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10a0 | 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 47 72 6f 6d 6f 76 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 | \npl.title('Gromov.Wasserstein') |
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2ac0 | 20 6f 66 20 74 68 65 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 0a | .of.the.algorithm\n\n".......],. |
2ae0 | 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 0a 20 20 | ......"cell_type":."markdown"... |
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3420 | 6e 20 72 61 6e 67 65 28 38 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 73 68 61 70 | n.range(8):\n............if.shap |
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34c0 | 20 20 20 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 32 5d 29 2c 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 | ....np.array(xs[2]),.np.array(xs |
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3840 | 5b 70 73 5b 30 5d 2c 20 70 73 5b 31 5d 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | [ps[0],.ps[1]\n................. |
3860 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c | ...........................],.p, |
3880 | 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 20 23 20 | .lambdast[i],.'square_loss',..#. |
38a0 | 35 65 2d 34 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | 5e-4,\n......................... |
38c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 | ..................max_iter=100,. |
38e0 | 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 5c 6e 5c 6e 43 74 30 32 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 | tol=1e-3)\n\nCt02.=.[0.for.i.in. |
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3920 | 20 20 20 43 74 30 32 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 | ...Ct02[i].=.ot.gromov.gromov_ba |
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3980 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b 30 5d 2c 20 70 73 5b 32 5d 5c 6e | .................[ps[0],.ps[2]\n |
39a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
39c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 | ............],.p,.lambdast[i],.' |
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3a00 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
3a20 | 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 5c 6e 5c 6e 43 74 | ...max_iter=100,.tol=1e-3)\n\nCt |
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65c0 | 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 | _sinkhorn.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n# |
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6680 | 6f 72 74 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6f 6e 74 6f 20 74 61 72 67 65 74 20 73 | ort.source.samples.onto.target.s |
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66c0 | 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 | ransform(Xs=Xs)\ntransp_Xs_sinkh |
66e0 | 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 | orn.=.ot_sinkhorn.transform(Xs=X |
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6820 | 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d | ".......],......."cell_type":."m |
6840 | 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 | arkdown".....},.....{......."exe |
6860 | 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | cution_count":.null,......."meta |
6880 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 | data":.{........."collapsed":.fa |
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68e0 | 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 31 30 29 29 5c 6e 70 6c 2e | figure(1,.figsize=(10,.10))\npl. |
6900 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b | subplot(2,.2,.1)\npl.scatter(Xs[ |
6920 | 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b | :,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+ |
6940 | 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 | ',.label='Source.samples')\npl.x |
6960 | 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 | ticks([])\npl.yticks([])\npl.leg |
6980 | 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 | end(loc=0)\npl.title('Source..sa |
69a0 | 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e | mples')\n\npl.subplot(2,.2,.2)\n |
69c0 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 | pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c |
69e0 | 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 | =yt,.marker='o',.label='Target.s |
6a00 | 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 | amples')\npl.xticks([])\npl.ytic |
6a20 | 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 | ks([])\npl.legend(loc=0)\npl.tit |
6a40 | 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | le('Target.samples')\n\npl.subpl |
6a60 | 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 | ot(2,.2,.3)\npl.imshow(M,.interp |
6a80 | 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | olation='nearest')\npl.xticks([] |
6aa0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 74 72 | )\npl.yticks([])\npl.title('Matr |
6ac0 | 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 | ix.of.pairwise.distances')\npl.t |
6ae0 | 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 | ight_layout()".......],......."c |
6b00 | 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 | ell_type":."code".....},.....{.. |
6b20 | 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 | ....."metadata":.{},......."sour |
6b40 | 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 6f 70 | ce":.[........."Fig.2.:.plots.op |
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6b80 | 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | t.methods\n--------------------- |
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6bc0 | 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 | ----\n\n".......],......."cell_t |
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6c00 | 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 | ...."execution_count":.null,.... |
6c20 | 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 | ..."metadata":.{........."collap |
6c40 | 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 | sed":.false.......},......."outp |
6c60 | 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 | uts":.[],......."source":.[..... |
6c80 | 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 36 | ...."pl.figure(2,.figsize=(10,.6 |
6ca0 | 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d | ))\n\npl.subplot(2,.3,.1)\npl.im |
6cc0 | 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 | show(ot_emd.coupling_,.interpola |
6ce0 | 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e | tion='nearest')\npl.xticks([])\n |
6d00 | 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c | pl.yticks([])\npl.title('Optimal |
6d20 | 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | .coupling\\nEMDTransport')\n\npl |
6d40 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f | .subplot(2,.3,.2)\npl.imshow(ot_ |
6d60 | 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f | sinkhorn.coupling_,.interpolatio |
6d80 | 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e | n='nearest')\npl.xticks([])\npl. |
6da0 | 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f | yticks([])\npl.title('Optimal.co |
6dc0 | 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e | upling\\nSinkhornTransport')\n\n |
6de0 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f | pl.subplot(2,.3,.3)\npl.imshow(o |
6e00 | 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d | t_lpl1.coupling_,.interpolation= |
6e20 | 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 | 'nearest')\npl.xticks([])\npl.yt |
6e40 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 | icks([])\npl.title('Optimal.coup |
6e60 | 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e | ling\\nSinkhornLpl1Transport')\n |
6e80 | 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 | \npl.subplot(2,.3,.4)\not.plot.p |
6ea0 | 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 65 6d 64 | lot2D_samples_mat(Xs,.Xt,.ot_emd |
6ec0 | 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 | .coupling_,.c=[.5,..5,.1])\npl.s |
6ee0 | 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c | catter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys, |
6f00 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c | .marker='+',.label='Source.sampl |
6f20 | 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c | es')\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:, |
6f40 | 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 | .1],.c=yt,.marker='o',.label='Ta |
6f60 | 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 | rget.samples')\npl.xticks([])\np |
6f80 | 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 | l.yticks([])\npl.title('Main.cou |
6fa0 | 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 | pling.coefficients\\nEMDTranspor |
6fc0 | 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e 6f 74 2e 70 | t')\n\npl.subplot(2,.3,.5)\not.p |
6fe0 | 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f | lot.plot2D_samples_mat(Xs,.Xt,.o |
7000 | 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c | t_sinkhorn.coupling_,.c=[.5,..5, |
7020 | 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c | .1])\npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:, |
7040 | 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f | .1],.c=ys,.marker='+',.label='So |
7060 | 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c | urce.samples')\npl.scatter(Xt[:, |
7080 | 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c | .0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o', |
70a0 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 | .label='Target.samples')\npl.xti |
70c0 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | cks([])\npl.yticks([])\npl.title |
70e0 | 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 53 | ('Main.coupling.coefficients\\nS |
7100 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | inkhornTransport')\n\npl.subplot |
7120 | 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 | (2,.3,.6)\not.plot.plot2D_sample |
7140 | 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c | s_mat(Xs,.Xt,.ot_lpl1.coupling_, |
7160 | 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a | .c=[.5,..5,.1])\npl.scatter(Xs[: |
7180 | 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 | ,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+' |
71a0 | 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 | ,.label='Source.samples')\npl.sc |
71c0 | 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 | atter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,. |
71e0 | 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 | marker='o',.label='Target.sample |
7200 | 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | s')\npl.xticks([])\npl.yticks([] |
7220 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 | )\npl.title('Main.coupling.coeff |
7240 | 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 | icients\\nSinkhornLpl1Transport' |
7260 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 0a 20 | )\npl.tight_layout()".......],.. |
7280 | 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a | ....."cell_type":."code".....},. |
72a0 | 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 | ....{......."metadata":.{},..... |
72c0 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 33 20 3a 20 70 | .."source":.[........."Fig.3.:.p |
72e0 | 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | lot.transported.samples\n------- |
7300 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 | -------------------------\n\n".. |
7320 | 20 20 20 20 20 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b | .....],......."cell_type":."mark |
7340 | 64 6f 77 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 | down".....},.....{......."execut |
7360 | 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 | ion_count":.null,......."metadat |
7380 | 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 | a":.{........."collapsed":.false |
73a0 | 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 | .......},......."outputs":.[],.. |
73c0 | 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 64 69 73 70 | ....."source":.[........."#.disp |
73e0 | 6c 61 79 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 | lay.transported.samples\npl.figu |
7400 | 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 34 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | re(4,.figsize=(10,.4))\npl.subpl |
7420 | 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d | ot(1,.3,.1)\npl.scatter(Xt[:,.0] |
7440 | 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 | ,.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',\n. |
7460 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 | ..........label='Target.samples' |
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8580 | 5c 6e 23 20 66 69 6c 6c 65 64 20 77 69 74 68 20 2d 31 2e 5c 6e 5c 6e 23 20 57 61 72 6e 69 6e 67 | \n#.filled.with.-1.\n\n#.Warning |
85a0 | 3a 20 77 65 20 72 65 63 61 6c 6c 20 74 68 61 74 20 2d 31 20 63 61 6e 6e 6f 74 20 62 65 20 75 73 | :.we.recall.that.-1.cannot.be.us |
85c0 | 65 64 20 61 73 20 61 20 63 6c 61 73 73 20 6c 61 62 65 6c 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 | ed.as.a.class.label".......],... |
85e0 | 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | ....."outputs":.[],........"meta |
8600 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 | data":.{........."collapsed":.fa |
8620 | 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | lse.......}.....},......{....... |
8640 | 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f | "source":.[........."Fig.1.:.plo |
8660 | 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 2b 20 6d | ts.source.and.target.samples.+.m |
8680 | 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 5c 6e 2d 2d 2d 2d | atrix.of.pairwise.distance\n---- |
86a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
86c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
86e0 | 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 | -\n\n".......],........"cell_typ |
8700 | 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 | e":."markdown",........"metadata |
8720 | 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 | ":.{}.....},......{......."execu |
8740 | 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f | tion_count":.null,........"cell_ |
8760 | 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 | type":."code",........"source":. |
8780 | 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d | [........."pl.figure(1,.figsize= |
87a0 | 28 31 30 2c 20 31 30 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e | (10,.10))\npl.subplot(2,.2,.1)\n |
87c0 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 | pl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c |
87e0 | 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 | =ys,.marker='+',.label='Source.s |
8800 | 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 | amples')\npl.xticks([])\npl.ytic |
8820 | 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 | ks([])\npl.legend(loc=0)\npl.tit |
8840 | 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 | le('Source..samples')\n\npl.subp |
8860 | 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 | lot(2,.2,.2)\npl.scatter(Xt[:,.0 |
8880 | 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c | ],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',.l |
88a0 | 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b | abel='Target.samples')\npl.xtick |
88c0 | 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 | s([])\npl.yticks([])\npl.legend( |
88e0 | 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | loc=0)\npl.title('Target.samples |
8900 | 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d | ')\n\npl.subplot(2,.2,.3)\npl.im |
8920 | 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 2e 63 6f 73 74 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 | show(ot_sinkhorn_un.cost_,.inter |
8940 | 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b | polation='nearest')\npl.xticks([ |
8960 | 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 | ])\npl.yticks([])\npl.title('Cos |
8980 | 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 75 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e | t.matrix.-.unsupervised.DA')\n\n |
89a0 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f | pl.subplot(2,.2,.4)\npl.imshow(o |
89c0 | 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 63 6f 73 74 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 | t_sinkhorn_semi.cost_,.interpola |
89e0 | 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e | tion='nearest')\npl.xticks([])\n |
8a00 | 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 | pl.yticks([])\npl.title('Cost.ma |
8a20 | 74 72 69 78 20 2d 20 73 65 6d 69 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | trix.-.semisupervised.DA')\n\npl |
8a40 | 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 68 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c | .tight_layout()\n\n#.the.optimal |
8a60 | 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 69 6e 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 2d 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 | .coupling.in.the.semi-supervised |
8a80 | 20 44 41 20 63 61 73 65 20 77 69 6c 6c 20 65 78 68 69 62 69 74 20 5c 22 20 73 68 61 70 65 5c 6e | .DA.case.will.exhibit.\".shape\n |
8aa0 | 23 20 73 69 6d 69 6c 61 72 5c 22 20 74 6f 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 2c 20 | #.similar\".to.the.cost.matrix,. |
8ac0 | 28 62 6c 6f 63 6b 20 64 69 61 67 6f 6e 61 6c 20 6d 61 74 72 69 78 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d | (block.diagonal.matrix)".......] |
8ae0 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ,........"outputs":.[],........" |
8b00 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 | metadata":.{........."collapsed" |
8b20 | 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 | :.false.......}.....},......{... |
8b40 | 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a | ...."source":.[........."Fig.2.: |
8b60 | 20 70 6c 6f 74 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 | .plots.optimal.couplings.for.the |
8b80 | 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .different.methods\n------------ |
8ba0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
8bc0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 | -------------\n\n".......],..... |
8be0 | 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 | ..."cell_type":."markdown",..... |
8c00 | 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a | ..."metadata":.{}.....},......{. |
8c20 | 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a | ......"execution_count":.null,.. |
8c40 | 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 | ......"cell_type":."code",...... |
8c60 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 | .."source":.[........."pl.figure |
8c80 | 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | (2,.figsize=(8,.4))\n\npl.subplo |
8ca0 | 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 | t(1,.2,.1)\npl.imshow(ot_sinkhor |
8cc0 | 6e 5f 75 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e | n_un.coupling_,.interpolation='n |
8ce0 | 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 | earest')\npl.xticks([])\npl.ytic |
8d00 | 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 | ks([])\npl.title('Optimal.coupli |
8d20 | 6e 67 5c 5c 6e 55 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 | ng\\nUnsupervised.DA')\n\npl.sub |
8d40 | 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b | plot(1,.2,.2)\npl.imshow(ot_sink |
8d60 | 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 | horn_semi.coupling_,.interpolati |
8d80 | 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c | on='nearest')\npl.xticks([])\npl |
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a720 | 62 20 62 69 6e 73 5c 6e 5c 6e 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 5c 6e 78 20 3d 20 6e | b.bins\n\n#.bin.positions\nx.=.n |
a740 | 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e 5c | p.arange(n,.dtype=np.float64)\n\ |
a760 | 6e 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 61 31 20 3d 20 | n#.Gaussian.distributions\na1.=. |
a780 | 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 | ot.datasets.get_1D_gauss(n,.m=20 |
a7a0 | 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 5c 6e 61 32 20 3d 20 | ,.s=5)..#.m=.mean,.s=.std\na2.=. |
a7c0 | 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 36 30 | ot.datasets.get_1D_gauss(n,.m=60 |
a7e0 | 2c 20 73 3d 38 29 5c 6e 5c 6e 23 20 63 72 65 61 74 69 6e 67 20 6d 61 74 72 69 78 20 41 20 63 6f | ,.s=8)\n\n#.creating.matrix.A.co |
a800 | 6e 74 61 69 6e 69 6e 67 20 61 6c 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 41 20 3d 20 | ntaining.all.distributions\nA.=. |
a820 | 6e 70 2e 76 73 74 61 63 6b 28 28 61 31 2c 20 61 32 29 29 2e 54 5c 6e 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 | np.vstack((a1,.a2)).T\nn_distrib |
a840 | 75 74 69 6f 6e 73 20 3d 20 41 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 | utions.=.A.shape[1]\n\n#.loss.ma |
a860 | 74 72 69 78 20 2b 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 | trix.+.normalization\nM.=.ot.uti |
a880 | 6c 73 2e 64 69 73 74 30 28 6e 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 5c 6e | ls.dist0(n)\nM./=.M.max()\n\n#\n |
a8a0 | 23 20 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 5c 6e 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 | #.Plot.data\n#.---------\n\n#%%. |
a8c0 | 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 | plot.the.distributions\n\npl.fig |
a8e0 | 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 | ure(1,.figsize=(6.4,.3))\nfor.i. |
a900 | 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 | in.range(n_distributions):\n.... |
a920 | 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 | pl.plot(x,.A[:,.i])\npl.title('D |
a940 | 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 | istributions')\npl.tight_layout( |
a960 | 29 5c 6e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e | )\n\n#\n#.Barycenter.computation |
a980 | 5c 6e 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 23 25 | \n#.----------------------\n\n#% |
a9a0 | 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 61 6c 70 68 | %.barycenter.computation\n\nalph |
a9c0 | 61 20 3d 20 30 2e 32 20 20 23 20 30 3c 3d 61 6c 70 68 61 3c 3d 31 5c 6e 77 65 69 67 68 74 73 20 | a.=.0.2..#.0<=alpha<=1\nweights. |
a9e0 | 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 5c 6e | =.np.array([1.-.alpha,.alpha])\n |
aa00 | 5c 6e 23 20 6c 32 62 61 72 79 5c 6e 62 61 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 | \n#.l2bary\nbary_l2.=.A.dot(weig |
aa20 | 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d | hts)\n\n#.wasserstein\nreg.=.1e- |
aa40 | 33 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 | 3\nbary_wass.=.ot.bregman.baryce |
aa60 | 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 | nter(A,.M,.reg,.weights)\n\npl.f |
aa80 | 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 | igure(2)\npl.clf()\npl.subplot(2 |
aaa0 | 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 | ,.1,.1)\nfor.i.in.range(n_distri |
aac0 | 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 | butions):\n....pl.plot(x,.A[:,.i |
aae0 | 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c | ])\npl.title('Distributions')\n\ |
ab00 | 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c | npl.subplot(2,.1,.2)\npl.plot(x, |
ab20 | 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 | .bary_l2,.'r',.label='l2')\npl.p |
ab40 | 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 57 61 | lot(x,.bary_wass,.'g',.label='Wa |
ab60 | 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 | sserstein')\npl.legend()\npl.tit |
ab80 | 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f | le('Barycenters')\npl.tight_layo |
aba0 | 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 69 6e 74 65 72 70 6f | ut()\n\n#\n#.Barycentric.interpo |
abc0 | 6c 61 74 69 6f 6e 5c 6e 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | lation\n#.---------------------- |
abe0 | 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 | ---\n\n#%%.barycenter.interpolat |
ac00 | 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 6e 5f 61 6c 70 68 61 20 3d 20 31 31 5c 6e 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 20 | ion\n\nn_alpha.=.11\nalpha_list. |
ac20 | 3d 20 6e 70 2e 6c 69 6e 73 70 61 63 65 28 30 2c 20 31 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 5c 6e 5c 6e | =.np.linspace(0,.1,.n_alpha)\n\n |
ac40 | 5c 6e 42 5f 6c 32 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 29 5c | \nB_l2.=.np.zeros((n,.n_alpha))\ |
ac60 | 6e 5c 6e 42 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 70 79 28 42 5f 6c 32 29 5c 6e 5c 6e 66 6f 72 | n\nB_wass.=.np.copy(B_l2)\n\nfor |
ac80 | 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 30 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 61 6c | .i.in.range(0,.n_alpha):\n....al |
aca0 | 70 68 61 20 3d 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5b 69 5d 5c 6e 20 20 20 20 77 65 69 67 68 74 73 | pha.=.alpha_list[i]\n....weights |
acc0 | 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 5c | .=.np.array([1.-.alpha,.alpha])\ |
ace0 | 6e 20 20 20 20 42 5f 6c 32 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 | n....B_l2[:,.i].=.A.dot(weights) |
ad00 | 5c 6e 20 20 20 20 42 5f 77 61 73 73 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e | \n....B_wass[:,.i].=.ot.bregman. |
ad20 | 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e | barycenter(A,.M,.reg,.weights)\n |
ad40 | 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 | \n#%%.plot.interpolation\n\npl.f |
ad60 | 69 67 75 72 65 28 33 29 5c 6e 5c 6e 63 6d 61 70 20 3d 20 70 6c 2e 63 6d 2e 67 65 74 5f 63 6d 61 | igure(3)\n\ncmap.=.pl.cm.get_cma |
ad80 | 70 28 27 76 69 72 69 64 69 73 27 29 5c 6e 76 65 72 74 73 20 3d 20 5b 5d 5c 6e 7a 73 20 3d 20 61 | p('viridis')\nverts.=.[]\nzs.=.a |
ada0 | 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5c 6e 66 6f 72 20 69 2c 20 7a 20 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 | lpha_list\nfor.i,.z.in.enumerate |
adc0 | 28 7a 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 79 73 20 3d 20 42 5f 6c 32 5b 3a 2c 20 69 5d 5c 6e 20 20 20 20 | (zs):\n....ys.=.B_l2[:,.i]\n.... |
ade0 | 76 65 72 74 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 6c 69 73 74 28 7a 69 70 28 78 2c 20 79 73 29 29 29 5c 6e | verts.append(list(zip(x,.ys)))\n |
ae00 | 5c 6e 61 78 20 3d 20 70 6c 2e 67 63 66 28 29 2e 67 63 61 28 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 3d 27 | \nax.=.pl.gcf().gca(projection=' |
ae20 | 33 64 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6f 6c 79 20 3d 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 28 76 65 | 3d')\n\npoly.=.PolyCollection(ve |
ae40 | 72 74 73 2c 20 66 61 63 65 63 6f 6c 6f 72 73 3d 5b 63 6d 61 70 28 61 29 20 66 6f 72 20 61 20 69 | rts,.facecolors=[cmap(a).for.a.i |
ae60 | 6e 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5d 29 5c 6e 70 6f 6c 79 2e 73 65 74 5f 61 6c 70 68 61 28 30 | n.alpha_list])\npoly.set_alpha(0 |
ae80 | 2e 37 29 5c 6e 61 78 2e 61 64 64 5f 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 33 64 28 70 6f 6c 79 2c 20 7a | .7)\nax.add_collection3d(poly,.z |
aea0 | 73 3d 7a 73 2c 20 7a 64 69 72 3d 27 79 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 61 62 65 6c 28 27 | s=zs,.zdir='y')\nax.set_xlabel(' |
aec0 | 78 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 6e 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 | x')\nax.set_xlim3d(0,.n)\nax.set |
aee0 | 5f 79 6c 61 62 65 6c 28 27 24 5c 5c 5c 5c 61 6c 70 68 61 24 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 79 | _ylabel('$\\\\alpha$')\nax.set_y |
af00 | 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 31 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 61 62 65 6c 28 27 27 29 5c 6e | lim3d(0,.1)\nax.set_zlabel('')\n |
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af40 | 30 31 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 | 01)\npl.title('Barycenter.interp |
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bca0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 76 65 72 | .............................ver |
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bd80 | 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 | sp_Xs_lpl1.=.ot_lpl1.transform(X |
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bdc0 | 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 | transform(Xs=Xs)".......],...... |
bde0 | 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 | .."outputs":.[],........"metadat |
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bfe0 | 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 | ks([])\npl.legend(loc=0)\npl.tit |
c000 | 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 | le('Source..samples')\n\npl.subp |
c020 | 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 | lot(1,.2,.2)\npl.scatter(Xt[:,.0 |
c040 | 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c | ],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',.l |
c060 | 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b | abel='Target.samples')\npl.xtick |
c080 | 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 | s([])\npl.yticks([])\npl.legend( |
c0a0 | 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | loc=0)\npl.title('Target.samples |
c0c0 | 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 | ')\npl.tight_layout()".......],. |
c0e0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 | ......."outputs":.[],........"me |
c100 | 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 | tadata":.{........."collapsed":. |
c120 | 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 | false.......}.....},......{..... |
c140 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 | .."source":.[........."Fig.2.:.p |
c160 | 6c 6f 74 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 61 6e 64 20 74 72 61 6e 73 70 | lot.optimal.couplings.and.transp |
c180 | 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | orted.samples\n----------------- |
c1a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
c1c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c | -----\n\n".......],........"cell |
c1e0 | 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | _type":."markdown",........"meta |
c200 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 | data":.{}.....},......{......."e |
c220 | 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 | xecution_count":.null,........"c |
c240 | 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 | ell_type":."code",........"sourc |
c260 | 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 20 3d 20 7b 27 69 6e 74 | e":.[........."param_img.=.{'int |
c280 | 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 27 3a 20 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 2c 20 27 63 6d 61 70 27 3a 20 | erpolation':.'nearest',.'cmap':. |
c2a0 | 27 73 70 65 63 74 72 61 6c 27 7d 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 | 'spectral'}\n\npl.figure(2,.figs |
c2c0 | 69 7a 65 3d 28 31 35 2c 20 38 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 31 | ize=(15,.8))\npl.subplot(2,.4,.1 |
c2e0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a | )\npl.imshow(ot_emd.coupling_,.* |
c300 | 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 | *param_img)\npl.xticks([])\npl.y |
c320 | 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 | ticks([])\npl.title('Optimal.cou |
c340 | 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 | pling\\nEMDTransport')\n\npl.sub |
c360 | 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b | plot(2,.4,.2)\npl.imshow(ot_sink |
c380 | 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c | horn.coupling_,.**param_img)\npl |
c3a0 | 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 | .xticks([])\npl.yticks([])\npl.t |
c3c0 | 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 | itle('Optimal.coupling\\nSinkhor |
c3e0 | 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c | nTransport')\n\npl.subplot(2,.4, |
c400 | 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f | .3)\npl.imshow(ot_lpl1.coupling_ |
c420 | 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 | ,.**param_img)\npl.xticks([])\np |
c440 | 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 | l.yticks([])\npl.title('Optimal. |
c460 | 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 | coupling\\nSinkhornLpl1Transport |
c480 | 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d | ')\n\npl.subplot(2,.4,.4)\npl.im |
c4a0 | 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f | show(ot_l1l2.coupling_,.**param_ |
c4c0 | 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b | img)\npl.xticks([])\npl.yticks([ |
c4e0 | 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c | ])\npl.title('Optimal.coupling\\ |
c500 | 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 | nSinkhornL1l2Transport')\n\npl.s |
c520 | 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a | ubplot(2,.4,.5)\npl.scatter(Xt[: |
c540 | 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 | ,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o' |
c560 | 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 | ,\n...........label='Target.samp |
c580 | 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 | les',.alpha=0.3)\npl.scatter(tra |
c5a0 | 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b | nsp_Xs_emd[:,.0],.transp_Xs_emd[ |
c5c0 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d | :,.1],.c=ys,\n...........marker= |
c5e0 | 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 | '+',.label='Transp.samples',.s=3 |
c600 | 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 | 0)\npl.xticks([])\npl.yticks([]) |
c620 | 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c | \npl.title('Transported.samples\ |
c640 | 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d | \nEmdTransport')\npl.legend(loc= |
c660 | 5c 22 6c 6f 77 65 72 20 6c 65 66 74 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | \"lower.left\")\n\npl.subplot(2, |
c680 | 20 34 2c 20 36 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b | .4,.6)\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[ |
c6a0 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 | :,.1],.c=yt,.marker='o',\n...... |
c6c0 | 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 | .....label='Target.samples',.alp |
c6e0 | 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 | ha=0.3)\npl.scatter(transp_Xs_si |
c700 | 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e | nkhorn[:,.0],.transp_Xs_sinkhorn |
c720 | 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 | [:,.1],.c=ys,\n...........marker |
c740 | 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d | ='+',.label='Transp.samples',.s= |
c760 | 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | 30)\npl.xticks([])\npl.yticks([] |
c780 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | )\npl.title('Transported.samples |
c7a0 | 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 | \\nSinkhornTransport')\n\npl.sub |
c7c0 | 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 37 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 | plot(2,.4,.7)\npl.scatter(Xt[:,. |
c7e0 | 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c | 0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',\ |
c800 | 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 | n...........label='Target.sample |
c820 | 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 | s',.alpha=0.3)\npl.scatter(trans |
c840 | 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b | p_Xs_lpl1[:,.0],.transp_Xs_lpl1[ |
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dae0 | 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 | .....{......."source":.[........ |
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dc40 | 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 | npl.subplot(1,.2,.2)\npl.imshow( |
dc60 | 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 | I2)\npl.axis('off')\npl.title('I |
dc80 | 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 | mage.2')\npl.tight_layout()".... |
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dda0 | 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 | ....},......{......."execution_c |
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de20 | 35 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 | 5))\n\npl.subplot(1,.2,.1)\npl.s |
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de80 | 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c | el('Red')\npl.ylabel('Blue')\npl |
dea0 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | .title('Image.1')\n\npl.subplot( |
dec0 | 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 | 1,.2,.2)\npl.scatter(Xt[:,.0],.X |
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df00 | 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 | ,.1])\npl.xlabel('Red')\npl.ylab |
df20 | 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c | el('Blue')\npl.title('Image.2')\ |
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dfc0 | 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 66 6f | source":.[........."Plot.transfo |
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e020 | 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 | type":."markdown",........"metad |
e040 | 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 | ata":.{}.....},......{......."ex |
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e080 | 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 | ll_type":."code",........"source |
e0a0 | 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 | ":.[........."pl.figure(2,.figsi |
e0c0 | 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 35 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 | ze=(10,.5))\n\npl.subplot(2,.3,. |
e0e0 | 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 | 1)\npl.imshow(I1)\npl.axis('off' |
e100 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | )\npl.title('Im..1')\n\npl.subpl |
e120 | 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 61 | ot(2,.3,.4)\npl.imshow(I2)\npl.a |
e140 | 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 32 27 29 5c 6e 5c | xis('off')\npl.title('Im..2')\n\ |
e160 | 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 | npl.subplot(2,.3,.2)\npl.imshow( |
e180 | 49 6d 61 67 65 5f 65 6d 64 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 | Image_emd)\npl.axis('off')\npl.t |
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ea60 | 6e 29 20 2b 20 31 29 20 2a 20 2d 30 2e 30 30 31 20 20 23 20 74 6f 20 6d 61 6b 65 20 69 74 20 73 | n).+.1).*.-0.001..#.to.make.it.s |
ea80 | 74 72 69 63 74 6c 79 20 63 6f 6e 76 65 78 2e 2e 2e 5c 6e 5c 6e 78 74 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 | trictly.convex...\n\nxt.=.np.zer |
eaa0 | 6f 73 28 28 6e 2c 20 32 29 29 5c 6e 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 | os((n,.2))\nxt[:,.1].=.np.arange |
eac0 | 28 6e 29 20 2b 20 31 5c 6e 5c 6e 61 2c 20 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 2c 20 6f 74 | (n).+.1\n\na,.b.=.ot.unif(n),.ot |
eae0 | 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 20 20 23 20 75 6e 69 66 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e | .unif(n)..#.uniform.distribution |
eb00 | 20 6f 6e 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 31 | .on.samples\n\n#.loss.matrix\nM1 |
eb20 | 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 | .=.ot.dist(xs,.xt,.metric='eucli |
eb40 | 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d 31 20 2f 3d 20 4d 31 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 | dean')\nM1./=.M1.max()\n\n#.loss |
eb60 | 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 | .matrix\nM2.=.ot.dist(xs,.xt,.me |
eb80 | 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 | tric='sqeuclidean')\nM2./=.M2.ma |
eba0 | 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 70 20 3d 20 6e 70 2e 73 71 | x()\n\n#.loss.matrix\nMp.=.np.sq |
ebc0 | 72 74 28 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 | rt(ot.dist(xs,.xt,.metric='eucli |
ebe0 | 64 65 61 6e 27 29 29 5c 6e 4d 70 20 2f 3d 20 4d 70 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 44 61 74 | dean'))\nMp./=.Mp.max()\n\n#.Dat |
ec00 | 61 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c | a\npl.figure(1,.figsize=(7,.3))\ |
ec20 | 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b | npl.clf()\npl.plot(xs[:,.0],.xs[ |
ec40 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c | :,.1],.'+b',.label='Source.sampl |
ec60 | 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d | es')\npl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1] |
ec80 | 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c | ,.'xr',.label='Target.samples')\ |
eca0 | 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 | npl.axis('equal')\npl.title('Sou |
ecc0 | 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 72 61 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e | rce.and.traget.distributions')\n |
ece0 | 5c 6e 5c 6e 23 20 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 | \n\n#.Cost.matrices\npl.figure(2 |
ed00 | 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | ,.figsize=(7,.3))\n\npl.subplot( |
ed20 | 31 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 31 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c | 1,.3,.1)\npl.imshow(M1,.interpol |
ed40 | 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 75 63 6c | ation='nearest')\npl.title('Eucl |
ed60 | 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c | idean.cost')\n\npl.subplot(1,.3, |
ed80 | 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 32 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e | .2)\npl.imshow(M2,.interpolation |
eda0 | 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 | ='nearest')\npl.title('Squared.E |
edc0 | 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c | uclidean.cost')\n\npl.subplot(1, |
ede0 | 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 70 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 | .3,.3)\npl.imshow(Mp,.interpolat |
ee00 | 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 72 74 20 45 | ion='nearest')\npl.title('Sqrt.E |
ee20 | 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 | uclidean.cost')\npl.tight_layout |
ee40 | 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 | ()".......],......."cell_type":. |
ee60 | 22 63 6f 64 65 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 | "code".....},.....{......."metad |
ee80 | 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 | ata":.{},......."source":.[..... |
eea0 | 20 20 20 20 22 44 61 74 61 73 65 74 20 31 20 3a 20 50 6c 6f 74 20 4f 54 20 4d 61 74 72 69 63 65 | ...."Dataset.1.:.Plot.OT.Matrice |
eec0 | 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c | s\n----------------------------\ |
eee0 | 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a | n\n".......],......."cell_type": |
ef00 | 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ."markdown".....},.....{......." |
ef20 | 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d | execution_count":.null,......."m |
ef40 | 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a | etadata":.{........."collapsed": |
ef60 | 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a | .false.......},......."outputs": |
ef80 | 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 | .[],......."source":.[........." |
efa0 | 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e 47 31 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 31 29 5c 6e | #%%.EMD\nG1.=.ot.emd(a,.b,.M1)\n |
efc0 | 47 32 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 32 29 5c 6e 47 70 20 3d 20 6f 74 2e 65 | G2.=.ot.emd(a,.b,.M2)\nGp.=.ot.e |
efe0 | 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 70 29 5c 6e 5c 6e 23 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 70 | md(a,.b,.Mp)\n\n#.OT.matrices\np |
f000 | 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 70 | l.figure(3,.figsize=(7,.3))\n\np |
f020 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 | l.subplot(1,.3,.1)\not.plot.plot |
f040 | 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 31 2c 20 63 3d 5b 2e 35 | 2D_samples_mat(xs,.xt,.G1,.c=[.5 |
f060 | 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b | ,..5,.1])\npl.plot(xs[:,.0],.xs[ |
f080 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c | :,.1],.'+b',.label='Source.sampl |
f0a0 | 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d | es')\npl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1] |
f0c0 | 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c | ,.'xr',.label='Target.samples')\ |
f0e0 | 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c | npl.axis('equal')\n#.pl.legend(l |
f100 | 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c | oc=0)\npl.title('OT.Euclidean')\ |
f120 | 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e | n\npl.subplot(1,.3,.2)\not.plot. |
f140 | 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 32 2c 20 63 | plot2D_samples_mat(xs,.xt,.G2,.c |
f160 | 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c | =[.5,..5,.1])\npl.plot(xs[:,.0], |
f180 | 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 | .xs[:,.1],.'+b',.label='Source.s |
f1a0 | 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a | amples')\npl.plot(xt[:,.0],.xt[: |
f1c0 | 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 | ,.1],.'xr',.label='Target.sample |
f1e0 | 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 | s')\npl.axis('equal')\n#.pl.lege |
f200 | 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 75 61 72 65 64 20 | nd(loc=0)\npl.title('OT.squared. |
f220 | 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 | Euclidean')\n\npl.subplot(1,.3,. |
f240 | 33 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 | 3)\not.plot.plot2D_samples_mat(x |
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11ce0 | 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 66 | ose=True)\n\not_mapping_linear.f |
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11de0 | 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 | linear_new.=.ot_mapping_linear.t |
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11ea0 | 73 3d 54 72 75 65 2c 20 73 69 67 6d 61 3d 31 2c 5c 6e 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 | s=True,.sigma=1,\n....max_iter=1 |
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11ee0 | 73 73 69 61 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 | ssian.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n#.for |
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11fe0 | 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f | apping_gaussian.transform(Xs=Xs_ |
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12020 | 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | .[],........"metadata":.{....... |
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12060 | 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 | .},......{......."source":.[.... |
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120c0 | 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b | ....],........"cell_type":."mark |
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12100 | 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e | .},......{......."execution_coun |
12120 | 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 | t":.null,........"cell_type":."c |
12140 | 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 | ode",........"source":.[........ |
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12340 | 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 | ansp_Xs_linear_new[:,.1],\n..... |
12360 | 20 20 20 20 20 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c | ......c=ys,.marker='+',.label='L |
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123a0 | 69 6d 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 | im..mapping.(linear)\")\n\npl.su |
123c0 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c | bplot(2,.2,.3)\npl.scatter(Xt[:, |
123e0 | 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c | .0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o', |
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12d60 | 5c 6e 5c 6e 6c 73 74 5f 6d 20 3d 20 6e 70 2e 6c 69 6e 73 70 61 63 65 28 32 30 2c 20 39 30 2c 20 | \n\nlst_m.=.np.linspace(20,.90,. |
12d80 | 6e 5f 74 61 72 67 65 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 | n_target)\n\n#.Gaussian.distribu |
12da0 | 74 69 6f 6e 73 5c 6e 61 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 | tions\na.=.gauss(n,.m=20,.s=5).. |
12dc0 | 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 5c 6e 5c 6e 42 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f | #.m=.mean,.s=.std\n\nB.=.np.zero |
12de0 | 73 28 28 6e 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 29 29 5c 6e 5c 6e 66 6f 72 20 69 2c 20 6d 20 69 6e 20 | s((n,.n_target))\n\nfor.i,.m.in. |
12e00 | 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 6c 73 74 5f 6d 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 42 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d | enumerate(lst_m):\n....B[:,.i].= |
12e20 | 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 6d 2c 20 73 3d 35 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 | .gauss(n,.m=m,.s=5)\n\n#.loss.ma |
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12ea0 | 61 78 28 29 5c 6e 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c | ax()\nM2.=.ot.dist(x.reshape((n, |
12ec0 | 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 27 73 71 65 75 63 6c | .1)),.x.reshape((n,.1)),.'sqeucl |
12ee0 | 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d | idean')\nM2./=.M2.max()".......] |
12f00 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ,........"outputs":.[],........" |
12f20 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 | metadata":.{........."collapsed" |
12f40 | 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 | :.false.......}.....},......{... |
12f60 | 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 64 61 | ...."source":.[........."Plot.da |
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12fa0 | 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 | ..."cell_type":."markdown",..... |
12fc0 | 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a | ..."metadata":.{}.....},......{. |
12fe0 | 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a | ......"execution_count":.null,.. |
13000 | 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 | ......"cell_type":."code",...... |
13020 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 | .."source":.[........."#%%.plot. |
13040 | 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 | the.distributions\n\npl.figure(1 |
13060 | 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 | )\npl.subplot(2,.1,.1)\npl.plot( |
13080 | 78 2c 20 61 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 73 74 72 69 62 | x,.a,.'b',.label='Source.distrib |
130a0 | 75 74 69 6f 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 73 74 72 69 | ution')\npl.title('Source.distri |
130c0 | 62 75 74 69 6f 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 | bution')\npl.subplot(2,.1,.2)\np |
130e0 | 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 42 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 | l.plot(x,.B,.label='Target.distr |
13100 | 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 64 69 73 | ibutions')\npl.title('Target.dis |
13120 | 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 | tributions')\npl.tight_layout()" |
13140 | 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 | .......],........"outputs":.[],. |
13160 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f | ......."metadata":.{........."co |
13180 | 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a | llapsed":.false.......}.....},.. |
131a0 | 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 | ....{......."source":.[......... |
131c0 | 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 45 4d 44 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6c | "Compute.EMD.for.the.different.l |
131e0 | 6f 73 73 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | osses\n------------------------- |
13200 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | -----------\n\n".......],....... |
13220 | 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 | ."cell_type":."markdown",....... |
13240 | 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 | ."metadata":.{}.....},......{... |
13260 | 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 | ...."execution_count":.null,.... |
13280 | 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | ...."cell_type":."code",........ |
132a0 | 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 43 6f 6d 70 75 74 65 | "source":.[........."#%%.Compute |
132c0 | 20 61 6e 64 20 70 6c 6f 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 61 6e 64 20 6c 6f 73 73 | .and.plot.distributions.and.loss |
132e0 | 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 5c 6e 64 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 32 28 61 2c 20 42 2c | .matrix\n\nd_emd.=.ot.emd2(a,.B, |
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13320 | 5c 6e 64 5f 65 6d 64 32 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 32 29 20 20 23 20 | \nd_emd2.=.ot.emd2(a,.B,.M2)..#. |
13340 | 64 69 72 65 63 74 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 6c | direct.computation.of.EMD.with.l |
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133a0 | 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 6d 64 32 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 71 75 61 72 65 64 20 | npl.plot(d_emd2,.label='Squared. |
133c0 | 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 4d 44 20 64 | Euclidean.EMD')\npl.title('EMD.d |
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13400 | 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ,........"outputs":.[],........" |
13420 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 | metadata":.{........."collapsed" |
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13460 | 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 43 6f 6d 70 75 74 65 | ...."source":.[........."Compute |
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134c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 | -------------\n\n".......],..... |
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14340 | 65 20 32 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 | e.2')".......],........"outputs" |
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144a0 | 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 5c | l.figure(2,.figsize=(6.4,.3))\n\ |
144c0 | 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 | npl.subplot(1,.2,.1)\npl.scatter |
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14520 | 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | d')\npl.ylabel('Blue')\npl.title |
14540 | 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 | ('Image.1')\n\npl.subplot(1,.2,. |
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149e0 | 29 5c 6e 49 32 74 65 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 | )\nI2te.=.minmax(mat2im(transp_X |
14a00 | 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c | t_sinkhorn,.I2.shape))".......], |
14a20 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d | ........"outputs":.[],........"m |
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14b00 | 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e | .},......{......."execution_coun |
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14b40 | 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 | ode",........"source":.[........ |
14b60 | 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 5c 6e | ."pl.figure(3,.figsize=(8,.4))\n |
14b80 | 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 | \npl.subplot(2,.3,.1)\npl.imshow |
14ba0 | 28 49 31 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | (I1)\npl.axis('off')\npl.title(' |
14bc0 | 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 | Image.1')\n\npl.subplot(2,.3,.2) |
14be0 | 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 | \npl.imshow(I1t)\npl.axis('off') |
14c00 | 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 | \npl.title('Image.1.Adapt')\n\np |
14c20 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 | l.subplot(2,.3,.3)\npl.imshow(I1 |
14c40 | 74 65 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 | te)\npl.axis('off')\npl.title('I |
14c60 | 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | mage.1.Adapt.(reg)')\n\npl.subpl |
14c80 | 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 61 | ot(2,.3,.4)\npl.imshow(I2)\npl.a |
14ca0 | 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c | xis('off')\npl.title('Image.2')\ |
14cc0 | 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f | n\npl.subplot(2,.3,.5)\npl.imsho |
14ce0 | 77 28 49 32 74 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | w(I2t)\npl.axis('off')\npl.title |
14d00 | 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | ('Image.2.Adapt')\n\npl.subplot( |
14d20 | 32 2c 20 33 2c 20 36 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 65 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 | 2,.3,.6)\npl.imshow(I2te)\npl.ax |
14d40 | 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 | is('off')\npl.title('Image.2.Ada |
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14d80 | 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 | npl.show()".......],........"out |
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