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| 19e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 74 72 61 | #####################.#.Plot.tra |
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| 21c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 21e0 | 0a 23 20 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 | .#.Instantiate.the.different.tra |
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| 2220 | 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .------------------------------- |
| 2240 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 | ----------------------------..#. |
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| 22c0 | 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 | nkhorn.=.ot.da.SinkhornTransport |
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| 23a0 | 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 47 72 6f 75 70 | .#.Sinkhorn.Transport.with.Group |
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| 24e0 | 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 | khorn.=.ot_sinkhorn.transform(Xs |
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| 2540 | 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 | ot_l1l2.transform(Xs=Xs)...##### |
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| 2580 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 25a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 | #########.#.Fig.1.:.plots.source |
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| 25e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 | -----------------------------..p |
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| 2680 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 | cks([]).pl.yticks([]).pl.legend( |
| 26a0 | 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | loc=0).pl.title('Source..samples |
| 26c0 | 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 | ')..pl.subplot(1,.2,.2).pl.scatt |
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| 2740 | 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 | legend(loc=0).pl.title('Target.s |
| 2760 | 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 | amples').pl.tight_layout()...### |
| 2780 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 27a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 27c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 6f 70 74 69 6d | ###########.#.Fig.2.:.plot.optim |
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| 2820 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 | -----------------------------..p |
| 2840 | 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 20 3d 20 7b 27 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 27 3a 20 27 6e 65 | aram_img.=.{'interpolation':.'ne |
| 2860 | 61 72 65 73 74 27 2c 20 27 63 6d 61 70 27 3a 20 27 73 70 65 63 74 72 61 6c 27 7d 0a 0a 70 6c 2e | arest',.'cmap':.'spectral'}..pl. |
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| 32e0 | 0a 63 6f 76 5f 74 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 5b 31 2c 20 2d 2e 38 5d 2c 20 5b 2d 2e | .cov_t.=.np.array([[1,.-.8],.[-. |
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| 4440 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 44 61 74 | ##########################.#.Dat |
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| 52e0 | 6d 61 74 28 49 32 29 0a 0a 23 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 6e 62 20 3d | mat(I2)..#.training.samples.nb.= |
| 5300 | 20 31 30 30 30 0a 69 64 78 31 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 31 2e 73 68 61 70 65 5b | .1000.idx1.=.r.randint(X1.shape[ |
| 5320 | 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 0a 69 64 78 32 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 | 0],.size=(nb,)).idx2.=.r.randint |
| 5340 | 28 58 32 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 0a 0a 58 73 20 3d 20 | (X2.shape[0],.size=(nb,))..Xs.=. |
| 5360 | 58 31 5b 69 64 78 31 2c 20 3a 5d 0a 58 74 20 3d 20 58 32 5b 69 64 78 32 2c 20 3a 5d 0a 0a 0a 23 | X1[idx1,.:].Xt.=.X2[idx2,.:]...# |
| 5380 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 53a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 53c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 44 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f | #############.#.Domain.adaptatio |
| 53e0 | 6e 20 66 6f 72 20 70 69 78 65 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 74 72 61 6e 73 66 65 | n.for.pixel.distribution.transfe |
| 5400 | 72 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | r.#.---------------------------- |
| 5420 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 45 4d 44 54 72 61 6e | ---------------------..#.EMDTran |
| 5440 | 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 | sport.ot_emd.=.ot.da.EMDTranspor |
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| 5480 | 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 | nsp_Xs_emd.=.ot_emd.transform(Xs |
| 54a0 | 3d 58 31 29 0a 49 6d 61 67 65 5f 65 6d 64 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 | =X1).Image_emd.=.minmax(mat2im(t |
| 54c0 | 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b | ransp_Xs_emd,.I1.shape))..#.Sink |
| 54e0 | 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 | hornTransport.ot_sinkhorn.=.ot.d |
| 5500 | 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 0a | a.SinkhornTransport(reg_e=1e-1). |
| 5520 | 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 74 72 | ot_sinkhorn.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt).tr |
| 5540 | 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 | ansp_Xs_sinkhorn.=.ot_emd.transf |
| 5560 | 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 0a 49 6d 61 67 65 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6d 69 6e 6d | orm(Xs=X1).Image_sinkhorn.=.minm |
| 5580 | 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 31 | ax(mat2im(transp_Xs_sinkhorn,.I1 |
| 55a0 | 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 | .shape))..ot_mapping_linear.=.ot |
| 55c0 | 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 0a 20 20 20 20 6d 75 3d 31 65 30 | .da.MappingTransport(.....mu=1e0 |
| 55e0 | 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 38 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d | ,.eta=1e-8,.bias=True,.max_iter= |
| 5600 | 32 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e | 20,.verbose=True).ot_mapping_lin |
| 5620 | 65 61 72 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 58 31 74 6c 20 3d 20 6f 74 | ear.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)..X1tl.=.ot |
| 5640 | 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 | _mapping_linear.transform(Xs=X1) |
| 5660 | 0a 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d | .Image_mapping_linear.=.minmax(m |
| 5680 | 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 6c 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 | at2im(X1tl,.I1.shape))..ot_mappi |
| 56a0 | 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 | ng_gaussian.=.ot.da.MappingTrans |
| 56c0 | 70 6f 72 74 28 0a 20 20 20 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 32 2c 20 73 69 67 6d | port(.....mu=1e0,.eta=1e-2,.sigm |
| 56e0 | 61 3d 31 2c 20 62 69 61 73 3d 46 61 6c 73 65 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 2c 20 76 65 | a=1,.bias=False,.max_iter=10,.ve |
| 5700 | 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e | rbose=True).ot_mapping_gaussian. |
| 5720 | 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 58 31 74 6e 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 | fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)..X1tn.=.ot_map |
| 5740 | 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 20 20 | ping_gaussian.transform(Xs=X1).. |
| 5760 | 23 20 75 73 65 20 74 68 65 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 0a 49 6d 61 67 | #.use.the.estimated.mapping.Imag |
| 5780 | 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 | e_mapping_gaussian.=.minmax(mat2 |
| 57a0 | 69 6d 28 58 31 74 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | im(X1tn,.I1.shape))...########## |
| 57c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 57e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 5800 | 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 69 6d 61 67 65 73 0a 23 20 2d 2d | ####.#.Plot.original.images.#.-- |
| 5820 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c | ------------------..pl.figure(1, |
| 5840 | 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c | .figsize=(6.4,.3)).pl.subplot(1, |
| 5860 | 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 | .2,.1).pl.imshow(I1).pl.axis('of |
| 5880 | 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 | f').pl.title('Image.1')..pl.subp |
| 58a0 | 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 0a 70 6c 2e 61 78 | lot(1,.2,.2).pl.imshow(I2).pl.ax |
| 58c0 | 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 70 6c | is('off').pl.title('Image.2').pl |
| 58e0 | 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .tight_layout()...############## |
| 5900 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 5920 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 5940 | 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 70 69 78 65 6c 20 76 61 6c 75 65 73 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f | .#.Plot.pixel.values.distributio |
| 5960 | 6e 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | n.#.---------------------------- |
| 5980 | 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 35 | --..pl.figure(2,.figsize=(6.4,.5 |
| 59a0 | 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 | ))..pl.subplot(1,.2,.1).pl.scatt |
| 59c0 | 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 73 29 0a 70 6c 2e | er(Xs[:,.0],.Xs[:,.2],.c=Xs).pl. |
| 59e0 | 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 | axis([0,.1,.0,.1]).pl.xlabel('Re |
| 5a00 | 64 27 29 0a 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | d').pl.ylabel('Blue').pl.title(' |
| 5a20 | 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 | Image.1')..pl.subplot(1,.2,.2).p |
| 5a40 | 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d | l.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.2],.c= |
| 5a60 | 58 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 | Xt).pl.axis([0,.1,.0,.1]).pl.xla |
| 5a80 | 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 0a 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e | bel('Red').pl.ylabel('Blue').pl. |
| 5aa0 | 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 | title('Image.2').pl.tight_layout |
| 5ac0 | 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ()...########################### |
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| 5b00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 | ###################.#.Plot.trans |
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| 6340 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 6360 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f | ##########################.#.Plo |
| 6380 | 74 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 69 6d 61 67 65 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | t.original.image.#.------------- |
| 63a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e | ------..pl.figure(1,.figsize=(6. |
| 63c0 | 34 2c 20 33 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 | 4,.3))..pl.subplot(1,.2,.1).pl.i |
| 63e0 | 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | mshow(I1).pl.axis('off').pl.titl |
| 6400 | 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 | e('Image.1')..pl.subplot(1,.2,.2 |
| 6420 | 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 | ).pl.imshow(I2).pl.axis('off').p |
| 6440 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | l.title('Image.2')...########### |
| 6460 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 6480 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 64a0 | 23 23 23 0a 23 20 53 63 61 74 74 65 72 20 70 6c 6f 74 20 6f 66 20 63 6f 6c 6f 72 73 0a 23 20 2d | ###.#.Scatter.plot.of.colors.#.- |
| 64c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 | ---------------------..pl.figure |
| 64e0 | 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | (2,.figsize=(6.4,.3))..pl.subplo |
| 6500 | 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 | t(1,.2,.1).pl.scatter(Xs[:,.0],. |
| 6520 | 58 73 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 73 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 | Xs[:,.2],.c=Xs).pl.axis([0,.1,.0 |
| 6540 | 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 0a 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c | ,.1]).pl.xlabel('Red').pl.ylabel |
| 6560 | 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a 0a 70 6c | ('Blue').pl.title('Image.1')..pl |
| 6580 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b | .subplot(1,.2,.2).pl.scatter(Xt[ |
| 65a0 | 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b | :,.0],.Xt[:,.2],.c=Xt).pl.axis([ |
| 65c0 | 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 0a 70 6c | 0,.1,.0,.1]).pl.xlabel('Red').pl |
| 65e0 | 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 | .ylabel('Blue').pl.title('Image. |
| 6600 | 32 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 | 2').pl.tight_layout()...######## |
| 6620 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 6640 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 6660 | 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 | ######.#.Instantiate.the.differe |
| 6680 | 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 | nt.transport.algorithms.and.fit. |
| 66a0 | 74 68 65 6d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | them.#.------------------------- |
| 66c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 66e0 | 2d 2d 0a 0a 23 20 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 | --..#.EMDTransport.ot_emd.=.ot.d |
| 6700 | 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 0a 6f 74 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 | a.EMDTransport().ot_emd.fit(Xs=X |
| 6720 | 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f | s,.Xt=Xt)..#.SinkhornTransport.o |
| 6740 | 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 | t_sinkhorn.=.ot.da.SinkhornTrans |
| 6760 | 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 | port(reg_e=1e-1).ot_sinkhorn.fit |
| 6780 | 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e 20 62 65 74 | (Xs=Xs,.Xt=Xt)..#.prediction.bet |
| 67a0 | 77 65 65 6e 20 69 6d 61 67 65 73 20 28 75 73 69 6e 67 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 61 6d 70 6c 65 | ween.images.(using.out.of.sample |
| 67c0 | 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e 20 61 73 20 69 6e 20 5b 36 5d 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 | .prediction.as.in.[6]).transp_Xs |
| 67e0 | 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 0a 74 | _emd.=.ot_emd.transform(Xs=X1).t |
| 6800 | 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 69 6e 76 65 72 73 65 5f 74 72 | ransp_Xt_emd.=.ot_emd.inverse_tr |
| 6820 | 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 74 3d 58 32 29 0a 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f | ansform(Xt=X2)..transp_Xs_sinkho |
| 6840 | 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 0a 74 72 61 | rn.=.ot_emd.transform(Xs=X1).tra |
| 6860 | 6e 73 70 5f 58 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 69 6e 76 65 72 73 65 | nsp_Xt_sinkhorn.=.ot_emd.inverse |
| 6880 | 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 74 3d 58 32 29 0a 0a 49 31 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 | _transform(Xt=X2)..I1t.=.minmax( |
| 68a0 | 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 | mat2im(transp_Xs_emd,.I1.shape)) |
| 68c0 | 0a 49 32 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 65 | .I2t.=.minmax(mat2im(transp_Xt_e |
| 68e0 | 6d 64 2c 20 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 49 31 74 65 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 | md,.I2.shape))..I1te.=.minmax(ma |
| 6900 | 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 | t2im(transp_Xs_sinkhorn,.I1.shap |
| 6920 | 65 29 29 0a 49 32 74 65 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f | e)).I2te.=.minmax(mat2im(transp_ |
| 6940 | 58 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 | Xt_sinkhorn,.I2.shape))...###### |
| 6960 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 6980 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 69a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 6e 65 77 20 69 6d 61 67 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d | ########.#.Plot.new.images.#.--- |
| 69c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 | ------------..pl.figure(3,.figsi |
| 69e0 | 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 0a | ze=(8,.4))..pl.subplot(2,.3,.1). |
| 6a00 | 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e | pl.imshow(I1).pl.axis('off').pl. |
| 6a20 | 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 | title('Image.1')..pl.subplot(2,. |
| 6a40 | 33 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 | 3,.2).pl.imshow(I1t).pl.axis('of |
| 6a60 | 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 27 29 0a 0a 70 | f').pl.title('Image.1.Adapt')..p |
| 6a80 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 | l.subplot(2,.3,.3).pl.imshow(I1t |
| 6aa0 | 65 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 | e).pl.axis('off').pl.title('Imag |
| 6ac0 | 65 20 31 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | e.1.Adapt.(reg)')..pl.subplot(2, |
| 6ae0 | 20 33 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 | .3,.4).pl.imshow(I2).pl.axis('of |
| 6b00 | 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 | f').pl.title('Image.2')..pl.subp |
| 6b20 | 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 29 0a 70 6c 2e 61 | lot(2,.3,.5).pl.imshow(I2t).pl.a |
| 6b40 | 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 | xis('off').pl.title('Image.2.Ada |
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| 7480 | 74 65 72 3d 6d 61 78 69 74 65 72 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ter=maxiter)...################# |
| 74a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 74c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 | #############################.#. |
| 74e0 | 50 6c 6f 74 20 32 44 20 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | Plot.2D.projections.#.---------- |
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| 7be0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 7c00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 7c20 | 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | #.#.Generate.data.#.------------ |
| 7c40 | 2d 0a 0a 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 0a 0a 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e 62 | -..#%%.parameters..n.=.100..#.nb |
| 7c60 | 20 62 69 6e 73 0a 0a 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 0a 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 | .bins..#.bin.positions.x.=.np.ar |
| 7c80 | 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 0a 0a 23 20 47 61 75 | ange(n,.dtype=np.float64)..#.Gau |
| 7ca0 | 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 61 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 | ssian.distributions.a.=.ot.datas |
| 7cc0 | 65 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 | ets.get_1D_gauss(n,.m=20,.s=5).. |
| 7ce0 | 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 0a 62 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 | #.m=.mean,.s=.std.b.=.ot.dataset |
| 7d00 | 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 36 30 2c 20 73 3d 31 30 29 0a 0a 23 | s.get_1D_gauss(n,.m=60,.s=10)..# |
| 7d20 | 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 | .loss.matrix.M.=.ot.dist(x.resha |
| 7d40 | 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 29 0a 4d | pe((n,.1)),.x.reshape((n,.1))).M |
| 7d60 | 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ./=.M.max()..################### |
| 7d80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 7da0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f | ###########################.#.So |
| 7dc0 | 6c 76 65 20 45 4d 44 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 45 4d 44 0a 0a 47 30 | lve.EMD.#.---------..#%%.EMD..G0 |
| 7de0 | 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c | .=.ot.emd(a,.b,.M)..pl.figure(3, |
| 7e00 | 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f | .figsize=(5,.5)).ot.plot.plot1D_ |
| 7e20 | 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 30 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 30 27 29 0a 0a 23 | mat(a,.b,.G0,.'OT.matrix.G0')..# |
| 7e40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 7e60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 7e80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 46 | #############.#.Solve.EMD.with.F |
| 7ea0 | 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 23 20 2d | robenius.norm.regularization.#.- |
| 7ec0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 7ee0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 46 72 | -----------..#%%.Example.with.Fr |
| 7f00 | 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 0a 0a 64 65 | obenius.norm.regularization...de |
| 7f20 | 66 20 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 30 2e 35 20 2a 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 | f.f(G):.....return.0.5.*.np.sum( |
| 7f40 | 47 2a 2a 32 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 47 0a | G**2)...def.df(G):.....return.G. |
| 7f60 | 0a 0a 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 31 0a 0a 47 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 63 67 28 | ..reg.=.1e-1..Gl2.=.ot.optim.cg( |
| 7f80 | 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 | a,.b,.M,.reg,.f,.df,.verbose=Tru |
| 7fa0 | 65 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f | e)..pl.figure(3).ot.plot.plot1D_ |
| 7fc0 | 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 6c 32 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 46 72 6f 62 2e 20 | mat(a,.b,.Gl2,.'OT.matrix.Frob.. |
| 7fe0 | 72 65 67 27 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | reg')..######################### |
| 8000 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 8020 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 45 4d | #####################.#.Solve.EM |
| 8040 | 44 20 77 69 74 68 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 23 | D.with.entropic.regularization.# |
| 8060 | 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .------------------------------- |
| 8080 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 65 6e 74 72 6f 70 | -------..#%%.Example.with.entrop |
| 80a0 | 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 0a 0a 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 0a 20 20 | ic.regularization...def.f(G):... |
| 80c0 | 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 20 2a 20 6e 70 2e 6c 6f 67 28 47 29 29 0a 0a | ..return.np.sum(G.*.np.log(G)).. |
| 80e0 | 0a 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 6c 6f 67 28 47 29 | .def.df(G):.....return.np.log(G) |
| 8100 | 20 2b 20 31 2e 0a 0a 0a 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 0a 0a 47 65 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 | .+.1....reg.=.1e-3..Ge.=.ot.opti |
| 8120 | 6d 2e 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 | m.cg(a,.b,.M,.reg,.f,.df,.verbos |
| 8140 | 65 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 | e=True)..pl.figure(4,.figsize=(5 |
| 8160 | 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 | ,.5)).ot.plot.plot1D_mat(a,.b,.G |
| 8180 | 65 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 45 6e 74 72 6f 70 2e 20 72 65 67 27 29 0a 0a 23 23 23 | e,.'OT.matrix.Entrop..reg')..### |
| 81a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 81c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 81e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 46 72 6f | ###########.#.Solve.EMD.with.Fro |
| 8200 | 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 2b 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a | benius.norm.+.entropic.regulariz |
| 8220 | 61 74 69 6f 6e 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ation.#.------------------------ |
| 8240 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a | -------------------------------. |
| 8260 | 0a 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d | .#%%.Example.with.Frobenius.norm |
| 8280 | 20 2b 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 | .+.entropic.regularization.with. |
| 82a0 | 67 63 67 0a 0a 0a 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 30 2e 35 20 2a | gcg...def.f(G):.....return.0.5.* |
| 82c0 | 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 2a 2a 32 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 | .np.sum(G**2)...def.df(G):.....r |
| 82e0 | 65 74 75 72 6e 20 47 0a 0a 0a 72 65 67 31 20 3d 20 31 65 2d 33 0a 72 65 67 32 20 3d 20 31 65 2d | eturn.G...reg1.=.1e-3.reg2.=.1e- |
| 8300 | 31 0a 0a 47 65 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 67 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 | 1..Gel2.=.ot.optim.gcg(a,.b,.M,. |
| 8320 | 72 65 67 31 2c 20 72 65 67 32 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 | reg1,.reg2,.f,.df,.verbose=True) |
| 8340 | 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f | ..pl.figure(5,.figsize=(5,.5)).o |
| 8360 | 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 65 6c 32 2c 20 27 4f | t.plot.plot1D_mat(a,.b,.Gel2,.'O |
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| 83c0 | 64 09 00 00 13 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6d 70 75 74 65 5f 65 6d 64 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d | d.......plot_compute_emd.py#.-*- |
| 83e0 | 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | .coding:.utf-8.-*-.""".========= |
| 8400 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 50 6c 6f 74 20 6d 75 6c 74 69 70 6c 65 20 45 4d 44 0a 3d 3d 3d 3d 3d | ========.Plot.multiple.EMD.===== |
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| 9d40 | 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 | end(loc=0).pl.title('Target.samp |
| 9d60 | 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d | les')..pl.subplot(2,.2,.3).pl.im |
| 9d80 | 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 | show(M,.interpolation='nearest') |
| 9da0 | 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e | .pl.xticks([]).pl.yticks([]).pl. |
| 9dc0 | 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e | title('Matrix.of.pairwise.distan |
| 9de0 | 63 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 | ces').pl.tight_layout()...###### |
| 9e00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 9e20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 9e40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c | ########.#.Fig.2.:.plots.optimal |
| 9e60 | 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 | .couplings.for.the.different.met |
| 9e80 | 68 6f 64 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | hods.#.------------------------- |
| 9ea0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 9ec0 | 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 36 29 29 0a 0a | .pl.figure(2,.figsize=(10,.6)).. |
| 9ee0 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 | pl.subplot(2,.3,.1).pl.imshow(ot |
| 9f00 | 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e | _emd.coupling_,.interpolation='n |
| 9f20 | 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 | earest').pl.xticks([]).pl.yticks |
| 9f40 | 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c | ([]).pl.title('Optimal.coupling\ |
| 9f60 | 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 | nEMDTransport')..pl.subplot(2,.3 |
| 9f80 | 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c | ,.2).pl.imshow(ot_sinkhorn.coupl |
| 9fa0 | 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 | ing_,.interpolation='nearest').p |
| 9fc0 | 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 | l.xticks([]).pl.yticks([]).pl.ti |
| 9fe0 | 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 | tle('Optimal.coupling\nSinkhornT |
| a000 | 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 0a | ransport')..pl.subplot(2,.3,.3). |
| a020 | 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 | pl.imshow(ot_lpl1.coupling_,.int |
| a040 | 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 | erpolation='nearest').pl.xticks( |
| a060 | 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 | []).pl.yticks([]).pl.title('Opti |
| a080 | 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 | mal.coupling\nSinkhornLpl1Transp |
| a0a0 | 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 0a 6f 74 2e 70 6c | ort')..pl.subplot(2,.3,.4).ot.pl |
| a0c0 | 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 | ot.plot2D_samples_mat(Xs,.Xt,.ot |
| a0e0 | 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 | _emd.coupling_,.c=[.5,..5,.1]).p |
| a100 | 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d | l.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c= |
| a120 | 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 | ys,.marker='+',.label='Source.sa |
| a140 | 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b | mples').pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[ |
| a160 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | :,.1],.c=yt,.marker='o',.label=' |
| a180 | 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 | Target.samples').pl.xticks([]).p |
| a1a0 | 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 | l.yticks([]).pl.title('Main.coup |
| a1c0 | 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 | ling.coefficients\nEMDTransport' |
| a1e0 | 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 | )..pl.subplot(2,.3,.5).ot.plot.p |
| a200 | 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 73 69 6e | lot2D_samples_mat(Xs,.Xt,.ot_sin |
| a220 | 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a | khorn.coupling_,.c=[.5,..5,.1]). |
| a240 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 | pl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c |
| a260 | 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 | =ys,.marker='+',.label='Source.s |
| a280 | 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 | amples').pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt |
| a2a0 | 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d | [:,.1],.c=yt,.marker='o',.label= |
| a2c0 | 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a | 'Target.samples').pl.xticks([]). |
| a2e0 | 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 | pl.yticks([]).pl.title('Main.cou |
| a300 | 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e | pling.coefficients\nSinkhornTran |
| a320 | 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 0a 6f 74 2e | sport')..pl.subplot(2,.3,.6).ot. |
| a340 | 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 | plot.plot2D_samples_mat(Xs,.Xt,. |
| a360 | 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d | ot_lpl1.coupling_,.c=[.5,..5,.1] |
| a380 | 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c | ).pl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1], |
| a3a0 | 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 | .c=ys,.marker='+',.label='Source |
| a3c0 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 | .samples').pl.scatter(Xt[:,.0],. |
| a3e0 | 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 | Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',.labe |
| a400 | 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | l='Target.samples').pl.xticks([] |
| a420 | 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 | ).pl.yticks([]).pl.title('Main.c |
| a440 | 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 | oupling.coefficients\nSinkhornLp |
| a460 | 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a | l1Transport').pl.tight_layout(). |
| a480 | 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ..############################## |
| a4a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| a4c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 33 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 | ################.#.Fig.3.:.plot. |
| a4e0 | 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | transported.samples.#.---------- |
| a500 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 64 69 73 70 6c 61 | ----------------------..#.displa |
| a520 | 79 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 | y.transported.samples.pl.figure( |
| a540 | 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 34 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 | 4,.figsize=(10,.4)).pl.subplot(1 |
| a560 | 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b | ,.3,.1).pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[ |
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