ofs | hex dump | ascii |
---|
0000 | 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 02 84 1e 4b 5d 81 39 dd bc 0c 00 00 bc 0c 00 00 1c 00 00 00 61 75 | PK...........K].9.............au |
0020 | 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 57 44 41 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e | to_examples/plot_WDA.ipynb{..."n |
0040 | 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 | bformat_minor":.0,...."nbformat" |
0060 | 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 | :.4,...."cells":.[.....{......." |
0080 | 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | execution_count":.null,........" |
00a0 | 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 | cell_type":."code",........"sour |
00c0 | 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 | ce":.[........."%matplotlib.inli |
00e0 | 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b | ne".......],........"outputs":.[ |
0100 | 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 | ],........"metadata":.{......... |
0120 | 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d | "collapsed":.false.......}.....} |
0140 | 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 | ,......{......."source":.[...... |
0160 | 20 20 20 22 5c 6e 23 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 44 69 73 63 72 69 6d 69 6e 61 6e 74 | ..."\n#.Wasserstein.Discriminant |
0180 | 20 41 6e 61 6c 79 73 69 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 | .Analysis\n\n\n\n".......],..... |
01a0 | 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 | ..."cell_type":."markdown",..... |
01c0 | 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a | ..."metadata":.{}.....},......{. |
01e0 | 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a | ......"execution_count":.null,.. |
0200 | 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 | ......"cell_type":."code",...... |
0220 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a | .."source":.[........."#.Author: |
0240 | 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 | .Remi.Flamary.<remi.flamary@unic |
0260 | 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 | e.fr>\n#\n#.License:.MIT.License |
0280 | 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d | \n\nimport.numpy.as.np\nimport.m |
02a0 | 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6f 74 | atplotlib.pylab.as.pl\n\nfrom.ot |
02c0 | 2e 64 72 20 69 6d 70 6f 72 74 20 77 64 61 2c 20 66 64 61 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 | .dr.import.wda,.fda\n\n\n#%%.par |
02e0 | 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 20 3d 20 31 30 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 | ameters\n\nn.=.1000..#.nb.sample |
0300 | 73 20 69 6e 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 61 74 61 73 65 74 73 5c | s.in.source.and.target.datasets\ |
0320 | 6e 6e 7a 20 3d 20 30 2e 32 5c 6e 5c 6e 23 20 67 65 6e 65 72 61 74 65 20 63 69 72 63 6c 65 20 64 | nnz.=.0.2\n\n#.generate.circle.d |
0340 | 61 74 61 73 65 74 5c 6e 74 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 28 6e 29 20 2a 20 | ataset\nt.=.np.random.rand(n).*. |
0360 | 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 5c 6e 79 73 20 3d 20 6e 70 2e 66 6c 6f 6f 72 28 28 6e 70 2e 61 72 61 | 2.*.np.pi\nys.=.np.floor((np.ara |
0380 | 6e 67 65 28 6e 29 20 2a 20 31 2e 30 20 2f 20 6e 20 2a 20 33 29 29 20 2b 20 31 5c 6e 78 73 20 3d | nge(n).*.1.0./.n.*.3)).+.1\nxs.= |
03a0 | 20 6e 70 2e 63 6f 6e 63 61 74 65 6e 61 74 65 28 5c 6e 20 20 20 20 28 6e 70 2e 63 6f 73 28 74 29 | .np.concatenate(\n....(np.cos(t) |
03c0 | 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 2c 20 6e 70 2e 73 69 6e 28 74 29 2e 72 65 73 | .reshape((-1,.1)),.np.sin(t).res |
03e0 | 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 29 2c 20 31 29 5c 6e 78 73 20 3d 20 78 73 20 2a 20 79 73 | hape((-1,.1))),.1)\nxs.=.xs.*.ys |
0400 | 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 2d 31 2c 20 31 29 20 2b 20 6e 7a 20 2a 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d | .reshape(-1,.1).+.nz.*.np.random |
0420 | 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c 20 32 29 5c 6e 5c 6e 74 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 | .randn(n,.2)\n\nt.=.np.random.ra |
0440 | 6e 64 28 6e 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 5c 6e 79 74 20 3d 20 6e 70 2e 66 6c 6f 6f 72 | nd(n).*.2.*.np.pi\nyt.=.np.floor |
0460 | 28 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2a 20 31 2e 30 20 2f 20 6e 20 2a 20 33 29 29 20 2b | ((np.arange(n).*.1.0./.n.*.3)).+ |
0480 | 20 31 5c 6e 78 74 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 6e 63 61 74 65 6e 61 74 65 28 5c 6e 20 20 20 20 28 6e | .1\nxt.=.np.concatenate(\n....(n |
04a0 | 70 2e 63 6f 73 28 74 29 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 2c 20 6e 70 2e 73 69 | p.cos(t).reshape((-1,.1)),.np.si |
04c0 | 6e 28 74 29 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 29 2c 20 31 29 5c 6e 78 74 20 3d | n(t).reshape((-1,.1))),.1)\nxt.= |
04e0 | 20 78 74 20 2a 20 79 74 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 2d 31 2c 20 31 29 20 2b 20 6e 7a 20 2a 20 6e | .xt.*.yt.reshape(-1,.1).+.nz.*.n |
0500 | 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c 20 32 29 5c 6e 5c 6e 6e 62 6e 6f 69 73 65 20 | p.random.randn(n,.2)\n\nnbnoise. |
0520 | 3d 20 38 5c 6e 5c 6e 78 73 20 3d 20 6e 70 2e 68 73 74 61 63 6b 28 28 78 73 2c 20 6e 70 2e 72 61 | =.8\n\nxs.=.np.hstack((xs,.np.ra |
0540 | 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c 20 6e 62 6e 6f 69 73 65 29 29 29 5c 6e 78 74 20 3d 20 6e | ndom.randn(n,.nbnoise)))\nxt.=.n |
0560 | 70 2e 68 73 74 61 63 6b 28 28 78 74 2c 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c | p.hstack((xt,.np.random.randn(n, |
0580 | 20 6e 62 6e 6f 69 73 65 29 29 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c | .nbnoise)))\n\n#%%.plot.samples\ |
05a0 | 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 2e 35 29 | npl.figure(1,.figsize=(6.4,.3.5) |
05c0 | 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 | )\n\npl.subplot(1,.2,.1)\npl.sca |
05e0 | 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d | tter(xt[:,.0],.xt[:,.1],.c=ys,.m |
0600 | 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | arker='+',.label='Source.samples |
0620 | 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | ')\npl.legend(loc=0)\npl.title(' |
0640 | 44 69 73 63 72 69 6d 69 6e 61 6e 74 20 64 69 6d 65 6e 73 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e | Discriminant.dimensions')\n\npl. |
0660 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b | subplot(1,.2,.2)\npl.scatter(xt[ |
0680 | 3a 2c 20 32 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 33 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b | :,.2],.xt[:,.3],.c=ys,.marker='+ |
06a0 | 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c | ',.label='Source.samples')\npl.l |
06c0 | 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 74 68 65 72 20 64 69 | egend(loc=0)\npl.title('Other.di |
06e0 | 6d 65 6e 73 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c | mensions')\npl.tight_layout()\n\ |
0700 | 6e 23 25 25 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 46 44 41 5c 6e 70 20 3d 20 32 5c 6e 5c 6e 50 66 64 61 2c | n#%%.Compute.FDA\np.=.2\n\nPfda, |
0720 | 20 70 72 6f 6a 66 64 61 20 3d 20 66 64 61 28 78 73 2c 20 79 73 2c 20 70 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 | .projfda.=.fda(xs,.ys,.p)\n\n#%% |
0740 | 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 57 44 41 5c 6e 70 20 3d 20 32 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 30 5c 6e | .Compute.WDA\np.=.2\nreg.=.1e0\n |
0760 | 6b 20 3d 20 31 30 5c 6e 6d 61 78 69 74 65 72 20 3d 20 31 30 30 5c 6e 5c 6e 50 77 64 61 2c 20 70 | k.=.10\nmaxiter.=.100\n\nPwda,.p |
0780 | 72 6f 6a 77 64 61 20 3d 20 77 64 61 28 78 73 2c 20 79 73 2c 20 70 2c 20 72 65 67 2c 20 6b 2c 20 | rojwda.=.wda(xs,.ys,.p,.reg,.k,. |
07a0 | 6d 61 78 69 74 65 72 3d 6d 61 78 69 74 65 72 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d | maxiter=maxiter)\n\n#%%.plot.sam |
07c0 | 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 78 73 70 20 3d 20 70 72 6f 6a 66 64 61 28 78 73 29 5c 6e 78 74 70 20 3d | ples\n\nxsp.=.projfda(xs)\nxtp.= |
07e0 | 20 70 72 6f 6a 66 64 61 28 78 74 29 5c 6e 5c 6e 78 73 70 77 20 3d 20 70 72 6f 6a 77 64 61 28 78 | .projfda(xt)\n\nxspw.=.projwda(x |
0800 | 73 29 5c 6e 78 74 70 77 20 3d 20 70 72 6f 6a 77 64 61 28 78 74 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 | s)\nxtpw.=.projwda(xt)\n\npl.fig |
0820 | 75 72 65 28 32 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 | ure(2)\n\npl.subplot(2,.2,.1)\np |
0840 | 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 70 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 70 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | l.scatter(xsp[:,.0],.xsp[:,.1],. |
0860 | 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 50 72 6f 6a 65 63 74 | c=ys,.marker='+',.label='Project |
0880 | 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e | ed.samples')\npl.legend(loc=0)\n |
08a0 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 6d | pl.title('Projected.training.sam |
08c0 | 70 6c 65 73 20 46 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 | ples.FDA')\n\npl.subplot(2,.2,.2 |
08e0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 70 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 70 5b 3a 2c 20 | )\npl.scatter(xtp[:,.0],.xtp[:,. |
0900 | 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 50 72 6f | 1],.c=ys,.marker='+',.label='Pro |
0920 | 6a 65 63 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d | jected.samples')\npl.legend(loc= |
0940 | 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 74 65 73 74 20 73 61 6d | 0)\npl.title('Projected.test.sam |
0960 | 70 6c 65 73 20 46 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 | ples.FDA')\n\npl.subplot(2,.2,.3 |
0980 | 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 70 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 70 77 5b 3a | )\npl.scatter(xspw[:,.0],.xspw[: |
09a0 | 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 50 | ,.1],.c=ys,.marker='+',.label='P |
09c0 | 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f | rojected.samples')\npl.legend(lo |
09e0 | 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 74 72 61 69 6e 69 | c=0)\npl.title('Projected.traini |
0a00 | 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 57 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 | ng.samples.WDA')\n\npl.subplot(2 |
0a20 | 2c 20 32 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 70 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 | ,.2,.4)\npl.scatter(xtpw[:,.0],. |
0a40 | 78 74 70 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 | xtpw[:,.1],.c=ys,.marker='+',.la |
0a60 | 62 65 6c 3d 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 | bel='Projected.samples')\npl.leg |
0a80 | 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 | end(loc=0)\npl.title('Projected. |
0aa0 | 74 65 73 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 57 44 41 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 | test.samples.WDA')\npl.tight_lay |
0ac0 | 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 | out()\n\npl.show()".......],.... |
0ae0 | 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 | ...."outputs":.[],........"metad |
0b00 | 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c | ata":.{........."collapsed":.fal |
0b20 | 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 | se.......}.....}...],...."metada |
0b40 | 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 | ta":.{....."kernelspec":.{...... |
0b60 | 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 | ."display_name":."Python.2",.... |
0b80 | 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c | ...."name":."python2",........"l |
0ba0 | 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 | anguage":."python".....},......" |
0bc0 | 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 | language_info":.{......."mimetyp |
0be0 | 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 | e":."text/x-python",........"nbc |
0c00 | 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 | onvert_exporter":."python",..... |
0c20 | 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c | ..."name":."python",........"fil |
0c40 | 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 | e_extension":.".py",........"ver |
0c60 | 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 | sion":."2.7.12",........"pygment |
0c80 | 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f | s_lexer":."ipython2",........"co |
0ca0 | 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 | demirror_mode":.{........."versi |
0cc0 | 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f | on":.2,.........."name":."ipytho |
0ce0 | 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 | n".......}.....}...}.}PK........ |
0d00 | 87 7b 82 49 fa 8c 13 06 e2 10 00 00 e2 10 00 00 25 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 | .{.I............%...auto_example |
0d20 | 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 | s/plot_OTDA_mapping.ipynb{..."nb |
0d40 | 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a | format_minor":.0,...."nbformat": |
0d60 | 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 | .4,...."cells":.[.....{......."e |
0d80 | 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 | xecution_count":.null,........"c |
0da0 | 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 | ell_type":."code",........"sourc |
0dc0 | 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e | e":.[........."%matplotlib.inlin |
0de0 | 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d | e".......],........"outputs":.[] |
0e00 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 | ,........"metadata":.{........." |
0e20 | 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c | collapsed":.false.......}.....}, |
0e40 | 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 | ......{......."source":.[....... |
0e60 | 20 20 22 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | .."\n=========================== |
0e80 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 4f 54 20 6d 61 70 70 69 6e 67 | ====================\nOT.mapping |
0ea0 | 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f | .estimation.for.domain.adaptatio |
0ec0 | 6e 20 5b 38 5d 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | n.[8]\n========================= |
0ee0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 5c 6e 5b 38 5d 20 4d 2e | ======================\n\n[8].M. |
0f00 | 20 50 65 72 72 6f 74 2c 20 4e 2e 20 43 6f 75 72 74 79 2c 20 52 2e 20 46 6c 61 6d 61 72 79 2c 20 | .Perrot,.N..Courty,.R..Flamary,. |
0f20 | 41 2e 20 48 61 62 72 61 72 64 2c 20 5c 22 4d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e | A..Habrard,.\"Mapping.estimation |
0f40 | 20 66 6f 72 5c 6e 20 20 20 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 | .for\n....discrete.optimal.trans |
0f60 | 70 6f 72 74 5c 22 2c 20 4e 65 75 72 61 6c 20 49 6e 66 6f 72 6d 61 74 69 6f 6e 20 50 72 6f 63 65 | port\",.Neural.Information.Proce |
0f80 | 73 73 69 6e 67 20 53 79 73 74 65 6d 73 20 28 4e 49 50 53 29 2c 20 32 30 31 36 2e 5c 6e 5c 6e 22 | ssing.Systems.(NIPS),.2016.\n\n" |
0fa0 | 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d | .......],........"cell_type":."m |
0fc0 | 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a | arkdown",........"metadata":.{}. |
0fe0 | 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 | ....},......{......."execution_c |
1000 | 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a | ount":.null,........"cell_type": |
1020 | 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 | ."code",........"source":.[..... |
1040 | 20 20 20 20 22 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 | ...."import.numpy.as.np\nimport. |
1060 | 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f | matplotlib.pylab.as.pl\nimport.o |
1080 | 74 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 64 61 74 61 73 65 74 20 67 65 6e 65 72 61 74 69 6f 6e 5c | t\n\n\n\n#%%.dataset.generation\ |
10a0 | 6e 5c 6e 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 73 65 65 64 28 30 29 20 23 20 6d 61 6b 65 73 20 65 78 61 | n\nnp.random.seed(0).#.makes.exa |
10c0 | 6d 70 6c 65 20 72 65 70 72 6f 64 75 63 69 62 6c 65 5c 6e 5c 6e 6e 3d 31 30 30 20 23 20 6e 62 20 | mple.reproducible\n\nn=100.#.nb. |
10e0 | 73 61 6d 70 6c 65 73 20 69 6e 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 61 74 | samples.in.source.and.target.dat |
1100 | 61 73 65 74 73 5c 6e 74 68 65 74 61 3d 32 2a 6e 70 2e 70 69 2f 32 30 5c 6e 6e 7a 3d 30 2e 31 5c | asets\ntheta=2*np.pi/20\nnz=0.1\ |
1120 | 6e 78 73 2c 79 73 3d 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 | nxs,ys=ot.datasets.get_data_clas |
1140 | 73 69 66 28 27 67 61 75 73 73 72 6f 74 27 2c 6e 2c 6e 7a 3d 6e 7a 29 5c 6e 78 74 2c 79 74 3d 6f | sif('gaussrot',n,nz=nz)\nxt,yt=o |
1160 | 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 67 61 75 | t.datasets.get_data_classif('gau |
1180 | 73 73 72 6f 74 27 2c 6e 2c 74 68 65 74 61 3d 74 68 65 74 61 2c 6e 7a 3d 6e 7a 29 5c 6e 5c 6e 23 | ssrot',n,theta=theta,nz=nz)\n\n# |
11a0 | 20 6f 6e 65 20 6f 66 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 6d 6f 64 65 20 63 68 61 6e 67 65 73 20 | .one.of.the.target.mode.changes. |
11c0 | 69 74 73 20 76 61 72 69 61 6e 63 65 20 28 6e 6f 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 29 | its.variance.(no.linear.mapping) |
11e0 | 5c 6e 78 74 5b 79 74 3d 3d 32 5d 2a 3d 33 5c 6e 78 74 3d 78 74 2b 34 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 | \nxt[yt==2]*=3\nxt=xt+4\n\n\n#%% |
1200 | 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 28 38 2c | .plot.samples\n\npl.figure(1,(8, |
1220 | 35 29 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 5b 3a | 5))\npl.clf()\n\npl.scatter(xs[: |
1240 | 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 | ,0],xs[:,1],c=ys,marker='+',labe |
1260 | 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 | l='Source.samples')\npl.scatter( |
1280 | 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c | xt[:,0],xt[:,1],c=yt,marker='o', |
12a0 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 | label='Target.samples')\n\npl.le |
12c0 | 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e | gend(loc=0)\npl.title('Source.an |
12e0 | 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e | d.target.distributions')\n\n\n\n |
1300 | 23 25 25 20 4f 54 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e | #%%.OT.linear.mapping.estimation |
1320 | 5c 6e 5c 6e 65 74 61 3d 31 65 2d 38 20 20 20 23 20 71 75 61 64 72 61 74 69 63 20 72 65 67 75 6c | \n\neta=1e-8...#.quadratic.regul |
1340 | 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 72 65 67 72 65 73 73 69 6f 6e 5c 6e 6d 75 3d 31 65 30 | arization.for.regression\nmu=1e0 |
1360 | 20 20 20 20 20 23 20 77 65 69 67 68 74 20 6f 66 20 74 68 65 20 4f 54 20 6c 69 6e 65 61 72 20 74 | .....#.weight.of.the.OT.linear.t |
1380 | 65 72 6d 5c 6e 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 20 20 23 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 20 61 20 62 69 61 | erm\nbias=True..#.estimate.a.bia |
13a0 | 73 5c 6e 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 5f 6d 61 70 70 69 | s\n\not_mapping=ot.da.OTDA_mappi |
13c0 | 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 28 29 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 | ng_linear()\not_mapping.fit(xs,x |
13e0 | 74 2c 6d 75 3d 6d 75 2c 65 74 61 3d 65 74 61 2c 62 69 61 73 3d 62 69 61 73 2c 6e 75 6d 49 74 65 | t,mu=mu,eta=eta,bias=bias,numIte |
1400 | 72 6d 61 78 20 3d 20 32 30 2c 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 78 73 74 3d 6f | rmax.=.20,verbose=True)\n\nxst=o |
1420 | 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 78 73 29 20 23 20 75 73 65 20 74 68 65 20 | t_mapping.predict(xs).#.use.the. |
1440 | 65 73 74 69 6d 61 74 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 78 73 74 30 3d 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 | estimated.mapping\nxst0=ot_mappi |
1460 | 6e 67 2e 69 6e 74 65 72 70 28 29 20 20 20 23 20 75 73 65 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 | ng.interp()...#.use.barycentric. |
1480 | 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 28 31 30 2c 37 29 29 | mapping\n\n\npl.figure(2,(10,7)) |
14a0 | 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 31 29 5c 6e 70 | \npl.clf()\npl.subplot(2,2,1)\np |
14c0 | 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d | l.scatter(xt[:,0],xt[:,1],c=yt,m |
14e0 | 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 | arker='o',label='Target.samples' |
1500 | 2c 61 6c 70 68 61 3d 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 30 5b 3a 2c 30 5d | ,alpha=.3)\npl.scatter(xst0[:,0] |
1520 | 2c 78 73 74 30 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c | ,xst0[:,1],c=ys,marker='+',label |
1540 | 3d 27 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c | ='barycentric.mapping')\npl.titl |
1560 | 65 28 5c 22 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | e(\"barycentric.mapping\")\n\npl |
1580 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a | .subplot(2,2,2)\npl.scatter(xt[: |
15a0 | 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 | ,0],xt[:,1],c=yt,marker='o',labe |
15c0 | 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 2e 33 29 5c 6e 70 6c | l='Target.samples',alpha=.3)\npl |
15e0 | 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c | .scatter(xst[:,0],xst[:,1],c=ys, |
1600 | 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 65 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e | marker='+',label='Learned.mappin |
1620 | 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 4c 65 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c | g')\npl.title(\"Learned.mapping\ |
1640 | 22 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 4b 65 72 6e 65 6c 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 | ")\n\n\n\n#%%.Kernel.mapping.est |
1660 | 69 6d 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 65 74 61 3d 31 65 2d 35 20 20 20 23 20 71 75 61 64 72 61 74 69 | imation\n\neta=1e-5...#.quadrati |
1680 | 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 72 65 67 72 65 73 73 69 6f 6e 5c | c.regularization.for.regression\ |
16a0 | 6e 6d 75 3d 31 65 2d 31 20 20 20 20 20 23 20 77 65 69 67 68 74 20 6f 66 20 74 68 65 20 4f 54 20 | nmu=1e-1.....#.weight.of.the.OT. |
16c0 | 6c 69 6e 65 61 72 20 74 65 72 6d 5c 6e 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 20 20 23 20 65 73 74 69 6d 61 | linear.term\nbias=True..#.estima |
16e0 | 74 65 20 61 20 62 69 61 73 5c 6e 73 69 67 6d 61 3d 31 20 20 20 20 23 20 73 69 67 6d 61 20 62 61 | te.a.bias\nsigma=1....#.sigma.ba |
1700 | 6e 64 77 69 64 74 68 20 66 6f 74 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 6b 65 72 6e 65 6c 5c 6e 5c 6e 5c | ndwidth.fot.gaussian.kernel\n\n\ |
1720 | 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 6c 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 5f 6d 61 | not_mapping_kernel=ot.da.OTDA_ma |
1740 | 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 6c 28 29 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 | pping_kernel()\not_mapping_kerne |
1760 | 6c 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 74 2c 6d 75 3d 6d 75 2c 65 74 61 3d 65 74 61 2c 73 69 67 6d 61 3d | l.fit(xs,xt,mu=mu,eta=eta,sigma= |
1780 | 73 69 67 6d 61 2c 62 69 61 73 3d 62 69 61 73 2c 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 20 3d 20 31 30 2c | sigma,bias=bias,numItermax.=.10, |
17a0 | 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 78 73 74 5f 6b 65 72 6e 65 6c 3d 6f 74 5f 6d | verbose=True)\n\nxst_kernel=ot_m |
17c0 | 61 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 6c 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 78 73 29 20 23 20 75 73 65 20 | apping_kernel.predict(xs).#.use. |
17e0 | 74 68 65 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 78 73 74 30 5f 6b 65 72 6e | the.estimated.mapping\nxst0_kern |
1800 | 65 6c 3d 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 6c 2e 69 6e 74 65 72 70 28 29 20 20 20 | el=ot_mapping_kernel.interp()... |
1820 | 23 20 75 73 65 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 | #.use.barycentric.mapping\n\n\n# |
1840 | 25 25 20 50 6c 6f 74 74 69 6e 67 20 74 68 65 20 6d 61 70 70 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e | %%.Plotting.the.mapped.samples\n |
1860 | 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 28 31 30 2c 37 29 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c | \npl.figure(2,(10,7))\npl.clf()\ |
1880 | 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 | npl.subplot(2,2,1)\npl.scatter(x |
18a0 | 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c | t[:,0],xt[:,1],c=yt,marker='o',l |
18c0 | 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c | abel='Target.samples',alpha=.2)\ |
18e0 | 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 30 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 30 5b 3a 2c 31 5d 2c | npl.scatter(xst0[:,0],xst0[:,1], |
1900 | 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 4d 61 70 70 65 64 20 73 6f | c=ys,marker='+',label='Mapped.so |
1920 | 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 42 61 72 79 2e | urce.samples')\npl.title(\"Bary. |
1940 | 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 5c 22 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 | .mapping.(linear)\")\npl.legend( |
1960 | 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e | loc=0)\n\npl.subplot(2,2,2)\npl. |
1980 | 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 | scatter(xt[:,0],xt[:,1],c=yt,mar |
19a0 | 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 | ker='o',label='Target.samples',a |
19c0 | 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 | lpha=.2)\npl.scatter(xst[:,0],xs |
19e0 | 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 65 | t[:,1],c=ys,marker='+',label='Le |
1a00 | 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 45 73 74 69 | arned.mapping')\npl.title(\"Esti |
1a20 | 6d 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 | m..mapping.(linear)\")\n\npl.sub |
1a40 | 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c | plot(2,2,3)\npl.scatter(xt[:,0], |
1a60 | 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 | xt[:,1],c=yt,marker='o',label='T |
1a80 | 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 | arget.samples',alpha=.2)\npl.sca |
1aa0 | 74 74 65 72 28 78 73 74 30 5f 6b 65 72 6e 65 6c 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 30 5f 6b 65 72 6e 65 | tter(xst0_kernel[:,0],xst0_kerne |
1ac0 | 6c 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 62 61 | l[:,1],c=ys,marker='+',label='ba |
1ae0 | 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 | rycentric.mapping')\npl.title(\" |
1b00 | 42 61 72 79 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6b 65 72 6e 65 6c 29 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e | Bary..mapping.(kernel)\")\n\npl. |
1b20 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 34 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c | subplot(2,2,4)\npl.scatter(xt[:, |
1b40 | 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c | 0],xt[:,1],c=yt,marker='o',label |
1b60 | 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e | ='Target.samples',alpha=.2)\npl. |
1b80 | 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 5f 6b 65 72 6e 65 6c 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 5f 6b 65 72 6e | scatter(xst_kernel[:,0],xst_kern |
1ba0 | 65 6c 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c | el[:,1],c=ys,marker='+',label='L |
1bc0 | 65 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 45 73 74 | earned.mapping')\npl.title(\"Est |
1be0 | 69 6d 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6b 65 72 6e 65 6c 29 5c 22 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d | im..mapping.(kernel)\")".......] |
1c00 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ,........"outputs":.[],........" |
1c20 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 | metadata":.{........."collapsed" |
1c40 | 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d | :.false.......}.....}...],...."m |
1c60 | 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a | etadata":.{....."kernelspec":.{. |
1c80 | 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 | ......"display_name":."Python.2" |
1ca0 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 | ,........"name":."python2",..... |
1cc0 | 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a | ..."language":."python".....},.. |
1ce0 | 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 | ...."language_info":.{......."mi |
1d00 | 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | metype":."text/x-python",....... |
1d20 | 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c | ."nbconvert_exporter":."python", |
1d40 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | ........"name":."python",....... |
1d60 | 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | ."file_extension":.".py",....... |
1d80 | 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 | ."version":."2.7.12",........"py |
1da0 | 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 | gments_lexer":."ipython2",...... |
1dc0 | 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 | .."codemirror_mode":.{........." |
1de0 | 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 | version":.2,.........."name":."i |
1e00 | 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 | python".......}.....}...}.}PK... |
1e20 | 00 00 00 00 00 2e 89 1e 4b b5 f1 d1 9b 8c 11 00 00 8c 11 00 00 24 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 | ........K............$...auto_ex |
1e40 | 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 70 74 69 6d 5f 4f 54 72 65 67 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 | amples/plot_optim_OTreg.ipynb{.. |
1e60 | 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d | ."nbformat_minor":.0,...."nbform |
1e80 | 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 | at":.4,...."cells":.[.....{..... |
1ea0 | 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 | .."execution_count":.null,...... |
1ec0 | 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 | .."cell_type":."code",........"s |
1ee0 | 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 | ource":.[........."%matplotlib.i |
1f00 | 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 | nline".......],........"outputs" |
1f20 | 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 | :.[],........"metadata":.{...... |
1f40 | 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 | ..."collapsed":.false.......}... |
1f60 | 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 | ..},......{......."source":.[... |
1f80 | 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 4f 54 20 77 69 74 68 20 67 | ......"\n#.Regularized.OT.with.g |
1fa0 | 65 6e 65 72 69 63 20 73 6f 6c 76 65 72 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d | eneric.solver\n\n\n\n\n".......] |
1fc0 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 | ,........"cell_type":."markdown" |
1fe0 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a | ,........"metadata":.{}.....},.. |
2000 | 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e | ....{......."execution_count":.n |
2020 | 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c | ull,........"cell_type":."code", |
2040 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 69 6d 70 | ........"source":.[........."imp |
2060 | 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c | ort.numpy.as.np\nimport.matplotl |
2080 | 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 22 0a 20 20 20 20 20 | ib.pylab.as.pl\nimport.ot"...... |
20a0 | 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | .],........"outputs":.[],....... |
20c0 | 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 | ."metadata":.{........."collapse |
20e0 | 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a | d":.false.......}.....},......{. |
2100 | 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 47 65 6e 65 72 | ......"source":.[........."Gener |
2120 | 61 74 65 20 64 61 74 61 20 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ate.data.\n##################### |
2140 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
2160 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 | ########################\n\n"... |
2180 | 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b | ....],........"cell_type":."mark |
21a0 | 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 | down",........"metadata":.{}.... |
21c0 | 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e | .},......{......."execution_coun |
21e0 | 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 | t":.null,........"cell_type":."c |
2200 | 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 | ode",........"source":.[........ |
2220 | 20 22 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e | ."#%%.parameters\n\nn.=.100..#.n |
2240 | 62 20 62 69 6e 73 5c 6e 5c 6e 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 5c 6e 78 20 3d 20 6e | b.bins\n\n#.bin.positions\nx.=.n |
2260 | 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e 5c | p.arange(n,.dtype=np.float64)\n\ |
2280 | 6e 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 61 20 3d 20 6f | n#.Gaussian.distributions\na.=.o |
22a0 | 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c | t.datasets.get_1D_gauss(n,.m=20, |
22c0 | 20 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 5c 6e 62 20 3d 20 6f 74 | .s=5)..#.m=.mean,.s=.std\nb.=.ot |
22e0 | 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 36 30 2c 20 | .datasets.get_1D_gauss(n,.m=60,. |
2300 | 73 3d 31 30 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 | s=10)\n\n#.loss.matrix\nM.=.ot.d |
2320 | 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 | ist(x.reshape((n,.1)),.x.reshape |
2340 | 28 28 6e 2c 20 31 29 29 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d | ((n,.1)))\nM./=.M.max()".......] |
2360 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ,........"outputs":.[],........" |
2380 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 | metadata":.{........."collapsed" |
23a0 | 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 | :.false.......}.....},......{... |
23c0 | 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 53 6f 6c 76 65 20 45 | ...."source":.[........."Solve.E |
23e0 | 4d 44 20 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | MD.\n########################### |
2400 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
2420 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c | ##################\n\n".......], |
2440 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c | ........"cell_type":."markdown", |
2460 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 | ........"metadata":.{}.....},... |
2480 | 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 | ...{......."execution_count":.nu |
24a0 | 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 | ll,........"cell_type":."code",. |
24c0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 | ......."source":.[........."#%%. |
24e0 | 45 4d 44 5c 6e 5c 6e 47 30 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 29 5c 6e 5c 6e 70 | EMD\n\nG0.=.ot.emd(a,.b,.M)\n\np |
2500 | 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e | l.figure(3,.figsize=(5,.5))\not. |
2520 | 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 30 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 | plot.plot1D_mat(a,.b,.G0,.'OT.ma |
2540 | 74 72 69 78 20 47 30 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 | trix.G0')".......],........"outp |
2560 | 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 | uts":.[],........"metadata":.{.. |
2580 | 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 | ......."collapsed":.false....... |
25a0 | 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 | }.....},......{......."source":. |
25c0 | 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e | [........."Solve.EMD.with.Froben |
25e0 | 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 | ius.norm.regularization\n####### |
2600 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
2620 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
2640 | 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c | ######\n\n".......],........"cel |
2660 | 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 | l_type":."markdown",........"met |
2680 | 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 | adata":.{}.....},......{......." |
26a0 | 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | execution_count":.null,........" |
26c0 | 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 | cell_type":."code",........"sour |
26e0 | 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 | ce":.[........."#%%.Example.with |
2700 | 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e | .Frobenius.norm.regularization\n |
2720 | 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 30 2e 35 20 2a 20 | \n\ndef.f(G):\n....return.0.5.*. |
2740 | 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 2a 2a 32 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 | np.sum(G**2)\n\n\ndef.df(G):\n.. |
2760 | 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 47 5c 6e 5c 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 31 5c 6e 5c 6e 47 6c | ..return.G\n\n\nreg.=.1e-1\n\nGl |
2780 | 32 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 66 2c | 2.=.ot.optim.cg(a,.b,.M,.reg,.f, |
27a0 | 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 | .df,.verbose=True)\n\npl.figure( |
27c0 | 33 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 6c 32 | 3)\not.plot.plot1D_mat(a,.b,.Gl2 |
27e0 | 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 46 72 6f 62 2e 20 72 65 67 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 | ,.'OT.matrix.Frob..reg')"....... |
2800 | 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | ],........"outputs":.[],........ |
2820 | 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 | "metadata":.{........."collapsed |
2840 | 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 | ":.false.......}.....},......{.. |
2860 | 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 53 6f 6c 76 65 20 | ....."source":.[........."Solve. |
2880 | 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e | EMD.with.entropic.regularization |
28a0 | 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | \n############################## |
28c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
28e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 | ###############\n\n".......],... |
2900 | 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 | ....."cell_type":."markdown",... |
2920 | 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 | ....."metadata":.{}.....},...... |
2940 | 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c | {......."execution_count":.null, |
2960 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 | ........"cell_type":."code",.... |
2980 | 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 78 61 | ...."source":.[........."#%%.Exa |
29a0 | 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f | mple.with.entropic.regularizatio |
29c0 | 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e | n\n\n\ndef.f(G):\n....return.np. |
29e0 | 73 75 6d 28 47 20 2a 20 6e 70 2e 6c 6f 67 28 47 29 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 64 66 28 47 | sum(G.*.np.log(G))\n\n\ndef.df(G |
2a00 | 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 6c 6f 67 28 47 29 20 2b 20 31 2e 5c 6e 5c | ):\n....return.np.log(G).+.1.\n\ |
2a20 | 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 5c 6e 47 65 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 63 | n\nreg.=.1e-3\n\nGe.=.ot.optim.c |
2a40 | 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 | g(a,.b,.M,.reg,.f,.df,.verbose=T |
2a60 | 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c | rue)\n\npl.figure(4,.figsize=(5, |
2a80 | 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 | .5))\not.plot.plot1D_mat(a,.b,.G |
2aa0 | 65 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 45 6e 74 72 6f 70 2e 20 72 65 67 27 29 22 0a 20 20 20 | e,.'OT.matrix.Entrop..reg')".... |
2ac0 | 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 | ...],........"outputs":.[],..... |
2ae0 | 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 | ..."metadata":.{........."collap |
2b00 | 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 | sed":.false.......}.....},...... |
2b20 | 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 53 6f 6c | {......."source":.[........."Sol |
2b40 | 76 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 2b 20 65 6e 74 | ve.EMD.with.Frobenius.norm.+.ent |
2b60 | 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ropic.regularization\n########## |
2b80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
2ba0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
2bc0 | 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 | ###\n\n".......],........"cell_t |
2be0 | 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 | ype":."markdown",........"metada |
2c00 | 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 | ta":.{}.....},......{......."exe |
2c20 | 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c | cution_count":.null,........"cel |
2c40 | 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 | l_type":."code",........"source" |
2c60 | 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 46 72 | :.[........."#%%.Example.with.Fr |
2c80 | 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 2b 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 | obenius.norm.+.entropic.regulari |
2ca0 | 7a 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 67 63 67 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 | zation.with.gcg\n\ndef.f(G):\n.. |
2cc0 | 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 30 2e 35 20 2a 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 2a 2a 32 29 5c 6e 5c 6e 5c | ..return.0.5.*.np.sum(G**2)\n\n\ |
2ce0 | 6e 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 47 5c 6e 5c 6e 5c 6e 72 | ndef.df(G):\n....return.G\n\n\nr |
2d00 | 65 67 31 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 72 65 67 32 20 3d 20 31 65 2d 31 5c 6e 5c 6e 47 65 6c 32 20 | eg1.=.1e-3\nreg2.=.1e-1\n\nGel2. |
2d20 | 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 67 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 31 2c 20 72 65 | =.ot.optim.gcg(a,.b,.M,.reg1,.re |
2d40 | 67 32 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 | g2,.f,.df,.verbose=True)\n\npl.f |
2d60 | 69 67 75 72 65 28 35 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f | igure(5,.figsize=(5,.5))\not.plo |
2d80 | 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 65 6c 32 2c 20 27 4f 54 20 65 6e 74 | t.plot1D_mat(a,.b,.Gel2,.'OT.ent |
2da0 | 72 6f 70 69 63 20 2b 20 6d 61 74 72 69 78 20 46 72 6f 62 2e 20 72 65 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 | ropic.+.matrix.Frob..reg')\npl.s |
2dc0 | 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 | how()".......],........"outputs" |
2de0 | 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 | :.[],........"metadata":.{...... |
2e00 | 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 | ..."collapsed":.false.......}... |
2e20 | 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b | ..}...],...."metadata":.{....."k |
2e40 | 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d | ernelspec":.{......."display_nam |
2e60 | 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 | e":."Python.2",........"name":." |
2e80 | 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 | python2",........"language":."py |
2ea0 | 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f | thon".....},......"language_info |
2ec0 | 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 | ":.{......."mimetype":."text/x-p |
2ee0 | 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 | ython",........"nbconvert_export |
2f00 | 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 | er":."python",........"name":."p |
2f20 | 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a | ython",........"file_extension": |
2f40 | 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 | .".py",........"version":."2.7.1 |
2f60 | 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 | 2",........"pygments_lexer":."ip |
2f80 | 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 | ython2",........"codemirror_mode |
2fa0 | 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 | ":.{........."version":.2,...... |
2fc0 | 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 | ...."name":."ipython".......}... |
2fe0 | 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 76 7b 82 49 50 0d 0a 74 03 0e 00 00 03 | ..}...}.}PK........v{.IP..t..... |
3000 | 0e 00 00 25 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 63 | ...%...auto_examples/plot_OTDA_c |
3020 | 6c 61 73 73 65 73 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 | lasses.ipynb{..."nbformat_minor" |
3040 | 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 | :.0,...."nbformat":.4,...."cells |
3060 | 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e | ":.[.....{......."execution_coun |
3080 | 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 | t":.null,........"cell_type":."c |
30a0 | 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 | ode",........"source":.[........ |
30c0 | 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a | ."%matplotlib.inline".......],.. |
30e0 | 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 | ......"outputs":.[],........"met |
3100 | 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 | adata":.{........."collapsed":.f |
3120 | 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 | alse.......}.....},......{...... |
3140 | 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 4f 54 20 66 6f 72 | ."source":.[........."\n#.OT.for |
3160 | 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 | .domain.adaptation\n\n\n\n"..... |
3180 | 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f | ..],........"cell_type":."markdo |
31a0 | 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d | wn",........"metadata":.{}.....} |
31c0 | 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 | ,......{......."execution_count" |
31e0 | 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 | :.null,........"cell_type":."cod |
3200 | 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 | e",........"source":.[........." |
3220 | 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 | import.matplotlib.pylab.as.pl\ni |
3240 | 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 | mport.ot\n\n\n\n\n#%%.parameters |
3260 | 5c 6e 5c 6e 6e 3d 31 35 30 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 69 6e 20 73 6f 75 72 63 65 | \n\nn=150.#.nb.samples.in.source |
3280 | 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 61 74 61 73 65 74 73 5c 6e 5c 6e 78 73 2c 79 73 3d 6f 74 | .and.target.datasets\n\nxs,ys=ot |
32a0 | 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 | .datasets.get_data_classif('3gau |
32c0 | 73 73 27 2c 6e 29 5c 6e 78 74 2c 79 74 3d 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 | ss',n)\nxt,yt=ot.datasets.get_da |
32e0 | 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 32 27 2c 6e 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c | ta_classif('3gauss2',n)\n\n\n\n\ |
3300 | 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 | n#%%.plot.samples\n\npl.figure(1 |
3320 | 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 | )\n\npl.subplot(2,2,1)\npl.scatt |
3340 | 65 72 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 | er(xs[:,0],xs[:,1],c=ys,marker=' |
3360 | 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c | +',label='Source.samples')\npl.l |
3380 | 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 | egend(loc=0)\npl.title('Source.. |
33a0 | 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | distributions')\n\npl.subplot(2, |
33c0 | 32 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d | 2,2)\npl.scatter(xt[:,0],xt[:,1] |
33e0 | 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 | ,c=yt,marker='o',label='Target.s |
3400 | 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 | amples')\npl.legend(loc=0)\npl.t |
3420 | 69 74 6c 65 28 27 74 61 72 67 65 74 20 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c | itle('target..distributions')\n\ |
3440 | 6e 5c 6e 23 25 25 20 4f 54 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 4c 50 20 70 72 6f | n\n#%%.OT.estimation\n\n#.LP.pro |
3460 | 62 6c 65 6d 5c 6e 64 61 5f 65 6d 64 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 28 29 20 20 20 20 20 23 20 | blem\nda_emd=ot.da.OTDA().....#. |
3480 | 69 6e 69 74 20 63 6c 61 73 73 5c 6e 64 61 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 74 29 20 20 20 | init.class\nda_emd.fit(xs,xt)... |
34a0 | 20 20 20 20 23 20 66 69 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 78 73 74 30 3d 64 61 | ....#.fit.distributions\nxst0=da |
34c0 | 5f 65 6d 64 2e 69 6e 74 65 72 70 28 29 20 20 20 20 23 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e | _emd.interp()....#.interpolation |
34e0 | 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 73 69 6e 6b 68 6f | .of.source.samples\n\n\n#.sinkho |
3500 | 72 6e 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 6c 61 6d 62 64 3d 31 65 2d 31 5c 6e 64 | rn.regularization\nlambd=1e-1\nd |
3520 | 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 29 5c 6e | a_entrop=ot.da.OTDA_sinkhorn()\n |
3540 | 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 74 2c 72 65 67 3d 6c 61 6d 62 64 29 5c 6e | da_entrop.fit(xs,xt,reg=lambd)\n |
3560 | 78 73 74 73 3d 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 69 6e 74 65 72 70 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6e 6f 6e | xsts=da_entrop.interp()\n\n#.non |
3580 | 2d 63 6f 6e 76 65 78 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 | -convex.Group.lasso.regularizati |
35a0 | 6f 6e 5c 6e 72 65 67 3d 31 65 2d 31 5c 6e 65 74 61 3d 31 65 30 5c 6e 64 61 5f 6c 70 6c 31 3d 6f | on\nreg=1e-1\neta=1e0\nda_lpl1=o |
35c0 | 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 5f 6c 70 6c 31 28 29 5c 6e 64 61 5f 6c 70 6c 31 2e 66 69 74 28 78 73 | t.da.OTDA_lpl1()\nda_lpl1.fit(xs |
35e0 | 2c 79 73 2c 78 74 2c 72 65 67 3d 72 65 67 2c 65 74 61 3d 65 74 61 29 5c 6e 78 73 74 67 3d 64 61 | ,ys,xt,reg=reg,eta=eta)\nxstg=da |
3600 | 5f 6c 70 6c 31 2e 69 6e 74 65 72 70 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 54 72 75 65 20 47 72 6f 75 70 | _lpl1.interp()\n\n\n#.True.Group |
3620 | 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 72 65 67 3d 31 65 2d 31 5c | .lasso.regularization\nreg=1e-1\ |
3640 | 6e 65 74 61 3d 32 65 30 5c 6e 64 61 5f 6c 31 6c 32 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 5f 6c 31 6c | neta=2e0\nda_l1l2=ot.da.OTDA_l1l |
3660 | 32 28 29 5c 6e 64 61 5f 6c 31 6c 32 2e 66 69 74 28 78 73 2c 79 73 2c 78 74 2c 72 65 67 3d 72 65 | 2()\nda_l1l2.fit(xs,ys,xt,reg=re |
3680 | 67 2c 65 74 61 3d 65 74 61 2c 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 3d 32 30 2c 76 65 72 62 6f 73 65 3d | g,eta=eta,numItermax=20,verbose= |
36a0 | 54 72 75 65 29 5c 6e 78 73 74 67 6c 3d 64 61 5f 6c 31 6c 32 2e 69 6e 74 65 72 70 28 29 5c 6e 5c | True)\nxstgl=da_l1l2.interp()\n\ |
36c0 | 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 65 64 20 73 6f 75 72 63 65 20 | n\n#%%.plot.interpolated.source. |
36e0 | 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 28 31 35 2c 38 29 29 5c 6e 5c 6e | samples\npl.figure(4,(15,8))\n\n |
3700 | 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 3d 7b 27 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 27 3a 27 6e 65 61 72 | param_img={'interpolation':'near |
3720 | 65 73 74 27 2c 27 63 6d 61 70 27 3a 27 6a 65 74 27 7d 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | est','cmap':'jet'}\n\npl.subplot |
3740 | 28 32 2c 34 2c 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 64 61 5f 65 6d 64 2e 47 2c 2a 2a 70 61 | (2,4,1)\npl.imshow(da_emd.G,**pa |
3760 | 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 27 29 5c | ram_img)\npl.title('OT.matrix')\ |
3780 | 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 34 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f | n\n\npl.subplot(2,4,2)\npl.imsho |
37a0 | 77 28 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 47 2c 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 74 | w(da_entrop.G,**param_img)\npl.t |
37c0 | 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | itle('OT.matrix.sinkhorn')\n\npl |
37e0 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 34 2c 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 64 61 5f 6c 70 | .subplot(2,4,3)\npl.imshow(da_lp |
3800 | 6c 31 2e 47 2c 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 | l1.G,**param_img)\npl.title('OT. |
3820 | 6d 61 74 72 69 78 20 6e 6f 6e 2d 63 6f 6e 76 65 78 20 47 72 6f 75 70 20 4c 61 73 73 6f 27 29 5c | matrix.non-convex.Group.Lasso')\ |
3840 | 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 34 2c 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 | n\npl.subplot(2,4,4)\npl.imshow( |
3860 | 64 61 5f 6c 31 6c 32 2e 47 2c 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | da_l1l2.G,**param_img)\npl.title |
3880 | 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 72 6f 75 70 20 4c 61 73 73 6f 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 | ('OT.matrix.Group.Lasso')\n\n\np |
38a0 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 34 2c 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b | l.subplot(2,4,5)\npl.scatter(xt[ |
38c0 | 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 | :,0],xt[:,1],c=yt,marker='o',lab |
38e0 | 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e | el='Target.samples',alpha=0.3)\n |
3900 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 30 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 30 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 | pl.scatter(xst0[:,0],xst0[:,1],c |
3920 | 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d | =ys,marker='+',label='Transp.sam |
3940 | 70 6c 65 73 27 2c 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6e 74 65 72 70 20 73 61 | ples',s=30)\npl.title('Interp.sa |
3960 | 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e | mples')\npl.legend(loc=0)\n\npl. |
3980 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 34 2c 36 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c | subplot(2,4,6)\npl.scatter(xt[:, |
39a0 | 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c | 0],xt[:,1],c=yt,marker='o',label |
39c0 | 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c | ='Target.samples',alpha=0.3)\npl |
39e0 | 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 | .scatter(xsts[:,0],xsts[:,1],c=y |
3a00 | 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c | s,marker='+',label='Transp.sampl |
3a20 | 65 73 27 2c 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6e 74 65 72 70 20 73 61 6d 70 | es',s=30)\npl.title('Interp.samp |
3a40 | 6c 65 73 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 34 | les.Sinkhorn')\n\npl.subplot(2,4 |
3a60 | 2c 37 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c | ,7)\npl.scatter(xt[:,0],xt[:,1], |
3a80 | 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 | c=yt,marker='o',label='Target.sa |
3aa0 | 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 | mples',alpha=0.3)\npl.scatter(xs |
3ac0 | 74 67 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 67 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b | tg[:,0],xstg[:,1],c=ys,marker='+ |
3ae0 | 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 73 3d 33 30 29 5c 6e | ',label='Transp.samples',s=30)\n |
3b00 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6e 74 65 72 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6e 6f 6e 2d 63 6f 6e | pl.title('Interp.samples.non-con |
3b20 | 76 65 78 20 47 72 6f 75 70 20 4c 61 73 73 6f 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | vex.Group.Lasso')\n\npl.subplot( |
3b40 | 32 2c 34 2c 38 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c | 2,4,8)\npl.scatter(xt[:,0],xt[:, |
3b60 | 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 | 1],c=yt,marker='o',label='Target |
3b80 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 | .samples',alpha=0.3)\npl.scatter |
3ba0 | 28 78 73 74 67 6c 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 67 6c 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b | (xstgl[:,0],xstgl[:,1],c=ys,mark |
3bc0 | 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 73 3d | er='+',label='Transp.samples',s= |
3be0 | 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6e 74 65 72 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 47 72 | 30)\npl.title('Interp.samples.Gr |
3c00 | 6f 75 70 20 4c 61 73 73 6f 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 | oup.Lasso')".......],........"ou |
3c20 | 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b | tputs":.[],........"metadata":.{ |
3c40 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 | ........."collapsed":.false..... |
3c60 | 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a | ..}.....}...],...."metadata":.{. |
3c80 | 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c | ...."kernelspec":.{......."displ |
3ca0 | 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 | ay_name":."Python.2",........"na |
3cc0 | 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 | me":."python2",........"language |
3ce0 | 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 | ":."python".....},......"languag |
3d00 | 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 | e_info":.{......."mimetype":."te |
3d20 | 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f | xt/x-python",........"nbconvert_ |
3d40 | 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d | exporter":."python",........"nam |
3d60 | 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e | e":."python",........"file_exten |
3d80 | 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 | sion":.".py",........"version":. |
3da0 | 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 | "2.7.12",........"pygments_lexer |
3dc0 | 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f | ":."ipython2",........"codemirro |
3de0 | 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c | r_mode":.{........."version":.2, |
3e00 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 | .........."name":."ipython"..... |
3e20 | 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 b7 86 1e 4b 6b 88 21 | ..}.....}...}.}PK...........Kk.! |
3e40 | 84 aa 1d 00 00 aa 1d 00 00 20 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f | .............auto_examples/plot_ |
3e60 | 6f 74 64 61 5f 64 32 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 | otda_d2.ipynb{..."nbformat_minor |
3e80 | 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c | ":.0,...."nbformat":.4,...."cell |
3ea0 | 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 | s":.[.....{......."execution_cou |
3ec0 | 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 | nt":.null,........"cell_type":." |
3ee0 | 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 | code",........"source":.[....... |
3f00 | 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 | .."%matplotlib.inline".......],. |
3f20 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 | ......."outputs":.[],........"me |
3f40 | 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 | tadata":.{........."collapsed":. |
3f60 | 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 | false.......}.....},......{..... |
3f80 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 4f 54 20 66 6f | .."source":.[........."\n#.OT.fo |
3fa0 | 72 20 65 6d 70 69 72 69 63 61 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 54 | r.empirical.distributions\n\n\nT |
3fc0 | 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 73 20 61 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 | his.example.introduces.a.domain. |
3fe0 | 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 69 6e 20 61 20 32 44 20 73 65 74 74 69 6e 67 2e 20 49 74 20 65 | adaptation.in.a.2D.setting..It.e |
4000 | 78 70 6c 69 63 69 74 73 5c 6e 74 68 65 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 20 6f 66 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 | xplicits\nthe.problem.of.domain. |
4020 | 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 61 6e 64 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 73 20 73 6f 6d 65 20 6f | adaptation.and.introduces.some.o |
4040 | 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 61 70 70 72 6f 61 63 68 65 73 20 74 6f 20 | ptimal.transport\napproaches.to. |
4060 | 73 6f 6c 76 65 20 69 74 2e 5c 6e 5c 6e 51 75 61 6e 74 69 74 69 65 73 20 73 75 63 68 20 61 73 20 | solve.it.\n\nQuantities.such.as. |
4080 | 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 2c 20 67 72 65 61 74 65 72 20 63 6f 75 70 6c | optimal.couplings,.greater.coupl |
40a0 | 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 20 61 6e 64 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 | ing.coefficients.and\ntransporte |
40c0 | 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 61 72 65 20 72 65 70 72 65 73 65 6e 74 65 64 20 69 6e 20 6f 72 64 | d.samples.are.represented.in.ord |
40e0 | 65 72 20 74 6f 20 67 69 76 65 20 61 20 76 69 73 75 61 6c 20 75 6e 64 65 72 73 74 61 6e 64 69 6e | er.to.give.a.visual.understandin |
4100 | 67 5c 6e 6f 66 20 77 68 61 74 20 74 68 65 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 | g\nof.what.the.transport.methods |
4120 | 20 61 72 65 20 64 6f 69 6e 67 2e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | .are.doing.\n\n".......],....... |
4140 | 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | ."cell_type":."markdown",....... |
4160 | 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 | ."metadata":.{}.....},......{... |
4180 | 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 | ...."execution_count":.null,.... |
41a0 | 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | ...."cell_type":."code",........ |
41c0 | 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 | "source":.[........."#.Authors:. |
41e0 | 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 | Remi.Flamary.<remi.flamary@unice |
4200 | 2e 66 72 3e 5c 6e 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 | .fr>\n#..........Stanislas.Chamb |
4220 | 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 5c 6e 23 5c 6e | on.<stan.chambon@gmail.com>\n#\n |
4240 | 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 | #.License:.MIT.License\n\nimport |
4260 | 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 | .matplotlib.pylab.as.pl\nimport. |
4280 | 6f 74 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b | ot".......],........"outputs":.[ |
42a0 | 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 | ],........"metadata":.{......... |
42c0 | 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d | "collapsed":.false.......}.....} |
42e0 | 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 | ,......{......."source":.[...... |
4300 | 20 20 20 22 67 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ..."generate.data\n############# |
4320 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
4340 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
4360 | 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 | \n\n".......],........"cell_type |
4380 | 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 | ":."markdown",........"metadata" |
43a0 | 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 | :.{}.....},......{......."execut |
43c0 | 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 | ion_count":.null,........"cell_t |
43e0 | 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b | ype":."code",........"source":.[ |
4400 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 73 6f 75 72 63 65 20 3d 20 31 35 30 | ........."n_samples_source.=.150 |
4420 | 5c 6e 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 31 35 30 5c 6e 5c 6e 58 73 2c 20 | \nn_samples_target.=.150\n\nXs,. |
4440 | 79 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 | ys.=.ot.datasets.get_data_classi |
4460 | 66 28 27 33 67 61 75 73 73 27 2c 20 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 73 6f 75 72 63 65 29 5c 6e 58 | f('3gauss',.n_samples_source)\nX |
4480 | 74 2c 20 79 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 | t,.yt.=.ot.datasets.get_data_cla |
44a0 | 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 32 27 2c 20 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 74 61 72 67 65 74 | ssif('3gauss2',.n_samples_target |
44c0 | 29 5c 6e 5c 6e 23 20 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 | )\n\n#.Cost.matrix\nM.=.ot.dist( |
44e0 | 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 22 0a 20 | Xs,.Xt,.metric='sqeuclidean')".. |
4500 | 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 | .....],........"outputs":.[],... |
4520 | 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c | ....."metadata":.{........."coll |
4540 | 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 | apsed":.false.......}.....},.... |
4560 | 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 49 | ..{......."source":.[........."I |
4580 | 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f | nstantiate.the.different.transpo |
45a0 | 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 5c 6e 23 23 23 23 | rt.algorithms.and.fit.them\n#### |
45c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
45e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
4600 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | #########\n\n".......],........" |
4620 | 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | cell_type":."markdown",........" |
4640 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 | metadata":.{}.....},......{..... |
4660 | 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 | .."execution_count":.null,...... |
4680 | 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 | .."cell_type":."code",........"s |
46a0 | 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 45 4d 44 20 54 72 61 6e 73 70 6f | ource":.[........."#.EMD.Transpo |
46c0 | 72 74 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 | rt\not_emd.=.ot.da.EMDTransport( |
46e0 | 29 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 | )\not_emd.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n# |
4700 | 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e | .Sinkhorn.Transport\not_sinkhorn |
4720 | 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 | .=.ot.da.SinkhornTransport(reg_e |
4740 | 3d 31 65 2d 31 29 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 | =1e-1)\not_sinkhorn.fit(Xs=Xs,.X |
4760 | 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 | t=Xt)\n\n#.Sinkhorn.Transport.wi |
4780 | 74 68 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 6f | th.Group.lasso.regularization\no |
47a0 | 74 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 | t_lpl1.=.ot.da.SinkhornLpl1Trans |
47c0 | 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 2c 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 31 65 30 29 5c 6e 6f 74 | port(reg_e=1e-1,.reg_cl=1e0)\not |
47e0 | 5f 6c 70 6c 31 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e | _lpl1.fit(Xs=Xs,.ys=ys,.Xt=Xt)\n |
4800 | 5c 6e 23 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6f 6e 74 | \n#.transport.source.samples.ont |
4820 | 6f 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 | o.target.samples\ntransp_Xs_emd. |
4840 | 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 | =.ot_emd.transform(Xs=Xs)\ntrans |
4860 | 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e | p_Xs_sinkhorn.=.ot_sinkhorn.tran |
4880 | 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f | sform(Xs=Xs)\ntransp_Xs_lpl1.=.o |
48a0 | 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d | t_lpl1.transform(Xs=Xs)".......] |
48c0 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ,........"outputs":.[],........" |
48e0 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 | metadata":.{........."collapsed" |
4900 | 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 | :.false.......}.....},......{... |
4920 | 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 31 20 3a | ...."source":.[........."Fig.1.: |
4940 | 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | .plots.source.and.target.samples |
4960 | 20 2b 20 6d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 5c 6e | .+.matrix.of.pairwise.distance\n |
4980 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
49a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
49c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 | #############\n\n".......],..... |
49e0 | 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 | ..."cell_type":."markdown",..... |
4a00 | 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a | ..."metadata":.{}.....},......{. |
4a20 | 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a | ......"execution_count":.null,.. |
4a40 | 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 | ......"cell_type":."code",...... |
4a60 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 | .."source":.[........."pl.figure |
4a80 | 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 31 30 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | (1,.figsize=(10,.10))\npl.subplo |
4aa0 | 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c | t(2,.2,.1)\npl.scatter(Xs[:,.0], |
4ac0 | 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 | .Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+',.lab |
4ae0 | 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 | el='Source.samples')\npl.xticks( |
4b00 | 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f | [])\npl.yticks([])\npl.legend(lo |
4b20 | 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 | c=0)\npl.title('Source..samples' |
4b40 | 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 | )\n\npl.subplot(2,.2,.2)\npl.sca |
4b60 | 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d | tter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.m |
4b80 | 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | arker='o',.label='Target.samples |
4ba0 | 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 | ')\npl.xticks([])\npl.yticks([]) |
4bc0 | 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 | \npl.legend(loc=0)\npl.title('Ta |
4be0 | 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 | rget.samples')\n\npl.subplot(2,. |
4c00 | 32 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f | 2,.3)\npl.imshow(M,.interpolatio |
4c20 | 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e | n='nearest')\npl.xticks([])\npl. |
4c40 | 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 | yticks([])\npl.title('Matrix.of. |
4c60 | 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c | pairwise.distances')\npl.tight_l |
4c80 | 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 | ayout()".......],........"output |
4ca0 | 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 | s":.[],........"metadata":.{.... |
4cc0 | 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a | ....."collapsed":.false.......}. |
4ce0 | 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a | ....},......{......."source":.[. |
4d00 | 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 | ........"Fig.2.:.plots.optimal.c |
4d20 | 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f | ouplings.for.the.different.metho |
4d40 | 64 73 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ds\n############################ |
4d60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
4d80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 | #################\n\n".......],. |
4da0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 | ......."cell_type":."markdown",. |
4dc0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 | ......."metadata":.{}.....},.... |
4de0 | 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c | ..{......."execution_count":.nul |
4e00 | 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a | l,........"cell_type":."code",.. |
4e20 | 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 | ......"source":.[........."pl.fi |
4e40 | 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 36 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 | gure(2,.figsize=(10,.6))\n\npl.s |
4e60 | 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d | ubplot(2,.3,.1)\npl.imshow(ot_em |
4e80 | 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 | d.coupling_,.interpolation='near |
4ea0 | 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 | est')\npl.xticks([])\npl.yticks( |
4ec0 | 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c | [])\npl.title('Optimal.coupling\ |
4ee0 | 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 | \nEMDTransport')\n\npl.subplot(2 |
4f00 | 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 | ,.3,.2)\npl.imshow(ot_sinkhorn.c |
4f20 | 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 | oupling_,.interpolation='nearest |
4f40 | 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 | ')\npl.xticks([])\npl.yticks([]) |
4f60 | 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 | \npl.title('Optimal.coupling\\nS |
4f80 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | inkhornTransport')\n\npl.subplot |
4fa0 | 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 | (2,.3,.3)\npl.imshow(ot_lpl1.cou |
4fc0 | 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 | pling_,.interpolation='nearest') |
4fe0 | 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e | \npl.xticks([])\npl.yticks([])\n |
5000 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e | pl.title('Optimal.coupling\\nSin |
5020 | 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | khornLpl1Transport')\n\npl.subpl |
5040 | 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 | ot(2,.3,.4)\not.plot.plot2D_samp |
5060 | 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f | les_mat(Xs,.Xt,.ot_emd.coupling_ |
5080 | 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b | ,.c=[.5,..5,.1])\npl.scatter(Xs[ |
50a0 | 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b | :,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+ |
50c0 | 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 | ',.label='Source.samples')\npl.s |
50e0 | 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c | catter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt, |
5100 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c | .marker='o',.label='Target.sampl |
5120 | 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b | es')\npl.xticks([])\npl.yticks([ |
5140 | 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 | ])\npl.title('Main.coupling.coef |
5160 | 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e | ficients\\nEMDTransport')\n\npl. |
5180 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 | subplot(2,.3,.5)\not.plot.plot2D |
51a0 | 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e | _samples_mat(Xs,.Xt,.ot_sinkhorn |
51c0 | 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 | .coupling_,.c=[.5,..5,.1])\npl.s |
51e0 | 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c | catter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys, |
5200 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c | .marker='+',.label='Source.sampl |
5220 | 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c | es')\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:, |
5240 | 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 | .1],.c=yt,.marker='o',.label='Ta |
5260 | 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 | rget.samples')\npl.xticks([])\np |
5280 | 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 | l.yticks([])\npl.title('Main.cou |
52a0 | 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 | pling.coefficients\\nSinkhornTra |
52c0 | 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 5c | nsport')\n\npl.subplot(2,.3,.6)\ |
52e0 | 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 | not.plot.plot2D_samples_mat(Xs,. |
5300 | 58 74 2c 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 | Xt,.ot_lpl1.coupling_,.c=[.5,..5 |
5320 | 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a | ,.1])\npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[: |
5340 | 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 | ,.1],.c=ys,.marker='+',.label='S |
5360 | 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a | ource.samples')\npl.scatter(Xt[: |
5380 | 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 | ,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o' |
53a0 | 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 | ,.label='Target.samples')\npl.xt |
53c0 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c | icks([])\npl.yticks([])\npl.titl |
53e0 | 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e | e('Main.coupling.coefficients\\n |
5400 | 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 | SinkhornLpl1Transport')\npl.tigh |
5420 | 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 | t_layout()".......],........"out |
5440 | 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a | puts":.[],........"metadata":.{. |
5460 | 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 | ........"collapsed":.false...... |
5480 | 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a | .}.....},......{......."source": |
54a0 | 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 33 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f | .[........."Fig.3.:.plot.transpo |
54c0 | 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | rted.samples\n################## |
54e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
5500 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 | ###########################\n\n" |
5520 | 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d | .......],........"cell_type":."m |
5540 | 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a | arkdown",........"metadata":.{}. |
5560 | 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 | ....},......{......."execution_c |
5580 | 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a | ount":.null,........"cell_type": |
55a0 | 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 | ."code",........"source":.[..... |
55c0 | 20 20 20 20 22 23 20 64 69 73 70 6c 61 79 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c | ...."#.display.transported.sampl |
55e0 | 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 34 29 | es\npl.figure(4,.figsize=(10,.4) |
5600 | 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 | )\npl.subplot(1,.3,.1)\npl.scatt |
5620 | 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 | er(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.mar |
5640 | 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 | ker='o',\n...........label='Targ |
5660 | 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 | et.samples',.alpha=0.5)\npl.scat |
5680 | 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f | ter(transp_Xs_emd[:,.0],.transp_ |
56a0 | 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | Xs_emd[:,.1],.c=ys,\n........... |
56c0 | 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 | marker='+',.label='Transp.sample |
56e0 | 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 | s',.s=30)\npl.title('Transported |
5700 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 | .samples\\nEmdTransport')\npl.le |
5720 | 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 | gend(loc=0)\npl.xticks([])\npl.y |
5740 | 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 | ticks([])\n\npl.subplot(1,.3,.2) |
5760 | 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c | \npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1], |
5780 | 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c | .c=yt,.marker='o',\n...........l |
57a0 | 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 | abel='Target.samples',.alpha=0.5 |
57c0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e | )\npl.scatter(transp_Xs_sinkhorn |
57e0 | 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 31 5d | [:,.0],.transp_Xs_sinkhorn[:,.1] |
5800 | 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 | ,.c=ys,\n...........marker='+',. |
5820 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 | label='Transp.samples',.s=30)\np |
5840 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 53 | l.title('Transported.samples\\nS |
5860 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | inkhornTransport')\npl.xticks([] |
5880 | 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 | )\npl.yticks([])\n\npl.subplot(1 |
58a0 | 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 | ,.3,.3)\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt |
58c0 | 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 | [:,.1],.c=yt,.marker='o',\n..... |
58e0 | 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c | ......label='Target.samples',.al |
5900 | 70 68 61 3d 30 2e 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c | pha=0.5)\npl.scatter(transp_Xs_l |
5920 | 70 6c 31 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 31 5d 2c | pl1[:,.0],.transp_Xs_lpl1[:,.1], |
5940 | 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c | .c=ys,\n...........marker='+',.l |
5960 | 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c | abel='Transp.samples',.s=30)\npl |
5980 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 53 69 | .title('Transported.samples\\nSi |
59a0 | 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 | nkhornLpl1Transport')\npl.xticks |
59c0 | 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f | ([])\npl.yticks([])\n\npl.tight_ |
59e0 | 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 | layout()\npl.show()".......],... |
5a00 | 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | ....."outputs":.[],........"meta |
5a20 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 | data":.{........."collapsed":.fa |
5a40 | 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 | lse.......}.....}...],...."metad |
5a60 | 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 | ata":.{....."kernelspec":.{..... |
5a80 | 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 | .."display_name":."Python.2",... |
5aa0 | 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ....."name":."python2",........" |
5ac0 | 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 | language":."python".....},...... |
5ae0 | 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 | "language_info":.{......."mimety |
5b00 | 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 | pe":."text/x-python",........"nb |
5b20 | 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 | convert_exporter":."python",.... |
5b40 | 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 | ...."name":."python",........"fi |
5b60 | 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 | le_extension":.".py",........"ve |
5b80 | 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e | rsion":."2.7.12",........"pygmen |
5ba0 | 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 | ts_lexer":."ipython2",........"c |
5bc0 | 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 | odemirror_mode":.{........."vers |
5be0 | 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 | ion":.2,.........."name":."ipyth |
5c00 | 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 | on".......}.....}...}.}PK....... |
5c20 | 00 f8 88 1e 4b be 57 96 68 4b 0e 00 00 4b 0e 00 00 1e 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c | ....K.W.hK...K.......auto_exampl |
5c40 | 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 | es/plot_OT_1D.ipynb{..."nbformat |
5c60 | 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 | _minor":.0,...."nbformat":.4,... |
5c80 | 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 | ."cells":.[.....{......."executi |
5ca0 | 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 | on_count":.null,........"cell_ty |
5cc0 | 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a | pe":."code",........"source":.[. |
5ce0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 | ........"%matplotlib.inline".... |
5d00 | 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 | ...],........"outputs":.[],..... |
5d20 | 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 | ..."metadata":.{........."collap |
5d40 | 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 | sed":.false.......}.....},...... |
5d60 | 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 | {......."source":.[........."\n# |
5d80 | 20 31 44 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 | .1D.optimal.transport\n\n\n\n".. |
5da0 | 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 | .....],........"cell_type":."mar |
5dc0 | 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 | kdown",........"metadata":.{}... |
5de0 | 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 | ..},......{......."execution_cou |
5e00 | 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 | nt":.null,........"cell_type":." |
5e20 | 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 | code",........"source":.[....... |
5e40 | 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e | .."#.Author:.Remi.Flamary.<remi. |
5e60 | 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a | flamary@unice.fr>\n#\n#.License: |
5e80 | 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 | .MIT.License\n\nimport.numpy.as. |
5ea0 | 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 | np\nimport.matplotlib.pylab.as.p |
5ec0 | 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 20 69 | l\nimport.ot\nfrom.ot.datasets.i |
5ee0 | 6d 70 6f 72 74 20 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 20 61 73 20 67 61 75 73 73 22 0a 20 20 20 | mport.get_1D_gauss.as.gauss".... |
5f00 | 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 | ...],........"outputs":.[],..... |
5f20 | 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 | ..."metadata":.{........."collap |
5f40 | 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 | sed":.false.......}.....},...... |
5f60 | 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 47 65 6e | {......."source":.[........."Gen |
5f80 | 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | erate.data\n#################### |
5fa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
5fc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 | #########################\n\n".. |
5fe0 | 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 | .....],........"cell_type":."mar |
6000 | 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 | kdown",........"metadata":.{}... |
6020 | 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 | ..},......{......."execution_cou |
6040 | 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 | nt":.null,........"cell_type":." |
6060 | 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 | code",........"source":.[....... |
6080 | 20 20 22 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 | .."#%%.parameters\n\nn.=.100..#. |
60a0 | 6e 62 20 62 69 6e 73 5c 6e 5c 6e 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 5c 6e 78 20 3d 20 | nb.bins\n\n#.bin.positions\nx.=. |
60c0 | 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e | np.arange(n,.dtype=np.float64)\n |
60e0 | 5c 6e 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 61 20 3d 20 | \n#.Gaussian.distributions\na.=. |
6100 | 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 | gauss(n,.m=20,.s=5)..#.m=.mean,. |
6120 | 73 3d 20 73 74 64 5c 6e 62 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 36 30 2c 20 73 3d 31 30 29 | s=.std\nb.=.gauss(n,.m=60,.s=10) |
6140 | 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 | \n\n#.loss.matrix\nM.=.ot.dist(x |
6160 | 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 | .reshape((n,.1)),.x.reshape((n,. |
6180 | 31 29 29 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 | 1)))\nM./=.M.max()".......],.... |
61a0 | 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 | ...."outputs":.[],........"metad |
61c0 | 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c | ata":.{........."collapsed":.fal |
61e0 | 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 | se.......}.....},......{......." |
6200 | 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 64 69 73 74 72 69 62 | source":.[........."Plot.distrib |
6220 | 75 74 69 6f 6e 73 20 61 6e 64 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 | utions.and.loss.matrix\n######## |
6240 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6260 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6280 | 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c | #####\n\n".......],........"cell |
62a0 | 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | _type":."markdown",........"meta |
62c0 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 | data":.{}.....},......{......."e |
62e0 | 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 | xecution_count":.null,........"c |
6300 | 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 | ell_type":."code",........"sourc |
6320 | 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 | e":.[........."#%%.plot.the.dist |
6340 | 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a | ributions\n\npl.figure(1,.figsiz |
6360 | 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 61 2c 20 27 62 27 2c 20 | e=(6.4,.3))\npl.plot(x,.a,.'b',. |
6380 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 5c 6e 70 6c | label='Source.distribution')\npl |
63a0 | 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 64 | .plot(x,.b,.'r',.label='Target.d |
63c0 | 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 | istribution')\npl.legend()\n\n#% |
63e0 | 25 20 70 6c 6f 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 61 6e 64 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 | %.plot.distributions.and.loss.ma |
6400 | 74 72 69 78 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c | trix\n\npl.figure(2,.figsize=(5, |
6420 | 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 4d | .5))\not.plot.plot1D_mat(a,.b,.M |
6440 | 2c 20 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 4d 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 | ,.'Cost.matrix.M')".......],.... |
6460 | 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 | ...."outputs":.[],........"metad |
6480 | 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c | ata":.{........."collapsed":.fal |
64a0 | 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 | se.......}.....},......{......." |
64c0 | 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 20 5c 6e | source":.[........."Solve.EMD.\n |
64e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6500 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6520 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 | #############\n\n".......],..... |
6540 | 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 | ..."cell_type":."markdown",..... |
6560 | 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a | ..."metadata":.{}.....},......{. |
6580 | 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a | ......"execution_count":.null,.. |
65a0 | 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 | ......"cell_type":."code",...... |
65c0 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e | .."source":.[........."#%%.EMD\n |
65e0 | 5c 6e 47 30 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 | \nG0.=.ot.emd(a,.b,.M)\n\npl.fig |
6600 | 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e | ure(3,.figsize=(5,.5))\not.plot. |
6620 | 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 30 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 | plot1D_mat(a,.b,.G0,.'OT.matrix. |
6640 | 47 30 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a | G0')".......],........"outputs": |
6660 | 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | .[],........"metadata":.{....... |
6680 | 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 | .."collapsed":.false.......}.... |
66a0 | 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 | .},......{......."source":.[.... |
66c0 | 20 20 20 20 20 22 53 6f 6c 76 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ....."Solve.Sinkhorn\n########## |
66e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6700 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6720 | 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 | ###\n\n".......],........"cell_t |
6740 | 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 | ype":."markdown",........"metada |
6760 | 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 | ta":.{}.....},......{......."exe |
6780 | 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c | cution_count":.null,........"cel |
67a0 | 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 | l_type":."code",........"source" |
67c0 | 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 5c 6e 6c 61 6d | :.[........."#%%.Sinkhorn\n\nlam |
67e0 | 62 64 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 47 73 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c 20 62 | bd.=.1e-3\nGs.=.ot.sinkhorn(a,.b |
6800 | 2c 20 4d 2c 20 6c 61 6d 62 64 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e | ,.M,.lambd,.verbose=True)\n\npl. |
6820 | 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c | figure(4,.figsize=(5,.5))\not.pl |
6840 | 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 73 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 | ot.plot1D_mat(a,.b,.Gs,.'OT.matr |
6860 | 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 | ix.Sinkhorn')\n\npl.show()"..... |
6880 | 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 | ..],........"outputs":.[],...... |
68a0 | 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 | .."metadata":.{........."collaps |
68c0 | 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 | ed":.false.......}.....}...],... |
68e0 | 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a | ."metadata":.{....."kernelspec": |
6900 | 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e | .{......."display_name":."Python |
6920 | 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a | .2",........"name":."python2",.. |
6940 | 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d | ......"language":."python".....} |
6960 | 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | ,......"language_info":.{....... |
6980 | 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 | "mimetype":."text/x-python",.... |
69a0 | 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f | ...."nbconvert_exporter":."pytho |
69c0 | 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 | n",........"name":."python",.... |
69e0 | 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 | ...."file_extension":.".py",.... |
6a00 | 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | ...."version":."2.7.12",........ |
6a20 | 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 | "pygments_lexer":."ipython2",... |
6a40 | 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | ....."codemirror_mode":.{....... |
6a60 | 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a | .."version":.2,.........."name": |
6a80 | 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b | ."ipython".......}.....}...}.}PK |
6aa0 | 03 04 14 00 00 00 00 00 32 82 e3 4a 48 a2 ab 22 f5 14 00 00 f5 14 00 00 20 00 00 00 61 75 74 6f | ........2..JH.."............auto |
6ac0 | 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 63 6f 6e 76 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 | _examples/plot_OT_conv.ipynb{... |
6ae0 | 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 | "nbformat_minor":.0,...."nbforma |
6b00 | 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 | t":.4,...."cells":.[.....{...... |
6b20 | 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | ."execution_count":.null,....... |
6b40 | 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f | ."cell_type":."code",........"so |
6b60 | 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e | urce":.[........."%matplotlib.in |
6b80 | 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a | line".......],........"outputs": |
6ba0 | 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | .[],........"metadata":.{....... |
6bc0 | 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 | .."collapsed":.false.......}.... |
6be0 | 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 | .},......{......."source":.[.... |
6c00 | 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 31 44 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 62 61 72 79 63 65 6e | ....."\n#.1D.Wasserstein.barycen |
6c20 | 74 65 72 20 64 65 6d 6f 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 40 61 75 74 68 6f 72 3a 20 72 66 6c 61 6d 61 72 | ter.demo\n\n\n\n@author:.rflamar |
6c40 | 79 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 | y\n\n".......],........"cell_typ |
6c60 | 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 | e":."markdown",........"metadata |
6c80 | 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 | ":.{}.....},......{......."execu |
6ca0 | 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f | tion_count":.null,........"cell_ |
6cc0 | 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 | type":."code",........"source":. |
6ce0 | 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 | [........."import.numpy.as.np\ni |
6d00 | 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d | mport.matplotlib.pylab.as.pl\nim |
6d20 | 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6d 70 6c 5f 74 6f 6f 6c 6b 69 74 73 2e 6d 70 6c 6f 74 | port.ot\nfrom.mpl_toolkits.mplot |
6d40 | 33 64 20 69 6d 70 6f 72 74 20 41 78 65 73 33 44 20 23 6e 65 63 65 73 73 61 72 79 20 66 6f 72 20 | 3d.import.Axes3D.#necessary.for. |
6d60 | 33 64 20 70 6c 6f 74 20 65 76 65 6e 20 69 66 20 6e 6f 74 20 75 73 65 64 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 | 3d.plot.even.if.not.used\nimport |
6d80 | 20 73 63 69 70 79 20 61 73 20 73 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 73 63 69 70 79 2e 73 69 67 6e 61 | .scipy.as.sp\nimport.scipy.signa |
6da0 | 6c 20 61 73 20 73 70 73 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 3d 31 30 | l.as.sps\n#%%.parameters\n\nn=10 |
6dc0 | 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e 73 5c 6e 5c 6e 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 5c 6e 78 | .#.nb.bins\n\n#.bin.positions\nx |
6de0 | 3d 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e | =np.arange(n,dtype=np.float64)\n |
6e00 | 5c 6e 78 78 2c 79 79 3d 6e 70 2e 6d 65 73 68 67 72 69 64 28 78 2c 78 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 78 70 | \nxx,yy=np.meshgrid(x,x)\n\n\nxp |
6e20 | 6f 73 3d 6e 70 2e 68 73 74 61 63 6b 28 28 78 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 2d 31 2c 31 29 2c 79 | os=np.hstack((xx.reshape(-1,1),y |
6e40 | 79 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 2d 31 2c 31 29 29 29 5c 6e 5c 6e 4d 3d 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 | y.reshape(-1,1)))\n\nM=ot.dist(x |
6e60 | 70 6f 73 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 49 30 3d 28 28 78 78 2d 35 29 2a 2a 32 2b 28 79 79 2d 35 29 2a 2a | pos)\n\n\nI0=((xx-5)**2+(yy-5)** |
6e80 | 32 3c 33 2a 2a 32 29 2a 31 2e 30 5c 6e 49 31 3d 28 28 78 78 2d 37 29 2a 2a 32 2b 28 79 79 2d 37 | 2<3**2)*1.0\nI1=((xx-7)**2+(yy-7 |
6ea0 | 29 2a 2a 32 3c 33 2a 2a 32 29 2a 31 2e 30 5c 6e 5c 6e 49 30 2f 3d 49 30 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e | )**2<3**2)*1.0\n\nI0/=I0.sum()\n |
6ec0 | 49 31 2f 3d 49 31 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e 5c 6e 69 30 3d 49 30 2e 72 61 76 65 6c 28 29 5c 6e 69 | I1/=I1.sum()\n\ni0=I0.ravel()\ni |
6ee0 | 31 3d 49 31 2e 72 61 76 65 6c 28 29 5c 6e 5c 6e 4d 3d 4d 5b 69 30 3e 30 2c 3a 5d 5b 3a 2c 69 31 | 1=I1.ravel()\n\nM=M[i0>0,:][:,i1 |
6f00 | 3e 30 5d 2e 63 6f 70 79 28 29 5c 6e 69 30 3d 69 30 5b 69 30 3e 30 5d 5c 6e 69 31 3d 69 31 5b 69 | >0].copy()\ni0=i0[i0>0]\ni1=i1[i |
6f20 | 31 3e 30 5d 5c 6e 49 74 6f 74 3d 6e 70 2e 63 6f 6e 63 61 74 65 6e 61 74 65 28 28 49 30 5b 3a 2c | 1>0]\nItot=np.concatenate((I0[:, |
6f40 | 3a 2c 6e 70 2e 6e 65 77 61 78 69 73 5d 2c 49 31 5b 3a 2c 3a 2c 6e 70 2e 6e 65 77 61 78 69 73 5d | :,np.newaxis],I1[:,:,np.newaxis] |
6f60 | 29 2c 32 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 | ),2)\n\n\n#%%.plot.the.distribut |
6f80 | 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | ions\n\npl.figure(1)\npl.subplot |
6fa0 | 28 32 2c 32 2c 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 30 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | (2,2,1)\npl.imshow(I0)\npl.subpl |
6fc0 | 6f 74 28 32 2c 32 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 | ot(2,2,2)\npl.imshow(I1)\n\n\n#% |
6fe0 | 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 61 6c 70 68 | %.barycenter.computation\n\nalph |
7000 | 61 3d 30 2e 35 20 23 20 30 3c 3d 61 6c 70 68 61 3c 3d 31 5c 6e 77 65 69 67 68 74 73 3d 6e 70 2e | a=0.5.#.0<=alpha<=1\nweights=np. |
7020 | 61 72 72 61 79 28 5b 31 2d 61 6c 70 68 61 2c 61 6c 70 68 61 5d 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 | array([1-alpha,alpha])\n\n\ndef. |
7040 | 63 6f 6e 76 32 28 49 2c 6b 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 73 70 2e 6e 64 69 6d 61 | conv2(I,k):\n....return.sp.ndima |
7060 | 67 65 2e 63 6f 6e 76 6f 6c 76 65 31 64 28 73 70 2e 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 63 6f 6e 76 6f 6c 76 | ge.convolve1d(sp.ndimage.convolv |
7080 | 65 31 64 28 49 2c 6b 2c 61 78 69 73 3d 31 29 2c 6b 2c 61 78 69 73 3d 30 29 5c 6e 5c 6e 64 65 66 | e1d(I,k,axis=1),k,axis=0)\n\ndef |
70a0 | 20 63 6f 6e 76 32 6e 28 49 2c 6b 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 73 3d 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 5f | .conv2n(I,k):\n....res=np.zeros_ |
70c0 | 6c 69 6b 65 28 49 29 5c 6e 20 20 20 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 49 2e 73 68 | like(I)\n....for.i.in.range(I.sh |
70e0 | 61 70 65 5b 32 5d 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 72 65 73 5b 3a 2c 3a 2c 69 5d 3d 63 6f 6e | ape[2]):\n........res[:,:,i]=con |
7100 | 76 32 28 49 5b 3a 2c 3a 2c 69 5d 2c 6b 29 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 72 65 73 5c 6e | v2(I[:,:,i],k)\n....return.res\n |
7120 | 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 67 65 74 5f 31 44 6b 65 72 6e 65 6c 28 72 65 67 2c 74 68 72 3d 31 65 2d | \n\ndef.get_1Dkernel(reg,thr=1e- |
7140 | 31 36 2c 77 6d 61 78 3d 31 30 32 34 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 77 3d 6d 61 78 28 6d 69 6e 28 77 6d | 16,wmax=1024):\n....w=max(min(wm |
7160 | 61 78 2c 32 2a 69 6e 74 28 28 2d 6e 70 2e 6c 6f 67 28 74 68 72 29 2a 72 65 67 29 2a 2a 28 2e 35 | ax,2*int((-np.log(thr)*reg)**(.5 |
7180 | 29 29 29 2c 33 29 5c 6e 20 20 20 20 78 3d 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 77 2c 64 74 79 70 65 3d | ))),3)\n....x=np.arange(w,dtype= |
71a0 | 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 65 78 70 28 2d | np.float64)\n....return.np.exp(- |
71c0 | 28 28 78 2d 77 2f 32 29 2a 2a 32 29 2f 72 65 67 29 5c 6e 20 20 20 20 5c 6e 74 68 72 3d 31 65 2d | ((x-w/2)**2)/reg)\n....\nthr=1e- |
71e0 | 31 36 5c 6e 72 65 67 3d 31 65 30 5c 6e 5c 6e 6b 3d 67 65 74 5f 31 44 6b 65 72 6e 65 6c 28 72 65 | 16\nreg=1e0\n\nk=get_1Dkernel(re |
7200 | 67 29 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 6b 29 5c 6e 5c 6e | g)\npl.figure(2)\npl.plot(k)\n\n |
7220 | 49 30 35 3d 63 6f 6e 76 32 28 49 30 2c 6b 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 5c | I05=conv2(I0,k)\n\npl.figure(1)\ |
7240 | 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 30 | npl.subplot(2,2,1)\npl.imshow(I0 |
7260 | 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 | )\npl.subplot(2,2,2)\npl.imshow( |
7280 | 49 30 35 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 5c 6e 5c 6e 47 3d 6f 74 2e 65 6d 64 28 69 30 2c 69 31 2c 4d 29 | I05)\n\n#%%\n\nG=ot.emd(i0,i1,M) |
72a0 | 5c 6e 72 30 3d 6e 70 2e 73 75 6d 28 4d 2a 47 29 5c 6e 5c 6e 72 65 67 3d 31 65 2d 31 5c 6e 47 73 | \nr0=np.sum(M*G)\n\nreg=1e-1\nGs |
72c0 | 3d 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 6b 6e 6f 70 70 28 69 30 2c 69 31 | =ot.bregman.sinkhorn_knopp(i0,i1 |
72e0 | 2c 4d 2c 72 65 67 3d 72 65 67 29 5c 6e 72 73 3d 6e 70 2e 73 75 6d 28 4d 2a 47 73 29 5c 6e 5c 6e | ,M,reg=reg)\nrs=np.sum(M*Gs)\n\n |
7300 | 23 25 25 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 6d 79 6c 6f 67 28 75 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 74 6d 70 3d 6e 70 | #%%\n\ndef.mylog(u):\n....tmp=np |
7320 | 2e 6c 6f 67 28 75 29 5c 6e 20 20 20 20 74 6d 70 5b 6e 70 2e 69 73 6e 61 6e 28 74 6d 70 29 5d 3d | .log(u)\n....tmp[np.isnan(tmp)]= |
7340 | 30 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 74 6d 70 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 | 0\n....return.tmp\n\ndef.sinkhor |
7360 | 6e 5f 63 6f 6e 76 28 61 2c 62 2c 20 72 65 67 2c 20 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 20 3d 20 31 30 | n_conv(a,b,.reg,.numItermax.=.10 |
7380 | 30 30 2c 20 73 74 6f 70 54 68 72 3d 31 65 2d 39 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 46 61 6c 73 65 2c | 00,.stopThr=1e-9,.verbose=False, |
73a0 | 20 6c 6f 67 3d 46 61 6c 73 65 2c 2a 2a 6b 77 61 72 67 73 29 3a 5c 6e 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 61 | .log=False,**kwargs):\n\n\n....a |
73c0 | 3d 6e 70 2e 61 73 61 72 72 61 79 28 61 2c 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c | =np.asarray(a,dtype=np.float64)\ |
73e0 | 6e 20 20 20 20 62 3d 6e 70 2e 61 73 61 72 72 61 79 28 62 2c 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f | n....b=np.asarray(b,dtype=np.flo |
7400 | 61 74 36 34 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 5c 6e 20 20 20 20 5c 6e 20 20 20 20 69 66 20 6c 65 | at64)\n........\n....\n....if.le |
7420 | 6e 28 62 2e 73 68 61 70 65 29 3e 32 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 62 62 3d 62 2e 73 68 61 | n(b.shape)>2:\n........nbb=b.sha |
7440 | 70 65 5b 32 5d 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 61 3d 61 5b 3a 2c 3a 2c 6e 70 2e 6e 65 77 61 78 69 | pe[2]\n........a=a[:,:,np.newaxi |
7460 | 73 5d 5c 6e 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 62 62 3d 30 5c 6e 20 20 | s]\n....else:\n........nbb=0\n.. |
7480 | 20 20 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 69 66 20 6c 6f 67 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 6f 67 3d 7b | ..\n\n....if.log:\n........log={ |
74a0 | 27 65 72 72 27 3a 5b 5d 7d 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 23 20 77 65 20 61 73 73 75 6d 65 20 74 68 61 | 'err':[]}\n\n....#.we.assume.tha |
74c0 | 74 20 6e 6f 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 20 61 72 65 20 6e 75 6c 6c 20 65 78 63 65 70 74 20 74 | t.no.distances.are.null.except.t |
74e0 | 68 6f 73 65 20 6f 66 20 74 68 65 20 64 69 61 67 6f 6e 61 6c 20 6f 66 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 | hose.of.the.diagonal.of.distance |
7500 | 73 5c 6e 20 20 20 20 69 66 20 6e 62 62 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 75 20 3d 20 6e 70 2e 6f | s\n....if.nbb:\n........u.=.np.o |
7520 | 6e 65 73 28 28 61 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 61 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 6e 62 62 29 29 | nes((a.shape[0],a.shape[1],nbb)) |
7540 | 2f 28 6e 70 2e 70 72 6f 64 28 61 2e 73 68 61 70 65 5b 3a 32 5d 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 | /(np.prod(a.shape[:2]))\n....... |
7560 | 20 76 20 3d 20 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 28 61 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 61 2e 73 68 61 70 65 | .v.=.np.ones((a.shape[0],a.shape |
7580 | 5b 31 5d 2c 6e 62 62 29 29 2f 28 6e 70 2e 70 72 6f 64 28 62 2e 73 68 61 70 65 5b 3a 32 5d 29 29 | [1],nbb))/(np.prod(b.shape[:2])) |
75a0 | 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 61 30 3d 31 2e 30 2f 28 6e 70 2e 70 72 6f 64 28 62 2e 73 68 61 70 | \n........a0=1.0/(np.prod(b.shap |
75c0 | 65 5b 3a 32 5d 29 29 5c 6e 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 75 20 3d 20 | e[:2]))\n....else:\n........u.=. |
75e0 | 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 28 61 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 61 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 29 29 | np.ones((a.shape[0],a.shape[1])) |
7600 | 2f 28 6e 70 2e 70 72 6f 64 28 61 2e 73 68 61 70 65 5b 3a 32 5d 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 | /(np.prod(a.shape[:2]))\n....... |
7620 | 20 76 20 3d 20 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 28 61 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 61 2e 73 68 61 70 65 | .v.=.np.ones((a.shape[0],a.shape |
7640 | 5b 31 5d 29 29 2f 28 6e 70 2e 70 72 6f 64 28 62 2e 73 68 61 70 65 5b 3a 32 5d 29 29 5c 6e 20 20 | [1]))/(np.prod(b.shape[:2]))\n.. |
7660 | 20 20 20 20 20 20 61 30 3d 31 2e 30 2f 28 6e 70 2e 70 72 6f 64 28 62 2e 73 68 61 70 65 5b 3a 32 | ......a0=1.0/(np.prod(b.shape[:2 |
7680 | 5d 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 5c 6e 20 20 20 20 6b 3d 67 | ]))\n........\n........\n....k=g |
76a0 | 65 74 5f 31 44 6b 65 72 6e 65 6c 28 72 65 67 29 5c 6e 20 20 20 20 5c 6e 20 20 20 20 69 66 20 6e | et_1Dkernel(reg)\n....\n....if.n |
76c0 | 62 62 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 4b 3d 6c 61 6d 62 64 61 20 49 3a 20 63 6f 6e 76 32 6e 28 | bb:\n........K=lambda.I:.conv2n( |
76e0 | 49 2c 6b 29 5c 6e 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 4b 3d 6c 61 6d 62 64 | I,k)\n....else:\n........K=lambd |
7700 | 61 20 49 3a 20 63 6f 6e 76 32 28 49 2c 6b 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 63 70 74 20 3d 20 30 5c 6e | a.I:.conv2(I,k)\n\n....cpt.=.0\n |
7720 | 20 20 20 20 65 72 72 3d 31 5c 6e 20 20 20 20 77 68 69 6c 65 20 28 65 72 72 3e 73 74 6f 70 54 68 | ....err=1\n....while.(err>stopTh |
7740 | 72 20 61 6e 64 20 63 70 74 3c 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 | r.and.cpt<numItermax):\n........ |
7760 | 75 70 72 65 76 20 3d 20 75 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 76 70 72 65 76 20 3d 20 76 5c 6e 20 20 | uprev.=.u\n........vprev.=.v\n.. |
7780 | 20 20 20 20 20 20 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 76 20 3d 20 6e 70 2e 64 69 76 69 64 65 28 62 2c | ......\n........v.=.np.divide(b, |
77a0 | 20 4b 28 75 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 75 20 3d 20 6e 70 2e 64 69 76 69 64 65 28 61 2c | .K(u))\n........u.=.np.divide(a, |
77c0 | 20 4b 28 76 29 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 28 6e 70 2e 61 6e 79 28 6e 70 2e | .K(v))\n\n........if.(np.any(np. |
77e0 | 69 73 6e 61 6e 28 75 29 29 20 6f 72 20 6e 70 2e 61 6e 79 28 6e 70 2e 69 73 6e 61 6e 28 76 29 29 | isnan(u)).or.np.any(np.isnan(v)) |
7800 | 20 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6f 72 20 6e 70 2e 61 6e 79 28 6e 70 2e 69 73 69 6e | .\n............or.np.any(np.isin |
7820 | 66 28 75 29 29 20 6f 72 20 6e 70 2e 61 6e 79 28 6e 70 2e 69 73 69 6e 66 28 76 29 29 29 3a 5c 6e | f(u)).or.np.any(np.isinf(v))):\n |
7840 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 23 20 77 65 20 68 61 76 65 20 72 65 61 63 68 65 64 20 74 68 | ............#.we.have.reached.th |
7860 | 65 20 6d 61 63 68 69 6e 65 20 70 72 65 63 69 73 69 6f 6e 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | e.machine.precision\n........... |
7880 | 20 23 20 63 6f 6d 65 20 62 61 63 6b 20 74 6f 20 70 72 65 76 69 6f 75 73 20 73 6f 6c 75 74 69 6f | .#.come.back.to.previous.solutio |
78a0 | 6e 20 61 6e 64 20 71 75 69 74 20 6c 6f 6f 70 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 70 72 69 | n.and.quit.loop\n............pri |
78c0 | 6e 74 28 27 57 61 72 6e 69 6e 67 3a 20 6e 75 6d 65 72 69 63 61 6c 20 65 72 72 6f 72 73 20 61 74 | nt('Warning:.numerical.errors.at |
78e0 | 20 69 74 65 72 61 74 69 6f 6e 27 2c 20 63 70 74 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 75 | .iteration',.cpt)\n............u |
7900 | 20 3d 20 75 70 72 65 76 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 76 20 3d 20 76 70 72 65 76 5c | .=.uprev\n............v.=.vprev\ |
7920 | 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 62 72 65 61 6b 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 63 | n............break\n........if.c |
7940 | 70 74 25 31 30 3d 3d 30 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 23 20 77 65 20 63 61 6e 20 | pt%10==0:\n............#.we.can. |
7960 | 73 70 65 65 64 20 75 70 20 74 68 65 20 70 72 6f 63 65 73 73 20 62 79 20 63 68 65 63 6b 69 6e 67 | speed.up.the.process.by.checking |
7980 | 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 65 72 72 6f 72 20 6f 6e 6c 79 20 61 6c 6c 20 74 68 65 20 31 30 74 68 | .for.the.error.only.all.the.10th |
79a0 | 20 69 74 65 72 61 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 65 72 72 20 3d | .iterations\n\n............err.= |
79c0 | 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 28 75 2d 75 70 72 65 76 29 2a 2a 32 29 2f 6e 70 2e 73 75 6d 28 28 75 29 | .np.sum((u-uprev)**2)/np.sum((u) |
79e0 | 2a 2a 32 29 2b 6e 70 2e 73 75 6d 28 28 76 2d 76 70 72 65 76 29 2a 2a 32 29 2f 6e 70 2e 73 75 6d | **2)+np.sum((v-vprev)**2)/np.sum |
7a00 | 28 28 76 29 2a 2a 32 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 6c 6f 67 3a 5c | ((v)**2)\n\n............if.log:\ |
7a20 | 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 6f 67 5b 27 65 72 72 27 5d 2e 61 70 70 65 | n................log['err'].appe |
7a40 | 6e 64 28 65 72 72 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 76 65 72 62 6f 73 | nd(err)\n\n............if.verbos |
7a60 | 65 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 63 70 74 25 32 30 30 20 3d | e:\n................if.cpt%200.= |
7a80 | 3d 30 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 70 72 69 6e 74 28 27 | =0:\n....................print(' |
7aa0 | 7b 3a 35 73 7d 7c 7b 3a 31 32 73 7d 27 2e 66 6f 72 6d 61 74 28 27 49 74 2e 27 2c 27 45 72 72 27 | {:5s}|{:12s}'.format('It.','Err' |
7ac0 | 29 2b 27 5c 5c 6e 27 2b 27 2d 27 2a 31 39 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | )+'\\n'+'-'*19)\n............... |
7ae0 | 20 70 72 69 6e 74 28 27 7b 3a 35 64 7d 7c 7b 3a 38 65 7d 7c 27 2e 66 6f 72 6d 61 74 28 63 70 74 | .print('{:5d}|{:8e}|'.format(cpt |
7b00 | 2c 65 72 72 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 63 70 74 20 3d 20 63 70 74 20 2b 31 5c 6e 20 20 | ,err))\n........cpt.=.cpt.+1\n.. |
7b20 | 20 20 69 66 20 6c 6f 67 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 6f 67 5b 27 75 27 5d 3d 75 5c 6e 20 | ..if.log:\n........log['u']=u\n. |
7b40 | 20 20 20 20 20 20 20 6c 6f 67 5b 27 76 27 5d 3d 76 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 5c 6e 20 20 20 | .......log['v']=v\n........\n... |
7b60 | 20 69 66 20 6e 62 62 3a 20 23 72 65 74 75 72 6e 20 6f 6e 6c 79 20 6c 6f 73 73 20 5c 6e 20 20 20 | .if.nbb:.#return.only.loss.\n... |
7b80 | 20 20 20 20 20 72 65 73 3d 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 62 62 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 | .....res=np.zeros((nbb))\n...... |
7ba0 | 20 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 62 62 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 | ..for.i.in.range(nbb):\n........ |
7bc0 | 20 20 20 20 72 65 73 5b 69 5d 3d 6e 70 2e 73 75 6d 28 75 5b 3a 2c 69 5d 2e 72 65 73 68 61 70 65 | ....res[i]=np.sum(u[:,i].reshape |
7be0 | 28 28 2d 31 2c 31 29 29 2a 4b 2a 76 5b 3a 2c 69 5d 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 31 2c 2d 31 29 | ((-1,1))*K*v[:,i].reshape((1,-1) |
7c00 | 29 2a 4d 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 6c 6f 67 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | )*M)\n........if.log:\n......... |
7c20 | 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 72 65 73 2c 6c 6f 67 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a | ...return.res,log\n........else: |
7c40 | 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 72 65 73 20 20 20 20 20 20 20 20 | \n............return.res........ |
7c60 | 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 5c 6e 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 20 23 20 72 65 74 75 72 6e 20 4f | \n........\n....else:.#.return.O |
7c80 | 54 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 72 65 73 3d 72 65 67 2a 61 30 2a 6e 70 2e | T.matrix\n........res=reg*a0*np. |
7ca0 | 73 75 6d 28 61 2a 6d 79 6c 6f 67 28 75 2b 28 75 3d 3d 30 29 29 2b 62 2a 6d 79 6c 6f 67 28 76 2b | sum(a*mylog(u+(u==0))+b*mylog(v+ |
7cc0 | 28 76 3d 3d 30 29 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 6c 6f 67 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 | (v==0)))\n........if.log:\n..... |
7ce0 | 20 20 20 20 20 20 20 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 72 65 73 2c | .......\n............return.res, |
7d00 | 6c 6f 67 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | log\n........else:\n............ |
7d20 | 72 65 74 75 72 6e 20 72 65 73 5c 6e 5c 6e 72 65 67 3d 31 65 30 5c 6e 72 2c 6c 6f 67 3d 73 69 6e | return.res\n\nreg=1e0\nr,log=sin |
7d40 | 6b 68 6f 72 6e 5f 63 6f 6e 76 28 49 30 2c 49 31 2c 72 65 67 2c 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 | khorn_conv(I0,I1,reg,verbose=Tru |
7d60 | 65 2c 6c 6f 67 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 61 3d 49 30 5c 6e 62 3d 49 31 5c 6e 75 3d 6c 6f 67 5b 27 | e,log=True)\na=I0\nb=I1\nu=log[' |
7d80 | 75 27 5d 5c 6e 76 3d 6c 6f 67 5b 27 76 27 5d 5c 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 | u']\nv=log['v']\n#%%.barycenter. |
7da0 | 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | interpolation".......],........" |
7dc0 | 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a | outputs":.[],........"metadata": |
7de0 | 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 | .{........."collapsed":.false... |
7e00 | 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 | ....}.....}...],...."metadata":. |
7e20 | 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 | {....."kernelspec":.{......."dis |
7e40 | 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | play_name":."Python.2",........" |
7e60 | 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 | name":."python2",........"langua |
7e80 | 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 | ge":."python".....},......"langu |
7ea0 | 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 | age_info":.{......."mimetype":." |
7ec0 | 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 | text/x-python",........"nbconver |
7ee0 | 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e | t_exporter":."python",........"n |
7f00 | 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 | ame":."python",........"file_ext |
7f20 | 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 | ension":.".py",........"version" |
7f40 | 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 | :."2.7.12",........"pygments_lex |
7f60 | 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 | er":."ipython2",........"codemir |
7f80 | 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 | ror_mode":.{........."version":. |
7fa0 | 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 | 2,.........."name":."ipython"... |
7fc0 | 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 0f 83 1e 4b 06 | ....}.....}...}.}PK...........K. |
7fe0 | 87 a7 1b 68 0f 00 00 68 0f 00 00 26 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f | ...h...h...&...auto_examples/plo |
8000 | 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 31 44 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d | t_barycenter_1D.ipynb{..."nbform |
8020 | 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 | at_minor":.0,...."nbformat":.4,. |
8040 | 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 | ..."cells":.[.....{......."execu |
8060 | 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f | tion_count":.null,........"cell_ |
8080 | 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 | type":."code",........"source":. |
80a0 | 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 | [........."%matplotlib.inline".. |
80c0 | 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 | .....],........"outputs":.[],... |
80e0 | 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c | ....."metadata":.{........."coll |
8100 | 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 | apsed":.false.......}.....},.... |
8120 | 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c | ..{......."source":.[........."\ |
8140 | 6e 23 20 31 44 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 64 65 6d | n#.1D.Wasserstein.barycenter.dem |
8160 | 6f 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c | o\n\n\n\n".......],........"cell |
8180 | 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | _type":."markdown",........"meta |
81a0 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 | data":.{}.....},......{......."e |
81c0 | 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 | xecution_count":.null,........"c |
81e0 | 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 | ell_type":."code",........"sourc |
8200 | 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c | e":.[........."#.Author:.Remi.Fl |
8220 | 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 | amary.<remi.flamary@unice.fr>\n# |
8240 | 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f | \n#.License:.MIT.License\n\nimpo |
8260 | 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 | rt.numpy.as.np\nimport.matplotli |
8280 | 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 23 20 6e 65 63 65 | b.pylab.as.pl\nimport.ot\n#.nece |
82a0 | 73 73 61 72 79 20 66 6f 72 20 33 64 20 70 6c 6f 74 20 65 76 65 6e 20 69 66 20 6e 6f 74 20 75 73 | ssary.for.3d.plot.even.if.not.us |
82c0 | 65 64 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6d 70 6c 5f 74 6f 6f 6c 6b 69 74 73 2e 6d 70 6c 6f 74 33 64 20 69 6d | ed\nfrom.mpl_toolkits.mplot3d.im |
82e0 | 70 6f 72 74 20 41 78 65 73 33 44 20 20 23 20 6e 6f 71 61 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6d 61 74 70 6c 6f | port.Axes3D..#.noqa\nfrom.matplo |
8300 | 74 6c 69 62 2e 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 73 20 69 6d 70 6f 72 74 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c | tlib.collections.import.PolyColl |
8320 | 65 63 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 20 | ection\n\n\n#%%.parameters\n\nn. |
8340 | 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e 73 5c 6e 5c 6e 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 | =.100..#.nb.bins\n\n#.bin.positi |
8360 | 6f 6e 73 5c 6e 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 | ons\nx.=.np.arange(n,.dtype=np.f |
8380 | 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e 5c 6e 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 | loat64)\n\n#.Gaussian.distributi |
83a0 | 6f 6e 73 5c 6e 61 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 | ons\na1.=.ot.datasets.get_1D_gau |
83c0 | 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 | ss(n,.m=20,.s=5)..#.m=.mean,.s=. |
83e0 | 73 74 64 5c 6e 61 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 | std\na2.=.ot.datasets.get_1D_gau |
8400 | 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 36 30 2c 20 73 3d 38 29 5c 6e 5c 6e 23 20 63 72 65 61 74 69 6e 67 20 6d | ss(n,.m=60,.s=8)\n\n#.creating.m |
8420 | 61 74 72 69 78 20 41 20 63 6f 6e 74 61 69 6e 69 6e 67 20 61 6c 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 | atrix.A.containing.all.distribut |
8440 | 69 6f 6e 73 5c 6e 41 20 3d 20 6e 70 2e 76 73 74 61 63 6b 28 28 61 31 2c 20 61 32 29 29 2e 54 5c | ions\nA.=.np.vstack((a1,.a2)).T\ |
8460 | 6e 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 3d 20 41 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 5c 6e 5c | nn_distributions.=.A.shape[1]\n\ |
8480 | 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 20 2b 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e | n#.loss.matrix.+.normalization\n |
84a0 | 4d 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 64 69 73 74 30 28 6e 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 | M.=.ot.utils.dist0(n)\nM./=.M.ma |
84c0 | 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e | x()\n\n#%%.plot.the.distribution |
84e0 | 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 | s\n\npl.figure(1,.figsize=(6.4,. |
8500 | 33 29 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 | 3))\nfor.i.in.range(n_distributi |
8520 | 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e | ons):\n....pl.plot(x,.A[:,.i])\n |
8540 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 | pl.title('Distributions')\npl.ti |
8560 | 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 | ght_layout()\n\n#%%.barycenter.c |
8580 | 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 61 6c 70 68 61 20 3d 20 30 2e 32 20 20 23 20 30 3c 3d | omputation\n\nalpha.=.0.2..#.0<= |
85a0 | 61 6c 70 68 61 3c 3d 31 5c 6e 77 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 | alpha<=1\nweights.=.np.array([1. |
85c0 | 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 32 62 61 72 79 5c 6e 62 61 | -.alpha,.alpha])\n\n#.l2bary\nba |
85e0 | 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 77 61 73 73 | ry_l2.=.A.dot(weights)\n\n#.wass |
8600 | 65 72 73 74 65 69 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 20 3d | erstein\nreg.=.1e-3\nbary_wass.= |
8620 | 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 | .ot.bregman.barycenter(A,.M,.reg |
8640 | 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 | ,.weights)\n\npl.figure(2)\npl.c |
8660 | 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 | lf()\npl.subplot(2,.1,.1)\nfor.i |
8680 | 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 | .in.range(n_distributions):\n... |
86a0 | 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | .pl.plot(x,.A[:,.i])\npl.title(' |
86c0 | 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | Distributions')\n\npl.subplot(2, |
86e0 | 20 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c | .1,.2)\npl.plot(x,.bary_l2,.'r', |
8700 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 | .label='l2')\npl.plot(x,.bary_wa |
8720 | 73 73 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 | ss,.'g',.label='Wasserstein')\np |
8740 | 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 | l.legend()\npl.title('Barycenter |
8760 | 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 62 61 | s')\npl.tight_layout()\n\n#%%.ba |
8780 | 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 6e 5f 61 6c 70 68 | rycenter.interpolation\n\nn_alph |
87a0 | 61 20 3d 20 31 31 5c 6e 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 20 3d 20 6e 70 2e 6c 69 6e 73 70 61 63 65 | a.=.11\nalpha_list.=.np.linspace |
87c0 | 28 30 2c 20 31 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 42 5f 6c 32 20 3d 20 6e 70 2e 7a | (0,.1,.n_alpha)\n\n\nB_l2.=.np.z |
87e0 | 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 29 5c 6e 5c 6e 42 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6e | eros((n,.n_alpha))\n\nB_wass.=.n |
8800 | 70 2e 63 6f 70 79 28 42 5f 6c 32 29 5c 6e 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 30 | p.copy(B_l2)\n\nfor.i.in.range(0 |
8820 | 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 61 6c 70 68 61 20 3d 20 61 6c 70 68 61 5f 6c | ,.n_alpha):\n....alpha.=.alpha_l |
8840 | 69 73 74 5b 69 5d 5c 6e 20 20 20 20 77 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b | ist[i]\n....weights.=.np.array([ |
8860 | 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 5c 6e 20 20 20 20 42 5f 6c 32 5b 3a 2c 20 | 1.-.alpha,.alpha])\n....B_l2[:,. |
8880 | 69 5d 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 20 20 20 20 42 5f 77 61 73 73 5b | i].=.A.dot(weights)\n....B_wass[ |
88a0 | 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c | :,.i].=.ot.bregman.barycenter(A, |
88c0 | 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 69 6e | .M,.reg,.weights)\n\n#%%.plot.in |
88e0 | 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 5c 6e 5c 6e 63 | terpolation\n\npl.figure(3)\n\nc |
8900 | 6d 61 70 20 3d 20 70 6c 2e 63 6d 2e 67 65 74 5f 63 6d 61 70 28 27 76 69 72 69 64 69 73 27 29 5c | map.=.pl.cm.get_cmap('viridis')\ |
8920 | 6e 76 65 72 74 73 20 3d 20 5b 5d 5c 6e 7a 73 20 3d 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5c 6e 66 6f | nverts.=.[]\nzs.=.alpha_list\nfo |
8940 | 72 20 69 2c 20 7a 20 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 7a 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 79 73 | r.i,.z.in.enumerate(zs):\n....ys |
8960 | 20 3d 20 42 5f 6c 32 5b 3a 2c 20 69 5d 5c 6e 20 20 20 20 76 65 72 74 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 | .=.B_l2[:,.i]\n....verts.append( |
8980 | 6c 69 73 74 28 7a 69 70 28 78 2c 20 79 73 29 29 29 5c 6e 5c 6e 61 78 20 3d 20 70 6c 2e 67 63 66 | list(zip(x,.ys)))\n\nax.=.pl.gcf |
89a0 | 28 29 2e 67 63 61 28 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 3d 27 33 64 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6f 6c 79 20 | ().gca(projection='3d')\n\npoly. |
89c0 | 3d 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 28 76 65 72 74 73 2c 20 66 61 63 65 63 6f 6c 6f | =.PolyCollection(verts,.facecolo |
89e0 | 72 73 3d 5b 63 6d 61 70 28 61 29 20 66 6f 72 20 61 20 69 6e 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5d | rs=[cmap(a).for.a.in.alpha_list] |
8a00 | 29 5c 6e 70 6f 6c 79 2e 73 65 74 5f 61 6c 70 68 61 28 30 2e 37 29 5c 6e 61 78 2e 61 64 64 5f 63 | )\npoly.set_alpha(0.7)\nax.add_c |
8a20 | 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 33 64 28 70 6f 6c 79 2c 20 7a 73 3d 7a 73 2c 20 7a 64 69 72 3d 27 79 | ollection3d(poly,.zs=zs,.zdir='y |
8a40 | 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 61 62 65 6c 28 27 78 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 78 | ')\nax.set_xlabel('x')\nax.set_x |
8a60 | 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 6e 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 61 62 65 6c 28 27 24 5c 5c 5c | lim3d(0,.n)\nax.set_ylabel('$\\\ |
8a80 | 5c 61 6c 70 68 61 24 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 31 29 5c 6e | \alpha$')\nax.set_ylim3d(0,.1)\n |
8aa0 | 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 61 62 65 6c 28 27 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 69 6d 33 64 | ax.set_zlabel('')\nax.set_zlim3d |
8ac0 | 28 30 2c 20 42 5f 6c 32 2e 6d 61 78 28 29 20 2a 20 31 2e 30 31 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | (0,.B_l2.max().*.1.01)\npl.title |
8ae0 | 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 | ('Barycenter.interpolation.with. |
8b00 | 6c 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 | l2')\npl.tight_layout()\n\npl.fi |
8b20 | 67 75 72 65 28 34 29 5c 6e 63 6d 61 70 20 3d 20 70 6c 2e 63 6d 2e 67 65 74 5f 63 6d 61 70 28 27 | gure(4)\ncmap.=.pl.cm.get_cmap(' |
8b40 | 76 69 72 69 64 69 73 27 29 5c 6e 76 65 72 74 73 20 3d 20 5b 5d 5c 6e 7a 73 20 3d 20 61 6c 70 68 | viridis')\nverts.=.[]\nzs.=.alph |
8b60 | 61 5f 6c 69 73 74 5c 6e 66 6f 72 20 69 2c 20 7a 20 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 7a 73 | a_list\nfor.i,.z.in.enumerate(zs |
8b80 | 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 79 73 20 3d 20 42 5f 77 61 73 73 5b 3a 2c 20 69 5d 5c 6e 20 20 20 20 76 | ):\n....ys.=.B_wass[:,.i]\n....v |
8ba0 | 65 72 74 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 6c 69 73 74 28 7a 69 70 28 78 2c 20 79 73 29 29 29 5c 6e 5c | erts.append(list(zip(x,.ys)))\n\ |
8bc0 | 6e 61 78 20 3d 20 70 6c 2e 67 63 66 28 29 2e 67 63 61 28 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 3d 27 33 | nax.=.pl.gcf().gca(projection='3 |
8be0 | 64 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6f 6c 79 20 3d 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 28 76 65 72 | d')\n\npoly.=.PolyCollection(ver |
8c00 | 74 73 2c 20 66 61 63 65 63 6f 6c 6f 72 73 3d 5b 63 6d 61 70 28 61 29 20 66 6f 72 20 61 20 69 6e | ts,.facecolors=[cmap(a).for.a.in |
8c20 | 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5d 29 5c 6e 70 6f 6c 79 2e 73 65 74 5f 61 6c 70 68 61 28 30 2e | .alpha_list])\npoly.set_alpha(0. |
8c40 | 37 29 5c 6e 61 78 2e 61 64 64 5f 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 33 64 28 70 6f 6c 79 2c 20 7a 73 | 7)\nax.add_collection3d(poly,.zs |
8c60 | 3d 7a 73 2c 20 7a 64 69 72 3d 27 79 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 61 62 65 6c 28 27 78 | =zs,.zdir='y')\nax.set_xlabel('x |
8c80 | 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 6e 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f | ')\nax.set_xlim3d(0,.n)\nax.set_ |
8ca0 | 79 6c 61 62 65 6c 28 27 24 5c 5c 5c 5c 61 6c 70 68 61 24 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c | ylabel('$\\\\alpha$')\nax.set_yl |
8cc0 | 69 6d 33 64 28 30 2c 20 31 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 61 62 65 6c 28 27 27 29 5c 6e 61 | im3d(0,.1)\nax.set_zlabel('')\na |
8ce0 | 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 42 5f 6c 32 2e 6d 61 78 28 29 20 2a 20 31 2e 30 | x.set_zlim3d(0,.B_l2.max().*.1.0 |
8d00 | 31 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f | 1)\npl.title('Barycenter.interpo |
8d20 | 6c 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 | lation.with.Wasserstein')\npl.ti |
8d40 | 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 | ght_layout()\n\npl.show()"...... |
8d60 | 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | .],........"outputs":.[],....... |
8d80 | 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 | ."metadata":.{........."collapse |
8da0 | 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 | d":.false.......}.....}...],.... |
8dc0 | 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 | "metadata":.{....."kernelspec":. |
8de0 | 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 | {......."display_name":."Python. |
8e00 | 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 | 2",........"name":."python2",... |
8e20 | 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c | ....."language":."python".....}, |
8e40 | 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ......"language_info":.{......." |
8e60 | 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 | mimetype":."text/x-python",..... |
8e80 | 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e | ..."nbconvert_exporter":."python |
8ea0 | 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 | ",........"name":."python",..... |
8ec0 | 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 | ..."file_extension":.".py",..... |
8ee0 | 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ..."version":."2.7.12",........" |
8f00 | 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 | pygments_lexer":."ipython2",.... |
8f20 | 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 | ...."codemirror_mode":.{........ |
8f40 | 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 | ."version":.2,.........."name":. |
8f60 | 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 | "ipython".......}.....}...}.}PK. |
8f80 | 04 14 00 00 00 00 00 9c 86 1e 4b f2 bc 11 4b 08 19 00 00 08 19 00 00 25 00 00 00 61 75 74 6f 5f | ..........K...K........%...auto_ |
8fa0 | 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6c 61 73 73 65 73 2e 69 70 79 6e 62 | examples/plot_otda_classes.ipynb |
8fc0 | 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 | {..."nbformat_minor":.0,...."nbf |
8fe0 | 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 | ormat":.4,...."cells":.[.....{.. |
9000 | 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 | ....."execution_count":.null,... |
9020 | 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | ....."cell_type":."code",....... |
9040 | 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 | ."source":.[........."%matplotli |
9060 | 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 | b.inline".......],........"outpu |
9080 | 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 | ts":.[],........"metadata":.{... |
90a0 | 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d | ......"collapsed":.false.......} |
90c0 | 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b | .....},......{......."source":.[ |
90e0 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 | ........."\n#.OT.for.domain.adap |
9100 | 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6e 74 72 6f 64 75 | tation\n\n\nThis.example.introdu |
9120 | 63 65 73 20 61 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 69 6e 20 61 20 32 44 20 | ces.a.domain.adaptation.in.a.2D. |
9140 | 73 65 74 74 69 6e 67 20 61 6e 64 20 74 68 65 20 34 20 4f 54 44 41 5c 6e 61 70 70 72 6f 61 63 68 | setting.and.the.4.OTDA\napproach |
9160 | 65 73 20 63 75 72 72 65 6e 74 6c 79 20 73 75 70 70 6f 72 74 65 64 20 69 6e 20 50 4f 54 2e 5c 6e | es.currently.supported.in.POT.\n |
9180 | 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 | \n\n".......],........"cell_type |
91a0 | 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 | ":."markdown",........"metadata" |
91c0 | 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 | :.{}.....},......{......."execut |
91e0 | 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 | ion_count":.null,........"cell_t |
9200 | 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b | ype":."code",........"source":.[ |
9220 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 | ........."#.Authors:.Remi.Flamar |
9240 | 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 20 20 20 20 | y.<remi.flamary@unice.fr>\n#.... |
9260 | 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 | ......Stanislas.Chambon.<stan.ch |
9280 | 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 | ambon@gmail.com>\n#\n#.License:. |
92a0 | 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 | MIT.License\n\nimport.matplotlib |
92c0 | 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d | .pylab.as.pl\nimport.ot".......] |
92e0 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ,........"outputs":.[],........" |
9300 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 | metadata":.{........."collapsed" |
9320 | 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 | :.false.......}.....},......{... |
9340 | 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 67 65 6e 65 72 61 74 | ...."source":.[........."generat |
9360 | 65 20 64 61 74 61 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | e.data\n######################## |
9380 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
93a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 | #####################\n\n"...... |
93c0 | 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 | .],........"cell_type":."markdow |
93e0 | 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c | n",........"metadata":.{}.....}, |
9400 | 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a | ......{......."execution_count": |
9420 | 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 | .null,........"cell_type":."code |
9440 | 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e | ",........"source":.[........."n |
9460 | 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 31 35 30 5c 6e 6e 5f 74 61 72 67 65 74 5f | _source_samples.=.150\nn_target_ |
9480 | 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 31 35 30 5c 6e 5c 6e 58 73 2c 20 79 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 | samples.=.150\n\nXs,.ys.=.ot.dat |
94a0 | 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 27 2c | asets.get_data_classif('3gauss', |
94c0 | 20 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 29 5c 6e 58 74 2c 20 79 74 20 3d 20 6f 74 2e | .n_source_samples)\nXt,.yt.=.ot. |
94e0 | 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 | datasets.get_data_classif('3gaus |
9500 | 73 32 27 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c | s2',.n_target_samples)".......], |
9520 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d | ........"outputs":.[],........"m |
9540 | 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a | etadata":.{........."collapsed": |
9560 | 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 | .false.......}.....},......{.... |
9580 | 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 49 6e 73 74 61 6e 74 69 | ..."source":.[........."Instanti |
95a0 | 61 74 65 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f | ate.the.different.transport.algo |
95c0 | 72 69 74 68 6d 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | rithms.and.fit.them\n########### |
95e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9600 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9620 | 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 | ##\n\n".......],........"cell_ty |
9640 | 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 | pe":."markdown",........"metadat |
9660 | 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 | a":.{}.....},......{......."exec |
9680 | 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c | ution_count":.null,........"cell |
96a0 | 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a | _type":."code",........"source": |
96c0 | 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 45 4d 44 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f | .[........."#.EMD.Transport\not_ |
96e0 | 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 5c 6e 6f 74 5f 65 | emd.=.ot.da.EMDTransport()\not_e |
9700 | 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f | md.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n#.Sinkho |
9720 | 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 | rn.Transport\not_sinkhorn.=.ot.d |
9740 | 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 5c | a.SinkhornTransport(reg_e=1e-1)\ |
9760 | 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e | not_sinkhorn.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n |
9780 | 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 47 72 6f 75 | \n#.Sinkhorn.Transport.with.Grou |
97a0 | 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 6f 74 5f 6c 70 6c 31 20 | p.lasso.regularization\not_lpl1. |
97c0 | 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 | =.ot.da.SinkhornLpl1Transport(re |
97e0 | 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 2c 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 31 65 30 29 5c 6e 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 66 | g_e=1e-1,.reg_cl=1e0)\not_lpl1.f |
9800 | 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e | it(Xs=Xs,.ys=ys,.Xt=Xt)\n\n#.Sin |
9820 | 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f | khorn.Transport.with.Group.lasso |
9840 | 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 6c 31 6c 32 5c 6e 6f 74 5f 6c 31 6c 32 20 3d 20 | .regularization.l1l2\not_l1l2.=. |
9860 | 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f | ot.da.SinkhornL1l2Transport(reg_ |
9880 | 65 3d 31 65 2d 31 2c 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 32 65 30 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 2c | e=1e-1,.reg_cl=2e0,.max_iter=20, |
98a0 | 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | \n.............................. |
98c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 66 | ........verbose=True)\not_l1l2.f |
98e0 | 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 72 61 | it(Xs=Xs,.ys=ys,.Xt=Xt)\n\n#.tra |
9900 | 6e 73 70 6f 72 74 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6f 6e 74 6f 20 74 61 72 67 65 | nsport.source.samples.onto.targe |
9920 | 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d | t.samples\ntransp_Xs_emd.=.ot_em |
9940 | 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 | d.transform(Xs=Xs)\ntransp_Xs_si |
9960 | 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 | nkhorn.=.ot_sinkhorn.transform(X |
9980 | 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e | s=Xs)\ntransp_Xs_lpl1.=.ot_lpl1. |
99a0 | 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 31 6c 32 | transform(Xs=Xs)\ntransp_Xs_l1l2 |
99c0 | 20 3d 20 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 22 0a 20 20 20 | .=.ot_l1l2.transform(Xs=Xs)".... |
99e0 | 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 | ...],........"outputs":.[],..... |
9a00 | 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 | ..."metadata":.{........."collap |
9a20 | 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 | sed":.false.......}.....},...... |
9a40 | 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 | {......."source":.[........."Fig |
9a60 | 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d | .1.:.plots.source.and.target.sam |
9a80 | 70 6c 65 73 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ples\n########################## |
9aa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9ac0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d | ###################\n\n".......] |
9ae0 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 | ,........"cell_type":."markdown" |
9b00 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a | ,........"metadata":.{}.....},.. |
9b20 | 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e | ....{......."execution_count":.n |
9b40 | 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c | ull,........"cell_type":."code", |
9b60 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e | ........"source":.[........."pl. |
9b80 | 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 35 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 | figure(1,.figsize=(10,.5))\npl.s |
9ba0 | 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a | ubplot(1,.2,.1)\npl.scatter(Xs[: |
9bc0 | 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 | ,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+' |
9be0 | 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 | ,.label='Source.samples')\npl.xt |
9c00 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 | icks([])\npl.yticks([])\npl.lege |
9c20 | 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d | nd(loc=0)\npl.title('Source..sam |
9c40 | 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 | ples')\n\npl.subplot(1,.2,.2)\np |
9c60 | 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d | l.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c= |
9c80 | 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 | yt,.marker='o',.label='Target.sa |
9ca0 | 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b | mples')\npl.xticks([])\npl.ytick |
9cc0 | 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c | s([])\npl.legend(loc=0)\npl.titl |
9ce0 | 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 | e('Target.samples')\npl.tight_la |
9d00 | 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 | yout()".......],........"outputs |
9d20 | 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 | ":.[],........"metadata":.{..... |
9d40 | 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 | ...."collapsed":.false.......}.. |
9d60 | 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 | ...},......{......."source":.[.. |
9d80 | 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 | ......."Fig.2.:.plot.optimal.cou |
9da0 | 70 6c 69 6e 67 73 20 61 6e 64 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e | plings.and.transported.samples\n |
9dc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9de0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9e00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 | #############\n\n".......],..... |
9e20 | 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 | ..."cell_type":."markdown",..... |
9e40 | 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a | ..."metadata":.{}.....},......{. |
9e60 | 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a | ......"execution_count":.null,.. |
9e80 | 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 | ......"cell_type":."code",...... |
9ea0 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 | .."source":.[........."param_img |
9ec0 | 20 3d 20 7b 27 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 27 3a 20 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 2c 20 | .=.{'interpolation':.'nearest',. |
9ee0 | 27 63 6d 61 70 27 3a 20 27 73 70 65 63 74 72 61 6c 27 7d 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 | 'cmap':.'spectral'}\n\npl.figure |
9f00 | 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 35 2c 20 38 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | (2,.figsize=(15,.8))\npl.subplot |
9f20 | 28 32 2c 20 34 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 | (2,.4,.1)\npl.imshow(ot_emd.coup |
9f40 | 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b | ling_,.**param_img)\npl.xticks([ |
9f60 | 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 | ])\npl.yticks([])\npl.title('Opt |
9f80 | 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e | imal.coupling\\nEMDTransport')\n |
9fa0 | 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 | \npl.subplot(2,.4,.2)\npl.imshow |
9fc0 | 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f | (ot_sinkhorn.coupling_,.**param_ |
9fe0 | 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b | img)\npl.xticks([])\npl.yticks([ |
a000 | 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c | ])\npl.title('Optimal.coupling\\ |
a020 | 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | nSinkhornTransport')\n\npl.subpl |
a040 | 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 | ot(2,.4,.3)\npl.imshow(ot_lpl1.c |
a060 | 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b | oupling_,.**param_img)\npl.xtick |
a080 | 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | s([])\npl.yticks([])\npl.title(' |
a0a0 | 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 | Optimal.coupling\\nSinkhornLpl1T |
a0c0 | 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 34 | ransport')\n\npl.subplot(2,.4,.4 |
a0e0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 | )\npl.imshow(ot_l1l2.coupling_,. |
a100 | 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e | **param_img)\npl.xticks([])\npl. |
a120 | 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f | yticks([])\npl.title('Optimal.co |
a140 | 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 | upling\\nSinkhornL1l2Transport') |
a160 | 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 | \n\npl.subplot(2,.4,.5)\npl.scat |
a180 | 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 | ter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.ma |
a1a0 | 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 | rker='o',\n...........label='Tar |
a1c0 | 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 | get.samples',.alpha=0.3)\npl.sca |
a1e0 | 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 | tter(transp_Xs_emd[:,.0],.transp |
a200 | 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | _Xs_emd[:,.1],.c=ys,\n.......... |
a220 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c | .marker='+',.label='Transp.sampl |
a240 | 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 | es',.s=30)\npl.xticks([])\npl.yt |
a260 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 | icks([])\npl.title('Transported. |
a280 | 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 | samples\\nEmdTransport')\npl.leg |
a2a0 | 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 5c 22 6c 6f 77 65 72 20 6c 65 66 74 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 | end(loc=\"lower.left\")\n\npl.su |
a2c0 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 36 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c | bplot(2,.4,.6)\npl.scatter(Xt[:, |
a2e0 | 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c | .0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o', |
a300 | 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c | \n...........label='Target.sampl |
a320 | 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e | es',.alpha=0.3)\npl.scatter(tran |
a340 | 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f | sp_Xs_sinkhorn[:,.0],.transp_Xs_ |
a360 | 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | sinkhorn[:,.1],.c=ys,\n......... |
a380 | 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 | ..marker='+',.label='Transp.samp |
a3a0 | 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 | les',.s=30)\npl.xticks([])\npl.y |
a3c0 | 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 | ticks([])\npl.title('Transported |
a3e0 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e | .samples\\nSinkhornTransport')\n |
a400 | 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 37 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 | \npl.subplot(2,.4,.7)\npl.scatte |
a420 | 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b | r(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.mark |
a440 | 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 | er='o',\n...........label='Targe |
a460 | 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 | t.samples',.alpha=0.3)\npl.scatt |
a480 | 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f | er(transp_Xs_lpl1[:,.0],.transp_ |
a4a0 | 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | Xs_lpl1[:,.1],.c=ys,\n.......... |
a4c0 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c | .marker='+',.label='Transp.sampl |
a4e0 | 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 | es',.s=30)\npl.xticks([])\npl.yt |
a500 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 | icks([])\npl.title('Transported. |
a520 | 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 | samples\\nSinkhornLpl1Transport' |
a540 | 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 38 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 | )\n\npl.subplot(2,.4,.8)\npl.sca |
a560 | 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d | tter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.m |
a580 | 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 | arker='o',\n...........label='Ta |
a5a0 | 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 | rget.samples',.alpha=0.3)\npl.sc |
a5c0 | 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 31 6c 32 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e | atter(transp_Xs_l1l2[:,.0],.tran |
a5e0 | 73 70 5f 58 73 5f 6c 31 6c 32 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 | sp_Xs_l1l2[:,.1],.c=ys,\n....... |
a600 | 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 | ....marker='+',.label='Transp.sa |
a620 | 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c | mples',.s=30)\npl.xticks([])\npl |
a640 | 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 | .yticks([])\npl.title('Transport |
a660 | 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f | ed.samples\\nSinkhornL1l2Transpo |
a680 | 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 | rt')\npl.tight_layout()\n\npl.sh |
a6a0 | 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a | ow()".......],........"outputs": |
a6c0 | 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | .[],........"metadata":.{....... |
a6e0 | 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 | .."collapsed":.false.......}.... |
a700 | 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 | .}...],...."metadata":.{....."ke |
a720 | 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 | rnelspec":.{......."display_name |
a740 | 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 | ":."Python.2",........"name":."p |
a760 | 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 | ython2",........"language":."pyt |
a780 | 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 | hon".....},......"language_info" |
a7a0 | 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 | :.{......."mimetype":."text/x-py |
a7c0 | 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 | thon",........"nbconvert_exporte |
a7e0 | 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 | r":."python",........"name":."py |
a800 | 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 | thon",........"file_extension":. |
a820 | 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 | ".py",........"version":."2.7.12 |
a840 | 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 | ",........"pygments_lexer":."ipy |
a860 | 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 | thon2",........"codemirror_mode" |
a880 | 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | :.{........."version":.2,....... |
a8a0 | 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 | ..."name":."ipython".......}.... |
a8c0 | 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 0d 88 1e 4b c8 39 53 c8 df 19 00 00 df 19 | .}...}.}PK...........K.9S....... |
a8e0 | 00 00 33 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 | ..3...auto_examples/plot_otda_ma |
a900 | 70 70 69 6e 67 5f 63 6f 6c 6f 72 73 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 | pping_colors_images.ipynb{..."nb |
a920 | 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a | format_minor":.0,...."nbformat": |
a940 | 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 | .4,...."cells":.[.....{......."e |
a960 | 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 | xecution_count":.null,........"c |
a980 | 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 | ell_type":."code",........"sourc |
a9a0 | 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e | e":.[........."%matplotlib.inlin |
a9c0 | 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d | e".......],........"outputs":.[] |
a9e0 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 | ,........"metadata":.{........." |
aa00 | 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c | collapsed":.false.......}.....}, |
aa20 | 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 | ......{......."source":.[....... |
aa40 | 20 20 22 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | .."\n=========================== |
aa60 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
aa80 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 4f 54 20 66 6f | =========================\nOT.fo |
aaa0 | 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 69 6d 61 67 65 20 63 | r.domain.adaptation.with.image.c |
aac0 | 6f 6c 6f 72 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 5b 36 5d 20 77 69 74 68 20 6d 61 70 70 69 6e 67 | olor.adaptation.[6].with.mapping |
aae0 | 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 5b 38 5d 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | .estimation.[8]\n=============== |
ab00 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
ab20 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
ab40 | 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 5c 6e 5b 36 5d 20 46 65 72 72 61 64 61 6e 73 2c 20 53 2e 2c 20 50 61 70 61 | =====\n\n[6].Ferradans,.S.,.Papa |
ab60 | 64 61 6b 69 73 2c 20 4e 2e 2c 20 50 65 79 72 65 2c 20 47 2e 2c 20 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 4a | dakis,.N.,.Peyre,.G.,.&.Aujol,.J |
ab80 | 2e 20 46 2e 20 28 32 30 31 34 29 2e 20 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 5c 6e 20 20 20 20 64 69 | ..F..(2014)..Regularized\n....di |
aba0 | 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 2e 20 53 49 41 4d 20 4a | screte.optimal.transport..SIAM.J |
abc0 | 6f 75 72 6e 61 6c 20 6f 6e 20 49 6d 61 67 69 6e 67 20 53 63 69 65 6e 63 65 73 2c 20 37 28 33 29 | ournal.on.Imaging.Sciences,.7(3) |
abe0 | 2c 5c 6e 20 20 20 20 31 38 35 33 2d 31 38 38 32 2e 5c 6e 5b 38 5d 20 4d 2e 20 50 65 72 72 6f 74 | ,\n....1853-1882.\n[8].M..Perrot |
ac00 | 2c 20 4e 2e 20 43 6f 75 72 74 79 2c 20 52 2e 20 46 6c 61 6d 61 72 79 2c 20 41 2e 20 48 61 62 72 | ,.N..Courty,.R..Flamary,.A..Habr |
ac20 | 61 72 64 2c 20 5c 22 4d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 5c 6e 20 | ard,.\"Mapping.estimation.for\n. |
ac40 | 20 20 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 22 2c | ...discrete.optimal.transport\", |
ac60 | 20 4e 65 75 72 61 6c 20 49 6e 66 6f 72 6d 61 74 69 6f 6e 20 50 72 6f 63 65 73 73 69 6e 67 20 53 | .Neural.Information.Processing.S |
ac80 | 79 73 74 65 6d 73 20 28 4e 49 50 53 29 2c 5c 6e 20 20 20 20 32 30 31 36 2e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 | ystems.(NIPS),\n....2016.\n\n\n" |
aca0 | 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d | .......],........"cell_type":."m |
acc0 | 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a | arkdown",........"metadata":.{}. |
ace0 | 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 | ....},......{......."execution_c |
ad00 | 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a | ount":.null,........"cell_type": |
ad20 | 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 | ."code",........"source":.[..... |
ad40 | 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 | ...."#.Authors:.Remi.Flamary.<re |
ad60 | 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | mi.flamary@unice.fr>\n#......... |
ad80 | 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e | .Stanislas.Chambon.<stan.chambon |
ada0 | 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c | @gmail.com>\n#\n#.License:.MIT.L |
adc0 | 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 66 72 | icense\n\nimport.numpy.as.np\nfr |
ade0 | 6f 6d 20 73 63 69 70 79 20 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 64 69 6d 61 67 65 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 | om.scipy.import.ndimage\nimport. |
ae00 | 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f | matplotlib.pylab.as.pl\nimport.o |
ae20 | 74 5c 6e 5c 6e 72 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 52 61 6e 64 6f 6d 53 74 61 74 65 28 34 | t\n\nr.=.np.random.RandomState(4 |
ae40 | 32 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 | 2)\n\n\ndef.im2mat(I):\n....\"\" |
ae60 | 5c 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 61 6e 64 20 69 6d 61 67 65 20 74 6f 20 6d 61 74 72 69 78 20 28 | \"Converts.and.image.to.matrix.( |
ae80 | 6f 6e 65 20 70 69 78 65 6c 20 70 65 72 20 6c 69 6e 65 29 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 72 | one.pixel.per.line)\"\"\"\n....r |
aea0 | 65 74 75 72 6e 20 49 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 49 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 20 2a 20 49 2e | eturn.I.reshape((I.shape[0].*.I. |
aec0 | 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 32 5d 29 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 | shape[1],.I.shape[2]))\n\n\ndef. |
aee0 | 6d 61 74 32 69 6d 28 58 2c 20 73 68 61 70 65 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e | mat2im(X,.shape):\n....\"\"\"Con |
af00 | 76 65 72 74 73 20 62 61 63 6b 20 61 20 6d 61 74 72 69 78 20 74 6f 20 61 6e 20 69 6d 61 67 65 5c | verts.back.a.matrix.to.an.image\ |
af20 | 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 58 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 73 68 61 70 | "\"\"\n....return.X.reshape(shap |
af40 | 65 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 | e)\n\n\ndef.minmax(I):\n....retu |
af60 | 72 6e 20 6e 70 2e 63 6c 69 70 28 49 2c 20 30 2c 20 31 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 | rn.np.clip(I,.0,.1)".......],... |
af80 | 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | ....."outputs":.[],........"meta |
afa0 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 | data":.{........."collapsed":.fa |
afc0 | 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | lse.......}.....},......{....... |
afe0 | 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 | "source":.[........."Generate.da |
b000 | 74 61 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ta\n############################ |
b020 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
b040 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 | #################\n\n".......],. |
b060 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 | ......."cell_type":."markdown",. |
b080 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 | ......."metadata":.{}.....},.... |
b0a0 | 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c | ..{......."execution_count":.nul |
b0c0 | 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a | l,........"cell_type":."code",.. |
b0e0 | 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 4c 6f 61 | ......"source":.[........."#.Loa |
b100 | 64 69 6e 67 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 49 31 20 3d 20 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 64 | ding.images\nI1.=.ndimage.imread |
b120 | 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 64 61 79 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 | ('../data/ocean_day.jpg').astype |
b140 | 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 5c 6e 49 32 20 3d 20 6e 64 69 6d 61 67 65 | (np.float64)./.256\nI2.=.ndimage |
b160 | 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 73 75 6e 73 65 74 2e 6a 70 | .imread('../data/ocean_sunset.jp |
b180 | 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 5c 6e 5c 6e | g').astype(np.float64)./.256\n\n |
b1a0 | 5c 6e 58 31 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 31 29 5c 6e 58 32 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 | \nX1.=.im2mat(I1)\nX2.=.im2mat(I |
b1c0 | 32 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 6e 62 20 3d 20 31 | 2)\n\n#.training.samples\nnb.=.1 |
b1e0 | 30 30 30 5c 6e 69 64 78 31 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 31 2e 73 68 61 70 65 5b 30 | 000\nidx1.=.r.randint(X1.shape[0 |
b200 | 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 5c 6e 69 64 78 32 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 | ],.size=(nb,))\nidx2.=.r.randint |
b220 | 28 58 32 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 5c 6e 5c 6e 58 73 20 | (X2.shape[0],.size=(nb,))\n\nXs. |
b240 | 3d 20 58 31 5b 69 64 78 31 2c 20 3a 5d 5c 6e 58 74 20 3d 20 58 32 5b 69 64 78 32 2c 20 3a 5d 22 | =.X1[idx1,.:]\nXt.=.X2[idx2,.:]" |
b260 | 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 | .......],........"outputs":.[],. |
b280 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f | ......."metadata":.{........."co |
b2a0 | 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a | llapsed":.false.......}.....},.. |
b2c0 | 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 | ....{......."source":.[......... |
b2e0 | 22 44 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 70 69 78 65 6c 20 64 69 73 | "Domain.adaptation.for.pixel.dis |
b300 | 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 74 72 61 6e 73 66 65 72 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | tribution.transfer\n############ |
b320 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
b340 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
b360 | 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 | #\n\n".......],........"cell_typ |
b380 | 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 | e":."markdown",........"metadata |
b3a0 | 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 | ":.{}.....},......{......."execu |
b3c0 | 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f | tion_count":.null,........"cell_ |
b3e0 | 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 | type":."code",........"source":. |
b400 | 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 65 6d | [........."#.EMDTransport\not_em |
b420 | 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 | d.=.ot.da.EMDTransport()\not_emd |
b440 | 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d | .fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\ntransp_Xs_em |
b460 | 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 5c 6e 49 6d 61 | d.=.ot_emd.transform(Xs=X1)\nIma |
b480 | 67 65 5f 65 6d 64 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 | ge_emd.=.minmax(mat2im(transp_Xs |
b4a0 | 5f 65 6d 64 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 | _emd,.I1.shape))\n\n#.SinkhornTr |
b4c0 | 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e | ansport\not_sinkhorn.=.ot.da.Sin |
b4e0 | 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 5c 6e 6f 74 5f 73 | khornTransport(reg_e=1e-1)\not_s |
b500 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 | inkhorn.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\ntrans |
b520 | 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d | p_Xs_sinkhorn.=.ot_emd.transform |
b540 | 28 58 73 3d 58 31 29 5c 6e 49 6d 61 67 65 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 | (Xs=X1)\nImage_sinkhorn.=.minmax |
b560 | 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 31 2e 73 | (mat2im(transp_Xs_sinkhorn,.I1.s |
b580 | 68 61 70 65 29 29 5c 6e 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 | hape))\n\not_mapping_linear.=.ot |
b5a0 | 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 5c 6e 20 20 20 20 6d 75 3d 31 65 | .da.MappingTransport(\n....mu=1e |
b5c0 | 30 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 38 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 | 0,.eta=1e-8,.bias=True,.max_iter |
b5e0 | 3d 32 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c | =20,.verbose=True)\not_mapping_l |
b600 | 69 6e 65 61 72 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 58 31 74 6c 20 | inear.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\nX1tl. |
b620 | 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 | =.ot_mapping_linear.transform(Xs |
b640 | 3d 58 31 29 5c 6e 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6d 69 6e | =X1)\nImage_mapping_linear.=.min |
b660 | 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 6c 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 5c 6e 6f | max(mat2im(X1tl,.I1.shape))\n\no |
b680 | 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 | t_mapping_gaussian.=.ot.da.Mappi |
b6a0 | 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 5c 6e 20 20 20 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d 31 65 | ngTransport(\n....mu=1e0,.eta=1e |
b6c0 | 2d 32 2c 20 73 69 67 6d 61 3d 31 2c 20 62 69 61 73 3d 46 61 6c 73 65 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 | -2,.sigma=1,.bias=False,.max_ite |
b6e0 | 72 3d 31 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f | r=10,.verbose=True)\not_mapping_ |
b700 | 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 58 31 | gaussian.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\nX1 |
b720 | 74 6e 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f | tn.=.ot_mapping_gaussian.transfo |
b740 | 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 20 20 23 20 75 73 65 20 74 68 65 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 64 20 6d | rm(Xs=X1)..#.use.the.estimated.m |
b760 | 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d | apping\nImage_mapping_gaussian.= |
b780 | 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 22 | .minmax(mat2im(X1tn,.I1.shape))" |
b7a0 | 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 | .......],........"outputs":.[],. |
b7c0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f | ......."metadata":.{........."co |
b7e0 | 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a | llapsed":.false.......}.....},.. |
b800 | 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 | ....{......."source":.[......... |
b820 | 22 70 6c 6f 74 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | "plot.original.images\n######### |
b840 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
b860 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
b880 | 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f | ####\n\n".......],........"cell_ |
b8a0 | 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 | type":."markdown",........"metad |
b8c0 | 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 | ata":.{}.....},......{......."ex |
b8e0 | 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 | ecution_count":.null,........"ce |
b900 | 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 | ll_type":."code",........"source |
b920 | 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 | ":.[........."pl.figure(1,.figsi |
b940 | 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 | ze=(6.4,.3))\npl.subplot(1,.2,.1 |
b960 | 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 | )\npl.imshow(I1)\npl.axis('off') |
b980 | 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 | \npl.title('Image.1')\n\npl.subp |
b9a0 | 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e | lot(1,.2,.2)\npl.imshow(I2)\npl. |
b9c0 | 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 | axis('off')\npl.title('Image.2') |
b9e0 | 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 | \npl.tight_layout()".......],... |
ba00 | 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | ....."outputs":.[],........"meta |
ba20 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 | data":.{........."collapsed":.fa |
ba40 | 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | lse.......}.....},......{....... |
ba60 | 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 6f 74 20 70 69 78 65 6c 20 | "source":.[........."plot.pixel. |
ba80 | 76 61 6c 75 65 73 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | values.distribution\n########### |
baa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
bac0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
bae0 | 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 | ##\n\n".......],........"cell_ty |
bb00 | 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 | pe":."markdown",........"metadat |
bb20 | 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 | a":.{}.....},......{......."exec |
bb40 | 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c | ution_count":.null,........"cell |
bb60 | 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a | _type":."code",........"source": |
bb80 | 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 | .[........."pl.figure(2,.figsize |
bba0 | 3d 28 36 2e 34 2c 20 35 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 | =(6.4,.5))\n\npl.subplot(1,.2,.1 |
bbc0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 32 5d | )\npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:,.2] |
bbe0 | 2c 20 63 3d 58 73 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 5c 6e | ,.c=Xs)\npl.axis([0,.1,.0,.1])\n |
bc00 | 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 | pl.xlabel('Red')\npl.ylabel('Blu |
bc20 | 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 | e')\npl.title('Image.1')\n\npl.s |
bc40 | 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a | ubplot(1,.2,.2)\npl.scatter(Xt[: |
bc60 | 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 74 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b | ,.0],.Xt[:,.2],.c=Xt)\npl.axis([ |
bc80 | 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e | 0,.1,.0,.1])\npl.xlabel('Red')\n |
bca0 | 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 | pl.ylabel('Blue')\npl.title('Ima |
bcc0 | 67 65 20 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 | ge.2')\npl.tight_layout()"...... |
bce0 | 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | .],........"outputs":.[],....... |
bd00 | 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 | ."metadata":.{........."collapse |
bd20 | 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a | d":.false.......}.....},......{. |
bd40 | 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 6f 74 20 | ......"source":.[........."plot. |
bd60 | 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 65 64 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | transformed.images\n############ |
bd80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
bda0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
bdc0 | 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 | #\n\n".......],........"cell_typ |
bde0 | 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 | e":."markdown",........"metadata |
be00 | 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 | ":.{}.....},......{......."execu |
be20 | 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f | tion_count":.null,........"cell_ |
be40 | 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 | type":."code",........"source":. |
be60 | 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d | [........."pl.figure(2,.figsize= |
be80 | 28 31 30 2c 20 35 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 5c | (10,.5))\n\npl.subplot(2,.3,.1)\ |
bea0 | 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e | npl.imshow(I1)\npl.axis('off')\n |
bec0 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | pl.title('Im..1')\n\npl.subplot( |
bee0 | 32 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 | 2,.3,.4)\npl.imshow(I2)\npl.axis |
bf00 | 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 32 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | ('off')\npl.title('Im..2')\n\npl |
bf20 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 | .subplot(2,.3,.2)\npl.imshow(Ima |
bf40 | 67 65 5f 65 6d 64 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c | ge_emd)\npl.axis('off')\npl.titl |
bf60 | 65 28 27 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | e('EmdTransport')\n\npl.subplot( |
bf80 | 32 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 67 65 5f 73 69 6e 6b 68 6f | 2,.3,.5)\npl.imshow(Image_sinkho |
bfa0 | 72 6e 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 | rn)\npl.axis('off')\npl.title('S |
bfc0 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | inkhornTransport')\n\npl.subplot |
bfe0 | 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 | (2,.3,.3)\npl.imshow(Image_mappi |
c000 | 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 | ng_linear)\npl.axis('off')\npl.t |
c020 | 69 74 6c 65 28 27 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 27 | itle('MappingTransport.(linear)' |
c040 | 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 | )\n\npl.subplot(2,.3,.6)\npl.ims |
c060 | 68 6f 77 28 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 29 5c 6e 70 6c 2e | how(Image_mapping_gaussian)\npl. |
c080 | 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 | axis('off')\npl.title('MappingTr |
c0a0 | 61 6e 73 70 6f 72 74 20 28 67 61 75 73 73 69 61 6e 29 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c | ansport.(gaussian)')\npl.tight_l |
c0c0 | 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a | ayout()\n\npl.show()".......],.. |
c0e0 | 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 | ......"outputs":.[],........"met |
c100 | 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 | adata":.{........."collapsed":.f |
c120 | 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 | alse.......}.....}...],...."meta |
c140 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 | data":.{....."kernelspec":.{.... |
c160 | 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a | ..."display_name":."Python.2",.. |
c180 | 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | ......"name":."python2",........ |
c1a0 | 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 | "language":."python".....},..... |
c1c0 | 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 | ."language_info":.{......."mimet |
c1e0 | 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e | ype":."text/x-python",........"n |
c200 | 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 | bconvert_exporter":."python",... |
c220 | 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 | ....."name":."python",........"f |
c240 | 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 | ile_extension":.".py",........"v |
c260 | 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 | ersion":."2.7.12",........"pygme |
c280 | 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | nts_lexer":."ipython2",........" |
c2a0 | 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 | codemirror_mode":.{........."ver |
c2c0 | 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 | sion":.2,.........."name":."ipyt |
c2e0 | 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 | hon".......}.....}...}.}PK...... |
c300 | 00 00 6a 7b 82 49 bb fd 13 71 39 0a 00 00 39 0a 00 00 2b 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 | ..j{.I...q9...9...+...auto_examp |
c320 | 6c 65 73 2f 64 65 6d 6f 5f 4f 54 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 6c 61 72 67 65 2e 69 70 79 6e | les/demo_OT_2D_sampleslarge.ipyn |
c340 | 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 | b{..."nbformat_minor":.0,...."nb |
c360 | 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a | format":.4,...."cells":.[.....{. |
c380 | 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a | ......"execution_count":.null,.. |
c3a0 | 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 | ......"cell_type":."code",...... |
c3c0 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c | .."source":.[........."%matplotl |
c3e0 | 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 | ib.inline".......],........"outp |
c400 | 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 | uts":.[],........"metadata":.{.. |
c420 | 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 | ......."collapsed":.false....... |
c440 | 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 | }.....},......{......."source":. |
c460 | 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 44 65 6d 6f 20 66 6f 72 20 32 44 20 4f 70 74 69 6d 61 6c | [........."\nDemo.for.2D.Optimal |
c480 | 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 65 6d 70 69 72 69 63 61 6c 20 64 69 73 | .transport.between.empirical.dis |
c4a0 | 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 40 61 75 74 68 6f 72 3a 20 72 66 6c 61 6d 61 72 79 5c | tributions\n\n@author:.rflamary\ |
c4c0 | 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 | n\n".......],........"cell_type" |
c4e0 | 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a | :."markdown",........"metadata": |
c500 | 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 | .{}.....},......{......."executi |
c520 | 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 | on_count":.null,........"cell_ty |
c540 | 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a | pe":."code",........"source":.[. |
c560 | 20 20 20 20 20 20 20 20 22 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 | ........"import.numpy.as.np\nimp |
c580 | 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f | ort.matplotlib.pylab.as.pl\nimpo |
c5a0 | 72 74 20 6f 74 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 20 61 6e 64 20 64 61 74 61 | rt.ot\n\n#%%.parameters.and.data |
c5c0 | 20 67 65 6e 65 72 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 6e 3d 35 30 30 30 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c | .generation\n\nn=5000.#.nb.sampl |
c5e0 | 65 73 5c 6e 5c 6e 6d 75 5f 73 3d 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 30 2c 30 5d 29 5c 6e 63 6f 76 5f | es\n\nmu_s=np.array([0,0])\ncov_ |
c600 | 73 3d 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 5b 31 2c 30 5d 2c 5b 30 2c 31 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 6d 75 5f | s=np.array([[1,0],[0,1]])\n\nmu_ |
c620 | 74 3d 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 34 2c 34 5d 29 5c 6e 63 6f 76 5f 74 3d 6e 70 2e 61 72 72 61 | t=np.array([4,4])\ncov_t=np.arra |
c640 | 79 28 5b 5b 31 2c 2d 2e 38 5d 2c 5b 2d 2e 38 2c 31 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 78 73 3d 6f 74 2e 64 61 | y([[1,-.8],[-.8,1]])\n\nxs=ot.da |
c660 | 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 6d 75 | tasets.get_2D_samples_gauss(n,mu |
c680 | 5f 73 2c 63 6f 76 5f 73 29 5c 6e 78 74 3d 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 32 44 | _s,cov_s)\nxt=ot.datasets.get_2D |
c6a0 | 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 6d 75 5f 74 2c 63 6f 76 5f 74 29 5c 6e 5c 6e | _samples_gauss(n,mu_t,cov_t)\n\n |
c6c0 | 61 2c 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 2c 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 20 23 20 75 6e | a,b.=.ot.unif(n),ot.unif(n).#.un |
c6e0 | 69 66 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c | iform.distribution.on.samples\n\ |
c700 | 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 3d 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 78 74 29 | n#.loss.matrix\nM=ot.dist(xs,xt) |
c720 | 5c 6e 4d 2f 3d 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | \nM/=M.max()\n\n#%%.plot.samples |
c740 | 5c 6e 5c 6e 23 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 5c 6e 23 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a | \n\n#pl.figure(1)\n#pl.plot(xs[: |
c760 | 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 27 2b 62 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 | ,0],xs[:,1],'+b',label='Source.s |
c780 | 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 23 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c | amples')\n#pl.plot(xt[:,0],xt[:, |
c7a0 | 31 5d 2c 27 78 72 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c | 1],'xr',label='Target.samples')\ |
c7c0 | 6e 23 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 23 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 | n#pl.legend(loc=0)\n#pl.title('S |
c7e0 | 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 72 61 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 | ource.and.traget.distributions') |
c800 | 5c 6e 23 5c 6e 23 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 23 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d | \n#\n#pl.figure(2)\n#pl.imshow(M |
c820 | 2c 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 23 70 6c 2e 74 | ,interpolation='nearest')\n#pl.t |
c840 | 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 4d 27 29 5c 6e 23 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 | itle('Cost.matrix.M')\n#\n\n#%%. |
c860 | 45 4d 44 5c 6e 5c 6e 47 30 3d 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 62 2c 4d 29 5c 6e 5c 6e 23 70 6c 2e 66 | EMD\n\nG0=ot.emd(a,b,M)\n\n#pl.f |
c880 | 69 67 75 72 65 28 33 29 5c 6e 23 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 30 2c 69 6e 74 65 72 70 6f 6c | igure(3)\n#pl.imshow(G0,interpol |
c8a0 | 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 23 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 | ation='nearest')\n#pl.title('OT. |
c8c0 | 6d 61 74 72 69 78 20 47 30 27 29 5c 6e 23 5c 6e 23 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 29 5c 6e 23 | matrix.G0')\n#\n#pl.figure(4)\n# |
c8e0 | 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 78 74 | ot.plot.plot2D_samples_mat(xs,xt |
c900 | 2c 47 30 2c 63 3d 5b 2e 35 2c 2e 35 2c 31 5d 29 5c 6e 23 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c | ,G0,c=[.5,.5,1])\n#pl.plot(xs[:, |
c920 | 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 27 2b 62 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 | 0],xs[:,1],'+b',label='Source.sa |
c940 | 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 23 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 | mples')\n#pl.plot(xt[:,0],xt[:,1 |
c960 | 5d 2c 27 78 72 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e | ],'xr',label='Target.samples')\n |
c980 | 23 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 23 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 | #pl.legend(loc=0)\n#pl.title('OT |
c9a0 | 20 6d 61 74 72 69 78 20 77 69 74 68 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 | .matrix.with.samples')\n\n\n#%%. |
c9c0 | 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 72 65 67 20 74 65 72 6d 5c 6e 6c 61 6d 62 64 3d 35 65 | sinkhorn\n\n#.reg.term\nlambd=5e |
c9e0 | 2d 33 5c 6e 5c 6e 47 73 3d 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c 62 2c 4d 2c 6c 61 6d 62 64 | -3\n\nGs=ot.sinkhorn(a,b,M,lambd |
ca00 | 29 5c 6e 5c 6e 23 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 29 5c 6e 23 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 | )\n\n#pl.figure(5)\n#pl.imshow(G |
ca20 | 73 2c 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 23 70 6c 2e | s,interpolation='nearest')\n#pl. |
ca40 | 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 23 5c 6e | title('OT.matrix.sinkhorn')\n#\n |
ca60 | 23 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 36 29 5c 6e 23 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 | #pl.figure(6)\n#ot.plot.plot2D_s |
ca80 | 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 78 74 2c 47 73 2c 63 6f 6c 6f 72 3d 5b 2e 35 2c 2e 35 | amples_mat(xs,xt,Gs,color=[.5,.5 |
caa0 | 2c 31 5d 29 5c 6e 23 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 27 | ,1])\n#pl.plot(xs[:,0],xs[:,1],' |
cac0 | 2b 62 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 23 70 6c | +b',label='Source.samples')\n#pl |
cae0 | 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 27 78 72 27 2c 6c 61 62 65 6c | .plot(xt[:,0],xt[:,1],'xr',label |
cb00 | 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 23 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c | ='Target.samples')\n#pl.legend(l |
cb20 | 6f 63 3d 30 29 5c 6e 23 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b | oc=0)\n#pl.title('OT.matrix.Sink |
cb40 | 68 6f 72 6e 20 77 69 74 68 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 23 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c | horn.with.samples')\n#".......], |
cb60 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d | ........"outputs":.[],........"m |
cb80 | 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a | etadata":.{........."collapsed": |
cba0 | 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 | .false.......}.....}...],...."me |
cbc0 | 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 | tadata":.{....."kernelspec":.{.. |
cbe0 | 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c | ....."display_name":."Python.2", |
cc00 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 | ........"name":."python2",...... |
cc20 | 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 | .."language":."python".....},... |
cc40 | 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d | ..."language_info":.{......."mim |
cc60 | 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | etype":."text/x-python",........ |
cc80 | 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 | "nbconvert_exporter":."python",. |
cca0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | ......."name":."python",........ |
ccc0 | 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | "file_extension":.".py",........ |
cce0 | 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 | "version":."2.7.12",........"pyg |
cd00 | 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | ments_lexer":."ipython2",....... |
cd20 | 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 | ."codemirror_mode":.{........."v |
cd40 | 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 | ersion":.2,.........."name":."ip |
cd60 | 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 | ython".......}.....}...}.}PK.... |
cd80 | 00 00 00 00 f6 83 1e 4b 31 52 a0 2f b3 0f 00 00 b3 0f 00 00 24 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 | .......K1R./........$...auto_exa |
cda0 | 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 4c 31 5f 76 73 5f 4c 32 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 | mples/plot_OT_L1_vs_L2.ipynb{... |
cdc0 | 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 | "nbformat_minor":.0,...."nbforma |
cde0 | 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 | t":.4,...."cells":.[.....{...... |
ce00 | 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | ."execution_count":.null,....... |
ce20 | 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f | ."cell_type":."code",........"so |
ce40 | 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e | urce":.[........."%matplotlib.in |
ce60 | 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a | line".......],........"outputs": |
ce80 | 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | .[],........"metadata":.{....... |
cea0 | 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 | .."collapsed":.false.......}.... |
cec0 | 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 | .},......{......."source":.[.... |
cee0 | 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 32 44 20 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 66 | ....."\n#.2D.Optimal.transport.f |
cf00 | 6f 72 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 72 69 63 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 53 74 6f 6c 65 20 | or.different.metrics\n\n\nStole. |
cf20 | 74 68 65 20 66 69 67 75 72 65 20 69 64 65 61 20 66 72 6f 6d 20 46 69 67 2e 20 31 20 61 6e 64 20 | the.figure.idea.from.Fig..1.and. |
cf40 | 32 20 69 6e 5c 6e 68 74 74 70 73 3a 2f 2f 61 72 78 69 76 2e 6f 72 67 2f 70 64 66 2f 31 37 30 36 | 2.in\nhttps://arxiv.org/pdf/1706 |
cf60 | 2e 30 37 36 35 30 2e 70 64 66 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 | .07650.pdf\n\n\n\n".......],.... |
cf80 | 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 | ...."cell_type":."markdown",.... |
cfa0 | 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b | ...."metadata":.{}.....},......{ |
cfc0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 | ......."execution_count":.null,. |
cfe0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 | ......."cell_type":."code",..... |
d000 | 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 | ..."source":.[........."#.Author |
d020 | 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 | :.Remi.Flamary.<remi.flamary@uni |
d040 | 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 | ce.fr>\n#\n#.License:.MIT.Licens |
d060 | 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 | e\n\nimport.numpy.as.np\nimport. |
d080 | 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f | matplotlib.pylab.as.pl\nimport.o |
d0a0 | 74 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 20 61 6e 64 20 64 61 74 61 20 67 65 6e | t\n\n#%%.parameters.and.data.gen |
d0c0 | 65 72 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 66 6f 72 20 64 61 74 61 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a | eration\n\nfor.data.in.range(2): |
d0e0 | 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 69 66 20 64 61 74 61 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 20 3d 20 32 30 | \n\n....if.data:\n........n.=.20 |
d100 | 20 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 78 73 20 3d 20 6e 70 2e | ..#.nb.samples\n........xs.=.np. |
d120 | 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 32 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 20 | zeros((n,.2))\n........xs[:,.0]. |
d140 | 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2b 20 31 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 78 73 5b 3a | =.np.arange(n).+.1\n........xs[: |
d160 | 2c 20 31 5d 20 3d 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2b 20 31 29 20 2a 20 2d 30 2e 30 | ,.1].=.(np.arange(n).+.1).*.-0.0 |
d180 | 30 31 20 20 23 20 74 6f 20 6d 61 6b 65 20 69 74 20 73 74 72 69 63 74 6c 79 20 63 6f 6e 76 65 78 | 01..#.to.make.it.strictly.convex |
d1a0 | 2e 2e 2e 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 78 74 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2c | ...\n\n........xt.=.np.zeros((n, |
d1c0 | 20 32 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e | .2))\n........xt[:,.1].=.np.aran |
d1e0 | 67 65 28 6e 29 20 2b 20 31 5c 6e 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 | ge(n).+.1\n....else:\n\n........ |
d200 | 6e 20 3d 20 35 30 20 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 78 74 | n.=.50..#.nb.samples\n........xt |
d220 | 6f 74 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 20 2b 20 31 2c 20 32 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 | ot.=.np.zeros((n.+.1,.2))\n..... |
d240 | 20 20 20 78 74 6f 74 5b 3a 2c 20 30 5d 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 73 28 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 | ...xtot[:,.0].=.np.cos(\n....... |
d260 | 20 20 20 20 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 20 2b 20 31 29 20 2b 20 31 2e 30 29 20 2a 20 | .....(np.arange(n.+.1).+.1.0).*. |
d280 | 30 2e 39 20 2f 20 28 6e 20 2b 20 32 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 29 5c 6e 20 20 20 20 | 0.9./.(n.+.2).*.2.*.np.pi)\n.... |
d2a0 | 20 20 20 20 78 74 6f 74 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 6e 70 2e 73 69 6e 28 5c 6e 20 20 20 20 20 20 | ....xtot[:,.1].=.np.sin(\n...... |
d2c0 | 20 20 20 20 20 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 20 2b 20 31 29 20 2b 20 31 2e 30 29 20 2a | ......(np.arange(n.+.1).+.1.0).* |
d2e0 | 20 30 2e 39 20 2f 20 28 6e 20 2b 20 32 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 29 5c 6e 5c 6e 20 | .0.9./.(n.+.2).*.2.*.np.pi)\n\n. |
d300 | 20 20 20 20 20 20 20 78 73 20 3d 20 78 74 6f 74 5b 3a 6e 2c 20 3a 5d 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 | .......xs.=.xtot[:n,.:]\n....... |
d320 | 20 78 74 20 3d 20 78 74 6f 74 5b 31 3a 2c 20 3a 5d 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 61 2c 20 62 20 3d 20 | .xt.=.xtot[1:,.:]\n\n....a,.b.=. |
d340 | 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 2c 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 20 20 23 20 75 6e 69 66 6f 72 | ot.unif(n),.ot.unif(n)..#.unifor |
d360 | 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 20 20 20 | m.distribution.on.samples\n\n... |
d380 | 20 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 20 20 20 20 4d 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 | .#.loss.matrix\n....M1.=.ot.dist |
d3a0 | 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 20 20 | (xs,.xt,.metric='euclidean')\n.. |
d3c0 | 20 20 4d 31 20 2f 3d 20 4d 31 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 23 20 6c 6f 73 73 20 6d | ..M1./=.M1.max()\n\n....#.loss.m |
d3e0 | 61 74 72 69 78 5c 6e 20 20 20 20 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 | atrix\n....M2.=.ot.dist(xs,.xt,. |
d400 | 6d 65 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 20 20 20 20 4d 32 20 2f 3d | metric='sqeuclidean')\n....M2./= |
d420 | 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e | .M2.max()\n\n....#.loss.matrix\n |
d440 | 20 20 20 20 4d 70 20 3d 20 6e 70 2e 73 71 72 74 28 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c | ....Mp.=.np.sqrt(ot.dist(xs,.xt, |
d460 | 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 29 5c 6e 20 20 20 20 4d 70 20 2f 3d | .metric='euclidean'))\n....Mp./= |
d480 | 20 4d 70 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 | .Mp.max()\n\n....#%%.plot.sample |
d4a0 | 73 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 20 2b 20 33 20 2a 20 64 61 74 61 2c | s\n\n....pl.figure(1.+.3.*.data, |
d4c0 | 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e | .figsize=(7,.3))\n....pl.clf()\n |
d4e0 | 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | ....pl.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],. |
d500 | 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 20 | '+b',.label='Source.samples')\n. |
d520 | 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 | ...pl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.' |
d540 | 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 20 20 | xr',.label='Target.samples')\n.. |
d560 | 20 20 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | ..pl.axis('equal')\n....pl.title |
d580 | 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 72 61 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e | ('Source.and.traget.distribution |
d5a0 | 73 27 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 20 2b 20 33 20 2a 20 64 61 74 | s')\n\n....pl.figure(2.+.3.*.dat |
d5c0 | 61 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 73 75 62 | a,.figsize=(7,.3))\n\n....pl.sub |
d5e0 | 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 31 2c | plot(1,.3,.1)\n....pl.imshow(M1, |
d600 | 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 | .interpolation='nearest')\n....p |
d620 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 | l.title('Euclidean.cost')\n\n... |
d640 | 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 69 6d 73 | .pl.subplot(1,.3,.2)\n....pl.ims |
d660 | 68 6f 77 28 4d 32 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 | how(M2,.interpolation='nearest') |
d680 | 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 | \n....pl.title('Squared.Euclidea |
d6a0 | 6e 20 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c | n.cost')\n\n....pl.subplot(1,.3, |
d6c0 | 20 33 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 70 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 | .3)\n....pl.imshow(Mp,.interpola |
d6e0 | 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 | tion='nearest')\n....pl.title('S |
d700 | 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 67 | qrt.Euclidean.cost')\n....pl.tig |
d720 | 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e 20 20 20 20 | ht_layout()\n\n....#%%.EMD\n.... |
d740 | 47 31 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 31 29 5c 6e 20 20 20 20 47 32 20 3d 20 | G1.=.ot.emd(a,.b,.M1)\n....G2.=. |
d760 | 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 32 29 5c 6e 20 20 20 20 47 70 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d | ot.emd(a,.b,.M2)\n....Gp.=.ot.em |
d780 | 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 70 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 20 2b | d(a,.b,.Mp)\n\n....pl.figure(3.+ |
d7a0 | 20 33 20 2a 20 64 61 74 61 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 20 20 | .3.*.data,.figsize=(7,.3))\n\n.. |
d7c0 | 20 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 20 20 20 20 6f 74 2e 70 6c | ..pl.subplot(1,.3,.1)\n....ot.pl |
d7e0 | 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 31 | ot.plot2D_samples_mat(xs,.xt,.G1 |
d800 | 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 | ,.c=[.5,..5,.1])\n....pl.plot(xs |
d820 | 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 | [:,.0],.xs[:,.1],.'+b',.label='S |
d840 | 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b | ource.samples')\n....pl.plot(xt[ |
d860 | 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 | :,.0],.xt[:,.1],.'xr',.label='Ta |
d880 | 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 | rget.samples')\n....pl.axis('equ |
d8a0 | 61 6c 27 29 5c 6e 20 20 20 20 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 20 20 | al')\n....#.pl.legend(loc=0)\n.. |
d8c0 | 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 20 20 | ..pl.title('OT.Euclidean')\n\n.. |
d8e0 | 20 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 20 20 20 20 6f 74 2e 70 6c | ..pl.subplot(1,.3,.2)\n....ot.pl |
d900 | 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 32 | ot.plot2D_samples_mat(xs,.xt,.G2 |
d920 | 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 | ,.c=[.5,..5,.1])\n....pl.plot(xs |
d940 | 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 | [:,.0],.xs[:,.1],.'+b',.label='S |
d960 | 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b | ource.samples')\n....pl.plot(xt[ |
d980 | 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 | :,.0],.xt[:,.1],.'xr',.label='Ta |
d9a0 | 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 | rget.samples')\n....pl.axis('equ |
d9c0 | 61 6c 27 29 5c 6e 20 20 20 20 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 20 20 | al')\n....#.pl.legend(loc=0)\n.. |
d9e0 | 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e | ..pl.title('OT.squared.Euclidean |
da00 | 27 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 20 | ')\n\n....pl.subplot(1,.3,.3)\n. |
da20 | 20 20 20 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 | ...ot.plot.plot2D_samples_mat(xs |
da40 | 2c 20 78 74 2c 20 47 70 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c | ,.xt,.Gp,.c=[.5,..5,.1])\n....pl |
da60 | 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 | .plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+b',. |
da80 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e | label='Source.samples')\n....pl. |
daa0 | 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c | plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr',.l |
dac0 | 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 61 | abel='Target.samples')\n....pl.a |
dae0 | 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 20 20 20 20 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f | xis('equal')\n....#.pl.legend(lo |
db00 | 63 3d 30 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 72 74 20 45 75 63 6c | c=0)\n....pl.title('OT.sqrt.Eucl |
db20 | 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e | idean')\n....pl.tight_layout()\n |
db40 | 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 | \npl.show()".......],........"ou |
db60 | 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b | tputs":.[],........"metadata":.{ |
db80 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 | ........."collapsed":.false..... |
dba0 | 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a | ..}.....}...],...."metadata":.{. |
dbc0 | 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c | ...."kernelspec":.{......."displ |
dbe0 | 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 | ay_name":."Python.2",........"na |
dc00 | 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 | me":."python2",........"language |
dc20 | 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 | ":."python".....},......"languag |
dc40 | 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 | e_info":.{......."mimetype":."te |
dc60 | 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f | xt/x-python",........"nbconvert_ |
dc80 | 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d | exporter":."python",........"nam |
dca0 | 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e | e":."python",........"file_exten |
dcc0 | 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 | sion":.".py",........"version":. |
dce0 | 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 | "2.7.12",........"pygments_lexer |
dd00 | 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f | ":."ipython2",........"codemirro |
dd20 | 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c | r_mode":.{........."version":.2, |
dd40 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 | .........."name":."ipython"..... |
dd60 | 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 a7 85 1e 4b 1c bf a6 | ..}.....}...}.}PK...........K... |
dd80 | e3 bf 0a 00 00 bf 0a 00 00 26 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f | .........&...auto_examples/plot_ |
dda0 | 4f 54 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 | OT_2D_samples.ipynb{..."nbformat |
ddc0 | 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 | _minor":.0,...."nbformat":.4,... |
dde0 | 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 | ."cells":.[.....{......."executi |
de00 | 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 | on_count":.null,........"cell_ty |
de20 | 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a | pe":."code",........"source":.[. |
de40 | 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 | ........"%matplotlib.inline".... |
de60 | 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 | ...],........"outputs":.[],..... |
de80 | 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 | ..."metadata":.{........."collap |
dea0 | 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 | sed":.false.......}.....},...... |
dec0 | 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 | {......."source":.[........."\n# |
dee0 | 20 32 44 20 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 65 6d | .2D.Optimal.transport.between.em |
df00 | 70 69 72 69 63 61 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 | pirical.distributions\n\n\n\n".. |
df20 | 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 | .....],........"cell_type":."mar |
df40 | 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 | kdown",........"metadata":.{}... |
df60 | 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 | ..},......{......."execution_cou |
df80 | 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 | nt":.null,........"cell_type":." |
dfa0 | 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 | code",........"source":.[....... |
dfc0 | 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e | .."#.Author:.Remi.Flamary.<remi. |
dfe0 | 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a | flamary@unice.fr>\n#\n#.License: |
e000 | 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 | .MIT.License\n\nimport.numpy.as. |
e020 | 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 | np\nimport.matplotlib.pylab.as.p |
e040 | 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 20 61 | l\nimport.ot\n\n#%%.parameters.a |
e060 | 6e 64 20 64 61 74 61 20 67 65 6e 65 72 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 6e 20 3d 20 35 30 20 20 23 20 | nd.data.generation\n\nn.=.50..#. |
e080 | 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 6d 75 5f 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 30 | nb.samples\n\nmu_s.=.np.array([0 |
e0a0 | 2c 20 30 5d 29 5c 6e 63 6f 76 5f 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 5b 31 2c 20 30 5d 2c | ,.0])\ncov_s.=.np.array([[1,.0], |
e0c0 | 20 5b 30 2c 20 31 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 6d 75 5f 74 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 34 2c | .[0,.1]])\n\nmu_t.=.np.array([4, |
e0e0 | 20 34 5d 29 5c 6e 63 6f 76 5f 74 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 5b 31 2c 20 2d 2e 38 5d | .4])\ncov_t.=.np.array([[1,.-.8] |
e100 | 2c 20 5b 2d 2e 38 2c 20 31 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 78 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 | ,.[-.8,.1]])\n\nxs.=.ot.datasets |
e120 | 2e 67 65 74 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 75 5f 73 2c 20 63 | .get_2D_samples_gauss(n,.mu_s,.c |
e140 | 6f 76 5f 73 29 5c 6e 78 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 32 44 5f 73 | ov_s)\nxt.=.ot.datasets.get_2D_s |
e160 | 61 6d 70 6c 65 73 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 75 5f 74 2c 20 63 6f 76 5f 74 29 5c 6e 5c 6e | amples_gauss(n,.mu_t,.cov_t)\n\n |
e180 | 61 2c 20 62 20 3d 20 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 28 6e 2c 29 29 20 2f 20 6e 2c 20 6e 70 2e 6f 6e 65 | a,.b.=.np.ones((n,))./.n,.np.one |
e1a0 | 73 28 28 6e 2c 29 29 20 2f 20 6e 20 20 23 20 75 6e 69 66 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 | s((n,))./.n..#.uniform.distribut |
e1c0 | 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c | ion.on.samples\n\n#.loss.matrix\ |
e1e0 | 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 | nM.=.ot.dist(xs,.xt)\nM./=.M.max |
e200 | 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 | ()\n\n#%%.plot.samples\n\npl.fig |
e220 | 75 72 65 28 31 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 | ure(1)\npl.plot(xs[:,.0],.xs[:,. |
e240 | 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 | 1],.'+b',.label='Source.samples' |
e260 | 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 | )\npl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.' |
e280 | 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c | xr',.label='Target.samples')\npl |
e2a0 | 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 | .legend(loc=0)\npl.title('Source |
e2c0 | 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 | .and.target.distributions')\n\np |
e2e0 | 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 | l.figure(2)\npl.imshow(M,.interp |
e300 | 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f | olation='nearest')\npl.title('Co |
e320 | 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 4d 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e 5c 6e 47 30 | st.matrix.M')\n\n\n#%%.EMD\n\nG0 |
e340 | 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 | .=.ot.emd(a,.b,.M)\n\npl.figure( |
e360 | 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 30 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d | 3)\npl.imshow(G0,.interpolation= |
e380 | 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 | 'nearest')\npl.title('OT.matrix. |
e3a0 | 47 30 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c | G0')\n\npl.figure(4)\not.plot.pl |
e3c0 | 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 30 2c 20 63 3d 5b | ot2D_samples_mat(xs,.xt,.G0,.c=[ |
e3e0 | 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 | .5,..5,.1])\npl.plot(xs[:,.0],.x |
e400 | 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d | s[:,.1],.'+b',.label='Source.sam |
e420 | 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 | ples')\npl.plot(xt[:,.0],.xt[:,. |
e440 | 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 | 1],.'xr',.label='Target.samples' |
e460 | 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f | )\npl.legend(loc=0)\npl.title('O |
e480 | 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 77 69 74 68 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 | T.matrix.with.samples')\n\n\n#%% |
e4a0 | 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 72 65 67 20 74 65 72 6d 5c 6e 6c 61 6d 62 64 20 3d | .sinkhorn\n\n#.reg.term\nlambd.= |
e4c0 | 20 31 65 2d 33 5c 6e 5c 6e 47 73 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c 20 62 2c 20 | .1e-3\n\nGs.=.ot.sinkhorn(a,.b,. |
e4e0 | 4d 2c 20 6c 61 6d 62 64 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d | M,.lambd)\n\npl.figure(5)\npl.im |
e500 | 73 68 6f 77 28 47 73 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 | show(Gs,.interpolation='nearest' |
e520 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 | )\npl.title('OT.matrix.sinkhorn' |
e540 | 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 36 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 | )\n\npl.figure(6)\not.plot.plot2 |
e560 | 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 73 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d | D_samples_mat(xs,.xt,.Gs,.color= |
e580 | 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 | [.5,..5,.1])\npl.plot(xs[:,.0],. |
e5a0 | 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 | xs[:,.1],.'+b',.label='Source.sa |
e5c0 | 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c | mples')\npl.plot(xt[:,.0],.xt[:, |
e5e0 | 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | .1],.'xr',.label='Target.samples |
e600 | 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | ')\npl.legend(loc=0)\npl.title(' |
e620 | 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 77 69 74 68 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 | OT.matrix.Sinkhorn.with.samples' |
e640 | 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | )\n\npl.show()".......],........ |
e660 | 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 | "outputs":.[],........"metadata" |
e680 | 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 | :.{........."collapsed":.false.. |
e6a0 | 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a | .....}.....}...],...."metadata": |
e6c0 | 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 | .{....."kernelspec":.{......."di |
e6e0 | 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | splay_name":."Python.2",........ |
e700 | 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 | "name":."python2",........"langu |
e720 | 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 | age":."python".....},......"lang |
e740 | 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 | uage_info":.{......."mimetype":. |
e760 | 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 | "text/x-python",........"nbconve |
e780 | 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | rt_exporter":."python",........" |
e7a0 | 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 | name":."python",........"file_ex |
e7c0 | 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e | tension":.".py",........"version |
e7e0 | 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 | ":."2.7.12",........"pygments_le |
e800 | 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 | xer":."ipython2",........"codemi |
e820 | 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a | rror_mode":.{........."version": |
e840 | 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 | .2,.........."name":."ipython".. |
e860 | 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 75 7b 82 49 | .....}.....}...}.}PK........u{.I |
e880 | 55 d4 67 d2 3c 0e 00 00 3c 0e 00 00 20 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c | U.g.<...<.......auto_examples/pl |
e8a0 | 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 32 44 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 | ot_OTDA_2D.ipynb{..."nbformat_mi |
e8c0 | 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 | nor":.0,...."nbformat":.4,...."c |
e8e0 | 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f | ells":.[.....{......."execution_ |
e900 | 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 | count":.null,........"cell_type" |
e920 | 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 | :."code",........"source":.[.... |
e940 | 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 | ....."%matplotlib.inline"....... |
e960 | 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | ],........"outputs":.[],........ |
e980 | 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 | "metadata":.{........."collapsed |
e9a0 | 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 | ":.false.......}.....},......{.. |
e9c0 | 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 4f 54 | ....."source":.[........."\n#.OT |
e9e0 | 20 66 6f 72 20 65 6d 70 69 72 69 63 61 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e | .for.empirical.distributions\n\n |
ea00 | 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 | \n\n".......],........"cell_type |
ea20 | 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 | ":."markdown",........"metadata" |
ea40 | 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 | :.{}.....},......{......."execut |
ea60 | 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 | ion_count":.null,........"cell_t |
ea80 | 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b | ype":."code",........"source":.[ |
eaa0 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d | ........."import.numpy.as.np\nim |
eac0 | 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 | port.matplotlib.pylab.as.pl\nimp |
eae0 | 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e | ort.ot\n\n\n\n#%%.parameters\n\n |
eb00 | 6e 3d 31 35 30 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e 73 5c 6e 5c 6e 78 73 2c 79 73 3d 6f 74 2e 64 61 74 61 | n=150.#.nb.bins\n\nxs,ys=ot.data |
eb20 | 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 27 2c 6e | sets.get_data_classif('3gauss',n |
eb40 | 29 5c 6e 78 74 2c 79 74 3d 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c | )\nxt,yt=ot.datasets.get_data_cl |
eb60 | 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 32 27 2c 6e 29 5c 6e 5c 6e 61 2c 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 | assif('3gauss2',n)\n\na,b.=.ot.u |
eb80 | 6e 69 66 28 6e 29 2c 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 | nif(n),ot.unif(n)\n#.loss.matrix |
eba0 | 5c 6e 4d 3d 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 78 74 29 5c 6e 23 4d 2f 3d 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c | \nM=ot.dist(xs,xt)\n#M/=M.max()\ |
ebc0 | 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 | n\n#%%.plot.samples\n\npl.figure |
ebe0 | 28 31 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 | (1)\n\npl.subplot(2,2,1)\npl.sca |
ec00 | 74 74 65 72 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 | tter(xs[:,0],xs[:,1],c=ys,marker |
ec20 | 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c | ='+',label='Source.samples')\npl |
ec40 | 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 | .legend(loc=0)\npl.title('Source |
ec60 | 20 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | ..distributions')\n\npl.subplot( |
ec80 | 32 2c 32 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c | 2,2,2)\npl.scatter(xt[:,0],xt[:, |
eca0 | 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 | 1],c=yt,marker='o',label='Target |
ecc0 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c | .samples')\npl.legend(loc=0)\npl |
ece0 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 74 61 72 67 65 74 20 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c | .title('target..distributions')\ |
ed00 | 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 69 6e 74 | n\npl.figure(2)\npl.imshow(M,int |
ed20 | 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | erpolation='nearest')\npl.title( |
ed40 | 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 4d 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 4f 54 20 65 73 74 | 'Cost.matrix.M')\n\n\n#%%.OT.est |
ed60 | 69 6d 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 45 4d 44 5c 6e 47 30 3d 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 62 2c | imation\n\n#.EMD\nG0=ot.emd(a,b, |
ed80 | 4d 29 5c 6e 5c 6e 23 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 6c 61 6d 62 64 3d 31 65 2d 31 5c 6e 47 73 | M)\n\n#.sinkhorn\nlambd=1e-1\nGs |
eda0 | 3d 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c 62 2c 4d 2c 6c 61 6d 62 64 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 | =ot.sinkhorn(a,b,M,lambd)\n\n\n# |
edc0 | 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 72 65 67 | .Group.lasso.regularization\nreg |
ede0 | 3d 31 65 2d 31 5c 6e 65 74 61 3d 31 65 30 5c 6e 47 67 3d 6f 74 2e 64 61 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 | =1e-1\neta=1e0\nGg=ot.da.sinkhor |
ee00 | 6e 5f 6c 70 6c 31 5f 6d 6d 28 61 2c 79 73 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 69 6e 74 29 2c 62 2c | n_lpl1_mm(a,ys.astype(np.int),b, |
ee20 | 4d 2c 72 65 67 2c 65 74 61 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 76 69 73 75 20 6d 61 74 72 69 63 65 | M,reg,eta)\n\n\n#%%.visu.matrice |
ee40 | 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | s\n\npl.figure(3)\n\npl.subplot( |
ee60 | 32 2c 33 2c 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 30 2c 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 | 2,3,1)\npl.imshow(G0,interpolati |
ee80 | 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 | on='nearest')\npl.title('OT.matr |
eea0 | 69 78 20 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 | ix.')\n\npl.subplot(2,3,2)\npl.i |
eec0 | 6d 73 68 6f 77 28 47 73 2c 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 | mshow(Gs,interpolation='nearest' |
eee0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 | )\npl.title('OT.matrix.Sinkhorn' |
ef00 | 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f | )\n\npl.subplot(2,3,3)\npl.imsho |
ef20 | 77 28 47 67 2c 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 | w(Gg,interpolation='nearest')\np |
ef40 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 27 29 | l.title('OT.matrix.Group.lasso') |
ef60 | 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 34 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 | \n\npl.subplot(2,3,4)\not.plot.p |
ef80 | 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 78 74 2c 47 30 2c 63 3d 5b 2e 35 | lot2D_samples_mat(xs,xt,G0,c=[.5 |
efa0 | 2c 2e 35 2c 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a | ,.5,1])\npl.scatter(xs[:,0],xs[: |
efc0 | 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 | ,1],c=ys,marker='+',label='Sourc |
efe0 | 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c | e.samples')\npl.scatter(xt[:,0], |
f000 | 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 | xt[:,1],c=yt,marker='o',label='T |
f020 | 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | arget.samples')\n\n\npl.subplot( |
f040 | 32 2c 33 2c 35 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d | 2,3,5)\not.plot.plot2D_samples_m |
f060 | 61 74 28 78 73 2c 78 74 2c 47 73 2c 63 3d 5b 2e 35 2c 2e 35 2c 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 | at(xs,xt,Gs,c=[.5,.5,1])\npl.sca |
f080 | 74 74 65 72 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 | tter(xs[:,0],xs[:,1],c=ys,marker |
f0a0 | 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c | ='+',label='Source.samples')\npl |
f0c0 | 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 | .scatter(xt[:,0],xt[:,1],c=yt,ma |
f0e0 | 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 | rker='o',label='Target.samples') |
f100 | 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 36 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 | \n\npl.subplot(2,3,6)\not.plot.p |
f120 | 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 78 74 2c 47 67 2c 63 3d 5b 2e 35 | lot2D_samples_mat(xs,xt,Gg,c=[.5 |
f140 | 2c 2e 35 2c 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a | ,.5,1])\npl.scatter(xs[:,0],xs[: |
f160 | 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 | ,1],c=ys,marker='+',label='Sourc |
f180 | 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c | e.samples')\npl.scatter(xt[:,0], |
f1a0 | 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 | xt[:,1],c=yt,marker='o',label='T |
f1c0 | 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 73 61 6d 70 6c 65 20 69 6e | arget.samples')\n\n#%%.sample.in |
f1e0 | 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 78 73 74 30 3d 6e 2a 47 30 2e 64 6f 74 28 78 74 29 | terpolation\n\nxst0=n*G0.dot(xt) |
f200 | 5c 6e 78 73 74 73 3d 6e 2a 47 73 2e 64 6f 74 28 78 74 29 5c 6e 78 73 74 67 3d 6e 2a 47 67 2e 64 | \nxsts=n*Gs.dot(xt)\nxstg=n*Gg.d |
f220 | 6f 74 28 78 74 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | ot(xt)\n\npl.figure(4)\npl.subpl |
f240 | 6f 74 28 32 2c 33 2c 31 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 | ot(2,3,1)\n\n\npl.scatter(xt[:,0 |
f260 | 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d | ],xt[:,1],c=yt,marker='o',label= |
f280 | 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 5c 6e 70 6c 2e | 'Target.samples',alpha=0.5)\npl. |
f2a0 | 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 30 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 30 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 | scatter(xst0[:,0],xst0[:,1],c=ys |
f2c0 | 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 | ,marker='+',label='Transp.sample |
f2e0 | 73 27 2c 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6e 74 65 72 70 20 73 61 6d 70 6c | s',s=30)\npl.title('Interp.sampl |
f300 | 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 | es')\npl.legend(loc=0)\n\npl.sub |
f320 | 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 32 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a | plot(2,3,2)\n\n\npl.scatter(xt[: |
f340 | 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 | ,0],xt[:,1],c=yt,marker='o',labe |
f360 | 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 5c 6e 70 | l='Target.samples',alpha=0.5)\np |
f380 | 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d | l.scatter(xsts[:,0],xsts[:,1],c= |
f3a0 | 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 | ys,marker='+',label='Transp.samp |
f3c0 | 6c 65 73 27 2c 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6e 74 65 72 70 20 73 61 6d | les',s=30)\npl.title('Interp.sam |
f3e0 | 70 6c 65 73 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | ples.Sinkhorn')\n\npl.subplot(2, |
f400 | 33 2c 33 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c | 3,3)\n\npl.scatter(xt[:,0],xt[:, |
f420 | 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 | 1],c=yt,marker='o',label='Target |
f440 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 | .samples',alpha=0.5)\npl.scatter |
f460 | 28 78 73 74 67 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 67 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 | (xstg[:,0],xstg[:,1],c=ys,marker |
f480 | 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 73 3d 33 30 | ='+',label='Transp.samples',s=30 |
f4a0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6e 74 65 72 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 47 72 6f 75 | )\npl.title('Interp.samples.Grou |
f4c0 | 70 6c 61 73 73 6f 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 | plasso')".......],........"outpu |
f4e0 | 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 | ts":.[],........"metadata":.{... |
f500 | 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d | ......"collapsed":.false.......} |
f520 | 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 | .....}...],...."metadata":.{.... |
f540 | 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f | ."kernelspec":.{......."display_ |
f560 | 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 | name":."Python.2",........"name" |
f580 | 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 | :."python2",........"language":. |
f5a0 | 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 | "python".....},......"language_i |
f5c0 | 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f | nfo":.{......."mimetype":."text/ |
f5e0 | 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 | x-python",........"nbconvert_exp |
f600 | 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a | orter":."python",........"name": |
f620 | 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f | ."python",........"file_extensio |
f640 | 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e | n":.".py",........"version":."2. |
f660 | 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 | 7.12",........"pygments_lexer":. |
f680 | 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d | "ipython2",........"codemirror_m |
f6a0 | 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 | ode":.{........."version":.2,... |
f6c0 | 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d | ......."name":."ipython".......} |
f6e0 | 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 b8 86 1e 4b 22 97 a9 c7 5d 18 | .....}...}.}PK...........K"...]. |
f700 | 00 00 5d 18 00 00 25 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 | ..]...%...auto_examples/plot_otd |
f720 | 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e | a_mapping.ipynb{..."nbformat_min |
f740 | 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 | or":.0,...."nbformat":.4,...."ce |
f760 | 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 | lls":.[.....{......."execution_c |
f780 | 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a | ount":.null,........"cell_type": |
f7a0 | 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 | ."code",........"source":.[..... |
f7c0 | 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d | ...."%matplotlib.inline".......] |
f7e0 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ,........"outputs":.[],........" |
f800 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 | metadata":.{........."collapsed" |
f820 | 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 | :.false.......}.....},......{... |
f840 | 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d | ...."source":.[........."\n===== |
f860 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
f880 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 4f 54 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f | ==========\nOT.mapping.estimatio |
f8a0 | 6e 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 5b 38 5d 5c 6e 3d 3d 3d | n.for.domain.adaptation.[8]\n=== |
f8c0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
f8e0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 5c 6e 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 70 72 65 | ============\n\nThis.example.pre |
f900 | 73 65 6e 74 73 20 68 6f 77 20 74 6f 20 75 73 65 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 | sents.how.to.use.MappingTranspor |
f920 | 74 20 74 6f 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 20 61 74 20 74 68 65 20 73 61 6d 65 5c 6e 74 69 6d 65 20 | t.to.estimate.at.the.same\ntime. |
f940 | 62 6f 74 68 20 74 68 65 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6e 64 20 | both.the.coupling.transport.and. |
f960 | 61 70 70 72 6f 78 69 6d 61 74 65 20 74 68 65 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 6d 61 70 20 77 69 | approximate.the.transport.map.wi |
f980 | 74 68 20 65 69 74 68 65 72 5c 6e 61 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6f 72 20 61 20 6b 65 72 6e 65 6c 69 | th.either\na.linear.or.a.kerneli |
f9a0 | 7a 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 61 73 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 64 20 69 6e 20 5b 38 5d | zed.mapping.as.introduced.in.[8] |
f9c0 | 5c 6e 5c 6e 5b 38 5d 20 4d 2e 20 50 65 72 72 6f 74 2c 20 4e 2e 20 43 6f 75 72 74 79 2c 20 52 2e | \n\n[8].M..Perrot,.N..Courty,.R. |
f9e0 | 20 46 6c 61 6d 61 72 79 2c 20 41 2e 20 48 61 62 72 61 72 64 2c 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 4d 61 70 | .Flamary,.A..Habrard,\n....\"Map |
fa00 | 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 | ping.estimation.for.discrete.opt |
fa20 | 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 22 2c 5c 6e 20 20 20 20 4e 65 75 72 61 6c 20 49 6e | imal.transport\",\n....Neural.In |
fa40 | 66 6f 72 6d 61 74 69 6f 6e 20 50 72 6f 63 65 73 73 69 6e 67 20 53 79 73 74 65 6d 73 20 28 4e 49 | formation.Processing.Systems.(NI |
fa60 | 50 53 29 2c 20 32 30 31 36 2e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | PS),.2016.\n\n".......],........ |
fa80 | 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | "cell_type":."markdown",........ |
faa0 | 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 | "metadata":.{}.....},......{.... |
fac0 | 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 | ..."execution_count":.null,..... |
fae0 | 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ..."cell_type":."code",........" |
fb00 | 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 | source":.[........."#.Authors:.R |
fb20 | 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e | emi.Flamary.<remi.flamary@unice. |
fb40 | 66 72 3e 5c 6e 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f | fr>\n#..........Stanislas.Chambo |
fb60 | 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 | n.<stan.chambon@gmail.com>\n#\n# |
fb80 | 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 | .License:.MIT.License\n\nimport. |
fba0 | 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 | numpy.as.np\nimport.matplotlib.p |
fbc0 | 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 | ylab.as.pl\nimport.ot".......],. |
fbe0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 | ......."outputs":.[],........"me |
fc00 | 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 | tadata":.{........."collapsed":. |
fc20 | 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 | false.......}.....},......{..... |
fc40 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 67 65 6e 65 72 61 74 65 20 | .."source":.[........."generate. |
fc60 | 64 61 74 61 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | data\n########################## |
fc80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
fca0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d | ###################\n\n".......] |
fcc0 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 | ,........"cell_type":."markdown" |
fce0 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a | ,........"metadata":.{}.....},.. |
fd00 | 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e | ....{......."execution_count":.n |
fd20 | 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c | ull,........"cell_type":."code", |
fd40 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 5f 73 | ........"source":.[........."n_s |
fd60 | 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 31 30 30 5c 6e 6e 5f 74 61 72 67 65 74 5f 73 61 | ource_samples.=.100\nn_target_sa |
fd80 | 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 31 30 30 5c 6e 74 68 65 74 61 20 3d 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 20 2f | mples.=.100\ntheta.=.2.*.np.pi./ |
fda0 | 20 32 30 5c 6e 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 65 6c 20 3d 20 30 2e 31 5c 6e 5c 6e 58 73 2c 20 79 73 | .20\nnoise_level.=.0.1\n\nXs,.ys |
fdc0 | 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 | .=.ot.datasets.get_data_classif( |
fde0 | 5c 6e 20 20 20 20 27 67 61 75 73 73 72 6f 74 27 2c 20 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c | \n....'gaussrot',.n_source_sampl |
fe00 | 65 73 2c 20 6e 7a 3d 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 65 6c 29 5c 6e 58 73 5f 6e 65 77 2c 20 5f 20 3d | es,.nz=noise_level)\nXs_new,._.= |
fe20 | 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 5c 6e | .ot.datasets.get_data_classif(\n |
fe40 | 20 20 20 20 27 67 61 75 73 73 72 6f 74 27 2c 20 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 | ....'gaussrot',.n_source_samples |
fe60 | 2c 20 6e 7a 3d 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 65 6c 29 5c 6e 58 74 2c 20 79 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 | ,.nz=noise_level)\nXt,.yt.=.ot.d |
fe80 | 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 5c 6e 20 20 20 20 27 | atasets.get_data_classif(\n....' |
fea0 | 67 61 75 73 73 72 6f 74 27 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 68 65 | gaussrot',.n_target_samples,.the |
fec0 | 74 61 3d 74 68 65 74 61 2c 20 6e 7a 3d 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 65 6c 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6f | ta=theta,.nz=noise_level)\n\n#.o |
fee0 | 6e 65 20 6f 66 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 6d 6f 64 65 20 63 68 61 6e 67 65 73 20 69 74 | ne.of.the.target.mode.changes.it |
ff00 | 73 20 76 61 72 69 61 6e 63 65 20 28 6e 6f 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 29 5c 6e | s.variance.(no.linear.mapping)\n |
ff20 | 58 74 5b 79 74 20 3d 3d 20 32 5d 20 2a 3d 20 33 5c 6e 58 74 20 3d 20 58 74 20 2b 20 34 22 0a 20 | Xt[yt.==.2].*=.3\nXt.=.Xt.+.4".. |
ff40 | 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 | .....],........"outputs":.[],... |
ff60 | 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c | ....."metadata":.{........."coll |
ff80 | 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 | apsed":.false.......}.....},.... |
ffa0 | 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 49 | ..{......."source":.[........."I |
ffc0 | 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f | nstantiate.the.different.transpo |
ffe0 | 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 5c 6e 23 23 23 23 | rt.algorithms.and.fit.them\n#### |
10000 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
10020 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
10040 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | #########\n\n".......],........" |
10060 | 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | cell_type":."markdown",........" |
10080 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 | metadata":.{}.....},......{..... |
100a0 | 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 | .."execution_count":.null,...... |
100c0 | 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 | .."cell_type":."code",........"s |
100e0 | 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e | ource":.[........."#.MappingTran |
10100 | 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6b 65 72 6e 65 6c 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 | sport.with.linear.kernel\not_map |
10120 | 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 | ping_linear.=.ot.da.MappingTrans |
10140 | 70 6f 72 74 28 5c 6e 20 20 20 20 6b 65 72 6e 65 6c 3d 5c 22 6c 69 6e 65 61 72 5c 22 2c 20 6d 75 | port(\n....kernel=\"linear\",.mu |
10160 | 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 38 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 5c 6e 20 20 20 20 | =1e0,.eta=1e-8,.bias=True,\n.... |
10180 | 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 6f 74 | max_iter=20,.verbose=True)\n\not |
101a0 | 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 | _mapping_linear.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt |
101c0 | 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c | )\n\n#.for.original.source.sampl |
101e0 | 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 | es,.transform.applies.barycentri |
10200 | 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 | c.mapping\ntransp_Xs_linear.=.ot |
10220 | 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 | _mapping_linear.transform(Xs=Xs) |
10240 | 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c | \n\n#.for.out.of.source.samples, |
10260 | 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 74 68 65 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 | .transform.applies.the.linear.ma |
10280 | 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 | pping\ntransp_Xs_linear_new.=.ot |
102a0 | 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f | _mapping_linear.transform(Xs=Xs_ |
102c0 | 6e 65 77 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 | new)\n\n\n#.MappingTransport.wit |
102e0 | 68 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 6b 65 72 6e 65 6c 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 | h.gaussian.kernel\not_mapping_ga |
10300 | 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 | ussian.=.ot.da.MappingTransport( |
10320 | 5c 6e 20 20 20 20 6b 65 72 6e 65 6c 3d 5c 22 67 61 75 73 73 69 61 6e 5c 22 2c 20 65 74 61 3d 31 | \n....kernel=\"gaussian\",.eta=1 |
10340 | 65 2d 35 2c 20 6d 75 3d 31 65 2d 31 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 20 73 69 67 6d 61 3d 31 | e-5,.mu=1e-1,.bias=True,.sigma=1 |
10360 | 2c 5c 6e 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 | ,\n....max_iter=10,.verbose=True |
10380 | 29 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 | )\not_mapping_gaussian.fit(Xs=Xs |
103a0 | 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 72 63 | ,.Xt=Xt)\n\n#.for.original.sourc |
103c0 | 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 62 61 72 | e.samples,.transform.applies.bar |
103e0 | 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 | ycentric.mapping\ntransp_Xs_gaus |
10400 | 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 | sian.=.ot_mapping_gaussian.trans |
10420 | 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 6f 75 72 | form(Xs=Xs)\n\n#.for.out.of.sour |
10440 | 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 74 68 | ce.samples,.transform.applies.th |
10460 | 65 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 | e.gaussian.mapping\ntransp_Xs_ga |
10480 | 75 73 73 69 61 6e 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e | ussian_new.=.ot_mapping_gaussian |
104a0 | 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 77 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 | .transform(Xs=Xs_new)".......],. |
104c0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 | ......."outputs":.[],........"me |
104e0 | 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 | tadata":.{........."collapsed":. |
10500 | 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 | false.......}.....},......{..... |
10520 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 6f 74 20 64 61 74 61 | .."source":.[........."plot.data |
10540 | 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | \n############################## |
10560 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
10580 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 | ###############\n\n".......],... |
105a0 | 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 | ....."cell_type":."markdown",... |
105c0 | 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 | ....."metadata":.{}.....},...... |
105e0 | 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c | {......."execution_count":.null, |
10600 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 | ........"cell_type":."code",.... |
10620 | 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 | ...."source":.[........."pl.figu |
10640 | 72 65 28 31 2c 20 28 31 30 2c 20 35 29 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 | re(1,.(10,.5))\npl.clf()\npl.sca |
10660 | 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d | tter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.m |
10680 | 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | arker='+',.label='Source.samples |
106a0 | 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 | ')\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1 |
106c0 | 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 | ],.c=yt,.marker='o',.label='Targ |
106e0 | 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e | et.samples')\npl.legend(loc=0)\n |
10700 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 | pl.title('Source.and.target.dist |
10720 | 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 | ributions')".......],........"ou |
10740 | 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b | tputs":.[],........"metadata":.{ |
10760 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 | ........."collapsed":.false..... |
10780 | 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 | ..}.....},......{......."source" |
107a0 | 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 | :.[........."plot.transported.sa |
107c0 | 6d 70 6c 65 73 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | mples\n######################### |
107e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
10800 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 | ####################\n\n"....... |
10820 | 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e | ],........"cell_type":."markdown |
10840 | 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 | ",........"metadata":.{}.....},. |
10860 | 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 | .....{......."execution_count":. |
10880 | 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 | null,........"cell_type":."code" |
108a0 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c | ,........"source":.[........."pl |
108c0 | 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | .figure(2)\npl.clf()\npl.subplot |
108e0 | 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 | (2,.2,.1)\npl.scatter(Xt[:,.0],. |
10900 | 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 | Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',\n... |
10920 | 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 | ........label='Target.samples',. |
10940 | 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f | alpha=.2)\npl.scatter(transp_Xs_ |
10960 | 6c 69 6e 65 61 72 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5b 3a | linear[:,.0],.transp_Xs_linear[: |
10980 | 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 | ,.1],.c=ys,.marker='+',\n....... |
109a0 | 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4d 61 70 70 65 64 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | ....label='Mapped.source.samples |
109c0 | 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 42 61 72 79 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 | ')\npl.title(\"Bary..mapping.(li |
109e0 | 6e 65 61 72 29 5c 22 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | near)\")\npl.legend(loc=0)\n\npl |
10a00 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 | .subplot(2,.2,.2)\npl.scatter(Xt |
10a20 | 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 | [:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker=' |
10a40 | 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 | o',\n...........label='Target.sa |
10a60 | 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 | mples',.alpha=.2)\npl.scatter(tr |
10a80 | 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 | ansp_Xs_linear_new[:,.0],.transp |
10aa0 | 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | _Xs_linear_new[:,.1],\n......... |
10ac0 | 20 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 65 61 72 6e | ..c=ys,.marker='+',.label='Learn |
10ae0 | 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 45 73 74 69 6d 2e 20 | ed.mapping')\npl.title(\"Estim.. |
10b00 | 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | mapping.(linear)\")\n\npl.subplo |
10b20 | 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c | t(2,.2,.3)\npl.scatter(Xt[:,.0], |
10b40 | 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 | .Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',\n.. |
10b60 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c | .........label='Target.samples', |
10b80 | 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 | .alpha=.2)\npl.scatter(transp_Xs |
10ba0 | 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 | _gaussian[:,.0],.transp_Xs_gauss |
10bc0 | 69 61 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 | ian[:,.1],.c=ys,\n...........mar |
10be0 | 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 | ker='+',.label='barycentric.mapp |
10c00 | 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 42 61 72 79 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 | ing')\npl.title(\"Bary..mapping. |
10c20 | 28 6b 65 72 6e 65 6c 29 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 | (kernel)\")\n\npl.subplot(2,.2,. |
10c40 | 34 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 | 4)\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1 |
10c60 | 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ],.c=yt,.marker='o',\n.......... |
10c80 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e | .label='Target.samples',.alpha=. |
10ca0 | 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 | 2)\npl.scatter(transp_Xs_gaussia |
10cc0 | 6e 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5f | n_new[:,.0],.transp_Xs_gaussian_ |
10ce0 | 6e 65 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 | new[:,.1],.c=ys,\n...........mar |
10d00 | 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 65 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 | ker='+',.label='Learned.mapping' |
10d20 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 45 73 74 69 6d 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6b 65 | )\npl.title(\"Estim..mapping.(ke |
10d40 | 72 6e 65 6c 29 5c 22 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 | rnel)\")\npl.tight_layout()\n\np |
10d60 | 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 | l.show()".......],........"outpu |
10d80 | 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 | ts":.[],........"metadata":.{... |
10da0 | 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d | ......"collapsed":.false.......} |
10dc0 | 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 | .....}...],...."metadata":.{.... |
10de0 | 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f | ."kernelspec":.{......."display_ |
10e00 | 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 | name":."Python.2",........"name" |
10e20 | 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 | :."python2",........"language":. |
10e40 | 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 | "python".....},......"language_i |
10e60 | 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f | nfo":.{......."mimetype":."text/ |
10e80 | 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 | x-python",........"nbconvert_exp |
10ea0 | 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a | orter":."python",........"name": |
10ec0 | 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f | ."python",........"file_extensio |
10ee0 | 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e | n":.".py",........"version":."2. |
10f00 | 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 | 7.12",........"pygments_lexer":. |
10f20 | 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d | "ipython2",........"codemirror_m |
10f40 | 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 | ode":.{........."version":.2,... |
10f60 | 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d | ......."name":."ipython".......} |
10f80 | 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 02 84 1e 4b ee 1f 11 06 c2 0a | .....}...}.}PK...........K...... |
10fa0 | 00 00 c2 0a 00 00 24 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6d | ......$...auto_examples/plot_com |
10fc0 | 70 75 74 65 5f 65 6d 64 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f | pute_emd.ipynb{..."nbformat_mino |
10fe0 | 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c | r":.0,...."nbformat":.4,...."cel |
11000 | 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f | ls":.[.....{......."execution_co |
11020 | 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 | unt":.null,........"cell_type":. |
11040 | 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 | "code",........"source":.[...... |
11060 | 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c | ..."%matplotlib.inline".......], |
11080 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d | ........"outputs":.[],........"m |
110a0 | 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a | etadata":.{........."collapsed": |
110c0 | 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 | .false.......}.....},......{.... |
110e0 | 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 31 44 20 6f | ..."source":.[........."\n#.1D.o |
11100 | 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 | ptimal.transport\n\n\n\n"....... |
11120 | 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e | ],........"cell_type":."markdown |
11140 | 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 | ",........"metadata":.{}.....},. |
11160 | 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 | .....{......."execution_count":. |
11180 | 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 | null,........"cell_type":."code" |
111a0 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 | ,........"source":.[........."#. |
111c0 | 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 | Author:.Remi.Flamary.<remi.flama |
111e0 | 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 | ry@unice.fr>\n#\n#.License:.MIT. |
11200 | 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 | License\n\nimport.numpy.as.np\ni |
11220 | 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d | mport.matplotlib.pylab.as.pl\nim |
11240 | 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 20 69 6d 70 6f 72 74 | port.ot\nfrom.ot.datasets.import |
11260 | 20 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 20 61 73 20 67 61 75 73 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 | .get_1D_gauss.as.gauss\n\n\n#%%. |
11280 | 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e 73 | parameters\n\nn.=.100..#.nb.bins |
112a0 | 5c 6e 6e 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 35 30 20 20 23 20 6e 62 20 74 61 72 67 65 74 20 64 69 73 | \nn_target.=.50..#.nb.target.dis |
112c0 | 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 5c | tributions\n\n\n#.bin.positions\ |
112e0 | 6e 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 | nx.=.np.arange(n,.dtype=np.float |
11300 | 36 34 29 5c 6e 5c 6e 6c 73 74 5f 6d 20 3d 20 6e 70 2e 6c 69 6e 73 70 61 63 65 28 32 30 2c 20 39 | 64)\n\nlst_m.=.np.linspace(20,.9 |
11320 | 30 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 | 0,.n_target)\n\n#.Gaussian.distr |
11340 | 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 61 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 | ibutions\na.=.gauss(n,.m=20,.s=5 |
11360 | 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 5c 6e 5c 6e 42 20 3d 20 6e 70 2e 7a | )..#.m=.mean,.s=.std\n\nB.=.np.z |
11380 | 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 29 29 5c 6e 5c 6e 66 6f 72 20 69 2c 20 6d 20 | eros((n,.n_target))\n\nfor.i,.m. |
113a0 | 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 6c 73 74 5f 6d 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 42 5b 3a 2c 20 69 | in.enumerate(lst_m):\n....B[:,.i |
113c0 | 5d 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 6d 2c 20 73 3d 35 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 | ].=.gauss(n,.m=m,.s=5)\n\n#.loss |
113e0 | 20 6d 61 74 72 69 78 20 61 6e 64 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 4d 20 3d 20 6f | .matrix.and.normalization\nM.=.o |
11400 | 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 | t.dist(x.reshape((n,.1)),.x.resh |
11420 | 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 | ape((n,.1)),.'euclidean')\nM./=. |
11440 | 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 | M.max()\nM2.=.ot.dist(x.reshape( |
11460 | 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 27 73 71 65 | (n,.1)),.x.reshape((n,.1)),.'sqe |
11480 | 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 23 25 25 20 | uclidean')\nM2./=.M2.max()\n#%%. |
114a0 | 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 | plot.the.distributions\n\npl.fig |
114c0 | 75 72 65 28 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e | ure(1)\npl.subplot(2,.1,.1)\npl. |
114e0 | 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 61 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 | plot(x,.a,.'b',.label='Source.di |
11500 | 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 | stribution')\npl.title('Source.d |
11520 | 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 | istribution')\npl.subplot(2,.1,. |
11540 | 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 42 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 | 2)\npl.plot(x,.B,.label='Target. |
11560 | 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 | distributions')\npl.title('Targe |
11580 | 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f | t.distributions')\npl.tight_layo |
115a0 | 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 61 6e 64 20 70 6c 6f 74 20 64 69 73 | ut()\n\n#%%.Compute.and.plot.dis |
115c0 | 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 61 6e 64 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 5c 6e 64 5f | tributions.and.loss.matrix\n\nd_ |
115e0 | 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 29 20 20 23 20 64 69 72 65 63 74 | emd.=.ot.emd2(a,.B,.M)..#.direct |
11600 | 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 45 4d 44 5c 6e 64 5f 65 6d 64 32 20 3d 20 6f 74 | .computation.of.EMD\nd_emd2.=.ot |
11620 | 2e 65 6d 64 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 32 29 20 20 23 20 64 69 72 65 63 74 20 63 6f 6d 70 75 74 | .emd2(a,.B,.M2)..#.direct.comput |
11640 | 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 6c 6f 73 73 20 4d 33 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 | ation.of.EMD.with.loss.M3\n\n\np |
11660 | 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 6d 64 2c 20 6c 61 62 65 | l.figure(2)\npl.plot(d_emd,.labe |
11680 | 6c 3d 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 6d | l='Euclidean.EMD')\npl.plot(d_em |
116a0 | 64 32 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 | d2,.label='Squared.Euclidean.EMD |
116c0 | 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 4d 44 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 5c 6e 70 | ')\npl.title('EMD.distances')\np |
116e0 | 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 32 5c 6e 64 | l.legend()\n\n#%%\nreg.=.1e-2\nd |
11700 | 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d | _sinkhorn.=.ot.sinkhorn2(a,.B,.M |
11720 | 2c 20 72 65 67 29 5c 6e 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 | ,.reg)\nd_sinkhorn2.=.ot.sinkhor |
11740 | 6e 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 32 2c 20 72 65 67 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 | n2(a,.B,.M2,.reg)\n\npl.figure(2 |
11760 | 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 6d 64 2c 20 6c 61 62 65 | )\npl.clf()\npl.plot(d_emd,.labe |
11780 | 6c 3d 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 6d | l='Euclidean.EMD')\npl.plot(d_em |
117a0 | 64 32 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 | d2,.label='Squared.Euclidean.EMD |
117c0 | 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 | ')\npl.plot(d_sinkhorn,.'+',.lab |
117e0 | 65 6c 3d 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f | el='Euclidean.Sinkhorn')\npl.plo |
11800 | 74 28 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 2c 20 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 71 75 61 72 | t(d_sinkhorn2,.'+',.label='Squar |
11820 | 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c | ed.Euclidean.Sinkhorn')\npl.titl |
11840 | 65 28 27 45 4d 44 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c | e('EMD.distances')\npl.legend()\ |
11860 | 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f | n\npl.show()".......],........"o |
11880 | 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 | utputs":.[],........"metadata":. |
118a0 | 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 | {........."collapsed":.false.... |
118c0 | 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b | ...}.....}...],...."metadata":.{ |
118e0 | 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 | ....."kernelspec":.{......."disp |
11900 | 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e | lay_name":."Python.2",........"n |
11920 | 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 | ame":."python2",........"languag |
11940 | 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 | e":."python".....},......"langua |
11960 | 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 | ge_info":.{......."mimetype":."t |
11980 | 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 | ext/x-python",........"nbconvert |
119a0 | 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 | _exporter":."python",........"na |
119c0 | 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 | me":."python",........"file_exte |
119e0 | 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a | nsion":.".py",........"version": |
11a00 | 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 | ."2.7.12",........"pygments_lexe |
11a20 | 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 | r":."ipython2",........"codemirr |
11a40 | 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 | or_mode":.{........."version":.2 |
11a60 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 | ,.........."name":."ipython".... |
11a80 | 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 6a 7b 82 49 cd 14 | ...}.....}...}.}PK........j{.I.. |
11aa0 | 1c 01 46 09 00 00 46 09 00 00 23 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 64 65 6d 6f | ..F...F...#...auto_examples/demo |
11ac0 | 5f 4f 54 5f 31 44 5f 74 65 73 74 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d | _OT_1D_test.ipynb{..."nbformat_m |
11ae0 | 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 | inor":.0,...."nbformat":.4,...." |
11b00 | 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e | cells":.[.....{......."execution |
11b20 | 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 | _count":.null,........"cell_type |
11b40 | 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 | ":."code",........"source":.[... |
11b60 | 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 | ......"%matplotlib.inline"...... |
11b80 | 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | .],........"outputs":.[],....... |
11ba0 | 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 | ."metadata":.{........."collapse |
11bc0 | 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a | d":.false.......}.....},......{. |
11be0 | 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 44 65 6d | ......"source":.[........."\nDem |
11c00 | 6f 20 66 6f 72 20 31 44 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 5c 6e 40 61 | o.for.1D.optimal.transport\n\n@a |
11c20 | 75 74 68 6f 72 3a 20 72 66 6c 61 6d 61 72 79 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 | uthor:.rflamary\n\n".......],... |
11c40 | 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 | ....."cell_type":."markdown",... |
11c60 | 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 | ....."metadata":.{}.....},...... |
11c80 | 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c | {......."execution_count":.null, |
11ca0 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 | ........"cell_type":."code",.... |
11cc0 | 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 69 6d 70 6f 72 74 20 | ...."source":.[........."import. |
11ce0 | 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 | numpy.as.np\nimport.matplotlib.p |
11d00 | 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6f 74 2e 64 | ylab.as.pl\nimport.ot\nfrom.ot.d |
11d20 | 61 74 61 73 65 74 73 20 69 6d 70 6f 72 74 20 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 20 61 73 20 67 | atasets.import.get_1D_gauss.as.g |
11d40 | 61 75 73 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 3d 31 30 | auss\n\n\n#%%.parameters\n\nn=10 |
11d60 | 30 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e 73 5c 6e 5c 6e 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 5c 6e | 0.#.nb.bins\n\n#.bin.positions\n |
11d80 | 78 3d 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c | x=np.arange(n,dtype=np.float64)\ |
11da0 | 6e 5c 6e 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 61 3d 67 | n\n#.Gaussian.distributions\na=g |
11dc0 | 61 75 73 73 28 6e 2c 6d 3d 6e 2a 2e 32 2c 73 3d 35 29 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d | auss(n,m=n*.2,s=5).#.m=.mean,.s= |
11de0 | 20 73 74 64 5c 6e 62 3d 67 61 75 73 73 28 6e 2c 6d 3d 6e 2a 2e 36 2c 73 3d 31 30 29 5c 6e 5c 6e | .std\nb=gauss(n,m=n*.6,s=10)\n\n |
11e00 | 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 3d 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 | #.loss.matrix\nM=ot.dist(x.resha |
11e20 | 70 65 28 28 6e 2c 31 29 29 2c 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 31 29 29 29 5c 6e 4d 2f 3d | pe((n,1)),x.reshape((n,1)))\nM/= |
11e40 | 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 | M.max()\n\n#%%.plot.the.distribu |
11e60 | 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 | tions\n\npl.figure(1)\npl.plot(x |
11e80 | 2c 61 2c 27 62 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f | ,a,'b',label='Source.distributio |
11ea0 | 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 62 2c 27 72 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 | n')\npl.plot(x,b,'r',label='Targ |
11ec0 | 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e | et.distribution')\npl.legend()\n |
11ee0 | 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 61 6e 64 20 6c 6f 73 | \n#%%.plot.distributions.and.los |
11f00 | 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f | s.matrix\n\npl.figure(2)\not.plo |
11f20 | 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 62 2c 4d 2c 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 | t.plot1D_mat(a,b,M,'Cost.matrix. |
11f40 | 4d 27 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e 5c 6e 47 30 3d 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 62 2c | M')\n\n#%%.EMD\n\nG0=ot.emd(a,b, |
11f60 | 4d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 | M)\n\npl.figure(3)\not.plot.plot |
11f80 | 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 62 2c 47 30 2c 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 30 27 29 5c 6e 5c | 1D_mat(a,b,G0,'OT.matrix.G0')\n\ |
11fa0 | 6e 23 25 25 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 5c 6e 6c 61 6d 62 64 3d 31 65 2d 33 5c 6e 47 73 3d | n#%%.Sinkhorn\n\nlambd=1e-3\nGs= |
11fc0 | 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c 62 2c 4d 2c 6c 61 6d 62 64 2c 76 65 72 62 6f 73 65 3d | ot.sinkhorn(a,b,M,lambd,verbose= |
11fe0 | 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 | True)\n\npl.figure(4)\not.plot.p |
12000 | 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 62 2c 47 73 2c 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b | lot1D_mat(a,b,Gs,'OT.matrix.Sink |
12020 | 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 5c 6e 6c 61 6d 62 64 3d | horn')\n\n#%%.Sinkhorn\n\nlambd= |
12040 | 31 65 2d 34 5c 6e 47 73 73 2c 6c 6f 67 3d 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 | 1e-4\nGss,log=ot.bregman.sinkhor |
12060 | 6e 5f 73 74 61 62 69 6c 69 7a 65 64 28 61 2c 62 2c 4d 2c 6c 61 6d 62 64 2c 76 65 72 62 6f 73 65 | n_stabilized(a,b,M,lambd,verbose |
12080 | 3d 54 72 75 65 2c 6c 6f 67 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 47 73 73 32 2c 6c 6f 67 32 3d 6f 74 2e 62 72 | =True,log=True)\nGss2,log2=ot.br |
120a0 | 65 67 6d 61 6e 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 74 61 62 69 6c 69 7a 65 64 28 61 2c 62 2c 4d 2c | egman.sinkhorn_stabilized(a,b,M, |
120c0 | 6c 61 6d 62 64 2c 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 2c 6c 6f 67 3d 54 72 75 65 2c 77 61 72 6d | lambd,verbose=True,log=True,warm |
120e0 | 73 74 61 72 74 3d 6c 6f 67 5b 27 77 61 72 6d 73 74 61 72 74 27 5d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 | start=log['warmstart'])\n\npl.fi |
12100 | 67 75 72 65 28 35 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 62 2c | gure(5)\not.plot.plot1D_mat(a,b, |
12120 | 47 73 73 2c 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 73 74 61 62 69 6c 69 7a | Gss,'OT.matrix.Sinkhorn.stabiliz |
12140 | 65 64 27 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 5c 6e 6c 61 6d 62 64 3d 31 65 | ed')\n\n#%%.Sinkhorn\n\nlambd=1e |
12160 | 2d 31 31 5c 6e 47 73 73 3d 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 65 70 73 | -11\nGss=ot.bregman.sinkhorn_eps |
12180 | 69 6c 6f 6e 5f 73 63 61 6c 69 6e 67 28 61 2c 62 2c 4d 2c 6c 61 6d 62 64 2c 76 65 72 62 6f 73 65 | ilon_scaling(a,b,M,lambd,verbose |
121a0 | 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e | =True)\n\npl.figure(5)\not.plot. |
121c0 | 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 62 2c 47 73 73 2c 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 | plot1D_mat(a,b,Gss,'OT.matrix.Si |
121e0 | 6e 6b 68 6f 72 6e 20 73 74 61 62 69 6c 69 7a 65 64 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 | nkhorn.stabilized')".......],... |
12200 | 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | ....."outputs":.[],........"meta |
12220 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 | data":.{........."collapsed":.fa |
12240 | 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 | lse.......}.....}...],...."metad |
12260 | 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 | ata":.{....."kernelspec":.{..... |
12280 | 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 | .."display_name":."Python.2",... |
122a0 | 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ....."name":."python2",........" |
122c0 | 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 | language":."python".....},...... |
122e0 | 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 | "language_info":.{......."mimety |
12300 | 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 | pe":."text/x-python",........"nb |
12320 | 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 | convert_exporter":."python",.... |
12340 | 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 | ...."name":."python",........"fi |
12360 | 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 | le_extension":.".py",........"ve |
12380 | 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e | rsion":."2.7.12",........"pygmen |
123a0 | 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 | ts_lexer":."ipython2",........"c |
123c0 | 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 | odemirror_mode":.{........."vers |
123e0 | 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 | ion":.2,.........."name":."ipyth |
12400 | 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 | on".......}.....}...}.}PK....... |
12420 | 00 86 7b 82 49 4f 22 f2 c8 74 0e 00 00 74 0e 00 00 2a 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c | ..{.IO"..t...t...*...auto_exampl |
12440 | 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 7b | es/plot_OTDA_color_images.ipynb{ |
12460 | 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f | ..."nbformat_minor":.0,...."nbfo |
12480 | 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 | rmat":.4,...."cells":.[.....{... |
124a0 | 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 | ...."execution_count":.null,.... |
124c0 | 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | ...."cell_type":."code",........ |
124e0 | 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 | "source":.[........."%matplotlib |
12500 | 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 | .inline".......],........"output |
12520 | 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 | s":.[],........"metadata":.{.... |
12540 | 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a | ....."collapsed":.false.......}. |
12560 | 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a | ....},......{......."source":.[. |
12580 | 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ........"\n===================== |
125a0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
125c0 | 3d 3d 3d 5c 6e 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 77 69 | ===\nOT.for.domain.adaptation.wi |
125e0 | 74 68 20 69 6d 61 67 65 20 63 6f 6c 6f 72 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 5b 36 5d 5c 6e 3d | th.image.color.adaptation.[6]\n= |
12600 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
12620 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 5c 6e 5b 36 5d 20 46 | =======================\n\n[6].F |
12640 | 65 72 72 61 64 61 6e 73 2c 20 53 2e 2c 20 50 61 70 61 64 61 6b 69 73 2c 20 4e 2e 2c 20 50 65 79 | erradans,.S.,.Papadakis,.N.,.Pey |
12660 | 72 65 2c 20 47 2e 2c 20 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 4a 2e 20 46 2e 20 28 32 30 31 34 29 2e 20 52 | re,.G.,.&.Aujol,.J..F..(2014)..R |
12680 | 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e | egularized.discrete.optimal.tran |
126a0 | 73 70 6f 72 74 2e 20 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c 20 6f 6e 20 49 6d 61 67 69 6e 67 20 53 | sport..SIAM.Journal.on.Imaging.S |
126c0 | 63 69 65 6e 63 65 73 2c 20 37 28 33 29 2c 20 31 38 35 33 2d 31 38 38 32 2e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 | ciences,.7(3),.1853-1882.\n\n".. |
126e0 | 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 | .....],........"cell_type":."mar |
12700 | 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 | kdown",........"metadata":.{}... |
12720 | 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 | ..},......{......."execution_cou |
12740 | 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 | nt":.null,........"cell_type":." |
12760 | 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 | code",........"source":.[....... |
12780 | 20 20 22 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 73 63 | .."import.numpy.as.np\nimport.sc |
127a0 | 69 70 79 2e 6e 64 69 6d 61 67 65 20 61 73 20 73 70 69 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c | ipy.ndimage.as.spi\nimport.matpl |
127c0 | 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 5c 6e | otlib.pylab.as.pl\nimport.ot\n\n |
127e0 | 5c 6e 23 25 25 20 4c 6f 61 64 69 6e 67 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 5c 6e 49 31 3d 73 70 69 2e 69 | \n#%%.Loading.images\n\nI1=spi.i |
12800 | 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 64 61 79 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 | mread('../data/ocean_day.jpg').a |
12820 | 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 2f 32 35 36 5c 6e 49 32 3d 73 70 69 2e 69 6d | stype(np.float64)/256\nI2=spi.im |
12840 | 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 73 75 6e 73 65 74 2e 6a 70 67 27 29 | read('../data/ocean_sunset.jpg') |
12860 | 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 2f 32 35 36 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 50 | .astype(np.float64)/256\n\n#%%.P |
12880 | 6c 6f 74 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | lot.images\n\npl.figure(1)\n\npl |
128a0 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 32 2c 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e | .subplot(1,2,1)\npl.imshow(I1)\n |
128c0 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | pl.title('Image.1')\n\npl.subplo |
128e0 | 74 28 31 2c 32 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c | t(1,2,2)\npl.imshow(I2)\npl.titl |
12900 | 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 | e('Image.2')\n\npl.show()\n\n#%% |
12920 | 20 49 6d 61 67 65 20 63 6f 6e 76 65 72 73 69 6f 6e 20 61 6e 64 20 64 61 74 61 73 65 74 20 67 65 | .Image.conversion.and.dataset.ge |
12940 | 6e 65 72 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 | neration\n\ndef.im2mat(I):\n.... |
12960 | 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 61 6e 64 20 69 6d 61 67 65 20 74 6f 20 6d 61 74 72 | \"\"\"Converts.and.image.to.matr |
12980 | 69 78 20 28 6f 6e 65 20 70 69 78 65 6c 20 70 65 72 20 6c 69 6e 65 29 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 | ix.(one.pixel.per.line)\"\"\"\n. |
129a0 | 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 49 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 49 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2a | ...return.I.reshape((I.shape[0]* |
129c0 | 49 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 49 2e 73 68 61 70 65 5b 32 5d 29 29 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 6d | I.shape[1],I.shape[2]))\n\ndef.m |
129e0 | 61 74 32 69 6d 28 58 2c 73 68 61 70 65 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e 76 65 | at2im(X,shape):\n....\"\"\"Conve |
12a00 | 72 74 73 20 62 61 63 6b 20 61 20 6d 61 74 72 69 78 20 74 6f 20 61 6e 20 69 6d 61 67 65 5c 22 5c | rts.back.a.matrix.to.an.image\"\ |
12a20 | 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 58 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 73 68 61 70 65 29 | "\"\n....return.X.reshape(shape) |
12a40 | 5c 6e 5c 6e 58 31 3d 69 6d 32 6d 61 74 28 49 31 29 5c 6e 58 32 3d 69 6d 32 6d 61 74 28 49 32 29 | \n\nX1=im2mat(I1)\nX2=im2mat(I2) |
12a60 | 5c 6e 5c 6e 23 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 6e 62 3d 31 30 30 30 5c | \n\n#.training.samples\nnb=1000\ |
12a80 | 6e 69 64 78 31 3d 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 31 2e 73 68 61 70 65 | nidx1=np.random.randint(X1.shape |
12aa0 | 5b 30 5d 2c 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 5c 6e 69 64 78 32 3d 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e | [0],size=(nb,))\nidx2=np.random. |
12ac0 | 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 32 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 5c | randint(X2.shape[0],size=(nb,))\ |
12ae0 | 6e 5c 6e 78 73 3d 58 31 5b 69 64 78 31 2c 3a 5d 5c 6e 78 74 3d 58 32 5b 69 64 78 32 2c 3a 5d 5c | n\nxs=X1[idx1,:]\nxt=X2[idx2,:]\ |
12b00 | 6e 5c 6e 23 25 25 20 50 6c 6f 74 20 69 6d 61 67 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c | n\n#%%.Plot.image.distributions\ |
12b20 | 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 28 31 30 2c 35 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 | n\n\npl.figure(2,(10,5))\n\npl.s |
12b40 | 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 32 2c 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 5b 3a 2c 30 | ubplot(1,2,1)\npl.scatter(xs[:,0 |
12b60 | 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 32 5d 2c 63 3d 78 73 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 31 2c 30 2c | ],xs[:,2],c=xs)\npl.axis([0,1,0, |
12b80 | 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c | 1])\npl.xlabel('Red')\npl.ylabel |
12ba0 | 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c | ('Blue')\npl.title('Image.1')\n\ |
12bc0 | 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 32 2c 32 29 5c 6e 23 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 | npl.subplot(1,2,2)\n#pl.imshow(I |
12be0 | 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 32 5d 2c 63 | 2)\npl.scatter(xt[:,0],xt[:,2],c |
12c00 | 3d 78 74 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 31 2c 30 2c 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 | =xt)\npl.axis([0,1,0,1])\npl.xla |
12c20 | 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 | bel('Red')\npl.ylabel('Blue')\np |
12c40 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 5c | l.title('Image.2')\n\npl.show()\ |
12c60 | 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 62 65 74 | n\n\n\n#%%.domain.adaptation.bet |
12c80 | 77 65 65 6e 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 5c 6e 23 20 4c 50 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 5c 6e 64 61 5f | ween.images\n\n#.LP.problem\nda_ |
12ca0 | 65 6d 64 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 28 29 20 20 20 20 20 23 20 69 6e 69 74 20 63 6c 61 73 | emd=ot.da.OTDA().....#.init.clas |
12cc0 | 73 5c 6e 64 61 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 74 29 20 20 20 20 20 20 20 23 20 66 69 74 | s\nda_emd.fit(xs,xt).......#.fit |
12ce0 | 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 72 | .distributions\n\n\n#.sinkhorn.r |
12d00 | 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 6c 61 6d 62 64 3d 31 65 2d 31 5c 6e 64 61 5f 65 6e | egularization\nlambd=1e-1\nda_en |
12d20 | 74 72 6f 70 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 29 5c 6e 64 61 5f 65 | trop=ot.da.OTDA_sinkhorn()\nda_e |
12d40 | 6e 74 72 6f 70 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 74 2c 72 65 67 3d 6c 61 6d 62 64 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e | ntrop.fit(xs,xt,reg=lambd)\n\n\n |
12d60 | 5c 6e 23 25 25 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 69 6d 61 67 65 73 20 | \n#%%.prediction.between.images. |
12d80 | 28 75 73 69 6e 67 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 61 6d 70 6c 65 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e 20 | (using.out.of.sample.prediction. |
12da0 | 61 73 20 69 6e 20 5b 36 5d 29 5c 6e 5c 6e 58 31 74 3d 64 61 5f 65 6d 64 2e 70 72 65 64 69 63 74 | as.in.[6])\n\nX1t=da_emd.predict |
12dc0 | 28 58 31 29 5c 6e 58 32 74 3d 64 61 5f 65 6d 64 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 58 32 2c 2d 31 29 5c | (X1)\nX2t=da_emd.predict(X2,-1)\ |
12de0 | 6e 5c 6e 5c 6e 58 31 74 65 3d 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 58 31 29 5c | n\n\nX1te=da_entrop.predict(X1)\ |
12e00 | 6e 58 32 74 65 3d 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 58 32 2c 2d 31 29 5c 6e | nX2te=da_entrop.predict(X2,-1)\n |
12e20 | 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e | \n\ndef.minmax(I):\n....return.n |
12e40 | 70 2e 6d 69 6e 69 6d 75 6d 28 6e 70 2e 6d 61 78 69 6d 75 6d 28 49 2c 30 29 2c 31 29 5c 6e 5c 6e | p.minimum(np.maximum(I,0),1)\n\n |
12e60 | 49 31 74 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 2c 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 | I1t=minmax(mat2im(X1t,I1.shape)) |
12e80 | 5c 6e 49 32 74 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 32 74 2c 49 32 2e 73 68 61 70 65 | \nI2t=minmax(mat2im(X2t,I2.shape |
12ea0 | 29 29 5c 6e 5c 6e 49 31 74 65 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 65 2c 49 31 | ))\n\nI1te=minmax(mat2im(X1te,I1 |
12ec0 | 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 49 32 74 65 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 32 74 | .shape))\nI2te=minmax(mat2im(X2t |
12ee0 | 65 2c 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 61 6c 6c 20 69 6d 61 | e,I2.shape))\n\n#%%.plot.all.ima |
12f00 | 67 65 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 28 31 30 2c 38 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | ges\n\npl.figure(2,(10,8))\n\npl |
12f20 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 31 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 | .subplot(2,3,1)\n\npl.imshow(I1) |
12f40 | 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 | \npl.title('Image.1')\n\npl.subp |
12f60 | 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 29 5c 6e 70 6c 2e 74 | lot(2,3,2)\npl.imshow(I1t)\npl.t |
12f80 | 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 | itle('Image.1.Adapt')\n\n\npl.su |
12fa0 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 65 29 5c 6e 70 | bplot(2,3,3)\npl.imshow(I1te)\np |
12fc0 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 5c 6e | l.title('Image.1.Adapt.(reg)')\n |
12fe0 | 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 34 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 | \npl.subplot(2,3,4)\n\npl.imshow |
13000 | 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e | (I2)\npl.title('Image.2')\n\npl. |
13020 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 35 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 29 5c 6e | subplot(2,3,5)\npl.imshow(I2t)\n |
13040 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 | pl.title('Image.2.Adapt')\n\n\np |
13060 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 36 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 65 | l.subplot(2,3,6)\npl.imshow(I2te |
13080 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 | )\npl.title('Image.2.Adapt.(reg) |
130a0 | 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | ')\n\npl.show()".......],....... |
130c0 | 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 | ."outputs":.[],........"metadata |
130e0 | 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a | ":.{........."collapsed":.false. |
13100 | 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 | ......}.....}...],...."metadata" |
13120 | 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 | :.{....."kernelspec":.{......."d |
13140 | 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | isplay_name":."Python.2",....... |
13160 | 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 | ."name":."python2",........"lang |
13180 | 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e | uage":."python".....},......"lan |
131a0 | 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a | guage_info":.{......."mimetype": |
131c0 | 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 | ."text/x-python",........"nbconv |
131e0 | 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | ert_exporter":."python",........ |
13200 | 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 | "name":."python",........"file_e |
13220 | 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f | xtension":.".py",........"versio |
13240 | 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c | n":."2.7.12",........"pygments_l |
13260 | 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d | exer":."ipython2",........"codem |
13280 | 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 | irror_mode":.{........."version" |
132a0 | 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a | :.2,.........."name":."ipython". |
132c0 | 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 d7 7b 82 | ......}.....}...}.}PK.........{. |
132e0 | 49 c4 9e 28 9b ea 11 00 00 ea 11 00 00 32 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 | I..(.........2...auto_examples/p |
13300 | 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 | lot_OTDA_mapping_color_images.ip |
13320 | 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 | ynb{..."nbformat_minor":.0,...." |
13340 | 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 | nbformat":.4,...."cells":.[..... |
13360 | 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c | {......."execution_count":.null, |
13380 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 | ........"cell_type":."code",.... |
133a0 | 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f | ...."source":.[........."%matplo |
133c0 | 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 | tlib.inline".......],........"ou |
133e0 | 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b | tputs":.[],........"metadata":.{ |
13400 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 | ........."collapsed":.false..... |
13420 | 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 | ..}.....},......{......."source" |
13440 | 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | :.[........."\n================= |
13460 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
13480 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
134a0 | 3d 3d 3d 5c 6e 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 77 69 | ===\nOT.for.domain.adaptation.wi |
134c0 | 74 68 20 69 6d 61 67 65 20 63 6f 6c 6f 72 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 5b 36 5d 20 77 69 | th.image.color.adaptation.[6].wi |
134e0 | 74 68 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 5b 38 5d 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d | th.mapping.estimation.[8]\n===== |
13500 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
13520 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
13540 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 5c 6e 5b 36 5d 20 46 65 72 72 61 64 61 6e 73 | ===============\n\n[6].Ferradans |
13560 | 2c 20 53 2e 2c 20 50 61 70 61 64 61 6b 69 73 2c 20 4e 2e 2c 20 50 65 79 72 65 2c 20 47 2e 2c 20 | ,.S.,.Papadakis,.N.,.Peyre,.G.,. |
13580 | 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 4a 2e 20 46 2e 20 28 32 30 31 34 29 2e 20 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a | &.Aujol,.J..F..(2014)..Regulariz |
135a0 | 65 64 5c 6e 20 20 20 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f | ed\n....discrete.optimal.transpo |
135c0 | 72 74 2e 20 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c 20 6f 6e 20 49 6d 61 67 69 6e 67 20 53 63 69 65 | rt..SIAM.Journal.on.Imaging.Scie |
135e0 | 6e 63 65 73 2c 20 37 28 33 29 2c 20 31 38 35 33 2d 31 38 38 32 2e 5c 6e 5b 38 5d 20 4d 2e 20 50 | nces,.7(3),.1853-1882.\n[8].M..P |
13600 | 65 72 72 6f 74 2c 20 4e 2e 20 43 6f 75 72 74 79 2c 20 52 2e 20 46 6c 61 6d 61 72 79 2c 20 41 2e | errot,.N..Courty,.R..Flamary,.A. |
13620 | 20 48 61 62 72 61 72 64 2c 20 5c 22 4d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 | .Habrard,.\"Mapping.estimation.f |
13640 | 6f 72 5c 6e 20 20 20 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f | or\n....discrete.optimal.transpo |
13660 | 72 74 5c 22 2c 20 4e 65 75 72 61 6c 20 49 6e 66 6f 72 6d 61 74 69 6f 6e 20 50 72 6f 63 65 73 73 | rt\",.Neural.Information.Process |
13680 | 69 6e 67 20 53 79 73 74 65 6d 73 20 28 4e 49 50 53 29 2c 20 32 30 31 36 2e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 | ing.Systems.(NIPS),.2016.\n\n\n" |
136a0 | 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d | .......],........"cell_type":."m |
136c0 | 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a | arkdown",........"metadata":.{}. |
136e0 | 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 | ....},......{......."execution_c |
13700 | 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a | ount":.null,........"cell_type": |
13720 | 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 | ."code",........"source":.[..... |
13740 | 20 20 20 20 22 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 | ...."import.numpy.as.np\nimport. |
13760 | 73 63 69 70 79 2e 6e 64 69 6d 61 67 65 20 61 73 20 73 70 69 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 | scipy.ndimage.as.spi\nimport.mat |
13780 | 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e | plotlib.pylab.as.pl\nimport.ot\n |
137a0 | 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 4c 6f 61 64 69 6e 67 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 5c 6e 49 31 3d 73 70 69 | \n\n#%%.Loading.images\n\nI1=spi |
137c0 | 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 64 61 79 2e 6a 70 67 27 29 | .imread('../data/ocean_day.jpg') |
137e0 | 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 2f 32 35 36 5c 6e 49 32 3d 73 70 69 2e | .astype(np.float64)/256\nI2=spi. |
13800 | 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 73 75 6e 73 65 74 2e 6a 70 67 | imread('../data/ocean_sunset.jpg |
13820 | 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 2f 32 35 36 5c 6e 5c 6e 23 25 25 | ').astype(np.float64)/256\n\n#%% |
13840 | 20 50 6c 6f 74 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 5c 6e 5c 6e | .Plot.images\n\npl.figure(1)\n\n |
13860 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 32 2c 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 | pl.subplot(1,2,1)\npl.imshow(I1) |
13880 | 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 | \npl.title('Image.1')\n\npl.subp |
138a0 | 6c 6f 74 28 31 2c 32 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 | lot(1,2,2)\npl.imshow(I2)\npl.ti |
138c0 | 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 5c 6e 5c 6e 23 | tle('Image.2')\n\npl.show()\n\n# |
138e0 | 25 25 20 49 6d 61 67 65 20 63 6f 6e 76 65 72 73 69 6f 6e 20 61 6e 64 20 64 61 74 61 73 65 74 20 | %%.Image.conversion.and.dataset. |
13900 | 67 65 6e 65 72 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 29 3a 5c 6e 20 20 | generation\n\ndef.im2mat(I):\n.. |
13920 | 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 61 6e 64 20 69 6d 61 67 65 20 74 6f 20 6d 61 | ..\"\"\"Converts.and.image.to.ma |
13940 | 74 72 69 78 20 28 6f 6e 65 20 70 69 78 65 6c 20 70 65 72 20 6c 69 6e 65 29 5c 22 5c 22 5c 22 5c | trix.(one.pixel.per.line)\"\"\"\ |
13960 | 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 49 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 49 2e 73 68 61 70 65 5b 30 | n....return.I.reshape((I.shape[0 |
13980 | 5d 2a 49 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 49 2e 73 68 61 70 65 5b 32 5d 29 29 5c 6e 5c 6e 64 65 66 | ]*I.shape[1],I.shape[2]))\n\ndef |
139a0 | 20 6d 61 74 32 69 6d 28 58 2c 73 68 61 70 65 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e | .mat2im(X,shape):\n....\"\"\"Con |
139c0 | 76 65 72 74 73 20 62 61 63 6b 20 61 20 6d 61 74 72 69 78 20 74 6f 20 61 6e 20 69 6d 61 67 65 5c | verts.back.a.matrix.to.an.image\ |
139e0 | 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 58 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 73 68 61 70 | "\"\"\n....return.X.reshape(shap |
13a00 | 65 29 5c 6e 5c 6e 58 31 3d 69 6d 32 6d 61 74 28 49 31 29 5c 6e 58 32 3d 69 6d 32 6d 61 74 28 49 | e)\n\nX1=im2mat(I1)\nX2=im2mat(I |
13a20 | 32 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 6e 62 3d 31 30 30 | 2)\n\n#.training.samples\nnb=100 |
13a40 | 30 5c 6e 69 64 78 31 3d 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 31 2e 73 68 61 | 0\nidx1=np.random.randint(X1.sha |
13a60 | 70 65 5b 30 5d 2c 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 5c 6e 69 64 78 32 3d 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f | pe[0],size=(nb,))\nidx2=np.rando |
13a80 | 6d 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 32 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 | m.randint(X2.shape[0],size=(nb,) |
13aa0 | 29 5c 6e 5c 6e 78 73 3d 58 31 5b 69 64 78 31 2c 3a 5d 5c 6e 78 74 3d 58 32 5b 69 64 78 32 2c 3a | )\n\nxs=X1[idx1,:]\nxt=X2[idx2,: |
13ac0 | 5d 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 50 6c 6f 74 20 69 6d 61 67 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e | ]\n\n#%%.Plot.image.distribution |
13ae0 | 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 28 31 30 2c 35 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | s\n\n\npl.figure(2,(10,5))\n\npl |
13b00 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 32 2c 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 5b 3a | .subplot(1,2,1)\npl.scatter(xs[: |
13b20 | 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 32 5d 2c 63 3d 78 73 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 31 2c | ,0],xs[:,2],c=xs)\npl.axis([0,1, |
13b40 | 30 2c 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 | 0,1])\npl.xlabel('Red')\npl.ylab |
13b60 | 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c | el('Blue')\npl.title('Image.1')\ |
13b80 | 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 32 2c 32 29 5c 6e 23 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 | n\npl.subplot(1,2,2)\n#pl.imshow |
13ba0 | 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 32 5d | (I2)\npl.scatter(xt[:,0],xt[:,2] |
13bc0 | 2c 63 3d 78 74 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 31 2c 30 2c 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 | ,c=xt)\npl.axis([0,1,0,1])\npl.x |
13be0 | 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c | label('Red')\npl.ylabel('Blue')\ |
13c00 | 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 | npl.title('Image.2')\n\npl.show( |
13c20 | 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 62 | )\n\n\n\n#%%.domain.adaptation.b |
13c40 | 65 74 77 65 65 6e 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 64 65 66 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 49 29 3a 5c 6e 20 | etween.images\ndef.minmax(I):\n. |
13c60 | 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 6d 69 6e 69 6d 75 6d 28 6e 70 2e 6d 61 78 69 6d 75 6d 28 | ...return.np.minimum(np.maximum( |
13c80 | 49 2c 30 29 2c 31 29 5c 6e 23 20 4c 50 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 5c 6e 64 61 5f 65 6d 64 3d 6f 74 | I,0),1)\n#.LP.problem\nda_emd=ot |
13ca0 | 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 28 29 20 20 20 20 20 23 20 69 6e 69 74 20 63 6c 61 73 73 5c 6e 64 61 5f | .da.OTDA().....#.init.class\nda_ |
13cc0 | 65 6d 64 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 74 29 20 20 20 20 20 20 20 23 20 66 69 74 20 64 69 73 74 72 | emd.fit(xs,xt).......#.fit.distr |
13ce0 | 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 58 31 74 3d 64 61 5f 65 6d 64 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 58 | ibutions\n\nX1t=da_emd.predict(X |
13d00 | 31 29 20 20 23 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 61 6d 70 6c 65 5c 6e 49 31 74 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 | 1)..#.out.of.sample\nI1t=minmax( |
13d20 | 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 2c 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 5c 6e 23 20 73 69 6e 6b 68 | mat2im(X1t,I1.shape))\n\n#.sinkh |
13d40 | 6f 72 6e 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 6c 61 6d 62 64 3d 31 65 2d 31 5c 6e | orn.regularization\nlambd=1e-1\n |
13d60 | 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 29 5c | da_entrop=ot.da.OTDA_sinkhorn()\ |
13d80 | 6e 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 74 2c 72 65 67 3d 6c 61 6d 62 64 29 5c | nda_entrop.fit(xs,xt,reg=lambd)\ |
13da0 | 6e 5c 6e 58 31 74 65 3d 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 58 31 29 5c 6e 49 | n\nX1te=da_entrop.predict(X1)\nI |
13dc0 | 31 74 65 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 65 2c 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 | 1te=minmax(mat2im(X1te,I1.shape) |
13de0 | 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e | )\n\n#.linear.mapping.estimation |
13e00 | 5c 6e 65 74 61 3d 31 65 2d 38 20 20 20 23 20 71 75 61 64 72 61 74 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 | \neta=1e-8...#.quadratic.regular |
13e20 | 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 72 65 67 72 65 73 73 69 6f 6e 5c 6e 6d 75 3d 31 65 30 20 20 | ization.for.regression\nmu=1e0.. |
13e40 | 20 20 20 23 20 77 65 69 67 68 74 20 6f 66 20 74 68 65 20 4f 54 20 6c 69 6e 65 61 72 20 74 65 72 | ...#.weight.of.the.OT.linear.ter |
13e60 | 6d 5c 6e 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 20 20 23 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 20 61 20 62 69 61 73 5c | m\nbias=True..#.estimate.a.bias\ |
13e80 | 6e 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 | n\not_mapping=ot.da.OTDA_mapping |
13ea0 | 5f 6c 69 6e 65 61 72 28 29 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 74 2c | _linear()\not_mapping.fit(xs,xt, |
13ec0 | 6d 75 3d 6d 75 2c 65 74 61 3d 65 74 61 2c 62 69 61 73 3d 62 69 61 73 2c 6e 75 6d 49 74 65 72 6d | mu=mu,eta=eta,bias=bias,numIterm |
13ee0 | 61 78 20 3d 20 32 30 2c 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 58 31 74 6c 3d 6f 74 | ax.=.20,verbose=True)\n\nX1tl=ot |
13f00 | 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 58 31 29 20 23 20 75 73 65 20 74 68 65 20 65 | _mapping.predict(X1).#.use.the.e |
13f20 | 73 74 69 6d 61 74 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 49 31 74 6c 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 | stimated.mapping\nI1tl=minmax(ma |
13f40 | 74 32 69 6d 28 58 31 74 6c 2c 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6e 6f 6e 6c 69 6e | t2im(X1tl,I1.shape))\n\n#.nonlin |
13f60 | 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 5c 6e 65 74 61 3d 31 65 2d 32 | ear.mapping.estimation\neta=1e-2 |
13f80 | 20 20 20 23 20 71 75 61 64 72 61 74 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 66 6f | ...#.quadratic.regularization.fo |
13fa0 | 72 20 72 65 67 72 65 73 73 69 6f 6e 5c 6e 6d 75 3d 31 65 30 20 20 20 20 20 23 20 77 65 69 67 68 | r.regression\nmu=1e0.....#.weigh |
13fc0 | 74 20 6f 66 20 74 68 65 20 4f 54 20 6c 69 6e 65 61 72 20 74 65 72 6d 5c 6e 62 69 61 73 3d 46 61 | t.of.the.OT.linear.term\nbias=Fa |
13fe0 | 6c 73 65 20 20 23 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 20 61 20 62 69 61 73 5c 6e 73 69 67 6d 61 3d 31 20 | lse..#.estimate.a.bias\nsigma=1. |
14000 | 20 20 20 23 20 73 69 67 6d 61 20 62 61 6e 64 77 69 64 74 68 20 66 6f 74 20 67 61 75 73 73 69 61 | ...#.sigma.bandwidth.fot.gaussia |
14020 | 6e 20 6b 65 72 6e 65 6c 5c 6e 5c 6e 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 6c 3d | n.kernel\n\n\not_mapping_kernel= |
14040 | 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 6c 28 29 5c 6e 6f 74 5f | ot.da.OTDA_mapping_kernel()\not_ |
14060 | 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 6c 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 74 2c 6d 75 3d 6d 75 2c 65 | mapping_kernel.fit(xs,xt,mu=mu,e |
14080 | 74 61 3d 65 74 61 2c 73 69 67 6d 61 3d 73 69 67 6d 61 2c 62 69 61 73 3d 62 69 61 73 2c 6e 75 6d | ta=eta,sigma=sigma,bias=bias,num |
140a0 | 49 74 65 72 6d 61 78 20 3d 20 31 30 2c 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 58 31 | Itermax.=.10,verbose=True)\n\nX1 |
140c0 | 74 6e 3d 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 6c 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 58 31 29 | tn=ot_mapping_kernel.predict(X1) |
140e0 | 20 23 20 75 73 65 20 74 68 65 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 49 31 | .#.use.the.estimated.mapping\nI1 |
14100 | 74 6e 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 6e 2c 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 | tn=minmax(mat2im(X1tn,I1.shape)) |
14120 | 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 | \n#%%.plot.images\n\n\npl.figure |
14140 | 28 32 2c 28 31 30 2c 38 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 31 29 5c | (2,(10,8))\n\npl.subplot(2,3,1)\ |
14160 | 6e 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 | n\npl.imshow(I1)\npl.title('Im.. |
14180 | 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 32 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 69 | 1')\n\npl.subplot(2,3,2)\n\npl.i |
141a0 | 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 32 27 29 5c 6e 5c 6e | mshow(I2)\npl.title('Im..2')\n\n |
141c0 | 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 | \npl.subplot(2,3,3)\npl.imshow(I |
141e0 | 31 74 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 20 49 6e 74 65 72 70 20 4c 50 27 29 | 1t)\npl.title('Im..1.Interp.LP') |
14200 | 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 | \n\npl.subplot(2,3,4)\npl.imshow |
14220 | 28 49 31 74 65 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 20 49 6e 74 65 72 70 20 45 | (I1te)\npl.title('Im..1.Interp.E |
14240 | 6e 74 72 6f 70 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 35 29 5c 6e | ntrop')\n\n\npl.subplot(2,3,5)\n |
14260 | 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 6c 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 | pl.imshow(I1tl)\npl.title('Im..1 |
14280 | 20 4c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | .Linear.mapping')\n\npl.subplot( |
142a0 | 32 2c 33 2c 36 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 6e 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c | 2,3,6)\npl.imshow(I1tn)\npl.titl |
142c0 | 65 28 27 49 6d 2e 20 31 20 6e 6f 6e 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 5c 6e | e('Im..1.nonlinear.mapping')\n\n |
142e0 | 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 | pl.show()".......],........"outp |
14300 | 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 | uts":.[],........"metadata":.{.. |
14320 | 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 | ......."collapsed":.false....... |
14340 | 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 | }.....}...],...."metadata":.{... |
14360 | 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 | .."kernelspec":.{......."display |
14380 | 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 | _name":."Python.2",........"name |
143a0 | 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a | ":."python2",........"language": |
143c0 | 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f | ."python".....},......"language_ |
143e0 | 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 | info":.{......."mimetype":."text |
14400 | 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 | /x-python",........"nbconvert_ex |
14420 | 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 | porter":."python",........"name" |
14440 | 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 | :."python",........"file_extensi |
14460 | 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 | on":.".py",........"version":."2 |
14480 | 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a | .7.12",........"pygments_lexer": |
144a0 | 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f | ."ipython2",........"codemirror_ |
144c0 | 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a | mode":.{........."version":.2,.. |
144e0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 | ........"name":."ipython"....... |
14500 | 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 34 87 1e 4b ea e0 aa 32 e7 | }.....}...}.}PK........4..K...2. |
14520 | 17 00 00 e7 17 00 00 2a 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 | .......*...auto_examples/plot_ot |
14540 | 64 61 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d | da_color_images.ipynb{..."nbform |
14560 | 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 | at_minor":.0,...."nbformat":.4,. |
14580 | 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 | ..."cells":.[.....{......."execu |
145a0 | 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f | tion_count":.null,........"cell_ |
145c0 | 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 | type":."code",........"source":. |
145e0 | 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 | [........."%matplotlib.inline".. |
14600 | 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 | .....],........"outputs":.[],... |
14620 | 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c | ....."metadata":.{........."coll |
14640 | 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 | apsed":.false.......}.....},.... |
14660 | 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c | ..{......."source":.[........."\ |
14680 | 6e 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | n=============================== |
146a0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 4f 54 20 66 6f | =========================\nOT.fo |
146c0 | 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 69 6d 61 67 65 20 63 | r.domain.adaptation.with.image.c |
146e0 | 6f 6c 6f 72 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 5b 36 5d 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | olor.adaptation.[6]\n=========== |
14700 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
14720 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 5c 6e 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 70 72 | =============\n\nThis.example.pr |
14740 | 65 73 65 6e 74 73 20 61 20 77 61 79 20 6f 66 20 74 72 61 6e 73 66 65 72 72 69 6e 67 20 63 6f 6c | esents.a.way.of.transferring.col |
14760 | 6f 72 73 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 74 77 6f 20 69 6d 61 67 65 5c 6e 77 69 74 68 20 4f 70 74 69 | ors.between.two.image\nwith.Opti |
14780 | 6d 61 6c 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 73 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 64 20 69 6e 20 5b | mal.Transport.as.introduced.in.[ |
147a0 | 36 5d 5c 6e 5c 6e 5b 36 5d 20 46 65 72 72 61 64 61 6e 73 2c 20 53 2e 2c 20 50 61 70 61 64 61 6b | 6]\n\n[6].Ferradans,.S.,.Papadak |
147c0 | 69 73 2c 20 4e 2e 2c 20 50 65 79 72 65 2c 20 47 2e 2c 20 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 4a 2e 20 46 | is,.N.,.Peyre,.G.,.&.Aujol,.J..F |
147e0 | 2e 20 28 32 30 31 34 29 2e 5c 6e 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 | ..(2014).\nRegularized.discrete. |
14800 | 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 2e 5c 6e 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c | optimal.transport.\nSIAM.Journal |
14820 | 20 6f 6e 20 49 6d 61 67 69 6e 67 20 53 63 69 65 6e 63 65 73 2c 20 37 28 33 29 2c 20 31 38 35 33 | .on.Imaging.Sciences,.7(3),.1853 |
14840 | 2d 31 38 38 32 2e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c | -1882.\n\n".......],........"cel |
14860 | 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 | l_type":."markdown",........"met |
14880 | 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 | adata":.{}.....},......{......." |
148a0 | 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | execution_count":.null,........" |
148c0 | 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 | cell_type":."code",........"sour |
148e0 | 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 | ce":.[........."#.Authors:.Remi. |
14900 | 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c | Flamary.<remi.flamary@unice.fr>\ |
14920 | 6e 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 | n#..........Stanislas.Chambon.<s |
14940 | 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 | tan.chambon@gmail.com>\n#\n#.Lic |
14960 | 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 | ense:.MIT.License\n\nimport.nump |
14980 | 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 66 72 6f 6d 20 73 63 69 70 79 20 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 64 69 6d 61 | y.as.np\nfrom.scipy.import.ndima |
149a0 | 67 65 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 | ge\nimport.matplotlib.pylab.as.p |
149c0 | 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 5c 6e 5c 6e 72 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e | l\nimport.ot\n\n\nr.=.np.random. |
149e0 | 52 61 6e 64 6f 6d 53 74 61 74 65 28 34 32 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 69 6d 32 6d 61 74 28 | RandomState(42)\n\n\ndef.im2mat( |
14a00 | 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 61 6e 64 20 69 6d 61 67 | I):\n....\"\"\"Converts.and.imag |
14a20 | 65 20 74 6f 20 6d 61 74 72 69 78 20 28 6f 6e 65 20 70 69 78 65 6c 20 70 65 72 20 6c 69 6e 65 29 | e.to.matrix.(one.pixel.per.line) |
14a40 | 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 49 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 49 2e | \"\"\"\n....return.I.reshape((I. |
14a60 | 73 68 61 70 65 5b 30 5d 20 2a 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 32 | shape[0].*.I.shape[1],.I.shape[2 |
14a80 | 5d 29 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 6d 61 74 32 69 6d 28 58 2c 20 73 68 61 70 65 29 3a 5c 6e | ]))\n\n\ndef.mat2im(X,.shape):\n |
14aa0 | 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 62 61 63 6b 20 61 20 6d 61 74 72 69 78 | ....\"\"\"Converts.back.a.matrix |
14ac0 | 20 74 6f 20 61 6e 20 69 6d 61 67 65 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 58 | .to.an.image\"\"\"\n....return.X |
14ae0 | 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 73 68 61 70 65 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 | .reshape(shape)\n\n\ndef.minmax( |
14b00 | 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 63 6c 69 70 28 49 2c 20 30 2c 20 31 29 | I):\n....return.np.clip(I,.0,.1) |
14b20 | 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c | ".......],........"outputs":.[], |
14b40 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 | ........"metadata":.{........."c |
14b60 | 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 | ollapsed":.false.......}.....},. |
14b80 | 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 | .....{......."source":.[........ |
14ba0 | 20 22 67 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ."generate.data\n############### |
14bc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
14be0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e | ##############################\n |
14c00 | 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a | \n".......],........"cell_type": |
14c20 | 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 | ."markdown",........"metadata":. |
14c40 | 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f | {}.....},......{......."executio |
14c60 | 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 | n_count":.null,........"cell_typ |
14c80 | 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 | e":."code",........"source":.[.. |
14ca0 | 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 4c 6f 61 64 69 6e 67 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 49 31 20 3d 20 6e | ......."#.Loading.images\nI1.=.n |
14cc0 | 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 64 61 79 | dimage.imread('../data/ocean_day |
14ce0 | 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 5c | .jpg').astype(np.float64)./.256\ |
14d00 | 6e 49 32 20 3d 20 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 | nI2.=.ndimage.imread('../data/oc |
14d20 | 65 61 6e 5f 73 75 6e 73 65 74 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 | ean_sunset.jpg').astype(np.float |
14d40 | 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 5c 6e 5c 6e 58 31 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 31 29 5c 6e 58 32 | 64)./.256\n\nX1.=.im2mat(I1)\nX2 |
14d60 | 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 32 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 6d 70 | .=.im2mat(I2)\n\n#.training.samp |
14d80 | 6c 65 73 5c 6e 6e 62 20 3d 20 31 30 30 30 5c 6e 69 64 78 31 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 | les\nnb.=.1000\nidx1.=.r.randint |
14da0 | 28 58 31 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 5c 6e 69 64 78 32 20 | (X1.shape[0],.size=(nb,))\nidx2. |
14dc0 | 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 32 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e | =.r.randint(X2.shape[0],.size=(n |
14de0 | 62 2c 29 29 5c 6e 5c 6e 58 73 20 3d 20 58 31 5b 69 64 78 31 2c 20 3a 5d 5c 6e 58 74 20 3d 20 58 | b,))\n\nXs.=.X1[idx1,.:]\nXt.=.X |
14e00 | 32 5b 69 64 78 32 2c 20 3a 5d 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 | 2[idx2,.:]".......],........"out |
14e20 | 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a | puts":.[],........"metadata":.{. |
14e40 | 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 | ........"collapsed":.false...... |
14e60 | 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a | .}.....},......{......."source": |
14e80 | 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 68 65 20 64 69 66 66 | .[........."Instantiate.the.diff |
14ea0 | 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 73 20 61 6e 64 20 66 | erent.transport.algorithms.and.f |
14ec0 | 69 74 20 74 68 65 6d 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | it.them\n####################### |
14ee0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
14f00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 | ######################\n\n"..... |
14f20 | 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f | ..],........"cell_type":."markdo |
14f40 | 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d | wn",........"metadata":.{}.....} |
14f60 | 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 | ,......{......."execution_count" |
14f80 | 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 | :.null,........"cell_type":."cod |
14fa0 | 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 | e",........"source":.[........." |
14fc0 | 23 20 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 | #.EMDTransport\not_emd.=.ot.da.E |
14fe0 | 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c | MDTransport()\not_emd.fit(Xs=Xs, |
15000 | 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e | .Xt=Xt)\n\n#.SinkhornTransport\n |
15020 | 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e | ot_sinkhorn.=.ot.da.SinkhornTran |
15040 | 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 | sport(reg_e=1e-1)\not_sinkhorn.f |
15060 | 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e | it(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n#.prediction |
15080 | 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 69 6d 61 67 65 73 20 28 75 73 69 6e 67 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 61 | .between.images.(using.out.of.sa |
150a0 | 6d 70 6c 65 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e 20 61 73 20 69 6e 20 5b 36 5d 29 5c 6e 74 72 61 6e | mple.prediction.as.in.[6])\ntran |
150c0 | 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d | sp_Xs_emd.=.ot_emd.transform(Xs= |
150e0 | 58 31 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 69 6e 76 65 | X1)\ntransp_Xt_emd.=.ot_emd.inve |
15100 | 72 73 65 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 74 3d 58 32 29 5c 6e 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 | rse_transform(Xt=X2)\n\ntransp_X |
15120 | 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 | s_sinkhorn.=.ot_emd.transform(Xs |
15140 | 3d 58 31 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d | =X1)\ntransp_Xt_sinkhorn.=.ot_em |
15160 | 64 2e 69 6e 76 65 72 73 65 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 74 3d 58 32 29 5c 6e 5c 6e 49 31 | d.inverse_transform(Xt=X2)\n\nI1 |
15180 | 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 2c | t.=.minmax(mat2im(transp_Xs_emd, |
151a0 | 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 49 32 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d | .I1.shape))\nI2t.=.minmax(mat2im |
151c0 | 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 65 6d 64 2c 20 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 5c 6e 49 31 | (transp_Xt_emd,.I2.shape))\n\nI1 |
151e0 | 74 65 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e | te.=.minmax(mat2im(transp_Xs_sin |
15200 | 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 49 32 74 65 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 | khorn,.I1.shape))\nI2te.=.minmax |
15220 | 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 32 2e 73 | (mat2im(transp_Xt_sinkhorn,.I2.s |
15240 | 68 61 70 65 29 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 | hape))".......],........"outputs |
15260 | 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 | ":.[],........"metadata":.{..... |
15280 | 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 | ...."collapsed":.false.......}.. |
152a0 | 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 | ...},......{......."source":.[.. |
152c0 | 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 6f 74 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 69 6d 61 67 65 5c 6e 23 23 23 | ......."plot.original.image\n### |
152e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
15300 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
15320 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | ##########\n\n".......],........ |
15340 | 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | "cell_type":."markdown",........ |
15360 | 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 | "metadata":.{}.....},......{.... |
15380 | 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 | ..."execution_count":.null,..... |
153a0 | 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ..."cell_type":."code",........" |
153c0 | 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c | source":.[........."pl.figure(1, |
153e0 | 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | .figsize=(6.4,.3))\n\npl.subplot |
15400 | 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 | (1,.2,.1)\npl.imshow(I1)\npl.axi |
15420 | 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c | s('off')\npl.title('Image.1')\n\ |
15440 | 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 | npl.subplot(1,.2,.2)\npl.imshow( |
15460 | 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 | I2)\npl.axis('off')\npl.title('I |
15480 | 6d 61 67 65 20 32 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 | mage.2')".......],........"outpu |
154a0 | 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 | ts":.[],........"metadata":.{... |
154c0 | 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d | ......"collapsed":.false.......} |
154e0 | 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b | .....},......{......."source":.[ |
15500 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 73 63 61 74 74 65 72 20 70 6c 6f 74 20 6f 66 20 63 6f 6c 6f 72 73 | ........."scatter.plot.of.colors |
15520 | 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | \n############################## |
15540 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
15560 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 | ###############\n\n".......],... |
15580 | 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 | ....."cell_type":."markdown",... |
155a0 | 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 | ....."metadata":.{}.....},...... |
155c0 | 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c | {......."execution_count":.null, |
155e0 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 | ........"cell_type":."code",.... |
15600 | 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 | ...."source":.[........."pl.figu |
15620 | 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 | re(2,.figsize=(6.4,.3))\n\npl.su |
15640 | 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c | bplot(1,.2,.1)\npl.scatter(Xs[:, |
15660 | 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 73 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 | .0],.Xs[:,.2],.c=Xs)\npl.axis([0 |
15680 | 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 | ,.1,.0,.1])\npl.xlabel('Red')\np |
156a0 | 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 | l.ylabel('Blue')\npl.title('Imag |
156c0 | 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c | e.1')\n\npl.subplot(1,.2,.2)\npl |
156e0 | 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 | .scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.2],.c=X |
15700 | 74 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c | t)\npl.axis([0,.1,.0,.1])\npl.xl |
15720 | 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e | abel('Red')\npl.ylabel('Blue')\n |
15740 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 | pl.title('Image.2')\npl.tight_la |
15760 | 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 | yout()".......],........"outputs |
15780 | 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 | ":.[],........"metadata":.{..... |
157a0 | 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 | ...."collapsed":.false.......}.. |
157c0 | 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 | ...},......{......."source":.[.. |
157e0 | 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 6f 74 20 6e 65 77 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 | ......."plot.new.images\n####### |
15800 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
15820 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
15840 | 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c | ######\n\n".......],........"cel |
15860 | 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 | l_type":."markdown",........"met |
15880 | 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 | adata":.{}.....},......{......." |
158a0 | 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | execution_count":.null,........" |
158c0 | 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 | cell_type":."code",........"sour |
158e0 | 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 | ce":.[........."pl.figure(3,.fig |
15900 | 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c | size=(8,.4))\n\npl.subplot(2,.3, |
15920 | 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 | .1)\npl.imshow(I1)\npl.axis('off |
15940 | 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 | ')\npl.title('Image.1')\n\npl.su |
15960 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 29 5c 6e | bplot(2,.3,.2)\npl.imshow(I1t)\n |
15980 | 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 | pl.axis('off')\npl.title('Image. |
159a0 | 31 20 41 64 61 70 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 | 1.Adapt')\n\npl.subplot(2,.3,.3) |
159c0 | 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 65 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 | \npl.imshow(I1te)\npl.axis('off' |
159e0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 | )\npl.title('Image.1.Adapt.(reg) |
15a00 | 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d | ')\n\npl.subplot(2,.3,.4)\npl.im |
15a20 | 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 | show(I2)\npl.axis('off')\npl.tit |
15a40 | 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 | le('Image.2')\n\npl.subplot(2,.3 |
15a60 | 2c 20 35 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f | ,.5)\npl.imshow(I2t)\npl.axis('o |
15a80 | 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 27 29 5c | ff')\npl.title('Image.2.Adapt')\ |
15aa0 | 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f | n\npl.subplot(2,.3,.6)\npl.imsho |
15ac0 | 77 28 49 32 74 65 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c | w(I2te)\npl.axis('off')\npl.titl |
15ae0 | 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 | e('Image.2.Adapt.(reg)')\npl.tig |
15b00 | 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 | ht_layout()\n\npl.show()"....... |
15b20 | 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | ],........"outputs":.[],........ |
15b40 | 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 | "metadata":.{........."collapsed |
15b60 | 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 | ":.false.......}.....}...],...." |
15b80 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b | metadata":.{....."kernelspec":.{ |
15ba0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 | ......."display_name":."Python.2 |
15bc0 | 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 | ",........"name":."python2",.... |
15be0 | 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 | ...."language":."python".....},. |
15c00 | 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d | ....."language_info":.{......."m |
15c20 | 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 | imetype":."text/x-python",...... |
15c40 | 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 | .."nbconvert_exporter":."python" |
15c60 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 | ,........"name":."python",...... |
15c80 | 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 | .."file_extension":.".py",...... |
15ca0 | 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 | .."version":."2.7.12",........"p |
15cc0 | 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 | ygments_lexer":."ipython2",..... |
15ce0 | 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 | ..."codemirror_mode":.{......... |
15d00 | 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 | "version":.2,.........."name":." |
15d20 | 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 01 02 | ipython".......}.....}...}.}PK.. |
15d40 | 14 03 14 00 00 00 00 00 02 84 1e 4b 5d 81 39 dd bc 0c 00 00 bc 0c 00 00 1c 00 00 00 00 00 00 00 | ...........K].9................. |
15d60 | 00 00 00 00 b4 81 00 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 57 44 41 | ..........auto_examples/plot_WDA |
15d80 | 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 87 7b 82 49 fa 8c 13 06 e2 10 00 00 e2 10 | .ipynbPK...........{.I.......... |
15da0 | 00 00 25 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 f6 0c 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 | ..%.................auto_example |
15dc0 | 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 | s/plot_OTDA_mapping.ipynbPK..... |
15de0 | 00 00 00 00 00 2e 89 1e 4b b5 f1 d1 9b 8c 11 00 00 8c 11 00 00 24 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 | ........K............$.......... |
15e00 | 00 b4 81 1b 1e 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 70 74 69 6d 5f | .......auto_examples/plot_optim_ |
15e20 | 4f 54 72 65 67 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 76 7b 82 49 50 0d 0a 74 03 | OTreg.ipynbPK..........v{.IP..t. |
15e40 | 0e 00 00 03 0e 00 00 25 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 e9 2f 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 | .......%............../..auto_ex |
15e60 | 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 63 6c 61 73 73 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b | amples/plot_OTDA_classes.ipynbPK |
15e80 | 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 b7 86 1e 4b 6b 88 21 84 aa 1d 00 00 aa 1d 00 00 20 00 00 00 00 00 | .............Kk.!............... |
15ea0 | 00 00 00 00 00 00 b4 81 2f 3e 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f | ......../>..auto_examples/plot_o |
15ec0 | 74 64 61 5f 64 32 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 f8 88 1e 4b be 57 96 68 | tda_d2.ipynbPK.............K.W.h |
15ee0 | 4b 0e 00 00 4b 0e 00 00 1e 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 17 5c 00 00 61 75 74 6f 5f 65 | K...K..................\..auto_e |
15f00 | 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 | xamples/plot_OT_1D.ipynbPK...... |
15f20 | 00 00 00 00 32 82 e3 4a 48 a2 ab 22 f5 14 00 00 f5 14 00 00 20 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 | ....2..JH..".................... |
15f40 | b4 81 9e 6a 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 63 6f 6e 76 | ...j..auto_examples/plot_OT_conv |
15f60 | 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 0f 83 1e 4b 06 87 a7 1b 68 0f 00 00 68 0f | .ipynbPK.............K....h...h. |
15f80 | 00 00 26 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 d1 7f 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 | ..&.................auto_example |
15fa0 | 73 2f 70 6c 6f 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 31 44 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 | s/plot_barycenter_1D.ipynbPK.... |
15fc0 | 14 00 00 00 00 00 9c 86 1e 4b f2 bc 11 4b 08 19 00 00 08 19 00 00 25 00 00 00 00 00 00 00 00 00 | .........K...K........%......... |
15fe0 | 00 00 b4 81 7d 8f 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f | ....}...auto_examples/plot_otda_ |
16000 | 63 6c 61 73 73 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 0d 88 1e 4b c8 39 53 | classes.ipynbPK.............K.9S |
16020 | c8 df 19 00 00 df 19 00 00 33 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 c8 a8 00 00 61 75 74 6f 5f | .........3.................auto_ |
16040 | 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 63 6f 6c 6f 72 | examples/plot_otda_mapping_color |
16060 | 73 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 6a 7b 82 49 bb fd | s_images.ipynbPK..........j{.I.. |
16080 | 13 71 39 0a 00 00 39 0a 00 00 2b 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 f8 c2 00 00 61 75 74 6f | .q9...9...+.................auto |
160a0 | 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 64 65 6d 6f 5f 4f 54 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 6c 61 72 67 | _examples/demo_OT_2D_sampleslarg |
160c0 | 65 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 f6 83 1e 4b 31 52 a0 2f b3 0f 00 00 b3 | e.ipynbPK.............K1R./..... |
160e0 | 0f 00 00 24 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 7a cd 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c | ...$.............z...auto_exampl |
16100 | 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 4c 31 5f 76 73 5f 4c 32 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 | es/plot_OT_L1_vs_L2.ipynbPK..... |
16120 | 00 00 00 00 00 a7 85 1e 4b 1c bf a6 e3 bf 0a 00 00 bf 0a 00 00 26 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 | ........K............&.......... |
16140 | 00 b4 81 6f dd 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 32 44 5f | ...o...auto_examples/plot_OT_2D_ |
16160 | 73 61 6d 70 6c 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 75 7b 82 49 55 d4 67 | samples.ipynbPK..........u{.IU.g |
16180 | d2 3c 0e 00 00 3c 0e 00 00 20 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 72 e8 00 00 61 75 74 6f 5f | .<...<.................r...auto_ |
161a0 | 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 32 44 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 | examples/plot_OTDA_2D.ipynbPK... |
161c0 | 03 14 00 00 00 00 00 b8 86 1e 4b 22 97 a9 c7 5d 18 00 00 5d 18 00 00 25 00 00 00 00 00 00 00 00 | ..........K"...]...]...%........ |
161e0 | 00 00 00 b4 81 ec f6 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 | .........auto_examples/plot_otda |
16200 | 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 02 84 1e 4b ee 1f | _mapping.ipynbPK.............K.. |
16220 | 11 06 c2 0a 00 00 c2 0a 00 00 24 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 8c 0f 01 00 61 75 74 6f | ..........$.................auto |
16240 | 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6d 70 75 74 65 5f 65 6d 64 2e 69 70 79 6e 62 | _examples/plot_compute_emd.ipynb |
16260 | 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 6a 7b 82 49 cd 14 1c 01 46 09 00 00 46 09 00 00 23 00 00 00 | PK..........j{.I....F...F...#... |
16280 | 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 90 1a 01 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 64 65 6d 6f | ..............auto_examples/demo |
162a0 | 5f 4f 54 5f 31 44 5f 74 65 73 74 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 86 7b 82 | _OT_1D_test.ipynbPK...........{. |
162c0 | 49 4f 22 f2 c8 74 0e 00 00 74 0e 00 00 2a 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 17 24 01 00 61 | IO"..t...t...*..............$..a |
162e0 | 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 | uto_examples/plot_OTDA_color_ima |
16300 | 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 d7 7b 82 49 c4 9e 28 9b ea 11 00 | ges.ipynbPK...........{.I..(.... |
16320 | 00 ea 11 00 00 32 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 d3 32 01 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d | .....2..............2..auto_exam |
16340 | 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 | ples/plot_OTDA_mapping_color_ima |
16360 | 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 34 87 1e 4b ea e0 aa 32 e7 17 00 | ges.ipynbPK..........4..K...2... |
16380 | 00 e7 17 00 00 2a 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 0d 45 01 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d | .....*..............E..auto_exam |
163a0 | 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e | ples/plot_otda_color_images.ipyn |
163c0 | 62 50 4b 05 06 00 00 00 00 14 00 14 00 85 06 00 00 3c 5d 01 00 00 00 | bPK..............<].... |