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| 2180 | 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5b 3a 2c 20 3a 2c 20 32 5d 20 2f 20 32 35 36 | stype(np.float64)[:,.:,.2]./.256 |
| 21a0 | 0d 0a 73 74 61 72 20 3d 20 73 70 69 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 73 74 61 | ..star.=.spi.imread('../data/sta |
| 21c0 | 72 2e 70 6e 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5b 3a 2c 20 3a 2c | r.png').astype(np.float64)[:,.:, |
| 21e0 | 20 32 5d 20 2f 20 32 35 36 0d 0a 0d 0a 73 68 61 70 65 73 20 3d 20 5b 73 71 75 61 72 65 2c 20 63 | .2]./.256....shapes.=.[square,.c |
| 2200 | 72 6f 73 73 2c 20 74 72 69 61 6e 67 6c 65 2c 20 73 74 61 72 5d 0d 0a 0d 0a 53 20 3d 20 34 0d 0a | ross,.triangle,.star]....S.=.4.. |
| 2220 | 78 73 20 3d 20 5b 5b 5d 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 0d 0a 0d 0a 0d | xs.=.[[].for.i.in.range(S)]..... |
| 2240 | 0a 66 6f 72 20 6e 62 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 34 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 66 6f 72 20 69 20 | .for.nb.in.range(4):......for.i. |
| 2260 | 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 38 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 66 6f 72 20 6a 20 69 6e 20 72 | in.range(8):..........for.j.in.r |
| 2280 | 61 6e 67 65 28 38 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 73 68 61 70 65 73 5b | ange(8):..............if.shapes[ |
| 22a0 | 6e 62 5d 5b 69 2c 20 6a 5d 20 3c 20 30 2e 39 35 3a 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | nb][i,.j].<.0.95:............... |
| 22c0 | 20 20 20 78 73 5b 6e 62 5d 2e 61 70 70 65 6e 64 28 5b 6a 2c 20 38 20 2d 20 69 5d 29 0d 0a 0d 0a | ...xs[nb].append([j,.8.-.i]).... |
| 22e0 | 78 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 30 5d 29 2c 20 | xs.=.np.array([np.array(xs[0]),. |
| 2300 | 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 31 5d 29 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | np.array(xs[1]),................ |
| 2320 | 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 32 5d 29 2c 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 33 5d | .np.array(xs[2]),.np.array(xs[3] |
| 2340 | 29 5d 29 0d 0a 0d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | )])....######################### |
| 2360 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 2380 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0d 0a 23 20 42 61 72 79 63 65 6e | #####################..#.Barycen |
| 23a0 | 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 0d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ter.computation..#.------------- |
| 23c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 0d 0a 0d 0a 6e 73 20 3d 20 5b 6c 65 6e 28 78 73 5b 73 5d 29 20 | ---------......ns.=.[len(xs[s]). |
| 23e0 | 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 0d 0a 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 | for.s.in.range(S)]..n_samples.=. |
| 2400 | 33 30 0d 0a 0d 0a 22 22 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 61 6c 6c 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 20 6d | 30...."""Compute.all.distances.m |
| 2420 | 61 74 72 69 63 65 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 66 6f 75 72 20 73 68 61 70 65 73 22 22 22 0d 0a | atrices.for.the.four.shapes""".. |
| 2440 | 43 73 20 3d 20 5b 73 70 2e 73 70 61 74 69 61 6c 2e 64 69 73 74 61 6e 63 65 2e 63 64 69 73 74 28 | Cs.=.[sp.spatial.distance.cdist( |
| 2460 | 78 73 5b 73 5d 2c 20 78 73 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d | xs[s],.xs[s]).for.s.in.range(S)] |
| 2480 | 0d 0a 43 73 20 3d 20 5b 63 73 20 2f 20 63 73 2e 6d 61 78 28 29 20 66 6f 72 20 63 73 20 69 6e 20 | ..Cs.=.[cs./.cs.max().for.cs.in. |
| 24a0 | 43 73 5d 0d 0a 0d 0a 70 73 20 3d 20 5b 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 73 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 | Cs]....ps.=.[ot.unif(ns[s]).for. |
| 24c0 | 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 0d 0a 70 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 73 61 | s.in.range(S)]..p.=.ot.unif(n_sa |
| 24e0 | 6d 70 6c 65 73 29 0d 0a 0d 0a 0d 0a 6c 61 6d 62 64 61 73 74 20 3d 20 5b 5b 66 6c 6f 61 74 28 69 | mples)......lambdast.=.[[float(i |
| 2500 | 29 20 2f 20 33 2c 20 66 6c 6f 61 74 28 33 20 2d 20 69 29 20 2f 20 33 5d 20 66 6f 72 20 69 20 69 | )./.3,.float(3.-.i)./.3].for.i.i |
| 2520 | 6e 20 5b 31 2c 20 32 5d 5d 0d 0a 0d 0a 43 74 30 31 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 | n.[1,.2]]....Ct01.=.[0.for.i.in. |
| 2540 | 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 0d 0a 20 | range(2)]..for.i.in.range(2):... |
| 2560 | 20 20 20 43 74 30 31 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 | ...Ct01[i].=.ot.gromov.gromov_ba |
| 2580 | 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 5b 43 73 5b 30 5d 2c 20 43 73 5b | rycenters(n_samples,.[Cs[0],.Cs[ |
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| 25c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b 30 5d 2c 20 70 73 5b 31 5d 0d 0a | .................[ps[0],.ps[1].. |
| 25e0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 2600 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 | ............],.p,.lambdast[i],.' |
| 2620 | 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 20 23 20 35 65 2d 34 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 | square_loss',..#.5e-4,.......... |
| 2640 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 2660 | 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 0d 0a 0d 0a 43 74 | ...max_iter=100,.tol=1e-3)....Ct |
| 2680 | 30 32 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f 72 20 | 02.=.[0.for.i.in.range(2)]..for. |
| 26a0 | 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 43 74 30 32 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 | i.in.range(2):......Ct02[i].=.ot |
| 26c0 | 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 6d | .gromov.gromov_barycenters(n_sam |
| 26e0 | 70 6c 65 73 2c 20 5b 43 73 5b 30 5d 2c 20 43 73 5b 32 5d 5d 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ples,.[Cs[0],.Cs[2]],........... |
| 2700 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 2720 | 20 20 5b 70 73 5b 30 5d 2c 20 70 73 5b 32 5d 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ..[ps[0],.ps[2]................. |
| 2740 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 | .............................],. |
| 2760 | 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 20 | p,.lambdast[i],.'square_loss',.. |
| 2780 | 23 20 35 65 2d 34 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | #.5e-4,......................... |
| 27a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 | ....................max_iter=100 |
| 27c0 | 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 0d 0a 0d 0a 43 74 31 33 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 | ,.tol=1e-3)....Ct13.=.[0.for.i.i |
| 27e0 | 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 0d | n.range(2)]..for.i.in.range(2):. |
| 2800 | 0a 20 20 20 20 43 74 31 33 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f | .....Ct13[i].=.ot.gromov.gromov_ |
| 2820 | 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 5b 43 73 5b 31 5d 2c 20 43 | barycenters(n_samples,.[Cs[1],.C |
| 2840 | 73 5b 33 5d 5d 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | s[3]],.......................... |
| 2860 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b 31 5d 2c 20 70 73 5b 33 5d | ...................[ps[1],.ps[3] |
| 2880 | 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 28a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c | ..............],.p,.lambdast[i], |
| 28c0 | 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 20 23 20 35 65 2d 34 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 | .'square_loss',..#.5e-4,........ |
| 28e0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 2900 | 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 0d 0a 0d 0a | .....max_iter=100,.tol=1e-3).... |
| 2920 | 43 74 32 33 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f | Ct23.=.[0.for.i.in.range(2)]..fo |
| 2940 | 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 43 74 32 33 5b 69 5d 20 3d 20 | r.i.in.range(2):......Ct23[i].=. |
| 2960 | 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 | ot.gromov.gromov_barycenters(n_s |
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| 29a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 29c0 | 20 20 20 20 5b 70 73 5b 32 5d 2c 20 70 73 5b 33 5d 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ....[ps[2],.ps[3]............... |
| 29e0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d | ...............................] |
| 2a00 | 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c | ,.p,.lambdast[i],.'square_loss', |
| 2a20 | 20 20 23 20 35 65 2d 34 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ..#.5e-4,....................... |
| 2a40 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 | ......................max_iter=1 |
| 2a60 | 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 0d 0a 0d 0a 0d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | 00,.tol=1e-3)......############# |
| 2a80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 2aa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 2ac0 | 23 0d 0a 23 20 56 69 73 75 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 0d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | #..#.Visualization..#.---------- |
| 2ae0 | 2d 2d 2d 0d 0a 23 0d 0a 23 20 54 68 65 20 50 43 41 20 68 65 6c 70 73 20 69 6e 20 67 65 74 74 69 | ---..#..#.The.PCA.helps.in.getti |
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| 2b60 | 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 73 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 | .[smacof_mds(Cs[s],.2).for.s.in. |
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| 2ba0 | 70 6f 73 74 30 31 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 74 30 31 5b 73 5d 2c 20 32 29 | post01.=.[smacof_mds(Ct01[s],.2) |
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| 2c20 | 2c 20 30 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 30 32 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 74 30 32 | ,.0]..npost02.=.[smacof_mds(Ct02 |
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| 2ca0 | 31 33 20 3d 20 5b 30 2c 20 30 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 31 33 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d | 13.=.[0,.0]..npost13.=.[smacof_m |
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| 2d00 | 6e 70 6f 73 74 31 33 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a | npost13[s]).for.s.in.range(2)].. |
| 2d20 | 0d 0a 6e 70 6f 73 74 32 33 20 3d 20 5b 30 2c 20 30 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 32 33 20 3d 20 5b 73 | ..npost23.=.[0,.0]..npost23.=.[s |
| 2d40 | 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 74 32 33 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 | macof_mds(Ct23[s],.2).for.s.in.r |
| 2d60 | 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 32 33 20 3d 20 5b 63 6c 66 2e 66 69 74 5f 74 72 61 | ange(2)]..npost23.=.[clf.fit_tra |
| 2d80 | 6e 73 66 6f 72 6d 28 6e 70 6f 73 74 32 33 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 | nsform(npost23[s]).for.s.in.rang |
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| 3020 | 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 35 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e | .pl.ylim((-1,.1))..ax5.scatter(n |
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| 30a0 | 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 36 2e | (-1,.1))..pl.ylim((-1,.1))..ax6. |
| 30c0 | 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 31 33 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 31 | scatter(npost13[1][:,.0],.npost1 |
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| 3120 | 0a 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 | .pl.xlim((-1,.1))..pl.ylim((-1,. |
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| 31c0 | 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 38 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 31 | lim((-1,.1))..ax8.scatter(npost1 |
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| 3260 | 65 72 28 6e 70 6f 73 5b 32 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 5b 32 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c | er(npos[2][:,.0],.npos[2][:,.1], |
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| 3480 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 52 65 67 75 6c 61 72 69 | =======================.Regulari |
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| 34c0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 49 | =============================..I |
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| 35a0 | 35 5d 5b 37 5d 2e 0a 0a 0a 5b 35 5d 20 4e 2e 20 43 6f 75 72 74 79 3b 20 52 2e 20 46 6c 61 6d 61 | 5][7]....[5].N..Courty;.R..Flama |
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| 3680 | 2c 20 4e 2e 2c 20 50 65 79 72 c3 a9 2c 20 47 2e 2c 20 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 4a 2e 20 46 2e | ,.N.,.Peyr..,.G.,.&.Aujol,.J..F. |
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| 36c0 | 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 2e 20 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c 20 6f 6e | timal.transport..SIAM.Journal.on |
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| 37a0 | 35 31 30 2e 30 36 35 36 37 2e 0a 0a 0a 0a 22 22 22 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 | 510.06567....."""..import.numpy. |
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| 39c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 39e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ########.#.Solve.EMD.#.--------- |
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| 3a20 | 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 | .pl.figure(3,.figsize=(5,.5)).ot |
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| 3a80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 3aa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c | ##########################.#.Sol |
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| 3ae0 | 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | arization.#.-------------------- |
| 3b00 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 45 78 | ------------------------..#%%.Ex |
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| 3b80 | 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 47 0a 0a 0a 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 31 0a 0a 47 6c 32 20 3d | ....return.G...reg.=.1e-1..Gl2.= |
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| 3c20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 3c40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 3c60 | 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 | ##.#.Solve.EMD.with.entropic.reg |
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| 3ca0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c | --------------------..#%%.Exampl |
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| 3d20 | 75 72 6e 20 6e 70 2e 6c 6f 67 28 47 29 20 2b 20 31 2e 0a 0a 0a 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 0a | urn.np.log(G).+.1....reg.=.1e-3. |
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| 3de0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 3e00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 | ########################.#.Solve |
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| 3e60 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 3e80 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 46 | ------------..#%%.Example.with.F |
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| 3fe0 | 00 92 53 be 4c 39 06 7c 60 0c 15 00 00 0c 15 00 00 0f 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 64 | ..S.L9.|`............plot_otda_d |
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| 4740 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 | ####################.#.Fig.1.:.p |
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| 4c60 | 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 | title('Optimal.coupling\nSinkhor |
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| 4ec0 | 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | xticks([]).pl.yticks([]).pl.titl |
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| 5060 | 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | t_layout()...################### |
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| 5b40 | 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d | _sinkhorn_semi.=.ot_sinkhorn_sem |
| 5b60 | 69 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 0a 23 20 73 65 6d 69 20 73 75 70 65 72 | i.transform(Xs=Xs)..#.semi.super |
| 5b80 | 76 69 73 65 64 20 44 41 20 75 73 65 73 20 61 76 61 69 6c 61 62 6c 65 20 6c 61 62 61 6c 65 64 20 | vised.DA.uses.available.labaled. |
| 5ba0 | 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 74 6f 20 6d 6f 64 69 66 79 20 74 68 65 20 63 6f 73 | target.samples.to.modify.the.cos |
| 5bc0 | 74 0a 23 20 6d 61 74 72 69 78 20 69 6e 76 6f 6c 76 65 64 20 69 6e 20 74 68 65 20 4f 54 20 70 72 | t.#.matrix.involved.in.the.OT.pr |
| 5be0 | 6f 62 6c 65 6d 2e 20 54 68 65 20 63 6f 73 74 20 6f 66 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 69 6e 67 20 | oblem..The.cost.of.transporting. |
| 5c00 | 61 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 0a 23 20 6f 66 20 63 6c 61 73 73 20 41 20 6f 6e 74 | a.source.sample.#.of.class.A.ont |
| 5c20 | 6f 20 61 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 20 6f 66 20 63 6c 61 73 73 20 42 20 21 3d 20 | o.a.target.sample.of.class.B.!=. |
| 5c40 | 41 20 69 73 20 73 65 74 20 74 6f 20 69 6e 66 69 6e 69 74 65 2c 20 6f 72 20 61 0a 23 20 76 65 72 | A.is.set.to.infinite,.or.a.#.ver |
| 5c60 | 79 20 6c 61 72 67 65 20 76 61 6c 75 65 0a 0a 23 20 6e 6f 74 65 20 74 68 61 74 20 69 6e 20 74 68 | y.large.value..#.note.that.in.th |
| 5c80 | 65 20 70 72 65 73 65 6e 74 20 63 61 73 65 20 77 65 20 63 6f 6e 73 69 64 65 72 20 74 68 61 74 20 | e.present.case.we.consider.that. |
| 5ca0 | 61 6c 6c 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 61 72 65 0a 23 20 6c 61 62 | all.the.target.samples.are.#.lab |
| 5cc0 | 65 6c 65 64 2e 20 46 6f 72 20 64 61 69 6c 79 20 61 70 70 6c 69 63 61 74 69 6f 6e 73 2c 20 73 6f | eled..For.daily.applications,.so |
| 5ce0 | 6d 65 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 20 6d 69 67 68 74 20 6e 6f 74 20 68 61 76 65 20 | me.target.sample.might.not.have. |
| 5d00 | 6c 61 62 65 6c 73 2c 0a 23 20 69 6e 20 74 68 69 73 20 63 61 73 65 20 74 68 65 20 65 6c 65 6d 65 | labels,.#.in.this.case.the.eleme |
| 5d20 | 6e 74 20 6f 66 20 79 74 20 63 6f 72 72 65 73 70 6f 6e 64 69 6e 67 20 74 6f 20 74 68 65 73 65 20 | nt.of.yt.corresponding.to.these. |
| 5d40 | 73 61 6d 70 6c 65 73 20 73 68 6f 75 6c 64 20 62 65 0a 23 20 66 69 6c 6c 65 64 20 77 69 74 68 20 | samples.should.be.#.filled.with. |
| 5d60 | 2d 31 2e 0a 0a 23 20 57 61 72 6e 69 6e 67 3a 20 77 65 20 72 65 63 61 6c 6c 20 74 68 61 74 20 2d | -1...#.Warning:.we.recall.that.- |
| 5d80 | 31 20 63 61 6e 6e 6f 74 20 62 65 20 75 73 65 64 20 61 73 20 61 20 63 6c 61 73 73 20 6c 61 62 65 | 1.cannot.be.used.as.a.class.labe |
| 5da0 | 6c 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | l...############################ |
| 5dc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 5de0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f | ##################.#.Fig.1.:.plo |
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| 5e20 | 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 0a 23 20 2d 2d 2d | atrix.of.pairwise.distance.#.--- |
| 5e40 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 5e60 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 5e80 | 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 31 30 | --..pl.figure(1,.figsize=(10,.10 |
| 5ea0 | 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 | )).pl.subplot(2,.2,.1).pl.scatte |
| 5ec0 | 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b | r(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.mark |
| 5ee0 | 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a | er='+',.label='Source.samples'). |
| 5f00 | 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 6c | pl.xticks([]).pl.yticks([]).pl.l |
| 5f20 | 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 | egend(loc=0).pl.title('Source..s |
| 5f40 | 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c | amples')..pl.subplot(2,.2,.2).pl |
| 5f60 | 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 | .scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=y |
| 5f80 | 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d | t,.marker='o',.label='Target.sam |
| 5fa0 | 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b | ples').pl.xticks([]).pl.yticks([ |
| 5fc0 | 5d 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 | ]).pl.legend(loc=0).pl.title('Ta |
| 5fe0 | 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c | rget.samples')..pl.subplot(2,.2, |
| 6000 | 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 2e 63 6f 73 | .3).pl.imshow(ot_sinkhorn_un.cos |
| 6020 | 74 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e | t_,.interpolation='nearest').pl. |
| 6040 | 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | xticks([]).pl.yticks([]).pl.titl |
| 6060 | 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 75 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 | e('Cost.matrix.-.unsupervised.DA |
| 6080 | 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f | ')..pl.subplot(2,.2,.4).pl.imsho |
| 60a0 | 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 63 6f 73 74 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 | w(ot_sinkhorn_semi.cost_,.interp |
| 60c0 | 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 | olation='nearest').pl.xticks([]) |
| 60e0 | 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 | .pl.yticks([]).pl.title('Cost.ma |
| 6100 | 74 72 69 78 20 2d 20 73 65 6d 69 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 0a 0a 70 6c 2e 74 | trix.-.semisupervised.DA')..pl.t |
| 6120 | 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 23 20 74 68 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 | ight_layout()..#.the.optimal.cou |
| 6140 | 70 6c 69 6e 67 20 69 6e 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 2d 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 20 | pling.in.the.semi-supervised.DA. |
| 6160 | 63 61 73 65 20 77 69 6c 6c 20 65 78 68 69 62 69 74 20 22 20 73 68 61 70 65 0a 23 20 73 69 6d 69 | case.will.exhibit.".shape.#.simi |
| 6180 | 6c 61 72 22 20 74 6f 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 2c 20 28 62 6c 6f 63 6b 20 | lar".to.the.cost.matrix,.(block. |
| 61a0 | 64 69 61 67 6f 6e 61 6c 20 6d 61 74 72 69 78 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | diagonal.matrix)...############# |
| 61c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 61e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 6200 | 23 0a 23 20 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 | #.#.Fig.2.:.plots.optimal.coupli |
| 6220 | 6e 67 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 0a 23 20 | ngs.for.the.different.methods.#. |
| 6240 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 6260 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 | -------------------------..pl.fi |
| 6280 | 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 | gure(2,.figsize=(8,.4))..pl.subp |
| 62a0 | 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f | lot(1,.2,.1).pl.imshow(ot_sinkho |
| 62c0 | 72 6e 5f 75 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 | rn_un.coupling_,.interpolation=' |
| 62e0 | 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b | nearest').pl.xticks([]).pl.ytick |
| 6300 | 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 | s([]).pl.title('Optimal.coupling |
| 6320 | 5c 6e 55 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | \nUnsupervised.DA')..pl.subplot( |
| 6340 | 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 | 1,.2,.2).pl.imshow(ot_sinkhorn_s |
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| 7440 | 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 0a 0a 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 0a 72 65 67 | .dot(weights)..#.wasserstein.reg |
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| 74a0 | 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | l.figure(2).pl.clf().pl.subplot( |
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| 75e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 62 61 72 79 | ----------------------..#%%.bary |
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| 78e0 | 24 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 31 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 7a | $').ax.set_ylim3d(0,.1).ax.set_z |
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| 7920 | 6d 61 78 28 29 20 2a 20 31 2e 30 31 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 | max().*.1.01).pl.title('Barycent |
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| 7be0 | 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 4f 54 20 66 | "".========================.OT.f |
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| 84a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f | ##################.#.Fig.2.:.plo |
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| 84e0 | 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ted.samples.#.------------------ |
| 8500 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 8520 | 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 20 3d 20 7b 27 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f | ----..param_img.=.{'interpolatio |
| 8540 | 6e 27 3a 20 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 7d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 | n':.'nearest'}..pl.figure(2,.fig |
| 8560 | 73 69 7a 65 3d 28 31 35 2c 20 38 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 31 | size=(15,.8)).pl.subplot(2,.4,.1 |
| 8580 | 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a | ).pl.imshow(ot_emd.coupling_,.** |
| 85a0 | 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 | param_img).pl.xticks([]).pl.ytic |
| 85c0 | 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e | ks([]).pl.title('Optimal.couplin |
| 85e0 | 67 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | g\nEMDTransport')..pl.subplot(2, |
| 8600 | 20 34 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 | .4,.2).pl.imshow(ot_sinkhorn.cou |
| 8620 | 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b | pling_,.**param_img).pl.xticks([ |
| 8640 | 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d | ]).pl.yticks([]).pl.title('Optim |
| 8660 | 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 | al.coupling\nSinkhornTransport') |
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| 86a0 | 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a | ot_lpl1.coupling_,.**param_img). |
| 86c0 | 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 | pl.xticks([]).pl.yticks([]).pl.t |
| 86e0 | 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e | itle('Optimal.coupling\nSinkhorn |
| 8700 | 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 | Lpl1Transport')..pl.subplot(2,.4 |
| 8720 | 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f | ,.4).pl.imshow(ot_l1l2.coupling_ |
| 8740 | 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e | ,.**param_img).pl.xticks([]).pl. |
| 8760 | 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 | yticks([]).pl.title('Optimal.cou |
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| 87a0 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 35 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 | pl.subplot(2,.4,.5).pl.scatter(X |
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| 8840 | 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d | [:,.1],.c=ys,............marker= |
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| 88a0 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 45 6d | l.title('Transported.samples\nEm |
| 88c0 | 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 22 6c 6f 77 65 | dTransport').pl.legend(loc="lowe |
| 88e0 | 72 20 6c 65 66 74 22 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 36 29 0a 70 6c | r.left")..pl.subplot(2,.4,.6).pl |
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| 8960 | 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 30 5d | scatter(transp_Xs_sinkhorn[:,.0] |
| 8980 | 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 | ,.transp_Xs_sinkhorn[:,.1],.c=ys |
| 89a0 | 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | ,............marker='+',.label=' |
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| 89e0 | 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 | ([]).pl.yticks([]).pl.title('Tra |
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| 8a60 | 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 | marker='o',............label='Ta |
| 8a80 | 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 | rget.samples',.alpha=0.3).pl.sca |
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| 8ac0 | 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | p_Xs_lpl1[:,.1],.c=ys,.......... |
| 8ae0 | 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 | ..marker='+',.label='Transp.samp |
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| 8b20 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 | cks([]).pl.title('Transported.sa |
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| 8b60 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 38 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 | pl.subplot(2,.4,.8).pl.scatter(X |
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| 9520 | 67 65 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e | ge_sinkhorn.=.minmax(mat2im(tran |
| 9540 | 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 6f 74 5f 6d | sp_Xs_sinkhorn,.I1.shape))..ot_m |
| 9560 | 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 | apping_linear.=.ot.da.MappingTra |
| 9580 | 6e 73 70 6f 72 74 28 0a 20 20 20 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 38 2c 20 62 69 | nsport(.....mu=1e0,.eta=1e-8,.bi |
| 95a0 | 61 73 3d 54 72 75 65 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 | as=True,.max_iter=20,.verbose=Tr |
| 95c0 | 75 65 29 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c | ue).ot_mapping_linear.fit(Xs=Xs, |
| 95e0 | 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 58 31 74 6c 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 | .Xt=Xt)..X1tl.=.ot_mapping_linea |
| 9600 | 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 0a 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 | r.transform(Xs=X1).Image_mapping |
| 9620 | 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 6c 2c 20 49 31 | _linear.=.minmax(mat2im(X1tl,.I1 |
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| 9660 | 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 0a 20 20 20 20 6d 75 3d 31 | ot.da.MappingTransport(.....mu=1 |
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| 96a0 | 65 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 6f 74 | e,.max_iter=10,.verbose=True).ot |
| 96c0 | 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d | _mapping_gaussian.fit(Xs=Xs,.Xt= |
| 96e0 | 58 74 29 0a 0a 58 31 74 6e 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e | Xt)..X1tn.=.ot_mapping_gaussian. |
| 9700 | 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 20 20 23 20 75 73 65 20 74 68 65 20 65 73 74 69 | transform(Xs=X1)..#.use.the.esti |
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| 9740 | 73 69 61 6e 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 | sian.=.minmax(mat2im(X1tn,.I1.sh |
| 9760 | 61 70 65 29 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ape))...######################## |
| 9780 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 97a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 6f 72 | ######################.#.Plot.or |
| 97c0 | 69 67 69 6e 61 6c 20 69 6d 61 67 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | iginal.images.#.---------------- |
| 97e0 | 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c | ----..pl.figure(1,.figsize=(6.4, |
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| 9880 | 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 | itle('Image.2').pl.tight_layout( |
| 98a0 | 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | )...############################ |
| 98c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 98e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 70 69 78 65 6c 20 | ##################.#.Plot.pixel. |
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| 9920 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 | --------------------..pl.figure( |
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| 99a0 | 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 0a 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 | .1]).pl.xlabel('Red').pl.ylabel( |
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| 9a00 | 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 | ,.0],.Xt[:,.2],.c=Xt).pl.axis([0 |
| 9a20 | 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 0a 70 6c 2e | ,.1,.0,.1]).pl.xlabel('Red').pl. |
| 9a40 | 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 | ylabel('Blue').pl.title('Image.2 |
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| 9a80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 9aa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 9ac0 | 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 65 64 20 69 6d 61 67 65 73 0a | #####.#.Plot.transformed.images. |
| 9ae0 | 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 | #.-----------------------..pl.fi |
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| 9b40 | 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 27 29 0a 0a 70 6c | xis('off').pl.title('Im..1')..pl |
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| 9b80 | 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 32 27 29 | pl.axis('off').pl.title('Im..2') |
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| 9be0 | 6c 65 28 27 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 | le('EmdTransport')..pl.subplot(2 |
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| 9ce0 | 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 | pping_gaussian).pl.axis('off').p |
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| a420 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 44 61 74 61 73 65 74 20 31 20 3a 20 50 6c | ###############.#.Dataset.1.:.Pl |
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| a5c0 | 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 | d(loc=0).pl.title('OT.Euclidean' |
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| a620 | 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 | [.5,..5,.1]).pl.plot(xs[:,.0],.x |
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| a680 | 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 | ],.'xr',.label='Target.samples') |
| a6a0 | 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f | .pl.axis('equal').#.pl.legend(lo |
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| a700 | 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 70 | ot.plot2D_samples_mat(xs,.xt,.Gp |
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| a7c0 | 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 | d(loc=0).pl.title('OT.sqrt.Eucli |
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| a820 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| a840 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 44 61 74 61 73 65 74 20 32 | ####################.#.Dataset.2 |
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| a8e0 | 61 6e 67 65 28 6e 20 2b 20 31 29 20 2b 20 31 2e 30 29 20 2a 20 30 2e 39 20 2f 20 28 6e 20 2b 20 | ange(n.+.1).+.1.0).*.0.9./.(n.+. |
| a900 | 32 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 29 0a 78 74 6f 74 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 6e 70 2e | 2).*.2.*.np.pi).xtot[:,.1].=.np. |
| a920 | 73 69 6e 28 0a 20 20 20 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 20 2b 20 31 29 20 2b 20 31 2e 30 | sin(.....(np.arange(n.+.1).+.1.0 |
| a940 | 29 20 2a 20 30 2e 39 20 2f 20 28 6e 20 2b 20 32 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 29 0a 0a | ).*.0.9./.(n.+.2).*.2.*.np.pi).. |
| a960 | 78 73 20 3d 20 78 74 6f 74 5b 3a 6e 2c 20 3a 5d 0a 78 74 20 3d 20 78 74 6f 74 5b 31 3a 2c 20 3a | xs.=.xtot[:n,.:].xt.=.xtot[1:,.: |
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| a9e0 | 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 4d 31 20 2f | xs,.xt,.metric='euclidean').M1./ |
| aa00 | 3d 20 4d 31 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 32 20 3d 20 6f | =.M1.max()..#.loss.matrix.M2.=.o |
| aa20 | 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 | t.dist(xs,.xt,.metric='sqeuclide |
| aa40 | 61 6e 27 29 0a 4d 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 | an').M2./=.M2.max()..#.loss.matr |
| aa60 | 69 78 0a 4d 70 20 3d 20 6e 70 2e 73 71 72 74 28 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 | ix.Mp.=.np.sqrt(ot.dist(xs,.xt,. |
| aa80 | 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 29 0a 4d 70 20 2f 3d 20 4d 70 2e 6d 61 | metric='euclidean')).Mp./=.Mp.ma |
| aaa0 | 78 28 29 0a 0a 0a 23 20 44 61 74 61 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a | x()...#.Data.pl.figure(4,.figsiz |
| aac0 | 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c | e=(7,.3)).pl.clf().pl.plot(xs[:, |
| aae0 | 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 | .0],.xs[:,.1],.'+b',.label='Sour |
| ab00 | 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 | ce.samples').pl.plot(xt[:,.0],.x |
| ab20 | 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d | t[:,.1],.'xr',.label='Target.sam |
| ab40 | 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | ples').pl.axis('equal').pl.title |
| ab60 | 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 72 61 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e | ('Source.and.traget.distribution |
| ab80 | 73 27 29 0a 0a 0a 23 20 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 | s')...#.Cost.matrices.pl.figure( |
| aba0 | 35 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 | 5,.figsize=(7,.3))..pl.subplot(1 |
| abc0 | 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 31 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 | ,.3,.1).pl.imshow(M1,.interpolat |
| abe0 | 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 75 63 6c 69 64 65 | ion='nearest').pl.title('Euclide |
| ac00 | 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 70 | an.cost')..pl.subplot(1,.3,.2).p |
| ac20 | 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 32 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 | l.imshow(M2,.interpolation='near |
| ac40 | 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 | est').pl.title('Squared.Euclidea |
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| ac80 | 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 70 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 | .imshow(Mp,.interpolation='neare |
| aca0 | 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f | st').pl.title('Sqrt.Euclidean.co |
| acc0 | 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 | st').pl.tight_layout()..######## |
| ace0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| ad00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| ad20 | 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 44 61 74 61 73 65 74 20 32 20 3a 20 50 6c 6f 74 20 20 4f 54 20 4d 61 | ######.#.Dataset.2.:.Plot..OT.Ma |
| ad40 | 74 72 69 63 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | trices.#.----------------------- |
| ad60 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 0a 23 25 25 20 45 4d 44 0a 47 31 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 | ------...#%%.EMD.G1.=.ot.emd(a,. |
| ad80 | 62 2c 20 4d 31 29 0a 47 32 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 32 29 0a 47 70 20 | b,.M1).G2.=.ot.emd(a,.b,.M2).Gp. |
| ada0 | 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 70 29 0a 0a 23 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 63 65 | =.ot.emd(a,.b,.Mp)..#.OT.matrice |
| adc0 | 73 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 36 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 0a 0a | s.pl.figure(6,.figsize=(7,.3)).. |
| ade0 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 | pl.subplot(1,.3,.1).ot.plot.plot |
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| ae80 | 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c | 'xr',.label='Target.samples').pl |
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| aec0 | 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 | ).pl.title('OT.Euclidean')..pl.s |
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| af40 | 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a | ,.'+b',.label='Source.samples'). |
| af60 | 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 | pl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr' |
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| afc0 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 0a | .title('OT.squared.Euclidean').. |
| afe0 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 | pl.subplot(1,.3,.3).ot.plot.plot |
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| b040 | 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 | ,.1],.'+b',.label='Source.sample |
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| b080 | 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c | 'xr',.label='Target.samples').pl |
| b0a0 | 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 | .axis('equal').#.pl.legend(loc=0 |
| b0c0 | 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a | ).pl.title('OT.sqrt.Euclidean'). |
| b0e0 | 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 | pl.tight_layout()..pl.show().PK. |
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| b140 | 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | -.coding:.utf-8.-*-.""".======== |
| b160 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
| b180 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
| b1a0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 31 44 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 62 61 72 79 63 65 6e | =========.1D.Wasserstein.barycen |
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| b1e0 | 61 6e 64 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 3d 3d 3d 3d | and.entropic.regularization.==== |
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| b220 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
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| b280 | 61 72 69 7a 65 64 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 0a 61 73 | arized.Wasserstein.Barycenter.as |
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| b2c0 | 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 20 75 73 69 6e 67 20 73 74 61 6e 64 61 72 64 20 4c 50 20 73 6f 6c 76 | rycenters.using.standard.LP.solv |
| b2e0 | 65 72 2e 0a 0a 49 74 20 72 65 70 72 6f 64 75 63 65 73 20 61 70 70 72 6f 78 69 6d 61 74 65 6c 79 | er...It.reproduces.approximately |
| b300 | 20 46 69 67 75 72 65 20 33 2e 31 20 61 6e 64 20 33 2e 32 20 66 72 6f 6d 20 74 68 65 20 66 6f 6c | .Figure.3.1.and.3.2.from.the.fol |
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| b3a0 | 61 67 69 6e 67 20 53 63 69 65 6e 63 65 73 2c 20 39 28 31 29 2c 20 33 32 30 2d 33 34 33 2e 0a 0a | aging.Sciences,.9(1),.320-343... |
| b3c0 | 5b 33 5d 20 42 65 6e 61 6d 6f 75 2c 20 4a 2e 20 44 2e 2c 20 43 61 72 6c 69 65 72 2c 20 47 2e 2c | [3].Benamou,.J..D.,.Carlier,.G., |
| b3e0 | 20 43 75 74 75 72 69 2c 20 4d 2e 2c 20 4e 65 6e 6e 61 2c 20 4c 2e 2c 20 26 20 50 65 79 72 c3 a9 | .Cuturi,.M.,.Nenna,.L.,.&.Peyr.. |
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| b420 | 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 73 20 66 6f 72 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 74 72 61 6e 73 | rojections.for.regularized.trans |
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| b480 | 41 31 31 31 31 2d 41 31 31 33 38 2e 0a 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d | A1111-A1138..."""..#.Author:.Rem |
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| b600 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 44 | ###################.#.Gaussian.D |
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| b640 | 65 72 73 0a 0a 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 20 3d 20 5b 5d 0a 0a 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e | ers..problems.=.[]..n.=.100..#.n |
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| b6a0 | 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 | ussian.distributions.#.Gaussian. |
| b6c0 | 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 61 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d | distributions.a1.=.ot.datasets.m |
| b6e0 | 61 6b 65 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d | ake_1D_gauss(n,.m=20,.s=5)..#.m= |
| b700 | 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 0a 61 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d | .mean,.s=.std.a2.=.ot.datasets.m |
| b720 | 61 6b 65 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 36 30 2c 20 73 3d 38 29 0a 0a 23 20 63 72 | ake_1D_gauss(n,.m=60,.s=8)..#.cr |
| b740 | 65 61 74 69 6e 67 20 6d 61 74 72 69 78 20 41 20 63 6f 6e 74 61 69 6e 69 6e 67 20 61 6c 6c 20 64 | eating.matrix.A.containing.all.d |
| b760 | 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 41 20 3d 20 6e 70 2e 76 73 74 61 63 6b 28 28 61 31 2c 20 | istributions.A.=.np.vstack((a1,. |
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| b7c0 | 6f 6e 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 64 69 73 74 30 28 6e 29 0a 4d 20 2f 3d 20 4d 2e | on.M.=.ot.utils.dist0(n).M./=.M. |
| b7e0 | 6d 61 78 28 29 0a 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f | max()...#%%.plot.the.distributio |
| b800 | 6e 73 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 | ns..pl.figure(1,.figsize=(6.4,.3 |
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| b8c0 | 77 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 | weights.=.np.array([1.-.alpha,.a |
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| b940 | 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 | man.barycenter(A,.M,.reg,.weight |
| b960 | 73 29 0a 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 0a 0a 0a 6f 74 2e 74 69 63 28 29 0a 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 | s).ot.toc()...ot.tic().bary_wass |
| b980 | 32 20 3d 20 6f 74 2e 6c 70 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 77 65 69 67 68 | 2.=.ot.lp.barycenter(A,.M,.weigh |
| b9a0 | 74 73 2c 20 73 6f 6c 76 65 72 3d 27 69 6e 74 65 72 69 6f 72 2d 70 6f 69 6e 74 27 2c 20 76 65 72 | ts,.solver='interior-point',.ver |
| b9c0 | 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 | bose=True).ot.toc()..pl.figure(2 |
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| ba20 | 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | ....pl.plot(x,.A[:,.i]).pl.title |
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| ba60 | 20 31 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c 20 | .1,.2).pl.plot(x,.bary_l2,.'r',. |
| ba80 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 | label='l2').pl.plot(x,.bary_wass |
| baa0 | 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 52 65 67 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 0a | ,.'g',.label='Reg.Wasserstein'). |
| bac0 | 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 | pl.plot(x,.bary_wass2,.'b',.labe |
| bae0 | 6c 3d 27 4c 50 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 0a | l='LP.Wasserstein').pl.legend(). |
| bb00 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 | pl.title('Barycenters').pl.tight |
| bb20 | 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 5b 41 2c 20 5b | _layout()..problems.append([A,.[ |
| bb40 | 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 5d 5d | bary_l2,.bary_wass,.bary_wass2]] |
| bb60 | 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | )..############################# |
| bb80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| bba0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 44 69 72 61 63 20 44 61 74 61 0a 23 | #################.#.Dirac.Data.# |
| bbc0 | 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 0a 0a 61 31 20 | .----------..#%%.parameters..a1. |
| bbe0 | 3d 20 31 2e 30 20 2a 20 28 78 20 3e 20 31 30 29 20 2a 20 28 78 20 3c 20 35 30 29 0a 61 32 20 3d | =.1.0.*.(x.>.10).*.(x.<.50).a2.= |
| bc00 | 20 31 2e 30 20 2a 20 28 78 20 3e 20 36 30 29 20 2a 20 28 78 20 3c 20 38 30 29 0a 0a 61 31 20 2f | .1.0.*.(x.>.60).*.(x.<.80)..a1./ |
| bc20 | 3d 20 61 31 2e 73 75 6d 28 29 0a 61 32 20 2f 3d 20 61 32 2e 73 75 6d 28 29 0a 0a 23 20 63 72 65 | =.a1.sum().a2./=.a2.sum()..#.cre |
| bc40 | 61 74 69 6e 67 20 6d 61 74 72 69 78 20 41 20 63 6f 6e 74 61 69 6e 69 6e 67 20 61 6c 6c 20 64 69 | ating.matrix.A.containing.all.di |
| bc60 | 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 41 20 3d 20 6e 70 2e 76 73 74 61 63 6b 28 28 61 31 2c 20 61 | stributions.A.=.np.vstack((a1,.a |
| bc80 | 32 29 29 2e 54 0a 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 3d 20 41 2e 73 68 61 70 65 5b | 2)).T.n_distributions.=.A.shape[ |
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| bcc0 | 6e 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 64 69 73 74 30 28 6e 29 0a 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d | n.M.=.ot.utils.dist0(n).M./=.M.m |
| bce0 | 61 78 28 29 0a 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e | ax()...#%%.plot.the.distribution |
| bd00 | 73 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 | s..pl.figure(1,.figsize=(6.4,.3) |
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| bd40 | 29 3a 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 | ):.....pl.plot(x,.A[:,.i]).pl.ti |
| bd60 | 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 | tle('Distributions').pl.tight_la |
| bd80 | 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 | yout()...#%%.barycenter.computat |
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| bdc0 | 77 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 | weights.=.np.array([1.-.alpha,.a |
| bde0 | 6c 70 68 61 5d 29 0a 0a 23 20 6c 32 62 61 72 79 0a 62 61 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 | lpha])..#.l2bary.bary_l2.=.A.dot |
| be00 | 28 77 65 69 67 68 74 73 29 0a 0a 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 0a 72 65 67 20 3d 20 31 | (weights)..#.wasserstein.reg.=.1 |
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| be60 | 73 29 0a 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 0a 0a 0a 6f 74 2e 74 69 63 28 29 0a 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 | s).ot.toc()...ot.tic().bary_wass |
| be80 | 32 20 3d 20 6f 74 2e 6c 70 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 77 65 69 67 68 | 2.=.ot.lp.barycenter(A,.M,.weigh |
| bea0 | 74 73 2c 20 73 6f 6c 76 65 72 3d 27 69 6e 74 65 72 69 6f 72 2d 70 6f 69 6e 74 27 2c 20 76 65 72 | ts,.solver='interior-point',.ver |
| bec0 | 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 0a 0a 0a 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 2e 61 | bose=True).ot.toc()...problems.a |
| bee0 | 70 70 65 6e 64 28 5b 41 2c 20 5b 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 62 | ppend([A,.[bary_l2,.bary_wass,.b |
| bf00 | 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 5d 5d 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 0a 70 6c 2e 63 6c | ary_wass2]])..pl.figure(2).pl.cl |
| bf20 | 66 28 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e | f().pl.subplot(2,.1,.1).for.i.in |
| bf40 | 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 0a 20 20 20 20 70 6c 2e | .range(n_distributions):.....pl. |
| bf60 | 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 | plot(x,.A[:,.i]).pl.title('Distr |
| bf80 | 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 0a | ibutions')..pl.subplot(2,.1,.2). |
| bfa0 | 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | pl.plot(x,.bary_l2,.'r',.label=' |
| bfc0 | 6c 32 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 27 67 27 2c 20 | l2').pl.plot(x,.bary_wass,.'g',. |
| bfe0 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 52 65 67 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 | label='Reg.Wasserstein').pl.plot |
| c000 | 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 50 20 57 | (x,.bary_wass2,.'b',.label='LP.W |
| c020 | 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | asserstein').pl.legend().pl.titl |
| c040 | 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 | e('Barycenters').pl.tight_layout |
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| c080 | 73 28 6e 29 0a 61 32 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 6e 29 0a 0a 61 31 5b 31 30 5d 20 3d 20 | s(n).a2.=.np.zeros(n)..a1[10].=. |
| c0a0 | 2e 32 35 0a 61 31 5b 32 30 5d 20 3d 20 2e 35 0a 61 31 5b 33 30 5d 20 3d 20 2e 32 35 0a 61 32 5b | .25.a1[20].=..5.a1[30].=..25.a2[ |
| c0c0 | 38 30 5d 20 3d 20 31 0a 0a 0a 61 31 20 2f 3d 20 61 31 2e 73 75 6d 28 29 0a 61 32 20 2f 3d 20 61 | 80].=.1...a1./=.a1.sum().a2./=.a |
| c0e0 | 32 2e 73 75 6d 28 29 0a 0a 23 20 63 72 65 61 74 69 6e 67 20 6d 61 74 72 69 78 20 41 20 63 6f 6e | 2.sum()..#.creating.matrix.A.con |
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| c160 | 2b 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 64 69 73 | +.normalization.M.=.ot.utils.dis |
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| c1a0 | 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 | e.distributions..pl.figure(1,.fi |
| c1c0 | 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e | gsize=(6.4,.3)).for.i.in.range(n |
| c1e0 | 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 | _distributions):.....pl.plot(x,. |
| c200 | 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 | A[:,.i]).pl.title('Distributions |
| c220 | 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 25 25 20 62 61 72 79 63 | ').pl.tight_layout()...#%%.baryc |
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| c2e0 | 77 61 73 73 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 | wass.=.ot.bregman.barycenter(A,. |
| c300 | 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 0a 6f 74 2e 74 6f 63 28 29 0a 0a 0a 6f 74 2e 74 | M,.reg,.weights).ot.toc()...ot.t |
| c320 | 69 63 28 29 0a 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 20 3d 20 6f 74 2e 6c 70 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 | ic().bary_wass2.=.ot.lp.barycent |
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| c360 | 6f 72 2d 70 6f 69 6e 74 27 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 6f 74 2e 74 6f 63 28 | or-point',.verbose=True).ot.toc( |
| c380 | 29 0a 0a 0a 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 5b 41 2c 20 5b 62 61 72 79 5f 6c 32 | )...problems.append([A,.[bary_l2 |
| c3a0 | 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 32 5d 5d 29 0a 0a 70 6c 2e 66 | ,.bary_wass,.bary_wass2]])..pl.f |
| c3c0 | 69 67 75 72 65 28 32 29 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 | igure(2).pl.clf().pl.subplot(2,. |
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| c400 | 69 6f 6e 73 29 3a 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 0a 70 | ions):.....pl.plot(x,.A[:,.i]).p |
| c420 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 | l.title('Distributions')..pl.sub |
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| c4c0 | 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 50 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 | ',.label='LP.Wasserstein').pl.le |
| c4e0 | 67 65 6e 64 28 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 0a 70 | gend().pl.title('Barycenters').p |
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| c520 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| c540 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| c560 | 23 0a 23 20 46 69 6e 61 6c 20 66 69 67 75 72 65 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a | #.#.Final.figure.#.------------. |
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| c5e0 | 6e 67 65 28 6e 62 6d 29 3a 0a 0a 20 20 20 20 41 20 3d 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 5b 69 5d 5b 30 | nge(nbm):......A.=.problems[i][0 |
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| c720 | 20 20 20 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 6e 62 6d 2c 20 31 20 2b 20 69 20 2b 20 6e | ....pl.subplot(2,.nbm,.1.+.i.+.n |
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| c9e0 | 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 | ."""..#.Author:.Remi.Flamary.<re |
| ca00 | 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 | mi.flamary@unice.fr>.#.#.License |
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| ca60 | 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 2e 70 6c 6f 74 0a 0a 23 23 23 23 23 23 | import.ot.import.ot.plot..###### |
| ca80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| caa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
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| cc20 | 2c 29 29 20 2f 20 6e 2c 20 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 28 6e 2c 29 29 20 2f 20 6e 20 20 23 20 75 6e | ,))./.n,.np.ones((n,))./.n..#.un |
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| ccc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 | #############################.#. |
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| ce40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| ce60 | 23 23 23 23 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 45 4d 44 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ####.#.Compute.EMD.#.----------- |
| ce80 | 0a 0a 23 25 25 20 45 4d 44 0a 0a 47 30 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 29 0a | ..#%%.EMD..G0.=.ot.emd(a,.b,.M). |
| cea0 | 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 30 2c 20 69 6e 74 65 | .pl.figure(3).pl.imshow(G0,.inte |
| cec0 | 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f | rpolation='nearest').pl.title('O |
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| d760 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| d780 | 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 | ########.#.Plot.transported.samp |
| d7a0 | 6c 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a | les.#.------------------------.. |
| d7c0 | 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 28 35 2c 20 35 29 29 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 70 6c | pl.figure(1,.(5,.5)).pl.clf().pl |
| d7e0 | 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 27 29 0a 70 | .plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+').p |
| d800 | 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 6f 27 29 0a | l.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'o'). |
| d820 | 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b | pl.plot(xst[:,.0],.xst[:,.1],.'+ |
| d840 | 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ')..pl.show()..################# |
| d860 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| d880 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 | #############################.#. |
| d8a0 | 4c 6f 61 64 20 69 6d 61 67 65 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | Load.image.data.#.-------------- |
| d8c0 | 2d 0a 0a 0a 64 65 66 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 29 3a 0a 20 20 20 20 22 22 22 43 6f 6e 76 65 72 | -...def.im2mat(I):....."""Conver |
| d8e0 | 74 73 20 61 6e 64 20 69 6d 61 67 65 20 74 6f 20 6d 61 74 72 69 78 20 28 6f 6e 65 20 70 69 78 65 | ts.and.image.to.matrix.(one.pixe |
| d900 | 6c 20 70 65 72 20 6c 69 6e 65 29 22 22 22 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 49 2e 72 65 73 68 | l.per.line)""".....return.I.resh |
| d920 | 61 70 65 28 28 49 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 20 2a 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 20 49 2e | ape((I.shape[0].*.I.shape[1],.I. |
| d940 | 73 68 61 70 65 5b 32 5d 29 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 6d 61 74 32 69 6d 28 58 2c 20 73 68 61 70 65 | shape[2]))...def.mat2im(X,.shape |
| d960 | 29 3a 0a 20 20 20 20 22 22 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 62 61 63 6b 20 61 20 6d 61 74 72 69 78 | ):....."""Converts.back.a.matrix |
| d980 | 20 74 6f 20 61 6e 20 69 6d 61 67 65 22 22 22 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 58 2e 72 65 73 | .to.an.image""".....return.X.res |
| d9a0 | 68 61 70 65 28 73 68 61 70 65 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 49 29 3a 0a 20 20 20 | hape(shape)...def.minmax(I):.... |
| d9c0 | 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 63 6c 69 70 28 49 2c 20 30 2c 20 31 29 0a 0a 0a 23 20 4c 6f 61 | .return.np.clip(I,.0,.1)...#.Loa |
| d9e0 | 64 69 6e 67 20 69 6d 61 67 65 73 0a 49 31 20 3d 20 70 6c 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 | ding.images.I1.=.pl.imread('../d |
| da00 | 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 64 61 79 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c | ata/ocean_day.jpg').astype(np.fl |
| da20 | 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 0a 49 32 20 3d 20 70 6c 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f | oat64)./.256.I2.=.pl.imread('../ |
| da40 | 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 73 75 6e 73 65 74 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e | data/ocean_sunset.jpg').astype(n |
| da60 | 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 0a 0a 0a 58 31 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 | p.float64)./.256...X1.=.im2mat(I |
| da80 | 31 29 0a 58 32 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 32 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | 1).X2.=.im2mat(I2)..############ |
| daa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| dac0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| dae0 | 23 23 0a 23 20 45 73 74 69 6d 61 74 65 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 61 6e 64 20 61 64 61 70 74 0a | ##.#.Estimate.mapping.and.adapt. |
| db00 | 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a | #.----------------------------.. |
| db20 | 6d 61 70 70 69 6e 67 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4c 69 6e 65 61 72 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 | mapping.=.ot.da.LinearTransport( |
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| db60 | 73 74 20 3d 20 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 0a 78 74 | st.=.mapping.transform(Xs=X1).xt |
| db80 | 73 20 3d 20 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 69 6e 76 65 72 73 65 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 74 | s.=.mapping.inverse_transform(Xt |
| dba0 | 3d 58 32 29 0a 0a 49 31 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 78 73 74 2c 20 49 | =X2)..I1t.=.minmax(mat2im(xst,.I |
| dbc0 | 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 49 32 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 78 74 | 1.shape)).I2t.=.minmax(mat2im(xt |
| dbe0 | 73 2c 20 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 23 20 25 25 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | s,.I2.shape))..#.%%...########## |
| dc00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| dc20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| dc40 | 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 65 64 20 69 6d 61 67 65 73 0a 23 | ####.#.Plot.transformed.images.# |
| dc60 | 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 | .-----------------------..pl.fig |
| dc80 | 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 37 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 | ure(2,.figsize=(10,.7))..pl.subp |
| dca0 | 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 0a 70 6c 2e 61 78 | lot(2,.2,.1).pl.imshow(I1).pl.ax |
| dcc0 | 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e | is('off').pl.title('Im..1')..pl. |
| dce0 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 0a 70 | subplot(2,.2,.2).pl.imshow(I2).p |
| dd00 | 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 32 27 29 0a | l.axis('off').pl.title('Im..2'). |
| dd20 | 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 | .pl.subplot(2,.2,.3).pl.imshow(I |
| dd40 | 31 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 70 | 1t).pl.axis('off').pl.title('Map |
| dd60 | 70 69 6e 67 20 49 6d 2e 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 34 | ping.Im..1')..pl.subplot(2,.2,.4 |
| dd80 | 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a | ).pl.imshow(I2t).pl.axis('off'). |
| dda0 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6e 76 65 72 73 65 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 49 6d 2e 20 32 27 | pl.title('Inverse.mapping.Im..2' |
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| dde0 | 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 | plot_otda_mapping.py#.-*-.coding |
| de00 | 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | :.utf-8.-*-.""".================ |
| de20 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 4f 54 20 6d | ===========================.OT.m |
| de40 | 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 | apping.estimation.for.domain.ada |
| de60 | 70 74 61 74 69 6f 6e 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ptation.======================== |
| de80 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c | ===================..This.exampl |
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| dec0 | 6e 73 70 6f 72 74 20 74 6f 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 20 61 74 20 74 68 65 20 73 61 6d 65 0a 74 | nsport.to.estimate.at.the.same.t |
| dee0 | 69 6d 65 20 62 6f 74 68 20 74 68 65 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 | ime.both.the.coupling.transport. |
| df00 | 61 6e 64 20 61 70 70 72 6f 78 69 6d 61 74 65 20 74 68 65 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 6d 61 | and.approximate.the.transport.ma |
| df20 | 70 20 77 69 74 68 20 65 69 74 68 65 72 0a 61 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6f 72 20 61 20 6b 65 72 6e | p.with.either.a.linear.or.a.kern |
| df40 | 65 6c 69 7a 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 61 73 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 64 20 69 6e 20 | elized.mapping.as.introduced.in. |
| df60 | 5b 38 5d 2e 0a 0a 5b 38 5d 20 4d 2e 20 50 65 72 72 6f 74 2c 20 4e 2e 20 43 6f 75 72 74 79 2c 20 | [8]...[8].M..Perrot,.N..Courty,. |
| df80 | 52 2e 20 46 6c 61 6d 61 72 79 2c 20 41 2e 20 48 61 62 72 61 72 64 2c 0a 20 20 20 20 22 4d 61 70 | R..Flamary,.A..Habrard,....."Map |
| dfa0 | 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 | ping.estimation.for.discrete.opt |
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| e8c0 | 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 77 29 0a 0a 0a 23 | aussian.transform(Xs=Xs_new)...# |
| e8e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
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| e920 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 | #############.#.Plot.transported |
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| eb60 | 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 65 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e | arker='+',.label='Learned.mappin |
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| ec40 | 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a | transp_Xs_gaussian[:,.1],.c=ys,. |
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| f1e0 | 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 | reshape((n,.1)),.x.reshape((n,.1 |
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| f240 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| f260 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 0a 23 20 | #################.#.Plot.data.#. |
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| f3a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| f3c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 6f | ###########################.#.Co |
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| f580 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| f5a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 53 69 | ###################.#.Compute.Si |
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| f5e0 | 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | #.------------------------------ |
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| f7e0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 4f 54 20 66 6f 72 20 69 6d 61 67 65 20 63 6f 6c 6f | ==============.OT.for.image.colo |
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| 101c0 | 5d 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 | ]).transp_Xs_emd.=.ot_emd.transf |
| 101e0 | 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d | orm(Xs=X1).transp_Xt_emd.=.ot_em |
| 10200 | 64 2e 69 6e 76 65 72 73 65 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 74 3d 58 32 29 0a 0a 74 72 61 6e | d.inverse_transform(Xt=X2)..tran |
| 10220 | 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 | sp_Xs_sinkhorn.=.ot_emd.transfor |
| 10240 | 6d 28 58 73 3d 58 31 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 | m(Xs=X1).transp_Xt_sinkhorn.=.ot |
| 10260 | 5f 65 6d 64 2e 69 6e 76 65 72 73 65 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 74 3d 58 32 29 0a 0a 49 | _emd.inverse_transform(Xt=X2)..I |
| 10280 | 31 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 | 1t.=.minmax(mat2im(transp_Xs_emd |
| 102a0 | 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 49 32 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d | ,.I1.shape)).I2t.=.minmax(mat2im |
| 102c0 | 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 65 6d 64 2c 20 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 49 31 74 65 | (transp_Xt_emd,.I2.shape))..I1te |
| 102e0 | 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 | .=.minmax(mat2im(transp_Xs_sinkh |
| 10300 | 6f 72 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 49 32 74 65 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 | orn,.I1.shape)).I2te.=.minmax(ma |
| 10320 | 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 32 2e 73 68 61 70 | t2im(transp_Xt_sinkhorn,.I2.shap |
| 10340 | 65 29 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | e))...########################## |
| 10360 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 10380 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 6e 65 77 20 | ####################.#.Plot.new. |
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| 10440 | 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 | .pl.axis('off').pl.title('Image. |
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| 104a0 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 0a 0a 70 | .title('Image.1.Adapt.(reg)')..p |
| 104c0 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 | l.subplot(2,.3,.4).pl.imshow(I2) |
| 104e0 | 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 | .pl.axis('off').pl.title('Image. |
| 10500 | 32 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 | 2')..pl.subplot(2,.3,.5).pl.imsh |
| 10520 | 6f 77 28 49 32 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | ow(I2t).pl.axis('off').pl.title( |
| 10540 | 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 | 'Image.2.Adapt')..pl.subplot(2,. |
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| 10580 | 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 | ff').pl.title('Image.2.Adapt.(re |
| 105a0 | 67 29 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 | g)').pl.tight_layout()..pl.show( |
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| 105e0 | 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 00 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 67 72 6f 6d 6f 76 2e 70 79 50 4b | ................plot_gromov.pyPK |
| 10600 | 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 91 53 be 4c a4 4f 47 3f 0c 0c 00 00 0c 0c 00 00 0b 00 00 00 00 00 | ...........S.L.OG?.............. |
| 10620 | 00 00 00 00 00 00 b4 81 1f 0b 00 00 70 6c 6f 74 5f 57 44 41 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 | ............plot_WDA.pyPK....... |
| 10640 | 00 00 00 97 53 be 4c e5 d4 47 7d 9d 1c 00 00 9d 1c 00 00 19 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 | ....S.L..G}..................... |
| 10660 | 81 54 17 00 00 70 6c 6f 74 5f 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 2e 70 79 50 4b | .T...plot_gromov_barycenter.pyPK |
| 10680 | 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 90 53 be 4c b8 cd f6 1b 7e 0b 00 00 7e 0b 00 00 13 00 00 00 00 00 | ...........S.L....~...~......... |
| 106a0 | 00 00 00 00 00 00 b4 81 28 34 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 70 74 69 6d 5f 4f 54 72 65 67 2e 70 79 50 | ........(4..plot_optim_OTreg.pyP |
| 106c0 | 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 92 53 be 4c 39 06 7c 60 0c 15 00 00 0c 15 00 00 0f 00 00 00 00 | K...........S.L9.|`............. |
| 106e0 | 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 d7 3f 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 64 32 2e 70 79 50 4b 01 02 | ..........?..plot_otda_d2.pyPK.. |
| 10700 | 14 03 14 00 00 00 00 00 92 53 be 4c 71 12 0d cb 23 12 00 00 23 12 00 00 1c 00 00 00 00 00 00 00 | .........S.Lq...#...#........... |
| 10720 | 00 00 00 00 b4 81 10 55 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 73 65 6d 69 5f 73 75 70 65 72 76 69 | .......U..plot_otda_semi_supervi |
| 10740 | 73 65 64 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 90 53 be 4c 0b 5c 2a af a2 06 00 00 a2 06 | sed.pyPK...........S.L.\*....... |
| 10760 | 00 00 0d 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 6d 67 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 2e 70 | ................mg..plot_OT_1D.p |
| 10780 | 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 92 53 be 4c 1c cd f5 95 28 0d 00 00 28 0d 00 00 15 00 00 | yPK...........S.L....(...(...... |
| 107a0 | 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 3a 6e 00 00 70 6c 6f 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 31 | ...........:n..plot_barycenter_1 |
| 107c0 | 44 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 92 53 be 4c b0 31 70 de ee 10 00 00 ee 10 00 00 | D.pyPK...........S.L.1p......... |
| 107e0 | 14 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 95 7b 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6c 61 73 | ...............{..plot_otda_clas |
| 10800 | 73 65 73 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 92 53 be 4c 1a d1 23 82 4f 10 00 00 4f 10 | ses.pyPK...........S.L..#.O...O. |
| 10820 | 00 00 22 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 b5 8c 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 | ..".................plot_otda_ma |
| 10840 | 70 70 69 6e 67 5f 63 6f 6c 6f 72 73 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 | pping_colors_images.pyPK........ |
| 10860 | 00 00 92 53 be 4c 6f 6c 58 5b 88 13 00 00 88 13 00 00 13 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 | ...S.LolX[...................... |
| 10880 | 44 9d 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 4c 31 5f 76 73 5f 4c 32 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 | D...plot_OT_L1_vs_L2.pyPK....... |
| 108a0 | 00 00 00 92 53 be 4c a6 16 4e 83 2e 17 00 00 2e 17 00 00 21 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 | ....S.L..N.........!............ |
| 108c0 | 81 fd b0 00 00 70 6c 6f 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 6c 70 5f 76 73 5f 65 6e 74 72 6f | .....plot_barycenter_lp_vs_entro |
| 108e0 | 70 69 63 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 90 53 be 4c bf 4a 09 ec 55 09 00 00 55 09 | pic.pyPK...........S.L.J..U...U. |
| 10900 | 00 00 15 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 6a c8 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 32 44 5f 73 | ................j...plot_OT_2D_s |
| 10920 | 61 6d 70 6c 65 73 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 90 53 be 4c 0e e0 72 82 97 0b 00 | amples.pyPK...........S.L..r.... |
| 10940 | 00 97 0b 00 00 1b 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 f2 d1 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 | .......................plot_otda |
| 10960 | 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 92 53 | _linear_mapping.pyPK...........S |
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