summaryrefslogtreecommitdiff
path: root/docs/source/auto_examples/auto_examples_jupyter.zip
blob: 3bb8ecf5747f03d0e6f60abb5ce0167b6014164d (plain)
ofshex dumpascii
0000 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 02 84 1e 4b 5d 81 39 dd bc 0c 00 00 bc 0c 00 00 1c 00 00 00 61 75 PK...........K].9.............au
0020 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 57 44 41 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e to_examples/plot_WDA.ipynb{..."n
0040 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 bformat_minor":.0,...."nbformat"
0060 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 :.4,...."cells":.[.....{......."
0080 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 execution_count":.null,........"
00a0 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 cell_type":."code",........"sour
00c0 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 ce":.[........."%matplotlib.inli
00e0 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b ne".......],........"outputs":.[
0100 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 ],........"metadata":.{.........
0120 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d "collapsed":.false.......}.....}
0140 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 ,......{......."source":.[......
0160 20 20 20 22 5c 6e 23 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 44 69 73 63 72 69 6d 69 6e 61 6e 74 ..."\n#.Wasserstein.Discriminant
0180 20 41 6e 61 6c 79 73 69 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 .Analysis\n\n\n\n".......],.....
01a0 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 ..."cell_type":."markdown",.....
01c0 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a ..."metadata":.{}.....},......{.
01e0 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a ......"execution_count":.null,..
0200 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 ......"cell_type":."code",......
0220 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a .."source":.[........."#.Author:
0240 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 .Remi.Flamary.<remi.flamary@unic
0260 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 e.fr>\n#\n#.License:.MIT.License
0280 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d \n\nimport.numpy.as.np\nimport.m
02a0 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6f 74 atplotlib.pylab.as.pl\n\nfrom.ot
02c0 2e 64 72 20 69 6d 70 6f 72 74 20 77 64 61 2c 20 66 64 61 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 .dr.import.wda,.fda\n\n\n#%%.par
02e0 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 20 3d 20 31 30 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 ameters\n\nn.=.1000..#.nb.sample
0300 73 20 69 6e 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 61 74 61 73 65 74 73 5c s.in.source.and.target.datasets\
0320 6e 6e 7a 20 3d 20 30 2e 32 5c 6e 5c 6e 23 20 67 65 6e 65 72 61 74 65 20 63 69 72 63 6c 65 20 64 nnz.=.0.2\n\n#.generate.circle.d
0340 61 74 61 73 65 74 5c 6e 74 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 28 6e 29 20 2a 20 ataset\nt.=.np.random.rand(n).*.
0360 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 5c 6e 79 73 20 3d 20 6e 70 2e 66 6c 6f 6f 72 28 28 6e 70 2e 61 72 61 2.*.np.pi\nys.=.np.floor((np.ara
0380 6e 67 65 28 6e 29 20 2a 20 31 2e 30 20 2f 20 6e 20 2a 20 33 29 29 20 2b 20 31 5c 6e 78 73 20 3d nge(n).*.1.0./.n.*.3)).+.1\nxs.=
03a0 20 6e 70 2e 63 6f 6e 63 61 74 65 6e 61 74 65 28 5c 6e 20 20 20 20 28 6e 70 2e 63 6f 73 28 74 29 .np.concatenate(\n....(np.cos(t)
03c0 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 2c 20 6e 70 2e 73 69 6e 28 74 29 2e 72 65 73 .reshape((-1,.1)),.np.sin(t).res
03e0 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 29 2c 20 31 29 5c 6e 78 73 20 3d 20 78 73 20 2a 20 79 73 hape((-1,.1))),.1)\nxs.=.xs.*.ys
0400 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 2d 31 2c 20 31 29 20 2b 20 6e 7a 20 2a 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d .reshape(-1,.1).+.nz.*.np.random
0420 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c 20 32 29 5c 6e 5c 6e 74 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 .randn(n,.2)\n\nt.=.np.random.ra
0440 6e 64 28 6e 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 5c 6e 79 74 20 3d 20 6e 70 2e 66 6c 6f 6f 72 nd(n).*.2.*.np.pi\nyt.=.np.floor
0460 28 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2a 20 31 2e 30 20 2f 20 6e 20 2a 20 33 29 29 20 2b ((np.arange(n).*.1.0./.n.*.3)).+
0480 20 31 5c 6e 78 74 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 6e 63 61 74 65 6e 61 74 65 28 5c 6e 20 20 20 20 28 6e .1\nxt.=.np.concatenate(\n....(n
04a0 70 2e 63 6f 73 28 74 29 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 2c 20 6e 70 2e 73 69 p.cos(t).reshape((-1,.1)),.np.si
04c0 6e 28 74 29 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 29 2c 20 31 29 5c 6e 78 74 20 3d n(t).reshape((-1,.1))),.1)\nxt.=
04e0 20 78 74 20 2a 20 79 74 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 2d 31 2c 20 31 29 20 2b 20 6e 7a 20 2a 20 6e .xt.*.yt.reshape(-1,.1).+.nz.*.n
0500 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c 20 32 29 5c 6e 5c 6e 6e 62 6e 6f 69 73 65 20 p.random.randn(n,.2)\n\nnbnoise.
0520 3d 20 38 5c 6e 5c 6e 78 73 20 3d 20 6e 70 2e 68 73 74 61 63 6b 28 28 78 73 2c 20 6e 70 2e 72 61 =.8\n\nxs.=.np.hstack((xs,.np.ra
0540 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c 20 6e 62 6e 6f 69 73 65 29 29 29 5c 6e 78 74 20 3d 20 6e ndom.randn(n,.nbnoise)))\nxt.=.n
0560 70 2e 68 73 74 61 63 6b 28 28 78 74 2c 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c p.hstack((xt,.np.random.randn(n,
0580 20 6e 62 6e 6f 69 73 65 29 29 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c .nbnoise)))\n\n#%%.plot.samples\
05a0 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 2e 35 29 npl.figure(1,.figsize=(6.4,.3.5)
05c0 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 )\n\npl.subplot(1,.2,.1)\npl.sca
05e0 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d tter(xt[:,.0],.xt[:,.1],.c=ys,.m
0600 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 arker='+',.label='Source.samples
0620 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 ')\npl.legend(loc=0)\npl.title('
0640 44 69 73 63 72 69 6d 69 6e 61 6e 74 20 64 69 6d 65 6e 73 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e Discriminant.dimensions')\n\npl.
0660 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b subplot(1,.2,.2)\npl.scatter(xt[
0680 3a 2c 20 32 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 33 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b :,.2],.xt[:,.3],.c=ys,.marker='+
06a0 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c ',.label='Source.samples')\npl.l
06c0 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 74 68 65 72 20 64 69 egend(loc=0)\npl.title('Other.di
06e0 6d 65 6e 73 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c mensions')\npl.tight_layout()\n\
0700 6e 23 25 25 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 46 44 41 5c 6e 70 20 3d 20 32 5c 6e 5c 6e 50 66 64 61 2c n#%%.Compute.FDA\np.=.2\n\nPfda,
0720 20 70 72 6f 6a 66 64 61 20 3d 20 66 64 61 28 78 73 2c 20 79 73 2c 20 70 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 .projfda.=.fda(xs,.ys,.p)\n\n#%%
0740 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 57 44 41 5c 6e 70 20 3d 20 32 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 30 5c 6e .Compute.WDA\np.=.2\nreg.=.1e0\n
0760 6b 20 3d 20 31 30 5c 6e 6d 61 78 69 74 65 72 20 3d 20 31 30 30 5c 6e 5c 6e 50 77 64 61 2c 20 70 k.=.10\nmaxiter.=.100\n\nPwda,.p
0780 72 6f 6a 77 64 61 20 3d 20 77 64 61 28 78 73 2c 20 79 73 2c 20 70 2c 20 72 65 67 2c 20 6b 2c 20 rojwda.=.wda(xs,.ys,.p,.reg,.k,.
07a0 6d 61 78 69 74 65 72 3d 6d 61 78 69 74 65 72 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d maxiter=maxiter)\n\n#%%.plot.sam
07c0 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 78 73 70 20 3d 20 70 72 6f 6a 66 64 61 28 78 73 29 5c 6e 78 74 70 20 3d ples\n\nxsp.=.projfda(xs)\nxtp.=
07e0 20 70 72 6f 6a 66 64 61 28 78 74 29 5c 6e 5c 6e 78 73 70 77 20 3d 20 70 72 6f 6a 77 64 61 28 78 .projfda(xt)\n\nxspw.=.projwda(x
0800 73 29 5c 6e 78 74 70 77 20 3d 20 70 72 6f 6a 77 64 61 28 78 74 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 s)\nxtpw.=.projwda(xt)\n\npl.fig
0820 75 72 65 28 32 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 ure(2)\n\npl.subplot(2,.2,.1)\np
0840 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 70 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 70 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 l.scatter(xsp[:,.0],.xsp[:,.1],.
0860 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 50 72 6f 6a 65 63 74 c=ys,.marker='+',.label='Project
0880 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e ed.samples')\npl.legend(loc=0)\n
08a0 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 6d pl.title('Projected.training.sam
08c0 70 6c 65 73 20 46 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 ples.FDA')\n\npl.subplot(2,.2,.2
08e0 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 70 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 70 5b 3a 2c 20 )\npl.scatter(xtp[:,.0],.xtp[:,.
0900 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 50 72 6f 1],.c=ys,.marker='+',.label='Pro
0920 6a 65 63 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d jected.samples')\npl.legend(loc=
0940 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 74 65 73 74 20 73 61 6d 0)\npl.title('Projected.test.sam
0960 70 6c 65 73 20 46 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 ples.FDA')\n\npl.subplot(2,.2,.3
0980 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 70 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 70 77 5b 3a )\npl.scatter(xspw[:,.0],.xspw[:
09a0 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 50 ,.1],.c=ys,.marker='+',.label='P
09c0 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f rojected.samples')\npl.legend(lo
09e0 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 74 72 61 69 6e 69 c=0)\npl.title('Projected.traini
0a00 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 57 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 ng.samples.WDA')\n\npl.subplot(2
0a20 2c 20 32 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 70 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 ,.2,.4)\npl.scatter(xtpw[:,.0],.
0a40 78 74 70 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 xtpw[:,.1],.c=ys,.marker='+',.la
0a60 62 65 6c 3d 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 bel='Projected.samples')\npl.leg
0a80 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 end(loc=0)\npl.title('Projected.
0aa0 74 65 73 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 57 44 41 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 test.samples.WDA')\npl.tight_lay
0ac0 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 out()\n\npl.show()".......],....
0ae0 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 ...."outputs":.[],........"metad
0b00 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c ata":.{........."collapsed":.fal
0b20 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 se.......}.....}...],...."metada
0b40 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 ta":.{....."kernelspec":.{......
0b60 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 ."display_name":."Python.2",....
0b80 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c ...."name":."python2",........"l
0ba0 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 anguage":."python".....},......"
0bc0 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 language_info":.{......."mimetyp
0be0 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 e":."text/x-python",........"nbc
0c00 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 onvert_exporter":."python",.....
0c20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c ..."name":."python",........"fil
0c40 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 e_extension":.".py",........"ver
0c60 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 sion":."2.7.12",........"pygment
0c80 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f s_lexer":."ipython2",........"co
0ca0 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 demirror_mode":.{........."versi
0cc0 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f on":.2,.........."name":."ipytho
0ce0 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 n".......}.....}...}.}PK........
0d00 87 7b 82 49 fa 8c 13 06 e2 10 00 00 e2 10 00 00 25 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 .{.I............%...auto_example
0d20 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 s/plot_OTDA_mapping.ipynb{..."nb
0d40 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a format_minor":.0,...."nbformat":
0d60 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 .4,...."cells":.[.....{......."e
0d80 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 xecution_count":.null,........"c
0da0 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 ell_type":."code",........"sourc
0dc0 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e e":.[........."%matplotlib.inlin
0de0 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d e".......],........"outputs":.[]
0e00 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 ,........"metadata":.{........."
0e20 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c collapsed":.false.......}.....},
0e40 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 ......{......."source":.[.......
0e60 20 20 22 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d .."\n===========================
0e80 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 4f 54 20 6d 61 70 70 69 6e 67 ====================\nOT.mapping
0ea0 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f .estimation.for.domain.adaptatio
0ec0 6e 20 5b 38 5d 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d n.[8]\n=========================
0ee0 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 5c 6e 5b 38 5d 20 4d 2e ======================\n\n[8].M.
0f00 20 50 65 72 72 6f 74 2c 20 4e 2e 20 43 6f 75 72 74 79 2c 20 52 2e 20 46 6c 61 6d 61 72 79 2c 20 .Perrot,.N..Courty,.R..Flamary,.
0f20 41 2e 20 48 61 62 72 61 72 64 2c 20 5c 22 4d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e A..Habrard,.\"Mapping.estimation
0f40 20 66 6f 72 5c 6e 20 20 20 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 .for\n....discrete.optimal.trans
0f60 70 6f 72 74 5c 22 2c 20 4e 65 75 72 61 6c 20 49 6e 66 6f 72 6d 61 74 69 6f 6e 20 50 72 6f 63 65 port\",.Neural.Information.Proce
0f80 73 73 69 6e 67 20 53 79 73 74 65 6d 73 20 28 4e 49 50 53 29 2c 20 32 30 31 36 2e 5c 6e 5c 6e 22 ssing.Systems.(NIPS),.2016.\n\n"
0fa0 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d .......],........"cell_type":."m
0fc0 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a arkdown",........"metadata":.{}.
0fe0 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 ....},......{......."execution_c
1000 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a ount":.null,........"cell_type":
1020 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 ."code",........"source":.[.....
1040 20 20 20 20 22 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 ...."import.numpy.as.np\nimport.
1060 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f matplotlib.pylab.as.pl\nimport.o
1080 74 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 64 61 74 61 73 65 74 20 67 65 6e 65 72 61 74 69 6f 6e 5c t\n\n\n\n#%%.dataset.generation\
10a0 6e 5c 6e 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 73 65 65 64 28 30 29 20 23 20 6d 61 6b 65 73 20 65 78 61 n\nnp.random.seed(0).#.makes.exa
10c0 6d 70 6c 65 20 72 65 70 72 6f 64 75 63 69 62 6c 65 5c 6e 5c 6e 6e 3d 31 30 30 20 23 20 6e 62 20 mple.reproducible\n\nn=100.#.nb.
10e0 73 61 6d 70 6c 65 73 20 69 6e 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 61 74 samples.in.source.and.target.dat
1100 61 73 65 74 73 5c 6e 74 68 65 74 61 3d 32 2a 6e 70 2e 70 69 2f 32 30 5c 6e 6e 7a 3d 30 2e 31 5c asets\ntheta=2*np.pi/20\nnz=0.1\
1120 6e 78 73 2c 79 73 3d 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 nxs,ys=ot.datasets.get_data_clas
1140 73 69 66 28 27 67 61 75 73 73 72 6f 74 27 2c 6e 2c 6e 7a 3d 6e 7a 29 5c 6e 78 74 2c 79 74 3d 6f sif('gaussrot',n,nz=nz)\nxt,yt=o
1160 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 67 61 75 t.datasets.get_data_classif('gau
1180 73 73 72 6f 74 27 2c 6e 2c 74 68 65 74 61 3d 74 68 65 74 61 2c 6e 7a 3d 6e 7a 29 5c 6e 5c 6e 23 ssrot',n,theta=theta,nz=nz)\n\n#
11a0 20 6f 6e 65 20 6f 66 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 6d 6f 64 65 20 63 68 61 6e 67 65 73 20 .one.of.the.target.mode.changes.
11c0 69 74 73 20 76 61 72 69 61 6e 63 65 20 28 6e 6f 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 29 its.variance.(no.linear.mapping)
11e0 5c 6e 78 74 5b 79 74 3d 3d 32 5d 2a 3d 33 5c 6e 78 74 3d 78 74 2b 34 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 \nxt[yt==2]*=3\nxt=xt+4\n\n\n#%%
1200 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 28 38 2c .plot.samples\n\npl.figure(1,(8,
1220 35 29 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 5b 3a 5))\npl.clf()\n\npl.scatter(xs[:
1240 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 ,0],xs[:,1],c=ys,marker='+',labe
1260 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 l='Source.samples')\npl.scatter(
1280 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c xt[:,0],xt[:,1],c=yt,marker='o',
12a0 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 label='Target.samples')\n\npl.le
12c0 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e gend(loc=0)\npl.title('Source.an
12e0 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e d.target.distributions')\n\n\n\n
1300 23 25 25 20 4f 54 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e #%%.OT.linear.mapping.estimation
1320 5c 6e 5c 6e 65 74 61 3d 31 65 2d 38 20 20 20 23 20 71 75 61 64 72 61 74 69 63 20 72 65 67 75 6c \n\neta=1e-8...#.quadratic.regul
1340 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 72 65 67 72 65 73 73 69 6f 6e 5c 6e 6d 75 3d 31 65 30 arization.for.regression\nmu=1e0
1360 20 20 20 20 20 23 20 77 65 69 67 68 74 20 6f 66 20 74 68 65 20 4f 54 20 6c 69 6e 65 61 72 20 74 .....#.weight.of.the.OT.linear.t
1380 65 72 6d 5c 6e 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 20 20 23 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 20 61 20 62 69 61 erm\nbias=True..#.estimate.a.bia
13a0 73 5c 6e 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 5f 6d 61 70 70 69 s\n\not_mapping=ot.da.OTDA_mappi
13c0 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 28 29 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 ng_linear()\not_mapping.fit(xs,x
13e0 74 2c 6d 75 3d 6d 75 2c 65 74 61 3d 65 74 61 2c 62 69 61 73 3d 62 69 61 73 2c 6e 75 6d 49 74 65 t,mu=mu,eta=eta,bias=bias,numIte
1400 72 6d 61 78 20 3d 20 32 30 2c 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 78 73 74 3d 6f rmax.=.20,verbose=True)\n\nxst=o
1420 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 78 73 29 20 23 20 75 73 65 20 74 68 65 20 t_mapping.predict(xs).#.use.the.
1440 65 73 74 69 6d 61 74 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 78 73 74 30 3d 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 estimated.mapping\nxst0=ot_mappi
1460 6e 67 2e 69 6e 74 65 72 70 28 29 20 20 20 23 20 75 73 65 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 ng.interp()...#.use.barycentric.
1480 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 28 31 30 2c 37 29 29 mapping\n\n\npl.figure(2,(10,7))
14a0 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 31 29 5c 6e 70 \npl.clf()\npl.subplot(2,2,1)\np
14c0 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d l.scatter(xt[:,0],xt[:,1],c=yt,m
14e0 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 arker='o',label='Target.samples'
1500 2c 61 6c 70 68 61 3d 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 30 5b 3a 2c 30 5d ,alpha=.3)\npl.scatter(xst0[:,0]
1520 2c 78 73 74 30 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c ,xst0[:,1],c=ys,marker='+',label
1540 3d 27 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c ='barycentric.mapping')\npl.titl
1560 65 28 5c 22 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c e(\"barycentric.mapping\")\n\npl
1580 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a .subplot(2,2,2)\npl.scatter(xt[:
15a0 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 ,0],xt[:,1],c=yt,marker='o',labe
15c0 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 2e 33 29 5c 6e 70 6c l='Target.samples',alpha=.3)\npl
15e0 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c .scatter(xst[:,0],xst[:,1],c=ys,
1600 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 65 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e marker='+',label='Learned.mappin
1620 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 4c 65 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c g')\npl.title(\"Learned.mapping\
1640 22 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 4b 65 72 6e 65 6c 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 ")\n\n\n\n#%%.Kernel.mapping.est
1660 69 6d 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 65 74 61 3d 31 65 2d 35 20 20 20 23 20 71 75 61 64 72 61 74 69 imation\n\neta=1e-5...#.quadrati
1680 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 72 65 67 72 65 73 73 69 6f 6e 5c c.regularization.for.regression\
16a0 6e 6d 75 3d 31 65 2d 31 20 20 20 20 20 23 20 77 65 69 67 68 74 20 6f 66 20 74 68 65 20 4f 54 20 nmu=1e-1.....#.weight.of.the.OT.
16c0 6c 69 6e 65 61 72 20 74 65 72 6d 5c 6e 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 20 20 23 20 65 73 74 69 6d 61 linear.term\nbias=True..#.estima
16e0 74 65 20 61 20 62 69 61 73 5c 6e 73 69 67 6d 61 3d 31 20 20 20 20 23 20 73 69 67 6d 61 20 62 61 te.a.bias\nsigma=1....#.sigma.ba
1700 6e 64 77 69 64 74 68 20 66 6f 74 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 6b 65 72 6e 65 6c 5c 6e 5c 6e 5c ndwidth.fot.gaussian.kernel\n\n\
1720 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 6c 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 5f 6d 61 not_mapping_kernel=ot.da.OTDA_ma
1740 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 6c 28 29 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 pping_kernel()\not_mapping_kerne
1760 6c 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 74 2c 6d 75 3d 6d 75 2c 65 74 61 3d 65 74 61 2c 73 69 67 6d 61 3d l.fit(xs,xt,mu=mu,eta=eta,sigma=
1780 73 69 67 6d 61 2c 62 69 61 73 3d 62 69 61 73 2c 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 20 3d 20 31 30 2c sigma,bias=bias,numItermax.=.10,
17a0 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 78 73 74 5f 6b 65 72 6e 65 6c 3d 6f 74 5f 6d verbose=True)\n\nxst_kernel=ot_m
17c0 61 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 6c 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 78 73 29 20 23 20 75 73 65 20 apping_kernel.predict(xs).#.use.
17e0 74 68 65 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 78 73 74 30 5f 6b 65 72 6e the.estimated.mapping\nxst0_kern
1800 65 6c 3d 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 6c 2e 69 6e 74 65 72 70 28 29 20 20 20 el=ot_mapping_kernel.interp()...
1820 23 20 75 73 65 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 #.use.barycentric.mapping\n\n\n#
1840 25 25 20 50 6c 6f 74 74 69 6e 67 20 74 68 65 20 6d 61 70 70 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e %%.Plotting.the.mapped.samples\n
1860 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 28 31 30 2c 37 29 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c \npl.figure(2,(10,7))\npl.clf()\
1880 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 npl.subplot(2,2,1)\npl.scatter(x
18a0 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c t[:,0],xt[:,1],c=yt,marker='o',l
18c0 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c abel='Target.samples',alpha=.2)\
18e0 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 30 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 30 5b 3a 2c 31 5d 2c npl.scatter(xst0[:,0],xst0[:,1],
1900 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 4d 61 70 70 65 64 20 73 6f c=ys,marker='+',label='Mapped.so
1920 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 42 61 72 79 2e urce.samples')\npl.title(\"Bary.
1940 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 5c 22 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 .mapping.(linear)\")\npl.legend(
1960 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e loc=0)\n\npl.subplot(2,2,2)\npl.
1980 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 scatter(xt[:,0],xt[:,1],c=yt,mar
19a0 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 ker='o',label='Target.samples',a
19c0 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 lpha=.2)\npl.scatter(xst[:,0],xs
19e0 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 65 t[:,1],c=ys,marker='+',label='Le
1a00 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 45 73 74 69 arned.mapping')\npl.title(\"Esti
1a20 6d 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 m..mapping.(linear)\")\n\npl.sub
1a40 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c plot(2,2,3)\npl.scatter(xt[:,0],
1a60 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 xt[:,1],c=yt,marker='o',label='T
1a80 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 arget.samples',alpha=.2)\npl.sca
1aa0 74 74 65 72 28 78 73 74 30 5f 6b 65 72 6e 65 6c 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 30 5f 6b 65 72 6e 65 tter(xst0_kernel[:,0],xst0_kerne
1ac0 6c 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 62 61 l[:,1],c=ys,marker='+',label='ba
1ae0 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 rycentric.mapping')\npl.title(\"
1b00 42 61 72 79 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6b 65 72 6e 65 6c 29 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e Bary..mapping.(kernel)\")\n\npl.
1b20 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 34 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c subplot(2,2,4)\npl.scatter(xt[:,
1b40 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 0],xt[:,1],c=yt,marker='o',label
1b60 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e ='Target.samples',alpha=.2)\npl.
1b80 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 5f 6b 65 72 6e 65 6c 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 5f 6b 65 72 6e scatter(xst_kernel[:,0],xst_kern
1ba0 65 6c 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c el[:,1],c=ys,marker='+',label='L
1bc0 65 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 45 73 74 earned.mapping')\npl.title(\"Est
1be0 69 6d 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6b 65 72 6e 65 6c 29 5c 22 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d im..mapping.(kernel)\")".......]
1c00 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 ,........"outputs":.[],........"
1c20 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 metadata":.{........."collapsed"
1c40 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d :.false.......}.....}...],...."m
1c60 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a etadata":.{....."kernelspec":.{.
1c80 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 ......"display_name":."Python.2"
1ca0 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 ,........"name":."python2",.....
1cc0 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a ..."language":."python".....},..
1ce0 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 ...."language_info":.{......."mi
1d00 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 metype":."text/x-python",.......
1d20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c ."nbconvert_exporter":."python",
1d40 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ........"name":."python",.......
1d60 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ."file_extension":.".py",.......
1d80 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 ."version":."2.7.12",........"py
1da0 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 gments_lexer":."ipython2",......
1dc0 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 .."codemirror_mode":.{........."
1de0 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 version":.2,.........."name":."i
1e00 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 python".......}.....}...}.}PK...
1e20 00 00 00 00 00 04 84 1e 4b d9 36 2d b4 9c 09 00 00 9c 09 00 00 24 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 ........K.6-.........$...auto_ex
1e40 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 70 74 69 6d 5f 4f 54 72 65 67 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 amples/plot_optim_OTreg.ipynb{..
1e60 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d ."nbformat_minor":.0,...."nbform
1e80 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 at":.4,...."cells":.[.....{.....
1ea0 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 .."execution_count":.null,......
1ec0 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 .."cell_type":."code",........"s
1ee0 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 ource":.[........."%matplotlib.i
1f00 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 nline".......],........"outputs"
1f20 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 :.[],........"metadata":.{......
1f40 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 ..."collapsed":.false.......}...
1f60 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 ..},......{......."source":.[...
1f80 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 4f 54 20 77 69 74 68 20 67 ......"\n#.Regularized.OT.with.g
1fa0 65 6e 65 72 69 63 20 73 6f 6c 76 65 72 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d eneric.solver\n\n\n\n\n".......]
1fc0 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 ,........"cell_type":."markdown"
1fe0 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a ,........"metadata":.{}.....},..
2000 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e ....{......."execution_count":.n
2020 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c ull,........"cell_type":."code",
2040 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 69 6d 70 ........"source":.[........."imp
2060 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c ort.numpy.as.np\nimport.matplotl
2080 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 ib.pylab.as.pl\nimport.ot\n\n\n#
20a0 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 62 %%.parameters\n\nn.=.100..#.nb.b
20c0 69 6e 73 5c 6e 5c 6e 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 5c 6e 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 ins\n\n#.bin.positions\nx.=.np.a
20e0 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e 5c 6e 23 20 range(n,.dtype=np.float64)\n\n#.
2100 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 61 20 3d 20 6f 74 2e 64 Gaussian.distributions\na.=.ot.d
2120 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d atasets.get_1D_gauss(n,.m=20,.s=
2140 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 5c 6e 62 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 5)..#.m=.mean,.s=.std\nb.=.ot.da
2160 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 36 30 2c 20 73 3d 31 tasets.get_1D_gauss(n,.m=60,.s=1
2180 30 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 0)\n\n#.loss.matrix\nM.=.ot.dist
21a0 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e (x.reshape((n,.1)),.x.reshape((n
21c0 2c 20 31 29 29 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 45 4d 44 5c ,.1)))\nM./=.M.max()\n\n#%%.EMD\
21e0 6e 5c 6e 47 30 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 n\nG0.=.ot.emd(a,.b,.M)\n\npl.fi
2200 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 gure(3,.figsize=(5,.5))\not.plot
2220 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 30 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 .plot1D_mat(a,.b,.G0,.'OT.matrix
2240 20 47 30 27 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e .G0')\n\n#%%.Example.with.Froben
2260 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 ius.norm.regularization\n\n\ndef
2280 20 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 30 2e 35 20 2a 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 .f(G):\n....return.0.5.*.np.sum(
22a0 47 2a 2a 32 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 G**2)\n\n\ndef.df(G):\n....retur
22c0 6e 20 47 5c 6e 5c 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 31 5c 6e 5c 6e 47 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e n.G\n\n\nreg.=.1e-1\n\nGl2.=.ot.
22e0 6f 70 74 69 6d 2e 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 optim.cg(a,.b,.M,.reg,.f,.df,.ve
2300 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 5c 6e 6f 74 2e rbose=True)\n\npl.figure(3)\not.
2320 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 6c 32 2c 20 27 4f 54 20 6d plot.plot1D_mat(a,.b,.Gl2,.'OT.m
2340 61 74 72 69 78 20 46 72 6f 62 2e 20 72 65 67 27 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 atrix.Frob..reg')\n\n#%%.Example
2360 20 77 69 74 68 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c .with.entropic.regularization\n\
2380 6e 5c 6e 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 n\ndef.f(G):\n....return.np.sum(
23a0 47 20 2a 20 6e 70 2e 6c 6f 67 28 47 29 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 5c 6e G.*.np.log(G))\n\n\ndef.df(G):\n
23c0 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 6c 6f 67 28 47 29 20 2b 20 31 2e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 72 ....return.np.log(G).+.1.\n\n\nr
23e0 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 5c 6e 47 65 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 63 67 28 61 2c eg.=.1e-3\n\nGe.=.ot.optim.cg(a,
2400 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 .b,.M,.reg,.f,.df,.verbose=True)
2420 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 \n\npl.figure(4,.figsize=(5,.5))
2440 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 65 2c 20 27 \not.plot.plot1D_mat(a,.b,.Ge,.'
2460 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 45 6e 74 72 6f 70 2e 20 72 65 67 27 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 45 OT.matrix.Entrop..reg')\n\n#%%.E
2480 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 2b 20 65 6e 74 xample.with.Frobenius.norm.+.ent
24a0 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 67 63 67 5c 6e 5c ropic.regularization.with.gcg\n\
24c0 6e 5c 6e 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 30 2e 35 20 2a 20 6e n\ndef.f(G):\n....return.0.5.*.n
24e0 70 2e 73 75 6d 28 47 2a 2a 32 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 20 p.sum(G**2)\n\n\ndef.df(G):\n...
2500 20 72 65 74 75 72 6e 20 47 5c 6e 5c 6e 5c 6e 72 65 67 31 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 72 65 67 32 .return.G\n\n\nreg1.=.1e-3\nreg2
2520 20 3d 20 31 65 2d 31 5c 6e 5c 6e 47 65 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 67 63 67 28 61 .=.1e-1\n\nGel2.=.ot.optim.gcg(a
2540 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 31 2c 20 72 65 67 32 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f ,.b,.M,.reg1,.reg2,.f,.df,.verbo
2560 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 se=True)\n\npl.figure(5,.figsize
2580 3d 28 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 =(5,.5))\not.plot.plot1D_mat(a,.
25a0 62 2c 20 47 65 6c 32 2c 20 27 4f 54 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 2b 20 6d 61 74 72 69 78 20 46 b,.Gel2,.'OT.entropic.+.matrix.F
25c0 72 6f 62 2e 20 72 65 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 rob..reg')\npl.show()".......],.
25e0 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 ......."outputs":.[],........"me
2600 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 tadata":.{........."collapsed":.
2620 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 false.......}.....}...],...."met
2640 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 adata":.{....."kernelspec":.{...
2660 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 ...."display_name":."Python.2",.
2680 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ......."name":."python2",.......
26a0 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 ."language":."python".....},....
26c0 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 .."language_info":.{......."mime
26e0 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 type":."text/x-python",........"
2700 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a nbconvert_exporter":."python",..
2720 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 ......"name":."python",........"
2740 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 file_extension":.".py",........"
2760 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d version":."2.7.12",........"pygm
2780 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 ents_lexer":."ipython2",........
27a0 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 "codemirror_mode":.{........."ve
27c0 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 rsion":.2,.........."name":."ipy
27e0 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 thon".......}.....}...}.}PK.....
2800 00 00 00 76 7b 82 49 50 0d 0a 74 03 0e 00 00 03 0e 00 00 25 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d ...v{.IP..t........%...auto_exam
2820 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 63 6c 61 73 73 65 73 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 ples/plot_OTDA_classes.ipynb{...
2840 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 "nbformat_minor":.0,...."nbforma
2860 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 t":.4,...."cells":.[.....{......
2880 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ."execution_count":.null,.......
28a0 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f ."cell_type":."code",........"so
28c0 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e urce":.[........."%matplotlib.in
28e0 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a line".......],........"outputs":
2900 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 .[],........"metadata":.{.......
2920 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 .."collapsed":.false.......}....
2940 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 .},......{......."source":.[....
2960 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 ....."\n#.OT.for.domain.adaptati
2980 6f 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c on\n\n\n\n".......],........"cel
29a0 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 l_type":."markdown",........"met
29c0 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 adata":.{}.....},......{......."
29e0 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 execution_count":.null,........"
2a00 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 cell_type":."code",........"sour
2a20 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 ce":.[........."import.matplotli
2a40 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e b.pylab.as.pl\nimport.ot\n\n\n\n
2a60 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 3d 31 35 30 20 23 20 6e 62 20 73 \n#%%.parameters\n\nn=150.#.nb.s
2a80 61 6d 70 6c 65 73 20 69 6e 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 61 74 61 amples.in.source.and.target.data
2aa0 73 65 74 73 5c 6e 5c 6e 78 73 2c 79 73 3d 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 sets\n\nxs,ys=ot.datasets.get_da
2ac0 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 27 2c 6e 29 5c 6e 78 74 2c 79 74 3d 6f 74 ta_classif('3gauss',n)\nxt,yt=ot
2ae0 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 .datasets.get_data_classif('3gau
2b00 73 73 32 27 2c 6e 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 ss2',n)\n\n\n\n\n#%%.plot.sample
2b20 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 s\n\npl.figure(1)\n\npl.subplot(
2b40 32 2c 32 2c 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 2,2,1)\npl.scatter(xs[:,0],xs[:,
2b60 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 1],c=ys,marker='+',label='Source
2b80 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c .samples')\npl.legend(loc=0)\npl
2ba0 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c .title('Source..distributions')\
2bc0 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 n\npl.subplot(2,2,2)\npl.scatter
2be0 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 (xt[:,0],xt[:,1],c=yt,marker='o'
2c00 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 ,label='Target.samples')\npl.leg
2c20 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 74 61 72 67 65 74 20 20 64 69 end(loc=0)\npl.title('target..di
2c40 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 4f 54 20 65 73 74 69 6d 61 stributions')\n\n\n#%%.OT.estima
2c60 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 4c 50 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 5c 6e 64 61 5f 65 6d 64 3d 6f 74 2e tion\n\n#.LP.problem\nda_emd=ot.
2c80 64 61 2e 4f 54 44 41 28 29 20 20 20 20 20 23 20 69 6e 69 74 20 63 6c 61 73 73 5c 6e 64 61 5f 65 da.OTDA().....#.init.class\nda_e
2ca0 6d 64 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 74 29 20 20 20 20 20 20 20 23 20 66 69 74 20 64 69 73 74 72 69 md.fit(xs,xt).......#.fit.distri
2cc0 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 78 73 74 30 3d 64 61 5f 65 6d 64 2e 69 6e 74 65 72 70 28 29 20 20 20 butions\nxst0=da_emd.interp()...
2ce0 20 23 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c .#.interpolation.of.source.sampl
2d00 65 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f es\n\n\n#.sinkhorn.regularizatio
2d20 6e 5c 6e 6c 61 6d 62 64 3d 31 65 2d 31 5c 6e 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f n\nlambd=1e-1\nda_entrop=ot.da.O
2d40 54 44 41 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 29 5c 6e 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 66 69 74 28 78 73 TDA_sinkhorn()\nda_entrop.fit(xs
2d60 2c 78 74 2c 72 65 67 3d 6c 61 6d 62 64 29 5c 6e 78 73 74 73 3d 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 69 ,xt,reg=lambd)\nxsts=da_entrop.i
2d80 6e 74 65 72 70 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6e 6f 6e 2d 63 6f 6e 76 65 78 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 nterp()\n\n#.non-convex.Group.la
2da0 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 72 65 67 3d 31 65 2d 31 5c 6e 65 74 sso.regularization\nreg=1e-1\net
2dc0 61 3d 31 65 30 5c 6e 64 61 5f 6c 70 6c 31 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 5f 6c 70 6c 31 28 29 a=1e0\nda_lpl1=ot.da.OTDA_lpl1()
2de0 5c 6e 64 61 5f 6c 70 6c 31 2e 66 69 74 28 78 73 2c 79 73 2c 78 74 2c 72 65 67 3d 72 65 67 2c 65 \nda_lpl1.fit(xs,ys,xt,reg=reg,e
2e00 74 61 3d 65 74 61 29 5c 6e 78 73 74 67 3d 64 61 5f 6c 70 6c 31 2e 69 6e 74 65 72 70 28 29 5c 6e ta=eta)\nxstg=da_lpl1.interp()\n
2e20 5c 6e 5c 6e 23 20 54 72 75 65 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a \n\n#.True.Group.lasso.regulariz
2e40 61 74 69 6f 6e 5c 6e 72 65 67 3d 31 65 2d 31 5c 6e 65 74 61 3d 32 65 30 5c 6e 64 61 5f 6c 31 6c ation\nreg=1e-1\neta=2e0\nda_l1l
2e60 32 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 5f 6c 31 6c 32 28 29 5c 6e 64 61 5f 6c 31 6c 32 2e 66 69 74 2=ot.da.OTDA_l1l2()\nda_l1l2.fit
2e80 28 78 73 2c 79 73 2c 78 74 2c 72 65 67 3d 72 65 67 2c 65 74 61 3d 65 74 61 2c 6e 75 6d 49 74 65 (xs,ys,xt,reg=reg,eta=eta,numIte
2ea0 72 6d 61 78 3d 32 30 2c 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 78 73 74 67 6c 3d 64 61 5f rmax=20,verbose=True)\nxstgl=da_
2ec0 6c 31 6c 32 2e 69 6e 74 65 72 70 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 69 6e 74 65 l1l2.interp()\n\n\n#%%.plot.inte
2ee0 72 70 6f 6c 61 74 65 64 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 rpolated.source.samples\npl.figu
2f00 72 65 28 34 2c 28 31 35 2c 38 29 29 5c 6e 5c 6e 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 3d 7b 27 69 6e 74 65 re(4,(15,8))\n\nparam_img={'inte
2f20 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 27 3a 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 2c 27 63 6d 61 70 27 3a 27 6a 65 74 rpolation':'nearest','cmap':'jet
2f40 27 7d 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 34 2c 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 '}\n\npl.subplot(2,4,1)\npl.imsh
2f60 6f 77 28 64 61 5f 65 6d 64 2e 47 2c 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 ow(da_emd.G,**param_img)\npl.tit
2f80 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 le('OT.matrix')\n\n\npl.subplot(
2fa0 32 2c 34 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 47 2c 2a 2a 2,4,2)\npl.imshow(da_entrop.G,**
2fc0 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 param_img)\npl.title('OT.matrix.
2fe0 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 34 2c 33 29 5c sinkhorn')\n\npl.subplot(2,4,3)\
3000 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 64 61 5f 6c 70 6c 31 2e 47 2c 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 npl.imshow(da_lpl1.G,**param_img
3020 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 6e 6f 6e 2d 63 6f 6e 76 65 )\npl.title('OT.matrix.non-conve
3040 78 20 47 72 6f 75 70 20 4c 61 73 73 6f 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c x.Group.Lasso')\n\npl.subplot(2,
3060 34 2c 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 64 61 5f 6c 31 6c 32 2e 47 2c 2a 2a 70 61 72 61 4,4)\npl.imshow(da_l1l2.G,**para
3080 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 72 6f 75 m_img)\npl.title('OT.matrix.Grou
30a0 70 20 4c 61 73 73 6f 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 34 2c 35 29 p.Lasso')\n\n\npl.subplot(2,4,5)
30c0 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 \npl.scatter(xt[:,0],xt[:,1],c=y
30e0 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c t,marker='o',label='Target.sampl
3100 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 30 5b es',alpha=0.3)\npl.scatter(xst0[
3120 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 30 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c :,0],xst0[:,1],c=ys,marker='+',l
3140 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e abel='Transp.samples',s=30)\npl.
3160 74 69 74 6c 65 28 27 49 6e 74 65 72 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 title('Interp.samples')\npl.lege
3180 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 34 2c 36 29 5c 6e nd(loc=0)\n\npl.subplot(2,4,6)\n
31a0 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c pl.scatter(xt[:,0],xt[:,1],c=yt,
31c0 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 marker='o',label='Target.samples
31e0 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 73 5b 3a 2c ',alpha=0.3)\npl.scatter(xsts[:,
3200 30 5d 2c 78 73 74 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 0],xsts[:,1],c=ys,marker='+',lab
3220 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 el='Transp.samples',s=30)\npl.ti
3240 74 6c 65 28 27 49 6e 74 65 72 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e tle('Interp.samples.Sinkhorn')\n
3260 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 34 2c 37 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 \npl.subplot(2,4,7)\npl.scatter(
3280 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c xt[:,0],xt[:,1],c=yt,marker='o',
32a0 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 label='Target.samples',alpha=0.3
32c0 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 67 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 67 5b 3a 2c 31 )\npl.scatter(xstg[:,0],xstg[:,1
32e0 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 ],c=ys,marker='+',label='Transp.
3300 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6e 74 65 72 70 samples',s=30)\npl.title('Interp
3320 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6e 6f 6e 2d 63 6f 6e 76 65 78 20 47 72 6f 75 70 20 4c 61 73 73 6f 27 .samples.non-convex.Group.Lasso'
3340 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 34 2c 38 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 )\n\npl.subplot(2,4,8)\npl.scatt
3360 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 er(xt[:,0],xt[:,1],c=yt,marker='
3380 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d o',label='Target.samples',alpha=
33a0 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 67 6c 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 67 0.3)\npl.scatter(xstgl[:,0],xstg
33c0 6c 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 l[:,1],c=ys,marker='+',label='Tr
33e0 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 ansp.samples',s=30)\npl.title('I
3400 6e 74 65 72 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 47 72 6f 75 70 20 4c 61 73 73 6f 27 29 22 0a 20 20 20 nterp.samples.Group.Lasso')"....
3420 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 ...],........"outputs":.[],.....
3440 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 ..."metadata":.{........."collap
3460 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a sed":.false.......}.....}...],..
3480 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 .."metadata":.{....."kernelspec"
34a0 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f :.{......."display_name":."Pytho
34c0 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 n.2",........"name":."python2",.
34e0 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 ......."language":."python".....
3500 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 },......"language_info":.{......
3520 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 ."mimetype":."text/x-python",...
3540 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 ....."nbconvert_exporter":."pyth
3560 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 on",........"name":."python",...
3580 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 ....."file_extension":.".py",...
35a0 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ....."version":."2.7.12",.......
35c0 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a ."pygments_lexer":."ipython2",..
35e0 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 ......"codemirror_mode":.{......
3600 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 ..."version":.2,.........."name"
3620 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 :."ipython".......}.....}...}.}P
3640 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 b7 86 1e 4b 6b 88 21 84 aa 1d 00 00 aa 1d 00 00 20 00 00 00 61 75 74 K...........Kk.!.............aut
3660 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 64 32 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 o_examples/plot_otda_d2.ipynb{..
3680 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d ."nbformat_minor":.0,...."nbform
36a0 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 at":.4,...."cells":.[.....{.....
36c0 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 .."execution_count":.null,......
36e0 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 .."cell_type":."code",........"s
3700 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 ource":.[........."%matplotlib.i
3720 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 nline".......],........"outputs"
3740 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 :.[],........"metadata":.{......
3760 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 ..."collapsed":.false.......}...
3780 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 ..},......{......."source":.[...
37a0 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 4f 54 20 66 6f 72 20 65 6d 70 69 72 69 63 61 6c 20 64 69 73 74 ......"\n#.OT.for.empirical.dist
37c0 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6e 74 72 ributions\n\n\nThis.example.intr
37e0 6f 64 75 63 65 73 20 61 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 69 6e 20 61 20 oduces.a.domain.adaptation.in.a.
3800 32 44 20 73 65 74 74 69 6e 67 2e 20 49 74 20 65 78 70 6c 69 63 69 74 73 5c 6e 74 68 65 20 70 72 2D.setting..It.explicits\nthe.pr
3820 6f 62 6c 65 6d 20 6f 66 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 61 6e 64 20 69 oblem.of.domain.adaptation.and.i
3840 6e 74 72 6f 64 75 63 65 73 20 73 6f 6d 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 ntroduces.some.optimal.transport
3860 5c 6e 61 70 70 72 6f 61 63 68 65 73 20 74 6f 20 73 6f 6c 76 65 20 69 74 2e 5c 6e 5c 6e 51 75 61 \napproaches.to.solve.it.\n\nQua
3880 6e 74 69 74 69 65 73 20 73 75 63 68 20 61 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 ntities.such.as.optimal.coupling
38a0 73 2c 20 67 72 65 61 74 65 72 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 s,.greater.coupling.coefficients
38c0 20 61 6e 64 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 61 72 65 20 72 65 .and\ntransported.samples.are.re
38e0 70 72 65 73 65 6e 74 65 64 20 69 6e 20 6f 72 64 65 72 20 74 6f 20 67 69 76 65 20 61 20 76 69 73 presented.in.order.to.give.a.vis
3900 75 61 6c 20 75 6e 64 65 72 73 74 61 6e 64 69 6e 67 5c 6e 6f 66 20 77 68 61 74 20 74 68 65 20 74 ual.understanding\nof.what.the.t
3920 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 20 61 72 65 20 64 6f 69 6e 67 2e 5c 6e 5c 6e 22 ransport.methods.are.doing.\n\n"
3940 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d .......],........"cell_type":."m
3960 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a arkdown",........"metadata":.{}.
3980 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 ....},......{......."execution_c
39a0 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a ount":.null,........"cell_type":
39c0 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 ."code",........"source":.[.....
39e0 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 ...."#.Authors:.Remi.Flamary.<re
3a00 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 mi.flamary@unice.fr>\n#.........
3a20 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e .Stanislas.Chambon.<stan.chambon
3a40 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c @gmail.com>\n#\n#.License:.MIT.L
3a60 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 icense\n\nimport.matplotlib.pyla
3a80 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 b.as.pl\nimport.ot".......],....
3aa0 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 ...."outputs":.[],........"metad
3ac0 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c ata":.{........."collapsed":.fal
3ae0 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 se.......}.....},......{......."
3b00 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 67 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 source":.[........."generate.dat
3b20 61 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 a\n#############################
3b40 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
3b60 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a ################\n\n".......],..
3b80 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a ......"cell_type":."markdown",..
3ba0 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 ......"metadata":.{}.....},.....
3bc0 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c .{......."execution_count":.null
3be0 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 ,........"cell_type":."code",...
3c00 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 5f 73 61 6d 70 ....."source":.[........."n_samp
3c20 6c 65 73 5f 73 6f 75 72 63 65 20 3d 20 31 35 30 5c 6e 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 74 61 72 67 les_source.=.150\nn_samples_targ
3c40 65 74 20 3d 20 31 35 30 5c 6e 5c 6e 58 73 2c 20 79 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 et.=.150\n\nXs,.ys.=.ot.datasets
3c60 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 27 2c 20 6e 5f 73 61 .get_data_classif('3gauss',.n_sa
3c80 6d 70 6c 65 73 5f 73 6f 75 72 63 65 29 5c 6e 58 74 2c 20 79 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 mples_source)\nXt,.yt.=.ot.datas
3ca0 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 32 27 2c 20 ets.get_data_classif('3gauss2',.
3cc0 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 74 61 72 67 65 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 n_samples_target)\n\n#.Cost.matr
3ce0 69 78 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 ix\nM.=.ot.dist(Xs,.Xt,.metric='
3d00 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 sqeuclidean')".......],........"
3d20 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a outputs":.[],........"metadata":
3d40 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 .{........."collapsed":.false...
3d60 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 ....}.....},......{......."sourc
3d80 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 68 65 20 64 e":.[........."Instantiate.the.d
3da0 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 73 20 61 6e ifferent.transport.algorithms.an
3dc0 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 d.fit.them\n####################
3de0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
3e00 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 #########################\n\n"..
3e20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 .....],........"cell_type":."mar
3e40 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 kdown",........"metadata":.{}...
3e60 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 ..},......{......."execution_cou
3e80 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 nt":.null,........"cell_type":."
3ea0 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 code",........"source":.[.......
3ec0 20 20 22 23 20 45 4d 44 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e .."#.EMD.Transport\not_emd.=.ot.
3ee0 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 da.EMDTransport()\not_emd.fit(Xs
3f00 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 =Xs,.Xt=Xt)\n\n#.Sinkhorn.Transp
3f20 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 ort\not_sinkhorn.=.ot.da.Sinkhor
3f40 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 nTransport(reg_e=1e-1)\not_sinkh
3f60 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 orn.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n#.Sinkh
3f80 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 orn.Transport.with.Group.lasso.r
3fa0 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 6f 74 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 egularization\not_lpl1.=.ot.da.S
3fc0 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 2c inkhornLpl1Transport(reg_e=1e-1,
3fe0 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 31 65 30 29 5c 6e 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c .reg_cl=1e0)\not_lpl1.fit(Xs=Xs,
4000 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 73 6f .ys=ys,.Xt=Xt)\n\n#.transport.so
4020 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6f 6e 74 6f 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 urce.samples.onto.target.samples
4040 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f \ntransp_Xs_emd.=.ot_emd.transfo
4060 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 rm(Xs=Xs)\ntransp_Xs_sinkhorn.=.
4080 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 ot_sinkhorn.transform(Xs=Xs)\ntr
40a0 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d ansp_Xs_lpl1.=.ot_lpl1.transform
40c0 28 58 73 3d 58 73 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 (Xs=Xs)".......],........"output
40e0 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 s":.[],........"metadata":.{....
4100 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a ....."collapsed":.false.......}.
4120 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a ....},......{......."source":.[.
4140 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e ........"Fig.1.:.plots.source.an
4160 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 2b 20 6d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 d.target.samples.+.matrix.of.pai
4180 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 rwise.distance\n################
41a0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
41c0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c #############################\n\
41e0 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 n".......],........"cell_type":.
4200 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b "markdown",........"metadata":.{
4220 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e }.....},......{......."execution
4240 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 _count":.null,........"cell_type
4260 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 ":."code",........"source":.[...
4280 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c ......"pl.figure(1,.figsize=(10,
42a0 20 31 30 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 .10))\npl.subplot(2,.2,.1)\npl.s
42c0 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c catter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,
42e0 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c .marker='+',.label='Source.sampl
4300 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b es')\npl.xticks([])\npl.yticks([
4320 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 ])\npl.legend(loc=0)\npl.title('
4340 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 Source..samples')\n\npl.subplot(
4360 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 2,.2,.2)\npl.scatter(Xt[:,.0],.X
4380 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c t[:,.1],.c=yt,.marker='o',.label
43a0 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d ='Target.samples')\npl.xticks([]
43c0 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d )\npl.yticks([])\npl.legend(loc=
43e0 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 0)\npl.title('Target.samples')\n
4400 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 \npl.subplot(2,.2,.3)\npl.imshow
4420 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c (M,.interpolation='nearest')\npl
4440 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 .xticks([])\npl.yticks([])\npl.t
4460 69 74 6c 65 28 27 4d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 itle('Matrix.of.pairwise.distanc
4480 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d es')\npl.tight_layout()".......]
44a0 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 ,........"outputs":.[],........"
44c0 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 metadata":.{........."collapsed"
44e0 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 :.false.......}.....},......{...
4500 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a ...."source":.[........."Fig.2.:
4520 20 70 6c 6f 74 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 .plots.optimal.couplings.for.the
4540 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 .different.methods\n############
4560 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
4580 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
45a0 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 #\n\n".......],........"cell_typ
45c0 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 e":."markdown",........"metadata
45e0 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 ":.{}.....},......{......."execu
4600 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f tion_count":.null,........"cell_
4620 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 type":."code",........"source":.
4640 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d [........."pl.figure(2,.figsize=
4660 28 31 30 2c 20 36 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 5c (10,.6))\n\npl.subplot(2,.3,.1)\
4680 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 npl.imshow(ot_emd.coupling_,.int
46a0 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 erpolation='nearest')\npl.xticks
46c0 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f ([])\npl.yticks([])\npl.title('O
46e0 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 ptimal.coupling\\nEMDTransport')
4700 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 \n\npl.subplot(2,.3,.2)\npl.imsh
4720 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 ow(ot_sinkhorn.coupling_,.interp
4740 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d olation='nearest')\npl.xticks([]
4760 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 )\npl.yticks([])\npl.title('Opti
4780 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 mal.coupling\\nSinkhornTransport
47a0 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d ')\n\npl.subplot(2,.3,.3)\npl.im
47c0 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c show(ot_lpl1.coupling_,.interpol
47e0 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c ation='nearest')\npl.xticks([])\
4800 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 npl.yticks([])\npl.title('Optima
4820 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f l.coupling\\nSinkhornLpl1Transpo
4840 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 6f 74 2e rt')\n\npl.subplot(2,.3,.4)\not.
4860 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 plot.plot2D_samples_mat(Xs,.Xt,.
4880 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 ot_emd.coupling_,.c=[.5,..5,.1])
48a0 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c \npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],
48c0 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 .c=ys,.marker='+',.label='Source
48e0 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c .samples')\npl.scatter(Xt[:,.0],
4900 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 .Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',.lab
4920 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 el='Target.samples')\npl.xticks(
4940 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 [])\npl.yticks([])\npl.title('Ma
4960 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 in.coupling.coefficients\\nEMDTr
4980 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 ansport')\n\npl.subplot(2,.3,.5)
49a0 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c \not.plot.plot2D_samples_mat(Xs,
49c0 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e .Xt,.ot_sinkhorn.coupling_,.c=[.
49e0 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 5,..5,.1])\npl.scatter(Xs[:,.0],
4a00 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 .Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+',.lab
4a20 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 el='Source.samples')\npl.scatter
4a40 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 (Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marke
4a60 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e r='o',.label='Target.samples')\n
4a80 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c pl.xticks([])\npl.yticks([])\npl
4aa0 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e .title('Main.coupling.coefficien
4ac0 74 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 ts\\nSinkhornTransport')\n\npl.s
4ae0 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f ubplot(2,.3,.6)\not.plot.plot2D_
4b00 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 samples_mat(Xs,.Xt,.ot_lpl1.coup
4b20 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 ling_,.c=[.5,..5,.1])\npl.scatte
4b40 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b r(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.mark
4b60 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c er='+',.label='Source.samples')\
4b80 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.
4ba0 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 c=yt,.marker='o',.label='Target.
4bc0 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 samples')\npl.xticks([])\npl.yti
4be0 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 cks([])\npl.title('Main.coupling
4c00 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e .coefficients\\nSinkhornLpl1Tran
4c20 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 sport')\npl.tight_layout()".....
4c40 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 ..],........"outputs":.[],......
4c60 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 .."metadata":.{........."collaps
4c80 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b ed":.false.......}.....},......{
4ca0 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 ......."source":.[........."Fig.
4cc0 33 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 23 23 3.:.plot.transported.samples\n##
4ce0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
4d00 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
4d20 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ###########\n\n".......],.......
4d40 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ."cell_type":."markdown",.......
4d60 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 ."metadata":.{}.....},......{...
4d80 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 ...."execution_count":.null,....
4da0 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 ...."cell_type":."code",........
4dc0 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 64 69 73 70 6c 61 79 20 74 "source":.[........."#.display.t
4de0 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c ransported.samples\npl.figure(4,
4e00 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 34 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c .figsize=(10,.4))\npl.subplot(1,
4e20 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b .3,.1)\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[
4e40 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 :,.1],.c=yt,.marker='o',\n......
4e60 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 .....label='Target.samples',.alp
4e80 68 61 3d 30 2e 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d ha=0.5)\npl.scatter(transp_Xs_em
4ea0 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d d[:,.0],.transp_Xs_emd[:,.1],.c=
4ec0 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 ys,\n...........marker='+',.labe
4ee0 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 l='Transp.samples',.s=30)\npl.ti
4f00 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 45 6d 64 54 72 tle('Transported.samples\\nEmdTr
4f20 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e ansport')\npl.legend(loc=0)\npl.
4f40 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e xticks([])\npl.yticks([])\n\npl.
4f60 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b subplot(1,.3,.2)\npl.scatter(Xt[
4f80 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f :,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o
4fa0 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d ',\n...........label='Target.sam
4fc0 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 ples',.alpha=0.5)\npl.scatter(tr
4fe0 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 ansp_Xs_sinkhorn[:,.0],.transp_X
5000 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 s_sinkhorn[:,.1],.c=ys,\n.......
5020 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 ....marker='+',.label='Transp.sa
5040 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f mples',.s=30)\npl.title('Transpo
5060 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 rted.samples\\nSinkhornTransport
5080 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 ')\npl.xticks([])\npl.yticks([])
50a0 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 \n\npl.subplot(1,.3,.3)\npl.scat
50c0 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 ter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.ma
50e0 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 rker='o',\n...........label='Tar
5100 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 get.samples',.alpha=0.5)\npl.sca
5120 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 tter(transp_Xs_lpl1[:,.0],.trans
5140 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 p_Xs_lpl1[:,.1],.c=ys,\n........
5160 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d ...marker='+',.label='Transp.sam
5180 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 ples',.s=30)\npl.title('Transpor
51a0 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 ted.samples\\nSinkhornLpl1Transp
51c0 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 ort')\npl.xticks([])\npl.yticks(
51e0 5b 5d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f [])\n\npl.tight_layout()\npl.sho
5200 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 w()".......],........"outputs":.
5220 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 [],........"metadata":.{........
5240 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 ."collapsed":.false.......}.....
5260 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 }...],...."metadata":.{....."ker
5280 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 nelspec":.{......."display_name"
52a0 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 :."Python.2",........"name":."py
52c0 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 thon2",........"language":."pyth
52e0 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a on".....},......"language_info":
5300 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 .{......."mimetype":."text/x-pyt
5320 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 hon",........"nbconvert_exporter
5340 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 ":."python",........"name":."pyt
5360 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 hon",........"file_extension":."
5380 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 .py",........"version":."2.7.12"
53a0 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 ,........"pygments_lexer":."ipyt
53c0 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a hon2",........"codemirror_mode":
53e0 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 .{........."version":.2,........
5400 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 .."name":."ipython".......}.....
5420 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 f4 83 1e 4b 0b 8e f3 56 28 08 00 00 28 08 00 }...}.}PK...........K...V(...(..
5440 00 1e 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 2e 69 70 .....auto_examples/plot_OT_1D.ip
5460 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 ynb{..."nbformat_minor":.0,...."
5480 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 nbformat":.4,...."cells":.[.....
54a0 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c {......."execution_count":.null,
54c0 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 ........"cell_type":."code",....
54e0 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f ...."source":.[........."%matplo
5500 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 tlib.inline".......],........"ou
5520 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b tputs":.[],........"metadata":.{
5540 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 ........."collapsed":.false.....
5560 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 ..}.....},......{......."source"
5580 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 31 44 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e :.[........."\n#.1D.optimal.tran
55a0 73 70 6f 72 74 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 sport\n\n\n\n".......],........"
55c0 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 cell_type":."markdown",........"
55e0 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 metadata":.{}.....},......{.....
5600 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 .."execution_count":.null,......
5620 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 .."cell_type":."code",........"s
5640 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d ource":.[........."#.Author:.Rem
5660 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 i.Flamary.<remi.flamary@unice.fr
5680 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e >\n#\n#.License:.MIT.License\n\n
56a0 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c import.numpy.as.np\nimport.matpl
56c0 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 66 72 otlib.pylab.as.pl\nimport.ot\nfr
56e0 6f 6d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 20 69 6d 70 6f 72 74 20 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 om.ot.datasets.import.get_1D_gau
5700 73 73 20 61 73 20 67 61 75 73 73 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c ss.as.gauss\n\n#%%.parameters\n\
5720 6e 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e 73 5c 6e 5c 6e 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 nn.=.100..#.nb.bins\n\n#.bin.pos
5740 69 74 69 6f 6e 73 5c 6e 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e itions\nx.=.np.arange(n,.dtype=n
5760 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e 5c 6e 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 p.float64)\n\n#.Gaussian.distrib
5780 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 61 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 utions\na.=.gauss(n,.m=20,.s=5).
57a0 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 5c 6e 62 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c .#.m=.mean,.s=.std\nb.=.gauss(n,
57c0 20 6d 3d 36 30 2c 20 73 3d 31 30 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d .m=60,.s=10)\n\n#.loss.matrix\nM
57e0 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e .=.ot.dist(x.reshape((n,.1)),.x.
5800 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e reshape((n,.1)))\nM./=.M.max()\n
5820 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e \n#%%.plot.the.distributions\n\n
5840 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e pl.figure(1,.figsize=(6.4,.3))\n
5860 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 61 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 pl.plot(x,.a,.'b',.label='Source
5880 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 2c 20 27 .distribution')\npl.plot(x,.b,.'
58a0 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 r',.label='Target.distribution')
58c0 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 64 69 73 74 72 69 \npl.legend()\n\n#%%.plot.distri
58e0 62 75 74 69 6f 6e 73 20 61 6e 64 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 butions.and.loss.matrix\n\npl.fi
5900 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 gure(2,.figsize=(5,.5))\not.plot
5920 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 .plot1D_mat(a,.b,.M,.'Cost.matri
5940 78 20 4d 27 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e 5c 6e 47 30 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 x.M')\n\n#%%.EMD\n\nG0.=.ot.emd(
5960 61 2c 20 62 2c 20 4d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 a,.b,.M)\n\npl.figure(3,.figsize
5980 3d 28 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 =(5,.5))\not.plot.plot1D_mat(a,.
59a0 62 2c 20 47 30 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 30 27 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 53 69 b,.G0,.'OT.matrix.G0')\n\n#%%.Si
59c0 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 5c 6e 6c 61 6d 62 64 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 47 73 20 3d 20 6f 74 2e nkhorn\n\nlambd.=.1e-3\nGs.=.ot.
59e0 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 6c 61 6d 62 64 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 sinkhorn(a,.b,.M,.lambd,.verbose
5a00 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 =True)\n\npl.figure(4,.figsize=(
5a20 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 5,.5))\not.plot.plot1D_mat(a,.b,
5a40 20 47 73 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c .Gs,.'OT.matrix.Sinkhorn')\n\npl
5a60 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 .show()".......],........"output
5a80 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 s":.[],........"metadata":.{....
5aa0 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a ....."collapsed":.false.......}.
5ac0 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 ....}...],...."metadata":.{.....
5ae0 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e "kernelspec":.{......."display_n
5b00 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a ame":."Python.2",........"name":
5b20 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 ."python2",........"language":."
5b40 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e python".....},......"language_in
5b60 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 fo":.{......."mimetype":."text/x
5b80 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f -python",........"nbconvert_expo
5ba0 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 rter":."python",........"name":.
5bc0 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e "python",........"file_extension
5be0 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 ":.".py",........"version":."2.7
5c00 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 .12",........"pygments_lexer":."
5c20 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f ipython2",........"codemirror_mo
5c40 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 de":.{........."version":.2,....
5c60 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a ......"name":."ipython".......}.
5c80 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 32 82 e3 4a 48 a2 ab 22 f5 14 00 ....}...}.}PK........2..JH.."...
5ca0 00 f5 14 00 00 20 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 63 .........auto_examples/plot_OT_c
5cc0 6f 6e 76 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 onv.ipynb{..."nbformat_minor":.0
5ce0 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 ,...."nbformat":.4,...."cells":.
5d00 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a [.....{......."execution_count":
5d20 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 .null,........"cell_type":."code
5d40 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 ",........"source":.[........."%
5d60 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 matplotlib.inline".......],.....
5d80 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 ..."outputs":.[],........"metada
5da0 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 ta":.{........."collapsed":.fals
5dc0 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 e.......}.....},......{......."s
5de0 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 31 44 20 57 61 73 73 65 72 ource":.[........."\n#.1D.Wasser
5e00 73 74 65 69 6e 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 64 65 6d 6f 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 40 61 75 stein.barycenter.demo\n\n\n\n@au
5e20 74 68 6f 72 3a 20 72 66 6c 61 6d 61 72 79 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 thor:.rflamary\n\n".......],....
5e40 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 ...."cell_type":."markdown",....
5e60 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b ...."metadata":.{}.....},......{
5e80 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 ......."execution_count":.null,.
5ea0 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 ......."cell_type":."code",.....
5ec0 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 69 6d 70 6f 72 74 20 6e ..."source":.[........."import.n
5ee0 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 umpy.as.np\nimport.matplotlib.py
5f00 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6d 70 6c 5f 74 lab.as.pl\nimport.ot\nfrom.mpl_t
5f20 6f 6f 6c 6b 69 74 73 2e 6d 70 6c 6f 74 33 64 20 69 6d 70 6f 72 74 20 41 78 65 73 33 44 20 23 6e oolkits.mplot3d.import.Axes3D.#n
5f40 65 63 65 73 73 61 72 79 20 66 6f 72 20 33 64 20 70 6c 6f 74 20 65 76 65 6e 20 69 66 20 6e 6f 74 ecessary.for.3d.plot.even.if.not
5f60 20 75 73 65 64 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 73 63 69 70 79 20 61 73 20 73 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 .used\nimport.scipy.as.sp\nimpor
5f80 74 20 73 63 69 70 79 2e 73 69 67 6e 61 6c 20 61 73 20 73 70 73 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d t.scipy.signal.as.sps\n#%%.param
5fa0 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 3d 31 30 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e 73 5c 6e 5c 6e 23 20 62 69 6e eters\n\nn=10.#.nb.bins\n\n#.bin
5fc0 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 5c 6e 78 3d 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 64 74 79 70 65 3d .positions\nx=np.arange(n,dtype=
5fe0 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e 5c 6e 78 78 2c 79 79 3d 6e 70 2e 6d 65 73 68 67 72 69 64 np.float64)\n\nxx,yy=np.meshgrid
6000 28 78 2c 78 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 78 70 6f 73 3d 6e 70 2e 68 73 74 61 63 6b 28 28 78 78 2e 72 65 (x,x)\n\n\nxpos=np.hstack((xx.re
6020 73 68 61 70 65 28 2d 31 2c 31 29 2c 79 79 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 2d 31 2c 31 29 29 29 5c 6e shape(-1,1),yy.reshape(-1,1)))\n
6040 5c 6e 4d 3d 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 70 6f 73 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 49 30 3d 28 28 78 78 2d 35 \nM=ot.dist(xpos)\n\n\nI0=((xx-5
6060 29 2a 2a 32 2b 28 79 79 2d 35 29 2a 2a 32 3c 33 2a 2a 32 29 2a 31 2e 30 5c 6e 49 31 3d 28 28 78 )**2+(yy-5)**2<3**2)*1.0\nI1=((x
6080 78 2d 37 29 2a 2a 32 2b 28 79 79 2d 37 29 2a 2a 32 3c 33 2a 2a 32 29 2a 31 2e 30 5c 6e 5c 6e 49 x-7)**2+(yy-7)**2<3**2)*1.0\n\nI
60a0 30 2f 3d 49 30 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e 49 31 2f 3d 49 31 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e 5c 6e 69 30 3d 0/=I0.sum()\nI1/=I1.sum()\n\ni0=
60c0 49 30 2e 72 61 76 65 6c 28 29 5c 6e 69 31 3d 49 31 2e 72 61 76 65 6c 28 29 5c 6e 5c 6e 4d 3d 4d I0.ravel()\ni1=I1.ravel()\n\nM=M
60e0 5b 69 30 3e 30 2c 3a 5d 5b 3a 2c 69 31 3e 30 5d 2e 63 6f 70 79 28 29 5c 6e 69 30 3d 69 30 5b 69 [i0>0,:][:,i1>0].copy()\ni0=i0[i
6100 30 3e 30 5d 5c 6e 69 31 3d 69 31 5b 69 31 3e 30 5d 5c 6e 49 74 6f 74 3d 6e 70 2e 63 6f 6e 63 61 0>0]\ni1=i1[i1>0]\nItot=np.conca
6120 74 65 6e 61 74 65 28 28 49 30 5b 3a 2c 3a 2c 6e 70 2e 6e 65 77 61 78 69 73 5d 2c 49 31 5b 3a 2c tenate((I0[:,:,np.newaxis],I1[:,
6140 3a 2c 6e 70 2e 6e 65 77 61 78 69 73 5d 29 2c 32 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 :,np.newaxis]),2)\n\n\n#%%.plot.
6160 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 the.distributions\n\npl.figure(1
6180 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 )\npl.subplot(2,2,1)\npl.imshow(
61a0 49 30 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f I0)\npl.subplot(2,2,2)\npl.imsho
61c0 77 28 49 31 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 w(I1)\n\n\n#%%.barycenter.comput
61e0 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 20 23 20 30 3c 3d 61 6c 70 68 61 3c 3d 31 ation\n\nalpha=0.5.#.0<=alpha<=1
6200 5c 6e 77 65 69 67 68 74 73 3d 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 2d 61 6c 70 68 61 2c 61 6c 70 68 \nweights=np.array([1-alpha,alph
6220 61 5d 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 63 6f 6e 76 32 28 49 2c 6b 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 a])\n\n\ndef.conv2(I,k):\n....re
6240 74 75 72 6e 20 73 70 2e 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 63 6f 6e 76 6f 6c 76 65 31 64 28 73 70 2e 6e 64 turn.sp.ndimage.convolve1d(sp.nd
6260 69 6d 61 67 65 2e 63 6f 6e 76 6f 6c 76 65 31 64 28 49 2c 6b 2c 61 78 69 73 3d 31 29 2c 6b 2c 61 image.convolve1d(I,k,axis=1),k,a
6280 78 69 73 3d 30 29 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 63 6f 6e 76 32 6e 28 49 2c 6b 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 xis=0)\n\ndef.conv2n(I,k):\n....
62a0 72 65 73 3d 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 5f 6c 69 6b 65 28 49 29 5c 6e 20 20 20 20 66 6f 72 20 69 20 res=np.zeros_like(I)\n....for.i.
62c0 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 49 2e 73 68 61 70 65 5b 32 5d 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 72 in.range(I.shape[2]):\n........r
62e0 65 73 5b 3a 2c 3a 2c 69 5d 3d 63 6f 6e 76 32 28 49 5b 3a 2c 3a 2c 69 5d 2c 6b 29 5c 6e 20 20 20 es[:,:,i]=conv2(I[:,:,i],k)\n...
6300 20 72 65 74 75 72 6e 20 72 65 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 67 65 74 5f 31 44 6b 65 72 6e 65 .return.res\n\n\ndef.get_1Dkerne
6320 6c 28 72 65 67 2c 74 68 72 3d 31 65 2d 31 36 2c 77 6d 61 78 3d 31 30 32 34 29 3a 5c 6e 20 20 20 l(reg,thr=1e-16,wmax=1024):\n...
6340 20 77 3d 6d 61 78 28 6d 69 6e 28 77 6d 61 78 2c 32 2a 69 6e 74 28 28 2d 6e 70 2e 6c 6f 67 28 74 .w=max(min(wmax,2*int((-np.log(t
6360 68 72 29 2a 72 65 67 29 2a 2a 28 2e 35 29 29 29 2c 33 29 5c 6e 20 20 20 20 78 3d 6e 70 2e 61 72 hr)*reg)**(.5))),3)\n....x=np.ar
6380 61 6e 67 65 28 77 2c 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e 20 20 20 20 72 65 ange(w,dtype=np.float64)\n....re
63a0 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 65 78 70 28 2d 28 28 78 2d 77 2f 32 29 2a 2a 32 29 2f 72 65 67 29 5c 6e turn.np.exp(-((x-w/2)**2)/reg)\n
63c0 20 20 20 20 5c 6e 74 68 72 3d 31 65 2d 31 36 5c 6e 72 65 67 3d 31 65 30 5c 6e 5c 6e 6b 3d 67 65 ....\nthr=1e-16\nreg=1e0\n\nk=ge
63e0 74 5f 31 44 6b 65 72 6e 65 6c 28 72 65 67 29 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 t_1Dkernel(reg)\npl.figure(2)\np
6400 6c 2e 70 6c 6f 74 28 6b 29 5c 6e 5c 6e 49 30 35 3d 63 6f 6e 76 32 28 49 30 2c 6b 29 5c 6e 5c 6e l.plot(k)\n\nI05=conv2(I0,k)\n\n
6420 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 31 29 5c pl.figure(1)\npl.subplot(2,2,1)\
6440 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 30 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 32 npl.imshow(I0)\npl.subplot(2,2,2
6460 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 30 35 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 5c 6e 5c 6e 47 3d 6f 74 )\npl.imshow(I05)\n\n#%%\n\nG=ot
6480 2e 65 6d 64 28 69 30 2c 69 31 2c 4d 29 5c 6e 72 30 3d 6e 70 2e 73 75 6d 28 4d 2a 47 29 5c 6e 5c .emd(i0,i1,M)\nr0=np.sum(M*G)\n\
64a0 6e 72 65 67 3d 31 65 2d 31 5c 6e 47 73 3d 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 nreg=1e-1\nGs=ot.bregman.sinkhor
64c0 6e 5f 6b 6e 6f 70 70 28 69 30 2c 69 31 2c 4d 2c 72 65 67 3d 72 65 67 29 5c 6e 72 73 3d 6e 70 2e n_knopp(i0,i1,M,reg=reg)\nrs=np.
64e0 73 75 6d 28 4d 2a 47 73 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 6d 79 6c 6f 67 28 75 29 sum(M*Gs)\n\n#%%\n\ndef.mylog(u)
6500 3a 5c 6e 20 20 20 20 74 6d 70 3d 6e 70 2e 6c 6f 67 28 75 29 5c 6e 20 20 20 20 74 6d 70 5b 6e 70 :\n....tmp=np.log(u)\n....tmp[np
6520 2e 69 73 6e 61 6e 28 74 6d 70 29 5d 3d 30 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 74 6d 70 5c 6e .isnan(tmp)]=0\n....return.tmp\n
6540 5c 6e 64 65 66 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 63 6f 6e 76 28 61 2c 62 2c 20 72 65 67 2c 20 6e 75 \ndef.sinkhorn_conv(a,b,.reg,.nu
6560 6d 49 74 65 72 6d 61 78 20 3d 20 31 30 30 30 2c 20 73 74 6f 70 54 68 72 3d 31 65 2d 39 2c 20 76 mItermax.=.1000,.stopThr=1e-9,.v
6580 65 72 62 6f 73 65 3d 46 61 6c 73 65 2c 20 6c 6f 67 3d 46 61 6c 73 65 2c 2a 2a 6b 77 61 72 67 73 erbose=False,.log=False,**kwargs
65a0 29 3a 5c 6e 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 61 3d 6e 70 2e 61 73 61 72 72 61 79 28 61 2c 64 74 79 70 65 ):\n\n\n....a=np.asarray(a,dtype
65c0 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e 20 20 20 20 62 3d 6e 70 2e 61 73 61 72 72 61 79 28 62 =np.float64)\n....b=np.asarray(b
65e0 2c 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 5c 6e 20 20 ,dtype=np.float64)\n........\n..
6600 20 20 5c 6e 20 20 20 20 69 66 20 6c 65 6e 28 62 2e 73 68 61 70 65 29 3e 32 3a 5c 6e 20 20 20 20 ..\n....if.len(b.shape)>2:\n....
6620 20 20 20 20 6e 62 62 3d 62 2e 73 68 61 70 65 5b 32 5d 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 61 3d 61 5b ....nbb=b.shape[2]\n........a=a[
6640 3a 2c 3a 2c 6e 70 2e 6e 65 77 61 78 69 73 5d 5c 6e 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 5c 6e 20 20 20 20 :,:,np.newaxis]\n....else:\n....
6660 20 20 20 20 6e 62 62 3d 30 5c 6e 20 20 20 20 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 69 66 20 6c 6f 67 3a 5c 6e ....nbb=0\n....\n\n....if.log:\n
6680 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 6f 67 3d 7b 27 65 72 72 27 3a 5b 5d 7d 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 23 20 ........log={'err':[]}\n\n....#.
66a0 77 65 20 61 73 73 75 6d 65 20 74 68 61 74 20 6e 6f 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 20 61 72 65 20 we.assume.that.no.distances.are.
66c0 6e 75 6c 6c 20 65 78 63 65 70 74 20 74 68 6f 73 65 20 6f 66 20 74 68 65 20 64 69 61 67 6f 6e 61 null.except.those.of.the.diagona
66e0 6c 20 6f 66 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 5c 6e 20 20 20 20 69 66 20 6e 62 62 3a 5c 6e 20 20 20 l.of.distances\n....if.nbb:\n...
6700 20 20 20 20 20 75 20 3d 20 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 28 61 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 61 2e 73 .....u.=.np.ones((a.shape[0],a.s
6720 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 6e 62 62 29 29 2f 28 6e 70 2e 70 72 6f 64 28 61 2e 73 68 61 70 65 5b 3a hape[1],nbb))/(np.prod(a.shape[:
6740 32 5d 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 76 20 3d 20 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 28 61 2e 73 68 61 2]))\n........v.=.np.ones((a.sha
6760 70 65 5b 30 5d 2c 61 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 6e 62 62 29 29 2f 28 6e 70 2e 70 72 6f 64 28 pe[0],a.shape[1],nbb))/(np.prod(
6780 62 2e 73 68 61 70 65 5b 3a 32 5d 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 61 30 3d 31 2e 30 2f 28 6e b.shape[:2]))\n........a0=1.0/(n
67a0 70 2e 70 72 6f 64 28 62 2e 73 68 61 70 65 5b 3a 32 5d 29 29 5c 6e 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 5c p.prod(b.shape[:2]))\n....else:\
67c0 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 75 20 3d 20 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 28 61 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d n........u.=.np.ones((a.shape[0]
67e0 2c 61 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 29 29 2f 28 6e 70 2e 70 72 6f 64 28 61 2e 73 68 61 70 65 5b 3a ,a.shape[1]))/(np.prod(a.shape[:
6800 32 5d 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 76 20 3d 20 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 28 61 2e 73 68 61 2]))\n........v.=.np.ones((a.sha
6820 70 65 5b 30 5d 2c 61 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 29 29 2f 28 6e 70 2e 70 72 6f 64 28 62 2e 73 68 pe[0],a.shape[1]))/(np.prod(b.sh
6840 61 70 65 5b 3a 32 5d 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 61 30 3d 31 2e 30 2f 28 6e 70 2e 70 72 ape[:2]))\n........a0=1.0/(np.pr
6860 6f 64 28 62 2e 73 68 61 70 65 5b 3a 32 5d 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 5c 6e 20 20 20 20 od(b.shape[:2]))\n........\n....
6880 20 20 20 20 5c 6e 20 20 20 20 6b 3d 67 65 74 5f 31 44 6b 65 72 6e 65 6c 28 72 65 67 29 5c 6e 20 ....\n....k=get_1Dkernel(reg)\n.
68a0 20 20 20 5c 6e 20 20 20 20 69 66 20 6e 62 62 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 4b 3d 6c 61 6d 62 ...\n....if.nbb:\n........K=lamb
68c0 64 61 20 49 3a 20 63 6f 6e 76 32 6e 28 49 2c 6b 29 5c 6e 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 5c 6e 20 20 da.I:.conv2n(I,k)\n....else:\n..
68e0 20 20 20 20 20 20 4b 3d 6c 61 6d 62 64 61 20 49 3a 20 63 6f 6e 76 32 28 49 2c 6b 29 5c 6e 5c 6e ......K=lambda.I:.conv2(I,k)\n\n
6900 20 20 20 20 63 70 74 20 3d 20 30 5c 6e 20 20 20 20 65 72 72 3d 31 5c 6e 20 20 20 20 77 68 69 6c ....cpt.=.0\n....err=1\n....whil
6920 65 20 28 65 72 72 3e 73 74 6f 70 54 68 72 20 61 6e 64 20 63 70 74 3c 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 e.(err>stopThr.and.cpt<numIterma
6940 78 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 75 70 72 65 76 20 3d 20 75 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 x):\n........uprev.=.u\n........
6960 76 70 72 65 76 20 3d 20 76 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 76 20 3d vprev.=.v\n........\n........v.=
6980 20 6e 70 2e 64 69 76 69 64 65 28 62 2c 20 4b 28 75 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 75 20 3d .np.divide(b,.K(u))\n........u.=
69a0 20 6e 70 2e 64 69 76 69 64 65 28 61 2c 20 4b 28 76 29 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 69 .np.divide(a,.K(v))\n\n........i
69c0 66 20 28 6e 70 2e 61 6e 79 28 6e 70 2e 69 73 6e 61 6e 28 75 29 29 20 6f 72 20 6e 70 2e 61 6e 79 f.(np.any(np.isnan(u)).or.np.any
69e0 28 6e 70 2e 69 73 6e 61 6e 28 76 29 29 20 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6f 72 20 6e (np.isnan(v)).\n............or.n
6a00 70 2e 61 6e 79 28 6e 70 2e 69 73 69 6e 66 28 75 29 29 20 6f 72 20 6e 70 2e 61 6e 79 28 6e 70 2e p.any(np.isinf(u)).or.np.any(np.
6a20 69 73 69 6e 66 28 76 29 29 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 23 20 77 65 20 68 61 isinf(v))):\n............#.we.ha
6a40 76 65 20 72 65 61 63 68 65 64 20 74 68 65 20 6d 61 63 68 69 6e 65 20 70 72 65 63 69 73 69 6f 6e ve.reached.the.machine.precision
6a60 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 23 20 63 6f 6d 65 20 62 61 63 6b 20 74 6f 20 70 72 65 \n............#.come.back.to.pre
6a80 76 69 6f 75 73 20 73 6f 6c 75 74 69 6f 6e 20 61 6e 64 20 71 75 69 74 20 6c 6f 6f 70 5c 6e 20 20 vious.solution.and.quit.loop\n..
6aa0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 70 72 69 6e 74 28 27 57 61 72 6e 69 6e 67 3a 20 6e 75 6d 65 72 69 ..........print('Warning:.numeri
6ac0 63 61 6c 20 65 72 72 6f 72 73 20 61 74 20 69 74 65 72 61 74 69 6f 6e 27 2c 20 63 70 74 29 5c 6e cal.errors.at.iteration',.cpt)\n
6ae0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 75 20 3d 20 75 70 72 65 76 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 ............u.=.uprev\n.........
6b00 20 20 20 76 20 3d 20 76 70 72 65 76 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 62 72 65 61 6b 5c ...v.=.vprev\n............break\
6b20 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 63 70 74 25 31 30 3d 3d 30 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 n........if.cpt%10==0:\n........
6b40 20 20 20 20 23 20 77 65 20 63 61 6e 20 73 70 65 65 64 20 75 70 20 74 68 65 20 70 72 6f 63 65 73 ....#.we.can.speed.up.the.proces
6b60 73 20 62 79 20 63 68 65 63 6b 69 6e 67 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 65 72 72 6f 72 20 6f 6e 6c 79 s.by.checking.for.the.error.only
6b80 20 61 6c 6c 20 74 68 65 20 31 30 74 68 20 69 74 65 72 61 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 .all.the.10th.iterations\n\n....
6ba0 20 20 20 20 20 20 20 20 65 72 72 20 3d 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 28 75 2d 75 70 72 65 76 29 2a 2a ........err.=.np.sum((u-uprev)**
6bc0 32 29 2f 6e 70 2e 73 75 6d 28 28 75 29 2a 2a 32 29 2b 6e 70 2e 73 75 6d 28 28 76 2d 76 70 72 65 2)/np.sum((u)**2)+np.sum((v-vpre
6be0 76 29 2a 2a 32 29 2f 6e 70 2e 73 75 6d 28 28 76 29 2a 2a 32 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 v)**2)/np.sum((v)**2)\n\n.......
6c00 20 20 20 20 20 69 66 20 6c 6f 67 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 6f .....if.log:\n................lo
6c20 67 5b 27 65 72 72 27 5d 2e 61 70 70 65 6e 64 28 65 72 72 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 g['err'].append(err)\n\n........
6c40 20 20 20 20 69 66 20 76 65 72 62 6f 73 65 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 ....if.verbose:\n...............
6c60 20 69 66 20 63 70 74 25 32 30 30 20 3d 3d 30 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 .if.cpt%200.==0:\n..............
6c80 20 20 20 20 20 20 70 72 69 6e 74 28 27 7b 3a 35 73 7d 7c 7b 3a 31 32 73 7d 27 2e 66 6f 72 6d 61 ......print('{:5s}|{:12s}'.forma
6ca0 74 28 27 49 74 2e 27 2c 27 45 72 72 27 29 2b 27 5c 5c 6e 27 2b 27 2d 27 2a 31 39 29 5c 6e 20 20 t('It.','Err')+'\\n'+'-'*19)\n..
6cc0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 70 72 69 6e 74 28 27 7b 3a 35 64 7d 7c 7b 3a 38 65 7d ..............print('{:5d}|{:8e}
6ce0 7c 27 2e 66 6f 72 6d 61 74 28 63 70 74 2c 65 72 72 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 63 70 74 |'.format(cpt,err))\n........cpt
6d00 20 3d 20 63 70 74 20 2b 31 5c 6e 20 20 20 20 69 66 20 6c 6f 67 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 .=.cpt.+1\n....if.log:\n........
6d20 6c 6f 67 5b 27 75 27 5d 3d 75 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 6f 67 5b 27 76 27 5d 3d 76 5c 6e log['u']=u\n........log['v']=v\n
6d40 20 20 20 20 20 20 20 20 5c 6e 20 20 20 20 69 66 20 6e 62 62 3a 20 23 72 65 74 75 72 6e 20 6f 6e ........\n....if.nbb:.#return.on
6d60 6c 79 20 6c 6f 73 73 20 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 72 65 73 3d 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 ly.loss.\n........res=np.zeros((
6d80 6e 62 62 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 62 nbb))\n........for.i.in.range(nb
6da0 62 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 72 65 73 5b 69 5d 3d 6e 70 2e 73 75 6d 28 75 b):\n............res[i]=np.sum(u
6dc0 5b 3a 2c 69 5d 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 31 29 29 2a 4b 2a 76 5b 3a 2c 69 5d 2e 72 [:,i].reshape((-1,1))*K*v[:,i].r
6de0 65 73 68 61 70 65 28 28 31 2c 2d 31 29 29 2a 4d 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 6c 6f eshape((1,-1))*M)\n........if.lo
6e00 67 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 72 65 73 2c 6c 6f 67 5c 6e g:\n............return.res,log\n
6e20 20 20 20 20 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 72 65 74 75 72 ........else:\n............retur
6e40 6e 20 72 65 73 20 20 20 20 20 20 20 20 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 5c 6e 20 20 20 20 65 6c 73 n.res........\n........\n....els
6e60 65 3a 20 23 20 72 65 74 75 72 6e 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 72 e:.#.return.OT.matrix\n........r
6e80 65 73 3d 72 65 67 2a 61 30 2a 6e 70 2e 73 75 6d 28 61 2a 6d 79 6c 6f 67 28 75 2b 28 75 3d 3d 30 es=reg*a0*np.sum(a*mylog(u+(u==0
6ea0 29 29 2b 62 2a 6d 79 6c 6f 67 28 76 2b 28 76 3d 3d 30 29 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 69 ))+b*mylog(v+(v==0)))\n........i
6ec0 66 20 6c 6f 67 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 f.log:\n............\n..........
6ee0 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 72 65 73 2c 6c 6f 67 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 5c ..return.res,log\n........else:\
6f00 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 72 65 73 5c 6e 5c 6e 72 65 67 3d 31 n............return.res\n\nreg=1
6f20 65 30 5c 6e 72 2c 6c 6f 67 3d 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 63 6f 6e 76 28 49 30 2c 49 31 2c 72 65 e0\nr,log=sinkhorn_conv(I0,I1,re
6f40 67 2c 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 2c 6c 6f 67 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 61 3d 49 30 5c 6e g,verbose=True,log=True)\na=I0\n
6f60 62 3d 49 31 5c 6e 75 3d 6c 6f 67 5b 27 75 27 5d 5c 6e 76 3d 6c 6f 67 5b 27 76 27 5d 5c 6e 23 25 b=I1\nu=log['u']\nv=log['v']\n#%
6f80 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 %.barycenter.interpolation".....
6fa0 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 ..],........"outputs":.[],......
6fc0 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 .."metadata":.{........."collaps
6fe0 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 ed":.false.......}.....}...],...
7000 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a ."metadata":.{....."kernelspec":
7020 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e .{......."display_name":."Python
7040 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a .2",........"name":."python2",..
7060 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d ......"language":."python".....}
7080 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 ,......"language_info":.{.......
70a0 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 "mimetype":."text/x-python",....
70c0 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f ...."nbconvert_exporter":."pytho
70e0 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 n",........"name":."python",....
7100 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 ...."file_extension":.".py",....
7120 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 ...."version":."2.7.12",........
7140 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 "pygments_lexer":."ipython2",...
7160 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 ....."codemirror_mode":.{.......
7180 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a .."version":.2,.........."name":
71a0 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b ."ipython".......}.....}...}.}PK
71c0 03 04 14 00 00 00 00 00 0f 83 1e 4b 06 87 a7 1b 68 0f 00 00 68 0f 00 00 26 00 00 00 61 75 74 6f ...........K....h...h...&...auto
71e0 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 31 44 2e 69 70 79 _examples/plot_barycenter_1D.ipy
7200 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e nb{..."nbformat_minor":.0,...."n
7220 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b bformat":.4,...."cells":.[.....{
7240 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 ......."execution_count":.null,.
7260 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 ......."cell_type":."code",.....
7280 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 ..."source":.[........."%matplot
72a0 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 lib.inline".......],........"out
72c0 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a puts":.[],........"metadata":.{.
72e0 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 ........"collapsed":.false......
7300 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a .}.....},......{......."source":
7320 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 31 44 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 62 .[........."\n#.1D.Wasserstein.b
7340 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 64 65 6d 6f 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c arycenter.demo\n\n\n\n".......],
7360 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c ........"cell_type":."markdown",
7380 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 ........"metadata":.{}.....},...
73a0 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 ...{......."execution_count":.nu
73c0 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 ll,........"cell_type":."code",.
73e0 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 ......."source":.[........."#.Au
7400 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 thor:.Remi.Flamary.<remi.flamary
7420 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 @unice.fr>\n#\n#.License:.MIT.Li
7440 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 cense\n\nimport.numpy.as.np\nimp
7460 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f ort.matplotlib.pylab.as.pl\nimpo
7480 72 74 20 6f 74 5c 6e 23 20 6e 65 63 65 73 73 61 72 79 20 66 6f 72 20 33 64 20 70 6c 6f 74 20 65 rt.ot\n#.necessary.for.3d.plot.e
74a0 76 65 6e 20 69 66 20 6e 6f 74 20 75 73 65 64 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6d 70 6c 5f 74 6f 6f 6c 6b 69 ven.if.not.used\nfrom.mpl_toolki
74c0 74 73 2e 6d 70 6c 6f 74 33 64 20 69 6d 70 6f 72 74 20 41 78 65 73 33 44 20 20 23 20 6e 6f 71 61 ts.mplot3d.import.Axes3D..#.noqa
74e0 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 73 20 69 6d \nfrom.matplotlib.collections.im
7500 70 6f 72 74 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 port.PolyCollection\n\n\n#%%.par
7520 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e 73 5c 6e 5c ameters\n\nn.=.100..#.nb.bins\n\
7540 6e 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 5c 6e 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 n#.bin.positions\nx.=.np.arange(
7560 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e 5c 6e 23 20 47 61 75 73 73 69 n,.dtype=np.float64)\n\n#.Gaussi
7580 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 61 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 an.distributions\na1.=.ot.datase
75a0 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 ts.get_1D_gauss(n,.m=20,.s=5)..#
75c0 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 5c 6e 61 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 .m=.mean,.s=.std\na2.=.ot.datase
75e0 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 36 30 2c 20 73 3d 38 29 5c 6e 5c ts.get_1D_gauss(n,.m=60,.s=8)\n\
7600 6e 23 20 63 72 65 61 74 69 6e 67 20 6d 61 74 72 69 78 20 41 20 63 6f 6e 74 61 69 6e 69 6e 67 20 n#.creating.matrix.A.containing.
7620 61 6c 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 41 20 3d 20 6e 70 2e 76 73 74 61 63 6b all.distributions\nA.=.np.vstack
7640 28 28 61 31 2c 20 61 32 29 29 2e 54 5c 6e 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 3d 20 ((a1,.a2)).T\nn_distributions.=.
7660 41 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 20 2b 20 6e 6f A.shape[1]\n\n#.loss.matrix.+.no
7680 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 64 69 73 74 30 28 rmalization\nM.=.ot.utils.dist0(
76a0 6e 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 n)\nM./=.M.max()\n\n#%%.plot.the
76c0 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 .distributions\n\npl.figure(1,.f
76e0 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 igsize=(6.4,.3))\nfor.i.in.range
7700 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 (n_distributions):\n....pl.plot(
7720 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 x,.A[:,.i])\npl.title('Distribut
7740 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 ions')\npl.tight_layout()\n\n#%%
7760 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 61 6c 70 68 61 .barycenter.computation\n\nalpha
7780 20 3d 20 30 2e 32 20 20 23 20 30 3c 3d 61 6c 70 68 61 3c 3d 31 5c 6e 77 65 69 67 68 74 73 20 3d .=.0.2..#.0<=alpha<=1\nweights.=
77a0 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 5c 6e 5c .np.array([1.-.alpha,.alpha])\n\
77c0 6e 23 20 6c 32 62 61 72 79 5c 6e 62 61 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 n#.l2bary\nbary_l2.=.A.dot(weigh
77e0 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 ts)\n\n#.wasserstein\nreg.=.1e-3
7800 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e \nbary_wass.=.ot.bregman.barycen
7820 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 ter(A,.M,.reg,.weights)\n\npl.fi
7840 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c gure(2)\npl.clf()\npl.subplot(2,
7860 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 .1,.1)\nfor.i.in.range(n_distrib
7880 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d utions):\n....pl.plot(x,.A[:,.i]
78a0 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e )\npl.title('Distributions')\n\n
78c0 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 pl.subplot(2,.1,.2)\npl.plot(x,.
78e0 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c bary_l2,.'r',.label='l2')\npl.pl
7900 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 57 61 73 ot(x,.bary_wass,.'g',.label='Was
7920 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c serstein')\npl.legend()\npl.titl
7940 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 e('Barycenters')\npl.tight_layou
7960 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 t()\n\n#%%.barycenter.interpolat
7980 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 6e 5f 61 6c 70 68 61 20 3d 20 31 31 5c 6e 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 20 ion\n\nn_alpha.=.11\nalpha_list.
79a0 3d 20 6e 70 2e 6c 69 6e 73 70 61 63 65 28 30 2c 20 31 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 5c 6e 5c 6e =.np.linspace(0,.1,.n_alpha)\n\n
79c0 5c 6e 42 5f 6c 32 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 29 5c \nB_l2.=.np.zeros((n,.n_alpha))\
79e0 6e 5c 6e 42 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 70 79 28 42 5f 6c 32 29 5c 6e 5c 6e 66 6f 72 n\nB_wass.=.np.copy(B_l2)\n\nfor
7a00 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 30 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 61 6c .i.in.range(0,.n_alpha):\n....al
7a20 70 68 61 20 3d 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5b 69 5d 5c 6e 20 20 20 20 77 65 69 67 68 74 73 pha.=.alpha_list[i]\n....weights
7a40 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 5c .=.np.array([1.-.alpha,.alpha])\
7a60 6e 20 20 20 20 42 5f 6c 32 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 n....B_l2[:,.i].=.A.dot(weights)
7a80 5c 6e 20 20 20 20 42 5f 77 61 73 73 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e \n....B_wass[:,.i].=.ot.bregman.
7aa0 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e barycenter(A,.M,.reg,.weights)\n
7ac0 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 \n#%%.plot.interpolation\n\npl.f
7ae0 69 67 75 72 65 28 33 29 5c 6e 5c 6e 63 6d 61 70 20 3d 20 70 6c 2e 63 6d 2e 67 65 74 5f 63 6d 61 igure(3)\n\ncmap.=.pl.cm.get_cma
7b00 70 28 27 76 69 72 69 64 69 73 27 29 5c 6e 76 65 72 74 73 20 3d 20 5b 5d 5c 6e 7a 73 20 3d 20 61 p('viridis')\nverts.=.[]\nzs.=.a
7b20 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5c 6e 66 6f 72 20 69 2c 20 7a 20 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 lpha_list\nfor.i,.z.in.enumerate
7b40 28 7a 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 79 73 20 3d 20 42 5f 6c 32 5b 3a 2c 20 69 5d 5c 6e 20 20 20 20 (zs):\n....ys.=.B_l2[:,.i]\n....
7b60 76 65 72 74 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 6c 69 73 74 28 7a 69 70 28 78 2c 20 79 73 29 29 29 5c 6e verts.append(list(zip(x,.ys)))\n
7b80 5c 6e 61 78 20 3d 20 70 6c 2e 67 63 66 28 29 2e 67 63 61 28 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 3d 27 \nax.=.pl.gcf().gca(projection='
7ba0 33 64 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6f 6c 79 20 3d 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 28 76 65 3d')\n\npoly.=.PolyCollection(ve
7bc0 72 74 73 2c 20 66 61 63 65 63 6f 6c 6f 72 73 3d 5b 63 6d 61 70 28 61 29 20 66 6f 72 20 61 20 69 rts,.facecolors=[cmap(a).for.a.i
7be0 6e 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5d 29 5c 6e 70 6f 6c 79 2e 73 65 74 5f 61 6c 70 68 61 28 30 n.alpha_list])\npoly.set_alpha(0
7c00 2e 37 29 5c 6e 61 78 2e 61 64 64 5f 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 33 64 28 70 6f 6c 79 2c 20 7a .7)\nax.add_collection3d(poly,.z
7c20 73 3d 7a 73 2c 20 7a 64 69 72 3d 27 79 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 61 62 65 6c 28 27 s=zs,.zdir='y')\nax.set_xlabel('
7c40 78 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 6e 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 x')\nax.set_xlim3d(0,.n)\nax.set
7c60 5f 79 6c 61 62 65 6c 28 27 24 5c 5c 5c 5c 61 6c 70 68 61 24 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 79 _ylabel('$\\\\alpha$')\nax.set_y
7c80 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 31 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 61 62 65 6c 28 27 27 29 5c 6e lim3d(0,.1)\nax.set_zlabel('')\n
7ca0 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 42 5f 6c 32 2e 6d 61 78 28 29 20 2a 20 31 2e ax.set_zlim3d(0,.B_l2.max().*.1.
7cc0 30 31 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 01)\npl.title('Barycenter.interp
7ce0 6f 6c 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 6c 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f olation.with.l2')\npl.tight_layo
7d00 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 29 5c 6e 63 6d 61 70 20 3d 20 70 6c 2e ut()\n\npl.figure(4)\ncmap.=.pl.
7d20 63 6d 2e 67 65 74 5f 63 6d 61 70 28 27 76 69 72 69 64 69 73 27 29 5c 6e 76 65 72 74 73 20 3d 20 cm.get_cmap('viridis')\nverts.=.
7d40 5b 5d 5c 6e 7a 73 20 3d 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5c 6e 66 6f 72 20 69 2c 20 7a 20 69 6e []\nzs.=.alpha_list\nfor.i,.z.in
7d60 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 7a 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 79 73 20 3d 20 42 5f 77 61 73 73 .enumerate(zs):\n....ys.=.B_wass
7d80 5b 3a 2c 20 69 5d 5c 6e 20 20 20 20 76 65 72 74 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 6c 69 73 74 28 7a 69 [:,.i]\n....verts.append(list(zi
7da0 70 28 78 2c 20 79 73 29 29 29 5c 6e 5c 6e 61 78 20 3d 20 70 6c 2e 67 63 66 28 29 2e 67 63 61 28 p(x,.ys)))\n\nax.=.pl.gcf().gca(
7dc0 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 3d 27 33 64 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6f 6c 79 20 3d 20 50 6f 6c 79 43 projection='3d')\n\npoly.=.PolyC
7de0 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 28 76 65 72 74 73 2c 20 66 61 63 65 63 6f 6c 6f 72 73 3d 5b 63 6d 61 ollection(verts,.facecolors=[cma
7e00 70 28 61 29 20 66 6f 72 20 61 20 69 6e 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5d 29 5c 6e 70 6f 6c 79 p(a).for.a.in.alpha_list])\npoly
7e20 2e 73 65 74 5f 61 6c 70 68 61 28 30 2e 37 29 5c 6e 61 78 2e 61 64 64 5f 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 .set_alpha(0.7)\nax.add_collecti
7e40 6f 6e 33 64 28 70 6f 6c 79 2c 20 7a 73 3d 7a 73 2c 20 7a 64 69 72 3d 27 79 27 29 5c 6e 61 78 2e on3d(poly,.zs=zs,.zdir='y')\nax.
7e60 73 65 74 5f 78 6c 61 62 65 6c 28 27 78 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 69 6d 33 64 28 30 set_xlabel('x')\nax.set_xlim3d(0
7e80 2c 20 6e 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 61 62 65 6c 28 27 24 5c 5c 5c 5c 61 6c 70 68 61 24 ,.n)\nax.set_ylabel('$\\\\alpha$
7ea0 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 31 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f ')\nax.set_ylim3d(0,.1)\nax.set_
7ec0 7a 6c 61 62 65 6c 28 27 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 42 5f 6c zlabel('')\nax.set_zlim3d(0,.B_l
7ee0 32 2e 6d 61 78 28 29 20 2a 20 31 2e 30 31 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 2.max().*.1.01)\npl.title('Baryc
7f00 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 57 61 73 73 65 72 73 enter.interpolation.with.Wassers
7f20 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e tein')\npl.tight_layout()\n\npl.
7f40 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 show()".......],........"outputs
7f60 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 ":.[],........"metadata":.{.....
7f80 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 ...."collapsed":.false.......}..
7fa0 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 ...}...],...."metadata":.{....."
7fc0 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 kernelspec":.{......."display_na
7fe0 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 me":."Python.2",........"name":.
8000 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 "python2",........"language":."p
8020 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 ython".....},......"language_inf
8040 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d o":.{......."mimetype":."text/x-
8060 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 python",........"nbconvert_expor
8080 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 ter":."python",........"name":."
80a0 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 python",........"file_extension"
80c0 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e :.".py",........"version":."2.7.
80e0 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 12",........"pygments_lexer":."i
8100 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 python2",........"codemirror_mod
8120 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 e":.{........."version":.2,.....
8140 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 ....."name":."ipython".......}..
8160 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 9c 86 1e 4b f2 bc 11 4b 08 19 00 00 ...}...}.}PK...........K...K....
8180 08 19 00 00 25 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f ....%...auto_examples/plot_otda_
81a0 63 6c 61 73 73 65 73 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 classes.ipynb{..."nbformat_minor
81c0 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c ":.0,...."nbformat":.4,...."cell
81e0 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 s":.[.....{......."execution_cou
8200 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 nt":.null,........"cell_type":."
8220 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 code",........"source":.[.......
8240 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 .."%matplotlib.inline".......],.
8260 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 ......."outputs":.[],........"me
8280 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 tadata":.{........."collapsed":.
82a0 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 false.......}.....},......{.....
82c0 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 4f 54 20 66 6f .."source":.[........."\n#.OT.fo
82e0 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 54 68 69 73 20 65 78 r.domain.adaptation\n\n\nThis.ex
8300 61 6d 70 6c 65 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 73 20 61 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 ample.introduces.a.domain.adapta
8320 74 69 6f 6e 20 69 6e 20 61 20 32 44 20 73 65 74 74 69 6e 67 20 61 6e 64 20 74 68 65 20 34 20 4f tion.in.a.2D.setting.and.the.4.O
8340 54 44 41 5c 6e 61 70 70 72 6f 61 63 68 65 73 20 63 75 72 72 65 6e 74 6c 79 20 73 75 70 70 6f 72 TDA\napproaches.currently.suppor
8360 74 65 64 20 69 6e 20 50 4f 54 2e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 ted.in.POT.\n\n\n".......],.....
8380 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 ..."cell_type":."markdown",.....
83a0 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a ..."metadata":.{}.....},......{.
83c0 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a ......"execution_count":.null,..
83e0 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 ......"cell_type":."code",......
8400 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 .."source":.[........."#.Authors
8420 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 :.Remi.Flamary.<remi.flamary@uni
8440 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 ce.fr>\n#..........Stanislas.Cha
8460 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 5c 6e 23 mbon.<stan.chambon@gmail.com>\n#
8480 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f \n#.License:.MIT.License\n\nimpo
84a0 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 rt.matplotlib.pylab.as.pl\nimpor
84c0 74 20 6f 74 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a t.ot".......],........"outputs":
84e0 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 .[],........"metadata":.{.......
8500 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 .."collapsed":.false.......}....
8520 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 .},......{......."source":.[....
8540 20 20 20 20 20 22 67 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ....."generate.data\n###########
8560 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
8580 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
85a0 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 ##\n\n".......],........"cell_ty
85c0 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 pe":."markdown",........"metadat
85e0 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 a":.{}.....},......{......."exec
8600 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c ution_count":.null,........"cell
8620 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a _type":."code",........"source":
8640 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 31 .[........."n_source_samples.=.1
8660 35 30 5c 6e 6e 5f 74 61 72 67 65 74 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 31 35 30 5c 6e 5c 6e 58 73 50\nn_target_samples.=.150\n\nXs
8680 2c 20 79 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 ,.ys.=.ot.datasets.get_data_clas
86a0 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 27 2c 20 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 29 5c sif('3gauss',.n_source_samples)\
86c0 6e 58 74 2c 20 79 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 nXt,.yt.=.ot.datasets.get_data_c
86e0 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 32 27 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 5f 73 61 6d 70 6c lassif('3gauss2',.n_target_sampl
8700 65 73 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 es)".......],........"outputs":.
8720 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 [],........"metadata":.{........
8740 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 ."collapsed":.false.......}.....
8760 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 },......{......."source":.[.....
8780 20 20 20 20 22 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 ...."Instantiate.the.different.t
87a0 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d ransport.algorithms.and.fit.them
87c0 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 \n##############################
87e0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
8800 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 ###############\n\n".......],...
8820 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 ....."cell_type":."markdown",...
8840 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 ....."metadata":.{}.....},......
8860 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c {......."execution_count":.null,
8880 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 ........"cell_type":."code",....
88a0 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 45 4d 44 20 54 ...."source":.[........."#.EMD.T
88c0 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e ransport\not_emd.=.ot.da.EMDTran
88e0 73 70 6f 72 74 28 29 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 sport()\not_emd.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt
8900 29 5c 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 73 69 )\n\n#.Sinkhorn.Transport\not_si
8920 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 nkhorn.=.ot.da.SinkhornTransport
8940 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 (reg_e=1e-1)\not_sinkhorn.fit(Xs
8960 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 =Xs,.Xt=Xt)\n\n#.Sinkhorn.Transp
8980 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 ort.with.Group.lasso.regularizat
89a0 69 6f 6e 5c 6e 6f 74 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c ion\not_lpl1.=.ot.da.SinkhornLpl
89c0 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 2c 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 31 65 1Transport(reg_e=1e-1,.reg_cl=1e
89e0 30 29 5c 6e 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 0)\not_lpl1.fit(Xs=Xs,.ys=ys,.Xt
8a00 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 =Xt)\n\n#.Sinkhorn.Transport.wit
8a20 68 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 6c 31 6c h.Group.lasso.regularization.l1l
8a40 32 5c 6e 6f 74 5f 6c 31 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 2\not_l1l2.=.ot.da.SinkhornL1l2T
8a60 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 2c 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 32 65 30 2c ransport(reg_e=1e-1,.reg_cl=2e0,
8a80 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 .max_iter=20,\n.................
8aa0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 .....................verbose=Tru
8ac0 65 29 5c 6e 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 e)\not_l1l2.fit(Xs=Xs,.ys=ys,.Xt
8ae0 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c =Xt)\n\n#.transport.source.sampl
8b00 65 73 20 6f 6e 74 6f 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 es.onto.target.samples\ntransp_X
8b20 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c s_emd.=.ot_emd.transform(Xs=Xs)\
8b40 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 ntransp_Xs_sinkhorn.=.ot_sinkhor
8b60 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 n.transform(Xs=Xs)\ntransp_Xs_lp
8b80 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 l1.=.ot_lpl1.transform(Xs=Xs)\nt
8ba0 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 31 6c 32 20 3d 20 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 ransp_Xs_l1l2.=.ot_l1l2.transfor
8bc0 6d 28 58 73 3d 58 73 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 m(Xs=Xs)".......],........"outpu
8be0 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 ts":.[],........"metadata":.{...
8c00 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d ......"collapsed":.false.......}
8c20 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b .....},......{......."source":.[
8c40 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 ........."Fig.1.:.plots.source.a
8c60 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 nd.target.samples\n#############
8c80 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
8ca0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
8cc0 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 \n\n".......],........"cell_type
8ce0 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 ":."markdown",........"metadata"
8d00 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 :.{}.....},......{......."execut
8d20 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 ion_count":.null,........"cell_t
8d40 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b ype":."code",........"source":.[
8d60 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 ........."pl.figure(1,.figsize=(
8d80 31 30 2c 20 35 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 10,.5))\npl.subplot(1,.2,.1)\npl
8da0 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 .scatter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=y
8dc0 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d s,.marker='+',.label='Source.sam
8de0 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 ples')\npl.xticks([])\npl.yticks
8e00 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 ([])\npl.legend(loc=0)\npl.title
8e20 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f ('Source..samples')\n\npl.subplo
8e40 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c t(1,.2,.2)\npl.scatter(Xt[:,.0],
8e60 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 .Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',.lab
8e80 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 el='Target.samples')\npl.xticks(
8ea0 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f [])\npl.yticks([])\npl.legend(lo
8ec0 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 c=0)\npl.title('Target.samples')
8ee0 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 \npl.tight_layout()".......],...
8f00 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 ....."outputs":.[],........"meta
8f20 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 data":.{........."collapsed":.fa
8f40 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 lse.......}.....},......{.......
8f60 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f "source":.[........."Fig.2.:.plo
8f80 74 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 61 6e 64 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 t.optimal.couplings.and.transpor
8fa0 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ted.samples\n###################
8fc0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
8fe0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a ##########################\n\n".
9000 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 ......],........"cell_type":."ma
9020 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 rkdown",........"metadata":.{}..
9040 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f ...},......{......."execution_co
9060 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 unt":.null,........"cell_type":.
9080 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 "code",........"source":.[......
90a0 20 20 20 22 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 20 3d 20 7b 27 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 27 ..."param_img.=.{'interpolation'
90c0 3a 20 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 2c 20 27 63 6d 61 70 27 3a 20 27 73 70 65 63 74 72 61 6c 27 7d :.'nearest',.'cmap':.'spectral'}
90e0 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 35 2c 20 38 29 \n\npl.figure(2,.figsize=(15,.8)
9100 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f )\npl.subplot(2,.4,.1)\npl.imsho
9120 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 w(ot_emd.coupling_,.**param_img)
9140 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e \npl.xticks([])\npl.yticks([])\n
9160 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 pl.title('Optimal.coupling\\nEMD
9180 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 Transport')\n\npl.subplot(2,.4,.
91a0 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 2)\npl.imshow(ot_sinkhorn.coupli
91c0 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 ng_,.**param_img)\npl.xticks([])
91e0 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d \npl.yticks([])\npl.title('Optim
9200 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 al.coupling\\nSinkhornTransport'
9220 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 )\n\npl.subplot(2,.4,.3)\npl.ims
9240 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 how(ot_lpl1.coupling_,.**param_i
9260 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d mg)\npl.xticks([])\npl.yticks([]
9280 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e )\npl.title('Optimal.coupling\\n
92a0 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 SinkhornLpl1Transport')\n\npl.su
92c0 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 31 6c bplot(2,.4,.4)\npl.imshow(ot_l1l
92e0 32 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 2.coupling_,.**param_img)\npl.xt
9300 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c icks([])\npl.yticks([])\npl.titl
9320 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 e('Optimal.coupling\\nSinkhornL1
9340 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 l2Transport')\n\npl.subplot(2,.4
9360 2c 20 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c ,.5)\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,
9380 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 .1],.c=yt,.marker='o',\n........
93a0 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 ...label='Target.samples',.alpha
93c0 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b =0.3)\npl.scatter(transp_Xs_emd[
93e0 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 :,.0],.transp_Xs_emd[:,.1],.c=ys
9400 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d ,\n...........marker='+',.label=
9420 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 'Transp.samples',.s=30)\npl.xtic
9440 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 ks([])\npl.yticks([])\npl.title(
9460 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 'Transported.samples\\nEmdTransp
9480 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 5c 22 6c 6f 77 65 72 20 6c 65 66 ort')\npl.legend(loc=\"lower.lef
94a0 74 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 36 29 5c 6e 70 6c 2e t\")\n\npl.subplot(2,.4,.6)\npl.
94c0 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt
94e0 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d ,.marker='o',\n...........label=
9500 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 'Target.samples',.alpha=0.3)\npl
9520 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 30 .scatter(transp_Xs_sinkhorn[:,.0
9540 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 ],.transp_Xs_sinkhorn[:,.1],.c=y
9560 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c s,\n...........marker='+',.label
9580 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 ='Transp.samples',.s=30)\npl.xti
95a0 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 cks([])\npl.yticks([])\npl.title
95c0 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e ('Transported.samples\\nSinkhorn
95e0 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 Transport')\n\npl.subplot(2,.4,.
9600 37 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 7)\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1
9620 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 ],.c=yt,.marker='o',\n..........
9640 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 .label='Target.samples',.alpha=0
9660 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a .3)\npl.scatter(transp_Xs_lpl1[:
9680 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 ,.0],.transp_Xs_lpl1[:,.1],.c=ys
96a0 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d ,\n...........marker='+',.label=
96c0 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 'Transp.samples',.s=30)\npl.xtic
96e0 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 ks([])\npl.yticks([])\npl.title(
9700 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 'Transported.samples\\nSinkhornL
9720 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 pl1Transport')\n\npl.subplot(2,.
9740 34 2c 20 38 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 4,.8)\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:
9760 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 ,.1],.c=yt,.marker='o',\n.......
9780 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 ....label='Target.samples',.alph
97a0 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 31 6c a=0.3)\npl.scatter(transp_Xs_l1l
97c0 32 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 31 6c 32 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 2[:,.0],.transp_Xs_l1l2[:,.1],.c
97e0 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 =ys,\n...........marker='+',.lab
9800 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 el='Transp.samples',.s=30)\npl.x
9820 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 ticks([])\npl.yticks([])\npl.tit
9840 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f le('Transported.samples\\nSinkho
9860 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f rnL1l2Transport')\npl.tight_layo
9880 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 ut()\n\npl.show()".......],.....
98a0 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 ..."outputs":.[],........"metada
98c0 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 ta":.{........."collapsed":.fals
98e0 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 e.......}.....}...],...."metadat
9900 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 a":.{....."kernelspec":.{.......
9920 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 "display_name":."Python.2",.....
9940 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 ..."name":."python2",........"la
9960 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c nguage":."python".....},......"l
9980 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 anguage_info":.{......."mimetype
99a0 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f ":."text/x-python",........"nbco
99c0 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 nvert_exporter":."python",......
99e0 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 .."name":."python",........"file
9a00 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 _extension":.".py",........"vers
9a20 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 ion":."2.7.12",........"pygments
9a40 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 _lexer":."ipython2",........"cod
9a60 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f emirror_mode":.{........."versio
9a80 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e n":.2,.........."name":."ipython
9aa0 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 0d ".......}.....}...}.}PK.........
9ac0 88 1e 4b c8 39 53 c8 df 19 00 00 df 19 00 00 33 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 ..K.9S.........3...auto_examples
9ae0 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 63 6f 6c 6f 72 73 5f 69 6d 61 67 65 73 /plot_otda_mapping_colors_images
9b00 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a .ipynb{..."nbformat_minor":.0,..
9b20 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 .."nbformat":.4,...."cells":.[..
9b40 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 ...{......."execution_count":.nu
9b60 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 ll,........"cell_type":."code",.
9b80 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 ......."source":.[........."%mat
9ba0 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 plotlib.inline".......],........
9bc0 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 "outputs":.[],........"metadata"
9be0 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 :.{........."collapsed":.false..
9c00 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 .....}.....},......{......."sour
9c20 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d ce":.[........."\n==============
9c40 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d ================================
9c60 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d ================================
9c80 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e ======\nOT.for.domain.adaptation
9ca0 20 77 69 74 68 20 69 6d 61 67 65 20 63 6f 6c 6f 72 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 5b 36 5d .with.image.color.adaptation.[6]
9cc0 20 77 69 74 68 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 5b 38 5d 5c 6e 3d 3d .with.mapping.estimation.[8]\n==
9ce0 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d ================================
9d00 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d ================================
9d20 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 5c 6e 5b 36 5d 20 46 65 72 72 61 64 ==================\n\n[6].Ferrad
9d40 61 6e 73 2c 20 53 2e 2c 20 50 61 70 61 64 61 6b 69 73 2c 20 4e 2e 2c 20 50 65 79 72 65 2c 20 47 ans,.S.,.Papadakis,.N.,.Peyre,.G
9d60 2e 2c 20 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 4a 2e 20 46 2e 20 28 32 30 31 34 29 2e 20 52 65 67 75 6c 61 .,.&.Aujol,.J..F..(2014)..Regula
9d80 72 69 7a 65 64 5c 6e 20 20 20 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e rized\n....discrete.optimal.tran
9da0 73 70 6f 72 74 2e 20 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c 20 6f 6e 20 49 6d 61 67 69 6e 67 20 53 sport..SIAM.Journal.on.Imaging.S
9dc0 63 69 65 6e 63 65 73 2c 20 37 28 33 29 2c 5c 6e 20 20 20 20 31 38 35 33 2d 31 38 38 32 2e 5c 6e ciences,.7(3),\n....1853-1882.\n
9de0 5b 38 5d 20 4d 2e 20 50 65 72 72 6f 74 2c 20 4e 2e 20 43 6f 75 72 74 79 2c 20 52 2e 20 46 6c 61 [8].M..Perrot,.N..Courty,.R..Fla
9e00 6d 61 72 79 2c 20 41 2e 20 48 61 62 72 61 72 64 2c 20 5c 22 4d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 mary,.A..Habrard,.\"Mapping.esti
9e20 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 5c 6e 20 20 20 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c mation.for\n....discrete.optimal
9e40 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 22 2c 20 4e 65 75 72 61 6c 20 49 6e 66 6f 72 6d 61 74 69 6f 6e .transport\",.Neural.Information
9e60 20 50 72 6f 63 65 73 73 69 6e 67 20 53 79 73 74 65 6d 73 20 28 4e 49 50 53 29 2c 5c 6e 20 20 20 .Processing.Systems.(NIPS),\n...
9e80 20 32 30 31 36 2e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 .2016.\n\n\n".......],........"c
9ea0 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d ell_type":."markdown",........"m
9ec0 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 etadata":.{}.....},......{......
9ee0 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ."execution_count":.null,.......
9f00 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f ."cell_type":."code",........"so
9f20 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d urce":.[........."#.Authors:.Rem
9f40 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 i.Flamary.<remi.flamary@unice.fr
9f60 3e 5c 6e 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 >\n#..........Stanislas.Chambon.
9f80 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c <stan.chambon@gmail.com>\n#\n#.L
9fa0 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 icense:.MIT.License\n\nimport.nu
9fc0 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 66 72 6f 6d 20 73 63 69 70 79 20 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 64 69 mpy.as.np\nfrom.scipy.import.ndi
9fe0 6d 61 67 65 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 mage\nimport.matplotlib.pylab.as
a000 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 5c 6e 72 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e .pl\nimport.ot\n\nr.=.np.random.
a020 52 61 6e 64 6f 6d 53 74 61 74 65 28 34 32 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 69 6d 32 6d 61 74 28 RandomState(42)\n\n\ndef.im2mat(
a040 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 61 6e 64 20 69 6d 61 67 I):\n....\"\"\"Converts.and.imag
a060 65 20 74 6f 20 6d 61 74 72 69 78 20 28 6f 6e 65 20 70 69 78 65 6c 20 70 65 72 20 6c 69 6e 65 29 e.to.matrix.(one.pixel.per.line)
a080 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 49 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 49 2e \"\"\"\n....return.I.reshape((I.
a0a0 73 68 61 70 65 5b 30 5d 20 2a 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 32 shape[0].*.I.shape[1],.I.shape[2
a0c0 5d 29 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 6d 61 74 32 69 6d 28 58 2c 20 73 68 61 70 65 29 3a 5c 6e ]))\n\n\ndef.mat2im(X,.shape):\n
a0e0 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 62 61 63 6b 20 61 20 6d 61 74 72 69 78 ....\"\"\"Converts.back.a.matrix
a100 20 74 6f 20 61 6e 20 69 6d 61 67 65 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 58 .to.an.image\"\"\"\n....return.X
a120 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 73 68 61 70 65 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 .reshape(shape)\n\n\ndef.minmax(
a140 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 63 6c 69 70 28 49 2c 20 30 2c 20 31 29 I):\n....return.np.clip(I,.0,.1)
a160 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c ".......],........"outputs":.[],
a180 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 ........"metadata":.{........."c
a1a0 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 ollapsed":.false.......}.....},.
a1c0 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 .....{......."source":.[........
a1e0 20 22 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ."Generate.data\n###############
a200 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
a220 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e ##############################\n
a240 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a \n".......],........"cell_type":
a260 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 ."markdown",........"metadata":.
a280 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f {}.....},......{......."executio
a2a0 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 n_count":.null,........"cell_typ
a2c0 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 e":."code",........"source":.[..
a2e0 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 4c 6f 61 64 69 6e 67 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 49 31 20 3d 20 6e ......."#.Loading.images\nI1.=.n
a300 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 64 61 79 dimage.imread('../data/ocean_day
a320 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 5c .jpg').astype(np.float64)./.256\
a340 6e 49 32 20 3d 20 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 nI2.=.ndimage.imread('../data/oc
a360 65 61 6e 5f 73 75 6e 73 65 74 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 ean_sunset.jpg').astype(np.float
a380 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 5c 6e 5c 6e 5c 6e 58 31 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 31 29 5c 6e 64)./.256\n\n\nX1.=.im2mat(I1)\n
a3a0 58 32 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 32 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 X2.=.im2mat(I2)\n\n#.training.sa
a3c0 6d 70 6c 65 73 5c 6e 6e 62 20 3d 20 31 30 30 30 5c 6e 69 64 78 31 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 mples\nnb.=.1000\nidx1.=.r.randi
a3e0 6e 74 28 58 31 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 5c 6e 69 64 78 nt(X1.shape[0],.size=(nb,))\nidx
a400 32 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 32 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 2.=.r.randint(X2.shape[0],.size=
a420 28 6e 62 2c 29 29 5c 6e 5c 6e 58 73 20 3d 20 58 31 5b 69 64 78 31 2c 20 3a 5d 5c 6e 58 74 20 3d (nb,))\n\nXs.=.X1[idx1,.:]\nXt.=
a440 20 58 32 5b 69 64 78 32 2c 20 3a 5d 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f .X2[idx2,.:]".......],........"o
a460 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 utputs":.[],........"metadata":.
a480 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 {........."collapsed":.false....
a4a0 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 ...}.....},......{......."source
a4c0 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 44 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 ":.[........."Domain.adaptation.
a4e0 66 6f 72 20 70 69 78 65 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 74 72 61 6e 73 66 65 72 5c for.pixel.distribution.transfer\
a500 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 n###############################
a520 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
a540 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 ##############\n\n".......],....
a560 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 ...."cell_type":."markdown",....
a580 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b ...."metadata":.{}.....},......{
a5a0 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 ......."execution_count":.null,.
a5c0 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 ......."cell_type":."code",.....
a5e0 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 45 4d 44 54 72 61 ..."source":.[........."#.EMDTra
a600 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 nsport\not_emd.=.ot.da.EMDTransp
a620 6f 72 74 28 29 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c ort()\not_emd.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\
a640 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 ntransp_Xs_emd.=.ot_emd.transfor
a660 6d 28 58 73 3d 58 31 29 5c 6e 49 6d 61 67 65 5f 65 6d 64 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 m(Xs=X1)\nImage_emd.=.minmax(mat
a680 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 5c 2im(transp_Xs_emd,.I1.shape))\n\
a6a0 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 n#.SinkhornTransport\not_sinkhor
a6c0 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f n.=.ot.da.SinkhornTransport(reg_
a6e0 65 3d 31 65 2d 31 29 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 e=1e-1)\not_sinkhorn.fit(Xs=Xs,.
a700 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f Xt=Xt)\ntransp_Xs_sinkhorn.=.ot_
a720 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 5c 6e 49 6d 61 67 65 5f 73 69 6e 6b emd.transform(Xs=X1)\nImage_sink
a740 68 6f 72 6e 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 horn.=.minmax(mat2im(transp_Xs_s
a760 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e inkhorn,.I1.shape))\n\not_mappin
a780 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 g_linear.=.ot.da.MappingTranspor
a7a0 74 28 5c 6e 20 20 20 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 38 2c 20 62 69 61 73 3d 54 t(\n....mu=1e0,.eta=1e-8,.bias=T
a7c0 72 75 65 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c rue,.max_iter=20,.verbose=True)\
a7e0 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 not_mapping_linear.fit(Xs=Xs,.Xt
a800 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 58 31 74 6c 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 =Xt)\n\nX1tl.=.ot_mapping_linear
a820 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 5c 6e 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 .transform(Xs=X1)\nImage_mapping
a840 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 6c 2c 20 49 31 _linear.=.minmax(mat2im(X1tl,.I1
a860 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 .shape))\n\not_mapping_gaussian.
a880 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 5c 6e 20 20 20 20 6d =.ot.da.MappingTransport(\n....m
a8a0 75 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 32 2c 20 73 69 67 6d 61 3d 31 2c 20 62 69 61 73 3d 46 u=1e0,.eta=1e-2,.sigma=1,.bias=F
a8c0 61 6c 73 65 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 alse,.max_iter=10,.verbose=True)
a8e0 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c \not_mapping_gaussian.fit(Xs=Xs,
a900 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 58 31 74 6e 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 .Xt=Xt)\n\nX1tn.=.ot_mapping_gau
a920 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 20 20 23 20 75 73 65 20 74 68 ssian.transform(Xs=X1)..#.use.th
a940 65 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 e.estimated.mapping\nImage_mappi
a960 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 6e ng_gaussian.=.minmax(mat2im(X1tn
a980 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f ,.I1.shape))".......],........"o
a9a0 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 utputs":.[],........"metadata":.
a9c0 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 {........."collapsed":.false....
a9e0 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 ...}.....},......{......."source
aa00 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 6f 74 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 69 6d 61 67 ":.[........."plot.original.imag
aa20 65 73 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 es\n############################
aa40 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
aa60 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 #################\n\n".......],.
aa80 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 ......."cell_type":."markdown",.
aaa0 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 ......."metadata":.{}.....},....
aac0 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c ..{......."execution_count":.nul
aae0 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a l,........"cell_type":."code",..
ab00 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 ......"source":.[........."pl.fi
ab20 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 gure(1,.figsize=(6.4,.3))\npl.su
ab40 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 70 bplot(1,.2,.1)\npl.imshow(I1)\np
ab60 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 l.axis('off')\npl.title('Image.1
ab80 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d ')\n\npl.subplot(1,.2,.2)\npl.im
aba0 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 show(I2)\npl.axis('off')\npl.tit
abc0 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 le('Image.2')\npl.tight_layout()
abe0 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c ".......],........"outputs":.[],
ac00 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 ........"metadata":.{........."c
ac20 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 ollapsed":.false.......}.....},.
ac40 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 .....{......."source":.[........
ac60 20 22 70 6c 6f 74 20 70 69 78 65 6c 20 76 61 6c 75 65 73 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e ."plot.pixel.values.distribution
ac80 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 \n##############################
aca0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
acc0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 ###############\n\n".......],...
ace0 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 ....."cell_type":."markdown",...
ad00 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 ....."metadata":.{}.....},......
ad20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c {......."execution_count":.null,
ad40 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 ........"cell_type":."code",....
ad60 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 ...."source":.[........."pl.figu
ad80 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 35 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 re(2,.figsize=(6.4,.5))\n\npl.su
ada0 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c bplot(1,.2,.1)\npl.scatter(Xs[:,
adc0 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 73 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 .0],.Xs[:,.2],.c=Xs)\npl.axis([0
ade0 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 ,.1,.0,.1])\npl.xlabel('Red')\np
ae00 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 l.ylabel('Blue')\npl.title('Imag
ae20 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c e.1')\n\npl.subplot(1,.2,.2)\npl
ae40 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 .scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.2],.c=X
ae60 74 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c t)\npl.axis([0,.1,.0,.1])\npl.xl
ae80 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e abel('Red')\npl.ylabel('Blue')\n
aea0 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 pl.title('Image.2')\npl.tight_la
aec0 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 yout()".......],........"outputs
aee0 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 ":.[],........"metadata":.{.....
af00 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 ...."collapsed":.false.......}..
af20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 ...},......{......."source":.[..
af40 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 65 64 20 69 6d 61 67 65 73 5c ......."plot.transformed.images\
af60 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 n###############################
af80 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
afa0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 ##############\n\n".......],....
afc0 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 ...."cell_type":."markdown",....
afe0 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b ...."metadata":.{}.....},......{
b000 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 ......."execution_count":.null,.
b020 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 ......."cell_type":."code",.....
b040 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 ..."source":.[........."pl.figur
b060 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 35 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 e(2,.figsize=(10,.5))\n\npl.subp
b080 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 70 6c 2e lot(2,.3,.1)\npl.imshow(I1)\npl.
b0a0 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 27 29 5c 6e axis('off')\npl.title('Im..1')\n
b0c0 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 \npl.subplot(2,.3,.4)\npl.imshow
b0e0 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 (I2)\npl.axis('off')\npl.title('
b100 49 6d 2e 20 32 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e Im..2')\n\npl.subplot(2,.3,.2)\n
b120 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 67 65 5f 65 6d 64 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f pl.imshow(Image_emd)\npl.axis('o
b140 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e ff')\npl.title('EmdTransport')\n
b160 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 \npl.subplot(2,.3,.5)\npl.imshow
b180 28 49 6d 61 67 65 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 (Image_sinkhorn)\npl.axis('off')
b1a0 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c \npl.title('SinkhornTransport')\
b1c0 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f n\npl.subplot(2,.3,.3)\npl.imsho
b1e0 77 28 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 w(Image_mapping_linear)\npl.axis
b200 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 ('off')\npl.title('MappingTransp
b220 6f 72 74 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 ort.(linear)')\n\npl.subplot(2,.
b240 33 2c 20 36 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 3,.6)\npl.imshow(Image_mapping_g
b260 61 75 73 73 69 61 6e 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 aussian)\npl.axis('off')\npl.tit
b280 6c 65 28 27 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 28 67 61 75 73 73 69 61 6e 29 27 le('MappingTransport.(gaussian)'
b2a0 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 )\npl.tight_layout()\n\npl.show(
b2c0 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d )".......],........"outputs":.[]
b2e0 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 ,........"metadata":.{........."
b300 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a collapsed":.false.......}.....}.
b320 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 ..],...."metadata":.{....."kerne
b340 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 lspec":.{......."display_name":.
b360 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 "Python.2",........"name":."pyth
b380 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e on2",........"language":."python
b3a0 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b ".....},......"language_info":.{
b3c0 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f ......."mimetype":."text/x-pytho
b3e0 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a n",........"nbconvert_exporter":
b400 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f ."python",........"name":."pytho
b420 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 n",........"file_extension":.".p
b440 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 y",........"version":."2.7.12",.
b460 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f ......."pygments_lexer":."ipytho
b480 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b n2",........"codemirror_mode":.{
b4a0 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 ........."version":.2,..........
b4c0 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a "name":."ipython".......}.....}.
b4e0 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 6a 7b 82 49 bb fd 13 71 39 0a 00 00 39 0a 00 00 2b ..}.}PK........j{.I...q9...9...+
b500 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 64 65 6d 6f 5f 4f 54 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 ...auto_examples/demo_OT_2D_samp
b520 6c 65 73 6c 61 72 67 65 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f leslarge.ipynb{..."nbformat_mino
b540 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c r":.0,...."nbformat":.4,...."cel
b560 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f ls":.[.....{......."execution_co
b580 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 unt":.null,........"cell_type":.
b5a0 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 "code",........"source":.[......
b5c0 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c ..."%matplotlib.inline".......],
b5e0 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d ........"outputs":.[],........"m
b600 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a etadata":.{........."collapsed":
b620 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 .false.......}.....},......{....
b640 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 44 65 6d 6f 20 66 ..."source":.[........."\nDemo.f
b660 6f 72 20 32 44 20 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 or.2D.Optimal.transport.between.
b680 65 6d 70 69 72 69 63 61 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 40 61 75 74 68 empirical.distributions\n\n@auth
b6a0 6f 72 3a 20 72 66 6c 61 6d 61 72 79 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 or:.rflamary\n\n".......],......
b6c0 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 .."cell_type":."markdown",......
b6e0 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 .."metadata":.{}.....},......{..
b700 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 ....."execution_count":.null,...
b720 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ....."cell_type":."code",.......
b740 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d ."source":.[........."import.num
b760 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 py.as.np\nimport.matplotlib.pyla
b780 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 b.as.pl\nimport.ot\n\n#%%.parame
b7a0 74 65 72 73 20 61 6e 64 20 64 61 74 61 20 67 65 6e 65 72 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 6e 3d 35 30 ters.and.data.generation\n\nn=50
b7c0 30 30 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 6d 75 5f 73 3d 6e 70 2e 61 72 72 61 79 00.#.nb.samples\n\nmu_s=np.array
b7e0 28 5b 30 2c 30 5d 29 5c 6e 63 6f 76 5f 73 3d 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 5b 31 2c 30 5d 2c 5b ([0,0])\ncov_s=np.array([[1,0],[
b800 30 2c 31 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 6d 75 5f 74 3d 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 34 2c 34 5d 29 5c 6e 0,1]])\n\nmu_t=np.array([4,4])\n
b820 63 6f 76 5f 74 3d 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 5b 31 2c 2d 2e 38 5d 2c 5b 2d 2e 38 2c 31 5d 5d cov_t=np.array([[1,-.8],[-.8,1]]
b840 29 5c 6e 5c 6e 78 73 3d 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c )\n\nxs=ot.datasets.get_2D_sampl
b860 65 73 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 6d 75 5f 73 2c 63 6f 76 5f 73 29 5c 6e 78 74 3d 6f 74 2e 64 61 es_gauss(n,mu_s,cov_s)\nxt=ot.da
b880 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 6d 75 tasets.get_2D_samples_gauss(n,mu
b8a0 5f 74 2c 63 6f 76 5f 74 29 5c 6e 5c 6e 61 2c 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 2c 6f 74 _t,cov_t)\n\na,b.=.ot.unif(n),ot
b8c0 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 20 23 20 75 6e 69 66 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 .unif(n).#.uniform.distribution.
b8e0 6f 6e 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 3d 6f on.samples\n\n#.loss.matrix\nM=o
b900 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 78 74 29 5c 6e 4d 2f 3d 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 t.dist(xs,xt)\nM/=M.max()\n\n#%%
b920 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 23 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 5c 6e .plot.samples\n\n#pl.figure(1)\n
b940 23 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 27 2b 62 27 2c 6c 61 #pl.plot(xs[:,0],xs[:,1],'+b',la
b960 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 23 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 bel='Source.samples')\n#pl.plot(
b980 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 27 78 72 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 xt[:,0],xt[:,1],'xr',label='Targ
b9a0 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 23 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c et.samples')\n#pl.legend(loc=0)\
b9c0 6e 23 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 72 61 67 65 74 20 64 69 n#pl.title('Source.and.traget.di
b9e0 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 23 5c 6e 23 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c stributions')\n#\n#pl.figure(2)\
ba00 6e 23 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 n#pl.imshow(M,interpolation='nea
ba20 72 65 73 74 27 29 5c 6e 23 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 4d rest')\n#pl.title('Cost.matrix.M
ba40 27 29 5c 6e 23 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e 5c 6e 47 30 3d 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c ')\n#\n\n#%%.EMD\n\nG0=ot.emd(a,
ba60 62 2c 4d 29 5c 6e 5c 6e 23 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 5c 6e 23 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f b,M)\n\n#pl.figure(3)\n#pl.imsho
ba80 77 28 47 30 2c 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 23 w(G0,interpolation='nearest')\n#
baa0 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 30 27 29 5c 6e 23 5c 6e 23 70 6c pl.title('OT.matrix.G0')\n#\n#pl
bac0 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 29 5c 6e 23 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 .figure(4)\n#ot.plot.plot2D_samp
bae0 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 78 74 2c 47 30 2c 63 3d 5b 2e 35 2c 2e 35 2c 31 5d 29 5c 6e 23 les_mat(xs,xt,G0,c=[.5,.5,1])\n#
bb00 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 27 2b 62 27 2c 6c 61 62 pl.plot(xs[:,0],xs[:,1],'+b',lab
bb20 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 23 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 el='Source.samples')\n#pl.plot(x
bb40 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 27 78 72 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 t[:,0],xt[:,1],'xr',label='Targe
bb60 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 23 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e t.samples')\n#pl.legend(loc=0)\n
bb80 23 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 77 69 74 68 20 73 61 6d 70 6c 65 #pl.title('OT.matrix.with.sample
bba0 73 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 72 65 67 20 74 s')\n\n\n#%%.sinkhorn\n\n#.reg.t
bbc0 65 72 6d 5c 6e 6c 61 6d 62 64 3d 35 65 2d 33 5c 6e 5c 6e 47 73 3d 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 erm\nlambd=5e-3\n\nGs=ot.sinkhor
bbe0 6e 28 61 2c 62 2c 4d 2c 6c 61 6d 62 64 29 5c 6e 5c 6e 23 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 29 5c n(a,b,M,lambd)\n\n#pl.figure(5)\
bc00 6e 23 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 73 2c 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 n#pl.imshow(Gs,interpolation='ne
bc20 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 23 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 73 69 arest')\n#pl.title('OT.matrix.si
bc40 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 23 5c 6e 23 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 36 29 5c 6e 23 6f 74 2e nkhorn')\n#\n#pl.figure(6)\n#ot.
bc60 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 78 74 2c 47 73 plot.plot2D_samples_mat(xs,xt,Gs
bc80 2c 63 6f 6c 6f 72 3d 5b 2e 35 2c 2e 35 2c 31 5d 29 5c 6e 23 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a ,color=[.5,.5,1])\n#pl.plot(xs[:
bca0 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 27 2b 62 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 ,0],xs[:,1],'+b',label='Source.s
bcc0 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 23 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c amples')\n#pl.plot(xt[:,0],xt[:,
bce0 31 5d 2c 27 78 72 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 1],'xr',label='Target.samples')\
bd00 6e 23 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 23 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f n#pl.legend(loc=0)\n#pl.title('O
bd20 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 77 69 74 68 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 T.matrix.Sinkhorn.with.samples')
bd40 5c 6e 23 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 \n#".......],........"outputs":.
bd60 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 [],........"metadata":.{........
bd80 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 ."collapsed":.false.......}.....
bda0 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 }...],...."metadata":.{....."ker
bdc0 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 nelspec":.{......."display_name"
bde0 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 :."Python.2",........"name":."py
be00 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 thon2",........"language":."pyth
be20 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a on".....},......"language_info":
be40 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 .{......."mimetype":."text/x-pyt
be60 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 hon",........"nbconvert_exporter
be80 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 ":."python",........"name":."pyt
bea0 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 hon",........"file_extension":."
bec0 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 .py",........"version":."2.7.12"
bee0 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 ,........"pygments_lexer":."ipyt
bf00 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a hon2",........"codemirror_mode":
bf20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 .{........."version":.2,........
bf40 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 .."name":."ipython".......}.....
bf60 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 f6 83 1e 4b 31 52 a0 2f b3 0f 00 00 b3 0f 00 }...}.}PK...........K1R./.......
bf80 00 24 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 4c 31 5f 76 73 .$...auto_examples/plot_OT_L1_vs
bfa0 5f 4c 32 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 _L2.ipynb{..."nbformat_minor":.0
bfc0 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 ,...."nbformat":.4,...."cells":.
bfe0 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a [.....{......."execution_count":
c000 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 .null,........"cell_type":."code
c020 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 ",........"source":.[........."%
c040 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 matplotlib.inline".......],.....
c060 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 ..."outputs":.[],........"metada
c080 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 ta":.{........."collapsed":.fals
c0a0 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 e.......}.....},......{......."s
c0c0 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 32 44 20 4f 70 74 69 6d 61 ource":.[........."\n#.2D.Optima
c0e0 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 66 6f 72 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 72 69 63 l.transport.for.different.metric
c100 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 53 74 6f 6c 65 20 74 68 65 20 66 69 67 75 72 65 20 69 64 65 61 20 66 72 6f s\n\n\nStole.the.figure.idea.fro
c120 6d 20 46 69 67 2e 20 31 20 61 6e 64 20 32 20 69 6e 5c 6e 68 74 74 70 73 3a 2f 2f 61 72 78 69 76 m.Fig..1.and.2.in\nhttps://arxiv
c140 2e 6f 72 67 2f 70 64 66 2f 31 37 30 36 2e 30 37 36 35 30 2e 70 64 66 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 .org/pdf/1706.07650.pdf\n\n\n\n"
c160 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d .......],........"cell_type":."m
c180 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a arkdown",........"metadata":.{}.
c1a0 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 ....},......{......."execution_c
c1c0 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a ount":.null,........"cell_type":
c1e0 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 ."code",........"source":.[.....
c200 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d ...."#.Author:.Remi.Flamary.<rem
c220 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 i.flamary@unice.fr>\n#\n#.Licens
c240 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 e:.MIT.License\n\nimport.numpy.a
c260 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 s.np\nimport.matplotlib.pylab.as
c280 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 .pl\nimport.ot\n\n#%%.parameters
c2a0 20 61 6e 64 20 64 61 74 61 20 67 65 6e 65 72 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 66 6f 72 20 64 61 74 61 .and.data.generation\n\nfor.data
c2c0 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 69 66 20 64 61 74 61 3a 5c 6e 20 .in.range(2):\n\n....if.data:\n.
c2e0 20 20 20 20 20 20 20 6e 20 3d 20 32 30 20 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 20 20 20 .......n.=.20..#.nb.samples\n...
c300 20 20 20 20 20 78 73 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 32 29 29 5c 6e 20 20 20 20 .....xs.=.np.zeros((n,.2))\n....
c320 20 20 20 20 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2b 20 31 5c ....xs[:,.0].=.np.arange(n).+.1\
c340 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e n........xs[:,.1].=.(np.arange(n
c360 29 20 2b 20 31 29 20 2a 20 2d 30 2e 30 30 31 20 20 23 20 74 6f 20 6d 61 6b 65 20 69 74 20 73 74 ).+.1).*.-0.001..#.to.make.it.st
c380 72 69 63 74 6c 79 20 63 6f 6e 76 65 78 2e 2e 2e 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 78 74 20 3d rictly.convex...\n\n........xt.=
c3a0 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 32 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 78 74 5b 3a 2c .np.zeros((n,.2))\n........xt[:,
c3c0 20 31 5d 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2b 20 31 5c 6e 20 20 20 20 65 6c 73 65 .1].=.np.arange(n).+.1\n....else
c3e0 3a 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 20 3d 20 35 30 20 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 :\n\n........n.=.50..#.nb.sample
c400 73 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 78 74 6f 74 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 20 2b 20 s\n........xtot.=.np.zeros((n.+.
c420 31 2c 20 32 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 78 74 6f 74 5b 3a 2c 20 30 5d 20 3d 20 6e 70 2e 1,.2))\n........xtot[:,.0].=.np.
c440 63 6f 73 28 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 20 2b cos(\n............(np.arange(n.+
c460 20 31 29 20 2b 20 31 2e 30 29 20 2a 20 30 2e 39 20 2f 20 28 6e 20 2b 20 32 29 20 2a 20 32 20 2a .1).+.1.0).*.0.9./.(n.+.2).*.2.*
c480 20 6e 70 2e 70 69 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 78 74 6f 74 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 6e 70 .np.pi)\n........xtot[:,.1].=.np
c4a0 2e 73 69 6e 28 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 20 .sin(\n............(np.arange(n.
c4c0 2b 20 31 29 20 2b 20 31 2e 30 29 20 2a 20 30 2e 39 20 2f 20 28 6e 20 2b 20 32 29 20 2a 20 32 20 +.1).+.1.0).*.0.9./.(n.+.2).*.2.
c4e0 2a 20 6e 70 2e 70 69 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 78 73 20 3d 20 78 74 6f 74 5b 3a 6e *.np.pi)\n\n........xs.=.xtot[:n
c500 2c 20 3a 5d 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 78 74 20 3d 20 78 74 6f 74 5b 31 3a 2c 20 3a 5d 5c 6e ,.:]\n........xt.=.xtot[1:,.:]\n
c520 5c 6e 20 20 20 20 61 2c 20 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 2c 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 \n....a,.b.=.ot.unif(n),.ot.unif
c540 28 6e 29 20 20 23 20 75 6e 69 66 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 (n)..#.uniform.distribution.on.s
c560 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 20 20 20 amples\n\n....#.loss.matrix\n...
c580 20 4d 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 .M1.=.ot.dist(xs,.xt,.metric='eu
c5a0 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 20 20 20 20 4d 31 20 2f 3d 20 4d 31 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c clidean')\n....M1./=.M1.max()\n\
c5c0 6e 20 20 20 20 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 20 20 20 20 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e n....#.loss.matrix\n....M2.=.ot.
c5e0 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e dist(xs,.xt,.metric='sqeuclidean
c600 27 29 5c 6e 20 20 20 20 4d 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 23 20 ')\n....M2./=.M2.max()\n\n....#.
c620 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 20 20 20 20 4d 70 20 3d 20 6e 70 2e 73 71 72 74 28 6f 74 loss.matrix\n....Mp.=.np.sqrt(ot
c640 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 .dist(xs,.xt,.metric='euclidean'
c660 29 29 5c 6e 20 20 20 20 4d 70 20 2f 3d 20 4d 70 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 23 25 ))\n....Mp./=.Mp.max()\n\n....#%
c680 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 %.plot.samples\n\n....pl.figure(
c6a0 31 20 2b 20 33 20 2a 20 64 61 74 61 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 20 1.+.3.*.data,.figsize=(7,.3))\n.
c6c0 20 20 20 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 ...pl.clf()\n....pl.plot(xs[:,.0
c6e0 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 ],.xs[:,.1],.'+b',.label='Source
c700 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d .samples')\n....pl.plot(xt[:,.0]
c720 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 ,.xt[:,.1],.'xr',.label='Target.
c740 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c samples')\n....pl.axis('equal')\
c760 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 72 61 67 65 74 n....pl.title('Source.and.traget
c780 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 66 69 67 75 72 .distributions')\n\n....pl.figur
c7a0 65 28 32 20 2b 20 33 20 2a 20 64 61 74 61 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c e(2.+.3.*.data,.figsize=(7,.3))\
c7c0 6e 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 20 20 20 20 n\n....pl.subplot(1,.3,.1)\n....
c7e0 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 31 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 pl.imshow(M1,.interpolation='nea
c800 72 65 73 74 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 rest')\n....pl.title('Euclidean.
c820 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 cost')\n\n....pl.subplot(1,.3,.2
c840 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 32 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 )\n....pl.imshow(M2,.interpolati
c860 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 75 on='nearest')\n....pl.title('Squ
c880 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e ared.Euclidean.cost')\n\n....pl.
c8a0 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 subplot(1,.3,.3)\n....pl.imshow(
c8c0 4d 70 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 20 20 Mp,.interpolation='nearest')\n..
c8e0 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 ..pl.title('Sqrt.Euclidean.cost'
c900 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 )\n....pl.tight_layout()\n\n....
c920 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e 20 20 20 20 47 31 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d #%%.EMD\n....G1.=.ot.emd(a,.b,.M
c940 31 29 5c 6e 20 20 20 20 47 32 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 32 29 5c 6e 20 1)\n....G2.=.ot.emd(a,.b,.M2)\n.
c960 20 20 20 47 70 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 70 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 ...Gp.=.ot.emd(a,.b,.Mp)\n\n....
c980 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 20 2b 20 33 20 2a 20 64 61 74 61 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d pl.figure(3.+.3.*.data,.figsize=
c9a0 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 (7,.3))\n\n....pl.subplot(1,.3,.
c9c0 31 29 5c 6e 20 20 20 20 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 1)\n....ot.plot.plot2D_samples_m
c9e0 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 31 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 20 at(xs,.xt,.G1,.c=[.5,..5,.1])\n.
ca00 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 ...pl.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'
ca20 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 20 20 +b',.label='Source.samples')\n..
ca40 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 ..pl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'x
ca60 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 20 20 20 r',.label='Target.samples')\n...
ca80 20 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 20 20 20 20 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 .pl.axis('equal')\n....#.pl.lege
caa0 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 45 75 63 6c nd(loc=0)\n....pl.title('OT.Eucl
cac0 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 idean')\n\n....pl.subplot(1,.3,.
cae0 32 29 5c 6e 20 20 20 20 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 2)\n....ot.plot.plot2D_samples_m
cb00 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 32 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 20 at(xs,.xt,.G2,.c=[.5,..5,.1])\n.
cb20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 ...pl.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'
cb40 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 20 20 +b',.label='Source.samples')\n..
cb60 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 ..pl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'x
cb80 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 20 20 20 r',.label='Target.samples')\n...
cba0 20 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 20 20 20 20 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 .pl.axis('equal')\n....#.pl.lege
cbc0 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 75 61 nd(loc=0)\n....pl.title('OT.squa
cbe0 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f red.Euclidean')\n\n....pl.subplo
cc00 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 20 20 20 20 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 t(1,.3,.3)\n....ot.plot.plot2D_s
cc20 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 70 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 amples_mat(xs,.xt,.Gp,.c=[.5,..5
cc40 2c 20 31 5d 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b ,.1])\n....pl.plot(xs[:,.0],.xs[
cc60 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c :,.1],.'+b',.label='Source.sampl
cc80 65 73 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a es')\n....pl.plot(xt[:,.0],.xt[:
cca0 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 ,.1],.'xr',.label='Target.sample
ccc0 73 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 20 20 20 20 23 s')\n....pl.axis('equal')\n....#
cce0 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 .pl.legend(loc=0)\n....pl.title(
cd00 27 4f 54 20 73 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 67 'OT.sqrt.Euclidean')\n....pl.tig
cd20 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 ht_layout()\n\npl.show()".......
cd40 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 ],........"outputs":.[],........
cd60 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 "metadata":.{........."collapsed
cd80 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 ":.false.......}.....}...],...."
cda0 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b metadata":.{....."kernelspec":.{
cdc0 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 ......."display_name":."Python.2
cde0 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 ",........"name":."python2",....
ce00 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 ...."language":."python".....},.
ce20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d ....."language_info":.{......."m
ce40 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 imetype":."text/x-python",......
ce60 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 .."nbconvert_exporter":."python"
ce80 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 ,........"name":."python",......
cea0 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 .."file_extension":.".py",......
cec0 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 .."version":."2.7.12",........"p
cee0 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 ygments_lexer":."ipython2",.....
cf00 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 ..."codemirror_mode":.{.........
cf20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 "version":.2,.........."name":."
cf40 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 ipython".......}.....}...}.}PK..
cf60 14 00 00 00 00 00 a7 85 1e 4b 1c bf a6 e3 bf 0a 00 00 bf 0a 00 00 26 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 .........K............&...auto_e
cf80 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2e 69 70 79 6e 62 xamples/plot_OT_2D_samples.ipynb
cfa0 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 {..."nbformat_minor":.0,...."nbf
cfc0 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 ormat":.4,...."cells":.[.....{..
cfe0 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 ....."execution_count":.null,...
d000 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ....."cell_type":."code",.......
d020 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 ."source":.[........."%matplotli
d040 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 b.inline".......],........"outpu
d060 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 ts":.[],........"metadata":.{...
d080 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d ......"collapsed":.false.......}
d0a0 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b .....},......{......."source":.[
d0c0 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 32 44 20 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f ........."\n#.2D.Optimal.transpo
d0e0 72 74 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 65 6d 70 69 72 69 63 61 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f rt.between.empirical.distributio
d100 6e 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c ns\n\n\n\n".......],........"cel
d120 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 l_type":."markdown",........"met
d140 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 adata":.{}.....},......{......."
d160 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 execution_count":.null,........"
d180 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 cell_type":."code",........"sour
d1a0 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 ce":.[........."#.Author:.Remi.F
d1c0 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e lamary.<remi.flamary@unice.fr>\n
d1e0 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 #\n#.License:.MIT.License\n\nimp
d200 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c ort.numpy.as.np\nimport.matplotl
d220 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 5c 6e 23 25 25 ib.pylab.as.pl\nimport.ot\n\n#%%
d240 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 20 61 6e 64 20 64 61 74 61 20 67 65 6e 65 72 61 74 69 6f 6e 5c .parameters.and.data.generation\
d260 6e 5c 6e 6e 20 3d 20 35 30 20 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 6d 75 5f 73 20 n\nn.=.50..#.nb.samples\n\nmu_s.
d280 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 30 2c 20 30 5d 29 5c 6e 63 6f 76 5f 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 =.np.array([0,.0])\ncov_s.=.np.a
d2a0 72 72 61 79 28 5b 5b 31 2c 20 30 5d 2c 20 5b 30 2c 20 31 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 6d 75 5f 74 20 3d rray([[1,.0],.[0,.1]])\n\nmu_t.=
d2c0 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 34 2c 20 34 5d 29 5c 6e 63 6f 76 5f 74 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 .np.array([4,.4])\ncov_t.=.np.ar
d2e0 72 61 79 28 5b 5b 31 2c 20 2d 2e 38 5d 2c 20 5b 2d 2e 38 2c 20 31 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 78 73 20 ray([[1,.-.8],.[-.8,.1]])\n\nxs.
d300 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 67 61 75 =.ot.datasets.get_2D_samples_gau
d320 73 73 28 6e 2c 20 6d 75 5f 73 2c 20 63 6f 76 5f 73 29 5c 6e 78 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 ss(n,.mu_s,.cov_s)\nxt.=.ot.data
d340 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 75 5f sets.get_2D_samples_gauss(n,.mu_
d360 74 2c 20 63 6f 76 5f 74 29 5c 6e 5c 6e 61 2c 20 62 20 3d 20 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 28 6e 2c 29 t,.cov_t)\n\na,.b.=.np.ones((n,)
d380 29 20 2f 20 6e 2c 20 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 28 6e 2c 29 29 20 2f 20 6e 20 20 23 20 75 6e 69 66 )./.n,.np.ones((n,))./.n..#.unif
d3a0 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 23 orm.distribution.on.samples\n\n#
d3c0 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 .loss.matrix\nM.=.ot.dist(xs,.xt
d3e0 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 )\nM./=.M.max()\n\n#%%.plot.samp
d400 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b les\n\npl.figure(1)\npl.plot(xs[
d420 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f :,.0],.xs[:,.1],.'+b',.label='So
d440 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d urce.samples')\npl.plot(xt[:,.0]
d460 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 ,.xt[:,.1],.'xr',.label='Target.
d480 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e samples')\npl.legend(loc=0)\npl.
d4a0 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 title('Source.and.target.distrib
d4c0 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 utions')\n\npl.figure(2)\npl.ims
d4e0 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c how(M,.interpolation='nearest')\
d500 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 4d 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e npl.title('Cost.matrix.M')\n\n\n
d520 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e 5c 6e 47 30 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 29 5c #%%.EMD\n\nG0.=.ot.emd(a,.b,.M)\
d540 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 30 2c 20 69 n\npl.figure(3)\npl.imshow(G0,.i
d560 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c nterpolation='nearest')\npl.titl
d580 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 30 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 e('OT.matrix.G0')\n\npl.figure(4
d5a0 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 )\not.plot.plot2D_samples_mat(xs
d5c0 2c 20 78 74 2c 20 47 30 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f ,.xt,.G0,.c=[.5,..5,.1])\npl.plo
d5e0 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 t(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+b',.labe
d600 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b l='Source.samples')\npl.plot(xt[
d620 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 :,.0],.xt[:,.1],.'xr',.label='Ta
d640 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 rget.samples')\npl.legend(loc=0)
d660 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 77 69 74 68 20 73 61 6d 70 6c \npl.title('OT.matrix.with.sampl
d680 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 72 65 67 20 es')\n\n\n#%%.sinkhorn\n\n#.reg.
d6a0 74 65 72 6d 5c 6e 6c 61 6d 62 64 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 5c 6e 47 73 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 term\nlambd.=.1e-3\n\nGs.=.ot.si
d6c0 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 6c 61 6d 62 64 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 nkhorn(a,.b,.M,.lambd)\n\npl.fig
d6e0 75 72 65 28 35 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 73 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 ure(5)\npl.imshow(Gs,.interpolat
d700 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 ion='nearest')\npl.title('OT.mat
d720 72 69 78 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 36 29 5c 6e rix.sinkhorn')\n\npl.figure(6)\n
d740 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 ot.plot.plot2D_samples_mat(xs,.x
d760 74 2c 20 47 73 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c t,.Gs,.color=[.5,..5,.1])\npl.pl
d780 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 ot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+b',.lab
d7a0 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 el='Source.samples')\npl.plot(xt
d7c0 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 [:,.0],.xt[:,.1],.'xr',.label='T
d7e0 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 arget.samples')\npl.legend(loc=0
d800 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 )\npl.title('OT.matrix.Sinkhorn.
d820 77 69 74 68 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 with.samples')\n\npl.show()"....
d840 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 ...],........"outputs":.[],.....
d860 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 ..."metadata":.{........."collap
d880 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a sed":.false.......}.....}...],..
d8a0 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 .."metadata":.{....."kernelspec"
d8c0 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f :.{......."display_name":."Pytho
d8e0 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 n.2",........"name":."python2",.
d900 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 ......."language":."python".....
d920 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 },......"language_info":.{......
d940 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 ."mimetype":."text/x-python",...
d960 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 ....."nbconvert_exporter":."pyth
d980 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 on",........"name":."python",...
d9a0 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 ....."file_extension":.".py",...
d9c0 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ....."version":."2.7.12",.......
d9e0 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a ."pygments_lexer":."ipython2",..
da00 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 ......"codemirror_mode":.{......
da20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 ..."version":.2,.........."name"
da40 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 :."ipython".......}.....}...}.}P
da60 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 75 7b 82 49 55 d4 67 d2 3c 0e 00 00 3c 0e 00 00 20 00 00 00 61 75 74 K........u{.IU.g.<...<.......aut
da80 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 32 44 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 o_examples/plot_OTDA_2D.ipynb{..
daa0 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d ."nbformat_minor":.0,...."nbform
dac0 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 at":.4,...."cells":.[.....{.....
dae0 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 .."execution_count":.null,......
db00 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 .."cell_type":."code",........"s
db20 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 ource":.[........."%matplotlib.i
db40 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 nline".......],........"outputs"
db60 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 :.[],........"metadata":.{......
db80 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 ..."collapsed":.false.......}...
dba0 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 ..},......{......."source":.[...
dbc0 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 4f 54 20 66 6f 72 20 65 6d 70 69 72 69 63 61 6c 20 64 69 73 74 ......"\n#.OT.for.empirical.dist
dbe0 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 ributions\n\n\n\n".......],.....
dc00 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 ..."cell_type":."markdown",.....
dc20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a ..."metadata":.{}.....},......{.
dc40 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a ......"execution_count":.null,..
dc60 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 ......"cell_type":."code",......
dc80 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 .."source":.[........."import.nu
dca0 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c mpy.as.np\nimport.matplotlib.pyl
dcc0 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 ab.as.pl\nimport.ot\n\n\n\n#%%.p
dce0 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 3d 31 35 30 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e 73 5c 6e 5c 6e arameters\n\nn=150.#.nb.bins\n\n
dd00 78 73 2c 79 73 3d 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 xs,ys=ot.datasets.get_data_class
dd20 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 27 2c 6e 29 5c 6e 78 74 2c 79 74 3d 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 if('3gauss',n)\nxt,yt=ot.dataset
dd40 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 32 27 2c 6e 29 5c s.get_data_classif('3gauss2',n)\
dd60 6e 5c 6e 61 2c 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 2c 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 5c 6e n\na,b.=.ot.unif(n),ot.unif(n)\n
dd80 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 3d 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 78 74 29 5c #.loss.matrix\nM=ot.dist(xs,xt)\
dda0 6e 23 4d 2f 3d 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 n#M/=M.max()\n\n#%%.plot.samples
ddc0 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 \n\npl.figure(1)\n\npl.subplot(2
dde0 2c 32 2c 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 ,2,1)\npl.scatter(xs[:,0],xs[:,1
de00 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 ],c=ys,marker='+',label='Source.
de20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e samples')\npl.legend(loc=0)\npl.
de40 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e title('Source..distributions')\n
de60 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 \npl.subplot(2,2,2)\npl.scatter(
de80 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c xt[:,0],xt[:,1],c=yt,marker='o',
dea0 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 label='Target.samples')\npl.lege
dec0 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 74 61 72 67 65 74 20 20 64 69 73 nd(loc=0)\npl.title('target..dis
dee0 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c tributions')\n\npl.figure(2)\npl
df00 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 .imshow(M,interpolation='nearest
df20 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 4d 27 29 5c 6e 5c ')\npl.title('Cost.matrix.M')\n\
df40 6e 5c 6e 23 25 25 20 4f 54 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 45 4d 44 5c 6e 47 n\n#%%.OT.estimation\n\n#.EMD\nG
df60 30 3d 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 62 2c 4d 29 5c 6e 5c 6e 23 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 6c 0=ot.emd(a,b,M)\n\n#.sinkhorn\nl
df80 61 6d 62 64 3d 31 65 2d 31 5c 6e 47 73 3d 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c 62 2c 4d 2c ambd=1e-1\nGs=ot.sinkhorn(a,b,M,
dfa0 6c 61 6d 62 64 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 lambd)\n\n\n#.Group.lasso.regula
dfc0 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 72 65 67 3d 31 65 2d 31 5c 6e 65 74 61 3d 31 65 30 5c 6e 47 67 3d rization\nreg=1e-1\neta=1e0\nGg=
dfe0 6f 74 2e 64 61 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 6c 70 6c 31 5f 6d 6d 28 61 2c 79 73 2e 61 73 74 79 ot.da.sinkhorn_lpl1_mm(a,ys.asty
e000 70 65 28 6e 70 2e 69 6e 74 29 2c 62 2c 4d 2c 72 65 67 2c 65 74 61 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 pe(np.int),b,M,reg,eta)\n\n\n#%%
e020 20 76 69 73 75 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 5c 6e .visu.matrices\n\npl.figure(3)\n
e040 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 \npl.subplot(2,3,1)\npl.imshow(G
e060 30 2c 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 0,interpolation='nearest')\npl.t
e080 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 itle('OT.matrix.')\n\npl.subplot
e0a0 28 32 2c 33 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 73 2c 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 (2,3,2)\npl.imshow(Gs,interpolat
e0c0 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 ion='nearest')\npl.title('OT.mat
e0e0 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 rix.Sinkhorn')\n\npl.subplot(2,3
e100 2c 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 67 2c 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d ,3)\npl.imshow(Gg,interpolation=
e120 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 'nearest')\npl.title('OT.matrix.
e140 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c Group.lasso')\n\npl.subplot(2,3,
e160 34 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 4)\not.plot.plot2D_samples_mat(x
e180 73 2c 78 74 2c 47 30 2c 63 3d 5b 2e 35 2c 2e 35 2c 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 s,xt,G0,c=[.5,.5,1])\npl.scatter
e1a0 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 (xs[:,0],xs[:,1],c=ys,marker='+'
e1c0 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 ,label='Source.samples')\npl.sca
e1e0 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 tter(xt[:,0],xt[:,1],c=yt,marker
e200 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e ='o',label='Target.samples')\n\n
e220 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 35 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f \npl.subplot(2,3,5)\not.plot.plo
e240 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 78 74 2c 47 73 2c 63 3d 5b 2e 35 2c 2e t2D_samples_mat(xs,xt,Gs,c=[.5,.
e260 35 2c 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5,1])\npl.scatter(xs[:,0],xs[:,1
e280 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 ],c=ys,marker='+',label='Source.
e2a0 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 samples')\npl.scatter(xt[:,0],xt
e2c0 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 [:,1],c=yt,marker='o',label='Tar
e2e0 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c get.samples')\n\npl.subplot(2,3,
e300 36 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 6)\not.plot.plot2D_samples_mat(x
e320 73 2c 78 74 2c 47 67 2c 63 3d 5b 2e 35 2c 2e 35 2c 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 s,xt,Gg,c=[.5,.5,1])\npl.scatter
e340 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 (xs[:,0],xs[:,1],c=ys,marker='+'
e360 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 ,label='Source.samples')\npl.sca
e380 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 tter(xt[:,0],xt[:,1],c=yt,marker
e3a0 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e ='o',label='Target.samples')\n\n
e3c0 23 25 25 20 73 61 6d 70 6c 65 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 78 73 74 30 #%%.sample.interpolation\n\nxst0
e3e0 3d 6e 2a 47 30 2e 64 6f 74 28 78 74 29 5c 6e 78 73 74 73 3d 6e 2a 47 73 2e 64 6f 74 28 78 74 29 =n*G0.dot(xt)\nxsts=n*Gs.dot(xt)
e400 5c 6e 78 73 74 67 3d 6e 2a 47 67 2e 64 6f 74 28 78 74 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 \nxstg=n*Gg.dot(xt)\n\npl.figure
e420 28 34 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 31 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 (4)\npl.subplot(2,3,1)\n\n\npl.s
e440 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b catter(xt[:,0],xt[:,1],c=yt,mark
e460 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c er='o',label='Target.samples',al
e480 70 68 61 3d 30 2e 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 30 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 pha=0.5)\npl.scatter(xst0[:,0],x
e4a0 73 74 30 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 st0[:,1],c=ys,marker='+',label='
e4c0 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 Transp.samples',s=30)\npl.title(
e4e0 27 49 6e 74 65 72 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 'Interp.samples')\npl.legend(loc
e500 3d 30 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 32 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c =0)\n\npl.subplot(2,3,2)\n\n\npl
e520 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 .scatter(xt[:,0],xt[:,1],c=yt,ma
e540 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c rker='o',label='Target.samples',
e560 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 73 5b 3a 2c 30 5d alpha=0.5)\npl.scatter(xsts[:,0]
e580 2c 78 73 74 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c ,xsts[:,1],c=ys,marker='+',label
e5a0 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c ='Transp.samples',s=30)\npl.titl
e5c0 65 28 27 49 6e 74 65 72 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 5c 6e e('Interp.samples.Sinkhorn')\n\n
e5e0 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 33 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 pl.subplot(2,3,3)\n\npl.scatter(
e600 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c xt[:,0],xt[:,1],c=yt,marker='o',
e620 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 label='Target.samples',alpha=0.5
e640 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 67 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 67 5b 3a 2c 31 )\npl.scatter(xstg[:,0],xstg[:,1
e660 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 ],c=ys,marker='+',label='Transp.
e680 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6e 74 65 72 70 samples',s=30)\npl.title('Interp
e6a0 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 47 72 6f 75 70 6c 61 73 73 6f 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 .samples.Grouplasso')".......],.
e6c0 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 ......."outputs":.[],........"me
e6e0 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 tadata":.{........."collapsed":.
e700 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 false.......}.....}...],...."met
e720 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 adata":.{....."kernelspec":.{...
e740 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 ...."display_name":."Python.2",.
e760 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ......."name":."python2",.......
e780 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 ."language":."python".....},....
e7a0 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 .."language_info":.{......."mime
e7c0 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 type":."text/x-python",........"
e7e0 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a nbconvert_exporter":."python",..
e800 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 ......"name":."python",........"
e820 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 file_extension":.".py",........"
e840 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d version":."2.7.12",........"pygm
e860 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 ents_lexer":."ipython2",........
e880 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 "codemirror_mode":.{........."ve
e8a0 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 rsion":.2,.........."name":."ipy
e8c0 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 thon".......}.....}...}.}PK.....
e8e0 00 00 00 b8 86 1e 4b 22 97 a9 c7 5d 18 00 00 5d 18 00 00 25 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d ......K"...]...]...%...auto_exam
e900 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 ples/plot_otda_mapping.ipynb{...
e920 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 "nbformat_minor":.0,...."nbforma
e940 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 t":.4,...."cells":.[.....{......
e960 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ."execution_count":.null,.......
e980 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f ."cell_type":."code",........"so
e9a0 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e urce":.[........."%matplotlib.in
e9c0 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a line".......],........"outputs":
e9e0 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 .[],........"metadata":.{.......
ea00 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 .."collapsed":.false.......}....
ea20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 .},......{......."source":.[....
ea40 20 20 20 20 20 22 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d ....."\n========================
ea60 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 4f 54 20 6d 61 70 70 =======================\nOT.mapp
ea80 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 ing.estimation.for.domain.adapta
eaa0 74 69 6f 6e 20 5b 38 5d 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d tion.[8]\n======================
eac0 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 5c 6e 54 68 69 =========================\n\nThi
eae0 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 70 72 65 73 65 6e 74 73 20 68 6f 77 20 74 6f 20 75 73 65 20 4d 61 s.example.presents.how.to.use.Ma
eb00 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 74 6f 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 20 61 74 20 74 68 ppingTransport.to.estimate.at.th
eb20 65 20 73 61 6d 65 5c 6e 74 69 6d 65 20 62 6f 74 68 20 74 68 65 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 74 e.same\ntime.both.the.coupling.t
eb40 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6e 64 20 61 70 70 72 6f 78 69 6d 61 74 65 20 74 68 65 20 74 72 61 ransport.and.approximate.the.tra
eb60 6e 73 70 6f 72 74 20 6d 61 70 20 77 69 74 68 20 65 69 74 68 65 72 5c 6e 61 20 6c 69 6e 65 61 72 nsport.map.with.either\na.linear
eb80 20 6f 72 20 61 20 6b 65 72 6e 65 6c 69 7a 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 61 73 20 69 6e 74 72 .or.a.kernelized.mapping.as.intr
eba0 6f 64 75 63 65 64 20 69 6e 20 5b 38 5d 5c 6e 5c 6e 5b 38 5d 20 4d 2e 20 50 65 72 72 6f 74 2c 20 oduced.in.[8]\n\n[8].M..Perrot,.
ebc0 4e 2e 20 43 6f 75 72 74 79 2c 20 52 2e 20 46 6c 61 6d 61 72 79 2c 20 41 2e 20 48 61 62 72 61 72 N..Courty,.R..Flamary,.A..Habrar
ebe0 64 2c 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 4d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 d,\n....\"Mapping.estimation.for
ec00 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 22 2c 5c 6e .discrete.optimal.transport\",\n
ec20 20 20 20 20 4e 65 75 72 61 6c 20 49 6e 66 6f 72 6d 61 74 69 6f 6e 20 50 72 6f 63 65 73 73 69 6e ....Neural.Information.Processin
ec40 67 20 53 79 73 74 65 6d 73 20 28 4e 49 50 53 29 2c 20 32 30 31 36 2e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 g.Systems.(NIPS),.2016.\n\n"....
ec60 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 ...],........"cell_type":."markd
ec80 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 own",........"metadata":.{}.....
eca0 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 },......{......."execution_count
ecc0 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f ":.null,........"cell_type":."co
ece0 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 de",........"source":.[.........
ed00 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 "#.Authors:.Remi.Flamary.<remi.f
ed20 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 lamary@unice.fr>\n#..........Sta
ed40 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 nislas.Chambon.<stan.chambon@gma
ed60 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e il.com>\n#\n#.License:.MIT.Licen
ed80 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 se\n\nimport.numpy.as.np\nimport
eda0 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 .matplotlib.pylab.as.pl\nimport.
edc0 6f 74 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b ot".......],........"outputs":.[
ede0 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 ],........"metadata":.{.........
ee00 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d "collapsed":.false.......}.....}
ee20 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 ,......{......."source":.[......
ee40 20 20 20 22 67 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ..."generate.data\n#############
ee60 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
ee80 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
eea0 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 \n\n".......],........"cell_type
eec0 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 ":."markdown",........"metadata"
eee0 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 :.{}.....},......{......."execut
ef00 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 ion_count":.null,........"cell_t
ef20 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b ype":."code",........"source":.[
ef40 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 31 30 30 ........."n_source_samples.=.100
ef60 5c 6e 6e 5f 74 61 72 67 65 74 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 31 30 30 5c 6e 74 68 65 74 61 20 \nn_target_samples.=.100\ntheta.
ef80 3d 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 20 2f 20 32 30 5c 6e 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 65 6c 20 3d 20 =.2.*.np.pi./.20\nnoise_level.=.
efa0 30 2e 31 5c 6e 5c 6e 58 73 2c 20 79 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 0.1\n\nXs,.ys.=.ot.datasets.get_
efc0 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 5c 6e 20 20 20 20 27 67 61 75 73 73 72 6f 74 27 2c 20 6e data_classif(\n....'gaussrot',.n
efe0 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 6e 7a 3d 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 65 6c 29 _source_samples,.nz=noise_level)
f000 5c 6e 58 73 5f 6e 65 77 2c 20 5f 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 \nXs_new,._.=.ot.datasets.get_da
f020 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 5c 6e 20 20 20 20 27 67 61 75 73 73 72 6f 74 27 2c 20 6e 5f 73 ta_classif(\n....'gaussrot',.n_s
f040 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 6e 7a 3d 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 65 6c 29 5c 6e ource_samples,.nz=noise_level)\n
f060 58 74 2c 20 79 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c Xt,.yt.=.ot.datasets.get_data_cl
f080 61 73 73 69 66 28 5c 6e 20 20 20 20 27 67 61 75 73 73 72 6f 74 27 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 assif(\n....'gaussrot',.n_target
f0a0 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 68 65 74 61 3d 74 68 65 74 61 2c 20 6e 7a 3d 6e 6f 69 73 65 5f _samples,.theta=theta,.nz=noise_
f0c0 6c 65 76 65 6c 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6f 6e 65 20 6f 66 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 6d 6f level)\n\n#.one.of.the.target.mo
f0e0 64 65 20 63 68 61 6e 67 65 73 20 69 74 73 20 76 61 72 69 61 6e 63 65 20 28 6e 6f 20 6c 69 6e 65 de.changes.its.variance.(no.line
f100 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 29 5c 6e 58 74 5b 79 74 20 3d 3d 20 32 5d 20 2a 3d 20 33 5c 6e 58 ar.mapping)\nXt[yt.==.2].*=.3\nX
f120 74 20 3d 20 58 74 20 2b 20 34 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 t.=.Xt.+.4".......],........"out
f140 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a puts":.[],........"metadata":.{.
f160 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 ........"collapsed":.false......
f180 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a .}.....},......{......."source":
f1a0 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 68 65 20 64 69 66 66 .[........."Instantiate.the.diff
f1c0 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 73 20 61 6e 64 20 66 erent.transport.algorithms.and.f
f1e0 69 74 20 74 68 65 6d 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 it.them\n#######################
f200 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
f220 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 ######################\n\n".....
f240 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f ..],........"cell_type":."markdo
f260 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d wn",........"metadata":.{}.....}
f280 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 ,......{......."execution_count"
f2a0 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 :.null,........"cell_type":."cod
f2c0 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 e",........"source":.[........."
f2e0 23 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6b #.MappingTransport.with.linear.k
f300 65 72 6e 65 6c 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 ernel\not_mapping_linear.=.ot.da
f320 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 5c 6e 20 20 20 20 6b 65 72 6e 65 6c 3d 5c .MappingTransport(\n....kernel=\
f340 22 6c 69 6e 65 61 72 5c 22 2c 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 38 2c 20 62 69 61 "linear\",.mu=1e0,.eta=1e-8,.bia
f360 73 3d 54 72 75 65 2c 5c 6e 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 s=True,\n....max_iter=20,.verbos
f380 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 66 69 74 e=True)\n\not_mapping_linear.fit
f3a0 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c (Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n#.for.original
f3c0 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 .source.samples,.transform.appli
f3e0 65 73 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 es.barycentric.mapping\ntransp_X
f400 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 s_linear.=.ot_mapping_linear.tra
f420 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 6f nsform(Xs=Xs)\n\n#.for.out.of.so
f440 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 urce.samples,.transform.applies.
f460 74 68 65 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 the.linear.mapping\ntransp_Xs_li
f480 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 near_new.=.ot_mapping_linear.tra
f4a0 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 77 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 4d 61 70 70 69 6e 67 nsform(Xs=Xs_new)\n\n\n#.Mapping
f4c0 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 6b 65 72 6e 65 6c 5c 6e Transport.with.gaussian.kernel\n
f4e0 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 ot_mapping_gaussian.=.ot.da.Mapp
f500 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 5c 6e 20 20 20 20 6b 65 72 6e 65 6c 3d 5c 22 67 61 75 73 ingTransport(\n....kernel=\"gaus
f520 73 69 61 6e 5c 22 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 35 2c 20 6d 75 3d 31 65 2d 31 2c 20 62 69 61 73 3d sian\",.eta=1e-5,.mu=1e-1,.bias=
f540 54 72 75 65 2c 20 73 69 67 6d 61 3d 31 2c 5c 6e 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 2c True,.sigma=1,\n....max_iter=10,
f560 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 .verbose=True)\not_mapping_gauss
f580 69 61 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f ian.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n#.for.o
f5a0 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 riginal.source.samples,.transfor
f5c0 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 m.applies.barycentric.mapping\nt
f5e0 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 ransp_Xs_gaussian.=.ot_mapping_g
f600 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f aussian.transform(Xs=Xs)\n\n#.fo
f620 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f r.out.of.source.samples,.transfo
f640 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 74 68 65 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c rm.applies.the.gaussian.mapping\
f660 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 ntransp_Xs_gaussian_new.=.ot_map
f680 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 ping_gaussian.transform(Xs=Xs_ne
f6a0 77 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b w)".......],........"outputs":.[
f6c0 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 ],........"metadata":.{.........
f6e0 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d "collapsed":.false.......}.....}
f700 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 ,......{......."source":.[......
f720 20 20 20 22 70 6c 6f 74 20 64 61 74 61 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ..."plot.data\n#################
f740 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
f760 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e ############################\n\n
f780 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 ".......],........"cell_type":."
f7a0 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d markdown",........"metadata":.{}
f7c0 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f .....},......{......."execution_
f7e0 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 count":.null,........"cell_type"
f800 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 :."code",........"source":.[....
f820 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 28 31 30 2c 20 35 29 29 5c 6e 70 6c 2e ....."pl.figure(1,.(10,.5))\npl.
f840 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a clf()\npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:
f860 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 ,.1],.c=ys,.marker='+',.label='S
f880 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a ource.samples')\npl.scatter(Xt[:
f8a0 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 ,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o'
f8c0 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 ,.label='Target.samples')\npl.le
f8e0 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e gend(loc=0)\npl.title('Source.an
f900 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 d.target.distributions')".......
f920 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 ],........"outputs":.[],........
f940 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 "metadata":.{........."collapsed
f960 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 ":.false.......}.....},......{..
f980 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 6f 74 20 74 ....."source":.[........."plot.t
f9a0 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ransported.samples\n############
f9c0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
f9e0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
fa00 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 #\n\n".......],........"cell_typ
fa20 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 e":."markdown",........"metadata
fa40 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 ":.{}.....},......{......."execu
fa60 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f tion_count":.null,........"cell_
fa80 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 type":."code",........"source":.
faa0 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 [........."pl.figure(2)\npl.clf(
fac0 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 )\npl.subplot(2,.2,.1)\npl.scatt
fae0 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 er(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.mar
fb00 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 ker='o',\n...........label='Targ
fb20 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 et.samples',.alpha=.2)\npl.scatt
fb40 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 er(transp_Xs_linear[:,.0],.trans
fb60 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d p_Xs_linear[:,.1],.c=ys,.marker=
fb80 27 2b 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4d 61 70 70 65 64 20 73 '+',\n...........label='Mapped.s
fba0 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 42 61 72 79 ource.samples')\npl.title(\"Bary
fbc0 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 5c 22 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 ..mapping.(linear)\")\npl.legend
fbe0 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e (loc=0)\n\npl.subplot(2,.2,.2)\n
fc00 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c
fc20 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 =yt,.marker='o',\n...........lab
fc40 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e el='Target.samples',.alpha=.2)\n
fc60 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 5b pl.scatter(transp_Xs_linear_new[
fc80 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 31 :,.0],.transp_Xs_linear_new[:,.1
fca0 5d 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c ],\n...........c=ys,.marker='+',
fcc0 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 65 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 .label='Learned.mapping')\npl.ti
fce0 74 6c 65 28 5c 22 45 73 74 69 6d 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 5c 22 29 tle(\"Estim..mapping.(linear)\")
fd00 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 \n\npl.subplot(2,.2,.3)\npl.scat
fd20 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 ter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.ma
fd40 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 rker='o',\n...........label='Tar
fd60 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 get.samples',.alpha=.2)\npl.scat
fd80 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 ter(transp_Xs_gaussian[:,.0],.tr
fda0 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 ansp_Xs_gaussian[:,.1],.c=ys,\n.
fdc0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 62 61 72 ..........marker='+',.label='bar
fde0 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 42 ycentric.mapping')\npl.title(\"B
fe00 61 72 79 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6b 65 72 6e 65 6c 29 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 ary..mapping.(kernel)\")\n\npl.s
fe20 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a ubplot(2,.2,.4)\npl.scatter(Xt[:
fe40 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 ,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o'
fe60 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 ,\n...........label='Target.samp
fe80 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e les',.alpha=.2)\npl.scatter(tran
fea0 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 sp_Xs_gaussian_new[:,.0],.transp
fec0 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 _Xs_gaussian_new[:,.1],.c=ys,\n.
fee0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 65 61 ..........marker='+',.label='Lea
ff00 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 45 73 74 69 6d rned.mapping')\npl.title(\"Estim
ff20 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6b 65 72 6e 65 6c 29 5c 22 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f ..mapping.(kernel)\")\npl.tight_
ff40 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 layout()\n\npl.show()".......],.
ff60 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 ......."outputs":.[],........"me
ff80 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 tadata":.{........."collapsed":.
ffa0 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 false.......}.....}...],...."met
ffc0 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 adata":.{....."kernelspec":.{...
ffe0 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 ...."display_name":."Python.2",.
10000 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ......."name":."python2",.......
10020 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 ."language":."python".....},....
10040 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 .."language_info":.{......."mime
10060 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 type":."text/x-python",........"
10080 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a nbconvert_exporter":."python",..
100a0 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 ......"name":."python",........"
100c0 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 file_extension":.".py",........"
100e0 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d version":."2.7.12",........"pygm
10100 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 ents_lexer":."ipython2",........
10120 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 "codemirror_mode":.{........."ve
10140 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 rsion":.2,.........."name":."ipy
10160 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 thon".......}.....}...}.}PK.....
10180 00 00 00 02 84 1e 4b ee 1f 11 06 c2 0a 00 00 c2 0a 00 00 24 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d ......K............$...auto_exam
101a0 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6d 70 75 74 65 5f 65 6d 64 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 ples/plot_compute_emd.ipynb{..."
101c0 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 nbformat_minor":.0,...."nbformat
101e0 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 ":.4,...."cells":.[.....{.......
10200 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 "execution_count":.null,........
10220 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 "cell_type":."code",........"sou
10240 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c rce":.[........."%matplotlib.inl
10260 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 ine".......],........"outputs":.
10280 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 [],........"metadata":.{........
102a0 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 ."collapsed":.false.......}.....
102c0 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 },......{......."source":.[.....
102e0 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 31 44 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 5c ...."\n#.1D.optimal.transport\n\
10300 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 n\n\n".......],........"cell_typ
10320 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 e":."markdown",........"metadata
10340 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 ":.{}.....},......{......."execu
10360 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f tion_count":.null,........"cell_
10380 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 type":."code",........"source":.
103a0 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 [........."#.Author:.Remi.Flamar
103c0 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 y.<remi.flamary@unice.fr>\n#\n#.
103e0 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e License:.MIT.License\n\nimport.n
10400 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 umpy.as.np\nimport.matplotlib.py
10420 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6f 74 2e 64 61 lab.as.pl\nimport.ot\nfrom.ot.da
10440 74 61 73 65 74 73 20 69 6d 70 6f 72 74 20 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 20 61 73 20 67 61 tasets.import.get_1D_gauss.as.ga
10460 75 73 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 20 3d 20 31 uss\n\n\n#%%.parameters\n\nn.=.1
10480 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e 73 5c 6e 6e 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 35 30 20 20 23 20 00..#.nb.bins\nn_target.=.50..#.
104a0 6e 62 20 74 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 62 nb.target.distributions\n\n\n#.b
104c0 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 5c 6e 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 in.positions\nx.=.np.arange(n,.d
104e0 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e 5c 6e 6c 73 74 5f 6d 20 3d 20 6e 70 2e 6c type=np.float64)\n\nlst_m.=.np.l
10500 69 6e 73 70 61 63 65 28 32 30 2c 20 39 30 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 47 inspace(20,.90,.n_target)\n\n#.G
10520 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 61 20 3d 20 67 61 75 73 73 aussian.distributions\na.=.gauss
10540 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 (n,.m=20,.s=5)..#.m=.mean,.s=.st
10560 64 5c 6e 5c 6e 42 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 29 29 d\n\nB.=.np.zeros((n,.n_target))
10580 5c 6e 5c 6e 66 6f 72 20 69 2c 20 6d 20 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 6c 73 74 5f 6d 29 \n\nfor.i,.m.in.enumerate(lst_m)
105a0 3a 5c 6e 20 20 20 20 42 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 6d 2c 20 73 :\n....B[:,.i].=.gauss(n,.m=m,.s
105c0 3d 35 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 20 61 6e 64 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 =5)\n\n#.loss.matrix.and.normali
105e0 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e zation\nM.=.ot.dist(x.reshape((n
10600 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 27 65 75 63 6c 69 ,.1)),.x.reshape((n,.1)),.'eucli
10620 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 dean')\nM./=.M.max()\nM2.=.ot.di
10640 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 st(x.reshape((n,.1)),.x.reshape(
10660 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d 32 20 2f 3d 20 4d (n,.1)),.'sqeuclidean')\nM2./=.M
10680 32 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 2.max()\n#%%.plot.the.distributi
106a0 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 ons\n\npl.figure(1)\npl.subplot(
106c0 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 61 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 2,.1,.1)\npl.plot(x,.a,.'b',.lab
106e0 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 el='Source.distribution')\npl.ti
10700 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 tle('Source.distribution')\npl.s
10720 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 42 2c 20 6c ubplot(2,.1,.2)\npl.plot(x,.B,.l
10740 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c abel='Target.distributions')\npl
10760 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e .title('Target.distributions')\n
10780 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 43 6f 6d 70 75 74 65 pl.tight_layout()\n\n#%%.Compute
107a0 20 61 6e 64 20 70 6c 6f 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 61 6e 64 20 6c 6f 73 73 .and.plot.distributions.and.loss
107c0 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 5c 6e 64 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 32 28 61 2c 20 42 2c .matrix\n\nd_emd.=.ot.emd2(a,.B,
107e0 20 4d 29 20 20 23 20 64 69 72 65 63 74 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 45 4d 44 .M)..#.direct.computation.of.EMD
10800 5c 6e 64 5f 65 6d 64 32 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 32 29 20 20 23 20 \nd_emd2.=.ot.emd2(a,.B,.M2)..#.
10820 64 69 72 65 63 74 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 6c direct.computation.of.EMD.with.l
10840 6f 73 73 20 4d 33 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f oss.M3\n\n\npl.figure(2)\npl.plo
10860 74 28 64 5f 65 6d 64 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 27 29 5c t(d_emd,.label='Euclidean.EMD')\
10880 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 6d 64 32 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 71 75 61 72 65 64 20 npl.plot(d_emd2,.label='Squared.
108a0 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 4d 44 20 64 Euclidean.EMD')\npl.title('EMD.d
108c0 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 5c 6e istances')\npl.legend()\n\n#%%\n
108e0 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 32 5c 6e 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b reg.=.1e-2\nd_sinkhorn.=.ot.sink
10900 68 6f 72 6e 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 29 5c 6e 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 horn2(a,.B,.M,.reg)\nd_sinkhorn2
10920 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 32 2c 20 72 65 67 29 5c 6e .=.ot.sinkhorn2(a,.B,.M2,.reg)\n
10940 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f \npl.figure(2)\npl.clf()\npl.plo
10960 74 28 64 5f 65 6d 64 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 27 29 5c t(d_emd,.label='Euclidean.EMD')\
10980 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 6d 64 32 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 71 75 61 72 65 64 20 npl.plot(d_emd2,.label='Squared.
109a0 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 73 69 6e 6b 68 Euclidean.EMD')\npl.plot(d_sinkh
109c0 6f 72 6e 2c 20 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 53 69 6e 6b 68 orn,.'+',.label='Euclidean.Sinkh
109e0 6f 72 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 2c 20 27 2b 27 2c orn')\npl.plot(d_sinkhorn2,.'+',
10a00 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 53 69 6e 6b 68 6f .label='Squared.Euclidean.Sinkho
10a20 72 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 4d 44 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 5c rn')\npl.title('EMD.distances')\
10a40 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 npl.legend()\n\npl.show()"......
10a60 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 .],........"outputs":.[],.......
10a80 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 ."metadata":.{........."collapse
10aa0 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 d":.false.......}.....}...],....
10ac0 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 "metadata":.{....."kernelspec":.
10ae0 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 {......."display_name":."Python.
10b00 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 2",........"name":."python2",...
10b20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c ....."language":."python".....},
10b40 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 ......"language_info":.{......."
10b60 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 mimetype":."text/x-python",.....
10b80 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e ..."nbconvert_exporter":."python
10ba0 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 ",........"name":."python",.....
10bc0 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 ..."file_extension":.".py",.....
10be0 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 ..."version":."2.7.12",........"
10c00 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 pygments_lexer":."ipython2",....
10c20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 ...."codemirror_mode":.{........
10c40 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 ."version":.2,.........."name":.
10c60 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 "ipython".......}.....}...}.}PK.
10c80 04 14 00 00 00 00 00 6a 7b 82 49 cd 14 1c 01 46 09 00 00 46 09 00 00 23 00 00 00 61 75 74 6f 5f .......j{.I....F...F...#...auto_
10ca0 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 64 65 6d 6f 5f 4f 54 5f 31 44 5f 74 65 73 74 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a examples/demo_OT_1D_test.ipynb{.
10cc0 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 .."nbformat_minor":.0,...."nbfor
10ce0 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 mat":.4,...."cells":.[.....{....
10d00 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 ..."execution_count":.null,.....
10d20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 ..."cell_type":."code",........"
10d40 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 source":.[........."%matplotlib.
10d60 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 inline".......],........"outputs
10d80 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 ":.[],........"metadata":.{.....
10da0 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 ...."collapsed":.false.......}..
10dc0 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 ...},......{......."source":.[..
10de0 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 44 65 6d 6f 20 66 6f 72 20 31 44 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 ......."\nDemo.for.1D.optimal.tr
10e00 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 5c 6e 40 61 75 74 68 6f 72 3a 20 72 66 6c 61 6d 61 72 79 5c 6e 5c 6e ansport\n\n@author:.rflamary\n\n
10e20 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 ".......],........"cell_type":."
10e40 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d markdown",........"metadata":.{}
10e60 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f .....},......{......."execution_
10e80 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 count":.null,........"cell_type"
10ea0 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 :."code",........"source":.[....
10ec0 20 20 20 20 20 22 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 ....."import.numpy.as.np\nimport
10ee0 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 .matplotlib.pylab.as.pl\nimport.
10f00 6f 74 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 20 69 6d 70 6f 72 74 20 67 65 74 5f ot\nfrom.ot.datasets.import.get_
10f20 31 44 5f 67 61 75 73 73 20 61 73 20 67 61 75 73 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 1D_gauss.as.gauss\n\n\n#%%.param
10f40 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 3d 31 30 30 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e 73 5c 6e 5c 6e 23 20 62 69 eters\n\nn=100.#.nb.bins\n\n#.bi
10f60 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 5c 6e 78 3d 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 64 74 79 70 65 n.positions\nx=np.arange(n,dtype
10f80 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e 5c 6e 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 =np.float64)\n\n#.Gaussian.distr
10fa0 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 61 3d 67 61 75 73 73 28 6e 2c 6d 3d 6e 2a 2e 32 2c 73 3d 35 29 20 ibutions\na=gauss(n,m=n*.2,s=5).
10fc0 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 5c 6e 62 3d 67 61 75 73 73 28 6e 2c 6d 3d 6e #.m=.mean,.s=.std\nb=gauss(n,m=n
10fe0 2a 2e 36 2c 73 3d 31 30 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 3d 6f 74 *.6,s=10)\n\n#.loss.matrix\nM=ot
11000 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 31 29 29 2c 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 .dist(x.reshape((n,1)),x.reshape
11020 28 28 6e 2c 31 29 29 29 5c 6e 4d 2f 3d 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 ((n,1)))\nM/=M.max()\n\n#%%.plot
11040 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 .the.distributions\n\npl.figure(
11060 31 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 61 2c 27 62 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 1)\npl.plot(x,a,'b',label='Sourc
11080 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 62 2c 27 72 e.distribution')\npl.plot(x,b,'r
110a0 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 5c 6e ',label='Target.distribution')\n
110c0 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 pl.legend()\n\n#%%.plot.distribu
110e0 74 69 6f 6e 73 20 61 6e 64 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 tions.and.loss.matrix\n\npl.figu
11100 72 65 28 32 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 62 2c 4d 2c re(2)\not.plot.plot1D_mat(a,b,M,
11120 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 4d 27 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e 5c 6e 47 'Cost.matrix.M')\n\n#%%.EMD\n\nG
11140 30 3d 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 62 2c 4d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 5c 0=ot.emd(a,b,M)\n\npl.figure(3)\
11160 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 62 2c 47 30 2c 27 4f 54 20 6d not.plot.plot1D_mat(a,b,G0,'OT.m
11180 61 74 72 69 78 20 47 30 27 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 5c 6e 6c 61 atrix.G0')\n\n#%%.Sinkhorn\n\nla
111a0 6d 62 64 3d 31 65 2d 33 5c 6e 47 73 3d 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c 62 2c 4d 2c 6c mbd=1e-3\nGs=ot.sinkhorn(a,b,M,l
111c0 61 6d 62 64 2c 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 ambd,verbose=True)\n\npl.figure(
111e0 34 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 62 2c 47 73 2c 27 4f 4)\not.plot.plot1D_mat(a,b,Gs,'O
11200 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 53 69 6e 6b 68 T.matrix.Sinkhorn')\n\n#%%.Sinkh
11220 6f 72 6e 5c 6e 5c 6e 6c 61 6d 62 64 3d 31 65 2d 34 5c 6e 47 73 73 2c 6c 6f 67 3d 6f 74 2e 62 72 orn\n\nlambd=1e-4\nGss,log=ot.br
11240 65 67 6d 61 6e 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 74 61 62 69 6c 69 7a 65 64 28 61 2c 62 2c 4d 2c egman.sinkhorn_stabilized(a,b,M,
11260 6c 61 6d 62 64 2c 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 2c 6c 6f 67 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 47 73 lambd,verbose=True,log=True)\nGs
11280 73 32 2c 6c 6f 67 32 3d 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 74 61 62 s2,log2=ot.bregman.sinkhorn_stab
112a0 69 6c 69 7a 65 64 28 61 2c 62 2c 4d 2c 6c 61 6d 62 64 2c 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 2c ilized(a,b,M,lambd,verbose=True,
112c0 6c 6f 67 3d 54 72 75 65 2c 77 61 72 6d 73 74 61 72 74 3d 6c 6f 67 5b 27 77 61 72 6d 73 74 61 72 log=True,warmstart=log['warmstar
112e0 74 27 5d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c t'])\n\npl.figure(5)\not.plot.pl
11300 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 62 2c 47 73 73 2c 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b ot1D_mat(a,b,Gss,'OT.matrix.Sink
11320 68 6f 72 6e 20 73 74 61 62 69 6c 69 7a 65 64 27 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 horn.stabilized')\n\n#%%.Sinkhor
11340 6e 5c 6e 5c 6e 6c 61 6d 62 64 3d 31 65 2d 31 31 5c 6e 47 73 73 3d 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e n\n\nlambd=1e-11\nGss=ot.bregman
11360 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 65 70 73 69 6c 6f 6e 5f 73 63 61 6c 69 6e 67 28 61 2c 62 2c 4d 2c .sinkhorn_epsilon_scaling(a,b,M,
11380 6c 61 6d 62 64 2c 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 lambd,verbose=True)\n\npl.figure
113a0 28 35 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 62 2c 47 73 73 2c (5)\not.plot.plot1D_mat(a,b,Gss,
113c0 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 73 74 61 62 69 6c 69 7a 65 64 27 29 'OT.matrix.Sinkhorn.stabilized')
113e0 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c ".......],........"outputs":.[],
11400 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 ........"metadata":.{........."c
11420 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 ollapsed":.false.......}.....}..
11440 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c .],...."metadata":.{....."kernel
11460 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 spec":.{......."display_name":."
11480 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f Python.2",........"name":."pytho
114a0 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 n2",........"language":."python"
114c0 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a .....},......"language_info":.{.
114e0 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e ......"mimetype":."text/x-python
11500 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 ",........"nbconvert_exporter":.
11520 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e "python",........"name":."python
11540 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 ",........"file_extension":.".py
11560 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a ",........"version":."2.7.12",..
11580 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e ......"pygments_lexer":."ipython
115a0 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 2",........"codemirror_mode":.{.
115c0 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 ........"version":.2,.........."
115e0 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 name":."ipython".......}.....}..
11600 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 86 7b 82 49 4f 22 f2 c8 74 0e 00 00 74 0e 00 00 2a 00 .}.}PK.........{.IO"..t...t...*.
11620 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 63 6f 6c 6f 72 5f ..auto_examples/plot_OTDA_color_
11640 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 images.ipynb{..."nbformat_minor"
11660 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 :.0,...."nbformat":.4,...."cells
11680 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e ":.[.....{......."execution_coun
116a0 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 t":.null,........"cell_type":."c
116c0 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 ode",........"source":.[........
116e0 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a ."%matplotlib.inline".......],..
11700 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 ......"outputs":.[],........"met
11720 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 adata":.{........."collapsed":.f
11740 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 alse.......}.....},......{......
11760 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d ."source":.[........."\n========
11780 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d ================================
117a0 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 ================\nOT.for.domain.
117c0 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 69 6d 61 67 65 20 63 6f 6c 6f 72 20 61 64 61 70 adaptation.with.image.color.adap
117e0 74 61 74 69 6f 6e 20 5b 36 5d 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d tation.[6]\n====================
11800 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d ================================
11820 3d 3d 3d 3d 5c 6e 5c 6e 5b 36 5d 20 46 65 72 72 61 64 61 6e 73 2c 20 53 2e 2c 20 50 61 70 61 64 ====\n\n[6].Ferradans,.S.,.Papad
11840 61 6b 69 73 2c 20 4e 2e 2c 20 50 65 79 72 65 2c 20 47 2e 2c 20 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 4a 2e akis,.N.,.Peyre,.G.,.&.Aujol,.J.
11860 20 46 2e 20 28 32 30 31 34 29 2e 20 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 64 69 73 63 72 65 74 65 .F..(2014)..Regularized.discrete
11880 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 2e 20 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c .optimal.transport..SIAM.Journal
118a0 20 6f 6e 20 49 6d 61 67 69 6e 67 20 53 63 69 65 6e 63 65 73 2c 20 37 28 33 29 2c 20 31 38 35 33 .on.Imaging.Sciences,.7(3),.1853
118c0 2d 31 38 38 32 2e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c -1882.\n\n".......],........"cel
118e0 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 l_type":."markdown",........"met
11900 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 adata":.{}.....},......{......."
11920 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 execution_count":.null,........"
11940 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 cell_type":."code",........"sour
11960 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 ce":.[........."import.numpy.as.
11980 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 73 63 69 70 79 2e 6e 64 69 6d 61 67 65 20 61 73 20 73 70 69 5c np\nimport.scipy.ndimage.as.spi\
119a0 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e nimport.matplotlib.pylab.as.pl\n
119c0 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 4c 6f 61 64 69 6e 67 20 69 6d 61 67 65 import.ot\n\n\n#%%.Loading.image
119e0 73 5c 6e 5c 6e 49 31 3d 73 70 69 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 s\n\nI1=spi.imread('../data/ocea
11a00 6e 5f 64 61 79 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 2f 32 n_day.jpg').astype(np.float64)/2
11a20 35 36 5c 6e 49 32 3d 73 70 69 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 56\nI2=spi.imread('../data/ocean
11a40 5f 73 75 6e 73 65 74 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 _sunset.jpg').astype(np.float64)
11a60 2f 32 35 36 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 50 6c 6f 74 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 /256\n\n#%%.Plot.images\n\npl.fi
11a80 67 75 72 65 28 31 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 32 2c 31 29 5c 6e 70 6c gure(1)\n\npl.subplot(1,2,1)\npl
11aa0 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 .imshow(I1)\npl.title('Image.1')
11ac0 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 32 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 \n\npl.subplot(1,2,2)\npl.imshow
11ae0 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e (I2)\npl.title('Image.2')\n\npl.
11b00 73 68 6f 77 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 49 6d 61 67 65 20 63 6f 6e 76 65 72 73 69 6f 6e 20 61 show()\n\n#%%.Image.conversion.a
11b20 6e 64 20 64 61 74 61 73 65 74 20 67 65 6e 65 72 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 69 6d 32 nd.dataset.generation\n\ndef.im2
11b40 6d 61 74 28 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 61 6e 64 20 mat(I):\n....\"\"\"Converts.and.
11b60 69 6d 61 67 65 20 74 6f 20 6d 61 74 72 69 78 20 28 6f 6e 65 20 70 69 78 65 6c 20 70 65 72 20 6c image.to.matrix.(one.pixel.per.l
11b80 69 6e 65 29 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 49 2e 72 65 73 68 61 70 65 ine)\"\"\"\n....return.I.reshape
11ba0 28 28 49 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2a 49 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 49 2e 73 68 61 70 65 5b ((I.shape[0]*I.shape[1],I.shape[
11bc0 32 5d 29 29 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 6d 61 74 32 69 6d 28 58 2c 73 68 61 70 65 29 3a 5c 6e 20 20 2]))\n\ndef.mat2im(X,shape):\n..
11be0 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 62 61 63 6b 20 61 20 6d 61 74 72 69 78 20 74 ..\"\"\"Converts.back.a.matrix.t
11c00 6f 20 61 6e 20 69 6d 61 67 65 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 58 2e 72 o.an.image\"\"\"\n....return.X.r
11c20 65 73 68 61 70 65 28 73 68 61 70 65 29 5c 6e 5c 6e 58 31 3d 69 6d 32 6d 61 74 28 49 31 29 5c 6e eshape(shape)\n\nX1=im2mat(I1)\n
11c40 58 32 3d 69 6d 32 6d 61 74 28 49 32 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 6d 70 X2=im2mat(I2)\n\n#.training.samp
11c60 6c 65 73 5c 6e 6e 62 3d 31 30 30 30 5c 6e 69 64 78 31 3d 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e les\nnb=1000\nidx1=np.random.ran
11c80 64 69 6e 74 28 58 31 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 5c 6e 69 64 dint(X1.shape[0],size=(nb,))\nid
11ca0 78 32 3d 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 32 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d x2=np.random.randint(X2.shape[0]
11cc0 2c 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 5c 6e 5c 6e 78 73 3d 58 31 5b 69 64 78 31 2c 3a 5d 5c 6e 78 ,size=(nb,))\n\nxs=X1[idx1,:]\nx
11ce0 74 3d 58 32 5b 69 64 78 32 2c 3a 5d 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 50 6c 6f 74 20 69 6d 61 67 65 20 64 t=X2[idx2,:]\n\n#%%.Plot.image.d
11d00 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 28 31 istributions\n\n\npl.figure(2,(1
11d20 30 2c 35 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 32 2c 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 0,5))\n\npl.subplot(1,2,1)\npl.s
11d40 63 61 74 74 65 72 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 32 5d 2c 63 3d 78 73 29 5c 6e 70 6c catter(xs[:,0],xs[:,2],c=xs)\npl
11d60 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 31 2c 30 2c 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 .axis([0,1,0,1])\npl.xlabel('Red
11d80 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 ')\npl.ylabel('Blue')\npl.title(
11da0 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 32 2c 32 29 5c 'Image.1')\n\npl.subplot(1,2,2)\
11dc0 6e 23 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a n#pl.imshow(I2)\npl.scatter(xt[:
11de0 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 32 5d 2c 63 3d 78 74 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 31 2c ,0],xt[:,2],c=xt)\npl.axis([0,1,
11e00 30 2c 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 0,1])\npl.xlabel('Red')\npl.ylab
11e20 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c el('Blue')\npl.title('Image.2')\
11e40 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 n\npl.show()\n\n\n\n#%%.domain.a
11e60 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 5c 6e 23 20 4c 50 daptation.between.images\n\n#.LP
11e80 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 5c 6e 64 61 5f 65 6d 64 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 28 29 20 20 20 .problem\nda_emd=ot.da.OTDA()...
11ea0 20 20 23 20 69 6e 69 74 20 63 6c 61 73 73 5c 6e 64 61 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 74 ..#.init.class\nda_emd.fit(xs,xt
11ec0 29 20 20 20 20 20 20 20 23 20 66 69 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 5c ).......#.fit.distributions\n\n\
11ee0 6e 23 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 6c 61 6d 62 n#.sinkhorn.regularization\nlamb
11f00 64 3d 31 65 2d 31 5c 6e 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 5f 73 69 6e d=1e-1\nda_entrop=ot.da.OTDA_sin
11f20 6b 68 6f 72 6e 28 29 5c 6e 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 74 2c 72 65 67 khorn()\nda_entrop.fit(xs,xt,reg
11f40 3d 6c 61 6d 62 64 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e 20 62 65 =lambd)\n\n\n\n#%%.prediction.be
11f60 74 77 65 65 6e 20 69 6d 61 67 65 73 20 28 75 73 69 6e 67 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 61 6d 70 6c tween.images.(using.out.of.sampl
11f80 65 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e 20 61 73 20 69 6e 20 5b 36 5d 29 5c 6e 5c 6e 58 31 74 3d 64 e.prediction.as.in.[6])\n\nX1t=d
11fa0 61 5f 65 6d 64 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 58 31 29 5c 6e 58 32 74 3d 64 61 5f 65 6d 64 2e 70 72 a_emd.predict(X1)\nX2t=da_emd.pr
11fc0 65 64 69 63 74 28 58 32 2c 2d 31 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 58 31 74 65 3d 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 edict(X2,-1)\n\n\nX1te=da_entrop
11fe0 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 58 31 29 5c 6e 58 32 74 65 3d 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 70 72 65 .predict(X1)\nX2te=da_entrop.pre
12000 64 69 63 74 28 58 32 2c 2d 31 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 49 29 3a 5c dict(X2,-1)\n\n\ndef.minmax(I):\
12020 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 6d 69 6e 69 6d 75 6d 28 6e 70 2e 6d 61 78 69 6d 75 n....return.np.minimum(np.maximu
12040 6d 28 49 2c 30 29 2c 31 29 5c 6e 5c 6e 49 31 74 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 m(I,0),1)\n\nI1t=minmax(mat2im(X
12060 31 74 2c 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 49 32 74 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 1t,I1.shape))\nI2t=minmax(mat2im
12080 28 58 32 74 2c 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 5c 6e 49 31 74 65 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d (X2t,I2.shape))\n\nI1te=minmax(m
120a0 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 65 2c 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 49 32 74 65 3d 6d 69 6e 6d at2im(X1te,I1.shape))\nI2te=minm
120c0 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 32 74 65 2c 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 ax(mat2im(X2te,I2.shape))\n\n#%%
120e0 20 70 6c 6f 74 20 61 6c 6c 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c .plot.all.images\n\npl.figure(2,
12100 28 31 30 2c 38 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 31 29 5c 6e 5c 6e (10,8))\n\npl.subplot(2,3,1)\n\n
12120 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 pl.imshow(I1)\npl.title('Image.1
12140 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 ')\n\npl.subplot(2,3,2)\npl.imsh
12160 6f 77 28 49 31 74 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 ow(I1t)\npl.title('Image.1.Adapt
12180 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d ')\n\n\npl.subplot(2,3,3)\npl.im
121a0 73 68 6f 77 28 49 31 74 65 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 show(I1te)\npl.title('Image.1.Ad
121c0 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 34 29 apt.(reg)')\n\npl.subplot(2,3,4)
121e0 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 \n\npl.imshow(I2)\npl.title('Ima
12200 67 65 20 32 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 35 29 5c 6e 70 6c 2e ge.2')\n\npl.subplot(2,3,5)\npl.
12220 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 imshow(I2t)\npl.title('Image.2.A
12240 64 61 70 74 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 36 29 5c 6e 70 dapt')\n\n\npl.subplot(2,3,6)\np
12260 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 65 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 l.imshow(I2te)\npl.title('Image.
12280 32 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 2.Adapt.(reg)')\n\npl.show()"...
122a0 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 ....],........"outputs":.[],....
122c0 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 ...."metadata":.{........."colla
122e0 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 psed":.false.......}.....}...],.
12300 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 ..."metadata":.{....."kernelspec
12320 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 ":.{......."display_name":."Pyth
12340 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c on.2",........"name":."python2",
12360 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 ........"language":."python"....
12380 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 .},......"language_info":.{.....
123a0 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a .."mimetype":."text/x-python",..
123c0 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 ......"nbconvert_exporter":."pyt
123e0 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a hon",........"name":."python",..
12400 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a ......"file_extension":.".py",..
12420 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 ......"version":."2.7.12",......
12440 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 .."pygments_lexer":."ipython2",.
12460 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 ......."codemirror_mode":.{.....
12480 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 ...."version":.2,.........."name
124a0 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d ":."ipython".......}.....}...}.}
124c0 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 d7 7b 82 49 c4 9e 28 9b ea 11 00 00 ea 11 00 00 32 00 00 00 61 75 PK.........{.I..(.........2...au
124e0 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 63 6f to_examples/plot_OTDA_mapping_co
12500 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 lor_images.ipynb{..."nbformat_mi
12520 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 nor":.0,...."nbformat":.4,...."c
12540 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f ells":.[.....{......."execution_
12560 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 count":.null,........"cell_type"
12580 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 :."code",........"source":.[....
125a0 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 ....."%matplotlib.inline".......
125c0 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 ],........"outputs":.[],........
125e0 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 "metadata":.{........."collapsed
12600 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 ":.false.......}.....},......{..
12620 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 3d 3d 3d 3d ....."source":.[........."\n====
12640 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d ================================
12660 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d ================================
12680 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 ================\nOT.for.domain.
126a0 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 69 6d 61 67 65 20 63 6f 6c 6f 72 20 61 64 61 70 adaptation.with.image.color.adap
126c0 74 61 74 69 6f 6e 20 5b 36 5d 20 77 69 74 68 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 tation.[6].with.mapping.estimati
126e0 6f 6e 20 5b 38 5d 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d on.[8]\n========================
12700 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d ================================
12720 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 5c 6e ============================\n\n
12740 5b 36 5d 20 46 65 72 72 61 64 61 6e 73 2c 20 53 2e 2c 20 50 61 70 61 64 61 6b 69 73 2c 20 4e 2e [6].Ferradans,.S.,.Papadakis,.N.
12760 2c 20 50 65 79 72 65 2c 20 47 2e 2c 20 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 4a 2e 20 46 2e 20 28 32 30 31 ,.Peyre,.G.,.&.Aujol,.J..F..(201
12780 34 29 2e 20 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 5c 6e 20 20 20 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 4)..Regularized\n....discrete.op
127a0 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 2e 20 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c 20 6f 6e timal.transport..SIAM.Journal.on
127c0 20 49 6d 61 67 69 6e 67 20 53 63 69 65 6e 63 65 73 2c 20 37 28 33 29 2c 20 31 38 35 33 2d 31 38 .Imaging.Sciences,.7(3),.1853-18
127e0 38 32 2e 5c 6e 5b 38 5d 20 4d 2e 20 50 65 72 72 6f 74 2c 20 4e 2e 20 43 6f 75 72 74 79 2c 20 52 82.\n[8].M..Perrot,.N..Courty,.R
12800 2e 20 46 6c 61 6d 61 72 79 2c 20 41 2e 20 48 61 62 72 61 72 64 2c 20 5c 22 4d 61 70 70 69 6e 67 ..Flamary,.A..Habrard,.\"Mapping
12820 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 5c 6e 20 20 20 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 .estimation.for\n....discrete.op
12840 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 22 2c 20 4e 65 75 72 61 6c 20 49 6e 66 6f 72 6d timal.transport\",.Neural.Inform
12860 61 74 69 6f 6e 20 50 72 6f 63 65 73 73 69 6e 67 20 53 79 73 74 65 6d 73 20 28 4e 49 50 53 29 2c ation.Processing.Systems.(NIPS),
12880 20 32 30 31 36 2e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 .2016.\n\n\n".......],........"c
128a0 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d ell_type":."markdown",........"m
128c0 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 etadata":.{}.....},......{......
128e0 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ."execution_count":.null,.......
12900 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f ."cell_type":."code",........"so
12920 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 urce":.[........."import.numpy.a
12940 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 73 63 69 70 79 2e 6e 64 69 6d 61 67 65 20 61 73 20 73 70 s.np\nimport.scipy.ndimage.as.sp
12960 69 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c i\nimport.matplotlib.pylab.as.pl
12980 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 4c 6f 61 64 69 6e 67 20 69 6d 61 \nimport.ot\n\n\n#%%.Loading.ima
129a0 67 65 73 5c 6e 5c 6e 49 31 3d 73 70 69 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 ges\n\nI1=spi.imread('../data/oc
129c0 65 61 6e 5f 64 61 79 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 ean_day.jpg').astype(np.float64)
129e0 2f 32 35 36 5c 6e 49 32 3d 73 70 69 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 /256\nI2=spi.imread('../data/oce
12a00 61 6e 5f 73 75 6e 73 65 74 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 an_sunset.jpg').astype(np.float6
12a20 34 29 2f 32 35 36 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 50 6c 6f 74 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 4)/256\n\n#%%.Plot.images\n\npl.
12a40 66 69 67 75 72 65 28 31 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 32 2c 31 29 5c 6e figure(1)\n\npl.subplot(1,2,1)\n
12a60 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 pl.imshow(I1)\npl.title('Image.1
12a80 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 32 2c 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 ')\n\npl.subplot(1,2,2)\npl.imsh
12aa0 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 5c 6e 70 ow(I2)\npl.title('Image.2')\n\np
12ac0 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 49 6d 61 67 65 20 63 6f 6e 76 65 72 73 69 6f 6e l.show()\n\n#%%.Image.conversion
12ae0 20 61 6e 64 20 64 61 74 61 73 65 74 20 67 65 6e 65 72 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 69 .and.dataset.generation\n\ndef.i
12b00 6d 32 6d 61 74 28 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 61 6e m2mat(I):\n....\"\"\"Converts.an
12b20 64 20 69 6d 61 67 65 20 74 6f 20 6d 61 74 72 69 78 20 28 6f 6e 65 20 70 69 78 65 6c 20 70 65 72 d.image.to.matrix.(one.pixel.per
12b40 20 6c 69 6e 65 29 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 49 2e 72 65 73 68 61 .line)\"\"\"\n....return.I.resha
12b60 70 65 28 28 49 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2a 49 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 49 2e 73 68 61 70 pe((I.shape[0]*I.shape[1],I.shap
12b80 65 5b 32 5d 29 29 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 6d 61 74 32 69 6d 28 58 2c 73 68 61 70 65 29 3a 5c 6e e[2]))\n\ndef.mat2im(X,shape):\n
12ba0 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 62 61 63 6b 20 61 20 6d 61 74 72 69 78 ....\"\"\"Converts.back.a.matrix
12bc0 20 74 6f 20 61 6e 20 69 6d 61 67 65 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 58 .to.an.image\"\"\"\n....return.X
12be0 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 73 68 61 70 65 29 5c 6e 5c 6e 58 31 3d 69 6d 32 6d 61 74 28 49 31 29 .reshape(shape)\n\nX1=im2mat(I1)
12c00 5c 6e 58 32 3d 69 6d 32 6d 61 74 28 49 32 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 \nX2=im2mat(I2)\n\n#.training.sa
12c20 6d 70 6c 65 73 5c 6e 6e 62 3d 31 30 30 30 5c 6e 69 64 78 31 3d 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 mples\nnb=1000\nidx1=np.random.r
12c40 61 6e 64 69 6e 74 28 58 31 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 5c 6e andint(X1.shape[0],size=(nb,))\n
12c60 69 64 78 32 3d 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 32 2e 73 68 61 70 65 5b idx2=np.random.randint(X2.shape[
12c80 30 5d 2c 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 5c 6e 5c 6e 78 73 3d 58 31 5b 69 64 78 31 2c 3a 5d 5c 0],size=(nb,))\n\nxs=X1[idx1,:]\
12ca0 6e 78 74 3d 58 32 5b 69 64 78 32 2c 3a 5d 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 50 6c 6f 74 20 69 6d 61 67 65 nxt=X2[idx2,:]\n\n#%%.Plot.image
12cc0 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c .distributions\n\n\npl.figure(2,
12ce0 28 31 30 2c 35 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 32 2c 31 29 5c 6e 70 6c (10,5))\n\npl.subplot(1,2,1)\npl
12d00 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 32 5d 2c 63 3d 78 73 29 5c 6e .scatter(xs[:,0],xs[:,2],c=xs)\n
12d20 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 31 2c 30 2c 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 pl.axis([0,1,0,1])\npl.xlabel('R
12d40 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c ed')\npl.ylabel('Blue')\npl.titl
12d60 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 32 2c 32 e('Image.1')\n\npl.subplot(1,2,2
12d80 29 5c 6e 23 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 )\n#pl.imshow(I2)\npl.scatter(xt
12da0 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 32 5d 2c 63 3d 78 74 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c [:,0],xt[:,2],c=xt)\npl.axis([0,
12dc0 31 2c 30 2c 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 1,0,1])\npl.xlabel('Red')\npl.yl
12de0 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 abel('Blue')\npl.title('Image.2'
12e00 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 64 6f 6d 61 69 6e )\n\npl.show()\n\n\n\n#%%.domain
12e20 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 64 65 66 20 .adaptation.between.images\ndef.
12e40 6d 69 6e 6d 61 78 28 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 6d 69 6e 69 6d 75 minmax(I):\n....return.np.minimu
12e60 6d 28 6e 70 2e 6d 61 78 69 6d 75 6d 28 49 2c 30 29 2c 31 29 5c 6e 23 20 4c 50 20 70 72 6f 62 6c m(np.maximum(I,0),1)\n#.LP.probl
12e80 65 6d 5c 6e 64 61 5f 65 6d 64 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 28 29 20 20 20 20 20 23 20 69 6e em\nda_emd=ot.da.OTDA().....#.in
12ea0 69 74 20 63 6c 61 73 73 5c 6e 64 61 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 74 29 20 20 20 20 20 it.class\nda_emd.fit(xs,xt).....
12ec0 20 20 23 20 66 69 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 58 31 74 3d 64 61 5f ..#.fit.distributions\n\nX1t=da_
12ee0 65 6d 64 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 58 31 29 20 20 23 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 61 6d 70 6c 65 emd.predict(X1)..#.out.of.sample
12f00 5c 6e 49 31 74 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 2c 49 31 2e 73 68 61 70 65 \nI1t=minmax(mat2im(X1t,I1.shape
12f20 29 29 5c 6e 5c 6e 23 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c ))\n\n#.sinkhorn.regularization\
12f40 6e 6c 61 6d 62 64 3d 31 65 2d 31 5c 6e 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 nlambd=1e-1\nda_entrop=ot.da.OTD
12f60 41 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 29 5c 6e 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 A_sinkhorn()\nda_entrop.fit(xs,x
12f80 74 2c 72 65 67 3d 6c 61 6d 62 64 29 5c 6e 5c 6e 58 31 74 65 3d 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 70 t,reg=lambd)\n\nX1te=da_entrop.p
12fa0 72 65 64 69 63 74 28 58 31 29 5c 6e 49 31 74 65 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 redict(X1)\nI1te=minmax(mat2im(X
12fc0 31 74 65 2c 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 1te,I1.shape))\n\n#.linear.mappi
12fe0 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 5c 6e 65 74 61 3d 31 65 2d 38 20 20 20 23 20 71 75 61 64 ng.estimation\neta=1e-8...#.quad
13000 72 61 74 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 72 65 67 72 65 73 73 ratic.regularization.for.regress
13020 69 6f 6e 5c 6e 6d 75 3d 31 65 30 20 20 20 20 20 23 20 77 65 69 67 68 74 20 6f 66 20 74 68 65 20 ion\nmu=1e0.....#.weight.of.the.
13040 4f 54 20 6c 69 6e 65 61 72 20 74 65 72 6d 5c 6e 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 20 20 23 20 65 73 74 OT.linear.term\nbias=True..#.est
13060 69 6d 61 74 65 20 61 20 62 69 61 73 5c 6e 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 3d 6f 74 2e 64 61 imate.a.bias\n\not_mapping=ot.da
13080 2e 4f 54 44 41 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 28 29 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 .OTDA_mapping_linear()\not_mappi
130a0 6e 67 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 74 2c 6d 75 3d 6d 75 2c 65 74 61 3d 65 74 61 2c 62 69 61 73 3d ng.fit(xs,xt,mu=mu,eta=eta,bias=
130c0 62 69 61 73 2c 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 20 3d 20 32 30 2c 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 bias,numItermax.=.20,verbose=Tru
130e0 65 29 5c 6e 5c 6e 58 31 74 6c 3d 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 58 31 e)\n\nX1tl=ot_mapping.predict(X1
13100 29 20 23 20 75 73 65 20 74 68 65 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 49 ).#.use.the.estimated.mapping\nI
13120 31 74 6c 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 6c 2c 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 1tl=minmax(mat2im(X1tl,I1.shape)
13140 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6e 6f 6e 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 )\n\n#.nonlinear.mapping.estimat
13160 69 6f 6e 5c 6e 65 74 61 3d 31 65 2d 32 20 20 20 23 20 71 75 61 64 72 61 74 69 63 20 72 65 67 75 ion\neta=1e-2...#.quadratic.regu
13180 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 72 65 67 72 65 73 73 69 6f 6e 5c 6e 6d 75 3d 31 65 larization.for.regression\nmu=1e
131a0 30 20 20 20 20 20 23 20 77 65 69 67 68 74 20 6f 66 20 74 68 65 20 4f 54 20 6c 69 6e 65 61 72 20 0.....#.weight.of.the.OT.linear.
131c0 74 65 72 6d 5c 6e 62 69 61 73 3d 46 61 6c 73 65 20 20 23 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 20 61 20 62 term\nbias=False..#.estimate.a.b
131e0 69 61 73 5c 6e 73 69 67 6d 61 3d 31 20 20 20 20 23 20 73 69 67 6d 61 20 62 61 6e 64 77 69 64 74 ias\nsigma=1....#.sigma.bandwidt
13200 68 20 66 6f 74 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 6b 65 72 6e 65 6c 5c 6e 5c 6e 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 h.fot.gaussian.kernel\n\n\not_ma
13220 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 6c 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f pping_kernel=ot.da.OTDA_mapping_
13240 6b 65 72 6e 65 6c 28 29 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 6c 2e 66 69 74 28 kernel()\not_mapping_kernel.fit(
13260 78 73 2c 78 74 2c 6d 75 3d 6d 75 2c 65 74 61 3d 65 74 61 2c 73 69 67 6d 61 3d 73 69 67 6d 61 2c xs,xt,mu=mu,eta=eta,sigma=sigma,
13280 62 69 61 73 3d 62 69 61 73 2c 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 20 3d 20 31 30 2c 76 65 72 62 6f 73 bias=bias,numItermax.=.10,verbos
132a0 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 58 31 74 6e 3d 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 e=True)\n\nX1tn=ot_mapping_kerne
132c0 6c 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 58 31 29 20 23 20 75 73 65 20 74 68 65 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 l.predict(X1).#.use.the.estimate
132e0 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 49 31 74 6e 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 d.mapping\nI1tn=minmax(mat2im(X1
13300 74 6e 2c 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e tn,I1.shape))\n#%%.plot.images\n
13320 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 28 31 30 2c 38 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 \n\npl.figure(2,(10,8))\n\npl.su
13340 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 31 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 70 bplot(2,3,1)\n\npl.imshow(I1)\np
13360 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 l.title('Im..1')\n\npl.subplot(2
13380 2c 33 2c 32 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 ,3,2)\n\npl.imshow(I2)\npl.title
133a0 28 27 49 6d 2e 20 32 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 33 29 ('Im..2')\n\n\npl.subplot(2,3,3)
133c0 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 \npl.imshow(I1t)\npl.title('Im..
133e0 31 20 49 6e 74 65 72 70 20 4c 50 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 1.Interp.LP')\n\npl.subplot(2,3,
13400 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 65 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 4)\npl.imshow(I1te)\npl.title('I
13420 6d 2e 20 31 20 49 6e 74 65 72 70 20 45 6e 74 72 6f 70 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 m..1.Interp.Entrop')\n\n\npl.sub
13440 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 35 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 6c 29 5c 6e 70 6c plot(2,3,5)\npl.imshow(I1tl)\npl
13460 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 20 4c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e .title('Im..1.Linear.mapping')\n
13480 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 36 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 \npl.subplot(2,3,6)\npl.imshow(I
134a0 31 74 6e 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 20 6e 6f 6e 6c 69 6e 65 61 72 20 1tn)\npl.title('Im..1.nonlinear.
134c0 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c mapping')\n\npl.show()".......],
134e0 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d ........"outputs":.[],........"m
13500 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a etadata":.{........."collapsed":
13520 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 .false.......}.....}...],...."me
13540 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 tadata":.{....."kernelspec":.{..
13560 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c ....."display_name":."Python.2",
13580 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 ........"name":."python2",......
135a0 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 .."language":."python".....},...
135c0 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d ..."language_info":.{......."mim
135e0 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 etype":."text/x-python",........
13600 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 "nbconvert_exporter":."python",.
13620 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 ......."name":."python",........
13640 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 "file_extension":.".py",........
13660 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 "version":."2.7.12",........"pyg
13680 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ments_lexer":."ipython2",.......
136a0 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 ."codemirror_mode":.{........."v
136c0 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 ersion":.2,.........."name":."ip
136e0 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 ython".......}.....}...}.}PK....
13700 00 00 00 00 34 87 1e 4b ea e0 aa 32 e7 17 00 00 e7 17 00 00 2a 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 ....4..K...2........*...auto_exa
13720 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 mples/plot_otda_color_images.ipy
13740 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e nb{..."nbformat_minor":.0,...."n
13760 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b bformat":.4,...."cells":.[.....{
13780 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 ......."execution_count":.null,.
137a0 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 ......."cell_type":."code",.....
137c0 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 ..."source":.[........."%matplot
137e0 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 lib.inline".......],........"out
13800 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a puts":.[],........"metadata":.{.
13820 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 ........"collapsed":.false......
13840 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a .}.....},......{......."source":
13860 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d .[........."\n==================
13880 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d ================================
138a0 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e ======\nOT.for.domain.adaptation
138c0 20 77 69 74 68 20 69 6d 61 67 65 20 63 6f 6c 6f 72 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 5b 36 5d .with.image.color.adaptation.[6]
138e0 5c 6e 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d \n==============================
13900 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 5c 6e 5c 6e 54 68 ==========================\n\nTh
13920 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 70 72 65 73 65 6e 74 73 20 61 20 77 61 79 20 6f 66 20 74 72 61 is.example.presents.a.way.of.tra
13940 6e 73 66 65 72 72 69 6e 67 20 63 6f 6c 6f 72 73 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 74 77 6f 20 69 6d 61 nsferring.colors.between.two.ima
13960 67 65 5c 6e 77 69 74 68 20 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 73 20 69 6e ge\nwith.Optimal.Transport.as.in
13980 74 72 6f 64 75 63 65 64 20 69 6e 20 5b 36 5d 5c 6e 5c 6e 5b 36 5d 20 46 65 72 72 61 64 61 6e 73 troduced.in.[6]\n\n[6].Ferradans
139a0 2c 20 53 2e 2c 20 50 61 70 61 64 61 6b 69 73 2c 20 4e 2e 2c 20 50 65 79 72 65 2c 20 47 2e 2c 20 ,.S.,.Papadakis,.N.,.Peyre,.G.,.
139c0 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 4a 2e 20 46 2e 20 28 32 30 31 34 29 2e 5c 6e 52 65 67 75 6c 61 72 69 &.Aujol,.J..F..(2014).\nRegulari
139e0 7a 65 64 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 2e 5c zed.discrete.optimal.transport.\
13a00 6e 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c 20 6f 6e 20 49 6d 61 67 69 6e 67 20 53 63 69 65 6e 63 65 nSIAM.Journal.on.Imaging.Science
13a20 73 2c 20 37 28 33 29 2c 20 31 38 35 33 2d 31 38 38 32 2e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d s,.7(3),.1853-1882.\n\n".......]
13a40 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 ,........"cell_type":."markdown"
13a60 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a ,........"metadata":.{}.....},..
13a80 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e ....{......."execution_count":.n
13aa0 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c ull,........"cell_type":."code",
13ac0 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 ........"source":.[........."#.A
13ae0 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 uthors:.Remi.Flamary.<remi.flama
13b00 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 6c ry@unice.fr>\n#..........Stanisl
13b20 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 as.Chambon.<stan.chambon@gmail.c
13b40 6f 6d 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e om>\n#\n#.License:.MIT.License\n
13b60 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 66 72 6f 6d 20 73 63 69 70 79 \nimport.numpy.as.np\nfrom.scipy
13b80 20 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 64 69 6d 61 67 65 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c .import.ndimage\nimport.matplotl
13ba0 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 5c 6e 5c 6e 72 ib.pylab.as.pl\nimport.ot\n\n\nr
13bc0 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 52 61 6e 64 6f 6d 53 74 61 74 65 28 34 32 29 5c 6e 5c 6e .=.np.random.RandomState(42)\n\n
13be0 5c 6e 64 65 66 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e 76 \ndef.im2mat(I):\n....\"\"\"Conv
13c00 65 72 74 73 20 61 6e 64 20 69 6d 61 67 65 20 74 6f 20 6d 61 74 72 69 78 20 28 6f 6e 65 20 70 69 erts.and.image.to.matrix.(one.pi
13c20 78 65 6c 20 70 65 72 20 6c 69 6e 65 29 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 xel.per.line)\"\"\"\n....return.
13c40 49 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 49 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 20 2a 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b I.reshape((I.shape[0].*.I.shape[
13c60 31 5d 2c 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 32 5d 29 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 6d 61 74 32 69 6d 1],.I.shape[2]))\n\n\ndef.mat2im
13c80 28 58 2c 20 73 68 61 70 65 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 (X,.shape):\n....\"\"\"Converts.
13ca0 62 61 63 6b 20 61 20 6d 61 74 72 69 78 20 74 6f 20 61 6e 20 69 6d 61 67 65 5c 22 5c 22 5c 22 5c back.a.matrix.to.an.image\"\"\"\
13cc0 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 58 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 73 68 61 70 65 29 5c 6e 5c 6e n....return.X.reshape(shape)\n\n
13ce0 5c 6e 64 65 66 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e \ndef.minmax(I):\n....return.np.
13d00 63 6c 69 70 28 49 2c 20 30 2c 20 31 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 clip(I,.0,.1)".......],........"
13d20 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a outputs":.[],........"metadata":
13d40 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 .{........."collapsed":.false...
13d60 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 ....}.....},......{......."sourc
13d80 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 67 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 23 23 e":.[........."generate.data\n##
13da0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
13dc0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
13de0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ###########\n\n".......],.......
13e00 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ."cell_type":."markdown",.......
13e20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 ."metadata":.{}.....},......{...
13e40 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 ...."execution_count":.null,....
13e60 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 ...."cell_type":."code",........
13e80 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 4c 6f 61 64 69 6e 67 20 69 "source":.[........."#.Loading.i
13ea0 6d 61 67 65 73 5c 6e 49 31 20 3d 20 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 mages\nI1.=.ndimage.imread('../d
13ec0 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 64 61 79 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c ata/ocean_day.jpg').astype(np.fl
13ee0 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 5c 6e 49 32 20 3d 20 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 oat64)./.256\nI2.=.ndimage.imrea
13f00 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 73 75 6e 73 65 74 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 d('../data/ocean_sunset.jpg').as
13f20 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 5c 6e 5c 6e 58 31 20 3d 20 69 type(np.float64)./.256\n\nX1.=.i
13f40 6d 32 6d 61 74 28 49 31 29 5c 6e 58 32 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 32 29 5c 6e 5c 6e 23 20 m2mat(I1)\nX2.=.im2mat(I2)\n\n#.
13f60 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 6e 62 20 3d 20 31 30 30 30 5c 6e 69 64 78 training.samples\nnb.=.1000\nidx
13f80 31 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 31 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 1.=.r.randint(X1.shape[0],.size=
13fa0 28 6e 62 2c 29 29 5c 6e 69 64 78 32 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 32 2e 73 68 61 70 (nb,))\nidx2.=.r.randint(X2.shap
13fc0 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 5c 6e 5c 6e 58 73 20 3d 20 58 31 5b 69 64 78 e[0],.size=(nb,))\n\nXs.=.X1[idx
13fe0 31 2c 20 3a 5d 5c 6e 58 74 20 3d 20 58 32 5b 69 64 78 32 2c 20 3a 5d 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 1,.:]\nXt.=.X2[idx2,.:]".......]
14000 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 ,........"outputs":.[],........"
14020 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 metadata":.{........."collapsed"
14040 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 :.false.......}.....},......{...
14060 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 49 6e 73 74 61 6e 74 ...."source":.[........."Instant
14080 69 61 74 65 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 iate.the.different.transport.alg
140a0 6f 72 69 74 68 6d 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 orithms.and.fit.them\n##########
140c0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
140e0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
14100 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 ###\n\n".......],........"cell_t
14120 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 ype":."markdown",........"metada
14140 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 ta":.{}.....},......{......."exe
14160 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c cution_count":.null,........"cel
14180 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 l_type":."code",........"source"
141a0 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f :.[........."#.EMDTransport\not_
141c0 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 5c 6e 6f 74 5f 65 emd.=.ot.da.EMDTransport()\not_e
141e0 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f md.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n#.Sinkho
14200 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 rnTransport\not_sinkhorn.=.ot.da
14220 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 5c 6e .SinkhornTransport(reg_e=1e-1)\n
14240 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c ot_sinkhorn.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\
14260 6e 23 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 69 6d 61 67 65 73 20 28 75 73 n#.prediction.between.images.(us
14280 69 6e 67 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 61 6d 70 6c 65 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e 20 61 73 20 ing.out.of.sample.prediction.as.
142a0 69 6e 20 5b 36 5d 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e in.[6])\ntransp_Xs_emd.=.ot_emd.
142c0 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 65 6d 64 20 transform(Xs=X1)\ntransp_Xt_emd.
142e0 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 69 6e 76 65 72 73 65 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 74 3d 58 32 =.ot_emd.inverse_transform(Xt=X2
14300 29 5c 6e 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 )\n\ntransp_Xs_sinkhorn.=.ot_emd
14320 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 73 69 6e .transform(Xs=X1)\ntransp_Xt_sin
14340 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 69 6e 76 65 72 73 65 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d khorn.=.ot_emd.inverse_transform
14360 28 58 74 3d 58 32 29 5c 6e 5c 6e 49 31 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 (Xt=X2)\n\nI1t.=.minmax(mat2im(t
14380 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 49 32 74 20 3d 20 ransp_Xs_emd,.I1.shape))\nI2t.=.
143a0 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 65 6d 64 2c 20 49 32 2e minmax(mat2im(transp_Xt_emd,.I2.
143c0 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 5c 6e 49 31 74 65 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 shape))\n\nI1te.=.minmax(mat2im(
143e0 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e transp_Xs_sinkhorn,.I1.shape))\n
14400 49 32 74 65 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 73 I2te.=.minmax(mat2im(transp_Xt_s
14420 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 inkhorn,.I2.shape))".......],...
14440 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 ....."outputs":.[],........"meta
14460 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 data":.{........."collapsed":.fa
14480 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 lse.......}.....},......{.......
144a0 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 6f 74 20 6f 72 69 67 69 6e "source":.[........."plot.origin
144c0 61 6c 20 69 6d 61 67 65 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 al.image\n######################
144e0 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
14500 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 #######################\n\n"....
14520 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 ...],........"cell_type":."markd
14540 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 own",........"metadata":.{}.....
14560 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 },......{......."execution_count
14580 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f ":.null,........"cell_type":."co
145a0 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 de",........"source":.[.........
145c0 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c "pl.figure(1,.figsize=(6.4,.3))\
145e0 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f n\npl.subplot(1,.2,.1)\npl.imsho
14600 77 28 49 31 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 w(I1)\npl.axis('off')\npl.title(
14620 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 'Image.1')\n\npl.subplot(1,.2,.2
14640 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 )\npl.imshow(I2)\npl.axis('off')
14660 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 \npl.title('Image.2')".......],.
14680 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 ......."outputs":.[],........"me
146a0 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 tadata":.{........."collapsed":.
146c0 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 false.......}.....},......{.....
146e0 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 73 63 61 74 74 65 72 20 70 .."source":.[........."scatter.p
14700 6c 6f 74 20 6f 66 20 63 6f 6c 6f 72 73 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 lot.of.colors\n#################
14720 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
14740 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e ############################\n\n
14760 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 ".......],........"cell_type":."
14780 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d markdown",........"metadata":.{}
147a0 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f .....},......{......."execution_
147c0 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 count":.null,........"cell_type"
147e0 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 :."code",........"source":.[....
14800 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c ....."pl.figure(2,.figsize=(6.4,
14820 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e .3))\n\npl.subplot(1,.2,.1)\npl.
14840 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 73 scatter(Xs[:,.0],.Xs[:,.2],.c=Xs
14860 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 )\npl.axis([0,.1,.0,.1])\npl.xla
14880 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 bel('Red')\npl.ylabel('Blue')\np
148a0 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 l.title('Image.1')\n\npl.subplot
148c0 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 (1,.2,.2)\npl.scatter(Xt[:,.0],.
148e0 58 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 74 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 Xt[:,.2],.c=Xt)\npl.axis([0,.1,.
14900 30 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 0,.1])\npl.xlabel('Red')\npl.yla
14920 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 bel('Blue')\npl.title('Image.2')
14940 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 \npl.tight_layout()".......],...
14960 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 ....."outputs":.[],........"meta
14980 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 data":.{........."collapsed":.fa
149a0 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 lse.......}.....},......{.......
149c0 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 6f 74 20 6e 65 77 20 69 6d "source":.[........."plot.new.im
149e0 61 67 65 73 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ages\n##########################
14a00 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 ################################
14a20 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d ###################\n\n".......]
14a40 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 ,........"cell_type":."markdown"
14a60 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a ,........"metadata":.{}.....},..
14a80 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e ....{......."execution_count":.n
14aa0 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c ull,........"cell_type":."code",
14ac0 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e ........"source":.[........."pl.
14ae0 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e figure(3,.figsize=(8,.4))\n\npl.
14b00 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c subplot(2,.3,.1)\npl.imshow(I1)\
14b20 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 npl.axis('off')\npl.title('Image
14b40 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e .1')\n\npl.subplot(2,.3,.2)\npl.
14b60 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e imshow(I1t)\npl.axis('off')\npl.
14b80 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 title('Image.1.Adapt')\n\npl.sub
14ba0 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 65 29 5c 6e plot(2,.3,.3)\npl.imshow(I1te)\n
14bc0 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 pl.axis('off')\npl.title('Image.
14be0 31 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 1.Adapt.(reg)')\n\npl.subplot(2,
14c00 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 .3,.4)\npl.imshow(I2)\npl.axis('
14c20 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c off')\npl.title('Image.2')\n\npl
14c40 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 .subplot(2,.3,.5)\npl.imshow(I2t
14c60 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 )\npl.axis('off')\npl.title('Ima
14c80 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c ge.2.Adapt')\n\npl.subplot(2,.3,
14ca0 20 36 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 65 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f .6)\npl.imshow(I2te)\npl.axis('o
14cc0 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 20 28 72 ff')\npl.title('Image.2.Adapt.(r
14ce0 65 67 29 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 eg)')\npl.tight_layout()\n\npl.s
14d00 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 how()".......],........"outputs"
14d20 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 :.[],........"metadata":.{......
14d40 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 ..."collapsed":.false.......}...
14d60 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b ..}...],...."metadata":.{....."k
14d80 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d ernelspec":.{......."display_nam
14da0 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 e":."Python.2",........"name":."
14dc0 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 python2",........"language":."py
14de0 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f thon".....},......"language_info
14e00 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 ":.{......."mimetype":."text/x-p
14e20 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 ython",........"nbconvert_export
14e40 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 er":."python",........"name":."p
14e60 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a ython",........"file_extension":
14e80 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 .".py",........"version":."2.7.1
14ea0 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 2",........"pygments_lexer":."ip
14ec0 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 ython2",........"codemirror_mode
14ee0 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 ":.{........."version":.2,......
14f00 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 ...."name":."ipython".......}...
14f20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 02 84 1e 4b 5d 81 39 dd bc 0c 00 ..}...}.}PK.............K].9....
14f40 00 bc 0c 00 00 1c 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 00 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d .......................auto_exam
14f60 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 57 44 41 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 87 ples/plot_WDA.ipynbPK...........
14f80 7b 82 49 fa 8c 13 06 e2 10 00 00 e2 10 00 00 25 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 f6 0c 00 {.I............%................
14fa0 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 .auto_examples/plot_OTDA_mapping
14fc0 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 04 84 1e 4b d9 36 2d b4 9c 09 00 00 9c 09 .ipynbPK.............K.6-.......
14fe0 00 00 24 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 1b 1e 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 ..$.................auto_example
15000 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 70 74 69 6d 5f 4f 54 72 65 67 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 s/plot_optim_OTreg.ipynbPK......
15020 00 00 00 00 76 7b 82 49 50 0d 0a 74 03 0e 00 00 03 0e 00 00 25 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 ....v{.IP..t........%...........
15040 b4 81 f9 27 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 63 6c ...'..auto_examples/plot_OTDA_cl
15060 61 73 73 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 b7 86 1e 4b 6b 88 21 84 aa asses.ipynbPK.............Kk.!..
15080 1d 00 00 aa 1d 00 00 20 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 3f 36 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 .....................?6..auto_ex
150a0 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 64 32 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 amples/plot_otda_d2.ipynbPK.....
150c0 00 00 00 00 00 f4 83 1e 4b 0b 8e f3 56 28 08 00 00 28 08 00 00 1e 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 ........K...V(...(..............
150e0 00 b4 81 27 54 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 2e ...'T..auto_examples/plot_OT_1D.
15100 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 32 82 e3 4a 48 a2 ab 22 f5 14 00 00 f5 14 00 ipynbPK..........2..JH..".......
15120 00 20 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 8b 5c 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 ................\..auto_examples
15140 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 63 6f 6e 76 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 0f /plot_OT_conv.ipynbPK...........
15160 83 1e 4b 06 87 a7 1b 68 0f 00 00 68 0f 00 00 26 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 be 71 00 ..K....h...h...&..............q.
15180 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 31 .auto_examples/plot_barycenter_1
151a0 44 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 9c 86 1e 4b f2 bc 11 4b 08 19 00 00 08 D.ipynbPK.............K...K.....
151c0 19 00 00 25 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 6a 81 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c ...%.............j...auto_exampl
151e0 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6c 61 73 73 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 es/plot_otda_classes.ipynbPK....
15200 14 00 00 00 00 00 0d 88 1e 4b c8 39 53 c8 df 19 00 00 df 19 00 00 33 00 00 00 00 00 00 00 00 00 .........K.9S.........3.........
15220 00 00 b4 81 b5 9a 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f ........auto_examples/plot_otda_
15240 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 63 6f 6c 6f 72 73 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 mapping_colors_images.ipynbPK...
15260 03 14 00 00 00 00 00 6a 7b 82 49 bb fd 13 71 39 0a 00 00 39 0a 00 00 2b 00 00 00 00 00 00 00 00 .......j{.I...q9...9...+........
15280 00 00 00 b4 81 e5 b4 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 64 65 6d 6f 5f 4f 54 5f 32 .........auto_examples/demo_OT_2
152a0 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 6c 61 72 67 65 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 D_sampleslarge.ipynbPK..........
152c0 f6 83 1e 4b 31 52 a0 2f b3 0f 00 00 b3 0f 00 00 24 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 67 bf ...K1R./........$.............g.
152e0 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 4c 31 5f 76 73 5f 4c 32 ..auto_examples/plot_OT_L1_vs_L2
15300 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 a7 85 1e 4b 1c bf a6 e3 bf 0a 00 00 bf 0a .ipynbPK.............K..........
15320 00 00 26 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 5c cf 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 ..&.............\...auto_example
15340 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 s/plot_OT_2D_samples.ipynbPK....
15360 14 00 00 00 00 00 75 7b 82 49 55 d4 67 d2 3c 0e 00 00 3c 0e 00 00 20 00 00 00 00 00 00 00 00 00 ......u{.IU.g.<...<.............
15380 00 00 b4 81 5f da 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f ...._...auto_examples/plot_OTDA_
153a0 32 44 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 b8 86 1e 4b 22 97 a9 c7 5d 18 00 00 2D.ipynbPK.............K"...]...
153c0 5d 18 00 00 25 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 d9 e8 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 ]...%.................auto_examp
153e0 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 les/plot_otda_mapping.ipynbPK...
15400 03 14 00 00 00 00 00 02 84 1e 4b ee 1f 11 06 c2 0a 00 00 c2 0a 00 00 24 00 00 00 00 00 00 00 00 ..........K............$........
15420 00 00 00 b4 81 79 01 01 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6d 70 .....y...auto_examples/plot_comp
15440 75 74 65 5f 65 6d 64 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 6a 7b 82 49 cd 14 1c ute_emd.ipynbPK..........j{.I...
15460 01 46 09 00 00 46 09 00 00 23 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 7d 0c 01 00 61 75 74 6f 5f .F...F...#.............}...auto_
15480 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 64 65 6d 6f 5f 4f 54 5f 31 44 5f 74 65 73 74 2e 69 70 79 6e 62 50 4b examples/demo_OT_1D_test.ipynbPK
154a0 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 86 7b 82 49 4f 22 f2 c8 74 0e 00 00 74 0e 00 00 2a 00 00 00 00 00 ...........{.IO"..t...t...*.....
154c0 00 00 00 00 00 00 b4 81 04 16 01 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f ............auto_examples/plot_O
154e0 54 44 41 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 TDA_color_images.ipynbPK........
15500 00 00 d7 7b 82 49 c4 9e 28 9b ea 11 00 00 ea 11 00 00 32 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 ...{.I..(.........2.............
15520 c0 24 01 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 6d 61 70 70 .$..auto_examples/plot_OTDA_mapp
15540 69 6e 67 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 ing_color_images.ipynbPK........
15560 00 00 34 87 1e 4b ea e0 aa 32 e7 17 00 00 e7 17 00 00 2a 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 ..4..K...2........*.............
15580 fa 36 01 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6f 6c 6f .6..auto_examples/plot_otda_colo
155a0 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 05 06 00 00 00 00 14 00 14 00 85 06 00 00 29 4f r_images.ipynbPK..............)O
155c0 01 00 00 00 ....
generated by cgit v1.2.3 (git 2.39.1) at 2024-06-23 18:21:55 +0000