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| 3a60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 | #####################\n\n"...... |
| 3a80 | 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 | .],........"cell_type":."markdow |
| 3aa0 | 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c | n",........"metadata":.{}.....}, |
| 3ac0 | 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a | ......{......."execution_count": |
| 3ae0 | 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 | .null,........"cell_type":."code |
| 3b00 | 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 | ",........"source":.[........."p |
| 3b20 | 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 35 29 29 5c 6e 70 6c | l.figure(1,.figsize=(10,.5))\npl |
| 3b40 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 | .subplot(1,.2,.1)\npl.scatter(Xs |
| 3b60 | 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 | [:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker=' |
| 3b80 | 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e | +',.label='Source.samples')\npl. |
| 3ba0 | 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 | xticks([])\npl.yticks([])\npl.le |
| 3bc0 | 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 | gend(loc=0)\npl.title('Source..s |
| 3be0 | 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c | amples')\n\npl.subplot(1,.2,.2)\ |
| 3c00 | 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],. |
| 3c20 | 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 | c=yt,.marker='o',.label='Target. |
| 3c40 | 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 | samples')\npl.xticks([])\npl.yti |
| 3c60 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 | cks([])\npl.legend(loc=0)\npl.ti |
| 3c80 | 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f | tle('Target.samples')\npl.tight_ |
| 3ca0 | 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 | layout()".......],........"outpu |
| 3cc0 | 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 | ts":.[],........"metadata":.{... |
| 3ce0 | 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d | ......"collapsed":.false.......} |
| 3d00 | 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b | .....},......{......."source":.[ |
| 3d20 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 | ........."Fig.2.:.plot.optimal.c |
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| 3d60 | 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | \n############################## |
| 3d80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 3da0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 | ###############\n\n".......],... |
| 3dc0 | 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 | ....."cell_type":."markdown",... |
| 3de0 | 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 | ....."metadata":.{}.....},...... |
| 3e00 | 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c | {......."execution_count":.null, |
| 3e20 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 | ........"cell_type":."code",.... |
| 3e40 | 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 61 72 61 6d 5f 69 | ...."source":.[........."param_i |
| 3e60 | 6d 67 20 3d 20 7b 27 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 27 3a 20 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 | mg.=.{'interpolation':.'nearest' |
| 3e80 | 2c 20 27 63 6d 61 70 27 3a 20 27 73 70 65 63 74 72 61 6c 27 7d 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 | ,.'cmap':.'spectral'}\n\npl.figu |
| 3ea0 | 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 35 2c 20 38 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | re(2,.figsize=(15,.8))\npl.subpl |
| 3ec0 | 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f | ot(2,.4,.1)\npl.imshow(ot_emd.co |
| 3ee0 | 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 | upling_,.**param_img)\npl.xticks |
| 3f00 | 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f | ([])\npl.yticks([])\npl.title('O |
| 3f20 | 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 | ptimal.coupling\\nEMDTransport') |
| 3f40 | 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 | \n\npl.subplot(2,.4,.2)\npl.imsh |
| 3f60 | 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 | ow(ot_sinkhorn.coupling_,.**para |
| 3f80 | 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 | m_img)\npl.xticks([])\npl.yticks |
| 3fa0 | 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 | ([])\npl.title('Optimal.coupling |
| 3fc0 | 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 | \\nSinkhornTransport')\n\npl.sub |
| 3fe0 | 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 | plot(2,.4,.3)\npl.imshow(ot_lpl1 |
| 4000 | 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 | .coupling_,.**param_img)\npl.xti |
| 4020 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | cks([])\npl.yticks([])\npl.title |
| 4040 | 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c | ('Optimal.coupling\\nSinkhornLpl |
| 4060 | 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c | 1Transport')\n\npl.subplot(2,.4, |
| 4080 | 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f | .4)\npl.imshow(ot_l1l2.coupling_ |
| 40a0 | 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 | ,.**param_img)\npl.xticks([])\np |
| 40c0 | 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 | l.yticks([])\npl.title('Optimal. |
| 40e0 | 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 | coupling\\nSinkhornL1l2Transport |
| 4100 | 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 | ')\n\npl.subplot(2,.4,.5)\npl.sc |
| 4120 | 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 | atter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,. |
| 4140 | 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 | marker='o',\n...........label='T |
| 4160 | 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 | arget.samples',.alpha=0.3)\npl.s |
| 4180 | 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e | catter(transp_Xs_emd[:,.0],.tran |
| 41a0 | 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 | sp_Xs_emd[:,.1],.c=ys,\n........ |
| 41c0 | 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d | ...marker='+',.label='Transp.sam |
| 41e0 | 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e | ples',.s=30)\npl.xticks([])\npl. |
| 4200 | 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 | yticks([])\npl.title('Transporte |
| 4220 | 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c | d.samples\\nEmdTransport')\npl.l |
| 4240 | 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 5c 22 6c 6f 77 65 72 20 6c 65 66 74 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e | egend(loc=\"lower.left\")\n\npl. |
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| 6860 | 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 | t()\n\npl.show()".......],...... |
| 6880 | 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 | .."outputs":.[],........"metadat |
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| 68e0 | 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 44 61 74 61 73 65 74 20 32 20 3a 20 50 61 | urce":.[........."Dataset.2.:.Pa |
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| 6920 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
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| 6ac0 | 39 20 2f 20 28 6e 20 2b 20 32 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 29 5c 6e 5c 6e 78 73 20 3d | 9./.(n.+.2).*.2.*.np.pi)\n\nxs.= |
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| 6be0 | 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 5c 6e 4d 70 20 3d 20 6e 70 2e 73 71 72 74 28 6f 74 2e 64 69 73 | loss.matrix\nMp.=.np.sqrt(ot.dis |
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| 6c20 | 4d 70 20 2f 3d 20 4d 70 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 44 61 74 61 5c 6e 70 6c 2e 66 | Mp./=.Mp.max()\n\n\n#.Data\npl.f |
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| 6c60 | 28 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | ()\npl.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],. |
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| 6ca0 | 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c | l.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr', |
| 6cc0 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 | .label='Target.samples')\npl.axi |
| 6ce0 | 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 | s('equal')\npl.title('Source.and |
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| 6d20 | 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 2c 20 66 69 67 73 69 | ost.matrices\npl.figure(5,.figsi |
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| 6d60 | 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 31 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 | )\npl.imshow(M1,.interpolation=' |
| 6d80 | 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 | nearest')\npl.title('Euclidean.c |
| 6da0 | 6f 73 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c | ost')\n\npl.subplot(1,.3,.2)\npl |
| 6dc0 | 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 32 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 | .imshow(M2,.interpolation='neare |
| 6de0 | 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 | st')\npl.title('Squared.Euclidea |
| 6e00 | 6e 20 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 5c | n.cost')\n\npl.subplot(1,.3,.3)\ |
| 6e20 | 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 70 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 | npl.imshow(Mp,.interpolation='ne |
| 6e40 | 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 | arest')\npl.title('Sqrt.Euclidea |
| 6e60 | 6e 20 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 | n.cost')\npl.tight_layout()".... |
| 6e80 | 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 | ...],........"outputs":.[],..... |
| 6ea0 | 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 | ..."metadata":.{........."collap |
| 6ec0 | 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 | sed":.false.......}.....},...... |
| 6ee0 | 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 44 61 74 | {......."source":.[........."Dat |
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| 6f40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 6f60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | #########\n\n".......],........" |
| 6f80 | 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | cell_type":."markdown",........" |
| 6fa0 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 | metadata":.{}.....},......{..... |
| 6fc0 | 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 | .."execution_count":.null,...... |
| 6fe0 | 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 | .."cell_type":."code",........"s |
| 7000 | 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 4d 44 5c 6e 47 31 20 3d | ource":.[........."#%%.EMD\nG1.= |
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| 7060 | 6e 5c 6e 23 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 36 2c 20 66 | n\n#.OT.matrices\npl.figure(6,.f |
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| 70a0 | 33 2c 20 31 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 | 3,.1)\not.plot.plot2D_samples_ma |
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| 70e0 | 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 | .plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+b',. |
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| 7120 | 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c | (xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr',.label |
| 7140 | 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 | ='Target.samples')\npl.axis('equ |
| 7160 | 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 | al')\n#.pl.legend(loc=0)\npl.tit |
| 7180 | 6c 65 28 27 4f 54 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | le('OT.Euclidean')\n\npl.subplot |
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| 71c0 | 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 32 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 | s_mat(xs,.xt,.G2,.c=[.5,..5,.1]) |
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| 7260 | 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c | 'equal')\n#.pl.legend(loc=0)\npl |
| 7280 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e | .title('OT.squared.Euclidean')\n |
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| 72c0 | 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 70 2c 20 63 3d | lot2D_samples_mat(xs,.xt,.Gp,.c= |
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| 7340 | 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | .1],.'xr',.label='Target.samples |
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| 7380 | 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 72 74 20 45 75 63 6c | d(loc=0)\npl.title('OT.sqrt.Eucl |
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| 8680 | 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 | mage.2')\npl.tight_layout()".... |
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| 8700 | 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f | {......."source":.[........."Plo |
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| 8780 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 | ##########\n\n".......],........ |
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| 87c0 | 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 | "metadata":.{}.....},......{.... |
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| 8820 | 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c | source":.[........."pl.figure(2, |
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| 8860 | 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 | (1,.2,.1)\npl.scatter(Xs[:,.0],. |
| 8880 | 58 73 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 73 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 | Xs[:,.2],.c=Xs)\npl.axis([0,.1,. |
| 88a0 | 30 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 | 0,.1])\npl.xlabel('Red')\npl.yla |
| 88c0 | 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 | bel('Blue')\npl.title('Image.1') |
| 88e0 | 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 | \n\npl.subplot(1,.2,.2)\npl.scat |
| 8900 | 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 74 29 5c 6e 70 | ter(Xt[:,.0],.Xt[:,.2],.c=Xt)\np |
| 8920 | 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 | l.axis([0,.1,.0,.1])\npl.xlabel( |
| 8940 | 27 52 65 64 27 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 | 'Red')\npl.ylabel('Blue')\npl.ti |
| 8960 | 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 | tle('Image.2')\npl.tight_layout( |
| 8980 | 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d | )".......],........"outputs":.[] |
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| 89e0 | 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 | ......{......."source":.[....... |
| 8a00 | 20 20 22 50 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 65 64 20 69 6d 61 67 65 73 5c 6e 23 23 23 23 | .."Plot.transformed.images\n#### |
| 8a20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 8a40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 8a60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | #########\n\n".......],........" |
| 8a80 | 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | cell_type":."markdown",........" |
| 8aa0 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 | metadata":.{}.....},......{..... |
| 8ac0 | 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 | .."execution_count":.null,...... |
| 8ae0 | 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 | .."cell_type":."code",........"s |
| 8b00 | 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 | ource":.[........."pl.figure(2,. |
| 8b20 | 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 35 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 | figsize=(10,.5))\n\npl.subplot(2 |
| 8b40 | 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 | ,.3,.1)\npl.imshow(I1)\npl.axis( |
| 8b60 | 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e | 'off')\npl.title('Im..1')\n\npl. |
| 8b80 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 5c | subplot(2,.3,.4)\npl.imshow(I2)\ |
| 8ba0 | 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 32 | npl.axis('off')\npl.title('Im..2 |
| 8bc0 | 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d | ')\n\npl.subplot(2,.3,.2)\npl.im |
| 8be0 | 73 68 6f 77 28 49 6d 61 67 65 5f 65 6d 64 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c | show(Image_emd)\npl.axis('off')\ |
| 8c00 | 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e | npl.title('EmdTransport')\n\npl. |
| 8c20 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 67 | subplot(2,.3,.5)\npl.imshow(Imag |
| 8c40 | 65 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e | e_sinkhorn)\npl.axis('off')\npl. |
| 8c60 | 74 69 74 6c 65 28 27 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c | title('SinkhornTransport')\n\npl |
| 8c80 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 | .subplot(2,.3,.3)\npl.imshow(Ima |
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| a340 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | .title('Image.1')\n\npl.subplot( |
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| a380 | 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 | s('off')\npl.title('Image.1.Adap |
| a3a0 | 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 | t')\n\npl.subplot(2,.3,.3)\npl.i |
| a3c0 | 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 65 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e | mshow(I1te)\npl.axis('off')\npl. |
| a3e0 | 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 5c 6e 5c 6e | title('Image.1.Adapt.(reg)')\n\n |
| a400 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 | pl.subplot(2,.3,.4)\npl.imshow(I |
| a420 | 32 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d | 2)\npl.axis('off')\npl.title('Im |
| a440 | 61 67 65 20 32 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e | age.2')\n\npl.subplot(2,.3,.5)\n |
| a460 | 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e | pl.imshow(I2t)\npl.axis('off')\n |
| a480 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e | pl.title('Image.2.Adapt')\n\npl. |
| a4a0 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 65 | subplot(2,.3,.6)\npl.imshow(I2te |
| a4c0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 | )\npl.axis('off')\npl.title('Ima |
| a4e0 | 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 | ge.2.Adapt.(reg)')\npl.tight_lay |
| a500 | 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 | out()\n\npl.show()".......],.... |
| a520 | 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 | ...."outputs":.[],........"metad |
| a540 | 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c | ata":.{........."collapsed":.fal |
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| c760 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| c780 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c | ##################\n\n".......], |
| c7a0 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c | ........"cell_type":."markdown", |
| c7c0 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 | ........"metadata":.{}.....},... |
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| c800 | 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 | ll,........"cell_type":."code",. |
| c820 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 | ......."source":.[........."#%%. |
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| c8c0 | 3d 20 31 65 2d 31 5c 6e 5c 6e 47 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 63 67 28 61 2c 20 62 | =.1e-1\n\nGl2.=.ot.optim.cg(a,.b |
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| c900 | 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d | \npl.figure(3)\not.plot.plot1D_m |
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| c940 | 65 67 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a | eg')".......],........"outputs": |
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| c9a0 | 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 | .},......{......."source":.[.... |
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| ca00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| ca20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 | ###########################\n\n" |
| ca40 | 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d | .......],........"cell_type":."m |
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| ca80 | 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 | ....},......{......."execution_c |
| caa0 | 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a | ount":.null,........"cell_type": |
| cac0 | 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 | ."code",........"source":.[..... |
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| cb20 | 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 20 2a 20 6e 70 2e 6c 6f 67 28 47 29 29 5c 6e | ..return.np.sum(G.*.np.log(G))\n |
| cb40 | 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 6c 6f | \n\ndef.df(G):\n....return.np.lo |
| cb60 | 67 28 47 29 20 2b 20 31 2e 5c 6e 5c 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 5c 6e 47 65 20 | g(G).+.1.\n\n\nreg.=.1e-3\n\nGe. |
| cb80 | 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 66 2c 20 64 | =.ot.optim.cg(a,.b,.M,.reg,.f,.d |
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| cbc0 | 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 | .figsize=(5,.5))\not.plot.plot1D |
| cbe0 | 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 65 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 45 6e 74 72 6f 70 | _mat(a,.b,.Ge,.'OT.matrix.Entrop |
| cc00 | 2e 20 72 65 67 27 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 | ..reg')".......],........"output |
| cc20 | 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 | s":.[],........"metadata":.{.... |
| cc40 | 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a | ....."collapsed":.false.......}. |
| cc60 | 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a | ....},......{......."source":.[. |
| cc80 | 20 20 20 20 20 20 20 20 22 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 | ........"Solve.EMD.with.Frobeniu |
| cca0 | 73 20 6e 6f 72 6d 20 2b 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e | s.norm.+.entropic.regularization |
| ccc0 | 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | \n############################## |
| cce0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| cd00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 | ###############\n\n".......],... |
| cd20 | 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 | ....."cell_type":."markdown",... |
| cd40 | 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 | ....."metadata":.{}.....},...... |
| cd60 | 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c | {......."execution_count":.null, |
| cd80 | 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 | ........"cell_type":."code",.... |
| cda0 | 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 45 78 61 | ...."source":.[........."#%%.Exa |
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| cde0 | 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 67 63 67 5c 6e 5c 6e 5c | pic.regularization.with.gcg\n\n\ |
| ce00 | 6e 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 30 2e 35 20 2a 20 6e 70 2e | ndef.f(G):\n....return.0.5.*.np. |
| ce20 | 73 75 6d 28 47 2a 2a 32 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 72 | sum(G**2)\n\n\ndef.df(G):\n....r |
| ce40 | 65 74 75 72 6e 20 47 5c 6e 5c 6e 5c 6e 72 65 67 31 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 72 65 67 32 20 3d | eturn.G\n\n\nreg1.=.1e-3\nreg2.= |
| ce60 | 20 31 65 2d 31 5c 6e 5c 6e 47 65 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 67 63 67 28 61 2c 20 | .1e-1\n\nGel2.=.ot.optim.gcg(a,. |
| ce80 | 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 31 2c 20 72 65 67 32 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 | b,.M,.reg1,.reg2,.f,.df,.verbose |
| cea0 | 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 | =True)\n\npl.figure(5,.figsize=( |
| cec0 | 35 2c 20 35 29 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c | 5,.5))\not.plot.plot1D_mat(a,.b, |
| cee0 | 20 47 65 6c 32 2c 20 27 4f 54 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 2b 20 6d 61 74 72 69 78 20 46 72 6f | .Gel2,.'OT.entropic.+.matrix.Fro |
| cf00 | 62 2e 20 72 65 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 | b..reg')\npl.show()".......],... |
| cf20 | 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | ....."outputs":.[],........"meta |
| cf40 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 | data":.{........."collapsed":.fa |
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| d800 | 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 | ape((n,.1)),.x.reshape((n,.1)),. |
| d820 | 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 5c 6e 4d 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 22 0a | 'sqeuclidean')\nM2./=.M2.max()". |
| d840 | 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a | ......],........"outputs":.[],.. |
| d860 | 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c | ......"metadata":.{........."col |
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| d8a0 | 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 | ...{......."source":.[........." |
| d8c0 | 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | Plot.data\n##################### |
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| d900 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 | ########################\n\n"... |
| d920 | 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b | ....],........"cell_type":."mark |
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| d9a0 | 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 | ode",........"source":.[........ |
| d9c0 | 20 22 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e | ."#%%.plot.the.distributions\n\n |
| d9e0 | 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 | pl.figure(1)\npl.subplot(2,.1,.1 |
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| da40 | 75 72 63 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | urce.distribution')\npl.subplot( |
| da60 | 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 42 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 | 2,.1,.2)\npl.plot(x,.B,.label='T |
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| daa0 | 27 54 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 | 'Target.distributions')\npl.tigh |
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| dae0 | 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a | puts":.[],........"metadata":.{. |
| db00 | 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 | ........"collapsed":.false...... |
| db20 | 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a | .}.....},......{......."source": |
| db40 | 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 45 4d 44 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 | .[........."Compute.EMD.for.the. |
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| db80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| dba0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c | ###############################\ |
| dbc0 | 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 | n\n".......],........"cell_type" |
| dbe0 | 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a | :."markdown",........"metadata": |
| dc00 | 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 | .{}.....},......{......."executi |
| dc20 | 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 | on_count":.null,........"cell_ty |
| dc40 | 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a | pe":."code",........"source":.[. |
| dc60 | 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 61 6e 64 20 70 6c 6f 74 20 64 69 | ........"#%%.Compute.and.plot.di |
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| dd00 | 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 6c 6f 73 73 20 4d 32 5c 6e 5c 6e 5c 6e | tation.of.EMD.with.loss.M2\n\n\n |
| dd20 | 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 6d 64 2c 20 6c 61 62 | pl.figure(2)\npl.plot(d_emd,.lab |
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| dd60 | 6d 64 32 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d | md2,.label='Squared.Euclidean.EM |
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| dda0 | 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 | pl.legend()".......],........"ou |
| ddc0 | 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b | tputs":.[],........"metadata":.{ |
| dde0 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 | ........."collapsed":.false..... |
| de00 | 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 | ..}.....},......{......."source" |
| de20 | 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 66 6f | :.[........."Compute.Sinkhorn.fo |
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| de80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| dea0 | 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c | #####\n\n".......],........"cell |
| dec0 | 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | _type":."markdown",........"meta |
| dee0 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 | data":.{}.....},......{......."e |
| df00 | 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 | xecution_count":.null,........"c |
| df20 | 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 | ell_type":."code",........"sourc |
| df40 | 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 32 5c 6e | e":.[........."#%%\nreg.=.1e-2\n |
| df60 | 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 28 61 2c 20 42 2c 20 | d_sinkhorn.=.ot.sinkhorn2(a,.B,. |
| df80 | 4d 2c 20 72 65 67 29 5c 6e 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f | M,.reg)\nd_sinkhorn2.=.ot.sinkho |
| dfa0 | 72 6e 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 32 2c 20 72 65 67 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 | rn2(a,.B,.M2,.reg)\n\npl.figure( |
| dfc0 | 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 6d 64 2c 20 6c 61 62 | 2)\npl.clf()\npl.plot(d_emd,.lab |
| dfe0 | 65 6c 3d 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 | el='Euclidean.EMD')\npl.plot(d_e |
| e000 | 6d 64 32 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d | md2,.label='Squared.Euclidean.EM |
| e020 | 44 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 27 2b 27 2c 20 6c 61 | D')\npl.plot(d_sinkhorn,.'+',.la |
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| f9e0 | 45 4d 44 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d | EMD.Transport\not_emd.=.ot.da.EM |
| fa00 | 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 5c 6e 6f 74 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 | DTransport()\not_emd.fit(Xs=Xs,. |
| fa20 | 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 5c 6e | Xt=Xt)\n\n#.Sinkhorn.Transport\n |
| fa40 | 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e | ot_sinkhorn.=.ot.da.SinkhornTran |
| fa60 | 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 5c 6e 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 | sport(reg_e=1e-1)\not_sinkhorn.f |
| fa80 | 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 | it(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n#.Sinkhorn.T |
| faa0 | 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 | ransport.with.Group.lasso.regula |
| fac0 | 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 6f 74 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f | rization\not_lpl1.=.ot.da.Sinkho |
| fae0 | 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 2c 20 72 65 67 5f | rnLpl1Transport(reg_e=1e-1,.reg_ |
| fb00 | 63 6c 3d 31 65 30 29 5c 6e 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 79 73 3d 79 | cl=1e0)\not_lpl1.fit(Xs=Xs,.ys=y |
| fb20 | 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 73 6f 75 72 63 65 20 | s,.Xt=Xt)\n\n#.transport.source. |
| fb40 | 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6f 6e 74 6f 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 74 72 61 | samples.onto.target.samples\ntra |
| fb60 | 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 | nsp_Xs_emd.=.ot_emd.transform(Xs |
| fb80 | 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 | =Xs)\ntransp_Xs_sinkhorn.=.ot_si |
| fba0 | 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f | nkhorn.transform(Xs=Xs)\ntransp_ |
| fbc0 | 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 | Xs_lpl1.=.ot_lpl1.transform(Xs=X |
| fbe0 | 73 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b | s)".......],........"outputs":.[ |
| fc00 | 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 | ],........"metadata":.{......... |
| fc20 | 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d | "collapsed":.false.......}.....} |
| fc40 | 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 | ,......{......."source":.[...... |
| fc60 | 20 20 20 22 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 | ..."Fig.1.:.plots.source.and.tar |
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| fcc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| fce0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 | ########################\n\n"... |
| fd00 | 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b | ....],........"cell_type":."mark |
| fd20 | 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 | down",........"metadata":.{}.... |
| fd40 | 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e | .},......{......."execution_coun |
| fd60 | 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 | t":.null,........"cell_type":."c |
| fd80 | 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 | ode",........"source":.[........ |
| fda0 | 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 31 30 29 29 | ."pl.figure(1,.figsize=(10,.10)) |
| fdc0 | 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 | \npl.subplot(2,.2,.1)\npl.scatte |
| fde0 | 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b | r(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.mark |
| fe00 | 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c | er='+',.label='Source.samples')\ |
| fe20 | 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 | npl.xticks([])\npl.yticks([])\np |
| fe40 | 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 | l.legend(loc=0)\npl.title('Sourc |
| fe60 | 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c | e..samples')\n\npl.subplot(2,.2, |
| fe80 | 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 | .2)\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,. |
| fea0 | 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 | 1],.c=yt,.marker='o',.label='Tar |
| fec0 | 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c | get.samples')\npl.xticks([])\npl |
| fee0 | 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 | .yticks([])\npl.legend(loc=0)\np |
| ff00 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e | l.title('Target.samples')\n\npl. |
| ff20 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 | subplot(2,.2,.3)\npl.imshow(M,.i |
| ff40 | 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 | nterpolation='nearest')\npl.xtic |
| ff60 | 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | ks([])\npl.yticks([])\npl.title( |
| ff80 | 27 4d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 5c | 'Matrix.of.pairwise.distances')\ |
| ffa0 | 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 | npl.tight_layout()".......],.... |
| ffc0 | 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 | ...."outputs":.[],........"metad |
| ffe0 | 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c | ata":.{........."collapsed":.fal |
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| 10020 | 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 | source":.[........."Fig.2.:.plot |
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| 100a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e | ############################\n\n |
| 100c0 | 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 | ".......],........"cell_type":." |
| 100e0 | 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d | markdown",........"metadata":.{} |
| 10100 | 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f | .....},......{......."execution_ |
| 10120 | 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 | count":.null,........"cell_type" |
| 10140 | 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 | :."code",........"source":.[.... |
| 10160 | 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 | ....."pl.figure(2,.figsize=(10,. |
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| 10200 | 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 | l.coupling\\nEMDTransport')\n\np |
| 10220 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 | l.subplot(2,.3,.2)\npl.imshow(ot |
| 10240 | 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 | _sinkhorn.coupling_,.interpolati |
| 10260 | 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c | on='nearest')\npl.xticks([])\npl |
| 10280 | 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 | .yticks([])\npl.title('Optimal.c |
| 102a0 | 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c | oupling\\nSinkhornTransport')\n\ |
| 102c0 | 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 | npl.subplot(2,.3,.3)\npl.imshow( |
| 102e0 | 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e | ot_lpl1.coupling_,.interpolation |
| 10300 | 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 | ='nearest')\npl.xticks([])\npl.y |
| 10320 | 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 | ticks([])\npl.title('Optimal.cou |
| 10340 | 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c | pling\\nSinkhornLpl1Transport')\ |
| 10360 | 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e | n\npl.subplot(2,.3,.4)\not.plot. |
| 10380 | 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 65 6d | plot2D_samples_mat(Xs,.Xt,.ot_em |
| 103a0 | 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e | d.coupling_,.c=[.5,..5,.1])\npl. |
| 103c0 | 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 | scatter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys |
| 103e0 | 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 | ,.marker='+',.label='Source.samp |
| 10400 | 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a | les')\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[: |
| 10420 | 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 | ,.1],.c=yt,.marker='o',.label='T |
| 10440 | 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e | arget.samples')\npl.xticks([])\n |
| 10460 | 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f | pl.yticks([])\npl.title('Main.co |
| 10480 | 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f | upling.coefficients\\nEMDTranspo |
| 104a0 | 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e 6f 74 2e | rt')\n\npl.subplot(2,.3,.5)\not. |
| 104c0 | 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 | plot.plot2D_samples_mat(Xs,.Xt,. |
| 104e0 | 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 | ot_sinkhorn.coupling_,.c=[.5,..5 |
| 10500 | 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a | ,.1])\npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[: |
| 10520 | 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 | ,.1],.c=ys,.marker='+',.label='S |
| 10540 | 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a | ource.samples')\npl.scatter(Xt[: |
| 10560 | 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 | ,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o' |
| 10580 | 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 | ,.label='Target.samples')\npl.xt |
| 105a0 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c | icks([])\npl.yticks([])\npl.titl |
| 105c0 | 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e | e('Main.coupling.coefficients\\n |
| 105e0 | 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | SinkhornTransport')\n\npl.subplo |
| 10600 | 74 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c | t(2,.3,.6)\not.plot.plot2D_sampl |
| 10620 | 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f | es_mat(Xs,.Xt,.ot_lpl1.coupling_ |
| 10640 | 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b | ,.c=[.5,..5,.1])\npl.scatter(Xs[ |
| 10660 | 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b | :,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+ |
| 10680 | 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 | ',.label='Source.samples')\npl.s |
| 106a0 | 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c | catter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt, |
| 106c0 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c | .marker='o',.label='Target.sampl |
| 106e0 | 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b | es')\npl.xticks([])\npl.yticks([ |
| 10700 | 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 | ])\npl.title('Main.coupling.coef |
| 10720 | 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 | ficients\\nSinkhornLpl1Transport |
| 10740 | 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 | ')\npl.tight_layout()".......],. |
| 10760 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 | ......."outputs":.[],........"me |
| 10780 | 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 | tadata":.{........."collapsed":. |
| 107a0 | 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 | false.......}.....},......{..... |
| 107c0 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 33 20 3a 20 70 | .."source":.[........."Fig.3.:.p |
| 107e0 | 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 23 23 23 23 23 23 23 | lot.transported.samples\n####### |
| 10800 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 10820 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 10840 | 23 23 23 23 23 23 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c | ######\n\n".......],........"cel |
| 10860 | 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 | l_type":."markdown",........"met |
| 10880 | 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 7d 2c 20 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 | adata":.{}.....},......{......." |
| 108a0 | 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 | execution_count":.null,........" |
| 108c0 | 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 20 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 | cell_type":."code",........"sour |
| 108e0 | 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 64 69 73 70 6c 61 79 20 74 72 61 6e 73 70 | ce":.[........."#.display.transp |
| 10900 | 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 | orted.samples\npl.figure(4,.figs |
| 10920 | 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 34 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 | ize=(10,.4))\npl.subplot(1,.3,.1 |
| 10940 | 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d | )\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1] |
| 10960 | 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ,.c=yt,.marker='o',\n........... |
| 10980 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e | label='Target.samples',.alpha=0. |
| 109a0 | 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 | 5)\npl.scatter(transp_Xs_emd[:,. |
| 109c0 | 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e | 0],.transp_Xs_emd[:,.1],.c=ys,\n |
| 109e0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 | ...........marker='+',.label='Tr |
| 10a00 | 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | ansp.samples',.s=30)\npl.title(' |
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