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4660 | 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b 30 5d 2c 20 70 73 5b 32 5d 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | .......[ps[0],.ps[2]\n.......... |
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4b60 | 6e 70 6f 73 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 73 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 | npos.=.[smacof_mds(Cs[s],.2).for |
4b80 | 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 5c 6e 5c 6e 6e 70 6f 73 74 30 31 20 3d 20 5b 30 2c | .s.in.range(S)]\n\nnpost01.=.[0, |
4ba0 | 20 30 5d 5c 6e 6e 70 6f 73 74 30 31 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 74 30 31 5b | .0]\nnpost01.=.[smacof_mds(Ct01[ |
4bc0 | 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 5c 6e 6e 70 6f 73 74 | s],.2).for.s.in.range(2)]\nnpost |
4be0 | 30 31 20 3d 20 5b 63 6c 66 2e 66 69 74 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 6e 70 6f 73 74 30 31 5b | 01.=.[clf.fit_transform(npost01[ |
4c00 | 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 5c 6e 5c 6e 6e 70 6f 73 74 30 | s]).for.s.in.range(2)]\n\nnpost0 |
4c20 | 32 20 3d 20 5b 30 2c 20 30 5d 5c 6e 6e 70 6f 73 74 30 32 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 | 2.=.[0,.0]\nnpost02.=.[smacof_md |
4c40 | 73 28 43 74 30 32 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d | s(Ct02[s],.2).for.s.in.range(2)] |
4c60 | 5c 6e 6e 70 6f 73 74 30 32 20 3d 20 5b 63 6c 66 2e 66 69 74 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 6e | \nnpost02.=.[clf.fit_transform(n |
4c80 | 70 6f 73 74 30 32 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 5c 6e 5c | post02[s]).for.s.in.range(2)]\n\ |
4ca0 | 6e 6e 70 6f 73 74 31 33 20 3d 20 5b 30 2c 20 30 5d 5c 6e 6e 70 6f 73 74 31 33 20 3d 20 5b 73 6d | nnpost13.=.[0,.0]\nnpost13.=.[sm |
4cc0 | 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 74 31 33 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 | acof_mds(Ct13[s],.2).for.s.in.ra |
4ce0 | 6e 67 65 28 32 29 5d 5c 6e 6e 70 6f 73 74 31 33 20 3d 20 5b 63 6c 66 2e 66 69 74 5f 74 72 61 6e | nge(2)]\nnpost13.=.[clf.fit_tran |
4d00 | 73 66 6f 72 6d 28 6e 70 6f 73 74 31 33 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 | sform(npost13[s]).for.s.in.range |
4d20 | 28 32 29 5d 5c 6e 5c 6e 6e 70 6f 73 74 32 33 20 3d 20 5b 30 2c 20 30 5d 5c 6e 6e 70 6f 73 74 32 | (2)]\n\nnpost23.=.[0,.0]\nnpost2 |
4d40 | 33 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 74 32 33 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 | 3.=.[smacof_mds(Ct23[s],.2).for. |
4d60 | 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 5c 6e 6e 70 6f 73 74 32 33 20 3d 20 5b 63 6c 66 2e 66 | s.in.range(2)]\nnpost23.=.[clf.f |
4d80 | 69 74 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 6e 70 6f 73 74 32 33 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 | it_transform(npost23[s]).for.s.i |
4da0 | 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 5c 6e 5c 6e 5c 6e 66 69 67 20 3d 20 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 | n.range(2)]\n\n\nfig.=.pl.figure |
4dc0 | 28 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 31 30 29 29 5c 6e 5c 6e 61 78 31 20 3d 20 70 6c 2e 73 | (figsize=(10,.10))\n\nax1.=.pl.s |
4de0 | 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 30 2c 20 30 29 29 5c 6e 70 6c 2e | ubplot2grid((4,.4),.(0,.0))\npl. |
4e00 | 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c | xlim((-1,.1))\npl.ylim((-1,.1))\ |
4e20 | 6e 61 78 31 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 | nax1.scatter(npos[0][:,.0],.npos |
4e40 | 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 72 27 29 5c 6e 5c 6e 61 78 32 20 3d 20 70 | [0][:,.1],.color='r')\n\nax2.=.p |
4e60 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 30 2c 20 31 29 29 5c 6e | l.subplot2grid((4,.4),.(0,.1))\n |
4e80 | 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 | pl.xlim((-1,.1))\npl.ylim((-1,.1 |
4ea0 | 29 29 5c 6e 61 78 32 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 30 31 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d | ))\nax2.scatter(npost01[1][:,.0] |
4ec0 | 2c 20 6e 70 6f 73 74 30 31 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 5c 6e | ,.npost01[1][:,.1],.color='b')\n |
4ee0 | 5c 6e 61 78 33 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 | \nax3.=.pl.subplot2grid((4,.4),. |
4f00 | 28 30 2c 20 32 29 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c | (0,.2))\npl.xlim((-1,.1))\npl.yl |
4f20 | 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 61 78 33 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 30 31 | im((-1,.1))\nax3.scatter(npost01 |
4f40 | 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 30 31 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c | [0][:,.0],.npost01[0][:,.1],.col |
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4f80 | 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 30 2c 20 33 29 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 | ((4,.4),.(0,.3))\npl.xlim((-1,.1 |
4fa0 | 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 61 78 34 2e 73 63 61 74 74 65 | ))\npl.ylim((-1,.1))\nax4.scatte |
4fc0 | 72 28 6e 70 6f 73 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | r(npos[1][:,.0],.npos[1][:,.1],. |
4fe0 | 63 6f 6c 6f 72 3d 27 72 27 29 5c 6e 5c 6e 61 78 35 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 | color='r')\n\nax5.=.pl.subplot2g |
5000 | 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 31 2c 20 30 29 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 | rid((4,.4),.(1,.0))\npl.xlim((-1 |
5020 | 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 61 78 35 2e 73 63 61 | ,.1))\npl.ylim((-1,.1))\nax5.sca |
5040 | 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 30 32 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 30 32 5b 31 | tter(npost02[1][:,.0],.npost02[1 |
5060 | 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 5c 6e 5c 6e 61 78 36 20 3d 20 70 6c 2e | ][:,.1],.color='b')\n\nax6.=.pl. |
5080 | 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 31 2c 20 33 29 29 5c 6e 70 6c | subplot2grid((4,.4),.(1,.3))\npl |
50a0 | 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 | .xlim((-1,.1))\npl.ylim((-1,.1)) |
50c0 | 5c 6e 61 78 36 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 31 33 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 | \nax6.scatter(npost13[1][:,.0],. |
50e0 | 6e 70 6f 73 74 31 33 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 5c 6e 5c 6e | npost13[1][:,.1],.color='b')\n\n |
5100 | 61 78 37 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 32 | ax7.=.pl.subplot2grid((4,.4),.(2 |
5120 | 2c 20 30 29 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 6d | ,.0))\npl.xlim((-1,.1))\npl.ylim |
5140 | 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 61 78 37 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 30 32 5b 30 | ((-1,.1))\nax7.scatter(npost02[0 |
5160 | 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 30 32 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 | ][:,.0],.npost02[0][:,.1],.color |
5180 | 3d 27 62 27 29 5c 6e 5c 6e 61 78 38 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 | ='b')\n\nax8.=.pl.subplot2grid(( |
51a0 | 34 2c 20 34 29 2c 20 28 32 2c 20 33 29 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 | 4,.4),.(2,.3))\npl.xlim((-1,.1)) |
51c0 | 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 61 78 38 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 | \npl.ylim((-1,.1))\nax8.scatter( |
51e0 | 6e 70 6f 73 74 31 33 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 31 33 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 | npost13[0][:,.0],.npost13[0][:,. |
5200 | 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 5c 6e 5c 6e 61 78 39 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | 1],.color='b')\n\nax9.=.pl.subpl |
5220 | 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 33 2c 20 30 29 29 5c 6e 70 6c 2e 78 6c 69 6d | ot2grid((4,.4),.(3,.0))\npl.xlim |
5240 | 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 61 78 39 | ((-1,.1))\npl.ylim((-1,.1))\nax9 |
5260 | 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 5b 32 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 5b 32 5d 5b | .scatter(npos[2][:,.0],.npos[2][ |
5280 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 72 27 29 5c 6e 5c 6e 61 78 31 30 20 3d 20 70 6c 2e 73 | :,.1],.color='r')\n\nax10.=.pl.s |
52a0 | 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 33 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e | ubplot2grid((4,.4),.(3,.1))\npl. |
52c0 | 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c 6e 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 5c | xlim((-1,.1))\npl.ylim((-1,.1))\ |
52e0 | 6e 61 78 31 30 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 32 33 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 | nax10.scatter(npost23[1][:,.0],. |
5300 | 6e 70 6f 73 74 32 33 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 5c 6e 5c 6e | npost23[1][:,.1],.color='b')\n\n |
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74e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
7500 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 | ---------------------\n\n"...... |
7520 | 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 | .].....},.....{......."cell_type |
7540 | 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e | ":."code",......."execution_coun |
7560 | 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 | t":.null,......."metadata":.{... |
7580 | 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d | ......"collapsed":.false.......} |
75a0 | 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f | ,......."outputs":.[],......."so |
75c0 | 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 | urce":.[........."pl.figure(1,.f |
75e0 | 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 31 30 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 | igsize=(10,.10))\npl.subplot(2,. |
7600 | 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a | 2,.1)\npl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[: |
7620 | 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 | ,.1],.c=ys,.marker='+',.label='S |
7640 | 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e | ource.samples')\npl.xticks([])\n |
7660 | 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c | pl.yticks([])\npl.legend(loc=0)\ |
7680 | 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e | npl.title('Source..samples')\n\n |
76a0 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 | pl.subplot(2,.2,.2)\npl.scatter( |
76c0 | 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 | Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker |
76e0 | 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 | ='o',.label='Target.samples')\np |
7700 | 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e | l.xticks([])\npl.yticks([])\npl. |
7720 | 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 | legend(loc=0)\npl.title('Target. |
7740 | 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 | samples')\n\npl.subplot(2,.2,.3) |
7760 | 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 | \npl.imshow(M,.interpolation='ne |
7780 | 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b | arest')\npl.xticks([])\npl.ytick |
77a0 | 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 | s([])\npl.title('Matrix.of.pairw |
77c0 | 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 | ise.distances')\npl.tight_layout |
77e0 | 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ()".......].....},.....{......." |
7800 | 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d | cell_type":."markdown",......."m |
7820 | 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a | etadata":.{},......."source":.[. |
7840 | 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 | ........"Fig.2.:.plots.optimal.c |
7860 | 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f | ouplings.for.the.different.metho |
7880 | 64 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ds\n---------------------------- |
78a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c | -----------------------------\n\ |
78c0 | 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 | n".......].....},.....{......."c |
78e0 | 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 | ell_type":."code",......."execut |
7900 | 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 | ion_count":.null,......."metadat |
7920 | 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 | a":.{........."collapsed":.false |
7940 | 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 | .......},......."outputs":.[],.. |
7960 | 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 | ....."source":.[........."pl.fig |
7980 | 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 36 29 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 | ure(2,.figsize=(10,.6))\n\npl.su |
79a0 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 | bplot(2,.3,.1)\npl.imshow(ot_emd |
79c0 | 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 | .coupling_,.interpolation='neare |
79e0 | 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b | st')\npl.xticks([])\npl.yticks([ |
7a00 | 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c | ])\npl.title('Optimal.coupling\\ |
7a20 | 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | nEMDTransport')\n\npl.subplot(2, |
7a40 | 20 33 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f | .3,.2)\npl.imshow(ot_sinkhorn.co |
7a60 | 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 | upling_,.interpolation='nearest' |
7a80 | 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c | )\npl.xticks([])\npl.yticks([])\ |
7aa0 | 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 | npl.title('Optimal.coupling\\nSi |
7ac0 | 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | nkhornTransport')\n\npl.subplot( |
7ae0 | 32 2c 20 33 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 | 2,.3,.3)\npl.imshow(ot_lpl1.coup |
7b00 | 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c | ling_,.interpolation='nearest')\ |
7b20 | 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 | npl.xticks([])\npl.yticks([])\np |
7b40 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b | l.title('Optimal.coupling\\nSink |
7b60 | 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | hornLpl1Transport')\n\npl.subplo |
7b80 | 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c | t(2,.3,.4)\not.plot.plot2D_sampl |
7ba0 | 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c | es_mat(Xs,.Xt,.ot_emd.coupling_, |
7bc0 | 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a | .c=[.5,..5,.1])\npl.scatter(Xs[: |
7be0 | 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 | ,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+' |
7c00 | 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 | ,.label='Source.samples')\npl.sc |
7c20 | 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 | atter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,. |
7c40 | 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 | marker='o',.label='Target.sample |
7c60 | 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | s')\npl.xticks([])\npl.yticks([] |
7c80 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 | )\npl.title('Main.coupling.coeff |
7ca0 | 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 | icients\\nEMDTransport')\n\npl.s |
7cc0 | 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f | ubplot(2,.3,.5)\not.plot.plot2D_ |
7ce0 | 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e | samples_mat(Xs,.Xt,.ot_sinkhorn. |
7d00 | 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 | coupling_,.c=[.5,..5,.1])\npl.sc |
7d20 | 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 | atter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,. |
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7dc0 | 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 | .yticks([])\npl.title('Main.coup |
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7ea0 | 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c | urce.samples')\npl.scatter(Xt[:, |
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7ee0 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 | .label='Target.samples')\npl.xti |
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7f20 | 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 5c 6e 53 | ('Main.coupling.coefficients\\nS |
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7f80 | 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 | ......"cell_type":."markdown",.. |
7fa0 | 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 | ....."metadata":.{},......."sour |
7fc0 | 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 33 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 74 72 61 | ce":.[........."Fig.3.:.plot.tra |
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82a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c | .........label='Target.samples', |
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95a0 | 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 | ])\npl.yticks([])\npl.legend(loc |
95c0 | 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c | =0)\npl.title('Target.samples')\ |
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9640 | 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d | npl.yticks([])\npl.title('Cost.m |
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9680 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 | subplot(2,.2,.4)\npl.imshow(ot_s |
96a0 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 63 6f 73 74 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f | inkhorn_semi.cost_,.interpolatio |
96c0 | 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e | n='nearest')\npl.xticks([])\npl. |
96e0 | 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 | yticks([])\npl.title('Cost.matri |
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9720 | 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 68 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f | ght_layout()\n\n#.the.optimal.co |
9740 | 75 70 6c 69 6e 67 20 69 6e 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 2d 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 | upling.in.the.semi-supervised.DA |
9760 | 20 63 61 73 65 20 77 69 6c 6c 20 65 78 68 69 62 69 74 20 5c 22 20 73 68 61 70 65 5c 6e 23 20 73 | .case.will.exhibit.\".shape\n#.s |
9780 | 69 6d 69 6c 61 72 5c 22 20 74 6f 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 2c 20 28 62 6c | imilar\".to.the.cost.matrix,.(bl |
97a0 | 6f 63 6b 20 64 69 61 67 6f 6e 61 6c 20 6d 61 74 72 69 78 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 | ock.diagonal.matrix)".......]... |
97c0 | 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d | ..},.....{......."cell_type":."m |
97e0 | 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a | arkdown",......."metadata":.{},. |
9800 | 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 | ......"source":.[........."Fig.2 |
9820 | 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 66 6f 72 20 74 | .:.plots.optimal.couplings.for.t |
9840 | 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | he.different.methods\n---------- |
9860 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
9880 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 | ---------------\n\n".......].... |
98a0 | 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f | .},.....{......."cell_type":."co |
98c0 | 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 | de",......."execution_count":.nu |
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9900 | 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 | "collapsed":.false.......},..... |
9920 | 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a | .."outputs":.[],......."source": |
9940 | 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 | .[........."pl.figure(2,.figsize |
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9980 | 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 | npl.imshow(ot_sinkhorn_un.coupli |
99a0 | 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 | ng_,.interpolation='nearest')\np |
99c0 | 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e | l.xticks([])\npl.yticks([])\npl. |
99e0 | 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 55 6e 73 75 70 65 | title('Optimal.coupling\\nUnsupe |
9a00 | 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 | rvised.DA')\n\npl.subplot(1,.2,. |
9a20 | 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 63 | 2)\npl.imshow(ot_sinkhorn_semi.c |
9a40 | 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 | oupling_,.interpolation='nearest |
9a60 | 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 | ')\npl.xticks([])\npl.yticks([]) |
9a80 | 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 | \npl.title('Optimal.coupling\\nS |
9aa0 | 65 6d 69 2d 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f | emi-supervised.DA')\n\npl.tight_ |
9ac0 | 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 | layout()".......].....},.....{.. |
9ae0 | 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 | ....."cell_type":."markdown",... |
9b00 | 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 | ...."metadata":.{},......."sourc |
9b20 | 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 33 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 74 72 61 6e | e":.[........."Fig.3.:.plot.tran |
9b40 | 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | sported.samples\n--------------- |
9b60 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 | -----------------\n\n".......].. |
9b80 | 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 | ...},.....{......."cell_type":." |
9ba0 | 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 | code",......."execution_count":. |
9bc0 | 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | null,......."metadata":.{....... |
9be0 | 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 | .."collapsed":.false.......},... |
9c00 | 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 | ...."outputs":.[],......."source |
9c20 | 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 64 69 73 70 6c 61 79 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 | ":.[........."#.display.transpor |
9c40 | 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a | ted.samples\npl.figure(4,.figsiz |
9c60 | 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e | e=(8,.4))\npl.subplot(1,.2,.1)\n |
9c80 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 | pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c |
9ca0 | 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 | =yt,.marker='o',\n...........lab |
9cc0 | 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 5c | el='Target.samples',.alpha=0.5)\ |
9ce0 | 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 | npl.scatter(transp_Xs_sinkhorn_u |
9d00 | 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 5b 3a | n[:,.0],.transp_Xs_sinkhorn_un[: |
9d20 | 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 | ,.1],.c=ys,\n...........marker=' |
9d40 | 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 | +',.label='Transp.samples',.s=30 |
9d60 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | )\npl.title('Transported.samples |
9d80 | 5c 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 | \\nEmdTransport')\npl.legend(loc |
9da0 | 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | =0)\npl.xticks([])\npl.yticks([] |
9dc0 | 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 | )\n\npl.subplot(1,.2,.2)\npl.sca |
9de0 | 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d | tter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.m |
9e00 | 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 | arker='o',\n...........label='Ta |
9e20 | 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 | rget.samples',.alpha=0.5)\npl.sc |
9e40 | 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 5b 3a 2c | atter(transp_Xs_sinkhorn_semi[:, |
9e60 | 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 5b 3a 2c 20 | .0],.transp_Xs_sinkhorn_semi[:,. |
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b840 | 65 74 68 6f 64 20 3d 20 5c 22 53 41 47 5c 22 5c 6e 73 61 67 5f 70 69 20 3d 20 6f 74 2e 73 74 6f | ethod.=.\"SAG\"\nsag_pi.=.ot.sto |
b860 | 63 68 61 73 74 69 63 2e 73 6f 6c 76 65 5f 73 65 6d 69 5f 64 75 61 6c 5f 65 6e 74 72 6f 70 69 63 | chastic.solve_semi_dual_entropic |
b880 | 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 6d 65 74 68 6f 64 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 | (a,.b,.M,.reg,.method,\n........ |
b8a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
b8c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 29 5c 6e 70 72 69 6e 74 28 73 61 67 5f 70 | ........numItermax)\nprint(sag_p |
b8e0 | 69 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 | i)".......].....},.....{......." |
b900 | 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d | cell_type":."markdown",......."m |
b920 | 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a | etadata":.{},......."source":.[. |
b940 | 20 20 20 20 20 20 20 20 22 53 45 4d 49 43 4f 4e 54 49 4e 4f 55 53 20 43 41 53 45 3a 5c 6e 5c 6e | ........"SEMICONTINOUS.CASE:\n\n |
b960 | 53 61 6d 70 6c 65 20 6f 6e 65 20 67 65 6e 65 72 61 6c 20 6d 65 61 73 75 72 65 20 61 2c 20 6f 6e | Sample.one.general.measure.a,.on |
b980 | 65 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 62 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 73 65 | e.discrete.measures.b.for.the.se |
b9a0 | 6d 69 63 6f 6e 74 69 6e 6f 75 73 5c 6e 63 61 73 65 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | micontinous\ncase\n------------- |
b9c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
b9e0 | 5c 6e 5c 6e 44 65 66 69 6e 65 20 6f 6e 65 20 67 65 6e 65 72 61 6c 20 6d 65 61 73 75 72 65 20 61 | \n\nDefine.one.general.measure.a |
ba00 | 2c 20 6f 6e 65 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 62 2c 20 74 68 65 20 70 | ,.one.discrete.measures.b,.the.p |
ba20 | 6f 69 6e 74 73 20 77 68 65 72 65 5c 6e 61 72 65 20 64 65 66 69 6e 65 64 20 74 68 65 20 73 6f 75 | oints.where\nare.defined.the.sou |
ba40 | 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 61 6e 64 20 | rce.and.the.target.measures.and. |
ba60 | 66 69 6e 61 6c 6c 79 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 63 2e 5c 6e 5c 6e 22 0a | finally.the.cost.matrix.c.\n\n". |
ba80 | 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c | ......].....},.....{......."cell |
baa0 | 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e | _type":."code",......."execution |
bac0 | 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a | _count":.null,......."metadata": |
bae0 | 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 | .{........."collapsed":.false... |
bb00 | 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 | ....},......."outputs":.[],..... |
bb20 | 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 20 | .."source":.[........."n_source. |
bb40 | 3d 20 37 5c 6e 6e 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 34 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 5c 6e 6e 75 6d 49 | =.7\nn_target.=.4\nreg.=.1\nnumI |
bb60 | 74 65 72 6d 61 78 20 3d 20 31 30 30 30 5c 6e 6c 6f 67 20 3d 20 54 72 75 65 5c 6e 5c 6e 61 20 3d | termax.=.1000\nlog.=.True\n\na.= |
bb80 | 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 29 5c 6e 62 20 3d 20 6f 74 | .ot.utils.unif(n_source)\nb.=.ot |
bba0 | 2e 75 74 69 6c 73 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 74 61 72 67 65 74 29 5c 6e 5c 6e 72 6e 67 20 3d 20 6e | .utils.unif(n_target)\n\nrng.=.n |
bbc0 | 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 52 61 6e 64 6f 6d 53 74 61 74 65 28 30 29 5c 6e 58 5f 73 6f 75 72 63 | p.random.RandomState(0)\nX_sourc |
bbe0 | 65 20 3d 20 72 6e 67 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 2c 20 32 29 5c 6e 59 5f 74 61 | e.=.rng.randn(n_source,.2)\nY_ta |
bc00 | 72 67 65 74 20 3d 20 72 6e 67 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 5f 74 61 72 67 65 74 2c 20 32 29 5c 6e 4d | rget.=.rng.randn(n_target,.2)\nM |
bc20 | 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 58 5f 73 6f 75 72 63 65 2c 20 59 5f 74 61 72 67 65 74 29 22 0a | .=.ot.dist(X_source,.Y_target)". |
bc40 | 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c | ......].....},.....{......."cell |
bc60 | 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 | _type":."markdown",......."metad |
bc80 | 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 | ata":.{},......."source":.[..... |
bca0 | 20 20 20 20 22 43 61 6c 6c 20 74 68 65 20 5c 22 41 53 47 44 5c 22 20 6d 65 74 68 6f 64 20 74 6f | ...."Call.the.\"ASGD\".method.to |
bcc0 | 20 66 69 6e 64 20 74 68 65 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 61 74 69 6f 6e 20 6d 61 74 72 69 78 20 | .find.the.transportation.matrix. |
bce0 | 69 6e 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 63 6f 6e 74 69 6e 6f 75 73 5c 6e 63 61 73 65 5c 6e 2d 2d 2d 2d | in.the.semicontinous\ncase\n---- |
bd00 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
bd20 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 44 65 66 69 6e 65 20 74 68 65 20 6d 65 74 68 6f 64 20 5c | ---------\n\nDefine.the.method.\ |
bd40 | 22 41 53 47 44 5c 22 2c 20 63 61 6c 6c 20 6f 74 2e 73 6f 6c 76 65 5f 73 65 6d 69 5f 64 75 61 6c | "ASGD\",.call.ot.solve_semi_dual |
bd60 | 5f 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 61 6e 64 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 5c 6e 72 65 73 75 6c 74 73 2e | _entropic.and.plot.the\nresults. |
bd80 | 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 | \n\n".......].....},.....{...... |
bda0 | 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 | ."cell_type":."code",......."exe |
bdc0 | 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | cution_count":.null,......."meta |
bde0 | 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 | data":.{........."collapsed":.fa |
be00 | 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d | lse.......},......."outputs":.[] |
be20 | 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 | ,......."source":.[........."met |
be40 | 68 6f 64 20 3d 20 5c 22 41 53 47 44 5c 22 5c 6e 61 73 67 64 5f 70 69 2c 20 6c 6f 67 5f 61 73 67 | hod.=.\"ASGD\"\nasgd_pi,.log_asg |
be60 | 64 20 3d 20 6f 74 2e 73 74 6f 63 68 61 73 74 69 63 2e 73 6f 6c 76 65 5f 73 65 6d 69 5f 64 75 61 | d.=.ot.stochastic.solve_semi_dua |
be80 | 6c 5f 65 6e 74 72 6f 70 69 63 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 6d 65 74 68 6f 64 2c | l_entropic(a,.b,.M,.reg,.method, |
bea0 | 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | \n.............................. |
bec0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 75 6d | .............................num |
bee0 | 49 74 65 72 6d 61 78 2c 20 6c 6f 67 3d 6c 6f 67 29 5c 6e 70 72 69 6e 74 28 6c 6f 67 5f 61 73 67 | Itermax,.log=log)\nprint(log_asg |
bf00 | 64 5b 27 61 6c 70 68 61 27 5d 2c 20 6c 6f 67 5f 61 73 67 64 5b 27 62 65 74 61 27 5d 29 5c 6e 70 | d['alpha'],.log_asgd['beta'])\np |
bf20 | 72 69 6e 74 28 61 73 67 64 5f 70 69 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 | rint(asgd_pi)".......].....},... |
bf40 | 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e | ..{......."cell_type":."markdown |
bf60 | 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ",......."metadata":.{},......." |
bf80 | 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 43 6f 6d 70 61 72 65 20 74 68 65 20 | source":.[........."Compare.the. |
bfa0 | 72 65 73 75 6c 74 73 20 77 69 74 68 20 74 68 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 61 6c 67 6f 72 69 | results.with.the.Sinkhorn.algori |
bfc0 | 74 68 6d 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | thm\n--------------------------- |
bfe0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 43 61 6c 6c 20 74 68 65 20 53 | ------------------\n\nCall.the.S |
c000 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 20 66 72 6f 6d 20 50 4f 54 5c 6e 5c 6e 22 0a | inkhorn.algorithm.from.POT\n\n". |
c020 | 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c | ......].....},.....{......."cell |
c040 | 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e | _type":."code",......."execution |
c060 | 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a | _count":.null,......."metadata": |
c080 | 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 | .{........."collapsed":.false... |
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c740 | 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 43 4f 4d | ,......."source":.[........."COM |
c760 | 50 55 54 45 20 54 52 41 4e 53 50 4f 52 54 41 54 49 4f 4e 20 4d 41 54 52 49 58 20 46 4f 52 20 44 | PUTE.TRANSPORTATION.MATRIX.FOR.D |
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c7c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 23 23 23 23 23 | #########################\n##### |
c7e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
c800 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
c820 | 23 23 23 23 23 23 23 5c 6e 20 53 45 4d 49 43 4f 4e 54 49 4e 4f 55 53 20 43 41 53 45 3a 5c 6e 5c | #######\n.SEMICONTINOUS.CASE:\n\ |
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c860 | 6f 6e 65 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 62 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 | one.discrete.measures.b.for.the. |
c880 | 73 65 6d 69 63 6f 6e 74 69 6e 6f 75 73 5c 6e 20 63 61 73 65 5c 6e 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | semicontinous\n.case\n.--------- |
c8a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
c8c0 | 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 20 44 65 66 69 6e 65 20 6f 6e 65 20 67 65 6e 65 72 61 6c 20 6d 65 61 73 | ----\n\n.Define.one.general.meas |
c8e0 | 75 72 65 20 61 2c 20 6f 6e 65 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 62 2c 20 | ure.a,.one.discrete.measures.b,. |
c900 | 74 68 65 20 70 6f 69 6e 74 73 20 77 68 65 72 65 5c 6e 20 61 72 65 20 64 65 66 69 6e 65 64 20 74 | the.points.where\n.are.defined.t |
c920 | 68 65 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 6d 65 61 73 75 72 65 | he.source.and.the.target.measure |
c940 | 73 20 61 6e 64 20 66 69 6e 61 6c 6c 79 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 63 2e | s.and.finally.the.cost.matrix.c. |
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c9a0 | 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 | cution_count":.null,......."meta |
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cb40 | 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 | ".......].....},.....{......."ce |
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cb80 | 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 | adata":.{},......."source":.[... |
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cca0 | 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 | "execution_count":.null,......." |
ccc0 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 | metadata":.{........."collapsed" |
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cd80 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
cda0 | 20 20 62 61 74 63 68 5f 73 69 7a 65 2c 20 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 | ..batch_size,.numItermax,\n..... |
cdc0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
cde0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 72 2c 20 6c 6f 67 3d 6c 6f 67 29 | ....................lr,.log=log) |
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ce40 | 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c | ......].....},.....{......."cell |
ce60 | 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 | _type":."markdown",......."metad |
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cf40 | 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c | ....{......."cell_type":."code", |
cf60 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a | ......."execution_count":.null,. |
cf80 | 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c | ......"metadata":.{........."col |
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d020 | 70 69 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | pi)".......].....},.....{....... |
d040 | 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 | "cell_type":."markdown",......." |
d060 | 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b | metadata":.{},......."source":.[ |
d080 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 20 53 47 44 20 72 65 73 75 6c 74 73 5c 6e 2d 2d 2d | ........."Plot..SGD.results\n--- |
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d0c0 | 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 | },.....{......."cell_type":."cod |
d0e0 | 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c | e",......."execution_count":.nul |
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d120 | 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 | collapsed":.false.......},...... |
d140 | 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 | ."outputs":.[],......."source":. |
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f3a0 | 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 | ransport.with.Group.lasso.regula |
f3c0 | 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 6c 31 6c 32 5c 6e 6f 74 5f 6c 31 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 | rization.l1l2\not_l1l2.=.ot.da.S |
f3e0 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 2c | inkhornL1l2Transport(reg_e=1e-1, |
f400 | 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 32 65 30 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 | .reg_cl=2e0,.max_iter=20,\n..... |
f420 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
f440 | 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 | .verbose=True)\not_l1l2.fit(Xs=X |
f460 | 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 | s,.ys=ys,.Xt=Xt)\n\n#.transport. |
f480 | 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6f 6e 74 6f 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c | source.samples.onto.target.sampl |
f4a0 | 65 73 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 | es\ntransp_Xs_emd.=.ot_emd.trans |
f4c0 | 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 | form(Xs=Xs)\ntransp_Xs_sinkhorn. |
f4e0 | 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e | =.ot_sinkhorn.transform(Xs=Xs)\n |
f500 | 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 6e 73 66 6f | transp_Xs_lpl1.=.ot_lpl1.transfo |
f520 | 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 31 6c 32 20 3d 20 6f 74 5f 6c | rm(Xs=Xs)\ntransp_Xs_l1l2.=.ot_l |
f540 | 31 6c 32 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 | 1l2.transform(Xs=Xs)".......]... |
f560 | 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d | ..},.....{......."cell_type":."m |
f580 | 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a | arkdown",......."metadata":.{},. |
f5a0 | 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 31 | ......"source":.[........."Fig.1 |
f5c0 | 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c | .:.plots.source.and.target.sampl |
f5e0 | 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | es\n---------------------------- |
f600 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a | -----------\n\n".......].....},. |
f620 | 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c | ....{......."cell_type":."code", |
f640 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a | ......."execution_count":.null,. |
f660 | 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c | ......"metadata":.{........."col |
f680 | 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f | lapsed":.false.......},......."o |
f6a0 | 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 | utputs":.[],......."source":.[.. |
f6c0 | 20 20 20 20 20 20 20 22 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 | ......."pl.figure(1,.figsize=(10 |
f6e0 | 2c 20 35 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 5c 6e 70 6c 2e 73 | ,.5))\npl.subplot(1,.2,.1)\npl.s |
f700 | 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c | catter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys, |
f720 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c | .marker='+',.label='Source.sampl |
f740 | 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b | es')\npl.xticks([])\npl.yticks([ |
f760 | 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | ])\npl.legend(loc=0)\npl.title(' |
f780 | 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | Source..samples')\n\npl.subplot( |
f7a0 | 31 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 | 1,.2,.2)\npl.scatter(Xt[:,.0],.X |
f7c0 | 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c | t[:,.1],.c=yt,.marker='o',.label |
f7e0 | 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | ='Target.samples')\npl.xticks([] |
f800 | 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d | )\npl.yticks([])\npl.legend(loc= |
f820 | 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e | 0)\npl.title('Target.samples')\n |
f840 | 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d | pl.tight_layout()".......].....} |
f860 | 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b | ,.....{......."cell_type":."mark |
f880 | 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 | down",......."metadata":.{},.... |
f8a0 | 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 46 69 67 20 32 20 3a 20 | ..."source":.[........."Fig.2.:. |
f8c0 | 70 6c 6f 74 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 61 6e 64 20 74 72 61 6e 73 | plot.optimal.couplings.and.trans |
f8e0 | 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ported.samples\n---------------- |
f900 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
f920 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b | ------\n\n".......].....},.....{ |
f940 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 | ......."cell_type":."code",..... |
f960 | 20 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 | .."execution_count":.null,...... |
f980 | 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 | ."metadata":.{........."collapse |
f9a0 | 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 | d":.false.......},......."output |
f9c0 | 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 | s":.[],......."source":.[....... |
f9e0 | 20 20 22 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 20 3d 20 7b 27 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 27 3a | .."param_img.=.{'interpolation': |
fa00 | 20 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 7d 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 | .'nearest'}\n\npl.figure(2,.figs |
fa20 | 69 7a 65 3d 28 31 35 2c 20 38 29 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 31 | ize=(15,.8))\npl.subplot(2,.4,.1 |
fa40 | 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a | )\npl.imshow(ot_emd.coupling_,.* |
fa60 | 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 | *param_img)\npl.xticks([])\npl.y |
fa80 | 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 | ticks([])\npl.title('Optimal.cou |
faa0 | 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 | pling\\nEMDTransport')\n\npl.sub |
fac0 | 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b | plot(2,.4,.2)\npl.imshow(ot_sink |
fae0 | 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c | horn.coupling_,.**param_img)\npl |
fb00 | 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 | .xticks([])\npl.yticks([])\npl.t |
fb20 | 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 | itle('Optimal.coupling\\nSinkhor |
fb40 | 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c | nTransport')\n\npl.subplot(2,.4, |
fb60 | 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f | .3)\npl.imshow(ot_lpl1.coupling_ |
fb80 | 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 | ,.**param_img)\npl.xticks([])\np |
fba0 | 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 | l.yticks([])\npl.title('Optimal. |
fbc0 | 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 | coupling\\nSinkhornLpl1Transport |
fbe0 | 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 34 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d | ')\n\npl.subplot(2,.4,.4)\npl.im |
fc00 | 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f | show(ot_l1l2.coupling_,.**param_ |
fc20 | 69 6d 67 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b | img)\npl.xticks([])\npl.yticks([ |
fc40 | 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 5c | ])\npl.title('Optimal.coupling\\ |
fc60 | 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 | nSinkhornL1l2Transport')\n\npl.s |
fc80 | 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 35 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a | ubplot(2,.4,.5)\npl.scatter(Xt[: |
fca0 | 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 | ,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o' |
fcc0 | 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 | ,\n...........label='Target.samp |
fce0 | 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 | les',.alpha=0.3)\npl.scatter(tra |
fd00 | 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b | nsp_Xs_emd[:,.0],.transp_Xs_emd[ |
fd20 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d | :,.1],.c=ys,\n...........marker= |
fd40 | 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 | '+',.label='Transp.samples',.s=3 |
fd60 | 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 | 0)\npl.xticks([])\npl.yticks([]) |
fd80 | 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c | \npl.title('Transported.samples\ |
fda0 | 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d | \nEmdTransport')\npl.legend(loc= |
fdc0 | 5c 22 6c 6f 77 65 72 20 6c 65 66 74 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | \"lower.left\")\n\npl.subplot(2, |
fde0 | 20 34 2c 20 36 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b | .4,.6)\npl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[ |
fe00 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 | :,.1],.c=yt,.marker='o',\n...... |
fe20 | 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 | .....label='Target.samples',.alp |
fe40 | 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 | ha=0.3)\npl.scatter(transp_Xs_si |
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fe80 | 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 | [:,.1],.c=ys,\n...........marker |
fea0 | 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d | ='+',.label='Transp.samples',.s= |
fec0 | 33 30 29 5c 6e 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | 30)\npl.xticks([])\npl.yticks([] |
fee0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | )\npl.title('Transported.samples |
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ff20 | 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 37 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 | plot(2,.4,.7)\npl.scatter(Xt[:,. |
ff40 | 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 5c | 0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',\ |
ff60 | 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 | n...........label='Target.sample |
ff80 | 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 | s',.alpha=0.3)\npl.scatter(trans |
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ffc0 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d | :,.1],.c=ys,\n...........marker= |
ffe0 | 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 | '+',.label='Transp.samples',.s=3 |
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10020 | 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c | \npl.title('Transported.samples\ |
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10060 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 38 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b | subplot(2,.4,.8)\npl.scatter(Xt[ |
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15f00 | 6e 28 64 69 73 74 29 5d 2c 20 64 69 73 74 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 73 70 5f 74 6f 5f 61 64 | n(dist)],.dist\n\n\ndef.sp_to_ad |
15f20 | 6a 65 6e 63 79 28 43 2c 20 74 68 72 65 73 68 69 6e 66 3d 30 2e 32 2c 20 74 68 72 65 73 68 73 75 | jency(C,.threshinf=0.2,.threshsu |
15f40 | 70 3d 31 2e 38 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 20 54 68 72 65 73 68 6f 6c 64 73 20 74 | p=1.8):\n....\"\"\".Thresholds.t |
15f60 | 68 65 20 73 74 72 75 63 74 75 72 65 20 6d 61 74 72 69 78 20 69 6e 20 6f 72 64 65 72 20 74 6f 20 | he.structure.matrix.in.order.to. |
15f80 | 63 6f 6d 70 75 74 65 20 61 6e 20 61 64 6a 65 6e 63 79 20 6d 61 74 72 69 78 2e 5c 6e 20 20 20 20 | compute.an.adjency.matrix.\n.... |
15fa0 | 41 6c 6c 20 76 61 6c 75 65 73 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 74 68 72 65 73 68 69 6e 66 20 61 6e 64 | All.values.between.threshinf.and |
15fc0 | 20 74 68 72 65 73 68 73 75 70 20 61 72 65 20 63 6f 6e 73 69 64 65 72 65 64 20 72 65 70 72 65 73 | .threshsup.are.considered.repres |
15fe0 | 65 6e 74 69 6e 67 20 63 6f 6e 6e 65 63 74 65 64 20 6e 6f 64 65 73 20 61 6e 64 20 73 65 74 20 74 | enting.connected.nodes.and.set.t |
16000 | 6f 20 31 2e 20 45 6c 73 65 20 61 72 65 20 73 65 74 20 74 6f 20 30 5c 6e 20 20 20 20 50 61 72 61 | o.1..Else.are.set.to.0\n....Para |
16020 | 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 20 20 20 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 20 20 20 20 43 20 3a 20 | meters\n....----------\n....C.:. |
16040 | 6e 64 61 72 72 61 79 2c 20 73 68 61 70 65 20 28 6e 5f 6e 6f 64 65 73 2c 6e 5f 6e 6f 64 65 73 29 | ndarray,.shape.(n_nodes,n_nodes) |
16060 | 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 73 74 72 75 63 74 75 72 65 20 6d 61 74 72 69 78 20 74 | \n........The.structure.matrix.t |
16080 | 6f 20 74 68 72 65 73 68 6f 6c 64 5c 6e 20 20 20 20 74 68 72 65 73 68 69 6e 66 20 3a 20 66 6c 6f | o.threshold\n....threshinf.:.flo |
160a0 | 61 74 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 6d 69 6e 69 6d 75 6d 20 76 61 6c 75 65 20 6f 66 | at\n........The.minimum.value.of |
160c0 | 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 20 66 72 6f 6d 20 77 68 69 63 68 20 74 68 65 20 6e 65 77 20 76 61 6c | .distance.from.which.the.new.val |
160e0 | 75 65 20 69 73 20 73 65 74 20 74 6f 20 31 5c 6e 20 20 20 20 74 68 72 65 73 68 73 75 70 20 3a 20 | ue.is.set.to.1\n....threshsup.:. |
16100 | 66 6c 6f 61 74 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 6d 61 78 69 6d 75 6d 20 76 61 6c 75 65 | float\n........The.maximum.value |
16120 | 20 6f 66 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 20 66 72 6f 6d 20 77 68 69 63 68 20 74 68 65 20 6e 65 77 20 | .of.distance.from.which.the.new. |
16140 | 76 61 6c 75 65 20 69 73 20 73 65 74 20 74 6f 20 31 5c 6e 20 20 20 20 52 65 74 75 72 6e 73 5c 6e | value.is.set.to.1\n....Returns\n |
16160 | 20 20 20 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 20 20 20 20 43 20 3a 20 6e 64 61 72 72 61 79 2c 20 73 68 | ....-------\n....C.:.ndarray,.sh |
16180 | 61 70 65 20 28 6e 5f 6e 6f 64 65 73 2c 6e 5f 6e 6f 64 65 73 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 54 | ape.(n_nodes,n_nodes)\n........T |
161a0 | 68 65 20 74 68 72 65 73 68 6f 6c 64 20 6d 61 74 72 69 78 2e 20 45 61 63 68 20 65 6c 65 6d 65 6e | he.threshold.matrix..Each.elemen |
161c0 | 74 20 69 73 20 69 6e 20 7b 30 2c 31 7d 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 48 | t.is.in.{0,1}\n....\"\"\"\n....H |
161e0 | 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 5f 6c 69 6b 65 28 43 29 5c 6e 20 20 20 20 6e 70 2e 66 69 6c 6c | .=.np.zeros_like(C)\n....np.fill |
16200 | 5f 64 69 61 67 6f 6e 61 6c 28 48 2c 20 6e 70 2e 64 69 61 67 6f 6e 61 6c 28 43 29 29 5c 6e 20 20 | _diagonal(H,.np.diagonal(C))\n.. |
16220 | 20 20 43 20 3d 20 43 20 2d 20 48 5c 6e 20 20 20 20 43 20 3d 20 6e 70 2e 6d 69 6e 69 6d 75 6d 28 | ..C.=.C.-.H\n....C.=.np.minimum( |
16240 | 6e 70 2e 6d 61 78 69 6d 75 6d 28 43 2c 20 74 68 72 65 73 68 69 6e 66 29 2c 20 74 68 72 65 73 68 | np.maximum(C,.threshinf),.thresh |
16260 | 73 75 70 29 5c 6e 20 20 20 20 43 5b 43 20 3d 3d 20 74 68 72 65 73 68 73 75 70 5d 20 3d 20 30 5c | sup)\n....C[C.==.threshsup].=.0\ |
16280 | 6e 20 20 20 20 43 5b 43 20 21 3d 20 30 5d 20 3d 20 31 5c 6e 5c 6e 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e | n....C[C.!=.0].=.1\n\n....return |
162a0 | 20 43 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 62 75 69 6c 64 5f 6e 6f 69 73 79 5f 63 69 72 63 75 6c 61 72 | .C\n\n\ndef.build_noisy_circular |
162c0 | 5f 67 72 61 70 68 28 4e 3d 32 30 2c 20 6d 75 3d 30 2c 20 73 69 67 6d 61 3d 30 2e 33 2c 20 77 69 | _graph(N=20,.mu=0,.sigma=0.3,.wi |
162e0 | 74 68 5f 6e 6f 69 73 65 3d 46 61 6c 73 65 2c 20 73 74 72 75 63 74 75 72 65 5f 6e 6f 69 73 65 3d | th_noise=False,.structure_noise= |
16300 | 46 61 6c 73 65 2c 20 70 3d 4e 6f 6e 65 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 5c 22 5c 22 5c 22 20 43 72 65 61 | False,.p=None):\n....\"\"\".Crea |
16320 | 74 65 20 61 20 6e 6f 69 73 79 20 63 69 72 63 75 6c 61 72 20 67 72 61 70 68 5c 6e 20 20 20 20 5c | te.a.noisy.circular.graph\n....\ |
16340 | 22 5c 22 5c 22 5c 6e 20 20 20 20 67 20 3d 20 6e 78 2e 47 72 61 70 68 28 29 5c 6e 20 20 20 20 67 | "\"\"\n....g.=.nx.Graph()\n....g |
16360 | 2e 61 64 64 5f 6e 6f 64 65 73 5f 66 72 6f 6d 28 6c 69 73 74 28 72 61 6e 67 65 28 4e 29 29 29 5c | .add_nodes_from(list(range(N)))\ |
16380 | 6e 20 20 20 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 4e 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 | n....for.i.in.range(N):\n....... |
163a0 | 20 6e 6f 69 73 65 20 3d 20 66 6c 6f 61 74 28 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 6e 6f 72 6d 61 6c 28 | .noise.=.float(np.random.normal( |
163c0 | 6d 75 2c 20 73 69 67 6d 61 2c 20 31 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 77 69 74 68 5f | mu,.sigma,.1))\n........if.with_ |
163e0 | 6e 6f 69 73 65 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 6e 6f 64 65 28 69 | noise:\n............g.add_node(i |
16400 | 2c 20 61 74 74 72 5f 6e 61 6d 65 3d 6d 61 74 68 2e 73 69 6e 28 28 32 20 2a 20 69 20 2a 20 6d 61 | ,.attr_name=math.sin((2.*.i.*.ma |
16420 | 74 68 2e 70 69 20 2f 20 4e 29 29 20 2b 20 6e 6f 69 73 65 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 65 6c | th.pi./.N)).+.noise)\n........el |
16440 | 73 65 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 6e 6f 64 65 28 69 2c 20 61 | se:\n............g.add_node(i,.a |
16460 | 74 74 72 5f 6e 61 6d 65 3d 6d 61 74 68 2e 73 69 6e 28 32 20 2a 20 69 20 2a 20 6d 61 74 68 2e 70 | ttr_name=math.sin(2.*.i.*.math.p |
16480 | 69 20 2f 20 4e 29 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 65 64 67 65 28 69 2c 20 69 | i./.N))\n........g.add_edge(i,.i |
164a0 | 20 2b 20 31 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 73 74 72 75 63 74 75 72 65 5f 6e 6f 69 73 | .+.1)\n........if.structure_nois |
164c0 | 65 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 72 61 6e 64 6f 6d 69 6e 74 20 3d 20 6e 70 2e 72 | e:\n............randomint.=.np.r |
164e0 | 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 30 2c 20 70 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | andom.randint(0,.p)\n........... |
16500 | 20 69 66 20 72 61 6e 64 6f 6d 69 6e 74 20 3d 3d 20 30 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | .if.randomint.==.0:\n........... |
16520 | 20 20 20 20 20 69 66 20 69 20 3c 3d 20 4e 20 2d 20 33 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | .....if.i.<=.N.-.3:\n........... |
16540 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 65 64 67 65 28 69 2c 20 69 20 2b 20 32 29 5c 6e 20 | .........g.add_edge(i,.i.+.2)\n. |
16560 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 69 20 3d 3d 20 4e 20 2d 20 32 3a 5c 6e 20 | ...............if.i.==.N.-.2:\n. |
16580 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 65 64 67 65 28 69 2c | ...................g.add_edge(i, |
165a0 | 20 30 29 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 69 20 3d 3d 20 4e 20 2d | .0)\n................if.i.==.N.- |
165c0 | 20 31 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 65 | .1:\n....................g.add_e |
165e0 | 64 67 65 28 69 2c 20 31 29 5c 6e 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 65 64 67 65 28 4e 2c 20 30 29 5c | dge(i,.1)\n....g.add_edge(N,.0)\ |
16600 | 6e 20 20 20 20 6e 6f 69 73 65 20 3d 20 66 6c 6f 61 74 28 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 6e 6f 72 | n....noise.=.float(np.random.nor |
16620 | 6d 61 6c 28 6d 75 2c 20 73 69 67 6d 61 2c 20 31 29 29 5c 6e 20 20 20 20 69 66 20 77 69 74 68 5f | mal(mu,.sigma,.1))\n....if.with_ |
16640 | 6e 6f 69 73 65 3a 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 6e 6f 64 65 28 4e 2c 20 61 74 | noise:\n........g.add_node(N,.at |
16660 | 74 72 5f 6e 61 6d 65 3d 6d 61 74 68 2e 73 69 6e 28 28 32 20 2a 20 4e 20 2a 20 6d 61 74 68 2e 70 | tr_name=math.sin((2.*.N.*.math.p |
16680 | 69 20 2f 20 4e 29 29 20 2b 20 6e 6f 69 73 65 29 5c 6e 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 5c 6e 20 20 20 | i./.N)).+.noise)\n....else:\n... |
166a0 | 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 6e 6f 64 65 28 4e 2c 20 61 74 74 72 5f 6e 61 6d 65 3d 6d 61 74 | .....g.add_node(N,.attr_name=mat |
166c0 | 68 2e 73 69 6e 28 32 20 2a 20 4e 20 2a 20 6d 61 74 68 2e 70 69 20 2f 20 4e 29 29 5c 6e 20 20 20 | h.sin(2.*.N.*.math.pi./.N))\n... |
166e0 | 20 72 65 74 75 72 6e 20 67 5c 6e 5c 6e 5c 6e 64 65 66 20 67 72 61 70 68 5f 63 6f 6c 6f 72 73 28 | .return.g\n\n\ndef.graph_colors( |
16700 | 6e 78 5f 67 72 61 70 68 2c 20 76 6d 69 6e 3d 30 2c 20 76 6d 61 78 3d 37 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 | nx_graph,.vmin=0,.vmax=7):\n.... |
16720 | 63 6e 6f 72 6d 20 3d 20 6d 63 6f 6c 2e 4e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 65 28 76 6d 69 6e 3d 76 6d 69 6e | cnorm.=.mcol.Normalize(vmin=vmin |
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17de0 | 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 | Cost.matrices\npl.figure(2,.figs |
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18860 | 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e | r',.label='Target.samples')\npl. |
18880 | 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 | axis('equal')\npl.title('Source. |
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188c0 | 23 20 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 2c 20 66 69 | #.Cost.matrices\npl.figure(5,.fi |
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18920 | 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 | n='nearest')\npl.title('Euclidea |
18940 | 6e 20 63 6f 73 74 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 5c | n.cost')\n\npl.subplot(1,.3,.2)\ |
18960 | 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 32 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 | npl.imshow(M2,.interpolation='ne |
18980 | 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 | arest')\npl.title('Squared.Eucli |
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189c0 | 33 29 5c 6e 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 70 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d | 3)\npl.imshow(Mp,.interpolation= |
189e0 | 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 | 'nearest')\npl.title('Sqrt.Eucli |
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18a60 | 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 | ata":.{},......."source":.[..... |
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18b20 | 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 | adata":.{........."collapsed":.f |
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18bc0 | 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 70 29 5c 6e 5c 6e 23 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 5c 6e 70 6c 2e | (a,.b,.Mp)\n\n#.OT.matrices\npl. |
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18c00 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 | subplot(1,.3,.1)\not.plot.plot2D |
18c20 | 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 31 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 | _samples_mat(xs,.xt,.G1,.c=[.5,. |
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18ca0 | 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 | 'xr',.label='Target.samples')\np |
18cc0 | 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 5c 6e 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 | l.axis('equal')\n#.pl.legend(loc |
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198e0 | 74 36 34 29 5c 6e 5c 6e 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 | t64)\n\n#.Gaussian.distributions |
19900 | 5c 6e 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 61 31 20 3d | \n#.Gaussian.distributions\na1.= |
19920 | 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d | .ot.datasets.make_1D_gauss(n,.m= |
19940 | 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 5c 6e 61 32 20 | 20,.s=5)..#.m=.mean,.s=.std\na2. |
19960 | 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d | =.ot.datasets.make_1D_gauss(n,.m |
19980 | 3d 36 30 2c 20 73 3d 38 29 5c 6e 5c 6e 23 20 63 72 65 61 74 69 6e 67 20 6d 61 74 72 69 78 20 41 | =60,.s=8)\n\n#.creating.matrix.A |
199a0 | 20 63 6f 6e 74 61 69 6e 69 6e 67 20 61 6c 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 41 | .containing.all.distributions\nA |
199c0 | 20 3d 20 6e 70 2e 76 73 74 61 63 6b 28 28 61 31 2c 20 61 32 29 29 2e 54 5c 6e 6e 5f 64 69 73 74 | .=.np.vstack((a1,.a2)).T\nn_dist |
199e0 | 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 3d 20 41 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 | ributions.=.A.shape[1]\n\n#.loss |
19a00 | 20 6d 61 74 72 69 78 20 2b 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e | .matrix.+.normalization\nM.=.ot. |
19a20 | 75 74 69 6c 73 2e 64 69 73 74 30 28 6e 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e | utils.dist0(n)\nM./=.M.max()\n\n |
19a40 | 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e | \n#%%.plot.the.distributions\n\n |
19a60 | 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e | pl.figure(1,.figsize=(6.4,.3))\n |
19a80 | 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a | for.i.in.range(n_distributions): |
19aa0 | 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 | \n....pl.plot(x,.A[:,.i])\npl.ti |
19ac0 | 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c | tle('Distributions')\npl.tight_l |
19ae0 | 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 | ayout()\n\n#%%.barycenter.comput |
19b00 | 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 61 6c 70 68 61 20 3d 20 30 2e 35 20 20 23 20 30 3c 3d 61 6c 70 68 61 | ation\n\nalpha.=.0.5..#.0<=alpha |
19b20 | 3c 3d 31 5c 6e 77 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 | <=1\nweights.=.np.array([1.-.alp |
19b40 | 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 32 62 61 72 79 5c 6e 62 61 72 79 5f 6c 32 | ha,.alpha])\n\n#.l2bary\nbary_l2 |
19b60 | 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 | .=.A.dot(weights)\n\n#.wasserste |
19b80 | 69 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 | in\nreg.=.1e-3\not.tic()\nbary_w |
19ba0 | 61 73 73 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d | ass.=.ot.bregman.barycenter(A,.M |
19bc0 | 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 6f | ,.reg,.weights)\not.toc()\n\n\no |
19be0 | 74 2e 74 69 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 20 3d 20 6f 74 2e 6c 70 2e 62 61 72 79 | t.tic()\nbary_wass2.=.ot.lp.bary |
19c00 | 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 2c 20 73 6f 6c 76 65 72 3d 27 69 6e | center(A,.M,.weights,.solver='in |
19c20 | 74 65 72 69 6f 72 2d 70 6f 69 6e 74 27 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 | terior-point',.verbose=True)\not |
19c40 | 2e 74 6f 63 28 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 | .toc()\n\npl.figure(2)\npl.clf() |
19c60 | 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 | \npl.subplot(2,.1,.1)\nfor.i.in. |
19c80 | 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e | range(n_distributions):\n....pl. |
19ca0 | 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 | plot(x,.A[:,.i])\npl.title('Dist |
19cc0 | 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 | ributions')\n\npl.subplot(2,.1,. |
19ce0 | 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 | 2)\npl.plot(x,.bary_l2,.'r',.lab |
19d00 | 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 | el='l2')\npl.plot(x,.bary_wass,. |
19d20 | 27 67 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 52 65 67 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 | 'g',.label='Reg.Wasserstein')\np |
19d40 | 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c | l.plot(x,.bary_wass2,.'b',.label |
19d60 | 3d 27 4c 50 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c | ='LP.Wasserstein')\npl.legend()\ |
19d80 | 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 | npl.title('Barycenters')\npl.tig |
19da0 | 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 5b | ht_layout()\n\nproblems.append([ |
19dc0 | 41 2c 20 5b 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 | A,.[bary_l2,.bary_wass,.bary_was |
19de0 | 73 32 5d 5d 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 | s2]])".......].....},.....{..... |
19e00 | 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 | .."cell_type":."markdown",...... |
19e20 | 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a | ."metadata":.{},......."source": |
19e40 | 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 44 69 72 61 63 20 44 61 74 61 5c 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .[........."Dirac.Data\n-------- |
19e60 | 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 | --\n\n".......].....},.....{.... |
19e80 | 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 65 | ..."cell_type":."code",......."e |
19ea0 | 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 | xecution_count":.null,......."me |
19ec0 | 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 | tadata":.{........."collapsed":. |
19ee0 | 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 | false.......},......."outputs":. |
19f00 | 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 | [],......."source":.[........."# |
19f20 | 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 5c 6e 5c 6e 61 31 20 3d 20 31 2e 30 20 2a 20 28 78 20 3e | %%.parameters\n\na1.=.1.0.*.(x.> |
19f40 | 20 31 30 29 20 2a 20 28 78 20 3c 20 35 30 29 5c 6e 61 32 20 3d 20 31 2e 30 20 2a 20 28 78 20 3e | .10).*.(x.<.50)\na2.=.1.0.*.(x.> |
19f60 | 20 36 30 29 20 2a 20 28 78 20 3c 20 38 30 29 5c 6e 5c 6e 61 31 20 2f 3d 20 61 31 2e 73 75 6d 28 | .60).*.(x.<.80)\n\na1./=.a1.sum( |
19f80 | 29 5c 6e 61 32 20 2f 3d 20 61 32 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 63 72 65 61 74 69 6e 67 20 | )\na2./=.a2.sum()\n\n#.creating. |
19fa0 | 6d 61 74 72 69 78 20 41 20 63 6f 6e 74 61 69 6e 69 6e 67 20 61 6c 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 | matrix.A.containing.all.distribu |
19fc0 | 74 69 6f 6e 73 5c 6e 41 20 3d 20 6e 70 2e 76 73 74 61 63 6b 28 28 61 31 2c 20 61 32 29 29 2e 54 | tions\nA.=.np.vstack((a1,.a2)).T |
19fe0 | 5c 6e 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 3d 20 41 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 5c 6e | \nn_distributions.=.A.shape[1]\n |
1a000 | 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 20 2b 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c | \n#.loss.matrix.+.normalization\ |
1a020 | 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 64 69 73 74 30 28 6e 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d | nM.=.ot.utils.dist0(n)\nM./=.M.m |
1a040 | 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 | ax()\n\n\n#%%.plot.the.distribut |
1a060 | 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e | ions\n\npl.figure(1,.figsize=(6. |
1a080 | 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 | 4,.3))\nfor.i.in.range(n_distrib |
1a0a0 | 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d | utions):\n....pl.plot(x,.A[:,.i] |
1a0c0 | 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c | )\npl.title('Distributions')\npl |
1a0e0 | 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e | .tight_layout()\n\n\n#%%.barycen |
1a100 | 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 5c 6e 5c 6e 61 6c 70 68 61 20 3d 20 30 2e 35 20 20 | ter.computation\n\nalpha.=.0.5.. |
1a120 | 23 20 30 3c 3d 61 6c 70 68 61 3c 3d 31 5c 6e 77 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 | #.0<=alpha<=1\nweights.=.np.arra |
1a140 | 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 32 62 61 72 | y([1.-.alpha,.alpha])\n\n#.l2bar |
1a160 | 79 5c 6e 62 61 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 | y\nbary_l2.=.A.dot(weights)\n\n# |
1a180 | 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 5c 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 | .wasserstein\nreg.=.1e-3\not.tic |
1a1a0 | 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 | ()\nbary_wass.=.ot.bregman.baryc |
1a1c0 | 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f | enter(A,.M,.reg,.weights)\not.to |
1a1e0 | 63 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 20 3d 20 | c()\n\n\not.tic()\nbary_wass2.=. |
1a200 | 6f 74 2e 6c 70 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 2c 20 | ot.lp.barycenter(A,.M,.weights,. |
1a220 | 73 6f 6c 76 65 72 3d 27 69 6e 74 65 72 69 6f 72 2d 70 6f 69 6e 74 27 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 | solver='interior-point',.verbose |
1a240 | 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 2e 61 | =True)\not.toc()\n\n\nproblems.a |
1a260 | 70 70 65 6e 64 28 5b 41 2c 20 5b 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 62 | ppend([A,.[bary_l2,.bary_wass,.b |
1a280 | 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 5d 5d 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c | ary_wass2]])\n\npl.figure(2)\npl |
1a2a0 | 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 | .clf()\npl.subplot(2,.1,.1)\nfor |
1a2c0 | 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 | .i.in.range(n_distributions):\n. |
1a2e0 | 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | ...pl.plot(x,.A[:,.i])\npl.title |
1a300 | 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | ('Distributions')\n\npl.subplot( |
1a320 | 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 | 2,.1,.2)\npl.plot(x,.bary_l2,.'r |
1a340 | 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f | ',.label='l2')\npl.plot(x,.bary_ |
1a360 | 77 61 73 73 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 52 65 67 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 | wass,.'g',.label='Reg.Wasserstei |
1a380 | 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 2c 20 27 62 27 2c | n')\npl.plot(x,.bary_wass2,.'b', |
1a3a0 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 50 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 | .label='LP.Wasserstein')\npl.leg |
1a3c0 | 65 6e 64 28 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e | end()\npl.title('Barycenters')\n |
1a3e0 | 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 | pl.tight_layout()\n\n#%%.paramet |
1a400 | 65 72 73 5c 6e 5c 6e 61 31 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 6e 29 5c 6e 61 32 20 3d 20 6e 70 | ers\n\na1.=.np.zeros(n)\na2.=.np |
1a420 | 2e 7a 65 72 6f 73 28 6e 29 5c 6e 5c 6e 61 31 5b 31 30 5d 20 3d 20 2e 32 35 5c 6e 61 31 5b 32 30 | .zeros(n)\n\na1[10].=..25\na1[20 |
1a440 | 5d 20 3d 20 2e 35 5c 6e 61 31 5b 33 30 5d 20 3d 20 2e 32 35 5c 6e 61 32 5b 38 30 5d 20 3d 20 31 | ].=..5\na1[30].=..25\na2[80].=.1 |
1a460 | 5c 6e 5c 6e 5c 6e 61 31 20 2f 3d 20 61 31 2e 73 75 6d 28 29 5c 6e 61 32 20 2f 3d 20 61 32 2e 73 | \n\n\na1./=.a1.sum()\na2./=.a2.s |
1a480 | 75 6d 28 29 5c 6e 5c 6e 23 20 63 72 65 61 74 69 6e 67 20 6d 61 74 72 69 78 20 41 20 63 6f 6e 74 | um()\n\n#.creating.matrix.A.cont |
1a4a0 | 61 69 6e 69 6e 67 20 61 6c 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 41 20 3d 20 6e 70 | aining.all.distributions\nA.=.np |
1a4c0 | 2e 76 73 74 61 63 6b 28 28 61 31 2c 20 61 32 29 29 2e 54 5c 6e 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 | .vstack((a1,.a2)).T\nn_distribut |
1a4e0 | 69 6f 6e 73 20 3d 20 41 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 | ions.=.A.shape[1]\n\n#.loss.matr |
1a500 | 69 78 20 2b 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 5c 6e 4d 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 | ix.+.normalization\nM.=.ot.utils |
1a520 | 2e 64 69 73 74 30 28 6e 29 5c 6e 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 | .dist0(n)\nM./=.M.max()\n\n\n#%% |
1a540 | 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 | .plot.the.distributions\n\npl.fi |
1a560 | 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 | gure(1,.figsize=(6.4,.3))\nfor.i |
1a580 | 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 | .in.range(n_distributions):\n... |
1a5a0 | 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | .pl.plot(x,.A[:,.i])\npl.title(' |
1a5c0 | 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 | Distributions')\npl.tight_layout |
1a5e0 | 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 | ()\n\n\n#%%.barycenter.computati |
1a600 | 6f 6e 5c 6e 5c 6e 61 6c 70 68 61 20 3d 20 30 2e 35 20 20 23 20 30 3c 3d 61 6c 70 68 61 3c 3d 31 | on\n\nalpha.=.0.5..#.0<=alpha<=1 |
1a620 | 5c 6e 77 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c | \nweights.=.np.array([1.-.alpha, |
1a640 | 20 61 6c 70 68 61 5d 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 32 62 61 72 79 5c 6e 62 61 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 | .alpha])\n\n#.l2bary\nbary_l2.=. |
1a660 | 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 5c | A.dot(weights)\n\n#.wasserstein\ |
1a680 | 6e 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 5c 6e 6f 74 2e 74 69 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 | nreg.=.1e-3\not.tic()\nbary_wass |
1a6a0 | 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 | .=.ot.bregman.barycenter(A,.M,.r |
1a6c0 | 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 6f 74 2e 74 | eg,.weights)\not.toc()\n\n\not.t |
1a6e0 | 69 63 28 29 5c 6e 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 20 3d 20 6f 74 2e 6c 70 2e 62 61 72 79 63 65 6e | ic()\nbary_wass2.=.ot.lp.barycen |
1a700 | 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 2c 20 73 6f 6c 76 65 72 3d 27 69 6e 74 65 72 | ter(A,.M,.weights,.solver='inter |
1a720 | 69 6f 72 2d 70 6f 69 6e 74 27 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 2e 74 6f | ior-point',.verbose=True)\not.to |
1a740 | 63 28 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 5b 41 2c 20 5b 62 61 | c()\n\n\nproblems.append([A,.[ba |
1a760 | 72 79 5f 6c 32 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 5d 5d 29 5c | ry_l2,.bary_wass,.bary_wass2]])\ |
1a780 | 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 | n\npl.figure(2)\npl.clf()\npl.su |
1a7a0 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 5c 6e 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e | bplot(2,.1,.1)\nfor.i.in.range(n |
1a7c0 | 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 5c 6e 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c | _distributions):\n....pl.plot(x, |
1a7e0 | 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f | .A[:,.i])\npl.title('Distributio |
1a800 | 6e 73 27 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e | ns')\n\npl.subplot(2,.1,.2)\npl. |
1a820 | 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 | plot(x,.bary_l2,.'r',.label='l2' |
1a840 | 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 | )\npl.plot(x,.bary_wass,.'g',.la |
1a860 | 62 65 6c 3d 27 52 65 67 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 | bel='Reg.Wasserstein')\npl.plot( |
1a880 | 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 50 20 57 61 | x,.bary_wass2,.'b',.label='LP.Wa |
1a8a0 | 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 | sserstein')\npl.legend()\npl.tit |
1a8c0 | 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f | le('Barycenters')\npl.tight_layo |
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1b9e0 | 28 34 29 5c 6e 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 | (4)\not.plot.plot2D_samples_mat( |
1ba00 | 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 30 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 5c 6e 70 6c 2e 70 | xs,.xt,.G0,.c=[.5,..5,.1])\npl.p |
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1ba40 | 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 | bel='Source.samples')\npl.plot(x |
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1ba80 | 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d | Target.samples')\npl.legend(loc= |
1baa0 | 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 77 69 74 68 20 73 61 6d | 0)\npl.title('OT.matrix.with.sam |
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1bae0 | 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 | ..."cell_type":."markdown",..... |
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1bb20 | 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 2d | :.[........."Compute.Sinkhorn\n- |
1bb40 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 | ---------------\n\n".......].... |
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1bbc0 | 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 | "collapsed":.false.......},..... |
1bbe0 | 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a | .."outputs":.[],......."source": |
1bc00 | 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 72 65 | .[........."#%%.sinkhorn\n\n#.re |
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1bd60 | 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 | 'Target.samples')\npl.legend(loc |
1bd80 | 3d 30 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 | =0)\npl.title('OT.matrix.Sinkhor |
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1bdc0 | 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f | .....].....},.....{......."cell_ |
1bde0 | 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 | type":."markdown",......."metada |
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1bf00 | 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5c 6e 5c 6e 23 20 72 65 67 20 74 65 72 6d | ....."#%%.sinkhorn\n\n#.reg.term |
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1bfa0 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 65 6d 70 69 72 69 63 61 6c 20 73 69 6e | l.title('OT.matrix.empirical.sin |
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1bfe0 | 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 65 73 2c | .plot2D_samples_mat(xs,.xt,.Ges, |
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1c0e0 | 20 20 20 7d 0a 20 20 5d 2c 0a 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 22 6b | ...}...],..."metadata":.{....."k |
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1e340 | 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f | lapsed":.false.......},......."o |
1e360 | 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 | utputs":.[],......."source":.[.. |
1e380 | 20 20 20 20 20 20 20 22 23 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 | ......."#.MappingTransport.with. |
1e3a0 | 6c 69 6e 65 61 72 20 6b 65 72 6e 65 6c 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 | linear.kernel\not_mapping_linear |
1e3c0 | 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 5c 6e 20 20 20 20 | .=.ot.da.MappingTransport(\n.... |
1e3e0 | 6b 65 72 6e 65 6c 3d 5c 22 6c 69 6e 65 61 72 5c 22 2c 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d 31 | kernel=\"linear\",.mu=1e0,.eta=1 |
1e400 | 65 2d 38 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 5c 6e 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 | e-8,.bias=True,\n....max_iter=20 |
1e420 | 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 | ,.verbose=True)\n\not_mapping_li |
1e440 | 6e 65 61 72 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 | near.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\n#.for. |
1e460 | 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f | original.source.samples,.transfo |
1e480 | 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e | rm.applies.barycentric.mapping\n |
1e4a0 | 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 | transp_Xs_linear.=.ot_mapping_li |
1e4c0 | 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f | near.transform(Xs=Xs)\n\n#.for.o |
1e4e0 | 75 74 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 | ut.of.source.samples,.transform. |
1e500 | 61 70 70 6c 69 65 73 20 74 68 65 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e | applies.the.linear.mapping\ntran |
1e520 | 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 | sp_Xs_linear_new.=.ot_mapping_li |
1e540 | 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 77 29 5c 6e 5c 6e 5c 6e 23 | near.transform(Xs=Xs_new)\n\n\n# |
1e560 | 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 | .MappingTransport.with.gaussian. |
1e580 | 6b 65 72 6e 65 6c 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 | kernel\not_mapping_gaussian.=.ot |
1e5a0 | 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 5c 6e 20 20 20 20 6b 65 72 6e 65 | .da.MappingTransport(\n....kerne |
1e5c0 | 6c 3d 5c 22 67 61 75 73 73 69 61 6e 5c 22 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 35 2c 20 6d 75 3d 31 65 2d | l=\"gaussian\",.eta=1e-5,.mu=1e- |
1e5e0 | 31 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 20 73 69 67 6d 61 3d 31 2c 5c 6e 20 20 20 20 6d 61 78 5f | 1,.bias=True,.sigma=1,\n....max_ |
1e600 | 69 74 65 72 3d 31 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 5c 6e 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 | iter=10,.verbose=True)\not_mappi |
1e620 | 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 5c 6e 5c | ng_gaussian.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)\n\ |
1e640 | 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 | n#.for.original.source.samples,. |
1e660 | 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 | transform.applies.barycentric.ma |
1e680 | 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 5f 6d | pping\ntransp_Xs_gaussian.=.ot_m |
1e6a0 | 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 | apping_gaussian.transform(Xs=Xs) |
1e6c0 | 5c 6e 5c 6e 23 20 66 6f 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c | \n\n#.for.out.of.source.samples, |
1e6e0 | 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 74 68 65 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 | .transform.applies.the.gaussian. |
1e700 | 6d 61 70 70 69 6e 67 5c 6e 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5f 6e 65 77 20 | mapping\ntransp_Xs_gaussian_new. |
1e720 | 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 | =.ot_mapping_gaussian.transform( |
1e740 | 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 77 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b | Xs=Xs_new)".......].....},.....{ |
1e760 | 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a | ......."cell_type":."markdown",. |
1e780 | 20 20 20 20 20 20 22 6d 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 | ......"metadata":.{},......."sou |
1e7a0 | 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 50 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 | rce":.[........."Plot.transporte |
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1e7e0 | 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 | ---\n\n".......].....},.....{... |
1e800 | 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 | ...."cell_type":."code",......." |
1e820 | 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6d | execution_count":.null,......."m |
1e840 | 65 74 61 64 61 74 61 22 3a 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a | etadata":.{........."collapsed": |
1e860 | 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a | .false.......},......."outputs": |
1e880 | 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 | .[],......."source":.[........." |
1e8a0 | 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 5c 6e 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | pl.figure(2)\npl.clf()\npl.subpl |
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1e940 | 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 | s_linear[:,.0],.transp_Xs_linear |
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1e980 | 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4d 61 70 70 65 64 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c | ......label='Mapped.source.sampl |
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1e9e0 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 | pl.subplot(2,.2,.2)\npl.scatter( |
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1ea40 | 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 | samples',.alpha=.2)\npl.scatter( |
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1ea80 | 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 5c 6e 20 20 20 20 20 20 20 | sp_Xs_linear_new[:,.1],\n....... |
1eaa0 | 20 20 20 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 65 61 | ....c=ys,.marker='+',.label='Lea |
1eac0 | 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 5c 6e 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 5c 22 45 73 74 69 6d | rned.mapping')\npl.title(\"Estim |
1eae0 | 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 5c 22 29 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 73 75 62 70 | ..mapping.(linear)\")\n\npl.subp |
1eb00 | 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 5c 6e 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 | lot(2,.2,.3)\npl.scatter(Xt[:,.0 |
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1f3e0 | 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 | ."source":.[........."#%%.parame |
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1f480 | 6e 6c 73 74 5f 6d 20 3d 20 6e 70 2e 6c 69 6e 73 70 61 63 65 28 32 30 2c 20 39 30 2c 20 6e 5f 74 | nlst_m.=.np.linspace(20,.90,.n_t |
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1f4c0 | 6e 73 5c 6e 61 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d | ns\na.=.gauss(n,.m=20,.s=5)..#.m |
1f4e0 | 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 5c 6e 5c 6e 42 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 | =.mean,.s=.std\n\nB.=.np.zeros(( |
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1f540 | 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 6d 2c 20 73 3d 35 29 5c 6e 5c 6e 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 | uss(n,.m=m,.s=5)\n\n#.loss.matri |
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1f5c0 | 29 5c 6e 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 | )\nM2.=.ot.dist(x.reshape((n,.1) |
1f5e0 | 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 | ),.x.reshape((n,.1)),.'sqeuclide |
1f600 | 61 6e 27 29 5c 6e 4d 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 | an')\nM2./=.M2.max()".......]... |
1f620 | 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d | ..},.....{......."cell_type":."m |
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1f700 | 22 63 6f 6c 6c 61 70 73 65 64 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 | "collapsed":.false.......},..... |
1f720 | 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a | .."outputs":.[],......."source": |
1f740 | 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 22 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 | .[........."#%%.plot.the.distrib |
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1f7e0 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 5c 6e 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 42 | l.subplot(2,.1,.2)\npl.plot(x,.B |
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1f860 | 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d | ..},.....{......."cell_type":."m |
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1f8e0 | 6e 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | n------------------------------- |
1f900 | 2d 2d 2d 2d 2d 5c 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a | -----\n\n".......].....},.....{. |
1f920 | 20 20 20 20 20 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 63 6f 64 65 22 2c 0a 20 20 20 20 20 | ......"cell_type":."code",...... |
1f940 | 20 22 65 78 65 63 75 74 69 6f 6e 5f 63 6f 75 6e 74 22 3a 20 6e 75 6c 6c 2c 0a 20 20 20 20 20 20 | ."execution_count":.null,....... |
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1f980 | 22 3a 20 66 61 6c 73 65 0a 20 20 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 6f 75 74 70 75 74 73 | ":.false.......},......."outputs |
1f9a0 | 22 3a 20 5b 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 22 73 6f 75 72 63 65 22 3a 20 5b 0a 20 20 20 20 20 20 20 | ":.[],......."source":.[........ |
1f9c0 | 20 22 23 25 25 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 61 6e 64 20 70 6c 6f 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 | ."#%%.Compute.and.plot.distribut |
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1fa60 | 6f 66 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 6c 6f 73 73 20 4d 32 5c 6e 5c 6e 5c 6e 70 6c 2e 66 69 67 75 | of.EMD.with.loss.M2\n\n\npl.figu |
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1fae0 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 4d 44 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 5c 6e 70 6c 2e 6c 65 67 65 | .title('EMD.distances')\npl.lege |
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1fb20 | 20 22 63 65 6c 6c 5f 74 79 70 65 22 3a 20 22 6d 61 72 6b 64 6f 77 6e 22 2c 0a 20 20 20 20 20 20 | ."cell_type":."markdown",....... |
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1fbc0 | 6e 5c 6e 22 0a 20 20 20 20 20 20 5d 0a 20 20 20 20 7d 2c 0a 20 20 20 20 7b 0a 20 20 20 20 20 20 | n\n".......].....},.....{....... |
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23e80 | 81 4b eb 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6c 61 73 73 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 | .K...plot_otda_classes.ipynbPK.. |
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23ee0 | 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 77 6d 7d 4e 80 8e 14 e4 3b 18 00 00 3b 18 00 00 25 00 00 | bPK..........wm}N....;...;...%.. |
23f00 | 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 8c 14 01 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 | ...............plot_otda_mapping |
23f20 | 5f 63 6f 6c 6f 72 73 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 | _colors_images.ipynbPK.......... |
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23fc0 | 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 89 74 d9 4e 2a a3 88 70 7d 20 00 00 7d 20 00 00 19 00 00 00 | PK...........t.N*..p}...}....... |
23fe0 | 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 66 55 01 00 70 6c 6f 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 66 67 | ..........fU..plot_barycenter_fg |
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24040 | 76 73 5f 4c 32 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 2d 60 cb 4c f9 b0 b7 c4 b9 | vs_L2.ipynbPK..........-`.L..... |
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240c0 | 00 00 00 00 00 b4 81 1e af 01 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2e 69 70 | ...........plot_OT_2D_samples.ip |
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24160 | 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 | t_otda_mapping.ipynbPK.......... |
24180 | 2d 60 cb 4c e5 eb aa 89 7c 10 00 00 7c 10 00 00 16 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 3b ef | -`.L....|...|.................;. |
241a0 | 01 00 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6d 70 75 74 65 5f 65 6d 64 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 | ..plot_compute_emd.ipynbPK...... |
241c0 | 00 00 00 00 ec 45 43 4d 58 b0 17 7b e5 0e 00 00 e5 0e 00 00 23 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 | .....ECMX..{........#........... |
241e0 | b4 81 eb ff 01 00 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6e 76 6f 6c 75 74 69 6f 6e 61 6c 5f 62 61 72 79 63 65 6e | ......plot_convolutional_barycen |
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24240 | 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 31 44 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 77 | barycenter_1D.ipynbPK..........w |
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24280 | 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 69 70 79 6e 62 50 4b 05 | .plot_otda_color_images.ipynbPK. |
242a0 | 06 00 00 00 00 19 00 19 00 e2 06 00 00 bb 3b 02 00 00 00 | ..............;.... |