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1960 | 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0d 0a 66 72 6f 6d 20 73 6b 6c 65 61 72 6e 20 69 6d 70 6f 72 | .pylab.as.pl..from.sklearn.impor |
1980 | 74 20 6d 61 6e 69 66 6f 6c 64 0d 0a 66 72 6f 6d 20 73 6b 6c 65 61 72 6e 2e 64 65 63 6f 6d 70 6f | t.manifold..from.sklearn.decompo |
19a0 | 73 69 74 69 6f 6e 20 69 6d 70 6f 72 74 20 50 43 41 0d 0a 0d 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0d 0a | sition.import.PCA....import.ot.. |
19c0 | 0d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ..############################## |
19e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
1a00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0d 0a 23 20 53 6d 61 63 6f 66 20 4d 44 53 0d 0a | ################..#.Smacof.MDS.. |
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1aa0 | 20 6f 75 74 70 75 74 20 6f 66 20 74 68 65 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 0d 0a 0d 0a 0d 0a 64 65 | .output.of.the.algorithm......de |
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1ae0 | 30 30 2c 20 65 70 73 3d 31 65 2d 39 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 22 22 22 0d 0a 20 20 20 20 52 65 74 | 00,.eps=1e-9):......"""......Ret |
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1be0 | 20 6e 73 29 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 64 69 73 73 69 6d 69 6c 61 72 69 74 79 20 6d 61 74 72 | .ns)..........dissimilarity.matr |
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1d00 | 20 20 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 20 20 20 20 6e 70 6f 73 20 3a 20 6e 64 61 72 72 61 79 2c 20 | ...-------......npos.:.ndarray,. |
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1e20 | 2d 39 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 64 69 73 73 69 6d 69 6c 61 72 69 74 79 3d 27 70 72 65 63 | -9,..........dissimilarity='prec |
1e40 | 6f 6d 70 75 74 65 64 27 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 5f 69 6e 69 74 3d 31 29 0d 0a 20 20 | omputed',..........n_init=1).... |
1e60 | 20 20 70 6f 73 20 3d 20 6d 64 73 2e 66 69 74 28 43 29 2e 65 6d 62 65 64 64 69 6e 67 5f 0d 0a 0d | ..pos.=.mds.fit(C).embedding_... |
1e80 | 0a 20 20 20 20 6e 6d 64 73 20 3d 20 6d 61 6e 69 66 6f 6c 64 2e 4d 44 53 28 0d 0a 20 20 20 20 20 | .....nmds.=.manifold.MDS(....... |
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1ec0 | 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 65 70 73 3d 31 65 2d 39 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 64 69 | ,..........eps=1e-9,..........di |
1ee0 | 73 73 69 6d 69 6c 61 72 69 74 79 3d 22 70 72 65 63 6f 6d 70 75 74 65 64 22 2c 0d 0a 20 20 20 20 | ssimilarity="precomputed",...... |
1f00 | 20 20 20 20 72 61 6e 64 6f 6d 5f 73 74 61 74 65 3d 72 6e 67 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 6e | ....random_state=rng,..........n |
1f20 | 5f 69 6e 69 74 3d 31 29 0d 0a 20 20 20 20 6e 70 6f 73 20 3d 20 6e 6d 64 73 2e 66 69 74 5f 74 72 | _init=1)......npos.=.nmds.fit_tr |
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1f60 | 72 6e 20 6e 70 6f 73 0d 0a 0d 0a 0d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | rn.npos......################### |
1f80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
1fa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0d 0a 23 20 44 | ###########################..#.D |
1fc0 | 61 74 61 20 70 72 65 70 61 72 61 74 69 6f 6e 0d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ata.preparation..#.------------- |
1fe0 | 2d 2d 2d 0d 0a 23 0d 0a 23 20 54 68 65 20 66 6f 75 72 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 | ---..#..#.The.four.distributions |
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2060 | 6f 6e 65 20 70 69 78 65 6c 20 70 65 72 20 6c 69 6e 65 29 22 22 22 0d 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 | one.pixel.per.line)"""......retu |
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21a0 | 0d 0a 73 74 61 72 20 3d 20 73 70 69 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 73 74 61 | ..star.=.spi.imread('../data/sta |
21c0 | 72 2e 70 6e 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5b 3a 2c 20 3a 2c | r.png').astype(np.float64)[:,.:, |
21e0 | 20 32 5d 20 2f 20 32 35 36 0d 0a 0d 0a 73 68 61 70 65 73 20 3d 20 5b 73 71 75 61 72 65 2c 20 63 | .2]./.256....shapes.=.[square,.c |
2200 | 72 6f 73 73 2c 20 74 72 69 61 6e 67 6c 65 2c 20 73 74 61 72 5d 0d 0a 0d 0a 53 20 3d 20 34 0d 0a | ross,.triangle,.star]....S.=.4.. |
2220 | 78 73 20 3d 20 5b 5b 5d 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 0d 0a 0d 0a 0d | xs.=.[[].for.i.in.range(S)]..... |
2240 | 0a 66 6f 72 20 6e 62 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 34 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 66 6f 72 20 69 20 | .for.nb.in.range(4):......for.i. |
2260 | 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 38 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 66 6f 72 20 6a 20 69 6e 20 72 | in.range(8):..........for.j.in.r |
2280 | 61 6e 67 65 28 38 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 73 68 61 70 65 73 5b | ange(8):..............if.shapes[ |
22a0 | 6e 62 5d 5b 69 2c 20 6a 5d 20 3c 20 30 2e 39 35 3a 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | nb][i,.j].<.0.95:............... |
22c0 | 20 20 20 78 73 5b 6e 62 5d 2e 61 70 70 65 6e 64 28 5b 6a 2c 20 38 20 2d 20 69 5d 29 0d 0a 0d 0a | ...xs[nb].append([j,.8.-.i]).... |
22e0 | 78 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 30 5d 29 2c 20 | xs.=.np.array([np.array(xs[0]),. |
2300 | 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 31 5d 29 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | np.array(xs[1]),................ |
2320 | 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 32 5d 29 2c 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 33 5d | .np.array(xs[2]),.np.array(xs[3] |
2340 | 29 5d 29 0d 0a 0d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | )])....######################### |
2360 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
2380 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0d 0a 23 20 42 61 72 79 63 65 6e | #####################..#.Barycen |
23a0 | 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 0d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ter.computation..#.------------- |
23c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 0d 0a 0d 0a 6e 73 20 3d 20 5b 6c 65 6e 28 78 73 5b 73 5d 29 20 | ---------......ns.=.[len(xs[s]). |
23e0 | 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 0d 0a 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 | for.s.in.range(S)]..n_samples.=. |
2400 | 33 30 0d 0a 0d 0a 22 22 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 61 6c 6c 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 20 6d | 30...."""Compute.all.distances.m |
2420 | 61 74 72 69 63 65 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 66 6f 75 72 20 73 68 61 70 65 73 22 22 22 0d 0a | atrices.for.the.four.shapes""".. |
2440 | 43 73 20 3d 20 5b 73 70 2e 73 70 61 74 69 61 6c 2e 64 69 73 74 61 6e 63 65 2e 63 64 69 73 74 28 | Cs.=.[sp.spatial.distance.cdist( |
2460 | 78 73 5b 73 5d 2c 20 78 73 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d | xs[s],.xs[s]).for.s.in.range(S)] |
2480 | 0d 0a 43 73 20 3d 20 5b 63 73 20 2f 20 63 73 2e 6d 61 78 28 29 20 66 6f 72 20 63 73 20 69 6e 20 | ..Cs.=.[cs./.cs.max().for.cs.in. |
24a0 | 43 73 5d 0d 0a 0d 0a 70 73 20 3d 20 5b 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 73 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 | Cs]....ps.=.[ot.unif(ns[s]).for. |
24c0 | 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 0d 0a 70 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 73 61 | s.in.range(S)]..p.=.ot.unif(n_sa |
24e0 | 6d 70 6c 65 73 29 0d 0a 0d 0a 0d 0a 6c 61 6d 62 64 61 73 74 20 3d 20 5b 5b 66 6c 6f 61 74 28 69 | mples)......lambdast.=.[[float(i |
2500 | 29 20 2f 20 33 2c 20 66 6c 6f 61 74 28 33 20 2d 20 69 29 20 2f 20 33 5d 20 66 6f 72 20 69 20 69 | )./.3,.float(3.-.i)./.3].for.i.i |
2520 | 6e 20 5b 31 2c 20 32 5d 5d 0d 0a 0d 0a 43 74 30 31 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 | n.[1,.2]]....Ct01.=.[0.for.i.in. |
2540 | 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 0d 0a 20 | range(2)]..for.i.in.range(2):... |
2560 | 20 20 20 43 74 30 31 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 | ...Ct01[i].=.ot.gromov.gromov_ba |
2580 | 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 5b 43 73 5b 30 5d 2c 20 43 73 5b | rycenters(n_samples,.[Cs[0],.Cs[ |
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25c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b 30 5d 2c 20 70 73 5b 31 5d 0d 0a | .................[ps[0],.ps[1].. |
25e0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
2600 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 | ............],.p,.lambdast[i],.' |
2620 | 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 20 23 20 35 65 2d 34 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 | square_loss',..#.5e-4,.......... |
2640 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
2660 | 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 0d 0a 0d 0a 43 74 | ...max_iter=100,.tol=1e-3)....Ct |
2680 | 30 32 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f 72 20 | 02.=.[0.for.i.in.range(2)]..for. |
26a0 | 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 43 74 30 32 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 | i.in.range(2):......Ct02[i].=.ot |
26c0 | 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 6d | .gromov.gromov_barycenters(n_sam |
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2700 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
2720 | 20 20 5b 70 73 5b 30 5d 2c 20 70 73 5b 32 5d 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ..[ps[0],.ps[2]................. |
2740 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 | .............................],. |
2760 | 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 20 | p,.lambdast[i],.'square_loss',.. |
2780 | 23 20 35 65 2d 34 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | #.5e-4,......................... |
27a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 | ....................max_iter=100 |
27c0 | 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 0d 0a 0d 0a 43 74 31 33 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 | ,.tol=1e-3)....Ct13.=.[0.for.i.i |
27e0 | 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 0d | n.range(2)]..for.i.in.range(2):. |
2800 | 0a 20 20 20 20 43 74 31 33 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f | .....Ct13[i].=.ot.gromov.gromov_ |
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2840 | 73 5b 33 5d 5d 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | s[3]],.......................... |
2860 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b 31 5d 2c 20 70 73 5b 33 5d | ...................[ps[1],.ps[3] |
2880 | 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
28a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c | ..............],.p,.lambdast[i], |
28c0 | 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 20 23 20 35 65 2d 34 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 | .'square_loss',..#.5e-4,........ |
28e0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
2900 | 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 0d 0a 0d 0a | .....max_iter=100,.tol=1e-3).... |
2920 | 43 74 32 33 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f | Ct23.=.[0.for.i.in.range(2)]..fo |
2940 | 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 43 74 32 33 5b 69 5d 20 3d 20 | r.i.in.range(2):......Ct23[i].=. |
2960 | 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 | ot.gromov.gromov_barycenters(n_s |
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29a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
29c0 | 20 20 20 20 5b 70 73 5b 32 5d 2c 20 70 73 5b 33 5d 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ....[ps[2],.ps[3]............... |
29e0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d | ...............................] |
2a00 | 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c | ,.p,.lambdast[i],.'square_loss', |
2a20 | 20 20 23 20 35 65 2d 34 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ..#.5e-4,....................... |
2a40 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 | ......................max_iter=1 |
2a60 | 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 0d 0a 0d 0a 0d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | 00,.tol=1e-3)......############# |
2a80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
2aa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
2ac0 | 23 0d 0a 23 20 56 69 73 75 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 0d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | #..#.Visualization..#.---------- |
2ae0 | 2d 2d 2d 0d 0a 23 0d 0a 23 20 54 68 65 20 50 43 41 20 68 65 6c 70 73 20 69 6e 20 67 65 74 74 69 | ---..#..#.The.PCA.helps.in.getti |
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2b20 | 69 6f 6e 73 0d 0a 0d 0a 0d 0a 63 6c 66 20 3d 20 50 43 41 28 6e 5f 63 6f 6d 70 6f 6e 65 6e 74 73 | ions......clf.=.PCA(n_components |
2b40 | 3d 32 29 0d 0a 6e 70 6f 73 20 3d 20 5b 30 2c 20 30 2c 20 30 2c 20 30 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 20 3d | =2)..npos.=.[0,.0,.0,.0]..npos.= |
2b60 | 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 73 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 | .[smacof_mds(Cs[s],.2).for.s.in. |
2b80 | 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 0d 0a 0d 0a 6e 70 6f 73 74 30 31 20 3d 20 5b 30 2c 20 30 5d 0d 0a 6e | range(S)]....npost01.=.[0,.0]..n |
2ba0 | 70 6f 73 74 30 31 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 74 30 31 5b 73 5d 2c 20 32 29 | post01.=.[smacof_mds(Ct01[s],.2) |
2bc0 | 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 30 31 20 3d 20 5b | .for.s.in.range(2)]..npost01.=.[ |
2be0 | 63 6c 66 2e 66 69 74 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 6e 70 6f 73 74 30 31 5b 73 5d 29 20 66 6f | clf.fit_transform(npost01[s]).fo |
2c00 | 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 0d 0a 6e 70 6f 73 74 30 32 20 3d 20 5b 30 | r.s.in.range(2)]....npost02.=.[0 |
2c20 | 2c 20 30 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 30 32 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 74 30 32 | ,.0]..npost02.=.[smacof_mds(Ct02 |
2c40 | 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 | [s],.2).for.s.in.range(2)]..npos |
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2c80 | 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 0d 0a 6e 70 6f 73 74 | [s]).for.s.in.range(2)]....npost |
2ca0 | 31 33 20 3d 20 5b 30 2c 20 30 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 31 33 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d | 13.=.[0,.0]..npost13.=.[smacof_m |
2cc0 | 64 73 28 43 74 31 33 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 | ds(Ct13[s],.2).for.s.in.range(2) |
2ce0 | 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 31 33 20 3d 20 5b 63 6c 66 2e 66 69 74 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 | ]..npost13.=.[clf.fit_transform( |
2d00 | 6e 70 6f 73 74 31 33 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a | npost13[s]).for.s.in.range(2)].. |
2d20 | 0d 0a 6e 70 6f 73 74 32 33 20 3d 20 5b 30 2c 20 30 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 32 33 20 3d 20 5b 73 | ..npost23.=.[0,.0]..npost23.=.[s |
2d40 | 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 74 32 33 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 | macof_mds(Ct23[s],.2).for.s.in.r |
2d60 | 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 32 33 20 3d 20 5b 63 6c 66 2e 66 69 74 5f 74 72 61 | ange(2)]..npost23.=.[clf.fit_tra |
2d80 | 6e 73 66 6f 72 6d 28 6e 70 6f 73 74 32 33 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 | nsform(npost23[s]).for.s.in.rang |
2da0 | 65 28 32 29 5d 0d 0a 0d 0a 0d 0a 66 69 67 20 3d 20 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 66 69 67 73 69 | e(2)]......fig.=.pl.figure(figsi |
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2e00 | 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 31 2e 73 | -1,.1))..pl.ylim((-1,.1))..ax1.s |
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2f40 | 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 30 31 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 | .0],.npost01[0][:,.1],.color='b' |
2f60 | 29 0d 0a 0d 0a 61 78 34 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 | )....ax4.=.pl.subplot2grid((4,.4 |
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2fa0 | 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 34 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 | .ylim((-1,.1))..ax4.scatter(npos |
2fc0 | 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d | [1][:,.0],.npos[1][:,.1],.color= |
2fe0 | 27 72 27 29 0d 0a 0d 0a 61 78 35 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 | 'r')....ax5.=.pl.subplot2grid((4 |
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3020 | 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 35 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e | .pl.ylim((-1,.1))..ax5.scatter(n |
3040 | 70 6f 73 74 30 32 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 30 32 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 31 | post02[1][:,.0],.npost02[1][:,.1 |
3060 | 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 0d 0a 0d 0a 61 78 36 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | ],.color='b')....ax6.=.pl.subplo |
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30a0 | 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 36 2e | (-1,.1))..pl.ylim((-1,.1))..ax6. |
30c0 | 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 31 33 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 31 | scatter(npost13[1][:,.0],.npost1 |
30e0 | 33 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 0d 0a 0d 0a 61 78 37 20 3d 20 | 3[1][:,.1],.color='b')....ax7.=. |
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3120 | 0a 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 | .pl.xlim((-1,.1))..pl.ylim((-1,. |
3140 | 31 29 29 0d 0a 61 78 37 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 30 32 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 30 | 1))..ax7.scatter(npost02[0][:,.0 |
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3180 | 0a 0d 0a 61 78 38 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c | ...ax8.=.pl.subplot2grid((4,.4), |
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31c0 | 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 38 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 31 | lim((-1,.1))..ax8.scatter(npost1 |
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3220 | 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 33 2c 20 30 29 29 0d 0a 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 | d((4,.4),.(3,.0))..pl.xlim((-1,. |
3240 | 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 39 2e 73 63 61 74 74 | 1))..pl.ylim((-1,.1))..ax9.scatt |
3260 | 65 72 28 6e 70 6f 73 5b 32 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 5b 32 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c | er(npos[2][:,.0],.npos[2][:,.1], |
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32c0 | 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 31 30 2e | -1,.1))..pl.ylim((-1,.1))..ax10. |
32e0 | 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 32 33 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 32 | scatter(npost23[1][:,.0],.npost2 |
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34c0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 49 | =============================..I |
34e0 | 6c 6c 75 73 74 72 61 74 65 73 20 74 68 65 20 75 73 65 20 6f 66 20 74 68 65 20 67 65 6e 65 72 69 | llustrates.the.use.of.the.generi |
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35a0 | 35 5d 5b 37 5d 2e 0a 0a 0a 5b 35 5d 20 4e 2e 20 43 6f 75 72 74 79 3b 20 52 2e 20 46 6c 61 6d 61 | 5][7]....[5].N..Courty;.R..Flama |
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3a80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
3aa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c | ##########################.#.Sol |
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3b00 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 45 78 | ------------------------..#%%.Ex |
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3de0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
3e00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 | ########################.#.Solve |
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42c0 | 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 2e 70 6c 6f 74 0a | .as.pl.import.ot.import.ot.plot. |
42e0 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
4300 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
4320 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 67 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a | ###############.#.generate.data. |
4340 | 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 73 6f 75 72 63 | #.-------------..n_samples_sourc |
4360 | 65 20 3d 20 31 35 30 0a 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 31 35 30 0a 0a | e.=.150.n_samples_target.=.150.. |
4380 | 58 73 2c 20 79 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 64 61 74 61 5f 63 | Xs,.ys.=.ot.datasets.make_data_c |
43a0 | 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 27 2c 20 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 73 6f 75 72 63 | lassif('3gauss',.n_samples_sourc |
43c0 | 65 29 0a 58 74 2c 20 79 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 64 61 74 | e).Xt,.yt.=.ot.datasets.make_dat |
43e0 | 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 32 27 2c 20 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 74 | a_classif('3gauss2',.n_samples_t |
4400 | 61 72 67 65 74 29 0a 0a 23 20 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 | arget)..#.Cost.matrix.M.=.ot.dis |
4420 | 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a | t(Xs,.Xt,.metric='sqeuclidean'). |
4440 | 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ..############################## |
4460 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
4480 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 | ################.#.Instantiate.t |
44a0 | 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d | he.different.transport.algorithm |
44c0 | 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | s.and.fit.them.#.--------------- |
44e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
4500 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 45 4d 44 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 | ------------..#.EMD.Transport.ot |
4520 | 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 0a 6f 74 5f 65 | _emd.=.ot.da.EMDTransport().ot_e |
4540 | 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e | md.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)..#.Sinkhorn |
4560 | 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 | .Transport.ot_sinkhorn.=.ot.da.S |
4580 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 0a 6f 74 5f | inkhornTransport(reg_e=1e-1).ot_ |
45a0 | 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 53 69 | sinkhorn.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)..#.Si |
45c0 | 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 | nkhorn.Transport.with.Group.lass |
45e0 | 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 6f 74 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 | o.regularization.ot_lpl1.=.ot.da |
4600 | 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d | .SinkhornLpl1Transport(reg_e=1e- |
4620 | 31 2c 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 31 65 30 29 0a 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 | 1,.reg_cl=1e0).ot_lpl1.fit(Xs=Xs |
4640 | 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 73 6f 75 | ,.ys=ys,.Xt=Xt)..#.transport.sou |
4660 | 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6f 6e 74 6f 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a | rce.samples.onto.target.samples. |
4680 | 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d | transp_Xs_emd.=.ot_emd.transform |
46a0 | 28 58 73 3d 58 73 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f | (Xs=Xs).transp_Xs_sinkhorn.=.ot_ |
46c0 | 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 74 72 61 6e 73 70 | sinkhorn.transform(Xs=Xs).transp |
46e0 | 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d | _Xs_lpl1.=.ot_lpl1.transform(Xs= |
4700 | 58 73 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | Xs)...########################## |
4720 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
4740 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 | ####################.#.Fig.1.:.p |
4760 | 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 2b | lots.source.and.target.samples.+ |
4780 | 20 6d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 0a 23 20 2d | .matrix.of.pairwise.distance.#.- |
47a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
47c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
47e0 | 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 | ----..pl.figure(1,.figsize=(10,. |
4800 | 31 30 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 | 10)).pl.subplot(2,.2,.1).pl.scat |
4820 | 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 | ter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.ma |
4840 | 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 | rker='+',.label='Source.samples' |
4860 | 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c | ).pl.xticks([]).pl.yticks([]).pl |
4880 | 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 | .legend(loc=0).pl.title('Source. |
48a0 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 0a | .samples')..pl.subplot(2,.2,.2). |
48c0 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 | pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c |
48e0 | 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 | =yt,.marker='o',.label='Target.s |
4900 | 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 | amples').pl.xticks([]).pl.yticks |
4920 | 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | ([]).pl.legend(loc=0).pl.title(' |
4940 | 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 | Target.samples')..pl.subplot(2,. |
4960 | 32 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e | 2,.3).pl.imshow(M,.interpolation |
4980 | 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 | ='nearest').pl.xticks([]).pl.yti |
49a0 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 | cks([]).pl.title('Matrix.of.pair |
49c0 | 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 | wise.distances').pl.tight_layout |
49e0 | 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ()...########################### |
4a00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
4a20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c | ###################.#.Fig.2.:.pl |
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4a60 | 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | fferent.methods.#.-------------- |
4a80 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
4aa0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 | -----------.pl.figure(2,.figsize |
4ac0 | 3d 28 31 30 2c 20 36 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 70 | =(10,.6))..pl.subplot(2,.3,.1).p |
4ae0 | 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 | l.imshow(ot_emd.coupling_,.inter |
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4b20 | 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 | ).pl.yticks([]).pl.title('Optima |
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4c60 | 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 | title('Optimal.coupling\nSinkhor |
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5080 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
50a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 | ###########################.#.Fi |
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5c00 | 61 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 0a 23 20 6f 66 20 63 6c 61 73 73 20 41 20 6f 6e 74 | a.source.sample.#.of.class.A.ont |
5c20 | 6f 20 61 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 20 6f 66 20 63 6c 61 73 73 20 42 20 21 3d 20 | o.a.target.sample.of.class.B.!=. |
5c40 | 41 20 69 73 20 73 65 74 20 74 6f 20 69 6e 66 69 6e 69 74 65 2c 20 6f 72 20 61 0a 23 20 76 65 72 | A.is.set.to.infinite,.or.a.#.ver |
5c60 | 79 20 6c 61 72 67 65 20 76 61 6c 75 65 0a 0a 23 20 6e 6f 74 65 20 74 68 61 74 20 69 6e 20 74 68 | y.large.value..#.note.that.in.th |
5c80 | 65 20 70 72 65 73 65 6e 74 20 63 61 73 65 20 77 65 20 63 6f 6e 73 69 64 65 72 20 74 68 61 74 20 | e.present.case.we.consider.that. |
5ca0 | 61 6c 6c 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 61 72 65 0a 23 20 6c 61 62 | all.the.target.samples.are.#.lab |
5cc0 | 65 6c 65 64 2e 20 46 6f 72 20 64 61 69 6c 79 20 61 70 70 6c 69 63 61 74 69 6f 6e 73 2c 20 73 6f | eled..For.daily.applications,.so |
5ce0 | 6d 65 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 20 6d 69 67 68 74 20 6e 6f 74 20 68 61 76 65 20 | me.target.sample.might.not.have. |
5d00 | 6c 61 62 65 6c 73 2c 0a 23 20 69 6e 20 74 68 69 73 20 63 61 73 65 20 74 68 65 20 65 6c 65 6d 65 | labels,.#.in.this.case.the.eleme |
5d20 | 6e 74 20 6f 66 20 79 74 20 63 6f 72 72 65 73 70 6f 6e 64 69 6e 67 20 74 6f 20 74 68 65 73 65 20 | nt.of.yt.corresponding.to.these. |
5d40 | 73 61 6d 70 6c 65 73 20 73 68 6f 75 6c 64 20 62 65 0a 23 20 66 69 6c 6c 65 64 20 77 69 74 68 20 | samples.should.be.#.filled.with. |
5d60 | 2d 31 2e 0a 0a 23 20 57 61 72 6e 69 6e 67 3a 20 77 65 20 72 65 63 61 6c 6c 20 74 68 61 74 20 2d | -1...#.Warning:.we.recall.that.- |
5d80 | 31 20 63 61 6e 6e 6f 74 20 62 65 20 75 73 65 64 20 61 73 20 61 20 63 6c 61 73 73 20 6c 61 62 65 | 1.cannot.be.used.as.a.class.labe |
5da0 | 6c 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | l...############################ |
5dc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
5de0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f | ##################.#.Fig.1.:.plo |
5e00 | 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 2b 20 6d | ts.source.and.target.samples.+.m |
5e20 | 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 0a 23 20 2d 2d 2d | atrix.of.pairwise.distance.#.--- |
5e40 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
5e60 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
5e80 | 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 31 30 | --..pl.figure(1,.figsize=(10,.10 |
5ea0 | 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 | )).pl.subplot(2,.2,.1).pl.scatte |
5ec0 | 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b | r(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.mark |
5ee0 | 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a | er='+',.label='Source.samples'). |
5f00 | 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 6c | pl.xticks([]).pl.yticks([]).pl.l |
5f20 | 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 | egend(loc=0).pl.title('Source..s |
5f40 | 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c | amples')..pl.subplot(2,.2,.2).pl |
5f60 | 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 | .scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=y |
5f80 | 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d | t,.marker='o',.label='Target.sam |
5fa0 | 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b | ples').pl.xticks([]).pl.yticks([ |
5fc0 | 5d 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 | ]).pl.legend(loc=0).pl.title('Ta |
5fe0 | 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c | rget.samples')..pl.subplot(2,.2, |
6000 | 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 2e 63 6f 73 | .3).pl.imshow(ot_sinkhorn_un.cos |
6020 | 74 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e | t_,.interpolation='nearest').pl. |
6040 | 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | xticks([]).pl.yticks([]).pl.titl |
6060 | 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 75 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 | e('Cost.matrix.-.unsupervised.DA |
6080 | 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f | ')..pl.subplot(2,.2,.4).pl.imsho |
60a0 | 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 63 6f 73 74 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 | w(ot_sinkhorn_semi.cost_,.interp |
60c0 | 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 | olation='nearest').pl.xticks([]) |
60e0 | 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 | .pl.yticks([]).pl.title('Cost.ma |
6100 | 74 72 69 78 20 2d 20 73 65 6d 69 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 0a 0a 70 6c 2e 74 | trix.-.semisupervised.DA')..pl.t |
6120 | 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 23 20 74 68 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 | ight_layout()..#.the.optimal.cou |
6140 | 70 6c 69 6e 67 20 69 6e 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 2d 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 20 | pling.in.the.semi-supervised.DA. |
6160 | 63 61 73 65 20 77 69 6c 6c 20 65 78 68 69 62 69 74 20 22 20 73 68 61 70 65 0a 23 20 73 69 6d 69 | case.will.exhibit.".shape.#.simi |
6180 | 6c 61 72 22 20 74 6f 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 2c 20 28 62 6c 6f 63 6b 20 | lar".to.the.cost.matrix,.(block. |
61a0 | 64 69 61 67 6f 6e 61 6c 20 6d 61 74 72 69 78 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | diagonal.matrix)...############# |
61c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
61e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6200 | 23 0a 23 20 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 | #.#.Fig.2.:.plots.optimal.coupli |
6220 | 6e 67 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 0a 23 20 | ngs.for.the.different.methods.#. |
6240 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
6260 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 | -------------------------..pl.fi |
6280 | 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 | gure(2,.figsize=(8,.4))..pl.subp |
62a0 | 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f | lot(1,.2,.1).pl.imshow(ot_sinkho |
62c0 | 72 6e 5f 75 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 | rn_un.coupling_,.interpolation=' |
62e0 | 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b | nearest').pl.xticks([]).pl.ytick |
6300 | 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 | s([]).pl.title('Optimal.coupling |
6320 | 5c 6e 55 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | \nUnsupervised.DA')..pl.subplot( |
6340 | 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 | 1,.2,.2).pl.imshow(ot_sinkhorn_s |
6360 | 65 6d 69 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 | emi.coupling_,.interpolation='ne |
6380 | 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 | arest').pl.xticks([]).pl.yticks( |
63a0 | 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e | []).pl.title('Optimal.coupling\n |
63c0 | 53 65 6d 69 2d 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 0a 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c | Semi-supervised.DA')..pl.tight_l |
63e0 | 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ayout()...###################### |
6400 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
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6d20 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
6d40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6d60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e | ###############.#.Solve.Sinkhorn |
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6dc0 | 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 6c 61 6d 62 64 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 70 | a,.b,.M,.lambd,.verbose=True)..p |
6de0 | 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 | l.figure(4,.figsize=(5,.5)).ot.p |
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6e40 | 00 00 00 00 6a 70 1d 4d be 2f a4 12 3a 18 00 00 3a 18 00 00 12 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 73 74 6f | ....jp.M./..:...:.......plot_sto |
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6e80 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 53 74 6f 63 68 61 73 74 69 63 20 65 78 61 6d 70 6c 65 73 0a 3d 3d 3d | ========.Stochastic.examples.=== |
6ea0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 69 73 20 65 78 | =======================..This.ex |
6ec0 | 61 6d 70 6c 65 20 69 73 20 64 65 73 69 67 6e 65 64 20 74 6f 20 73 68 6f 77 20 68 6f 77 20 74 6f | ample.is.designed.to.show.how.to |
6ee0 | 20 75 73 65 20 74 68 65 20 73 74 6f 63 68 61 74 69 63 20 6f 70 74 69 6d 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a | .use.the.stochatic.optimization. |
6f00 | 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 73 20 66 6f 72 20 64 65 73 63 72 65 74 65 20 61 6e 64 20 73 65 6d 69 | algorithms.for.descrete.and.semi |
6f20 | 63 6f 6e 74 69 6e 6f 75 73 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 66 72 6f 6d 20 74 68 65 20 50 4f 54 20 | continous.measures.from.the.POT. |
6f40 | 6c 69 62 72 61 72 79 2e 0a 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 4b 69 6c 69 61 6e 20 | library..."""..#.Author:.Kilian. |
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6fe0 | 70 6c 6f 74 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | plot...######################### |
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7020 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 4f 4d 50 55 54 45 20 54 | ####################.#.COMPUTE.T |
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70a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 70 72 69 6e 74 28 22 | ########################.print(" |
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7100 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7120 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 44 49 53 43 | #########################.#.DISC |
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71a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 23 0a 23 20 44 65 66 69 6e 65 20 32 20 64 69 73 63 | --------------.#.#.Define.2.disc |
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7200 | 20 61 6e 64 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 61 6e 64 20 66 69 6e | .and.the.target.measures.and.fin |
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72e0 | 72 63 65 2c 20 32 29 0a 59 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 72 6e 67 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 5f 74 | rce,.2).Y_target.=.rng.randn(n_t |
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7320 | 59 5f 74 61 72 67 65 74 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | Y_target)..##################### |
7340 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7360 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 0a 23 20 43 61 6c | ########################.#.#.Cal |
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73e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 23 0a 23 20 44 65 | -------------------------.#.#.De |
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74c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 | ......................numItermax |
74e0 | 29 0a 70 72 69 6e 74 28 73 61 67 5f 70 69 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ).print(sag_pi)..############### |
7500 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7520 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 | ##############################.# |
7540 | 20 53 45 4d 49 43 4f 4e 54 49 4e 4f 55 53 20 43 41 53 45 0a 23 20 53 61 6d 70 6c 65 20 6f 6e 65 | .SEMICONTINOUS.CASE.#.Sample.one |
7560 | 20 67 65 6e 65 72 61 6c 20 6d 65 61 73 75 72 65 20 61 2c 20 6f 6e 65 20 64 69 73 63 72 65 74 65 | .general.measure.a,.one.discrete |
7580 | 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 62 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 63 6f 6e 74 69 6e 6f 75 | .measures.b.for.the.semicontinou |
75a0 | 73 0a 23 20 63 61 73 65 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | s.#.case.#.--------------------- |
75c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 23 0a 23 20 44 65 66 | ------------------------.#.#.Def |
75e0 | 69 6e 65 20 6f 6e 65 20 67 65 6e 65 72 61 6c 20 6d 65 61 73 75 72 65 20 61 2c 20 6f 6e 65 20 64 | ine.one.general.measure.a,.one.d |
7600 | 69 73 63 72 65 74 65 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 62 2c 20 74 68 65 20 70 6f 69 6e 74 73 20 77 | iscrete.measures.b,.the.points.w |
7620 | 68 65 72 65 0a 23 20 61 72 65 20 64 65 66 69 6e 65 64 20 74 68 65 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e | here.#.are.defined.the.source.an |
7640 | 64 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 61 6e 64 20 66 69 6e 61 6c 6c | d.the.target.measures.and.finall |
7660 | 79 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 63 2e 0a 0a 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 20 3d | y.the.cost.matrix.c...n_source.= |
7680 | 20 37 0a 6e 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 34 0a 72 65 67 20 3d 20 31 0a 6e 75 6d 49 74 65 72 6d | .7.n_target.=.4.reg.=.1.numIterm |
76a0 | 61 78 20 3d 20 31 30 30 30 0a 6c 6f 67 20 3d 20 54 72 75 65 0a 0a 61 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 | ax.=.1000.log.=.True..a.=.ot.uti |
76c0 | 6c 73 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 29 0a 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 75 | ls.unif(n_source).b.=.ot.utils.u |
76e0 | 6e 69 66 28 6e 5f 74 61 72 67 65 74 29 0a 0a 72 6e 67 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 52 | nif(n_target)..rng.=.np.random.R |
7700 | 61 6e 64 6f 6d 53 74 61 74 65 28 30 29 0a 58 5f 73 6f 75 72 63 65 20 3d 20 72 6e 67 2e 72 61 6e | andomState(0).X_source.=.rng.ran |
7720 | 64 6e 28 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 2c 20 32 29 0a 59 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 72 6e 67 2e 72 | dn(n_source,.2).Y_target.=.rng.r |
7740 | 61 6e 64 6e 28 6e 5f 74 61 72 67 65 74 2c 20 32 29 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 58 5f | andn(n_target,.2).M.=.ot.dist(X_ |
7760 | 73 6f 75 72 63 65 2c 20 59 5f 74 61 72 67 65 74 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | source,.Y_target)..############# |
7780 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
77a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
77c0 | 0a 23 0a 23 20 43 61 6c 6c 20 74 68 65 20 22 41 53 47 44 22 20 6d 65 74 68 6f 64 20 74 6f 20 66 | .#.#.Call.the."ASGD".method.to.f |
77e0 | 69 6e 64 20 74 68 65 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 61 74 69 6f 6e 20 6d 61 74 72 69 78 20 69 6e | ind.the.transportation.matrix.in |
7800 | 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 63 6f 6e 74 69 6e 6f 75 73 0a 23 20 63 61 73 65 0a 23 20 2d 2d 2d 2d | .the.semicontinous.#.case.#.---- |
7820 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
7840 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 23 0a 23 20 44 65 66 69 6e 65 20 74 68 65 20 6d 65 74 68 6f 64 20 | ---------.#.#.Define.the.method. |
7860 | 22 41 53 47 44 22 2c 20 63 61 6c 6c 20 6f 74 2e 73 6f 6c 76 65 5f 73 65 6d 69 5f 64 75 61 6c 5f | "ASGD",.call.ot.solve_semi_dual_ |
7880 | 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 61 6e 64 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 0a 23 20 72 65 73 75 6c 74 73 2e | entropic.and.plot.the.#.results. |
78a0 | 0a 0a 6d 65 74 68 6f 64 20 3d 20 22 41 53 47 44 22 0a 61 73 67 64 5f 70 69 2c 20 6c 6f 67 5f 61 | ..method.=."ASGD".asgd_pi,.log_a |
78c0 | 73 67 64 20 3d 20 6f 74 2e 73 74 6f 63 68 61 73 74 69 63 2e 73 6f 6c 76 65 5f 73 65 6d 69 5f 64 | sgd.=.ot.stochastic.solve_semi_d |
78e0 | 75 61 6c 5f 65 6e 74 72 6f 70 69 63 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 6d 65 74 68 6f | ual_entropic(a,.b,.M,.reg,.metho |
7900 | 64 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | d,.............................. |
7920 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 75 | ..............................nu |
7940 | 6d 49 74 65 72 6d 61 78 2c 20 6c 6f 67 3d 6c 6f 67 29 0a 70 72 69 6e 74 28 6c 6f 67 5f 61 73 67 | mItermax,.log=log).print(log_asg |
7960 | 64 5b 27 61 6c 70 68 61 27 5d 2c 20 6c 6f 67 5f 61 73 67 64 5b 27 62 65 74 61 27 5d 29 0a 70 72 | d['alpha'],.log_asgd['beta']).pr |
7980 | 69 6e 74 28 61 73 67 64 5f 70 69 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | int(asgd_pi)..################## |
79a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
79c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 0a 23 20 | ###########################.#.#. |
79e0 | 43 6f 6d 70 61 72 65 20 74 68 65 20 72 65 73 75 6c 74 73 20 77 69 74 68 20 74 68 65 20 53 69 6e | Compare.the.results.with.the.Sin |
7a00 | 6b 68 6f 72 6e 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | khorn.algorithm.#.-------------- |
7a20 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a | -------------------------------. |
7a40 | 23 0a 23 20 43 61 6c 6c 20 74 68 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 20 | #.#.Call.the.Sinkhorn.algorithm. |
7a60 | 66 72 6f 6d 20 50 4f 54 0a 0a 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 70 69 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 | from.POT..sinkhorn_pi.=.ot.sinkh |
7a80 | 6f 72 6e 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 29 0a 70 72 69 6e 74 28 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e | orn(a,.b,.M,.reg).print(sinkhorn |
7aa0 | 5f 70 69 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | _pi)...######################### |
7ac0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7ae0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 4c 4f 54 20 54 52 41 | #####################.#.PLOT.TRA |
7b00 | 4e 53 50 4f 52 54 41 54 49 4f 4e 20 4d 41 54 52 49 58 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | NSPORTATION.MATRIX.############# |
7b20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7b40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7b60 | 23 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | #..############################# |
7b80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7ba0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 53 41 47 20 72 65 73 | #################.#.Plot.SAG.res |
7bc0 | 75 6c 74 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 | ults.#.----------------..pl.figu |
7be0 | 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c | re(4,.figsize=(5,.5)).ot.plot.pl |
7c00 | 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 73 61 67 5f 70 69 2c 20 27 73 65 6d 69 2d 64 75 61 | ot1D_mat(a,.b,.sag_pi,.'semi-dua |
7c20 | 6c 20 3a 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 41 47 27 29 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 0a 0a | l.:.OT.matrix.SAG').pl.show()... |
7c40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7c60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7c80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 41 53 47 44 20 72 65 73 75 6c | ##############.#.Plot.ASGD.resul |
7ca0 | 74 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 | ts.#.-----------------..pl.figur |
7cc0 | 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f | e(4,.figsize=(5,.5)).ot.plot.plo |
7ce0 | 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 61 73 67 64 5f 70 69 2c 20 27 73 65 6d 69 2d 64 75 61 | t1D_mat(a,.b,.asgd_pi,.'semi-dua |
7d00 | 6c 20 3a 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 41 53 47 44 27 29 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 0a | l.:.OT.matrix.ASGD').pl.show().. |
7d20 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
7d40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7d60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 | ###############.#.Plot.Sinkhorn. |
7d80 | 72 65 73 75 6c 74 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a | results.#.---------------------. |
7da0 | 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 | .pl.figure(4,.figsize=(5,.5)).ot |
7dc0 | 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f | .plot.plot1D_mat(a,.b,.sinkhorn_ |
7de0 | 70 69 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 0a 70 6c 2e 73 68 6f | pi,.'OT.matrix.Sinkhorn').pl.sho |
7e00 | 77 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | w()...########################## |
7e20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7e40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 4f 4d 50 55 54 45 20 54 52 | ###################.#.COMPUTE.TR |
7e60 | 41 4e 53 50 4f 52 54 41 54 49 4f 4e 20 4d 41 54 52 49 58 20 46 4f 52 20 44 55 41 4c 20 50 52 4f | ANSPORTATION.MATRIX.FOR.DUAL.PRO |
7e80 | 42 4c 45 4d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | BLEM.########################### |
7ea0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7ec0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 70 72 69 6e 74 28 22 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ##################.print("------ |
7ee0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 44 55 41 4c 20 50 52 4f 42 4c 45 4d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 22 29 | ------DUAL.PROBLEM------------") |
7f00 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
7f20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7f40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 45 4d 49 43 4f 4e 54 49 4e 4f 55 53 20 43 | ##############.#.SEMICONTINOUS.C |
7f60 | 41 53 45 0a 23 20 53 61 6d 70 6c 65 20 6f 6e 65 20 67 65 6e 65 72 61 6c 20 6d 65 61 73 75 72 65 | ASE.#.Sample.one.general.measure |
7f80 | 20 61 2c 20 6f 6e 65 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 62 20 66 6f 72 20 | .a,.one.discrete.measures.b.for. |
7fa0 | 74 68 65 20 73 65 6d 69 63 6f 6e 74 69 6e 6f 75 73 0a 23 20 63 61 73 65 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d | the.semicontinous.#.case.#.----- |
7fc0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
7fe0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 23 0a 23 20 44 65 66 69 6e 65 20 6f 6e 65 20 67 65 6e 65 72 61 6c 20 | --------.#.#.Define.one.general. |
8000 | 6d 65 61 73 75 72 65 20 61 2c 20 6f 6e 65 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 | measure.a,.one.discrete.measures |
8020 | 20 62 2c 20 74 68 65 20 70 6f 69 6e 74 73 20 77 68 65 72 65 0a 23 20 61 72 65 20 64 65 66 69 6e | .b,.the.points.where.#.are.defin |
8040 | 65 64 20 74 68 65 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 6d 65 61 | ed.the.source.and.the.target.mea |
8060 | 73 75 72 65 73 20 61 6e 64 20 66 69 6e 61 6c 6c 79 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 | sures.and.finally.the.cost.matri |
8080 | 78 20 63 2e 0a 0a 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 20 3d 20 37 0a 6e 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 34 0a | x.c...n_source.=.7.n_target.=.4. |
80a0 | 72 65 67 20 3d 20 31 0a 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 20 3d 20 31 30 30 30 30 30 0a 6c 72 20 3d | reg.=.1.numItermax.=.100000.lr.= |
80c0 | 20 30 2e 31 0a 62 61 74 63 68 5f 73 69 7a 65 20 3d 20 33 0a 6c 6f 67 20 3d 20 54 72 75 65 0a 0a | .0.1.batch_size.=.3.log.=.True.. |
80e0 | 61 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 29 0a 62 20 3d 20 | a.=.ot.utils.unif(n_source).b.=. |
8100 | 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 74 61 72 67 65 74 29 0a 0a 72 6e 67 20 3d 20 6e | ot.utils.unif(n_target)..rng.=.n |
8120 | 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 52 61 6e 64 6f 6d 53 74 61 74 65 28 30 29 0a 58 5f 73 6f 75 72 63 65 | p.random.RandomState(0).X_source |
8140 | 20 3d 20 72 6e 67 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 2c 20 32 29 0a 59 5f 74 61 72 67 | .=.rng.randn(n_source,.2).Y_targ |
8160 | 65 74 20 3d 20 72 6e 67 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 5f 74 61 72 67 65 74 2c 20 32 29 0a 4d 20 3d 20 | et.=.rng.randn(n_target,.2).M.=. |
8180 | 6f 74 2e 64 69 73 74 28 58 5f 73 6f 75 72 63 65 2c 20 59 5f 74 61 72 67 65 74 29 0a 0a 23 23 23 | ot.dist(X_source,.Y_target)..### |
81a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
81c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
81e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 0a 23 20 43 61 6c 6c 20 74 68 65 20 22 53 47 44 22 20 64 75 | ##########.#.#.Call.the."SGD".du |
8200 | 61 6c 20 6d 65 74 68 6f 64 20 74 6f 20 66 69 6e 64 20 74 68 65 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 61 | al.method.to.find.the.transporta |
8220 | 74 69 6f 6e 20 6d 61 74 72 69 78 20 69 6e 20 74 68 65 0a 23 20 73 65 6d 69 63 6f 6e 74 69 6e 6f | tion.matrix.in.the.#.semicontino |
8240 | 75 73 20 63 61 73 65 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | us.case.#.---------------------- |
8260 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 23 0a 23 20 43 61 6c 6c | -----------------------.#.#.Call |
8280 | 20 6f 74 2e 73 6f 6c 76 65 5f 64 75 61 6c 5f 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 61 6e 64 20 70 6c 6f 74 | .ot.solve_dual_entropic.and.plot |
82a0 | 20 74 68 65 20 72 65 73 75 6c 74 73 2e 0a 0a 73 67 64 5f 64 75 61 6c 5f 70 69 2c 20 6c 6f 67 5f | .the.results...sgd_dual_pi,.log_ |
82c0 | 73 67 64 20 3d 20 6f 74 2e 73 74 6f 63 68 61 73 74 69 63 2e 73 6f 6c 76 65 5f 64 75 61 6c 5f 65 | sgd.=.ot.stochastic.solve_dual_e |
82e0 | 6e 74 72 6f 70 69 63 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ntropic(a,.b,.M,.reg,........... |
8300 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
8320 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 62 61 74 63 68 5f 73 69 7a 65 2c 20 6e 75 6d 49 74 | ...............batch_size,.numIt |
8340 | 65 72 6d 61 78 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ermax,.......................... |
8360 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
8380 | 6c 72 2c 20 6c 6f 67 3d 6c 6f 67 29 0a 70 72 69 6e 74 28 6c 6f 67 5f 73 67 64 5b 27 61 6c 70 68 | lr,.log=log).print(log_sgd['alph |
83a0 | 61 27 5d 2c 20 6c 6f 67 5f 73 67 64 5b 27 62 65 74 61 27 5d 29 0a 70 72 69 6e 74 28 73 67 64 5f | a'],.log_sgd['beta']).print(sgd_ |
83c0 | 64 75 61 6c 5f 70 69 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | dual_pi)..###################### |
83e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
8400 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 0a 23 20 43 6f 6d 70 | #######################.#.#.Comp |
8420 | 61 72 65 20 74 68 65 20 72 65 73 75 6c 74 73 20 77 69 74 68 20 74 68 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 | are.the.results.with.the.Sinkhor |
8440 | 6e 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | n.algorithm.#.------------------ |
8460 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 23 0a 23 20 | ---------------------------.#.#. |
8480 | 43 61 6c 6c 20 74 68 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 20 66 72 6f 6d | Call.the.Sinkhorn.algorithm.from |
84a0 | 20 50 4f 54 0a 0a 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 70 69 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 | .POT..sinkhorn_pi.=.ot.sinkhorn( |
84c0 | 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 29 0a 70 72 69 6e 74 28 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 70 69 29 | a,.b,.M,.reg).print(sinkhorn_pi) |
84e0 | 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ..############################## |
8500 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
8520 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 20 53 47 44 20 72 65 73 | ################.#.Plot..SGD.res |
8540 | 75 6c 74 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 | ults.#.-----------------..pl.fig |
8560 | 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 | ure(4,.figsize=(5,.5)).ot.plot.p |
8580 | 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 73 67 64 5f 64 75 61 6c 5f 70 69 2c 20 27 64 75 | lot1D_mat(a,.b,.sgd_dual_pi,.'du |
85a0 | 61 6c 20 3a 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 47 44 27 29 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 0a | al.:.OT.matrix.SGD').pl.show().. |
85c0 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
85e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
8600 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 | ###############.#.Plot.Sinkhorn. |
8620 | 72 65 73 75 6c 74 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a | results.#.---------------------. |
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96c0 | 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 32 27 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 29 | sif('3gauss2',.n_target_samples) |
96e0 | 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ...############################# |
9700 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9720 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 | #################.#.Instantiate. |
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9760 | 6d 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ms.and.fit.them.#.-------------- |
9780 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
97a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 45 4d 44 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f | -------------..#.EMD.Transport.o |
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9840 | 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 53 | _sinkhorn.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)..#.S |
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9880 | 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 6f 74 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 | so.regularization.ot_lpl1.=.ot.d |
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9a20 | 58 73 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b | Xs).transp_Xs_sinkhorn.=.ot_sink |
9a40 | 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f | horn.transform(Xs=Xs).transp_Xs_ |
9a60 | 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a | lpl1.=.ot_lpl1.transform(Xs=Xs). |
9a80 | 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 31 6c 32 20 3d 20 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 74 72 61 6e 73 66 6f | transp_Xs_l1l2.=.ot_l1l2.transfo |
9aa0 | 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | rm(Xs=Xs)...#################### |
9ac0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9ae0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 | ##########################.#.Fig |
9b00 | 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d | .1.:.plots.source.and.target.sam |
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9b40 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 | --------------..pl.figure(1,.fig |
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9ca0 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 | l.title('Target.samples').pl.tig |
9cc0 | 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ht_layout()...################## |
9ce0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9d00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 | ############################.#.F |
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a780 | 20 62 69 6e 73 0a 0a 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 0a 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 | .bins..#.bin.positions.x.=.np.ar |
a7a0 | 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 0a 0a 23 20 47 61 75 | ange(n,.dtype=np.float64)..#.Gau |
a7c0 | 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 61 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c | ssian.distributions.a.=.gauss(n, |
a7e0 | 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 0a 62 | .m=20,.s=5)..#.m=.mean,.s=.std.b |
a800 | 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 36 30 2c 20 73 3d 31 30 29 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 | .=.gauss(n,.m=60,.s=10)..#.loss. |
a820 | 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c | matrix.M.=.ot.dist(x.reshape((n, |
a840 | 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 29 0a 4d 20 2f 3d 20 4d 2e | .1)),.x.reshape((n,.1))).M./=.M. |
a860 | 6d 61 78 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | max()...######################## |
a880 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
a8a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 64 69 | ######################.#.Plot.di |
a8c0 | 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 61 6e 64 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 23 20 2d 2d | stributions.and.loss.matrix.#.-- |
a8e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
a900 | 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 0a 70 6c | ..#%%.plot.the.distributions..pl |
a920 | 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 0a 70 6c 2e | .figure(1,.figsize=(6.4,.3)).pl. |
a940 | 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 61 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 | plot(x,.a,.'b',.label='Source.di |
a960 | 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 2c 20 27 72 27 2c 20 | stribution').pl.plot(x,.b,.'r',. |
a980 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 0a 70 6c 2e | label='Target.distribution').pl. |
a9a0 | 6c 65 67 65 6e 64 28 29 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 | legend()..#%%.plot.distributions |
a9c0 | 20 61 6e 64 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 | .and.loss.matrix..pl.figure(2,.f |
a9e0 | 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 | igsize=(5,.5)).ot.plot.plot1D_ma |
aa00 | 74 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 4d 27 29 0a 0a 23 23 23 | t(a,.b,.M,.'Cost.matrix.M')..### |
aa20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
aa40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
aa60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ###########.#.Solve.EMD.#.------ |
aa80 | 2d 2d 2d 0a 0a 0a 23 25 25 20 45 4d 44 0a 0a 47 30 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c | ---...#%%.EMD..G0.=.ot.emd(a,.b, |
aaa0 | 20 4d 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 | .M)..pl.figure(3,.figsize=(5,.5) |
aac0 | 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 30 2c 20 27 | ).ot.plot.plot1D_mat(a,.b,.G0,.' |
aae0 | 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 30 27 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | OT.matrix.G0')..################ |
ab00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
ab20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 | ##############################.# |
ab40 | 20 53 6f 6c 76 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .Solve.Sinkhorn.#.-------------- |
ab60 | 0a 0a 0a 23 25 25 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 0a 0a 6c 61 6d 62 64 20 3d 20 32 65 2d 33 0a 47 73 | ...#%%.Sinkhorn..lambd.=.2e-3.Gs |
ab80 | 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 6c 61 6d 62 64 2c 20 76 | .=.ot.sinkhorn(a,.b,.M,.lambd,.v |
aba0 | 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 | erbose=True)..pl.figure(4,.figsi |
abc0 | 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c | ze=(5,.5)).ot.plot.plot1D_mat(a, |
abe0 | 20 62 2c 20 47 73 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 0a 0a 70 | .b,.Gs,.'OT.matrix.Sinkhorn')..p |
ac00 | 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | l.show()..###################### |
ac20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
ac40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 | ########################.#.Solve |
ac60 | 20 53 6d 6f 6f 74 68 20 4f 54 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 0a 23 25 | .Smooth.OT.#.--------------...#% |
ac80 | 25 20 53 6d 6f 6f 74 68 20 4f 54 20 77 69 74 68 20 4b 4c 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 | %.Smooth.OT.with.KL.regularizati |
aca0 | 6f 6e 0a 0a 6c 61 6d 62 64 20 3d 20 32 65 2d 33 0a 47 73 6d 20 3d 20 6f 74 2e 73 6d 6f 6f 74 68 | on..lambd.=.2e-3.Gsm.=.ot.smooth |
acc0 | 2e 73 6d 6f 6f 74 68 5f 6f 74 5f 64 75 61 6c 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 6c 61 6d 62 64 2c 20 | .smooth_ot_dual(a,.b,.M,.lambd,. |
ace0 | 72 65 67 5f 74 79 70 65 3d 27 6b 6c 27 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 2c 20 66 69 67 | reg_type='kl')..pl.figure(5,.fig |
ad00 | 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 | size=(5,.5)).ot.plot.plot1D_mat( |
ad20 | 61 2c 20 62 2c 20 47 73 6d 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 6d 6f 6f 74 68 20 4f 54 20 | a,.b,.Gsm,.'OT.matrix.Smooth.OT. |
ad40 | 4b 4c 20 72 65 67 2e 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 0a 0a 23 25 25 20 53 6d 6f 6f 74 | KL.reg.')..pl.show()...#%%.Smoot |
ad60 | 68 20 4f 54 20 77 69 74 68 20 4b 4c 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 0a 6c 61 6d | h.OT.with.KL.regularization..lam |
ad80 | 62 64 20 3d 20 31 65 2d 31 0a 47 73 6d 20 3d 20 6f 74 2e 73 6d 6f 6f 74 68 2e 73 6d 6f 6f 74 68 | bd.=.1e-1.Gsm.=.ot.smooth.smooth |
ada0 | 5f 6f 74 5f 64 75 61 6c 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 6c 61 6d 62 64 2c 20 72 65 67 5f 74 79 70 | _ot_dual(a,.b,.M,.lambd,.reg_typ |
adc0 | 65 3d 27 6c 32 27 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 36 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 | e='l2')..pl.figure(6,.figsize=(5 |
ade0 | 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 | ,.5)).ot.plot.plot1D_mat(a,.b,.G |
ae00 | 73 6d 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 6d 6f 6f 74 68 20 4f 54 20 6c 32 20 72 65 67 2e | sm,.'OT.matrix.Smooth.OT.l2.reg. |
ae20 | 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 76 70 1d 4d 1a d1 23 82 | ')..pl.show().PK........vp.M..#. |
ae40 | 4f 10 00 00 4f 10 00 00 22 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 63 6f | O...O..."...plot_otda_mapping_co |
ae60 | 6c 6f 72 73 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d | lors_images.py#.-*-.coding:.utf- |
ae80 | 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | 8.-*-.""".====================== |
aea0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a | ===============================. |
aec0 | 4f 54 20 66 6f 72 20 69 6d 61 67 65 20 63 6f 6c 6f 72 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 77 69 | OT.for.image.color.adaptation.wi |
aee0 | 74 68 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | th.mapping.estimation.========== |
af00 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
af20 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 | ===========..OT.for.domain.adapt |
af40 | 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 69 6d 61 67 65 20 63 6f 6c 6f 72 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f | ation.with.image.color.adaptatio |
af60 | 6e 20 5b 36 5d 20 77 69 74 68 20 6d 61 70 70 69 6e 67 0a 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 5b 38 | n.[6].with.mapping.estimation.[8 |
af80 | 5d 2e 0a 0a 5b 36 5d 20 46 65 72 72 61 64 61 6e 73 2c 20 53 2e 2c 20 50 61 70 61 64 61 6b 69 73 | ]...[6].Ferradans,.S.,.Papadakis |
afa0 | 2c 20 4e 2e 2c 20 50 65 79 72 65 2c 20 47 2e 2c 20 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 4a 2e 20 46 2e 20 | ,.N.,.Peyre,.G.,.&.Aujol,.J..F.. |
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b8e0 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
b900 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
b920 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 | ###############.#.Plot.original. |
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b9a0 | 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 | pl.axis('off').pl.title('Image.1 |
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ba20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
ba40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
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bbc0 | 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 70 6c 2e 74 | 'Blue').pl.title('Image.2').pl.t |
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bc20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 | ##############################.# |
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be20 | 6e 73 70 6f 72 74 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | nsport.(linear)')..pl.subplot(2, |
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bea0 | 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 | pl.tight_layout()..pl.show().PK. |
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c340 | 20 20 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 5f 77 65 69 67 68 74 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 62 5f 69 29 0a | ...measures_weights.append(b_i). |
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c960 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 6e 20 3d 20 32 30 | ------------------------..n.=.20 |
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c9a0 | 20 32 29 29 0a 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2b 20 31 | .2)).xs[:,.0].=.np.arange(n).+.1 |
c9c0 | 0a 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2b 20 31 29 20 2a | .xs[:,.1].=.(np.arange(n).+.1).* |
c9e0 | 20 2d 30 2e 30 30 31 20 20 23 20 74 6f 20 6d 61 6b 65 20 69 74 20 73 74 72 69 63 74 6c 79 20 63 | .-0.001..#.to.make.it.strictly.c |
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ca20 | 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2b 20 31 0a 0a 61 2c 20 | xt[:,.1].=.np.arange(n).+.1..a,. |
ca40 | 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 2c 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 20 20 23 20 75 6e | b.=.ot.unif(n),.ot.unif(n)..#.un |
ca60 | 69 66 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 0a 23 | iform.distribution.on.samples..# |
ca80 | 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 | .loss.matrix.M1.=.ot.dist(xs,.xt |
caa0 | 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 4d 31 20 2f 3d 20 4d 31 2e 6d | ,.metric='euclidean').M1./=.M1.m |
cac0 | 61 78 28 29 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 | ax()..#.loss.matrix.M2.=.ot.dist |
cae0 | 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 4d | (xs,.xt,.metric='sqeuclidean').M |
cb00 | 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 70 20 | 2./=.M2.max()..#.loss.matrix.Mp. |
cb20 | 3d 20 6e 70 2e 73 71 72 74 28 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 | =.np.sqrt(ot.dist(xs,.xt,.metric |
cb40 | 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 29 0a 4d 70 20 2f 3d 20 4d 70 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 | ='euclidean')).Mp./=.Mp.max()..# |
cb60 | 20 44 61 74 61 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 | .Data.pl.figure(1,.figsize=(7,.3 |
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cc00 | 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 | pl.axis('equal').pl.title('Sourc |
cc20 | 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 0a 0a 23 | e.and.target.distributions')...# |
cc40 | 20 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 | .Cost.matrices.pl.figure(2,.figs |
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cc80 | 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 31 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 | .pl.imshow(M1,.interpolation='ne |
cca0 | 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 | arest').pl.title('Euclidean.cost |
ccc0 | 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f | ')..pl.subplot(1,.3,.2).pl.imsho |
cce0 | 77 28 4d 32 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 | w(M2,.interpolation='nearest').p |
cd00 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 | l.title('Squared.Euclidean.cost' |
cd20 | 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 | )..pl.subplot(1,.3,.3).pl.imshow |
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cd60 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 0a 70 6c | .title('Sqrt.Euclidean.cost').pl |
cd80 | 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .tight_layout()..############### |
cda0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
cdc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a | ###############################. |
cde0 | 23 20 44 61 74 61 73 65 74 20 31 20 3a 20 50 6c 6f 74 20 4f 54 20 4d 61 74 72 69 63 65 73 0a 23 | #.Dataset.1.:.Plot.OT.Matrices.# |
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ce60 | 61 2c 20 62 2c 20 4d 70 29 0a 0a 23 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 | a,.b,.Mp)..#.OT.matrices.pl.figu |
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cf20 | 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 | ot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr',.lab |
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cf80 | 65 28 27 4f 54 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c | e('OT.Euclidean')..pl.subplot(1, |
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d0a0 | 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 | t(1,.3,.3).ot.plot.plot2D_sample |
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e8a0 | 6c 32 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 5d 5d 29 0a 0a 70 6c | l2,.bary_wass,.bary_wass2]])..pl |
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f7a0 | 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 | 'nearest').pl.title('Cost.matrix |
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f7e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
f800 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 45 | ####################.#.Compute.E |
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f9c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 6f 6d | ##########################.#.Com |
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faa0 | 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 36 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c | l.figure(6).ot.plot.plot2D_sampl |
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105e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 74 72 61 6e | ####################.#.Plot.tran |
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107e0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 4f 54 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f | ===========.OT.mapping.estimatio |
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12d00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
12d20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
12d40 | 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 6e 65 77 20 69 6d 61 67 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ####.#.Plot.new.images.#.------- |
12d60 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 | --------..pl.figure(3,.figsize=( |
12d80 | 38 2c 20 34 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 | 8,.4))..pl.subplot(2,.3,.1).pl.i |
12da0 | 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | mshow(I1).pl.axis('off').pl.titl |
12dc0 | 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 | e('Image.1')..pl.subplot(2,.3,.2 |
12de0 | 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a | ).pl.imshow(I1t).pl.axis('off'). |
12e00 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 | pl.title('Image.1.Adapt')..pl.su |
12e20 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 65 29 0a 70 | bplot(2,.3,.3).pl.imshow(I1te).p |
12e40 | 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 | l.axis('off').pl.title('Image.1. |
12e60 | 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 | Adapt.(reg)')..pl.subplot(2,.3,. |
12e80 | 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a | 4).pl.imshow(I2).pl.axis('off'). |
12ea0 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | pl.title('Image.2')..pl.subplot( |
12ec0 | 32 2c 20 33 2c 20 35 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 | 2,.3,.5).pl.imshow(I2t).pl.axis( |
12ee0 | 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 27 29 | 'off').pl.title('Image.2.Adapt') |
12f00 | 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 | ..pl.subplot(2,.3,.6).pl.imshow( |
12f20 | 49 32 74 65 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 | I2te).pl.axis('off').pl.title('I |
12f40 | 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 | mage.2.Adapt.(reg)').pl.tight_la |
12f60 | 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 6a 70 | yout()..pl.show().PK..........jp |
12f80 | 1d 4d c6 3b 52 da f3 0a 00 00 f3 0a 00 00 0e 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 00 00 00 00 | .M.;R........................... |
12fa0 | 70 6c 6f 74 5f 67 72 6f 6d 6f 76 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 6a 70 1d 4d a4 4f | plot_gromov.pyPK..........jp.M.O |
12fc0 | 47 3f 0c 0c 00 00 0c 0c 00 00 0b 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 1f 0b 00 00 70 6c 6f 74 | G?..........................plot |
12fe0 | 5f 57 44 41 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 76 70 1d 4d e5 d4 47 7d 9d 1c 00 00 9d | _WDA.pyPK..........vp.M..G}..... |
13000 | 1c 00 00 19 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 54 17 00 00 70 6c 6f 74 5f 67 72 6f 6d 6f 76 | .................T...plot_gromov |
13020 | 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 69 70 1d 4d b8 cd | _barycenter.pyPK..........ip.M.. |
13040 | f6 1b 7e 0b 00 00 7e 0b 00 00 13 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 28 34 00 00 70 6c 6f 74 | ..~...~.................(4..plot |
13060 | 5f 6f 70 74 69 6d 5f 4f 54 72 65 67 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 76 70 1d 4d 39 | _optim_OTreg.pyPK..........vp.M9 |
13080 | 06 7c 60 0c 15 00 00 0c 15 00 00 0f 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 d7 3f 00 00 70 6c 6f | .|`.......................?..plo |
130a0 | 74 5f 6f 74 64 61 5f 64 32 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 76 70 1d 4d 71 12 0d cb | t_otda_d2.pyPK..........vp.Mq... |
130c0 | 23 12 00 00 23 12 00 00 1c 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 10 55 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f | #...#..................U..plot_o |
130e0 | 74 64 61 5f 73 65 6d 69 5f 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 | tda_semi_supervised.pyPK........ |
13100 | 00 00 69 70 1d 4d 0b 5c 2a af a2 06 00 00 a2 06 00 00 0d 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 | ..ip.M.\*....................... |
13120 | 6d 67 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 6a 70 1d | mg..plot_OT_1D.pyPK..........jp. |
13140 | 4d be 2f a4 12 3a 18 00 00 3a 18 00 00 12 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 3a 6e 00 00 70 | M./..:...:.................:n..p |
13160 | 6c 6f 74 5f 73 74 6f 63 68 61 73 74 69 63 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 76 70 1d | lot_stochastic.pyPK..........vp. |
13180 | 4d 1c cd f5 95 28 0d 00 00 28 0d 00 00 15 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 a4 86 00 00 70 | M....(...(.....................p |
131a0 | 6c 6f 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 31 44 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 | lot_barycenter_1D.pyPK.......... |
131c0 | 76 70 1d 4d b0 31 70 de ee 10 00 00 ee 10 00 00 14 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 ff 93 | vp.M.1p......................... |
131e0 | 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6c 61 73 73 65 73 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 | ..plot_otda_classes.pyPK........ |
13200 | 00 00 69 70 1d 4d ff 09 e8 78 dd 08 00 00 dd 08 00 00 14 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 | ..ip.M...x...................... |
13220 | 1f a5 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 5f 73 6d 6f 6f 74 68 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 | ....plot_OT_1D_smooth.pyPK...... |
13240 | 00 00 00 00 76 70 1d 4d 1a d1 23 82 4f 10 00 00 4f 10 00 00 22 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 | ....vp.M..#.O...O..."........... |
13260 | b4 81 2e ae 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 63 6f 6c 6f 72 73 5f 69 | ......plot_otda_mapping_colors_i |
13280 | 6d 61 67 65 73 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 69 70 1d 4d 90 0c 61 ee fa 07 00 00 | mages.pyPK..........ip.M..a..... |
132a0 | fa 07 00 00 1f 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 bd be 00 00 70 6c 6f 74 5f 66 72 65 65 5f | ......................plot_free_ |
132c0 | 73 75 70 70 6f 72 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 | support_barycenter.pyPK......... |
132e0 | 00 76 70 1d 4d 6f 6c 58 5b 88 13 00 00 88 13 00 00 13 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 f4 | .vp.MolX[....................... |
13300 | c6 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 4c 31 5f 76 73 5f 4c 32 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 | ...plot_OT_L1_vs_L2.pyPK........ |
13320 | 00 00 76 70 1d 4d a6 16 4e 83 2e 17 00 00 2e 17 00 00 21 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 | ..vp.M..N.........!............. |
13340 | ad da 00 00 70 6c 6f 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 6c 70 5f 76 73 5f 65 6e 74 72 6f 70 | ....plot_barycenter_lp_vs_entrop |
13360 | 69 63 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 6a 70 1d 4d bf 4a 09 ec 55 09 00 00 55 09 00 | ic.pyPK..........jp.M.J..U...U.. |
13380 | 00 15 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 1a f2 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 32 44 5f 73 61 | ...................plot_OT_2D_sa |
133a0 | 6d 70 6c 65 73 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 6a 70 1d 4d 0e e0 72 82 97 0b 00 00 | mples.pyPK..........jp.M..r..... |
133c0 | 97 0b 00 00 1b 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 a2 fb 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f | ......................plot_otda_ |
133e0 | 6c 69 6e 65 61 72 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 76 70 1d | linear_mapping.pyPK..........vp. |
13400 | 4d cd ad d9 82 f4 0f 00 00 f4 0f 00 00 14 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 72 07 01 00 70 | M..........................r...p |
13420 | 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 6a | lot_otda_mapping.pyPK..........j |
13440 | 70 1d 4d 7a 2e b5 2b 65 09 00 00 65 09 00 00 13 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 98 17 01 | p.Mz..+e...e.................... |
13460 | 00 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6d 70 75 74 65 5f 65 6d 64 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 | .plot_compute_emd.pyPK.......... |
13480 | 76 70 1d 4d 99 da 74 4f 0d 0e 00 00 0d 0e 00 00 19 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 2e 21 | vp.M..tO.......................! |
134a0 | 01 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 70 79 50 4b 05 06 00 | ..plot_otda_color_images.pyPK... |
134c0 | 00 00 00 14 00 14 00 49 05 00 00 72 2f 01 00 00 00 | .......I...r/.... |