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2ae0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 0a 20 | ......."cell_type":."markdown".. |
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38c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c | ...................max_iter=100, |
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3980 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b 30 5d 2c 20 70 73 5b 32 5d 5c | ..................[ps[0],.ps[2]\ |
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39c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 | .............],.p,.lambdast[i],. |
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3a00 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
3a20 | 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 5c 6e 5c 6e 43 | ....max_iter=100,.tol=1e-3)\n\nC |
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3c20 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b 32 5d 2c 20 70 73 5b 33 | ....................[ps[2],.ps[3 |
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3fe0 | 6f 73 74 31 33 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 74 31 33 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 | ost13.=.[smacof_mds(Ct13[s],.2). |
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4080 | 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 5c 6e 6e 70 6f 73 74 | s],.2).for.s.in.range(2)]\nnpost |
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6480 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c | ------------\n\n".......].....}, |
64a0 | 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 | .....{......."cell_type":."code" |
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6680 | 58 73 3d 58 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 72 61 6e 73 70 | Xs=Xs,.ys=ys,.Xt=Xt)\n\n#.transp |
66a0 | 6f 72 74 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6f 6e 74 6f 20 74 61 72 67 65 74 20 73 | ort.source.samples.onto.target.s |
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66e0 | 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 | ransform(Xs=Xs)\ntransp_Xs_sinkh |
6700 | 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 | orn.=.ot_sinkhorn.transform(Xs=X |
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6740 | 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 | nsform(Xs=Xs)".......].....},... |
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67a0 | 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 | source":.[........."Fig.1.:.plot |
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6820 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
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6920 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b | subplot(2,.2,.1)\npl.scatter(Xs[ |
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6960 | 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 | ',.label='Source.samples')\npl.x |
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69a0 | 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 | end(loc=0)\npl.title('Source..sa |
69c0 | 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e | mples')\n\npl.subplot(2,.2,.2)\n |
69e0 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 | pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c |
6a00 | 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 | =yt,.marker='o',.label='Target.s |
6a20 | 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 | amples')\npl.xticks([])\npl.ytic |
6a40 | 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 | ks([])\npl.legend(loc=0)\npl.tit |
6a60 | 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | le('Target.samples')\n\npl.subpl |
6a80 | 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 | ot(2,.2,.3)\npl.imshow(M,.interp |
6aa0 | 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | olation='nearest')\npl.xticks([] |
6ac0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 74 72 | )\npl.yticks([])\npl.title('Matr |
6ae0 | 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 | ix.of.pairwise.distances')\npl.t |
6b00 | 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 | ight_layout()".......].....},... |
6b20 | 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e | ..{......."cell_type":."markdown |
6b40 | 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ",......."metadata":.{},......." |
6b60 | 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 | source":.[........."Fig.2.:.plot |
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6ba0 | 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | erent.methods\n----------------- |
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6be0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 | --------\n\n".......].....},.... |
6c00 | 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 | .{......."cell_type":."code",... |
6c20 | 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 | ...."execution_count":.null,.... |
6c40 | 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 | ..."metadata":.{........."collap |
6c60 | 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 | sed":.false.......},......."outp |
6c80 | 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 | uts":.[],......."source":.[..... |
6ca0 | 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 36 | ...."pl.figure(2,.figsize=(10,.6 |
6cc0 | 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d | ))\n\npl.subplot(2,.3,.1)\npl.im |
6ce0 | 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 | show(ot_emd.coupling_,.interpola |
6d00 | 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e | tion='nearest')\npl.xticks([])\n |
6d20 | 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c | pl.yticks([])\npl.title('Optimal |
6d40 | 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | .coupling\\nEMDTransport')\n\npl |
6d60 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f | .subplot(2,.3,.2)\npl.imshow(ot_ |
6d80 | 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f | sinkhorn.coupling_,.interpolatio |
6da0 | 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e | n='nearest')\npl.xticks([])\npl. |
6dc0 | 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f | yticks([])\npl.title('Optimal.co |
6de0 | 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e | upling\\nSinkhornTransport')\n\n |
6e00 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f | pl.subplot(2,.3,.3)\npl.imshow(o |
6e20 | 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d | t_lpl1.coupling_,.interpolation= |
6e40 | 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 | 'nearest')\npl.xticks([])\npl.yt |
6e60 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 | icks([])\npl.title('Optimal.coup |
6e80 | 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e | ling\\nSinkhornLpl1Transport')\n |
6ea0 | 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 | \npl.subplot(2,.3,.4)\not.plot.p |
6ec0 | 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 65 6d 64 | lot2D_samples_mat(Xs,.Xt,.ot_emd |
6ee0 | 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 | .coupling_,.c=[.5,..5,.1])\npl.s |
6f00 | 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c | catter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys, |
6f20 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c | .marker='+',.label='Source.sampl |
6f40 | 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c | es')\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:, |
6f60 | 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 | .1],.c=yt,.marker='o',.label='Ta |
6f80 | 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 | rget.samples')\npl.xticks([])\np |
6fa0 | 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 | l.yticks([])\npl.title('Main.cou |
6fc0 | 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 | pling.coefficients\\nEMDTranspor |
6fe0 | 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e 6f 74 2e 70 | t')\n\npl.subplot(2,.3,.5)\not.p |
7000 | 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f | lot.plot2D_samples_mat(Xs,.Xt,.o |
7020 | 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c | t_sinkhorn.coupling_,.c=[.5,..5, |
7040 | 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c | .1])\npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:, |
7060 | 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f | .1],.c=ys,.marker='+',.label='So |
7080 | 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c | urce.samples')\npl.scatter(Xt[:, |
70a0 | 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c | .0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o', |
70c0 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 | .label='Target.samples')\npl.xti |
70e0 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | cks([])\npl.yticks([])\npl.title |
7100 | 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 53 | ('Main.coupling.coefficients\\nS |
7120 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | inkhornTransport')\n\npl.subplot |
7140 | 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 | (2,.3,.6)\not.plot.plot2D_sample |
7160 | 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c | s_mat(Xs,.Xt,.ot_lpl1.coupling_, |
7180 | 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a | .c=[.5,..5,.1])\npl.scatter(Xs[: |
71a0 | 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 | ,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+' |
71c0 | 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 | ,.label='Source.samples')\npl.sc |
71e0 | 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 | atter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,. |
7200 | 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 | marker='o',.label='Target.sample |
7220 | 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | s')\npl.xticks([])\npl.yticks([] |
7240 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 | )\npl.title('Main.coupling.coeff |
7260 | 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 | icients\\nSinkhornLpl1Transport' |
7280 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 | )\npl.tight_layout()".......]... |
72a0 | 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d | ..},.....{......."cell_type":."m |
72c0 | 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a | arkdown",......."metadata":.{},. |
72e0 | 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 33 | ......"source":.[........."Fig.3 |
7300 | 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d | .:.plot.transported.samples\n--- |
7320 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c | -----------------------------\n\ |
7340 | 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 | n".......].....},.....{......."c |
7360 | 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 | ell_type":."code",......."execut |
7380 | 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 | ion_count":.null,......."metadat |
73a0 | 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 | a":.{........."collapsed":.false |
73c0 | 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 | .......},......."outputs":.[],.. |
73e0 | 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 64 69 73 70 | ....."source":.[........."#.disp |
7400 | 6c 61 79 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 | lay.transported.samples\npl.figu |
7420 | 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 34 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | re(4,.figsize=(10,.4))\npl.subpl |
7440 | 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d | ot(1,.3,.1)\npl.scatter(Xt[:,.0] |
7460 | 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 | ,.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',\n. |
7480 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 | ..........label='Target.samples' |
74a0 | 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f | ,.alpha=0.5)\npl.scatter(transp_ |
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85c0 | 20 2d 31 20 63 61 6e 6e 6f 74 20 62 65 20 75 73 65 64 20 61 73 20 61 20 63 6c 61 73 73 20 6c 61 | .-1.cannot.be.used.as.a.class.la |
85e0 | 62 65 6c 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | bel".......].....},.....{....... |
8600 | 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 | "cell_type":."markdown",......." |
8620 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b | metadata":.{},......."source":.[ |
8640 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 | ........."Fig.1.:.plots.source.a |
8660 | 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 2b 20 6d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 | nd.target.samples.+.matrix.of.pa |
8680 | 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | irwise.distance\n--------------- |
86a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
86c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 | ----------------------\n\n"..... |
86e0 | 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 | ..].....},.....{......."cell_typ |
8700 | 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 | e":."code",......."execution_cou |
8720 | 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 | nt":.null,......."metadata":.{.. |
8740 | 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 | ......."collapsed":.false....... |
8760 | 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 | },......."outputs":.[],......."s |
8780 | 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 | ource":.[........."pl.figure(1,. |
87a0 | 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 31 30 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | figsize=(10,.10))\npl.subplot(2, |
87c0 | 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b | .2,.1)\npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[ |
87e0 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | :,.1],.c=ys,.marker='+',.label=' |
8800 | 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c | Source.samples')\npl.xticks([])\ |
8820 | 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 | npl.yticks([])\npl.legend(loc=0) |
8840 | 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c | \npl.title('Source..samples')\n\ |
8860 | 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 | npl.subplot(2,.2,.2)\npl.scatter |
8880 | 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 | (Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marke |
88a0 | 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e | r='o',.label='Target.samples')\n |
88c0 | 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c | pl.xticks([])\npl.yticks([])\npl |
88e0 | 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 | .legend(loc=0)\npl.title('Target |
8900 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 | .samples')\n\npl.subplot(2,.2,.3 |
8920 | 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 2e 63 6f 73 74 | )\npl.imshow(ot_sinkhorn_un.cost |
8940 | 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e | _,.interpolation='nearest')\npl. |
8960 | 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 | xticks([])\npl.yticks([])\npl.ti |
8980 | 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 75 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 | tle('Cost.matrix.-.unsupervised. |
89a0 | 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e | DA')\n\npl.subplot(2,.2,.4)\npl. |
89c0 | 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 63 6f 73 74 5f 2c 20 69 | imshow(ot_sinkhorn_semi.cost_,.i |
89e0 | 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 | nterpolation='nearest')\npl.xtic |
8a00 | 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | ks([])\npl.yticks([])\npl.title( |
8a20 | 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 73 65 6d 69 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 | 'Cost.matrix.-.semisupervised.DA |
8a40 | 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 68 65 | ')\n\npl.tight_layout()\n\n#.the |
8a60 | 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 69 6e 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 2d 73 75 | .optimal.coupling.in.the.semi-su |
8a80 | 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 20 63 61 73 65 20 77 69 6c 6c 20 65 78 68 69 62 69 74 20 5c 22 | pervised.DA.case.will.exhibit.\" |
8aa0 | 20 73 68 61 70 65 5c 6e 23 20 73 69 6d 69 6c 61 72 5c 22 20 74 6f 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 | .shape\n#.similar\".to.the.cost. |
8ac0 | 6d 61 74 72 69 78 2c 20 28 62 6c 6f 63 6b 20 64 69 61 67 6f 6e 61 6c 20 6d 61 74 72 69 78 29 22 | matrix,.(block.diagonal.matrix)" |
8ae0 | 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c | .......].....},.....{......."cel |
8b00 | 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | l_type":."markdown",......."meta |
8b20 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 | data":.{},......."source":.[.... |
8b40 | 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 | ....."Fig.2.:.plots.optimal.coup |
8b60 | 6c 69 6e 67 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 5c | lings.for.the.different.methods\ |
8b80 | 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | n------------------------------- |
8ba0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a | --------------------------\n\n". |
8bc0 | 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c | ......].....},.....{......."cell |
8be0 | 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e | _type":."code",......."execution |
8c00 | 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a | _count":.null,......."metadata": |
8c20 | 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 | .{........."collapsed":.false... |
8c40 | 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 | ....},......."outputs":.[],..... |
8c60 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 | .."source":.[........."pl.figure |
8c80 | 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | (2,.figsize=(8,.4))\n\npl.subplo |
8ca0 | 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 | t(1,.2,.1)\npl.imshow(ot_sinkhor |
8cc0 | 6e 5f 75 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e | n_un.coupling_,.interpolation='n |
8ce0 | 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 | earest')\npl.xticks([])\npl.ytic |
8d00 | 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 | ks([])\npl.title('Optimal.coupli |
8d20 | 6e 67 5c 5c 6e 55 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 | ng\\nUnsupervised.DA')\n\npl.sub |
8d40 | 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b | plot(1,.2,.2)\npl.imshow(ot_sink |
8d60 | 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 | horn_semi.coupling_,.interpolati |
8d80 | 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c | on='nearest')\npl.xticks([])\npl |
8da0 | 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 | .yticks([])\npl.title('Optimal.c |
8dc0 | 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 65 6d 69 2d 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 5c 6e | oupling\\nSemi-supervised.DA')\n |
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af80 | 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 | ......"cell_type":."markdown",.. |
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c0a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
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d200 | 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 | ....},.....{......."cell_type":. |
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d340 | 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 | ......."#%%.barycenter.computati |
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d3a0 | 20 61 6c 70 68 61 5d 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 32 62 61 72 79 5c 6e 62 61 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 | .alpha])\n\n#.l2bary\nbary_l2.=. |
d3c0 | 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 5c | A.dot(weights)\n\n#.wasserstein\ |
d3e0 | 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 | nreg.=.1e-3\nbary_wass.=.ot.breg |
d400 | 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 | man.barycenter(A,.M,.reg,.weight |
d420 | 73 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c | s)\n\npl.figure(2)\npl.clf()\npl |
d440 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 | .subplot(2,.1,.1)\nfor.i.in.rang |
d460 | 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 | e(n_distributions):\n....pl.plot |
d480 | 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 | (x,.A[:,.i])\npl.title('Distribu |
d4a0 | 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e | tions')\n\npl.subplot(2,.1,.2)\n |
d4c0 | 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | pl.plot(x,.bary_l2,.'r',.label=' |
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d500 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 | .label='Wasserstein')\npl.legend |
d520 | 28 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e | ()\npl.title('Barycenters')\npl. |
d540 | 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 | tight_layout()".......].....},.. |
d560 | 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 | ...{......."cell_type":."markdow |
d580 | 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 | n",......."metadata":.{},....... |
d5a0 | 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 42 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 | "source":.[........."Barycentric |
d5c0 | 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .interpolation\n---------------- |
d5e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 | ---------\n\n".......].....},... |
d600 | 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 | ..{......."cell_type":."code",.. |
d620 | 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 | ....."execution_count":.null,... |
d640 | 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 | ...."metadata":.{........."colla |
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d6a0 | 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 | ....."#%%.barycenter.interpolati |
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d6e0 | 20 6e 70 2e 6c 69 6e 73 70 61 63 65 28 30 2c 20 31 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 5c 6e 5c 6e 5c | .np.linspace(0,.1,.n_alpha)\n\n\ |
d700 | 6e 42 5f 6c 32 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 29 5c 6e | nB_l2.=.np.zeros((n,.n_alpha))\n |
d720 | 5c 6e 42 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 70 79 28 42 5f 6c 32 29 5c 6e 5c 6e 66 6f 72 20 | \nB_wass.=.np.copy(B_l2)\n\nfor. |
d740 | 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 30 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 61 6c 70 | i.in.range(0,.n_alpha):\n....alp |
d760 | 68 61 20 3d 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5b 69 5d 5c 6e 20 20 20 20 77 65 69 67 68 74 73 20 | ha.=.alpha_list[i]\n....weights. |
d780 | 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 5c 6e | =.np.array([1.-.alpha,.alpha])\n |
d7a0 | 20 20 20 20 42 5f 6c 32 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c | ....B_l2[:,.i].=.A.dot(weights)\ |
d7c0 | 6e 20 20 20 20 42 5f 77 61 73 73 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 | n....B_wass[:,.i].=.ot.bregman.b |
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d800 | 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 | n#%%.plot.interpolation\n\npl.fi |
d820 | 67 75 72 65 28 33 29 5c 6e 5c 6e 63 6d 61 70 20 3d 20 70 6c 2e 63 6d 2e 67 65 74 5f 63 6d 61 70 | gure(3)\n\ncmap.=.pl.cm.get_cmap |
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d860 | 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5c 6e 66 6f 72 20 69 2c 20 7a 20 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 | pha_list\nfor.i,.z.in.enumerate( |
d880 | 7a 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 79 73 20 3d 20 42 5f 6c 32 5b 3a 2c 20 69 5d 5c 6e 20 20 20 20 76 | zs):\n....ys.=.B_l2[:,.i]\n....v |
d8a0 | 65 72 74 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 6c 69 73 74 28 7a 69 70 28 78 2c 20 79 73 29 29 29 5c 6e 5c | erts.append(list(zip(x,.ys)))\n\ |
d8c0 | 6e 61 78 20 3d 20 70 6c 2e 67 63 66 28 29 2e 67 63 61 28 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 3d 27 33 | nax.=.pl.gcf().gca(projection='3 |
d8e0 | 64 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6f 6c 79 20 3d 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 28 76 65 72 | d')\n\npoly.=.PolyCollection(ver |
d900 | 74 73 2c 20 66 61 63 65 63 6f 6c 6f 72 73 3d 5b 63 6d 61 70 28 61 29 20 66 6f 72 20 61 20 69 6e | ts,.facecolors=[cmap(a).for.a.in |
d920 | 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5d 29 5c 6e 70 6f 6c 79 2e 73 65 74 5f 61 6c 70 68 61 28 30 2e | .alpha_list])\npoly.set_alpha(0. |
d940 | 37 29 5c 6e 61 78 2e 61 64 64 5f 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 33 64 28 70 6f 6c 79 2c 20 7a 73 | 7)\nax.add_collection3d(poly,.zs |
d960 | 3d 7a 73 2c 20 7a 64 69 72 3d 27 79 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 61 62 65 6c 28 27 78 | =zs,.zdir='y')\nax.set_xlabel('x |
d980 | 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 6e 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f | ')\nax.set_xlim3d(0,.n)\nax.set_ |
d9a0 | 79 6c 61 62 65 6c 28 27 24 5c 5c 5c 5c 61 6c 70 68 61 24 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c | ylabel('$\\\\alpha$')\nax.set_yl |
d9c0 | 69 6d 33 64 28 30 2c 20 31 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 61 62 65 6c 28 27 27 29 5c 6e 61 | im3d(0,.1)\nax.set_zlabel('')\na |
d9e0 | 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 42 5f 6c 32 2e 6d 61 78 28 29 20 2a 20 31 2e 30 | x.set_zlim3d(0,.B_l2.max().*.1.0 |
da00 | 31 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f | 1)\npl.title('Barycenter.interpo |
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ea80 | 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c | pl.yticks([])\npl.legend(loc=0)\ |
eaa0 | 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e | npl.title('Source..samples')\n\n |
eac0 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 | pl.subplot(1,.2,.2)\npl.scatter( |
eae0 | 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 | Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker |
eb00 | 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 | ='o',.label='Target.samples')\np |
eb20 | 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e | l.xticks([])\npl.yticks([])\npl. |
eb40 | 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 | legend(loc=0)\npl.title('Target. |
eb60 | 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 | samples')\npl.tight_layout()"... |
eb80 | 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 | ....].....},.....{......."cell_t |
eba0 | 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 | ype":."markdown",......."metadat |
ebc0 | 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 | a":.{},......."source":.[....... |
ebe0 | 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 | .."Fig.2.:.plot.optimal.coupling |
ec00 | 73 20 61 6e 64 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d | s.and.transported.samples\n----- |
ec20 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
ec40 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 | -----------------\n\n".......].. |
ec60 | 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 | ...},.....{......."cell_type":." |
ec80 | 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 | code",......."execution_count":. |
eca0 | 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | null,......."metadata":.{....... |
ecc0 | 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 | .."collapsed":.false.......},... |
ece0 | 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 | ...."outputs":.[],......."source |
ed00 | 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 20 3d 20 7b 27 69 6e 74 65 | ":.[........."param_img.=.{'inte |
ed20 | 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 27 3a 20 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 7d 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 | rpolation':.'nearest'}\n\npl.fig |
ed40 | 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 35 2c 20 38 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 | ure(2,.figsize=(15,.8))\npl.subp |
ed60 | 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 | lot(2,.4,.1)\npl.imshow(ot_emd.c |
ed80 | 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b | oupling_,.**param_img)\npl.xtick |
eda0 | 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | s([])\npl.yticks([])\npl.title(' |
edc0 | 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 | Optimal.coupling\\nEMDTransport' |
ede0 | 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 | )\n\npl.subplot(2,.4,.2)\npl.ims |
ee00 | 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 | how(ot_sinkhorn.coupling_,.**par |
ee20 | 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b | am_img)\npl.xticks([])\npl.ytick |
ee40 | 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e | s([])\npl.title('Optimal.couplin |
ee60 | 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 | g\\nSinkhornTransport')\n\npl.su |
ee80 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c | bplot(2,.4,.3)\npl.imshow(ot_lpl |
eea0 | 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 | 1.coupling_,.**param_img)\npl.xt |
eec0 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c | icks([])\npl.yticks([])\npl.titl |
eee0 | 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 | e('Optimal.coupling\\nSinkhornLp |
ef00 | 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 | l1Transport')\n\npl.subplot(2,.4 |
ef20 | 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 | ,.4)\npl.imshow(ot_l1l2.coupling |
ef40 | 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e | _,.**param_img)\npl.xticks([])\n |
ef60 | 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c | pl.yticks([])\npl.title('Optimal |
ef80 | 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f 72 | .coupling\\nSinkhornL1l2Transpor |
efa0 | 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 | t')\n\npl.subplot(2,.4,.5)\npl.s |
efc0 | 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c | catter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt, |
efe0 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | .marker='o',\n...........label=' |
f000 | 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e | Target.samples',.alpha=0.3)\npl. |
f020 | 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 | scatter(transp_Xs_emd[:,.0],.tra |
f040 | 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 | nsp_Xs_emd[:,.1],.c=ys,\n....... |
f060 | 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 | ....marker='+',.label='Transp.sa |
f080 | 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c | mples',.s=30)\npl.xticks([])\npl |
f0a0 | 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 | .yticks([])\npl.title('Transport |
f0c0 | 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e | ed.samples\\nEmdTransport')\npl. |
f0e0 | 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 5c 22 6c 6f 77 65 72 20 6c 65 66 74 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | legend(loc=\"lower.left\")\n\npl |
f100 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 36 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 | .subplot(2,.4,.6)\npl.scatter(Xt |
f120 | 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 | [:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker=' |
f140 | 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 | o',\n...........label='Target.sa |
f160 | 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 | mples',.alpha=0.3)\npl.scatter(t |
f180 | 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f | ransp_Xs_sinkhorn[:,.0],.transp_ |
f1a0 | 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 | Xs_sinkhorn[:,.1],.c=ys,\n...... |
f1c0 | 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 | .....marker='+',.label='Transp.s |
f1e0 | 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 | amples',.s=30)\npl.xticks([])\np |
f200 | 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 | l.yticks([])\npl.title('Transpor |
f220 | 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 | ted.samples\\nSinkhornTransport' |
f240 | 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 37 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 | )\n\npl.subplot(2,.4,.7)\npl.sca |
f260 | 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d | tter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.m |
f280 | 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 | arker='o',\n...........label='Ta |
f2a0 | 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 | rget.samples',.alpha=0.3)\npl.sc |
f2c0 | 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e | atter(transp_Xs_lpl1[:,.0],.tran |
f2e0 | 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 | sp_Xs_lpl1[:,.1],.c=ys,\n....... |
f300 | 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 | ....marker='+',.label='Transp.sa |
f320 | 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c | mples',.s=30)\npl.xticks([])\npl |
f340 | 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 | .yticks([])\npl.title('Transport |
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11a40 | 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c | label('Red')\npl.ylabel('Blue')\ |
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11ae0 | 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 65 64 20 69 | ":.[........."Plot.transformed.i |
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11c20 | 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 27 | pl.axis('off')\npl.title('Im..1' |
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11cc0 | 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 | ('off')\npl.title('EmdTransport' |
11ce0 | 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 | )\n\npl.subplot(2,.3,.5)\npl.ims |
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13620 | 74 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 | t.matrices\npl.figure(2,.figsize |
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13660 | 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 31 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 | npl.imshow(M1,.interpolation='ne |
13680 | 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 | arest')\npl.title('Euclidean.cos |
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136c0 | 6d 73 68 6f 77 28 4d 32 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 | mshow(M2,.interpolation='nearest |
136e0 | 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 | ')\npl.title('Squared.Euclidean. |
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13720 | 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 70 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 | l.imshow(Mp,.interpolation='near |
13740 | 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 | est')\npl.title('Sqrt.Euclidean. |
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13780 | 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 | .].....},.....{......."cell_type |
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137c0 | 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 | .{},......."source":.[........." |
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13820 | 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c | ......].....},.....{......."cell |
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138a0 | 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 | ....},......."outputs":.[],..... |
138c0 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e | .."source":.[........."#%%.EMD\n |
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139e0 | 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c | plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr',.l |
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13a20 | 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c | 'equal')\n#.pl.legend(loc=0)\npl |
13a40 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 | .title('OT.Euclidean')\n\npl.sub |
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13a80 | 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 32 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c | mples_mat(xs,.xt,.G2,.c=[.5,..5, |
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13ae0 | 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 | npl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr |
13b00 | 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 | ',.label='Target.samples')\npl.a |
13b20 | 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 | xis('equal')\n#.pl.legend(loc=0) |
13b40 | 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e | \npl.title('OT.squared.Euclidean |
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13c20 | 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c 2e 6c | ples')\npl.axis('equal')\n#.pl.l |
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13c80 | 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 | \npl.show()".......].....},..... |
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13cc0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f | ......."metadata":.{},......."so |
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13d20 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 | --------\n\n".......].....},.... |
13d40 | 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 | .{......."cell_type":."code",... |
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13e00 | 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 20 2b 20 31 2c 20 32 29 29 5c 6e 78 74 6f 74 5b 3a 2c 20 | =.np.zeros((n.+.1,.2))\nxtot[:,. |
13e20 | 30 5d 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 73 28 5c 6e 20 20 20 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 20 2b | 0].=.np.cos(\n....(np.arange(n.+ |
13e40 | 20 31 29 20 2b 20 31 2e 30 29 20 2a 20 30 2e 39 20 2f 20 28 6e 20 2b 20 32 29 20 2a 20 32 20 2a | .1).+.1.0).*.0.9./.(n.+.2).*.2.* |
13e60 | 20 6e 70 2e 70 69 29 5c 6e 78 74 6f 74 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 6e 70 2e 73 69 6e 28 5c 6e 20 | .np.pi)\nxtot[:,.1].=.np.sin(\n. |
13e80 | 20 20 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 20 2b 20 31 29 20 2b 20 31 2e 30 29 20 2a 20 30 2e | ...(np.arange(n.+.1).+.1.0).*.0. |
13ea0 | 39 20 2f 20 28 6e 20 2b 20 32 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 29 5c 6e 5c 6e 78 73 20 3d | 9./.(n.+.2).*.2.*.np.pi)\n\nxs.= |
13ec0 | 20 78 74 6f 74 5b 3a 6e 2c 20 3a 5d 5c 6e 78 74 20 3d 20 78 74 6f 74 5b 31 3a 2c 20 3a 5d 5c 6e | .xtot[:n,.:]\nxt.=.xtot[1:,.:]\n |
13ee0 | 5c 6e 61 2c 20 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 2c 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 20 | \na,.b.=.ot.unif(n),.ot.unif(n). |
13f00 | 20 23 20 75 6e 69 66 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 61 6d 70 6c | .#.uniform.distribution.on.sampl |
13f20 | 65 73 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 | es\n\n#.loss.matrix\nM1.=.ot.dis |
13f40 | 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d | t(xs,.xt,.metric='euclidean')\nM |
13f60 | 31 20 2f 3d 20 4d 31 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e | 1./=.M1.max()\n\n#.loss.matrix\n |
13f80 | 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 | M2.=.ot.dist(xs,.xt,.metric='sqe |
13fa0 | 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 | uclidean')\nM2./=.M2.max()\n\n#. |
13fc0 | 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 70 20 3d 20 6e 70 2e 73 71 72 74 28 6f 74 2e 64 69 73 | loss.matrix\nMp.=.np.sqrt(ot.dis |
13fe0 | 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 29 5c 6e | t(xs,.xt,.metric='euclidean'))\n |
14000 | 4d 70 20 2f 3d 20 4d 70 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 44 61 74 61 5c 6e 70 6c 2e 66 | Mp./=.Mp.max()\n\n\n#.Data\npl.f |
14020 | 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 | igure(4,.figsize=(7,.3))\npl.clf |
14040 | 28 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | ()\npl.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],. |
14060 | 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 | '+b',.label='Source.samples')\np |
14080 | 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c | l.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr', |
140a0 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 | .label='Target.samples')\npl.axi |
140c0 | 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 | s('equal')\npl.title('Source.and |
140e0 | 20 74 72 61 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 43 | .traget.distributions')\n\n\n#.C |
14100 | 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 2c 20 66 69 67 73 69 | ost.matrices\npl.figure(5,.figsi |
14120 | 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 | ze=(7,.3))\n\npl.subplot(1,.3,.1 |
14140 | 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 31 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 | )\npl.imshow(M1,.interpolation=' |
14160 | 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 | nearest')\npl.title('Euclidean.c |
14180 | 6f 73 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c | ost')\n\npl.subplot(1,.3,.2)\npl |
141a0 | 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 32 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 | .imshow(M2,.interpolation='neare |
141c0 | 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 | st')\npl.title('Squared.Euclidea |
141e0 | 6e 20 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 5c | n.cost')\n\npl.subplot(1,.3,.3)\ |
14200 | 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 70 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 | npl.imshow(Mp,.interpolation='ne |
14220 | 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 | arest')\npl.title('Sqrt.Euclidea |
14240 | 6e 20 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 | n.cost')\npl.tight_layout()".... |
14260 | 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 | ...].....},.....{......."cell_ty |
14280 | 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 | pe":."markdown",......."metadata |
142a0 | 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 | ":.{},......."source":.[........ |
142c0 | 20 22 44 61 74 61 73 65 74 20 32 20 3a 20 50 6c 6f 74 20 20 4f 54 20 4d 61 74 72 69 63 65 73 5c | ."Dataset.2.:.Plot..OT.Matrices\ |
142e0 | 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e | n-----------------------------\n |
14300 | 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 | \n".......].....},.....{......." |
14320 | 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 | cell_type":."code",......."execu |
14340 | 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 | tion_count":.null,......."metada |
14360 | 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 | ta":.{........."collapsed":.fals |
14380 | 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a | e.......},......."outputs":.[],. |
143a0 | 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 | ......"source":.[........."#%%.E |
143c0 | 4d 44 5c 6e 47 31 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 31 29 5c 6e 47 32 20 3d 20 | MD\nG1.=.ot.emd(a,.b,.M1)\nG2.=. |
143e0 | 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 32 29 5c 6e 47 70 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c | ot.emd(a,.b,.M2)\nGp.=.ot.emd(a, |
14400 | 20 62 2c 20 4d 70 29 5c 6e 5c 6e 23 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 | .b,.Mp)\n\n#.OT.matrices\npl.fig |
14420 | 75 72 65 28 36 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 | ure(6,.figsize=(7,.3))\n\npl.sub |
14440 | 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 | plot(1,.3,.1)\not.plot.plot2D_sa |
14460 | 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 31 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c | mples_mat(xs,.xt,.G1,.c=[.5,..5, |
14480 | 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d | .1])\npl.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1] |
144a0 | 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c | ,.'+b',.label='Source.samples')\ |
144c0 | 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 | npl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr |
144e0 | 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 | ',.label='Target.samples')\npl.a |
14500 | 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 | xis('equal')\n#.pl.legend(loc=0) |
14520 | 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | \npl.title('OT.Euclidean')\n\npl |
14540 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 | .subplot(1,.3,.2)\not.plot.plot2 |
14560 | 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 32 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c | D_samples_mat(xs,.xt,.G2,.c=[.5, |
14580 | 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a | ..5,.1])\npl.plot(xs[:,.0],.xs[: |
145a0 | 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 | ,.1],.'+b',.label='Source.sample |
145c0 | 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c | s')\npl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1], |
145e0 | 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e | .'xr',.label='Target.samples')\n |
14600 | 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f | pl.axis('equal')\n#.pl.legend(lo |
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15680 | 20 20 20 20 20 20 20 20 22 44 69 72 61 63 20 44 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c | ........"Dirac.Data\n----------\ |
156a0 | 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | n\n".......].....},.....{....... |
156c0 | 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 | "cell_type":."code",......."exec |
156e0 | 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 | ution_count":.null,......."metad |
15700 | 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c | ata":.{........."collapsed":.fal |
15720 | 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c | se.......},......."outputs":.[], |
15740 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 | ......."source":.[........."#%%. |
15760 | 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 61 31 20 3d 20 31 2e 30 20 2a 20 28 78 20 3e 20 31 30 | parameters\n\na1.=.1.0.*.(x.>.10 |
15780 | 29 20 2a 20 28 78 20 3c 20 35 30 29 5c 6e 61 32 20 3d 20 31 2e 30 20 2a 20 28 78 20 3e 20 36 30 | ).*.(x.<.50)\na2.=.1.0.*.(x.>.60 |
157a0 | 29 20 2a 20 28 78 20 3c 20 38 30 29 5c 6e 5c 6e 61 31 20 2f 3d 20 61 31 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e | ).*.(x.<.80)\n\na1./=.a1.sum()\n |
157c0 | 61 32 20 2f 3d 20 61 32 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 63 72 65 61 74 69 6e 67 20 6d 61 74 | a2./=.a2.sum()\n\n#.creating.mat |
157e0 | 72 69 78 20 41 20 63 6f 6e 74 61 69 6e 69 6e 67 20 61 6c 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f | rix.A.containing.all.distributio |
15800 | 6e 73 5c 6e 41 20 3d 20 6e 70 2e 76 73 74 61 63 6b 28 28 61 31 2c 20 61 32 29 29 2e 54 5c 6e 6e | ns\nA.=.np.vstack((a1,.a2)).T\nn |
15820 | 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 3d 20 41 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 5c 6e 5c 6e 23 | _distributions.=.A.shape[1]\n\n# |
15840 | 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 20 2b 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 4d 20 | .loss.matrix.+.normalization\nM. |
15860 | 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 64 69 73 74 30 28 6e 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 | =.ot.utils.dist0(n)\nM./=.M.max( |
15880 | 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e | )\n\n\n#%%.plot.the.distribution |
158a0 | 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 | s\n\npl.figure(1,.figsize=(6.4,. |
158c0 | 33 29 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 | 3))\nfor.i.in.range(n_distributi |
158e0 | 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e | ons):\n....pl.plot(x,.A[:,.i])\n |
15900 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 | pl.title('Distributions')\npl.ti |
15920 | 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 | ght_layout()\n\n\n#%%.barycenter |
15940 | 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 61 6c 70 68 61 20 3d 20 30 2e 35 20 20 23 20 30 | .computation\n\nalpha.=.0.5..#.0 |
15960 | 3c 3d 61 6c 70 68 61 3c 3d 31 5c 6e 77 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b | <=alpha<=1\nweights.=.np.array([ |
15980 | 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 32 62 61 72 79 5c 6e | 1.-.alpha,.alpha])\n\n#.l2bary\n |
159a0 | 62 61 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 77 61 | bary_l2.=.A.dot(weights)\n\n#.wa |
159c0 | 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 5c | sserstein\nreg.=.1e-3\not.tic()\ |
159e0 | 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 | nbary_wass.=.ot.bregman.barycent |
15a00 | 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 | er(A,.M,.reg,.weights)\not.toc() |
15a20 | 5c 6e 5c 6e 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 20 3d 20 6f 74 2e | \n\n\not.tic()\nbary_wass2.=.ot. |
15a40 | 6c 70 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 2c 20 73 6f 6c | lp.barycenter(A,.M,.weights,.sol |
15a60 | 76 65 72 3d 27 69 6e 74 65 72 69 6f 72 2d 70 6f 69 6e 74 27 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 | ver='interior-point',.verbose=Tr |
15a80 | 75 65 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 2e 61 70 70 65 | ue)\not.toc()\n\n\nproblems.appe |
15aa0 | 6e 64 28 5b 41 2c 20 5b 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 62 61 72 79 | nd([A,.[bary_l2,.bary_wass,.bary |
15ac0 | 5f 77 61 73 73 32 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c | _wass2]])\n\npl.figure(2)\npl.cl |
15ae0 | 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 | f()\npl.subplot(2,.1,.1)\nfor.i. |
15b00 | 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 | in.range(n_distributions):\n.... |
15b20 | 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 | pl.plot(x,.A[:,.i])\npl.title('D |
15b40 | 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 | istributions')\n\npl.subplot(2,. |
15b60 | 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c 20 | 1,.2)\npl.plot(x,.bary_l2,.'r',. |
15b80 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 | label='l2')\npl.plot(x,.bary_was |
15ba0 | 73 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 52 65 67 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 | s,.'g',.label='Reg.Wasserstein') |
15bc0 | 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 | \npl.plot(x,.bary_wass2,.'b',.la |
15be0 | 62 65 6c 3d 27 4c 50 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 | bel='LP.Wasserstein')\npl.legend |
15c00 | 28 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e | ()\npl.title('Barycenters')\npl. |
15c20 | 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 | tight_layout()\n\n#%%.parameters |
15c40 | 5c 6e 5c 6e 61 31 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 6e 29 5c 6e 61 32 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 | \n\na1.=.np.zeros(n)\na2.=.np.ze |
15c60 | 72 6f 73 28 6e 29 5c 6e 5c 6e 61 31 5b 31 30 5d 20 3d 20 2e 32 35 5c 6e 61 31 5b 32 30 5d 20 3d | ros(n)\n\na1[10].=..25\na1[20].= |
15c80 | 20 2e 35 5c 6e 61 31 5b 33 30 5d 20 3d 20 2e 32 35 5c 6e 61 32 5b 38 30 5d 20 3d 20 31 5c 6e 5c | ..5\na1[30].=..25\na2[80].=.1\n\ |
15ca0 | 6e 5c 6e 61 31 20 2f 3d 20 61 31 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e 61 32 20 2f 3d 20 61 32 2e 73 75 6d 28 | n\na1./=.a1.sum()\na2./=.a2.sum( |
15cc0 | 29 5c 6e 5c 6e 23 20 63 72 65 61 74 69 6e 67 20 6d 61 74 72 69 78 20 41 20 63 6f 6e 74 61 69 6e | )\n\n#.creating.matrix.A.contain |
15ce0 | 69 6e 67 20 61 6c 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 41 20 3d 20 6e 70 2e 76 73 | ing.all.distributions\nA.=.np.vs |
15d00 | 74 61 63 6b 28 28 61 31 2c 20 61 32 29 29 2e 54 5c 6e 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e | tack((a1,.a2)).T\nn_distribution |
15d20 | 73 20 3d 20 41 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 20 | s.=.A.shape[1]\n\n#.loss.matrix. |
15d40 | 2b 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 64 69 | +.normalization\nM.=.ot.utils.di |
15d60 | 73 74 30 28 6e 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c | st0(n)\nM./=.M.max()\n\n\n#%%.pl |
15d80 | 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 | ot.the.distributions\n\npl.figur |
15da0 | 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e | e(1,.figsize=(6.4,.3))\nfor.i.in |
15dc0 | 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c | .range(n_distributions):\n....pl |
15de0 | 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 | .plot(x,.A[:,.i])\npl.title('Dis |
15e00 | 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c | tributions')\npl.tight_layout()\ |
15e20 | 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 5c | n\n\n#%%.barycenter.computation\ |
15e40 | 6e 5c 6e 61 6c 70 68 61 20 3d 20 30 2e 35 20 20 23 20 30 3c 3d 61 6c 70 68 61 3c 3d 31 5c 6e 77 | n\nalpha.=.0.5..#.0<=alpha<=1\nw |
15e60 | 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c | eights.=.np.array([1.-.alpha,.al |
15e80 | 70 68 61 5d 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 32 62 61 72 79 5c 6e 62 61 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 41 2e 64 | pha])\n\n#.l2bary\nbary_l2.=.A.d |
15ea0 | 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 5c 6e 72 65 | ot(weights)\n\n#.wasserstein\nre |
15ec0 | 67 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 20 3d 20 | g.=.1e-3\not.tic()\nbary_wass.=. |
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198e0 | 61 72 5c 22 2c 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 38 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 | ar\",.mu=1e0,.eta=1e-8,.bias=Tru |
19900 | 65 2c 5c 6e 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 | e,\n....max_iter=20,.verbose=Tru |
19920 | 65 29 5c 6e 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 | e)\n\not_mapping_linear.fit(Xs=X |
19940 | 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 72 | s,.Xt=Xt)\n\n#.for.original.sour |
19960 | 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 62 61 | ce.samples,.transform.applies.ba |
19980 | 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e | rycentric.mapping\ntransp_Xs_lin |
199a0 | 65 61 72 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 | ear.=.ot_mapping_linear.transfor |
199c0 | 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 65 20 | m(Xs=Xs)\n\n#.for.out.of.source. |
199e0 | 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 74 68 65 20 6c | samples,.transform.applies.the.l |
19a00 | 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f | inear.mapping\ntransp_Xs_linear_ |
19a20 | 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 | new.=.ot_mapping_linear.transfor |
19a40 | 6d 28 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 77 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 | m(Xs=Xs_new)\n\n\n#.MappingTrans |
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19a80 | 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 | pping_gaussian.=.ot.da.MappingTr |
19aa0 | 61 6e 73 70 6f 72 74 28 5c 6e 20 20 20 20 6b 65 72 6e 65 6c 3d 5c 22 67 61 75 73 73 69 61 6e 5c | ansport(\n....kernel=\"gaussian\ |
19ac0 | 22 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 35 2c 20 6d 75 3d 31 65 2d 31 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c | ",.eta=1e-5,.mu=1e-1,.bias=True, |
19ae0 | 20 73 69 67 6d 61 3d 31 2c 5c 6e 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 2c 20 76 65 72 62 | .sigma=1,\n....max_iter=10,.verb |
19b00 | 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 66 | ose=True)\not_mapping_gaussian.f |
19b20 | 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 69 6e | it(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n#.for.origin |
19b40 | 61 6c 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 | al.source.samples,.transform.app |
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19ba0 | 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 75 74 | an.transform(Xs=Xs)\n\n#.for.out |
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19c00 | 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f | sp_Xs_gaussian_new.=.ot_mapping_ |
19c20 | 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 77 29 22 0a 20 | gaussian.transform(Xs=Xs_new)".. |
19c40 | 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f | .....].....},.....{......."cell_ |
19c60 | 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 | type":."markdown",......."metada |
19c80 | 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 | ta":.{},......."source":.[...... |
19ca0 | 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d | ..."Plot.transported.samples\n-- |
19cc0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 | ----------------------\n\n"..... |
19ce0 | 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 | ..].....},.....{......."cell_typ |
19d00 | 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 | e":."code",......."execution_cou |
19d20 | 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 | nt":.null,......."metadata":.{.. |
19d40 | 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 | ......."collapsed":.false....... |
19d60 | 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 | },......."outputs":.[],......."s |
19d80 | 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c | ource":.[........."pl.figure(2)\ |
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19dc0 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 | pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c |
19de0 | 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 | =yt,.marker='o',\n...........lab |
19e00 | 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e | el='Target.samples',.alpha=.2)\n |
19e20 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5b 3a 2c 20 30 | pl.scatter(transp_Xs_linear[:,.0 |
19e40 | 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c | ],.transp_Xs_linear[:,.1],.c=ys, |
19e60 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | .marker='+',\n...........label=' |
19e80 | 4d 61 70 70 65 64 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c | Mapped.source.samples')\npl.titl |
19ea0 | 65 28 5c 22 42 61 72 79 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 5c 22 29 5c 6e 70 | e(\"Bary..mapping.(linear)\")\np |
19ec0 | 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | l.legend(loc=0)\n\npl.subplot(2, |
19ee0 | 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b | .2,.2)\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[ |
19f00 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 | :,.1],.c=yt,.marker='o',\n...... |
19f20 | 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 | .....label='Target.samples',.alp |
19f40 | 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e | ha=.2)\npl.scatter(transp_Xs_lin |
19f60 | 65 61 72 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f | ear_new[:,.0],.transp_Xs_linear_ |
19f80 | 6e 65 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 | new[:,.1],\n...........c=ys,.mar |
19fa0 | 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 65 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 | ker='+',.label='Learned.mapping' |
19fc0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 45 73 74 69 6d 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 | )\npl.title(\"Estim..mapping.(li |
19fe0 | 6e 65 61 72 29 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c | near)\")\n\npl.subplot(2,.2,.3)\ |
1a000 | 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],. |
1a020 | 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 | c=yt,.marker='o',\n...........la |
1a040 | 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c | bel='Target.samples',.alpha=.2)\ |
1a060 | 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5b 3a | npl.scatter(transp_Xs_gaussian[: |
1a080 | 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | ,.0],.transp_Xs_gaussian[:,.1],. |
1a0a0 | 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 | c=ys,\n...........marker='+',.la |
1a0c0 | 62 65 6c 3d 27 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 | bel='barycentric.mapping')\npl.t |
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1aac0 | 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 | st(x.reshape((n,.1)),.x.reshape( |
1aae0 | 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d 32 20 2f 3d 20 4d | (n,.1)),.'sqeuclidean')\nM2./=.M |
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1aba0 | 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 | ..."cell_type":."code",......."e |
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1d3c0 | 6d 28 58 74 3d 58 32 29 5c 6e 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d | m(Xt=X2)\n\ntransp_Xs_sinkhorn.= |
1d3e0 | 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 5c 6e 74 | .ot_sinkhorn.transform(Xs=X1)\nt |
1d400 | 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e | ransp_Xt_sinkhorn.=.ot_sinkhorn. |
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1dba0 | 61 5f 64 32 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 2d 60 cb 4c a9 b8 76 f6 f8 19 | a_d2.ipynbPK..........-`.L..v... |
1dbc0 | 00 00 f8 19 00 00 1f 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 19 7a 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 | .....................z..plot_otd |
1dbe0 | 61 5f 73 65 6d 69 5f 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 | a_semi_supervised.ipynbPK....... |
1dc00 | 00 00 00 2d 60 cb 4c 27 4a df 9c 9d 0d 00 00 9d 0d 00 00 10 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 | ...-`.L'J....................... |
1dc20 | 81 4e 94 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 | .N...plot_OT_1D.ipynbPK......... |
1dc40 | 00 c0 5c 6f 4e 6b b3 7a d2 55 26 00 00 55 26 00 00 15 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 19 | ..\oNk.z.U&..U&................. |
1dc60 | a2 00 00 70 6c 6f 74 5f 73 74 6f 63 68 61 73 74 69 63 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 | ...plot_stochastic.ipynbPK...... |
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1dce0 | 00 00 00 00 00 00 b4 81 76 de 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6c 61 73 73 65 73 2e 69 70 | ........v...plot_otda_classes.ip |
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1dd20 | 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 d8 f6 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 5f 73 6d 6f 6f | .................plot_OT_1D_smoo |
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1dd60 | 3b 18 00 00 25 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 b7 07 01 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f | ;...%.................plot_otda_ |
1dd80 | 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 63 6f 6c 6f 72 73 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 | mapping_colors_images.ipynbPK... |
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1ddc0 | 00 00 00 b4 81 35 20 01 00 70 6c 6f 74 5f 66 72 65 65 5f 73 75 70 70 6f 72 74 5f 62 61 72 79 63 | .....5...plot_free_support_baryc |
1dde0 | 65 6e 74 65 72 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 2d 60 cb 4c 3e 1d 30 6f d5 | enter.ipynbPK..........-`.L>.0o. |
1de00 | 1a 00 00 d5 1a 00 00 16 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 57 2e 01 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 | .....................W...plot_OT |
1de20 | 5f 4c 31 5f 76 73 5f 4c 32 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 2d 60 cb 4c f9 | _L1_vs_L2.ipynbPK..........-`.L. |
1de40 | b0 b7 c4 b9 1d 00 00 b9 1d 00 00 24 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 60 49 01 00 70 6c 6f | ...........$.............`I..plo |
1de60 | 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 6c 70 5f 76 73 5f 65 6e 74 72 6f 70 69 63 2e 69 70 79 6e | t_barycenter_lp_vs_entropic.ipyn |
1de80 | 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 2d 60 cb 4c 17 38 53 24 28 10 00 00 28 10 00 00 18 00 00 | bPK..........-`.L.8S$(...(...... |
1dea0 | 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 5b 67 01 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 | ...........[g..plot_OT_2D_sample |
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1dee0 | 15 00 00 1e 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 b9 77 01 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6c | ..................w..plot_otda_l |
1df00 | 69 6e 65 61 72 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 2d | inear_mapping.ipynbPK..........- |
1df20 | 60 cb 4c 49 c5 7b 83 fa 16 00 00 fa 16 00 00 17 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 ff 8c 01 | `.LI.{.......................... |
1df40 | 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 | .plot_otda_mapping.ipynbPK...... |
1df60 | 00 00 00 00 2d 60 cb 4c e5 eb aa 89 7c 10 00 00 7c 10 00 00 16 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 | ....-`.L....|...|............... |
1df80 | b4 81 2e a4 01 00 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6d 70 75 74 65 5f 65 6d 64 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 | ......plot_compute_emd.ipynbPK.. |
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1dfc0 | 00 00 00 00 b4 81 de b4 01 00 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6e 76 6f 6c 75 74 69 6f 6e 61 6c 5f 62 61 72 | ..........plot_convolutional_bar |
1dfe0 | 79 63 65 6e 74 65 72 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 3c 5d 6f 4e a0 07 79 | ycenter.ipynbPK..........<]oN..y |
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1e020 | 6f 74 64 61 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 05 06 00 00 00 00 15 | otda_color_images.ipynbPK....... |
1e040 | 00 15 00 d6 05 00 00 61 da 01 00 00 00 | .......a..... |