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| 39c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 | .............],.p,.lambdast[i],. |
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| 3a20 | 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 5c 6e 5c 6e 43 | ....max_iter=100,.tol=1e-3)\n\nC |
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| 3ac0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 3ae0 | 20 20 20 5b 70 73 5b 31 5d 2c 20 70 73 5b 33 5d 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ...[ps[1],.ps[3]\n.............. |
| 3b00 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c | ..............................], |
| 3b20 | 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 | .p,.lambdast[i],.'square_loss',. |
| 3b40 | 20 23 20 35 65 2d 34 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | .#.5e-4,\n...................... |
| 3b60 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 | .....................max_iter=10 |
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| 3c20 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b 32 5d 2c 20 70 73 5b 33 | ....................[ps[2],.ps[3 |
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| 3c60 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d | ...............],.p,.lambdast[i] |
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| 56e0 | 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 | source":.[........."#%%.Example. |
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| 57c0 | 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 5c | n\npl.figure(4,.figsize=(5,.5))\ |
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| 58c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 58e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d | -------------\n\n".......].....} |
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| 5940 | 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 | ,......."metadata":.{........."c |
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| 5980 | 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b | "outputs":.[],......."source":.[ |
| 59a0 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 | ........."#%%.Example.with.Frobe |
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| 6480 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c | ------------\n\n".......].....}, |
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| 65e0 | 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 | _sinkhorn.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n# |
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| 6720 | 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 | s)\ntransp_Xs_lpl1.=.ot_lpl1.tra |
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| 67a0 | 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 | source":.[........."Fig.1.:.plot |
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| 6820 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
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| 6860 | 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 | ."cell_type":."code",......."exe |
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| 68a0 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 | data":.{........."collapsed":.fa |
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| 68e0 | 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e | ,......."source":.[........."pl. |
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| 6980 | 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 | ticks([])\npl.yticks([])\npl.leg |
| 69a0 | 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 | end(loc=0)\npl.title('Source..sa |
| 69c0 | 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e | mples')\n\npl.subplot(2,.2,.2)\n |
| 69e0 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 | pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c |
| 6a00 | 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 | =yt,.marker='o',.label='Target.s |
| 6a20 | 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 | amples')\npl.xticks([])\npl.ytic |
| 6a40 | 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 | ks([])\npl.legend(loc=0)\npl.tit |
| 6a60 | 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | le('Target.samples')\n\npl.subpl |
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| 6ac0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 74 72 | )\npl.yticks([])\npl.title('Matr |
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| 6b00 | 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 | ight_layout()".......].....},... |
| 6b20 | 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e | ..{......."cell_type":."markdown |
| 6b40 | 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ",......."metadata":.{},......." |
| 6b60 | 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 | source":.[........."Fig.2.:.plot |
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| 6ba0 | 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | erent.methods\n----------------- |
| 6bc0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 6be0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 | --------\n\n".......].....},.... |
| 6c00 | 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 | .{......."cell_type":."code",... |
| 6c20 | 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 | ...."execution_count":.null,.... |
| 6c40 | 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 | ..."metadata":.{........."collap |
| 6c60 | 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 | sed":.false.......},......."outp |
| 6c80 | 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 | uts":.[],......."source":.[..... |
| 6ca0 | 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 36 | ...."pl.figure(2,.figsize=(10,.6 |
| 6cc0 | 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d | ))\n\npl.subplot(2,.3,.1)\npl.im |
| 6ce0 | 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 | show(ot_emd.coupling_,.interpola |
| 6d00 | 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e | tion='nearest')\npl.xticks([])\n |
| 6d20 | 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c | pl.yticks([])\npl.title('Optimal |
| 6d40 | 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | .coupling\\nEMDTransport')\n\npl |
| 6d60 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f | .subplot(2,.3,.2)\npl.imshow(ot_ |
| 6d80 | 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f | sinkhorn.coupling_,.interpolatio |
| 6da0 | 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e | n='nearest')\npl.xticks([])\npl. |
| 6dc0 | 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f | yticks([])\npl.title('Optimal.co |
| 6de0 | 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e | upling\\nSinkhornTransport')\n\n |
| 6e00 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f | pl.subplot(2,.3,.3)\npl.imshow(o |
| 6e20 | 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d | t_lpl1.coupling_,.interpolation= |
| 6e40 | 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 | 'nearest')\npl.xticks([])\npl.yt |
| 6e60 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 | icks([])\npl.title('Optimal.coup |
| 6e80 | 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e | ling\\nSinkhornLpl1Transport')\n |
| 6ea0 | 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 | \npl.subplot(2,.3,.4)\not.plot.p |
| 6ec0 | 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 65 6d 64 | lot2D_samples_mat(Xs,.Xt,.ot_emd |
| 6ee0 | 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 | .coupling_,.c=[.5,..5,.1])\npl.s |
| 6f00 | 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c | catter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys, |
| 6f20 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c | .marker='+',.label='Source.sampl |
| 6f40 | 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c | es')\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:, |
| 6f60 | 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 | .1],.c=yt,.marker='o',.label='Ta |
| 6f80 | 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 | rget.samples')\npl.xticks([])\np |
| 6fa0 | 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 | l.yticks([])\npl.title('Main.cou |
| 6fc0 | 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 | pling.coefficients\\nEMDTranspor |
| 6fe0 | 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e 6f 74 2e 70 | t')\n\npl.subplot(2,.3,.5)\not.p |
| 7000 | 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f | lot.plot2D_samples_mat(Xs,.Xt,.o |
| 7020 | 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c | t_sinkhorn.coupling_,.c=[.5,..5, |
| 7040 | 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c | .1])\npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:, |
| 7060 | 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f | .1],.c=ys,.marker='+',.label='So |
| 7080 | 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c | urce.samples')\npl.scatter(Xt[:, |
| 70a0 | 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c | .0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o', |
| 70c0 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 | .label='Target.samples')\npl.xti |
| 70e0 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | cks([])\npl.yticks([])\npl.title |
| 7100 | 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 53 | ('Main.coupling.coefficients\\nS |
| 7120 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | inkhornTransport')\n\npl.subplot |
| 7140 | 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 | (2,.3,.6)\not.plot.plot2D_sample |
| 7160 | 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c | s_mat(Xs,.Xt,.ot_lpl1.coupling_, |
| 7180 | 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a | .c=[.5,..5,.1])\npl.scatter(Xs[: |
| 71a0 | 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 | ,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+' |
| 71c0 | 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 | ,.label='Source.samples')\npl.sc |
| 71e0 | 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 | atter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,. |
| 7200 | 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 | marker='o',.label='Target.sample |
| 7220 | 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | s')\npl.xticks([])\npl.yticks([] |
| 7240 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 | )\npl.title('Main.coupling.coeff |
| 7260 | 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 | icients\\nSinkhornLpl1Transport' |
| 7280 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 | )\npl.tight_layout()".......]... |
| 72a0 | 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d | ..},.....{......."cell_type":."m |
| 72c0 | 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a | arkdown",......."metadata":.{},. |
| 72e0 | 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 33 | ......"source":.[........."Fig.3 |
| 7300 | 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d | .:.plot.transported.samples\n--- |
| 7320 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c | -----------------------------\n\ |
| 7340 | 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 | n".......].....},.....{......."c |
| 7360 | 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 | ell_type":."code",......."execut |
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| 8620 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b | metadata":.{},......."source":.[ |
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| 86c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 | ----------------------\n\n"..... |
| 86e0 | 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 | ..].....},.....{......."cell_typ |
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| 87e0 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | :,.1],.c=ys,.marker='+',.label=' |
| 8800 | 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c | Source.samples')\npl.xticks([])\ |
| 8820 | 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 | npl.yticks([])\npl.legend(loc=0) |
| 8840 | 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c | \npl.title('Source..samples')\n\ |
| 8860 | 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 | npl.subplot(2,.2,.2)\npl.scatter |
| 8880 | 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 | (Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marke |
| 88a0 | 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e | r='o',.label='Target.samples')\n |
| 88c0 | 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c | pl.xticks([])\npl.yticks([])\npl |
| 88e0 | 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 | .legend(loc=0)\npl.title('Target |
| 8900 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 | .samples')\n\npl.subplot(2,.2,.3 |
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| 8940 | 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e | _,.interpolation='nearest')\npl. |
| 8960 | 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 | xticks([])\npl.yticks([])\npl.ti |
| 8980 | 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 75 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 | tle('Cost.matrix.-.unsupervised. |
| 89a0 | 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e | DA')\n\npl.subplot(2,.2,.4)\npl. |
| 89c0 | 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 63 6f 73 74 5f 2c 20 69 | imshow(ot_sinkhorn_semi.cost_,.i |
| 89e0 | 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 | nterpolation='nearest')\npl.xtic |
| 8a00 | 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | ks([])\npl.yticks([])\npl.title( |
| 8a20 | 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 73 65 6d 69 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 | 'Cost.matrix.-.semisupervised.DA |
| 8a40 | 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 68 65 | ')\n\npl.tight_layout()\n\n#.the |
| 8a60 | 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 69 6e 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 2d 73 75 | .optimal.coupling.in.the.semi-su |
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| 8aa0 | 20 73 68 61 70 65 5c 6e 23 20 73 69 6d 69 6c 61 72 5c 22 20 74 6f 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 | .shape\n#.similar\".to.the.cost. |
| 8ac0 | 6d 61 74 72 69 78 2c 20 28 62 6c 6f 63 6b 20 64 69 61 67 6f 6e 61 6c 20 6d 61 74 72 69 78 29 22 | matrix,.(block.diagonal.matrix)" |
| 8ae0 | 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c | .......].....},.....{......."cel |
| 8b00 | 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | l_type":."markdown",......."meta |
| 8b20 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 | data":.{},......."source":.[.... |
| 8b40 | 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 | ....."Fig.2.:.plots.optimal.coup |
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| 8b80 | 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | n------------------------------- |
| 8ba0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a | --------------------------\n\n". |
| 8bc0 | 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c | ......].....},.....{......."cell |
| 8be0 | 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e | _type":."code",......."execution |
| 8c00 | 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a | _count":.null,......."metadata": |
| 8c20 | 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 | .{........."collapsed":.false... |
| 8c40 | 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 | ....},......."outputs":.[],..... |
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| a640 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| a660 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ############\n################## |
| a680 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| a6a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 20 44 49 53 | ##########################\n.DIS |
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| a720 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 20 44 65 66 69 6e 65 20 32 20 | ------------------\n\n.Define.2. |
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| a780 | 63 65 5c 6e 20 61 6e 64 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 61 6e 64 | ce\n.and.the.target.measures.and |
| a7a0 | 20 66 69 6e 61 6c 6c 79 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 63 2e 5c 6e 5c 6e 22 | .finally.the.cost.matrix.c.\n\n" |
| a7c0 | 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c | .......].....},.....{......."cel |
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| a960 | 58 5f 73 6f 75 72 63 65 2c 20 59 5f 74 61 72 67 65 74 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 | X_source,.Y_target)".......].... |
| a980 | 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 | .},.....{......."cell_type":."ma |
| a9a0 | 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 | rkdown",......."metadata":.{},.. |
| a9c0 | 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 43 61 6c 6c 20 74 | ....."source":.[........."Call.t |
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| aa20 | 65 74 65 20 63 61 73 65 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ete.case\n---------------------- |
| aa40 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 44 65 66 69 6e | -----------------------\n\nDefin |
| aa60 | 65 20 74 68 65 20 6d 65 74 68 6f 64 20 5c 22 53 41 47 5c 22 2c 20 63 61 6c 6c 20 6f 74 2e 73 6f | e.the.method.\"SAG\",.call.ot.so |
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| aaa0 | 74 68 65 5c 6e 72 65 73 75 6c 74 73 2e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d | the\nresults.\n\n".......].....} |
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| ab00 | 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 | ,......."metadata":.{........."c |
| ab20 | 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 | ollapsed":.false.......},....... |
| ab40 | 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b | "outputs":.[],......."source":.[ |
| ab60 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 68 6f 64 20 3d 20 5c 22 53 41 47 5c 22 5c 6e 73 61 67 5f | ........."method.=.\"SAG\"\nsag_ |
| ab80 | 70 69 20 3d 20 6f 74 2e 73 74 6f 63 68 61 73 74 69 63 2e 73 6f 6c 76 65 5f 73 65 6d 69 5f 64 75 | pi.=.ot.stochastic.solve_semi_du |
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| abe0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 29 5c 6e | ...................numItermax)\n |
| ac00 | 70 72 69 6e 74 28 73 61 67 5f 70 69 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 | print(sag_pi)".......].....},... |
| ac20 | 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e | ..{......."cell_type":."markdown |
| ac40 | 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ",......."metadata":.{},......." |
| ac60 | 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 53 45 4d 49 43 4f 4e 54 49 4e 4f 55 | source":.[........."SEMICONTINOU |
| ac80 | 53 20 43 41 53 45 3a 5c 6e 5c 6e 53 61 6d 70 6c 65 20 6f 6e 65 20 67 65 6e 65 72 61 6c 20 6d 65 | S.CASE:\n\nSample.one.general.me |
| aca0 | 61 73 75 72 65 20 61 2c 20 6f 6e 65 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 62 | asure.a,.one.discrete.measures.b |
| acc0 | 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 63 6f 6e 74 69 6e 6f 75 73 5c 6e 63 61 73 65 5c 6e 2d 2d | .for.the.semicontinous\ncase\n-- |
| ace0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| ad00 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 44 65 66 69 6e 65 20 6f 6e 65 20 67 65 6e 65 72 61 | -----------\n\nDefine.one.genera |
| ad20 | 6c 20 6d 65 61 73 75 72 65 20 61 2c 20 6f 6e 65 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6d 65 61 73 75 72 | l.measure.a,.one.discrete.measur |
| ad40 | 65 73 20 62 2c 20 74 68 65 20 70 6f 69 6e 74 73 20 77 68 65 72 65 5c 6e 61 72 65 20 64 65 66 69 | es.b,.the.points.where\nare.defi |
| ad60 | 6e 65 64 20 74 68 65 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 6d 65 | ned.the.source.and.the.target.me |
| ad80 | 61 73 75 72 65 73 20 61 6e 64 20 66 69 6e 61 6c 6c 79 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 6d 61 74 72 | asures.and.finally.the.cost.matr |
| ada0 | 69 78 20 63 2e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a | ix.c.\n\n".......].....},.....{. |
| adc0 | 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 | ......"cell_type":."code",...... |
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| ae00 | 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 | "metadata":.{........."collapsed |
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| d320 | 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 | utputs":.[],......."source":.[.. |
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| d3c0 | 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 5c | A.dot(weights)\n\n#.wasserstein\ |
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| d440 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 | .subplot(2,.1,.1)\nfor.i.in.rang |
| d460 | 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 | e(n_distributions):\n....pl.plot |
| d480 | 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 | (x,.A[:,.i])\npl.title('Distribu |
| d4a0 | 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e | tions')\n\npl.subplot(2,.1,.2)\n |
| d4c0 | 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | pl.plot(x,.bary_l2,.'r',.label=' |
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| d500 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 | .label='Wasserstein')\npl.legend |
| d520 | 28 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e | ()\npl.title('Barycenters')\npl. |
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| d560 | 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 | ...{......."cell_type":."markdow |
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| d5a0 | 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 42 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 | "source":.[........."Barycentric |
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| d5e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 | ---------\n\n".......].....},... |
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| d620 | 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 | ....."execution_count":.null,... |
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| d6a0 | 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 | ....."#%%.barycenter.interpolati |
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| d720 | 5c 6e 42 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 70 79 28 42 5f 6c 32 29 5c 6e 5c 6e 66 6f 72 20 | \nB_wass.=.np.copy(B_l2)\n\nfor. |
| d740 | 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 30 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 61 6c 70 | i.in.range(0,.n_alpha):\n....alp |
| d760 | 68 61 20 3d 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5b 69 5d 5c 6e 20 20 20 20 77 65 69 67 68 74 73 20 | ha.=.alpha_list[i]\n....weights. |
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| d7a0 | 20 20 20 20 42 5f 6c 32 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c | ....B_l2[:,.i].=.A.dot(weights)\ |
| d7c0 | 6e 20 20 20 20 42 5f 77 61 73 73 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 | n....B_wass[:,.i].=.ot.bregman.b |
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| d800 | 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 | n#%%.plot.interpolation\n\npl.fi |
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| e920 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 | ----------------------\n\n"..... |
| e940 | 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 | ..].....},.....{......."cell_typ |
| e960 | 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 | e":."code",......."execution_cou |
| e980 | 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 | nt":.null,......."metadata":.{.. |
| e9a0 | 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 | ......."collapsed":.false....... |
| e9c0 | 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 | },......."outputs":.[],......."s |
| e9e0 | 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 | ource":.[........."pl.figure(1,. |
| ea00 | 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 35 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 | figsize=(10,.5))\npl.subplot(1,. |
| ea20 | 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a | 2,.1)\npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[: |
| ea40 | 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 | ,.1],.c=ys,.marker='+',.label='S |
| ea60 | 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e | ource.samples')\npl.xticks([])\n |
| ea80 | 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c | pl.yticks([])\npl.legend(loc=0)\ |
| eaa0 | 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e | npl.title('Source..samples')\n\n |
| eac0 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 | pl.subplot(1,.2,.2)\npl.scatter( |
| eae0 | 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 | Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker |
| eb00 | 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 | ='o',.label='Target.samples')\np |
| eb20 | 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e | l.xticks([])\npl.yticks([])\npl. |
| eb40 | 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 | legend(loc=0)\npl.title('Target. |
| eb60 | 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 | samples')\npl.tight_layout()"... |
| eb80 | 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 | ....].....},.....{......."cell_t |
| eba0 | 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 | ype":."markdown",......."metadat |
| ebc0 | 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 | a":.{},......."source":.[....... |
| ebe0 | 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 | .."Fig.2.:.plot.optimal.coupling |
| ec00 | 73 20 61 6e 64 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d | s.and.transported.samples\n----- |
| ec20 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| ec40 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 | -----------------\n\n".......].. |
| ec60 | 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 | ...},.....{......."cell_type":." |
| ec80 | 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 | code",......."execution_count":. |
| eca0 | 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | null,......."metadata":.{....... |
| ecc0 | 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 | .."collapsed":.false.......},... |
| ece0 | 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 | ...."outputs":.[],......."source |
| ed00 | 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 20 3d 20 7b 27 69 6e 74 65 | ":.[........."param_img.=.{'inte |
| ed20 | 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 27 3a 20 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 7d 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 | rpolation':.'nearest'}\n\npl.fig |
| ed40 | 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 35 2c 20 38 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 | ure(2,.figsize=(15,.8))\npl.subp |
| ed60 | 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 | lot(2,.4,.1)\npl.imshow(ot_emd.c |
| ed80 | 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b | oupling_,.**param_img)\npl.xtick |
| eda0 | 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | s([])\npl.yticks([])\npl.title(' |
| edc0 | 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 | Optimal.coupling\\nEMDTransport' |
| ede0 | 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 | )\n\npl.subplot(2,.4,.2)\npl.ims |
| ee00 | 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 | how(ot_sinkhorn.coupling_,.**par |
| ee20 | 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b | am_img)\npl.xticks([])\npl.ytick |
| ee40 | 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e | s([])\npl.title('Optimal.couplin |
| ee60 | 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 | g\\nSinkhornTransport')\n\npl.su |
| ee80 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c | bplot(2,.4,.3)\npl.imshow(ot_lpl |
| eea0 | 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 | 1.coupling_,.**param_img)\npl.xt |
| eec0 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c | icks([])\npl.yticks([])\npl.titl |
| eee0 | 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 | e('Optimal.coupling\\nSinkhornLp |
| ef00 | 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 | l1Transport')\n\npl.subplot(2,.4 |
| ef20 | 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 | ,.4)\npl.imshow(ot_l1l2.coupling |
| ef40 | 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e | _,.**param_img)\npl.xticks([])\n |
| ef60 | 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c | pl.yticks([])\npl.title('Optimal |
| ef80 | 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f 72 | .coupling\\nSinkhornL1l2Transpor |
| efa0 | 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 | t')\n\npl.subplot(2,.4,.5)\npl.s |
| efc0 | 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c | catter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt, |
| efe0 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | .marker='o',\n...........label=' |
| f000 | 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e | Target.samples',.alpha=0.3)\npl. |
| f020 | 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 | scatter(transp_Xs_emd[:,.0],.tra |
| f040 | 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 | nsp_Xs_emd[:,.1],.c=ys,\n....... |
| f060 | 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 | ....marker='+',.label='Transp.sa |
| f080 | 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c | mples',.s=30)\npl.xticks([])\npl |
| f0a0 | 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 | .yticks([])\npl.title('Transport |
| f0c0 | 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e | ed.samples\\nEmdTransport')\npl. |
| f0e0 | 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 5c 22 6c 6f 77 65 72 20 6c 65 66 74 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | legend(loc=\"lower.left\")\n\npl |
| f100 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 36 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 | .subplot(2,.4,.6)\npl.scatter(Xt |
| f120 | 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 | [:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker=' |
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| 119c0 | 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 | pl.ylabel('Blue')\npl.title('Ima |
| 119e0 | 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 | ge.1')\n\npl.subplot(1,.2,.2)\np |
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| 11a40 | 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c | label('Red')\npl.ylabel('Blue')\ |
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| 13380 | 6e 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2b 20 31 29 20 2a | nxs[:,.1].=.(np.arange(n).+.1).* |
| 133a0 | 20 2d 30 2e 30 30 31 20 20 23 20 74 6f 20 6d 61 6b 65 20 69 74 20 73 74 72 69 63 74 6c 79 20 63 | .-0.001..#.to.make.it.strictly.c |
| 133c0 | 6f 6e 76 65 78 2e 2e 2e 5c 6e 5c 6e 78 74 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 32 29 | onvex...\n\nxt.=.np.zeros((n,.2) |
| 133e0 | 29 5c 6e 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2b 20 31 5c 6e | )\nxt[:,.1].=.np.arange(n).+.1\n |
| 13400 | 5c 6e 61 2c 20 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 2c 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 20 | \na,.b.=.ot.unif(n),.ot.unif(n). |
| 13420 | 20 23 20 75 6e 69 66 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 61 6d 70 6c | .#.uniform.distribution.on.sampl |
| 13440 | 65 73 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 | es\n\n#.loss.matrix\nM1.=.ot.dis |
| 13460 | 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d | t(xs,.xt,.metric='euclidean')\nM |
| 13480 | 31 20 2f 3d 20 4d 31 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e | 1./=.M1.max()\n\n#.loss.matrix\n |
| 134a0 | 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 | M2.=.ot.dist(xs,.xt,.metric='sqe |
| 134c0 | 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 | uclidean')\nM2./=.M2.max()\n\n#. |
| 134e0 | 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 70 20 3d 20 6e 70 2e 73 71 72 74 28 6f 74 2e 64 69 73 | loss.matrix\nMp.=.np.sqrt(ot.dis |
| 13500 | 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 29 5c 6e | t(xs,.xt,.metric='euclidean'))\n |
| 13520 | 4d 70 20 2f 3d 20 4d 70 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 44 61 74 61 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 | Mp./=.Mp.max()\n\n#.Data\npl.fig |
| 13540 | 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 | ure(1,.figsize=(7,.3))\npl.clf() |
| 13560 | 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b | \npl.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+ |
| 13580 | 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e | b',.label='Source.samples')\npl. |
| 135a0 | 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c | plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr',.l |
| 135c0 | 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 | abel='Target.samples')\npl.axis( |
| 135e0 | 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 | 'equal')\npl.title('Source.and.t |
| 13600 | 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 43 6f 73 | arget.distributions')\n\n\n#.Cos |
| 13620 | 74 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 | t.matrices\npl.figure(2,.figsize |
| 13640 | 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 5c | =(7,.3))\n\npl.subplot(1,.3,.1)\ |
| 13660 | 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 31 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 | npl.imshow(M1,.interpolation='ne |
| 13680 | 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 | arest')\npl.title('Euclidean.cos |
| 136a0 | 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 | t')\n\npl.subplot(1,.3,.2)\npl.i |
| 136c0 | 6d 73 68 6f 77 28 4d 32 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 | mshow(M2,.interpolation='nearest |
| 136e0 | 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 | ')\npl.title('Squared.Euclidean. |
| 13700 | 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 | cost')\n\npl.subplot(1,.3,.3)\np |
| 13720 | 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 70 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 | l.imshow(Mp,.interpolation='near |
| 13740 | 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 | est')\npl.title('Sqrt.Euclidean. |
| 13760 | 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 | cost')\npl.tight_layout()"...... |
| 13780 | 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 | .].....},.....{......."cell_type |
| 137a0 | 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a | ":."markdown",......."metadata": |
| 137c0 | 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 | .{},......."source":.[........." |
| 137e0 | 44 61 74 61 73 65 74 20 31 20 3a 20 50 6c 6f 74 20 4f 54 20 4d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 2d 2d | Dataset.1.:.Plot.OT.Matrices\n-- |
| 13800 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a | --------------------------\n\n". |
| 13820 | 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c | ......].....},.....{......."cell |
| 13840 | 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e | _type":."code",......."execution |
| 13860 | 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a | _count":.null,......."metadata": |
| 13880 | 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 | .{........."collapsed":.false... |
| 138a0 | 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 | ....},......."outputs":.[],..... |
| 138c0 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e | .."source":.[........."#%%.EMD\n |
| 138e0 | 47 31 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 31 29 5c 6e 47 32 20 3d 20 6f 74 2e 65 | G1.=.ot.emd(a,.b,.M1)\nG2.=.ot.e |
| 13900 | 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 32 29 5c 6e 47 70 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 | md(a,.b,.M2)\nGp.=.ot.emd(a,.b,. |
| 13920 | 4d 70 29 5c 6e 5c 6e 23 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 | Mp)\n\n#.OT.matrices\npl.figure( |
| 13940 | 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | 3,.figsize=(7,.3))\n\npl.subplot |
| 13960 | 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 | (1,.3,.1)\not.plot.plot2D_sample |
| 13980 | 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 31 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 | s_mat(xs,.xt,.G1,.c=[.5,..5,.1]) |
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| 139c0 | 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e | b',.label='Source.samples')\npl. |
| 139e0 | 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c | plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr',.l |
| 13a00 | 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 | abel='Target.samples')\npl.axis( |
| 13a20 | 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c | 'equal')\n#.pl.legend(loc=0)\npl |
| 13a40 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 | .title('OT.Euclidean')\n\npl.sub |
| 13a60 | 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 | plot(1,.3,.2)\not.plot.plot2D_sa |
| 13a80 | 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 32 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c | mples_mat(xs,.xt,.G2,.c=[.5,..5, |
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| 13ac0 | 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c | ,.'+b',.label='Source.samples')\ |
| 13ae0 | 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 | npl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr |
| 13b00 | 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 | ',.label='Target.samples')\npl.a |
| 13b20 | 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 | xis('equal')\n#.pl.legend(loc=0) |
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| 153e0 | 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 | .=.ot.bregman.barycenter(A,.M,.r |
| 15400 | 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 6f 74 2e 74 | eg,.weights)\not.toc()\n\n\not.t |
| 15420 | 69 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 20 3d 20 6f 74 2e 6c 70 2e 62 61 72 79 63 65 6e | ic()\nbary_wass2.=.ot.lp.barycen |
| 15440 | 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 2c 20 73 6f 6c 76 65 72 3d 27 69 6e 74 65 72 | ter(A,.M,.weights,.solver='inter |
| 15460 | 69 6f 72 2d 70 6f 69 6e 74 27 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f | ior-point',.verbose=True)\not.to |
| 15480 | 63 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 | c()\n\npl.figure(2)\npl.clf()\np |
| 154a0 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e | l.subplot(2,.1,.1)\nfor.i.in.ran |
| 154c0 | 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f | ge(n_distributions):\n....pl.plo |
| 154e0 | 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 | t(x,.A[:,.i])\npl.title('Distrib |
| 15500 | 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c | utions')\n\npl.subplot(2,.1,.2)\ |
| 15520 | 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d | npl.plot(x,.bary_l2,.'r',.label= |
| 15540 | 27 6c 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 27 67 27 | 'l2')\npl.plot(x,.bary_wass,.'g' |
| 15560 | 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 52 65 67 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 | ,.label='Reg.Wasserstein')\npl.p |
| 15580 | 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c | lot(x,.bary_wass2,.'b',.label='L |
| 155a0 | 50 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 70 6c | P.Wasserstein')\npl.legend()\npl |
| 155c0 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f | .title('Barycenters')\npl.tight_ |
| 155e0 | 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 5b 41 2c 20 | layout()\n\nproblems.append([A,. |
| 15600 | 5b 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 5d | [bary_l2,.bary_wass,.bary_wass2] |
| 15620 | 5d 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ])".......].....},.....{......." |
| 15640 | 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d | cell_type":."markdown",......."m |
| 15660 | 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a | etadata":.{},......."source":.[. |
| 15680 | 20 20 20 20 20 20 20 20 22 44 69 72 61 63 20 44 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c | ........"Dirac.Data\n----------\ |
| 156a0 | 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | n\n".......].....},.....{....... |
| 156c0 | 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 | "cell_type":."code",......."exec |
| 156e0 | 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 | ution_count":.null,......."metad |
| 15700 | 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c | ata":.{........."collapsed":.fal |
| 15720 | 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c | se.......},......."outputs":.[], |
| 15740 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 | ......."source":.[........."#%%. |
| 15760 | 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 61 31 20 3d 20 31 2e 30 20 2a 20 28 78 20 3e 20 31 30 | parameters\n\na1.=.1.0.*.(x.>.10 |
| 15780 | 29 20 2a 20 28 78 20 3c 20 35 30 29 5c 6e 61 32 20 3d 20 31 2e 30 20 2a 20 28 78 20 3e 20 36 30 | ).*.(x.<.50)\na2.=.1.0.*.(x.>.60 |
| 157a0 | 29 20 2a 20 28 78 20 3c 20 38 30 29 5c 6e 5c 6e 61 31 20 2f 3d 20 61 31 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e | ).*.(x.<.80)\n\na1./=.a1.sum()\n |
| 157c0 | 61 32 20 2f 3d 20 61 32 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 63 72 65 61 74 69 6e 67 20 6d 61 74 | a2./=.a2.sum()\n\n#.creating.mat |
| 157e0 | 72 69 78 20 41 20 63 6f 6e 74 61 69 6e 69 6e 67 20 61 6c 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f | rix.A.containing.all.distributio |
| 15800 | 6e 73 5c 6e 41 20 3d 20 6e 70 2e 76 73 74 61 63 6b 28 28 61 31 2c 20 61 32 29 29 2e 54 5c 6e 6e | ns\nA.=.np.vstack((a1,.a2)).T\nn |
| 15820 | 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 3d 20 41 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 5c 6e 5c 6e 23 | _distributions.=.A.shape[1]\n\n# |
| 15840 | 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 20 2b 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 4d 20 | .loss.matrix.+.normalization\nM. |
| 15860 | 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 64 69 73 74 30 28 6e 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 | =.ot.utils.dist0(n)\nM./=.M.max( |
| 15880 | 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e | )\n\n\n#%%.plot.the.distribution |
| 158a0 | 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 | s\n\npl.figure(1,.figsize=(6.4,. |
| 158c0 | 33 29 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 | 3))\nfor.i.in.range(n_distributi |
| 158e0 | 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e | ons):\n....pl.plot(x,.A[:,.i])\n |
| 15900 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 | pl.title('Distributions')\npl.ti |
| 15920 | 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 | ght_layout()\n\n\n#%%.barycenter |
| 15940 | 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 61 6c 70 68 61 20 3d 20 30 2e 35 20 20 23 20 30 | .computation\n\nalpha.=.0.5..#.0 |
| 15960 | 3c 3d 61 6c 70 68 61 3c 3d 31 5c 6e 77 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b | <=alpha<=1\nweights.=.np.array([ |
| 15980 | 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 32 62 61 72 79 5c 6e | 1.-.alpha,.alpha])\n\n#.l2bary\n |
| 159a0 | 62 61 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 77 61 | bary_l2.=.A.dot(weights)\n\n#.wa |
| 159c0 | 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 5c | sserstein\nreg.=.1e-3\not.tic()\ |
| 159e0 | 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 | nbary_wass.=.ot.bregman.barycent |
| 15a00 | 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 | er(A,.M,.reg,.weights)\not.toc() |
| 15a20 | 5c 6e 5c 6e 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 20 3d 20 6f 74 2e | \n\n\not.tic()\nbary_wass2.=.ot. |
| 15a40 | 6c 70 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 2c 20 73 6f 6c | lp.barycenter(A,.M,.weights,.sol |
| 15a60 | 76 65 72 3d 27 69 6e 74 65 72 69 6f 72 2d 70 6f 69 6e 74 27 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 | ver='interior-point',.verbose=Tr |
| 15a80 | 75 65 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 2e 61 70 70 65 | ue)\not.toc()\n\n\nproblems.appe |
| 15aa0 | 6e 64 28 5b 41 2c 20 5b 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 62 61 72 79 | nd([A,.[bary_l2,.bary_wass,.bary |
| 15ac0 | 5f 77 61 73 73 32 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c | _wass2]])\n\npl.figure(2)\npl.cl |
| 15ae0 | 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 | f()\npl.subplot(2,.1,.1)\nfor.i. |
| 15b00 | 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 | in.range(n_distributions):\n.... |
| 15b20 | 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 | pl.plot(x,.A[:,.i])\npl.title('D |
| 15b40 | 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 | istributions')\n\npl.subplot(2,. |
| 15b60 | 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c 20 | 1,.2)\npl.plot(x,.bary_l2,.'r',. |
| 15b80 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 | label='l2')\npl.plot(x,.bary_was |
| 15ba0 | 73 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 52 65 67 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 | s,.'g',.label='Reg.Wasserstein') |
| 15bc0 | 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 | \npl.plot(x,.bary_wass2,.'b',.la |
| 15be0 | 62 65 6c 3d 27 4c 50 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 | bel='LP.Wasserstein')\npl.legend |
| 15c00 | 28 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e | ()\npl.title('Barycenters')\npl. |
| 15c20 | 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 | tight_layout()\n\n#%%.parameters |
| 15c40 | 5c 6e 5c 6e 61 31 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 6e 29 5c 6e 61 32 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 | \n\na1.=.np.zeros(n)\na2.=.np.ze |
| 15c60 | 72 6f 73 28 6e 29 5c 6e 5c 6e 61 31 5b 31 30 5d 20 3d 20 2e 32 35 5c 6e 61 31 5b 32 30 5d 20 3d | ros(n)\n\na1[10].=..25\na1[20].= |
| 15c80 | 20 2e 35 5c 6e 61 31 5b 33 30 5d 20 3d 20 2e 32 35 5c 6e 61 32 5b 38 30 5d 20 3d 20 31 5c 6e 5c | ..5\na1[30].=..25\na2[80].=.1\n\ |
| 15ca0 | 6e 5c 6e 61 31 20 2f 3d 20 61 31 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e 61 32 20 2f 3d 20 61 32 2e 73 75 6d 28 | n\na1./=.a1.sum()\na2./=.a2.sum( |
| 15cc0 | 29 5c 6e 5c 6e 23 20 63 72 65 61 74 69 6e 67 20 6d 61 74 72 69 78 20 41 20 63 6f 6e 74 61 69 6e | )\n\n#.creating.matrix.A.contain |
| 15ce0 | 69 6e 67 20 61 6c 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 41 20 3d 20 6e 70 2e 76 73 | ing.all.distributions\nA.=.np.vs |
| 15d00 | 74 61 63 6b 28 28 61 31 2c 20 61 32 29 29 2e 54 5c 6e 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e | tack((a1,.a2)).T\nn_distribution |
| 15d20 | 73 20 3d 20 41 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 20 | s.=.A.shape[1]\n\n#.loss.matrix. |
| 15d40 | 2b 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 64 69 | +.normalization\nM.=.ot.utils.di |
| 15d60 | 73 74 30 28 6e 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c | st0(n)\nM./=.M.max()\n\n\n#%%.pl |
| 15d80 | 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 | ot.the.distributions\n\npl.figur |
| 15da0 | 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e | e(1,.figsize=(6.4,.3))\nfor.i.in |
| 15dc0 | 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c | .range(n_distributions):\n....pl |
| 15de0 | 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 | .plot(x,.A[:,.i])\npl.title('Dis |
| 15e00 | 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c | tributions')\npl.tight_layout()\ |
| 15e20 | 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 5c | n\n\n#%%.barycenter.computation\ |
| 15e40 | 6e 5c 6e 61 6c 70 68 61 20 3d 20 30 2e 35 20 20 23 20 30 3c 3d 61 6c 70 68 61 3c 3d 31 5c 6e 77 | n\nalpha.=.0.5..#.0<=alpha<=1\nw |
| 15e60 | 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c | eights.=.np.array([1.-.alpha,.al |
| 15e80 | 70 68 61 5d 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 32 62 61 72 79 5c 6e 62 61 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 41 2e 64 | pha])\n\n#.l2bary\nbary_l2.=.A.d |
| 15ea0 | 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 5c 6e 72 65 | ot(weights)\n\n#.wasserstein\nre |
| 15ec0 | 67 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 20 3d 20 | g.=.1e-3\not.tic()\nbary_wass.=. |
| 15ee0 | 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c | ot.bregman.barycenter(A,.M,.reg, |
| 15f00 | 20 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 | .weights)\not.toc()\n\n\not.tic( |
| 15f20 | 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 20 3d 20 6f 74 2e 6c 70 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 | )\nbary_wass2.=.ot.lp.barycenter |
| 15f40 | 28 41 2c 20 4d 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 2c 20 73 6f 6c 76 65 72 3d 27 69 6e 74 65 72 69 6f 72 | (A,.M,.weights,.solver='interior |
| 15f60 | 2d 70 6f 69 6e 74 27 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 | -point',.verbose=True)\not.toc() |
| 15f80 | 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 5b 41 2c 20 5b 62 61 72 79 5f | \n\n\nproblems.append([A,.[bary_ |
| 15fa0 | 6c 32 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e | l2,.bary_wass,.bary_wass2]])\n\n |
| 15fc0 | 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | pl.figure(2)\npl.clf()\npl.subpl |
| 15fe0 | 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 | ot(2,.1,.1)\nfor.i.in.range(n_di |
| 16000 | 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b | stributions):\n....pl.plot(x,.A[ |
| 16020 | 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 | :,.i])\npl.title('Distributions' |
| 16040 | 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f | )\n\npl.subplot(2,.1,.2)\npl.plo |
| 16060 | 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 5c 6e | t(x,.bary_l2,.'r',.label='l2')\n |
| 16080 | 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 62 65 6c | pl.plot(x,.bary_wass,.'g',.label |
| 160a0 | 3d 27 52 65 67 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 | ='Reg.Wasserstein')\npl.plot(x,. |
| 160c0 | 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 50 20 57 61 73 73 65 | bary_wass2,.'b',.label='LP.Wasse |
| 160e0 | 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | rstein')\npl.legend()\npl.title( |
| 16100 | 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 | 'Barycenters')\npl.tight_layout( |
| 16120 | 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 | )".......].....},.....{......."c |
| 16140 | 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 | ell_type":."markdown",......."me |
| 16160 | 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 | tadata":.{},......."source":.[.. |
| 16180 | 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 6e 61 6c 20 66 69 67 75 72 65 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ......."Final.figure\n---------- |
| 161a0 | 2d 2d 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 | --\n\n\n".......].....},.....{.. |
| 161c0 | 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 | ....."cell_type":."code",....... |
| 161e0 | 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 | "execution_count":.null,......." |
| 16200 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 | metadata":.{........."collapsed" |
| 16220 | 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 | :.false.......},......."outputs" |
| 16240 | 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 | :.[],......."source":.[......... |
| 16260 | 22 23 25 25 20 70 6c 6f 74 5c 6e 5c 6e 6e 62 6d 20 3d 20 6c 65 6e 28 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 29 | "#%%.plot\n\nnbm.=.len(problems) |
| 16280 | 5c 6e 6e 62 6d 32 20 3d 20 28 6e 62 6d 20 2f 2f 20 32 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 | \nnbm2.=.(nbm.//.2)\n\n\npl.figu |
| 162a0 | 72 65 28 32 2c 20 28 32 30 2c 20 36 29 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 5c 6e 66 6f 72 20 | re(2,.(20,.6))\npl.clf()\n\nfor. |
| 162c0 | 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 62 6d 29 3a 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 41 20 3d 20 70 72 6f 62 | i.in.range(nbm):\n\n....A.=.prob |
| 162e0 | 6c 65 6d 73 5b 69 5d 5b 30 5d 5c 6e 20 20 20 20 62 61 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 70 72 6f 62 6c 65 | lems[i][0]\n....bary_l2.=.proble |
| 16300 | 6d 73 5b 69 5d 5b 31 5d 5b 30 5d 5c 6e 20 20 20 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 20 3d 20 70 72 6f | ms[i][1][0]\n....bary_wass.=.pro |
| 16320 | 62 6c 65 6d 73 5b 69 5d 5b 31 5d 5b 31 5d 5c 6e 20 20 20 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 20 3d | blems[i][1][1]\n....bary_wass2.= |
| 16340 | 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 5b 69 5d 5b 31 5d 5b 32 5d 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 73 75 62 | .problems[i][1][2]\n\n....pl.sub |
| 16360 | 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 6e 62 6d 2c 20 31 20 2b 20 69 29 5c 6e 20 20 20 20 66 6f 72 20 6a 20 69 | plot(2,.nbm,.1.+.i)\n....for.j.i |
| 16380 | 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 | n.range(n_distributions):\n..... |
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| 1d1a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 | -----------------------\n\n".... |
| 1d1c0 | 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 | ...].....},.....{......."cell_ty |
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| 1d320 | 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 69 6d 61 | =Xt)\n\n#.prediction.between.ima |
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| 1d3a0 | 58 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 69 6e 76 65 72 73 65 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 | Xt_emd.=.ot_emd.inverse_transfor |
| 1d3c0 | 6d 28 58 74 3d 58 32 29 5c 6e 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d | m(Xt=X2)\n\ntransp_Xs_sinkhorn.= |
| 1d3e0 | 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 5c 6e 74 | .ot_sinkhorn.transform(Xs=X1)\nt |
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| 1d4c0 | 6f 72 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 49 32 74 65 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d | orn,.I1.shape))\nI2te.=.minmax(m |
| 1d4e0 | 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 32 2e 73 68 61 | at2im(transp_Xt_sinkhorn,.I2.sha |
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| 1d520 | 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 | ."cell_type":."markdown",....... |
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| 1d5a0 | 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c | ....{......."cell_type":."code", |
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