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| 1220 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 | ########################.#.Compu |
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| 1260 | 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | #.------------------------------ |
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| 12e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
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| 13c0 | 20 6b 2c 20 6d 61 78 69 74 65 72 3d 6d 61 78 69 74 65 72 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .k,.maxiter=maxiter)...######### |
| 13e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
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| 1420 | 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 32 44 20 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 73 0a 23 20 2d 2d | #####.#.Plot.2D.projections.#.-- |
| 1440 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 | -----------------..#%%.plot.samp |
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| 17a0 | 2d 0d 0a 22 22 22 0d 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | -.."""..======================== |
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| 1800 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0d 0a 0d 0a 54 | ===========================....T |
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| 1840 | 68 6f 77 20 74 6f 20 75 73 65 20 74 68 65 20 47 72 6f 6d 6f 76 2d 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 | how.to.use.the.Gromov-Wasserstei |
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| 1880 | 0a 22 22 22 0d 0a 0d 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 45 72 77 61 6e 20 56 61 75 74 69 65 72 20 | ."""....#.Author:.Erwan.Vautier. |
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| 18c0 | 20 20 20 20 20 4e 69 63 6f 6c 61 73 20 43 6f 75 72 74 79 20 3c 6e 63 6f 75 72 74 79 40 69 72 69 | .....Nicolas.Courty.<ncourty@iri |
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| 1980 | 20 6d 61 6e 69 66 6f 6c 64 0d 0a 66 72 6f 6d 20 73 6b 6c 65 61 72 6e 2e 64 65 63 6f 6d 70 6f 73 | .manifold..from.sklearn.decompos |
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| 1e60 | 20 70 6f 73 20 3d 20 6d 64 73 2e 66 69 74 28 43 29 2e 65 6d 62 65 64 64 69 6e 67 5f 0d 0a 0d 0a | .pos.=.mds.fit(C).embedding_.... |
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| 1f20 | 69 6e 69 74 3d 31 29 0d 0a 20 20 20 20 6e 70 6f 73 20 3d 20 6e 6d 64 73 2e 66 69 74 5f 74 72 61 | init=1)......npos.=.nmds.fit_tra |
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| 1f60 | 6e 20 6e 70 6f 73 0d 0a 0d 0a 0d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | n.npos......#################### |
| 1f80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 1fa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0d 0a 23 20 44 61 | ##########################..#.Da |
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| 2180 | 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5b 3a 2c 20 3a 2c 20 32 5d 20 2f 20 32 35 36 0d | type(np.float64)[:,.:,.2]./.256. |
| 21a0 | 0a 73 74 61 72 20 3d 20 73 70 69 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 73 74 61 72 | .star.=.spi.imread('../data/star |
| 21c0 | 2e 70 6e 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5b 3a 2c 20 3a 2c 20 | .png').astype(np.float64)[:,.:,. |
| 21e0 | 32 5d 20 2f 20 32 35 36 0d 0a 0d 0a 73 68 61 70 65 73 20 3d 20 5b 73 71 75 61 72 65 2c 20 63 72 | 2]./.256....shapes.=.[square,.cr |
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| 2260 | 6e 20 72 61 6e 67 65 28 38 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 66 6f 72 20 6a 20 69 6e 20 72 61 | n.range(8):..........for.j.in.ra |
| 2280 | 6e 67 65 28 38 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 73 68 61 70 65 73 5b 6e | nge(8):..............if.shapes[n |
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| 22c0 | 20 20 78 73 5b 6e 62 5d 2e 61 70 70 65 6e 64 28 5b 6a 2c 20 38 20 2d 20 69 5d 29 0d 0a 0d 0a 78 | ..xs[nb].append([j,.8.-.i])....x |
| 22e0 | 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 30 5d 29 2c 20 6e | s.=.np.array([np.array(xs[0]),.n |
| 2300 | 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 31 5d 29 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | p.array(xs[1]),................. |
| 2320 | 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 32 5d 29 2c 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 33 5d 29 | np.array(xs[2]),.np.array(xs[3]) |
| 2340 | 5d 29 0d 0a 0d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ])....########################## |
| 2360 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 2380 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0d 0a 23 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 | ####################..#.Barycent |
| 23a0 | 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 0d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | er.computation..#.-------------- |
| 23c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 0d 0a 0d 0a 6e 73 20 3d 20 5b 6c 65 6e 28 78 73 5b 73 5d 29 20 66 | --------......ns.=.[len(xs[s]).f |
| 23e0 | 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 0d 0a 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 33 | or.s.in.range(S)]..n_samples.=.3 |
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| 2420 | 74 72 69 63 65 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 66 6f 75 72 20 73 68 61 70 65 73 22 22 22 0d 0a 43 | trices.for.the.four.shapes"""..C |
| 2440 | 73 20 3d 20 5b 73 70 2e 73 70 61 74 69 61 6c 2e 64 69 73 74 61 6e 63 65 2e 63 64 69 73 74 28 78 | s.=.[sp.spatial.distance.cdist(x |
| 2460 | 73 5b 73 5d 2c 20 78 73 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 0d | s[s],.xs[s]).for.s.in.range(S)]. |
| 2480 | 0a 43 73 20 3d 20 5b 63 73 20 2f 20 63 73 2e 6d 61 78 28 29 20 66 6f 72 20 63 73 20 69 6e 20 43 | .Cs.=.[cs./.cs.max().for.cs.in.C |
| 24a0 | 73 5d 0d 0a 0d 0a 70 73 20 3d 20 5b 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 73 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 | s]....ps.=.[ot.unif(ns[s]).for.s |
| 24c0 | 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 0d 0a 70 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 73 61 6d | .in.range(S)]..p.=.ot.unif(n_sam |
| 24e0 | 70 6c 65 73 29 0d 0a 0d 0a 0d 0a 6c 61 6d 62 64 61 73 74 20 3d 20 5b 5b 66 6c 6f 61 74 28 69 29 | ples)......lambdast.=.[[float(i) |
| 2500 | 20 2f 20 33 2c 20 66 6c 6f 61 74 28 33 20 2d 20 69 29 20 2f 20 33 5d 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e | ./.3,.float(3.-.i)./.3].for.i.in |
| 2520 | 20 5b 31 2c 20 32 5d 5d 0d 0a 0d 0a 43 74 30 31 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 | .[1,.2]]....Ct01.=.[0.for.i.in.r |
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| 2560 | 20 20 43 74 30 31 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 | ..Ct01[i].=.ot.gromov.gromov_bar |
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| 25c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b 30 5d 2c 20 70 73 5b 31 5d 0d 0a 20 | ................[ps[0],.ps[1]... |
| 25e0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 2600 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 | ...........],.p,.lambdast[i],.'s |
| 2620 | 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 20 23 20 35 65 2d 34 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | quare_loss',..#.5e-4,........... |
| 2640 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 2660 | 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 0d 0a 0d 0a 43 74 30 | ..max_iter=100,.tol=1e-3)....Ct0 |
| 2680 | 32 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f 72 20 69 | 2.=.[0.for.i.in.range(2)]..for.i |
| 26a0 | 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 43 74 30 32 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e | .in.range(2):......Ct02[i].=.ot. |
| 26c0 | 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 6d 70 | gromov.gromov_barycenters(n_samp |
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| 2700 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 2720 | 20 5b 70 73 5b 30 5d 2c 20 70 73 5b 32 5d 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | .[ps[0],.ps[2].................. |
| 2740 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 | ............................],.p |
| 2760 | 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 20 23 | ,.lambdast[i],.'square_loss',..# |
| 2780 | 20 35 65 2d 34 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | .5e-4,.......................... |
| 27a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c | ...................max_iter=100, |
| 27c0 | 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 0d 0a 0d 0a 43 74 31 33 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e | .tol=1e-3)....Ct13.=.[0.for.i.in |
| 27e0 | 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 0d 0a | .range(2)]..for.i.in.range(2):.. |
| 2800 | 20 20 20 20 43 74 31 33 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 | ....Ct13[i].=.ot.gromov.gromov_b |
| 2820 | 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 5b 43 73 5b 31 5d 2c 20 43 73 | arycenters(n_samples,.[Cs[1],.Cs |
| 2840 | 5b 33 5d 5d 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | [3]],........................... |
| 2860 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b 31 5d 2c 20 70 73 5b 33 5d 0d | ..................[ps[1],.ps[3]. |
| 2880 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 28a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 | .............],.p,.lambdast[i],. |
| 28c0 | 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 20 23 20 35 65 2d 34 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 | 'square_loss',..#.5e-4,......... |
| 28e0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 2900 | 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 0d 0a 0d 0a 43 | ....max_iter=100,.tol=1e-3)....C |
| 2920 | 74 32 33 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f 72 | t23.=.[0.for.i.in.range(2)]..for |
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| 3480 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a | ======================.Regulariz |
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| 34c0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 49 6c | ============================..Il |
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| 35a0 | 5d 5b 37 5d 2e 0a 0a 0a 5b 35 5d 20 4e 2e 20 43 6f 75 72 74 79 3b 20 52 2e 20 46 6c 61 6d 61 72 | ][7]....[5].N..Courty;.R..Flamar |
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| 35e0 | 74 69 6d 61 6c 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 66 6f 72 0a 44 6f 6d 61 69 6e 20 41 64 61 70 74 | timal.Transport.for.Domain.Adapt |
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| 3620 | 61 74 74 65 72 6e 20 41 6e 61 6c 79 73 69 73 20 61 6e 64 20 4d 61 63 68 69 6e 65 0a 49 6e 74 65 | attern.Analysis.and.Machine.Inte |
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| 3680 | 20 4e 2e 2c 20 50 65 79 72 c3 a9 2c 20 47 2e 2c 20 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 4a 2e 20 46 2e 20 | .N.,.Peyr..,.G.,.&.Aujol,.J..F.. |
| 36a0 | 28 32 30 31 34 29 2e 0a 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 | (2014)..Regularized.discrete.opt |
| 36c0 | 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 2e 20 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c 20 6f 6e 20 | imal.transport..SIAM.Journal.on. |
| 36e0 | 49 6d 61 67 69 6e 67 20 53 63 69 65 6e 63 65 73 2c 0a 37 28 33 29 2c 20 31 38 35 33 2d 31 38 38 | Imaging.Sciences,.7(3),.1853-188 |
| 3700 | 32 2e 0a 0a 5b 37 5d 20 52 61 6b 6f 74 6f 6d 61 6d 6f 6e 6a 79 2c 20 41 2e 2c 20 46 6c 61 6d 61 | 2...[7].Rakotomamonjy,.A.,.Flama |
| 3720 | 72 79 2c 20 52 2e 2c 20 26 20 43 6f 75 72 74 79 2c 20 4e 2e 20 28 32 30 31 35 29 2e 20 47 65 6e | ry,.R.,.&.Courty,.N..(2015)..Gen |
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| 37a0 | 31 30 2e 30 36 35 36 37 2e 0a 0a 0a 0a 22 22 22 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 | 10.06567....."""..import.numpy.a |
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| 37e0 | 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 2e 70 6c 6f 74 0a 0a 23 23 23 | pl.import.ot.import.ot.plot..### |
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| 39a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 39c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 39e0 | 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 | #####.#.Solve.EMD.#.---------..# |
| 3a00 | 25 25 20 45 4d 44 0a 0a 47 30 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 29 0a 0a 70 6c | %%.EMD..G0.=.ot.emd(a,.b,.M)..pl |
| 3a20 | 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c | .figure(3,.figsize=(5,.5)).ot.pl |
| 3a40 | 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 30 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 | ot.plot1D_mat(a,.b,.G0,.'OT.matr |
| 3a60 | 69 78 20 47 30 27 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ix.G0')..####################### |
| 3a80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 3aa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 | #######################.#.Solve. |
| 3ac0 | 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 | EMD.with.Frobenius.norm.regulari |
| 3ae0 | 7a 61 74 69 6f 6e 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | zation.#.----------------------- |
| 3b00 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 | ---------------------..#%%.Examp |
| 3b20 | 6c 65 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a | le.with.Frobenius.norm.regulariz |
| 3b40 | 61 74 69 6f 6e 0a 0a 0a 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 30 2e 35 | ation...def.f(G):.....return.0.5 |
| 3b60 | 20 2a 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 2a 2a 32 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 | .*.np.sum(G**2)...def.df(G):.... |
| 3b80 | 20 72 65 74 75 72 6e 20 47 0a 0a 0a 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 31 0a 0a 47 6c 32 20 3d 20 6f 74 | .return.G...reg.=.1e-1..Gl2.=.ot |
| 3ba0 | 2e 6f 70 74 69 6d 2e 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 | .optim.cg(a,.b,.M,.reg,.f,.df,.v |
| 3bc0 | 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 0a 6f 74 2e 70 6c | erbose=True)..pl.figure(3).ot.pl |
| 3be0 | 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 6c 32 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 | ot.plot1D_mat(a,.b,.Gl2,.'OT.mat |
| 3c00 | 72 69 78 20 46 72 6f 62 2e 20 72 65 67 27 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | rix.Frob..reg')..############### |
| 3c20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 3c40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a | ###############################. |
| 3c60 | 23 20 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 | #.Solve.EMD.with.entropic.regula |
| 3c80 | 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | rization.#.--------------------- |
| 3ca0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 | -----------------..#%%.Example.w |
| 3cc0 | 69 74 68 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 0a 0a 64 65 | ith.entropic.regularization...de |
| 3ce0 | 66 20 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 20 2a 20 6e 70 | f.f(G):.....return.np.sum(G.*.np |
| 3d00 | 2e 6c 6f 67 28 47 29 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e | .log(G))...def.df(G):.....return |
| 3d20 | 20 6e 70 2e 6c 6f 67 28 47 29 20 2b 20 31 2e 0a 0a 0a 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 0a 0a 47 65 | .np.log(G).+.1....reg.=.1e-3..Ge |
| 3d40 | 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 66 2c 20 | .=.ot.optim.cg(a,.b,.M,.reg,.f,. |
| 3d60 | 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 | df,.verbose=True)..pl.figure(4,. |
| 3d80 | 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d | figsize=(5,.5)).ot.plot.plot1D_m |
| 3da0 | 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 65 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 45 6e 74 72 6f 70 2e 20 | at(a,.b,.Ge,.'OT.matrix.Entrop.. |
| 3dc0 | 72 65 67 27 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | reg')..######################### |
| 3de0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 3e00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 45 4d | #####################.#.Solve.EM |
| 3e20 | 44 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 2b 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 | D.with.Frobenius.norm.+.entropic |
| 3e40 | 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .regularization.#.-------------- |
| 3e60 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 3e80 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 | ---------..#%%.Example.with.Frob |
| 3ea0 | 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 2b 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 | enius.norm.+.entropic.regulariza |
| 3ec0 | 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 67 63 67 0a 0a 0a 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 | tion.with.gcg...def.f(G):.....re |
| 3ee0 | 74 75 72 6e 20 30 2e 35 20 2a 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 2a 2a 32 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 64 66 | turn.0.5.*.np.sum(G**2)...def.df |
| 3f00 | 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 47 0a 0a 0a 72 65 67 31 20 3d 20 31 65 2d 33 0a | (G):.....return.G...reg1.=.1e-3. |
| 3f20 | 72 65 67 32 20 3d 20 31 65 2d 31 0a 0a 47 65 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 67 63 67 | reg2.=.1e-1..Gel2.=.ot.optim.gcg |
| 3f40 | 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 31 2c 20 72 65 67 32 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 72 | (a,.b,.M,.reg1,.reg2,.f,.df,.ver |
| 3f60 | 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 | bose=True)..pl.figure(5,.figsize |
| 3f80 | 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 | =(5,.5)).ot.plot.plot1D_mat(a,.b |
| 3fa0 | 2c 20 47 65 6c 32 2c 20 27 4f 54 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 2b 20 6d 61 74 72 69 78 20 46 72 | ,.Gel2,.'OT.entropic.+.matrix.Fr |
| 3fc0 | 6f 62 2e 20 72 65 67 27 29 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 77 79 | ob..reg').pl.show().PK........wy |
| 3fe0 | 50 4c 66 5a 12 7c 0a 15 00 00 0a 15 00 00 0f 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 64 32 2e 70 | PLfZ.|............plot_otda_d2.p |
| 4000 | 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d | y#.-*-.coding:.utf-8.-*-.""".=== |
| 4020 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
| 4040 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 | ================.OT.for.domain.a |
| 4060 | 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 65 6d 70 69 72 69 63 61 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 | daptation.on.empirical.distribut |
| 4080 | 69 6f 6e 73 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ions.=========================== |
| 40a0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 69 73 20 65 | ========================..This.e |
| 40c0 | 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 73 20 61 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 | xample.introduces.a.domain.adapt |
| 40e0 | 61 74 69 6f 6e 20 69 6e 20 61 20 32 44 20 73 65 74 74 69 6e 67 2e 20 49 74 20 65 78 70 6c 69 63 | ation.in.a.2D.setting..It.explic |
| 4100 | 69 74 73 0a 74 68 65 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 20 6f 66 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 | its.the.problem.of.domain.adapta |
| 4120 | 74 69 6f 6e 20 61 6e 64 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 73 20 73 6f 6d 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c | tion.and.introduces.some.optimal |
| 4140 | 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 61 70 70 72 6f 61 63 68 65 73 20 74 6f 20 73 6f 6c 76 65 20 69 | .transport.approaches.to.solve.i |
| 4160 | 74 2e 0a 0a 51 75 61 6e 74 69 74 69 65 73 20 73 75 63 68 20 61 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 | t...Quantities.such.as.optimal.c |
| 4180 | 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 2c 20 67 72 65 61 74 65 72 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 | ouplings,.greater.coupling.coeff |
| 41a0 | 69 63 69 65 6e 74 73 20 61 6e 64 0a 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 | icients.and.transported.samples. |
| 41c0 | 61 72 65 20 72 65 70 72 65 73 65 6e 74 65 64 20 69 6e 20 6f 72 64 65 72 20 74 6f 20 67 69 76 65 | are.represented.in.order.to.give |
| 41e0 | 20 61 20 76 69 73 75 61 6c 20 75 6e 64 65 72 73 74 61 6e 64 69 6e 67 0a 6f 66 20 77 68 61 74 20 | .a.visual.understanding.of.what. |
| 4200 | 74 68 65 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 20 61 72 65 20 64 6f 69 6e 67 2e | the.transport.methods.are.doing. |
| 4220 | 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 | ."""..#.Authors:.Remi.Flamary.<r |
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| 42e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 4300 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
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| 4440 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 4460 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
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| 44e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 4500 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 45 4d 44 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f 65 6d 64 20 | -------..#.EMD.Transport.ot_emd. |
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| 46c0 | 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c | orn.transform(Xs=Xs).transp_Xs_l |
| 46e0 | 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 0a | pl1.=.ot_lpl1.transform(Xs=Xs).. |
| 4700 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
| 4720 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 4740 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 | ###############.#.Fig.1.:.plots. |
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| 47a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 47c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a | -------------------------------. |
| 47e0 | 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 31 30 29 29 0a | .pl.figure(1,.figsize=(10,.10)). |
| 4800 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 | pl.subplot(2,.2,.1).pl.scatter(X |
| 4820 | 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d | s[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker= |
| 4840 | 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e | '+',.label='Source.samples').pl. |
| 4860 | 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 | xticks([]).pl.yticks([]).pl.lege |
| 4880 | 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 | nd(loc=0).pl.title('Source..samp |
| 48a0 | 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 | les')..pl.subplot(2,.2,.2).pl.sc |
| 48c0 | 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 | atter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,. |
| 48e0 | 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 | marker='o',.label='Target.sample |
| 4900 | 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a | s').pl.xticks([]).pl.yticks([]). |
| 4920 | 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 | pl.legend(loc=0).pl.title('Targe |
| 4940 | 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 | t.samples')..pl.subplot(2,.2,.3) |
| 4960 | 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 | .pl.imshow(M,.interpolation='nea |
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| 49a0 | 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 | ]).pl.title('Matrix.of.pairwise. |
| 49c0 | 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a | distances').pl.tight_layout()... |
| 49e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 4a00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 4a20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 6f | ##############.#.Fig.2.:.plots.o |
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| 4a80 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 4aa0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c | ------.pl.figure(2,.figsize=(10, |
| 4ac0 | 20 36 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 | .6))..pl.subplot(2,.3,.1).pl.ims |
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| 4b20 | 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 | yticks([]).pl.title('Optimal.cou |
| 4b40 | 70 6c 69 6e 67 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | pling\nEMDTransport')..pl.subplo |
| 4b60 | 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e | t(2,.3,.2).pl.imshow(ot_sinkhorn |
| 4b80 | 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 | .coupling_,.interpolation='neare |
| 4ba0 | 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 | st').pl.xticks([]).pl.yticks([]) |
| 4bc0 | 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e | .pl.title('Optimal.coupling\nSin |
| 4be0 | 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 | khornTransport')..pl.subplot(2,. |
| 4c00 | 33 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 | 3,.3).pl.imshow(ot_lpl1.coupling |
| 4c20 | 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 | _,.interpolation='nearest').pl.x |
| 4c40 | 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | ticks([]).pl.yticks([]).pl.title |
| 4c60 | 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 | ('Optimal.coupling\nSinkhornLpl1 |
| 4c80 | 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 | Transport')..pl.subplot(2,.3,.4) |
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| 4cc0 | 58 74 2c 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c | Xt,.ot_emd.coupling_,.c=[.5,..5, |
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| 4d00 | 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 | 1],.c=ys,.marker='+',.label='Sou |
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| 4d40 | 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c | ],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',.l |
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| 4d80 | 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 | ([]).pl.yticks([]).pl.title('Mai |
| 4da0 | 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e | n.coupling.coefficients\nEMDTran |
| 4dc0 | 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 0a 6f 74 2e | sport')..pl.subplot(2,.3,.5).ot. |
| 4de0 | 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 | plot.plot2D_samples_mat(Xs,.Xt,. |
| 4e00 | 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 | ot_sinkhorn.coupling_,.c=[.5,..5 |
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| 4e40 | 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f | .1],.c=ys,.marker='+',.label='So |
| 4e60 | 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 | urce.samples').pl.scatter(Xt[:,. |
| 4e80 | 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 | 0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',. |
| 4ea0 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b | label='Target.samples').pl.xtick |
| 4ec0 | 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 | s([]).pl.yticks([]).pl.title('Ma |
| 4ee0 | 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f | in.coupling.coefficients\nSinkho |
| 4f00 | 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 | rnTransport')..pl.subplot(2,.3,. |
| 4f20 | 36 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 | 6).ot.plot.plot2D_samples_mat(Xs |
| 4f40 | 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 | ,.Xt,.ot_lpl1.coupling_,.c=[.5,. |
| 4f60 | 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b | .5,.1]).pl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[ |
| 4f80 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | :,.1],.c=ys,.marker='+',.label=' |
| 4fa0 | 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a | Source.samples').pl.scatter(Xt[: |
| 4fc0 | 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 | ,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o' |
| 4fe0 | 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 | ,.label='Target.samples').pl.xti |
| 5000 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | cks([]).pl.yticks([]).pl.title(' |
| 5020 | 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 6e 53 69 6e 6b | Main.coupling.coefficients\nSink |
| 5040 | 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 | hornLpl1Transport').pl.tight_lay |
| 5060 | 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | out()...######################## |
| 5080 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 50a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 33 20 3a | ######################.#.Fig.3.: |
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| 50e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 | ----------------------------..#. |
| 5100 | 64 69 73 70 6c 61 79 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 70 6c 2e 66 | display.transported.samples.pl.f |
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| 51c0 | 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 31 5d | s_emd[:,.0],.transp_Xs_emd[:,.1] |
| 51e0 | 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c | ,.c=ys,............marker='+',.l |
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| 5b40 | 72 6e 5f 73 65 6d 69 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 74 72 61 6e 73 | rn_semi.=.ot_sinkhorn_semi.trans |
| 5b60 | 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 0a 23 20 73 65 6d 69 20 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 | form(Xs=Xs)..#.semi.supervised.D |
| 5b80 | 41 20 75 73 65 73 20 61 76 61 69 6c 61 62 6c 65 20 6c 61 62 61 6c 65 64 20 74 61 72 67 65 74 20 | A.uses.available.labaled.target. |
| 5ba0 | 73 61 6d 70 6c 65 73 20 74 6f 20 6d 6f 64 69 66 79 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 0a 23 20 6d 61 74 | samples.to.modify.the.cost.#.mat |
| 5bc0 | 72 69 78 20 69 6e 76 6f 6c 76 65 64 20 69 6e 20 74 68 65 20 4f 54 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 2e 20 | rix.involved.in.the.OT.problem.. |
| 5be0 | 54 68 65 20 63 6f 73 74 20 6f 66 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 69 6e 67 20 61 20 73 6f 75 72 63 | The.cost.of.transporting.a.sourc |
| 5c00 | 65 20 73 61 6d 70 6c 65 0a 23 20 6f 66 20 63 6c 61 73 73 20 41 20 6f 6e 74 6f 20 61 20 74 61 72 | e.sample.#.of.class.A.onto.a.tar |
| 5c20 | 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 20 6f 66 20 63 6c 61 73 73 20 42 20 21 3d 20 41 20 69 73 20 73 65 | get.sample.of.class.B.!=.A.is.se |
| 5c40 | 74 20 74 6f 20 69 6e 66 69 6e 69 74 65 2c 20 6f 72 20 61 0a 23 20 76 65 72 79 20 6c 61 72 67 65 | t.to.infinite,.or.a.#.very.large |
| 5c60 | 20 76 61 6c 75 65 0a 0a 23 20 6e 6f 74 65 20 74 68 61 74 20 69 6e 20 74 68 65 20 70 72 65 73 65 | .value..#.note.that.in.the.prese |
| 5c80 | 6e 74 20 63 61 73 65 20 77 65 20 63 6f 6e 73 69 64 65 72 20 74 68 61 74 20 61 6c 6c 20 74 68 65 | nt.case.we.consider.that.all.the |
| 5ca0 | 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 61 72 65 0a 23 20 6c 61 62 65 6c 65 64 2e 20 46 | .target.samples.are.#.labeled..F |
| 5cc0 | 6f 72 20 64 61 69 6c 79 20 61 70 70 6c 69 63 61 74 69 6f 6e 73 2c 20 73 6f 6d 65 20 74 61 72 67 | or.daily.applications,.some.targ |
| 5ce0 | 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 20 6d 69 67 68 74 20 6e 6f 74 20 68 61 76 65 20 6c 61 62 65 6c 73 2c | et.sample.might.not.have.labels, |
| 5d00 | 0a 23 20 69 6e 20 74 68 69 73 20 63 61 73 65 20 74 68 65 20 65 6c 65 6d 65 6e 74 20 6f 66 20 79 | .#.in.this.case.the.element.of.y |
| 5d20 | 74 20 63 6f 72 72 65 73 70 6f 6e 64 69 6e 67 20 74 6f 20 74 68 65 73 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | t.corresponding.to.these.samples |
| 5d40 | 20 73 68 6f 75 6c 64 20 62 65 0a 23 20 66 69 6c 6c 65 64 20 77 69 74 68 20 2d 31 2e 0a 0a 23 20 | .should.be.#.filled.with.-1...#. |
| 5d60 | 57 61 72 6e 69 6e 67 3a 20 77 65 20 72 65 63 61 6c 6c 20 74 68 61 74 20 2d 31 20 63 61 6e 6e 6f | Warning:.we.recall.that.-1.canno |
| 5d80 | 74 20 62 65 20 75 73 65 64 20 61 73 20 61 20 63 6c 61 73 73 20 6c 61 62 65 6c 0a 0a 0a 23 23 23 | t.be.used.as.a.class.label...### |
| 5da0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 5dc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 5de0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 | ###########.#.Fig.1.:.plots.sour |
| 5e00 | 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 2b 20 6d 61 74 72 69 78 20 6f | ce.and.target.samples.+.matrix.o |
| 5e20 | 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | f.pairwise.distance.#.---------- |
| 5e40 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 5e60 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e | ---------------------------..pl. |
| 5e80 | 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 31 30 29 29 0a 70 6c 2e 73 | figure(1,.figsize=(10,.10)).pl.s |
| 5ea0 | 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c | ubplot(2,.2,.1).pl.scatter(Xs[:, |
| 5ec0 | 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c | .0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+', |
| 5ee0 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 | .label='Source.samples').pl.xtic |
| 5f00 | 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c | ks([]).pl.yticks([]).pl.legend(l |
| 5f20 | 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 | oc=0).pl.title('Source..samples' |
| 5f40 | 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 | )..pl.subplot(2,.2,.2).pl.scatte |
| 5f60 | 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b | r(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.mark |
| 5f80 | 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a | er='o',.label='Target.samples'). |
| 5fa0 | 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 6c | pl.xticks([]).pl.yticks([]).pl.l |
| 5fc0 | 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 | egend(loc=0).pl.title('Target.sa |
| 5fe0 | 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e | mples')..pl.subplot(2,.2,.3).pl. |
| 6000 | 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 2e 63 6f 73 74 5f 2c 20 69 6e 74 | imshow(ot_sinkhorn_un.cost_,.int |
| 6020 | 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 | erpolation='nearest').pl.xticks( |
| 6040 | 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 | []).pl.yticks([]).pl.title('Cost |
| 6060 | 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 75 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 0a 0a 70 6c 2e | .matrix.-.unsupervised.DA')..pl. |
| 6080 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 | subplot(2,.2,.4).pl.imshow(ot_si |
| 60a0 | 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 63 6f 73 74 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e | nkhorn_semi.cost_,.interpolation |
| 60c0 | 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 | ='nearest').pl.xticks([]).pl.yti |
| 60e0 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 | cks([]).pl.title('Cost.matrix.-. |
| 6100 | 73 65 6d 69 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 0a 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 | semisupervised.DA')..pl.tight_la |
| 6120 | 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 23 20 74 68 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 69 | yout()..#.the.optimal.coupling.i |
| 6140 | 6e 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 2d 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 20 63 61 73 65 20 77 69 | n.the.semi-supervised.DA.case.wi |
| 6160 | 6c 6c 20 65 78 68 69 62 69 74 20 22 20 73 68 61 70 65 0a 23 20 73 69 6d 69 6c 61 72 22 20 74 6f | ll.exhibit.".shape.#.similar".to |
| 6180 | 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 2c 20 28 62 6c 6f 63 6b 20 64 69 61 67 6f 6e 61 | .the.cost.matrix,.(block.diagona |
| 61a0 | 6c 20 6d 61 74 72 69 78 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | l.matrix)...#################### |
| 61c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 61e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 | ##########################.#.Fig |
| 6200 | 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 66 6f 72 | .2.:.plots.optimal.couplings.for |
| 6220 | 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .the.different.methods.#.------- |
| 6240 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 6260 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c | ------------------..pl.figure(2, |
| 6280 | 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 | .figsize=(8,.4))..pl.subplot(1,. |
| 62a0 | 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 2e 63 | 2,.1).pl.imshow(ot_sinkhorn_un.c |
| 62c0 | 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 | oupling_,.interpolation='nearest |
| 62e0 | 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 | ').pl.xticks([]).pl.yticks([]).p |
| 6300 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 55 6e 73 75 70 | l.title('Optimal.coupling\nUnsup |
| 6320 | 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 | ervised.DA')..pl.subplot(1,.2,.2 |
| 6340 | 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 63 6f 75 | ).pl.imshow(ot_sinkhorn_semi.cou |
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| 7be0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 | =================.OT.for.domain. |
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| 7ca0 | 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 | uthors:.Remi.Flamary.<remi.flama |
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| 7ea0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 49 6e | ###########################.#.In |
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| 7f20 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 45 4d 44 20 54 | -----------------------..#.EMD.T |
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| 7fa0 | 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f | n.=.ot.da.SinkhornTransport(reg_ |
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| 7fe0 | 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 | t=Xt)..#.Sinkhorn.Transport.with |
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| 81c0 | 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a | .=.ot_sinkhorn.transform(Xs=Xs). |
| 81e0 | 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 6e 73 66 6f | transp_Xs_lpl1.=.ot_lpl1.transfo |
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| 8320 | 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 | .Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+',.lab |
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| 8420 | 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 | d(loc=0).pl.title('Target.sample |
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| 8480 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 84a0 | 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f | ######.#.Fig.2.:.plot.optimal.co |
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| 84e0 | 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | #.------------------------------ |
| 8500 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 61 72 61 6d 5f | ------------------------..param_ |
| 8520 | 69 6d 67 20 3d 20 7b 27 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 27 3a 20 27 6e 65 61 72 65 73 74 | img.=.{'interpolation':.'nearest |
| 8540 | 27 2c 20 27 63 6d 61 70 27 3a 20 27 73 70 65 63 74 72 61 6c 27 7d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 | ',.'cmap':.'spectral'}..pl.figur |
| 8560 | 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 35 2c 20 38 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | e(2,.figsize=(15,.8)).pl.subplot |
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| 85a0 | 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 | ing_,.**param_img).pl.xticks([]) |
| 85c0 | 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c | .pl.yticks([]).pl.title('Optimal |
| 85e0 | 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 | .coupling\nEMDTransport')..pl.su |
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| 8640 | 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | xticks([]).pl.yticks([]).pl.titl |
| 8660 | 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 | e('Optimal.coupling\nSinkhornTra |
| 8680 | 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 33 29 0a 70 6c | nsport')..pl.subplot(2,.4,.3).pl |
| 86a0 | 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 | .imshow(ot_lpl1.coupling_,.**par |
| 86c0 | 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 | am_img).pl.xticks([]).pl.yticks( |
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| 8740 | 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 | oupling_,.**param_img).pl.xticks |
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| 88a0 | 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d | ks([]).pl.title('Transported.sam |
| 88c0 | 70 6c 65 73 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c | ples\nEmdTransport').pl.legend(l |
| 88e0 | 6f 63 3d 22 6c 6f 77 65 72 20 6c 65 66 74 22 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 | oc="lower.left")..pl.subplot(2,. |
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| 89c0 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 0a 70 | .label='Transp.samples',.s=30).p |
| 89e0 | 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 | l.xticks([]).pl.yticks([]).pl.ti |
| 8a00 | 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f | tle('Transported.samples\nSinkho |
| 8a20 | 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 | rnTransport')..pl.subplot(2,.4,. |
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| 8a80 | 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 | abel='Target.samples',.alpha=0.3 |
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| 8ae0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 | ..........marker='+',.label='Tra |
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| 8ba0 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 | .marker='o',............label='T |
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| 9520 | 3d 58 31 29 0a 49 6d 61 67 65 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 | =X1).Image_sinkhorn.=.minmax(mat |
| 9540 | 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 | 2im(transp_Xs_sinkhorn,.I1.shape |
| 9560 | 29 29 0a 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 | ))..ot_mapping_linear.=.ot.da.Ma |
| 9580 | 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 0a 20 20 20 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d | ppingTransport(.....mu=1e0,.eta= |
| 95a0 | 31 65 2d 38 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 2c 20 76 65 | 1e-8,.bias=True,.max_iter=20,.ve |
| 95c0 | 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 66 69 | rbose=True).ot_mapping_linear.fi |
| 95e0 | 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 58 31 74 6c 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 | t(Xs=Xs,.Xt=Xt)..X1tl.=.ot_mappi |
| 9600 | 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 0a 49 6d 61 67 65 | ng_linear.transform(Xs=X1).Image |
| 9620 | 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 | _mapping_linear.=.minmax(mat2im( |
| 9640 | 58 31 74 6c 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 | X1tl,.I1.shape))..ot_mapping_gau |
| 9660 | 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 0a | ssian.=.ot.da.MappingTransport(. |
| 9680 | 20 20 20 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 32 2c 20 73 69 67 6d 61 3d 31 2c 20 62 | ....mu=1e0,.eta=1e-2,.sigma=1,.b |
| 96a0 | 69 61 73 3d 46 61 6c 73 65 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d | ias=False,.max_iter=10,.verbose= |
| 96c0 | 54 72 75 65 29 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 66 69 74 28 58 73 | True).ot_mapping_gaussian.fit(Xs |
| 96e0 | 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 58 31 74 6e 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 | =Xs,.Xt=Xt)..X1tn.=.ot_mapping_g |
| 9700 | 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 20 20 23 20 75 73 65 20 | aussian.transform(Xs=X1)..#.use. |
| 9720 | 74 68 65 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 0a 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 | the.estimated.mapping.Image_mapp |
| 9740 | 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 | ing_gaussian.=.minmax(mat2im(X1t |
| 9760 | 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | n,.I1.shape))...################ |
| 9780 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 97a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 | ##############################.# |
| 97c0 | 20 50 6c 6f 74 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 69 6d 61 67 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .Plot.original.images.#.-------- |
| 97e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 | ------------..pl.figure(1,.figsi |
| 9800 | 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 | ze=(6.4,.3)).pl.subplot(1,.2,.1) |
| 9820 | 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c | .pl.imshow(I1).pl.axis('off').pl |
| 9840 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c | .title('Image.1')..pl.subplot(1, |
| 9860 | 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 | .2,.2).pl.imshow(I2).pl.axis('of |
| 9880 | 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 | f').pl.title('Image.2').pl.tight |
| 98a0 | 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | _layout()...#################### |
| 98c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 98e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f | ##########################.#.Plo |
| 9900 | 74 20 70 69 78 65 6c 20 76 61 6c 75 65 73 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 0a 23 20 2d 2d | t.pixel.values.distribution.#.-- |
| 9920 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c | ----------------------------..pl |
| 9940 | 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 35 29 29 0a 0a 70 6c | .figure(2,.figsize=(6.4,.5))..pl |
| 9960 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b | .subplot(1,.2,.1).pl.scatter(Xs[ |
| 9980 | 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 73 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b | :,.0],.Xs[:,.2],.c=Xs).pl.axis([ |
| 99a0 | 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 0a 70 6c | 0,.1,.0,.1]).pl.xlabel('Red').pl |
| 99c0 | 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 | .ylabel('Blue').pl.title('Image. |
| 99e0 | 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 | 1')..pl.subplot(1,.2,.2).pl.scat |
| 9a00 | 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 74 29 0a 70 6c | ter(Xt[:,.0],.Xt[:,.2],.c=Xt).pl |
| 9a20 | 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 | .axis([0,.1,.0,.1]).pl.xlabel('R |
| 9a40 | 65 64 27 29 0a 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | ed').pl.ylabel('Blue').pl.title( |
| 9a60 | 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 | 'Image.2').pl.tight_layout()...# |
| 9a80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 9aa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 9ac0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 65 64 | #############.#.Plot.transformed |
| 9ae0 | 20 69 6d 61 67 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .images.#.---------------------- |
| 9b00 | 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 35 29 29 | -..pl.figure(2,.figsize=(10,.5)) |
| 9b20 | 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 | ..pl.subplot(2,.3,.1).pl.imshow( |
| 9b40 | 49 31 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e | I1).pl.axis('off').pl.title('Im. |
| 9b60 | 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 | .1')..pl.subplot(2,.3,.4).pl.ims |
| 9b80 | 68 6f 77 28 49 32 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | how(I2).pl.axis('off').pl.title( |
| 9ba0 | 27 49 6d 2e 20 32 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 70 6c | 'Im..2')..pl.subplot(2,.3,.2).pl |
| 9bc0 | 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 67 65 5f 65 6d 64 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 | .imshow(Image_emd).pl.axis('off' |
| 9be0 | 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 | ).pl.title('EmdTransport')..pl.s |
| 9c00 | 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 67 65 5f | ubplot(2,.3,.5).pl.imshow(Image_ |
| 9c20 | 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | sinkhorn).pl.axis('off').pl.titl |
| 9c40 | 65 28 27 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | e('SinkhornTransport')..pl.subpl |
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| 9c80 | 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 | ing_linear).pl.axis('off').pl.ti |
| 9ca0 | 74 6c 65 28 27 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 27 29 | tle('MappingTransport.(linear)') |
| 9cc0 | 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 | ..pl.subplot(2,.3,.6).pl.imshow( |
| 9ce0 | 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 | Image_mapping_gaussian).pl.axis( |
| 9d00 | 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 | 'off').pl.title('MappingTranspor |
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| a7c0 | 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 | pl.legend(loc=0).pl.title('OT.sq |
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| a840 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 44 | ############################.#.D |
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| a880 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 6e 20 3d 20 35 30 20 20 | ----------------------..n.=.50.. |
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| a900 | 20 2f 20 28 6e 20 2b 20 32 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 29 0a 78 74 6f 74 5b 3a 2c 20 | ./.(n.+.2).*.2.*.np.pi).xtot[:,. |
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| aa60 | 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 70 20 3d 20 6e 70 2e 73 71 72 74 28 6f 74 2e 64 69 73 74 28 | oss.matrix.Mp.=.np.sqrt(ot.dist( |
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| ab60 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 72 61 67 65 74 20 64 69 73 74 | pl.title('Source.and.traget.dist |
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| be80 | 74 27 2c 20 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 6e 7a 3d 6e 6f 69 73 65 5f 6c | t',.n_source_samples,.nz=noise_l |
| bea0 | 65 76 65 6c 29 0a 58 73 5f 6e 65 77 2c 20 5f 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 | evel).Xs_new,._.=.ot.datasets.ge |
| bec0 | 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 0a 20 20 20 20 27 67 61 75 73 73 72 6f 74 27 2c 20 | t_data_classif(.....'gaussrot',. |
| bee0 | 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 6e 7a 3d 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 65 6c | n_source_samples,.nz=noise_level |
| bf00 | 29 0a 58 74 2c 20 79 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f | ).Xt,.yt.=.ot.datasets.get_data_ |
| bf20 | 63 6c 61 73 73 69 66 28 0a 20 20 20 20 27 67 61 75 73 73 72 6f 74 27 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 | classif(.....'gaussrot',.n_targe |
| bf40 | 74 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 68 65 74 61 3d 74 68 65 74 61 2c 20 6e 7a 3d 6e 6f 69 73 65 | t_samples,.theta=theta,.nz=noise |
| bf60 | 5f 6c 65 76 65 6c 29 0a 0a 23 20 6f 6e 65 20 6f 66 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 6d 6f 64 | _level)..#.one.of.the.target.mod |
| bf80 | 65 20 63 68 61 6e 67 65 73 20 69 74 73 20 76 61 72 69 61 6e 63 65 20 28 6e 6f 20 6c 69 6e 65 61 | e.changes.its.variance.(no.linea |
| bfa0 | 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 29 0a 58 74 5b 79 74 20 3d 3d 20 32 5d 20 2a 3d 20 33 0a 58 74 20 3d | r.mapping).Xt[yt.==.2].*=.3.Xt.= |
| bfc0 | 20 58 74 20 2b 20 34 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .Xt.+.4..####################### |
| bfe0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| c000 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 64 | #######################.#.Plot.d |
| c020 | 61 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 28 31 | ata.#.---------..pl.figure(1,.(1 |
| c040 | 30 2c 20 35 29 29 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c | 0,.5)).pl.clf().pl.scatter(Xs[:, |
| c060 | 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c | .0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+', |
| c080 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 | .label='Source.samples').pl.scat |
| c0a0 | 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 | ter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.ma |
| c0c0 | 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 | rker='o',.label='Target.samples' |
| c0e0 | 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 | ).pl.legend(loc=0).pl.title('Sou |
| c100 | 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 0a | rce.and.target.distributions').. |
| c120 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
| c140 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| c160 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 68 | ###############.#.Instantiate.th |
| c180 | 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 73 | e.different.transport.algorithms |
| c1a0 | 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .and.fit.them.#.---------------- |
| c1c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| c1e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 | -----------..#.MappingTransport. |
| c200 | 77 69 74 68 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6b 65 72 6e 65 6c 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 | with.linear.kernel.ot_mapping_li |
| c220 | 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 0a 20 | near.=.ot.da.MappingTransport(.. |
| c240 | 20 20 20 6b 65 72 6e 65 6c 3d 22 6c 69 6e 65 61 72 22 2c 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d | ...kernel="linear",.mu=1e0,.eta= |
| c260 | 31 65 2d 38 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 0a 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 | 1e-8,.bias=True,.....max_iter=20 |
| c280 | 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 | ,.verbose=True)..ot_mapping_line |
| c2a0 | 61 72 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 | ar.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)..#.for.orig |
| c2c0 | 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 | inal.source.samples,.transform.a |
| c2e0 | 70 70 6c 69 65 73 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 0a 74 72 61 6e 73 | pplies.barycentric.mapping.trans |
| c300 | 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e | p_Xs_linear.=.ot_mapping_linear. |
| c320 | 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 0a 23 20 66 6f 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 | transform(Xs=Xs)..#.for.out.of.s |
| c340 | 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 | ource.samples,.transform.applies |
| c360 | 20 74 68 65 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 | .the.linear.mapping.transp_Xs_li |
| c380 | 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 | near_new.=.ot_mapping_linear.tra |
| c3a0 | 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 77 29 0a 0a 0a 23 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 | nsform(Xs=Xs_new)...#.MappingTra |
| c3c0 | 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 6b 65 72 6e 65 6c 0a 6f 74 5f 6d | nsport.with.gaussian.kernel.ot_m |
| c3e0 | 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 | apping_gaussian.=.ot.da.MappingT |
| c400 | 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 0a 20 20 20 20 6b 65 72 6e 65 6c 3d 22 67 61 75 73 73 69 61 6e 22 2c | ransport(.....kernel="gaussian", |
| c420 | 20 65 74 61 3d 31 65 2d 35 2c 20 6d 75 3d 31 65 2d 31 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 20 73 | .eta=1e-5,.mu=1e-1,.bias=True,.s |
| c440 | 69 67 6d 61 3d 31 2c 0a 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 | igma=1,.....max_iter=10,.verbose |
| c460 | 3d 54 72 75 65 29 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 66 69 74 28 58 | =True).ot_mapping_gaussian.fit(X |
| c480 | 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 | s=Xs,.Xt=Xt)..#.for.original.sou |
| c4a0 | 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 62 | rce.samples,.transform.applies.b |
| c4c0 | 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 | arycentric.mapping.transp_Xs_gau |
| c4e0 | 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e | ssian.=.ot_mapping_gaussian.tran |
| c500 | 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 0a 23 20 66 6f 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 | sform(Xs=Xs)..#.for.out.of.sourc |
| c520 | 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 74 68 65 | e.samples,.transform.applies.the |
| c540 | 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 | .gaussian.mapping.transp_Xs_gaus |
| c560 | 73 69 61 6e 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 | sian_new.=.ot_mapping_gaussian.t |
| c580 | 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 77 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ransform(Xs=Xs_new)...########## |
| c5a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| c5c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| c5e0 | 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a | ####.#.Plot.transported.samples. |
| c600 | 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 | #.------------------------..pl.f |
| c620 | 69 67 75 72 65 28 32 29 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 | igure(2).pl.clf().pl.subplot(2,. |
| c640 | 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c | 2,.1).pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:, |
| c660 | 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | .1],.c=yt,.marker='o',.......... |
| c680 | 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d | ..label='Target.samples',.alpha= |
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| d7a0 | 63 6b 20 61 20 6d 61 74 72 69 78 20 74 6f 20 61 6e 20 69 6d 61 67 65 22 22 22 0a 20 20 20 20 72 | ck.a.matrix.to.an.image""".....r |
| d7c0 | 65 74 75 72 6e 20 58 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 73 68 61 70 65 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 6d 69 6e | eturn.X.reshape(shape)...def.min |
| d7e0 | 6d 61 78 28 49 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 63 6c 69 70 28 49 2c 20 30 2c | max(I):.....return.np.clip(I,.0, |
| d800 | 20 31 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .1)...########################## |
| d820 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| d840 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 | ####################.#.Generate. |
| d860 | 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 4c 6f 61 64 69 6e 67 20 | data.#.-------------..#.Loading. |
| d880 | 69 6d 61 67 65 73 0a 49 31 20 3d 20 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 | images.I1.=.ndimage.imread('../d |
| d8a0 | 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 64 61 79 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c | ata/ocean_day.jpg').astype(np.fl |
| d8c0 | 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 0a 49 32 20 3d 20 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 64 | oat64)./.256.I2.=.ndimage.imread |
| d8e0 | 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 73 75 6e 73 65 74 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 | ('../data/ocean_sunset.jpg').ast |
| d900 | 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 0a 0a 58 31 20 3d 20 69 6d 32 6d | ype(np.float64)./.256..X1.=.im2m |
| d920 | 61 74 28 49 31 29 0a 58 32 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 32 29 0a 0a 23 20 74 72 61 69 6e 69 | at(I1).X2.=.im2mat(I2)..#.traini |
| d940 | 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 6e 62 20 3d 20 31 30 30 30 0a 69 64 78 31 20 3d 20 72 2e 72 61 | ng.samples.nb.=.1000.idx1.=.r.ra |
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| d980 | 64 78 32 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 32 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a | dx2.=.r.randint(X2.shape[0],.siz |
| d9a0 | 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 0a 0a 58 73 20 3d 20 58 31 5b 69 64 78 31 2c 20 3a 5d 0a 58 74 20 3d 20 | e=(nb,))..Xs.=.X1[idx1,.:].Xt.=. |
| d9c0 | 58 32 5b 69 64 78 32 2c 20 3a 5d 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | X2[idx2,.:]...################## |
| d9e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| da00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 | ############################.#.P |
| da20 | 6c 6f 74 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 69 6d 61 67 65 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | lot.original.image.#.----------- |
| da40 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 | --------..pl.figure(1,.figsize=( |
| da60 | 36 2e 34 2c 20 33 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c | 6.4,.3))..pl.subplot(1,.2,.1).pl |
| da80 | 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 | .imshow(I1).pl.axis('off').pl.ti |
| daa0 | 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c | tle('Image.1')..pl.subplot(1,.2, |
| dac0 | 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 | .2).pl.imshow(I2).pl.axis('off') |
| dae0 | 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .pl.title('Image.2')...######### |
| db00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| db20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| db40 | 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 63 61 74 74 65 72 20 70 6c 6f 74 20 6f 66 20 63 6f 6c 6f 72 73 0a 23 | #####.#.Scatter.plot.of.colors.# |
| db60 | 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 | .----------------------..pl.figu |
| db80 | 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 | re(2,.figsize=(6.4,.3))..pl.subp |
| dba0 | 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d | lot(1,.2,.1).pl.scatter(Xs[:,.0] |
| dbc0 | 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 73 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c | ,.Xs[:,.2],.c=Xs).pl.axis([0,.1, |
| dbe0 | 20 30 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 0a 70 6c 2e 79 6c 61 62 | .0,.1]).pl.xlabel('Red').pl.ylab |
| dc00 | 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a 0a | el('Blue').pl.title('Image.1').. |
| dc20 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 | pl.subplot(1,.2,.2).pl.scatter(X |
| dc40 | 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 | t[:,.0],.Xt[:,.2],.c=Xt).pl.axis |
| dc60 | 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 0a | ([0,.1,.0,.1]).pl.xlabel('Red'). |
| dc80 | 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 | pl.ylabel('Blue').pl.title('Imag |
| dca0 | 65 20 32 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 | e.2').pl.tight_layout()...###### |
| dcc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| dce0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| dd00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 | ########.#.Instantiate.the.diffe |
| dd20 | 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 73 20 61 6e 64 20 66 69 | rent.transport.algorithms.and.fi |
| dd40 | 74 20 74 68 65 6d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | t.them.#.----------------------- |
| dd60 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| dd80 | 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 | ----..#.EMDTransport.ot_emd.=.ot |
| dda0 | 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 0a 6f 74 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 | .da.EMDTransport().ot_emd.fit(Xs |
| ddc0 | 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 | =Xs,.Xt=Xt)..#.SinkhornTransport |
| dde0 | 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 | .ot_sinkhorn.=.ot.da.SinkhornTra |
| de00 | 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 | nsport(reg_e=1e-1).ot_sinkhorn.f |
| de20 | 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e 20 62 | it(Xs=Xs,.Xt=Xt)..#.prediction.b |
| de40 | 65 74 77 65 65 6e 20 69 6d 61 67 65 73 20 28 75 73 69 6e 67 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 61 6d 70 | etween.images.(using.out.of.samp |
| de60 | 6c 65 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e 20 61 73 20 69 6e 20 5b 36 5d 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f | le.prediction.as.in.[6]).transp_ |
| de80 | 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 | Xs_emd.=.ot_emd.transform(Xs=X1) |
| dea0 | 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 69 6e 76 65 72 73 65 5f | .transp_Xt_emd.=.ot_emd.inverse_ |
| dec0 | 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 74 3d 58 32 29 0a 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b | transform(Xt=X2)..transp_Xs_sink |
| dee0 | 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 0a 74 | horn.=.ot_emd.transform(Xs=X1).t |
| df00 | 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 69 6e 76 65 72 | ransp_Xt_sinkhorn.=.ot_emd.inver |
| df20 | 73 65 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 74 3d 58 32 29 0a 0a 49 31 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 | se_transform(Xt=X2)..I1t.=.minma |
| df40 | 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 | x(mat2im(transp_Xs_emd,.I1.shape |
| df60 | 29 29 0a 49 32 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 | )).I2t.=.minmax(mat2im(transp_Xt |
| df80 | 5f 65 6d 64 2c 20 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 49 31 74 65 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 | _emd,.I2.shape))..I1te.=.minmax( |
| dfa0 | 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 | mat2im(transp_Xs_sinkhorn,.I1.sh |
| dfc0 | 61 70 65 29 29 0a 49 32 74 65 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 | ape)).I2te.=.minmax(mat2im(trans |
| dfe0 | 70 5f 58 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 | p_Xt_sinkhorn,.I2.shape))...#### |
| e000 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| e020 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| e040 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 6e 65 77 20 69 6d 61 67 65 73 0a 23 20 2d | ##########.#.Plot.new.images.#.- |
| e060 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 | --------------..pl.figure(3,.fig |
| e080 | 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 | size=(8,.4))..pl.subplot(2,.3,.1 |
| e0a0 | 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 | ).pl.imshow(I1).pl.axis('off').p |
| e0c0 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 | l.title('Image.1')..pl.subplot(2 |
| e0e0 | 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 | ,.3,.2).pl.imshow(I1t).pl.axis(' |
| e100 | 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 27 29 0a | off').pl.title('Image.1.Adapt'). |
| e120 | 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 | .pl.subplot(2,.3,.3).pl.imshow(I |
| e140 | 31 74 65 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d | 1te).pl.axis('off').pl.title('Im |
| e160 | 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | age.1.Adapt.(reg)')..pl.subplot( |
| e180 | 32 2c 20 33 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 | 2,.3,.4).pl.imshow(I2).pl.axis(' |
| e1a0 | 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 | off').pl.title('Image.2')..pl.su |
| e1c0 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 29 0a 70 6c | bplot(2,.3,.5).pl.imshow(I2t).pl |
| e1e0 | 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 | .axis('off').pl.title('Image.2.A |
| e200 | 64 61 70 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 0a 70 6c 2e 69 | dapt')..pl.subplot(2,.3,.6).pl.i |
| e220 | 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 65 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 | mshow(I2te).pl.axis('off').pl.ti |
| e240 | 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 | tle('Image.2.Adapt.(reg)').pl.ti |
| e260 | 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 01 02 14 03 14 00 | ght_layout()..pl.show().PK...... |
| e280 | 00 00 00 00 76 79 50 4c d7 f6 2e c0 f2 0a 00 00 f2 0a 00 00 0e 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 | ....vyPL........................ |
| e2a0 | b4 81 00 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 67 72 6f 6d 6f 76 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 | ......plot_gromov.pyPK.......... |
| e2c0 | 77 79 50 4c a4 4f 47 3f 0c 0c 00 00 0c 0c 00 00 0b 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 1e 0b | wyPL.OG?........................ |
| e2e0 | 00 00 70 6c 6f 74 5f 57 44 41 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 77 79 50 4c e5 d4 47 | ..plot_WDA.pyPK..........wyPL..G |
| e300 | 7d 9d 1c 00 00 9d 1c 00 00 19 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 53 17 00 00 70 6c 6f 74 5f | }......................S...plot_ |
| e320 | 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 | gromov_barycenter.pyPK.......... |
| e340 | 76 79 50 4c be a0 06 25 7c 0b 00 00 7c 0b 00 00 13 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 27 34 | vyPL...%|...|.................'4 |
| e360 | 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 70 74 69 6d 5f 4f 54 72 65 67 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 | ..plot_optim_OTreg.pyPK......... |
| e380 | 00 77 79 50 4c 66 5a 12 7c 0a 15 00 00 0a 15 00 00 0f 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 d4 | .wyPLfZ.|....................... |
| e3a0 | 3f 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 64 32 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 77 79 | ?..plot_otda_d2.pyPK..........wy |
| e3c0 | 50 4c 0a ea dc a4 21 12 00 00 21 12 00 00 1c 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 0b 55 00 00 | PL....!...!..................U.. |
| e3e0 | 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 73 65 6d 69 5f 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 2e 70 79 50 4b 01 02 | plot_otda_semi_supervised.pyPK.. |
| e400 | 14 03 14 00 00 00 00 00 76 79 50 4c c6 f7 0c 9f a1 06 00 00 a1 06 00 00 0d 00 00 00 00 00 00 00 | ........vyPL.................... |
| e420 | 00 00 00 00 b4 81 66 67 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 | ......fg..plot_OT_1D.pyPK....... |
| e440 | 00 00 00 77 79 50 4c 2b 3f e5 77 26 0d 00 00 26 0d 00 00 15 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 | ...wyPL+?.w&...&................ |
| e460 | 81 32 6e 00 00 70 6c 6f 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 31 44 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 | .2n..plot_barycenter_1D.pyPK.... |
| e480 | 14 00 00 00 00 00 77 79 50 4c 60 f3 2a fb 00 11 00 00 00 11 00 00 14 00 00 00 00 00 00 00 00 00 | ......wyPL`.*................... |
| e4a0 | 00 00 b4 81 8b 7b 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6c 61 73 73 65 73 2e 70 79 50 4b 01 02 | .....{..plot_otda_classes.pyPK.. |
| e4c0 | 14 03 14 00 00 00 00 00 77 79 50 4c 1a d1 23 82 4f 10 00 00 4f 10 00 00 22 00 00 00 00 00 00 00 | ........wyPL..#.O...O..."....... |
| e4e0 | 00 00 00 00 b4 81 bd 8c 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 63 6f 6c 6f | ..........plot_otda_mapping_colo |
| e500 | 72 73 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 77 79 50 4c 10 25 96 fd | rs_images.pyPK..........wyPL.%.. |
| e520 | 88 13 00 00 88 13 00 00 13 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 4c 9d 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f | ......................L...plot_O |
| e540 | 54 5f 4c 31 5f 76 73 5f 4c 32 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 77 79 50 4c 8c 4d bd | T_L1_vs_L2.pyPK..........wyPL.M. |
| e560 | 60 44 09 00 00 44 09 00 00 15 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 05 b1 00 00 70 6c 6f 74 5f | `D...D.....................plot_ |
| e580 | 4f 54 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 77 79 50 4c | OT_2D_samples.pyPK..........wyPL |
| e5a0 | 6f e7 38 bd f1 0f 00 00 f1 0f 00 00 14 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 7c ba 00 00 70 6c | o.8.......................|...pl |
| e5c0 | 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 77 79 | ot_otda_mapping.pyPK..........wy |
| e5e0 | 50 4c c9 85 61 a8 64 09 00 00 64 09 00 00 13 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 9f ca 00 00 | PL..a.d...d..................... |
| e600 | 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6d 70 75 74 65 5f 65 6d 64 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 77 | plot_compute_emd.pyPK..........w |
| e620 | 79 50 4c 99 da 74 4f 0d 0e 00 00 0d 0e 00 00 19 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 34 d4 00 | yPL..tO......................4.. |
| e640 | 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 70 79 50 4b 05 06 00 00 | .plot_otda_color_images.pyPK.... |
| e660 | 00 00 0f 00 0f 00 e2 03 00 00 78 e2 00 00 00 00 | ..........x..... |
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index : debian-python-pot | |
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