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| 2220 | 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 | erbose=True)\n\not_mapping_linea |
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| 2320 | 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 | Xs_linear_new.=.ot_mapping_linea |
| 2340 | 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 77 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 4d 61 | r.transform(Xs=Xs_new)\n\n\n#.Ma |
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| 24c0 | 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 | n#.for.out.of.source.samples,.tr |
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| 2520 | 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d | t_mapping_gaussian.transform(Xs= |
| 2540 | 58 73 5f 6e 65 77 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 | Xs_new)".......],........"output |
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| 2640 | 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 | ....},......{......."execution_c |
| 2660 | 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a | ount":.null,........"cell_type": |
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| 2880 | 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 5c 6e 20 20 | .transp_Xs_linear_new[:,.1],\n.. |
| 28a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c | .........c=ys,.marker='+',.label |
| 28c0 | 3d 27 4c 65 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 | ='Learned.mapping')\npl.title(\" |
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| 3200 | 20 20 20 20 20 20 22 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 31 35 30 5c 6e 6e | ......"n_source_samples.=.150\nn |
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| 3280 | 79 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 | yt.=.ot.datasets.get_data_classi |
| 32a0 | 66 28 27 33 67 61 75 73 73 32 27 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 29 22 0a | f('3gauss2',.n_target_samples)". |
| 32c0 | 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a | ......],........"outputs":.[],.. |
| 32e0 | 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c | ......"metadata":.{........."col |
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| 3320 | 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 | ...{......."source":.[........." |
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| 3380 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 33a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 | ------------------------\n\n"... |
| 33c0 | 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b | ....],........"cell_type":."mark |
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| 3400 | 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e | .},......{......."execution_coun |
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| 3440 | 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 | ode",........"source":.[........ |
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| 34c0 | 72 74 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e | rt\not_sinkhorn.=.ot.da.Sinkhorn |
| 34e0 | 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f | Transport(reg_e=1e-1)\not_sinkho |
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| 3560 | 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 2c 20 | nkhornLpl1Transport(reg_e=1e-1,. |
| 3580 | 72 65 67 5f 63 6c 3d 31 65 30 29 5c 6e 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 | reg_cl=1e0)\not_lpl1.fit(Xs=Xs,. |
| 35a0 | 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e | ys=ys,.Xt=Xt)\n\n#.Sinkhorn.Tran |
| 35c0 | 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a | sport.with.Group.lasso.regulariz |
| 35e0 | 61 74 69 6f 6e 20 6c 31 6c 32 5c 6e 6f 74 5f 6c 31 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b | ation.l1l2\not_l1l2.=.ot.da.Sink |
| 3600 | 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 2c 20 72 65 | hornL1l2Transport(reg_e=1e-1,.re |
| 3620 | 67 5f 63 6c 3d 32 65 30 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 | g_cl=2e0,.max_iter=20,\n........ |
| 3640 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 76 65 | ..............................ve |
| 3660 | 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 | rbose=True)\not_l1l2.fit(Xs=Xs,. |
| 3680 | 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 73 6f 75 | ys=ys,.Xt=Xt)\n\n#.transport.sou |
| 36a0 | 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6f 6e 74 6f 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c | rce.samples.onto.target.samples\ |
| 36c0 | 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 | ntransp_Xs_emd.=.ot_emd.transfor |
| 36e0 | 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f | m(Xs=Xs)\ntransp_Xs_sinkhorn.=.o |
| 3700 | 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 | t_sinkhorn.transform(Xs=Xs)\ntra |
| 3720 | 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 | nsp_Xs_lpl1.=.ot_lpl1.transform( |
| 3740 | 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 31 6c 32 20 3d 20 6f 74 5f 6c 31 6c 32 | Xs=Xs)\ntransp_Xs_l1l2.=.ot_l1l2 |
| 3760 | 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 | .transform(Xs=Xs)".......],..... |
| 3780 | 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 | ..."outputs":.[],........"metada |
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| 37c0 | 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 | e.......}.....},......{......."s |
| 37e0 | 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 | ource":.[........."Fig.1.:.plots |
| 3800 | 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d | .source.and.target.samples\n---- |
| 3820 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 3840 | 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 | ---\n\n".......],........"cell_t |
| 3860 | 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 | ype":."markdown",........"metada |
| 3880 | 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 | ta":.{}.....},......{......."exe |
| 38a0 | 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c | cution_count":.null,........"cel |
| 38c0 | 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 | l_type":."code",........"source" |
| 38e0 | 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a | :.[........."pl.figure(1,.figsiz |
| 3900 | 65 3d 28 31 30 2c 20 35 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c | e=(10,.5))\npl.subplot(1,.2,.1)\ |
| 3920 | 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],. |
| 3940 | 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 | c=ys,.marker='+',.label='Source. |
| 3960 | 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 | samples')\npl.xticks([])\npl.yti |
| 3980 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 | cks([])\npl.legend(loc=0)\npl.ti |
| 39a0 | 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 | tle('Source..samples')\n\npl.sub |
| 39c0 | 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 | plot(1,.2,.2)\npl.scatter(Xt[:,. |
| 39e0 | 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 | 0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',. |
| 3a00 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 | label='Target.samples')\npl.xtic |
| 3a20 | 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 | ks([])\npl.yticks([])\npl.legend |
| 3a40 | 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 | (loc=0)\npl.title('Target.sample |
| 3a60 | 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c | s')\npl.tight_layout()".......], |
| 3a80 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d | ........"outputs":.[],........"m |
| 3aa0 | 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a | etadata":.{........."collapsed": |
| 3ac0 | 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 | .false.......}.....},......{.... |
| 3ae0 | 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 | ..."source":.[........."Fig.2.:. |
| 3b00 | 70 6c 6f 74 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 61 6e 64 20 74 72 61 6e 73 | plot.optimal.couplings.and.trans |
| 3b20 | 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ported.samples\n---------------- |
| 3b40 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 3b60 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c | ------\n\n".......],........"cel |
| 3b80 | 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 | l_type":."markdown",........"met |
| 3ba0 | 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 | adata":.{}.....},......{......." |
| 3bc0 | 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | execution_count":.null,........" |
| 3be0 | 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 | cell_type":."code",........"sour |
| 3c00 | 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 20 3d 20 7b 27 69 6e | ce":.[........."param_img.=.{'in |
| 3c20 | 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 27 3a 20 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 2c 20 27 63 6d 61 70 27 3a | terpolation':.'nearest',.'cmap': |
| 3c40 | 20 27 73 70 65 63 74 72 61 6c 27 7d 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 | .'spectral'}\n\npl.figure(2,.fig |
| 3c60 | 73 69 7a 65 3d 28 31 35 2c 20 38 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 | size=(15,.8))\npl.subplot(2,.4,. |
| 3c80 | 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 | 1)\npl.imshow(ot_emd.coupling_,. |
| 3ca0 | 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e | **param_img)\npl.xticks([])\npl. |
| 3cc0 | 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f | yticks([])\npl.title('Optimal.co |
| 3ce0 | 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 | upling\\nEMDTransport')\n\npl.su |
| 3d00 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e | bplot(2,.4,.2)\npl.imshow(ot_sin |
| 3d20 | 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 | khorn.coupling_,.**param_img)\np |
| 3d40 | 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e | l.xticks([])\npl.yticks([])\npl. |
| 3d60 | 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f | title('Optimal.coupling\\nSinkho |
| 3d80 | 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 | rnTransport')\n\npl.subplot(2,.4 |
| 3da0 | 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 | ,.3)\npl.imshow(ot_lpl1.coupling |
| 3dc0 | 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e | _,.**param_img)\npl.xticks([])\n |
| 3de0 | 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c | pl.yticks([])\npl.title('Optimal |
| 3e00 | 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 | .coupling\\nSinkhornLpl1Transpor |
| 3e20 | 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 | t')\n\npl.subplot(2,.4,.4)\npl.i |
| 3e40 | 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d | mshow(ot_l1l2.coupling_,.**param |
| 3e60 | 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 | _img)\npl.xticks([])\npl.yticks( |
| 3e80 | 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c | [])\npl.title('Optimal.coupling\ |
| 3ea0 | 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e | \nSinkhornL1l2Transport')\n\npl. |
| 3ec0 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b | subplot(2,.4,.5)\npl.scatter(Xt[ |
| 3ee0 | 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f | :,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o |
| 3f00 | 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d | ',\n...........label='Target.sam |
| 3f20 | 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 | ples',.alpha=0.3)\npl.scatter(tr |
| 3f40 | 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 | ansp_Xs_emd[:,.0],.transp_Xs_emd |
| 3f60 | 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 | [:,.1],.c=ys,\n...........marker |
| 3f80 | 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d | ='+',.label='Transp.samples',.s= |
| 3fa0 | 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | 30)\npl.xticks([])\npl.yticks([] |
| 3fc0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | )\npl.title('Transported.samples |
| 3fe0 | 5c 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 | \\nEmdTransport')\npl.legend(loc |
| 4000 | 3d 5c 22 6c 6f 77 65 72 20 6c 65 66 74 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 | =\"lower.left\")\n\npl.subplot(2 |
| 4020 | 2c 20 34 2c 20 36 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 | ,.4,.6)\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt |
| 4040 | 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 | [:,.1],.c=yt,.marker='o',\n..... |
| 4060 | 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c | ......label='Target.samples',.al |
| 4080 | 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 | pha=0.3)\npl.scatter(transp_Xs_s |
| 40a0 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 | inkhorn[:,.0],.transp_Xs_sinkhor |
| 40c0 | 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 | n[:,.1],.c=ys,\n...........marke |
| 40e0 | 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 | r='+',.label='Transp.samples',.s |
| 4100 | 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b | =30)\npl.xticks([])\npl.yticks([ |
| 4120 | 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 | ])\npl.title('Transported.sample |
| 4140 | 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 | s\\nSinkhornTransport')\n\npl.su |
| 4160 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 37 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c | bplot(2,.4,.7)\npl.scatter(Xt[:, |
| 4180 | 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c | .0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o', |
| 41a0 | 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c | \n...........label='Target.sampl |
| 41c0 | 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e | es',.alpha=0.3)\npl.scatter(tran |
| 41e0 | 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 | sp_Xs_lpl1[:,.0],.transp_Xs_lpl1 |
| 4200 | 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 | [:,.1],.c=ys,\n...........marker |
| 4220 | 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d | ='+',.label='Transp.samples',.s= |
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| 4b40 | 6d 75 5f 74 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 34 2c 20 34 5d 29 5c 6e 63 6f 76 5f 74 20 3d | mu_t.=.np.array([4,.4])\ncov_t.= |
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| 4be0 | 6e 2c 20 6d 75 5f 74 2c 20 63 6f 76 5f 74 29 5c 6e 5c 6e 61 2c 20 62 20 3d 20 6e 70 2e 6f 6e 65 | n,.mu_t,.cov_t)\n\na,.b.=.np.one |
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| 4ce0 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 | .."source":.[........."Plot.data |
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| 4d20 | 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | ."cell_type":."markdown",....... |
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| 4da0 | 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 | "source":.[........."#%%.plot.sa |
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| 4f40 | 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 43 6f | .{......."source":.[........."Co |
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| 4f80 | 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f | ..],........"cell_type":."markdo |
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| 4fc0 | 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 | ,......{......."execution_count" |
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| 5020 | 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e 5c 6e 47 30 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 29 5c | #%%.EMD\n\nG0.=.ot.emd(a,.b,.M)\ |
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| 51e0 | 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 | .},......{......."source":.[.... |
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| 52a0 | 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f | ."cell_type":."code",........"so |
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| 5c20 | 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2b 20 31 5c 6e 5c 6e 61 2c 20 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 | arange(n).+.1\n\na,.b.=.ot.unif( |
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| 5cc0 | 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 | #.loss.matrix\nM2.=.ot.dist(xs,. |
| 5ce0 | 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d 32 20 2f 3d | xt,.metric='sqeuclidean')\nM2./= |
| 5d00 | 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 70 20 3d | .M2.max()\n\n#.loss.matrix\nMp.= |
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| 5d60 | 6e 23 20 44 61 74 61 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 | n#.Data\npl.figure(1,.figsize=(7 |
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| 5de0 | 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 | [:,.1],.'xr',.label='Target.samp |
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| 5ec0 | 28 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | ('Euclidean.cost')\n\npl.subplot |
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| 5fe0 | 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d | ......"collapsed":.false.......} |
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| 6020 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 44 61 74 61 73 65 74 20 31 20 3a 20 50 6c 6f 74 20 4f 54 20 4d 61 | ........."Dataset.1.:.Plot.OT.Ma |
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| 6080 | 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 | type":."markdown",........"metad |
| 60a0 | 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 | ata":.{}.....},......{......."ex |
| 60c0 | 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 | ecution_count":.null,........"ce |
| 60e0 | 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 | ll_type":."code",........"source |
| 6100 | 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e 47 31 20 3d 20 6f 74 2e 65 | ":.[........."#%%.EMD\nG1.=.ot.e |
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| 6160 | 4f 54 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a | OT.matrices\npl.figure(3,.figsiz |
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| 6260 | 6e 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f | n#.pl.legend(loc=0)\npl.title('O |
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| 6840 | 70 20 2f 3d 20 4d 70 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 44 61 74 61 5c 6e 70 6c 2e 66 69 | p./=.Mp.max()\n\n\n#.Data\npl.fi |
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| 81c0 | 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 | l.axis('off')\npl.title('Image.2 |
| 81e0 | 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 | ')\npl.tight_layout()".......],. |
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| 8260 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 70 69 78 65 | .."source":.[........."Plot.pixe |
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| 82a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 | ---------------------\n\n"...... |
| 82c0 | 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 | .],........"cell_type":."markdow |
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| 8320 | 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 | .null,........"cell_type":."code |
| 8340 | 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 | ",........"source":.[........."p |
| 8360 | 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 35 29 29 5c 6e 5c | l.figure(2,.figsize=(6.4,.5))\n\ |
| 8380 | 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 | npl.subplot(1,.2,.1)\npl.scatter |
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| 83e0 | 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | d')\npl.ylabel('Blue')\npl.title |
| 8400 | 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 | ('Image.1')\n\npl.subplot(1,.2,. |
| 8420 | 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 32 | 2)\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.2 |
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| bec0 | 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 | size=(5,.5))\not.plot.plot1D_mat |
| bee0 | 28 61 2c 20 62 2c 20 47 30 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 30 27 29 22 0a 20 20 20 20 | (a,.b,.G0,.'OT.matrix.G0')"..... |
| bf00 | 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 | ..],........"outputs":.[],...... |
| bf20 | 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 | .."metadata":.{........."collaps |
| bf40 | 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b | ed":.false.......}.....},......{ |
| bf60 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 53 6f 6c 76 | ......."source":.[........."Solv |
| bf80 | 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 72 65 67 75 6c 61 | e.EMD.with.Frobenius.norm.regula |
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| bfc0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 | ----------------------\n\n"..... |
| bfe0 | 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f | ..],........"cell_type":."markdo |
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| c020 | 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 | ,......{......."execution_count" |
| c040 | 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 | :.null,........"cell_type":."cod |
| c060 | 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 | e",........"source":.[........." |
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| c0c0 | 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 30 2e 35 20 2a 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 2a 2a 32 29 5c 6e 5c 6e | ...return.0.5.*.np.sum(G**2)\n\n |
| c0e0 | 5c 6e 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 47 5c 6e 5c 6e 5c 6e | \ndef.df(G):\n....return.G\n\n\n |
| c100 | 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 31 5c 6e 5c 6e 47 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 63 67 28 | reg.=.1e-1\n\nGl2.=.ot.optim.cg( |
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| c140 | 65 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 | e)\n\npl.figure(3)\not.plot.plot |
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| c180 | 62 2e 20 72 65 67 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 | b..reg')".......],........"outpu |
| c1a0 | 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 | ts":.[],........"metadata":.{... |
| c1c0 | 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d | ......"collapsed":.false.......} |
| c1e0 | 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b | .....},......{......."source":.[ |
| c200 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 65 6e 74 72 6f 70 69 | ........."Solve.EMD.with.entropi |
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| c240 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 | ------------------------\n\n"... |
| c260 | 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b | ....],........"cell_type":."mark |
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| c2a0 | 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e | .},......{......."execution_coun |
| c2c0 | 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 | t":.null,........"cell_type":."c |
| c2e0 | 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 | ode",........"source":.[........ |
| c300 | 20 22 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 | ."#%%.Example.with.entropic.regu |
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| c360 | 6e 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 6c 6f 67 28 47 | ndef.df(G):\n....return.np.log(G |
| c380 | 29 20 2b 20 31 2e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 5c 6e 47 65 20 3d 20 6f | ).+.1.\n\n\nreg.=.1e-3\n\nGe.=.o |
| c3a0 | 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 | t.optim.cg(a,.b,.M,.reg,.f,.df,. |
| c3c0 | 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 | verbose=True)\n\npl.figure(4,.fi |
| c3e0 | 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 | gsize=(5,.5))\not.plot.plot1D_ma |
| c400 | 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 65 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 45 6e 74 72 6f 70 2e 20 72 | t(a,.b,.Ge,.'OT.matrix.Entrop..r |
| c420 | 65 67 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a | eg')".......],........"outputs": |
| c440 | 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | .[],........"metadata":.{....... |
| c460 | 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 | .."collapsed":.false.......}.... |
| c480 | 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 | .},......{......."source":.[.... |
| c4a0 | 20 20 20 20 20 22 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e | ....."Solve.EMD.with.Frobenius.n |
| c4c0 | 6f 72 6d 20 2b 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 2d | orm.+.entropic.regularization\n- |
| c4e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| c500 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 | ----------------------\n\n"..... |
| c520 | 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f | ..],........"cell_type":."markdo |
| c540 | 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d | wn",........"metadata":.{}.....} |
| c560 | 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 | ,......{......."execution_count" |
| c580 | 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 | :.null,........"cell_type":."cod |
| c5a0 | 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 | e",........"source":.[........." |
| c5c0 | 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 | #%%.Example.with.Frobenius.norm. |
| c5e0 | 2b 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 67 | +.entropic.regularization.with.g |
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| c620 | 35 20 2a 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 2a 2a 32 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a | 5.*.np.sum(G**2)\n\n\ndef.df(G): |
| c640 | 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 47 5c 6e 5c 6e 5c 6e 72 65 67 31 20 3d 20 31 65 2d 33 5c | \n....return.G\n\n\nreg1.=.1e-3\ |
| c660 | 6e 72 65 67 32 20 3d 20 31 65 2d 31 5c 6e 5c 6e 47 65 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e | nreg2.=.1e-1\n\nGel2.=.ot.optim. |
| c680 | 67 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 31 2c 20 72 65 67 32 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 | gcg(a,.b,.M,.reg1,.reg2,.f,.df,. |
| c6a0 | 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 2c 20 66 69 | verbose=True)\n\npl.figure(5,.fi |
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| cf60 | 74 69 6f 6e 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 | tion\nM.=.ot.dist(x.reshape((n,. |
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| cfc0 | 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e | (x.reshape((n,.1)),.x.reshape((n |
| cfe0 | 2c 20 31 29 29 2c 20 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e | ,.1)),.'sqeuclidean')\nM2./=.M2. |
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| d020 | 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 | :.[],........"metadata":.{...... |
| d040 | 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 | ..."collapsed":.false.......}... |
| d060 | 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 | ..},......{......."source":.[... |
| d080 | 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 | ......"Plot.data\n---------\n\n" |
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| d0e0 | 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 | ....},......{......."execution_c |
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| d120 | 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 | ."code",........"source":.[..... |
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| d1c0 | 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | 'Source.distribution')\npl.subpl |
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| d240 | 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ight_layout()".......],........" |
| d260 | 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a | outputs":.[],........"metadata": |
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| d2a0 | 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 | ....}.....},......{......."sourc |
| d2c0 | 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 45 4d 44 20 66 6f 72 20 74 | e":.[........."Compute.EMD.for.t |
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| d320 | 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 | .....],........"cell_type":."mar |
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| d360 | 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 | ..},......{......."execution_cou |
| d380 | 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 | nt":.null,........"cell_type":." |
| d3a0 | 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 | code",........"source":.[....... |
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| d3e0 | 74 69 6f 6e 73 20 61 6e 64 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 5c 6e 64 5f 65 6d 64 20 3d | tions.and.loss.matrix\n\nd_emd.= |
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| d440 | 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 32 29 20 20 23 20 64 69 72 65 63 74 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e | (a,.B,.M2)..#.direct.computation |
| d460 | 20 6f 66 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 6c 6f 73 73 20 4d 32 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 | .of.EMD.with.loss.M2\n\n\npl.fig |
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| d580 | 20 20 20 20 20 20 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 | ......"Compute.Sinkhorn.for.the. |
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| d5e0 | 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d | .......],........"cell_type":."m |
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| d620 | 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 | ....},......{......."execution_c |
| d640 | 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a | ount":.null,........"cell_type": |
| d660 | 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 | ."code",........"source":.[..... |
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| d6c0 | 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 28 61 2c 20 42 2c 20 | _sinkhorn2.=.ot.sinkhorn2(a,.B,. |
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| f120 | 69 74 68 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e | ith.Group.lasso.regularization\n |
| f140 | 6f 74 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e | ot_lpl1.=.ot.da.SinkhornLpl1Tran |
| f160 | 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 2c 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 31 65 30 29 5c 6e 6f | sport(reg_e=1e-1,.reg_cl=1e0)\no |
| f180 | 74 5f 6c 70 6c 31 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c | t_lpl1.fit(Xs=Xs,.ys=ys,.Xt=Xt)\ |
| f1a0 | 6e 5c 6e 23 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6f 6e | n\n#.transport.source.samples.on |
| f1c0 | 74 6f 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 | to.target.samples\ntransp_Xs_emd |
| f1e0 | 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e | .=.ot_emd.transform(Xs=Xs)\ntran |
| f200 | 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 | sp_Xs_sinkhorn.=.ot_sinkhorn.tra |
| f220 | 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 | nsform(Xs=Xs)\ntransp_Xs_lpl1.=. |
| f240 | 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 | ot_lpl1.transform(Xs=Xs)"....... |
| f260 | 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | ],........"outputs":.[],........ |
| f280 | 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 | "metadata":.{........."collapsed |
| f2a0 | 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 | ":.false.......}.....},......{.. |
| f2c0 | 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 31 20 | ....."source":.[........."Fig.1. |
| f2e0 | 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 | :.plots.source.and.target.sample |
| f300 | 73 20 2b 20 6d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 5c | s.+.matrix.of.pairwise.distance\ |
| f320 | 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | n------------------------------- |
| f340 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| f360 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c | ------\n\n".......],........"cel |
| f380 | 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 | l_type":."markdown",........"met |
| f3a0 | 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 | adata":.{}.....},......{......." |
| f3c0 | 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | execution_count":.null,........" |
| f3e0 | 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 | cell_type":."code",........"sour |
| f400 | 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 | ce":.[........."pl.figure(1,.fig |
| f420 | 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 31 30 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c | size=(10,.10))\npl.subplot(2,.2, |
| f440 | 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 | .1)\npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:,. |
| f460 | 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 | 1],.c=ys,.marker='+',.label='Sou |
| f480 | 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c | rce.samples')\npl.xticks([])\npl |
| f4a0 | 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 | .yticks([])\npl.legend(loc=0)\np |
| f4c0 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | l.title('Source..samples')\n\npl |
| f4e0 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 | .subplot(2,.2,.2)\npl.scatter(Xt |
| f500 | 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 | [:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker=' |
| f520 | 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e | o',.label='Target.samples')\npl. |
| f540 | 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 | xticks([])\npl.yticks([])\npl.le |
| f560 | 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 | gend(loc=0)\npl.title('Target.sa |
| f580 | 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c 6e | mples')\n\npl.subplot(2,.2,.3)\n |
| f5a0 | 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 | pl.imshow(M,.interpolation='near |
| f5c0 | 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 | est')\npl.xticks([])\npl.yticks( |
| f5e0 | 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 | [])\npl.title('Matrix.of.pairwis |
| f600 | 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 | e.distances')\npl.tight_layout() |
| f620 | 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c | ".......],........"outputs":.[], |
| f640 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 | ........"metadata":.{........."c |
| f660 | 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 | ollapsed":.false.......}.....},. |
| f680 | 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 | .....{......."source":.[........ |
| f6a0 | 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 | ."Fig.2.:.plots.optimal.coupling |
| f6c0 | 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 5c 6e 2d 2d 2d | s.for.the.different.methods\n--- |
| f6e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| f700 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 | ----------------------\n\n"..... |
| f720 | 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f | ..],........"cell_type":."markdo |
| f740 | 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d | wn",........"metadata":.{}.....} |
| f760 | 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 | ,......{......."execution_count" |
| f780 | 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 | :.null,........"cell_type":."cod |
| f7a0 | 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 | e",........"source":.[........." |
| f7c0 | 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 36 29 29 5c 6e 5c | pl.figure(2,.figsize=(10,.6))\n\ |
| f7e0 | 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 | npl.subplot(2,.3,.1)\npl.imshow( |
| f800 | 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d | ot_emd.coupling_,.interpolation= |
| f820 | 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 | 'nearest')\npl.xticks([])\npl.yt |
| f840 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 | icks([])\npl.title('Optimal.coup |
| f860 | 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 | ling\\nEMDTransport')\n\npl.subp |
| f880 | 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 | lot(2,.3,.2)\npl.imshow(ot_sinkh |
| f8a0 | 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 | orn.coupling_,.interpolation='ne |
| f8c0 | 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b | arest')\npl.xticks([])\npl.ytick |
| f8e0 | 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e | s([])\npl.title('Optimal.couplin |
| f900 | 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 | g\\nSinkhornTransport')\n\npl.su |
| f920 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c | bplot(2,.3,.3)\npl.imshow(ot_lpl |
| f940 | 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 | 1.coupling_,.interpolation='near |
| f960 | 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 | est')\npl.xticks([])\npl.yticks( |
| f980 | 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c | [])\npl.title('Optimal.coupling\ |
| f9a0 | 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e | \nSinkhornLpl1Transport')\n\npl. |
| f9c0 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 | subplot(2,.3,.4)\not.plot.plot2D |
| f9e0 | 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 | _samples_mat(Xs,.Xt,.ot_emd.coup |
| fa00 | 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 | ling_,.c=[.5,..5,.1])\npl.scatte |
| fa20 | 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b | r(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.mark |
| fa40 | 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c | er='+',.label='Source.samples')\ |
| fa60 | 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],. |
| fa80 | 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 | c=yt,.marker='o',.label='Target. |
| faa0 | 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 | samples')\npl.xticks([])\npl.yti |
| fac0 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 | cks([])\npl.title('Main.coupling |
| fae0 | 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e | .coefficients\\nEMDTransport')\n |
| fb00 | 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 | \npl.subplot(2,.3,.5)\not.plot.p |
| fb20 | 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 73 69 6e | lot2D_samples_mat(Xs,.Xt,.ot_sin |
| fb40 | 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c | khorn.coupling_,.c=[.5,..5,.1])\ |
| fb60 | 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],. |
| fb80 | 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 | c=ys,.marker='+',.label='Source. |
| fba0 | 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 | samples')\npl.scatter(Xt[:,.0],. |
| fbc0 | 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 | Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',.labe |
| fbe0 | 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b | l='Target.samples')\npl.xticks([ |
| fc00 | 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 | ])\npl.yticks([])\npl.title('Mai |
| fc20 | 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f | n.coupling.coefficients\\nSinkho |
| fc40 | 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 | rnTransport')\n\npl.subplot(2,.3 |
| fc60 | 2c 20 36 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 | ,.6)\not.plot.plot2D_samples_mat |
| fc80 | 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e | (Xs,.Xt,.ot_lpl1.coupling_,.c=[. |
| fca0 | 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c | 5,..5,.1])\npl.scatter(Xs[:,.0], |
| fcc0 | 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 | .Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+',.lab |
| fce0 | 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 | el='Source.samples')\npl.scatter |
| fd00 | 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 | (Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marke |
| fd20 | 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e | r='o',.label='Target.samples')\n |
| fd40 | 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c | pl.xticks([])\npl.yticks([])\npl |
| fd60 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e | .title('Main.coupling.coefficien |
| fd80 | 74 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c | ts\\nSinkhornLpl1Transport')\npl |
| fda0 | 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | .tight_layout()".......],....... |
| fdc0 | 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 | ."outputs":.[],........"metadata |
| fde0 | 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a | ":.{........."collapsed":.false. |
| fe00 | 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 | ......}.....},......{......."sou |
| fe20 | 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 33 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 74 72 | rce":.[........."Fig.3.:.plot.tr |
| fe40 | 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ansported.samples\n------------- |
| fe60 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d | -------------------\n\n".......] |
| fe80 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 | ,........"cell_type":."markdown" |
| fea0 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a | ,........"metadata":.{}.....},.. |
| fec0 | 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e | ....{......."execution_count":.n |
| fee0 | 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c | ull,........"cell_type":."code", |
| ff00 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 64 | ........"source":.[........."#.d |
| ff20 | 69 73 70 6c 61 79 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 | isplay.transported.samples\npl.f |
| ff40 | 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 34 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 | igure(4,.figsize=(10,.4))\npl.su |
| ff60 | 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c | bplot(1,.3,.1)\npl.scatter(Xt[:, |
| ff80 | 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c | .0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o', |
| ffa0 | 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c | \n...........label='Target.sampl |
| ffc0 | 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e | es',.alpha=0.5)\npl.scatter(tran |
| ffe0 | 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a | sp_Xs_emd[:,.0],.transp_Xs_emd[: |
| 10000 | 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 | ,.1],.c=ys,\n...........marker=' |
| 10020 | 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 | +',.label='Transp.samples',.s=30 |
| 10040 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | )\npl.title('Transported.samples |
| 10060 | 5c 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 | \\nEmdTransport')\npl.legend(loc |
| 10080 | 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | =0)\npl.xticks([])\npl.yticks([] |
| 100a0 | 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 | )\n\npl.subplot(1,.3,.2)\npl.sca |
| 100c0 | 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d | tter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.m |
| 100e0 | 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 | arker='o',\n...........label='Ta |
| 10100 | 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 | rget.samples',.alpha=0.5)\npl.sc |
| 10120 | 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 | atter(transp_Xs_sinkhorn[:,.0],. |
| 10140 | 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c | transp_Xs_sinkhorn[:,.1],.c=ys,\ |
| 10160 | 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 | n...........marker='+',.label='T |
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