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2e20 | 20 74 68 65 20 73 68 6f 72 74 65 73 74 5f 70 61 74 68 20 6d 61 74 72 69 78 20 63 6f 6d 69 6e 67 | .the.shortest_path.matrix.coming |
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2f60 | 6f 66 20 74 68 65 20 6c 69 6e 65 73 65 61 72 63 68 5c 6e 20 20 20 20 73 74 65 70 20 3a 20 69 6e | of.the.linesearch\n....step.:.in |
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2fa0 | 65 73 68 6f 6c 64 73 20 74 65 73 74 65 64 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 | esholds.tested\n....\"\"\"\n.... |
2fc0 | 64 69 73 74 20 3d 20 5b 5d 5c 6e 20 20 20 20 73 65 61 72 63 68 20 3d 20 6e 70 2e 6c 69 6e 73 70 | dist.=.[]\n....search.=.np.linsp |
2fe0 | 61 63 65 28 69 6e 66 2c 20 73 75 70 2c 20 73 74 65 70 29 5c 6e 20 20 20 20 66 6f 72 20 74 68 72 | ace(inf,.sup,.step)\n....for.thr |
3000 | 65 73 68 20 69 6e 20 73 65 61 72 63 68 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 43 70 72 69 6d 65 20 3d | esh.in.search:\n........Cprime.= |
3020 | 20 73 70 5f 74 6f 5f 61 64 6a 65 6e 63 79 28 43 2c 20 30 2c 20 74 68 72 65 73 68 29 5c 6e 20 20 | .sp_to_adjency(C,.0,.thresh)\n.. |
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3120 | 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 20 54 68 72 65 73 68 6f 6c 64 73 20 74 68 65 20 73 74 | ):\n....\"\"\".Thresholds.the.st |
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3180 | 61 6c 75 65 73 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 74 68 72 65 73 68 69 6e 66 20 61 6e 64 20 74 68 72 65 | alues.between.threshinf.and.thre |
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31c0 | 67 20 63 6f 6e 6e 65 63 74 65 64 20 6e 6f 64 65 73 20 61 6e 64 20 73 65 74 20 74 6f 20 31 2e 20 | g.connected.nodes.and.set.to.1.. |
31e0 | 45 6c 73 65 20 61 72 65 20 73 65 74 20 74 6f 20 30 5c 6e 20 20 20 20 50 61 72 61 6d 65 74 65 72 | Else.are.set.to.0\n....Parameter |
3200 | 73 5c 6e 20 20 20 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 20 20 20 20 43 20 3a 20 6e 64 61 72 72 | s\n....----------\n....C.:.ndarr |
3220 | 61 79 2c 20 73 68 61 70 65 20 28 6e 5f 6e 6f 64 65 73 2c 6e 5f 6e 6f 64 65 73 29 5c 6e 20 20 20 | ay,.shape.(n_nodes,n_nodes)\n... |
3240 | 20 20 20 20 20 54 68 65 20 73 74 72 75 63 74 75 72 65 20 6d 61 74 72 69 78 20 74 6f 20 74 68 72 | .....The.structure.matrix.to.thr |
3260 | 65 73 68 6f 6c 64 5c 6e 20 20 20 20 74 68 72 65 73 68 69 6e 66 20 3a 20 66 6c 6f 61 74 5c 6e 20 | eshold\n....threshinf.:.float\n. |
3280 | 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 6d 69 6e 69 6d 75 6d 20 76 61 6c 75 65 20 6f 66 20 64 69 73 74 | .......The.minimum.value.of.dist |
32a0 | 61 6e 63 65 20 66 72 6f 6d 20 77 68 69 63 68 20 74 68 65 20 6e 65 77 20 76 61 6c 75 65 20 69 73 | ance.from.which.the.new.value.is |
32c0 | 20 73 65 74 20 74 6f 20 31 5c 6e 20 20 20 20 74 68 72 65 73 68 73 75 70 20 3a 20 66 6c 6f 61 74 | .set.to.1\n....threshsup.:.float |
32e0 | 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 6d 61 78 69 6d 75 6d 20 76 61 6c 75 65 20 6f 66 20 64 | \n........The.maximum.value.of.d |
3300 | 69 73 74 61 6e 63 65 20 66 72 6f 6d 20 77 68 69 63 68 20 74 68 65 20 6e 65 77 20 76 61 6c 75 65 | istance.from.which.the.new.value |
3320 | 20 69 73 20 73 65 74 20 74 6f 20 31 5c 6e 20 20 20 20 52 65 74 75 72 6e 73 5c 6e 20 20 20 20 2d | .is.set.to.1\n....Returns\n....- |
3340 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 20 20 20 20 43 20 3a 20 6e 64 61 72 72 61 79 2c 20 73 68 61 70 65 20 28 | ------\n....C.:.ndarray,.shape.( |
3360 | 6e 5f 6e 6f 64 65 73 2c 6e 5f 6e 6f 64 65 73 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 74 68 | n_nodes,n_nodes)\n........The.th |
3380 | 72 65 73 68 6f 6c 64 20 6d 61 74 72 69 78 2e 20 45 61 63 68 20 65 6c 65 6d 65 6e 74 20 69 73 20 | reshold.matrix..Each.element.is. |
33a0 | 69 6e 20 7b 30 2c 31 7d 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 48 20 3d 20 6e 70 | in.{0,1}\n....\"\"\"\n....H.=.np |
33c0 | 2e 7a 65 72 6f 73 5f 6c 69 6b 65 28 43 29 5c 6e 20 20 20 20 6e 70 2e 66 69 6c 6c 5f 64 69 61 67 | .zeros_like(C)\n....np.fill_diag |
33e0 | 6f 6e 61 6c 28 48 2c 20 6e 70 2e 64 69 61 67 6f 6e 61 6c 28 43 29 29 5c 6e 20 20 20 20 43 20 3d | onal(H,.np.diagonal(C))\n....C.= |
3400 | 20 43 20 2d 20 48 5c 6e 20 20 20 20 43 20 3d 20 6e 70 2e 6d 69 6e 69 6d 75 6d 28 6e 70 2e 6d 61 | .C.-.H\n....C.=.np.minimum(np.ma |
3420 | 78 69 6d 75 6d 28 43 2c 20 74 68 72 65 73 68 69 6e 66 29 2c 20 74 68 72 65 73 68 73 75 70 29 5c | ximum(C,.threshinf),.threshsup)\ |
3440 | 6e 20 20 20 20 43 5b 43 20 3d 3d 20 74 68 72 65 73 68 73 75 70 5d 20 3d 20 30 5c 6e 20 20 20 20 | n....C[C.==.threshsup].=.0\n.... |
3460 | 43 5b 43 20 21 3d 20 30 5d 20 3d 20 31 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 43 5c 6e 5c | C[C.!=.0].=.1\n\n....return.C\n\ |
3480 | 6e 5c 6e 64 65 66 20 62 75 69 6c 64 5f 6e 6f 69 73 79 5f 63 69 72 63 75 6c 61 72 5f 67 72 61 70 | n\ndef.build_noisy_circular_grap |
34a0 | 68 28 4e 3d 32 30 2c 20 6d 75 3d 30 2c 20 73 69 67 6d 61 3d 30 2e 33 2c 20 77 69 74 68 5f 6e 6f | h(N=20,.mu=0,.sigma=0.3,.with_no |
34c0 | 69 73 65 3d 46 61 6c 73 65 2c 20 73 74 72 75 63 74 75 72 65 5f 6e 6f 69 73 65 3d 46 61 6c 73 65 | ise=False,.structure_noise=False |
34e0 | 2c 20 70 3d 4e 6f 6e 65 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 20 43 72 65 61 74 65 20 61 20 | ,.p=None):\n....\"\"\".Create.a. |
3500 | 6e 6f 69 73 79 20 63 69 72 63 75 6c 61 72 20 67 72 61 70 68 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 | noisy.circular.graph\n....\"\"\" |
3520 | 5c 6e 20 20 20 20 67 20 3d 20 6e 78 2e 47 72 61 70 68 28 29 5c 6e 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f | \n....g.=.nx.Graph()\n....g.add_ |
3540 | 6e 6f 64 65 73 5f 66 72 6f 6d 28 6c 69 73 74 28 72 61 6e 67 65 28 4e 29 29 29 5c 6e 20 20 20 20 | nodes_from(list(range(N)))\n.... |
3560 | 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 4e 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 6f 69 73 | for.i.in.range(N):\n........nois |
3580 | 65 20 3d 20 66 6c 6f 61 74 28 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 6e 6f 72 6d 61 6c 28 6d 75 2c 20 73 | e.=.float(np.random.normal(mu,.s |
35a0 | 69 67 6d 61 2c 20 31 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 77 69 74 68 5f 6e 6f 69 73 65 | igma,.1))\n........if.with_noise |
35c0 | 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 6e 6f 64 65 28 69 2c 20 61 74 74 | :\n............g.add_node(i,.att |
35e0 | 72 5f 6e 61 6d 65 3d 6d 61 74 68 2e 73 69 6e 28 28 32 20 2a 20 69 20 2a 20 6d 61 74 68 2e 70 69 | r_name=math.sin((2.*.i.*.math.pi |
3600 | 20 2f 20 4e 29 29 20 2b 20 6e 6f 69 73 65 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 5c 6e | ./.N)).+.noise)\n........else:\n |
3620 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 6e 6f 64 65 28 69 2c 20 61 74 74 72 5f 6e | ............g.add_node(i,.attr_n |
3640 | 61 6d 65 3d 6d 61 74 68 2e 73 69 6e 28 32 20 2a 20 69 20 2a 20 6d 61 74 68 2e 70 69 20 2f 20 4e | ame=math.sin(2.*.i.*.math.pi./.N |
3660 | 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 65 64 67 65 28 69 2c 20 69 20 2b 20 31 29 | ))\n........g.add_edge(i,.i.+.1) |
3680 | 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 73 74 72 75 63 74 75 72 65 5f 6e 6f 69 73 65 3a 5c 6e 20 | \n........if.structure_noise:\n. |
36a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 72 61 6e 64 6f 6d 69 6e 74 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d | ...........randomint.=.np.random |
36c0 | 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 30 2c 20 70 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 72 | .randint(0,.p)\n............if.r |
36e0 | 61 6e 64 6f 6d 69 6e 74 20 3d 3d 20 30 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | andomint.==.0:\n................ |
3700 | 69 66 20 69 20 3c 3d 20 4e 20 2d 20 33 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | if.i.<=.N.-.3:\n................ |
3720 | 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 65 64 67 65 28 69 2c 20 69 20 2b 20 32 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 | ....g.add_edge(i,.i.+.2)\n...... |
3740 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 69 20 3d 3d 20 4e 20 2d 20 32 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 | ..........if.i.==.N.-.2:\n...... |
3760 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 65 64 67 65 28 69 2c 20 30 29 5c 6e | ..............g.add_edge(i,.0)\n |
3780 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 69 20 3d 3d 20 4e 20 2d 20 31 3a 5c 6e | ................if.i.==.N.-.1:\n |
37a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 65 64 67 65 28 69 | ....................g.add_edge(i |
37c0 | 2c 20 31 29 5c 6e 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 65 64 67 65 28 4e 2c 20 30 29 5c 6e 20 20 20 20 | ,.1)\n....g.add_edge(N,.0)\n.... |
37e0 | 6e 6f 69 73 65 20 3d 20 66 6c 6f 61 74 28 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 6e 6f 72 6d 61 6c 28 6d | noise.=.float(np.random.normal(m |
3800 | 75 2c 20 73 69 67 6d 61 2c 20 31 29 29 5c 6e 20 20 20 20 69 66 20 77 69 74 68 5f 6e 6f 69 73 65 | u,.sigma,.1))\n....if.with_noise |
3820 | 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 6e 6f 64 65 28 4e 2c 20 61 74 74 72 5f 6e 61 | :\n........g.add_node(N,.attr_na |
3840 | 6d 65 3d 6d 61 74 68 2e 73 69 6e 28 28 32 20 2a 20 4e 20 2a 20 6d 61 74 68 2e 70 69 20 2f 20 4e | me=math.sin((2.*.N.*.math.pi./.N |
3860 | 29 29 20 2b 20 6e 6f 69 73 65 29 5c 6e 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 | )).+.noise)\n....else:\n........ |
3880 | 67 2e 61 64 64 5f 6e 6f 64 65 28 4e 2c 20 61 74 74 72 5f 6e 61 6d 65 3d 6d 61 74 68 2e 73 69 6e | g.add_node(N,.attr_name=math.sin |
38a0 | 28 32 20 2a 20 4e 20 2a 20 6d 61 74 68 2e 70 69 20 2f 20 4e 29 29 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 | (2.*.N.*.math.pi./.N))\n....retu |
38c0 | 72 6e 20 67 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 67 72 61 70 68 5f 63 6f 6c 6f 72 73 28 6e 78 5f 67 72 | rn.g\n\n\ndef.graph_colors(nx_gr |
38e0 | 61 70 68 2c 20 76 6d 69 6e 3d 30 2c 20 76 6d 61 78 3d 37 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 63 6e 6f 72 6d | aph,.vmin=0,.vmax=7):\n....cnorm |
3900 | 20 3d 20 6d 63 6f 6c 2e 4e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 65 28 76 6d 69 6e 3d 76 6d 69 6e 2c 20 76 6d 61 | .=.mcol.Normalize(vmin=vmin,.vma |
3920 | 78 3d 76 6d 61 78 29 5c 6e 20 20 20 20 63 70 69 63 6b 20 3d 20 63 6d 2e 53 63 61 6c 61 72 4d 61 | x=vmax)\n....cpick.=.cm.ScalarMa |
3940 | 70 70 61 62 6c 65 28 6e 6f 72 6d 3d 63 6e 6f 72 6d 2c 20 63 6d 61 70 3d 27 76 69 72 69 64 69 73 | ppable(norm=cnorm,.cmap='viridis |
3960 | 27 29 5c 6e 20 20 20 20 63 70 69 63 6b 2e 73 65 74 5f 61 72 72 61 79 28 5b 5d 29 5c 6e 20 20 20 | ')\n....cpick.set_array([])\n... |
3980 | 20 76 61 6c 5f 6d 61 70 20 3d 20 7b 7d 5c 6e 20 20 20 20 66 6f 72 20 6b 2c 20 76 20 69 6e 20 6e | .val_map.=.{}\n....for.k,.v.in.n |
39a0 | 78 2e 67 65 74 5f 6e 6f 64 65 5f 61 74 74 72 69 62 75 74 65 73 28 6e 78 5f 67 72 61 70 68 2c 20 | x.get_node_attributes(nx_graph,. |
39c0 | 27 61 74 74 72 5f 6e 61 6d 65 27 29 2e 69 74 65 6d 73 28 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 76 | 'attr_name').items():\n........v |
39e0 | 61 6c 5f 6d 61 70 5b 6b 5d 20 3d 20 63 70 69 63 6b 2e 74 6f 5f 72 67 62 61 28 76 29 5c 6e 20 20 | al_map[k].=.cpick.to_rgba(v)\n.. |
3a00 | 20 20 63 6f 6c 6f 72 73 20 3d 20 5b 5d 5c 6e 20 20 20 20 66 6f 72 20 6e 6f 64 65 20 69 6e 20 6e | ..colors.=.[]\n....for.node.in.n |
3a20 | 78 5f 67 72 61 70 68 2e 6e 6f 64 65 73 28 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 63 6f 6c 6f 72 73 | x_graph.nodes():\n........colors |
3a40 | 2e 61 70 70 65 6e 64 28 76 61 6c 5f 6d 61 70 5b 6e 6f 64 65 5d 29 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 | .append(val_map[node])\n....retu |
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53c0 | 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 | egman.barycenter(A,.M,.reg,.weig |
53e0 | 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e | hts)\n\npl.figure(2)\npl.clf()\n |
5400 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 | pl.subplot(2,.1,.1)\nfor.i.in.ra |
5420 | 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c | nge(n_distributions):\n....pl.pl |
5440 | 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 | ot(x,.A[:,.i])\npl.title('Distri |
5460 | 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 | butions')\n\npl.subplot(2,.1,.2) |
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54e0 | 6e 64 28 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 70 | nd()\npl.title('Barycenters')\np |
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5580 | 69 63 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ic.interpolation\n-------------- |
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55c0 | 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c | ....{......."cell_type":."code", |
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5720 | 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 | s.=.np.array([1.-.alpha,.alpha]) |
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58a0 | 5f 6c 69 73 74 5c 6e 66 6f 72 20 69 2c 20 7a 20 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 7a 73 29 | _list\nfor.i,.z.in.enumerate(zs) |
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5980 | 6e 61 78 2e 61 64 64 5f 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 33 64 28 70 6f 6c 79 2c 20 7a 73 3d 7a 73 | nax.add_collection3d(poly,.zs=zs |
59a0 | 2c 20 7a 64 69 72 3d 27 79 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 61 62 65 6c 28 27 78 27 29 5c | ,.zdir='y')\nax.set_xlabel('x')\ |
59c0 | 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 6e 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 61 | nax.set_xlim3d(0,.n)\nax.set_yla |
59e0 | 62 65 6c 28 27 24 5c 5c 5c 5c 61 6c 70 68 61 24 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 69 6d 33 | bel('$\\\\alpha$')\nax.set_ylim3 |
5a00 | 64 28 30 2c 20 31 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 61 62 65 6c 28 27 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 | d(0,.1)\nax.set_zlabel('')\nax.s |
5a20 | 65 74 5f 7a 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 42 5f 6c 32 2e 6d 61 78 28 29 20 2a 20 31 2e 30 31 29 5c | et_zlim3d(0,.B_l2.max().*.1.01)\ |
5a40 | 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 | npl.title('Barycenter.interpolat |
5a60 | 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 6c 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 | ion.with.l2')\npl.tight_layout() |
5a80 | 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 29 5c 6e 63 6d 61 70 20 3d 20 70 6c 2e 63 6d 2e 67 | \n\npl.figure(4)\ncmap.=.pl.cm.g |
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5ac0 | 7a 73 20 3d 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5c 6e 66 6f 72 20 69 2c 20 7a 20 69 6e 20 65 6e 75 | zs.=.alpha_list\nfor.i,.z.in.enu |
5ae0 | 6d 65 72 61 74 65 28 7a 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 79 73 20 3d 20 42 5f 77 61 73 73 5b 3a 2c 20 | merate(zs):\n....ys.=.B_wass[:,. |
5b00 | 69 5d 5c 6e 20 20 20 20 76 65 72 74 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 6c 69 73 74 28 7a 69 70 28 78 2c | i]\n....verts.append(list(zip(x, |
5b20 | 20 79 73 29 29 29 5c 6e 5c 6e 61 78 20 3d 20 70 6c 2e 67 63 66 28 29 2e 67 63 61 28 70 72 6f 6a | .ys)))\n\nax.=.pl.gcf().gca(proj |
5b40 | 65 63 74 69 6f 6e 3d 27 33 64 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6f 6c 79 20 3d 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 | ection='3d')\n\npoly.=.PolyColle |
5b60 | 63 74 69 6f 6e 28 76 65 72 74 73 2c 20 66 61 63 65 63 6f 6c 6f 72 73 3d 5b 63 6d 61 70 28 61 29 | ction(verts,.facecolors=[cmap(a) |
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5ba0 | 5f 61 6c 70 68 61 28 30 2e 37 29 5c 6e 61 78 2e 61 64 64 5f 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 33 64 | _alpha(0.7)\nax.add_collection3d |
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65c0 | 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 | ...},.....{......."cell_type":." |
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6660 | 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 5c 6e 70 6c 2e 70 | ":.[........."pl.figure(1)\npl.p |
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6700 | 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 | 0)\npl.title('Source.and.target. |
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6740 | 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 | npl.imshow(M,.interpolation='nea |
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67a0 | 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 | ell_type":."markdown",......."me |
67c0 | 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 | tadata":.{},......."source":.[.. |
67e0 | 20 20 20 20 20 20 20 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 45 4d 44 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ......."Compute.EMD\n----------- |
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6900 | 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 | nearest')\npl.title('OT.matrix.G |
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6940 | 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 30 2c 20 63 3d 5b 2e | t2D_samples_mat(xs,.xt,.G0,.c=[. |
6960 | 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 | 5,..5,.1])\npl.plot(xs[:,.0],.xs |
6980 | 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 | [:,.1],.'+b',.label='Source.samp |
69a0 | 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 | les')\npl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1 |
69c0 | 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 | ],.'xr',.label='Target.samples') |
69e0 | 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 | \npl.legend(loc=0)\npl.title('OT |
6a00 | 20 6d 61 74 72 69 78 20 77 69 74 68 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a | .matrix.with.samples')".......]. |
6a20 | 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 | ....},.....{......."cell_type":. |
6a40 | 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d | "markdown",......."metadata":.{} |
6a60 | 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 43 6f 6d | ,......."source":.[........."Com |
6a80 | 70 75 74 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c | pute.Sinkhorn\n----------------\ |
6aa0 | 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | n\n".......].....},.....{....... |
6ac0 | 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 | "cell_type":."code",......."exec |
6ae0 | 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 | ution_count":.null,......."metad |
6b00 | 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c | ata":.{........."collapsed":.fal |
6b20 | 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c | se.......},......."outputs":.[], |
6b40 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 72 65 | ......."source":.[........."#.re |
6b60 | 67 20 74 65 72 6d 5c 6e 6c 61 6d 62 64 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 5c 6e 47 73 20 3d 20 6f 74 2e | g.term\nlambd.=.1e-3\n\nGs.=.ot. |
6b80 | 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 6c 61 6d 62 64 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 | sinkhorn(a,.b,.M,.lambd)\n\npl.f |
6ba0 | 69 67 75 72 65 28 35 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 73 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c | igure(5)\npl.imshow(Gs,.interpol |
6bc0 | 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d | ation='nearest')\npl.title('OT.m |
6be0 | 61 74 72 69 78 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 36 29 | atrix.sinkhorn')\n\npl.figure(6) |
6c00 | 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c | \not.plot.plot2D_samples_mat(xs, |
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6c40 | 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c | plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+b',.l |
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8b80 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 | pl.title('Barycenters')\npl.tigh |
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8bc0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a | ......."cell_type":."markdown",. |
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12d40 | 30 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | 0,\n............................ |
12d60 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 5f 6c 31 6c 32 | ..........verbose=True)\not_l1l2 |
12d80 | 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 | .fit(Xs=Xs,.ys=ys,.Xt=Xt)\n\n#.t |
12da0 | 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6f 6e 74 6f 20 74 61 72 | ransport.source.samples.onto.tar |
12dc0 | 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f | get.samples\ntransp_Xs_emd.=.ot_ |
12de0 | 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f | emd.transform(Xs=Xs)\ntransp_Xs_ |
12e00 | 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d | sinkhorn.=.ot_sinkhorn.transform |
12e20 | 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f 6c 70 6c | (Xs=Xs)\ntransp_Xs_lpl1.=.ot_lpl |
12e40 | 31 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 31 | 1.transform(Xs=Xs)\ntransp_Xs_l1 |
12e60 | 6c 32 20 3d 20 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 22 0a 20 | l2.=.ot_l1l2.transform(Xs=Xs)".. |
12e80 | 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f | .....].....},.....{......."cell_ |
12ea0 | 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 | type":."markdown",......."metada |
12ec0 | 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 | ta":.{},......."source":.[...... |
12ee0 | 20 20 20 22 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 | ..."Fig.1.:.plots.source.and.tar |
12f00 | 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | get.samples\n------------------- |
12f20 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 | --------------------\n\n"....... |
12f40 | 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 | ].....},.....{......."cell_type" |
12f60 | 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 | :."code",......."execution_count |
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12fa0 | 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c | ....."collapsed":.false.......}, |
12fc0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 | ......."outputs":.[],......."sou |
12fe0 | 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 | rce":.[........."pl.figure(1,.fi |
13000 | 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 35 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c | gsize=(10,.5))\npl.subplot(1,.2, |
13020 | 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 | .1)\npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:,. |
13040 | 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 | 1],.c=ys,.marker='+',.label='Sou |
13060 | 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c | rce.samples')\npl.xticks([])\npl |
13080 | 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 | .yticks([])\npl.legend(loc=0)\np |
130a0 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | l.title('Source..samples')\n\npl |
130c0 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 | .subplot(1,.2,.2)\npl.scatter(Xt |
130e0 | 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 | [:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker=' |
13100 | 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e | o',.label='Target.samples')\npl. |
13120 | 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 | xticks([])\npl.yticks([])\npl.le |
13140 | 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 | gend(loc=0)\npl.title('Target.sa |
13160 | 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 | mples')\npl.tight_layout()"..... |
13180 | 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 | ..].....},.....{......."cell_typ |
131a0 | 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 | e":."markdown",......."metadata" |
131c0 | 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 | :.{},......."source":.[......... |
131e0 | 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 | "Fig.2.:.plot.optimal.couplings. |
13200 | 61 6e 64 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | and.transported.samples\n------- |
13220 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
13240 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 | ---------------\n\n".......].... |
13260 | 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f | .},.....{......."cell_type":."co |
13280 | 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 | de",......."execution_count":.nu |
132a0 | 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 | ll,......."metadata":.{......... |
132c0 | 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 | "collapsed":.false.......},..... |
132e0 | 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a | .."outputs":.[],......."source": |
13300 | 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 20 3d 20 7b 27 69 6e 74 65 72 70 | .[........."param_img.=.{'interp |
13320 | 6f 6c 61 74 69 6f 6e 27 3a 20 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 7d 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 | olation':.'nearest'}\n\npl.figur |
13340 | 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 35 2c 20 38 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | e(2,.figsize=(15,.8))\npl.subplo |
13360 | 74 28 32 2c 20 34 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 | t(2,.4,.1)\npl.imshow(ot_emd.cou |
13380 | 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 | pling_,.**param_img)\npl.xticks( |
133a0 | 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 | [])\npl.yticks([])\npl.title('Op |
133c0 | 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c | timal.coupling\\nEMDTransport')\ |
133e0 | 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f | n\npl.subplot(2,.4,.2)\npl.imsho |
13400 | 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d | w(ot_sinkhorn.coupling_,.**param |
13420 | 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 | _img)\npl.xticks([])\npl.yticks( |
13440 | 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c | [])\npl.title('Optimal.coupling\ |
13460 | 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 | \nSinkhornTransport')\n\npl.subp |
13480 | 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e | lot(2,.4,.3)\npl.imshow(ot_lpl1. |
134a0 | 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 | coupling_,.**param_img)\npl.xtic |
134c0 | 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | ks([])\npl.yticks([])\npl.title( |
134e0 | 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 | 'Optimal.coupling\\nSinkhornLpl1 |
13500 | 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 | Transport')\n\npl.subplot(2,.4,. |
13520 | 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c | 4)\npl.imshow(ot_l1l2.coupling_, |
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13560 | 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 | .yticks([])\npl.title('Optimal.c |
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14620 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 | ----------------\n\n".......]... |
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146c0 | 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 | ..."outputs":.[],......."source" |
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147c0 | 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ,\n............................. |
147e0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 6f 67 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c | ....................log=True)\n\ |
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14860 | 63 20 70 61 72 74 69 61 6c 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 20 28 | c.partial.Wasserstein.distance.( |
14880 | 6d 20 3d 20 30 2e 35 29 3a 20 27 20 2b 5c 6e 20 20 20 20 20 20 73 74 72 28 6c 6f 67 5b 27 70 61 | m.=.0.5):.'.+\n......str(log['pa |
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14940 | 61 70 3d 27 6a 65 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 6e 74 72 6f 70 69 63 20 70 61 | ap='jet')\npl.title('Entropic.pa |
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14bc0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 | ......."outputs":.[],......."sou |
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14ce0 | 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 5b 31 2c 20 30 2c 20 30 5d 2c 20 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 5d 2c | .np.array([[1,.0,.0],.[0,.1,.0], |
14d00 | 20 5b 30 2c 20 30 2c 20 31 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 78 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 | .[0,.0,.1]])\n\n\nxs.=.ot.datase |
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14de0 | 50 29 20 2b 20 6d 75 5f 74 5c 6e 78 74 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 6e 63 61 74 65 6e 61 74 65 28 28 | P).+.mu_t\nxt.=.np.concatenate(( |
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14fe0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
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15020 | 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 | },.....{......."cell_type":."cod |
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151a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 6f 67 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 72 65 | ...................log=True)\nre |
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15220 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
15240 | 20 20 20 20 20 6d 3d 6d 2c 20 6c 6f 67 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 70 72 69 6e 74 28 27 50 61 | .....m=m,.log=True)\n\nprint('Pa |
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152a0 | 74 27 5d 29 29 5c 6e 70 72 69 6e 74 28 27 45 6e 74 72 6f 70 69 63 20 70 61 72 74 69 61 6c 20 57 | t']))\nprint('Entropic.partial.W |
152c0 | 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 20 28 6d 20 3d 20 31 29 3a 20 27 20 2b | asserstein.distance.(m.=.1):.'.+ |
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15300 | 27 5d 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 28 31 30 2c 20 35 29 29 5c 6e 70 | ']))\n\npl.figure(1,.(10,.5))\np |
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153a0 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 72 65 73 | .subplot(1,.2,.2)\npl.imshow(res |
153c0 | 2c 20 63 6d 61 70 3d 27 6a 65 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 6e 74 72 6f 70 69 | ,.cmap='jet')\npl.title('Entropi |
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15420 | 20 32 20 2f 20 33 5c 6e 72 65 73 30 2c 20 6c 6f 67 30 20 3d 20 6f 74 2e 70 61 72 74 69 61 6c 2e | .2./.3\nres0,.log0.=.ot.partial. |
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154e0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
15500 | 6d 3d 6d 2c 20 6c 6f 67 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 70 72 69 6e 74 28 27 50 61 72 74 69 61 6c | m=m,.log=True)\n\nprint('Partial |
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15540 | 20 27 20 2b 5c 6e 20 20 20 20 20 20 73 74 72 28 6c 6f 67 30 5b 27 70 61 72 74 69 61 6c 5f 67 77 | .'.+\n......str(log0['partial_gw |
15560 | 5f 64 69 73 74 27 5d 29 29 5c 6e 70 72 69 6e 74 28 27 45 6e 74 72 6f 70 69 63 20 70 61 72 74 69 | _dist']))\nprint('Entropic.parti |
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16fa0 | 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a | _count":.null,......."metadata": |
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16fe0 | 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 | ....},......."outputs":.[],..... |
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17080 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
170a0 | 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 29 5c 6e 70 72 69 6e 74 28 73 61 67 5f 70 69 29 22 0a 20 20 20 20 | numItermax)\nprint(sag_pi)"..... |
170c0 | 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 | ..].....},.....{......."cell_typ |
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171a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 44 65 66 69 | ------------------------\n\nDefi |
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173a0 | 2e 52 61 6e 64 6f 6d 53 74 61 74 65 28 30 29 5c 6e 58 5f 73 6f 75 72 63 65 20 3d 20 72 6e 67 2e | .RandomState(0)\nX_source.=.rng. |
173c0 | 72 61 6e 64 6e 28 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 2c 20 32 29 5c 6e 59 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 72 | randn(n_source,.2)\nY_target.=.r |
173e0 | 6e 67 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 5f 74 61 72 67 65 74 2c 20 32 29 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 | ng.randn(n_target,.2)\nM.=.ot.di |
17400 | 73 74 28 58 5f 73 6f 75 72 63 65 2c 20 59 5f 74 61 72 67 65 74 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a | st(X_source,.Y_target)".......]. |
17420 | 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 | ....},.....{......."cell_type":. |
17440 | 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d | "markdown",......."metadata":.{} |
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174a0 | 65 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 61 74 69 6f 6e 20 6d 61 74 72 69 78 20 69 6e 20 74 68 65 20 73 | e.transportation.matrix.in.the.s |
174c0 | 65 6d 69 63 6f 6e 74 69 6e 6f 75 73 5c 6e 63 61 73 65 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | emicontinous\ncase\n------------ |
174e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
17500 | 2d 5c 6e 5c 6e 44 65 66 69 6e 65 20 74 68 65 20 6d 65 74 68 6f 64 20 5c 22 41 53 47 44 5c 22 2c | -\n\nDefine.the.method.\"ASGD\", |
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17540 | 63 20 61 6e 64 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 5c 6e 72 65 73 75 6c 74 73 2e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 | c.and.plot.the\nresults.\n\n"... |
17560 | 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 | ....].....},.....{......."cell_t |
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175e0 | 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 | ..},......."outputs":.[],....... |
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17640 | 74 6f 63 68 61 73 74 69 63 2e 73 6f 6c 76 65 5f 73 65 6d 69 5f 64 75 61 6c 5f 65 6e 74 72 6f 70 | tochastic.solve_semi_dual_entrop |
17660 | 69 63 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 6d 65 74 68 6f 64 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 | ic(a,.b,.M,.reg,.method,\n...... |
17680 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
176a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 2c | .....................numItermax, |
176c0 | 20 6c 6f 67 3d 6c 6f 67 29 5c 6e 70 72 69 6e 74 28 6c 6f 67 5f 61 73 67 64 5b 27 61 6c 70 68 61 | .log=log)\nprint(log_asgd['alpha |
176e0 | 27 5d 2c 20 6c 6f 67 5f 61 73 67 64 5b 27 62 65 74 61 27 5d 29 5c 6e 70 72 69 6e 74 28 61 73 67 | '],.log_asgd['beta'])\nprint(asg |
17700 | 64 5f 70 69 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 | d_pi)".......].....},.....{..... |
17720 | 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 | .."cell_type":."markdown",...... |
17740 | 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a | ."metadata":.{},......."source": |
17760 | 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 43 6f 6d 70 61 72 65 20 74 68 65 20 72 65 73 75 6c 74 73 20 | .[........."Compare.the.results. |
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177a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
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18060 | 69 6e 6f 75 73 5c 6e 20 63 61 73 65 5c 6e 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | inous\n.case\n.----------------- |
18080 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e | ----------------------------\n\n |
180a0 | 20 44 65 66 69 6e 65 20 6f 6e 65 20 67 65 6e 65 72 61 6c 20 6d 65 61 73 75 72 65 20 61 2c 20 6f | .Define.one.general.measure.a,.o |
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182e0 | 20 72 6e 67 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 5f 74 61 72 67 65 74 2c 20 32 29 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e | .rng.randn(n_target,.2)\nM.=.ot. |
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183c0 | 20 74 68 65 5c 6e 73 65 6d 69 63 6f 6e 74 69 6e 6f 75 73 20 63 61 73 65 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .the\nsemicontinous.case\n------ |
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18560 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 62 61 74 63 68 5f | ..........................batch_ |
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185a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
185c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 72 2c 20 6c 6f 67 3d 6c 6f 67 29 5c 6e 70 72 69 6e 74 28 | ............lr,.log=log)\nprint( |
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1b200 | 47 70 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 70 29 5c 6e 5c 6e 23 20 4f 54 20 6d 61 | Gp.=.ot.emd(a,.b,.Mp)\n\n#.OT.ma |
1b220 | 74 72 69 63 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c | trices\npl.figure(3,.figsize=(7, |
1b240 | 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 6f 74 2e | .3))\n\npl.subplot(1,.3,.1)\not. |
1b260 | 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 | plot.plot2D_samples_mat(xs,.xt,. |
1b280 | 47 31 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a | G1,.c=[.5,..5,.1])\npl.plot(xs[: |
1b2a0 | 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 | ,.0],.xs[:,.1],.'+b',.label='Sou |
1b2c0 | 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c | rce.samples')\npl.plot(xt[:,.0], |
1b2e0 | 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 | .xt[:,.1],.'xr',.label='Target.s |
1b300 | 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c | amples')\npl.axis('equal')\n#.pl |
1b320 | 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 45 75 63 | .legend(loc=0)\npl.title('OT.Euc |
1b340 | 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 5c | lidean')\n\npl.subplot(1,.3,.2)\ |
1b360 | 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 | not.plot.plot2D_samples_mat(xs,. |
1b380 | 78 74 2c 20 47 32 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 | xt,.G2,.c=[.5,..5,.1])\npl.plot( |
1b3a0 | 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d | xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+b',.label= |
1b3c0 | 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c | 'Source.samples')\npl.plot(xt[:, |
1b3e0 | 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 | .0],.xt[:,.1],.'xr',.label='Targ |
1b400 | 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e | et.samples')\npl.axis('equal')\n |
1b420 | 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 | #.pl.legend(loc=0)\npl.title('OT |
1b440 | 20 73 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | .squared.Euclidean')\n\npl.subpl |
1b460 | 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 | ot(1,.3,.3)\not.plot.plot2D_samp |
1b480 | 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 70 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 | les_mat(xs,.xt,.Gp,.c=[.5,..5,.1 |
1b4a0 | 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | ])\npl.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],. |
1b4c0 | 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 | '+b',.label='Source.samples')\np |
1b4e0 | 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c | l.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr', |
1b500 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 | .label='Target.samples')\npl.axi |
1b520 | 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e | s('equal')\n#.pl.legend(loc=0)\n |
1b540 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 70 | pl.title('OT.sqrt.Euclidean')\np |
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1b580 | 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f | .....].....},.....{......."cell_ |
1b5a0 | 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 | type":."markdown",......."metada |
1b5c0 | 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 | ta":.{},......."source":.[...... |
1b5e0 | 20 20 20 22 44 61 74 61 73 65 74 20 32 20 3a 20 50 61 72 74 69 61 6c 20 63 69 72 63 6c 65 5c 6e | ..."Dataset.2.:.Partial.circle\n |
1b600 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a | --------------------------\n\n". |
1b620 | 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c | ......].....},.....{......."cell |
1b640 | 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e | _type":."code",......."execution |
1b660 | 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a | _count":.null,......."metadata": |
1b680 | 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 | .{........."collapsed":.false... |
1b6a0 | 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 | ....},......."outputs":.[],..... |
1b6c0 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 20 3d 20 35 30 20 20 23 | .."source":.[........."n.=.50..# |
1b6e0 | 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 78 74 6f 74 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 20 | .nb.samples\nxtot.=.np.zeros((n. |
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1b720 | 20 20 20 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 20 2b 20 31 29 20 2b 20 31 2e 30 29 20 2a 20 30 | ....(np.arange(n.+.1).+.1.0).*.0 |
1b740 | 2e 39 20 2f 20 28 6e 20 2b 20 32 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 29 5c 6e 78 74 6f 74 5b | .9./.(n.+.2).*.2.*.np.pi)\nxtot[ |
1b760 | 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 6e 70 2e 73 69 6e 28 5c 6e 20 20 20 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 | :,.1].=.np.sin(\n....(np.arange( |
1b780 | 6e 20 2b 20 31 29 20 2b 20 31 2e 30 29 20 2a 20 30 2e 39 20 2f 20 28 6e 20 2b 20 32 29 20 2a 20 | n.+.1).+.1.0).*.0.9./.(n.+.2).*. |
1b7a0 | 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 29 5c 6e 5c 6e 78 73 20 3d 20 78 74 6f 74 5b 3a 6e 2c 20 3a 5d 5c 6e | 2.*.np.pi)\n\nxs.=.xtot[:n,.:]\n |
1b7c0 | 78 74 20 3d 20 78 74 6f 74 5b 31 3a 2c 20 3a 5d 5c 6e 5c 6e 61 2c 20 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e | xt.=.xtot[1:,.:]\n\na,.b.=.ot.un |
1b7e0 | 69 66 28 6e 29 2c 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 20 20 23 20 75 6e 69 66 6f 72 6d 20 64 69 73 | if(n),.ot.unif(n)..#.uniform.dis |
1b800 | 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d | tribution.on.samples\n\n#.loss.m |
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1b860 | 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 | n\n#.loss.matrix\nM2.=.ot.dist(x |
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1b8a0 | 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d | ./=.M2.max()\n\n#.loss.matrix\nM |
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1b8e0 | 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 29 5c 6e 4d 70 20 2f 3d 20 4d 70 2e 6d 61 78 28 29 | ic='euclidean'))\nMp./=.Mp.max() |
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20d20 | 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 31 30 29 29 5c 6e 70 | l.figure(1,.figsize=(10,.10))\np |
20d40 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 | l.subplot(2,.2,.1)\npl.scatter(X |
20d60 | 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d | s[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker= |
20d80 | 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c | '+',.label='Source.samples')\npl |
20da0 | 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c | .xticks([])\npl.yticks([])\npl.l |
20dc0 | 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 | egend(loc=0)\npl.title('Source.. |
20de0 | 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 | samples')\n\npl.subplot(2,.2,.2) |
20e00 | 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c | \npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1], |
20e20 | 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 | .c=yt,.marker='o',.label='Target |
20e40 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 | .samples')\npl.xticks([])\npl.yt |
20e60 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 | icks([])\npl.legend(loc=0)\npl.t |
20e80 | 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 | itle('Target.samples')\n\npl.sub |
20ea0 | 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b | plot(2,.2,.3)\npl.imshow(ot_sink |
20ec0 | 68 6f 72 6e 5f 75 6e 2e 63 6f 73 74 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 | horn_un.cost_,.interpolation='ne |
20ee0 | 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b | arest')\npl.xticks([])\npl.ytick |
20f00 | 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 75 | s([])\npl.title('Cost.matrix.-.u |
20f20 | 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 | nsupervised.DA')\n\npl.subplot(2 |
20f40 | 2c 20 32 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 | ,.2,.4)\npl.imshow(ot_sinkhorn_s |
20f60 | 65 6d 69 2e 63 6f 73 74 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 | emi.cost_,.interpolation='neares |
20f80 | 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | t')\npl.xticks([])\npl.yticks([] |
20fa0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 73 65 6d 69 73 | )\npl.title('Cost.matrix.-.semis |
20fc0 | 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 | upervised.DA')\n\npl.tight_layou |
20fe0 | 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 68 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 69 6e | t()\n\n#.the.optimal.coupling.in |
21000 | 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 2d 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 20 63 61 73 65 20 77 69 6c | .the.semi-supervised.DA.case.wil |
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21040 | 74 6f 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 2c 20 28 62 6c 6f 63 6b 20 64 69 61 67 6f | to.the.cost.matrix,.(block.diago |
21060 | 6e 61 6c 20 6d 61 74 72 69 78 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 | nal.matrix)".......].....},..... |
21080 | 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c | {......."cell_type":."markdown", |
210a0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f | ......."metadata":.{},......."so |
210c0 | 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 | urce":.[........."Fig.2.:.plots. |
210e0 | 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 | optimal.couplings.for.the.differ |
21100 | 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ent.methods\n------------------- |
21120 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
21140 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b | ------\n\n".......].....},.....{ |
21160 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 | ......."cell_type":."code",..... |
21180 | 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 | .."execution_count":.null,...... |
211a0 | 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 | ."metadata":.{........."collapse |
211c0 | 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 | d":.false.......},......."output |
211e0 | 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 | s":.[],......."source":.[....... |
21200 | 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 5c | .."pl.figure(2,.figsize=(8,.4))\ |
21220 | 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f | n\npl.subplot(1,.2,.1)\npl.imsho |
21240 | 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 | w(ot_sinkhorn_un.coupling_,.inte |
21260 | 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 | rpolation='nearest')\npl.xticks( |
21280 | 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 | [])\npl.yticks([])\npl.title('Op |
212a0 | 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 55 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 | timal.coupling\\nUnsupervised.DA |
212c0 | 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d | ')\n\npl.subplot(1,.2,.2)\npl.im |
212e0 | 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c | show(ot_sinkhorn_semi.coupling_, |
21300 | 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 | .interpolation='nearest')\npl.xt |
21320 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c | icks([])\npl.yticks([])\npl.titl |
21340 | 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 65 6d 69 2d 73 75 70 65 72 | e('Optimal.coupling\\nSemi-super |
21360 | 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 | vised.DA')\n\npl.tight_layout()" |
21380 | 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c | .......].....},.....{......."cel |
213a0 | 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | l_type":."markdown",......."meta |
213c0 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 | data":.{},......."source":.[.... |
213e0 | 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 33 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 | ....."Fig.3.:.plot.transported.s |
21400 | 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | amples\n------------------------ |
21420 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 | --------\n\n".......].....},.... |
21440 | 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 | .{......."cell_type":."code",... |
21460 | 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 | ...."execution_count":.null,.... |
21480 | 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 | ..."metadata":.{........."collap |
214a0 | 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 | sed":.false.......},......."outp |
214c0 | 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 | uts":.[],......."source":.[..... |
214e0 | 20 20 20 20 22 23 20 64 69 73 70 6c 61 79 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c | ...."#.display.transported.sampl |
21500 | 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 | es\npl.figure(4,.figsize=(8,.4)) |
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22620 | 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 | =Xt)\n\n#.for.original.source.sa |
22640 | 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 62 61 72 79 63 65 6e | mples,.transform.applies.barycen |
22660 | 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d | tric.mapping\ntransp_Xs_linear.= |
22680 | 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d | .ot_mapping_linear.transform(Xs= |
226a0 | 58 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c | Xs)\n\n#.for.out.of.source.sampl |
226c0 | 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 74 68 65 20 6c 69 6e 65 61 72 | es,.transform.applies.the.linear |
226e0 | 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 20 3d | .mapping\ntransp_Xs_linear_new.= |
22700 | 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d | .ot_mapping_linear.transform(Xs= |
22720 | 58 73 5f 6e 65 77 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 | Xs_new)\n\n\n#.MappingTransport. |
22740 | 77 69 74 68 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 6b 65 72 6e 65 6c 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 | with.gaussian.kernel\not_mapping |
22760 | 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f | _gaussian.=.ot.da.MappingTranspo |
22780 | 72 74 28 5c 6e 20 20 20 20 6b 65 72 6e 65 6c 3d 5c 22 67 61 75 73 73 69 61 6e 5c 22 2c 20 65 74 | rt(\n....kernel=\"gaussian\",.et |
227a0 | 61 3d 31 65 2d 35 2c 20 6d 75 3d 31 65 2d 31 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 20 73 69 67 6d | a=1e-5,.mu=1e-1,.bias=True,.sigm |
227c0 | 61 3d 31 2c 5c 6e 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 | a=1,\n....max_iter=10,.verbose=T |
227e0 | 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 66 69 74 28 58 73 | rue)\not_mapping_gaussian.fit(Xs |
22800 | 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f | =Xs,.Xt=Xt)\n\n#.for.original.so |
22820 | 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 | urce.samples,.transform.applies. |
22840 | 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 | barycentric.mapping\ntransp_Xs_g |
22860 | 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 | aussian.=.ot_mapping_gaussian.tr |
22880 | 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 | ansform(Xs=Xs)\n\n#.for.out.of.s |
228a0 | 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 | ource.samples,.transform.applies |
228c0 | 20 74 68 65 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 | .the.gaussian.mapping\ntransp_Xs |
228e0 | 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 | _gaussian_new.=.ot_mapping_gauss |
22900 | 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 77 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 | ian.transform(Xs=Xs_new)"....... |
22920 | 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 | ].....},.....{......."cell_type" |
22940 | 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 | :."markdown",......."metadata":. |
22960 | 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 | {},......."source":.[........."P |
22980 | 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | lot.transported.samples\n------- |
229a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 | -----------------\n\n".......].. |
229c0 | 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 | ...},.....{......."cell_type":." |
229e0 | 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 | code",......."execution_count":. |
22a00 | 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | null,......."metadata":.{....... |
22a20 | 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 | .."collapsed":.false.......},... |
22a40 | 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 | ...."outputs":.[],......."source |
22a60 | 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 | ":.[........."pl.figure(2)\npl.c |
22a80 | 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 | lf()\npl.subplot(2,.2,.1)\npl.sc |
22aa0 | 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 | atter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,. |
22ac0 | 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 | marker='o',\n...........label='T |
22ae0 | 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 | arget.samples',.alpha=.2)\npl.sc |
22b00 | 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 | atter(transp_Xs_linear[:,.0],.tr |
22b20 | 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b | ansp_Xs_linear[:,.1],.c=ys,.mark |
22b40 | 65 72 3d 27 2b 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4d 61 70 70 65 | er='+',\n...........label='Mappe |
22b60 | 64 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 42 | d.source.samples')\npl.title(\"B |
22b80 | 61 72 79 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 5c 22 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 | ary..mapping.(linear)\")\npl.leg |
22ba0 | 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 | end(loc=0)\n\npl.subplot(2,.2,.2 |
22bc0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d | )\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1] |
22be0 | 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ,.c=yt,.marker='o',\n........... |
22c00 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 | label='Target.samples',.alpha=.2 |
22c20 | 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e | )\npl.scatter(transp_Xs_linear_n |
22c40 | 65 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 5b 3a | ew[:,.0],.transp_Xs_linear_new[: |
22c60 | 2c 20 31 5d 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 | ,.1],\n...........c=ys,.marker=' |
22c80 | 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 65 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c | +',.label='Learned.mapping')\npl |
22ca0 | 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 45 73 74 69 6d 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 | .title(\"Estim..mapping.(linear) |
22cc0 | 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 | \")\n\npl.subplot(2,.2,.3)\npl.s |
22ce0 | 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c | catter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt, |
22d00 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | .marker='o',\n...........label=' |
22d20 | 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 | Target.samples',.alpha=.2)\npl.s |
22d40 | 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c | catter(transp_Xs_gaussian[:,.0], |
22d60 | 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c | .transp_Xs_gaussian[:,.1],.c=ys, |
22d80 | 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | \n...........marker='+',.label=' |
22da0 | 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | barycentric.mapping')\npl.title( |
22dc0 | 5c 22 42 61 72 79 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6b 65 72 6e 65 6c 29 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 | \"Bary..mapping.(kernel)\")\n\np |
22de0 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 | l.subplot(2,.2,.4)\npl.scatter(X |
22e00 | 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d | t[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker= |
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23ce0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 | ......."outputs":.[],......."sou |
23d00 | 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 | rce":.[........."pl.figure(1,.fi |
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23da0 | 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e | l.yticks([])\npl.legend(loc=0)\n |
23dc0 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 | pl.title('Source..samples')\n\np |
23de0 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 | l.subplot(2,.2,.2)\npl.scatter(X |
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23e40 | 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c | .xticks([])\npl.yticks([])\npl.l |
23e60 | 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 | egend(loc=0)\npl.title('Target.s |
23e80 | 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c | amples')\n\npl.subplot(2,.2,.3)\ |
23ea0 | 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 | npl.imshow(M,.interpolation='nea |
23ec0 | 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 | rest')\npl.xticks([])\npl.yticks |
23ee0 | 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 | ([])\npl.title('Matrix.of.pairwi |
23f00 | 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 | se.distances')\npl.tight_layout( |
23f20 | 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 | )".......].....},.....{......."c |
23f40 | 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 | ell_type":."markdown",......."me |
23f60 | 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 | tadata":.{},......."source":.[.. |
23f80 | 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f | ......."Fig.2.:.plots.optimal.co |
23fa0 | 75 70 6c 69 6e 67 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 | uplings.for.the.different.method |
23fc0 | 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | s\n----------------------------- |
23fe0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e | ----------------------------\n\n |
24000 | 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 | ".......].....},.....{......."ce |
24020 | 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 | ll_type":."code",......."executi |
24040 | 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 | on_count":.null,......."metadata |
24060 | 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a | ":.{........."collapsed":.false. |
24080 | 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 | ......},......."outputs":.[],... |
240a0 | 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 | ...."source":.[........."pl.figu |
240c0 | 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 36 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 | re(2,.figsize=(10,.6))\n\npl.sub |
240e0 | 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e | plot(2,.3,.1)\npl.imshow(ot_emd. |
24100 | 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 | coupling_,.interpolation='neares |
24120 | 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | t')\npl.xticks([])\npl.yticks([] |
24140 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e | )\npl.title('Optimal.coupling\\n |
24160 | 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 | EMDTransport')\n\npl.subplot(2,. |
24180 | 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 | 3,.2)\npl.imshow(ot_sinkhorn.cou |
241a0 | 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 | pling_,.interpolation='nearest') |
241c0 | 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e | \npl.xticks([])\npl.yticks([])\n |
241e0 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e | pl.title('Optimal.coupling\\nSin |
24200 | 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 | khornTransport')\n\npl.subplot(2 |
24220 | 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c | ,.3,.3)\npl.imshow(ot_lpl1.coupl |
24240 | 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e | ing_,.interpolation='nearest')\n |
24260 | 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c | pl.xticks([])\npl.yticks([])\npl |
24280 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 | .title('Optimal.coupling\\nSinkh |
242a0 | 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | ornLpl1Transport')\n\npl.subplot |
242c0 | 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 | (2,.3,.4)\not.plot.plot2D_sample |
242e0 | 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 | s_mat(Xs,.Xt,.ot_emd.coupling_,. |
24300 | 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c | c=[.5,..5,.1])\npl.scatter(Xs[:, |
24320 | 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c | .0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+', |
24340 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 | .label='Source.samples')\npl.sca |
24360 | 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d | tter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.m |
24380 | 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | arker='o',.label='Target.samples |
243a0 | 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 | ')\npl.xticks([])\npl.yticks([]) |
243c0 | 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 | \npl.title('Main.coupling.coeffi |
243e0 | 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 | cients\\nEMDTransport')\n\npl.su |
24400 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 | bplot(2,.3,.5)\not.plot.plot2D_s |
24420 | 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 | amples_mat(Xs,.Xt,.ot_sinkhorn.c |
24440 | 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 | oupling_,.c=[.5,..5,.1])\npl.sca |
24460 | 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d | tter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.m |
24480 | 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | arker='+',.label='Source.samples |
244a0 | 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 | ')\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1 |
244c0 | 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 | ],.c=yt,.marker='o',.label='Targ |
244e0 | 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e | et.samples')\npl.xticks([])\npl. |
24500 | 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c | yticks([])\npl.title('Main.coupl |
24520 | 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 | ing.coefficients\\nSinkhornTrans |
24540 | 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 5c 6e 6f | port')\n\npl.subplot(2,.3,.6)\no |
24560 | 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 | t.plot.plot2D_samples_mat(Xs,.Xt |
24580 | 2c 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 | ,.ot_lpl1.coupling_,.c=[.5,..5,. |
245a0 | 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 | 1])\npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:,. |
245c0 | 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 | 1],.c=ys,.marker='+',.label='Sou |
245e0 | 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 | rce.samples')\npl.scatter(Xt[:,. |
24600 | 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 | 0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',. |
24620 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 | label='Target.samples')\npl.xtic |
24640 | 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | ks([])\npl.yticks([])\npl.title( |
24660 | 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 53 69 | 'Main.coupling.coefficients\\nSi |
24680 | 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f | nkhornLpl1Transport')\npl.tight_ |
246a0 | 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 | layout()".......].....},.....{.. |
246c0 | 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 | ....."cell_type":."markdown",... |
246e0 | 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 | ...."metadata":.{},......."sourc |
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28d00 | 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 | t_otda_color_images.ipynbPK..... |
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28de0 | 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6c 61 73 73 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 | t_otda_classes.ipynbPK.......... |
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28f80 | 6f 72 6e 5f 31 44 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 a6 72 94 50 9d 28 3f 1d | orn_1D.ipynbPK...........r.P.(?. |
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