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| 39c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 | .............],.p,.lambdast[i],. |
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| 3a20 | 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 5c 6e 5c 6e 43 | ....max_iter=100,.tol=1e-3)\n\nC |
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| 3ac0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 3ae0 | 20 20 20 5b 70 73 5b 31 5d 2c 20 70 73 5b 33 5d 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ...[ps[1],.ps[3]\n.............. |
| 3b00 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c | ..............................], |
| 3b20 | 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 | .p,.lambdast[i],.'square_loss',. |
| 3b40 | 20 23 20 35 65 2d 34 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | .#.5e-4,\n...................... |
| 3b60 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 | .....................max_iter=10 |
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| 3c20 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b 32 5d 2c 20 70 73 5b 33 | ....................[ps[2],.ps[3 |
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| 3c60 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d | ...............],.p,.lambdast[i] |
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| 56e0 | 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 | source":.[........."#%%.Example. |
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| 57c0 | 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 5c | n\npl.figure(4,.figsize=(5,.5))\ |
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| 58c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 58e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d | -------------\n\n".......].....} |
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| 5940 | 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 | ,......."metadata":.{........."c |
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| 5980 | 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b | "outputs":.[],......."source":.[ |
| 59a0 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 | ........."#%%.Example.with.Frobe |
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| 6480 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c | ------------\n\n".......].....}, |
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| 65e0 | 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 | _sinkhorn.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n# |
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| 6720 | 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 | s)\ntransp_Xs_lpl1.=.ot_lpl1.tra |
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| 67a0 | 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 | source":.[........."Fig.1.:.plot |
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| 6820 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
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| 6860 | 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 | ."cell_type":."code",......."exe |
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| 68a0 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 | data":.{........."collapsed":.fa |
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| 68e0 | 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e | ,......."source":.[........."pl. |
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| 6980 | 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 | ticks([])\npl.yticks([])\npl.leg |
| 69a0 | 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 | end(loc=0)\npl.title('Source..sa |
| 69c0 | 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e | mples')\n\npl.subplot(2,.2,.2)\n |
| 69e0 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 | pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c |
| 6a00 | 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 | =yt,.marker='o',.label='Target.s |
| 6a20 | 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 | amples')\npl.xticks([])\npl.ytic |
| 6a40 | 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 | ks([])\npl.legend(loc=0)\npl.tit |
| 6a60 | 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | le('Target.samples')\n\npl.subpl |
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| 6ac0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 74 72 | )\npl.yticks([])\npl.title('Matr |
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| 6b00 | 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 | ight_layout()".......].....},... |
| 6b20 | 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e | ..{......."cell_type":."markdown |
| 6b40 | 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ",......."metadata":.{},......." |
| 6b60 | 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 | source":.[........."Fig.2.:.plot |
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| 6ba0 | 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | erent.methods\n----------------- |
| 6bc0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 6be0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 | --------\n\n".......].....},.... |
| 6c00 | 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 | .{......."cell_type":."code",... |
| 6c20 | 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 | ...."execution_count":.null,.... |
| 6c40 | 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 | ..."metadata":.{........."collap |
| 6c60 | 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 | sed":.false.......},......."outp |
| 6c80 | 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 | uts":.[],......."source":.[..... |
| 6ca0 | 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 36 | ...."pl.figure(2,.figsize=(10,.6 |
| 6cc0 | 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d | ))\n\npl.subplot(2,.3,.1)\npl.im |
| 6ce0 | 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 | show(ot_emd.coupling_,.interpola |
| 6d00 | 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e | tion='nearest')\npl.xticks([])\n |
| 6d20 | 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c | pl.yticks([])\npl.title('Optimal |
| 6d40 | 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | .coupling\\nEMDTransport')\n\npl |
| 6d60 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f | .subplot(2,.3,.2)\npl.imshow(ot_ |
| 6d80 | 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f | sinkhorn.coupling_,.interpolatio |
| 6da0 | 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e | n='nearest')\npl.xticks([])\npl. |
| 6dc0 | 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f | yticks([])\npl.title('Optimal.co |
| 6de0 | 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e | upling\\nSinkhornTransport')\n\n |
| 6e00 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f | pl.subplot(2,.3,.3)\npl.imshow(o |
| 6e20 | 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d | t_lpl1.coupling_,.interpolation= |
| 6e40 | 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 | 'nearest')\npl.xticks([])\npl.yt |
| 6e60 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 | icks([])\npl.title('Optimal.coup |
| 6e80 | 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e | ling\\nSinkhornLpl1Transport')\n |
| 6ea0 | 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 | \npl.subplot(2,.3,.4)\not.plot.p |
| 6ec0 | 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 65 6d 64 | lot2D_samples_mat(Xs,.Xt,.ot_emd |
| 6ee0 | 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 | .coupling_,.c=[.5,..5,.1])\npl.s |
| 6f00 | 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c | catter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys, |
| 6f20 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c | .marker='+',.label='Source.sampl |
| 6f40 | 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c | es')\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:, |
| 6f60 | 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 | .1],.c=yt,.marker='o',.label='Ta |
| 6f80 | 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 | rget.samples')\npl.xticks([])\np |
| 6fa0 | 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 | l.yticks([])\npl.title('Main.cou |
| 6fc0 | 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 | pling.coefficients\\nEMDTranspor |
| 6fe0 | 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e 6f 74 2e 70 | t')\n\npl.subplot(2,.3,.5)\not.p |
| 7000 | 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f | lot.plot2D_samples_mat(Xs,.Xt,.o |
| 7020 | 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c | t_sinkhorn.coupling_,.c=[.5,..5, |
| 7040 | 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c | .1])\npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:, |
| 7060 | 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f | .1],.c=ys,.marker='+',.label='So |
| 7080 | 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c | urce.samples')\npl.scatter(Xt[:, |
| 70a0 | 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c | .0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o', |
| 70c0 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 | .label='Target.samples')\npl.xti |
| 70e0 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | cks([])\npl.yticks([])\npl.title |
| 7100 | 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 53 | ('Main.coupling.coefficients\\nS |
| 7120 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | inkhornTransport')\n\npl.subplot |
| 7140 | 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 | (2,.3,.6)\not.plot.plot2D_sample |
| 7160 | 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c | s_mat(Xs,.Xt,.ot_lpl1.coupling_, |
| 7180 | 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a | .c=[.5,..5,.1])\npl.scatter(Xs[: |
| 71a0 | 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 | ,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+' |
| 71c0 | 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 | ,.label='Source.samples')\npl.sc |
| 71e0 | 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 | atter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,. |
| 7200 | 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 | marker='o',.label='Target.sample |
| 7220 | 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | s')\npl.xticks([])\npl.yticks([] |
| 7240 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 | )\npl.title('Main.coupling.coeff |
| 7260 | 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 | icients\\nSinkhornLpl1Transport' |
| 7280 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 | )\npl.tight_layout()".......]... |
| 72a0 | 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d | ..},.....{......."cell_type":."m |
| 72c0 | 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a | arkdown",......."metadata":.{},. |
| 72e0 | 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 33 | ......"source":.[........."Fig.3 |
| 7300 | 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d | .:.plot.transported.samples\n--- |
| 7320 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c | -----------------------------\n\ |
| 7340 | 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 | n".......].....},.....{......."c |
| 7360 | 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 | ell_type":."code",......."execut |
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| 8620 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b | metadata":.{},......."source":.[ |
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| 86c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 | ----------------------\n\n"..... |
| 86e0 | 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 | ..].....},.....{......."cell_typ |
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| 87e0 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | :,.1],.c=ys,.marker='+',.label=' |
| 8800 | 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c | Source.samples')\npl.xticks([])\ |
| 8820 | 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 | npl.yticks([])\npl.legend(loc=0) |
| 8840 | 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c | \npl.title('Source..samples')\n\ |
| 8860 | 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 | npl.subplot(2,.2,.2)\npl.scatter |
| 8880 | 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 | (Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marke |
| 88a0 | 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e | r='o',.label='Target.samples')\n |
| 88c0 | 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c | pl.xticks([])\npl.yticks([])\npl |
| 88e0 | 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 | .legend(loc=0)\npl.title('Target |
| 8900 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 | .samples')\n\npl.subplot(2,.2,.3 |
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| 8940 | 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e | _,.interpolation='nearest')\npl. |
| 8960 | 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 | xticks([])\npl.yticks([])\npl.ti |
| 8980 | 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 75 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 | tle('Cost.matrix.-.unsupervised. |
| 89a0 | 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e | DA')\n\npl.subplot(2,.2,.4)\npl. |
| 89c0 | 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 63 6f 73 74 5f 2c 20 69 | imshow(ot_sinkhorn_semi.cost_,.i |
| 89e0 | 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 | nterpolation='nearest')\npl.xtic |
| 8a00 | 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | ks([])\npl.yticks([])\npl.title( |
| 8a20 | 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 73 65 6d 69 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 | 'Cost.matrix.-.semisupervised.DA |
| 8a40 | 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 68 65 | ')\n\npl.tight_layout()\n\n#.the |
| 8a60 | 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 69 6e 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 2d 73 75 | .optimal.coupling.in.the.semi-su |
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| 8aa0 | 20 73 68 61 70 65 5c 6e 23 20 73 69 6d 69 6c 61 72 5c 22 20 74 6f 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 | .shape\n#.similar\".to.the.cost. |
| 8ac0 | 6d 61 74 72 69 78 2c 20 28 62 6c 6f 63 6b 20 64 69 61 67 6f 6e 61 6c 20 6d 61 74 72 69 78 29 22 | matrix,.(block.diagonal.matrix)" |
| 8ae0 | 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c | .......].....},.....{......."cel |
| 8b00 | 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | l_type":."markdown",......."meta |
| 8b20 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 | data":.{},......."source":.[.... |
| 8b40 | 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 | ....."Fig.2.:.plots.optimal.coup |
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| 8b80 | 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | n------------------------------- |
| 8ba0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a | --------------------------\n\n". |
| 8bc0 | 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c | ......].....},.....{......."cell |
| 8be0 | 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e | _type":."code",......."execution |
| 8c00 | 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a | _count":.null,......."metadata": |
| 8c20 | 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 | .{........."collapsed":.false... |
| 8c40 | 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 | ....},......."outputs":.[],..... |
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| a640 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| a660 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ############\n################## |
| a680 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| a6a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 20 44 49 53 | ##########################\n.DIS |
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| a720 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 20 44 65 66 69 6e 65 20 32 20 | ------------------\n\n.Define.2. |
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| a780 | 63 65 5c 6e 20 61 6e 64 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 61 6e 64 | ce\n.and.the.target.measures.and |
| a7a0 | 20 66 69 6e 61 6c 6c 79 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 63 2e 5c 6e 5c 6e 22 | .finally.the.cost.matrix.c.\n\n" |
| a7c0 | 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c | .......].....},.....{......."cel |
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| a960 | 58 5f 73 6f 75 72 63 65 2c 20 59 5f 74 61 72 67 65 74 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 | X_source,.Y_target)".......].... |
| a980 | 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 | .},.....{......."cell_type":."ma |
| a9a0 | 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 | rkdown",......."metadata":.{},.. |
| a9c0 | 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 43 61 6c 6c 20 74 | ....."source":.[........."Call.t |
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| aa20 | 65 74 65 20 63 61 73 65 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ete.case\n---------------------- |
| aa40 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 44 65 66 69 6e | -----------------------\n\nDefin |
| aa60 | 65 20 74 68 65 20 6d 65 74 68 6f 64 20 5c 22 53 41 47 5c 22 2c 20 63 61 6c 6c 20 6f 74 2e 73 6f | e.the.method.\"SAG\",.call.ot.so |
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| aaa0 | 74 68 65 5c 6e 72 65 73 75 6c 74 73 2e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d | the\nresults.\n\n".......].....} |
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| ab00 | 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 | ,......."metadata":.{........."c |
| ab20 | 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 | ollapsed":.false.......},....... |
| ab40 | 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b | "outputs":.[],......."source":.[ |
| ab60 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 68 6f 64 20 3d 20 5c 22 53 41 47 5c 22 5c 6e 73 61 67 5f | ........."method.=.\"SAG\"\nsag_ |
| ab80 | 70 69 20 3d 20 6f 74 2e 73 74 6f 63 68 61 73 74 69 63 2e 73 6f 6c 76 65 5f 73 65 6d 69 5f 64 75 | pi.=.ot.stochastic.solve_semi_du |
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| abe0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 29 5c 6e | ...................numItermax)\n |
| ac00 | 70 72 69 6e 74 28 73 61 67 5f 70 69 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 | print(sag_pi)".......].....},... |
| ac20 | 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e | ..{......."cell_type":."markdown |
| ac40 | 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ",......."metadata":.{},......." |
| ac60 | 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 53 45 4d 49 43 4f 4e 54 49 4e 4f 55 | source":.[........."SEMICONTINOU |
| ac80 | 53 20 43 41 53 45 3a 5c 6e 5c 6e 53 61 6d 70 6c 65 20 6f 6e 65 20 67 65 6e 65 72 61 6c 20 6d 65 | S.CASE:\n\nSample.one.general.me |
| aca0 | 61 73 75 72 65 20 61 2c 20 6f 6e 65 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 62 | asure.a,.one.discrete.measures.b |
| acc0 | 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 63 6f 6e 74 69 6e 6f 75 73 5c 6e 63 61 73 65 5c 6e 2d 2d | .for.the.semicontinous\ncase\n-- |
| ace0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| ad00 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 44 65 66 69 6e 65 20 6f 6e 65 20 67 65 6e 65 72 61 | -----------\n\nDefine.one.genera |
| ad20 | 6c 20 6d 65 61 73 75 72 65 20 61 2c 20 6f 6e 65 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6d 65 61 73 75 72 | l.measure.a,.one.discrete.measur |
| ad40 | 65 73 20 62 2c 20 74 68 65 20 70 6f 69 6e 74 73 20 77 68 65 72 65 5c 6e 61 72 65 20 64 65 66 69 | es.b,.the.points.where\nare.defi |
| ad60 | 6e 65 64 20 74 68 65 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 6d 65 | ned.the.source.and.the.target.me |
| ad80 | 61 73 75 72 65 73 20 61 6e 64 20 66 69 6e 61 6c 6c 79 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 6d 61 74 72 | asures.and.finally.the.cost.matr |
| ada0 | 69 78 20 63 2e 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a | ix.c.\n\n".......].....},.....{. |
| adc0 | 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 | ......"cell_type":."code",...... |
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| ae00 | 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 | "metadata":.{........."collapsed |
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| d320 | 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 | utputs":.[],......."source":.[.. |
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| d3c0 | 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 5c | A.dot(weights)\n\n#.wasserstein\ |
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| d440 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 | .subplot(2,.1,.1)\nfor.i.in.rang |
| d460 | 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 | e(n_distributions):\n....pl.plot |
| d480 | 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 | (x,.A[:,.i])\npl.title('Distribu |
| d4a0 | 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e | tions')\n\npl.subplot(2,.1,.2)\n |
| d4c0 | 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | pl.plot(x,.bary_l2,.'r',.label=' |
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| d500 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 | .label='Wasserstein')\npl.legend |
| d520 | 28 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e | ()\npl.title('Barycenters')\npl. |
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| d560 | 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 | ...{......."cell_type":."markdow |
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| d5a0 | 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 42 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 | "source":.[........."Barycentric |
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| d5e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 | ---------\n\n".......].....},... |
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| d620 | 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 | ....."execution_count":.null,... |
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| d6a0 | 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 | ....."#%%.barycenter.interpolati |
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| d720 | 5c 6e 42 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 70 79 28 42 5f 6c 32 29 5c 6e 5c 6e 66 6f 72 20 | \nB_wass.=.np.copy(B_l2)\n\nfor. |
| d740 | 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 30 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 61 6c 70 | i.in.range(0,.n_alpha):\n....alp |
| d760 | 68 61 20 3d 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5b 69 5d 5c 6e 20 20 20 20 77 65 69 67 68 74 73 20 | ha.=.alpha_list[i]\n....weights. |
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| d7a0 | 20 20 20 20 42 5f 6c 32 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c | ....B_l2[:,.i].=.A.dot(weights)\ |
| d7c0 | 6e 20 20 20 20 42 5f 77 61 73 73 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 | n....B_wass[:,.i].=.ot.bregman.b |
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| d800 | 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 | n#%%.plot.interpolation\n\npl.fi |
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| e920 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 | ----------------------\n\n"..... |
| e940 | 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 | ..].....},.....{......."cell_typ |
| e960 | 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 | e":."code",......."execution_cou |
| e980 | 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 | nt":.null,......."metadata":.{.. |
| e9a0 | 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 | ......."collapsed":.false....... |
| e9c0 | 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 | },......."outputs":.[],......."s |
| e9e0 | 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 | ource":.[........."pl.figure(1,. |
| ea00 | 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 35 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 | figsize=(10,.5))\npl.subplot(1,. |
| ea20 | 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a | 2,.1)\npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[: |
| ea40 | 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 | ,.1],.c=ys,.marker='+',.label='S |
| ea60 | 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e | ource.samples')\npl.xticks([])\n |
| ea80 | 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c | pl.yticks([])\npl.legend(loc=0)\ |
| eaa0 | 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e | npl.title('Source..samples')\n\n |
| eac0 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 | pl.subplot(1,.2,.2)\npl.scatter( |
| eae0 | 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 | Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker |
| eb00 | 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 | ='o',.label='Target.samples')\np |
| eb20 | 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e | l.xticks([])\npl.yticks([])\npl. |
| eb40 | 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 | legend(loc=0)\npl.title('Target. |
| eb60 | 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 | samples')\npl.tight_layout()"... |
| eb80 | 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 | ....].....},.....{......."cell_t |
| eba0 | 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 | ype":."markdown",......."metadat |
| ebc0 | 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 | a":.{},......."source":.[....... |
| ebe0 | 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 | .."Fig.2.:.plot.optimal.coupling |
| ec00 | 73 20 61 6e 64 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d | s.and.transported.samples\n----- |
| ec20 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| ec40 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 | -----------------\n\n".......].. |
| ec60 | 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 | ...},.....{......."cell_type":." |
| ec80 | 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 | code",......."execution_count":. |
| eca0 | 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | null,......."metadata":.{....... |
| ecc0 | 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 | .."collapsed":.false.......},... |
| ece0 | 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 | ...."outputs":.[],......."source |
| ed00 | 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 20 3d 20 7b 27 69 6e 74 65 | ":.[........."param_img.=.{'inte |
| ed20 | 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 27 3a 20 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 7d 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 | rpolation':.'nearest'}\n\npl.fig |
| ed40 | 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 35 2c 20 38 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 | ure(2,.figsize=(15,.8))\npl.subp |
| ed60 | 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 | lot(2,.4,.1)\npl.imshow(ot_emd.c |
| ed80 | 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b | oupling_,.**param_img)\npl.xtick |
| eda0 | 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | s([])\npl.yticks([])\npl.title(' |
| edc0 | 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 | Optimal.coupling\\nEMDTransport' |
| ede0 | 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 | )\n\npl.subplot(2,.4,.2)\npl.ims |
| ee00 | 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 | how(ot_sinkhorn.coupling_,.**par |
| ee20 | 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b | am_img)\npl.xticks([])\npl.ytick |
| ee40 | 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e | s([])\npl.title('Optimal.couplin |
| ee60 | 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 | g\\nSinkhornTransport')\n\npl.su |
| ee80 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c | bplot(2,.4,.3)\npl.imshow(ot_lpl |
| eea0 | 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 | 1.coupling_,.**param_img)\npl.xt |
| eec0 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c | icks([])\npl.yticks([])\npl.titl |
| eee0 | 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 | e('Optimal.coupling\\nSinkhornLp |
| ef00 | 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 | l1Transport')\n\npl.subplot(2,.4 |
| ef20 | 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 | ,.4)\npl.imshow(ot_l1l2.coupling |
| ef40 | 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e | _,.**param_img)\npl.xticks([])\n |
| ef60 | 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c | pl.yticks([])\npl.title('Optimal |
| ef80 | 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f 72 | .coupling\\nSinkhornL1l2Transpor |
| efa0 | 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 | t')\n\npl.subplot(2,.4,.5)\npl.s |
| efc0 | 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c | catter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt, |
| efe0 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | .marker='o',\n...........label=' |
| f000 | 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e | Target.samples',.alpha=0.3)\npl. |
| f020 | 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 | scatter(transp_Xs_emd[:,.0],.tra |
| f040 | 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 | nsp_Xs_emd[:,.1],.c=ys,\n....... |
| f060 | 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 | ....marker='+',.label='Transp.sa |
| f080 | 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c | mples',.s=30)\npl.xticks([])\npl |
| f0a0 | 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 | .yticks([])\npl.title('Transport |
| f0c0 | 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e | ed.samples\\nEmdTransport')\npl. |
| f0e0 | 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 5c 22 6c 6f 77 65 72 20 6c 65 66 74 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | legend(loc=\"lower.left\")\n\npl |
| f100 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 36 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 | .subplot(2,.4,.6)\npl.scatter(Xt |
| f120 | 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 | [:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker=' |
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| 119c0 | 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 | pl.ylabel('Blue')\npl.title('Ima |
| 119e0 | 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 | ge.1')\n\npl.subplot(1,.2,.2)\np |
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| 11a40 | 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c | label('Red')\npl.ylabel('Blue')\ |
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| 14c00 | 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 | ution_count":.null,......."metad |
| 14c20 | 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c | ata":.{........."collapsed":.fal |
| 14c40 | 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c | se.......},......."outputs":.[], |
| 14c60 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 41 75 | ......."source":.[........."#.Au |
| 14c80 | 74 68 6f 72 3a 20 54 69 74 6f 75 61 6e 20 56 61 79 65 72 20 3c 74 69 74 6f 75 61 6e 2e 76 61 79 | thor:.Titouan.Vayer.<titouan.vay |
| 14ca0 | 65 72 40 69 72 69 73 61 2e 66 72 3e 5c 6e 23 5c 6e 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 | er@irisa.fr>\n#\n#.License:.MIT. |
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| 14d20 | 72 6b 78 20 61 73 20 6e 78 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 68 5c 6e 66 72 6f 6d 20 73 63 69 | rkx.as.nx\nimport.math\nfrom.sci |
| 14d40 | 70 79 2e 73 70 61 72 73 65 2e 63 73 67 72 61 70 68 20 69 6d 70 6f 72 74 20 73 68 6f 72 74 65 73 | py.sparse.csgraph.import.shortes |
| 14d60 | 74 5f 70 61 74 68 5c 6e 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 63 6f 6c 6f 72 73 | t_path\nimport.matplotlib.colors |
| 14d80 | 20 61 73 20 6d 63 6f 6c 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6d 70 6f 72 74 | .as.mcol\nfrom.matplotlib.import |
| 14da0 | 20 63 6d 5c 6e 66 72 6f 6d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 20 69 6d 70 6f 72 74 20 66 67 77 5f 62 | .cm\nfrom.ot.gromov.import.fgw_b |
| 14dc0 | 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 5c 6e 23 25 25 20 47 72 61 70 68 20 66 75 6e 63 74 69 6f 6e 73 5c | arycenters\n#%%.Graph.functions\ |
| 14de0 | 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 66 69 6e 64 5f 74 68 72 65 73 68 28 43 2c 20 69 6e 66 3d 30 2e 35 2c | n\n\ndef.find_thresh(C,.inf=0.5, |
| 14e00 | 20 73 75 70 3d 33 2c 20 73 74 65 70 3d 31 30 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 20 54 72 | .sup=3,.step=10):\n....\"\"\".Tr |
| 14e20 | 69 63 6b 20 74 6f 20 66 69 6e 64 20 74 68 65 20 61 64 65 71 75 61 74 65 20 74 68 72 65 73 68 6f | ick.to.find.the.adequate.thresho |
| 14e40 | 6c 64 73 20 66 72 6f 6d 20 77 68 65 72 65 20 76 61 6c 75 65 20 6f 66 20 74 68 65 20 43 20 6d 61 | lds.from.where.value.of.the.C.ma |
| 14e60 | 74 72 69 78 20 61 72 65 20 63 6f 6e 73 69 64 65 72 65 64 20 63 6c 6f 73 65 20 65 6e 6f 75 67 68 | trix.are.considered.close.enough |
| 14e80 | 20 74 6f 20 73 61 79 20 74 68 61 74 20 6e 6f 64 65 73 20 61 72 65 20 63 6f 6e 6e 65 63 74 65 64 | .to.say.that.nodes.are.connected |
| 14ea0 | 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 54 74 68 65 20 74 68 72 65 73 68 6f 6c 64 20 69 73 20 66 6f 75 6e | \n........Tthe.threshold.is.foun |
| 14ec0 | 64 20 62 79 20 61 20 6c 69 6e 65 73 65 61 72 63 68 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 76 61 6c 75 65 73 | d.by.a.linesearch.between.values |
| 14ee0 | 20 5c 22 69 6e 66 5c 22 20 61 6e 64 20 5c 22 73 75 70 5c 22 20 77 69 74 68 20 5c 22 73 74 65 70 | .\"inf\".and.\"sup\".with.\"step |
| 14f00 | 5c 22 20 74 68 72 65 73 68 6f 6c 64 73 20 74 65 73 74 65 64 2e 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 54 | \".thresholds.tested.\n........T |
| 14f20 | 68 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 68 72 65 73 68 6f 6c 64 20 69 73 20 74 68 65 20 6f 6e 65 20 | he.optimal.threshold.is.the.one. |
| 14f40 | 77 68 69 63 68 20 6d 69 6e 69 6d 69 7a 65 73 20 74 68 65 20 72 65 63 6f 6e 73 74 72 75 63 74 69 | which.minimizes.the.reconstructi |
| 14f60 | 6f 6e 20 65 72 72 6f 72 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 74 68 65 20 73 68 6f 72 74 65 73 74 5f 70 61 | on.error.between.the.shortest_pa |
| 14f80 | 74 68 20 6d 61 74 72 69 78 20 63 6f 6d 69 6e 67 20 66 72 6f 6d 20 74 68 65 20 74 68 72 65 73 68 | th.matrix.coming.from.the.thresh |
| 14fa0 | 6f 6c 64 65 64 20 61 64 6a 65 6e 63 79 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 61 6e | olded.adjency.matrix\n........an |
| 14fc0 | 64 20 74 68 65 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 6d 61 74 72 69 78 2e 5c 6e 20 20 20 20 50 61 72 61 | d.the.original.matrix.\n....Para |
| 14fe0 | 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 20 20 20 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 20 20 20 20 43 20 3a 20 | meters\n....----------\n....C.:. |
| 15000 | 6e 64 61 72 72 61 79 2c 20 73 68 61 70 65 20 28 6e 5f 6e 6f 64 65 73 2c 6e 5f 6e 6f 64 65 73 29 | ndarray,.shape.(n_nodes,n_nodes) |
| 15020 | 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 73 74 72 75 63 74 75 72 65 20 6d 61 74 72 | \n............The.structure.matr |
| 15040 | 69 78 20 74 6f 20 74 68 72 65 73 68 6f 6c 64 5c 6e 20 20 20 20 69 6e 66 20 3a 20 66 6c 6f 61 74 | ix.to.threshold\n....inf.:.float |
| 15060 | 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 62 65 67 69 6e 6e 69 6e 67 20 6f 66 20 74 68 65 | \n..........The.beginning.of.the |
| 15080 | 20 6c 69 6e 65 73 65 61 72 63 68 5c 6e 20 20 20 20 73 75 70 20 3a 20 66 6c 6f 61 74 5c 6e 20 20 | .linesearch\n....sup.:.float\n.. |
| 150a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 65 6e 64 20 6f 66 20 74 68 65 20 6c 69 6e 65 73 65 61 72 63 | ........The.end.of.the.linesearc |
| 150c0 | 68 5c 6e 20 20 20 20 73 74 65 70 20 3a 20 69 6e 74 65 67 65 72 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | h\n....step.:.integer\n......... |
| 150e0 | 20 20 20 4e 75 6d 62 65 72 20 6f 66 20 74 68 72 65 73 68 6f 6c 64 73 20 74 65 73 74 65 64 5c 6e | ...Number.of.thresholds.tested\n |
| 15100 | 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 64 69 73 74 20 3d 20 5b 5d 5c 6e 20 20 20 20 73 | ....\"\"\"\n....dist.=.[]\n....s |
| 15120 | 65 61 72 63 68 20 3d 20 6e 70 2e 6c 69 6e 73 70 61 63 65 28 69 6e 66 2c 20 73 75 70 2c 20 73 74 | earch.=.np.linspace(inf,.sup,.st |
| 15140 | 65 70 29 5c 6e 20 20 20 20 66 6f 72 20 74 68 72 65 73 68 20 69 6e 20 73 65 61 72 63 68 3a 5c 6e | ep)\n....for.thresh.in.search:\n |
| 15160 | 20 20 20 20 20 20 20 20 43 70 72 69 6d 65 20 3d 20 73 70 5f 74 6f 5f 61 64 6a 65 6e 63 79 28 43 | ........Cprime.=.sp_to_adjency(C |
| 15180 | 2c 20 30 2c 20 74 68 72 65 73 68 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 53 43 20 3d 20 73 68 6f 72 74 | ,.0,.thresh)\n........SC.=.short |
| 151a0 | 65 73 74 5f 70 61 74 68 28 43 70 72 69 6d 65 2c 20 6d 65 74 68 6f 64 3d 27 44 27 29 5c 6e 20 20 | est_path(Cprime,.method='D')\n.. |
| 151c0 | 20 20 20 20 20 20 53 43 5b 53 43 20 3d 3d 20 66 6c 6f 61 74 28 27 69 6e 66 27 29 5d 20 3d 20 31 | ......SC[SC.==.float('inf')].=.1 |
| 151e0 | 30 30 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 64 69 73 74 2e 61 70 70 65 6e 64 28 6e 70 2e 6c 69 6e 61 6c | 00\n........dist.append(np.linal |
| 15200 | 67 2e 6e 6f 72 6d 28 53 43 20 2d 20 43 29 29 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 73 65 61 72 | g.norm(SC.-.C))\n....return.sear |
| 15220 | 63 68 5b 6e 70 2e 61 72 67 6d 69 6e 28 64 69 73 74 29 5d 2c 20 64 69 73 74 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 | ch[np.argmin(dist)],.dist\n\n\nd |
| 15240 | 65 66 20 73 70 5f 74 6f 5f 61 64 6a 65 6e 63 79 28 43 2c 20 74 68 72 65 73 68 69 6e 66 3d 30 2e | ef.sp_to_adjency(C,.threshinf=0. |
| 15260 | 32 2c 20 74 68 72 65 73 68 73 75 70 3d 31 2e 38 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 20 54 | 2,.threshsup=1.8):\n....\"\"\".T |
| 15280 | 68 72 65 73 68 6f 6c 64 73 20 74 68 65 20 73 74 72 75 63 74 75 72 65 20 6d 61 74 72 69 78 20 69 | hresholds.the.structure.matrix.i |
| 152a0 | 6e 20 6f 72 64 65 72 20 74 6f 20 63 6f 6d 70 75 74 65 20 61 6e 20 61 64 6a 65 6e 63 79 20 6d 61 | n.order.to.compute.an.adjency.ma |
| 152c0 | 74 72 69 78 2e 5c 6e 20 20 20 20 41 6c 6c 20 76 61 6c 75 65 73 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 74 68 | trix.\n....All.values.between.th |
| 152e0 | 72 65 73 68 69 6e 66 20 61 6e 64 20 74 68 72 65 73 68 73 75 70 20 61 72 65 20 63 6f 6e 73 69 64 | reshinf.and.threshsup.are.consid |
| 15300 | 65 72 65 64 20 72 65 70 72 65 73 65 6e 74 69 6e 67 20 63 6f 6e 6e 65 63 74 65 64 20 6e 6f 64 65 | ered.representing.connected.node |
| 15320 | 73 20 61 6e 64 20 73 65 74 20 74 6f 20 31 2e 20 45 6c 73 65 20 61 72 65 20 73 65 74 20 74 6f 20 | s.and.set.to.1..Else.are.set.to. |
| 15340 | 30 5c 6e 20 20 20 20 50 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 20 20 20 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | 0\n....Parameters\n....--------- |
| 15360 | 2d 5c 6e 20 20 20 20 43 20 3a 20 6e 64 61 72 72 61 79 2c 20 73 68 61 70 65 20 28 6e 5f 6e 6f 64 | -\n....C.:.ndarray,.shape.(n_nod |
| 15380 | 65 73 2c 6e 5f 6e 6f 64 65 73 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 73 74 72 75 63 74 75 | es,n_nodes)\n........The.structu |
| 153a0 | 72 65 20 6d 61 74 72 69 78 20 74 6f 20 74 68 72 65 73 68 6f 6c 64 5c 6e 20 20 20 20 74 68 72 65 | re.matrix.to.threshold\n....thre |
| 153c0 | 73 68 69 6e 66 20 3a 20 66 6c 6f 61 74 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 6d 69 6e 69 6d | shinf.:.float\n........The.minim |
| 153e0 | 75 6d 20 76 61 6c 75 65 20 6f 66 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 20 66 72 6f 6d 20 77 68 69 63 68 20 | um.value.of.distance.from.which. |
| 15400 | 74 68 65 20 6e 65 77 20 76 61 6c 75 65 20 69 73 20 73 65 74 20 74 6f 20 31 5c 6e 20 20 20 20 74 | the.new.value.is.set.to.1\n....t |
| 15420 | 68 72 65 73 68 73 75 70 20 3a 20 66 6c 6f 61 74 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 6d 61 | hreshsup.:.float\n........The.ma |
| 15440 | 78 69 6d 75 6d 20 76 61 6c 75 65 20 6f 66 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 20 66 72 6f 6d 20 77 68 69 | ximum.value.of.distance.from.whi |
| 15460 | 63 68 20 74 68 65 20 6e 65 77 20 76 61 6c 75 65 20 69 73 20 73 65 74 20 74 6f 20 31 5c 6e 20 20 | ch.the.new.value.is.set.to.1\n.. |
| 15480 | 20 20 52 65 74 75 72 6e 73 5c 6e 20 20 20 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 20 20 20 20 43 20 3a 20 | ..Returns\n....-------\n....C.:. |
| 154a0 | 6e 64 61 72 72 61 79 2c 20 73 68 61 70 65 20 28 6e 5f 6e 6f 64 65 73 2c 6e 5f 6e 6f 64 65 73 29 | ndarray,.shape.(n_nodes,n_nodes) |
| 154c0 | 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 74 68 72 65 73 68 6f 6c 64 20 6d 61 74 72 69 78 2e 20 | \n........The.threshold.matrix.. |
| 154e0 | 45 61 63 68 20 65 6c 65 6d 65 6e 74 20 69 73 20 69 6e 20 7b 30 2c 31 7d 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 | Each.element.is.in.{0,1}\n....\" |
| 15500 | 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 48 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 5f 6c 69 6b 65 28 43 29 5c 6e | \"\"\n....H.=.np.zeros_like(C)\n |
| 15520 | 20 20 20 20 6e 70 2e 66 69 6c 6c 5f 64 69 61 67 6f 6e 61 6c 28 48 2c 20 6e 70 2e 64 69 61 67 6f | ....np.fill_diagonal(H,.np.diago |
| 15540 | 6e 61 6c 28 43 29 29 5c 6e 20 20 20 20 43 20 3d 20 43 20 2d 20 48 5c 6e 20 20 20 20 43 20 3d 20 | nal(C))\n....C.=.C.-.H\n....C.=. |
| 15560 | 6e 70 2e 6d 69 6e 69 6d 75 6d 28 6e 70 2e 6d 61 78 69 6d 75 6d 28 43 2c 20 74 68 72 65 73 68 69 | np.minimum(np.maximum(C,.threshi |
| 15580 | 6e 66 29 2c 20 74 68 72 65 73 68 73 75 70 29 5c 6e 20 20 20 20 43 5b 43 20 3d 3d 20 74 68 72 65 | nf),.threshsup)\n....C[C.==.thre |
| 155a0 | 73 68 73 75 70 5d 20 3d 20 30 5c 6e 20 20 20 20 43 5b 43 20 21 3d 20 30 5d 20 3d 20 31 5c 6e 5c | shsup].=.0\n....C[C.!=.0].=.1\n\ |
| 155c0 | 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 43 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 62 75 69 6c 64 5f 6e 6f 69 | n....return.C\n\n\ndef.build_noi |
| 155e0 | 73 79 5f 63 69 72 63 75 6c 61 72 5f 67 72 61 70 68 28 4e 3d 32 30 2c 20 6d 75 3d 30 2c 20 73 69 | sy_circular_graph(N=20,.mu=0,.si |
| 15600 | 67 6d 61 3d 30 2e 33 2c 20 77 69 74 68 5f 6e 6f 69 73 65 3d 46 61 6c 73 65 2c 20 73 74 72 75 63 | gma=0.3,.with_noise=False,.struc |
| 15620 | 74 75 72 65 5f 6e 6f 69 73 65 3d 46 61 6c 73 65 2c 20 70 3d 4e 6f 6e 65 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 | ture_noise=False,.p=None):\n.... |
| 15640 | 5c 22 5c 22 5c 22 20 43 72 65 61 74 65 20 61 20 6e 6f 69 73 79 20 63 69 72 63 75 6c 61 72 20 67 | \"\"\".Create.a.noisy.circular.g |
| 15660 | 72 61 70 68 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 67 20 3d 20 6e 78 2e 47 72 61 | raph\n....\"\"\"\n....g.=.nx.Gra |
| 15680 | 70 68 28 29 5c 6e 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 6e 6f 64 65 73 5f 66 72 6f 6d 28 6c 69 73 74 28 | ph()\n....g.add_nodes_from(list( |
| 156a0 | 72 61 6e 67 65 28 4e 29 29 29 5c 6e 20 20 20 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 4e | range(N)))\n....for.i.in.range(N |
| 156c0 | 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 6f 69 73 65 20 3d 20 66 6c 6f 61 74 28 6e 70 2e 72 61 6e | ):\n........noise.=.float(np.ran |
| 156e0 | 64 6f 6d 2e 6e 6f 72 6d 61 6c 28 6d 75 2c 20 73 69 67 6d 61 2c 20 31 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 | dom.normal(mu,.sigma,.1))\n..... |
| 15700 | 20 20 20 69 66 20 77 69 74 68 5f 6e 6f 69 73 65 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 67 | ...if.with_noise:\n............g |
| 15720 | 2e 61 64 64 5f 6e 6f 64 65 28 69 2c 20 61 74 74 72 5f 6e 61 6d 65 3d 6d 61 74 68 2e 73 69 6e 28 | .add_node(i,.attr_name=math.sin( |
| 15740 | 28 32 20 2a 20 69 20 2a 20 6d 61 74 68 2e 70 69 20 2f 20 4e 29 29 20 2b 20 6e 6f 69 73 65 29 5c | (2.*.i.*.math.pi./.N)).+.noise)\ |
| 15760 | 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 | n........else:\n............g.ad |
| 15780 | 64 5f 6e 6f 64 65 28 69 2c 20 61 74 74 72 5f 6e 61 6d 65 3d 6d 61 74 68 2e 73 69 6e 28 32 20 2a | d_node(i,.attr_name=math.sin(2.* |
| 157a0 | 20 69 20 2a 20 6d 61 74 68 2e 70 69 20 2f 20 4e 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 | .i.*.math.pi./.N))\n........g.ad |
| 157c0 | 64 5f 65 64 67 65 28 69 2c 20 69 20 2b 20 31 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 73 74 72 | d_edge(i,.i.+.1)\n........if.str |
| 157e0 | 75 63 74 75 72 65 5f 6e 6f 69 73 65 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 72 61 6e 64 6f | ucture_noise:\n............rando |
| 15800 | 6d 69 6e 74 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 30 2c 20 70 29 5c 6e | mint.=.np.random.randint(0,.p)\n |
| 15820 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 72 61 6e 64 6f 6d 69 6e 74 20 3d 3d 20 30 3a 5c 6e | ............if.randomint.==.0:\n |
| 15840 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 69 20 3c 3d 20 4e 20 2d 20 33 3a 5c 6e | ................if.i.<=.N.-.3:\n |
| 15860 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 65 64 67 65 28 69 | ....................g.add_edge(i |
| 15880 | 2c 20 69 20 2b 20 32 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 69 20 3d | ,.i.+.2)\n................if.i.= |
| 158a0 | 3d 20 4e 20 2d 20 32 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e | =.N.-.2:\n....................g. |
| 158c0 | 61 64 64 5f 65 64 67 65 28 69 2c 20 30 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | add_edge(i,.0)\n................ |
| 158e0 | 69 66 20 69 20 3d 3d 20 4e 20 2d 20 31 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | if.i.==.N.-.1:\n................ |
| 15900 | 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 65 64 67 65 28 69 2c 20 31 29 5c 6e 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f | ....g.add_edge(i,.1)\n....g.add_ |
| 15920 | 65 64 67 65 28 4e 2c 20 30 29 5c 6e 20 20 20 20 6e 6f 69 73 65 20 3d 20 66 6c 6f 61 74 28 6e 70 | edge(N,.0)\n....noise.=.float(np |
| 15940 | 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 6e 6f 72 6d 61 6c 28 6d 75 2c 20 73 69 67 6d 61 2c 20 31 29 29 5c 6e 20 | .random.normal(mu,.sigma,.1))\n. |
| 15960 | 20 20 20 69 66 20 77 69 74 68 5f 6e 6f 69 73 65 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 | ...if.with_noise:\n........g.add |
| 15980 | 5f 6e 6f 64 65 28 4e 2c 20 61 74 74 72 5f 6e 61 6d 65 3d 6d 61 74 68 2e 73 69 6e 28 28 32 20 2a | _node(N,.attr_name=math.sin((2.* |
| 159a0 | 20 4e 20 2a 20 6d 61 74 68 2e 70 69 20 2f 20 4e 29 29 20 2b 20 6e 6f 69 73 65 29 5c 6e 20 20 20 | .N.*.math.pi./.N)).+.noise)\n... |
| 159c0 | 20 65 6c 73 65 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 6e 6f 64 65 28 4e 2c 20 61 74 | .else:\n........g.add_node(N,.at |
| 159e0 | 74 72 5f 6e 61 6d 65 3d 6d 61 74 68 2e 73 69 6e 28 32 20 2a 20 4e 20 2a 20 6d 61 74 68 2e 70 69 | tr_name=math.sin(2.*.N.*.math.pi |
| 15a00 | 20 2f 20 4e 29 29 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 67 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 67 72 | ./.N))\n....return.g\n\n\ndef.gr |
| 15a20 | 61 70 68 5f 63 6f 6c 6f 72 73 28 6e 78 5f 67 72 61 70 68 2c 20 76 6d 69 6e 3d 30 2c 20 76 6d 61 | aph_colors(nx_graph,.vmin=0,.vma |
| 15a40 | 78 3d 37 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 63 6e 6f 72 6d 20 3d 20 6d 63 6f 6c 2e 4e 6f 72 6d 61 6c 69 7a | x=7):\n....cnorm.=.mcol.Normaliz |
| 15a60 | 65 28 76 6d 69 6e 3d 76 6d 69 6e 2c 20 76 6d 61 78 3d 76 6d 61 78 29 5c 6e 20 20 20 20 63 70 69 | e(vmin=vmin,.vmax=vmax)\n....cpi |
| 15a80 | 63 6b 20 3d 20 63 6d 2e 53 63 61 6c 61 72 4d 61 70 70 61 62 6c 65 28 6e 6f 72 6d 3d 63 6e 6f 72 | ck.=.cm.ScalarMappable(norm=cnor |
| 15aa0 | 6d 2c 20 63 6d 61 70 3d 27 76 69 72 69 64 69 73 27 29 5c 6e 20 20 20 20 63 70 69 63 6b 2e 73 65 | m,.cmap='viridis')\n....cpick.se |
| 15ac0 | 74 5f 61 72 72 61 79 28 5b 5d 29 5c 6e 20 20 20 20 76 61 6c 5f 6d 61 70 20 3d 20 7b 7d 5c 6e 20 | t_array([])\n....val_map.=.{}\n. |
| 15ae0 | 20 20 20 66 6f 72 20 6b 2c 20 76 20 69 6e 20 6e 78 2e 67 65 74 5f 6e 6f 64 65 5f 61 74 74 72 69 | ...for.k,.v.in.nx.get_node_attri |
| 15b00 | 62 75 74 65 73 28 6e 78 5f 67 72 61 70 68 2c 20 27 61 74 74 72 5f 6e 61 6d 65 27 29 2e 69 74 65 | butes(nx_graph,.'attr_name').ite |
| 15b20 | 6d 73 28 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 76 61 6c 5f 6d 61 70 5b 6b 5d 20 3d 20 63 70 69 63 | ms():\n........val_map[k].=.cpic |
| 15b40 | 6b 2e 74 6f 5f 72 67 62 61 28 76 29 5c 6e 20 20 20 20 63 6f 6c 6f 72 73 20 3d 20 5b 5d 5c 6e 20 | k.to_rgba(v)\n....colors.=.[]\n. |
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| 15b80 | 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 63 6f 6c 6f 72 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 76 61 6c 5f 6d 61 70 5b | \n........colors.append(val_map[ |
| 15ba0 | 6e 6f 64 65 5d 29 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 63 6f 6c 6f 72 73 22 0a 20 20 20 20 20 | node])\n....return.colors"...... |
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| 15be0 | 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a | ":."markdown",......."metadata": |
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| 16d80 | 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 | .{......."cell_type":."code",... |
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| 16fc0 | 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 70 20 3d 20 | M2.max()\n\n#.loss.matrix\nMp.=. |
| 16fe0 | 6e 70 2e 73 71 72 74 28 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 | np.sqrt(ot.dist(xs,.xt,.metric=' |
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| 17020 | 23 20 44 61 74 61 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c | #.Data\npl.figure(1,.figsize=(7, |
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| 171c0 | 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 75 61 | ation='nearest')\npl.title('Squa |
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| 17200 | 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 70 2c 20 69 6e 74 65 72 | ot(1,.3,.3)\npl.imshow(Mp,.inter |
| 17220 | 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 | polation='nearest')\npl.title('S |
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| 17260 | 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 | ayout()".......].....},.....{... |
| 17280 | 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 | ...."cell_type":."markdown",.... |
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| 17320 | 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 | .{......."cell_type":."code",... |
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| 17360 | 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 | ..."metadata":.{........."collap |
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| 173c0 | 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e 47 31 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 | ...."#%%.EMD\nG1.=.ot.emd(a,.b,. |
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| 18d40 | 6f 6e 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 64 69 73 74 30 28 6e 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 | on\nM.=.ot.utils.dist0(n)\nM./=. |
| 18d60 | 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 | M.max()\n\n\n#%%.plot.the.distri |
| 18d80 | 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d | butions\n\npl.figure(1,.figsize= |
| 18da0 | 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 | (6.4,.3))\nfor.i.in.range(n_dist |
| 18dc0 | 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c | ributions):\n....pl.plot(x,.A[:, |
| 18de0 | 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c | .i])\npl.title('Distributions')\ |
| 18e00 | 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 | npl.tight_layout()\n\n#%%.baryce |
| 18e20 | 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 61 6c 70 68 61 20 3d 20 30 2e 35 20 | nter.computation\n\nalpha.=.0.5. |
| 18e40 | 20 23 20 30 3c 3d 61 6c 70 68 61 3c 3d 31 5c 6e 77 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 | .#.0<=alpha<=1\nweights.=.np.arr |
| 18e60 | 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 32 62 61 | ay([1.-.alpha,.alpha])\n\n#.l2ba |
| 18e80 | 72 79 5c 6e 62 61 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e | ry\nbary_l2.=.A.dot(weights)\n\n |
| 18ea0 | 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 6f 74 2e 74 69 | #.wasserstein\nreg.=.1e-3\not.ti |
| 18ec0 | 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 | c()\nbary_wass.=.ot.bregman.bary |
| 18ee0 | 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 6f 74 2e 74 | center(A,.M,.reg,.weights)\not.t |
| 18f00 | 6f 63 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 20 3d | oc()\n\n\not.tic()\nbary_wass2.= |
| 18f20 | 20 6f 74 2e 6c 70 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 2c | .ot.lp.barycenter(A,.M,.weights, |
| 18f40 | 20 73 6f 6c 76 65 72 3d 27 69 6e 74 65 72 69 6f 72 2d 70 6f 69 6e 74 27 2c 20 76 65 72 62 6f 73 | .solver='interior-point',.verbos |
| 18f60 | 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 | e=True)\not.toc()\n\npl.figure(2 |
| 18f80 | 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 | )\npl.clf()\npl.subplot(2,.1,.1) |
| 18fa0 | 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 | \nfor.i.in.range(n_distributions |
| 18fc0 | 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e | ):\n....pl.plot(x,.A[:,.i])\npl. |
| 18fe0 | 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 | title('Distributions')\n\npl.sub |
| 19000 | 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c | plot(2,.1,.2)\npl.plot(x,.bary_l |
| 19020 | 32 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 | 2,.'r',.label='l2')\npl.plot(x,. |
| 19040 | 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 52 65 67 20 57 61 73 73 65 | bary_wass,.'g',.label='Reg.Wasse |
| 19060 | 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 2c | rstein')\npl.plot(x,.bary_wass2, |
| 19080 | 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 50 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 | .'b',.label='LP.Wasserstein')\np |
| 190a0 | 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 | l.legend()\npl.title('Barycenter |
| 190c0 | 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 72 6f 62 6c 65 | s')\npl.tight_layout()\n\nproble |
| 190e0 | 6d 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 5b 41 2c 20 5b 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 | ms.append([A,.[bary_l2,.bary_was |
| 19100 | 73 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 5d 5d 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c | s,.bary_wass2]])".......].....}, |
| 19120 | 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 | .....{......."cell_type":."markd |
| 19140 | 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 | own",......."metadata":.{},..... |
| 19160 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 44 69 72 61 63 20 44 61 74 | .."source":.[........."Dirac.Dat |
| 19180 | 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d | a\n----------\n\n".......].....} |
| 191a0 | 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 | ,.....{......."cell_type":."code |
| 191c0 | 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c | ",......."execution_count":.null |
| 191e0 | 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 | ,......."metadata":.{........."c |
| 19200 | 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 | ollapsed":.false.......},....... |
| 19220 | 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b | "outputs":.[],......."source":.[ |
| 19240 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 61 31 20 3d | ........."#%%.parameters\n\na1.= |
| 19260 | 20 31 2e 30 20 2a 20 28 78 20 3e 20 31 30 29 20 2a 20 28 78 20 3c 20 35 30 29 5c 6e 61 32 20 3d | .1.0.*.(x.>.10).*.(x.<.50)\na2.= |
| 19280 | 20 31 2e 30 20 2a 20 28 78 20 3e 20 36 30 29 20 2a 20 28 78 20 3c 20 38 30 29 5c 6e 5c 6e 61 31 | .1.0.*.(x.>.60).*.(x.<.80)\n\na1 |
| 192a0 | 20 2f 3d 20 61 31 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e 61 32 20 2f 3d 20 61 32 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e 5c 6e | ./=.a1.sum()\na2./=.a2.sum()\n\n |
| 192c0 | 23 20 63 72 65 61 74 69 6e 67 20 6d 61 74 72 69 78 20 41 20 63 6f 6e 74 61 69 6e 69 6e 67 20 61 | #.creating.matrix.A.containing.a |
| 192e0 | 6c 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 41 20 3d 20 6e 70 2e 76 73 74 61 63 6b 28 | ll.distributions\nA.=.np.vstack( |
| 19300 | 28 61 31 2c 20 61 32 29 29 2e 54 5c 6e 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 3d 20 41 | (a1,.a2)).T\nn_distributions.=.A |
| 19320 | 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 20 2b 20 6e 6f 72 | .shape[1]\n\n#.loss.matrix.+.nor |
| 19340 | 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 64 69 73 74 30 28 6e | malization\nM.=.ot.utils.dist0(n |
| 19360 | 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 | )\nM./=.M.max()\n\n\n#%%.plot.th |
| 19380 | 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 | e.distributions\n\npl.figure(1,. |
| 193a0 | 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 | figsize=(6.4,.3))\nfor.i.in.rang |
| 193c0 | 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 | e(n_distributions):\n....pl.plot |
| 193e0 | 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 | (x,.A[:,.i])\npl.title('Distribu |
| 19400 | 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e | tions')\npl.tight_layout()\n\n\n |
| 19420 | 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 61 6c | #%%.barycenter.computation\n\nal |
| 19440 | 70 68 61 20 3d 20 30 2e 35 20 20 23 20 30 3c 3d 61 6c 70 68 61 3c 3d 31 5c 6e 77 65 69 67 68 74 | pha.=.0.5..#.0<=alpha<=1\nweight |
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| 19480 | 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 32 62 61 72 79 5c 6e 62 61 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 | \n\n#.l2bary\nbary_l2.=.A.dot(we |
| 194a0 | 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 | ights)\n\n#.wasserstein\nreg.=.1 |
| 194c0 | 65 2d 33 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 | e-3\not.tic()\nbary_wass.=.ot.br |
| 194e0 | 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 | egman.barycenter(A,.M,.reg,.weig |
| 19500 | 68 74 73 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 5c 6e 62 61 | hts)\not.toc()\n\n\not.tic()\nba |
| 19520 | 72 79 5f 77 61 73 73 32 20 3d 20 6f 74 2e 6c 70 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d | ry_wass2.=.ot.lp.barycenter(A,.M |
| 19540 | 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 2c 20 73 6f 6c 76 65 72 3d 27 69 6e 74 65 72 69 6f 72 2d 70 6f 69 6e | ,.weights,.solver='interior-poin |
| 19560 | 74 27 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 5c 6e 5c 6e 5c | t',.verbose=True)\not.toc()\n\n\ |
| 19580 | 6e 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 5b 41 2c 20 5b 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 62 | nproblems.append([A,.[bary_l2,.b |
| 195a0 | 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 | ary_wass,.bary_wass2]])\n\npl.fi |
| 195c0 | 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | gure(2)\npl.clf()\npl.subplot(2, |
| 195e0 | 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 | .1,.1)\nfor.i.in.range(n_distrib |
| 19600 | 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d | utions):\n....pl.plot(x,.A[:,.i] |
| 19620 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e | )\npl.title('Distributions')\n\n |
| 19640 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 | pl.subplot(2,.1,.2)\npl.plot(x,. |
| 19660 | 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c | bary_l2,.'r',.label='l2')\npl.pl |
| 19680 | 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 52 65 67 | ot(x,.bary_wass,.'g',.label='Reg |
| 196a0 | 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f | .Wasserstein')\npl.plot(x,.bary_ |
| 196c0 | 77 61 73 73 32 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 50 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 | wass2,.'b',.label='LP.Wasserstei |
| 196e0 | 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 | n')\npl.legend()\npl.title('Bary |
| 19700 | 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e | centers')\npl.tight_layout()\n\n |
| 19720 | 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 61 31 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 | #%%.parameters\n\na1.=.np.zeros( |
| 19740 | 6e 29 5c 6e 61 32 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 6e 29 5c 6e 5c 6e 61 31 5b 31 30 5d 20 3d | n)\na2.=.np.zeros(n)\n\na1[10].= |
| 19760 | 20 2e 32 35 5c 6e 61 31 5b 32 30 5d 20 3d 20 2e 35 5c 6e 61 31 5b 33 30 5d 20 3d 20 2e 32 35 5c | ..25\na1[20].=..5\na1[30].=..25\ |
| 19780 | 6e 61 32 5b 38 30 5d 20 3d 20 31 5c 6e 5c 6e 5c 6e 61 31 20 2f 3d 20 61 31 2e 73 75 6d 28 29 5c | na2[80].=.1\n\n\na1./=.a1.sum()\ |
| 197a0 | 6e 61 32 20 2f 3d 20 61 32 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 63 72 65 61 74 69 6e 67 20 6d 61 | na2./=.a2.sum()\n\n#.creating.ma |
| 197c0 | 74 72 69 78 20 41 20 63 6f 6e 74 61 69 6e 69 6e 67 20 61 6c 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 | trix.A.containing.all.distributi |
| 197e0 | 6f 6e 73 5c 6e 41 20 3d 20 6e 70 2e 76 73 74 61 63 6b 28 28 61 31 2c 20 61 32 29 29 2e 54 5c 6e | ons\nA.=.np.vstack((a1,.a2)).T\n |
| 19800 | 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 3d 20 41 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 5c 6e 5c 6e | n_distributions.=.A.shape[1]\n\n |
| 19820 | 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 20 2b 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 4d | #.loss.matrix.+.normalization\nM |
| 19840 | 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 64 69 73 74 30 28 6e 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 | .=.ot.utils.dist0(n)\nM./=.M.max |
| 19860 | 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f | ()\n\n\n#%%.plot.the.distributio |
| 19880 | 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c | ns\n\npl.figure(1,.figsize=(6.4, |
| 198a0 | 20 33 29 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 | .3))\nfor.i.in.range(n_distribut |
| 198c0 | 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c | ions):\n....pl.plot(x,.A[:,.i])\ |
| 198e0 | 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 | npl.title('Distributions')\npl.t |
| 19900 | 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 | ight_layout()\n\n\n#%%.barycente |
| 19920 | 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 61 6c 70 68 61 20 3d 20 30 2e 35 20 20 23 20 | r.computation\n\nalpha.=.0.5..#. |
| 19940 | 30 3c 3d 61 6c 70 68 61 3c 3d 31 5c 6e 77 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 | 0<=alpha<=1\nweights.=.np.array( |
| 19960 | 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 32 62 61 72 79 5c | [1.-.alpha,.alpha])\n\n#.l2bary\ |
| 19980 | 6e 62 61 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 77 | nbary_l2.=.A.dot(weights)\n\n#.w |
| 199a0 | 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 | asserstein\nreg.=.1e-3\not.tic() |
| 199c0 | 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e | \nbary_wass.=.ot.bregman.barycen |
| 199e0 | 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 | ter(A,.M,.reg,.weights)\not.toc( |
| 19a00 | 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 20 3d 20 6f 74 | )\n\n\not.tic()\nbary_wass2.=.ot |
| 19a20 | 2e 6c 70 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 2c 20 73 6f | .lp.barycenter(A,.M,.weights,.so |
| 19a40 | 6c 76 65 72 3d 27 69 6e 74 65 72 69 6f 72 2d 70 6f 69 6e 74 27 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 | lver='interior-point',.verbose=T |
| 19a60 | 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 2e 61 70 70 | rue)\not.toc()\n\n\nproblems.app |
| 19a80 | 65 6e 64 28 5b 41 2c 20 5b 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 62 61 72 | end([A,.[bary_l2,.bary_wass,.bar |
| 19aa0 | 79 5f 77 61 73 73 32 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 | y_wass2]])\n\npl.figure(2)\npl.c |
| 19ac0 | 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 | lf()\npl.subplot(2,.1,.1)\nfor.i |
| 19ae0 | 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 | .in.range(n_distributions):\n... |
| 19b00 | 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | .pl.plot(x,.A[:,.i])\npl.title(' |
| 19b20 | 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | Distributions')\n\npl.subplot(2, |
| 19b40 | 20 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c | .1,.2)\npl.plot(x,.bary_l2,.'r', |
| 19b60 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 | .label='l2')\npl.plot(x,.bary_wa |
| 19b80 | 73 73 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 52 65 67 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 | ss,.'g',.label='Reg.Wasserstein' |
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| 19be0 | 64 28 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 70 6c | d()\npl.title('Barycenters')\npl |
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| 19c20 | 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f | ....{......."cell_type":."markdo |
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| 19c60 | 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 6e 61 6c 20 66 69 67 75 | ."source":.[........."Final.figu |
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| 19ca0 | 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 | ....},.....{......."cell_type":. |
| 19cc0 | 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a | "code",......."execution_count": |
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| 1d6e0 | 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 | ping_linear.=.ot.da.MappingTrans |
| 1d700 | 70 6f 72 74 28 5c 6e 20 20 20 20 6b 65 72 6e 65 6c 3d 5c 22 6c 69 6e 65 61 72 5c 22 2c 20 6d 75 | port(\n....kernel=\"linear\",.mu |
| 1d720 | 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 38 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 5c 6e 20 20 20 20 | =1e0,.eta=1e-8,.bias=True,\n.... |
| 1d740 | 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 6f 74 | max_iter=20,.verbose=True)\n\not |
| 1d760 | 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 | _mapping_linear.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt |
| 1d780 | 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c | )\n\n#.for.original.source.sampl |
| 1d7a0 | 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 | es,.transform.applies.barycentri |
| 1d7c0 | 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 | c.mapping\ntransp_Xs_linear.=.ot |
| 1d7e0 | 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 | _mapping_linear.transform(Xs=Xs) |
| 1d800 | 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c | \n\n#.for.out.of.source.samples, |
| 1d820 | 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 74 68 65 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 | .transform.applies.the.linear.ma |
| 1d840 | 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 | pping\ntransp_Xs_linear_new.=.ot |
| 1d860 | 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f | _mapping_linear.transform(Xs=Xs_ |
| 1d880 | 6e 65 77 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 | new)\n\n\n#.MappingTransport.wit |
| 1d8a0 | 68 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 6b 65 72 6e 65 6c 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 | h.gaussian.kernel\not_mapping_ga |
| 1d8c0 | 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 | ussian.=.ot.da.MappingTransport( |
| 1d8e0 | 5c 6e 20 20 20 20 6b 65 72 6e 65 6c 3d 5c 22 67 61 75 73 73 69 61 6e 5c 22 2c 20 65 74 61 3d 31 | \n....kernel=\"gaussian\",.eta=1 |
| 1d900 | 65 2d 35 2c 20 6d 75 3d 31 65 2d 31 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 20 73 69 67 6d 61 3d 31 | e-5,.mu=1e-1,.bias=True,.sigma=1 |
| 1d920 | 2c 5c 6e 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 | ,\n....max_iter=10,.verbose=True |
| 1d940 | 29 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 | )\not_mapping_gaussian.fit(Xs=Xs |
| 1d960 | 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 72 63 | ,.Xt=Xt)\n\n#.for.original.sourc |
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| 1d9c0 | 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 | sian.=.ot_mapping_gaussian.trans |
| 1d9e0 | 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 6f 75 72 | form(Xs=Xs)\n\n#.for.out.of.sour |
| 1da00 | 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 74 68 | ce.samples,.transform.applies.th |
| 1da20 | 65 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 | e.gaussian.mapping\ntransp_Xs_ga |
| 1da40 | 75 73 73 69 61 6e 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e | ussian_new.=.ot_mapping_gaussian |
| 1da60 | 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 77 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 | .transform(Xs=Xs_new)".......].. |
| 1da80 | 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 | ...},.....{......."cell_type":." |
| 1daa0 | 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c | markdown",......."metadata":.{}, |
| 1dac0 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 | ......."source":.[........."Plot |
| 1dae0 | 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .transported.samples\n---------- |
| 1db00 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 | --------------\n\n".......]..... |
| 1db20 | 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 | },.....{......."cell_type":."cod |
| 1db40 | 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c | e",......."execution_count":.nul |
| 1db60 | 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 | l,......."metadata":.{........." |
| 1db80 | 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 | collapsed":.false.......},...... |
| 1dba0 | 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 | ."outputs":.[],......."source":. |
| 1dbc0 | 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 | [........."pl.figure(2)\npl.clf( |
| 1dbe0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 | )\npl.subplot(2,.2,.1)\npl.scatt |
| 1dc00 | 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 | er(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.mar |
| 1dc20 | 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 | ker='o',\n...........label='Targ |
| 1dc40 | 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 | et.samples',.alpha=.2)\npl.scatt |
| 1dc60 | 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 | er(transp_Xs_linear[:,.0],.trans |
| 1dc80 | 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d | p_Xs_linear[:,.1],.c=ys,.marker= |
| 1dca0 | 27 2b 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4d 61 70 70 65 64 20 73 | '+',\n...........label='Mapped.s |
| 1dcc0 | 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 42 61 72 79 | ource.samples')\npl.title(\"Bary |
| 1dce0 | 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 5c 22 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 | ..mapping.(linear)\")\npl.legend |
| 1dd00 | 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e | (loc=0)\n\npl.subplot(2,.2,.2)\n |
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| 1dd40 | 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 | =yt,.marker='o',\n...........lab |
| 1dd60 | 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e | el='Target.samples',.alpha=.2)\n |
| 1dd80 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 5b | pl.scatter(transp_Xs_linear_new[ |
| 1dda0 | 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 31 | :,.0],.transp_Xs_linear_new[:,.1 |
| 1ddc0 | 5d 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c | ],\n...........c=ys,.marker='+', |
| 1dde0 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 65 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 | .label='Learned.mapping')\npl.ti |
| 1de00 | 74 6c 65 28 5c 22 45 73 74 69 6d 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 5c 22 29 | tle(\"Estim..mapping.(linear)\") |
| 1de20 | 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 | \n\npl.subplot(2,.2,.3)\npl.scat |
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| 1de60 | 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 | rker='o',\n...........label='Tar |
| 1de80 | 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 | get.samples',.alpha=.2)\npl.scat |
| 1dea0 | 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 | ter(transp_Xs_gaussian[:,.0],.tr |
| 1dec0 | 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 | ansp_Xs_gaussian[:,.1],.c=ys,\n. |
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| 1e760 | 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 | t.distributions\n\n\n#.bin.posit |
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| 1e7a0 | 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5c 6e 5c 6e 6c 73 74 5f 6d 20 3d 20 6e 70 2e 6c 69 6e 73 70 61 63 65 28 | float64)\n\nlst_m.=.np.linspace( |
| 1e7c0 | 32 30 2c 20 39 30 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 | 20,.90,.n_target)\n\n#.Gaussian. |
| 1e7e0 | 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 61 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 | distributions\na.=.gauss(n,.m=20 |
| 1e800 | 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 5c 6e 5c 6e 42 20 3d | ,.s=5)..#.m=.mean,.s=.std\n\nB.= |
| 1e820 | 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 29 29 5c 6e 5c 6e 66 6f 72 20 | .np.zeros((n,.n_target))\n\nfor. |
| 1e840 | 69 2c 20 6d 20 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 6c 73 74 5f 6d 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 42 | i,.m.in.enumerate(lst_m):\n....B |
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| 1e880 | 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 20 61 6e 64 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e | .loss.matrix.and.normalization\n |
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| 1e8c0 | 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e | .reshape((n,.1)),.'euclidean')\n |
| 1e8e0 | 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 | M./=.M.max()\nM2.=.ot.dist(x.res |
| 1e900 | 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c | hape((n,.1)),.x.reshape((n,.1)), |
| 1e920 | 20 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 22 | .'sqeuclidean')\nM2./=.M2.max()" |
| 1e940 | 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c | .......].....},.....{......."cel |
| 1e960 | 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | l_type":."markdown",......."meta |
| 1e980 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 | data":.{},......."source":.[.... |
| 1e9a0 | 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a | ....."Plot.data\n---------\n\n". |
| 1e9c0 | 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c | ......].....},.....{......."cell |
| 1e9e0 | 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e | _type":."code",......."execution |
| 1ea00 | 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a | _count":.null,......."metadata": |
| 1ea20 | 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 | .{........."collapsed":.false... |
| 1ea40 | 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 | ....},......."outputs":.[],..... |
| 1ea60 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 | .."source":.[........."#%%.plot. |
| 1ea80 | 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 | the.distributions\n\npl.figure(1 |
| 1eaa0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 | )\npl.subplot(2,.1,.1)\npl.plot( |
| 1eac0 | 78 2c 20 61 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 73 74 72 69 62 | x,.a,.'b',.label='Source.distrib |
| 1eae0 | 75 74 69 6f 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 73 74 72 69 | ution')\npl.title('Source.distri |
| 1eb00 | 62 75 74 69 6f 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 | bution')\npl.subplot(2,.1,.2)\np |
| 1eb20 | 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 42 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 | l.plot(x,.B,.label='Target.distr |
| 1eb40 | 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 64 69 73 | ibutions')\npl.title('Target.dis |
| 1eb60 | 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 | tributions')\npl.tight_layout()" |
| 1eb80 | 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c | .......].....},.....{......."cel |
| 1eba0 | 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | l_type":."markdown",......."meta |
| 1ebc0 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 | data":.{},......."source":.[.... |
| 1ebe0 | 20 20 20 20 20 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 45 4d 44 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 | ....."Compute.EMD.for.the.differ |
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| 1ec20 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 | ----------------\n\n".......]... |
| 1ec40 | 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 | ..},.....{......."cell_type":."c |
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| 1ec80 | 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 | ull,......."metadata":.{........ |
| 1eca0 | 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 | ."collapsed":.false.......},.... |
| 1ecc0 | 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 | ..."outputs":.[],......."source" |
| 1ece0 | 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 61 6e 64 20 70 6c 6f | :.[........."#%%.Compute.and.plo |
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| 1ed40 | 69 72 65 63 74 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 45 4d 44 5c 6e 64 5f 65 6d 64 32 | irect.computation.of.EMD\nd_emd2 |
| 1ed60 | 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 32 29 20 20 23 20 64 69 72 65 63 74 20 63 | .=.ot.emd2(a,.B,.M2)..#.direct.c |
| 1ed80 | 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 6c 6f 73 73 20 4d 32 5c 6e | omputation.of.EMD.with.loss.M2\n |
| 1eda0 | 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 6d 64 2c | \n\npl.figure(2)\npl.plot(d_emd, |
| 1edc0 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 | .label='Euclidean.EMD')\npl.plot |
| 1ede0 | 28 64 5f 65 6d 64 32 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 | (d_emd2,.label='Squared.Euclidea |
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| 1ee40 | 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f | ....{......."cell_type":."markdo |
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| 1ee80 | 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 53 69 | ."source":.[........."Compute.Si |
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| 1eee0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 | ----------\n\n".......].....},.. |
| 1ef00 | 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a | ...{......."cell_type":."code",. |
| 1ef20 | 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 | ......"execution_count":.null,.. |
| 1ef40 | 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c | ....."metadata":.{........."coll |
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