summaryrefslogtreecommitdiff
path: root/docs/source/auto_examples/auto_examples_jupyter.zip
blob: bba0bee2d444e01951c0ab08bc02175108ab6569 (plain)
ofshex dumpascii
0000 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 4d 4c be 4c 88 ac 62 ba 81 11 00 00 81 11 00 00 11 00 00 00 70 6c PK........ML.L..b.............pl
0020 6f 74 5f 67 72 6f 6d 6f 76 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 ot_gromov.ipynb{..."cells":.[...
0040 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 ..{......."cell_type":."code",..
0060 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 ....."execution_count":.null,...
0080 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 ...."metadata":.{........."colla
00a0 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 psed":.false.......},......."out
00c0 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 puts":.[],......."source":.[....
00e0 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 ....."%matplotlib.inline".......
0100 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 ].....},.....{......."cell_type"
0120 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 :."markdown",......."metadata":.
0140 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c {},......."source":.[........."\
0160 6e 23 20 47 72 6f 6d 6f 76 2d 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 65 78 61 6d 70 6c 65 5c 6e 5c n#.Gromov-Wasserstein.example\n\
0180 6e 5c 6e 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 73 20 64 65 73 69 67 6e 65 64 20 74 6f 20 73 n\nThis.example.is.designed.to.s
01a0 68 6f 77 20 68 6f 77 20 74 6f 20 75 73 65 20 74 68 65 20 47 72 6f 6d 6f 76 2d 57 61 73 73 65 72 how.how.to.use.the.Gromov-Wasser
01c0 74 73 65 69 6e 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 5c 6e 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 69 6e 20 50 tsein.distance\ncomputation.in.P
01e0 4f 54 2e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 OT.\n\n".......].....},.....{...
0200 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 ...."cell_type":."code",......."
0220 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d execution_count":.null,......."m
0240 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a etadata":.{........."collapsed":
0260 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a .false.......},......."outputs":
0280 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 .[],......."source":.[........."
02a0 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 45 72 77 61 6e 20 56 61 75 74 69 65 72 20 3c 65 72 77 61 6e 2e 76 #.Author:.Erwan.Vautier.<erwan.v
02c0 61 75 74 69 65 72 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 5c 6e 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 4e 69 63 autier@gmail.com>\n#.........Nic
02e0 6f 6c 61 73 20 43 6f 75 72 74 79 20 3c 6e 63 6f 75 72 74 79 40 69 72 69 73 61 2e 66 72 3e 5c 6e olas.Courty.<ncourty@irisa.fr>\n
0300 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 #\n#.License:.MIT.License\n\nimp
0320 6f 72 74 20 73 63 69 70 79 20 61 73 20 73 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 ort.scipy.as.sp\nimport.numpy.as
0340 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 .np\nimport.matplotlib.pylab.as.
0360 70 6c 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6d 70 6c 5f 74 6f 6f 6c 6b 69 74 73 2e 6d 70 6c 6f 74 33 64 20 69 6d pl\nfrom.mpl_toolkits.mplot3d.im
0380 70 6f 72 74 20 41 78 65 73 33 44 20 20 23 20 6e 6f 71 61 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 22 0a port.Axes3D..#.noqa\nimport.ot".
03a0 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c ......].....},.....{......."cell
03c0 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 _type":."markdown",......."metad
03e0 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 ata":.{},......."source":.[.....
0400 20 20 20 20 22 53 61 6d 70 6c 65 20 74 77 6f 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 ...."Sample.two.Gaussian.distrib
0420 75 74 69 6f 6e 73 20 28 32 44 20 61 6e 64 20 33 44 29 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d utions.(2D.and.3D)\n------------
0440 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d --------------------------------
0460 2d 5c 6e 5c 6e 54 68 65 20 47 72 6f 6d 6f 76 2d 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 64 69 73 74 -\n\nThe.Gromov-Wasserstein.dist
0480 61 6e 63 65 20 61 6c 6c 6f 77 73 20 74 6f 20 63 6f 6d 70 75 74 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 ance.allows.to.compute.distances
04a0 20 77 69 74 68 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 74 68 61 74 5c 6e 64 6f 20 6e 6f 74 20 62 65 6c 6f 6e .with.samples.that\ndo.not.belon
04c0 67 20 74 6f 20 74 68 65 20 73 61 6d 65 20 6d 65 74 72 69 63 20 73 70 61 63 65 2e 20 46 6f 72 20 g.to.the.same.metric.space..For.
04e0 64 65 6d 6f 6e 73 74 72 61 74 69 6f 6e 20 70 75 72 70 6f 73 65 2c 20 77 65 20 73 61 6d 70 6c 65 demonstration.purpose,.we.sample
0500 5c 6e 74 77 6f 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 69 6e 20 \ntwo.Gaussian.distributions.in.
0520 32 2d 20 61 6e 64 20 33 2d 64 69 6d 65 6e 73 69 6f 6e 61 6c 20 73 70 61 63 65 73 2e 5c 6e 5c 6e 2-.and.3-dimensional.spaces.\n\n
0540 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 ".......].....},.....{......."ce
0560 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 ll_type":."code",......."executi
0580 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 on_count":.null,......."metadata
05a0 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a ":.{........."collapsed":.false.
05c0 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 ......},......."outputs":.[],...
05e0 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 5f 73 61 6d 70 6c ...."source":.[........."n_sampl
0600 65 73 20 3d 20 33 30 20 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 6d 75 5f 73 20 3d 20 es.=.30..#.nb.samples\n\nmu_s.=.
0620 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 30 2c 20 30 5d 29 5c 6e 63 6f 76 5f 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 np.array([0,.0])\ncov_s.=.np.arr
0640 61 79 28 5b 5b 31 2c 20 30 5d 2c 20 5b 30 2c 20 31 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 6d 75 5f 74 20 3d 20 6e ay([[1,.0],.[0,.1]])\n\nmu_t.=.n
0660 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 34 2c 20 34 2c 20 34 5d 29 5c 6e 63 6f 76 5f 74 20 3d 20 6e 70 2e 61 p.array([4,.4,.4])\ncov_t.=.np.a
0680 72 72 61 79 28 5b 5b 31 2c 20 30 2c 20 30 5d 2c 20 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 5d 2c 20 5b 30 2c 20 rray([[1,.0,.0],.[0,.1,.0],.[0,.
06a0 30 2c 20 31 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 78 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 0,.1]])\n\n\nxs.=.ot.datasets.ma
06c0 6b 65 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 67 61 75 73 73 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 6d ke_2D_samples_gauss(n_samples,.m
06e0 75 5f 73 2c 20 63 6f 76 5f 73 29 5c 6e 50 20 3d 20 73 70 2e 6c 69 6e 61 6c 67 2e 73 71 72 74 6d u_s,.cov_s)\nP.=.sp.linalg.sqrtm
0700 28 63 6f 76 5f 74 29 5c 6e 78 74 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 5f (cov_t)\nxt.=.np.random.randn(n_
0720 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 33 29 2e 64 6f 74 28 50 29 20 2b 20 6d 75 5f 74 22 0a 20 20 20 20 20 samples,.3).dot(P).+.mu_t"......
0740 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 .].....},.....{......."cell_type
0760 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a ":."markdown",......."metadata":
0780 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 .{},......."source":.[........."
07a0 50 6c 6f 74 74 69 6e 67 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d Plotting.the.distributions\n----
07c0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 ----------------------\n\n".....
07e0 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 ..].....},.....{......."cell_typ
0800 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 e":."code",......."execution_cou
0820 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 nt":.null,......."metadata":.{..
0840 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 ......."collapsed":.false.......
0860 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 },......."outputs":.[],......."s
0880 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 66 69 67 20 3d 20 70 6c 2e 66 69 67 75 ource":.[........."fig.=.pl.figu
08a0 72 65 28 29 5c 6e 61 78 31 20 3d 20 66 69 67 2e 61 64 64 5f 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 32 31 29 re()\nax1.=.fig.add_subplot(121)
08c0 5c 6e 61 78 31 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 \nax1.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'
08e0 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 61 78 +b',.label='Source.samples')\nax
0900 32 20 3d 20 66 69 67 2e 61 64 64 5f 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 32 32 2c 20 70 72 6f 6a 65 63 74 2.=.fig.add_subplot(122,.project
0920 69 6f 6e 3d 27 33 64 27 29 5c 6e 61 78 32 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c ion='3d')\nax2.scatter(xt[:,.0],
0940 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 72 27 29 5c .xt[:,.1],.xt[:,.2],.color='r')\
0960 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b npl.show()".......].....},.....{
0980 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a ......."cell_type":."markdown",.
09a0 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 ......"metadata":.{},......."sou
09c0 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 rce":.[........."Compute.distanc
09e0 65 20 6b 65 72 6e 65 6c 73 2c 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 65 20 74 68 65 6d 20 61 6e 64 20 74 68 e.kernels,.normalize.them.and.th
0a00 65 6e 20 64 69 73 70 6c 61 79 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d en.display\n--------------------
0a20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d --------------------------------
0a40 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a -----\n\n".......].....},.....{.
0a60 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 ......"cell_type":."code",......
0a80 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 ."execution_count":.null,.......
0aa0 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 "metadata":.{........."collapsed
0ac0 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 ":.false.......},......."outputs
0ae0 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 ":.[],......."source":.[........
0b00 20 22 43 31 20 3d 20 73 70 2e 73 70 61 74 69 61 6c 2e 64 69 73 74 61 6e 63 65 2e 63 64 69 73 74 ."C1.=.sp.spatial.distance.cdist
0b20 28 78 73 2c 20 78 73 29 5c 6e 43 32 20 3d 20 73 70 2e 73 70 61 74 69 61 6c 2e 64 69 73 74 61 6e (xs,.xs)\nC2.=.sp.spatial.distan
0b40 63 65 2e 63 64 69 73 74 28 78 74 2c 20 78 74 29 5c 6e 5c 6e 43 31 20 2f 3d 20 43 31 2e 6d 61 78 ce.cdist(xt,.xt)\n\nC1./=.C1.max
0b60 28 29 5c 6e 43 32 20 2f 3d 20 43 32 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 ()\nC2./=.C2.max()\n\npl.figure(
0b80 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 32 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 43 31 )\npl.subplot(121)\npl.imshow(C1
0ba0 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 32 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 43 32 )\npl.subplot(122)\npl.imshow(C2
0bc0 29 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 )\npl.show()".......].....},....
0be0 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 .{......."cell_type":."markdown"
0c00 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 ,......."metadata":.{},......."s
0c20 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 47 72 6f 6d 6f ource":.[........."Compute.Gromo
0c40 76 2d 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 70 6c 61 6e 73 20 61 6e 64 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 v-Wasserstein.plans.and.distance
0c60 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d \n------------------------------
0c80 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 ---------------\n\n".......]....
0ca0 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f .},.....{......."cell_type":."co
0cc0 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 de",......."execution_count":.nu
0ce0 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 ll,......."metadata":.{.........
0d00 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 "collapsed":.false.......},.....
0d20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a .."outputs":.[],......."source":
0d40 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 .[........."p.=.ot.unif(n_sample
0d60 73 29 5c 6e 71 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 29 5c 6e 5c 6e 67 77 s)\nq.=.ot.unif(n_samples)\n\ngw
0d80 30 2c 20 6c 6f 67 30 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 77 61 73 73 65 0,.log0.=.ot.gromov.gromov_wasse
0da0 72 73 74 65 69 6e 28 5c 6e 20 20 20 20 43 31 2c 20 43 32 2c 20 70 2c 20 71 2c 20 27 73 71 75 61 rstein(\n....C1,.C2,.p,.q,.'squa
0dc0 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 2c 20 6c 6f 67 3d 54 72 75 65 re_loss',.verbose=True,.log=True
0de0 29 5c 6e 5c 6e 67 77 2c 20 6c 6f 67 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 65 6e 74 72 6f 70 69 )\n\ngw,.log.=.ot.gromov.entropi
0e00 63 5f 67 72 6f 6d 6f 76 5f 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 28 5c 6e 20 20 20 20 43 31 2c 20 43 c_gromov_wasserstein(\n....C1,.C
0e20 32 2c 20 70 2c 20 71 2c 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 65 70 73 69 6c 6f 6e 3d 2,.p,.q,.'square_loss',.epsilon=
0e40 35 65 2d 34 2c 20 6c 6f 67 3d 54 72 75 65 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 5e-4,.log=True,.verbose=True)\n\
0e60 6e 5c 6e 70 72 69 6e 74 28 27 47 72 6f 6d 6f 76 2d 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 64 69 73 n\nprint('Gromov-Wasserstein.dis
0e80 74 61 6e 63 65 73 3a 20 27 20 2b 20 73 74 72 28 6c 6f 67 30 5b 27 67 77 5f 64 69 73 74 27 5d 29 tances:.'.+.str(log0['gw_dist'])
0ea0 29 5c 6e 70 72 69 6e 74 28 27 45 6e 74 72 6f 70 69 63 20 47 72 6f 6d 6f 76 2d 57 61 73 73 65 72 )\nprint('Entropic.Gromov-Wasser
0ec0 73 74 65 69 6e 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 3a 20 27 20 2b 20 73 74 72 28 6c 6f 67 5b 27 67 77 stein.distances:.'.+.str(log['gw
0ee0 5f 64 69 73 74 27 5d 29 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 28 31 30 2c _dist']))\n\n\npl.figure(1,.(10,
0f00 20 35 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e .5))\n\npl.subplot(1,.2,.1)\npl.
0f20 69 6d 73 68 6f 77 28 67 77 30 2c 20 63 6d 61 70 3d 27 6a 65 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c imshow(gw0,.cmap='jet')\npl.titl
0f40 65 28 27 47 72 6f 6d 6f 76 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 e('Gromov.Wasserstein')\n\npl.su
0f60 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 67 77 2c 20 63 6d bplot(1,.2,.2)\npl.imshow(gw,.cm
0f80 61 70 3d 27 6a 65 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 6e 74 72 6f 70 69 63 20 47 72 ap='jet')\npl.title('Entropic.Gr
0fa0 6f 6d 6f 76 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 omov.Wasserstein')\n\npl.show()"
0fc0 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 .......].....}...],..."metadata"
0fe0 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 :.{....."kernelspec":.{......."d
1000 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 isplay_name":."Python.3",.......
1020 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d "language":."python",......."nam
1040 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 33 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 e":."python3".....},....."langua
1060 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f ge_info":.{......."codemirror_mo
1080 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 de":.{........."name":."ipython"
10a0 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 33 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a ,........."version":.3.......},.
10c0 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 0a 20 ......"file_extension":.".py",..
10e0 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 ....."mimetype":."text/x-python"
1100 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 ,......."name":."python",.......
1120 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a "nbconvert_exporter":."python",.
1140 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e ......"pygments_lexer":."ipython
1160 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 33 2e 36 2e 35 22 0a 20 20 20 3",......."version":."3.6.5"....
1180 20 7d 0a 20 20 7d 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f .}...},..."nbformat":.4,..."nbfo
11a0 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 a7 6e a2 4c ae 38 rmat_minor":.0.}PK.........n.L.8
11c0 61 57 26 14 00 00 26 14 00 00 0e 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 57 44 41 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 aW&...&.......plot_WDA.ipynb{...
11e0 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 "nbformat_minor":.0,...."nbforma
1200 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 t":.4,...."cells":.[.....{......
1220 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ."execution_count":.null,.......
1240 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f ."cell_type":."code",........"so
1260 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e urce":.[........."%matplotlib.in
1280 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a line".......],........"outputs":
12a0 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 .[],........"metadata":.{.......
12c0 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 .."collapsed":.false.......}....
12e0 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 .},......{......."source":.[....
1300 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 44 69 73 63 72 69 6d 69 6e 61 ....."\n#.Wasserstein.Discrimina
1320 6e 74 20 41 6e 61 6c 79 73 69 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6c nt.Analysis\n\n\nThis.example.il
1340 6c 75 73 74 72 61 74 65 20 74 68 65 20 75 73 65 20 6f 66 20 57 44 41 20 61 73 20 70 72 6f 70 6f lustrate.the.use.of.WDA.as.propo
1360 73 65 64 20 69 6e 20 5b 31 31 5d 2e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5b 31 31 5d 20 46 6c 61 6d 61 72 79 2c 20 sed.in.[11].\n\n\n[11].Flamary,.
1380 52 2e 2c 20 43 75 74 75 72 69 2c 20 4d 2e 2c 20 43 6f 75 72 74 79 2c 20 4e 2e 2c 20 26 20 52 61 R.,.Cuturi,.M.,.Courty,.N.,.&.Ra
13a0 6b 6f 74 6f 6d 61 6d 6f 6e 6a 79 2c 20 41 2e 20 28 32 30 31 36 29 2e 5c 6e 57 61 73 73 65 72 73 kotomamonjy,.A..(2016).\nWassers
13c0 74 65 69 6e 20 44 69 73 63 72 69 6d 69 6e 61 6e 74 20 41 6e 61 6c 79 73 69 73 2e 5c 6e 5c 6e 5c tein.Discriminant.Analysis.\n\n\
13e0 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 n".......],........"cell_type":.
1400 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b "markdown",........"metadata":.{
1420 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e }.....},......{......."execution
1440 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 _count":.null,........"cell_type
1460 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 ":."code",........"source":.[...
1480 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 ......"#.Author:.Remi.Flamary.<r
14a0 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 emi.flamary@unice.fr>\n#\n#.Lice
14c0 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 nse:.MIT.License\n\nimport.numpy
14e0 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 .as.np\nimport.matplotlib.pylab.
1500 61 73 20 70 6c 5c 6e 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6f 74 2e 64 72 20 69 6d 70 6f 72 74 20 77 64 61 2c 20 as.pl\n\nfrom.ot.dr.import.wda,.
1520 66 64 61 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 fda".......],........"outputs":.
1540 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 [],........"metadata":.{........
1560 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 ."collapsed":.false.......}.....
1580 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 },......{......."source":.[.....
15a0 20 20 20 20 22 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d ...."Generate.data\n------------
15c0 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 -\n\n".......],........"cell_typ
15e0 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 e":."markdown",........"metadata
1600 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 ":.{}.....},......{......."execu
1620 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f tion_count":.null,........"cell_
1640 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 type":."code",........"source":.
1660 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 20 3d [........."#%%.parameters\n\nn.=
1680 20 31 30 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 69 6e 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e .1000..#.nb.samples.in.source.an
16a0 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 61 74 61 73 65 74 73 5c 6e 6e 7a 20 3d 20 30 2e 32 5c 6e 5c 6e 23 d.target.datasets\nnz.=.0.2\n\n#
16c0 20 67 65 6e 65 72 61 74 65 20 63 69 72 63 6c 65 20 64 61 74 61 73 65 74 5c 6e 74 20 3d 20 6e 70 .generate.circle.dataset\nt.=.np
16e0 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 28 6e 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 5c 6e 79 73 20 .random.rand(n).*.2.*.np.pi\nys.
1700 3d 20 6e 70 2e 66 6c 6f 6f 72 28 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2a 20 31 2e 30 20 2f =.np.floor((np.arange(n).*.1.0./
1720 20 6e 20 2a 20 33 29 29 20 2b 20 31 5c 6e 78 73 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 6e 63 61 74 65 6e 61 74 .n.*.3)).+.1\nxs.=.np.concatenat
1740 65 28 5c 6e 20 20 20 20 28 6e 70 2e 63 6f 73 28 74 29 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 20 e(\n....(np.cos(t).reshape((-1,.
1760 31 29 29 2c 20 6e 70 2e 73 69 6e 28 74 29 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 29 1)),.np.sin(t).reshape((-1,.1)))
1780 2c 20 31 29 5c 6e 78 73 20 3d 20 78 73 20 2a 20 79 73 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 2d 31 2c 20 31 ,.1)\nxs.=.xs.*.ys.reshape(-1,.1
17a0 29 20 2b 20 6e 7a 20 2a 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c 20 32 29 5c 6e ).+.nz.*.np.random.randn(n,.2)\n
17c0 5c 6e 74 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 28 6e 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 \nt.=.np.random.rand(n).*.2.*.np
17e0 2e 70 69 5c 6e 79 74 20 3d 20 6e 70 2e 66 6c 6f 6f 72 28 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 .pi\nyt.=.np.floor((np.arange(n)
1800 20 2a 20 31 2e 30 20 2f 20 6e 20 2a 20 33 29 29 20 2b 20 31 5c 6e 78 74 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f .*.1.0./.n.*.3)).+.1\nxt.=.np.co
1820 6e 63 61 74 65 6e 61 74 65 28 5c 6e 20 20 20 20 28 6e 70 2e 63 6f 73 28 74 29 2e 72 65 73 68 61 ncatenate(\n....(np.cos(t).resha
1840 70 65 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 2c 20 6e 70 2e 73 69 6e 28 74 29 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 pe((-1,.1)),.np.sin(t).reshape((
1860 2d 31 2c 20 31 29 29 29 2c 20 31 29 5c 6e 78 74 20 3d 20 78 74 20 2a 20 79 74 2e 72 65 73 68 61 -1,.1))),.1)\nxt.=.xt.*.yt.resha
1880 70 65 28 2d 31 2c 20 31 29 20 2b 20 6e 7a 20 2a 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e pe(-1,.1).+.nz.*.np.random.randn
18a0 28 6e 2c 20 32 29 5c 6e 5c 6e 6e 62 6e 6f 69 73 65 20 3d 20 38 5c 6e 5c 6e 78 73 20 3d 20 6e 70 (n,.2)\n\nnbnoise.=.8\n\nxs.=.np
18c0 2e 68 73 74 61 63 6b 28 28 78 73 2c 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c 20 .hstack((xs,.np.random.randn(n,.
18e0 6e 62 6e 6f 69 73 65 29 29 29 5c 6e 78 74 20 3d 20 6e 70 2e 68 73 74 61 63 6b 28 28 78 74 2c 20 nbnoise)))\nxt.=.np.hstack((xt,.
1900 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c 20 6e 62 6e 6f 69 73 65 29 29 29 22 0a 20 np.random.randn(n,.nbnoise)))"..
1920 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 .....],........"outputs":.[],...
1940 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c ....."metadata":.{........."coll
1960 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 apsed":.false.......}.....},....
1980 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 ..{......."source":.[........."P
19a0 6c 6f 74 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d lot.data\n---------\n\n".......]
19c0 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 ,........"cell_type":."markdown"
19e0 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a ,........"metadata":.{}.....},..
1a00 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e ....{......."execution_count":.n
1a20 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c ull,........"cell_type":."code",
1a40 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 ........"source":.[........."#%%
1a60 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 .plot.samples\npl.figure(1,.figs
1a80 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 2e 35 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c ize=(6.4,.3.5))\n\npl.subplot(1,
1aa0 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b .2,.1)\npl.scatter(xt[:,.0],.xt[
1ac0 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 :,.1],.c=ys,.marker='+',.label='
1ae0 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d Source.samples')\npl.legend(loc=
1b00 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 63 72 69 6d 69 6e 61 6e 74 20 64 69 6d 65 6e 0)\npl.title('Discriminant.dimen
1b20 73 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e sions')\n\npl.subplot(1,.2,.2)\n
1b40 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 33 5d 2c 20 63 pl.scatter(xt[:,.2],.xt[:,.3],.c
1b60 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 =ys,.marker='+',.label='Source.s
1b80 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 amples')\npl.legend(loc=0)\npl.t
1ba0 69 74 6c 65 28 27 4f 74 68 65 72 20 64 69 6d 65 6e 73 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 itle('Other.dimensions')\npl.tig
1bc0 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 ht_layout()".......],........"ou
1be0 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b tputs":.[],........"metadata":.{
1c00 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 ........."collapsed":.false.....
1c20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 ..}.....},......{......."source"
1c40 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 46 69 73 68 65 72 20 44 69 73 63 :.[........."Compute.Fisher.Disc
1c60 72 69 6d 69 6e 61 6e 74 20 41 6e 61 6c 79 73 69 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d riminant.Analysis\n-------------
1c80 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 -----------------------\n\n"....
1ca0 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 ...],........"cell_type":."markd
1cc0 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 own",........"metadata":.{}.....
1ce0 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 },......{......."execution_count
1d00 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f ":.null,........"cell_type":."co
1d20 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 de",........"source":.[.........
1d40 22 23 25 25 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 46 44 41 5c 6e 70 20 3d 20 32 5c 6e 5c 6e 50 66 64 61 2c "#%%.Compute.FDA\np.=.2\n\nPfda,
1d60 20 70 72 6f 6a 66 64 61 20 3d 20 66 64 61 28 78 73 2c 20 79 73 2c 20 70 29 22 0a 20 20 20 20 20 .projfda.=.fda(xs,.ys,.p)"......
1d80 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 .],........"outputs":.[],.......
1da0 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 ."metadata":.{........."collapse
1dc0 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a d":.false.......}.....},......{.
1de0 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 43 6f 6d 70 75 ......"source":.[........."Compu
1e00 74 65 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 44 69 73 63 72 69 6d 69 6e 61 6e 74 20 41 6e 61 6c te.Wasserstein.Discriminant.Anal
1e20 79 73 69 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d ysis\n--------------------------
1e40 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 ---------------\n\n".......],...
1e60 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 ....."cell_type":."markdown",...
1e80 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 ....."metadata":.{}.....},......
1ea0 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c {......."execution_count":.null,
1ec0 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 ........"cell_type":."code",....
1ee0 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 43 6f 6d ...."source":.[........."#%%.Com
1f00 70 75 74 65 20 57 44 41 5c 6e 70 20 3d 20 32 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 30 5c 6e 6b 20 3d 20 pute.WDA\np.=.2\nreg.=.1e0\nk.=.
1f20 31 30 5c 6e 6d 61 78 69 74 65 72 20 3d 20 31 30 30 5c 6e 5c 6e 50 77 64 61 2c 20 70 72 6f 6a 77 10\nmaxiter.=.100\n\nPwda,.projw
1f40 64 61 20 3d 20 77 64 61 28 78 73 2c 20 79 73 2c 20 70 2c 20 72 65 67 2c 20 6b 2c 20 6d 61 78 69 da.=.wda(xs,.ys,.p,.reg,.k,.maxi
1f60 74 65 72 3d 6d 61 78 69 74 65 72 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f ter=maxiter)".......],........"o
1f80 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 utputs":.[],........"metadata":.
1fa0 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 {........."collapsed":.false....
1fc0 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 ...}.....},......{......."source
1fe0 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 32 44 20 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e ":.[........."Plot.2D.projection
2000 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 s\n-------------------\n\n".....
2020 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f ..],........"cell_type":."markdo
2040 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d wn",........"metadata":.{}.....}
2060 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 ,......{......."execution_count"
2080 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 :.null,........"cell_type":."cod
20a0 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 e",........"source":.[........."
20c0 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 78 73 70 20 3d 20 70 72 6f 6a 66 64 #%%.plot.samples\n\nxsp.=.projfd
20e0 61 28 78 73 29 5c 6e 78 74 70 20 3d 20 70 72 6f 6a 66 64 61 28 78 74 29 5c 6e 5c 6e 78 73 70 77 a(xs)\nxtp.=.projfda(xt)\n\nxspw
2100 20 3d 20 70 72 6f 6a 77 64 61 28 78 73 29 5c 6e 78 74 70 77 20 3d 20 70 72 6f 6a 77 64 61 28 78 .=.projwda(xs)\nxtpw.=.projwda(x
2120 74 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 t)\n\npl.figure(2)\n\npl.subplot
2140 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 70 5b 3a 2c 20 30 5d 2c (2,.2,.1)\npl.scatter(xsp[:,.0],
2160 20 78 73 70 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 .xsp[:,.1],.c=ys,.marker='+',.la
2180 62 65 6c 3d 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 bel='Projected.samples')\npl.leg
21a0 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 end(loc=0)\npl.title('Projected.
21c0 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 46 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 training.samples.FDA')\n\npl.sub
21e0 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 70 5b 3a 2c plot(2,.2,.2)\npl.scatter(xtp[:,
2200 20 30 5d 2c 20 78 74 70 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 .0],.xtp[:,.1],.c=ys,.marker='+'
2220 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c ,.label='Projected.samples')\npl
2240 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 72 6f 6a 65 63 .legend(loc=0)\npl.title('Projec
2260 74 65 64 20 74 65 73 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 46 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 ted.test.samples.FDA')\n\npl.sub
2280 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 70 77 5b 3a plot(2,.2,.3)\npl.scatter(xspw[:
22a0 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 70 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 ,.0],.xspw[:,.1],.c=ys,.marker='
22c0 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e +',.label='Projected.samples')\n
22e0 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 72 6f 6a pl.legend(loc=0)\npl.title('Proj
2300 65 63 74 65 64 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 57 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e ected.training.samples.WDA')\n\n
2320 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 pl.subplot(2,.2,.4)\npl.scatter(
2340 78 74 70 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 70 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 xtpw[:,.0],.xtpw[:,.1],.c=ys,.ma
2360 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c rker='+',.label='Projected.sampl
2380 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 es')\npl.legend(loc=0)\npl.title
23a0 28 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 74 65 73 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 57 44 41 27 29 5c 6e ('Projected.test.samples.WDA')\n
23c0 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a pl.tight_layout()\n\npl.show()".
23e0 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a ......],........"outputs":.[],..
2400 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c ......"metadata":.{........."col
2420 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d lapsed":.false.......}.....}...]
2440 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 ,...."metadata":.{....."kernelsp
2460 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 ec":.{......."display_name":."Py
2480 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 thon.2",........"name":."python2
24a0 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 ",........"language":."python"..
24c0 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 ...},......"language_info":.{...
24e0 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c ...."mimetype":."text/x-python",
2500 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 ........"nbconvert_exporter":."p
2520 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c ython",........"name":."python",
2540 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c ........"file_extension":.".py",
2560 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 ........"version":."2.7.12",....
2580 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 ...."pygments_lexer":."ipython2"
25a0 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 ,........"codemirror_mode":.{...
25c0 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 ......"version":.2,.........."na
25e0 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d me":."ipython".......}.....}...}
2600 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 18 7f a2 4c aa d3 d6 af 27 23 00 00 27 23 00 00 1c 00 00 00 .}PK...........L....'#..'#......
2620 70 6c 6f 74 5f 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 plot_gromov_barycenter.ipynb{...
2640 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f "cells":.[.....{......."executio
2660 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 n_count":.null,......."metadata"
2680 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 :.{........."collapsed":.false..
26a0 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 .....},......."outputs":.[],....
26c0 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 ..."source":.[........."%matplot
26e0 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c lib.inline".......],......."cell
2700 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 _type":."code".....},.....{.....
2720 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 .."metadata":.{},......."source"
2740 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 47 72 6f 6d 6f 76 2d 57 61 73 73 65 72 73 74 :.[........."\n#.Gromov-Wasserst
2760 65 69 6e 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 65 78 61 6d 70 6c 65 5c 6e 5c 6e 5c 6e 54 68 69 73 ein.Barycenter.example\n\n\nThis
2780 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 73 20 64 65 73 69 67 6e 65 64 20 74 6f 20 73 68 6f 77 20 68 6f 77 .example.is.designed.to.show.how
27a0 20 74 6f 20 75 73 65 20 74 68 65 20 47 72 6f 6d 6f 76 2d 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 64 .to.use.the.Gromov-Wasserstein.d
27c0 69 73 74 61 6e 63 65 5c 6e 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 69 6e 20 50 4f 54 2e 5c 6e 5c 6e istance\ncomputation.in.POT.\n\n
27e0 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d ".......],......."cell_type":."m
2800 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 arkdown".....},.....{......."exe
2820 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 cution_count":.null,......."meta
2840 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 data":.{........."collapsed":.fa
2860 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d lse.......},......."outputs":.[]
2880 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 ,......."source":.[........."#.A
28a0 75 74 68 6f 72 3a 20 45 72 77 61 6e 20 56 61 75 74 69 65 72 20 3c 65 72 77 61 6e 2e 76 61 75 74 uthor:.Erwan.Vautier.<erwan.vaut
28c0 69 65 72 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 5c 6e 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 4e 69 63 6f 6c 61 ier@gmail.com>\n#.........Nicola
28e0 73 20 43 6f 75 72 74 79 20 3c 6e 63 6f 75 72 74 79 40 69 72 69 73 61 2e 66 72 3e 5c 6e 23 5c 6e s.Courty.<ncourty@irisa.fr>\n#\n
2900 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f #.License:.MIT.License\n\n\nimpo
2920 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 73 63 69 70 79 20 61 73 20 rt.numpy.as.np\nimport.scipy.as.
2940 73 70 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 73 63 69 70 79 2e 6e 64 69 6d 61 67 65 20 61 73 20 73 70 sp\n\nimport.scipy.ndimage.as.sp
2960 69 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c i\nimport.matplotlib.pylab.as.pl
2980 5c 6e 66 72 6f 6d 20 73 6b 6c 65 61 72 6e 20 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 6e 69 66 6f 6c 64 5c 6e \nfrom.sklearn.import.manifold\n
29a0 66 72 6f 6d 20 73 6b 6c 65 61 72 6e 2e 64 65 63 6f 6d 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 20 69 6d 70 6f 72 from.sklearn.decomposition.impor
29c0 74 20 50 43 41 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 0a 20 20 20 t.PCA\n\nimport.ot".......],....
29e0 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 ..."cell_type":."code".....},...
2a00 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 ..{......."metadata":.{},.......
2a20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 53 6d 61 63 6f 66 20 4d 44 53 5c "source":.[........."Smacof.MDS\
2a40 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 54 68 69 73 20 66 75 6e 63 74 69 6f 6e 20 61 6c 6c n----------\n\nThis.function.all
2a60 6f 77 73 20 74 6f 20 66 69 6e 64 20 61 6e 20 65 6d 62 65 64 64 69 6e 67 20 6f 66 20 70 6f 69 6e ows.to.find.an.embedding.of.poin
2a80 74 73 20 67 69 76 65 6e 20 61 20 64 69 73 73 69 6d 69 6c 61 72 69 74 79 20 6d 61 74 72 69 78 5c ts.given.a.dissimilarity.matrix\
2aa0 6e 74 68 61 74 20 77 69 6c 6c 20 62 65 20 67 69 76 65 6e 20 62 79 20 74 68 65 20 6f 75 74 70 75 nthat.will.be.given.by.the.outpu
2ac0 74 20 6f 66 20 74 68 65 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c t.of.the.algorithm\n\n".......],
2ae0 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 0a 20 ......."cell_type":."markdown"..
2b00 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 ...},.....{......."execution_cou
2b20 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 nt":.null,......."metadata":.{..
2b40 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 ......."collapsed":.false.......
2b60 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 },......."outputs":.[],......."s
2b80 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 64 65 66 20 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 ource":.[........."def.smacof_md
2ba0 73 28 43 2c 20 64 69 6d 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 33 30 30 30 2c 20 65 70 73 3d 31 65 2d s(C,.dim,.max_iter=3000,.eps=1e-
2bc0 39 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 52 65 74 75 72 6e 73 20 61 6e 20 9):\n....\"\"\"\n....Returns.an.
2be0 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 65 64 20 70 6f 69 6e 74 20 63 6c 6f 75 64 20 66 6f 6c 6c 6f 77 69 interpolated.point.cloud.followi
2c00 6e 67 20 74 68 65 20 64 69 73 73 69 6d 69 6c 61 72 69 74 79 20 6d 61 74 72 69 78 20 43 5c 6e 20 ng.the.dissimilarity.matrix.C\n.
2c20 20 20 20 75 73 69 6e 67 20 53 4d 41 43 4f 46 20 6d 75 6c 74 69 64 69 6d 65 6e 73 69 6f 6e 61 6c ...using.SMACOF.multidimensional
2c40 20 73 63 61 6c 69 6e 67 20 28 4d 44 53 29 20 69 6e 20 73 70 65 63 69 66 69 63 20 64 69 6d 65 6e .scaling.(MDS).in.specific.dimen
2c60 73 69 6f 6e 6e 65 64 5c 6e 20 20 20 20 74 61 72 67 65 74 20 73 70 61 63 65 5c 6e 5c 6e 20 20 20 sionned\n....target.space\n\n...
2c80 20 50 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 20 20 20 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 20 20 20 .Parameters\n....----------\n...
2ca0 20 43 20 3a 20 6e 64 61 72 72 61 79 2c 20 73 68 61 70 65 20 28 6e 73 2c 20 6e 73 29 5c 6e 20 20 .C.:.ndarray,.shape.(ns,.ns)\n..
2cc0 20 20 20 20 20 20 64 69 73 73 69 6d 69 6c 61 72 69 74 79 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 20 20 20 20 ......dissimilarity.matrix\n....
2ce0 64 69 6d 20 3a 20 69 6e 74 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 64 69 6d 65 6e 73 69 6f 6e 20 6f dim.:.int\n..........dimension.o
2d00 66 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 65 64 20 73 70 61 63 65 5c 6e 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 f.the.targeted.space\n....max_it
2d20 65 72 20 3a 20 20 69 6e 74 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 4d 61 78 69 6d 75 6d 20 6e 75 6d 62 65 er.:..int\n........Maximum.numbe
2d40 72 20 6f 66 20 69 74 65 72 61 74 69 6f 6e 73 20 6f 66 20 74 68 65 20 53 4d 41 43 4f 46 20 61 6c r.of.iterations.of.the.SMACOF.al
2d60 67 6f 72 69 74 68 6d 20 66 6f 72 20 61 20 73 69 6e 67 6c 65 20 72 75 6e 5c 6e 20 20 20 20 65 70 gorithm.for.a.single.run\n....ep
2d80 73 20 3a 20 66 6c 6f 61 74 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 72 65 6c 61 74 69 76 65 20 74 6f 6c 65 s.:.float\n........relative.tole
2da0 72 61 6e 63 65 20 77 2e 72 2e 74 20 73 74 72 65 73 73 20 74 6f 20 64 65 63 6c 61 72 65 20 63 6f rance.w.r.t.stress.to.declare.co
2dc0 6e 76 65 72 67 65 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 52 65 74 75 72 6e 73 5c 6e 20 20 20 20 2d 2d 2d 2d 2d nverge\n\n....Returns\n....-----
2de0 2d 2d 5c 6e 20 20 20 20 6e 70 6f 73 20 3a 20 6e 64 61 72 72 61 79 2c 20 73 68 61 70 65 20 28 52 --\n....npos.:.ndarray,.shape.(R
2e00 2c 20 64 69 6d 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 45 6d 62 65 64 64 65 64 20 63 6f 6f 72 ,.dim)\n...........Embedded.coor
2e20 64 69 6e 61 74 65 73 20 6f 66 20 74 68 65 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 65 64 20 70 6f 69 6e dinates.of.the.interpolated.poin
2e40 74 20 63 6c 6f 75 64 20 28 64 65 66 69 6e 65 64 20 77 69 74 68 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 t.cloud.(defined.with\n.........
2e60 20 20 6f 6e 65 20 69 73 6f 6d 65 74 72 79 29 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 5c 6e 20 ..one.isometry)\n....\"\"\"\n\n.
2e80 20 20 20 72 6e 67 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 52 61 6e 64 6f 6d 53 74 61 74 65 28 73 ...rng.=.np.random.RandomState(s
2ea0 65 65 64 3d 33 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 6d 64 73 20 3d 20 6d 61 6e 69 66 6f 6c 64 2e 4d 44 53 eed=3)\n\n....mds.=.manifold.MDS
2ec0 28 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 64 69 6d 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 (\n........dim,\n........max_ite
2ee0 72 3d 6d 61 78 5f 69 74 65 72 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 65 70 73 3d 31 65 2d 39 2c 5c 6e r=max_iter,\n........eps=1e-9,\n
2f00 20 20 20 20 20 20 20 20 64 69 73 73 69 6d 69 6c 61 72 69 74 79 3d 27 70 72 65 63 6f 6d 70 75 74 ........dissimilarity='precomput
2f20 65 64 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 5f 69 6e 69 74 3d 31 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6f 73 ed',\n........n_init=1)\n....pos
2f40 20 3d 20 6d 64 73 2e 66 69 74 28 43 29 2e 65 6d 62 65 64 64 69 6e 67 5f 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 .=.mds.fit(C).embedding_\n\n....
2f60 6e 6d 64 73 20 3d 20 6d 61 6e 69 66 6f 6c 64 2e 4d 44 53 28 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 32 2c nmds.=.manifold.MDS(\n........2,
2f80 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 6d 61 78 5f 69 74 65 72 2c 5c 6e 20 20 \n........max_iter=max_iter,\n..
2fa0 20 20 20 20 20 20 65 70 73 3d 31 65 2d 39 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 64 69 73 73 69 6d 69 ......eps=1e-9,\n........dissimi
2fc0 6c 61 72 69 74 79 3d 5c 22 70 72 65 63 6f 6d 70 75 74 65 64 5c 22 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 larity=\"precomputed\",\n.......
2fe0 20 72 61 6e 64 6f 6d 5f 73 74 61 74 65 3d 72 6e 67 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 5f 69 6e .random_state=rng,\n........n_in
3000 69 74 3d 31 29 5c 6e 20 20 20 20 6e 70 6f 73 20 3d 20 6e 6d 64 73 2e 66 69 74 5f 74 72 61 6e 73 it=1)\n....npos.=.nmds.fit_trans
3020 66 6f 72 6d 28 43 2c 20 69 6e 69 74 3d 70 6f 73 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 form(C,.init=pos)\n\n....return.
3040 6e 70 6f 73 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 npos".......],......."cell_type"
3060 3a 20 22 63 6f 64 65 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 :."code".....},.....{......."met
3080 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 adata":.{},......."source":.[...
30a0 20 20 20 20 20 20 22 44 61 74 61 20 70 72 65 70 61 72 61 74 69 6f 6e 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d ......"Data.preparation\n-------
30c0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 54 68 65 20 66 6f 75 72 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 ---------\n\nThe.four.distributi
30e0 6f 6e 73 20 61 72 65 20 63 6f 6e 73 74 72 75 63 74 65 64 20 66 72 6f 6d 20 34 20 73 69 6d 70 6c ons.are.constructed.from.4.simpl
3100 65 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 e.images\n\n".......],......."ce
3120 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 ll_type":."markdown".....},.....
3140 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c {......."execution_count":.null,
3160 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f ......."metadata":.{........."co
3180 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 llapsed":.false.......},......."
31a0 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a outputs":.[],......."source":.[.
31c0 20 20 20 20 20 20 20 20 22 64 65 66 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c ........"def.im2mat(I):\n....\"\
31e0 22 5c 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 61 6e 64 20 69 6d 61 67 65 20 74 6f 20 6d 61 74 72 69 78 20 "\"Converts.and.image.to.matrix.
3200 28 6f 6e 65 20 70 69 78 65 6c 20 70 65 72 20 6c 69 6e 65 29 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 (one.pixel.per.line)\"\"\"\n....
3220 72 65 74 75 72 6e 20 49 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 49 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 20 2a 20 49 return.I.reshape((I.shape[0].*.I
3240 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 32 5d 29 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 73 71 75 .shape[1],.I.shape[2]))\n\n\nsqu
3260 61 72 65 20 3d 20 73 70 69 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 73 71 75 61 72 65 are.=.spi.imread('../data/square
3280 2e 70 6e 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5b 3a 2c 20 3a 2c 20 .png').astype(np.float64)[:,.:,.
32a0 32 5d 20 2f 20 32 35 36 5c 6e 63 72 6f 73 73 20 3d 20 73 70 69 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2]./.256\ncross.=.spi.imread('..
32c0 2f 64 61 74 61 2f 63 72 6f 73 73 2e 70 6e 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 /data/cross.png').astype(np.floa
32e0 74 36 34 29 5b 3a 2c 20 3a 2c 20 32 5d 20 2f 20 32 35 36 5c 6e 74 72 69 61 6e 67 6c 65 20 3d 20 t64)[:,.:,.2]./.256\ntriangle.=.
3300 73 70 69 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 74 72 69 61 6e 67 6c 65 2e 70 6e 67 spi.imread('../data/triangle.png
3320 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5b 3a 2c 20 3a 2c 20 32 5d 20 2f ').astype(np.float64)[:,.:,.2]./
3340 20 32 35 36 5c 6e 73 74 61 72 20 3d 20 73 70 69 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 .256\nstar.=.spi.imread('../data
3360 2f 73 74 61 72 2e 70 6e 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5b 3a /star.png').astype(np.float64)[:
3380 2c 20 3a 2c 20 32 5d 20 2f 20 32 35 36 5c 6e 5c 6e 73 68 61 70 65 73 20 3d 20 5b 73 71 75 61 72 ,.:,.2]./.256\n\nshapes.=.[squar
33a0 65 2c 20 63 72 6f 73 73 2c 20 74 72 69 61 6e 67 6c 65 2c 20 73 74 61 72 5d 5c 6e 5c 6e 53 20 3d e,.cross,.triangle,.star]\n\nS.=
33c0 20 34 5c 6e 78 73 20 3d 20 5b 5b 5d 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 5c .4\nxs.=.[[].for.i.in.range(S)]\
33e0 6e 5c 6e 5c 6e 66 6f 72 20 6e 62 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 34 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 66 6f n\n\nfor.nb.in.range(4):\n....fo
3400 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 38 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 66 6f 72 20 6a 20 r.i.in.range(8):\n........for.j.
3420 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 38 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 73 68 61 in.range(8):\n............if.sha
3440 70 65 73 5b 6e 62 5d 5b 69 2c 20 6a 5d 20 3c 20 30 2e 39 35 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 pes[nb][i,.j].<.0.95:\n.........
3460 20 20 20 20 20 20 20 78 73 5b 6e 62 5d 2e 61 70 70 65 6e 64 28 5b 6a 2c 20 38 20 2d 20 69 5d 29 .......xs[nb].append([j,.8.-.i])
3480 5c 6e 5c 6e 78 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 30 \n\nxs.=.np.array([np.array(xs[0
34a0 5d 29 2c 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 31 5d 29 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 ]),.np.array(xs[1]),\n..........
34c0 20 20 20 20 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 32 5d 29 2c 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 .....np.array(xs[2]),.np.array(x
34e0 73 5b 33 5d 29 5d 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 s[3])])".......],......."cell_ty
3500 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 pe":."code".....},.....{......."
3520 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b metadata":.{},......."source":.[
3540 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e ........."Barycenter.computation
3560 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 \n----------------------\n\n"...
3580 20 20 20 20 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 ....],......."cell_type":."markd
35a0 6f 77 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 own".....},.....{......."executi
35c0 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 on_count":.null,......."metadata
35e0 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a ":.{........."collapsed":.false.
3600 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 ......},......."outputs":.[],...
3620 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 73 20 3d 20 5b 6c ...."source":.[........."ns.=.[l
3640 65 6e 28 78 73 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 5c 6e 6e 5f en(xs[s]).for.s.in.range(S)]\nn_
3660 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 33 30 5c 6e 5c 6e 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 61 6c samples.=.30\n\n\"\"\"Compute.al
3680 6c 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 66 6f 75 l.distances.matrices.for.the.fou
36a0 72 20 73 68 61 70 65 73 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 43 73 20 3d 20 5b 73 70 2e 73 70 61 74 69 61 6c r.shapes\"\"\"\nCs.=.[sp.spatial
36c0 2e 64 69 73 74 61 6e 63 65 2e 63 64 69 73 74 28 78 73 5b 73 5d 2c 20 78 73 5b 73 5d 29 20 66 6f .distance.cdist(xs[s],.xs[s]).fo
36e0 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 5c 6e 43 73 20 3d 20 5b 63 73 20 2f 20 63 73 2e r.s.in.range(S)]\nCs.=.[cs./.cs.
3700 6d 61 78 28 29 20 66 6f 72 20 63 73 20 69 6e 20 43 73 5d 5c 6e 5c 6e 70 73 20 3d 20 5b 6f 74 2e max().for.cs.in.Cs]\n\nps.=.[ot.
3720 75 6e 69 66 28 6e 73 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 5c 6e unif(ns[s]).for.s.in.range(S)]\n
3740 70 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 6c 61 6d 62 p.=.ot.unif(n_samples)\n\n\nlamb
3760 64 61 73 74 20 3d 20 5b 5b 66 6c 6f 61 74 28 69 29 20 2f 20 33 2c 20 66 6c 6f 61 74 28 33 20 2d dast.=.[[float(i)./.3,.float(3.-
3780 20 69 29 20 2f 20 33 5d 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 5b 31 2c 20 32 5d 5d 5c 6e 5c 6e 43 74 30 .i)./.3].for.i.in.[1,.2]]\n\nCt0
37a0 31 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 5c 6e 66 6f 72 20 69 1.=.[0.for.i.in.range(2)]\nfor.i
37c0 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 43 74 30 31 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e .in.range(2):\n....Ct01[i].=.ot.
37e0 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 6d 70 gromov.gromov_barycenters(n_samp
3800 6c 65 73 2c 20 5b 43 73 5b 30 5d 2c 20 43 73 5b 31 5d 5d 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 les,.[Cs[0],.Cs[1]],\n..........
3820 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 ................................
3840 20 5b 70 73 5b 30 5d 2c 20 70 73 5b 31 5d 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 .[ps[0],.ps[1]\n................
3860 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 ............................],.p
3880 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 20 23 ,.lambdast[i],.'square_loss',..#
38a0 20 35 65 2d 34 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 .5e-4,\n........................
38c0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c ...................max_iter=100,
38e0 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 5c 6e 5c 6e 43 74 30 32 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e .tol=1e-3)\n\nCt02.=.[0.for.i.in
3900 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 5c 6e .range(2)]\nfor.i.in.range(2):\n
3920 20 20 20 20 43 74 30 32 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 ....Ct02[i].=.ot.gromov.gromov_b
3940 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 5b 43 73 5b 30 5d 2c 20 43 73 arycenters(n_samples,.[Cs[0],.Cs
3960 5b 32 5d 5d 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 [2]],\n.........................
3980 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b 30 5d 2c 20 70 73 5b 32 5d 5c ..................[ps[0],.ps[2]\
39a0 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 n...............................
39c0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 .............],.p,.lambdast[i],.
39e0 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 20 23 20 35 65 2d 34 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 'square_loss',..#.5e-4,\n.......
3a00 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 ................................
3a20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 5c 6e 5c 6e 43 ....max_iter=100,.tol=1e-3)\n\nC
3a40 74 31 33 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 5c 6e 66 6f 72 t13.=.[0.for.i.in.range(2)]\nfor
3a60 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 43 74 31 33 5b 69 5d 20 3d 20 6f .i.in.range(2):\n....Ct13[i].=.o
3a80 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 t.gromov.gromov_barycenters(n_sa
3aa0 6d 70 6c 65 73 2c 20 5b 43 73 5b 31 5d 2c 20 43 73 5b 33 5d 5d 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 mples,.[Cs[1],.Cs[3]],\n........
3ac0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 ................................
3ae0 20 20 20 5b 70 73 5b 31 5d 2c 20 70 73 5b 33 5d 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 ...[ps[1],.ps[3]\n..............
3b00 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c ..............................],
3b20 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 .p,.lambdast[i],.'square_loss',.
3b40 20 23 20 35 65 2d 34 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 .#.5e-4,\n......................
3b60 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 .....................max_iter=10
3b80 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 5c 6e 5c 6e 43 74 32 33 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 0,.tol=1e-3)\n\nCt23.=.[0.for.i.
3ba0 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a in.range(2)]\nfor.i.in.range(2):
3bc0 5c 6e 20 20 20 20 43 74 32 33 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 \n....Ct23[i].=.ot.gromov.gromov
3be0 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 5b 43 73 5b 32 5d 2c 20 _barycenters(n_samples,.[Cs[2],.
3c00 43 73 5b 33 5d 5d 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 Cs[3]],\n.......................
3c20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b 32 5d 2c 20 70 73 5b 33 ....................[ps[2],.ps[3
3c40 5d 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 ]\n.............................
3c60 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d ...............],.p,.lambdast[i]
3c80 2c 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 20 23 20 35 65 2d 34 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 ,.'square_loss',..#.5e-4,\n.....
3ca0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 ................................
3cc0 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 22 0a 20 ......max_iter=100,.tol=1e-3)"..
3ce0 20 20 20 20 20 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 .....],......."cell_type":."code
3d00 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a ".....},.....{......."metadata":
3d20 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 .{},......."source":.[........."
3d40 56 69 73 75 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e Visualization\n-------------\n\n
3d60 54 68 65 20 50 43 41 20 68 65 6c 70 73 20 69 6e 20 67 65 74 74 69 6e 67 20 63 6f 6e 73 69 73 74 The.PCA.helps.in.getting.consist
3d80 65 6e 63 79 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 74 68 65 20 72 6f 74 61 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 22 0a ency.between.the.rotations\n\n".
3da0 20 20 20 20 20 20 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 ......],......."cell_type":."mar
3dc0 6b 64 6f 77 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 kdown".....},.....{......."execu
3de0 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 tion_count":.null,......."metada
3e00 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 ta":.{........."collapsed":.fals
3e20 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a e.......},......."outputs":.[],.
3e40 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6c 66 20 3d ......"source":.[........."clf.=
3e60 20 50 43 41 28 6e 5f 63 6f 6d 70 6f 6e 65 6e 74 73 3d 32 29 5c 6e 6e 70 6f 73 20 3d 20 5b 30 2c .PCA(n_components=2)\nnpos.=.[0,
3e80 20 30 2c 20 30 2c 20 30 5d 5c 6e 6e 70 6f 73 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 73 .0,.0,.0]\nnpos.=.[smacof_mds(Cs
3ea0 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 5c 6e 5c 6e 6e 70 [s],.2).for.s.in.range(S)]\n\nnp
3ec0 6f 73 74 30 31 20 3d 20 5b 30 2c 20 30 5d 5c 6e 6e 70 6f 73 74 30 31 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f ost01.=.[0,.0]\nnpost01.=.[smaco
3ee0 66 5f 6d 64 73 28 43 74 30 31 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 f_mds(Ct01[s],.2).for.s.in.range
3f00 28 32 29 5d 5c 6e 6e 70 6f 73 74 30 31 20 3d 20 5b 63 6c 66 2e 66 69 74 5f 74 72 61 6e 73 66 6f (2)]\nnpost01.=.[clf.fit_transfo
3f20 72 6d 28 6e 70 6f 73 74 30 31 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 rm(npost01[s]).for.s.in.range(2)
3f40 5d 5c 6e 5c 6e 6e 70 6f 73 74 30 32 20 3d 20 5b 30 2c 20 30 5d 5c 6e 6e 70 6f 73 74 30 32 20 3d ]\n\nnpost02.=.[0,.0]\nnpost02.=
3f60 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 74 30 32 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 .[smacof_mds(Ct02[s],.2).for.s.i
3f80 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 5c 6e 6e 70 6f 73 74 30 32 20 3d 20 5b 63 6c 66 2e 66 69 74 5f n.range(2)]\nnpost02.=.[clf.fit_
3fa0 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 6e 70 6f 73 74 30 32 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 transform(npost02[s]).for.s.in.r
3fc0 61 6e 67 65 28 32 29 5d 5c 6e 5c 6e 6e 70 6f 73 74 31 33 20 3d 20 5b 30 2c 20 30 5d 5c 6e 6e 70 ange(2)]\n\nnpost13.=.[0,.0]\nnp
3fe0 6f 73 74 31 33 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 74 31 33 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 ost13.=.[smacof_mds(Ct13[s],.2).
4000 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 5c 6e 6e 70 6f 73 74 31 33 20 3d 20 5b 63 for.s.in.range(2)]\nnpost13.=.[c
4020 6c 66 2e 66 69 74 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 6e 70 6f 73 74 31 33 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 lf.fit_transform(npost13[s]).for
4040 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 5c 6e 5c 6e 6e 70 6f 73 74 32 33 20 3d 20 5b 30 2c .s.in.range(2)]\n\nnpost23.=.[0,
4060 20 30 5d 5c 6e 6e 70 6f 73 74 32 33 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 74 32 33 5b .0]\nnpost23.=.[smacof_mds(Ct23[
4080 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 5c 6e 6e 70 6f 73 74 s],.2).for.s.in.range(2)]\nnpost
40a0 32 33 20 3d 20 5b 63 6c 66 2e 66 69 74 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 6e 70 6f 73 74 32 33 5b 23.=.[clf.fit_transform(npost23[
40c0 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 5c 6e 5c 6e 5c 6e 66 69 67 20 s]).for.s.in.range(2)]\n\n\nfig.
40e0 3d 20 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 31 30 29 29 5c 6e 5c =.pl.figure(figsize=(10,.10))\n\
4100 6e 61 78 31 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 nax1.=.pl.subplot2grid((4,.4),.(
4120 30 2c 20 30 29 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 0,.0))\npl.xlim((-1,.1))\npl.yli
4140 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 61 78 31 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 5b 30 5d 5b m((-1,.1))\nax1.scatter(npos[0][
4160 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 72 27 29 :,.0],.npos[0][:,.1],.color='r')
4180 5c 6e 5c 6e 61 78 32 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 \n\nax2.=.pl.subplot2grid((4,.4)
41a0 2c 20 28 30 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e ,.(0,.1))\npl.xlim((-1,.1))\npl.
41c0 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 61 78 32 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 ylim((-1,.1))\nax2.scatter(npost
41e0 30 31 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 30 31 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 01[1][:,.0],.npost01[1][:,.1],.c
4200 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 5c 6e 5c 6e 61 78 33 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 olor='b')\n\nax3.=.pl.subplot2gr
4220 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 30 2c 20 32 29 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c id((4,.4),.(0,.2))\npl.xlim((-1,
4240 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 61 78 33 2e 73 63 61 74 .1))\npl.ylim((-1,.1))\nax3.scat
4260 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 30 31 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 30 31 5b 30 5d ter(npost01[0][:,.0],.npost01[0]
4280 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 5c 6e 5c 6e 61 78 34 20 3d 20 70 6c 2e 73 [:,.1],.color='b')\n\nax4.=.pl.s
42a0 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 30 2c 20 33 29 29 5c 6e 70 6c 2e ubplot2grid((4,.4),.(0,.3))\npl.
42c0 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c xlim((-1,.1))\npl.ylim((-1,.1))\
42e0 6e 61 78 34 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 nax4.scatter(npos[1][:,.0],.npos
4300 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 72 27 29 5c 6e 5c 6e 61 78 35 20 3d 20 70 [1][:,.1],.color='r')\n\nax5.=.p
4320 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 31 2c 20 30 29 29 5c 6e l.subplot2grid((4,.4),.(1,.0))\n
4340 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 pl.xlim((-1,.1))\npl.ylim((-1,.1
4360 29 29 5c 6e 61 78 35 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 30 32 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d ))\nax5.scatter(npost02[1][:,.0]
4380 2c 20 6e 70 6f 73 74 30 32 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 5c 6e ,.npost02[1][:,.1],.color='b')\n
43a0 5c 6e 61 78 36 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 \nax6.=.pl.subplot2grid((4,.4),.
43c0 28 31 2c 20 33 29 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c (1,.3))\npl.xlim((-1,.1))\npl.yl
43e0 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 61 78 36 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 31 33 im((-1,.1))\nax6.scatter(npost13
4400 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 31 33 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c [1][:,.0],.npost13[1][:,.1],.col
4420 6f 72 3d 27 62 27 29 5c 6e 5c 6e 61 78 37 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 or='b')\n\nax7.=.pl.subplot2grid
4440 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 32 2c 20 30 29 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 ((4,.4),.(2,.0))\npl.xlim((-1,.1
4460 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 61 78 37 2e 73 63 61 74 74 65 ))\npl.ylim((-1,.1))\nax7.scatte
4480 72 28 6e 70 6f 73 74 30 32 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 30 32 5b 30 5d 5b 3a r(npost02[0][:,.0],.npost02[0][:
44a0 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 5c 6e 5c 6e 61 78 38 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 ,.1],.color='b')\n\nax8.=.pl.sub
44c0 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 32 2c 20 33 29 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c plot2grid((4,.4),.(2,.3))\npl.xl
44e0 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 61 im((-1,.1))\npl.ylim((-1,.1))\na
4500 78 38 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 31 33 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f x8.scatter(npost13[0][:,.0],.npo
4520 73 74 31 33 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 5c 6e 5c 6e 61 78 39 st13[0][:,.1],.color='b')\n\nax9
4540 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 33 2c 20 30 .=.pl.subplot2grid((4,.4),.(3,.0
4560 29 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d ))\npl.xlim((-1,.1))\npl.ylim((-
4580 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 61 78 39 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 5b 32 5d 5b 3a 2c 20 30 1,.1))\nax9.scatter(npos[2][:,.0
45a0 5d 2c 20 6e 70 6f 73 5b 32 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 72 27 29 5c 6e 5c 6e ],.npos[2][:,.1],.color='r')\n\n
45c0 61 78 31 30 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 ax10.=.pl.subplot2grid((4,.4),.(
45e0 33 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 3,.1))\npl.xlim((-1,.1))\npl.yli
4600 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 61 78 31 30 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 32 33 m((-1,.1))\nax10.scatter(npost23
4620 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 32 33 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c [1][:,.0],.npost23[1][:,.1],.col
4640 6f 72 3d 27 62 27 29 5c 6e 5c 6e 61 78 31 31 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 or='b')\n\nax11.=.pl.subplot2gri
4660 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 33 2c 20 32 29 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 d((4,.4),.(3,.2))\npl.xlim((-1,.
4680 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 61 78 31 31 2e 73 63 61 74 1))\npl.ylim((-1,.1))\nax11.scat
46a0 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 32 33 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 32 33 5b 30 5d ter(npost23[0][:,.0],.npost23[0]
46c0 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 5c 6e 5c 6e 61 78 31 32 20 3d 20 70 6c 2e [:,.1],.color='b')\n\nax12.=.pl.
46e0 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 33 2c 20 33 29 29 5c 6e 70 6c subplot2grid((4,.4),.(3,.3))\npl
4700 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 .xlim((-1,.1))\npl.ylim((-1,.1))
4720 5c 6e 61 78 31 32 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 5b 33 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 \nax12.scatter(npos[3][:,.0],.np
4740 6f 73 5b 33 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 72 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d os[3][:,.1],.color='r')".......]
4760 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 0a 20 20 20 20 ,......."cell_type":."code".....
4780 7d 0a 20 20 5d 2c 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 }...],..."metadata":.{....."lang
47a0 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 uage_info":.{......."name":."pyt
47c0 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b hon",......."codemirror_mode":.{
47e0 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 ........."name":."ipython",.....
4800 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 33 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 ...."version":.3.......},.......
4820 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a "nbconvert_exporter":."python",.
4840 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 33 2e 35 2e 32 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 ......"version":."3.5.2",.......
4860 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 33 22 2c 0a 20 20 "pygments_lexer":."ipython3",...
4880 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 0a 20 20 20 ...."file_extension":.".py",....
48a0 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 ..."mimetype":."text/x-python"..
48c0 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 ...},....."kernelspec":.{.......
48e0 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 33 22 2c 0a 20 20 20 20 "display_name":."Python.3",.....
4900 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 .."name":."python3",......."lang
4920 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 2c 0a 20 20 22 6e 62 uage":."python".....}...},..."nb
4940 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 format_minor":.0,..."nbformat":.
4960 34 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 4c 4c be 4c 17 03 7f 9a 5e 13 00 00 5e 13 00 00 16 00 00 4.}PK........LL.L....^...^......
4980 00 70 6c 6f 74 5f 6f 70 74 69 6d 5f 4f 54 72 65 67 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 63 65 6c 6c .plot_optim_OTreg.ipynb{..."cell
49a0 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 s":.[.....{......."cell_type":."
49c0 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 code",......."execution_count":.
49e0 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 null,......."metadata":.{.......
4a00 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 .."collapsed":.false.......},...
4a20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 ...."outputs":.[],......."source
4a40 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 ":.[........."%matplotlib.inline
4a60 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 ".......].....},.....{......."ce
4a80 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 ll_type":."markdown",......."met
4aa0 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 adata":.{},......."source":.[...
4ac0 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 4f 54 20 77 69 74 68 20 67 ......"\n#.Regularized.OT.with.g
4ae0 65 6e 65 72 69 63 20 73 6f 6c 76 65 72 5c 6e 5c 6e 5c 6e 49 6c 6c 75 73 74 72 61 74 65 73 20 74 eneric.solver\n\n\nIllustrates.t
4b00 68 65 20 75 73 65 20 6f 66 20 74 68 65 20 67 65 6e 65 72 69 63 20 73 6f 6c 76 65 72 20 66 6f 72 he.use.of.the.generic.solver.for
4b20 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 4f 54 20 77 69 74 68 5c 6e 75 73 65 72 2d 64 65 73 69 67 .regularized.OT.with\nuser-desig
4b40 6e 65 64 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 74 65 72 6d 2e 20 49 74 20 75 73 65 73 ned.regularization.term..It.uses
4b60 20 43 6f 6e 64 69 74 69 6f 6e 61 6c 20 67 72 61 64 69 65 6e 74 20 61 73 20 69 6e 20 5b 36 5d 20 .Conditional.gradient.as.in.[6].
4b80 61 6e 64 5c 6e 67 65 6e 65 72 61 6c 69 7a 65 64 20 43 6f 6e 64 69 74 69 6f 6e 61 6c 20 47 72 61 and\ngeneralized.Conditional.Gra
4ba0 64 69 65 6e 74 20 61 73 20 70 72 6f 70 6f 73 65 64 20 69 6e 20 5b 35 5d 5b 37 5d 2e 5c 6e 5c 6e dient.as.proposed.in.[5][7].\n\n
4bc0 5c 6e 5b 35 5d 20 4e 2e 20 43 6f 75 72 74 79 3b 20 52 2e 20 46 6c 61 6d 61 72 79 3b 20 44 2e 20 \n[5].N..Courty;.R..Flamary;.D..
4be0 54 75 69 61 3b 20 41 2e 20 52 61 6b 6f 74 6f 6d 61 6d 6f 6e 6a 79 2c 20 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 Tuia;.A..Rakotomamonjy,.Optimal.
4c00 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 66 6f 72 5c 6e 44 6f 6d 61 69 6e 20 41 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e Transport.for\nDomain.Adaptation
4c20 2c 20 69 6e 20 49 45 45 45 20 54 72 61 6e 73 61 63 74 69 6f 6e 73 20 6f 6e 20 50 61 74 74 65 72 ,.in.IEEE.Transactions.on.Patter
4c40 6e 20 41 6e 61 6c 79 73 69 73 20 61 6e 64 20 4d 61 63 68 69 6e 65 5c 6e 49 6e 74 65 6c 6c 69 67 n.Analysis.and.Machine\nIntellig
4c60 65 6e 63 65 20 2c 20 76 6f 6c 2e 50 50 2c 20 6e 6f 2e 39 39 2c 20 70 70 2e 31 2d 31 2e 5c 6e 5c ence.,.vol.PP,.no.99,.pp.1-1.\n\
4c80 6e 5b 36 5d 20 46 65 72 72 61 64 61 6e 73 2c 20 53 2e 2c 20 50 61 70 61 64 61 6b 69 73 2c 20 4e n[6].Ferradans,.S.,.Papadakis,.N
4ca0 2e 2c 20 50 65 79 72 5c 75 30 30 65 39 2c 20 47 2e 2c 20 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 4a 2e 20 46 .,.Peyr\u00e9,.G.,.&.Aujol,.J..F
4cc0 2e 20 28 32 30 31 34 29 2e 5c 6e 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 ..(2014).\nRegularized.discrete.
4ce0 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 2e 20 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c 20 optimal.transport..SIAM.Journal.
4d00 6f 6e 20 49 6d 61 67 69 6e 67 20 53 63 69 65 6e 63 65 73 2c 5c 6e 37 28 33 29 2c 20 31 38 35 33 on.Imaging.Sciences,\n7(3),.1853
4d20 2d 31 38 38 32 2e 5c 6e 5c 6e 5b 37 5d 20 52 61 6b 6f 74 6f 6d 61 6d 6f 6e 6a 79 2c 20 41 2e 2c -1882.\n\n[7].Rakotomamonjy,.A.,
4d40 20 46 6c 61 6d 61 72 79 2c 20 52 2e 2c 20 26 20 43 6f 75 72 74 79 2c 20 4e 2e 20 28 32 30 31 35 .Flamary,.R.,.&.Courty,.N..(2015
4d60 29 2e 20 47 65 6e 65 72 61 6c 69 7a 65 64 5c 6e 63 6f 6e 64 69 74 69 6f 6e 61 6c 20 67 72 61 64 )..Generalized\nconditional.grad
4d80 69 65 6e 74 3a 20 61 6e 61 6c 79 73 69 73 20 6f 66 20 63 6f 6e 76 65 72 67 65 6e 63 65 20 61 6e ient:.analysis.of.convergence.an
4da0 64 20 61 70 70 6c 69 63 61 74 69 6f 6e 73 2e 5c 6e 61 72 58 69 76 20 70 72 65 70 72 69 6e 74 20 d.applications.\narXiv.preprint.
4dc0 61 72 58 69 76 3a 31 35 31 30 2e 30 36 35 36 37 2e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 arXiv:1510.06567.\n\n\n\n\n"....
4de0 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 ...].....},.....{......."cell_ty
4e00 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f pe":."code",......."execution_co
4e20 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a unt":.null,......."metadata":.{.
4e40 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 ........"collapsed":.false......
4e60 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 .},......."outputs":.[],......."
4e80 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 source":.[........."import.numpy
4ea0 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 .as.np\nimport.matplotlib.pylab.
4ec0 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 2e 70 6c 6f 74 as.pl\nimport.ot\nimport.ot.plot
4ee0 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 ".......].....},.....{......."ce
4f00 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 ll_type":."markdown",......."met
4f20 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 adata":.{},......."source":.[...
4f40 20 20 20 20 20 20 22 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d ......"Generate.data\n----------
4f60 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 ---\n\n".......].....},.....{...
4f80 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 ...."cell_type":."code",......."
4fa0 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d execution_count":.null,......."m
4fc0 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a etadata":.{........."collapsed":
4fe0 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a .false.......},......."outputs":
5000 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 .[],......."source":.[........."
5020 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 #%%.parameters\n\nn.=.100..#.nb.
5040 62 69 6e 73 5c 6e 5c 6e 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 5c 6e 78 20 3d 20 6e 70 2e bins\n\n#.bin.positions\nx.=.np.
5060 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e 5c 6e 23 arange(n,.dtype=np.float64)\n\n#
5080 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 61 20 3d 20 6f 74 2e .Gaussian.distributions\na.=.ot.
50a0 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 datasets.make_1D_gauss(n,.m=20,.
50c0 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 5c 6e 62 20 3d 20 6f 74 2e s=5)..#.m=.mean,.s=.std\nb.=.ot.
50e0 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 36 30 2c 20 datasets.make_1D_gauss(n,.m=60,.
5100 73 3d 31 30 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 s=10)\n\n#.loss.matrix\nM.=.ot.d
5120 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 ist(x.reshape((n,.1)),.x.reshape
5140 28 28 6e 2c 20 31 29 29 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d ((n,.1)))\nM./=.M.max()".......]
5160 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a .....},.....{......."cell_type":
5180 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b ."markdown",......."metadata":.{
51a0 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 53 6f },......."source":.[........."So
51c0 6c 76 65 20 45 4d 44 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a lve.EMD\n---------\n\n".......].
51e0 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 ....},.....{......."cell_type":.
5200 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a "code",......."execution_count":
5220 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 .null,......."metadata":.{......
5240 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 ..."collapsed":.false.......},..
5260 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 ....."outputs":.[],......."sourc
5280 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e 5c 6e 47 30 20 3d 20 6f e":.[........."#%%.EMD\n\nG0.=.o
52a0 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 t.emd(a,.b,.M)\n\npl.figure(3,.f
52c0 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d igsize=(5,.5))\not.plot.plot1D_m
52e0 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 30 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 30 27 29 22 0a 20 20 at(a,.b,.G0,.'OT.matrix.G0')"...
5300 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 ....].....},.....{......."cell_t
5320 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 ype":."markdown",......."metadat
5340 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 a":.{},......."source":.[.......
5360 20 20 22 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d .."Solve.EMD.with.Frobenius.norm
5380 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d .regularization\n---------------
53a0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c -----------------------------\n\
53c0 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 n".......].....},.....{......."c
53e0 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 ell_type":."code",......."execut
5400 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 ion_count":.null,......."metadat
5420 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 a":.{........."collapsed":.false
5440 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 .......},......."outputs":.[],..
5460 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 78 ....."source":.[........."#%%.Ex
5480 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 72 65 67 75 6c 61 ample.with.Frobenius.norm.regula
54a0 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 rization\n\n\ndef.f(G):\n....ret
54c0 75 72 6e 20 30 2e 35 20 2a 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 2a 2a 32 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 urn.0.5.*.np.sum(G**2)\n\n\ndef.
54e0 64 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 47 5c 6e 5c 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 df(G):\n....return.G\n\n\nreg.=.
5500 31 65 2d 31 5c 6e 5c 6e 47 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 1e-1\n\nGl2.=.ot.optim.cg(a,.b,.
5520 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e M,.reg,.f,.df,.verbose=True)\n\n
5540 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 pl.figure(3)\not.plot.plot1D_mat
5560 28 61 2c 20 62 2c 20 47 6c 32 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 46 72 6f 62 2e 20 72 65 67 (a,.b,.Gl2,.'OT.matrix.Frob..reg
5580 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 ')".......].....},.....{......."
55a0 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d cell_type":."markdown",......."m
55c0 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a etadata":.{},......."source":.[.
55e0 20 20 20 20 20 20 20 20 22 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 ........"Solve.EMD.with.entropic
5600 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d .regularization\n---------------
5620 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 -----------------------\n\n"....
5640 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 ...].....},.....{......."cell_ty
5660 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f pe":."code",......."execution_co
5680 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a unt":.null,......."metadata":.{.
56a0 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 ........"collapsed":.false......
56c0 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 .},......."outputs":.[],......."
56e0 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 source":.[........."#%%.Example.
5700 77 69 74 68 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e with.entropic.regularization\n\n
5720 5c 6e 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 \ndef.f(G):\n....return.np.sum(G
5740 20 2a 20 6e 70 2e 6c 6f 67 28 47 29 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 .*.np.log(G))\n\n\ndef.df(G):\n.
5760 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 6c 6f 67 28 47 29 20 2b 20 31 2e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 72 65 ...return.np.log(G).+.1.\n\n\nre
5780 67 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 5c 6e 47 65 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 63 67 28 61 2c 20 g.=.1e-3\n\nGe.=.ot.optim.cg(a,.
57a0 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c b,.M,.reg,.f,.df,.verbose=True)\
57c0 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 5c n\npl.figure(4,.figsize=(5,.5))\
57e0 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 65 2c 20 27 4f not.plot.plot1D_mat(a,.b,.Ge,.'O
5800 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 45 6e 74 72 6f 70 2e 20 72 65 67 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a T.matrix.Entrop..reg')".......].
5820 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 ....},.....{......."cell_type":.
5840 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d "markdown",......."metadata":.{}
5860 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 53 6f 6c ,......."source":.[........."Sol
5880 76 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 2b 20 65 6e 74 ve.EMD.with.Frobenius.norm.+.ent
58a0 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d ropic.regularization\n----------
58c0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d --------------------------------
58e0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d -------------\n\n".......].....}
5900 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 ,.....{......."cell_type":."code
5920 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c ",......."execution_count":.null
5940 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 ,......."metadata":.{........."c
5960 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 ollapsed":.false.......},.......
5980 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b "outputs":.[],......."source":.[
59a0 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 ........."#%%.Example.with.Frobe
59c0 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 2b 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 nius.norm.+.entropic.regularizat
59e0 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 67 63 67 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 20 ion.with.gcg\n\n\ndef.f(G):\n...
5a00 20 72 65 74 75 72 6e 20 30 2e 35 20 2a 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 2a 2a 32 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e .return.0.5.*.np.sum(G**2)\n\n\n
5a20 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 47 5c 6e 5c 6e 5c 6e 72 65 def.df(G):\n....return.G\n\n\nre
5a40 67 31 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 72 65 67 32 20 3d 20 31 65 2d 31 5c 6e 5c 6e 47 65 6c 32 20 3d g1.=.1e-3\nreg2.=.1e-1\n\nGel2.=
5a60 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 67 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 31 2c 20 72 65 67 .ot.optim.gcg(a,.b,.M,.reg1,.reg
5a80 32 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 2,.f,.df,.verbose=True)\n\npl.fi
5aa0 67 75 72 65 28 35 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 gure(5,.figsize=(5,.5))\not.plot
5ac0 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 65 6c 32 2c 20 27 4f 54 20 65 6e 74 72 .plot1D_mat(a,.b,.Gel2,.'OT.entr
5ae0 6f 70 69 63 20 2b 20 6d 61 74 72 69 78 20 46 72 6f 62 2e 20 72 65 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 68 opic.+.matrix.Frob..reg')\npl.sh
5b00 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 0a 20 20 22 6d 65 74 61 ow()".......].....}...],..."meta
5b20 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 data":.{....."kernelspec":.{....
5b40 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 33 22 2c 0a 20 ..."display_name":."Python.3",..
5b60 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 ....."language":."python",......
5b80 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 33 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 22 6c ."name":."python3".....},....."l
5ba0 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 anguage_info":.{......."codemirr
5bc0 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 or_mode":.{........."name":."ipy
5be0 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 33 0a 20 20 20 20 thon",........."version":.3.....
5c00 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 ..},......."file_extension":.".p
5c20 79 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 y",......."mimetype":."text/x-py
5c40 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 thon",......."name":."python",..
5c60 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 ....."nbconvert_exporter":."pyth
5c80 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 on",......."pygments_lexer":."ip
5ca0 79 74 68 6f 6e 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 33 2e 36 2e 35 ython3",......."version":."3.6.5
5cc0 22 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 0a 20 20 ".....}...},..."nbformat":.4,...
5ce0 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 69 "nbformat_minor":.0.}PK........i
5d00 4c be 4c d1 72 b5 4d f4 1c 00 00 f4 1c 00 00 12 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 64 32 2e L.L.r.M............plot_otda_d2.
5d20 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 ipynb{..."cells":.[.....{.......
5d40 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 "cell_type":."code",......."exec
5d60 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 ution_count":.null,......."metad
5d80 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c ata":.{........."collapsed":.fal
5da0 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c se.......},......."outputs":.[],
5dc0 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 ......."source":.[........."%mat
5de0 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 plotlib.inline".......].....},..
5e00 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 ...{......."cell_type":."markdow
5e20 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 n",......."metadata":.{},.......
5e40 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 4f 54 20 66 6f 72 20 "source":.[........."\n#.OT.for.
5e60 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 65 6d 70 69 72 69 63 61 6c 20 64 domain.adaptation.on.empirical.d
5e80 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 istributions\n\n\nThis.example.i
5ea0 6e 74 72 6f 64 75 63 65 73 20 61 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 69 6e ntroduces.a.domain.adaptation.in
5ec0 20 61 20 32 44 20 73 65 74 74 69 6e 67 2e 20 49 74 20 65 78 70 6c 69 63 69 74 73 5c 6e 74 68 65 .a.2D.setting..It.explicits\nthe
5ee0 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 20 6f 66 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 61 6e .problem.of.domain.adaptation.an
5f00 64 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 73 20 73 6f 6d 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 d.introduces.some.optimal.transp
5f20 6f 72 74 5c 6e 61 70 70 72 6f 61 63 68 65 73 20 74 6f 20 73 6f 6c 76 65 20 69 74 2e 5c 6e 5c 6e ort\napproaches.to.solve.it.\n\n
5f40 51 75 61 6e 74 69 74 69 65 73 20 73 75 63 68 20 61 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c Quantities.such.as.optimal.coupl
5f60 69 6e 67 73 2c 20 67 72 65 61 74 65 72 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 ings,.greater.coupling.coefficie
5f80 6e 74 73 20 61 6e 64 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 61 72 65 nts.and\ntransported.samples.are
5fa0 20 72 65 70 72 65 73 65 6e 74 65 64 20 69 6e 20 6f 72 64 65 72 20 74 6f 20 67 69 76 65 20 61 20 .represented.in.order.to.give.a.
5fc0 76 69 73 75 61 6c 20 75 6e 64 65 72 73 74 61 6e 64 69 6e 67 5c 6e 6f 66 20 77 68 61 74 20 74 68 visual.understanding\nof.what.th
5fe0 65 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 20 61 72 65 20 64 6f 69 6e 67 2e 5c 6e e.transport.methods.are.doing.\n
6000 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 \n".......].....},.....{......."
6020 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 cell_type":."code",......."execu
6040 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 tion_count":.null,......."metada
6060 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 ta":.{........."collapsed":.fals
6080 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a e.......},......."outputs":.[],.
60a0 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 ......"source":.[........."#.Aut
60c0 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 hors:.Remi.Flamary.<remi.flamary
60e0 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 @unice.fr>\n#..........Stanislas
6100 20 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d .Chambon.<stan.chambon@gmail.com
6120 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e >\n#\n#.License:.MIT.License\n\n
6140 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 import.matplotlib.pylab.as.pl\ni
6160 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 2e 70 6c 6f 74 22 0a 20 20 20 20 20 20 mport.ot\nimport.ot.plot".......
6180 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 ].....},.....{......."cell_type"
61a0 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 :."markdown",......."metadata":.
61c0 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 67 {},......."source":.[........."g
61e0 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 enerate.data\n-------------\n\n"
6200 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c .......].....},.....{......."cel
6220 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f l_type":."code",......."executio
6240 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 n_count":.null,......."metadata"
6260 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 :.{........."collapsed":.false..
6280 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 .....},......."outputs":.[],....
62a0 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 ..."source":.[........."n_sample
62c0 73 5f 73 6f 75 72 63 65 20 3d 20 31 35 30 5c 6e 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 74 61 72 67 65 74 s_source.=.150\nn_samples_target
62e0 20 3d 20 31 35 30 5c 6e 5c 6e 58 73 2c 20 79 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d .=.150\n\nXs,.ys.=.ot.datasets.m
6300 61 6b 65 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 27 2c 20 6e 5f 73 61 6d ake_data_classif('3gauss',.n_sam
6320 70 6c 65 73 5f 73 6f 75 72 63 65 29 5c 6e 58 74 2c 20 79 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 ples_source)\nXt,.yt.=.ot.datase
6340 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 32 27 2c 20 ts.make_data_classif('3gauss2',.
6360 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 74 61 72 67 65 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 n_samples_target)\n\n#.Cost.matr
6380 69 78 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 ix\nM.=.ot.dist(Xs,.Xt,.metric='
63a0 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 sqeuclidean')".......].....},...
63c0 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e ..{......."cell_type":."markdown
63e0 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 ",......."metadata":.{},......."
6400 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 source":.[........."Instantiate.
6420 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 the.different.transport.algorith
6440 6d 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d ms.and.fit.them\n---------------
6460 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d --------------------------------
6480 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c ------------\n\n".......].....},
64a0 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 .....{......."cell_type":."code"
64c0 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c ,......."execution_count":.null,
64e0 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f ......."metadata":.{........."co
6500 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 llapsed":.false.......},......."
6520 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a outputs":.[],......."source":.[.
6540 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 45 4d 44 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 ........"#.EMD.Transport\not_emd
6560 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 2e .=.ot.da.EMDTransport()\not_emd.
6580 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n#.Sinkhorn.
65a0 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 Transport\not_sinkhorn.=.ot.da.S
65c0 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 5c 6e 6f 74 inkhornTransport(reg_e=1e-1)\not
65e0 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 _sinkhorn.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n#
6600 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 47 72 6f 75 70 20 6c .Sinkhorn.Transport.with.Group.l
6620 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 6f 74 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f asso.regularization\not_lpl1.=.o
6640 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 t.da.SinkhornLpl1Transport(reg_e
6660 3d 31 65 2d 31 2c 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 31 65 30 29 5c 6e 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 66 69 74 28 =1e-1,.reg_cl=1e0)\not_lpl1.fit(
6680 58 73 3d 58 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 72 61 6e 73 70 Xs=Xs,.ys=ys,.Xt=Xt)\n\n#.transp
66a0 6f 72 74 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6f 6e 74 6f 20 74 61 72 67 65 74 20 73 ort.source.samples.onto.target.s
66c0 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 amples\ntransp_Xs_emd.=.ot_emd.t
66e0 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 ransform(Xs=Xs)\ntransp_Xs_sinkh
6700 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 orn.=.ot_sinkhorn.transform(Xs=X
6720 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 s)\ntransp_Xs_lpl1.=.ot_lpl1.tra
6740 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 nsform(Xs=Xs)".......].....},...
6760 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e ..{......."cell_type":."markdown
6780 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 ",......."metadata":.{},......."
67a0 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 source":.[........."Fig.1.:.plot
67c0 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 2b 20 6d 61 s.source.and.target.samples.+.ma
67e0 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d trix.of.pairwise.distance\n-----
6800 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d --------------------------------
6820 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d --------------------------------
6840 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 \n\n".......].....},.....{......
6860 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 ."cell_type":."code",......."exe
6880 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 cution_count":.null,......."meta
68a0 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 data":.{........."collapsed":.fa
68c0 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d lse.......},......."outputs":.[]
68e0 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e ,......."source":.[........."pl.
6900 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 31 30 29 29 5c 6e 70 6c 2e figure(1,.figsize=(10,.10))\npl.
6920 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b subplot(2,.2,.1)\npl.scatter(Xs[
6940 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b :,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+
6960 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 ',.label='Source.samples')\npl.x
6980 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 ticks([])\npl.yticks([])\npl.leg
69a0 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 end(loc=0)\npl.title('Source..sa
69c0 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e mples')\n\npl.subplot(2,.2,.2)\n
69e0 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c
6a00 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 =yt,.marker='o',.label='Target.s
6a20 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 amples')\npl.xticks([])\npl.ytic
6a40 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 ks([])\npl.legend(loc=0)\npl.tit
6a60 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c le('Target.samples')\n\npl.subpl
6a80 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 ot(2,.2,.3)\npl.imshow(M,.interp
6aa0 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d olation='nearest')\npl.xticks([]
6ac0 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 74 72 )\npl.yticks([])\npl.title('Matr
6ae0 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 ix.of.pairwise.distances')\npl.t
6b00 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 ight_layout()".......].....},...
6b20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e ..{......."cell_type":."markdown
6b40 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 ",......."metadata":.{},......."
6b60 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 source":.[........."Fig.2.:.plot
6b80 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 s.optimal.couplings.for.the.diff
6ba0 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d erent.methods\n-----------------
6bc0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d --------------------------------
6be0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 --------\n\n".......].....},....
6c00 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 .{......."cell_type":."code",...
6c20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 ...."execution_count":.null,....
6c40 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 ..."metadata":.{........."collap
6c60 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 sed":.false.......},......."outp
6c80 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 uts":.[],......."source":.[.....
6ca0 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 36 ...."pl.figure(2,.figsize=(10,.6
6cc0 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d ))\n\npl.subplot(2,.3,.1)\npl.im
6ce0 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 show(ot_emd.coupling_,.interpola
6d00 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e tion='nearest')\npl.xticks([])\n
6d20 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c pl.yticks([])\npl.title('Optimal
6d40 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c .coupling\\nEMDTransport')\n\npl
6d60 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f .subplot(2,.3,.2)\npl.imshow(ot_
6d80 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f sinkhorn.coupling_,.interpolatio
6da0 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e n='nearest')\npl.xticks([])\npl.
6dc0 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f yticks([])\npl.title('Optimal.co
6de0 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e upling\\nSinkhornTransport')\n\n
6e00 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f pl.subplot(2,.3,.3)\npl.imshow(o
6e20 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d t_lpl1.coupling_,.interpolation=
6e40 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 'nearest')\npl.xticks([])\npl.yt
6e60 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 icks([])\npl.title('Optimal.coup
6e80 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e ling\\nSinkhornLpl1Transport')\n
6ea0 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 \npl.subplot(2,.3,.4)\not.plot.p
6ec0 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 65 6d 64 lot2D_samples_mat(Xs,.Xt,.ot_emd
6ee0 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 .coupling_,.c=[.5,..5,.1])\npl.s
6f00 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c catter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,
6f20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c .marker='+',.label='Source.sampl
6f40 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c es')\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,
6f60 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 .1],.c=yt,.marker='o',.label='Ta
6f80 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 rget.samples')\npl.xticks([])\np
6fa0 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 l.yticks([])\npl.title('Main.cou
6fc0 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 pling.coefficients\\nEMDTranspor
6fe0 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e 6f 74 2e 70 t')\n\npl.subplot(2,.3,.5)\not.p
7000 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f lot.plot2D_samples_mat(Xs,.Xt,.o
7020 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c t_sinkhorn.coupling_,.c=[.5,..5,
7040 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c .1])\npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:,
7060 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f .1],.c=ys,.marker='+',.label='So
7080 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c urce.samples')\npl.scatter(Xt[:,
70a0 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c .0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',
70c0 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 .label='Target.samples')\npl.xti
70e0 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 cks([])\npl.yticks([])\npl.title
7100 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 53 ('Main.coupling.coefficients\\nS
7120 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 inkhornTransport')\n\npl.subplot
7140 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 (2,.3,.6)\not.plot.plot2D_sample
7160 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c s_mat(Xs,.Xt,.ot_lpl1.coupling_,
7180 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a .c=[.5,..5,.1])\npl.scatter(Xs[:
71a0 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 ,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+'
71c0 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 ,.label='Source.samples')\npl.sc
71e0 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 atter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.
7200 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 marker='o',.label='Target.sample
7220 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d s')\npl.xticks([])\npl.yticks([]
7240 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 )\npl.title('Main.coupling.coeff
7260 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 icients\\nSinkhornLpl1Transport'
7280 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 )\npl.tight_layout()".......]...
72a0 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d ..},.....{......."cell_type":."m
72c0 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a arkdown",......."metadata":.{},.
72e0 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 33 ......"source":.[........."Fig.3
7300 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d .:.plot.transported.samples\n---
7320 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c -----------------------------\n\
7340 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 n".......].....},.....{......."c
7360 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 ell_type":."code",......."execut
7380 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 ion_count":.null,......."metadat
73a0 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 a":.{........."collapsed":.false
73c0 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 .......},......."outputs":.[],..
73e0 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 64 69 73 70 ....."source":.[........."#.disp
7400 6c 61 79 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 lay.transported.samples\npl.figu
7420 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 34 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c re(4,.figsize=(10,.4))\npl.subpl
7440 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d ot(1,.3,.1)\npl.scatter(Xt[:,.0]
7460 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 ,.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',\n.
7480 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 ..........label='Target.samples'
74a0 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f ,.alpha=0.5)\npl.scatter(transp_
74c0 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 31 Xs_emd[:,.0],.transp_Xs_emd[:,.1
74e0 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c ],.c=ys,\n...........marker='+',
7500 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e .label='Transp.samples',.s=30)\n
7520 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e pl.title('Transported.samples\\n
7540 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 EmdTransport')\npl.legend(loc=0)
7560 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e \npl.xticks([])\npl.yticks([])\n
7580 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 \npl.subplot(1,.3,.2)\npl.scatte
75a0 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b r(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.mark
75c0 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 er='o',\n...........label='Targe
75e0 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 t.samples',.alpha=0.5)\npl.scatt
7600 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 er(transp_Xs_sinkhorn[:,.0],.tra
7620 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 nsp_Xs_sinkhorn[:,.1],.c=ys,\n..
7640 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e .........marker='+',.label='Tran
7660 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 sp.samples',.s=30)\npl.title('Tr
7680 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e ansported.samples\\nSinkhornTran
76a0 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b sport')\npl.xticks([])\npl.ytick
76c0 73 28 5b 5d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c s([])\n\npl.subplot(1,.3,.3)\npl
76e0 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 .scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=y
7700 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c t,.marker='o',\n...........label
7720 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 5c 6e 70 ='Target.samples',.alpha=0.5)\np
7740 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 l.scatter(transp_Xs_lpl1[:,.0],.
7760 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 transp_Xs_lpl1[:,.1],.c=ys,\n...
7780 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 ........marker='+',.label='Trans
77a0 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 p.samples',.s=30)\npl.title('Tra
77c0 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 nsported.samples\\nSinkhornLpl1T
77e0 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 ransport')\npl.xticks([])\npl.yt
7800 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 70 icks([])\n\npl.tight_layout()\np
7820 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 0a 20 20 22 l.show()".......].....}...],..."
7840 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b metadata":.{....."kernelspec":.{
7860 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 33 ......."display_name":."Python.3
7880 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 ",......."language":."python",..
78a0 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 33 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 ....."name":."python3".....},...
78c0 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 .."language_info":.{......."code
78e0 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 mirror_mode":.{........."name":.
7900 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 33 0a "ipython",........."version":.3.
7920 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a ......},......."file_extension":
7940 20 22 2e 70 79 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f .".py",......."mimetype":."text/
7960 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e x-python",......."name":."python
7980 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 ",......."nbconvert_exporter":."
79a0 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a python",......."pygments_lexer":
79c0 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 33 ."ipython3",......."version":."3
79e0 2e 36 2e 35 22 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 .6.5".....}...},..."nbformat":.4
7a00 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 ,..."nbformat_minor":.0.}PK.....
7a20 00 00 00 53 4c be 4c a9 b8 76 f6 f8 19 00 00 f8 19 00 00 1f 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 ...SL.L..v.............plot_otda
7a40 5f 73 65 6d 69 5f 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 _semi_supervised.ipynb{..."cells
7a60 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 ":.[.....{......."cell_type":."c
7a80 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e ode",......."execution_count":.n
7aa0 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 ull,......."metadata":.{........
7ac0 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 ."collapsed":.false.......},....
7ae0 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 ..."outputs":.[],......."source"
7b00 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 :.[........."%matplotlib.inline"
7b20 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c .......].....},.....{......."cel
7b40 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 l_type":."markdown",......."meta
7b60 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 data":.{},......."source":.[....
7b80 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 4f 54 44 41 20 75 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 76 73 20 73 ....."\n#.OTDA.unsupervised.vs.s
7ba0 65 6d 69 2d 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 73 65 74 74 69 6e 67 5c 6e 5c 6e 5c 6e 54 68 69 73 emi-supervised.setting\n\n\nThis
7bc0 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 73 20 61 20 73 65 6d 69 20 73 75 70 65 72 .example.introduces.a.semi.super
7be0 76 69 73 65 64 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 69 6e 20 61 20 32 44 20 vised.domain.adaptation.in.a.2D.
7c00 73 65 74 74 69 6e 67 2e 5c 6e 49 74 20 65 78 70 6c 69 63 69 74 73 20 74 68 65 20 70 72 6f 62 6c setting.\nIt.explicits.the.probl
7c20 65 6d 20 6f 66 20 73 65 6d 69 20 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 em.of.semi.supervised.domain.ada
7c40 70 74 61 74 69 6f 6e 20 61 6e 64 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 73 5c 6e 73 6f 6d 65 20 6f 70 74 ptation.and.introduces\nsome.opt
7c60 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 70 70 72 6f 61 63 68 65 73 20 74 6f 20 73 6f 6c imal.transport.approaches.to.sol
7c80 76 65 20 69 74 2e 5c 6e 5c 6e 51 75 61 6e 74 69 74 69 65 73 20 73 75 63 68 20 61 73 20 6f 70 74 ve.it.\n\nQuantities.such.as.opt
7ca0 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 2c 20 67 72 65 61 74 65 72 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 imal.couplings,.greater.coupling
7cc0 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 20 61 6e 64 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 .coefficients.and\ntransported.s
7ce0 61 6d 70 6c 65 73 20 61 72 65 20 72 65 70 72 65 73 65 6e 74 65 64 20 69 6e 20 6f 72 64 65 72 20 amples.are.represented.in.order.
7d00 74 6f 20 67 69 76 65 20 61 20 76 69 73 75 61 6c 20 75 6e 64 65 72 73 74 61 6e 64 69 6e 67 5c 6e to.give.a.visual.understanding\n
7d20 6f 66 20 77 68 61 74 20 74 68 65 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 20 61 72 of.what.the.transport.methods.ar
7d40 65 20 64 6f 69 6e 67 2e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 e.doing.\n\n".......].....},....
7d60 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 .{......."cell_type":."code",...
7d80 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 ...."execution_count":.null,....
7da0 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 ..."metadata":.{........."collap
7dc0 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 sed":.false.......},......."outp
7de0 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 uts":.[],......."source":.[.....
7e00 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 ...."#.Authors:.Remi.Flamary.<re
7e20 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 mi.flamary@unice.fr>\n#.........
7e40 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e .Stanislas.Chambon.<stan.chambon
7e60 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c @gmail.com>\n#\n#.License:.MIT.L
7e80 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 icense\n\nimport.matplotlib.pyla
7ea0 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 b.as.pl\nimport.ot".......].....
7ec0 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 },.....{......."cell_type":."mar
7ee0 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 kdown",......."metadata":.{},...
7f00 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 47 65 6e 65 72 61 74 ...."source":.[........."Generat
7f20 65 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 e.data\n-------------\n\n"......
7f40 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 .].....},.....{......."cell_type
7f60 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e ":."code",......."execution_coun
7f80 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 t":.null,......."metadata":.{...
7fa0 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d ......"collapsed":.false.......}
7fc0 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f ,......."outputs":.[],......."so
7fe0 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 73 6f 75 72 urce":.[........."n_samples_sour
8000 63 65 20 3d 20 31 35 30 5c 6e 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 31 35 30 ce.=.150\nn_samples_target.=.150
8020 5c 6e 5c 6e 58 73 2c 20 79 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 64 61 \n\nXs,.ys.=.ot.datasets.make_da
8040 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 27 2c 20 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 73 ta_classif('3gauss',.n_samples_s
8060 6f 75 72 63 65 29 5c 6e 58 74 2c 20 79 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b ource)\nXt,.yt.=.ot.datasets.mak
8080 65 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 32 27 2c 20 6e 5f 73 61 6d 70 e_data_classif('3gauss2',.n_samp
80a0 6c 65 73 5f 74 61 72 67 65 74 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 les_target)".......].....},.....
80c0 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c {......."cell_type":."markdown",
80e0 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f ......."metadata":.{},......."so
8100 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 73 6f 75 72 urce":.[........."Transport.sour
8120 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6f 6e 74 6f 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e ce.samples.onto.target.samples\n
8140 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d --------------------------------
8160 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c ------------\n\n".......].....},
8180 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 .....{......."cell_type":."code"
81a0 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c ,......."execution_count":.null,
81c0 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f ......."metadata":.{........."co
81e0 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 llapsed":.false.......},......."
8200 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a outputs":.[],......."source":.[.
8220 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 75 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 ........"#.unsupervised.domain.a
8240 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 daptation\not_sinkhorn_un.=.ot.d
8260 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 5c a.SinkhornTransport(reg_e=1e-1)\
8280 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 not_sinkhorn_un.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt
82a0 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 )\ntransp_Xs_sinkhorn_un.=.ot_si
82c0 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 nkhorn_un.transform(Xs=Xs)\n\n#.
82e0 73 65 6d 69 2d 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f semi-supervised.domain.adaptatio
8300 6e 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b n\not_sinkhorn_semi.=.ot.da.Sink
8320 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 5c 6e 6f 74 5f 73 69 hornTransport(reg_e=1e-1)\not_si
8340 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 2c 20 79 73 nkhorn_semi.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt,.ys
8360 3d 79 73 2c 20 79 74 3d 79 74 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f =ys,.yt=yt)\ntransp_Xs_sinkhorn_
8380 73 65 6d 69 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 semi.=.ot_sinkhorn_semi.transfor
83a0 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 73 65 6d 69 20 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 m(Xs=Xs)\n\n#.semi.supervised.DA
83c0 20 75 73 65 73 20 61 76 61 69 6c 61 62 6c 65 20 6c 61 62 61 6c 65 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 .uses.available.labaled.target.s
83e0 61 6d 70 6c 65 73 20 74 6f 20 6d 6f 64 69 66 79 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 5c 6e 23 20 6d 61 74 amples.to.modify.the.cost\n#.mat
8400 72 69 78 20 69 6e 76 6f 6c 76 65 64 20 69 6e 20 74 68 65 20 4f 54 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 2e 20 rix.involved.in.the.OT.problem..
8420 54 68 65 20 63 6f 73 74 20 6f 66 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 69 6e 67 20 61 20 73 6f 75 72 63 The.cost.of.transporting.a.sourc
8440 65 20 73 61 6d 70 6c 65 5c 6e 23 20 6f 66 20 63 6c 61 73 73 20 41 20 6f 6e 74 6f 20 61 20 74 61 e.sample\n#.of.class.A.onto.a.ta
8460 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 20 6f 66 20 63 6c 61 73 73 20 42 20 21 3d 20 41 20 69 73 20 73 rget.sample.of.class.B.!=.A.is.s
8480 65 74 20 74 6f 20 69 6e 66 69 6e 69 74 65 2c 20 6f 72 20 61 5c 6e 23 20 76 65 72 79 20 6c 61 72 et.to.infinite,.or.a\n#.very.lar
84a0 67 65 20 76 61 6c 75 65 5c 6e 5c 6e 23 20 6e 6f 74 65 20 74 68 61 74 20 69 6e 20 74 68 65 20 70 ge.value\n\n#.note.that.in.the.p
84c0 72 65 73 65 6e 74 20 63 61 73 65 20 77 65 20 63 6f 6e 73 69 64 65 72 20 74 68 61 74 20 61 6c 6c resent.case.we.consider.that.all
84e0 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 61 72 65 5c 6e 23 20 6c 61 62 65 6c .the.target.samples.are\n#.label
8500 65 64 2e 20 46 6f 72 20 64 61 69 6c 79 20 61 70 70 6c 69 63 61 74 69 6f 6e 73 2c 20 73 6f 6d 65 ed..For.daily.applications,.some
8520 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 20 6d 69 67 68 74 20 6e 6f 74 20 68 61 76 65 20 6c 61 .target.sample.might.not.have.la
8540 62 65 6c 73 2c 5c 6e 23 20 69 6e 20 74 68 69 73 20 63 61 73 65 20 74 68 65 20 65 6c 65 6d 65 6e bels,\n#.in.this.case.the.elemen
8560 74 20 6f 66 20 79 74 20 63 6f 72 72 65 73 70 6f 6e 64 69 6e 67 20 74 6f 20 74 68 65 73 65 20 73 t.of.yt.corresponding.to.these.s
8580 61 6d 70 6c 65 73 20 73 68 6f 75 6c 64 20 62 65 5c 6e 23 20 66 69 6c 6c 65 64 20 77 69 74 68 20 amples.should.be\n#.filled.with.
85a0 2d 31 2e 5c 6e 5c 6e 23 20 57 61 72 6e 69 6e 67 3a 20 77 65 20 72 65 63 61 6c 6c 20 74 68 61 74 -1.\n\n#.Warning:.we.recall.that
85c0 20 2d 31 20 63 61 6e 6e 6f 74 20 62 65 20 75 73 65 64 20 61 73 20 61 20 63 6c 61 73 73 20 6c 61 .-1.cannot.be.used.as.a.class.la
85e0 62 65 6c 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 bel".......].....},.....{.......
8600 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 "cell_type":."markdown",......."
8620 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b metadata":.{},......."source":.[
8640 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 ........."Fig.1.:.plots.source.a
8660 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 2b 20 6d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 nd.target.samples.+.matrix.of.pa
8680 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d irwise.distance\n---------------
86a0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d --------------------------------
86c0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 ----------------------\n\n".....
86e0 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 ..].....},.....{......."cell_typ
8700 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 e":."code",......."execution_cou
8720 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 nt":.null,......."metadata":.{..
8740 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 ......."collapsed":.false.......
8760 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 },......."outputs":.[],......."s
8780 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 ource":.[........."pl.figure(1,.
87a0 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 31 30 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c figsize=(10,.10))\npl.subplot(2,
87c0 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b .2,.1)\npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[
87e0 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 :,.1],.c=ys,.marker='+',.label='
8800 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c Source.samples')\npl.xticks([])\
8820 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 npl.yticks([])\npl.legend(loc=0)
8840 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c \npl.title('Source..samples')\n\
8860 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 npl.subplot(2,.2,.2)\npl.scatter
8880 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 (Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marke
88a0 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e r='o',.label='Target.samples')\n
88c0 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c pl.xticks([])\npl.yticks([])\npl
88e0 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 .legend(loc=0)\npl.title('Target
8900 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 .samples')\n\npl.subplot(2,.2,.3
8920 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 2e 63 6f 73 74 )\npl.imshow(ot_sinkhorn_un.cost
8940 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e _,.interpolation='nearest')\npl.
8960 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 xticks([])\npl.yticks([])\npl.ti
8980 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 75 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 tle('Cost.matrix.-.unsupervised.
89a0 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e DA')\n\npl.subplot(2,.2,.4)\npl.
89c0 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 63 6f 73 74 5f 2c 20 69 imshow(ot_sinkhorn_semi.cost_,.i
89e0 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 nterpolation='nearest')\npl.xtic
8a00 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 ks([])\npl.yticks([])\npl.title(
8a20 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 73 65 6d 69 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 'Cost.matrix.-.semisupervised.DA
8a40 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 68 65 ')\n\npl.tight_layout()\n\n#.the
8a60 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 69 6e 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 2d 73 75 .optimal.coupling.in.the.semi-su
8a80 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 20 63 61 73 65 20 77 69 6c 6c 20 65 78 68 69 62 69 74 20 5c 22 pervised.DA.case.will.exhibit.\"
8aa0 20 73 68 61 70 65 5c 6e 23 20 73 69 6d 69 6c 61 72 5c 22 20 74 6f 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 .shape\n#.similar\".to.the.cost.
8ac0 6d 61 74 72 69 78 2c 20 28 62 6c 6f 63 6b 20 64 69 61 67 6f 6e 61 6c 20 6d 61 74 72 69 78 29 22 matrix,.(block.diagonal.matrix)"
8ae0 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c .......].....},.....{......."cel
8b00 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 l_type":."markdown",......."meta
8b20 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 data":.{},......."source":.[....
8b40 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 ....."Fig.2.:.plots.optimal.coup
8b60 6c 69 6e 67 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 5c lings.for.the.different.methods\
8b80 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d n-------------------------------
8ba0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a --------------------------\n\n".
8bc0 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c ......].....},.....{......."cell
8be0 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e _type":."code",......."execution
8c00 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a _count":.null,......."metadata":
8c20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 .{........."collapsed":.false...
8c40 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 ....},......."outputs":.[],.....
8c60 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 .."source":.[........."pl.figure
8c80 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f (2,.figsize=(8,.4))\n\npl.subplo
8ca0 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 t(1,.2,.1)\npl.imshow(ot_sinkhor
8cc0 6e 5f 75 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e n_un.coupling_,.interpolation='n
8ce0 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 earest')\npl.xticks([])\npl.ytic
8d00 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 ks([])\npl.title('Optimal.coupli
8d20 6e 67 5c 5c 6e 55 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 ng\\nUnsupervised.DA')\n\npl.sub
8d40 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b plot(1,.2,.2)\npl.imshow(ot_sink
8d60 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 horn_semi.coupling_,.interpolati
8d80 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c on='nearest')\npl.xticks([])\npl
8da0 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 .yticks([])\npl.title('Optimal.c
8dc0 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 65 6d 69 2d 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 5c 6e oupling\\nSemi-supervised.DA')\n
8de0 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 \npl.tight_layout()".......]....
8e00 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 .},.....{......."cell_type":."ma
8e20 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 rkdown",......."metadata":.{},..
8e40 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 33 20 ....."source":.[........."Fig.3.
8e60 3a 20 70 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d :.plot.transported.samples\n----
8e80 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e ----------------------------\n\n
8ea0 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 ".......].....},.....{......."ce
8ec0 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 ll_type":."code",......."executi
8ee0 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 on_count":.null,......."metadata
8f00 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a ":.{........."collapsed":.false.
8f20 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 ......},......."outputs":.[],...
8f40 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 64 69 73 70 6c ...."source":.[........."#.displ
8f60 61 79 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 ay.transported.samples\npl.figur
8f80 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 e(4,.figsize=(8,.4))\npl.subplot
8fa0 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 (1,.2,.1)\npl.scatter(Xt[:,.0],.
8fc0 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',\n...
8fe0 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 ........label='Target.samples',.
9000 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 alpha=0.5)\npl.scatter(transp_Xs
9020 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 _sinkhorn_un[:,.0],.transp_Xs_si
9040 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 nkhorn_un[:,.1],.c=ys,\n........
9060 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d ...marker='+',.label='Transp.sam
9080 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 ples',.s=30)\npl.title('Transpor
90a0 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c ted.samples\\nEmdTransport')\npl
90c0 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 .legend(loc=0)\npl.xticks([])\np
90e0 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c l.yticks([])\n\npl.subplot(1,.2,
9100 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 .2)\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.
9120 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 1],.c=yt,.marker='o',\n.........
9140 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d ..label='Target.samples',.alpha=
9160 30 2e 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 0.5)\npl.scatter(transp_Xs_sinkh
9180 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f orn_semi[:,.0],.transp_Xs_sinkho
91a0 72 6e 5f 73 65 6d 69 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 rn_semi[:,.1],.c=ys,\n..........
91c0 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c .marker='+',.label='Transp.sampl
91e0 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 es',.s=30)\npl.title('Transporte
9200 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c d.samples\\nSinkhornTransport')\
9220 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 5c npl.xticks([])\npl.yticks([])\n\
9240 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 npl.tight_layout()\npl.show()"..
9260 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 .....].....}...],..."metadata":.
9280 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 {....."kernelspec":.{......."dis
92a0 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c play_name":."Python.3",......."l
92c0 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 anguage":."python",......."name"
92e0 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 33 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 :."python3".....},....."language
9300 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 _info":.{......."codemirror_mode
9320 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a ":.{........."name":."ipython",.
9340 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 33 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 ........"version":.3.......},...
9360 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 0a 20 20 20 ...."file_extension":.".py",....
9380 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a ..."mimetype":."text/x-python",.
93a0 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e ......"name":."python",......."n
93c0 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 bconvert_exporter":."python",...
93e0 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 33 22 ...."pygments_lexer":."ipython3"
9400 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 33 2e 36 2e 35 22 0a 20 20 20 20 7d ,......."version":."3.6.5".....}
9420 0a 20 20 7d 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d ...},..."nbformat":.4,..."nbform
9440 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 4b 4c be 4c 27 4a df 9c at_minor":.0.}PK........KL.L'J..
9460 9d 0d 00 00 9d 0d 00 00 10 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 ............plot_OT_1D.ipynb{...
9480 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 "cells":.[.....{......."cell_typ
94a0 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 e":."code",......."execution_cou
94c0 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 nt":.null,......."metadata":.{..
94e0 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 ......."collapsed":.false.......
9500 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 },......."outputs":.[],......."s
9520 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 ource":.[........."%matplotlib.i
9540 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 nline".......].....},.....{.....
9560 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 .."cell_type":."markdown",......
9580 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a ."metadata":.{},......."source":
95a0 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 31 44 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 .[........."\n#.1D.optimal.trans
95c0 70 6f 72 74 5c 6e 5c 6e 5c 6e 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6c 6c 75 73 74 72 61 74 port\n\n\nThis.example.illustrat
95e0 65 73 20 74 68 65 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 45 4d 44 20 61 6e 64 20 53 69 es.the.computation.of.EMD.and.Si
9600 6e 6b 68 6f 72 6e 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 70 6c 61 6e 73 5c 6e 61 6e 64 20 74 68 65 69 nkhorn.transport.plans\nand.thei
9620 72 20 76 69 73 75 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 2e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a r.visualization.\n\n\n".......].
9640 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 ....},.....{......."cell_type":.
9660 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a "code",......."execution_count":
9680 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 .null,......."metadata":.{......
96a0 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 ..."collapsed":.false.......},..
96c0 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 ....."outputs":.[],......."sourc
96e0 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c e":.[........."#.Author:.Remi.Fl
9700 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 amary.<remi.flamary@unice.fr>\n#
9720 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f \n#.License:.MIT.License\n\nimpo
9740 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 rt.numpy.as.np\nimport.matplotli
9760 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 b.pylab.as.pl\nimport.ot\nimport
9780 20 6f 74 2e 70 6c 6f 74 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 20 69 6d 70 6f 72 .ot.plot\nfrom.ot.datasets.impor
97a0 74 20 6d 61 6b 65 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 20 61 73 20 67 61 75 73 73 22 0a 20 20 20 20 20 20 t.make_1D_gauss.as.gauss".......
97c0 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 ].....},.....{......."cell_type"
97e0 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 :."markdown",......."metadata":.
9800 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 47 {},......."source":.[........."G
9820 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 enerate.data\n-------------\n\n"
9840 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c .......].....},.....{......."cel
9860 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f l_type":."code",......."executio
9880 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 n_count":.null,......."metadata"
98a0 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 :.{........."collapsed":.false..
98c0 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 .....},......."outputs":.[],....
98e0 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 70 61 72 61 ..."source":.[........."#%%.para
9900 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e 73 5c 6e 5c 6e meters\n\nn.=.100..#.nb.bins\n\n
9920 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 5c 6e 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e #.bin.positions\nx.=.np.arange(n
9940 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e 5c 6e 23 20 47 61 75 73 73 69 61 ,.dtype=np.float64)\n\n#.Gaussia
9960 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 61 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d n.distributions\na.=.gauss(n,.m=
9980 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 5c 6e 62 20 3d 20,.s=5)..#.m=.mean,.s=.std\nb.=
99a0 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 36 30 2c 20 73 3d 31 30 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 .gauss(n,.m=60,.s=10)\n\n#.loss.
99c0 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e matrix\nM.=.ot.dist(x.reshape((n
99e0 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 ,.1)),.x.reshape((n,.1)))\nM./=.
9a00 4d 2e 6d 61 78 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 M.max()".......].....},.....{...
9a20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 ...."cell_type":."markdown",....
9a40 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 ..."metadata":.{},......."source
9a60 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 ":.[........."Plot.distributions
9a80 20 61 6e 64 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d .and.loss.matrix\n--------------
9aa0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 --------------------\n\n".......
9ac0 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 ].....},.....{......."cell_type"
9ae0 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 :."code",......."execution_count
9b00 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 ":.null,......."metadata":.{....
9b20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c ....."collapsed":.false.......},
9b40 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 ......."outputs":.[],......."sou
9b60 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 rce":.[........."#%%.plot.the.di
9b80 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 stributions\n\npl.figure(1,.figs
9ba0 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 61 2c 20 27 62 27 ize=(6.4,.3))\npl.plot(x,.a,.'b'
9bc0 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 5c 6e ,.label='Source.distribution')\n
9be0 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 pl.plot(x,.b,.'r',.label='Target
9c00 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 5c 6e .distribution')\npl.legend()\n\n
9c20 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 61 6e 64 20 6c 6f 73 73 20 #%%.plot.distributions.and.loss.
9c40 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 matrix\n\npl.figure(2,.figsize=(
9c60 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 5,.5))\not.plot.plot1D_mat(a,.b,
9c80 20 4d 2c 20 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 4d 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 .M,.'Cost.matrix.M')".......]...
9ca0 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d ..},.....{......."cell_type":."m
9cc0 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a arkdown",......."metadata":.{},.
9ce0 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 53 6f 6c 76 65 ......"source":.[........."Solve
9d00 20 45 4d 44 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 .EMD\n---------\n\n".......]....
9d20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f .},.....{......."cell_type":."co
9d40 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 de",......."execution_count":.nu
9d60 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 ll,......."metadata":.{.........
9d80 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 "collapsed":.false.......},.....
9da0 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a .."outputs":.[],......."source":
9dc0 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e 5c 6e 47 30 20 3d 20 6f 74 2e 65 .[........."#%%.EMD\n\nG0.=.ot.e
9de0 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 md(a,.b,.M)\n\npl.figure(3,.figs
9e00 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 ize=(5,.5))\not.plot.plot1D_mat(
9e20 61 2c 20 62 2c 20 47 30 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 30 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 a,.b,.G0,.'OT.matrix.G0')"......
9e40 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 .].....},.....{......."cell_type
9e60 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a ":."markdown",......."metadata":
9e80 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 .{},......."source":.[........."
9ea0 53 6f 6c 76 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e Solve.Sinkhorn\n--------------\n
9ec0 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 \n".......].....},.....{......."
9ee0 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 cell_type":."code",......."execu
9f00 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 tion_count":.null,......."metada
9f20 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 ta":.{........."collapsed":.fals
9f40 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a e.......},......."outputs":.[],.
9f60 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 53 ......"source":.[........."#%%.S
9f80 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 5c 6e 6c 61 6d 62 64 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 47 73 20 3d 20 6f 74 inkhorn\n\nlambd.=.1e-3\nGs.=.ot
9fa0 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 6c 61 6d 62 64 2c 20 76 65 72 62 6f 73 .sinkhorn(a,.b,.M,.lambd,.verbos
9fc0 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d e=True)\n\npl.figure(4,.figsize=
9fe0 28 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 (5,.5))\not.plot.plot1D_mat(a,.b
a000 2c 20 47 73 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 ,.Gs,.'OT.matrix.Sinkhorn')\n\np
a020 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 0a 20 20 22 l.show()".......].....}...],..."
a040 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b metadata":.{....."kernelspec":.{
a060 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 33 ......."display_name":."Python.3
a080 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 ",......."language":."python",..
a0a0 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 33 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 ....."name":."python3".....},...
a0c0 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 .."language_info":.{......."code
a0e0 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 mirror_mode":.{........."name":.
a100 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 33 0a "ipython",........."version":.3.
a120 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a ......},......."file_extension":
a140 20 22 2e 70 79 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f .".py",......."mimetype":."text/
a160 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e x-python",......."name":."python
a180 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 ",......."nbconvert_exporter":."
a1a0 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a python",......."pygments_lexer":
a1c0 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 33 ."ipython3",......."version":."3
a1e0 2e 36 2e 35 22 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 .6.5".....}...},..."nbformat":.4
a200 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 ,..."nbformat_minor":.0.}PK.....
a220 00 00 00 51 4c be 4c 18 79 30 f2 4b 11 00 00 4b 11 00 00 18 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 62 61 72 79 ...QL.L.y0.K...K.......plot_bary
a240 63 65 6e 74 65 72 5f 31 44 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 center_1D.ipynb{..."cells":.[...
a260 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 ..{......."cell_type":."code",..
a280 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 ....."execution_count":.null,...
a2a0 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 ...."metadata":.{........."colla
a2c0 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 psed":.false.......},......."out
a2e0 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 puts":.[],......."source":.[....
a300 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 ....."%matplotlib.inline".......
a320 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 ].....},.....{......."cell_type"
a340 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 :."markdown",......."metadata":.
a360 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c {},......."source":.[........."\
a380 6e 23 20 31 44 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 64 65 6d n#.1D.Wasserstein.barycenter.dem
a3a0 6f 5c 6e 5c 6e 5c 6e 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6c 6c 75 73 74 72 61 74 65 73 20 o\n\n\nThis.example.illustrates.
a3c0 74 68 65 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 57 the.computation.of.regularized.W
a3e0 61 73 73 65 72 73 79 65 69 6e 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5c 6e 61 73 20 70 72 6f 70 6f 73 assersyein.Barycenter\nas.propos
a400 65 64 20 69 6e 20 5b 33 5d 2e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5b 33 5d 20 42 65 6e 61 6d 6f 75 2c 20 4a 2e 20 ed.in.[3].\n\n\n[3].Benamou,.J..
a420 44 2e 2c 20 43 61 72 6c 69 65 72 2c 20 47 2e 2c 20 43 75 74 75 72 69 2c 20 4d 2e 2c 20 4e 65 6e D.,.Carlier,.G.,.Cuturi,.M.,.Nen
a440 6e 61 2c 20 4c 2e 2c 20 26 20 50 65 79 72 5c 75 30 30 65 39 2c 20 47 2e 20 28 32 30 31 35 29 2e na,.L.,.&.Peyr\u00e9,.G..(2015).
a460 5c 6e 49 74 65 72 61 74 69 76 65 20 42 72 65 67 6d 61 6e 20 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 73 20 \nIterative.Bregman.projections.
a480 66 6f 72 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 61 74 69 6f 6e 20 70 for.regularized.transportation.p
a4a0 72 6f 62 6c 65 6d 73 5c 6e 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c 20 6f 6e 20 53 63 69 65 6e 74 69 roblems\nSIAM.Journal.on.Scienti
a4c0 66 69 63 20 43 6f 6d 70 75 74 69 6e 67 2c 20 33 37 28 32 29 2c 20 41 31 31 31 31 2d 41 31 31 33 fic.Computing,.37(2),.A1111-A113
a4e0 38 2e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 8.\n\n\n".......].....},.....{..
a500 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 ....."cell_type":."code",.......
a520 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 "execution_count":.null,......."
a540 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 metadata":.{........."collapsed"
a560 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 :.false.......},......."outputs"
a580 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 :.[],......."source":.[.........
a5a0 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c "#.Author:.Remi.Flamary.<remi.fl
a5c0 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d amary@unice.fr>\n#\n#.License:.M
a5e0 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 IT.License\n\nimport.numpy.as.np
a600 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c \nimport.matplotlib.pylab.as.pl\
a620 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 23 20 6e 65 63 65 73 73 61 72 79 20 66 6f 72 20 33 64 20 70 nimport.ot\n#.necessary.for.3d.p
a640 6c 6f 74 20 65 76 65 6e 20 69 66 20 6e 6f 74 20 75 73 65 64 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6d 70 6c 5f 74 lot.even.if.not.used\nfrom.mpl_t
a660 6f 6f 6c 6b 69 74 73 2e 6d 70 6c 6f 74 33 64 20 69 6d 70 6f 72 74 20 41 78 65 73 33 44 20 20 23 oolkits.mplot3d.import.Axes3D..#
a680 20 6e 6f 71 61 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f .noqa\nfrom.matplotlib.collectio
a6a0 6e 73 20 69 6d 70 6f 72 74 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 23 5c 6e 23 ns.import.PolyCollection\n\n#\n#
a6c0 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c .Generate.data\n#.-------------\
a6e0 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 n\n#%%.parameters\n\nn.=.100..#.
a700 6e 62 20 62 69 6e 73 5c 6e 5c 6e 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 5c 6e 78 20 3d 20 nb.bins\n\n#.bin.positions\nx.=.
a720 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e np.arange(n,.dtype=np.float64)\n
a740 5c 6e 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 61 31 20 3d \n#.Gaussian.distributions\na1.=
a760 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d .ot.datasets.make_1D_gauss(n,.m=
a780 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 5c 6e 61 32 20 20,.s=5)..#.m=.mean,.s=.std\na2.
a7a0 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d =.ot.datasets.make_1D_gauss(n,.m
a7c0 3d 36 30 2c 20 73 3d 38 29 5c 6e 5c 6e 23 20 63 72 65 61 74 69 6e 67 20 6d 61 74 72 69 78 20 41 =60,.s=8)\n\n#.creating.matrix.A
a7e0 20 63 6f 6e 74 61 69 6e 69 6e 67 20 61 6c 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 41 .containing.all.distributions\nA
a800 20 3d 20 6e 70 2e 76 73 74 61 63 6b 28 28 61 31 2c 20 61 32 29 29 2e 54 5c 6e 6e 5f 64 69 73 74 .=.np.vstack((a1,.a2)).T\nn_dist
a820 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 3d 20 41 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 ributions.=.A.shape[1]\n\n#.loss
a840 20 6d 61 74 72 69 78 20 2b 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e .matrix.+.normalization\nM.=.ot.
a860 75 74 69 6c 73 2e 64 69 73 74 30 28 6e 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e utils.dist0(n)\nM./=.M.max()\n\n
a880 23 5c 6e 23 20 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 5c 6e 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 23 #\n#.Plot.data\n#.---------\n\n#
a8a0 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e %%.plot.the.distributions\n\npl.
a8c0 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 66 6f 72 figure(1,.figsize=(6.4,.3))\nfor
a8e0 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 .i.in.range(n_distributions):\n.
a900 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 ...pl.plot(x,.A[:,.i])\npl.title
a920 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f ('Distributions')\npl.tight_layo
a940 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 ut()\n\n#\n#.Barycenter.computat
a960 69 6f 6e 5c 6e 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c ion\n#.----------------------\n\
a980 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 61 n#%%.barycenter.computation\n\na
a9a0 6c 70 68 61 20 3d 20 30 2e 32 20 20 23 20 30 3c 3d 61 6c 70 68 61 3c 3d 31 5c 6e 77 65 69 67 68 lpha.=.0.2..#.0<=alpha<=1\nweigh
a9c0 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d ts.=.np.array([1.-.alpha,.alpha]
a9e0 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 32 62 61 72 79 5c 6e 62 61 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 )\n\n#.l2bary\nbary_l2.=.A.dot(w
aa00 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 eights)\n\n#.wasserstein\nreg.=.
aa20 31 65 2d 33 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 1e-3\nbary_wass.=.ot.bregman.bar
aa40 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 70 ycenter(A,.M,.reg,.weights)\n\np
aa60 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f l.figure(2)\npl.clf()\npl.subplo
aa80 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 t(2,.1,.1)\nfor.i.in.range(n_dis
aaa0 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a tributions):\n....pl.plot(x,.A[:
aac0 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 ,.i])\npl.title('Distributions')
aae0 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 \n\npl.subplot(2,.1,.2)\npl.plot
ab00 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 5c 6e 70 (x,.bary_l2,.'r',.label='l2')\np
ab20 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d l.plot(x,.bary_wass,.'g',.label=
ab40 27 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 70 6c 2e 'Wasserstein')\npl.legend()\npl.
ab60 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c title('Barycenters')\npl.tight_l
ab80 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 69 6e 74 65 ayout()\n\n#\n#.Barycentric.inte
aba0 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 5c 6e 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d rpolation\n#.-------------------
abc0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f ------\n\n#%%.barycenter.interpo
abe0 6c 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 6e 5f 61 6c 70 68 61 20 3d 20 31 31 5c 6e 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 lation\n\nn_alpha.=.11\nalpha_li
ac00 73 74 20 3d 20 6e 70 2e 6c 69 6e 73 70 61 63 65 28 30 2c 20 31 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 5c st.=.np.linspace(0,.1,.n_alpha)\
ac20 6e 5c 6e 5c 6e 42 5f 6c 32 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 n\n\nB_l2.=.np.zeros((n,.n_alpha
ac40 29 29 5c 6e 5c 6e 42 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 70 79 28 42 5f 6c 32 29 5c 6e 5c 6e ))\n\nB_wass.=.np.copy(B_l2)\n\n
ac60 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 30 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 3a 5c 6e 20 20 20 for.i.in.range(0,.n_alpha):\n...
ac80 20 61 6c 70 68 61 20 3d 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5b 69 5d 5c 6e 20 20 20 20 77 65 69 67 .alpha.=.alpha_list[i]\n....weig
aca0 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 hts.=.np.array([1.-.alpha,.alpha
acc0 5d 29 5c 6e 20 20 20 20 42 5f 6c 32 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 ])\n....B_l2[:,.i].=.A.dot(weigh
ace0 74 73 29 5c 6e 20 20 20 20 42 5f 77 61 73 73 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d ts)\n....B_wass[:,.i].=.ot.bregm
ad00 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 an.barycenter(A,.M,.reg,.weights
ad20 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 70 )\n\n#%%.plot.interpolation\n\np
ad40 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 5c 6e 5c 6e 63 6d 61 70 20 3d 20 70 6c 2e 63 6d 2e 67 65 74 5f l.figure(3)\n\ncmap.=.pl.cm.get_
ad60 63 6d 61 70 28 27 76 69 72 69 64 69 73 27 29 5c 6e 76 65 72 74 73 20 3d 20 5b 5d 5c 6e 7a 73 20 cmap('viridis')\nverts.=.[]\nzs.
ad80 3d 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5c 6e 66 6f 72 20 69 2c 20 7a 20 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 =.alpha_list\nfor.i,.z.in.enumer
ada0 61 74 65 28 7a 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 79 73 20 3d 20 42 5f 6c 32 5b 3a 2c 20 69 5d 5c 6e 20 ate(zs):\n....ys.=.B_l2[:,.i]\n.
adc0 20 20 20 76 65 72 74 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 6c 69 73 74 28 7a 69 70 28 78 2c 20 79 73 29 29 ...verts.append(list(zip(x,.ys))
ade0 29 5c 6e 5c 6e 61 78 20 3d 20 70 6c 2e 67 63 66 28 29 2e 67 63 61 28 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f )\n\nax.=.pl.gcf().gca(projectio
ae00 6e 3d 27 33 64 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6f 6c 79 20 3d 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e n='3d')\n\npoly.=.PolyCollection
ae20 28 76 65 72 74 73 2c 20 66 61 63 65 63 6f 6c 6f 72 73 3d 5b 63 6d 61 70 28 61 29 20 66 6f 72 20 (verts,.facecolors=[cmap(a).for.
ae40 61 20 69 6e 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5d 29 5c 6e 70 6f 6c 79 2e 73 65 74 5f 61 6c 70 68 a.in.alpha_list])\npoly.set_alph
ae60 61 28 30 2e 37 29 5c 6e 61 78 2e 61 64 64 5f 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 33 64 28 70 6f 6c 79 a(0.7)\nax.add_collection3d(poly
ae80 2c 20 7a 73 3d 7a 73 2c 20 7a 64 69 72 3d 27 79 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 61 62 65 ,.zs=zs,.zdir='y')\nax.set_xlabe
aea0 6c 28 27 78 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 6e 29 5c 6e 61 78 2e l('x')\nax.set_xlim3d(0,.n)\nax.
aec0 73 65 74 5f 79 6c 61 62 65 6c 28 27 24 5c 5c 5c 5c 61 6c 70 68 61 24 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 set_ylabel('$\\\\alpha$')\nax.se
aee0 74 5f 79 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 31 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 61 62 65 6c 28 27 27 t_ylim3d(0,.1)\nax.set_zlabel(''
af00 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 42 5f 6c 32 2e 6d 61 78 28 29 20 2a )\nax.set_zlim3d(0,.B_l2.max().*
af20 20 31 2e 30 31 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 .1.01)\npl.title('Barycenter.int
af40 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 6c 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c erpolation.with.l2')\npl.tight_l
af60 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 29 5c 6e 63 6d 61 70 20 3d 20 ayout()\n\npl.figure(4)\ncmap.=.
af80 70 6c 2e 63 6d 2e 67 65 74 5f 63 6d 61 70 28 27 76 69 72 69 64 69 73 27 29 5c 6e 76 65 72 74 73 pl.cm.get_cmap('viridis')\nverts
afa0 20 3d 20 5b 5d 5c 6e 7a 73 20 3d 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5c 6e 66 6f 72 20 69 2c 20 7a .=.[]\nzs.=.alpha_list\nfor.i,.z
afc0 20 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 7a 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 79 73 20 3d 20 42 5f 77 .in.enumerate(zs):\n....ys.=.B_w
afe0 61 73 73 5b 3a 2c 20 69 5d 5c 6e 20 20 20 20 76 65 72 74 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 6c 69 73 74 ass[:,.i]\n....verts.append(list
b000 28 7a 69 70 28 78 2c 20 79 73 29 29 29 5c 6e 5c 6e 61 78 20 3d 20 70 6c 2e 67 63 66 28 29 2e 67 (zip(x,.ys)))\n\nax.=.pl.gcf().g
b020 63 61 28 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 3d 27 33 64 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6f 6c 79 20 3d 20 50 6f ca(projection='3d')\n\npoly.=.Po
b040 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 28 76 65 72 74 73 2c 20 66 61 63 65 63 6f 6c 6f 72 73 3d 5b lyCollection(verts,.facecolors=[
b060 63 6d 61 70 28 61 29 20 66 6f 72 20 61 20 69 6e 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5d 29 5c 6e 70 cmap(a).for.a.in.alpha_list])\np
b080 6f 6c 79 2e 73 65 74 5f 61 6c 70 68 61 28 30 2e 37 29 5c 6e 61 78 2e 61 64 64 5f 63 6f 6c 6c 65 oly.set_alpha(0.7)\nax.add_colle
b0a0 63 74 69 6f 6e 33 64 28 70 6f 6c 79 2c 20 7a 73 3d 7a 73 2c 20 7a 64 69 72 3d 27 79 27 29 5c 6e ction3d(poly,.zs=zs,.zdir='y')\n
b0c0 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 61 62 65 6c 28 27 78 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 69 6d 33 ax.set_xlabel('x')\nax.set_xlim3
b0e0 64 28 30 2c 20 6e 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 61 62 65 6c 28 27 24 5c 5c 5c 5c 61 6c 70 d(0,.n)\nax.set_ylabel('$\\\\alp
b100 68 61 24 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 31 29 5c 6e 61 78 2e 73 ha$')\nax.set_ylim3d(0,.1)\nax.s
b120 65 74 5f 7a 6c 61 62 65 6c 28 27 27 29 5c 6e 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 et_zlabel('')\nax.set_zlim3d(0,.
b140 42 5f 6c 32 2e 6d 61 78 28 29 20 2a 20 31 2e 30 31 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 B_l2.max().*.1.01)\npl.title('Ba
b160 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 57 61 73 73 rycenter.interpolation.with.Wass
b180 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e erstein')\npl.tight_layout()\n\n
b1a0 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 0a 20 20 pl.show()".......].....}...],...
b1c0 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 "metadata":.{....."kernelspec":.
b1e0 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 {......."display_name":."Python.
b200 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 3",......."language":."python",.
b220 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 33 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 ......"name":."python3".....},..
b240 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 ..."language_info":.{......."cod
b260 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a emirror_mode":.{........."name":
b280 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 33 ."ipython",........."version":.3
b2a0 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 .......},......."file_extension"
b2c0 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 :.".py",......."mimetype":."text
b2e0 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f /x-python",......."name":."pytho
b300 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 n",......."nbconvert_exporter":.
b320 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 "python",......."pygments_lexer"
b340 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 :."ipython3",......."version":."
b360 33 2e 36 2e 35 22 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 3.6.5".....}...},..."nbformat":.
b380 34 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 4,..."nbformat_minor":.0.}PK....
b3a0 00 00 00 00 fb 4c be 4c cc bf 84 66 2d 18 00 00 2d 18 00 00 17 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 .....L.L...f-...-.......plot_otd
b3c0 61 5f 63 6c 61 73 73 65 73 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 a_classes.ipynb{..."cells":.[...
b3e0 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 ..{......."cell_type":."code",..
b400 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 ....."execution_count":.null,...
b420 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 ...."metadata":.{........."colla
b440 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 psed":.false.......},......."out
b460 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 puts":.[],......."source":.[....
b480 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 ....."%matplotlib.inline".......
b4a0 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 ].....},.....{......."cell_type"
b4c0 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 :."markdown",......."metadata":.
b4e0 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c {},......."source":.[........."\
b500 6e 23 20 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 5c n#.OT.for.domain.adaptation\n\n\
b520 6e 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 73 20 61 20 64 6f 6d 61 69 nThis.example.introduces.a.domai
b540 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 69 6e 20 61 20 32 44 20 73 65 74 74 69 6e 67 20 61 6e 64 n.adaptation.in.a.2D.setting.and
b560 20 74 68 65 20 34 20 4f 54 44 41 5c 6e 61 70 70 72 6f 61 63 68 65 73 20 63 75 72 72 65 6e 74 6c .the.4.OTDA\napproaches.currentl
b580 79 20 73 75 70 70 6f 72 74 65 64 20 69 6e 20 50 4f 54 2e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 y.supported.in.POT.\n\n\n"......
b5a0 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 .].....},.....{......."cell_type
b5c0 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e ":."code",......."execution_coun
b5e0 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 t":.null,......."metadata":.{...
b600 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d ......"collapsed":.false.......}
b620 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f ,......."outputs":.[],......."so
b640 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d urce":.[........."#.Authors:.Rem
b660 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 i.Flamary.<remi.flamary@unice.fr
b680 3e 5c 6e 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 >\n#..........Stanislas.Chambon.
b6a0 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c <stan.chambon@gmail.com>\n#\n#.L
b6c0 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 icense:.MIT.License\n\nimport.ma
b6e0 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 22 tplotlib.pylab.as.pl\nimport.ot"
b700 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c .......].....},.....{......."cel
b720 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 l_type":."markdown",......."meta
b740 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 data":.{},......."source":.[....
b760 20 20 20 20 20 22 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d ....."Generate.data\n-----------
b780 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 --\n\n".......].....},.....{....
b7a0 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 ..."cell_type":."code",......."e
b7c0 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 xecution_count":.null,......."me
b7e0 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 tadata":.{........."collapsed":.
b800 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 false.......},......."outputs":.
b820 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e [],......."source":.[........."n
b840 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 31 35 30 5c 6e 6e 5f 74 61 72 67 65 74 5f _source_samples.=.150\nn_target_
b860 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 31 35 30 5c 6e 5c 6e 58 73 2c 20 79 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 samples.=.150\n\nXs,.ys.=.ot.dat
b880 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 27 asets.make_data_classif('3gauss'
b8a0 2c 20 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 29 5c 6e 58 74 2c 20 79 74 20 3d 20 6f 74 ,.n_source_samples)\nXt,.yt.=.ot
b8c0 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 .datasets.make_data_classif('3ga
b8e0 75 73 73 32 27 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 uss2',.n_target_samples)".......
b900 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 ].....},.....{......."cell_type"
b920 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 :."markdown",......."metadata":.
b940 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 49 {},......."source":.[........."I
b960 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f nstantiate.the.different.transpo
b980 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 5c 6e 2d 2d 2d 2d rt.algorithms.and.fit.them\n----
b9a0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d --------------------------------
b9c0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 -----------------------\n\n"....
b9e0 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 ...].....},.....{......."cell_ty
ba00 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f pe":."code",......."execution_co
ba20 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a unt":.null,......."metadata":.{.
ba40 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 ........"collapsed":.false......
ba60 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 .},......."outputs":.[],......."
ba80 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 45 4d 44 20 54 72 61 6e 73 70 source":.[........."#.EMD.Transp
baa0 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 ort\not_emd.=.ot.da.EMDTransport
bac0 28 29 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e ()\not_emd.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n
bae0 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 #.Sinkhorn.Transport\not_sinkhor
bb00 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f n.=.ot.da.SinkhornTransport(reg_
bb20 65 3d 31 65 2d 31 29 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 e=1e-1)\not_sinkhorn.fit(Xs=Xs,.
bb40 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 Xt=Xt)\n\n#.Sinkhorn.Transport.w
bb60 69 74 68 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e ith.Group.lasso.regularization\n
bb80 6f 74 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e ot_lpl1.=.ot.da.SinkhornLpl1Tran
bba0 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 2c 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 31 65 30 29 5c 6e 6f sport(reg_e=1e-1,.reg_cl=1e0)\no
bbc0 74 5f 6c 70 6c 31 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c t_lpl1.fit(Xs=Xs,.ys=ys,.Xt=Xt)\
bbe0 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 47 72 6f n\n#.Sinkhorn.Transport.with.Gro
bc00 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 6c 31 6c 32 5c 6e 6f 74 up.lasso.regularization.l1l2\not
bc20 5f 6c 31 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 70 _l1l2.=.ot.da.SinkhornL1l2Transp
bc40 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 2c 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 32 65 30 2c 20 6d 61 78 5f ort(reg_e=1e-1,.reg_cl=2e0,.max_
bc60 69 74 65 72 3d 32 30 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 iter=20,\n......................
bc80 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f ................verbose=True)\no
bca0 74 5f 6c 31 6c 32 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c t_l1l2.fit(Xs=Xs,.ys=ys,.Xt=Xt)\
bcc0 6e 5c 6e 23 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6f 6e n\n#.transport.source.samples.on
bce0 74 6f 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 to.target.samples\ntransp_Xs_emd
bd00 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e .=.ot_emd.transform(Xs=Xs)\ntran
bd20 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 sp_Xs_sinkhorn.=.ot_sinkhorn.tra
bd40 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 nsform(Xs=Xs)\ntransp_Xs_lpl1.=.
bd60 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 ot_lpl1.transform(Xs=Xs)\ntransp
bd80 5f 58 73 5f 6c 31 6c 32 20 3d 20 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d _Xs_l1l2.=.ot_l1l2.transform(Xs=
bda0 58 73 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 Xs)".......].....},.....{.......
bdc0 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 "cell_type":."markdown",......."
bde0 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b metadata":.{},......."source":.[
be00 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 ........."Fig.1.:.plots.source.a
be20 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d nd.target.samples\n-------------
be40 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a --------------------------\n\n".
be60 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c ......].....},.....{......."cell
be80 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e _type":."code",......."execution
bea0 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a _count":.null,......."metadata":
bec0 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 .{........."collapsed":.false...
bee0 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 ....},......."outputs":.[],.....
bf00 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 .."source":.[........."pl.figure
bf20 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 35 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 (1,.figsize=(10,.5))\npl.subplot
bf40 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 (1,.2,.1)\npl.scatter(Xs[:,.0],.
bf60 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+',.labe
bf80 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b l='Source.samples')\npl.xticks([
bfa0 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 ])\npl.yticks([])\npl.legend(loc
bfc0 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 =0)\npl.title('Source..samples')
bfe0 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 \n\npl.subplot(1,.2,.2)\npl.scat
c000 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 ter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.ma
c020 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 rker='o',.label='Target.samples'
c040 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c )\npl.xticks([])\npl.yticks([])\
c060 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 npl.legend(loc=0)\npl.title('Tar
c080 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 get.samples')\npl.tight_layout()
c0a0 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 ".......].....},.....{......."ce
c0c0 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 ll_type":."markdown",......."met
c0e0 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 adata":.{},......."source":.[...
c100 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 ......"Fig.2.:.plot.optimal.coup
c120 6c 69 6e 67 73 20 61 6e 64 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d lings.and.transported.samples\n-
c140 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d --------------------------------
c160 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 ---------------------\n\n"......
c180 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 .].....},.....{......."cell_type
c1a0 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e ":."code",......."execution_coun
c1c0 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 t":.null,......."metadata":.{...
c1e0 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d ......"collapsed":.false.......}
c200 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f ,......."outputs":.[],......."so
c220 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 20 3d 20 7b 27 urce":.[........."param_img.=.{'
c240 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 27 3a 20 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 7d 5c 6e 5c 6e 70 6c interpolation':.'nearest'}\n\npl
c260 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 35 2c 20 38 29 29 5c 6e 70 6c 2e .figure(2,.figsize=(15,.8))\npl.
c280 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 subplot(2,.4,.1)\npl.imshow(ot_e
c2a0 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 md.coupling_,.**param_img)\npl.x
c2c0 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 ticks([])\npl.yticks([])\npl.tit
c2e0 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 le('Optimal.coupling\\nEMDTransp
c300 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c ort')\n\npl.subplot(2,.4,.2)\npl
c320 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a .imshow(ot_sinkhorn.coupling_,.*
c340 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 *param_img)\npl.xticks([])\npl.y
c360 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 ticks([])\npl.title('Optimal.cou
c380 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 pling\\nSinkhornTransport')\n\np
c3a0 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 l.subplot(2,.4,.3)\npl.imshow(ot
c3c0 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 _lpl1.coupling_,.**param_img)\np
c3e0 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e l.xticks([])\npl.yticks([])\npl.
c400 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f title('Optimal.coupling\\nSinkho
c420 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 rnLpl1Transport')\n\npl.subplot(
c440 32 2c 20 34 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 63 6f 75 70 2,.4,.4)\npl.imshow(ot_l1l2.coup
c460 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b ling_,.**param_img)\npl.xticks([
c480 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 ])\npl.yticks([])\npl.title('Opt
c4a0 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e imal.coupling\\nSinkhornL1l2Tran
c4c0 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 35 29 5c 6e sport')\n\npl.subplot(2,.4,.5)\n
c4e0 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c
c500 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 =yt,.marker='o',\n...........lab
c520 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c el='Target.samples',.alpha=0.3)\
c540 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c npl.scatter(transp_Xs_emd[:,.0],
c560 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 .transp_Xs_emd[:,.1],.c=ys,\n...
c580 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 ........marker='+',.label='Trans
c5a0 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 p.samples',.s=30)\npl.xticks([])
c5c0 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 \npl.yticks([])\npl.title('Trans
c5e0 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c ported.samples\\nEmdTransport')\
c600 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 5c 22 6c 6f 77 65 72 20 6c 65 66 74 5c 22 29 5c 6e npl.legend(loc=\"lower.left\")\n
c620 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 36 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 \npl.subplot(2,.4,.6)\npl.scatte
c640 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b r(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.mark
c660 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 er='o',\n...........label='Targe
c680 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 t.samples',.alpha=0.3)\npl.scatt
c6a0 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 er(transp_Xs_sinkhorn[:,.0],.tra
c6c0 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 nsp_Xs_sinkhorn[:,.1],.c=ys,\n..
c6e0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e .........marker='+',.label='Tran
c700 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d sp.samples',.s=30)\npl.xticks([]
c720 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e )\npl.yticks([])\npl.title('Tran
c740 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 sported.samples\\nSinkhornTransp
c760 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 37 29 5c 6e 70 6c ort')\n\npl.subplot(2,.4,.7)\npl
c780 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 .scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=y
c7a0 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c t,.marker='o',\n...........label
c7c0 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 ='Target.samples',.alpha=0.3)\np
c7e0 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 l.scatter(transp_Xs_lpl1[:,.0],.
c800 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 transp_Xs_lpl1[:,.1],.c=ys,\n...
c820 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 ........marker='+',.label='Trans
c840 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 p.samples',.s=30)\npl.xticks([])
c860 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 \npl.yticks([])\npl.title('Trans
c880 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 ported.samples\\nSinkhornLpl1Tra
c8a0 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 38 29 5c nsport')\n\npl.subplot(2,.4,.8)\
c8c0 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.
c8e0 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 c=yt,.marker='o',\n...........la
c900 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 bel='Target.samples',.alpha=0.3)
c920 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 31 6c 32 5b 3a 2c 20 30 \npl.scatter(transp_Xs_l1l2[:,.0
c940 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 31 6c 32 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e ],.transp_Xs_l1l2[:,.1],.c=ys,\n
c960 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 ...........marker='+',.label='Tr
c980 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 ansp.samples',.s=30)\npl.xticks(
c9a0 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 [])\npl.yticks([])\npl.title('Tr
c9c0 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 ansported.samples\\nSinkhornL1l2
c9e0 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e Transport')\npl.tight_layout()\n
ca00 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 0a \npl.show()".......].....}...],.
ca20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 .."metadata":.{....."kernelspec"
ca40 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f :.{......."display_name":."Pytho
ca60 6e 20 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 n.3",......."language":."python"
ca80 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 33 22 0a 20 20 20 20 7d 2c ,......."name":."python3".....},
caa0 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 ....."language_info":.{......."c
cac0 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 odemirror_mode":.{........."name
cae0 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a ":."ipython",........."version":
cb00 20 33 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f .3.......},......."file_extensio
cb20 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 n":.".py",......."mimetype":."te
cb40 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 xt/x-python",......."name":."pyt
cb60 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 hon",......."nbconvert_exporter"
cb80 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 :."python",......."pygments_lexe
cba0 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a r":."ipython3",......."version":
cbc0 20 22 33 2e 36 2e 35 22 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 ."3.6.5".....}...},..."nbformat"
cbe0 3a 20 34 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 0a 7d 50 4b 03 04 :.4,..."nbformat_minor":.0.}PK..
cc00 14 00 00 00 00 00 a7 6e a2 4c ee 5d c2 9b 78 18 00 00 78 18 00 00 25 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f .......n.L.]..x...x...%...plot_o
cc20 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 63 6f 6c 6f 72 73 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 7b tda_mapping_colors_images.ipynb{
cc40 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f ..."nbformat_minor":.0,...."nbfo
cc60 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 rmat":.4,...."cells":.[.....{...
cc80 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 ...."execution_count":.null,....
cca0 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 ...."cell_type":."code",........
ccc0 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 "source":.[........."%matplotlib
cce0 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 .inline".......],........"output
cd00 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 s":.[],........"metadata":.{....
cd20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a ....."collapsed":.false.......}.
cd40 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a ....},......{......."source":.[.
cd60 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 4f 54 20 66 6f 72 20 69 6d 61 67 65 20 63 6f 6c 6f 72 20 ........"\n#.OT.for.image.color.
cd80 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 adaptation.with.mapping.estimati
cda0 6f 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e on\n\n\nOT.for.domain.adaptation
cdc0 20 77 69 74 68 20 69 6d 61 67 65 20 63 6f 6c 6f 72 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 5b 36 5d .with.image.color.adaptation.[6]
cde0 20 77 69 74 68 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 5b 38 5d 2e 5c 6e .with.mapping\nestimation.[8].\n
ce00 5c 6e 5b 36 5d 20 46 65 72 72 61 64 61 6e 73 2c 20 53 2e 2c 20 50 61 70 61 64 61 6b 69 73 2c 20 \n[6].Ferradans,.S.,.Papadakis,.
ce20 4e 2e 2c 20 50 65 79 72 65 2c 20 47 2e 2c 20 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 4a 2e 20 46 2e 20 28 32 N.,.Peyre,.G.,.&.Aujol,.J..F..(2
ce40 30 31 34 29 2e 20 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 5c 6e 20 20 20 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 014)..Regularized\n....discrete.
ce60 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 2e 20 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c 20 optimal.transport..SIAM.Journal.
ce80 6f 6e 20 49 6d 61 67 69 6e 67 20 53 63 69 65 6e 63 65 73 2c 20 37 28 33 29 2c 5c 6e 20 20 20 20 on.Imaging.Sciences,.7(3),\n....
cea0 31 38 35 33 2d 31 38 38 32 2e 5c 6e 5b 38 5d 20 4d 2e 20 50 65 72 72 6f 74 2c 20 4e 2e 20 43 6f 1853-1882.\n[8].M..Perrot,.N..Co
cec0 75 72 74 79 2c 20 52 2e 20 46 6c 61 6d 61 72 79 2c 20 41 2e 20 48 61 62 72 61 72 64 2c 20 5c 22 urty,.R..Flamary,.A..Habrard,.\"
cee0 4d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 5c 6e 20 20 20 20 64 69 73 63 Mapping.estimation.for\n....disc
cf00 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 22 2c 20 4e 65 75 72 61 6c rete.optimal.transport\",.Neural
cf20 20 49 6e 66 6f 72 6d 61 74 69 6f 6e 20 50 72 6f 63 65 73 73 69 6e 67 20 53 79 73 74 65 6d 73 20 .Information.Processing.Systems.
cf40 28 4e 49 50 53 29 2c 5c 6e 20 20 20 20 32 30 31 36 2e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 (NIPS),\n....2016.\n\n\n".......
cf60 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e ],........"cell_type":."markdown
cf80 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 ",........"metadata":.{}.....},.
cfa0 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 .....{......."execution_count":.
cfc0 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 null,........"cell_type":."code"
cfe0 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 ,........"source":.[........."#.
d000 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d Authors:.Remi.Flamary.<remi.flam
d020 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 ary@unice.fr>\n#..........Stanis
d040 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e las.Chambon.<stan.chambon@gmail.
d060 63 6f 6d 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c com>\n#\n#.License:.MIT.License\
d080 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 66 72 6f 6d 20 73 63 69 70 n\nimport.numpy.as.np\nfrom.scip
d0a0 79 20 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 64 69 6d 61 67 65 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 y.import.ndimage\nimport.matplot
d0c0 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 5c 6e 72 20 lib.pylab.as.pl\nimport.ot\n\nr.
d0e0 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 52 61 6e 64 6f 6d 53 74 61 74 65 28 34 32 29 5c 6e 5c 6e 5c =.np.random.RandomState(42)\n\n\
d100 6e 64 65 66 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e 76 65 ndef.im2mat(I):\n....\"\"\"Conve
d120 72 74 73 20 61 6e 64 20 69 6d 61 67 65 20 74 6f 20 6d 61 74 72 69 78 20 28 6f 6e 65 20 70 69 78 rts.and.image.to.matrix.(one.pix
d140 65 6c 20 70 65 72 20 6c 69 6e 65 29 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 49 el.per.line)\"\"\"\n....return.I
d160 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 49 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 20 2a 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 31 .reshape((I.shape[0].*.I.shape[1
d180 5d 2c 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 32 5d 29 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 6d 61 74 32 69 6d 28 ],.I.shape[2]))\n\n\ndef.mat2im(
d1a0 58 2c 20 73 68 61 70 65 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 62 X,.shape):\n....\"\"\"Converts.b
d1c0 61 63 6b 20 61 20 6d 61 74 72 69 78 20 74 6f 20 61 6e 20 69 6d 61 67 65 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e ack.a.matrix.to.an.image\"\"\"\n
d1e0 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 58 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 73 68 61 70 65 29 5c 6e 5c 6e 5c ....return.X.reshape(shape)\n\n\
d200 6e 64 65 66 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 63 ndef.minmax(I):\n....return.np.c
d220 6c 69 70 28 49 2c 20 30 2c 20 31 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f lip(I,.0,.1)".......],........"o
d240 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 utputs":.[],........"metadata":.
d260 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 {........."collapsed":.false....
d280 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 ...}.....},......{......."source
d2a0 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d ":.[........."Generate.data\n---
d2c0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 ----------\n\n".......],........
d2e0 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 "cell_type":."markdown",........
d300 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 "metadata":.{}.....},......{....
d320 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 ..."execution_count":.null,.....
d340 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 ..."cell_type":."code",........"
d360 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 4c 6f 61 64 69 6e 67 20 69 6d source":.[........."#.Loading.im
d380 61 67 65 73 5c 6e 49 31 20 3d 20 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 ages\nI1.=.ndimage.imread('../da
d3a0 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 64 61 79 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f ta/ocean_day.jpg').astype(np.flo
d3c0 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 5c 6e 49 32 20 3d 20 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 64 at64)./.256\nI2.=.ndimage.imread
d3e0 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 73 75 6e 73 65 74 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 ('../data/ocean_sunset.jpg').ast
d400 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 5c 6e 5c 6e 5c 6e 58 31 20 3d 20 ype(np.float64)./.256\n\n\nX1.=.
d420 69 6d 32 6d 61 74 28 49 31 29 5c 6e 58 32 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 32 29 5c 6e 5c 6e 23 im2mat(I1)\nX2.=.im2mat(I2)\n\n#
d440 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 6e 62 20 3d 20 31 30 30 30 5c 6e 69 64 .training.samples\nnb.=.1000\nid
d460 78 31 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 31 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 x1.=.r.randint(X1.shape[0],.size
d480 3d 28 6e 62 2c 29 29 5c 6e 69 64 78 32 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 32 2e 73 68 61 =(nb,))\nidx2.=.r.randint(X2.sha
d4a0 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 5c 6e 5c 6e 58 73 20 3d 20 58 31 5b 69 64 pe[0],.size=(nb,))\n\nXs.=.X1[id
d4c0 78 31 2c 20 3a 5d 5c 6e 58 74 20 3d 20 58 32 5b 69 64 78 32 2c 20 3a 5d 22 0a 20 20 20 20 20 20 x1,.:]\nXt.=.X2[idx2,.:]".......
d4e0 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 ],........"outputs":.[],........
d500 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 "metadata":.{........."collapsed
d520 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 ":.false.......}.....},......{..
d540 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 44 6f 6d 61 69 6e ....."source":.[........."Domain
d560 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 70 69 78 65 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 .adaptation.for.pixel.distributi
d580 6f 6e 20 74 72 61 6e 73 66 65 72 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d on.transfer\n-------------------
d5a0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e ------------------------------\n
d5c0 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a \n".......],........"cell_type":
d5e0 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 ."markdown",........"metadata":.
d600 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f {}.....},......{......."executio
d620 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 n_count":.null,........"cell_typ
d640 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 e":."code",........"source":.[..
d660 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d ......."#.EMDTransport\not_emd.=
d680 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 2e 66 69 .ot.da.EMDTransport()\not_emd.fi
d6a0 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d t(Xs=Xs,.Xt=Xt)\ntransp_Xs_emd.=
d6c0 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 5c 6e 49 6d 61 67 65 5f .ot_emd.transform(Xs=X1)\nImage_
d6e0 65 6d 64 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d emd.=.minmax(mat2im(transp_Xs_em
d700 64 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 d,.I1.shape))\n\n#.SinkhornTrans
d720 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f port\not_sinkhorn.=.ot.da.Sinkho
d740 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b rnTransport(reg_e=1e-1)\not_sink
d760 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 horn.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\ntransp_X
d780 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 s_sinkhorn.=.ot_emd.transform(Xs
d7a0 3d 58 31 29 5c 6e 49 6d 61 67 65 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 =X1)\nImage_sinkhorn.=.minmax(ma
d7c0 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 t2im(transp_Xs_sinkhorn,.I1.shap
d7e0 65 29 29 5c 6e 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 e))\n\not_mapping_linear.=.ot.da
d800 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 5c 6e 20 20 20 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 .MappingTransport(\n....mu=1e0,.
d820 65 74 61 3d 31 65 2d 38 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 eta=1e-8,.bias=True,.max_iter=20
d840 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 ,.verbose=True)\not_mapping_line
d860 61 72 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 58 31 74 6c 20 3d 20 6f ar.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\nX1tl.=.o
d880 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 t_mapping_linear.transform(Xs=X1
d8a0 29 5c 6e 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 )\nImage_mapping_linear.=.minmax
d8c0 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 6c 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 5c 6e 6f 74 5f 6d (mat2im(X1tl,.I1.shape))\n\not_m
d8e0 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 apping_gaussian.=.ot.da.MappingT
d900 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 5c 6e 20 20 20 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 32 2c ransport(\n....mu=1e0,.eta=1e-2,
d920 20 73 69 67 6d 61 3d 31 2c 20 62 69 61 73 3d 46 61 6c 73 65 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 .sigma=1,.bias=False,.max_iter=1
d940 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 0,.verbose=True)\not_mapping_gau
d960 73 73 69 61 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 58 31 74 6e 20 ssian.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\nX1tn.
d980 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 =.ot_mapping_gaussian.transform(
d9a0 58 73 3d 58 31 29 20 20 23 20 75 73 65 20 74 68 65 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 64 20 6d 61 70 70 Xs=X1)..#.use.the.estimated.mapp
d9c0 69 6e 67 5c 6e 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6d 69 ing\nImage_mapping_gaussian.=.mi
d9e0 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 22 0a 20 20 nmax(mat2im(X1tn,.I1.shape))"...
da00 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 ....],........"outputs":.[],....
da20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 ...."metadata":.{........."colla
da40 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 psed":.false.......}.....},.....
da60 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c .{......."source":.[........."Pl
da80 6f 74 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d ot.original.images\n------------
daa0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 --------\n\n".......],........"c
dac0 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d ell_type":."markdown",........"m
dae0 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 etadata":.{}.....},......{......
db00 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ."execution_count":.null,.......
db20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f ."cell_type":."code",........"so
db40 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 urce":.[........."pl.figure(1,.f
db60 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 igsize=(6.4,.3))\npl.subplot(1,.
db80 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 2,.1)\npl.imshow(I1)\npl.axis('o
dba0 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e ff')\npl.title('Image.1')\n\npl.
dbc0 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c subplot(1,.2,.2)\npl.imshow(I2)\
dbe0 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 npl.axis('off')\npl.title('Image
dc00 20 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d .2')\npl.tight_layout()".......]
dc20 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 ,........"outputs":.[],........"
dc40 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 metadata":.{........."collapsed"
dc60 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 :.false.......}.....},......{...
dc80 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 70 69 ...."source":.[........."Plot.pi
dca0 78 65 6c 20 76 61 6c 75 65 73 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d xel.values.distribution\n-------
dcc0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 -----------------------\n\n"....
dce0 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 ...],........"cell_type":."markd
dd00 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 own",........"metadata":.{}.....
dd20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 },......{......."execution_count
dd40 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f ":.null,........"cell_type":."co
dd60 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 de",........"source":.[.........
dd80 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 35 29 29 5c "pl.figure(2,.figsize=(6.4,.5))\
dda0 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 n\npl.subplot(1,.2,.1)\npl.scatt
ddc0 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 73 29 5c 6e 70 6c er(Xs[:,.0],.Xs[:,.2],.c=Xs)\npl
dde0 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 .axis([0,.1,.0,.1])\npl.xlabel('
de00 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 Red')\npl.ylabel('Blue')\npl.tit
de20 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 le('Image.1')\n\npl.subplot(1,.2
de40 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c ,.2)\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,
de60 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 74 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d .2],.c=Xt)\npl.axis([0,.1,.0,.1]
de80 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 )\npl.xlabel('Red')\npl.ylabel('
dea0 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e Blue')\npl.title('Image.2')\npl.
dec0 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 tight_layout()".......],........
dee0 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 "outputs":.[],........"metadata"
df00 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 :.{........."collapsed":.false..
df20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 .....}.....},......{......."sour
df40 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 65 64 ce":.[........."Plot.transformed
df60 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d .images\n-----------------------
df80 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 \n\n".......],........"cell_type
dfa0 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 ":."markdown",........"metadata"
dfc0 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 :.{}.....},......{......."execut
dfe0 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 ion_count":.null,........"cell_t
e000 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b ype":."code",........"source":.[
e020 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 ........."pl.figure(2,.figsize=(
e040 31 30 2c 20 35 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 10,.5))\n\npl.subplot(2,.3,.1)\n
e060 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 pl.imshow(I1)\npl.axis('off')\np
e080 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 l.title('Im..1')\n\npl.subplot(2
e0a0 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 ,.3,.4)\npl.imshow(I2)\npl.axis(
e0c0 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 32 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 'off')\npl.title('Im..2')\n\npl.
e0e0 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 67 subplot(2,.3,.2)\npl.imshow(Imag
e100 65 5f 65 6d 64 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 e_emd)\npl.axis('off')\npl.title
e120 28 27 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 ('EmdTransport')\n\npl.subplot(2
e140 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 67 65 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 ,.3,.5)\npl.imshow(Image_sinkhor
e160 6e 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 69 n)\npl.axis('off')\npl.title('Si
e180 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 nkhornTransport')\n\npl.subplot(
e1a0 32 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 2,.3,.3)\npl.imshow(Image_mappin
e1c0 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 g_linear)\npl.axis('off')\npl.ti
e1e0 74 6c 65 28 27 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 27 29 tle('MappingTransport.(linear)')
e200 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 \n\npl.subplot(2,.3,.6)\npl.imsh
e220 6f 77 28 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 29 5c 6e 70 6c 2e 61 ow(Image_mapping_gaussian)\npl.a
e240 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 xis('off')\npl.title('MappingTra
e260 6e 73 70 6f 72 74 20 28 67 61 75 73 73 69 61 6e 29 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 nsport.(gaussian)')\npl.tight_la
e280 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 yout()\n\npl.show()".......],...
e2a0 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 ....."outputs":.[],........"meta
e2c0 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 data":.{........."collapsed":.fa
e2e0 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 lse.......}.....}...],...."metad
e300 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 ata":.{....."kernelspec":.{.....
e320 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 .."display_name":."Python.2",...
e340 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 ....."name":."python2",........"
e360 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 language":."python".....},......
e380 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 "language_info":.{......."mimety
e3a0 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 pe":."text/x-python",........"nb
e3c0 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 convert_exporter":."python",....
e3e0 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 ...."name":."python",........"fi
e400 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 le_extension":.".py",........"ve
e420 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e rsion":."2.7.12",........"pygmen
e440 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 ts_lexer":."ipython2",........"c
e460 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 odemirror_mode":.{........."vers
e480 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 ion":.2,.........."name":."ipyth
e4a0 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 on".......}.....}...}.}PK.......
e4c0 00 69 4c be 4c 3e 1d 30 6f d5 1a 00 00 d5 1a 00 00 16 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 4c 31 5f .iL.L>.0o............plot_OT_L1_
e4e0 76 73 5f 4c 32 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a vs_L2.ipynb{..."cells":.[.....{.
e500 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 ......"cell_type":."code",......
e520 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 ."execution_count":.null,.......
e540 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 "metadata":.{........."collapsed
e560 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 ":.false.......},......."outputs
e580 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 ":.[],......."source":.[........
e5a0 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 ."%matplotlib.inline".......]...
e5c0 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d ..},.....{......."cell_type":."m
e5e0 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a arkdown",......."metadata":.{},.
e600 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 32 ......"source":.[........."\n#.2
e620 44 20 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 66 6f 72 20 64 69 66 66 65 72 65 6e D.Optimal.transport.for.differen
e640 74 20 6d 65 74 72 69 63 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 32 44 20 4f 54 20 6f 6e 20 65 6d 70 69 72 69 63 61 t.metrics\n\n\n2D.OT.on.empirica
e660 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 20 20 77 69 74 68 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 67 6f l.distributio..with.different.go
e680 75 6e 64 20 6d 65 74 72 69 63 2e 5c 6e 5c 6e 53 74 6f 6c 65 20 74 68 65 20 66 69 67 75 72 65 20 und.metric.\n\nStole.the.figure.
e6a0 69 64 65 61 20 66 72 6f 6d 20 46 69 67 2e 20 31 20 61 6e 64 20 32 20 69 6e 5c 6e 68 74 74 70 73 idea.from.Fig..1.and.2.in\nhttps
e6c0 3a 2f 2f 61 72 78 69 76 2e 6f 72 67 2f 70 64 66 2f 31 37 30 36 2e 30 37 36 35 30 2e 70 64 66 5c ://arxiv.org/pdf/1706.07650.pdf\
e6e0 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 n\n\n\n".......].....},.....{...
e700 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 ...."cell_type":."code",......."
e720 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d execution_count":.null,......."m
e740 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a etadata":.{........."collapsed":
e760 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a .false.......},......."outputs":
e780 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 .[],......."source":.[........."
e7a0 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 #.Author:.Remi.Flamary.<remi.fla
e7c0 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 mary@unice.fr>\n#\n#.License:.MI
e7e0 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c T.License\n\nimport.numpy.as.np\
e800 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e nimport.matplotlib.pylab.as.pl\n
e820 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 2e 70 6c 6f 74 22 0a 20 20 20 20 20 import.ot\nimport.ot.plot"......
e840 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 .].....},.....{......."cell_type
e860 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a ":."markdown",......."metadata":
e880 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 .{},......."source":.[........."
e8a0 44 61 74 61 73 65 74 20 31 20 3a 20 75 6e 69 66 6f 72 6d 20 73 61 6d 70 6c 69 6e 67 5c 6e 2d 2d Dataset.1.:.uniform.sampling\n--
e8c0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a --------------------------\n\n".
e8e0 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c ......].....},.....{......."cell
e900 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e _type":."code",......."execution
e920 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a _count":.null,......."metadata":
e940 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 .{........."collapsed":.false...
e960 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 ....},......."outputs":.[],.....
e980 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 20 3d 20 32 30 20 20 23 .."source":.[........."n.=.20..#
e9a0 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 78 73 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 32 .nb.samples\nxs.=.np.zeros((n,.2
e9c0 29 29 5c 6e 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2b 20 31 5c ))\nxs[:,.0].=.np.arange(n).+.1\
e9e0 6e 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2b 20 31 29 20 2a nxs[:,.1].=.(np.arange(n).+.1).*
ea00 20 2d 30 2e 30 30 31 20 20 23 20 74 6f 20 6d 61 6b 65 20 69 74 20 73 74 72 69 63 74 6c 79 20 63 .-0.001..#.to.make.it.strictly.c
ea20 6f 6e 76 65 78 2e 2e 2e 5c 6e 5c 6e 78 74 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 32 29 onvex...\n\nxt.=.np.zeros((n,.2)
ea40 29 5c 6e 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2b 20 31 5c 6e )\nxt[:,.1].=.np.arange(n).+.1\n
ea60 5c 6e 61 2c 20 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 2c 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 20 \na,.b.=.ot.unif(n),.ot.unif(n).
ea80 20 23 20 75 6e 69 66 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 61 6d 70 6c .#.uniform.distribution.on.sampl
eaa0 65 73 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 es\n\n#.loss.matrix\nM1.=.ot.dis
eac0 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d t(xs,.xt,.metric='euclidean')\nM
eae0 31 20 2f 3d 20 4d 31 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 1./=.M1.max()\n\n#.loss.matrix\n
eb00 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 M2.=.ot.dist(xs,.xt,.metric='sqe
eb20 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 uclidean')\nM2./=.M2.max()\n\n#.
eb40 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 70 20 3d 20 6e 70 2e 73 71 72 74 28 6f 74 2e 64 69 73 loss.matrix\nMp.=.np.sqrt(ot.dis
eb60 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 29 5c 6e t(xs,.xt,.metric='euclidean'))\n
eb80 4d 70 20 2f 3d 20 4d 70 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 44 61 74 61 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 Mp./=.Mp.max()\n\n#.Data\npl.fig
eba0 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 ure(1,.figsize=(7,.3))\npl.clf()
ebc0 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b \npl.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+
ebe0 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e b',.label='Source.samples')\npl.
ec00 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr',.l
ec20 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 abel='Target.samples')\npl.axis(
ec40 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 'equal')\npl.title('Source.and.t
ec60 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 43 6f 73 arget.distributions')\n\n\n#.Cos
ec80 74 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 t.matrices\npl.figure(2,.figsize
eca0 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 5c =(7,.3))\n\npl.subplot(1,.3,.1)\
ecc0 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 31 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 npl.imshow(M1,.interpolation='ne
ece0 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 arest')\npl.title('Euclidean.cos
ed00 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 t')\n\npl.subplot(1,.3,.2)\npl.i
ed20 6d 73 68 6f 77 28 4d 32 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 mshow(M2,.interpolation='nearest
ed40 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 ')\npl.title('Squared.Euclidean.
ed60 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 cost')\n\npl.subplot(1,.3,.3)\np
ed80 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 70 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 l.imshow(Mp,.interpolation='near
eda0 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 est')\npl.title('Sqrt.Euclidean.
edc0 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 cost')\npl.tight_layout()"......
ede0 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 .].....},.....{......."cell_type
ee00 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a ":."markdown",......."metadata":
ee20 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 .{},......."source":.[........."
ee40 44 61 74 61 73 65 74 20 31 20 3a 20 50 6c 6f 74 20 4f 54 20 4d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 2d 2d Dataset.1.:.Plot.OT.Matrices\n--
ee60 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a --------------------------\n\n".
ee80 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c ......].....},.....{......."cell
eea0 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e _type":."code",......."execution
eec0 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a _count":.null,......."metadata":
eee0 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 .{........."collapsed":.false...
ef00 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 ....},......."outputs":.[],.....
ef20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e .."source":.[........."#%%.EMD\n
ef40 47 31 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 31 29 5c 6e 47 32 20 3d 20 6f 74 2e 65 G1.=.ot.emd(a,.b,.M1)\nG2.=.ot.e
ef60 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 32 29 5c 6e 47 70 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 md(a,.b,.M2)\nGp.=.ot.emd(a,.b,.
ef80 4d 70 29 5c 6e 5c 6e 23 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 Mp)\n\n#.OT.matrices\npl.figure(
efa0 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 3,.figsize=(7,.3))\n\npl.subplot
efc0 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 (1,.3,.1)\not.plot.plot2D_sample
efe0 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 31 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 s_mat(xs,.xt,.G1,.c=[.5,..5,.1])
f000 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b \npl.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+
f020 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e b',.label='Source.samples')\npl.
f040 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr',.l
f060 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 abel='Target.samples')\npl.axis(
f080 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 'equal')\n#.pl.legend(loc=0)\npl
f0a0 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 .title('OT.Euclidean')\n\npl.sub
f0c0 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 plot(1,.3,.2)\not.plot.plot2D_sa
f0e0 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 32 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c mples_mat(xs,.xt,.G2,.c=[.5,..5,
f100 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d .1])\npl.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1]
f120 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c ,.'+b',.label='Source.samples')\
f140 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 npl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr
f160 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 ',.label='Target.samples')\npl.a
f180 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 xis('equal')\n#.pl.legend(loc=0)
f1a0 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e \npl.title('OT.squared.Euclidean
f1c0 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c ')\n\npl.subplot(1,.3,.3)\not.pl
f1e0 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 70 ot.plot2D_samples_mat(xs,.xt,.Gp
f200 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 ,.c=[.5,..5,.1])\npl.plot(xs[:,.
f220 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 0],.xs[:,.1],.'+b',.label='Sourc
f240 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 e.samples')\npl.plot(xt[:,.0],.x
f260 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d t[:,.1],.'xr',.label='Target.sam
f280 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c 2e 6c ples')\npl.axis('equal')\n#.pl.l
f2a0 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 72 74 20 egend(loc=0)\npl.title('OT.sqrt.
f2c0 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e Euclidean')\npl.tight_layout()\n
f2e0 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 \npl.show()".......].....},.....
f300 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c {......."cell_type":."markdown",
f320 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f ......."metadata":.{},......."so
f340 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 44 61 74 61 73 65 74 20 32 20 3a 20 50 61 urce":.[........."Dataset.2.:.Pa
f360 72 74 69 61 6c 20 63 69 72 63 6c 65 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d rtial.circle\n------------------
f380 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 --------\n\n".......].....},....
f3a0 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 .{......."cell_type":."code",...
f3c0 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 ...."execution_count":.null,....
f3e0 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 ..."metadata":.{........."collap
f400 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 sed":.false.......},......."outp
f420 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 uts":.[],......."source":.[.....
f440 20 20 20 20 22 6e 20 3d 20 35 30 20 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 78 74 6f 74 20 ...."n.=.50..#.nb.samples\nxtot.
f460 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 20 2b 20 31 2c 20 32 29 29 5c 6e 78 74 6f 74 5b 3a 2c 20 =.np.zeros((n.+.1,.2))\nxtot[:,.
f480 30 5d 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 73 28 5c 6e 20 20 20 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 20 2b 0].=.np.cos(\n....(np.arange(n.+
f4a0 20 31 29 20 2b 20 31 2e 30 29 20 2a 20 30 2e 39 20 2f 20 28 6e 20 2b 20 32 29 20 2a 20 32 20 2a .1).+.1.0).*.0.9./.(n.+.2).*.2.*
f4c0 20 6e 70 2e 70 69 29 5c 6e 78 74 6f 74 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 6e 70 2e 73 69 6e 28 5c 6e 20 .np.pi)\nxtot[:,.1].=.np.sin(\n.
f4e0 20 20 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 20 2b 20 31 29 20 2b 20 31 2e 30 29 20 2a 20 30 2e ...(np.arange(n.+.1).+.1.0).*.0.
f500 39 20 2f 20 28 6e 20 2b 20 32 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 29 5c 6e 5c 6e 78 73 20 3d 9./.(n.+.2).*.2.*.np.pi)\n\nxs.=
f520 20 78 74 6f 74 5b 3a 6e 2c 20 3a 5d 5c 6e 78 74 20 3d 20 78 74 6f 74 5b 31 3a 2c 20 3a 5d 5c 6e .xtot[:n,.:]\nxt.=.xtot[1:,.:]\n
f540 5c 6e 61 2c 20 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 2c 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 20 \na,.b.=.ot.unif(n),.ot.unif(n).
f560 20 23 20 75 6e 69 66 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 61 6d 70 6c .#.uniform.distribution.on.sampl
f580 65 73 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 es\n\n#.loss.matrix\nM1.=.ot.dis
f5a0 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d t(xs,.xt,.metric='euclidean')\nM
f5c0 31 20 2f 3d 20 4d 31 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 1./=.M1.max()\n\n#.loss.matrix\n
f5e0 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 M2.=.ot.dist(xs,.xt,.metric='sqe
f600 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 uclidean')\nM2./=.M2.max()\n\n#.
f620 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 70 20 3d 20 6e 70 2e 73 71 72 74 28 6f 74 2e 64 69 73 loss.matrix\nMp.=.np.sqrt(ot.dis
f640 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 29 5c 6e t(xs,.xt,.metric='euclidean'))\n
f660 4d 70 20 2f 3d 20 4d 70 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 44 61 74 61 5c 6e 70 6c 2e 66 Mp./=.Mp.max()\n\n\n#.Data\npl.f
f680 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 igure(4,.figsize=(7,.3))\npl.clf
f6a0 28 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 ()\npl.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.
f6c0 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 '+b',.label='Source.samples')\np
f6e0 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c l.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr',
f700 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 .label='Target.samples')\npl.axi
f720 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 s('equal')\npl.title('Source.and
f740 20 74 72 61 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 43 .traget.distributions')\n\n\n#.C
f760 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 2c 20 66 69 67 73 69 ost.matrices\npl.figure(5,.figsi
f780 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 ze=(7,.3))\n\npl.subplot(1,.3,.1
f7a0 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 31 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 )\npl.imshow(M1,.interpolation='
f7c0 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 nearest')\npl.title('Euclidean.c
f7e0 6f 73 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c ost')\n\npl.subplot(1,.3,.2)\npl
f800 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 32 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 .imshow(M2,.interpolation='neare
f820 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 st')\npl.title('Squared.Euclidea
f840 6e 20 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 5c n.cost')\n\npl.subplot(1,.3,.3)\
f860 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 70 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 npl.imshow(Mp,.interpolation='ne
f880 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 arest')\npl.title('Sqrt.Euclidea
f8a0 6e 20 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 n.cost')\npl.tight_layout()"....
f8c0 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 ...].....},.....{......."cell_ty
f8e0 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 pe":."markdown",......."metadata
f900 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 ":.{},......."source":.[........
f920 20 22 44 61 74 61 73 65 74 20 32 20 3a 20 50 6c 6f 74 20 20 4f 54 20 4d 61 74 72 69 63 65 73 5c ."Dataset.2.:.Plot..OT.Matrices\
f940 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e n-----------------------------\n
f960 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 \n".......].....},.....{......."
f980 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 cell_type":."code",......."execu
f9a0 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 tion_count":.null,......."metada
f9c0 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 ta":.{........."collapsed":.fals
f9e0 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a e.......},......."outputs":.[],.
fa00 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 ......"source":.[........."#%%.E
fa20 4d 44 5c 6e 47 31 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 31 29 5c 6e 47 32 20 3d 20 MD\nG1.=.ot.emd(a,.b,.M1)\nG2.=.
fa40 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 32 29 5c 6e 47 70 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c ot.emd(a,.b,.M2)\nGp.=.ot.emd(a,
fa60 20 62 2c 20 4d 70 29 5c 6e 5c 6e 23 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 .b,.Mp)\n\n#.OT.matrices\npl.fig
fa80 75 72 65 28 36 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 ure(6,.figsize=(7,.3))\n\npl.sub
faa0 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 plot(1,.3,.1)\not.plot.plot2D_sa
fac0 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 31 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c mples_mat(xs,.xt,.G1,.c=[.5,..5,
fae0 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d .1])\npl.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1]
fb00 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c ,.'+b',.label='Source.samples')\
fb20 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 npl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr
fb40 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 ',.label='Target.samples')\npl.a
fb60 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 xis('equal')\n#.pl.legend(loc=0)
fb80 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c \npl.title('OT.Euclidean')\n\npl
fba0 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 .subplot(1,.3,.2)\not.plot.plot2
fbc0 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 32 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c D_samples_mat(xs,.xt,.G2,.c=[.5,
fbe0 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a ..5,.1])\npl.plot(xs[:,.0],.xs[:
fc00 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 ,.1],.'+b',.label='Source.sample
fc20 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c s')\npl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],
fc40 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e .'xr',.label='Target.samples')\n
fc60 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f pl.axis('equal')\n#.pl.legend(lo
fc80 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 c=0)\npl.title('OT.squared.Eucli
fca0 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 6f dean')\n\npl.subplot(1,.3,.3)\no
fcc0 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 t.plot.plot2D_samples_mat(xs,.xt
fce0 2c 20 47 70 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 ,.Gp,.c=[.5,..5,.1])\npl.plot(xs
fd00 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 [:,.0],.xs[:,.1],.'+b',.label='S
fd20 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 ource.samples')\npl.plot(xt[:,.0
fd40 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 ],.xt[:,.1],.'xr',.label='Target
fd60 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 .samples')\npl.axis('equal')\n#.
fd80 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 pl.legend(loc=0)\npl.title('OT.s
fda0 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 qrt.Euclidean')\npl.tight_layout
fdc0 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 ()\n\npl.show()".......].....}..
fde0 20 5d 2c 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 .],..."metadata":.{....."kernels
fe00 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 pec":.{......."display_name":."P
fe20 79 74 68 6f 6e 20 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 ython.3",......."language":."pyt
fe40 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 33 22 0a 20 20 hon",......."name":."python3"...
fe60 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 ..},....."language_info":.{.....
fe80 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 .."codemirror_mode":.{........."
fea0 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 name":."ipython",........."versi
fec0 6f 6e 22 3a 20 33 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 on":.3.......},......."file_exte
fee0 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a nsion":.".py",......."mimetype":
ff00 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 ."text/x-python",......."name":.
ff20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 "python",......."nbconvert_expor
ff40 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f ter":."python",......."pygments_
ff60 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 lexer":."ipython3",......."versi
ff80 6f 6e 22 3a 20 22 33 2e 36 2e 35 22 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 on":."3.6.5".....}...},..."nbfor
ffa0 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 0a 7d mat":.4,..."nbformat_minor":.0.}
ffc0 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 6e 4c be 4c 81 f4 0f 36 24 1b 00 00 24 1b 00 00 24 00 00 00 70 6c PK........nL.L...6$...$...$...pl
ffe0 6f 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 6c 70 5f 76 73 5f 65 6e 74 72 6f 70 69 63 2e 69 70 79 ot_barycenter_lp_vs_entropic.ipy
10000 6e 62 7b 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 nb{..."cells":.[.....{......."ce
10020 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 ll_type":."code",......."executi
10040 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 on_count":.null,......."metadata
10060 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a ":.{........."collapsed":.false.
10080 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 ......},......."outputs":.[],...
100a0 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f ...."source":.[........."%matplo
100c0 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 tlib.inline".......].....},.....
100e0 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c {......."cell_type":."markdown",
10100 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f ......."metadata":.{},......."so
10120 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 31 44 20 57 61 73 73 65 72 73 urce":.[........."\n#.1D.Wassers
10140 74 65 69 6e 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 61 72 69 73 6f 6e 20 62 65 74 77 65 tein.barycenter.comparison.betwe
10160 65 6e 20 65 78 61 63 74 20 4c 50 20 61 6e 64 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 en.exact.LP.and.entropic.regular
10180 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6c 6c 75 73 74 ization\n\n\nThis.example.illust
101a0 72 61 74 65 73 20 74 68 65 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 72 65 67 75 6c 61 72 rates.the.computation.of.regular
101c0 69 7a 65 64 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5c 6e 61 73 20 ized.Wasserstein.Barycenter\nas.
101e0 70 72 6f 70 6f 73 65 64 20 69 6e 20 5b 33 5d 20 61 6e 64 20 65 78 61 63 74 20 4c 50 20 62 61 72 proposed.in.[3].and.exact.LP.bar
10200 79 63 65 6e 74 65 72 73 20 75 73 69 6e 67 20 73 74 61 6e 64 61 72 64 20 4c 50 20 73 6f 6c 76 65 ycenters.using.standard.LP.solve
10220 72 2e 5c 6e 5c 6e 49 74 20 72 65 70 72 6f 64 75 63 65 73 20 61 70 70 72 6f 78 69 6d 61 74 65 6c r.\n\nIt.reproduces.approximatel
10240 79 20 46 69 67 75 72 65 20 33 2e 31 20 61 6e 64 20 33 2e 32 20 66 72 6f 6d 20 74 68 65 20 66 6f y.Figure.3.1.and.3.2.from.the.fo
10260 6c 6c 6f 77 69 6e 67 20 70 61 70 65 72 3a 5c 6e 43 75 74 75 72 69 2c 20 4d 2e 2c 20 26 20 50 65 llowing.paper:\nCuturi,.M.,.&.Pe
10280 79 72 5c 75 30 30 65 39 2c 20 47 2e 20 28 32 30 31 36 29 2e 20 41 20 73 6d 6f 6f 74 68 65 64 20 yr\u00e9,.G..(2016)..A.smoothed.
102a0 64 75 61 6c 20 61 70 70 72 6f 61 63 68 20 66 6f 72 20 76 61 72 69 61 74 69 6f 6e 61 6c 5c 6e 57 dual.approach.for.variational\nW
102c0 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 2e 20 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 asserstein.problems..SIAM.Journa
102e0 6c 20 6f 6e 20 49 6d 61 67 69 6e 67 20 53 63 69 65 6e 63 65 73 2c 20 39 28 31 29 2c 20 33 32 30 l.on.Imaging.Sciences,.9(1),.320
10300 2d 33 34 33 2e 5c 6e 5c 6e 5b 33 5d 20 42 65 6e 61 6d 6f 75 2c 20 4a 2e 20 44 2e 2c 20 43 61 72 -343.\n\n[3].Benamou,.J..D.,.Car
10320 6c 69 65 72 2c 20 47 2e 2c 20 43 75 74 75 72 69 2c 20 4d 2e 2c 20 4e 65 6e 6e 61 2c 20 4c 2e 2c lier,.G.,.Cuturi,.M.,.Nenna,.L.,
10340 20 26 20 50 65 79 72 5c 75 30 30 65 39 2c 20 47 2e 20 28 32 30 31 35 29 2e 5c 6e 49 74 65 72 61 .&.Peyr\u00e9,.G..(2015).\nItera
10360 74 69 76 65 20 42 72 65 67 6d 61 6e 20 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 73 20 66 6f 72 20 72 65 67 tive.Bregman.projections.for.reg
10380 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 61 74 69 6f 6e 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 ularized.transportation.problems
103a0 5c 6e 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c 20 6f 6e 20 53 63 69 65 6e 74 69 66 69 63 20 43 6f 6d \nSIAM.Journal.on.Scientific.Com
103c0 70 75 74 69 6e 67 2c 20 33 37 28 32 29 2c 20 41 31 31 31 31 2d 41 31 31 33 38 2e 5c 6e 5c 6e 5c puting,.37(2),.A1111-A1138.\n\n\
103e0 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 n\n\n".......].....},.....{.....
10400 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 .."cell_type":."code",......."ex
10420 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 ecution_count":.null,......."met
10440 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 adata":.{........."collapsed":.f
10460 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b alse.......},......."outputs":.[
10480 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 ],......."source":.[........."#.
104a0 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 Author:.Remi.Flamary.<remi.flama
104c0 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 ry@unice.fr>\n#\n#.License:.MIT.
104e0 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 License\n\nimport.numpy.as.np\ni
10500 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d mport.matplotlib.pylab.as.pl\nim
10520 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 23 20 6e 65 63 65 73 73 61 72 79 20 66 6f 72 20 33 64 20 70 6c 6f 74 port.ot\n#.necessary.for.3d.plot
10540 20 65 76 65 6e 20 69 66 20 6e 6f 74 20 75 73 65 64 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6d 70 6c 5f 74 6f 6f 6c .even.if.not.used\nfrom.mpl_tool
10560 6b 69 74 73 2e 6d 70 6c 6f 74 33 64 20 69 6d 70 6f 72 74 20 41 78 65 73 33 44 20 20 23 20 6e 6f kits.mplot3d.import.Axes3D..#.no
10580 71 61 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 73 20 qa\nfrom.matplotlib.collections.
105a0 69 6d 70 6f 72 74 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 20 20 23 20 6e 6f 71 61 5c 6e 5c import.PolyCollection..#.noqa\n\
105c0 6e 23 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 2e 6c 70 2e 63 76 78 20 61 73 20 63 76 78 5c 6e 5c 6e 23 5c 6e n#import.ot.lp.cvx.as.cvx\n\n#\n
105e0 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d #.Generate.data\n#.-------------
10600 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 20 3d \n\n#%%.parameters\n\nproblems.=
10620 20 5b 5d 5c 6e 5c 6e 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e 73 5c 6e 5c 6e 23 20 62 .[]\n\nn.=.100..#.nb.bins\n\n#.b
10640 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 5c 6e 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 in.positions\nx.=.np.arange(n,.d
10660 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e 5c 6e 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 type=np.float64)\n\n#.Gaussian.d
10680 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 istributions\n#.Gaussian.distrib
106a0 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 61 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 31 44 utions\na1.=.ot.datasets.make_1D
106c0 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c _gauss(n,.m=20,.s=5)..#.m=.mean,
106e0 20 73 3d 20 73 74 64 5c 6e 61 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 31 .s=.std\na2.=.ot.datasets.make_1
10700 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 36 30 2c 20 73 3d 38 29 5c 6e 5c 6e 23 20 63 72 65 61 74 D_gauss(n,.m=60,.s=8)\n\n#.creat
10720 69 6e 67 20 6d 61 74 72 69 78 20 41 20 63 6f 6e 74 61 69 6e 69 6e 67 20 61 6c 6c 20 64 69 73 74 ing.matrix.A.containing.all.dist
10740 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 41 20 3d 20 6e 70 2e 76 73 74 61 63 6b 28 28 61 31 2c 20 61 32 ributions\nA.=.np.vstack((a1,.a2
10760 29 29 2e 54 5c 6e 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 3d 20 41 2e 73 68 61 70 65 5b )).T\nn_distributions.=.A.shape[
10780 31 5d 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 20 2b 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 1]\n\n#.loss.matrix.+.normalizat
107a0 69 6f 6e 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 64 69 73 74 30 28 6e 29 5c 6e 4d 20 2f 3d ion\nM.=.ot.utils.dist0(n)\nM./=
107c0 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 5c 6e 23 20 2d 2d .M.max()\n\n#\n#.Plot.data\n#.--
107e0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 -------\n\n#%%.plot.the.distribu
10800 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 tions\n\npl.figure(1,.figsize=(6
10820 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 .4,.3))\nfor.i.in.range(n_distri
10840 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 butions):\n....pl.plot(x,.A[:,.i
10860 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 ])\npl.title('Distributions')\np
10880 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 42 61 72 79 63 65 6e l.tight_layout()\n\n#\n#.Barycen
108a0 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d ter.computation\n#.-------------
108c0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 ---------\n\n#%%.barycenter.comp
108e0 75 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 61 6c 70 68 61 20 3d 20 30 2e 35 20 20 23 20 30 3c 3d 61 6c 70 utation\n\nalpha.=.0.5..#.0<=alp
10900 68 61 3c 3d 31 5c 6e 77 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 ha<=1\nweights.=.np.array([1.-.a
10920 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 32 62 61 72 79 5c 6e 62 61 72 79 5f lpha,.alpha])\n\n#.l2bary\nbary_
10940 6c 32 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 77 61 73 73 65 72 73 l2.=.A.dot(weights)\n\n#.wassers
10960 74 65 69 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 tein\nreg.=.1e-3\not.tic()\nbary
10980 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c _wass.=.ot.bregman.barycenter(A,
109a0 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 5c 6e 5c 6e 5c .M,.reg,.weights)\not.toc()\n\n\
109c0 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 20 3d 20 6f 74 2e 6c 70 2e 62 61 not.tic()\nbary_wass2.=.ot.lp.ba
109e0 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 2c 20 73 6f 6c 76 65 72 3d 27 rycenter(A,.M,.weights,.solver='
10a00 69 6e 74 65 72 69 6f 72 2d 70 6f 69 6e 74 27 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e interior-point',.verbose=True)\n
10a20 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 ot.toc()\n\npl.figure(2)\npl.clf
10a40 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 ()\npl.subplot(2,.1,.1)\nfor.i.i
10a60 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 n.range(n_distributions):\n....p
10a80 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 l.plot(x,.A[:,.i])\npl.title('Di
10aa0 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 stributions')\n\npl.subplot(2,.1
10ac0 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c 20 6c ,.2)\npl.plot(x,.bary_l2,.'r',.l
10ae0 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 abel='l2')\npl.plot(x,.bary_wass
10b00 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 52 65 67 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c ,.'g',.label='Reg.Wasserstein')\
10b20 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 npl.plot(x,.bary_wass2,.'b',.lab
10b40 65 6c 3d 27 4c 50 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 el='LP.Wasserstein')\npl.legend(
10b60 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 )\npl.title('Barycenters')\npl.t
10b80 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 2e 61 70 70 65 6e 64 ight_layout()\n\nproblems.append
10ba0 28 5b 41 2c 20 5b 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 62 61 72 79 5f 77 ([A,.[bary_l2,.bary_wass,.bary_w
10bc0 61 73 73 32 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 61 31 20 ass2]])\n\n#%%.parameters\n\na1.
10be0 3d 20 31 2e 30 20 2a 20 28 78 20 3e 20 31 30 29 20 2a 20 28 78 20 3c 20 35 30 29 5c 6e 61 32 20 =.1.0.*.(x.>.10).*.(x.<.50)\na2.
10c00 3d 20 31 2e 30 20 2a 20 28 78 20 3e 20 36 30 29 20 2a 20 28 78 20 3c 20 38 30 29 5c 6e 5c 6e 61 =.1.0.*.(x.>.60).*.(x.<.80)\n\na
10c20 31 20 2f 3d 20 61 31 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e 61 32 20 2f 3d 20 61 32 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e 5c 1./=.a1.sum()\na2./=.a2.sum()\n\
10c40 6e 23 20 63 72 65 61 74 69 6e 67 20 6d 61 74 72 69 78 20 41 20 63 6f 6e 74 61 69 6e 69 6e 67 20 n#.creating.matrix.A.containing.
10c60 61 6c 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 41 20 3d 20 6e 70 2e 76 73 74 61 63 6b all.distributions\nA.=.np.vstack
10c80 28 28 61 31 2c 20 61 32 29 29 2e 54 5c 6e 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 3d 20 ((a1,.a2)).T\nn_distributions.=.
10ca0 41 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 20 2b 20 6e 6f A.shape[1]\n\n#.loss.matrix.+.no
10cc0 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 64 69 73 74 30 28 rmalization\nM.=.ot.utils.dist0(
10ce0 6e 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 n)\nM./=.M.max()\n\n\n#%%.plot.t
10d00 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c he.distributions\n\npl.figure(1,
10d20 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e .figsize=(6.4,.3))\nfor.i.in.ran
10d40 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f ge(n_distributions):\n....pl.plo
10d60 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 t(x,.A[:,.i])\npl.title('Distrib
10d80 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 utions')\npl.tight_layout()\n\n#
10da0 5c 6e 23 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 23 20 2d 2d \n#.Barycenter.computation\n#.--
10dc0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 --------------------\n\n#%%.bary
10de0 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 61 6c 70 68 61 20 3d 20 30 2e center.computation\n\nalpha.=.0.
10e00 35 20 20 23 20 30 3c 3d 61 6c 70 68 61 3c 3d 31 5c 6e 77 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 5..#.0<=alpha<=1\nweights.=.np.a
10e20 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 32 rray([1.-.alpha,.alpha])\n\n#.l2
10e40 62 61 72 79 5c 6e 62 61 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e bary\nbary_l2.=.A.dot(weights)\n
10e60 5c 6e 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 6f 74 2e \n#.wasserstein\nreg.=.1e-3\not.
10e80 74 69 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 tic()\nbary_wass.=.ot.bregman.ba
10ea0 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 6f 74 rycenter(A,.M,.reg,.weights)\not
10ec0 2e 74 6f 63 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 .toc()\n\n\not.tic()\nbary_wass2
10ee0 20 3d 20 6f 74 2e 6c 70 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 77 65 69 67 68 74 .=.ot.lp.barycenter(A,.M,.weight
10f00 73 2c 20 73 6f 6c 76 65 72 3d 27 69 6e 74 65 72 69 6f 72 2d 70 6f 69 6e 74 27 2c 20 76 65 72 62 s,.solver='interior-point',.verb
10f20 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 72 6f 62 6c 65 6d ose=True)\not.toc()\n\n\nproblem
10f40 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 5b 41 2c 20 5b 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 s.append([A,.[bary_l2,.bary_wass
10f60 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c ,.bary_wass2]])\n\npl.figure(2)\
10f80 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e npl.clf()\npl.subplot(2,.1,.1)\n
10fa0 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a for.i.in.range(n_distributions):
10fc0 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 \n....pl.plot(x,.A[:,.i])\npl.ti
10fe0 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c tle('Distributions')\n\npl.subpl
11000 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c ot(2,.1,.2)\npl.plot(x,.bary_l2,
11020 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 .'r',.label='l2')\npl.plot(x,.ba
11040 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 52 65 67 20 57 61 73 73 65 72 73 ry_wass,.'g',.label='Reg.Wassers
11060 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 2c 20 27 tein')\npl.plot(x,.bary_wass2,.'
11080 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 50 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e b',.label='LP.Wasserstein')\npl.
110a0 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 legend()\npl.title('Barycenters'
110c0 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 )\npl.tight_layout()\n\n#%%.para
110e0 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 61 31 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 6e 29 5c 6e 61 32 20 3d meters\n\na1.=.np.zeros(n)\na2.=
11100 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 6e 29 5c 6e 5c 6e 61 31 5b 31 30 5d 20 3d 20 2e 32 35 5c 6e 61 31 .np.zeros(n)\n\na1[10].=..25\na1
11120 5b 32 30 5d 20 3d 20 2e 35 5c 6e 61 31 5b 33 30 5d 20 3d 20 2e 32 35 5c 6e 61 32 5b 38 30 5d 20 [20].=..5\na1[30].=..25\na2[80].
11140 3d 20 31 5c 6e 5c 6e 5c 6e 61 31 20 2f 3d 20 61 31 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e 61 32 20 2f 3d 20 61 =.1\n\n\na1./=.a1.sum()\na2./=.a
11160 32 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 63 72 65 61 74 69 6e 67 20 6d 61 74 72 69 78 20 41 20 63 2.sum()\n\n#.creating.matrix.A.c
11180 6f 6e 74 61 69 6e 69 6e 67 20 61 6c 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 41 20 3d ontaining.all.distributions\nA.=
111a0 20 6e 70 2e 76 73 74 61 63 6b 28 28 61 31 2c 20 61 32 29 29 2e 54 5c 6e 6e 5f 64 69 73 74 72 69 .np.vstack((a1,.a2)).T\nn_distri
111c0 62 75 74 69 6f 6e 73 20 3d 20 41 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d butions.=.A.shape[1]\n\n#.loss.m
111e0 61 74 72 69 78 20 2b 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 atrix.+.normalization\nM.=.ot.ut
11200 69 6c 73 2e 64 69 73 74 30 28 6e 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e ils.dist0(n)\nM./=.M.max()\n\n\n
11220 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c #%%.plot.the.distributions\n\npl
11240 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 66 6f .figure(1,.figsize=(6.4,.3))\nfo
11260 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e r.i.in.range(n_distributions):\n
11280 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c ....pl.plot(x,.A[:,.i])\npl.titl
112a0 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 e('Distributions')\npl.tight_lay
112c0 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 out()\n\n#\n#.Barycenter.computa
112e0 74 69 6f 6e 5c 6e 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e tion\n#.----------------------\n
11300 5c 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e \n#%%.barycenter.computation\n\n
11320 61 6c 70 68 61 20 3d 20 30 2e 35 20 20 23 20 30 3c 3d 61 6c 70 68 61 3c 3d 31 5c 6e 77 65 69 67 alpha.=.0.5..#.0<=alpha<=1\nweig
11340 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 hts.=.np.array([1.-.alpha,.alpha
11360 5d 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 32 62 61 72 79 5c 6e 62 61 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 ])\n\n#.l2bary\nbary_l2.=.A.dot(
11380 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d weights)\n\n#.wasserstein\nreg.=
113a0 20 31 65 2d 33 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6f 74 2e .1e-3\not.tic()\nbary_wass.=.ot.
113c0 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 bregman.barycenter(A,.M,.reg,.we
113e0 69 67 68 74 73 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 5c 6e ights)\not.toc()\n\n\not.tic()\n
11400 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 20 3d 20 6f 74 2e 6c 70 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c bary_wass2.=.ot.lp.barycenter(A,
11420 20 4d 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 2c 20 73 6f 6c 76 65 72 3d 27 69 6e 74 65 72 69 6f 72 2d 70 6f .M,.weights,.solver='interior-po
11440 69 6e 74 27 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 5c 6e 5c int',.verbose=True)\not.toc()\n\
11460 6e 5c 6e 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 5b 41 2c 20 5b 62 61 72 79 5f 6c 32 2c n\nproblems.append([A,.[bary_l2,
11480 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e .bary_wass,.bary_wass2]])\n\npl.
114a0 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 figure(2)\npl.clf()\npl.subplot(
114c0 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 2,.1,.1)\nfor.i.in.range(n_distr
114e0 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 ibutions):\n....pl.plot(x,.A[:,.
11500 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e i])\npl.title('Distributions')\n
11520 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 \npl.subplot(2,.1,.2)\npl.plot(x
11540 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e ,.bary_l2,.'r',.label='l2')\npl.
11560 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 52 plot(x,.bary_wass,.'g',.label='R
11580 65 67 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 eg.Wasserstein')\npl.plot(x,.bar
115a0 79 5f 77 61 73 73 32 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 50 20 57 61 73 73 65 72 73 74 y_wass2,.'b',.label='LP.Wasserst
115c0 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 ein')\npl.legend()\npl.title('Ba
115e0 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e rycenters')\npl.tight_layout()\n
11600 5c 6e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 46 69 6e 61 6c 20 66 69 67 75 72 65 5c 6e 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d \n\n#\n#.Final.figure\n#.-------
11620 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 23 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 5c 6e 5c 6e 6e 62 6d 20 3d 20 6c 65 -----\n#\n\n#%%.plot\n\nnbm.=.le
11640 6e 28 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 29 5c 6e 6e 62 6d 32 20 3d 20 28 6e 62 6d 20 2f 2f 20 32 29 5c 6e n(problems)\nnbm2.=.(nbm.//.2)\n
11660 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 28 32 30 2c 20 36 29 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c \n\npl.figure(2,.(20,.6))\npl.cl
11680 66 28 29 5c 6e 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 62 6d 29 3a 5c 6e 5c 6e 20 f()\n\nfor.i.in.range(nbm):\n\n.
116a0 20 20 20 41 20 3d 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 5b 69 5d 5b 30 5d 5c 6e 20 20 20 20 62 61 72 79 5f ...A.=.problems[i][0]\n....bary_
116c0 6c 32 20 3d 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 5b 69 5d 5b 31 5d 5b 30 5d 5c 6e 20 20 20 20 62 61 72 79 l2.=.problems[i][1][0]\n....bary
116e0 5f 77 61 73 73 20 3d 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 5b 69 5d 5b 31 5d 5b 31 5d 5c 6e 20 20 20 20 62 _wass.=.problems[i][1][1]\n....b
11700 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 20 3d 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 5b 69 5d 5b 31 5d 5b 32 5d 5c 6e 5c ary_wass2.=.problems[i][1][2]\n\
11720 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 6e 62 6d 2c 20 31 20 2b 20 69 29 5c 6e n....pl.subplot(2,.nbm,.1.+.i)\n
11740 20 20 20 20 66 6f 72 20 6a 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f ....for.j.in.range(n_distributio
11760 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 6a 5d ns):\n........pl.plot(x,.A[:,.j]
11780 29 5c 6e 20 20 20 20 69 66 20 69 20 3d 3d 20 6e 62 6d 32 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 70 6c )\n....if.i.==.nbm2:\n........pl
117a0 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e .title('Distributions')\n....pl.
117c0 78 74 69 63 6b 73 28 28 29 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 28 29 29 5c 6e 5c xticks(())\n....pl.yticks(())\n\
117e0 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 6e 62 6d 2c 20 31 20 2b 20 69 20 2b 20 n....pl.subplot(2,.nbm,.1.+.i.+.
11800 6e 62 6d 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 nbm)\n\n....pl.plot(x,.bary_l2,.
11820 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 32 20 28 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 29 27 29 5c 6e 20 20 'r',.label='L2.(Euclidean)')\n..
11840 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 62 ..pl.plot(x,.bary_wass,.'g',.lab
11860 65 6c 3d 27 52 65 67 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c el='Reg.Wasserstein')\n....pl.pl
11880 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 50 ot(x,.bary_wass2,.'b',.label='LP
118a0 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 20 20 20 20 69 66 20 69 20 3d 3d 20 6e 62 6d 20 .Wasserstein')\n....if.i.==.nbm.
118c0 2d 20 31 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 20 20 20 20 69 -.1:\n........pl.legend()\n....i
118e0 66 20 69 20 3d 3d 20 6e 62 6d 32 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 f.i.==.nbm2:\n........pl.title('
11900 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 28 Barycenters')\n\n....pl.xticks((
11920 29 29 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 28 29 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 ))\n....pl.yticks(())".......]..
11940 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b ...}...],..."metadata":.{....."k
11960 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d ernelspec":.{......."display_nam
11980 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 e":."Python.3",......."language"
119a0 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f :."python",......."name":."pytho
119c0 6e 33 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 n3".....},....."language_info":.
119e0 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 {......."codemirror_mode":.{....
11a00 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 ....."name":."ipython",.........
11a20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 33 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c "version":.3.......},......."fil
11a40 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 e_extension":.".py",......."mime
11a60 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e type":."text/x-python",......."n
11a80 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 ame":."python",......."nbconvert
11aa0 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 _exporter":."python",......."pyg
11ac0 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 ments_lexer":."ipython3",.......
11ae0 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 33 2e 36 2e 35 22 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 2c 0a 20 20 "version":."3.6.5".....}...},...
11b00 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 "nbformat":.4,..."nbformat_minor
11b20 22 3a 20 30 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 63 4d be 4c 17 38 53 24 28 10 00 00 28 10 00 00 ":.0.}PK........cM.L.8S$(...(...
11b40 18 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 ....plot_OT_2D_samples.ipynb{...
11b60 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 "cells":.[.....{......."cell_typ
11b80 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 e":."code",......."execution_cou
11ba0 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 nt":.null,......."metadata":.{..
11bc0 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 ......."collapsed":.false.......
11be0 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 },......."outputs":.[],......."s
11c00 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 ource":.[........."%matplotlib.i
11c20 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 nline".......].....},.....{.....
11c40 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 .."cell_type":."markdown",......
11c60 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a ."metadata":.{},......."source":
11c80 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 32 44 20 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 .[........."\n#.2D.Optimal.trans
11ca0 70 6f 72 74 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 65 6d 70 69 72 69 63 61 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 port.between.empirical.distribut
11cc0 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 49 6c 6c 75 73 74 72 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 32 44 20 6f 70 74 ions\n\n\nIllustration.of.2D.opt
11ce0 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 64 69 73 63 72 69 62 75 74 imal.transport.between.discribut
11d00 69 6f 6e 73 20 74 68 61 74 20 61 72 65 20 77 65 69 67 68 74 65 64 5c 6e 73 75 6d 20 6f 66 20 64 ions.that.are.weighted\nsum.of.d
11d20 69 72 61 63 73 2e 20 54 68 65 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 69 73 20 70 6c 6f 74 74 65 64 20 iracs..The.OT.matrix.is.plotted.
11d40 77 69 74 68 20 74 68 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d with.the.samples.\n\n\n".......]
11d60 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a .....},.....{......."cell_type":
11d80 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 ."code",......."execution_count"
11da0 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 :.null,......."metadata":.{.....
11dc0 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a ...."collapsed":.false.......},.
11de0 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 ......"outputs":.[],......."sour
11e00 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 ce":.[........."#.Author:.Remi.F
11e20 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e lamary.<remi.flamary@unice.fr>\n
11e40 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 #\n#.License:.MIT.License\n\nimp
11e60 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c ort.numpy.as.np\nimport.matplotl
11e80 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 69 6d 70 6f 72 ib.pylab.as.pl\nimport.ot\nimpor
11ea0 74 20 6f 74 2e 70 6c 6f 74 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a t.ot.plot".......].....},.....{.
11ec0 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 ......"cell_type":."markdown",..
11ee0 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 ....."metadata":.{},......."sour
11f00 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 2d ce":.[........."Generate.data\n-
11f20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c ------------\n\n".......].....},
11f40 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 .....{......."cell_type":."code"
11f60 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c ,......."execution_count":.null,
11f80 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f ......."metadata":.{........."co
11fa0 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 llapsed":.false.......},......."
11fc0 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a outputs":.[],......."source":.[.
11fe0 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 20 61 6e 64 20 64 61 74 61 ........"#%%.parameters.and.data
12000 20 67 65 6e 65 72 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 6e 20 3d 20 35 30 20 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 .generation\n\nn.=.50..#.nb.samp
12020 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 6d 75 5f 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 30 2c 20 30 5d 29 5c 6e les\n\nmu_s.=.np.array([0,.0])\n
12040 63 6f 76 5f 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 5b 31 2c 20 30 5d 2c 20 5b 30 2c 20 31 5d cov_s.=.np.array([[1,.0],.[0,.1]
12060 5d 29 5c 6e 5c 6e 6d 75 5f 74 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 34 2c 20 34 5d 29 5c 6e 63 ])\n\nmu_t.=.np.array([4,.4])\nc
12080 6f 76 5f 74 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 5b 31 2c 20 2d 2e 38 5d 2c 20 5b 2d 2e 38 2c ov_t.=.np.array([[1,.-.8],.[-.8,
120a0 20 31 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 78 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 32 .1]])\n\nxs.=.ot.datasets.make_2
120c0 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 75 5f 73 2c 20 63 6f 76 5f 73 29 5c D_samples_gauss(n,.mu_s,.cov_s)\
120e0 6e 78 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 nxt.=.ot.datasets.make_2D_sample
12100 73 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 75 5f 74 2c 20 63 6f 76 5f 74 29 5c 6e 5c 6e 61 2c 20 62 20 s_gauss(n,.mu_t,.cov_t)\n\na,.b.
12120 3d 20 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 28 6e 2c 29 29 20 2f 20 6e 2c 20 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 28 6e 2c =.np.ones((n,))./.n,.np.ones((n,
12140 29 29 20 2f 20 6e 20 20 23 20 75 6e 69 66 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 6f ))./.n..#.uniform.distribution.o
12160 6e 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 20 3d 20 n.samples\n\n#.loss.matrix\nM.=.
12180 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 22 0a 20 ot.dist(xs,.xt)\nM./=.M.max()"..
121a0 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f .....].....},.....{......."cell_
121c0 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 type":."markdown",......."metada
121e0 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 ta":.{},......."source":.[......
12200 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 ..."Plot.data\n---------\n\n"...
12220 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 ....].....},.....{......."cell_t
12240 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 ype":."code",......."execution_c
12260 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b ount":.null,......."metadata":.{
12280 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 ........."collapsed":.false.....
122a0 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 ..},......."outputs":.[],.......
122c0 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 "source":.[........."#%%.plot.sa
122e0 6d 70 6c 65 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 mples\n\npl.figure(1)\npl.plot(x
12300 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 s[:,.0],.xs[:,.1],.'+b',.label='
12320 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 Source.samples')\npl.plot(xt[:,.
12340 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 0],.xt[:,.1],.'xr',.label='Targe
12360 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 t.samples')\npl.legend(loc=0)\np
12380 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 l.title('Source.and.target.distr
123a0 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 ibutions')\n\npl.figure(2)\npl.i
123c0 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 mshow(M,.interpolation='nearest'
123e0 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 4d 27 29 22 0a 20 20 )\npl.title('Cost.matrix.M')"...
12400 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 ....].....},.....{......."cell_t
12420 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 ype":."markdown",......."metadat
12440 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 a":.{},......."source":.[.......
12460 20 20 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 45 4d 44 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 .."Compute.EMD\n-----------\n\n"
12480 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c .......].....},.....{......."cel
124a0 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f l_type":."code",......."executio
124c0 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 n_count":.null,......."metadata"
124e0 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 :.{........."collapsed":.false..
12500 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 .....},......."outputs":.[],....
12520 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 4d 44 5c ..."source":.[........."#%%.EMD\
12540 6e 5c 6e 47 30 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 n\nG0.=.ot.emd(a,.b,.M)\n\npl.fi
12560 67 75 72 65 28 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 30 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 gure(3)\npl.imshow(G0,.interpola
12580 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 tion='nearest')\npl.title('OT.ma
125a0 74 72 69 78 20 47 30 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c trix.G0')\n\npl.figure(4)\not.pl
125c0 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 30 ot.plot2D_samples_mat(xs,.xt,.G0
125e0 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 ,.c=[.5,..5,.1])\npl.plot(xs[:,.
12600 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 0],.xs[:,.1],.'+b',.label='Sourc
12620 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 e.samples')\npl.plot(xt[:,.0],.x
12640 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d t[:,.1],.'xr',.label='Target.sam
12660 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 ples')\npl.legend(loc=0)\npl.tit
12680 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 77 69 74 68 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 22 0a 20 20 le('OT.matrix.with.samples')"...
126a0 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 ....].....},.....{......."cell_t
126c0 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 ype":."markdown",......."metadat
126e0 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 a":.{},......."source":.[.......
12700 20 20 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d .."Compute.Sinkhorn\n-----------
12720 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a -----\n\n".......].....},.....{.
12740 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 ......"cell_type":."code",......
12760 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 ."execution_count":.null,.......
12780 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 "metadata":.{........."collapsed
127a0 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 ":.false.......},......."outputs
127c0 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 ":.[],......."source":.[........
127e0 20 22 23 25 25 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 72 65 67 20 74 65 72 6d 5c 6e 6c 61 ."#%%.sinkhorn\n\n#.reg.term\nla
12800 6d 62 64 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 5c 6e 47 73 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 mbd.=.1e-3\n\nGs.=.ot.sinkhorn(a
12820 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 6c 61 6d 62 64 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 29 5c 6e ,.b,.M,.lambd)\n\npl.figure(5)\n
12840 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 73 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 pl.imshow(Gs,.interpolation='nea
12860 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 73 69 6e 6b rest')\npl.title('OT.matrix.sink
12880 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 36 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e horn')\n\npl.figure(6)\not.plot.
128a0 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 73 2c 20 63 plot2D_samples_mat(xs,.xt,.Gs,.c
128c0 6f 6c 6f 72 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c olor=[.5,..5,.1])\npl.plot(xs[:,
128e0 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 .0],.xs[:,.1],.'+b',.label='Sour
12900 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 ce.samples')\npl.plot(xt[:,.0],.
12920 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 xt[:,.1],.'xr',.label='Target.sa
12940 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 mples')\npl.legend(loc=0)\npl.ti
12960 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 77 69 74 68 20 73 61 6d tle('OT.matrix.Sinkhorn.with.sam
12980 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 ples')\n\npl.show()".......]....
129a0 20 7d 0a 20 20 5d 2c 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 .}...],..."metadata":.{....."ker
129c0 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 nelspec":.{......."display_name"
129e0 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 :."Python.3",......."language":.
12a00 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 33 "python",......."name":."python3
12a20 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a ".....},....."language_info":.{.
12a40 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 ......"codemirror_mode":.{......
12a60 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 ..."name":."ipython",........."v
12a80 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 33 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f ersion":.3.......},......."file_
12aa0 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 extension":.".py",......."mimety
12ac0 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d pe":."text/x-python",......."nam
12ae0 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 e":."python",......."nbconvert_e
12b00 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 xporter":."python",......."pygme
12b20 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 nts_lexer":."ipython3",......."v
12b40 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 33 2e 36 2e 35 22 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 2c 0a 20 20 22 6e ersion":."3.6.5".....}...},..."n
12b60 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a bformat":.4,..."nbformat_minor":
12b80 20 30 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 50 4c be 4c 3c c9 39 9a d1 14 00 00 d1 14 00 00 1e 00 .0.}PK........PL.L<.9...........
12ba0 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 69 70 79 6e 62 ..plot_otda_linear_mapping.ipynb
12bc0 7b 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c {..."cells":.[.....{......."cell
12be0 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e _type":."code",......."execution
12c00 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a _count":.null,......."metadata":
12c20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 .{........."collapsed":.false...
12c40 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 ....},......."outputs":.[],.....
12c60 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c .."source":.[........."%matplotl
12c80 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a ib.inline".......].....},.....{.
12ca0 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 ......"cell_type":."markdown",..
12cc0 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 ....."metadata":.{},......."sour
12ce0 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 43 72 65 61 74 65 64 20 6f 6e 20 54 75 65 ce":.[........."\nCreated.on.Tue
12d00 20 4d 61 72 20 32 30 20 31 34 3a 33 31 3a 31 35 20 32 30 31 38 5c 6e 5c 6e 40 61 75 74 68 6f 72 .Mar.20.14:31:15.2018\n\n@author
12d20 3a 20 72 66 6c 61 6d 61 72 79 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 :.rflamary\n\n".......].....},..
12d40 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a ...{......."cell_type":."code",.
12d60 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 ......"execution_count":.null,..
12d80 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c ....."metadata":.{........."coll
12da0 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 apsed":.false.......},......."ou
12dc0 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 tputs":.[],......."source":.[...
12de0 20 20 20 20 20 20 22 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 ......"import.numpy.as.np\nimpor
12e00 74 20 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 22 0a 20 20 20 20 20 20 t.pylab.as.pl\nimport.ot".......
12e20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 ].....},.....{......."cell_type"
12e40 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 :."markdown",......."metadata":.
12e60 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 47 {},......."source":.[........."G
12e80 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 enerate.data\n-------------\n\n"
12ea0 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c .......].....},.....{......."cel
12ec0 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f l_type":."code",......."executio
12ee0 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 n_count":.null,......."metadata"
12f00 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 :.{........."collapsed":.false..
12f20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 .....},......."outputs":.[],....
12f40 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 20 3d 20 31 30 30 30 ..."source":.[........."n.=.1000
12f60 5c 6e 64 20 3d 20 32 5c 6e 73 69 67 6d 61 20 3d 20 2e 31 5c 6e 5c 6e 23 20 73 6f 75 72 63 65 20 \nd.=.2\nsigma.=..1\n\n#.source.
12f80 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 61 6e 67 6c 65 73 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 samples\nangles.=.np.random.rand
12fa0 28 6e 2c 20 31 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 5c 6e 78 73 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 6e 63 (n,.1).*.2.*.np.pi\nxs.=.np.conc
12fc0 61 74 65 6e 61 74 65 28 28 6e 70 2e 73 69 6e 28 61 6e 67 6c 65 73 29 2c 20 6e 70 2e 63 6f 73 28 atenate((np.sin(angles),.np.cos(
12fe0 61 6e 67 6c 65 73 29 29 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 61 angles)),\n....................a
13000 78 69 73 3d 31 29 20 2b 20 73 69 67 6d 61 20 2a 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e xis=1).+.sigma.*.np.random.randn
13020 28 6e 2c 20 32 29 5c 6e 78 73 5b 3a 6e 20 2f 2f 20 32 2c 20 31 5d 20 2b 3d 20 32 5c 6e 5c 6e 5c (n,.2)\nxs[:n.//.2,.1].+=.2\n\n\
13040 6e 23 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 61 6e 67 6c 65 74 20 3d 20 6e 70 2e 72 n#.target.samples\nanglet.=.np.r
13060 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 28 6e 2c 20 31 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 5c 6e 78 74 andom.rand(n,.1).*.2.*.np.pi\nxt
13080 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 6e 63 61 74 65 6e 61 74 65 28 28 6e 70 2e 73 69 6e 28 61 6e 67 6c 65 74 .=.np.concatenate((np.sin(anglet
130a0 29 2c 20 6e 70 2e 63 6f 73 28 61 6e 67 6c 65 74 29 29 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 ),.np.cos(anglet)),\n...........
130c0 20 20 20 20 20 20 20 20 20 61 78 69 73 3d 31 29 20 2b 20 73 69 67 6d 61 20 2a 20 6e 70 2e 72 61 .........axis=1).+.sigma.*.np.ra
130e0 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c 20 32 29 5c 6e 78 74 5b 3a 6e 20 2f 2f 20 32 2c 20 31 5d ndom.randn(n,.2)\nxt[:n.//.2,.1]
13100 20 2b 3d 20 32 5c 6e 5c 6e 5c 6e 41 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 5b 31 2e 35 2c 20 2e .+=.2\n\n\nA.=.np.array([[1.5,..
13120 37 5d 2c 20 5b 2e 37 2c 20 31 2e 35 5d 5d 29 5c 6e 62 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 5b 7],.[.7,.1.5]])\nb.=.np.array([[
13140 34 2c 20 32 5d 5d 29 5c 6e 78 74 20 3d 20 78 74 2e 64 6f 74 28 41 29 20 2b 20 62 22 0a 20 20 20 4,.2]])\nxt.=.xt.dot(A).+.b"....
13160 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 ...].....},.....{......."cell_ty
13180 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 pe":."markdown",......."metadata
131a0 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 ":.{},......."source":.[........
131c0 20 22 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 ."Plot.data\n---------\n\n".....
131e0 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 ..].....},.....{......."cell_typ
13200 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 e":."code",......."execution_cou
13220 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 nt":.null,......."metadata":.{..
13240 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 ......."collapsed":.false.......
13260 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 },......."outputs":.[],......."s
13280 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 ource":.[........."pl.figure(1,.
132a0 28 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c (5,.5))\npl.plot(xs[:,.0],.xs[:,
132c0 20 31 5d 2c 20 27 2b 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b .1],.'+')\npl.plot(xt[:,.0],.xt[
132e0 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 6f 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 :,.1],.'o')".......].....},.....
13300 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c {......."cell_type":."markdown",
13320 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f ......."metadata":.{},......."so
13340 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 45 73 74 69 6d 61 74 65 20 6c 69 6e 65 61 urce":.[........."Estimate.linea
13360 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 61 6e 64 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d r.mapping.and.transport\n-------
13380 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e ------------------------------\n
133a0 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 \n".......].....},.....{......."
133c0 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 cell_type":."code",......."execu
133e0 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 tion_count":.null,......."metada
13400 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 ta":.{........."collapsed":.fals
13420 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a e.......},......."outputs":.[],.
13440 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 41 65 2c 20 62 ......"source":.[........."Ae,.b
13460 65 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 28 78 73 2c 20 e.=.ot.da.OT_mapping_linear(xs,.
13480 78 74 29 5c 6e 5c 6e 78 73 74 20 3d 20 78 73 2e 64 6f 74 28 41 65 29 20 2b 20 62 65 22 0a 20 20 xt)\n\nxst.=.xs.dot(Ae).+.be"...
134a0 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 ....].....},.....{......."cell_t
134c0 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 ype":."markdown",......."metadat
134e0 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 a":.{},......."source":.[.......
13500 20 20 22 50 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d .."Plot.transported.samples\n---
13520 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 ---------------------\n\n"......
13540 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 .].....},.....{......."cell_type
13560 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e ":."code",......."execution_coun
13580 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 t":.null,......."metadata":.{...
135a0 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d ......"collapsed":.false.......}
135c0 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f ,......."outputs":.[],......."so
135e0 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 28 urce":.[........."pl.figure(1,.(
13600 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 5,.5))\npl.clf()\npl.plot(xs[:,.
13620 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 0],.xs[:,.1],.'+')\npl.plot(xt[:
13640 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 6f 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 ,.0],.xt[:,.1],.'o')\npl.plot(xs
13660 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 t[:,.0],.xst[:,.1],.'+')\n\npl.s
13680 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 how()".......].....},.....{.....
136a0 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 .."cell_type":."markdown",......
136c0 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a ."metadata":.{},......."source":
136e0 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 4c 6f 61 64 20 69 6d 61 67 65 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d .[........."Load.image.data\n---
13700 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c ------------\n\n".......].....},
13720 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 .....{......."cell_type":."code"
13740 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c ,......."execution_count":.null,
13760 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f ......."metadata":.{........."co
13780 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 llapsed":.false.......},......."
137a0 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a outputs":.[],......."source":.[.
137c0 20 20 20 20 20 20 20 20 22 64 65 66 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c ........"def.im2mat(I):\n....\"\
137e0 22 5c 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 61 6e 64 20 69 6d 61 67 65 20 74 6f 20 6d 61 74 72 69 78 20 "\"Converts.and.image.to.matrix.
13800 28 6f 6e 65 20 70 69 78 65 6c 20 70 65 72 20 6c 69 6e 65 29 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 (one.pixel.per.line)\"\"\"\n....
13820 72 65 74 75 72 6e 20 49 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 49 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 20 2a 20 49 return.I.reshape((I.shape[0].*.I
13840 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 32 5d 29 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 .shape[1],.I.shape[2]))\n\n\ndef
13860 20 6d 61 74 32 69 6d 28 58 2c 20 73 68 61 70 65 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f .mat2im(X,.shape):\n....\"\"\"Co
13880 6e 76 65 72 74 73 20 62 61 63 6b 20 61 20 6d 61 74 72 69 78 20 74 6f 20 61 6e 20 69 6d 61 67 65 nverts.back.a.matrix.to.an.image
138a0 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 58 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 73 68 61 \"\"\"\n....return.X.reshape(sha
138c0 70 65 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 pe)\n\n\ndef.minmax(I):\n....ret
138e0 75 72 6e 20 6e 70 2e 63 6c 69 70 28 49 2c 20 30 2c 20 31 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 4c 6f 61 64 urn.np.clip(I,.0,.1)\n\n\n#.Load
13900 69 6e 67 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 49 31 20 3d 20 70 6c 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 ing.images\nI1.=.pl.imread('../d
13920 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 64 61 79 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c ata/ocean_day.jpg').astype(np.fl
13940 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 5c 6e 49 32 20 3d 20 70 6c 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e oat64)./.256\nI2.=.pl.imread('..
13960 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 73 75 6e 73 65 74 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 /data/ocean_sunset.jpg').astype(
13980 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 5c 6e 5c 6e 5c 6e 58 31 20 3d 20 69 6d 32 6d np.float64)./.256\n\n\nX1.=.im2m
139a0 61 74 28 49 31 29 5c 6e 58 32 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 32 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d at(I1)\nX2.=.im2mat(I2)".......]
139c0 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a .....},.....{......."cell_type":
139e0 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b ."markdown",......."metadata":.{
13a00 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 45 73 },......."source":.[........."Es
13a20 74 69 6d 61 74 65 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 61 6e 64 20 61 64 61 70 74 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d timate.mapping.and.adapt\n------
13a40 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 ----------------------\n\n".....
13a60 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 ..].....},.....{......."cell_typ
13a80 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 e":."code",......."execution_cou
13aa0 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 nt":.null,......."metadata":.{..
13ac0 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 ......."collapsed":.false.......
13ae0 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 },......."outputs":.[],......."s
13b00 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6d 61 70 70 69 6e 67 20 3d 20 6f 74 2e ource":.[........."mapping.=.ot.
13b20 64 61 2e 4c 69 6e 65 61 72 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 5c 6e 5c 6e 6d 61 70 70 69 6e 67 2e da.LinearTransport()\n\nmapping.
13b40 66 69 74 28 58 73 3d 58 31 2c 20 58 74 3d 58 32 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 78 73 74 20 3d 20 6d 61 70 fit(Xs=X1,.Xt=X2)\n\n\nxst.=.map
13b60 70 69 6e 67 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 5c 6e 78 74 73 20 3d 20 6d 61 70 ping.transform(Xs=X1)\nxts.=.map
13b80 70 69 6e 67 2e 69 6e 76 65 72 73 65 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 74 3d 58 32 29 5c 6e 5c ping.inverse_transform(Xt=X2)\n\
13ba0 6e 49 31 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 78 73 74 2c 20 49 31 2e 73 68 61 nI1t.=.minmax(mat2im(xst,.I1.sha
13bc0 70 65 29 29 5c 6e 49 32 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 78 74 73 2c 20 49 pe))\nI2t.=.minmax(mat2im(xts,.I
13be0 32 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 5c 6e 23 20 25 25 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2.shape))\n\n#.%%".......].....}
13c00 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b ,.....{......."cell_type":."mark
13c20 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 down",......."metadata":.{},....
13c40 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 74 72 61 ..."source":.[........."Plot.tra
13c60 6e 73 66 6f 72 6d 65 64 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d nsformed.images\n---------------
13c80 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 --------\n\n".......].....},....
13ca0 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 .{......."cell_type":."code",...
13cc0 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 ...."execution_count":.null,....
13ce0 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 ..."metadata":.{........."collap
13d00 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 sed":.false.......},......."outp
13d20 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 uts":.[],......."source":.[.....
13d40 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 37 ...."pl.figure(2,.figsize=(10,.7
13d60 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d ))\n\npl.subplot(2,.2,.1)\npl.im
13d80 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 show(I1)\npl.axis('off')\npl.tit
13da0 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 le('Im..1')\n\npl.subplot(2,.2,.
13dc0 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 2)\npl.imshow(I2)\npl.axis('off'
13de0 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 32 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c )\npl.title('Im..2')\n\npl.subpl
13e00 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 29 5c 6e 70 6c 2e ot(2,.2,.3)\npl.imshow(I1t)\npl.
13e20 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 70 70 69 6e 67 20 49 axis('off')\npl.title('Mapping.I
13e40 6d 2e 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 34 29 5c 6e 70 m..1')\n\npl.subplot(2,.2,.4)\np
13e60 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 l.imshow(I2t)\npl.axis('off')\np
13e80 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6e 76 65 72 73 65 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 49 6d 2e 20 32 27 29 l.title('Inverse.mapping.Im..2')
13ea0 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 ".......].....}...],..."metadata
13ec0 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 ":.{....."kernelspec":.{......."
13ee0 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 display_name":."Python.3",......
13f00 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 ."language":."python",......."na
13f20 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 33 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 me":."python3".....},....."langu
13f40 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d age_info":.{......."codemirror_m
13f60 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e ode":.{........."name":."ipython
13f80 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 33 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c ",........."version":.3.......},
13fa0 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 0a ......."file_extension":.".py",.
13fc0 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e ......"mimetype":."text/x-python
13fe0 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 ",......."name":."python",......
14000 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c ."nbconvert_exporter":."python",
14020 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f ......."pygments_lexer":."ipytho
14040 6e 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 33 2e 36 2e 35 22 0a 20 20 n3",......."version":."3.6.5"...
14060 20 20 7d 0a 20 20 7d 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 ..}...},..."nbformat":.4,..."nbf
14080 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 52 4c be 4c 49 ormat_minor":.0.}PK........RL.LI
140a0 c5 7b 83 fa 16 00 00 fa 16 00 00 17 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 .{.............plot_otda_mapping
140c0 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 .ipynb{..."cells":.[.....{......
140e0 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 ."cell_type":."code",......."exe
14100 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 cution_count":.null,......."meta
14120 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 data":.{........."collapsed":.fa
14140 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d lse.......},......."outputs":.[]
14160 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 ,......."source":.[........."%ma
14180 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a tplotlib.inline".......].....},.
141a0 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f ....{......."cell_type":."markdo
141c0 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 wn",......."metadata":.{},......
141e0 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 4f 54 20 6d 61 70 ."source":.[........."\n#.OT.map
14200 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 ping.estimation.for.domain.adapt
14220 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 70 72 65 73 65 6e 74 73 ation\n\n\nThis.example.presents
14240 20 68 6f 77 20 74 6f 20 75 73 65 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 74 6f 20 .how.to.use.MappingTransport.to.
14260 65 73 74 69 6d 61 74 65 20 61 74 20 74 68 65 20 73 61 6d 65 5c 6e 74 69 6d 65 20 62 6f 74 68 20 estimate.at.the.same\ntime.both.
14280 74 68 65 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6e 64 20 61 70 70 72 6f the.coupling.transport.and.appro
142a0 78 69 6d 61 74 65 20 74 68 65 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 6d 61 70 20 77 69 74 68 20 65 69 ximate.the.transport.map.with.ei
142c0 74 68 65 72 5c 6e 61 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6f 72 20 61 20 6b 65 72 6e 65 6c 69 7a 65 64 20 6d ther\na.linear.or.a.kernelized.m
142e0 61 70 70 69 6e 67 20 61 73 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 64 20 69 6e 20 5b 38 5d 2e 5c 6e 5c 6e apping.as.introduced.in.[8].\n\n
14300 5b 38 5d 20 4d 2e 20 50 65 72 72 6f 74 2c 20 4e 2e 20 43 6f 75 72 74 79 2c 20 52 2e 20 46 6c 61 [8].M..Perrot,.N..Courty,.R..Fla
14320 6d 61 72 79 2c 20 41 2e 20 48 61 62 72 61 72 64 2c 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 4d 61 70 70 69 6e 67 mary,.A..Habrard,\n....\"Mapping
14340 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c .estimation.for.discrete.optimal
14360 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 22 2c 5c 6e 20 20 20 20 4e 65 75 72 61 6c 20 49 6e 66 6f 72 6d .transport\",\n....Neural.Inform
14380 61 74 69 6f 6e 20 50 72 6f 63 65 73 73 69 6e 67 20 53 79 73 74 65 6d 73 20 28 4e 49 50 53 29 2c ation.Processing.Systems.(NIPS),
143a0 20 32 30 31 36 2e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b .2016.\n\n".......].....},.....{
143c0 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 ......."cell_type":."code",.....
143e0 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 .."execution_count":.null,......
14400 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 ."metadata":.{........."collapse
14420 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 d":.false.......},......."output
14440 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 s":.[],......."source":.[.......
14460 20 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 .."#.Authors:.Remi.Flamary.<remi
14480 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 .flamary@unice.fr>\n#..........S
144a0 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 tanislas.Chambon.<stan.chambon@g
144c0 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 mail.com>\n#\n#.License:.MIT.Lic
144e0 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 69 6d 70 6f ense\n\nimport.numpy.as.np\nimpo
14500 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 rt.matplotlib.pylab.as.pl\nimpor
14520 74 20 6f 74 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 t.ot".......].....},.....{......
14540 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 ."cell_type":."markdown",.......
14560 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 "metadata":.{},......."source":.
14580 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d [........."Generate.data\n------
145a0 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 -------\n\n".......].....},.....
145c0 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 {......."cell_type":."code",....
145e0 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 ..."execution_count":.null,.....
14600 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 .."metadata":.{........."collaps
14620 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 ed":.false.......},......."outpu
14640 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 ts":.[],......."source":.[......
14660 20 20 20 22 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 31 30 30 5c 6e 6e 5f 74 61 ..."n_source_samples.=.100\nn_ta
14680 72 67 65 74 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 31 30 30 5c 6e 74 68 65 74 61 20 3d 20 32 20 2a 20 rget_samples.=.100\ntheta.=.2.*.
146a0 6e 70 2e 70 69 20 2f 20 32 30 5c 6e 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 65 6c 20 3d 20 30 2e 31 5c 6e 5c np.pi./.20\nnoise_level.=.0.1\n\
146c0 6e 58 73 2c 20 79 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 64 61 74 61 5f nXs,.ys.=.ot.datasets.make_data_
146e0 63 6c 61 73 73 69 66 28 5c 6e 20 20 20 20 27 67 61 75 73 73 72 6f 74 27 2c 20 6e 5f 73 6f 75 72 classif(\n....'gaussrot',.n_sour
14700 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 6e 7a 3d 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 65 6c 29 5c 6e 58 73 5f ce_samples,.nz=noise_level)\nXs_
14720 6e 65 77 2c 20 5f 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 64 61 74 61 5f 63 new,._.=.ot.datasets.make_data_c
14740 6c 61 73 73 69 66 28 5c 6e 20 20 20 20 27 67 61 75 73 73 72 6f 74 27 2c 20 6e 5f 73 6f 75 72 63 lassif(\n....'gaussrot',.n_sourc
14760 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 6e 7a 3d 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 65 6c 29 5c 6e 58 74 2c 20 e_samples,.nz=noise_level)\nXt,.
14780 79 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 yt.=.ot.datasets.make_data_class
147a0 69 66 28 5c 6e 20 20 20 20 27 67 61 75 73 73 72 6f 74 27 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 5f 73 61 if(\n....'gaussrot',.n_target_sa
147c0 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 68 65 74 61 3d 74 68 65 74 61 2c 20 6e 7a 3d 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 mples,.theta=theta,.nz=noise_lev
147e0 65 6c 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6f 6e 65 20 6f 66 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 6d 6f 64 65 20 el)\n\n#.one.of.the.target.mode.
14800 63 68 61 6e 67 65 73 20 69 74 73 20 76 61 72 69 61 6e 63 65 20 28 6e 6f 20 6c 69 6e 65 61 72 20 changes.its.variance.(no.linear.
14820 6d 61 70 70 69 6e 67 29 5c 6e 58 74 5b 79 74 20 3d 3d 20 32 5d 20 2a 3d 20 33 5c 6e 58 74 20 3d mapping)\nXt[yt.==.2].*=.3\nXt.=
14840 20 58 74 20 2b 20 34 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 .Xt.+.4".......].....},.....{...
14860 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 ...."cell_type":."markdown",....
14880 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 ..."metadata":.{},......."source
148a0 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d ":.[........."Plot.data\n-------
148c0 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 --\n\n".......].....},.....{....
148e0 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 ..."cell_type":."code",......."e
14900 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 xecution_count":.null,......."me
14920 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 tadata":.{........."collapsed":.
14940 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 false.......},......."outputs":.
14960 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 [],......."source":.[........."p
14980 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 28 31 30 2c 20 35 29 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e l.figure(1,.(10,.5))\npl.clf()\n
149a0 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 pl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c
149c0 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 =ys,.marker='+',.label='Source.s
149e0 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 amples')\npl.scatter(Xt[:,.0],.X
14a00 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c t[:,.1],.c=yt,.marker='o',.label
14a20 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f ='Target.samples')\npl.legend(lo
14a40 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 c=0)\npl.title('Source.and.targe
14a60 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d t.distributions')".......].....}
14a80 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b ,.....{......."cell_type":."mark
14aa0 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 down",......."metadata":.{},....
14ac0 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 49 6e 73 74 61 6e 74 69 ..."source":.[........."Instanti
14ae0 61 74 65 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f ate.the.different.transport.algo
14b00 72 69 74 68 6d 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d rithms.and.fit.them\n-----------
14b20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d --------------------------------
14b40 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 ----------------\n\n".......]...
14b60 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 ..},.....{......."cell_type":."c
14b80 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e ode",......."execution_count":.n
14ba0 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 ull,......."metadata":.{........
14bc0 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 ."collapsed":.false.......},....
14be0 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 ..."outputs":.[],......."source"
14c00 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 :.[........."#.MappingTransport.
14c20 77 69 74 68 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6b 65 72 6e 65 6c 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c with.linear.kernel\not_mapping_l
14c40 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 5c inear.=.ot.da.MappingTransport(\
14c60 6e 20 20 20 20 6b 65 72 6e 65 6c 3d 5c 22 6c 69 6e 65 61 72 5c 22 2c 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 n....kernel=\"linear\",.mu=1e0,.
14c80 65 74 61 3d 31 65 2d 38 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 5c 6e 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 eta=1e-8,.bias=True,\n....max_it
14ca0 65 72 3d 32 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 er=20,.verbose=True)\n\not_mappi
14cc0 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 ng_linear.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n#
14ce0 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 .for.original.source.samples,.tr
14d00 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 ansform.applies.barycentric.mapp
14d20 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 ing\ntransp_Xs_linear.=.ot_mappi
14d40 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 ng_linear.transform(Xs=Xs)\n\n#.
14d60 66 6f 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 for.out.of.source.samples,.trans
14d80 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 74 68 65 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c form.applies.the.linear.mapping\
14da0 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 ntransp_Xs_linear_new.=.ot_mappi
14dc0 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 77 29 5c 6e ng_linear.transform(Xs=Xs_new)\n
14de0 5c 6e 5c 6e 23 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 67 61 75 73 \n\n#.MappingTransport.with.gaus
14e00 73 69 61 6e 20 6b 65 72 6e 65 6c 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e sian.kernel\not_mapping_gaussian
14e20 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 5c 6e 20 20 20 20 .=.ot.da.MappingTransport(\n....
14e40 6b 65 72 6e 65 6c 3d 5c 22 67 61 75 73 73 69 61 6e 5c 22 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 35 2c 20 6d kernel=\"gaussian\",.eta=1e-5,.m
14e60 75 3d 31 65 2d 31 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 20 73 69 67 6d 61 3d 31 2c 5c 6e 20 20 20 u=1e-1,.bias=True,.sigma=1,\n...
14e80 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 5f .max_iter=10,.verbose=True)\not_
14ea0 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 mapping_gaussian.fit(Xs=Xs,.Xt=X
14ec0 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 t)\n\n#.for.original.source.samp
14ee0 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 les,.transform.applies.barycentr
14f00 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d ic.mapping\ntransp_Xs_gaussian.=
14f20 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 .ot_mapping_gaussian.transform(X
14f40 73 3d 58 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d s=Xs)\n\n#.for.out.of.source.sam
14f60 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 74 68 65 20 67 61 75 73 ples,.transform.applies.the.gaus
14f80 73 69 61 6e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e sian.mapping\ntransp_Xs_gaussian
14fa0 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 _new.=.ot_mapping_gaussian.trans
14fc0 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 77 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a form(Xs=Xs_new)".......].....},.
14fe0 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f ....{......."cell_type":."markdo
15000 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 wn",......."metadata":.{},......
15020 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 ."source":.[........."Plot.trans
15040 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d ported.samples\n----------------
15060 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 --------\n\n".......].....},....
15080 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 .{......."cell_type":."code",...
150a0 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 ...."execution_count":.null,....
150c0 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 ..."metadata":.{........."collap
150e0 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 sed":.false.......},......."outp
15100 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 uts":.[],......."source":.[.....
15120 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e ...."pl.figure(2)\npl.clf()\npl.
15140 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b subplot(2,.2,.1)\npl.scatter(Xt[
15160 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f :,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o
15180 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d ',\n...........label='Target.sam
151a0 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 ples',.alpha=.2)\npl.scatter(tra
151c0 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c nsp_Xs_linear[:,.0],.transp_Xs_l
151e0 69 6e 65 61 72 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 5c 6e inear[:,.1],.c=ys,.marker='+',\n
15200 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4d 61 70 70 65 64 20 73 6f 75 72 63 65 20 ...........label='Mapped.source.
15220 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 42 61 72 79 2e 20 6d 61 70 70 samples')\npl.title(\"Bary..mapp
15240 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 5c 22 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 ing.(linear)\")\npl.legend(loc=0
15260 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 )\n\npl.subplot(2,.2,.2)\npl.sca
15280 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d tter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.m
152a0 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 arker='o',\n...........label='Ta
152c0 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 rget.samples',.alpha=.2)\npl.sca
152e0 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c tter(transp_Xs_linear_new[:,.0],
15300 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 5c 6e 20 20 .transp_Xs_linear_new[:,.1],\n..
15320 20 20 20 20 20 20 20 20 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c .........c=ys,.marker='+',.label
15340 3d 27 4c 65 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 ='Learned.mapping')\npl.title(\"
15360 45 73 74 69 6d 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c Estim..mapping.(linear)\")\n\npl
15380 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 .subplot(2,.2,.3)\npl.scatter(Xt
153a0 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 [:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='
153c0 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 o',\n...........label='Target.sa
153e0 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 mples',.alpha=.2)\npl.scatter(tr
15400 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 ansp_Xs_gaussian[:,.0],.transp_X
15420 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 s_gaussian[:,.1],.c=ys,\n.......
15440 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 ....marker='+',.label='barycentr
15460 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 42 61 72 79 2e 20 6d ic.mapping')\npl.title(\"Bary..m
15480 61 70 70 69 6e 67 20 28 6b 65 72 6e 65 6c 29 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 apping.(kernel)\")\n\npl.subplot
154a0 28 32 2c 20 32 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 (2,.2,.4)\npl.scatter(Xt[:,.0],.
154c0 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',\n...
154e0 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 ........label='Target.samples',.
15500 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f alpha=.2)\npl.scatter(transp_Xs_
15520 67 61 75 73 73 69 61 6e 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 gaussian_new[:,.0],.transp_Xs_ga
15540 75 73 73 69 61 6e 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 ussian_new[:,.1],.c=ys,\n.......
15560 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 65 61 72 6e 65 64 20 6d ....marker='+',.label='Learned.m
15580 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 45 73 74 69 6d 2e 20 6d 61 70 70 apping')\npl.title(\"Estim..mapp
155a0 69 6e 67 20 28 6b 65 72 6e 65 6c 29 5c 22 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 ing.(kernel)\")\npl.tight_layout
155c0 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 ()\n\npl.show()".......].....}..
155e0 20 5d 2c 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 .],..."metadata":.{....."kernels
15600 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 pec":.{......."display_name":."P
15620 79 74 68 6f 6e 20 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 ython.3",......."language":."pyt
15640 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 33 22 0a 20 20 hon",......."name":."python3"...
15660 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 ..},....."language_info":.{.....
15680 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 .."codemirror_mode":.{........."
156a0 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 name":."ipython",........."versi
156c0 6f 6e 22 3a 20 33 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 on":.3.......},......."file_exte
156e0 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a nsion":.".py",......."mimetype":
15700 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 ."text/x-python",......."name":.
15720 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 "python",......."nbconvert_expor
15740 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f ter":."python",......."pygments_
15760 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 lexer":."ipython3",......."versi
15780 6f 6e 22 3a 20 22 33 2e 36 2e 35 22 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 7d 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 on":."3.6.5".....}...},..."nbfor
157a0 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 0a 7d mat":.4,..."nbformat_minor":.0.}
157c0 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 4f 4c be 4c e5 eb aa 89 7c 10 00 00 7c 10 00 00 16 00 00 00 70 6c PK........OL.L....|...|.......pl
157e0 6f 74 5f 63 6f 6d 70 75 74 65 5f 65 6d 64 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a ot_compute_emd.ipynb{..."cells":
15800 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 .[.....{......."cell_type":."cod
15820 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c e",......."execution_count":.nul
15840 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 l,......."metadata":.{........."
15860 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 collapsed":.false.......},......
15880 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 ."outputs":.[],......."source":.
158a0 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 [........."%matplotlib.inline"..
158c0 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f .....].....},.....{......."cell_
158e0 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 type":."markdown",......."metada
15900 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 ta":.{},......."source":.[......
15920 20 20 20 22 5c 6e 23 20 50 6c 6f 74 20 6d 75 6c 74 69 70 6c 65 20 45 4d 44 5c 6e 5c 6e 5c 6e 53 ..."\n#.Plot.multiple.EMD\n\n\nS
15940 68 6f 77 73 20 68 6f 77 20 74 6f 20 63 6f 6d 70 75 74 65 20 6d 75 6c 74 69 70 6c 65 20 45 4d 44 hows.how.to.compute.multiple.EMD
15960 20 61 6e 64 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 77 69 74 68 20 74 77 6f 20 64 69 66 66 65 72 6e 74 5c .and.Sinkhorn.with.two.differnt\
15980 6e 67 72 6f 75 6e 64 20 6d 65 74 72 69 63 73 20 61 6e 64 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 69 72 20 76 nground.metrics.and.plot.their.v
159a0 61 6c 75 65 73 20 66 6f 72 20 64 69 66 66 65 65 6e 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 alues.for.diffeent.distributions
159c0 2e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a .\n\n\n\n".......].....},.....{.
159e0 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 ......"cell_type":."code",......
15a00 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 ."execution_count":.null,.......
15a20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 "metadata":.{........."collapsed
15a40 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 ":.false.......},......."outputs
15a60 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 ":.[],......."source":.[........
15a80 20 22 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 ."#.Author:.Remi.Flamary.<remi.f
15aa0 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 lamary@unice.fr>\n#\n#.License:.
15ac0 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e MIT.License\n\nimport.numpy.as.n
15ae0 70 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c p\nimport.matplotlib.pylab.as.pl
15b00 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 20 69 6d \nimport.ot\nfrom.ot.datasets.im
15b20 70 6f 72 74 20 6d 61 6b 65 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 20 61 73 20 67 61 75 73 73 22 0a 20 20 20 port.make_1D_gauss.as.gauss"....
15b40 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 ...].....},.....{......."cell_ty
15b60 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 pe":."markdown",......."metadata
15b80 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 ":.{},......."source":.[........
15ba0 20 22 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e ."Generate.data\n-------------\n
15bc0 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 \n".......].....},.....{......."
15be0 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 cell_type":."code",......."execu
15c00 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 tion_count":.null,......."metada
15c20 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 ta":.{........."collapsed":.fals
15c40 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a e.......},......."outputs":.[],.
15c60 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 70 ......"source":.[........."#%%.p
15c80 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e 73 5c arameters\n\nn.=.100..#.nb.bins\
15ca0 6e 6e 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 35 30 20 20 23 20 6e 62 20 74 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 nn_target.=.50..#.nb.target.dist
15cc0 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 5c 6e ributions\n\n\n#.bin.positions\n
15ce0 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 x.=.np.arange(n,.dtype=np.float6
15d00 34 29 5c 6e 5c 6e 6c 73 74 5f 6d 20 3d 20 6e 70 2e 6c 69 6e 73 70 61 63 65 28 32 30 2c 20 39 30 4)\n\nlst_m.=.np.linspace(20,.90
15d20 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 ,.n_target)\n\n#.Gaussian.distri
15d40 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 61 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 29 butions\na.=.gauss(n,.m=20,.s=5)
15d60 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 5c 6e 5c 6e 42 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 ..#.m=.mean,.s=.std\n\nB.=.np.ze
15d80 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 29 29 5c 6e 5c 6e 66 6f 72 20 69 2c 20 6d 20 69 ros((n,.n_target))\n\nfor.i,.m.i
15da0 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 6c 73 74 5f 6d 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 42 5b 3a 2c 20 69 5d n.enumerate(lst_m):\n....B[:,.i]
15dc0 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 6d 2c 20 73 3d 35 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 .=.gauss(n,.m=m,.s=5)\n\n#.loss.
15de0 6d 61 74 72 69 78 20 61 6e 64 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 matrix.and.normalization\nM.=.ot
15e00 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 .dist(x.reshape((n,.1)),.x.resha
15e20 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d pe((n,.1)),.'euclidean')\nM./=.M
15e40 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 .max()\nM2.=.ot.dist(x.reshape((
15e60 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 27 73 71 65 75 n,.1)),.x.reshape((n,.1)),.'sqeu
15e80 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 clidean')\nM2./=.M2.max()"......
15ea0 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 .].....},.....{......."cell_type
15ec0 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a ":."markdown",......."metadata":
15ee0 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 .{},......."source":.[........."
15f00 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 Plot.data\n---------\n\n".......
15f20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 ].....},.....{......."cell_type"
15f40 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 :."code",......."execution_count
15f60 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 ":.null,......."metadata":.{....
15f80 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c ....."collapsed":.false.......},
15fa0 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 ......."outputs":.[],......."sou
15fc0 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 rce":.[........."#%%.plot.the.di
15fe0 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 5c 6e 70 6c 2e stributions\n\npl.figure(1)\npl.
16000 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 61 2c 20 subplot(2,.1,.1)\npl.plot(x,.a,.
16020 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 'b',.label='Source.distribution'
16040 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e )\npl.title('Source.distribution
16060 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 ')\npl.subplot(2,.1,.2)\npl.plot
16080 28 78 2c 20 42 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f (x,.B,.label='Target.distributio
160a0 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 ns')\npl.title('Target.distribut
160c0 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 ions')\npl.tight_layout()"......
160e0 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 .].....},.....{......."cell_type
16100 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a ":."markdown",......."metadata":
16120 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 .{},......."source":.[........."
16140 43 6f 6d 70 75 74 65 20 45 4d 44 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6c 6f Compute.EMD.for.the.different.lo
16160 73 73 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d sses\n--------------------------
16180 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 ----------\n\n".......].....},..
161a0 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a ...{......."cell_type":."code",.
161c0 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 ......"execution_count":.null,..
161e0 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c ....."metadata":.{........."coll
16200 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 apsed":.false.......},......."ou
16220 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 tputs":.[],......."source":.[...
16240 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 61 6e 64 20 70 6c 6f 74 20 64 69 73 74 ......"#%%.Compute.and.plot.dist
16260 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 61 6e 64 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 5c 6e 64 5f 65 ributions.and.loss.matrix\n\nd_e
16280 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 29 20 20 23 20 64 69 72 65 63 74 20 md.=.ot.emd2(a,.B,.M)..#.direct.
162a0 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 45 4d 44 5c 6e 64 5f 65 6d 64 32 20 3d 20 6f 74 2e computation.of.EMD\nd_emd2.=.ot.
162c0 65 6d 64 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 32 29 20 20 23 20 64 69 72 65 63 74 20 63 6f 6d 70 75 74 61 emd2(a,.B,.M2)..#.direct.computa
162e0 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 6c 6f 73 73 20 4d 32 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c tion.of.EMD.with.loss.M2\n\n\npl
16300 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 6d 64 2c 20 6c 61 62 65 6c .figure(2)\npl.plot(d_emd,.label
16320 3d 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 6d 64 ='Euclidean.EMD')\npl.plot(d_emd
16340 32 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 27 2,.label='Squared.Euclidean.EMD'
16360 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 4d 44 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 5c 6e 70 6c )\npl.title('EMD.distances')\npl
16380 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a .legend()".......].....},.....{.
163a0 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 ......"cell_type":."markdown",..
163c0 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 ....."metadata":.{},......."sour
163e0 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e ce":.[........."Compute.Sinkhorn
16400 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6c 6f 73 73 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d .for.the.different.losses\n-----
16420 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d --------------------------------
16440 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 ----\n\n".......].....},.....{..
16460 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 ....."cell_type":."code",.......
16480 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 "execution_count":.null,......."
164a0 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 metadata":.{........."collapsed"
164c0 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 :.false.......},......."outputs"
164e0 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 :.[],......."source":.[.........
16500 22 23 25 25 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 32 5c 6e 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f "#%%\nreg.=.1e-2\nd_sinkhorn.=.o
16520 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 29 5c 6e 64 5f 73 69 6e t.sinkhorn2(a,.B,.M,.reg)\nd_sin
16540 6b 68 6f 72 6e 32 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 32 2c 20 khorn2.=.ot.sinkhorn2(a,.B,.M2,.
16560 72 65 67 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e reg)\n\npl.figure(2)\npl.clf()\n
16580 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 6d 64 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 pl.plot(d_emd,.label='Euclidean.
165a0 45 4d 44 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 6d 64 32 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 71 EMD')\npl.plot(d_emd2,.label='Sq
165c0 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 uared.Euclidean.EMD')\npl.plot(d
165e0 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e _sinkhorn,.'+',.label='Euclidean
16600 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 .Sinkhorn')\npl.plot(d_sinkhorn2
16620 2c 20 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 ,.'+',.label='Squared.Euclidean.
16640 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 4d 44 20 64 69 73 74 61 6e Sinkhorn')\npl.title('EMD.distan
16660 63 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 ces')\npl.legend()\n\npl.show()"
16680 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 .......].....}...],..."metadata"
166a0 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 :.{....."kernelspec":.{......."d
166c0 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 50 79 74 68 6f 6e 20 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 isplay_name":."Python.3",.......
166e0 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d "language":."python",......."nam
16700 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 33 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 e":."python3".....},....."langua
16720 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f ge_info":.{......."codemirror_mo
16740 64 65 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 de":.{........."name":."ipython"
16760 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 33 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a ,........."version":.3.......},.
16780 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 79 22 2c 0a 20 ......"file_extension":.".py",..
167a0 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f 6e 22 ....."mimetype":."text/x-python"
167c0 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 ,......."name":."python",.......
167e0 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 0a "nbconvert_exporter":."python",.
16800 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e ......"pygments_lexer":."ipython
16820 33 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 33 2e 36 2e 35 22 0a 20 20 20 3",......."version":."3.6.5"....
16840 20 7d 0a 20 20 7d 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 0a 20 20 22 6e 62 66 6f .}...},..."nbformat":.4,..."nbfo
16860 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 30 0a 7d 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 a7 6e a2 4c b3 d8 rmat_minor":.0.}PK.........n.L..
16880 ae 69 5b 16 00 00 5b 16 00 00 1c 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d .i[...[.......plot_otda_color_im
168a0 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 7b 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 5f 6d 69 6e 6f 72 22 3a 20 ages.ipynb{..."nbformat_minor":.
168c0 30 2c 20 0a 20 20 22 6e 62 66 6f 72 6d 61 74 22 3a 20 34 2c 20 0a 20 20 22 63 65 6c 6c 73 22 3a 0,...."nbformat":.4,...."cells":
168e0 20 5b 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 .[.....{......."execution_count"
16900 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 :.null,........"cell_type":."cod
16920 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 e",........"source":.[........."
16940 25 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6e 6c 69 6e 65 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 %matplotlib.inline".......],....
16960 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 ...."outputs":.[],........"metad
16980 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c ata":.{........."collapsed":.fal
169a0 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 se.......}.....},......{......."
169c0 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 5c 6e 23 20 4f 54 20 66 6f 72 20 69 source":.[........."\n#.OT.for.i
169e0 6d 61 67 65 20 63 6f 6c 6f 72 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 54 68 69 73 20 mage.color.adaptation\n\n\nThis.
16a00 65 78 61 6d 70 6c 65 20 70 72 65 73 65 6e 74 73 20 61 20 77 61 79 20 6f 66 20 74 72 61 6e 73 66 example.presents.a.way.of.transf
16a20 65 72 72 69 6e 67 20 63 6f 6c 6f 72 73 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 74 77 6f 20 69 6d 61 67 65 5c erring.colors.between.two.image\
16a40 6e 77 69 74 68 20 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 73 20 69 6e 74 72 6f nwith.Optimal.Transport.as.intro
16a60 64 75 63 65 64 20 69 6e 20 5b 36 5d 5c 6e 5c 6e 5b 36 5d 20 46 65 72 72 61 64 61 6e 73 2c 20 53 duced.in.[6]\n\n[6].Ferradans,.S
16a80 2e 2c 20 50 61 70 61 64 61 6b 69 73 2c 20 4e 2e 2c 20 50 65 79 72 65 2c 20 47 2e 2c 20 26 20 41 .,.Papadakis,.N.,.Peyre,.G.,.&.A
16aa0 75 6a 6f 6c 2c 20 4a 2e 20 46 2e 20 28 32 30 31 34 29 2e 5c 6e 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 ujol,.J..F..(2014).\nRegularized
16ac0 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 2e 5c 6e 53 49 .discrete.optimal.transport.\nSI
16ae0 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c 20 6f 6e 20 49 6d 61 67 69 6e 67 20 53 63 69 65 6e 63 65 73 2c 20 AM.Journal.on.Imaging.Sciences,.
16b00 37 28 33 29 2c 20 31 38 35 33 2d 31 38 38 32 2e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 7(3),.1853-1882.\n\n".......],..
16b20 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a ......"cell_type":."markdown",..
16b40 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 ......"metadata":.{}.....},.....
16b60 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c .{......."execution_count":.null
16b80 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 ,........"cell_type":."code",...
16ba0 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 74 68 ....."source":.[........."#.Auth
16bc0 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 ors:.Remi.Flamary.<remi.flamary@
16be0 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 5c 6e 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 unice.fr>\n#..........Stanislas.
16c00 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e Chambon.<stan.chambon@gmail.com>
16c20 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 5c 6e 5c 6e 69 \n#\n#.License:.MIT.License\n\ni
16c40 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 5c 6e 66 72 6f 6d 20 73 63 69 70 79 20 69 6d mport.numpy.as.np\nfrom.scipy.im
16c60 70 6f 72 74 20 6e 64 69 6d 61 67 65 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e port.ndimage\nimport.matplotlib.
16c80 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 5c 6e 5c 6e 5c 6e 72 20 3d 20 pylab.as.pl\nimport.ot\n\n\nr.=.
16ca0 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 52 61 6e 64 6f 6d 53 74 61 74 65 28 34 32 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 np.random.RandomState(42)\n\n\nd
16cc0 65 66 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e 76 65 72 74 ef.im2mat(I):\n....\"\"\"Convert
16ce0 73 20 61 6e 64 20 69 6d 61 67 65 20 74 6f 20 6d 61 74 72 69 78 20 28 6f 6e 65 20 70 69 78 65 6c s.and.image.to.matrix.(one.pixel
16d00 20 70 65 72 20 6c 69 6e 65 29 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 49 2e 72 .per.line)\"\"\"\n....return.I.r
16d20 65 73 68 61 70 65 28 28 49 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 20 2a 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c eshape((I.shape[0].*.I.shape[1],
16d40 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 32 5d 29 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 6d 61 74 32 69 6d 28 58 2c .I.shape[2]))\n\n\ndef.mat2im(X,
16d60 20 73 68 61 70 65 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 62 61 63 .shape):\n....\"\"\"Converts.bac
16d80 6b 20 61 20 6d 61 74 72 69 78 20 74 6f 20 61 6e 20 69 6d 61 67 65 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 k.a.matrix.to.an.image\"\"\"\n..
16da0 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 58 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 73 68 61 70 65 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 ..return.X.reshape(shape)\n\n\nd
16dc0 65 66 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 49 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 63 6c 69 ef.minmax(I):\n....return.np.cli
16de0 70 28 49 2c 20 30 2c 20 31 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 p(I,.0,.1)".......],........"out
16e00 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a puts":.[],........"metadata":.{.
16e20 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 ........"collapsed":.false......
16e40 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a .}.....},......{......."source":
16e60 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d .[........."Generate.data\n-----
16e80 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 --------\n\n".......],........"c
16ea0 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d ell_type":."markdown",........"m
16ec0 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 etadata":.{}.....},......{......
16ee0 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ."execution_count":.null,.......
16f00 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f ."cell_type":."code",........"so
16f20 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 4c 6f 61 64 69 6e 67 20 69 6d 61 67 urce":.[........."#.Loading.imag
16f40 65 73 5c 6e 49 31 20 3d 20 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 es\nI1.=.ndimage.imread('../data
16f60 2f 6f 63 65 61 6e 5f 64 61 79 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 /ocean_day.jpg').astype(np.float
16f80 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 5c 6e 49 32 20 3d 20 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 64)./.256\nI2.=.ndimage.imread('
16fa0 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 73 75 6e 73 65 74 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 ../data/ocean_sunset.jpg').astyp
16fc0 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 5c 6e 5c 6e 58 31 20 3d 20 69 6d 32 6d e(np.float64)./.256\n\nX1.=.im2m
16fe0 61 74 28 49 31 29 5c 6e 58 32 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 32 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 72 61 at(I1)\nX2.=.im2mat(I2)\n\n#.tra
17000 69 6e 69 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 6e 62 20 3d 20 31 30 30 30 5c 6e 69 64 78 31 20 3d ining.samples\nnb.=.1000\nidx1.=
17020 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 31 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 .r.randint(X1.shape[0],.size=(nb
17040 2c 29 29 5c 6e 69 64 78 32 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 32 2e 73 68 61 70 65 5b 30 ,))\nidx2.=.r.randint(X2.shape[0
17060 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 5c 6e 5c 6e 58 73 20 3d 20 58 31 5b 69 64 78 31 2c 20 ],.size=(nb,))\n\nXs.=.X1[idx1,.
17080 3a 5d 5c 6e 58 74 20 3d 20 58 32 5b 69 64 78 32 2c 20 3a 5d 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a :]\nXt.=.X2[idx2,.:]".......],..
170a0 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 ......"outputs":.[],........"met
170c0 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 adata":.{........."collapsed":.f
170e0 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 alse.......}.....},......{......
17100 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 6f 72 69 67 69 ."source":.[........."Plot.origi
17120 6e 61 6c 20 69 6d 61 67 65 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e nal.image\n-------------------\n
17140 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a \n".......],........"cell_type":
17160 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 ."markdown",........"metadata":.
17180 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f {}.....},......{......."executio
171a0 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 n_count":.null,........"cell_typ
171c0 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 e":."code",........"source":.[..
171e0 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e ......."pl.figure(1,.figsize=(6.
17200 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 4,.3))\n\npl.subplot(1,.2,.1)\np
17220 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c l.imshow(I1)\npl.axis('off')\npl
17240 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 .title('Image.1')\n\npl.subplot(
17260 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 1,.2,.2)\npl.imshow(I2)\npl.axis
17280 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 22 0a 20 20 ('off')\npl.title('Image.2')"...
172a0 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 ....],........"outputs":.[],....
172c0 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 ...."metadata":.{........."colla
172e0 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 psed":.false.......}.....},.....
17300 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 53 63 .{......."source":.[........."Sc
17320 61 74 74 65 72 20 70 6c 6f 74 20 6f 66 20 63 6f 6c 6f 72 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d atter.plot.of.colors\n----------
17340 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 ------------\n\n".......],......
17360 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 .."cell_type":."markdown",......
17380 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 .."metadata":.{}.....},......{..
173a0 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 ....."execution_count":.null,...
173c0 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 ....."cell_type":."code",.......
173e0 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 ."source":.[........."pl.figure(
17400 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 2,.figsize=(6.4,.3))\n\npl.subpl
17420 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d ot(1,.2,.1)\npl.scatter(Xs[:,.0]
17440 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 73 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 ,.Xs[:,.2],.c=Xs)\npl.axis([0,.1
17460 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 ,.0,.1])\npl.xlabel('Red')\npl.y
17480 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 label('Blue')\npl.title('Image.1
174a0 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 ')\n\npl.subplot(1,.2,.2)\npl.sc
174c0 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 74 29 5c atter(Xt[:,.0],.Xt[:,.2],.c=Xt)\
174e0 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 npl.axis([0,.1,.0,.1])\npl.xlabe
17500 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e l('Red')\npl.ylabel('Blue')\npl.
17520 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 title('Image.2')\npl.tight_layou
17540 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 t()".......],........"outputs":.
17560 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 [],........"metadata":.{........
17580 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 ."collapsed":.false.......}.....
175a0 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 },......{......."source":.[.....
175c0 20 20 20 20 22 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 ...."Instantiate.the.different.t
175e0 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d ransport.algorithms.and.fit.them
17600 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d \n------------------------------
17620 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c -----------------------------\n\
17640 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 n".......],........"cell_type":.
17660 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b "markdown",........"metadata":.{
17680 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e }.....},......{......."execution
176a0 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 _count":.null,........"cell_type
176c0 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 ":."code",........"source":.[...
176e0 20 20 20 20 20 20 22 23 20 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 ......"#.EMDTransport\not_emd.=.
17700 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 ot.da.EMDTransport()\not_emd.fit
17720 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e (Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n#.SinkhornTran
17740 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 sport\not_sinkhorn.=.ot.da.Sinkh
17760 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e ornTransport(reg_e=1e-1)\not_sin
17780 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 70 72 65 khorn.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n#.pre
177a0 64 69 63 74 69 6f 6e 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 69 6d 61 67 65 73 20 28 75 73 69 6e 67 20 6f 75 diction.between.images.(using.ou
177c0 74 20 6f 66 20 73 61 6d 70 6c 65 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e 20 61 73 20 69 6e 20 5b 36 5d t.of.sample.prediction.as.in.[6]
177e0 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 )\ntransp_Xs_emd.=.ot_emd.transf
17800 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 orm(Xs=X1)\ntransp_Xt_emd.=.ot_e
17820 6d 64 2e 69 6e 76 65 72 73 65 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 74 3d 58 32 29 5c 6e 5c 6e 74 md.inverse_transform(Xt=X2)\n\nt
17840 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 ransp_Xs_sinkhorn.=.ot_emd.trans
17860 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 form(Xs=X1)\ntransp_Xt_sinkhorn.
17880 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 69 6e 76 65 72 73 65 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 74 3d 58 32 =.ot_emd.inverse_transform(Xt=X2
178a0 29 5c 6e 5c 6e 49 31 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f )\n\nI1t.=.minmax(mat2im(transp_
178c0 58 73 5f 65 6d 64 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 49 32 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 Xs_emd,.I1.shape))\nI2t.=.minmax
178e0 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 65 6d 64 2c 20 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 (mat2im(transp_Xt_emd,.I2.shape)
17900 29 5c 6e 5c 6e 49 31 74 65 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 )\n\nI1te.=.minmax(mat2im(transp
17920 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 5c 6e 49 32 74 65 20 3d _Xs_sinkhorn,.I1.shape))\nI2te.=
17940 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 .minmax(mat2im(transp_Xt_sinkhor
17960 6e 2c 20 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 n,.I2.shape))".......],........"
17980 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a outputs":.[],........"metadata":
179a0 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 .{........."collapsed":.false...
179c0 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 ....}.....},......{......."sourc
179e0 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 6e 65 77 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e e":.[........."Plot.new.images\n
17a00 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 ---------------\n\n".......],...
17a20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 ....."cell_type":."markdown",...
17a40 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 ....."metadata":.{}.....},......
17a60 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c {......."execution_count":.null,
17a80 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 ........"cell_type":."code",....
17aa0 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 ...."source":.[........."pl.figu
17ac0 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 re(3,.figsize=(8,.4))\n\npl.subp
17ae0 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 70 6c 2e lot(2,.3,.1)\npl.imshow(I1)\npl.
17b00 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 axis('off')\npl.title('Image.1')
17b20 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 \n\npl.subplot(2,.3,.2)\npl.imsh
17b40 6f 77 28 49 31 74 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c ow(I1t)\npl.axis('off')\npl.titl
17b60 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 e('Image.1.Adapt')\n\npl.subplot
17b80 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 65 29 5c 6e 70 6c 2e 61 (2,.3,.3)\npl.imshow(I1te)\npl.a
17ba0 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 xis('off')\npl.title('Image.1.Ad
17bc0 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 apt.(reg)')\n\npl.subplot(2,.3,.
17be0 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 4)\npl.imshow(I2)\npl.axis('off'
17c00 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 )\npl.title('Image.2')\n\npl.sub
17c20 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 29 5c 6e 70 plot(2,.3,.5)\npl.imshow(I2t)\np
17c40 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 l.axis('off')\npl.title('Image.2
17c60 20 41 64 61 70 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 5c .Adapt')\n\npl.subplot(2,.3,.6)\
17c80 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 65 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 npl.imshow(I2te)\npl.axis('off')
17ca0 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 \npl.title('Image.2.Adapt.(reg)'
17cc0 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 )\npl.tight_layout()\n\npl.show(
17ce0 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d )".......],........"outputs":.[]
17d00 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 ,........"metadata":.{........."
17d20 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a collapsed":.false.......}.....}.
17d40 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b 65 72 6e 65 ..],...."metadata":.{....."kerne
17d60 6c 73 70 65 63 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 64 69 73 70 6c 61 79 5f 6e 61 6d 65 22 3a 20 lspec":.{......."display_name":.
17d80 22 50 79 74 68 6f 6e 20 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 "Python.2",........"name":."pyth
17da0 6f 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f 6e on2",........"language":."python
17dc0 22 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 22 6c 61 6e 67 75 61 67 65 5f 69 6e 66 6f 22 3a 20 7b ".....},......"language_info":.{
17de0 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 69 6d 65 74 79 70 65 22 3a 20 22 74 65 78 74 2f 78 2d 70 79 74 68 6f ......."mimetype":."text/x-pytho
17e00 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 62 63 6f 6e 76 65 72 74 5f 65 78 70 6f 72 74 65 72 22 3a n",........"nbconvert_exporter":
17e20 20 22 70 79 74 68 6f 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 70 79 74 68 6f ."python",........"name":."pytho
17e40 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 66 69 6c 65 5f 65 78 74 65 6e 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 2e 70 n",........"file_extension":.".p
17e60 79 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 22 32 2e 37 2e 31 32 22 2c 20 y",........"version":."2.7.12",.
17e80 0a 20 20 20 20 20 20 22 70 79 67 6d 65 6e 74 73 5f 6c 65 78 65 72 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f ......."pygments_lexer":."ipytho
17ea0 6e 32 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 64 65 6d 69 72 72 6f 72 5f 6d 6f 64 65 22 3a 20 7b n2",........"codemirror_mode":.{
17ec0 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 76 65 72 73 69 6f 6e 22 3a 20 32 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 ........."version":.2,..........
17ee0 22 6e 61 6d 65 22 3a 20 22 69 70 79 74 68 6f 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 0a "name":."ipython".......}.....}.
17f00 20 20 7d 0a 7d 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 4d 4c be 4c 88 ac 62 ba 81 11 00 00 81 11 00 ..}.}PK..........ML.L..b........
17f20 00 11 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 00 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 67 72 6f 6d 6f 76 2e 69 ...................plot_gromov.i
17f40 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 a7 6e a2 4c ae 38 61 57 26 14 00 00 26 14 00 00 pynbPK...........n.L.8aW&...&...
17f60 0e 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 b0 11 00 00 70 6c 6f 74 5f 57 44 41 2e 69 70 79 6e 62 ..................plot_WDA.ipynb
17f80 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 18 7f a2 4c aa d3 d6 af 27 23 00 00 27 23 00 00 1c 00 00 00 PK.............L....'#..'#......
17fa0 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 02 26 00 00 70 6c 6f 74 5f 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 ...........&..plot_gromov_baryce
17fc0 6e 74 65 72 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 4c 4c be 4c 17 03 7f 9a 5e 13 nter.ipynbPK..........LL.L....^.
17fe0 00 00 5e 13 00 00 16 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 63 49 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 70 74 ..^.................cI..plot_opt
18000 69 6d 5f 4f 54 72 65 67 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 69 4c be 4c d1 72 im_OTreg.ipynbPK..........iL.L.r
18020 b5 4d f4 1c 00 00 f4 1c 00 00 12 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 f5 5c 00 00 70 6c 6f 74 .M.......................\..plot
18040 5f 6f 74 64 61 5f 64 32 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 53 4c be 4c a9 b8 _otda_d2.ipynbPK..........SL.L..
18060 76 f6 f8 19 00 00 f8 19 00 00 1f 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 19 7a 00 00 70 6c 6f 74 v........................z..plot
18080 5f 6f 74 64 61 5f 73 65 6d 69 5f 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 _otda_semi_supervised.ipynbPK...
180a0 03 14 00 00 00 00 00 4b 4c be 4c 27 4a df 9c 9d 0d 00 00 9d 0d 00 00 10 00 00 00 00 00 00 00 00 .......KL.L'J...................
180c0 00 00 00 b4 81 4e 94 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 .....N...plot_OT_1D.ipynbPK.....
180e0 00 00 00 00 00 51 4c be 4c 18 79 30 f2 4b 11 00 00 4b 11 00 00 18 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 .....QL.L.y0.K...K..............
18100 00 b4 81 19 a2 00 00 70 6c 6f 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 31 44 2e 69 70 79 6e 62 50 .......plot_barycenter_1D.ipynbP
18120 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 fb 4c be 4c cc bf 84 66 2d 18 00 00 2d 18 00 00 17 00 00 00 00 K...........L.L...f-...-........
18140 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 9a b3 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6c 61 73 73 65 73 2e 69 .............plot_otda_classes.i
18160 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 a7 6e a2 4c ee 5d c2 9b 78 18 00 00 78 18 00 00 pynbPK...........n.L.]..x...x...
18180 25 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 fc cb 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 %.................plot_otda_mapp
181a0 69 6e 67 5f 63 6f 6c 6f 72 73 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 ing_colors_images.ipynbPK.......
181c0 00 00 00 69 4c be 4c 3e 1d 30 6f d5 1a 00 00 d5 1a 00 00 16 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 ...iL.L>.0o.....................
181e0 81 b7 e4 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 4c 31 5f 76 73 5f 4c 32 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 .....plot_OT_L1_vs_L2.ipynbPK...
18200 03 14 00 00 00 00 00 6e 4c be 4c 81 f4 0f 36 24 1b 00 00 24 1b 00 00 24 00 00 00 00 00 00 00 00 .......nL.L...6$...$...$........
18220 00 00 00 b4 81 c0 ff 00 00 70 6c 6f 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 6c 70 5f 76 73 5f 65 .........plot_barycenter_lp_vs_e
18240 6e 74 72 6f 70 69 63 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 63 4d be 4c 17 38 53 ntropic.ipynbPK..........cM.L.8S
18260 24 28 10 00 00 28 10 00 00 18 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 26 1b 01 00 70 6c 6f 74 5f $(...(.................&...plot_
18280 4f 54 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 50 OT_2D_samples.ipynbPK..........P
182a0 4c be 4c 3c c9 39 9a d1 14 00 00 d1 14 00 00 1e 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 84 2b 01 L.L<.9........................+.
182c0 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 69 70 79 6e 62 50 .plot_otda_linear_mapping.ipynbP
182e0 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 52 4c be 4c 49 c5 7b 83 fa 16 00 00 fa 16 00 00 17 00 00 00 00 K..........RL.LI.{..............
18300 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 91 40 01 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 69 ..........@..plot_otda_mapping.i
18320 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 4f 4c be 4c e5 eb aa 89 7c 10 00 00 7c 10 00 00 pynbPK..........OL.L....|...|...
18340 16 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 c0 57 01 00 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6d 70 75 74 65 5f 65 ...............W..plot_compute_e
18360 6d 64 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 a7 6e a2 4c b3 d8 ae 69 5b 16 00 00 md.ipynbPK...........n.L...i[...
18380 5b 16 00 00 1c 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 70 68 01 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f [.................ph..plot_otda_
183a0 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 05 06 00 00 00 00 11 00 11 00 ad 04 color_images.ipynbPK............
183c0 00 00 05 7f 01 00 00 00 ........