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| 0880 | 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 | scatter(xt[:,0],xt[:,1],c=yt,mar |
| 08a0 | 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a | ker='o',label='Target.samples'). |
| 08c0 | 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 | .pl.legend(loc=0).pl.title('Sour |
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| 09e0 | 75 2c 65 74 61 3d 65 74 61 2c 62 69 61 73 3d 62 69 61 73 2c 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 20 3d | u,eta=eta,bias=bias,numItermax.= |
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| 0b20 | 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 | marker='+',label='barycentric.ma |
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| 18e0 | 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 | rce.samples').pl.legend(loc=0).p |
| 1900 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 | l.title('Source..distributions') |
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| 1940 | 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c | t[:,0],xt[:,1],c=yt,marker='o',l |
| 1960 | 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 | abel='Target.samples').pl.legend |
| 1980 | 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 74 61 72 67 65 74 20 20 64 69 73 74 72 69 | (loc=0).pl.title('target..distri |
| 19a0 | 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 0a 0a 23 25 25 20 4f 54 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 0a 0a 23 | butions')...#%%.OT.estimation..# |
| 19c0 | 20 4c 50 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 0a 64 61 5f 65 6d 64 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 28 29 20 | .LP.problem.da_emd=ot.da.OTDA(). |
| 19e0 | 20 20 20 20 23 20 69 6e 69 74 20 63 6c 61 73 73 0a 64 61 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 | ....#.init.class.da_emd.fit(xs,x |
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| 1a40 | 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 0a 0a 23 20 73 69 6e 6b 68 | tion.of.source.samples...#.sinkh |
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| 1ac0 | 73 3d 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 69 6e 74 65 72 70 28 29 0a 0a 23 20 6e 6f 6e 2d 63 6f 6e 76 | s=da_entrop.interp()..#.non-conv |
| 1ae0 | 65 78 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 72 65 | ex.Group.lasso.regularization.re |
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| 1b20 | 41 5f 6c 70 6c 31 28 29 0a 64 61 5f 6c 70 6c 31 2e 66 69 74 28 78 73 2c 79 73 2c 78 74 2c 72 65 | A_lpl1().da_lpl1.fit(xs,ys,xt,re |
| 1b40 | 67 3d 72 65 67 2c 65 74 61 3d 65 74 61 29 0a 78 73 74 67 3d 64 61 5f 6c 70 6c 31 2e 69 6e 74 65 | g=reg,eta=eta).xstg=da_lpl1.inte |
| 1b60 | 72 70 28 29 0a 0a 0a 23 20 54 72 75 65 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 | rp()...#.True.Group.lasso.regula |
| 1b80 | 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 72 65 67 3d 31 65 2d 31 0a 65 74 61 3d 32 65 30 0a 64 61 5f 6c 31 6c | rization.reg=1e-1.eta=2e0.da_l1l |
| 1ba0 | 32 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 5f 6c 31 6c 32 28 29 0a 64 61 5f 6c 31 6c 32 2e 66 69 74 28 | 2=ot.da.OTDA_l1l2().da_l1l2.fit( |
| 1bc0 | 78 73 2c 79 73 2c 78 74 2c 72 65 67 3d 72 65 67 2c 65 74 61 3d 65 74 61 2c 6e 75 6d 49 74 65 72 | xs,ys,xt,reg=reg,eta=eta,numIter |
| 1be0 | 6d 61 78 3d 32 30 2c 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 78 73 74 67 6c 3d 64 61 5f 6c 31 | max=20,verbose=True).xstgl=da_l1 |
| 1c00 | 6c 32 2e 69 6e 74 65 72 70 28 29 0a 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 | l2.interp()...#%%.plot.interpola |
| 1c20 | 74 65 64 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 28 | ted.source.samples.pl.figure(4,( |
| 1c40 | 31 35 2c 38 29 29 0a 0a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 3d 7b 27 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f | 15,8))..param_img={'interpolatio |
| 1c60 | 6e 27 3a 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 2c 27 63 6d 61 70 27 3a 27 6a 65 74 27 7d 0a 0a 70 6c 2e 73 | n':'nearest','cmap':'jet'}..pl.s |
| 1c80 | 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 34 2c 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 64 61 5f 65 6d 64 2e 47 | ubplot(2,4,1).pl.imshow(da_emd.G |
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| 1ce0 | 77 28 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 47 2c 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a 70 6c 2e 74 69 | w(da_entrop.G,**param_img).pl.ti |
| 1d00 | 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 | tle('OT.matrix.sinkhorn')..pl.su |
| 1d20 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 34 2c 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 64 61 5f 6c 70 6c 31 2e 47 | bplot(2,4,3).pl.imshow(da_lpl1.G |
| 1d40 | 2c 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 | ,**param_img).pl.title('OT.matri |
| 1d60 | 78 20 6e 6f 6e 2d 63 6f 6e 76 65 78 20 47 72 6f 75 70 20 4c 61 73 73 6f 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 | x.non-convex.Group.Lasso')..pl.s |
| 1d80 | 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 34 2c 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 64 61 5f 6c 31 6c 32 2e | ubplot(2,4,4).pl.imshow(da_l1l2. |
| 1da0 | 47 2c 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 | G,**param_img).pl.title('OT.matr |
| 1dc0 | 69 78 20 47 72 6f 75 70 20 4c 61 73 73 6f 27 29 0a 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | ix.Group.Lasso')...pl.subplot(2, |
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| 1e00 | 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 | c=yt,marker='o',label='Target.sa |
| 1e20 | 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 | mples',alpha=0.3).pl.scatter(xst |
| 1e40 | 30 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 30 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 | 0[:,0],xst0[:,1],c=ys,marker='+' |
| 1e60 | 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 73 3d 33 30 29 0a 70 6c | ,label='Transp.samples',s=30).pl |
| 1e80 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6e 74 65 72 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 | .title('Interp.samples').pl.lege |
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| 1ec0 | 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 | scatter(xt[:,0],xt[:,1],c=yt,mar |
| 1ee0 | 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 | ker='o',label='Target.samples',a |
| 1f00 | 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 | lpha=0.3).pl.scatter(xsts[:,0],x |
| 1f20 | 73 74 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 | sts[:,1],c=ys,marker='+',label=' |
| 1f40 | 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 73 3d 33 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | Transp.samples',s=30).pl.title(' |
| 1f60 | 49 6e 74 65 72 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 | Interp.samples.Sinkhorn')..pl.su |
| 1f80 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 34 2c 37 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c | bplot(2,4,7).pl.scatter(xt[:,0], |
| 1fa0 | 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 | xt[:,1],c=yt,marker='o',label='T |
| 1fc0 | 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 | arget.samples',alpha=0.3).pl.sca |
| 1fe0 | 74 74 65 72 28 78 73 74 67 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 67 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 | tter(xstg[:,0],xstg[:,1],c=ys,ma |
| 2000 | 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c | rker='+',label='Transp.samples', |
| 2020 | 73 3d 33 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6e 74 65 72 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6e | s=30).pl.title('Interp.samples.n |
| 2040 | 6f 6e 2d 63 6f 6e 76 65 78 20 47 72 6f 75 70 20 4c 61 73 73 6f 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 | on-convex.Group.Lasso')..pl.subp |
| 2060 | 6c 6f 74 28 32 2c 34 2c 38 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 | lot(2,4,8).pl.scatter(xt[:,0],xt |
| 2080 | 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 | [:,1],c=yt,marker='o',label='Tar |
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| 2920 | 6c 76 65 31 64 28 49 2c 6b 2c 61 78 69 73 3d 31 29 2c 6b 2c 61 78 69 73 3d 30 29 0a 0a 64 65 66 | lve1d(I,k,axis=1),k,axis=0)..def |
| 2940 | 20 63 6f 6e 76 32 6e 28 49 2c 6b 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 73 3d 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 5f 6c | .conv2n(I,k):.....res=np.zeros_l |
| 2960 | 69 6b 65 28 49 29 0a 20 20 20 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 49 2e 73 68 61 70 | ike(I).....for.i.in.range(I.shap |
| 2980 | 65 5b 32 5d 29 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 72 65 73 5b 3a 2c 3a 2c 69 5d 3d 63 6f 6e 76 32 28 | e[2]):.........res[:,:,i]=conv2( |
| 29a0 | 49 5b 3a 2c 3a 2c 69 5d 2c 6b 29 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 72 65 73 0a 0a 0a 64 65 66 | I[:,:,i],k).....return.res...def |
| 29c0 | 20 67 65 74 5f 31 44 6b 65 72 6e 65 6c 28 72 65 67 2c 74 68 72 3d 31 65 2d 31 36 2c 77 6d 61 78 | .get_1Dkernel(reg,thr=1e-16,wmax |
| 29e0 | 3d 31 30 32 34 29 3a 0a 20 20 20 20 77 3d 6d 61 78 28 6d 69 6e 28 77 6d 61 78 2c 32 2a 69 6e 74 | =1024):.....w=max(min(wmax,2*int |
| 2a00 | 28 28 2d 6e 70 2e 6c 6f 67 28 74 68 72 29 2a 72 65 67 29 2a 2a 28 2e 35 29 29 29 2c 33 29 0a 20 | ((-np.log(thr)*reg)**(.5))),3).. |
| 2a20 | 20 20 20 78 3d 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 77 2c 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 | ...x=np.arange(w,dtype=np.float6 |
| 2a40 | 34 29 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 65 78 70 28 2d 28 28 78 2d 77 2f 32 29 2a 2a | 4).....return.np.exp(-((x-w/2)** |
| 2a60 | 32 29 2f 72 65 67 29 0a 20 20 20 20 0a 74 68 72 3d 31 65 2d 31 36 0a 72 65 67 3d 31 65 30 0a 0a | 2)/reg)......thr=1e-16.reg=1e0.. |
| 2a80 | 6b 3d 67 65 74 5f 31 44 6b 65 72 6e 65 6c 28 72 65 67 29 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 | k=get_1Dkernel(reg).pl.figure(2) |
| 2aa0 | 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 6b 29 0a 0a 49 30 35 3d 63 6f 6e 76 32 28 49 30 2c 6b 29 0a 0a 70 6c | .pl.plot(k)..I05=conv2(I0,k)..pl |
| 2ac0 | 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 31 29 0a 70 6c 2e | .figure(1).pl.subplot(2,2,1).pl. |
| 2ae0 | 69 6d 73 68 6f 77 28 49 30 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 32 29 0a 70 6c 2e | imshow(I0).pl.subplot(2,2,2).pl. |
| 2b00 | 69 6d 73 68 6f 77 28 49 30 35 29 0a 0a 23 25 25 0a 0a 47 3d 6f 74 2e 65 6d 64 28 69 30 2c 69 31 | imshow(I05)..#%%..G=ot.emd(i0,i1 |
| 2b20 | 2c 4d 29 0a 72 30 3d 6e 70 2e 73 75 6d 28 4d 2a 47 29 0a 0a 72 65 67 3d 31 65 2d 31 0a 47 73 3d | ,M).r0=np.sum(M*G)..reg=1e-1.Gs= |
| 2b40 | 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 6b 6e 6f 70 70 28 69 30 2c 69 31 2c | ot.bregman.sinkhorn_knopp(i0,i1, |
| 2b60 | 4d 2c 72 65 67 3d 72 65 67 29 0a 72 73 3d 6e 70 2e 73 75 6d 28 4d 2a 47 73 29 0a 0a 23 25 25 0a | M,reg=reg).rs=np.sum(M*Gs)..#%%. |
| 2b80 | 0a 64 65 66 20 6d 79 6c 6f 67 28 75 29 3a 0a 20 20 20 20 74 6d 70 3d 6e 70 2e 6c 6f 67 28 75 29 | .def.mylog(u):.....tmp=np.log(u) |
| 2ba0 | 0a 20 20 20 20 74 6d 70 5b 6e 70 2e 69 73 6e 61 6e 28 74 6d 70 29 5d 3d 30 0a 20 20 20 20 72 65 | .....tmp[np.isnan(tmp)]=0.....re |
| 2bc0 | 74 75 72 6e 20 74 6d 70 0a 0a 64 65 66 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 63 6f 6e 76 28 61 2c 62 2c | turn.tmp..def.sinkhorn_conv(a,b, |
| 2be0 | 20 72 65 67 2c 20 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 20 3d 20 31 30 30 30 2c 20 73 74 6f 70 54 68 72 | .reg,.numItermax.=.1000,.stopThr |
| 2c00 | 3d 31 65 2d 39 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 46 61 6c 73 65 2c 20 6c 6f 67 3d 46 61 6c 73 65 2c | =1e-9,.verbose=False,.log=False, |
| 2c20 | 2a 2a 6b 77 61 72 67 73 29 3a 0a 0a 0a 20 20 20 20 61 3d 6e 70 2e 61 73 61 72 72 61 79 28 61 2c | **kwargs):.......a=np.asarray(a, |
| 2c40 | 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 0a 20 20 20 20 62 3d 6e 70 2e 61 73 61 72 72 | dtype=np.float64).....b=np.asarr |
| 2c60 | 61 79 28 62 2c 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 0a | ay(b,dtype=np.float64).......... |
| 2c80 | 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 69 66 20 6c 65 6e 28 62 2e 73 68 61 70 65 29 3e 32 3a 0a 20 20 20 20 | .........if.len(b.shape)>2:..... |
| 2ca0 | 20 20 20 20 6e 62 62 3d 62 2e 73 68 61 70 65 5b 32 5d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 61 3d 61 5b 3a | ....nbb=b.shape[2].........a=a[: |
| 2cc0 | 2c 3a 2c 6e 70 2e 6e 65 77 61 78 69 73 5d 0a 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 | ,:,np.newaxis].....else:........ |
| 2ce0 | 20 6e 62 62 3d 30 0a 20 20 20 20 0a 0a 20 20 20 20 69 66 20 6c 6f 67 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 | .nbb=0...........if.log:........ |
| 2d00 | 20 6c 6f 67 3d 7b 27 65 72 72 27 3a 5b 5d 7d 0a 0a 20 20 20 20 23 20 77 65 20 61 73 73 75 6d 65 | .log={'err':[]}......#.we.assume |
| 2d20 | 20 74 68 61 74 20 6e 6f 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 20 61 72 65 20 6e 75 6c 6c 20 65 78 63 65 | .that.no.distances.are.null.exce |
| 2d40 | 70 74 20 74 68 6f 73 65 20 6f 66 20 74 68 65 20 64 69 61 67 6f 6e 61 6c 20 6f 66 20 64 69 73 74 | pt.those.of.the.diagonal.of.dist |
| 2d60 | 61 6e 63 65 73 0a 20 20 20 20 69 66 20 6e 62 62 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 75 20 3d 20 6e 70 | ances.....if.nbb:.........u.=.np |
| 2d80 | 2e 6f 6e 65 73 28 28 61 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 61 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 6e 62 62 | .ones((a.shape[0],a.shape[1],nbb |
| 2da0 | 29 29 2f 28 6e 70 2e 70 72 6f 64 28 61 2e 73 68 61 70 65 5b 3a 32 5d 29 29 0a 20 20 20 20 20 20 | ))/(np.prod(a.shape[:2]))....... |
| 2dc0 | 20 20 76 20 3d 20 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 28 61 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 61 2e 73 68 61 70 | ..v.=.np.ones((a.shape[0],a.shap |
| 2de0 | 65 5b 31 5d 2c 6e 62 62 29 29 2f 28 6e 70 2e 70 72 6f 64 28 62 2e 73 68 61 70 65 5b 3a 32 5d 29 | e[1],nbb))/(np.prod(b.shape[:2]) |
| 2e00 | 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 61 30 3d 31 2e 30 2f 28 6e 70 2e 70 72 6f 64 28 62 2e 73 68 61 70 | ).........a0=1.0/(np.prod(b.shap |
| 2e20 | 65 5b 3a 32 5d 29 29 0a 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 75 20 3d 20 6e 70 | e[:2])).....else:.........u.=.np |
| 2e40 | 2e 6f 6e 65 73 28 28 61 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 61 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 29 29 2f 28 | .ones((a.shape[0],a.shape[1]))/( |
| 2e60 | 6e 70 2e 70 72 6f 64 28 61 2e 73 68 61 70 65 5b 3a 32 5d 29 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 76 20 | np.prod(a.shape[:2])).........v. |
| 2e80 | 3d 20 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 28 61 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 61 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d | =.np.ones((a.shape[0],a.shape[1] |
| 2ea0 | 29 29 2f 28 6e 70 2e 70 72 6f 64 28 62 2e 73 68 61 70 65 5b 3a 32 5d 29 29 0a 20 20 20 20 20 20 | ))/(np.prod(b.shape[:2]))....... |
| 2ec0 | 20 20 61 30 3d 31 2e 30 2f 28 6e 70 2e 70 72 6f 64 28 62 2e 73 68 61 70 65 5b 3a 32 5d 29 29 0a | ..a0=1.0/(np.prod(b.shape[:2])). |
| 2ee0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 6b 3d 67 65 74 5f 31 44 6b 65 | ......................k=get_1Dke |
| 2f00 | 72 6e 65 6c 28 72 65 67 29 0a 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 69 66 20 6e 62 62 3a 0a 20 20 20 20 20 | rnel(reg)..........if.nbb:...... |
| 2f20 | 20 20 20 4b 3d 6c 61 6d 62 64 61 20 49 3a 20 63 6f 6e 76 32 6e 28 49 2c 6b 29 0a 20 20 20 20 65 | ...K=lambda.I:.conv2n(I,k).....e |
| 2f40 | 6c 73 65 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 4b 3d 6c 61 6d 62 64 61 20 49 3a 20 63 6f 6e 76 32 28 49 | lse:.........K=lambda.I:.conv2(I |
| 2f60 | 2c 6b 29 0a 0a 20 20 20 20 63 70 74 20 3d 20 30 0a 20 20 20 20 65 72 72 3d 31 0a 20 20 20 20 77 | ,k)......cpt.=.0.....err=1.....w |
| 2f80 | 68 69 6c 65 20 28 65 72 72 3e 73 74 6f 70 54 68 72 20 61 6e 64 20 63 70 74 3c 6e 75 6d 49 74 65 | hile.(err>stopThr.and.cpt<numIte |
| 2fa0 | 72 6d 61 78 29 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 75 70 72 65 76 20 3d 20 75 0a 20 20 20 20 20 20 20 | rmax):.........uprev.=.u........ |
| 2fc0 | 20 76 70 72 65 76 20 3d 20 76 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 76 20 3d 20 | .vprev.=.v..................v.=. |
| 2fe0 | 6e 70 2e 64 69 76 69 64 65 28 62 2c 20 4b 28 75 29 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 75 20 3d 20 6e | np.divide(b,.K(u)).........u.=.n |
| 3000 | 70 2e 64 69 76 69 64 65 28 61 2c 20 4b 28 76 29 29 0a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 28 6e | p.divide(a,.K(v))..........if.(n |
| 3020 | 70 2e 61 6e 79 28 6e 70 2e 69 73 6e 61 6e 28 75 29 29 20 6f 72 20 6e 70 2e 61 6e 79 28 6e 70 2e | p.any(np.isnan(u)).or.np.any(np. |
| 3040 | 69 73 6e 61 6e 28 76 29 29 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6f 72 20 6e 70 2e 61 6e 79 | isnan(v))..............or.np.any |
| 3060 | 28 6e 70 2e 69 73 69 6e 66 28 75 29 29 20 6f 72 20 6e 70 2e 61 6e 79 28 6e 70 2e 69 73 69 6e 66 | (np.isinf(u)).or.np.any(np.isinf |
| 3080 | 28 76 29 29 29 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 23 20 77 65 20 68 61 76 65 20 72 65 61 | (v))):.............#.we.have.rea |
| 30a0 | 63 68 65 64 20 74 68 65 20 6d 61 63 68 69 6e 65 20 70 72 65 63 69 73 69 6f 6e 0a 20 20 20 20 20 | ched.the.machine.precision...... |
| 30c0 | 20 20 20 20 20 20 20 23 20 63 6f 6d 65 20 62 61 63 6b 20 74 6f 20 70 72 65 76 69 6f 75 73 20 73 | .......#.come.back.to.previous.s |
| 30e0 | 6f 6c 75 74 69 6f 6e 20 61 6e 64 20 71 75 69 74 20 6c 6f 6f 70 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | olution.and.quit.loop........... |
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| 3120 | 72 73 20 61 74 20 69 74 65 72 61 74 69 6f 6e 27 2c 20 63 70 74 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | rs.at.iteration',.cpt).......... |
| 3140 | 20 20 20 75 20 3d 20 75 70 72 65 76 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 76 20 3d 20 76 70 72 | ...u.=.uprev.............v.=.vpr |
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| 3240 | 76 29 2a 2a 32 29 0a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 6c 6f 67 3a 0a 20 20 20 20 | v)**2)..............if.log:..... |
| 3260 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 6f 67 5b 27 65 72 72 27 5d 2e 61 70 70 65 6e 64 28 65 72 | ............log['err'].append(er |
| 3280 | 72 29 0a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 76 65 72 62 6f 73 65 3a 0a 20 20 20 20 | r)..............if.verbose:..... |
| 32a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 63 70 74 25 32 30 30 20 3d 3d 30 3a 0a 20 20 20 20 | ............if.cpt%200.==0:..... |
| 32c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 70 72 69 6e 74 28 27 7b 3a 35 73 7d 7c 7b 3a 31 | ................print('{:5s}|{:1 |
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| 3320 | 64 7d 7c 7b 3a 38 65 7d 7c 27 2e 66 6f 72 6d 61 74 28 63 70 74 2c 65 72 72 29 29 0a 20 20 20 20 | d}|{:8e}|'.format(cpt,err))..... |
| 3340 | 20 20 20 20 63 70 74 20 3d 20 63 70 74 20 2b 31 0a 20 20 20 20 69 66 20 6c 6f 67 3a 0a 20 20 20 | ....cpt.=.cpt.+1.....if.log:.... |
| 3360 | 20 20 20 20 20 6c 6f 67 5b 27 75 27 5d 3d 75 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 6f 67 5b 27 76 27 5d | .....log['u']=u.........log['v'] |
| 3380 | 3d 76 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 69 66 20 6e 62 62 3a 20 23 72 65 74 75 72 6e 20 | =v..............if.nbb:.#return. |
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| 3480 | 20 20 20 20 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 20 23 20 72 65 | ......................else:.#.re |
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| 34e0 | 6f 67 28 76 2b 28 76 3d 3d 30 29 29 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 6c 6f 67 3a 0a 20 20 | og(v+(v==0))).........if.log:... |
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| 3620 | 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | "".============================= |
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| 3740 | 69 6d 70 6f 72 74 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 0a 0a 0a 23 25 25 20 70 61 72 61 | import.PolyCollection...#%%.para |
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| 3960 | 65 69 67 68 74 73 3d 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 2d 61 6c 70 68 61 2c 61 6c 70 68 61 5d 29 | eights=np.array([1-alpha,alpha]) |
| 3980 | 0a 0a 23 20 6c 32 62 61 72 79 0a 62 61 72 79 5f 6c 32 3d 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 | ..#.l2bary.bary_l2=A.dot(weights |
| 39a0 | 29 0a 0a 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 0a 72 65 67 3d 31 65 2d 33 0a 62 61 72 79 5f 77 | )..#.wasserstein.reg=1e-3.bary_w |
| 39c0 | 61 73 73 3d 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 4d 2c 72 65 | ass=ot.bregman.barycenter(A,M,re |
| 39e0 | 67 2c 77 65 69 67 68 74 73 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 | g,weights)..pl.figure(2).pl.clf( |
| 3a00 | 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 31 2c 31 29 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e | ).pl.subplot(2,1,1).for.i.in.ran |
| 3a20 | 67 65 28 6e 62 64 29 3a 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 41 5b 3a 2c 69 5d 29 0a 70 | ge(nbd):.....pl.plot(x,A[:,i]).p |
| 3a40 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 | l.title('Distributions')..pl.sub |
| 3a60 | 70 6c 6f 74 28 32 2c 31 2c 32 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 27 72 | plot(2,1,2).pl.plot(x,bary_l2,'r |
| 3a80 | 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 62 61 72 79 5f 77 61 73 | ',label='l2').pl.plot(x,bary_was |
| 3aa0 | 73 2c 27 67 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 | s,'g',label='Wasserstein').pl.le |
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| 3b20 | 30 2c 31 2c 6e 62 61 6c 70 68 61 29 0a 0a 0a 42 5f 6c 32 3d 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2c | 0,1,nbalpha)...B_l2=np.zeros((n, |
| 3b40 | 6e 62 61 6c 70 68 61 29 29 0a 0a 42 5f 77 61 73 73 3d 6e 70 2e 63 6f 70 79 28 42 5f 6c 32 29 0a | nbalpha))..B_wass=np.copy(B_l2). |
| 3b60 | 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 30 2c 6e 62 61 6c 70 68 61 29 3a 0a 20 20 20 20 | .for.i.in.range(0,nbalpha):..... |
| 3b80 | 61 6c 70 68 61 3d 61 6c 70 68 61 6c 69 73 74 5b 69 5d 0a 20 20 20 20 77 65 69 67 68 74 73 3d 6e | alpha=alphalist[i].....weights=n |
| 3ba0 | 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 2d 61 6c 70 68 61 2c 61 6c 70 68 61 5d 29 0a 20 20 20 20 42 5f 6c | p.array([1-alpha,alpha]).....B_l |
| 3bc0 | 32 5b 3a 2c 69 5d 3d 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 0a 20 20 20 20 42 5f 77 61 73 73 | 2[:,i]=A.dot(weights).....B_wass |
| 3be0 | 5b 3a 2c 69 5d 3d 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 4d 2c | [:,i]=ot.bregman.barycenter(A,M, |
| 3c00 | 72 65 67 2c 77 65 69 67 68 74 73 29 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 | reg,weights)..#%%.plot.interpola |
| 3c20 | 74 69 6f 6e 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 28 31 30 2c 35 29 29 0a 0a 23 70 6c 2e 73 | tion..pl.figure(3,(10,5))..#pl.s |
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| 3ca0 | 0a 20 20 20 20 79 73 20 3d 20 42 5f 6c 32 5b 3a 2c 69 5d 0a 20 20 20 20 76 65 72 74 73 2e 61 70 | .....ys.=.B_l2[:,i].....verts.ap |
| 3cc0 | 70 65 6e 64 28 6c 69 73 74 28 7a 69 70 28 78 2c 20 79 73 29 29 29 0a 0a 61 78 20 3d 20 70 6c 2e | pend(list(zip(x,.ys)))..ax.=.pl. |
| 3ce0 | 67 63 66 28 29 2e 67 63 61 28 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 3d 27 33 64 27 29 0a 0a 70 6f 6c 79 | gcf().gca(projection='3d')..poly |
| 3d00 | 20 3d 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 28 76 65 72 74 73 2c 66 61 63 65 63 6f 6c 6f | .=.PolyCollection(verts,facecolo |
| 3d20 | 72 73 3d 5b 63 6d 61 70 28 61 29 20 66 6f 72 20 61 20 69 6e 20 61 6c 70 68 61 6c 69 73 74 5d 29 | rs=[cmap(a).for.a.in.alphalist]) |
| 3d40 | 0a 70 6f 6c 79 2e 73 65 74 5f 61 6c 70 68 61 28 30 2e 37 29 0a 61 78 2e 61 64 64 5f 63 6f 6c 6c | .poly.set_alpha(0.7).ax.add_coll |
| 3d60 | 65 63 74 69 6f 6e 33 64 28 70 6f 6c 79 2c 20 7a 73 3d 7a 73 2c 20 7a 64 69 72 3d 27 79 27 29 0a | ection3d(poly,.zs=zs,.zdir='y'). |
| 3d80 | 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 61 62 65 6c 28 27 78 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 69 6d 33 | .ax.set_xlabel('x').ax.set_xlim3 |
| 3da0 | 64 28 30 2c 20 6e 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 61 62 65 6c 28 27 24 5c 5c 61 6c 70 68 61 24 | d(0,.n).ax.set_ylabel('$\\alpha$ |
| 3dc0 | 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 31 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 61 | ').ax.set_ylim3d(0,1).ax.set_zla |
| 3de0 | 62 65 6c 28 27 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 42 5f 6c 32 2e 6d 61 | bel('').ax.set_zlim3d(0,.B_l2.ma |
| 3e00 | 78 28 29 2a 31 2e 30 31 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 | x()*1.01).pl.title('Barycenter.i |
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| 3e40 | 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 28 31 30 2c 35 29 29 0a 0a 23 70 6c 2e 73 75 62 70 | )..pl.figure(4,(10,5))..#pl.subp |
| 3e60 | 6c 6f 74 28 31 2c 32 2c 31 29 0a 63 6d 61 70 3d 70 6c 2e 63 6d 2e 67 65 74 5f 63 6d 61 70 28 27 | lot(1,2,1).cmap=pl.cm.get_cmap(' |
| 3e80 | 76 69 72 69 64 69 73 27 29 0a 76 65 72 74 73 20 3d 20 5b 5d 0a 7a 73 20 3d 20 61 6c 70 68 61 6c | viridis').verts.=.[].zs.=.alphal |
| 3ea0 | 69 73 74 0a 66 6f 72 20 69 2c 7a 20 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 7a 73 29 3a 0a 20 20 | ist.for.i,z.in.enumerate(zs):... |
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| 3f20 | 3d 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 28 76 65 72 74 73 2c 66 61 63 65 63 6f 6c 6f 72 | =.PolyCollection(verts,facecolor |
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| 3f60 | 70 6f 6c 79 2e 73 65 74 5f 61 6c 70 68 61 28 30 2e 37 29 0a 61 78 2e 61 64 64 5f 63 6f 6c 6c 65 | poly.set_alpha(0.7).ax.add_colle |
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| 3fa0 | 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 61 62 65 6c 28 27 78 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 69 6d 33 64 | ax.set_xlabel('x').ax.set_xlim3d |
| 3fc0 | 28 30 2c 20 6e 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 61 62 65 6c 28 27 24 5c 5c 61 6c 70 68 61 24 27 | (0,.n).ax.set_ylabel('$\\alpha$' |
| 3fe0 | 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 31 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 61 62 | ).ax.set_ylim3d(0,1).ax.set_zlab |
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| 4980 | 20 20 20 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 3d 35 30 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 | ................n=50.#.nb.sample |
| 49a0 | 73 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 78 74 6f 74 3d 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2b 31 2c 32 29 29 | s.........xtot=np.zeros((n+1,2)) |
| 49c0 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 78 74 6f 74 5b 3a 2c 30 5d 3d 6e 70 2e 63 6f 73 28 28 6e 70 2e 61 72 | .........xtot[:,0]=np.cos((np.ar |
| 49e0 | 61 6e 67 65 28 6e 2b 31 29 2b 31 2e 30 29 2a 30 2e 39 2f 28 6e 2b 32 29 2a 32 2a 6e 70 2e 70 69 | ange(n+1)+1.0)*0.9/(n+2)*2*np.pi |
| 4a00 | 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 78 74 6f 74 5b 3a 2c 31 5d 3d 6e 70 2e 73 69 6e 28 28 6e 70 2e 61 | ).........xtot[:,1]=np.sin((np.a |
| 4a20 | 72 61 6e 67 65 28 6e 2b 31 29 2b 31 2e 30 29 2a 30 2e 39 2f 28 6e 2b 32 29 2a 32 2a 6e 70 2e 70 | range(n+1)+1.0)*0.9/(n+2)*2*np.p |
| 4a40 | 69 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 78 73 3d 78 74 6f 74 5b 3a 6e 2c 3a | i)..................xs=xtot[:n,: |
| 4a60 | 5d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 78 74 3d 78 74 6f 74 5b 31 3a 2c 3a 5d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 | ].........xt=xtot[1:,:]......... |
| 4a80 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 61 2c 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 | ...................a,b.=.ot.unif |
| 4aa0 | 28 6e 29 2c 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 20 23 20 75 6e 69 66 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 | (n),ot.unif(n).#.uniform.distrib |
| 4ac0 | 75 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 23 20 6c 6f 73 73 | ution.on.samples..........#.loss |
| 4ae0 | 20 6d 61 74 72 69 78 0a 20 20 20 20 4d 31 3d 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 78 74 2c 6d 65 74 | .matrix.....M1=ot.dist(xs,xt,met |
| 4b00 | 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 20 20 20 20 4d 31 2f 3d 4d 31 2e 6d 61 78 28 | ric='euclidean').....M1/=M1.max( |
| 4b20 | 29 0a 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 20 20 20 20 4d 32 3d | )..........#.loss.matrix.....M2= |
| 4b40 | 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 78 74 2c 6d 65 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 | ot.dist(xs,xt,metric='sqeuclidea |
| 4b60 | 6e 27 29 0a 20 20 20 20 4d 32 2f 3d 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 0a 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 23 20 | n').....M2/=M2.max()..........#. |
| 4b80 | 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 20 20 20 20 4d 70 3d 6e 70 2e 73 71 72 74 28 6f 74 2e 64 69 | loss.matrix.....Mp=np.sqrt(ot.di |
| 4ba0 | 73 74 28 78 73 2c 78 74 2c 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 29 0a 20 20 | st(xs,xt,metric='euclidean'))... |
| 4bc0 | 20 20 4d 70 2f 3d 4d 70 2e 6d 61 78 28 29 0a 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 23 25 25 20 70 6c 6f 74 | ..Mp/=Mp.max()..........#%%.plot |
| 4be0 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2b 33 2a | .samples..........pl.figure(1+3* |
| 4c00 | 64 61 74 61 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 | data).....pl.clf().....pl.plot(x |
| 4c20 | 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 27 2b 62 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 | s[:,0],xs[:,1],'+b',label='Sourc |
| 4c40 | 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c | e.samples').....pl.plot(xt[:,0], |
| 4c60 | 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 27 78 72 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c | xt[:,1],'xr',label='Target.sampl |
| 4c80 | 65 73 27 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 20 20 20 20 70 6c | es').....pl.axis('equal').....pl |
| 4ca0 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 72 61 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 | .title('Source.and.traget.distri |
| 4cc0 | 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2b 33 | butions')..........pl.figure(2+3 |
| 4ce0 | 2a 64 61 74 61 2c 28 31 35 2c 35 29 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 33 | *data,(15,5)).....pl.subplot(1,3 |
| 4d00 | 2c 31 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 31 2c 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 | ,1).....pl.imshow(M1,interpolati |
| 4d20 | 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 75 63 69 | on='nearest').....pl.title('Euci |
| 4d40 | 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 33 2c 32 | dean.cost').....pl.subplot(1,3,2 |
| 4d60 | 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 32 2c 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e | ).....pl.imshow(M2,interpolation |
| 4d80 | 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 75 61 72 65 | ='nearest').....pl.title('Square |
| 4da0 | 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 0a 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 73 | d.Euclidean.cost')..........pl.s |
| 4dc0 | 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 33 2c 33 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 70 2c 69 | ubplot(1,3,3).....pl.imshow(Mp,i |
| 4de0 | 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 74 | nterpolation='nearest').....pl.t |
| 4e00 | 69 74 6c 65 28 27 53 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 0a 20 20 20 20 | itle('Sqrt.Euclidean.cost')..... |
| 4e20 | 23 25 25 20 45 4d 44 0a 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 47 31 3d 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 62 2c 4d | #%%.EMD..........G1=ot.emd(a,b,M |
| 4e40 | 31 29 0a 20 20 20 20 47 32 3d 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 62 2c 4d 32 29 0a 20 20 20 20 47 70 3d | 1).....G2=ot.emd(a,b,M2).....Gp= |
| 4e60 | 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 62 2c 4d 70 29 0a 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 66 69 67 75 72 | ot.emd(a,b,Mp)..........pl.figur |
| 4e80 | 65 28 33 2b 33 2a 64 61 74 61 2c 28 31 35 2c 35 29 29 0a 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 73 | e(3+3*data,(15,5))..........pl.s |
| 4ea0 | 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 33 2c 31 29 0a 20 20 20 20 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 | ubplot(1,3,1).....ot.plot.plot2D |
| 4ec0 | 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 78 74 2c 47 31 2c 63 3d 5b 2e 35 2c 2e 35 2c 31 | _samples_mat(xs,xt,G1,c=[.5,.5,1 |
| 4ee0 | 5d 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 27 | ]).....pl.plot(xs[:,0],xs[:,1],' |
| 4f00 | 2b 62 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 20 20 20 20 | +b',label='Source.samples')..... |
| 4f20 | 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 27 78 72 27 2c 6c 61 62 | pl.plot(xt[:,0],xt[:,1],'xr',lab |
| 4f40 | 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 61 78 69 73 | el='Target.samples').....pl.axis |
| 4f60 | 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 20 20 20 20 23 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a | ('equal').....#pl.legend(loc=0). |
| 4f80 | 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 20 20 20 | ....pl.title('OT.Euclidean').... |
| 4fa0 | 20 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 33 2c 32 29 0a 20 20 20 20 0a 20 20 20 | ......pl.subplot(1,3,2)......... |
| 4fc0 | 20 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 78 | .ot.plot.plot2D_samples_mat(xs,x |
| 4fe0 | 74 2c 47 32 2c 63 3d 5b 2e 35 2c 2e 35 2c 31 5d 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 | t,G2,c=[.5,.5,1]).....pl.plot(xs |
| 5000 | 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 27 2b 62 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 | [:,0],xs[:,1],'+b',label='Source |
| 5020 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 | .samples').....pl.plot(xt[:,0],x |
| 5040 | 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 27 78 72 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 | t[:,1],'xr',label='Target.sample |
| 5060 | 73 27 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 20 20 20 20 23 70 6c | s').....pl.axis('equal').....#pl |
| 5080 | 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 | .legend(loc=0).....pl.title('OT. |
| 50a0 | 73 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 70 6c 2e | squared.Euclidean')..........pl. |
| 50c0 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 33 2c 33 29 0a 20 20 20 20 0a 20 20 20 20 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e | subplot(1,3,3)..........ot.plot. |
| 50e0 | 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 78 74 2c 47 70 2c 63 3d 5b 2e | plot2D_samples_mat(xs,xt,Gp,c=[. |
| 5100 | 35 2c 2e 35 2c 31 5d 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b | 5,.5,1]).....pl.plot(xs[:,0],xs[ |
| 5120 | 3a 2c 31 5d 2c 27 2b 62 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 | :,1],'+b',label='Source.samples' |
| 5140 | 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 27 78 | ).....pl.plot(xt[:,0],xt[:,1],'x |
| 5160 | 72 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 20 20 20 20 70 | r',label='Target.samples').....p |
| 5180 | 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 20 20 20 20 23 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c | l.axis('equal').....#pl.legend(l |
| 51a0 | 6f 63 3d 30 29 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 72 74 20 45 75 63 6c | oc=0).....pl.title('OT.sqrt.Eucl |
| 51c0 | 69 64 65 61 6e 27 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 a9 83 e3 4a b4 93 15 da 5a 06 00 00 5a 06 | idean').PK...........J....Z...Z. |
| 51e0 | 00 00 23 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 32 44 5f 73 | ..#...auto_examples/plot_OT_2D_s |
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| 58a0 | 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d | -*-.coding:.utf-8.-*-.""".====== |
| 58c0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 4f 54 20 66 6f 72 20 | ========================.OT.for. |
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| 5a20 | 28 29 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 | ()..#%%.plot.samples..pl.figure( |
| 5a40 | 31 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 | 1)..pl.subplot(2,2,1).pl.scatter |
| 5a60 | 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 | (xs[:,0],xs[:,1],c=ys,marker='+' |
| 5a80 | 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 | ,label='Source.samples').pl.lege |
| 5aa0 | 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 64 69 73 74 | nd(loc=0).pl.title('Source..dist |
| 5ac0 | 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 32 2c 32 29 0a 70 | ributions')..pl.subplot(2,2,2).p |
| 5ae0 | 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d | l.scatter(xt[:,0],xt[:,1],c=yt,m |
| 5b00 | 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 | arker='o',label='Target.samples' |
| 5b20 | 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 74 61 72 | ).pl.legend(loc=0).pl.title('tar |
| 5b40 | 67 65 74 20 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 | get..distributions')..pl.figure( |
| 5b60 | 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 | 2).pl.imshow(M,interpolation='ne |
| 5b80 | 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 4d 27 | arest').pl.title('Cost.matrix.M' |
| 5ba0 | 29 0a 0a 0a 23 25 25 20 4f 54 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 0a 0a 23 20 45 4d 44 0a 47 30 3d | )...#%%.OT.estimation..#.EMD.G0= |
| 5bc0 | 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 62 2c 4d 29 0a 0a 23 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 0a 6c 61 6d 62 64 3d | ot.emd(a,b,M)..#.sinkhorn.lambd= |
| 5be0 | 31 65 2d 31 0a 47 73 3d 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c 62 2c 4d 2c 6c 61 6d 62 64 29 | 1e-1.Gs=ot.sinkhorn(a,b,M,lambd) |
| 5c00 | 0a 0a 0a 23 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a | ...#.Group.lasso.regularization. |
| 5c20 | 72 65 67 3d 31 65 2d 31 0a 65 74 61 3d 31 65 30 0a 47 67 3d 6f 74 2e 64 61 2e 73 69 6e 6b 68 6f | reg=1e-1.eta=1e0.Gg=ot.da.sinkho |
| 5c40 | 72 6e 5f 6c 70 6c 31 5f 6d 6d 28 61 2c 79 73 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 69 6e 74 29 2c 62 | rn_lpl1_mm(a,ys.astype(np.int),b |
| 5c60 | 2c 4d 2c 72 65 67 2c 65 74 61 29 0a 0a 0a 23 25 25 20 76 69 73 75 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 0a | ,M,reg,eta)...#%%.visu.matrices. |
| 5c80 | 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 31 29 | .pl.figure(3)..pl.subplot(2,3,1) |
| 5ca0 | 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 30 2c 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 | .pl.imshow(G0,interpolation='nea |
| 5cc0 | 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 27 29 0a 0a 70 | rest').pl.title('OT.matrix.')..p |
| 5ce0 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 73 2c 69 6e | l.subplot(2,3,2).pl.imshow(Gs,in |
| 5d00 | 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | terpolation='nearest').pl.title( |
| 5d20 | 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | 'OT.matrix.Sinkhorn')..pl.subplo |
| 5d40 | 74 28 32 2c 33 2c 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 67 2c 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 | t(2,3,3).pl.imshow(Gg,interpolat |
| 5d60 | 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 | ion='nearest').pl.title('OT.matr |
| 5d80 | 69 78 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 | ix.Group.lasso')..pl.subplot(2,3 |
| 5da0 | 2c 34 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 | ,4).ot.plot.plot2D_samples_mat(x |
| 5dc0 | 73 2c 78 74 2c 47 30 2c 63 3d 5b 2e 35 2c 2e 35 2c 31 5d 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 | s,xt,G0,c=[.5,.5,1]).pl.scatter( |
| 5de0 | 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c | xs[:,0],xs[:,1],c=ys,marker='+', |
| 5e00 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 | label='Source.samples').pl.scatt |
| 5e20 | 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 | er(xt[:,0],xt[:,1],c=yt,marker=' |
| 5e40 | 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 0a 70 6c 2e | o',label='Target.samples')...pl. |
| 5e60 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 35 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 | subplot(2,3,5).ot.plot.plot2D_sa |
| 5e80 | 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 78 74 2c 47 73 2c 63 3d 5b 2e 35 2c 2e 35 2c 31 5d 29 0a | mples_mat(xs,xt,Gs,c=[.5,.5,1]). |
| 5ea0 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c | pl.scatter(xs[:,0],xs[:,1],c=ys, |
| 5ec0 | 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | marker='+',label='Source.samples |
| 5ee0 | 27 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d | ').pl.scatter(xt[:,0],xt[:,1],c= |
| 5f00 | 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 | yt,marker='o',label='Target.samp |
| 5f20 | 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 36 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 | les')..pl.subplot(2,3,6).ot.plot |
| 5f40 | 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 78 74 2c 47 67 2c 63 3d 5b | .plot2D_samples_mat(xs,xt,Gg,c=[ |
| 5f60 | 2e 35 2c 2e 35 2c 31 5d 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b | .5,.5,1]).pl.scatter(xs[:,0],xs[ |
| 5f80 | 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 | :,1],c=ys,marker='+',label='Sour |
| 5fa0 | 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c | ce.samples').pl.scatter(xt[:,0], |
| 5fc0 | 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 | xt[:,1],c=yt,marker='o',label='T |
| 5fe0 | 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 23 25 25 20 73 61 6d 70 6c 65 20 69 6e 74 65 | arget.samples')..#%%.sample.inte |
| 6000 | 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 0a 0a 78 73 74 30 3d 6e 2a 47 30 2e 64 6f 74 28 78 74 29 0a 78 73 74 | rpolation..xst0=n*G0.dot(xt).xst |
| 6020 | 73 3d 6e 2a 47 73 2e 64 6f 74 28 78 74 29 0a 78 73 74 67 3d 6e 2a 47 67 2e 64 6f 74 28 78 74 29 | s=n*Gs.dot(xt).xstg=n*Gg.dot(xt) |
| 6040 | 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 31 29 | ..pl.figure(4).pl.subplot(2,3,1) |
| 6060 | 0a 0a 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d | ...pl.scatter(xt[:,0],xt[:,1],c= |
| 6080 | 79 74 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 | yt,marker='o',label='Target.samp |
| 60a0 | 6c 65 73 27 2c 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 30 5b | les',alpha=0.5).pl.scatter(xst0[ |
| 60c0 | 3a 2c 30 5d 2c 78 73 74 30 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c | :,0],xst0[:,1],c=ys,marker='+',l |
| 60e0 | 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 73 3d 33 30 29 0a 70 6c 2e 74 | abel='Transp.samples',s=30).pl.t |
| 6100 | 69 74 6c 65 28 27 49 6e 74 65 72 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 | itle('Interp.samples').pl.legend |
| 6120 | 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 32 29 0a 0a 0a 70 6c 2e | (loc=0)..pl.subplot(2,3,2)...pl. |
| 6140 | 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 74 2c 6d 61 72 | scatter(xt[:,0],xt[:,1],c=yt,mar |
| 6160 | 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 61 | ker='o',label='Target.samples',a |
| 6180 | 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 74 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 | lpha=0.5).pl.scatter(xsts[:,0],x |
| 61a0 | 73 74 73 5b 3a 2c 31 5d 2c 63 3d 79 73 2c 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 6c 61 62 65 6c 3d 27 | sts[:,1],c=ys,marker='+',label=' |
| 61c0 | 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 73 3d 33 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | Transp.samples',s=30).pl.title(' |
| 61e0 | 49 6e 74 65 72 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 | Interp.samples.Sinkhorn')..pl.su |
| 6200 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 33 29 0a 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d | bplot(2,3,3)..pl.scatter(xt[:,0] |
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| 7260 | 30 5d 2a 49 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 49 2e 73 68 61 70 65 5b 32 5d 29 29 0a 0a 64 65 66 20 | 0]*I.shape[1],I.shape[2]))..def. |
| 7280 | 6d 61 74 32 69 6d 28 58 2c 73 68 61 70 65 29 3a 0a 20 20 20 20 22 22 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 | mat2im(X,shape):....."""Converts |
| 72a0 | 20 62 61 63 6b 20 61 20 6d 61 74 72 69 78 20 74 6f 20 61 6e 20 69 6d 61 67 65 22 22 22 0a 20 20 | .back.a.matrix.to.an.image"""... |
| 72c0 | 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 58 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 73 68 61 70 65 29 0a 0a 58 31 3d 69 6d | ..return.X.reshape(shape)..X1=im |
| 72e0 | 32 6d 61 74 28 49 31 29 0a 58 32 3d 69 6d 32 6d 61 74 28 49 32 29 0a 0a 23 20 74 72 61 69 6e 69 | 2mat(I1).X2=im2mat(I2)..#.traini |
| 7300 | 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 6e 62 3d 31 30 30 30 0a 69 64 78 31 3d 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f | ng.samples.nb=1000.idx1=np.rando |
| 7320 | 6d 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 31 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 | m.randint(X1.shape[0],size=(nb,) |
| 7340 | 29 0a 69 64 78 32 3d 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 32 2e 73 68 61 70 | ).idx2=np.random.randint(X2.shap |
| 7360 | 65 5b 30 5d 2c 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 0a 0a 78 73 3d 58 31 5b 69 64 78 31 2c 3a 5d 0a | e[0],size=(nb,))..xs=X1[idx1,:]. |
| 7380 | 78 74 3d 58 32 5b 69 64 78 32 2c 3a 5d 0a 0a 23 25 25 20 50 6c 6f 74 20 69 6d 61 67 65 20 64 69 | xt=X2[idx2,:]..#%%.Plot.image.di |
| 73a0 | 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 28 31 30 2c 35 29 | stributions...pl.figure(2,(10,5) |
| 73c0 | 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 32 2c 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 | )..pl.subplot(1,2,1).pl.scatter( |
| 73e0 | 78 73 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 73 5b 3a 2c 32 5d 2c 63 3d 78 73 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 | xs[:,0],xs[:,2],c=xs).pl.axis([0 |
| 7400 | 2c 31 2c 30 2c 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 0a 70 6c 2e 79 6c 61 | ,1,0,1]).pl.xlabel('Red').pl.yla |
| 7420 | 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a | bel('Blue').pl.title('Image.1'). |
| 7440 | 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 32 2c 32 29 0a 23 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 | .pl.subplot(1,2,2).#pl.imshow(I2 |
| 7460 | 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 30 5d 2c 78 74 5b 3a 2c 32 5d 2c 63 3d 78 | ).pl.scatter(xt[:,0],xt[:,2],c=x |
| 7480 | 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 31 2c 30 2c 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 | t).pl.axis([0,1,0,1]).pl.xlabel( |
| 74a0 | 27 52 65 64 27 29 0a 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | 'Red').pl.ylabel('Blue').pl.titl |
| 74c0 | 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 0a 0a 0a 23 25 25 20 64 | e('Image.2')..pl.show()....#%%.d |
| 74e0 | 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 69 6d 61 67 65 73 0a | omain.adaptation.between.images. |
| 7500 | 0a 23 20 4c 50 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 0a 64 61 5f 65 6d 64 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 28 | .#.LP.problem.da_emd=ot.da.OTDA( |
| 7520 | 29 20 20 20 20 20 23 20 69 6e 69 74 20 63 6c 61 73 73 0a 64 61 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 78 73 | ).....#.init.class.da_emd.fit(xs |
| 7540 | 2c 78 74 29 20 20 20 20 20 20 20 23 20 66 69 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 0a | ,xt).......#.fit.distributions.. |
| 7560 | 0a 23 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 6c 61 6d 62 64 | .#.sinkhorn.regularization.lambd |
| 7580 | 3d 31 65 2d 31 0a 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f 54 44 41 5f 73 69 6e 6b 68 | =1e-1.da_entrop=ot.da.OTDA_sinkh |
| 75a0 | 6f 72 6e 28 29 0a 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 74 2c 72 65 67 3d 6c 61 | orn().da_entrop.fit(xs,xt,reg=la |
| 75c0 | 6d 62 64 29 0a 0a 0a 0a 23 25 25 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 69 | mbd)....#%%.prediction.between.i |
| 75e0 | 6d 61 67 65 73 20 28 75 73 69 6e 67 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 61 6d 70 6c 65 20 70 72 65 64 69 | mages.(using.out.of.sample.predi |
| 7600 | 63 74 69 6f 6e 20 61 73 20 69 6e 20 5b 36 5d 29 0a 0a 58 31 74 3d 64 61 5f 65 6d 64 2e 70 72 65 | ction.as.in.[6])..X1t=da_emd.pre |
| 7620 | 64 69 63 74 28 58 31 29 0a 58 32 74 3d 64 61 5f 65 6d 64 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 58 32 2c 2d | dict(X1).X2t=da_emd.predict(X2,- |
| 7640 | 31 29 0a 0a 0a 58 31 74 65 3d 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 58 31 29 0a | 1)...X1te=da_entrop.predict(X1). |
| 7660 | 58 32 74 65 3d 64 61 5f 65 6e 74 72 6f 70 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 58 32 2c 2d 31 29 0a 0a 0a | X2te=da_entrop.predict(X2,-1)... |
| 7680 | 64 65 66 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 49 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 6d 69 6e | def.minmax(I):.....return.np.min |
| 76a0 | 69 6d 75 6d 28 6e 70 2e 6d 61 78 69 6d 75 6d 28 49 2c 30 29 2c 31 29 0a 0a 49 31 74 3d 6d 69 6e | imum(np.maximum(I,0),1)..I1t=min |
| 76c0 | 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 2c 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 49 32 74 3d 6d 69 | max(mat2im(X1t,I1.shape)).I2t=mi |
| 76e0 | 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 32 74 2c 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 49 31 74 65 | nmax(mat2im(X2t,I2.shape))..I1te |
| 7700 | 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 65 2c 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 49 | =minmax(mat2im(X1te,I1.shape)).I |
| 7720 | 32 74 65 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 32 74 65 2c 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 | 2te=minmax(mat2im(X2te,I2.shape) |
| 7740 | 29 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 61 6c 6c 20 69 6d 61 67 65 73 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 | )..#%%.plot.all.images..pl.figur |
| 7760 | 65 28 32 2c 28 31 30 2c 38 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 31 29 0a 0a | e(2,(10,8))..pl.subplot(2,3,1).. |
| 7780 | 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 | pl.imshow(I1).pl.title('Image.1' |
| 77a0 | 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 | )..pl.subplot(2,3,2).pl.imshow(I |
| 77c0 | 31 74 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 27 29 0a 0a 0a | 1t).pl.title('Image.1.Adapt')... |
| 77e0 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 65 | pl.subplot(2,3,3).pl.imshow(I1te |
| 7800 | 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 | ).pl.title('Image.1.Adapt.(reg)' |
| 7820 | 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 34 29 0a 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 | )..pl.subplot(2,3,4)..pl.imshow( |
| 7840 | 49 32 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 | I2).pl.title('Image.2')..pl.subp |
| 7860 | 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 35 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 | lot(2,3,5).pl.imshow(I2t).pl.tit |
| 7880 | 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 27 29 0a 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | le('Image.2.Adapt')...pl.subplot |
| 78a0 | 28 32 2c 33 2c 36 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 65 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | (2,3,6).pl.imshow(I2te).pl.title |
| 78c0 | 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 | ('Image.2.Adapt.(reg)')..pl.show |
| 78e0 | 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 a9 83 e3 4a f7 ba 1e e3 6d 0d 00 00 6d 0d 00 00 2f 00 00 | ().PK...........J....m...m.../.. |
| 7900 | 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 | .auto_examples/plot_OTDA_mapping |
| 7920 | 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 | _color_images.py#.-*-.coding:.ut |
| 7940 | 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | f-8.-*-.""".==================== |
| 7960 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
| 7980 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
| 79a0 | 0a 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 69 | .OT.for.domain.adaptation.with.i |
| 79c0 | 6d 61 67 65 20 63 6f 6c 6f 72 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 5b 36 5d 20 77 69 74 68 20 6d | mage.color.adaptation.[6].with.m |
| 79e0 | 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 5b 38 5d 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | apping.estimation.[8].========== |
| 7a00 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
| 7a20 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
| 7a40 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 5b 36 5d 20 46 65 72 72 61 64 61 6e 73 2c 20 53 2e 2c 20 50 | ==========..[6].Ferradans,.S.,.P |
| 7a60 | 61 70 61 64 61 6b 69 73 2c 20 4e 2e 2c 20 50 65 79 72 65 2c 20 47 2e 2c 20 26 20 41 75 6a 6f 6c | apadakis,.N.,.Peyre,.G.,.&.Aujol |
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| 7aa0 | 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 2e 20 53 49 41 4d | discrete.optimal.transport..SIAM |
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| 7de0 | 22 22 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 62 61 63 6b 20 61 20 6d 61 74 72 69 78 20 74 6f 20 61 6e 20 | """Converts.back.a.matrix.to.an. |
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| 7fe0 | 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 0a 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 | .pl.xlabel('Red').pl.ylabel('Blu |
| 8000 | 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 | e').pl.title('Image.2')..pl.show |
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| 82a0 | 73 2c 78 74 2c 6d 75 3d 6d 75 2c 65 74 61 3d 65 74 61 2c 62 69 61 73 3d 62 69 61 73 2c 6e 75 6d | s,xt,mu=mu,eta=eta,bias=bias,num |
| 82c0 | 49 74 65 72 6d 61 78 20 3d 20 32 30 2c 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 58 31 74 6c | Itermax.=.20,verbose=True)..X1tl |
| 82e0 | 3d 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 58 31 29 20 23 20 75 73 65 20 74 68 | =ot_mapping.predict(X1).#.use.th |
| 8300 | 65 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 0a 49 31 74 6c 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 | e.estimated.mapping.I1tl=minmax( |
| 8320 | 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 6c 2c 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 23 20 6e 6f 6e 6c 69 6e | mat2im(X1tl,I1.shape))..#.nonlin |
| 8340 | 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 0a 65 74 61 3d 31 65 2d 32 20 | ear.mapping.estimation.eta=1e-2. |
| 8360 | 20 20 23 20 71 75 61 64 72 61 74 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 | ..#.quadratic.regularization.for |
| 8380 | 20 72 65 67 72 65 73 73 69 6f 6e 0a 6d 75 3d 31 65 30 20 20 20 20 20 23 20 77 65 69 67 68 74 20 | .regression.mu=1e0.....#.weight. |
| 83a0 | 6f 66 20 74 68 65 20 4f 54 20 6c 69 6e 65 61 72 20 74 65 72 6d 0a 62 69 61 73 3d 46 61 6c 73 65 | of.the.OT.linear.term.bias=False |
| 83c0 | 20 20 23 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 20 61 20 62 69 61 73 0a 73 69 67 6d 61 3d 31 20 20 20 20 23 | ..#.estimate.a.bias.sigma=1....# |
| 83e0 | 20 73 69 67 6d 61 20 62 61 6e 64 77 69 64 74 68 20 66 6f 74 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 6b 65 | .sigma.bandwidth.fot.gaussian.ke |
| 8400 | 72 6e 65 6c 0a 0a 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 6c 3d 6f 74 2e 64 61 2e 4f | rnel...ot_mapping_kernel=ot.da.O |
| 8420 | 54 44 41 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 6c 28 29 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f | TDA_mapping_kernel().ot_mapping_ |
| 8440 | 6b 65 72 6e 65 6c 2e 66 69 74 28 78 73 2c 78 74 2c 6d 75 3d 6d 75 2c 65 74 61 3d 65 74 61 2c 73 | kernel.fit(xs,xt,mu=mu,eta=eta,s |
| 8460 | 69 67 6d 61 3d 73 69 67 6d 61 2c 62 69 61 73 3d 62 69 61 73 2c 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 20 | igma=sigma,bias=bias,numItermax. |
| 8480 | 3d 20 31 30 2c 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 58 31 74 6e 3d 6f 74 5f 6d 61 70 70 | =.10,verbose=True)..X1tn=ot_mapp |
| 84a0 | 69 6e 67 5f 6b 65 72 6e 65 6c 2e 70 72 65 64 69 63 74 28 58 31 29 20 23 20 75 73 65 20 74 68 65 | ing_kernel.predict(X1).#.use.the |
| 84c0 | 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 0a 49 31 74 6e 3d 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d | .estimated.mapping.I1tn=minmax(m |
| 84e0 | 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 6e 2c 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 69 | at2im(X1tn,I1.shape)).#%%.plot.i |
| 8500 | 6d 61 67 65 73 0a 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 28 31 30 2c 38 29 29 0a 0a 70 6c 2e | mages...pl.figure(2,(10,8))..pl. |
| 8520 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 31 29 0a 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 0a 70 6c | subplot(2,3,1)..pl.imshow(I1).pl |
| 8540 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c | .title('Im..1')..pl.subplot(2,3, |
| 8560 | 32 29 0a 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 | 2)..pl.imshow(I2).pl.title('Im.. |
| 8580 | 32 27 29 0a 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f | 2')...pl.subplot(2,3,3).pl.imsho |
| 85a0 | 77 28 49 31 74 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 20 49 6e 74 65 72 70 20 4c 50 | w(I1t).pl.title('Im..1.Interp.LP |
| 85c0 | 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 | ')..pl.subplot(2,3,4).pl.imshow( |
| 85e0 | 49 31 74 65 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 20 49 6e 74 65 72 70 20 45 6e 74 | I1te).pl.title('Im..1.Interp.Ent |
| 8600 | 72 6f 70 27 29 0a 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 35 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 | rop')...pl.subplot(2,3,5).pl.ims |
| 8620 | 68 6f 77 28 49 31 74 6c 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 20 4c 69 6e 65 61 72 | how(I1tl).pl.title('Im..1.Linear |
| 8640 | 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 33 2c 36 29 0a 70 6c | .mapping')..pl.subplot(2,3,6).pl |
| 8660 | 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 6e 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 20 6e 6f | .imshow(I1tn).pl.title('Im..1.no |
| 8680 | 6e 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 01 | nlinear.mapping')..pl.show().PK. |
| 86a0 | 02 14 03 14 00 00 00 00 00 a9 83 e3 4a 2f 8a 49 ca a0 04 00 00 a0 04 00 00 19 00 00 00 00 00 00 | ............J/.I................ |
| 86c0 | 00 00 00 00 00 b4 81 00 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 57 44 | ...........auto_examples/plot_WD |
| 86e0 | 41 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 a9 83 e3 4a e7 a1 46 a7 95 0c 00 00 95 0c 00 00 | A.pyPK.............J..F......... |
| 8700 | 22 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 d7 04 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f | ".................auto_examples/ |
| 8720 | 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 | plot_OTDA_mapping.pyPK.......... |
| 8740 | aa 83 e3 4a 75 a6 3a ed 10 05 00 00 10 05 00 00 21 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 ac 11 | ...Ju.:.........!............... |
| 8760 | 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 70 74 69 6d 5f 4f 54 72 65 67 | ..auto_examples/plot_optim_OTreg |
| 8780 | 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 a9 83 e3 4a f2 c1 a7 29 f1 09 00 00 f1 09 00 00 22 | .pyPK.............J...)........" |
| 87a0 | 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 fb 16 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 | .................auto_examples/p |
| 87c0 | 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 63 6c 61 73 73 65 73 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 a9 | lot_OTDA_classes.pyPK........... |
| 87e0 | 83 e3 4a 58 62 bb 42 8f 03 00 00 8f 03 00 00 1b 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 2c 21 00 | ..JXb.B......................,!. |
| 8800 | 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 2e 70 79 50 4b 01 02 | .auto_examples/plot_OT_1D.pyPK.. |
| 8820 | 14 03 14 00 00 00 00 00 32 82 e3 4a 58 1b a1 c7 97 10 00 00 97 10 00 00 1d 00 00 00 00 00 00 00 | ........2..JX................... |
| 8840 | 00 00 00 00 b4 81 f4 24 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f | .......$..auto_examples/plot_OT_ |
| 8860 | 63 6f 6e 76 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 a9 83 e3 4a d8 dc 52 b3 62 0a 00 00 62 | conv.pyPK.............J..R.b...b |
| 8880 | 0a 00 00 23 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 c6 35 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c | ...#..............5..auto_exampl |
| 88a0 | 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 31 44 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 | es/plot_barycenter_1D.pyPK...... |
| 88c0 | 00 00 00 00 6a 7b 82 49 25 c9 d6 13 1c 06 00 00 1c 06 00 00 28 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 | ....j{.I%...........(........... |
| 88e0 | b4 81 69 40 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 64 65 6d 6f 5f 4f 54 5f 32 44 5f 73 | ..i@..auto_examples/demo_OT_2D_s |
| 8900 | 61 6d 70 6c 65 73 6c 61 72 67 65 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 a9 83 e3 4a 19 12 | ampleslarge.pyPK.............J.. |
| 8920 | 26 b2 be 0a 00 00 be 0a 00 00 21 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 cb 46 00 00 61 75 74 6f | &.........!..............F..auto |
| 8940 | 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 4c 31 5f 76 73 5f 4c 32 2e 70 79 50 4b 01 | _examples/plot_OT_L1_vs_L2.pyPK. |
| 8960 | 02 14 03 14 00 00 00 00 00 a9 83 e3 4a b4 93 15 da 5a 06 00 00 5a 06 00 00 23 00 00 00 00 00 00 | ............J....Z...Z...#...... |
| 8980 | 00 00 00 00 00 b4 81 c8 51 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 | ........Q..auto_examples/plot_OT |
| 89a0 | 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 a9 83 e3 4a ec af | _2D_samples.pyPK.............J.. |
| 89c0 | 42 31 2e 0a 00 00 2e 0a 00 00 1d 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 63 58 00 00 61 75 74 6f | B1......................cX..auto |
| 89e0 | 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 32 44 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 | _examples/plot_OTDA_2D.pyPK..... |
| 8a00 | 00 00 00 00 00 aa 83 e3 4a c5 46 2c f5 21 06 00 00 21 06 00 00 21 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 | ........J.F,.!...!...!.......... |
| 8a20 | 00 b4 81 cc 62 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6d 70 75 74 | ....b..auto_examples/plot_comput |
| 8a40 | 65 5f 65 6d 64 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 6a 7b 82 49 d4 40 d8 69 2e 05 00 00 | e_emd.pyPK..........j{.I.@.i.... |
| 8a60 | 2e 05 00 00 20 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 2c 69 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 | ..................,i..auto_examp |
| 8a80 | 6c 65 73 2f 64 65 6d 6f 5f 4f 54 5f 31 44 5f 74 65 73 74 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 | les/demo_OT_1D_test.pyPK........ |
| 8aa0 | 00 00 a9 83 e3 4a a5 25 9f a1 06 0a 00 00 06 0a 00 00 27 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 | .....J.%..........'............. |
| 8ac0 | 98 6e 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 44 41 5f 63 6f 6c 6f | .n..auto_examples/plot_OTDA_colo |
| 8ae0 | 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 a9 83 e3 4a f7 ba 1e e3 6d | r_images.pyPK.............J....m |
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