| ofs | hex dump | ascii |
|---|---|---|
| 0000 | 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b fc f7 6b 6f da 09 00 00 da 09 00 00 1c 00 00 00 61 75 | PK.........o/K..ko............au |
| 0020 | 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 67 72 6f 6d 6f 76 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 | to_examples/plot_gromov.py#.-*-. |
| 0040 | 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0d 0a 22 22 22 0d 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | coding:.utf-8.-*-.."""..======== |
| 0060 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0d 0a 47 72 6f 6d 6f 76 2d 57 61 73 73 65 | ==================..Gromov-Wasse |
| 0080 | 72 73 74 65 69 6e 20 65 78 61 6d 70 6c 65 0d 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | rstein.example..================ |
| 00a0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0d 0a 0d 0a 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 73 20 64 65 | ==========....This.example.is.de |
| 00c0 | 73 69 67 6e 65 64 20 74 6f 20 73 68 6f 77 20 68 6f 77 20 74 6f 20 75 73 65 20 74 68 65 20 47 72 | signed.to.show.how.to.use.the.Gr |
| 00e0 | 6f 6d 6f 76 2d 57 61 73 73 65 72 74 73 65 69 6e 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 0d 0a 63 6f 6d 70 75 | omov-Wassertsein.distance..compu |
| 0100 | 74 61 74 69 6f 6e 20 69 6e 20 50 4f 54 2e 0d 0a 22 22 22 0d 0a 0d 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a | tation.in.POT..."""....#.Author: |
| 0120 | 20 45 72 77 61 6e 20 56 61 75 74 69 65 72 20 3c 65 72 77 61 6e 2e 76 61 75 74 69 65 72 40 67 6d | .Erwan.Vautier.<erwan.vautier@gm |
| 0140 | 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 0d 0a 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 4e 69 63 6f 6c 61 73 20 43 6f 75 72 | ail.com>..#.........Nicolas.Cour |
| 0160 | 74 79 20 3c 6e 63 6f 75 72 74 79 40 69 72 69 73 61 2e 66 72 3e 0d 0a 23 0d 0a 23 20 4c 69 63 65 | ty.<ncourty@irisa.fr>..#..#.Lice |
| 0180 | 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 0d 0a 0d 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 73 63 69 70 79 | nse:.MIT.License....import.scipy |
| 01a0 | 20 61 73 20 73 70 0d 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0d 0a 69 6d 70 6f | .as.sp..import.numpy.as.np..impo |
| 01c0 | 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0d 0a 66 72 6f 6d 20 | rt.matplotlib.pylab.as.pl..from. |
| 01e0 | 6d 70 6c 5f 74 6f 6f 6c 6b 69 74 73 2e 6d 70 6c 6f 74 33 64 20 69 6d 70 6f 72 74 20 41 78 65 73 | mpl_toolkits.mplot3d.import.Axes |
| 0200 | 33 44 20 20 23 20 6e 6f 71 61 0d 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0d 0a 0d 0a 0d 0a 23 23 23 23 23 | 3D..#.noqa..import.ot......##### |
| 0220 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 0240 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 0260 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0d 0a 23 20 53 61 6d 70 6c 65 20 74 77 6f 20 47 61 75 73 73 69 61 6e | #########..#.Sample.two.Gaussian |
| 0280 | 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 28 32 44 20 61 6e 64 20 33 44 29 0d 0a 23 20 2d 2d | .distributions.(2D.and.3D)..#.-- |
| 02a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 02c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 23 0d 0a 23 20 54 68 65 20 47 72 6f 6d 6f 76 2d 57 61 73 | -----------..#..#.The.Gromov-Was |
| 02e0 | 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 20 61 6c 6c 6f 77 73 20 74 6f 20 63 6f 6d 70 | serstein.distance.allows.to.comp |
| 0300 | 75 74 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 20 77 69 74 68 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 74 68 61 74 0d | ute.distances.with.samples.that. |
| 0320 | 0a 23 20 64 6f 20 6e 6f 74 20 62 65 6c 6f 6e 67 20 74 6f 20 74 68 65 20 73 61 6d 65 20 6d 65 74 | .#.do.not.belong.to.the.same.met |
| 0340 | 72 69 63 20 73 70 61 63 65 2e 20 46 6f 72 20 64 65 6d 6f 6e 73 74 72 61 74 69 6f 6e 20 70 75 72 | ric.space..For.demonstration.pur |
| 0360 | 70 6f 73 65 2c 20 77 65 20 73 61 6d 70 6c 65 0d 0a 23 20 74 77 6f 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 | pose,.we.sample..#.two.Gaussian. |
| 0380 | 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 69 6e 20 32 2d 20 61 6e 64 20 33 2d 64 69 6d 65 6e 73 | distributions.in.2-.and.3-dimens |
| 03a0 | 69 6f 6e 61 6c 20 73 70 61 63 65 73 2e 0d 0a 0d 0a 0d 0a 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 33 | ional.spaces.......n_samples.=.3 |
| 03c0 | 30 20 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0d 0a 0d 0a 6d 75 5f 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 | 0..#.nb.samples....mu_s.=.np.arr |
| 03e0 | 61 79 28 5b 30 2c 20 30 5d 29 0d 0a 63 6f 76 5f 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 5b 31 | ay([0,.0])..cov_s.=.np.array([[1 |
| 0400 | 2c 20 30 5d 2c 20 5b 30 2c 20 31 5d 5d 29 0d 0a 0d 0a 6d 75 5f 74 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 | ,.0],.[0,.1]])....mu_t.=.np.arra |
| 0420 | 79 28 5b 34 2c 20 34 2c 20 34 5d 29 0d 0a 63 6f 76 5f 74 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b | y([4,.4,.4])..cov_t.=.np.array([ |
| 0440 | 5b 31 2c 20 30 2c 20 30 5d 2c 20 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 5d 2c 20 5b 30 2c 20 30 2c 20 31 5d 5d | [1,.0,.0],.[0,.1,.0],.[0,.0,.1]] |
| 0460 | 29 0d 0a 0d 0a 0d 0a 78 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 32 44 5f 73 | )......xs.=.ot.datasets.get_2D_s |
| 0480 | 61 6d 70 6c 65 73 5f 67 61 75 73 73 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 6d 75 5f 73 2c 20 63 6f | amples_gauss(n_samples,.mu_s,.co |
| 04a0 | 76 5f 73 29 0d 0a 50 20 3d 20 73 70 2e 6c 69 6e 61 6c 67 2e 73 71 72 74 6d 28 63 6f 76 5f 74 29 | v_s)..P.=.sp.linalg.sqrtm(cov_t) |
| 04c0 | 0d 0a 78 74 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 | ..xt.=.np.random.randn(n_samples |
| 04e0 | 2c 20 33 29 2e 64 6f 74 28 50 29 20 2b 20 6d 75 5f 74 0d 0a 0d 0a 0d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 | ,.3).dot(P).+.mu_t......######## |
| 0500 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 0520 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 0540 | 23 23 23 23 23 23 0d 0a 23 20 50 6c 6f 74 74 69 6e 67 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 | ######..#.Plotting.the.distribut |
| 0560 | 69 6f 6e 73 0d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ions..#.------------------------ |
| 0580 | 2d 2d 0d 0a 0d 0a 0d 0a 66 69 67 20 3d 20 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 29 0d 0a 61 78 31 20 3d | --......fig.=.pl.figure()..ax1.= |
| 05a0 | 20 66 69 67 2e 61 64 64 5f 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 32 31 29 0d 0a 61 78 31 2e 70 6c 6f 74 28 | .fig.add_subplot(121)..ax1.plot( |
| 05c0 | 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d | xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+b',.label= |
| 05e0 | 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0d 0a 61 78 32 20 3d 20 66 69 67 2e 61 64 64 | 'Source.samples')..ax2.=.fig.add |
| 0600 | 5f 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 32 32 2c 20 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 3d 27 33 64 27 29 0d 0a | _subplot(122,.projection='3d').. |
| 0620 | 61 78 32 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | ax2.scatter(xt[:,.0],.xt[:,.1],. |
| 0640 | 78 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 72 27 29 0d 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0d | xt[:,.2],.color='r')..pl.show(). |
| 0660 | 0a 0d 0a 0d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .....########################### |
| 0680 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 06a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0d 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 64 | ###################..#.Compute.d |
| 06c0 | 69 73 74 61 6e 63 65 20 6b 65 72 6e 65 6c 73 2c 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 65 20 74 68 65 6d 20 | istance.kernels,.normalize.them. |
| 06e0 | 61 6e 64 20 74 68 65 6e 20 64 69 73 70 6c 61 79 0d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | and.then.display..#.------------ |
| 0700 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 0720 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 0d 0a 0d 0a 43 31 20 3d 20 73 70 2e 73 70 61 74 69 | -------------......C1.=.sp.spati |
| 0740 | 61 6c 2e 64 69 73 74 61 6e 63 65 2e 63 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 73 29 0d 0a 43 32 20 3d 20 | al.distance.cdist(xs,.xs)..C2.=. |
| 0760 | 73 70 2e 73 70 61 74 69 61 6c 2e 64 69 73 74 61 6e 63 65 2e 63 64 69 73 74 28 78 74 2c 20 78 74 | sp.spatial.distance.cdist(xt,.xt |
| 0780 | 29 0d 0a 0d 0a 43 31 20 2f 3d 20 43 31 2e 6d 61 78 28 29 0d 0a 43 32 20 2f 3d 20 43 32 2e 6d 61 | )....C1./=.C1.max()..C2./=.C2.ma |
| 07a0 | 78 28 29 0d 0a 0d 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 29 0d 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 | x()....pl.figure()..pl.subplot(1 |
| 07c0 | 32 31 29 0d 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 43 31 29 0d 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 | 21)..pl.imshow(C1)..pl.subplot(1 |
| 07e0 | 32 32 29 0d 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 43 32 29 0d 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0d 0a 0d | 22)..pl.imshow(C2)..pl.show()... |
| 0800 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
| 0820 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 0840 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0d 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 47 72 6f 6d 6f | ###############..#.Compute.Gromo |
| 0860 | 76 2d 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 70 6c 61 6e 73 20 61 6e 64 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 | v-Wasserstein.plans.and.distance |
| 0880 | 0d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ..#.---------------------------- |
| 08a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 0d 0a 0d 0a 70 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e | -----------------......p.=.ot.un |
| 08c0 | 69 66 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 29 0d 0a 71 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 73 61 6d | if(n_samples)..q.=.ot.unif(n_sam |
| 08e0 | 70 6c 65 73 29 0d 0a 0d 0a 67 77 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 77 61 73 73 65 72 73 74 | ples)....gw.=.ot.gromov_wasserst |
| 0900 | 65 69 6e 28 43 31 2c 20 43 32 2c 20 70 2c 20 71 2c 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c | ein(C1,.C2,.p,.q,.'square_loss', |
| 0920 | 20 65 70 73 69 6c 6f 6e 3d 35 65 2d 34 29 0d 0a 67 77 5f 64 69 73 74 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f | .epsilon=5e-4)..gw_dist.=.ot.gro |
| 0940 | 6d 6f 76 5f 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 32 28 43 31 2c 20 43 32 2c 20 70 2c 20 71 2c 20 27 | mov_wasserstein2(C1,.C2,.p,.q,.' |
| 0960 | 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 65 70 73 69 6c 6f 6e 3d 35 65 2d 34 29 0d 0a 0d 0a 70 | square_loss',.epsilon=5e-4)....p |
| 0980 | 72 69 6e 74 28 27 47 72 6f 6d 6f 76 2d 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 64 69 73 74 61 6e 63 | rint('Gromov-Wasserstein.distanc |
| 09a0 | 65 73 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 3a 20 27 20 2b | es.between.the.distribution:.'.+ |
| 09c0 | 20 73 74 72 28 67 77 5f 64 69 73 74 29 29 0d 0a 0d 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 29 0d 0a 70 | .str(gw_dist))....pl.figure()..p |
| 09e0 | 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 67 77 2c 20 63 6d 61 70 3d 27 6a 65 74 27 29 0d 0a 70 6c 2e 63 6f 6c | l.imshow(gw,.cmap='jet')..pl.col |
| 0a00 | 6f 72 62 61 72 28 29 0d 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0d 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 09 6f | orbar()..pl.show()..PK.........o |
| 0a20 | 2f 4b a4 4f 47 3f 0c 0c 00 00 0c 0c 00 00 19 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f | /K.OG?............auto_examples/ |
| 0a40 | 70 6c 6f 74 5f 57 44 41 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d | plot_WDA.py#.-*-.coding:.utf-8.- |
| 0a60 | 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | *-.""".========================= |
| 0a80 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 44 69 73 63 72 69 6d 69 6e 61 6e | ========.Wasserstein.Discriminan |
| 0aa0 | 74 20 41 6e 61 6c 79 73 69 73 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | t.Analysis.===================== |
| 0ac0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6c 6c 75 73 | ============..This.example.illus |
| 0ae0 | 74 72 61 74 65 20 74 68 65 20 75 73 65 20 6f 66 20 57 44 41 20 61 73 20 70 72 6f 70 6f 73 65 64 | trate.the.use.of.WDA.as.proposed |
| 0b00 | 20 69 6e 20 5b 31 31 5d 2e 0a 0a 0a 5b 31 31 5d 20 46 6c 61 6d 61 72 79 2c 20 52 2e 2c 20 43 75 | .in.[11]....[11].Flamary,.R.,.Cu |
| 0b20 | 74 75 72 69 2c 20 4d 2e 2c 20 43 6f 75 72 74 79 2c 20 4e 2e 2c 20 26 20 52 61 6b 6f 74 6f 6d 61 | turi,.M.,.Courty,.N.,.&.Rakotoma |
| 0b40 | 6d 6f 6e 6a 79 2c 20 41 2e 20 28 32 30 31 36 29 2e 0a 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 44 69 | monjy,.A..(2016)..Wasserstein.Di |
| 0b60 | 73 63 72 69 6d 69 6e 61 6e 74 20 41 6e 61 6c 79 73 69 73 2e 0a 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 | scriminant.Analysis..."""..#.Aut |
| 0b80 | 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 | hor:.Remi.Flamary.<remi.flamary@ |
| 0ba0 | 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e | unice.fr>.#.#.License:.MIT.Licen |
| 0bc0 | 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 | se..import.numpy.as.np.import.ma |
| 0be0 | 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 0a 66 72 6f 6d 20 6f 74 2e 64 72 | tplotlib.pylab.as.pl..from.ot.dr |
| 0c00 | 20 69 6d 70 6f 72 74 20 77 64 61 2c 20 66 64 61 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .import.wda,.fda...############# |
| 0c20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 0c40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 0c60 | 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | #.#.Generate.data.#.------------ |
| 0c80 | 2d 0a 0a 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 0a 0a 6e 20 3d 20 31 30 30 30 20 20 23 20 6e | -..#%%.parameters..n.=.1000..#.n |
| 0ca0 | 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 69 6e 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 | b.samples.in.source.and.target.d |
| 0cc0 | 61 74 61 73 65 74 73 0a 6e 7a 20 3d 20 30 2e 32 0a 0a 23 20 67 65 6e 65 72 61 74 65 20 63 69 72 | atasets.nz.=.0.2..#.generate.cir |
| 0ce0 | 63 6c 65 20 64 61 74 61 73 65 74 0a 74 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 28 6e | cle.dataset.t.=.np.random.rand(n |
| 0d00 | 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 0a 79 73 20 3d 20 6e 70 2e 66 6c 6f 6f 72 28 28 6e 70 2e | ).*.2.*.np.pi.ys.=.np.floor((np. |
| 0d20 | 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2a 20 31 2e 30 20 2f 20 6e 20 2a 20 33 29 29 20 2b 20 31 0a 78 73 | arange(n).*.1.0./.n.*.3)).+.1.xs |
| 0d40 | 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 6e 63 61 74 65 6e 61 74 65 28 0a 20 20 20 20 28 6e 70 2e 63 6f 73 28 74 | .=.np.concatenate(.....(np.cos(t |
| 0d60 | 29 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 2c 20 6e 70 2e 73 69 6e 28 74 29 2e 72 65 | ).reshape((-1,.1)),.np.sin(t).re |
| 0d80 | 73 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 29 2c 20 31 29 0a 78 73 20 3d 20 78 73 20 2a 20 79 73 | shape((-1,.1))),.1).xs.=.xs.*.ys |
| 0da0 | 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 2d 31 2c 20 31 29 20 2b 20 6e 7a 20 2a 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d | .reshape(-1,.1).+.nz.*.np.random |
| 0dc0 | 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c 20 32 29 0a 0a 74 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 | .randn(n,.2)..t.=.np.random.rand |
| 0de0 | 28 6e 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 0a 79 74 20 3d 20 6e 70 2e 66 6c 6f 6f 72 28 28 6e | (n).*.2.*.np.pi.yt.=.np.floor((n |
| 0e00 | 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2a 20 31 2e 30 20 2f 20 6e 20 2a 20 33 29 29 20 2b 20 31 0a | p.arange(n).*.1.0./.n.*.3)).+.1. |
| 0e20 | 78 74 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 6e 63 61 74 65 6e 61 74 65 28 0a 20 20 20 20 28 6e 70 2e 63 6f 73 | xt.=.np.concatenate(.....(np.cos |
| 0e40 | 28 74 29 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 2c 20 6e 70 2e 73 69 6e 28 74 29 2e | (t).reshape((-1,.1)),.np.sin(t). |
| 0e60 | 72 65 73 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 29 2c 20 31 29 0a 78 74 20 3d 20 78 74 20 2a 20 | reshape((-1,.1))),.1).xt.=.xt.*. |
| 0e80 | 79 74 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 2d 31 2c 20 31 29 20 2b 20 6e 7a 20 2a 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 | yt.reshape(-1,.1).+.nz.*.np.rand |
| 0ea0 | 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c 20 32 29 0a 0a 6e 62 6e 6f 69 73 65 20 3d 20 38 0a 0a 78 73 20 | om.randn(n,.2)..nbnoise.=.8..xs. |
| 0ec0 | 3d 20 6e 70 2e 68 73 74 61 63 6b 28 28 78 73 2c 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e | =.np.hstack((xs,.np.random.randn |
| 0ee0 | 28 6e 2c 20 6e 62 6e 6f 69 73 65 29 29 29 0a 78 74 20 3d 20 6e 70 2e 68 73 74 61 63 6b 28 28 78 | (n,.nbnoise))).xt.=.np.hstack((x |
| 0f00 | 74 2c 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c 20 6e 62 6e 6f 69 73 65 29 29 29 | t,.np.random.randn(n,.nbnoise))) |
| 0f20 | 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ..############################## |
| 0f40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 0f60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d | ################.#.Plot.data.#.- |
| 0f80 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 70 6c 2e 66 69 | --------..#%%.plot.samples.pl.fi |
| 0fa0 | 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 2e 35 29 29 0a 0a 70 6c 2e | gure(1,.figsize=(6.4,.3.5))..pl. |
| 0fc0 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a | subplot(1,.2,.1).pl.scatter(xt[: |
| 0fe0 | 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 | ,.0],.xt[:,.1],.c=ys,.marker='+' |
| 1000 | 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 | ,.label='Source.samples').pl.leg |
| 1020 | 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 63 72 69 6d 69 6e 61 6e | end(loc=0).pl.title('Discriminan |
| 1040 | 74 20 64 69 6d 65 6e 73 69 6f 6e 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c | t.dimensions')..pl.subplot(1,.2, |
| 1060 | 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 33 | .2).pl.scatter(xt[:,.2],.xt[:,.3 |
| 1080 | 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 | ],.c=ys,.marker='+',.label='Sour |
| 10a0 | 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c | ce.samples').pl.legend(loc=0).pl |
| 10c0 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 74 68 65 72 20 64 69 6d 65 6e 73 69 6f 6e 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 | .title('Other.dimensions').pl.ti |
| 10e0 | 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ght_layout()..################## |
| 1100 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 1120 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 | ############################.#.C |
| 1140 | 6f 6d 70 75 74 65 20 46 69 73 68 65 72 20 44 69 73 63 72 69 6d 69 6e 61 6e 74 20 41 6e 61 6c 79 | ompute.Fisher.Discriminant.Analy |
| 1160 | 73 69 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | sis.#.-------------------------- |
| 1180 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 46 44 41 0a 70 20 3d 20 | ----------..#%%.Compute.FDA.p.=. |
| 11a0 | 32 0a 0a 50 66 64 61 2c 20 70 72 6f 6a 66 64 61 20 3d 20 66 64 61 28 78 73 2c 20 79 73 2c 20 70 | 2..Pfda,.projfda.=.fda(xs,.ys,.p |
| 11c0 | 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | )..############################# |
| 11e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 1200 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 57 61 73 73 | #################.#.Compute.Wass |
| 1220 | 65 72 73 74 65 69 6e 20 44 69 73 63 72 69 6d 69 6e 61 6e 74 20 41 6e 61 6c 79 73 69 73 0a 23 20 | erstein.Discriminant.Analysis.#. |
| 1240 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 1260 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 57 44 41 0a 70 20 3d 20 32 | ---------..#%%.Compute.WDA.p.=.2 |
| 1280 | 0a 72 65 67 20 3d 20 31 65 30 0a 6b 20 3d 20 31 30 0a 6d 61 78 69 74 65 72 20 3d 20 31 30 30 0a | .reg.=.1e0.k.=.10.maxiter.=.100. |
| 12a0 | 0a 50 77 64 61 2c 20 70 72 6f 6a 77 64 61 20 3d 20 77 64 61 28 78 73 2c 20 79 73 2c 20 70 2c 20 | .Pwda,.projwda.=.wda(xs,.ys,.p,. |
| 12c0 | 72 65 67 2c 20 6b 2c 20 6d 61 78 69 74 65 72 3d 6d 61 78 69 74 65 72 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 | reg,.k,.maxiter=maxiter)...##### |
| 12e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 1300 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 1320 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 32 44 20 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 73 0a | #########.#.Plot.2D.projections. |
| 1340 | 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 | #.-------------------..#%%.plot. |
| 1360 | 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 0a 78 73 70 20 3d 20 70 72 6f 6a 66 64 61 28 78 73 29 0a 78 74 70 20 3d | samples..xsp.=.projfda(xs).xtp.= |
| 1380 | 20 70 72 6f 6a 66 64 61 28 78 74 29 0a 0a 78 73 70 77 20 3d 20 70 72 6f 6a 77 64 61 28 78 73 29 | .projfda(xt)..xspw.=.projwda(xs) |
| 13a0 | 0a 78 74 70 77 20 3d 20 70 72 6f 6a 77 64 61 28 78 74 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 | .xtpw.=.projwda(xt)..pl.figure(2 |
| 13c0 | 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 | )..pl.subplot(2,.2,.1).pl.scatte |
| 13e0 | 72 28 78 73 70 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 70 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 | r(xsp[:,.0],.xsp[:,.1],.c=ys,.ma |
| 1400 | 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c | rker='+',.label='Projected.sampl |
| 1420 | 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | es').pl.legend(loc=0).pl.title(' |
| 1440 | 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 46 44 41 27 29 | Projected.training.samples.FDA') |
| 1460 | 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 | ..pl.subplot(2,.2,.2).pl.scatter |
| 1480 | 28 78 74 70 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 70 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 | (xtp[:,.0],.xtp[:,.1],.c=ys,.mar |
| 14a0 | 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 | ker='+',.label='Projected.sample |
| 14c0 | 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 | s').pl.legend(loc=0).pl.title('P |
| 14e0 | 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 74 65 73 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 46 44 41 27 29 0a 0a 70 6c 2e | rojected.test.samples.FDA')..pl. |
| 1500 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 70 77 | subplot(2,.2,.3).pl.scatter(xspw |
| 1520 | 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 70 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 | [:,.0],.xspw[:,.1],.c=ys,.marker |
| 1540 | 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 | ='+',.label='Projected.samples') |
| 1560 | 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 72 6f 6a | .pl.legend(loc=0).pl.title('Proj |
| 1580 | 65 63 74 65 64 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 57 44 41 27 29 0a 0a 70 6c | ected.training.samples.WDA')..pl |
| 15a0 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 70 | .subplot(2,.2,.4).pl.scatter(xtp |
| 15c0 | 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 70 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 | w[:,.0],.xtpw[:,.1],.c=ys,.marke |
| 15e0 | 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 | r='+',.label='Projected.samples' |
| 1600 | 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 72 6f | ).pl.legend(loc=0).pl.title('Pro |
| 1620 | 6a 65 63 74 65 64 20 74 65 73 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 57 44 41 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 | jected.test.samples.WDA').pl.tig |
| 1640 | 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 | ht_layout()..pl.show().PK....... |
| 1660 | 00 09 6f 2f 4b 8b 89 17 b5 91 1c 00 00 91 1c 00 00 27 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c | ..o/K............'...auto_exampl |
| 1680 | 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 2e 70 79 23 20 2d 2a | es/plot_gromov_barycenter.py#.-* |
| 16a0 | 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0d 0a 22 22 22 0d 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d | -.coding:.utf-8.-*-.."""..====== |
| 16c0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0d | ===============================. |
| 16e0 | 0a 47 72 6f 6d 6f 76 2d 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 65 | .Gromov-Wasserstein.Barycenter.e |
| 1700 | 78 61 6d 70 6c 65 0d 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | xample..======================== |
| 1720 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0d 0a 0d 0a 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 73 | =============....This.example.is |
| 1740 | 20 64 65 73 69 67 6e 65 64 20 74 6f 20 73 68 6f 77 20 68 6f 77 20 74 6f 20 75 73 65 20 74 68 65 | .designed.to.show.how.to.use.the |
| 1760 | 20 47 72 6f 6d 6f 76 2d 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 0d 0a 63 6f | .Gromov-Wasserstein.distance..co |
| 1780 | 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 69 6e 20 50 4f 54 2e 0d 0a 22 22 22 0d 0a 0d 0a 23 20 41 75 74 68 | mputation.in.POT..."""....#.Auth |
| 17a0 | 6f 72 3a 20 45 72 77 61 6e 20 56 61 75 74 69 65 72 20 3c 65 72 77 61 6e 2e 76 61 75 74 69 65 72 | or:.Erwan.Vautier.<erwan.vautier |
| 17c0 | 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 0d 0a 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 4e 69 63 6f 6c 61 73 20 43 | @gmail.com>..#.........Nicolas.C |
| 17e0 | 6f 75 72 74 79 20 3c 6e 63 6f 75 72 74 79 40 69 72 69 73 61 2e 66 72 3e 0d 0a 23 0d 0a 23 20 4c | ourty.<ncourty@irisa.fr>..#..#.L |
| 1800 | 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 0d 0a 0d 0a 0d 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 | icense:.MIT.License......import. |
| 1820 | 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0d 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 73 63 69 70 79 20 61 73 20 73 70 0d | numpy.as.np..import.scipy.as.sp. |
| 1840 | 0a 0d 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 73 63 69 70 79 2e 6e 64 69 6d 61 67 65 20 61 73 20 73 70 69 0d 0a | ...import.scipy.ndimage.as.spi.. |
| 1860 | 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0d 0a 66 | import.matplotlib.pylab.as.pl..f |
| 1880 | 72 6f 6d 20 73 6b 6c 65 61 72 6e 20 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 6e 69 66 6f 6c 64 0d 0a 66 72 6f | rom.sklearn.import.manifold..fro |
| 18a0 | 6d 20 73 6b 6c 65 61 72 6e 2e 64 65 63 6f 6d 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 20 69 6d 70 6f 72 74 20 50 | m.sklearn.decomposition.import.P |
| 18c0 | 43 41 0d 0a 0d 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0d 0a 0d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | CA....import.ot....############# |
| 18e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 1900 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 1920 | 23 0d 0a 23 20 53 6d 61 63 6f 66 20 4d 44 53 0d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 23 | #..#.Smacof.MDS..#.----------..# |
| 1940 | 0d 0a 23 20 54 68 69 73 20 66 75 6e 63 74 69 6f 6e 20 61 6c 6c 6f 77 73 20 74 6f 20 66 69 6e 64 | ..#.This.function.allows.to.find |
| 1960 | 20 61 6e 20 65 6d 62 65 64 64 69 6e 67 20 6f 66 20 70 6f 69 6e 74 73 20 67 69 76 65 6e 20 61 20 | .an.embedding.of.points.given.a. |
| 1980 | 64 69 73 73 69 6d 69 6c 61 72 69 74 79 20 6d 61 74 72 69 78 0d 0a 23 20 74 68 61 74 20 77 69 6c | dissimilarity.matrix..#.that.wil |
| 19a0 | 6c 20 62 65 20 67 69 76 65 6e 20 62 79 20 74 68 65 20 6f 75 74 70 75 74 20 6f 66 20 74 68 65 20 | l.be.given.by.the.output.of.the. |
| 19c0 | 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 0d 0a 0d 0a 0d 0a 64 65 66 20 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 2c | algorithm......def.smacof_mds(C, |
| 19e0 | 20 64 69 6d 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 33 30 30 30 2c 20 65 70 73 3d 31 65 2d 39 29 3a 0d | .dim,.max_iter=3000,.eps=1e-9):. |
| 1a00 | 0a 20 20 20 20 22 22 22 0d 0a 20 20 20 20 52 65 74 75 72 6e 73 20 61 6e 20 69 6e 74 65 72 70 6f | ....."""......Returns.an.interpo |
| 1a20 | 6c 61 74 65 64 20 70 6f 69 6e 74 20 63 6c 6f 75 64 20 66 6f 6c 6c 6f 77 69 6e 67 20 74 68 65 20 | lated.point.cloud.following.the. |
| 1a40 | 64 69 73 73 69 6d 69 6c 61 72 69 74 79 20 6d 61 74 72 69 78 20 43 0d 0a 20 20 20 20 75 73 69 6e | dissimilarity.matrix.C......usin |
| 1a60 | 67 20 53 4d 41 43 4f 46 20 6d 75 6c 74 69 64 69 6d 65 6e 73 69 6f 6e 61 6c 20 73 63 61 6c 69 6e | g.SMACOF.multidimensional.scalin |
| 1a80 | 67 20 28 4d 44 53 29 20 69 6e 20 73 70 65 63 69 66 69 63 20 64 69 6d 65 6e 73 69 6f 6e 6e 65 64 | g.(MDS).in.specific.dimensionned |
| 1aa0 | 0d 0a 20 20 20 20 74 61 72 67 65 74 20 73 70 61 63 65 0d 0a 0d 0a 20 20 20 20 50 61 72 61 6d 65 | ......target.space........Parame |
| 1ac0 | 74 65 72 73 0d 0a 20 20 20 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 20 20 20 20 43 20 3a 20 6e 64 | ters......----------......C.:.nd |
| 1ae0 | 61 72 72 61 79 2c 20 73 68 61 70 65 20 28 6e 73 2c 20 6e 73 29 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 64 | array,.shape.(ns,.ns)..........d |
| 1b00 | 69 73 73 69 6d 69 6c 61 72 69 74 79 20 6d 61 74 72 69 78 0d 0a 20 20 20 20 64 69 6d 20 3a 20 69 | issimilarity.matrix......dim.:.i |
| 1b20 | 6e 74 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 64 69 6d 65 6e 73 69 6f 6e 20 6f 66 20 74 68 65 20 74 | nt............dimension.of.the.t |
| 1b40 | 61 72 67 65 74 65 64 20 73 70 61 63 65 0d 0a 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 20 3a 20 20 69 | argeted.space......max_iter.:..i |
| 1b60 | 6e 74 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 4d 61 78 69 6d 75 6d 20 6e 75 6d 62 65 72 20 6f 66 20 69 74 | nt..........Maximum.number.of.it |
| 1b80 | 65 72 61 74 69 6f 6e 73 20 6f 66 20 74 68 65 20 53 4d 41 43 4f 46 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d | erations.of.the.SMACOF.algorithm |
| 1ba0 | 20 66 6f 72 20 61 20 73 69 6e 67 6c 65 20 72 75 6e 0d 0a 20 20 20 20 65 70 73 20 3a 20 66 6c 6f | .for.a.single.run......eps.:.flo |
| 1bc0 | 61 74 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 72 65 6c 61 74 69 76 65 20 74 6f 6c 65 72 61 6e 63 65 20 77 | at..........relative.tolerance.w |
| 1be0 | 2e 72 2e 74 20 73 74 72 65 73 73 20 74 6f 20 64 65 63 6c 61 72 65 20 63 6f 6e 76 65 72 67 65 0d | .r.t.stress.to.declare.converge. |
| 1c00 | 0a 0d 0a 20 20 20 20 52 65 74 75 72 6e 73 0d 0a 20 20 20 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 20 20 20 | .......Returns......-------..... |
| 1c20 | 20 6e 70 6f 73 20 3a 20 6e 64 61 72 72 61 79 2c 20 73 68 61 70 65 20 28 52 2c 20 64 69 6d 29 0d | .npos.:.ndarray,.shape.(R,.dim). |
| 1c40 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 45 6d 62 65 64 64 65 64 20 63 6f 6f 72 64 69 6e 61 74 65 73 | ............Embedded.coordinates |
| 1c60 | 20 6f 66 20 74 68 65 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 65 64 20 70 6f 69 6e 74 20 63 6c 6f 75 64 | .of.the.interpolated.point.cloud |
| 1c80 | 20 28 64 65 66 69 6e 65 64 20 77 69 74 68 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6f 6e 65 20 69 | .(defined.with.............one.i |
| 1ca0 | 73 6f 6d 65 74 72 79 29 0d 0a 20 20 20 20 22 22 22 0d 0a 0d 0a 20 20 20 20 72 6e 67 20 3d 20 6e | sometry)......"""........rng.=.n |
| 1cc0 | 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 52 61 6e 64 6f 6d 53 74 61 74 65 28 73 65 65 64 3d 33 29 0d 0a 0d 0a | p.random.RandomState(seed=3).... |
| 1ce0 | 20 20 20 20 6d 64 73 20 3d 20 6d 61 6e 69 66 6f 6c 64 2e 4d 44 53 28 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 | ....mds.=.manifold.MDS(......... |
| 1d00 | 20 64 69 6d 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 6d 61 78 5f 69 74 65 72 | .dim,..........max_iter=max_iter |
| 1d20 | 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 65 70 73 3d 31 65 2d 39 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 64 69 | ,..........eps=1e-9,..........di |
| 1d40 | 73 73 69 6d 69 6c 61 72 69 74 79 3d 27 70 72 65 63 6f 6d 70 75 74 65 64 27 2c 0d 0a 20 20 20 20 | ssimilarity='precomputed',...... |
| 1d60 | 20 20 20 20 6e 5f 69 6e 69 74 3d 31 29 0d 0a 20 20 20 20 70 6f 73 20 3d 20 6d 64 73 2e 66 69 74 | ....n_init=1)......pos.=.mds.fit |
| 1d80 | 28 43 29 2e 65 6d 62 65 64 64 69 6e 67 5f 0d 0a 0d 0a 20 20 20 20 6e 6d 64 73 20 3d 20 6d 61 6e | (C).embedding_........nmds.=.man |
| 1da0 | 69 66 6f 6c 64 2e 4d 44 53 28 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 32 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 | ifold.MDS(..........2,.......... |
| 1dc0 | 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 6d 61 78 5f 69 74 65 72 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 65 70 73 3d | max_iter=max_iter,..........eps= |
| 1de0 | 31 65 2d 39 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 64 69 73 73 69 6d 69 6c 61 72 69 74 79 3d 22 70 72 | 1e-9,..........dissimilarity="pr |
| 1e00 | 65 63 6f 6d 70 75 74 65 64 22 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 72 61 6e 64 6f 6d 5f 73 74 61 74 | ecomputed",..........random_stat |
| 1e20 | 65 3d 72 6e 67 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 5f 69 6e 69 74 3d 31 29 0d 0a 20 20 20 20 6e | e=rng,..........n_init=1)......n |
| 1e40 | 70 6f 73 20 3d 20 6e 6d 64 73 2e 66 69 74 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 43 2c 20 69 6e 69 74 | pos.=.nmds.fit_transform(C,.init |
| 1e60 | 3d 70 6f 73 29 0d 0a 0d 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 6f 73 0d 0a 0d 0a 0d 0a 23 23 | =pos)........return.npos......## |
| 1e80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 1ea0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 1ec0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0d 0a 23 20 44 61 74 61 20 70 72 65 70 61 72 61 74 69 6f 6e | ############..#.Data.preparation |
| 1ee0 | 0d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 23 0d 0a 23 20 54 68 65 20 66 | ..#.----------------..#..#.The.f |
| 1f00 | 6f 75 72 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 61 72 65 20 63 6f 6e 73 74 72 75 63 74 65 | our.distributions.are.constructe |
| 1f20 | 64 20 66 72 6f 6d 20 34 20 73 69 6d 70 6c 65 20 69 6d 61 67 65 73 0d 0a 0d 0a 0d 0a 64 65 66 20 | d.from.4.simple.images......def. |
| 1f40 | 69 6d 32 6d 61 74 28 49 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 22 22 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 61 6e 64 20 | im2mat(I):......"""Converts.and. |
| 1f60 | 69 6d 61 67 65 20 74 6f 20 6d 61 74 72 69 78 20 28 6f 6e 65 20 70 69 78 65 6c 20 70 65 72 20 6c | image.to.matrix.(one.pixel.per.l |
| 1f80 | 69 6e 65 29 22 22 22 0d 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 49 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 49 | ine)"""......return.I.reshape((I |
| 1fa0 | 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 20 2a 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b | .shape[0].*.I.shape[1],.I.shape[ |
| 1fc0 | 32 5d 29 29 0d 0a 0d 0a 0d 0a 73 71 75 61 72 65 20 3d 20 73 70 69 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e | 2]))......square.=.spi.imread('. |
| 1fe0 | 2e 2f 64 61 74 61 2f 73 71 75 61 72 65 2e 70 6e 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c | ./data/square.png').astype(np.fl |
| 2000 | 6f 61 74 36 34 29 5b 3a 2c 20 3a 2c 20 32 5d 20 2f 20 32 35 36 0d 0a 63 72 6f 73 73 20 3d 20 73 | oat64)[:,.:,.2]./.256..cross.=.s |
| 2020 | 70 69 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 63 72 6f 73 73 2e 70 6e 67 27 29 2e 61 | pi.imread('../data/cross.png').a |
| 2040 | 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5b 3a 2c 20 3a 2c 20 32 5d 20 2f 20 32 35 36 | stype(np.float64)[:,.:,.2]./.256 |
| 2060 | 0d 0a 74 72 69 61 6e 67 6c 65 20 3d 20 73 70 69 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 | ..triangle.=.spi.imread('../data |
| 2080 | 2f 74 72 69 61 6e 67 6c 65 2e 70 6e 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 | /triangle.png').astype(np.float6 |
| 20a0 | 34 29 5b 3a 2c 20 3a 2c 20 32 5d 20 2f 20 32 35 36 0d 0a 73 74 61 72 20 3d 20 73 70 69 2e 69 6d | 4)[:,.:,.2]./.256..star.=.spi.im |
| 20c0 | 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 73 74 61 72 2e 70 6e 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 | read('../data/star.png').astype( |
| 20e0 | 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 5b 3a 2c 20 3a 2c 20 32 5d 20 2f 20 32 35 36 0d 0a 0d 0a 73 68 | np.float64)[:,.:,.2]./.256....sh |
| 2100 | 61 70 65 73 20 3d 20 5b 73 71 75 61 72 65 2c 20 63 72 6f 73 73 2c 20 74 72 69 61 6e 67 6c 65 2c | apes.=.[square,.cross,.triangle, |
| 2120 | 20 73 74 61 72 5d 0d 0a 0d 0a 53 20 3d 20 34 0d 0a 78 73 20 3d 20 5b 5b 5d 20 66 6f 72 20 69 20 | .star]....S.=.4..xs.=.[[].for.i. |
| 2140 | 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 0d 0a 0d 0a 0d 0a 66 6f 72 20 6e 62 20 69 6e 20 72 61 6e 67 | in.range(S)]......for.nb.in.rang |
| 2160 | 65 28 34 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 38 29 3a 0d 0a 20 | e(4):......for.i.in.range(8):... |
| 2180 | 20 20 20 20 20 20 20 66 6f 72 20 6a 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 38 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 20 | .......for.j.in.range(8):....... |
| 21a0 | 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 73 68 61 70 65 73 5b 6e 62 5d 5b 69 2c 20 6a 5d 20 3c 20 30 2e 39 | .......if.shapes[nb][i,.j].<.0.9 |
| 21c0 | 35 3a 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 78 73 5b 6e 62 5d 2e 61 70 70 65 6e | 5:..................xs[nb].appen |
| 21e0 | 64 28 5b 6a 2c 20 38 20 2d 20 69 5d 29 0d 0a 0d 0a 78 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b | d([j,.8.-.i])....xs.=.np.array([ |
| 2200 | 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 30 5d 29 2c 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 31 5d 29 | np.array(xs[0]),.np.array(xs[1]) |
| 2220 | 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 32 5d | ,.................np.array(xs[2] |
| 2240 | 29 2c 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 33 5d 29 5d 29 0d 0a 0d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 | ),.np.array(xs[3])])....######## |
| 2260 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 2280 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 22a0 | 23 23 23 23 23 23 0d 0a 23 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e | ######..#.Barycenter.computation |
| 22c0 | 0d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 0d 0a 0d 0a | ..#.----------------------...... |
| 22e0 | 6e 73 20 3d 20 5b 6c 65 6e 28 78 73 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 | ns.=.[len(xs[s]).for.s.in.range( |
| 2300 | 53 29 5d 0d 0a 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 33 30 0d 0a 0d 0a 22 22 22 43 6f 6d 70 75 74 | S)]..n_samples.=.30...."""Comput |
| 2320 | 65 20 61 6c 6c 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 | e.all.distances.matrices.for.the |
| 2340 | 20 66 6f 75 72 20 73 68 61 70 65 73 22 22 22 0d 0a 43 73 20 3d 20 5b 73 70 2e 73 70 61 74 69 61 | .four.shapes"""..Cs.=.[sp.spatia |
| 2360 | 6c 2e 64 69 73 74 61 6e 63 65 2e 63 64 69 73 74 28 78 73 5b 73 5d 2c 20 78 73 5b 73 5d 29 20 66 | l.distance.cdist(xs[s],.xs[s]).f |
| 2380 | 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 0d 0a 43 73 20 3d 20 5b 63 73 20 2f 20 63 73 | or.s.in.range(S)]..Cs.=.[cs./.cs |
| 23a0 | 2e 6d 61 78 28 29 20 66 6f 72 20 63 73 20 69 6e 20 43 73 5d 0d 0a 0d 0a 70 73 20 3d 20 5b 6f 74 | .max().for.cs.in.Cs]....ps.=.[ot |
| 23c0 | 2e 75 6e 69 66 28 6e 73 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 0d | .unif(ns[s]).for.s.in.range(S)]. |
| 23e0 | 0a 70 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 29 0d 0a 0d 0a 0d 0a 6c 61 6d | .p.=.ot.unif(n_samples)......lam |
| 2400 | 62 64 61 73 74 20 3d 20 5b 5b 66 6c 6f 61 74 28 69 29 20 2f 20 33 2c 20 66 6c 6f 61 74 28 33 20 | bdast.=.[[float(i)./.3,.float(3. |
| 2420 | 2d 20 69 29 20 2f 20 33 5d 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 5b 31 2c 20 32 5d 5d 0d 0a 0d 0a 43 74 | -.i)./.3].for.i.in.[1,.2]]....Ct |
| 2440 | 30 31 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f 72 20 | 01.=.[0.for.i.in.range(2)]..for. |
| 2460 | 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 43 74 30 31 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 | i.in.range(2):......Ct01[i].=.ot |
| 2480 | 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 6d | .gromov.gromov_barycenters(n_sam |
| 24a0 | 70 6c 65 73 2c 20 5b 43 73 5b 30 5d 2c 20 43 73 5b 31 5d 5d 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ples,.[Cs[0],.Cs[1]],........... |
| 24c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 24e0 | 20 20 5b 70 73 5b 30 5d 2c 20 70 73 5b 31 5d 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ..[ps[0],.ps[1]................. |
| 2500 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 | .............................],. |
| 2520 | 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 35 | p,.lambdast[i],.'square_loss',.5 |
| 2540 | 65 2d 34 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | e-4,............................ |
| 2560 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 | .................max_iter=100,.t |
| 2580 | 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 0d 0a 0d 0a 43 74 30 32 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 | ol=1e-3)....Ct02.=.[0.for.i.in.r |
| 25a0 | 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 0d 0a 20 20 | ange(2)]..for.i.in.range(2):.... |
| 25c0 | 20 20 43 74 30 32 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 | ..Ct02[i].=.ot.gromov.gromov_bar |
| 25e0 | 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 5b 43 73 5b 30 5d 2c 20 43 73 5b 32 | ycenters(n_samples,.[Cs[0],.Cs[2 |
| 2600 | 5d 5d 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ]],............................. |
| 2620 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b 30 5d 2c 20 70 73 5b 32 5d 0d 0a 20 | ................[ps[0],.ps[2]... |
| 2640 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 2660 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 | ...........],.p,.lambdast[i],.'s |
| 2680 | 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 35 65 2d 34 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | quare_loss',.5e-4,.............. |
| 26a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d | ...............................m |
| 26c0 | 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 0d 0a 0d 0a 43 74 31 33 20 3d | ax_iter=100,.tol=1e-3)....Ct13.= |
| 26e0 | 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e | .[0.for.i.in.range(2)]..for.i.in |
| 2700 | 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 43 74 31 33 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f | .range(2):......Ct13[i].=.ot.gro |
| 2720 | 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 | mov.gromov_barycenters(n_samples |
| 2740 | 2c 20 5b 43 73 5b 31 5d 2c 20 43 73 5b 33 5d 5d 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ,.[Cs[1],.Cs[3]],............... |
| 2760 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 | ..............................[p |
| 2780 | 73 5b 31 5d 2c 20 70 73 5b 33 5d 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | s[1],.ps[3]..................... |
| 27a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c | .........................],.p,.l |
| 27c0 | 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 35 65 2d 34 2c | ambdast[i],.'square_loss',.5e-4, |
| 27e0 | 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 2800 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 | .............max_iter=100,.tol=1 |
| 2820 | 65 2d 33 29 0d 0a 0d 0a 43 74 32 33 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 | e-3)....Ct23.=.[0.for.i.in.range |
| 2840 | 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 43 74 | (2)]..for.i.in.range(2):......Ct |
| 2860 | 32 33 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 6e | 23[i].=.ot.gromov.gromov_barycen |
| 2880 | 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 5b 43 73 5b 32 5d 2c 20 43 73 5b 33 5d 5d 2c 0d | ters(n_samples,.[Cs[2],.Cs[3]],. |
| 28a0 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 28c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b 32 5d 2c 20 70 73 5b 33 5d 0d 0a 20 20 20 20 20 | ............[ps[2],.ps[3]....... |
| 28e0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 2900 | 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 71 75 61 72 | .......],.p,.lambdast[i],.'squar |
| 2920 | 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 35 65 2d 34 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | e_loss',.5e-4,.................. |
| 2940 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 | ...........................max_i |
| 2960 | 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 0d 0a 0d 0a 0d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 | ter=100,.tol=1e-3)......######## |
| 2980 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 29a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 29c0 | 23 23 23 23 23 23 0d 0a 23 20 56 69 73 75 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 0d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d | ######..#.Visualization..#.----- |
| 29e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 23 0d 0a 23 20 54 68 65 20 50 43 41 20 68 65 6c 70 73 20 69 6e 20 | --------..#..#.The.PCA.helps.in. |
| 2a00 | 67 65 74 74 69 6e 67 20 63 6f 6e 73 69 73 74 65 6e 63 79 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 74 68 65 20 | getting.consistency.between.the. |
| 2a20 | 72 6f 74 61 74 69 6f 6e 73 0d 0a 0d 0a 0d 0a 63 6c 66 20 3d 20 50 43 41 28 6e 5f 63 6f 6d 70 6f | rotations......clf.=.PCA(n_compo |
| 2a40 | 6e 65 6e 74 73 3d 32 29 0d 0a 6e 70 6f 73 20 3d 20 5b 30 2c 20 30 2c 20 30 2c 20 30 5d 0d 0a 6e | nents=2)..npos.=.[0,.0,.0,.0]..n |
| 2a60 | 70 6f 73 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 73 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 | pos.=.[smacof_mds(Cs[s],.2).for. |
| 2a80 | 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 0d 0a 0d 0a 6e 70 6f 73 74 30 31 20 3d 20 5b 30 2c 20 | s.in.range(S)]....npost01.=.[0,. |
| 2aa0 | 30 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 30 31 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 74 30 31 5b 73 | 0]..npost01.=.[smacof_mds(Ct01[s |
| 2ac0 | 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 30 | ],.2).for.s.in.range(2)]..npost0 |
| 2ae0 | 31 20 3d 20 5b 63 6c 66 2e 66 69 74 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 6e 70 6f 73 74 30 31 5b 73 | 1.=.[clf.fit_transform(npost01[s |
| 2b00 | 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 0d 0a 6e 70 6f 73 74 30 32 | ]).for.s.in.range(2)]....npost02 |
| 2b20 | 20 3d 20 5b 30 2c 20 30 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 30 32 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 | .=.[0,.0]..npost02.=.[smacof_mds |
| 2b40 | 28 43 74 30 32 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d | (Ct02[s],.2).for.s.in.range(2)]. |
| 2b60 | 0a 6e 70 6f 73 74 30 32 20 3d 20 5b 63 6c 66 2e 66 69 74 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 6e 70 | .npost02.=.[clf.fit_transform(np |
| 2b80 | 6f 73 74 30 32 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 0d 0a | ost02[s]).for.s.in.range(2)].... |
| 2ba0 | 6e 70 6f 73 74 31 33 20 3d 20 5b 30 2c 20 30 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 31 33 20 3d 20 5b 73 6d 61 | npost13.=.[0,.0]..npost13.=.[sma |
| 2bc0 | 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 74 31 33 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e | cof_mds(Ct13[s],.2).for.s.in.ran |
| 2be0 | 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 31 33 20 3d 20 5b 63 6c 66 2e 66 69 74 5f 74 72 61 6e 73 | ge(2)]..npost13.=.[clf.fit_trans |
| 2c00 | 66 6f 72 6d 28 6e 70 6f 73 74 31 33 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 | form(npost13[s]).for.s.in.range( |
| 2c20 | 32 29 5d 0d 0a 0d 0a 6e 70 6f 73 74 32 33 20 3d 20 5b 30 2c 20 30 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 32 33 | 2)]....npost23.=.[0,.0]..npost23 |
| 2c40 | 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 74 32 33 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 | .=.[smacof_mds(Ct23[s],.2).for.s |
| 2c60 | 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 32 33 20 3d 20 5b 63 6c 66 2e 66 69 | .in.range(2)]..npost23.=.[clf.fi |
| 2c80 | 74 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 6e 70 6f 73 74 32 33 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e | t_transform(npost23[s]).for.s.in |
| 2ca0 | 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 0d 0a 0d 0a 66 69 67 20 3d 20 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 | .range(2)]......fig.=.pl.figure( |
| 2cc0 | 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 31 30 29 29 0d 0a 0d 0a 61 78 31 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 | figsize=(10,.10))....ax1.=.pl.su |
| 2ce0 | 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 30 2c 20 30 29 29 0d 0a 70 6c 2e 78 | bplot2grid((4,.4),.(0,.0))..pl.x |
| 2d00 | 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a | lim((-1,.1))..pl.ylim((-1,.1)).. |
| 2d20 | 61 78 31 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 5b | ax1.scatter(npos[0][:,.0],.npos[ |
| 2d40 | 30 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 72 27 29 0d 0a 0d 0a 61 78 32 20 3d 20 70 6c | 0][:,.1],.color='r')....ax2.=.pl |
| 2d60 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 30 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 | .subplot2grid((4,.4),.(0,.1))..p |
| 2d80 | 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 | l.xlim((-1,.1))..pl.ylim((-1,.1) |
| 2da0 | 29 0d 0a 61 78 32 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 30 31 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c | )..ax2.scatter(npost01[1][:,.0], |
| 2dc0 | 20 6e 70 6f 73 74 30 31 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 0d 0a 0d | .npost01[1][:,.1],.color='b')... |
| 2de0 | 0a 61 78 33 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 | .ax3.=.pl.subplot2grid((4,.4),.( |
| 2e00 | 30 2c 20 32 29 29 0d 0a 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 | 0,.2))..pl.xlim((-1,.1))..pl.yli |
| 2e20 | 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 33 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 30 31 5b | m((-1,.1))..ax3.scatter(npost01[ |
| 2e40 | 30 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 30 31 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f | 0][:,.0],.npost01[0][:,.1],.colo |
| 2e60 | 72 3d 27 62 27 29 0d 0a 0d 0a 61 78 34 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 | r='b')....ax4.=.pl.subplot2grid( |
| 2e80 | 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 30 2c 20 33 29 29 0d 0a 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 | (4,.4),.(0,.3))..pl.xlim((-1,.1) |
| 2ea0 | 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 34 2e 73 63 61 74 74 65 72 | )..pl.ylim((-1,.1))..ax4.scatter |
| 2ec0 | 28 6e 70 6f 73 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 | (npos[1][:,.0],.npos[1][:,.1],.c |
| 2ee0 | 6f 6c 6f 72 3d 27 72 27 29 0d 0a 0d 0a 61 78 35 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 | olor='r')....ax5.=.pl.subplot2gr |
| 2f00 | 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 31 2c 20 30 29 29 0d 0a 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c | id((4,.4),.(1,.0))..pl.xlim((-1, |
| 2f20 | 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 35 2e 73 63 61 74 | .1))..pl.ylim((-1,.1))..ax5.scat |
| 2f40 | 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 30 32 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 30 32 5b 31 5d | ter(npost02[1][:,.0],.npost02[1] |
| 2f60 | 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 0d 0a 0d 0a 61 78 36 20 3d 20 70 6c 2e 73 | [:,.1],.color='b')....ax6.=.pl.s |
| 2f80 | 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 31 2c 20 33 29 29 0d 0a 70 6c 2e | ubplot2grid((4,.4),.(1,.3))..pl. |
| 2fa0 | 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d | xlim((-1,.1))..pl.ylim((-1,.1)). |
| 2fc0 | 0a 61 78 36 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 31 33 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e | .ax6.scatter(npost13[1][:,.0],.n |
| 2fe0 | 70 6f 73 74 31 33 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 0d 0a 0d 0a 61 | post13[1][:,.1],.color='b')....a |
| 3000 | 78 37 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 32 2c | x7.=.pl.subplot2grid((4,.4),.(2, |
| 3020 | 20 30 29 29 0d 0a 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 | .0))..pl.xlim((-1,.1))..pl.ylim( |
| 3040 | 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 37 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 30 32 5b 30 5d | (-1,.1))..ax7.scatter(npost02[0] |
| 3060 | 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 30 32 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d | [:,.0],.npost02[0][:,.1],.color= |
| 3080 | 27 62 27 29 0d 0a 0d 0a 61 78 38 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 | 'b')....ax8.=.pl.subplot2grid((4 |
| 30a0 | 2c 20 34 29 2c 20 28 32 2c 20 33 29 29 0d 0a 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d | ,.4),.(2,.3))..pl.xlim((-1,.1)). |
| 30c0 | 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 38 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e | .pl.ylim((-1,.1))..ax8.scatter(n |
| 30e0 | 70 6f 73 74 31 33 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 31 33 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 31 | post13[0][:,.0],.npost13[0][:,.1 |
| 3100 | 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 0d 0a 0d 0a 61 78 39 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | ],.color='b')....ax9.=.pl.subplo |
| 3120 | 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 33 2c 20 30 29 29 0d 0a 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 | t2grid((4,.4),.(3,.0))..pl.xlim( |
| 3140 | 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 39 2e | (-1,.1))..pl.ylim((-1,.1))..ax9. |
| 3160 | 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 5b 32 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 5b 32 5d 5b 3a | scatter(npos[2][:,.0],.npos[2][: |
| 3180 | 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 72 27 29 0d 0a 0d 0a 61 78 31 30 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 | ,.1],.color='r')....ax10.=.pl.su |
| 31a0 | 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 33 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 78 | bplot2grid((4,.4),.(3,.1))..pl.x |
| 31c0 | 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a | lim((-1,.1))..pl.ylim((-1,.1)).. |
| 31e0 | 61 78 31 30 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 32 33 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e | ax10.scatter(npost23[1][:,.0],.n |
| 3200 | 70 6f 73 74 32 33 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 0d 0a 0d 0a 61 | post23[1][:,.1],.color='b')....a |
| 3220 | 78 31 31 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 33 | x11.=.pl.subplot2grid((4,.4),.(3 |
| 3240 | 2c 20 32 29 29 0d 0a 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d | ,.2))..pl.xlim((-1,.1))..pl.ylim |
| 3260 | 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 31 31 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 32 33 5b | ((-1,.1))..ax11.scatter(npost23[ |
| 3280 | 30 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 32 33 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f | 0][:,.0],.npost23[0][:,.1],.colo |
| 32a0 | 72 3d 27 62 27 29 0d 0a 0d 0a 61 78 31 32 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 | r='b')....ax12.=.pl.subplot2grid |
| 32c0 | 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 33 2c 20 33 29 29 0d 0a 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 | ((4,.4),.(3,.3))..pl.xlim((-1,.1 |
| 32e0 | 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 31 32 2e 73 63 61 74 74 | ))..pl.ylim((-1,.1))..ax12.scatt |
| 3300 | 65 72 28 6e 70 6f 73 5b 33 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 5b 33 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c | er(npos[3][:,.0],.npos[3][:,.1], |
| 3320 | 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 72 27 29 0d 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b 7e 83 d4 f9 6e | .color='r')..PK.........o/K~...n |
| 3340 | 0b 00 00 6e 0b 00 00 21 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 70 | ...n...!...auto_examples/plot_op |
| 3360 | 74 69 6d 5f 4f 54 72 65 67 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 | tim_OTreg.py#.-*-.coding:.utf-8. |
| 3380 | 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | -*-.""".======================== |
| 33a0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 4f 54 20 77 69 74 68 20 67 | ==========.Regularized.OT.with.g |
| 33c0 | 65 6e 65 72 69 63 20 73 6f 6c 76 65 72 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | eneric.solver.================== |
| 33e0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 49 6c 6c 75 73 74 72 61 74 65 73 20 74 68 | ================..Illustrates.th |
| 3400 | 65 20 75 73 65 20 6f 66 20 74 68 65 20 67 65 6e 65 72 69 63 20 73 6f 6c 76 65 72 20 66 6f 72 20 | e.use.of.the.generic.solver.for. |
| 3420 | 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 4f 54 20 77 69 74 68 0a 75 73 65 72 2d 64 65 73 69 67 6e 65 | regularized.OT.with.user-designe |
| 3440 | 64 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 74 65 72 6d 2e 20 49 74 20 75 73 65 73 20 43 | d.regularization.term..It.uses.C |
| 3460 | 6f 6e 64 69 74 69 6f 6e 61 6c 20 67 72 61 64 69 65 6e 74 20 61 73 20 69 6e 20 5b 36 5d 20 61 6e | onditional.gradient.as.in.[6].an |
| 3480 | 64 0a 67 65 6e 65 72 61 6c 69 7a 65 64 20 43 6f 6e 64 69 74 69 6f 6e 61 6c 20 47 72 61 64 69 65 | d.generalized.Conditional.Gradie |
| 34a0 | 6e 74 20 61 73 20 70 72 6f 70 6f 73 65 64 20 69 6e 20 5b 35 5d 5b 37 5d 2e 0a 0a 0a 5b 35 5d 20 | nt.as.proposed.in.[5][7]....[5]. |
| 34c0 | 4e 2e 20 43 6f 75 72 74 79 3b 20 52 2e 20 46 6c 61 6d 61 72 79 3b 20 44 2e 20 54 75 69 61 3b 20 | N..Courty;.R..Flamary;.D..Tuia;. |
| 34e0 | 41 2e 20 52 61 6b 6f 74 6f 6d 61 6d 6f 6e 6a 79 2c 20 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 54 72 61 6e 73 70 | A..Rakotomamonjy,.Optimal.Transp |
| 3500 | 6f 72 74 20 66 6f 72 0a 44 6f 6d 61 69 6e 20 41 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 2c 20 69 6e 20 49 45 | ort.for.Domain.Adaptation,.in.IE |
| 3520 | 45 45 20 54 72 61 6e 73 61 63 74 69 6f 6e 73 20 6f 6e 20 50 61 74 74 65 72 6e 20 41 6e 61 6c 79 | EE.Transactions.on.Pattern.Analy |
| 3540 | 73 69 73 20 61 6e 64 20 4d 61 63 68 69 6e 65 0a 49 6e 74 65 6c 6c 69 67 65 6e 63 65 20 2c 20 76 | sis.and.Machine.Intelligence.,.v |
| 3560 | 6f 6c 2e 50 50 2c 20 6e 6f 2e 39 39 2c 20 70 70 2e 31 2d 31 2e 0a 0a 5b 36 5d 20 46 65 72 72 61 | ol.PP,.no.99,.pp.1-1...[6].Ferra |
| 3580 | 64 61 6e 73 2c 20 53 2e 2c 20 50 61 70 61 64 61 6b 69 73 2c 20 4e 2e 2c 20 50 65 79 72 c3 a9 2c | dans,.S.,.Papadakis,.N.,.Peyr.., |
| 35a0 | 20 47 2e 2c 20 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 4a 2e 20 46 2e 20 28 32 30 31 34 29 2e 0a 52 65 67 75 | .G.,.&.Aujol,.J..F..(2014)..Regu |
| 35c0 | 6c 61 72 69 7a 65 64 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f | larized.discrete.optimal.transpo |
| 35e0 | 72 74 2e 20 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c 20 6f 6e 20 49 6d 61 67 69 6e 67 20 53 63 69 65 | rt..SIAM.Journal.on.Imaging.Scie |
| 3600 | 6e 63 65 73 2c 0a 37 28 33 29 2c 20 31 38 35 33 2d 31 38 38 32 2e 0a 0a 5b 37 5d 20 52 61 6b 6f | nces,.7(3),.1853-1882...[7].Rako |
| 3620 | 74 6f 6d 61 6d 6f 6e 6a 79 2c 20 41 2e 2c 20 46 6c 61 6d 61 72 79 2c 20 52 2e 2c 20 26 20 43 6f | tomamonjy,.A.,.Flamary,.R.,.&.Co |
| 3640 | 75 72 74 79 2c 20 4e 2e 20 28 32 30 31 35 29 2e 20 47 65 6e 65 72 61 6c 69 7a 65 64 0a 63 6f 6e | urty,.N..(2015)..Generalized.con |
| 3660 | 64 69 74 69 6f 6e 61 6c 20 67 72 61 64 69 65 6e 74 3a 20 61 6e 61 6c 79 73 69 73 20 6f 66 20 63 | ditional.gradient:.analysis.of.c |
| 3680 | 6f 6e 76 65 72 67 65 6e 63 65 20 61 6e 64 20 61 70 70 6c 69 63 61 74 69 6f 6e 73 2e 0a 61 72 58 | onvergence.and.applications..arX |
| 36a0 | 69 76 20 70 72 65 70 72 69 6e 74 20 61 72 58 69 76 3a 31 35 31 30 2e 30 36 35 36 37 2e 0a 0a 0a | iv.preprint.arXiv:1510.06567.... |
| 36c0 | 0a 22 22 22 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 | ."""..import.numpy.as.np.import. |
| 36e0 | 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 | matplotlib.pylab.as.pl.import.ot |
| 3700 | 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ...############################# |
| 3720 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 3740 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 | #################.#.Generate.dat |
| 3760 | 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 | a.#.-------------..#%%.parameter |
| 3780 | 73 0a 0a 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e 73 0a 0a 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 | s..n.=.100..#.nb.bins..#.bin.pos |
| 37a0 | 69 74 69 6f 6e 73 0a 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 | itions.x.=.np.arange(n,.dtype=np |
| 37c0 | 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 0a 0a 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 | .float64)..#.Gaussian.distributi |
| 37e0 | 6f 6e 73 0a 61 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 | ons.a.=.ot.datasets.get_1D_gauss |
| 3800 | 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 | (n,.m=20,.s=5)..#.m=.mean,.s=.st |
| 3820 | 64 0a 62 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e | d.b.=.ot.datasets.get_1D_gauss(n |
| 3840 | 2c 20 6d 3d 36 30 2c 20 73 3d 31 30 29 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 20 3d | ,.m=60,.s=10)..#.loss.matrix.M.= |
| 3860 | 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 | .ot.dist(x.reshape((n,.1)),.x.re |
| 3880 | 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 29 0a 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 23 23 | shape((n,.1))).M./=.M.max()..### |
| 38a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 38c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 38e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ###########.#.Solve.EMD.#.------ |
| 3900 | 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 45 4d 44 0a 0a 47 30 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 | ---..#%%.EMD..G0.=.ot.emd(a,.b,. |
| 3920 | 4d 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 | M)..pl.figure(3,.figsize=(5,.5)) |
| 3940 | 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 30 2c 20 27 4f | .ot.plot.plot1D_mat(a,.b,.G0,.'O |
| 3960 | 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 30 27 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | T.matrix.G0')..################# |
| 3980 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 39a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 | #############################.#. |
| 39c0 | 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 72 65 | Solve.EMD.with.Frobenius.norm.re |
| 39e0 | 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | gularization.#.----------------- |
| 3a00 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 | ---------------------------..#%% |
| 3a20 | 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 72 65 67 | .Example.with.Frobenius.norm.reg |
| 3a40 | 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 0a 0a 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 | ularization...def.f(G):.....retu |
| 3a60 | 72 6e 20 30 2e 35 20 2a 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 2a 2a 32 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 64 66 28 47 | rn.0.5.*.np.sum(G**2)...def.df(G |
| 3a80 | 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 47 0a 0a 0a 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 31 0a 0a 47 6c | ):.....return.G...reg.=.1e-1..Gl |
| 3aa0 | 32 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 66 2c | 2.=.ot.optim.cg(a,.b,.M,.reg,.f, |
| 3ac0 | 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 | .df,.verbose=True)..pl.figure(3) |
| 3ae0 | 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 6c 32 2c 20 27 | .ot.plot.plot1D_mat(a,.b,.Gl2,.' |
| 3b00 | 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 46 72 6f 62 2e 20 72 65 67 27 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | OT.matrix.Frob..reg')..######### |
| 3b20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 3b40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 3b60 | 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 | #####.#.Solve.EMD.with.entropic. |
| 3b80 | 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | regularization.#.--------------- |
| 3ba0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 45 78 61 | -----------------------..#%%.Exa |
| 3bc0 | 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f | mple.with.entropic.regularizatio |
| 3be0 | 6e 0a 0a 0a 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 | n...def.f(G):.....return.np.sum( |
| 3c00 | 47 20 2a 20 6e 70 2e 6c 6f 67 28 47 29 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 | G.*.np.log(G))...def.df(G):..... |
| 3c20 | 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 6c 6f 67 28 47 29 20 2b 20 31 2e 0a 0a 0a 72 65 67 20 3d 20 31 65 | return.np.log(G).+.1....reg.=.1e |
| 3c40 | 2d 33 0a 0a 47 65 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 | -3..Ge.=.ot.optim.cg(a,.b,.M,.re |
| 3c60 | 67 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 | g,.f,.df,.verbose=True)..pl.figu |
| 3c80 | 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c | re(4,.figsize=(5,.5)).ot.plot.pl |
| 3ca0 | 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 65 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 45 6e | ot1D_mat(a,.b,.Ge,.'OT.matrix.En |
| 3cc0 | 74 72 6f 70 2e 20 72 65 67 27 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | trop..reg')..################### |
| 3ce0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 3d00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f | ###########################.#.So |
| 3d20 | 6c 76 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 2b 20 65 6e | lve.EMD.with.Frobenius.norm.+.en |
| 3d40 | 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | tropic.regularization.#.-------- |
| 3d60 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 3d80 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 | ---------------..#%%.Example.wit |
| 3da0 | 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 2b 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 | h.Frobenius.norm.+.entropic.regu |
| 3dc0 | 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 67 63 67 0a 0a 0a 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 0a | larization.with.gcg...def.f(G):. |
| 3de0 | 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 30 2e 35 20 2a 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 2a 2a 32 29 0a 0a 0a | ....return.0.5.*.np.sum(G**2)... |
| 3e00 | 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 47 0a 0a 0a 72 65 67 31 20 3d | def.df(G):.....return.G...reg1.= |
| 3e20 | 20 31 65 2d 33 0a 72 65 67 32 20 3d 20 31 65 2d 31 0a 0a 47 65 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 | .1e-3.reg2.=.1e-1..Gel2.=.ot.opt |
| 3e40 | 69 6d 2e 67 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 31 2c 20 72 65 67 32 2c 20 66 2c 20 64 | im.gcg(a,.b,.M,.reg1,.reg2,.f,.d |
| 3e60 | 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 2c 20 66 | f,.verbose=True)..pl.figure(5,.f |
| 3e80 | 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 | igsize=(5,.5)).ot.plot.plot1D_ma |
| 3ea0 | 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 65 6c 32 2c 20 27 4f 54 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 2b 20 6d 61 74 | t(a,.b,.Gel2,.'OT.entropic.+.mat |
| 3ec0 | 72 69 78 20 46 72 6f 62 2e 20 72 65 67 27 29 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 | rix.Frob..reg').pl.show().PK.... |
| 3ee0 | 00 00 00 00 09 6f 2f 4b 3b 5a 71 cf fc 14 00 00 fc 14 00 00 1d 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 | .....o/K;Zq.............auto_exa |
| 3f00 | 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 64 32 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e | mples/plot_otda_d2.py#.-*-.codin |
| 3f20 | 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | g:.utf-8.-*-.""".=============== |
| 3f40 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
| 3f60 | 3d 3d 3d 3d 0a 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 6e | ====.OT.for.domain.adaptation.on |
| 3f80 | 20 65 6d 70 69 72 69 63 61 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | .empirical.distributions.======= |
| 3fa0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
| 3fc0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6e 74 72 6f | ============..This.example.intro |
| 3fe0 | 64 75 63 65 73 20 61 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 69 6e 20 61 20 32 | duces.a.domain.adaptation.in.a.2 |
| 4000 | 44 20 73 65 74 74 69 6e 67 2e 20 49 74 20 65 78 70 6c 69 63 69 74 73 0a 74 68 65 20 70 72 6f 62 | D.setting..It.explicits.the.prob |
| 4020 | 6c 65 6d 20 6f 66 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 61 6e 64 20 69 6e 74 | lem.of.domain.adaptation.and.int |
| 4040 | 72 6f 64 75 63 65 73 20 73 6f 6d 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 61 | roduces.some.optimal.transport.a |
| 4060 | 70 70 72 6f 61 63 68 65 73 20 74 6f 20 73 6f 6c 76 65 20 69 74 2e 0a 0a 51 75 61 6e 74 69 74 69 | pproaches.to.solve.it...Quantiti |
| 4080 | 65 73 20 73 75 63 68 20 61 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 2c 20 67 72 | es.such.as.optimal.couplings,.gr |
| 40a0 | 65 61 74 65 72 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 20 61 6e 64 0a | eater.coupling.coefficients.and. |
| 40c0 | 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 61 72 65 20 72 65 70 72 65 73 65 6e | transported.samples.are.represen |
| 40e0 | 74 65 64 20 69 6e 20 6f 72 64 65 72 20 74 6f 20 67 69 76 65 20 61 20 76 69 73 75 61 6c 20 75 6e | ted.in.order.to.give.a.visual.un |
| 4100 | 64 65 72 73 74 61 6e 64 69 6e 67 0a 6f 66 20 77 68 61 74 20 74 68 65 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 | derstanding.of.what.the.transpor |
| 4120 | 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 20 61 72 65 20 64 6f 69 6e 67 2e 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 68 | t.methods.are.doing.."""..#.Auth |
| 4140 | 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 | ors:.Remi.Flamary.<remi.flamary@ |
| 4160 | 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 | unice.fr>.#..........Stanislas.C |
| 4180 | 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 0a | hambon.<stan.chambon@gmail.com>. |
| 41a0 | 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 | #.#.License:.MIT.License..import |
| 41c0 | 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f | .matplotlib.pylab.as.pl.import.o |
| 41e0 | 74 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | t...############################ |
| 4200 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 4220 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 67 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 | ##################.#.generate.da |
| 4240 | 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 73 6f | ta.#.-------------..n_samples_so |
| 4260 | 75 72 63 65 20 3d 20 31 35 30 0a 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 31 35 | urce.=.150.n_samples_target.=.15 |
| 4280 | 30 0a 0a 58 73 2c 20 79 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 | 0..Xs,.ys.=.ot.datasets.get_data |
| 42a0 | 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 27 2c 20 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 73 6f 75 | _classif('3gauss',.n_samples_sou |
| 42c0 | 72 63 65 29 0a 58 74 2c 20 79 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 | rce).Xt,.yt.=.ot.datasets.get_da |
| 42e0 | 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 32 27 2c 20 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f | ta_classif('3gauss2',.n_samples_ |
| 4300 | 74 61 72 67 65 74 29 0a 0a 23 20 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 | target)..#.Cost.matrix.M.=.ot.di |
| 4320 | 73 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 | st(Xs,.Xt,.metric='sqeuclidean') |
| 4340 | 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ...############################# |
| 4360 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 4380 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 | #################.#.Instantiate. |
| 43a0 | 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 | the.different.transport.algorith |
| 43c0 | 6d 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ms.and.fit.them.#.-------------- |
| 43e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 4400 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 45 4d 44 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f | -------------..#.EMD.Transport.o |
| 4420 | 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 0a 6f 74 5f | t_emd.=.ot.da.EMDTransport().ot_ |
| 4440 | 65 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 | emd.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)..#.Sinkhor |
| 4460 | 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e | n.Transport.ot_sinkhorn.=.ot.da. |
| 4480 | 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 0a 6f 74 | SinkhornTransport(reg_e=1e-1).ot |
| 44a0 | 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 53 | _sinkhorn.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)..#.S |
| 44c0 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 | inkhorn.Transport.with.Group.las |
| 44e0 | 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 6f 74 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 | so.regularization.ot_lpl1.=.ot.d |
| 4500 | 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 | a.SinkhornLpl1Transport(reg_e=1e |
| 4520 | 2d 31 2c 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 31 65 30 29 0a 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 | -1,.reg_cl=1e0).ot_lpl1.fit(Xs=X |
| 4540 | 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 73 6f | s,.ys=ys,.Xt=Xt)..#.transport.so |
| 4560 | 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6f 6e 74 6f 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | urce.samples.onto.target.samples |
| 4580 | 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 | .transp_Xs_emd.=.ot_emd.transfor |
| 45a0 | 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 | m(Xs=Xs).transp_Xs_sinkhorn.=.ot |
| 45c0 | 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 74 72 61 6e 73 | _sinkhorn.transform(Xs=Xs).trans |
| 45e0 | 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 | p_Xs_lpl1.=.ot_lpl1.transform(Xs |
| 4600 | 3d 58 73 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | =Xs)...######################### |
| 4620 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 4640 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 31 20 3a 20 | #####################.#.Fig.1.:. |
| 4660 | 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 | plots.source.and.target.samples. |
| 4680 | 2b 20 6d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 0a 23 20 | +.matrix.of.pairwise.distance.#. |
| 46a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 46c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 46e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c | -----..pl.figure(1,.figsize=(10, |
| 4700 | 20 31 30 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 | .10)).pl.subplot(2,.2,.1).pl.sca |
| 4720 | 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d | tter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.m |
| 4740 | 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | arker='+',.label='Source.samples |
| 4760 | 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 | ').pl.xticks([]).pl.yticks([]).p |
| 4780 | 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 | l.legend(loc=0).pl.title('Source |
| 47a0 | 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 | ..samples')..pl.subplot(2,.2,.2) |
| 47c0 | 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | .pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],. |
| 47e0 | 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 | c=yt,.marker='o',.label='Target. |
| 4800 | 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b | samples').pl.xticks([]).pl.ytick |
| 4820 | 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | s([]).pl.legend(loc=0).pl.title( |
| 4840 | 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | 'Target.samples')..pl.subplot(2, |
| 4860 | 20 32 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f | .2,.3).pl.imshow(M,.interpolatio |
| 4880 | 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 | n='nearest').pl.xticks([]).pl.yt |
| 48a0 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 | icks([]).pl.title('Matrix.of.pai |
| 48c0 | 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 | rwise.distances').pl.tight_layou |
| 48e0 | 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | t()...########################## |
| 4900 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 4920 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 | ####################.#.Fig.2.:.p |
| 4940 | 6c 6f 74 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 | lots.optimal.couplings.for.the.d |
| 4960 | 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ifferent.methods.#.------------- |
| 4980 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 49a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a | ------------.pl.figure(2,.figsiz |
| 49c0 | 65 3d 28 31 30 2c 20 36 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 0a | e=(10,.6))..pl.subplot(2,.3,.1). |
| 49e0 | 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 | pl.imshow(ot_emd.coupling_,.inte |
| 4a00 | 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b | rpolation='nearest').pl.xticks([ |
| 4a20 | 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d | ]).pl.yticks([]).pl.title('Optim |
| 4a40 | 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e | al.coupling\nEMDTransport')..pl. |
| 4a60 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 | subplot(2,.3,.2).pl.imshow(ot_si |
| 4a80 | 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d | nkhorn.coupling_,.interpolation= |
| 4aa0 | 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 | 'nearest').pl.xticks([]).pl.ytic |
| 4ac0 | 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e | ks([]).pl.title('Optimal.couplin |
| 4ae0 | 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | g\nSinkhornTransport')..pl.subpl |
| 4b00 | 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f | ot(2,.3,.3).pl.imshow(ot_lpl1.co |
| 4b20 | 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 | upling_,.interpolation='nearest' |
| 4b40 | 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c | ).pl.xticks([]).pl.yticks([]).pl |
| 4b60 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f | .title('Optimal.coupling\nSinkho |
| 4b80 | 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | rnLpl1Transport')..pl.subplot(2, |
| 4ba0 | 20 33 2c 20 34 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 | .3,.4).ot.plot.plot2D_samples_ma |
| 4bc0 | 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e | t(Xs,.Xt,.ot_emd.coupling_,.c=[. |
| 4be0 | 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 | 5,..5,.1]).pl.scatter(Xs[:,.0],. |
| 4c00 | 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 | Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+',.labe |
| 4c20 | 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 | l='Source.samples').pl.scatter(X |
| 4c40 | 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d | t[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker= |
| 4c60 | 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e | 'o',.label='Target.samples').pl. |
| 4c80 | 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | xticks([]).pl.yticks([]).pl.titl |
| 4ca0 | 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 6e 45 | e('Main.coupling.coefficients\nE |
| 4cc0 | 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 | MDTransport')..pl.subplot(2,.3,. |
| 4ce0 | 35 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 | 5).ot.plot.plot2D_samples_mat(Xs |
| 4d00 | 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b | ,.Xt,.ot_sinkhorn.coupling_,.c=[ |
| 4d20 | 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c | .5,..5,.1]).pl.scatter(Xs[:,.0], |
| 4d40 | 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 | .Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+',.lab |
| 4d60 | 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 | el='Source.samples').pl.scatter( |
| 4d80 | 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 | Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker |
| 4da0 | 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c | ='o',.label='Target.samples').pl |
| 4dc0 | 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 | .xticks([]).pl.yticks([]).pl.tit |
| 4de0 | 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 6e | le('Main.coupling.coefficients\n |
| 4e00 | 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | SinkhornTransport')..pl.subplot( |
| 4e20 | 32 2c 20 33 2c 20 36 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f | 2,.3,.6).ot.plot.plot2D_samples_ |
| 4e40 | 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 | mat(Xs,.Xt,.ot_lpl1.coupling_,.c |
| 4e60 | 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 | =[.5,..5,.1]).pl.scatter(Xs[:,.0 |
| 4e80 | 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c | ],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+',.l |
| 4ea0 | 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 | abel='Source.samples').pl.scatte |
| 4ec0 | 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b | r(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.mark |
| 4ee0 | 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a | er='o',.label='Target.samples'). |
| 4f00 | 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 | pl.xticks([]).pl.yticks([]).pl.t |
| 4f20 | 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 | itle('Main.coupling.coefficients |
| 4f40 | 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 | \nSinkhornLpl1Transport').pl.tig |
| 4f60 | 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ht_layout()...################## |
| 4f80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 4fa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 | ############################.#.F |
| 4fc0 | 69 67 20 33 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a | ig.3.:.plot.transported.samples. |
| 4fe0 | 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | #.------------------------------ |
| 5000 | 2d 2d 0a 0a 23 20 64 69 73 70 6c 61 79 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 | --..#.display.transported.sample |
| 5020 | 73 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 34 29 29 0a | s.pl.figure(4,.figsize=(10,.4)). |
| 5040 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 | pl.subplot(1,.3,.1).pl.scatter(X |
| 5060 | 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d | t[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker= |
| 5080 | 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 | 'o',............label='Target.sa |
| 50a0 | 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 | mples',.alpha=0.5).pl.scatter(tr |
| 50c0 | 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 | ansp_Xs_emd[:,.0],.transp_Xs_emd |
| 50e0 | 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d | [:,.1],.c=ys,............marker= |
| 5100 | 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 | '+',.label='Transp.samples',.s=3 |
| 5120 | 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | 0).pl.title('Transported.samples |
| 5140 | 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 | \nEmdTransport').pl.legend(loc=0 |
| 5160 | 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 0a 70 | ).pl.xticks([]).pl.yticks([])..p |
| 5180 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 | l.subplot(1,.3,.2).pl.scatter(Xt |
| 51a0 | 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 | [:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker=' |
| 51c0 | 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d | o',............label='Target.sam |
| 51e0 | 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 | ples',.alpha=0.5).pl.scatter(tra |
| 5200 | 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 | nsp_Xs_sinkhorn[:,.0],.transp_Xs |
| 5220 | 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | _sinkhorn[:,.1],.c=ys,.......... |
| 5240 | 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 | ..marker='+',.label='Transp.samp |
| 5260 | 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 | les',.s=30).pl.title('Transporte |
| 5280 | 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 70 | d.samples\nSinkhornTransport').p |
| 52a0 | 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 0a 70 6c 2e 73 | l.xticks([]).pl.yticks([])..pl.s |
| 52c0 | 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c | ubplot(1,.3,.3).pl.scatter(Xt[:, |
| 52e0 | 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c | .0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o', |
| 5300 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 | ............label='Target.sample |
| 5320 | 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 | s',.alpha=0.5).pl.scatter(transp |
| 5340 | 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a | _Xs_lpl1[:,.0],.transp_Xs_lpl1[: |
| 5360 | 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b | ,.1],.c=ys,............marker='+ |
| 5380 | 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 | ',.label='Transp.samples',.s=30) |
| 53a0 | 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e | .pl.title('Transported.samples\n |
| 53c0 | 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b | SinkhornLpl1Transport').pl.xtick |
| 53e0 | 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 | s([]).pl.yticks([])..pl.tight_la |
| 5400 | 79 6f 75 74 28 29 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b 0a | yout().pl.show().PK.........o/K. |
| 5420 | ea dc a4 21 12 00 00 21 12 00 00 2a 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f | ...!...!...*...auto_examples/plo |
| 5440 | 74 5f 6f 74 64 61 5f 73 65 6d 69 5f 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 | t_otda_semi_supervised.py#.-*-.c |
| 5460 | 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | oding:.utf-8.-*-.""".=========== |
| 5480 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
| 54a0 | 3d 0a 4f 54 44 41 20 75 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 76 73 20 73 65 6d 69 2d 73 75 70 65 | =.OTDA.unsupervised.vs.semi-supe |
| 54c0 | 72 76 69 73 65 64 20 73 65 74 74 69 6e 67 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | rvised.setting.================= |
| 54e0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 69 | ===========================..Thi |
| 5500 | 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 73 20 61 20 73 65 6d 69 20 73 75 70 65 | s.example.introduces.a.semi.supe |
| 5520 | 72 76 69 73 65 64 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 69 6e 20 61 20 32 44 | rvised.domain.adaptation.in.a.2D |
| 5540 | 20 73 65 74 74 69 6e 67 2e 0a 49 74 20 65 78 70 6c 69 63 69 74 73 20 74 68 65 20 70 72 6f 62 6c | .setting..It.explicits.the.probl |
| 5560 | 65 6d 20 6f 66 20 73 65 6d 69 20 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 | em.of.semi.supervised.domain.ada |
| 5580 | 70 74 61 74 69 6f 6e 20 61 6e 64 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 73 0a 73 6f 6d 65 20 6f 70 74 69 | ptation.and.introduces.some.opti |
| 55a0 | 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 70 70 72 6f 61 63 68 65 73 20 74 6f 20 73 6f 6c 76 | mal.transport.approaches.to.solv |
| 55c0 | 65 20 69 74 2e 0a 0a 51 75 61 6e 74 69 74 69 65 73 20 73 75 63 68 20 61 73 20 6f 70 74 69 6d 61 | e.it...Quantities.such.as.optima |
| 55e0 | 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 2c 20 67 72 65 61 74 65 72 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f | l.couplings,.greater.coupling.co |
| 5600 | 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 20 61 6e 64 0a 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c | efficients.and.transported.sampl |
| 5620 | 65 73 20 61 72 65 20 72 65 70 72 65 73 65 6e 74 65 64 20 69 6e 20 6f 72 64 65 72 20 74 6f 20 67 | es.are.represented.in.order.to.g |
| 5640 | 69 76 65 20 61 20 76 69 73 75 61 6c 20 75 6e 64 65 72 73 74 61 6e 64 69 6e 67 0a 6f 66 20 77 68 | ive.a.visual.understanding.of.wh |
| 5660 | 61 74 20 74 68 65 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 20 61 72 65 20 64 6f 69 | at.the.transport.methods.are.doi |
| 5680 | 6e 67 2e 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 | ng.."""..#.Authors:.Remi.Flamary |
| 56a0 | 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 20 20 20 20 20 20 | .<remi.flamary@unice.fr>.#...... |
| 56c0 | 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d | ....Stanislas.Chambon.<stan.cham |
| 56e0 | 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 | bon@gmail.com>.#.#.License:.MIT. |
| 5700 | 4c 69 63 65 6e 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 | License..import.matplotlib.pylab |
| 5720 | 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .as.pl.import.ot...############# |
| 5740 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 5760 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 5780 | 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | #.#.Generate.data.#.------------ |
| 57a0 | 2d 0a 0a 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 73 6f 75 72 63 65 20 3d 20 31 35 30 0a 6e 5f 73 61 6d 70 | -..n_samples_source.=.150.n_samp |
| 57c0 | 6c 65 73 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 31 35 30 0a 0a 58 73 2c 20 79 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 | les_target.=.150..Xs,.ys.=.ot.da |
| 57e0 | 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 27 | tasets.get_data_classif('3gauss' |
| 5800 | 2c 20 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 73 6f 75 72 63 65 29 0a 58 74 2c 20 79 74 20 3d 20 6f 74 2e | ,.n_samples_source).Xt,.yt.=.ot. |
| 5820 | 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 | datasets.get_data_classif('3gaus |
| 5840 | 73 32 27 2c 20 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 74 61 72 67 65 74 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 | s2',.n_samples_target)...####### |
| 5860 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 5880 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 58a0 | 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c | #######.#.Transport.source.sampl |
| 58c0 | 65 73 20 6f 6e 74 6f 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | es.onto.target.samples.#.------- |
| 58e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 5900 | 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 0a 23 20 75 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 | -----...#.unsupervised.domain.ad |
| 5920 | 61 70 74 61 74 69 6f 6e 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e | aptation.ot_sinkhorn_un.=.ot.da. |
| 5940 | 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 0a 6f 74 | SinkhornTransport(reg_e=1e-1).ot |
| 5960 | 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 74 | _sinkhorn_un.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt).t |
| 5980 | 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f | ransp_Xs_sinkhorn_un.=.ot_sinkho |
| 59a0 | 72 6e 5f 75 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 0a 23 20 73 65 6d 69 2d 73 | rn_un.transform(Xs=Xs)..#.semi-s |
| 59c0 | 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 0a 6f 74 5f 73 | upervised.domain.adaptation.ot_s |
| 59e0 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 | inkhorn_semi.=.ot.da.SinkhornTra |
| 5a00 | 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 | nsport(reg_e=1e-1).ot_sinkhorn_s |
| 5a20 | 65 6d 69 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 79 74 3d | emi.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt,.ys=ys,.yt= |
| 5a40 | 79 74 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 20 3d 20 6f 74 | yt).transp_Xs_sinkhorn_semi.=.ot |
| 5a60 | 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a | _sinkhorn_semi.transform(Xs=Xs). |
| 5a80 | 0a 23 20 73 65 6d 69 20 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 20 75 73 65 73 20 61 76 61 69 6c | .#.semi.supervised.DA.uses.avail |
| 5aa0 | 61 62 6c 65 20 6c 61 62 61 6c 65 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 74 6f 20 6d | able.labaled.target.samples.to.m |
| 5ac0 | 6f 64 69 66 79 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 0a 23 20 6d 61 74 72 69 78 20 69 6e 76 6f 6c 76 65 64 | odify.the.cost.#.matrix.involved |
| 5ae0 | 20 69 6e 20 74 68 65 20 4f 54 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 2e 20 54 68 65 20 63 6f 73 74 20 6f 66 20 | .in.the.OT.problem..The.cost.of. |
| 5b00 | 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 69 6e 67 20 61 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 0a 23 20 6f | transporting.a.source.sample.#.o |
| 5b20 | 66 20 63 6c 61 73 73 20 41 20 6f 6e 74 6f 20 61 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 20 6f | f.class.A.onto.a.target.sample.o |
| 5b40 | 66 20 63 6c 61 73 73 20 42 20 21 3d 20 41 20 69 73 20 73 65 74 20 74 6f 20 69 6e 66 69 6e 69 74 | f.class.B.!=.A.is.set.to.infinit |
| 5b60 | 65 2c 20 6f 72 20 61 0a 23 20 76 65 72 79 20 6c 61 72 67 65 20 76 61 6c 75 65 0a 0a 23 20 6e 6f | e,.or.a.#.very.large.value..#.no |
| 5b80 | 74 65 20 74 68 61 74 20 69 6e 20 74 68 65 20 70 72 65 73 65 6e 74 20 63 61 73 65 20 77 65 20 63 | te.that.in.the.present.case.we.c |
| 5ba0 | 6f 6e 73 69 64 65 72 20 74 68 61 74 20 61 6c 6c 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 | onsider.that.all.the.target.samp |
| 5bc0 | 6c 65 73 20 61 72 65 0a 23 20 6c 61 62 65 6c 65 64 2e 20 46 6f 72 20 64 61 69 6c 79 20 61 70 70 | les.are.#.labeled..For.daily.app |
| 5be0 | 6c 69 63 61 74 69 6f 6e 73 2c 20 73 6f 6d 65 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 20 6d 69 | lications,.some.target.sample.mi |
| 5c00 | 67 68 74 20 6e 6f 74 20 68 61 76 65 20 6c 61 62 65 6c 73 2c 0a 23 20 69 6e 20 74 68 69 73 20 63 | ght.not.have.labels,.#.in.this.c |
| 5c20 | 61 73 65 20 74 68 65 20 65 6c 65 6d 65 6e 74 20 6f 66 20 79 74 20 63 6f 72 72 65 73 70 6f 6e 64 | ase.the.element.of.yt.correspond |
| 5c40 | 69 6e 67 20 74 6f 20 74 68 65 73 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 73 68 6f 75 6c 64 20 62 65 0a 23 | ing.to.these.samples.should.be.# |
| 5c60 | 20 66 69 6c 6c 65 64 20 77 69 74 68 20 2d 31 2e 0a 0a 23 20 57 61 72 6e 69 6e 67 3a 20 77 65 20 | .filled.with.-1...#.Warning:.we. |
| 5c80 | 72 65 63 61 6c 6c 20 74 68 61 74 20 2d 31 20 63 61 6e 6e 6f 74 20 62 65 20 75 73 65 64 20 61 73 | recall.that.-1.cannot.be.used.as |
| 5ca0 | 20 61 20 63 6c 61 73 73 20 6c 61 62 65 6c 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .a.class.label...############### |
| 5cc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 5ce0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a | ###############################. |
| 5d00 | 23 20 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 | #.Fig.1.:.plots.source.and.targe |
| 5d20 | 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 2b 20 6d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 | t.samples.+.matrix.of.pairwise.d |
| 5d40 | 69 73 74 61 6e 63 65 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | istance.#.---------------------- |
| 5d60 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 5d80 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 | ---------------..pl.figure(1,.fi |
| 5da0 | 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 31 30 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c | gsize=(10,.10)).pl.subplot(2,.2, |
| 5dc0 | 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 | .1).pl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1 |
| 5de0 | 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 | ],.c=ys,.marker='+',.label='Sour |
| 5e00 | 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 | ce.samples').pl.xticks([]).pl.yt |
| 5e20 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 | icks([]).pl.legend(loc=0).pl.tit |
| 5e40 | 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | le('Source..samples')..pl.subplo |
| 5e60 | 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 | t(2,.2,.2).pl.scatter(Xt[:,.0],. |
| 5e80 | 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 | Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',.labe |
| 5ea0 | 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | l='Target.samples').pl.xticks([] |
| 5ec0 | 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 | ).pl.yticks([]).pl.legend(loc=0) |
| 5ee0 | 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e | .pl.title('Target.samples')..pl. |
| 5f00 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 | subplot(2,.2,.3).pl.imshow(ot_si |
| 5f20 | 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 2e 63 6f 73 74 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 | nkhorn_un.cost_,.interpolation=' |
| 5f40 | 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b | nearest').pl.xticks([]).pl.ytick |
| 5f60 | 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 75 6e | s([]).pl.title('Cost.matrix.-.un |
| 5f80 | 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 | supervised.DA')..pl.subplot(2,.2 |
| 5fa0 | 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e | ,.4).pl.imshow(ot_sinkhorn_semi. |
| 5fc0 | 63 6f 73 74 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a | cost_,.interpolation='nearest'). |
| 5fe0 | 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 | pl.xticks([]).pl.yticks([]).pl.t |
| 6000 | 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 73 65 6d 69 73 75 70 65 72 76 69 73 | itle('Cost.matrix.-.semisupervis |
| 6020 | 65 64 20 44 41 27 29 0a 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 23 20 74 68 | ed.DA')..pl.tight_layout()..#.th |
| 6040 | 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 69 6e 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 2d 73 | e.optimal.coupling.in.the.semi-s |
| 6060 | 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 20 63 61 73 65 20 77 69 6c 6c 20 65 78 68 69 62 69 74 20 22 | upervised.DA.case.will.exhibit." |
| 6080 | 20 73 68 61 70 65 0a 23 20 73 69 6d 69 6c 61 72 22 20 74 6f 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 6d 61 | .shape.#.similar".to.the.cost.ma |
| 60a0 | 74 72 69 78 2c 20 28 62 6c 6f 63 6b 20 64 69 61 67 6f 6e 61 6c 20 6d 61 74 72 69 78 29 0a 0a 0a | trix,.(block.diagonal.matrix)... |
| 60c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 60e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 6100 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 6f | ##############.#.Fig.2.:.plots.o |
| 6120 | 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 | ptimal.couplings.for.the.differe |
| 6140 | 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | nt.methods.#.------------------- |
| 6160 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 6180 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 38 2c | ------..pl.figure(2,.figsize=(8, |
| 61a0 | 20 34 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 | .4))..pl.subplot(1,.2,.1).pl.ims |
| 61c0 | 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e | how(ot_sinkhorn_un.coupling_,.in |
| 61e0 | 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 | terpolation='nearest').pl.xticks |
| 6200 | 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 | ([]).pl.yticks([]).pl.title('Opt |
| 6220 | 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 55 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 | imal.coupling\nUnsupervised.DA') |
| 6240 | 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 | ..pl.subplot(1,.2,.2).pl.imshow( |
| 6260 | 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 | ot_sinkhorn_semi.coupling_,.inte |
| 6280 | 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b | rpolation='nearest').pl.xticks([ |
| 62a0 | 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d | ]).pl.yticks([]).pl.title('Optim |
| 62c0 | 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 65 6d 69 2d 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 | al.coupling\nSemi-supervised.DA' |
| 62e0 | 29 0a 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | )..pl.tight_layout()...######### |
| 6300 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 6320 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 6340 | 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 33 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 | #####.#.Fig.3.:.plot.transported |
| 6360 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .samples.#.--------------------- |
| 6380 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 64 69 73 70 6c 61 79 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 | -----------..#.display.transport |
| 63a0 | 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d | ed.samples.pl.figure(4,.figsize= |
| 63c0 | 28 38 2c 20 34 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 | (8,.4)).pl.subplot(1,.2,.1).pl.s |
| 63e0 | 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c | catter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt, |
| 6400 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 | .marker='o',............label='T |
| 6420 | 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 0a 70 6c 2e 73 63 | arget.samples',.alpha=0.5).pl.sc |
| 6440 | 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 5b 3a 2c 20 30 | atter(transp_Xs_sinkhorn_un[:,.0 |
| 6460 | 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | ],.transp_Xs_sinkhorn_un[:,.1],. |
| 6480 | 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 | c=ys,............marker='+',.lab |
| 64a0 | 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 | el='Transp.samples',.s=30).pl.ti |
| 64c0 | 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 | tle('Transported.samples\nEmdTra |
| 64e0 | 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 | nsport').pl.legend(loc=0).pl.xti |
| 6500 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | cks([]).pl.yticks([])..pl.subplo |
| 6520 | 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 | t(1,.2,.2).pl.scatter(Xt[:,.0],. |
| 6540 | 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 | Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',..... |
| 6560 | 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 | .......label='Target.samples',.a |
| 6580 | 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 | lpha=0.5).pl.scatter(transp_Xs_s |
| 65a0 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 | inkhorn_semi[:,.0],.transp_Xs_si |
| 65c0 | 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 | nkhorn_semi[:,.1],.c=ys,........ |
| 65e0 | 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 | ....marker='+',.label='Transp.sa |
| 6600 | 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 | mples',.s=30).pl.title('Transpor |
| 6620 | 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 | ted.samples\nSinkhornTransport') |
| 6640 | 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 0a 70 6c | .pl.xticks([]).pl.yticks([])..pl |
| 6660 | 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 | .tight_layout().pl.show().PK.... |
| 6680 | 00 00 00 00 09 6f 2f 4b ad 47 e9 fa 92 06 00 00 92 06 00 00 1b 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 | .....o/K.G..............auto_exa |
| 66a0 | 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a | mples/plot_OT_1D.py#.-*-.coding: |
| 66c0 | 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | .utf-8.-*-.""".================= |
| 66e0 | 3d 3d 3d 0a 31 44 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ===.1D.optimal.transport.======= |
| 6700 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6c 6c 75 | =============..This.example.illu |
| 6720 | 73 74 72 61 74 65 73 20 74 68 65 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 45 4d 44 20 61 | strates.the.computation.of.EMD.a |
| 6740 | 6e 64 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 70 6c 61 6e 73 0a 61 6e 64 20 | nd.Sinkhorn.transport.plans.and. |
| 6760 | 74 68 65 69 72 20 76 69 73 75 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 2e 0a 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 | their.visualization..."""..#.Aut |
| 6780 | 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 | hor:.Remi.Flamary.<remi.flamary@ |
| 67a0 | 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e | unice.fr>.#.#.License:.MIT.Licen |
| 67c0 | 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 | se..import.numpy.as.np.import.ma |
| 67e0 | 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0a 66 | tplotlib.pylab.as.pl.import.ot.f |
| 6800 | 72 6f 6d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 20 69 6d 70 6f 72 74 20 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 | rom.ot.datasets.import.get_1D_ga |
| 6820 | 75 73 73 20 61 73 20 67 61 75 73 73 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | uss.as.gauss..################## |
| 6840 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 6860 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 47 | ############################.#.G |
| 6880 | 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 0a 23 | enerate.data.#.-------------...# |
| 68a0 | 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 0a 0a 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e | %%.parameters..n.=.100..#.nb.bin |
| 68c0 | 73 0a 0a 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 0a 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 | s..#.bin.positions.x.=.np.arange |
| 68e0 | 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 0a 0a 23 20 47 61 75 73 73 69 61 | (n,.dtype=np.float64)..#.Gaussia |
| 6900 | 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 61 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 | n.distributions.a.=.gauss(n,.m=2 |
| 6920 | 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 0a 62 20 3d 20 67 | 0,.s=5)..#.m=.mean,.s=.std.b.=.g |
| 6940 | 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 36 30 2c 20 73 3d 31 30 29 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 | auss(n,.m=60,.s=10)..#.loss.matr |
| 6960 | 69 78 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 | ix.M.=.ot.dist(x.reshape((n,.1)) |
| 6980 | 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 29 0a 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 | ,.x.reshape((n,.1))).M./=.M.max( |
| 69a0 | 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | )...############################ |
| 69c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 69e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 64 69 73 74 72 69 | ##################.#.Plot.distri |
| 6a00 | 62 75 74 69 6f 6e 73 20 61 6e 64 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d | butions.and.loss.matrix.#.------ |
| 6a20 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 | ----------------------------..#% |
| 6a40 | 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 | %.plot.the.distributions..pl.fig |
| 6a60 | 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 | ure(1,.figsize=(6.4,.3)).pl.plot |
| 6a80 | 28 78 2c 20 61 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 73 74 72 69 | (x,.a,.'b',.label='Source.distri |
| 6aa0 | 62 75 74 69 6f 6e 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 | bution').pl.plot(x,.b,.'r',.labe |
| 6ac0 | 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 | l='Target.distribution').pl.lege |
| 6ae0 | 6e 64 28 29 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 61 6e 64 | nd()..#%%.plot.distributions.and |
| 6b00 | 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 | .loss.matrix..pl.figure(2,.figsi |
| 6b20 | 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c | ze=(5,.5)).ot.plot.plot1D_mat(a, |
| 6b40 | 20 62 2c 20 4d 2c 20 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 4d 27 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 | .b,.M,.'Cost.matrix.M')..####### |
| 6b60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 6b80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 6ba0 | 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a | #######.#.Solve.EMD.#.---------. |
| 6bc0 | 0a 0a 23 25 25 20 45 4d 44 0a 0a 47 30 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 29 0a | ..#%%.EMD..G0.=.ot.emd(a,.b,.M). |
| 6be0 | 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 | .pl.figure(3,.figsize=(5,.5)).ot |
| 6c00 | 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 30 2c 20 27 4f 54 20 6d | .plot.plot1D_mat(a,.b,.G0,.'OT.m |
| 6c20 | 61 74 72 69 78 20 47 30 27 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | atrix.G0')..#################### |
| 6c40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 6c60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c | ##########################.#.Sol |
| 6c80 | 76 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 0a 23 | ve.Sinkhorn.#.--------------...# |
| 6ca0 | 25 25 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 0a 0a 6c 61 6d 62 64 20 3d 20 31 65 2d 33 0a 47 73 20 3d 20 6f | %%.Sinkhorn..lambd.=.1e-3.Gs.=.o |
| 6cc0 | 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 6c 61 6d 62 64 2c 20 76 65 72 62 6f | t.sinkhorn(a,.b,.M,.lambd,.verbo |
| 6ce0 | 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 | se=True)..pl.figure(4,.figsize=( |
| 6d00 | 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 | 5,.5)).ot.plot.plot1D_mat(a,.b,. |
| 6d20 | 47 73 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 | Gs,.'OT.matrix.Sinkhorn')..pl.sh |
| 6d40 | 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b 0c f2 34 0e 5a 0e 00 00 5a 0e 00 00 23 | ow().PK.........o/K..4.Z...Z...# |
| 6d60 | 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 | ...auto_examples/plot_barycenter |
| 6d80 | 5f 31 44 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 | _1D.py#.-*-.coding:.utf-8.-*-."" |
| 6da0 | 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ".============================== |
| 6dc0 | 0a 31 44 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 64 65 6d 6f 0a | .1D.Wasserstein.barycenter.demo. |
| 6de0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a | ==============================.. |
| 6e00 | 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6c 6c 75 73 74 72 61 74 65 73 20 74 68 65 20 63 6f 6d | This.example.illustrates.the.com |
| 6e20 | 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 57 61 73 73 65 72 73 79 | putation.of.regularized.Wassersy |
| 6e40 | 65 69 6e 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 0a 61 73 20 70 72 6f 70 6f 73 65 64 20 69 6e 20 5b 33 | ein.Barycenter.as.proposed.in.[3 |
| 6e60 | 5d 2e 0a 0a 0a 5b 33 5d 20 42 65 6e 61 6d 6f 75 2c 20 4a 2e 20 44 2e 2c 20 43 61 72 6c 69 65 72 | ]....[3].Benamou,.J..D.,.Carlier |
| 6e80 | 2c 20 47 2e 2c 20 43 75 74 75 72 69 2c 20 4d 2e 2c 20 4e 65 6e 6e 61 2c 20 4c 2e 2c 20 26 20 50 | ,.G.,.Cuturi,.M.,.Nenna,.L.,.&.P |
| 6ea0 | 65 79 72 c3 a9 2c 20 47 2e 20 28 32 30 31 35 29 2e 0a 49 74 65 72 61 74 69 76 65 20 42 72 65 67 | eyr..,.G..(2015)..Iterative.Breg |
| 6ec0 | 6d 61 6e 20 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 73 20 66 6f 72 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 | man.projections.for.regularized. |
| 6ee0 | 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 61 74 69 6f 6e 20 70 72 6f 62 6c 65 6d 73 0a 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 | transportation.problems.SIAM.Jou |
| 6f00 | 72 6e 61 6c 20 6f 6e 20 53 63 69 65 6e 74 69 66 69 63 20 43 6f 6d 70 75 74 69 6e 67 2c 20 33 37 | rnal.on.Scientific.Computing,.37 |
| 6f20 | 28 32 29 2c 20 41 31 31 31 31 2d 41 31 31 33 38 2e 0a 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 | (2),.A1111-A1138..."""..#.Author |
| 6f40 | 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 | :.Remi.Flamary.<remi.flamary@uni |
| 6f60 | 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 0a | ce.fr>.#.#.License:.MIT.License. |
| 6f80 | 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c | .import.numpy.as.np.import.matpl |
| 6fa0 | 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0a 23 20 6e 65 | otlib.pylab.as.pl.import.ot.#.ne |
| 6fc0 | 63 65 73 73 61 72 79 20 66 6f 72 20 33 64 20 70 6c 6f 74 20 65 76 65 6e 20 69 66 20 6e 6f 74 20 | cessary.for.3d.plot.even.if.not. |
| 6fe0 | 75 73 65 64 0a 66 72 6f 6d 20 6d 70 6c 5f 74 6f 6f 6c 6b 69 74 73 2e 6d 70 6c 6f 74 33 64 20 69 | used.from.mpl_toolkits.mplot3d.i |
| 7000 | 6d 70 6f 72 74 20 41 78 65 73 33 44 20 20 23 20 6e 6f 71 61 0a 66 72 6f 6d 20 6d 61 74 70 6c 6f | mport.Axes3D..#.noqa.from.matplo |
| 7020 | 74 6c 69 62 2e 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 73 20 69 6d 70 6f 72 74 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c | tlib.collections.import.PolyColl |
| 7040 | 65 63 74 69 6f 6e 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ection..######################## |
| 7060 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 7080 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 | ######################.#.Generat |
| 70a0 | 65 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 70 61 72 61 | e.data.#.-------------..#%%.para |
| 70c0 | 6d 65 74 65 72 73 0a 0a 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e 73 0a 0a 23 20 62 69 | meters..n.=.100..#.nb.bins..#.bi |
| 70e0 | 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 0a 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 | n.positions.x.=.np.arange(n,.dty |
| 7100 | 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 0a 0a 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 | pe=np.float64)..#.Gaussian.distr |
| 7120 | 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 61 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 | ibutions.a1.=.ot.datasets.get_1D |
| 7140 | 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c | _gauss(n,.m=20,.s=5)..#.m=.mean, |
| 7160 | 20 73 3d 20 73 74 64 0a 61 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f | .s=.std.a2.=.ot.datasets.get_1D_ |
| 7180 | 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 36 30 2c 20 73 3d 38 29 0a 0a 23 20 63 72 65 61 74 69 6e 67 20 | gauss(n,.m=60,.s=8)..#.creating. |
| 71a0 | 6d 61 74 72 69 78 20 41 20 63 6f 6e 74 61 69 6e 69 6e 67 20 61 6c 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 | matrix.A.containing.all.distribu |
| 71c0 | 74 69 6f 6e 73 0a 41 20 3d 20 6e 70 2e 76 73 74 61 63 6b 28 28 61 31 2c 20 61 32 29 29 2e 54 0a | tions.A.=.np.vstack((a1,.a2)).T. |
| 71e0 | 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 3d 20 41 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 0a 0a 23 20 | n_distributions.=.A.shape[1]..#. |
| 7200 | 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 20 2b 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 4d 20 3d 20 | loss.matrix.+.normalization.M.=. |
| 7220 | 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 64 69 73 74 30 28 6e 29 0a 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a | ot.utils.dist0(n).M./=.M.max().. |
| 7240 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 7260 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 7280 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d | ##############.#.Plot.data.#.--- |
| 72a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f | ------..#%%.plot.the.distributio |
| 72c0 | 6e 73 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 | ns..pl.figure(1,.figsize=(6.4,.3 |
| 72e0 | 29 29 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e | )).for.i.in.range(n_distribution |
| 7300 | 73 29 3a 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 0a 70 6c 2e 74 | s):.....pl.plot(x,.A[:,.i]).pl.t |
| 7320 | 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c | itle('Distributions').pl.tight_l |
| 7340 | 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ayout()..####################### |
| 7360 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 7380 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 42 61 72 79 63 65 | #######################.#.Baryce |
| 73a0 | 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | nter.computation.#.------------- |
| 73c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 | ---------..#%%.barycenter.comput |
| 73e0 | 61 74 69 6f 6e 0a 0a 61 6c 70 68 61 20 3d 20 30 2e 32 20 20 23 20 30 3c 3d 61 6c 70 68 61 3c 3d | ation..alpha.=.0.2..#.0<=alpha<= |
| 7400 | 31 0a 77 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 2c | 1.weights.=.np.array([1.-.alpha, |
| 7420 | 20 61 6c 70 68 61 5d 29 0a 0a 23 20 6c 32 62 61 72 79 0a 62 61 72 79 5f 6c 32 20 3d 20 41 2e 64 | .alpha])..#.l2bary.bary_l2.=.A.d |
| 7440 | 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 0a 0a 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 0a 72 65 67 20 3d | ot(weights)..#.wasserstein.reg.= |
| 7460 | 20 31 65 2d 33 0a 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 | .1e-3.bary_wass.=.ot.bregman.bar |
| 7480 | 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 0a 0a 70 6c 2e | ycenter(A,.M,.reg,.weights)..pl. |
| 74a0 | 66 69 67 75 72 65 28 32 29 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | figure(2).pl.clf().pl.subplot(2, |
| 74c0 | 20 31 2c 20 31 29 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 | .1,.1).for.i.in.range(n_distribu |
| 74e0 | 74 69 6f 6e 73 29 3a 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 0a | tions):.....pl.plot(x,.A[:,.i]). |
| 7500 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 | pl.title('Distributions')..pl.su |
| 7520 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 6c | bplot(2,.1,.2).pl.plot(x,.bary_l |
| 7540 | 32 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 | 2,.'r',.label='l2').pl.plot(x,.b |
| 7560 | 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 | ary_wass,.'g',.label='Wasserstei |
| 7580 | 6e 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 | n').pl.legend().pl.title('Baryce |
| 75a0 | 6e 74 65 72 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 | nters').pl.tight_layout()..##### |
| 75c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 75e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 7600 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c | #########.#.Barycentric.interpol |
| 7620 | 61 74 69 6f 6e 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ation.#.------------------------ |
| 7640 | 2d 0a 0a 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 0a | -..#%%.barycenter.interpolation. |
| 7660 | 0a 6e 5f 61 6c 70 68 61 20 3d 20 31 31 0a 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 20 3d 20 6e 70 2e 6c 69 | .n_alpha.=.11.alpha_list.=.np.li |
| 7680 | 6e 73 70 61 63 65 28 30 2c 20 31 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 0a 0a 0a 42 5f 6c 32 20 3d 20 6e | nspace(0,.1,.n_alpha)...B_l2.=.n |
| 76a0 | 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 29 0a 0a 42 5f 77 61 73 73 20 3d 20 | p.zeros((n,.n_alpha))..B_wass.=. |
| 76c0 | 6e 70 2e 63 6f 70 79 28 42 5f 6c 32 29 0a 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 30 2c | np.copy(B_l2)..for.i.in.range(0, |
| 76e0 | 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 3a 0a 20 20 20 20 61 6c 70 68 61 20 3d 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 | .n_alpha):.....alpha.=.alpha_lis |
| 7700 | 74 5b 69 5d 0a 20 20 20 20 77 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d | t[i].....weights.=.np.array([1.- |
| 7720 | 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 0a 20 20 20 20 42 5f 6c 32 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d | .alpha,.alpha]).....B_l2[:,.i].= |
| 7740 | 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 0a 20 20 20 20 42 5f 77 61 73 73 5b 3a 2c 20 69 5d | .A.dot(weights).....B_wass[:,.i] |
| 7760 | 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 | .=.ot.bregman.barycenter(A,.M,.r |
| 7780 | 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 29 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 | eg,.weights)..#%%.plot.interpola |
| 77a0 | 74 69 6f 6e 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 0a 0a 63 6d 61 70 20 3d 20 70 6c 2e 63 6d | tion..pl.figure(3)..cmap.=.pl.cm |
| 77c0 | 2e 67 65 74 5f 63 6d 61 70 28 27 76 69 72 69 64 69 73 27 29 0a 76 65 72 74 73 20 3d 20 5b 5d 0a | .get_cmap('viridis').verts.=.[]. |
| 77e0 | 7a 73 20 3d 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 0a 66 6f 72 20 69 2c 20 7a 20 69 6e 20 65 6e 75 6d | zs.=.alpha_list.for.i,.z.in.enum |
| 7800 | 65 72 61 74 65 28 7a 73 29 3a 0a 20 20 20 20 79 73 20 3d 20 42 5f 6c 32 5b 3a 2c 20 69 5d 0a 20 | erate(zs):.....ys.=.B_l2[:,.i].. |
| 7820 | 20 20 20 76 65 72 74 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 6c 69 73 74 28 7a 69 70 28 78 2c 20 79 73 29 29 | ...verts.append(list(zip(x,.ys)) |
| 7840 | 29 0a 0a 61 78 20 3d 20 70 6c 2e 67 63 66 28 29 2e 67 63 61 28 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 3d | )..ax.=.pl.gcf().gca(projection= |
| 7860 | 27 33 64 27 29 0a 0a 70 6f 6c 79 20 3d 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 28 76 65 72 | '3d')..poly.=.PolyCollection(ver |
| 7880 | 74 73 2c 20 66 61 63 65 63 6f 6c 6f 72 73 3d 5b 63 6d 61 70 28 61 29 20 66 6f 72 20 61 20 69 6e | ts,.facecolors=[cmap(a).for.a.in |
| 78a0 | 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5d 29 0a 70 6f 6c 79 2e 73 65 74 5f 61 6c 70 68 61 28 30 2e 37 | .alpha_list]).poly.set_alpha(0.7 |
| 78c0 | 29 0a 61 78 2e 61 64 64 5f 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 33 64 28 70 6f 6c 79 2c 20 7a 73 3d 7a | ).ax.add_collection3d(poly,.zs=z |
| 78e0 | 73 2c 20 7a 64 69 72 3d 27 79 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 61 62 65 6c 28 27 78 27 29 0a | s,.zdir='y').ax.set_xlabel('x'). |
| 7900 | 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 6e 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 61 62 65 | ax.set_xlim3d(0,.n).ax.set_ylabe |
| 7920 | 6c 28 27 24 5c 5c 61 6c 70 68 61 24 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 | l('$\\alpha$').ax.set_ylim3d(0,. |
| 7940 | 31 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 61 62 65 6c 28 27 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 69 6d | 1).ax.set_zlabel('').ax.set_zlim |
| 7960 | 33 64 28 30 2c 20 42 5f 6c 32 2e 6d 61 78 28 29 20 2a 20 31 2e 30 31 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | 3d(0,.B_l2.max().*.1.01).pl.titl |
| 7980 | 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 | e('Barycenter.interpolation.with |
| 79a0 | 20 6c 32 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 | .l2').pl.tight_layout()..pl.figu |
| 79c0 | 72 65 28 34 29 0a 63 6d 61 70 20 3d 20 70 6c 2e 63 6d 2e 67 65 74 5f 63 6d 61 70 28 27 76 69 72 | re(4).cmap.=.pl.cm.get_cmap('vir |
| 79e0 | 69 64 69 73 27 29 0a 76 65 72 74 73 20 3d 20 5b 5d 0a 7a 73 20 3d 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 | idis').verts.=.[].zs.=.alpha_lis |
| 7a00 | 74 0a 66 6f 72 20 69 2c 20 7a 20 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 7a 73 29 3a 0a 20 20 20 | t.for.i,.z.in.enumerate(zs):.... |
| 7a20 | 20 79 73 20 3d 20 42 5f 77 61 73 73 5b 3a 2c 20 69 5d 0a 20 20 20 20 76 65 72 74 73 2e 61 70 70 | .ys.=.B_wass[:,.i].....verts.app |
| 7a40 | 65 6e 64 28 6c 69 73 74 28 7a 69 70 28 78 2c 20 79 73 29 29 29 0a 0a 61 78 20 3d 20 70 6c 2e 67 | end(list(zip(x,.ys)))..ax.=.pl.g |
| 7a60 | 63 66 28 29 2e 67 63 61 28 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 3d 27 33 64 27 29 0a 0a 70 6f 6c 79 20 | cf().gca(projection='3d')..poly. |
| 7a80 | 3d 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 28 76 65 72 74 73 2c 20 66 61 63 65 63 6f 6c 6f | =.PolyCollection(verts,.facecolo |
| 7aa0 | 72 73 3d 5b 63 6d 61 70 28 61 29 20 66 6f 72 20 61 20 69 6e 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5d | rs=[cmap(a).for.a.in.alpha_list] |
| 7ac0 | 29 0a 70 6f 6c 79 2e 73 65 74 5f 61 6c 70 68 61 28 30 2e 37 29 0a 61 78 2e 61 64 64 5f 63 6f 6c | ).poly.set_alpha(0.7).ax.add_col |
| 7ae0 | 6c 65 63 74 69 6f 6e 33 64 28 70 6f 6c 79 2c 20 7a 73 3d 7a 73 2c 20 7a 64 69 72 3d 27 79 27 29 | lection3d(poly,.zs=zs,.zdir='y') |
| 7b00 | 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 61 62 65 6c 28 27 78 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 69 6d 33 | .ax.set_xlabel('x').ax.set_xlim3 |
| 7b20 | 64 28 30 2c 20 6e 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 61 62 65 6c 28 27 24 5c 5c 61 6c 70 68 61 24 | d(0,.n).ax.set_ylabel('$\\alpha$ |
| 7b40 | 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 31 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c | ').ax.set_ylim3d(0,.1).ax.set_zl |
| 7b60 | 61 62 65 6c 28 27 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 42 5f 6c 32 2e 6d | abel('').ax.set_zlim3d(0,.B_l2.m |
| 7b80 | 61 78 28 29 20 2a 20 31 2e 30 31 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 | ax().*.1.01).pl.title('Barycente |
| 7ba0 | 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e | r.interpolation.with.Wasserstein |
| 7bc0 | 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a | ').pl.tight_layout()..pl.show(). |
| 7be0 | 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b 60 f3 2a fb 00 11 00 00 00 11 00 00 22 00 00 00 61 75 | PK.........o/K`.*........."...au |
| 7c00 | 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6c 61 73 73 65 73 2e 70 79 | to_examples/plot_otda_classes.py |
| 7c20 | 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d | #.-*-.coding:.utf-8.-*-.""".==== |
| 7c40 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 | ====================.OT.for.doma |
| 7c60 | 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | in.adaptation.================== |
| 7c80 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 73 20 | ======..This.example.introduces. |
| 7ca0 | 61 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 69 6e 20 61 20 32 44 20 73 65 74 74 | a.domain.adaptation.in.a.2D.sett |
| 7cc0 | 69 6e 67 20 61 6e 64 20 74 68 65 20 34 20 4f 54 44 41 0a 61 70 70 72 6f 61 63 68 65 73 20 63 75 | ing.and.the.4.OTDA.approaches.cu |
| 7ce0 | 72 72 65 6e 74 6c 79 20 73 75 70 70 6f 72 74 65 64 20 69 6e 20 50 4f 54 2e 0a 0a 22 22 22 0a 0a | rrently.supported.in.POT...""".. |
| 7d00 | 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c | #.Authors:.Remi.Flamary.<remi.fl |
| 7d20 | 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 | amary@unice.fr>.#..........Stani |
| 7d40 | 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c | slas.Chambon.<stan.chambon@gmail |
| 7d60 | 2e 63 6f 6d 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 0a 0a | .com>.#.#.License:.MIT.License.. |
| 7d80 | 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d | import.matplotlib.pylab.as.pl.im |
| 7da0 | 70 6f 72 74 20 6f 74 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | port.ot...###################### |
| 7dc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 7de0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 | ########################.#.Gener |
| 7e00 | 61 74 65 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 6e 5f 73 6f 75 72 | ate.data.#.-------------..n_sour |
| 7e20 | 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 31 35 30 0a 6e 5f 74 61 72 67 65 74 5f 73 61 6d 70 6c 65 | ce_samples.=.150.n_target_sample |
| 7e40 | 73 20 3d 20 31 35 30 0a 0a 58 73 2c 20 79 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 | s.=.150..Xs,.ys.=.ot.datasets.ge |
| 7e60 | 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 27 2c 20 6e 5f 73 6f 75 72 63 | t_data_classif('3gauss',.n_sourc |
| 7e80 | 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 29 0a 58 74 2c 20 79 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e | e_samples).Xt,.yt.=.ot.datasets. |
| 7ea0 | 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 32 27 2c 20 6e 5f 74 61 | get_data_classif('3gauss2',.n_ta |
| 7ec0 | 72 67 65 74 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | rget_samples)...################ |
| 7ee0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 7f00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 | ##############################.# |
| 7f20 | 20 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 | .Instantiate.the.different.trans |
| 7f40 | 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 0a 23 20 2d | port.algorithms.and.fit.them.#.- |
| 7f60 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 7f80 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 45 4d | --------------------------..#.EM |
| 7fa0 | 44 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 | D.Transport.ot_emd.=.ot.da.EMDTr |
| 7fc0 | 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 0a 6f 74 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 | ansport().ot_emd.fit(Xs=Xs,.Xt=X |
| 7fe0 | 74 29 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b | t)..#.Sinkhorn.Transport.ot_sink |
| 8000 | 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 | horn.=.ot.da.SinkhornTransport(r |
| 8020 | 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 | eg_e=1e-1).ot_sinkhorn.fit(Xs=Xs |
| 8040 | 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 | ,.Xt=Xt)..#.Sinkhorn.Transport.w |
| 8060 | 69 74 68 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 6f | ith.Group.lasso.regularization.o |
| 8080 | 74 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 | t_lpl1.=.ot.da.SinkhornLpl1Trans |
| 80a0 | 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 2c 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 31 65 30 29 0a 6f 74 5f | port(reg_e=1e-1,.reg_cl=1e0).ot_ |
| 80c0 | 6c 70 6c 31 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 | lpl1.fit(Xs=Xs,.ys=ys,.Xt=Xt)..# |
| 80e0 | 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 47 72 6f 75 70 20 6c | .Sinkhorn.Transport.with.Group.l |
| 8100 | 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 6c 31 6c 32 0a 6f 74 5f 6c 31 6c 32 | asso.regularization.l1l2.ot_l1l2 |
| 8120 | 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 | .=.ot.da.SinkhornL1l2Transport(r |
| 8140 | 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 2c 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 32 65 30 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d | eg_e=1e-1,.reg_cl=2e0,.max_iter= |
| 8160 | 32 30 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | 20,............................. |
| 8180 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e | ..........verbose=True).ot_l1l2. |
| 81a0 | 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 74 72 61 6e | fit(Xs=Xs,.ys=ys,.Xt=Xt)..#.tran |
| 81c0 | 73 70 6f 72 74 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6f 6e 74 6f 20 74 61 72 67 65 74 | sport.source.samples.onto.target |
| 81e0 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e | .samples.transp_Xs_emd.=.ot_emd. |
| 8200 | 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 | transform(Xs=Xs).transp_Xs_sinkh |
| 8220 | 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 | orn.=.ot_sinkhorn.transform(Xs=X |
| 8240 | 73 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 6e | s).transp_Xs_lpl1.=.ot_lpl1.tran |
| 8260 | 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 31 6c 32 20 3d 20 6f 74 | sform(Xs=Xs).transp_Xs_l1l2.=.ot |
| 8280 | 5f 6c 31 6c 32 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 | _l1l2.transform(Xs=Xs)...####### |
| 82a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 82c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 82e0 | 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 | #######.#.Fig.1.:.plots.source.a |
| 8300 | 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | nd.target.samples.#.------------ |
| 8320 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e | ---------------------------..pl. |
| 8340 | 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 35 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 | figure(1,.figsize=(10,.5)).pl.su |
| 8360 | 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 | bplot(1,.2,.1).pl.scatter(Xs[:,. |
| 8380 | 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 | 0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+',. |
| 83a0 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b | label='Source.samples').pl.xtick |
| 83c0 | 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f | s([]).pl.yticks([]).pl.legend(lo |
| 83e0 | 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 | c=0).pl.title('Source..samples') |
| 8400 | 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 | ..pl.subplot(1,.2,.2).pl.scatter |
| 8420 | 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 | (Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marke |
| 8440 | 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 | r='o',.label='Target.samples').p |
| 8460 | 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 6c 65 | l.xticks([]).pl.yticks([]).pl.le |
| 8480 | 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d | gend(loc=0).pl.title('Target.sam |
| 84a0 | 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 | ples').pl.tight_layout()...##### |
| 84c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 84e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 8500 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 6f 70 74 69 6d 61 6c | #########.#.Fig.2.:.plot.optimal |
| 8520 | 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 61 6e 64 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c | .couplings.and.transported.sampl |
| 8540 | 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | es.#.--------------------------- |
| 8560 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 61 72 | ---------------------------..par |
| 8580 | 61 6d 5f 69 6d 67 20 3d 20 7b 27 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 27 3a 20 27 6e 65 61 72 | am_img.=.{'interpolation':.'near |
| 85a0 | 65 73 74 27 2c 20 27 63 6d 61 70 27 3a 20 27 73 70 65 63 74 72 61 6c 27 7d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 | est',.'cmap':.'spectral'}..pl.fi |
| 85c0 | 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 35 2c 20 38 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 | gure(2,.figsize=(15,.8)).pl.subp |
| 85e0 | 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f | lot(2,.4,.1).pl.imshow(ot_emd.co |
| 8600 | 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 | upling_,.**param_img).pl.xticks( |
| 8620 | 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 | []).pl.yticks([]).pl.title('Opti |
| 8640 | 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c | mal.coupling\nEMDTransport')..pl |
| 8660 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 | .subplot(2,.4,.2).pl.imshow(ot_s |
| 8680 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a | inkhorn.coupling_,.**param_img). |
| 86a0 | 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 | pl.xticks([]).pl.yticks([]).pl.t |
| 86c0 | 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e | itle('Optimal.coupling\nSinkhorn |
| 86e0 | 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 33 29 | Transport')..pl.subplot(2,.4,.3) |
| 8700 | 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a | .pl.imshow(ot_lpl1.coupling_,.** |
| 8720 | 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 | param_img).pl.xticks([]).pl.ytic |
| 8740 | 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e | ks([]).pl.title('Optimal.couplin |
| 8760 | 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 | g\nSinkhornLpl1Transport')..pl.s |
| 8780 | 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 31 6c | ubplot(2,.4,.4).pl.imshow(ot_l1l |
| 87a0 | 32 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 | 2.coupling_,.**param_img).pl.xti |
| 87c0 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | cks([]).pl.yticks([]).pl.title(' |
| 87e0 | 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 | Optimal.coupling\nSinkhornL1l2Tr |
| 8800 | 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 35 29 0a 70 | ansport')..pl.subplot(2,.4,.5).p |
| 8820 | 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d | l.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c= |
| 8840 | 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c | yt,.marker='o',............label |
| 8860 | 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 0a 70 6c | ='Target.samples',.alpha=0.3).pl |
| 8880 | 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 | .scatter(transp_Xs_emd[:,.0],.tr |
| 88a0 | 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 | ansp_Xs_emd[:,.1],.c=ys,........ |
| 88c0 | 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 | ....marker='+',.label='Transp.sa |
| 88e0 | 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 | mples',.s=30).pl.xticks([]).pl.y |
| 8900 | 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 | ticks([]).pl.title('Transported. |
| 8920 | 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e | samples\nEmdTransport').pl.legen |
| 8940 | 64 28 6c 6f 63 3d 22 6c 6f 77 65 72 20 6c 65 66 74 22 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | d(loc="lower.left")..pl.subplot( |
| 8960 | 32 2c 20 34 2c 20 36 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 | 2,.4,.6).pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt |
| 8980 | 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 | [:,.1],.c=yt,.marker='o',....... |
| 89a0 | 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 | .....label='Target.samples',.alp |
| 89c0 | 68 61 3d 30 2e 33 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e | ha=0.3).pl.scatter(transp_Xs_sin |
| 89e0 | 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b | khorn[:,.0],.transp_Xs_sinkhorn[ |
| 8a00 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 | :,.1],.c=ys,............marker=' |
| 8a20 | 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 | +',.label='Transp.samples',.s=30 |
| 8a40 | 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c | ).pl.xticks([]).pl.yticks([]).pl |
| 8a60 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 53 69 6e | .title('Transported.samples\nSin |
| 8a80 | 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 | khornTransport')..pl.subplot(2,. |
| 8aa0 | 34 2c 20 37 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c | 4,.7).pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:, |
| 8ac0 | 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | .1],.c=yt,.marker='o',.......... |
| 8ae0 | 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d | ..label='Target.samples',.alpha= |
| 8b00 | 30 2e 33 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a | 0.3).pl.scatter(transp_Xs_lpl1[: |
| 8b20 | 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 | ,.0],.transp_Xs_lpl1[:,.1],.c=ys |
| 8b40 | 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | ,............marker='+',.label=' |
| 8b60 | 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 | Transp.samples',.s=30).pl.xticks |
| 8b80 | 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 | ([]).pl.yticks([]).pl.title('Tra |
| 8ba0 | 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 | nsported.samples\nSinkhornLpl1Tr |
| 8bc0 | 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 38 29 0a 70 | ansport')..pl.subplot(2,.4,.8).p |
| 8be0 | 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d | l.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c= |
| 8c00 | 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c | yt,.marker='o',............label |
| 8c20 | 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 0a 70 6c | ='Target.samples',.alpha=0.3).pl |
| 8c40 | 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 31 6c 32 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 | .scatter(transp_Xs_l1l2[:,.0],.t |
| 8c60 | 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 31 6c 32 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 | ransp_Xs_l1l2[:,.1],.c=ys,...... |
| 8c80 | 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 | ......marker='+',.label='Transp. |
| 8ca0 | 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c | samples',.s=30).pl.xticks([]).pl |
| 8cc0 | 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 | .yticks([]).pl.title('Transporte |
| 8ce0 | 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 | d.samples\nSinkhornL1l2Transport |
| 8d00 | 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a | ').pl.tight_layout()..pl.show(). |
| 8d20 | 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b 1a d1 23 82 4f 10 00 00 4f 10 00 00 30 00 00 00 61 75 | PK.........o/K..#.O...O...0...au |
| 8d40 | 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 63 6f | to_examples/plot_otda_mapping_co |
| 8d60 | 6c 6f 72 73 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d | lors_images.py#.-*-.coding:.utf- |
| 8d80 | 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | 8.-*-.""".====================== |
| 8da0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a | ===============================. |
| 8dc0 | 4f 54 20 66 6f 72 20 69 6d 61 67 65 20 63 6f 6c 6f 72 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 77 69 | OT.for.image.color.adaptation.wi |
| 8de0 | 74 68 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | th.mapping.estimation.========== |
| 8e00 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
| 8e20 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 | ===========..OT.for.domain.adapt |
| 8e40 | 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 69 6d 61 67 65 20 63 6f 6c 6f 72 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f | ation.with.image.color.adaptatio |
| 8e60 | 6e 20 5b 36 5d 20 77 69 74 68 20 6d 61 70 70 69 6e 67 0a 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 5b 38 | n.[6].with.mapping.estimation.[8 |
| 8e80 | 5d 2e 0a 0a 5b 36 5d 20 46 65 72 72 61 64 61 6e 73 2c 20 53 2e 2c 20 50 61 70 61 64 61 6b 69 73 | ]...[6].Ferradans,.S.,.Papadakis |
| 8ea0 | 2c 20 4e 2e 2c 20 50 65 79 72 65 2c 20 47 2e 2c 20 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 4a 2e 20 46 2e 20 | ,.N.,.Peyre,.G.,.&.Aujol,.J..F.. |
| 8ec0 | 28 32 30 31 34 29 2e 20 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 0a 20 20 20 20 64 69 73 63 72 65 74 65 | (2014)..Regularized.....discrete |
| 8ee0 | 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 2e 20 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c | .optimal.transport..SIAM.Journal |
| 8f00 | 20 6f 6e 20 49 6d 61 67 69 6e 67 20 53 63 69 65 6e 63 65 73 2c 20 37 28 33 29 2c 0a 20 20 20 20 | .on.Imaging.Sciences,.7(3),..... |
| 8f20 | 31 38 35 33 2d 31 38 38 32 2e 0a 5b 38 5d 20 4d 2e 20 50 65 72 72 6f 74 2c 20 4e 2e 20 43 6f 75 | 1853-1882..[8].M..Perrot,.N..Cou |
| 8f40 | 72 74 79 2c 20 52 2e 20 46 6c 61 6d 61 72 79 2c 20 41 2e 20 48 61 62 72 61 72 64 2c 20 22 4d 61 | rty,.R..Flamary,.A..Habrard,."Ma |
| 8f60 | 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 0a 20 20 20 20 64 69 73 63 72 65 74 | pping.estimation.for.....discret |
| 8f80 | 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 22 2c 20 4e 65 75 72 61 6c 20 49 6e 66 | e.optimal.transport",.Neural.Inf |
| 8fa0 | 6f 72 6d 61 74 69 6f 6e 20 50 72 6f 63 65 73 73 69 6e 67 20 53 79 73 74 65 6d 73 20 28 4e 49 50 | ormation.Processing.Systems.(NIP |
| 8fc0 | 53 29 2c 0a 20 20 20 20 32 30 31 36 2e 0a 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 | S),.....2016..."""..#.Authors:.R |
| 8fe0 | 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e | emi.Flamary.<remi.flamary@unice. |
| 9000 | 66 72 3e 0a 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e | fr>.#..........Stanislas.Chambon |
| 9020 | 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 | .<stan.chambon@gmail.com>.#.#.Li |
| 9040 | 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 | cense:.MIT.License..import.numpy |
| 9060 | 20 61 73 20 6e 70 0a 66 72 6f 6d 20 73 63 69 70 79 20 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 64 69 6d 61 67 65 | .as.np.from.scipy.import.ndimage |
| 9080 | 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 | .import.matplotlib.pylab.as.pl.i |
| 90a0 | 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0a 0a 72 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 52 61 6e 64 6f 6d 53 74 | mport.ot..r.=.np.random.RandomSt |
| 90c0 | 61 74 65 28 34 32 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 29 3a 0a 20 20 20 20 22 22 22 | ate(42)...def.im2mat(I):.....""" |
| 90e0 | 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 61 6e 64 20 69 6d 61 67 65 20 74 6f 20 6d 61 74 72 69 78 20 28 6f 6e | Converts.and.image.to.matrix.(on |
| 9100 | 65 20 70 69 78 65 6c 20 70 65 72 20 6c 69 6e 65 29 22 22 22 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 | e.pixel.per.line)""".....return. |
| 9120 | 49 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 49 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 20 2a 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b | I.reshape((I.shape[0].*.I.shape[ |
| 9140 | 31 5d 2c 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 32 5d 29 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 6d 61 74 32 69 6d 28 58 2c | 1],.I.shape[2]))...def.mat2im(X, |
| 9160 | 20 73 68 61 70 65 29 3a 0a 20 20 20 20 22 22 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 62 61 63 6b 20 61 20 | .shape):....."""Converts.back.a. |
| 9180 | 6d 61 74 72 69 78 20 74 6f 20 61 6e 20 69 6d 61 67 65 22 22 22 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e | matrix.to.an.image""".....return |
| 91a0 | 20 58 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 73 68 61 70 65 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 49 | .X.reshape(shape)...def.minmax(I |
| 91c0 | 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 63 6c 69 70 28 49 2c 20 30 2c 20 31 29 0a 0a | ):.....return.np.clip(I,.0,.1).. |
| 91e0 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
| 9200 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 9220 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a | ###############.#.Generate.data. |
| 9240 | 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 4c 6f 61 64 69 6e 67 20 69 6d 61 67 65 | #.-------------..#.Loading.image |
| 9260 | 73 0a 49 31 20 3d 20 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f | s.I1.=.ndimage.imread('../data/o |
| 9280 | 63 65 61 6e 5f 64 61 79 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 | cean_day.jpg').astype(np.float64 |
| 92a0 | 29 20 2f 20 32 35 36 0a 49 32 20 3d 20 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f | )./.256.I2.=.ndimage.imread('../ |
| 92c0 | 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 73 75 6e 73 65 74 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e | data/ocean_sunset.jpg').astype(n |
| 92e0 | 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 0a 0a 0a 58 31 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 | p.float64)./.256...X1.=.im2mat(I |
| 9300 | 31 29 0a 58 32 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 32 29 0a 0a 23 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 | 1).X2.=.im2mat(I2)..#.training.s |
| 9320 | 61 6d 70 6c 65 73 0a 6e 62 20 3d 20 31 30 30 30 0a 69 64 78 31 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e | amples.nb.=.1000.idx1.=.r.randin |
| 9340 | 74 28 58 31 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 0a 69 64 78 32 20 | t(X1.shape[0],.size=(nb,)).idx2. |
| 9360 | 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 32 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e | =.r.randint(X2.shape[0],.size=(n |
| 9380 | 62 2c 29 29 0a 0a 58 73 20 3d 20 58 31 5b 69 64 78 31 2c 20 3a 5d 0a 58 74 20 3d 20 58 32 5b 69 | b,))..Xs.=.X1[idx1,.:].Xt.=.X2[i |
| 93a0 | 64 78 32 2c 20 3a 5d 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | dx2,.:]...###################### |
| 93c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 93e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 44 6f 6d 61 69 | ########################.#.Domai |
| 9400 | 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 70 69 78 65 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 | n.adaptation.for.pixel.distribut |
| 9420 | 69 6f 6e 20 74 72 61 6e 73 66 65 72 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ion.transfer.#.----------------- |
| 9440 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 9460 | 0a 0a 23 20 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e | ..#.EMDTransport.ot_emd.=.ot.da. |
| 9480 | 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 0a 6f 74 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c | EMDTransport().ot_emd.fit(Xs=Xs, |
| 94a0 | 20 58 74 3d 58 74 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 | .Xt=Xt).transp_Xs_emd.=.ot_emd.t |
| 94c0 | 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 0a 49 6d 61 67 65 5f 65 6d 64 20 3d 20 6d 69 6e 6d | ransform(Xs=X1).Image_emd.=.minm |
| 94e0 | 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 | ax(mat2im(transp_Xs_emd,.I1.shap |
| 9500 | 65 29 29 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b | e))..#.SinkhornTransport.ot_sink |
| 9520 | 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 | horn.=.ot.da.SinkhornTransport(r |
| 9540 | 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 | eg_e=1e-1).ot_sinkhorn.fit(Xs=Xs |
| 9560 | 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 | ,.Xt=Xt).transp_Xs_sinkhorn.=.ot |
| 9580 | 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 0a 49 6d 61 67 65 5f 73 69 6e 6b | _emd.transform(Xs=X1).Image_sink |
| 95a0 | 68 6f 72 6e 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 | horn.=.minmax(mat2im(transp_Xs_s |
| 95c0 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f | inkhorn,.I1.shape))..ot_mapping_ |
| 95e0 | 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 | linear.=.ot.da.MappingTransport( |
| 9600 | 0a 20 20 20 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 38 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 | .....mu=1e0,.eta=1e-8,.bias=True |
| 9620 | 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 6f 74 5f | ,.max_iter=20,.verbose=True).ot_ |
| 9640 | 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 | mapping_linear.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt) |
| 9660 | 0a 0a 58 31 74 6c 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 | ..X1tl.=.ot_mapping_linear.trans |
| 9680 | 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 0a 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 | form(Xs=X1).Image_mapping_linear |
| 96a0 | 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 6c 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 | .=.minmax(mat2im(X1tl,.I1.shape) |
| 96c0 | 29 0a 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d | )..ot_mapping_gaussian.=.ot.da.M |
| 96e0 | 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 0a 20 20 20 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 | appingTransport(.....mu=1e0,.eta |
| 9700 | 3d 31 65 2d 32 2c 20 73 69 67 6d 61 3d 31 2c 20 62 69 61 73 3d 46 61 6c 73 65 2c 20 6d 61 78 5f | =1e-2,.sigma=1,.bias=False,.max_ |
| 9720 | 69 74 65 72 3d 31 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e | iter=10,.verbose=True).ot_mappin |
| 9740 | 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 58 31 | g_gaussian.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)..X1 |
| 9760 | 74 6e 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f | tn.=.ot_mapping_gaussian.transfo |
| 9780 | 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 20 20 23 20 75 73 65 20 74 68 65 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 64 20 6d | rm(Xs=X1)..#.use.the.estimated.m |
| 97a0 | 61 70 70 69 6e 67 0a 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 | apping.Image_mapping_gaussian.=. |
| 97c0 | 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 58 31 74 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a | minmax(mat2im(X1tn,.I1.shape)).. |
| 97e0 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
| 9800 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 9820 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 | ###############.#.Plot.original. |
| 9840 | 69 6d 61 67 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 | images.#.--------------------..p |
| 9860 | 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 0a 70 6c | l.figure(1,.figsize=(6.4,.3)).pl |
| 9880 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 0a | .subplot(1,.2,.1).pl.imshow(I1). |
| 98a0 | 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 | pl.axis('off').pl.title('Image.1 |
| 98c0 | 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f | ')..pl.subplot(1,.2,.2).pl.imsho |
| 98e0 | 77 28 49 32 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 | w(I2).pl.axis('off').pl.title('I |
| 9900 | 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 | mage.2').pl.tight_layout()...### |
| 9920 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 9940 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 9960 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 70 69 78 65 6c 20 76 61 6c 75 65 73 20 | ###########.#.Plot.pixel.values. |
| 9980 | 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | distribution.#.----------------- |
| 99a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 | -------------..pl.figure(2,.figs |
| 99c0 | 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 35 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 | ize=(6.4,.5))..pl.subplot(1,.2,. |
| 99e0 | 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 32 5d | 1).pl.scatter(Xs[:,.0],.Xs[:,.2] |
| 9a00 | 2c 20 63 3d 58 73 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c | ,.c=Xs).pl.axis([0,.1,.0,.1]).pl |
| 9a20 | 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 0a 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 | .xlabel('Red').pl.ylabel('Blue') |
| 9a40 | 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | .pl.title('Image.1')..pl.subplot |
| 9a60 | 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 | (1,.2,.2).pl.scatter(Xt[:,.0],.X |
| 9a80 | 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c | t[:,.2],.c=Xt).pl.axis([0,.1,.0, |
| 9aa0 | 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 0a 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 | .1]).pl.xlabel('Red').pl.ylabel( |
| 9ac0 | 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 70 6c 2e 74 | 'Blue').pl.title('Image.2').pl.t |
| 9ae0 | 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ight_layout()...################ |
| 9b00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 9b20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 | ##############################.# |
| 9b40 | 20 50 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 65 64 20 69 6d 61 67 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d | .Plot.transformed.images.#.----- |
| 9b60 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c | ------------------..pl.figure(2, |
| 9b80 | 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 35 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | .figsize=(10,.5))..pl.subplot(2, |
| 9ba0 | 20 33 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 | .3,.1).pl.imshow(I1).pl.axis('of |
| 9bc0 | 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | f').pl.title('Im..1')..pl.subplo |
| 9be0 | 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 | t(2,.3,.4).pl.imshow(I2).pl.axis |
| 9c00 | 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 32 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 | ('off').pl.title('Im..2')..pl.su |
| 9c20 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 67 65 5f 65 | bplot(2,.3,.2).pl.imshow(Image_e |
| 9c40 | 6d 64 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 6d 64 | md).pl.axis('off').pl.title('Emd |
| 9c60 | 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 | Transport')..pl.subplot(2,.3,.5) |
| 9c80 | 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 67 65 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 29 0a 70 6c 2e 61 78 | .pl.imshow(Image_sinkhorn).pl.ax |
| 9ca0 | 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e | is('off').pl.title('SinkhornTran |
| 9cc0 | 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e | sport')..pl.subplot(2,.3,.3).pl. |
| 9ce0 | 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 29 0a 70 6c 2e | imshow(Image_mapping_linear).pl. |
| 9d00 | 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 | axis('off').pl.title('MappingTra |
| 9d20 | 6e 73 70 6f 72 74 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | nsport.(linear)')..pl.subplot(2, |
| 9d40 | 20 33 2c 20 36 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 | .3,.6).pl.imshow(Image_mapping_g |
| 9d60 | 61 75 73 73 69 61 6e 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | aussian).pl.axis('off').pl.title |
| 9d80 | 28 27 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 28 67 61 75 73 73 69 61 6e 29 27 29 0a | ('MappingTransport.(gaussian)'). |
| 9da0 | 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 | pl.tight_layout()..pl.show().PK. |
| 9dc0 | 04 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b 37 2c 8d 0c 79 13 00 00 79 13 00 00 21 00 00 00 61 75 74 6f 5f | ........o/K7,..y...y...!...auto_ |
| 9de0 | 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 4c 31 5f 76 73 5f 4c 32 2e 70 79 23 20 2d 2a | examples/plot_OT_L1_vs_L2.py#.-* |
| 9e00 | 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | -.coding:.utf-8.-*-.""".======== |
| 9e20 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
| 9e40 | 3d 3d 0a 32 44 20 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 66 6f 72 20 64 69 66 66 | ==.2D.Optimal.transport.for.diff |
| 9e60 | 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 72 69 63 73 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | erent.metrics.================== |
| 9e80 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 32 44 20 4f 54 20 | ========================..2D.OT. |
| 9ea0 | 6f 6e 20 65 6d 70 69 72 69 63 61 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 20 20 77 69 74 68 20 64 | on.empirical.distributio..with.d |
| 9ec0 | 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 67 6f 75 6e 64 20 6d 65 74 72 69 63 2e 0a 0a 53 74 6f 6c 65 20 74 68 | ifferent.gound.metric...Stole.th |
| 9ee0 | 65 20 66 69 67 75 72 65 20 69 64 65 61 20 66 72 6f 6d 20 46 69 67 2e 20 31 20 61 6e 64 20 32 20 | e.figure.idea.from.Fig..1.and.2. |
| 9f00 | 69 6e 0a 68 74 74 70 73 3a 2f 2f 61 72 78 69 76 2e 6f 72 67 2f 70 64 66 2f 31 37 30 36 2e 30 37 | in.https://arxiv.org/pdf/1706.07 |
| 9f20 | 36 35 30 2e 70 64 66 0a 0a 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c | 650.pdf..."""..#.Author:.Remi.Fl |
| 9f40 | 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 0a | amary.<remi.flamary@unice.fr>.#. |
| 9f60 | 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e | #.License:.MIT.License..import.n |
| 9f80 | 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c | umpy.as.np.import.matplotlib.pyl |
| 9fa0 | 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ab.as.pl.import.ot..############ |
| 9fc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 9fe0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| a000 | 23 23 0a 23 20 44 61 74 61 73 65 74 20 31 20 3a 20 75 6e 69 66 6f 72 6d 20 73 61 6d 70 6c 69 6e | ##.#.Dataset.1.:.uniform.samplin |
| a020 | 67 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | g.#.---------------------------- |
| a040 | 0a 0a 6e 20 3d 20 32 30 20 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 78 73 20 3d 20 6e 70 2e 7a | ..n.=.20..#.nb.samples.xs.=.np.z |
| a060 | 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 32 29 29 0a 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 | eros((n,.2)).xs[:,.0].=.np.arang |
| a080 | 65 28 6e 29 20 2b 20 31 0a 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e | e(n).+.1.xs[:,.1].=.(np.arange(n |
| a0a0 | 29 20 2b 20 31 29 20 2a 20 2d 30 2e 30 30 31 20 20 23 20 74 6f 20 6d 61 6b 65 20 69 74 20 73 74 | ).+.1).*.-0.001..#.to.make.it.st |
| a0c0 | 72 69 63 74 6c 79 20 63 6f 6e 76 65 78 2e 2e 2e 0a 0a 78 74 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 | rictly.convex.....xt.=.np.zeros( |
| a0e0 | 28 6e 2c 20 32 29 29 0a 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 | (n,.2)).xt[:,.1].=.np.arange(n). |
| a100 | 2b 20 31 0a 0a 61 2c 20 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 2c 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 | +.1..a,.b.=.ot.unif(n),.ot.unif( |
| a120 | 6e 29 20 20 23 20 75 6e 69 66 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 61 | n)..#.uniform.distribution.on.sa |
| a140 | 6d 70 6c 65 73 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 | mples..#.loss.matrix.M1.=.ot.dis |
| a160 | 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 4d 31 | t(xs,.xt,.metric='euclidean').M1 |
| a180 | 20 2f 3d 20 4d 31 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 32 20 3d | ./=.M1.max()..#.loss.matrix.M2.= |
| a1a0 | 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 75 63 6c 69 | .ot.dist(xs,.xt,.metric='sqeucli |
| a1c0 | 64 65 61 6e 27 29 0a 4d 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 | dean').M2./=.M2.max()..#.loss.ma |
| a1e0 | 74 72 69 78 0a 4d 70 20 3d 20 6e 70 2e 73 71 72 74 28 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 | trix.Mp.=.np.sqrt(ot.dist(xs,.xt |
| a200 | 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 29 0a 4d 70 20 2f 3d 20 4d 70 2e | ,.metric='euclidean')).Mp./=.Mp. |
| a220 | 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 20 44 61 74 61 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 | max()..#.Data.pl.figure(1,.figsi |
| a240 | 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a | ze=(7,.3)).pl.clf().pl.plot(xs[: |
| a260 | 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 | ,.0],.xs[:,.1],.'+b',.label='Sou |
| a280 | 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 | rce.samples').pl.plot(xt[:,.0],. |
| a2a0 | 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 | xt[:,.1],.'xr',.label='Target.sa |
| a2c0 | 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | mples').pl.axis('equal').pl.titl |
| a2e0 | 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 72 61 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f | e('Source.and.traget.distributio |
| a300 | 6e 73 27 29 0a 0a 0a 23 20 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 | ns')...#.Cost.matrices.pl.figure |
| a320 | 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | (2,.figsize=(7,.3))..pl.subplot( |
| a340 | 31 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 31 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 | 1,.3,.1).pl.imshow(M1,.interpola |
| a360 | 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 75 63 6c 69 64 | tion='nearest').pl.title('Euclid |
| a380 | 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 0a | ean.cost')..pl.subplot(1,.3,.2). |
| a3a0 | 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 32 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 | pl.imshow(M2,.interpolation='nea |
| a3c0 | 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 | rest').pl.title('Squared.Euclide |
| a3e0 | 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 70 | an.cost')..pl.subplot(1,.3,.3).p |
| a400 | 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 70 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 | l.imshow(Mp,.interpolation='near |
| a420 | 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 | est').pl.title('Sqrt.Euclidean.c |
| a440 | 6f 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 | ost').pl.tight_layout()..####### |
| a460 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| a480 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| a4a0 | 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 44 61 74 61 73 65 74 20 31 20 3a 20 50 6c 6f 74 20 4f 54 20 4d 61 | #######.#.Dataset.1.:.Plot.OT.Ma |
| a4c0 | 74 72 69 63 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | trices.#.----------------------- |
| a4e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 0a 23 25 25 20 45 4d 44 0a 47 31 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 | -----...#%%.EMD.G1.=.ot.emd(a,.b |
| a500 | 2c 20 4d 31 29 0a 47 32 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 32 29 0a 47 70 20 3d | ,.M1).G2.=.ot.emd(a,.b,.M2).Gp.= |
| a520 | 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 70 29 0a 0a 23 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 | .ot.emd(a,.b,.Mp)..#.OT.matrices |
| a540 | 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 0a 0a 70 | .pl.figure(3,.figsize=(7,.3))..p |
| a560 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 | l.subplot(1,.3,.1).ot.plot.plot2 |
| a580 | 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 31 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c | D_samples_mat(xs,.xt,.G1,.c=[.5, |
| a5a0 | 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c | ..5,.1]).pl.plot(xs[:,.0],.xs[:, |
| a5c0 | 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | .1],.'+b',.label='Source.samples |
| a5e0 | 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 | ').pl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.' |
| a600 | 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e | xr',.label='Target.samples').pl. |
| a620 | 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 | axis('equal').#.pl.legend(loc=0) |
| a640 | 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 | .pl.title('OT.Euclidean')..pl.su |
| a660 | 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 | bplot(1,.3,.2).ot.plot.plot2D_sa |
| a680 | 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 32 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c | mples_mat(xs,.xt,.G2,.c=[.5,..5, |
| a6a0 | 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c | .1]).pl.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1], |
| a6c0 | 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 | .'+b',.label='Source.samples').p |
| a6e0 | 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c | l.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr', |
| a700 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 | .label='Target.samples').pl.axis |
| a720 | 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e | ('equal').#.pl.legend(loc=0).pl. |
| a740 | 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 0a 70 | title('OT.squared.Euclidean')..p |
| a760 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 | l.subplot(1,.3,.3).ot.plot.plot2 |
| a780 | 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 70 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c | D_samples_mat(xs,.xt,.Gp,.c=[.5, |
| a7a0 | 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c | ..5,.1]).pl.plot(xs[:,.0],.xs[:, |
| a7c0 | 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | .1],.'+b',.label='Source.samples |
| a7e0 | 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 | ').pl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.' |
| a800 | 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e | xr',.label='Target.samples').pl. |
| a820 | 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 | axis('equal').#.pl.legend(loc=0) |
| a840 | 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 70 | .pl.title('OT.sqrt.Euclidean').p |
| a860 | 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 0a 0a 23 23 | l.tight_layout()..pl.show()...## |
| a880 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| a8a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| a8c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 44 61 74 61 73 65 74 20 32 20 3a 20 50 61 72 74 69 | ############.#.Dataset.2.:.Parti |
| a8e0 | 61 6c 20 63 69 72 63 6c 65 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | al.circle.#.-------------------- |
| a900 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 6e 20 3d 20 35 30 20 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 78 74 6f | ------..n.=.50..#.nb.samples.xto |
| a920 | 74 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 20 2b 20 31 2c 20 32 29 29 0a 78 74 6f 74 5b 3a 2c | t.=.np.zeros((n.+.1,.2)).xtot[:, |
| a940 | 20 30 5d 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 73 28 0a 20 20 20 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 20 2b | .0].=.np.cos(.....(np.arange(n.+ |
| a960 | 20 31 29 20 2b 20 31 2e 30 29 20 2a 20 30 2e 39 20 2f 20 28 6e 20 2b 20 32 29 20 2a 20 32 20 2a | .1).+.1.0).*.0.9./.(n.+.2).*.2.* |
| a980 | 20 6e 70 2e 70 69 29 0a 78 74 6f 74 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 6e 70 2e 73 69 6e 28 0a 20 20 20 | .np.pi).xtot[:,.1].=.np.sin(.... |
| a9a0 | 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 20 2b 20 31 29 20 2b 20 31 2e 30 29 20 2a 20 30 2e 39 20 | .(np.arange(n.+.1).+.1.0).*.0.9. |
| a9c0 | 2f 20 28 6e 20 2b 20 32 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 29 0a 0a 78 73 20 3d 20 78 74 6f | /.(n.+.2).*.2.*.np.pi)..xs.=.xto |
| a9e0 | 74 5b 3a 6e 2c 20 3a 5d 0a 78 74 20 3d 20 78 74 6f 74 5b 31 3a 2c 20 3a 5d 0a 0a 61 2c 20 62 20 | t[:n,.:].xt.=.xtot[1:,.:]..a,.b. |
| aa00 | 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 2c 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 20 20 23 20 75 6e 69 66 | =.ot.unif(n),.ot.unif(n)..#.unif |
| aa20 | 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 0a 23 20 6c | orm.distribution.on.samples..#.l |
| aa40 | 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 | oss.matrix.M1.=.ot.dist(xs,.xt,. |
| aa60 | 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 4d 31 20 2f 3d 20 4d 31 2e 6d 61 78 | metric='euclidean').M1./=.M1.max |
| aa80 | 28 29 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 | ()..#.loss.matrix.M2.=.ot.dist(x |
| aaa0 | 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 4d 32 20 | s,.xt,.metric='sqeuclidean').M2. |
| aac0 | 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 70 20 3d 20 | /=.M2.max()..#.loss.matrix.Mp.=. |
| aae0 | 6e 70 2e 73 71 72 74 28 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 | np.sqrt(ot.dist(xs,.xt,.metric=' |
| ab00 | 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 29 0a 4d 70 20 2f 3d 20 4d 70 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 0a 23 20 | euclidean')).Mp./=.Mp.max()...#. |
| ab20 | 44 61 74 61 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 | Data.pl.figure(4,.figsize=(7,.3) |
| ab40 | 29 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b | ).pl.clf().pl.plot(xs[:,.0],.xs[ |
| ab60 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c | :,.1],.'+b',.label='Source.sampl |
| ab80 | 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c | es').pl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1], |
| aba0 | 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 | .'xr',.label='Target.samples').p |
| abc0 | 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 | l.axis('equal').pl.title('Source |
| abe0 | 20 61 6e 64 20 74 72 61 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 0a 0a 23 20 | .and.traget.distributions')...#. |
| ac00 | 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 2c 20 66 69 67 73 69 | Cost.matrices.pl.figure(5,.figsi |
| ac20 | 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 0a | ze=(7,.3))..pl.subplot(1,.3,.1). |
| ac40 | 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 31 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 | pl.imshow(M1,.interpolation='nea |
| ac60 | 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 | rest').pl.title('Euclidean.cost' |
| ac80 | 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 | )..pl.subplot(1,.3,.2).pl.imshow |
| aca0 | 28 4d 32 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c | (M2,.interpolation='nearest').pl |
| acc0 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 | .title('Squared.Euclidean.cost') |
| ace0 | 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 | ..pl.subplot(1,.3,.3).pl.imshow( |
| ad00 | 4d 70 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e | Mp,.interpolation='nearest').pl. |
| ad20 | 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 0a 70 6c 2e | title('Sqrt.Euclidean.cost').pl. |
| ad40 | 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | tight_layout()..################ |
| ad60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| ad80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 | ##############################.# |
| ada0 | 20 44 61 74 61 73 65 74 20 32 20 3a 20 50 6c 6f 74 20 20 4f 54 20 4d 61 74 72 69 63 65 73 0a 23 | .Dataset.2.:.Plot..OT.Matrices.# |
| adc0 | 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a | .-----------------------------.. |
| ade0 | 0a 23 25 25 20 45 4d 44 0a 47 31 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 31 29 0a 47 | .#%%.EMD.G1.=.ot.emd(a,.b,.M1).G |
| ae00 | 32 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 32 29 0a 47 70 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 | 2.=.ot.emd(a,.b,.M2).Gp.=.ot.emd |
| ae20 | 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 70 29 0a 0a 23 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 0a 70 6c 2e 66 69 67 | (a,.b,.Mp)..#.OT.matrices.pl.fig |
| ae40 | 75 72 65 28 36 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | ure(6,.figsize=(7,.3))..pl.subpl |
| ae60 | 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c | ot(1,.3,.1).ot.plot.plot2D_sampl |
| ae80 | 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 31 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d | es_mat(xs,.xt,.G1,.c=[.5,..5,.1] |
| aea0 | 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b | ).pl.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+ |
| aec0 | 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 | b',.label='Source.samples').pl.p |
| aee0 | 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 | lot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr',.la |
| af00 | 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 | bel='Target.samples').pl.axis('e |
| af20 | 71 75 61 6c 27 29 0a 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 | qual').#.pl.legend(loc=0).pl.tit |
| af40 | 6c 65 28 27 4f 54 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 | le('OT.Euclidean')..pl.subplot(1 |
| af60 | 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d | ,.3,.2).ot.plot.plot2D_samples_m |
| af80 | 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 32 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c | at(xs,.xt,.G2,.c=[.5,..5,.1]).pl |
| afa0 | 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 | .plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+b',. |
| afc0 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 | label='Source.samples').pl.plot( |
| afe0 | 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d | xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr',.label= |
| b000 | 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c | 'Target.samples').pl.axis('equal |
| b020 | 27 29 0a 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | ').#.pl.legend(loc=0).pl.title(' |
| b040 | 4f 54 20 73 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | OT.squared.Euclidean')..pl.subpl |
| b060 | 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c | ot(1,.3,.3).ot.plot.plot2D_sampl |
| b080 | 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 70 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d | es_mat(xs,.xt,.Gp,.c=[.5,..5,.1] |
| b0a0 | 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b | ).pl.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+ |
| b0c0 | 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 | b',.label='Source.samples').pl.p |
| b0e0 | 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 | lot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr',.la |
| b100 | 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 | bel='Target.samples').pl.axis('e |
| b120 | 71 75 61 6c 27 29 0a 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 | qual').#.pl.legend(loc=0).pl.tit |
| b140 | 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 | le('OT.sqrt.Euclidean').pl.tight |
| b160 | 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 09 | _layout()..pl.show().PK......... |
| b180 | 6f 2f 4b 8c 4d bd 60 44 09 00 00 44 09 00 00 23 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 | o/K.M.`D...D...#...auto_examples |
| b1a0 | 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 | /plot_OT_2D_samples.py#.-*-.codi |
| b1c0 | 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ng:.utf-8.-*-.""".============== |
| b1e0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
| b200 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 32 44 20 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 62 65 74 77 | ======.2D.Optimal.transport.betw |
| b220 | 65 65 6e 20 65 6d 70 69 72 69 63 61 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 3d 3d 3d 3d | een.empirical.distributions.==== |
| b240 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
| b260 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 49 6c 6c 75 73 74 72 61 74 69 6f 6e 20 6f | ================..Illustration.o |
| b280 | 66 20 32 44 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 64 | f.2D.optimal.transport.between.d |
| b2a0 | 69 73 63 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 74 68 61 74 20 61 72 65 20 77 65 69 67 68 74 65 64 0a 73 | iscributions.that.are.weighted.s |
| b2c0 | 75 6d 20 6f 66 20 64 69 72 61 63 73 2e 20 54 68 65 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 69 73 20 70 | um.of.diracs..The.OT.matrix.is.p |
| b2e0 | 6c 6f 74 74 65 64 20 77 69 74 68 20 74 68 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2e 0a 0a 22 22 22 0a 0a 23 | lotted.with.the.samples..."""..# |
| b300 | 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d | .Author:.Remi.Flamary.<remi.flam |
| b320 | 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c | ary@unice.fr>.#.#.License:.MIT.L |
| b340 | 69 63 65 6e 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0a 69 6d 70 6f 72 | icense..import.numpy.as.np.impor |
| b360 | 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 | t.matplotlib.pylab.as.pl.import. |
| b380 | 6f 74 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ot..############################ |
| b3a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| b3c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 | ##################.#.Generate.da |
| b3e0 | 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 | ta.#.-------------..#%%.paramete |
| b400 | 72 73 20 61 6e 64 20 64 61 74 61 20 67 65 6e 65 72 61 74 69 6f 6e 0a 0a 6e 20 3d 20 35 30 20 20 | rs.and.data.generation..n.=.50.. |
| b420 | 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 0a 6d 75 5f 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 30 | #.nb.samples..mu_s.=.np.array([0 |
| b440 | 2c 20 30 5d 29 0a 63 6f 76 5f 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 5b 31 2c 20 30 5d 2c 20 | ,.0]).cov_s.=.np.array([[1,.0],. |
| b460 | 5b 30 2c 20 31 5d 5d 29 0a 0a 6d 75 5f 74 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 34 2c 20 34 5d | [0,.1]])..mu_t.=.np.array([4,.4] |
| b480 | 29 0a 63 6f 76 5f 74 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 5b 31 2c 20 2d 2e 38 5d 2c 20 5b 2d | ).cov_t.=.np.array([[1,.-.8],.[- |
| b4a0 | 2e 38 2c 20 31 5d 5d 29 0a 0a 78 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 32 | .8,.1]])..xs.=.ot.datasets.get_2 |
| b4c0 | 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 75 5f 73 2c 20 63 6f 76 5f 73 29 0a | D_samples_gauss(n,.mu_s,.cov_s). |
| b4e0 | 78 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f | xt.=.ot.datasets.get_2D_samples_ |
| b500 | 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 75 5f 74 2c 20 63 6f 76 5f 74 29 0a 0a 61 2c 20 62 20 3d 20 6e 70 | gauss(n,.mu_t,.cov_t)..a,.b.=.np |
| b520 | 2e 6f 6e 65 73 28 28 6e 2c 29 29 20 2f 20 6e 2c 20 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 28 6e 2c 29 29 20 2f | .ones((n,))./.n,.np.ones((n,))./ |
| b540 | 20 6e 20 20 23 20 75 6e 69 66 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 61 | .n..#.uniform.distribution.on.sa |
| b560 | 6d 70 6c 65 73 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 | mples..#.loss.matrix.M.=.ot.dist |
| b580 | 28 78 73 2c 20 78 74 29 0a 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | (xs,.xt).M./=.M.max()..######### |
| b5a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| b5c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| b5e0 | 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 | #####.#.Plot.data.#.---------..# |
| b600 | 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 0a 70 6c | %%.plot.samples..pl.figure(1).pl |
| b620 | 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 | .plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+b',. |
| b640 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 | label='Source.samples').pl.plot( |
| b660 | 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d | xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr',.label= |
| b680 | 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d | 'Target.samples').pl.legend(loc= |
| b6a0 | 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 | 0).pl.title('Source.and.target.d |
| b6c0 | 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 0a 70 6c 2e | istributions')..pl.figure(2).pl. |
| b6e0 | 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 | imshow(M,.interpolation='nearest |
| b700 | 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 4d 27 29 0a 0a 23 23 | ').pl.title('Cost.matrix.M')..## |
| b720 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| b740 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| b760 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 45 4d 44 0a 23 20 2d 2d 2d | ############.#.Compute.EMD.#.--- |
| b780 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 45 4d 44 0a 0a 47 30 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 | --------..#%%.EMD..G0.=.ot.emd(a |
| b7a0 | 2c 20 62 2c 20 4d 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 | ,.b,.M)..pl.figure(3).pl.imshow( |
| b7c0 | 47 30 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e | G0,.interpolation='nearest').pl. |
| b7e0 | 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 30 27 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 | title('OT.matrix.G0')..pl.figure |
| b800 | 28 34 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 | (4).ot.plot.plot2D_samples_mat(x |
| b820 | 73 2c 20 78 74 2c 20 47 30 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f | s,.xt,.G0,.c=[.5,..5,.1]).pl.plo |
| b840 | 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 | t(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+b',.labe |
| b860 | 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a | l='Source.samples').pl.plot(xt[: |
| b880 | 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 | ,.0],.xt[:,.1],.'xr',.label='Tar |
| b8a0 | 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 | get.samples').pl.legend(loc=0).p |
| b8c0 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 77 69 74 68 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 | l.title('OT.matrix.with.samples' |
| b8e0 | 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | )...############################ |
| b900 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| b920 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 53 69 6e | ##################.#.Compute.Sin |
| b940 | 6b 68 6f 72 6e 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 73 69 | khorn.#.----------------..#%%.si |
| b960 | 6e 6b 68 6f 72 6e 0a 0a 23 20 72 65 67 20 74 65 72 6d 0a 6c 61 6d 62 64 20 3d 20 31 65 2d 33 0a | nkhorn..#.reg.term.lambd.=.1e-3. |
| b980 | 0a 47 73 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 6c 61 6d 62 64 | .Gs.=.ot.sinkhorn(a,.b,.M,.lambd |
| b9a0 | 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 73 2c 20 69 6e | )..pl.figure(5).pl.imshow(Gs,.in |
| b9c0 | 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | terpolation='nearest').pl.title( |
| b9e0 | 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 | 'OT.matrix.sinkhorn')..pl.figure |
| ba00 | 28 36 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 | (6).ot.plot.plot2D_samples_mat(x |
| ba20 | 73 2c 20 78 74 2c 20 47 73 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c | s,.xt,.Gs,.color=[.5,..5,.1]).pl |
| ba40 | 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 | .plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+b',. |
| ba60 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 | label='Source.samples').pl.plot( |
| ba80 | 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d | xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr',.label= |
| baa0 | 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d | 'Target.samples').pl.legend(loc= |
| bac0 | 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 | 0).pl.title('OT.matrix.Sinkhorn. |
| bae0 | 77 69 74 68 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 | with.samples')..pl.show().PK.... |
| bb00 | 00 00 00 00 09 6f 2f 4b 6f e7 38 bd f1 0f 00 00 f1 0f 00 00 22 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 | .....o/Ko.8........."...auto_exa |
| bb20 | 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 | mples/plot_otda_mapping.py#.-*-. |
| bb40 | 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | coding:.utf-8.-*-.""".========== |
| bb60 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
| bb80 | 3d 0a 4f 54 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 | =.OT.mapping.estimation.for.doma |
| bba0 | 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | in.adaptation.================== |
| bbc0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 69 73 20 | =========================..This. |
| bbe0 | 65 78 61 6d 70 6c 65 20 70 72 65 73 65 6e 74 73 20 68 6f 77 20 74 6f 20 75 73 65 20 4d 61 70 70 | example.presents.how.to.use.Mapp |
| bc00 | 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 74 6f 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 20 61 74 20 74 68 65 20 | ingTransport.to.estimate.at.the. |
| bc20 | 73 61 6d 65 0a 74 69 6d 65 20 62 6f 74 68 20 74 68 65 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 74 72 61 6e | same.time.both.the.coupling.tran |
| bc40 | 73 70 6f 72 74 20 61 6e 64 20 61 70 70 72 6f 78 69 6d 61 74 65 20 74 68 65 20 74 72 61 6e 73 70 | sport.and.approximate.the.transp |
| bc60 | 6f 72 74 20 6d 61 70 20 77 69 74 68 20 65 69 74 68 65 72 0a 61 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6f 72 20 | ort.map.with.either.a.linear.or. |
| bc80 | 61 20 6b 65 72 6e 65 6c 69 7a 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 61 73 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 | a.kernelized.mapping.as.introduc |
| bca0 | 65 64 20 69 6e 20 5b 38 5d 2e 0a 0a 5b 38 5d 20 4d 2e 20 50 65 72 72 6f 74 2c 20 4e 2e 20 43 6f | ed.in.[8]...[8].M..Perrot,.N..Co |
| bcc0 | 75 72 74 79 2c 20 52 2e 20 46 6c 61 6d 61 72 79 2c 20 41 2e 20 48 61 62 72 61 72 64 2c 0a 20 20 | urty,.R..Flamary,.A..Habrard,... |
| bce0 | 20 20 22 4d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 64 69 73 63 72 65 | .."Mapping.estimation.for.discre |
| bd00 | 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 22 2c 0a 20 20 20 20 4e 65 75 72 61 | te.optimal.transport",.....Neura |
| bd20 | 6c 20 49 6e 66 6f 72 6d 61 74 69 6f 6e 20 50 72 6f 63 65 73 73 69 6e 67 20 53 79 73 74 65 6d 73 | l.Information.Processing.Systems |
| bd40 | 20 28 4e 49 50 53 29 2c 20 32 30 31 36 2e 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 | .(NIPS),.2016.."""..#.Authors:.R |
| bd60 | 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e | emi.Flamary.<remi.flamary@unice. |
| bd80 | 66 72 3e 0a 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e | fr>.#..........Stanislas.Chambon |
| bda0 | 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 | .<stan.chambon@gmail.com>.#.#.Li |
| bdc0 | 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 | cense:.MIT.License..import.numpy |
| bde0 | 20 61 73 20 6e 70 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 | .as.np.import.matplotlib.pylab.a |
| be00 | 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | s.pl.import.ot...############### |
| be20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| be40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a | ###############################. |
| be60 | 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a | #.Generate.data.#.-------------. |
| be80 | 0a 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 31 30 30 0a 6e 5f 74 61 72 67 65 74 | .n_source_samples.=.100.n_target |
| bea0 | 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 31 30 30 0a 74 68 65 74 61 20 3d 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 | _samples.=.100.theta.=.2.*.np.pi |
| bec0 | 20 2f 20 32 30 0a 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 65 6c 20 3d 20 30 2e 31 0a 0a 58 73 2c 20 79 73 20 | ./.20.noise_level.=.0.1..Xs,.ys. |
| bee0 | 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 0a | =.ot.datasets.get_data_classif(. |
| bf00 | 20 20 20 20 27 67 61 75 73 73 72 6f 74 27 2c 20 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 | ....'gaussrot',.n_source_samples |
| bf20 | 2c 20 6e 7a 3d 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 65 6c 29 0a 58 73 5f 6e 65 77 2c 20 5f 20 3d 20 6f 74 | ,.nz=noise_level).Xs_new,._.=.ot |
| bf40 | 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 0a 20 20 20 20 | .datasets.get_data_classif(..... |
| bf60 | 27 67 61 75 73 73 72 6f 74 27 2c 20 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 6e 7a | 'gaussrot',.n_source_samples,.nz |
| bf80 | 3d 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 65 6c 29 0a 58 74 2c 20 79 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 | =noise_level).Xt,.yt.=.ot.datase |
| bfa0 | 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 0a 20 20 20 20 27 67 61 75 73 73 72 | ts.get_data_classif(.....'gaussr |
| bfc0 | 6f 74 27 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 68 65 74 61 3d 74 68 65 | ot',.n_target_samples,.theta=the |
| bfe0 | 74 61 2c 20 6e 7a 3d 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 65 6c 29 0a 0a 23 20 6f 6e 65 20 6f 66 20 74 68 | ta,.nz=noise_level)..#.one.of.th |
| c000 | 65 20 74 61 72 67 65 74 20 6d 6f 64 65 20 63 68 61 6e 67 65 73 20 69 74 73 20 76 61 72 69 61 6e | e.target.mode.changes.its.varian |
| c020 | 63 65 20 28 6e 6f 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 29 0a 58 74 5b 79 74 20 3d 3d 20 | ce.(no.linear.mapping).Xt[yt.==. |
| c040 | 32 5d 20 2a 3d 20 33 0a 58 74 20 3d 20 58 74 20 2b 20 34 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | 2].*=.3.Xt.=.Xt.+.4..########### |
| c060 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| c080 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| c0a0 | 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e | ###.#.Plot.data.#.---------..pl. |
| c0c0 | 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 28 31 30 2c 20 35 29 29 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 70 6c 2e 73 | figure(1,.(10,.5)).pl.clf().pl.s |
| c0e0 | 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c | catter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys, |
| c100 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c | .marker='+',.label='Source.sampl |
| c120 | 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 | es').pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,. |
| c140 | 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 | 1],.c=yt,.marker='o',.label='Tar |
| c160 | 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 | get.samples').pl.legend(loc=0).p |
| c180 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 | l.title('Source.and.target.distr |
| c1a0 | 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ibutions')...################### |
| c1c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| c1e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 49 6e | ###########################.#.In |
| c200 | 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 | stantiate.the.different.transpor |
| c220 | 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d | t.algorithms.and.fit.them.#.---- |
| c240 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| c260 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 4d 61 70 70 69 | -----------------------..#.Mappi |
| c280 | 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6b 65 72 6e 65 6c 0a 6f | ngTransport.with.linear.kernel.o |
| c2a0 | 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 | t_mapping_linear.=.ot.da.Mapping |
| c2c0 | 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 0a 20 20 20 20 6b 65 72 6e 65 6c 3d 22 6c 69 6e 65 61 72 22 2c 20 | Transport(.....kernel="linear",. |
| c2e0 | 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 38 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 0a 20 20 20 | mu=1e0,.eta=1e-8,.bias=True,.... |
| c300 | 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 6f 74 5f | .max_iter=20,.verbose=True)..ot_ |
| c320 | 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 | mapping_linear.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt) |
| c340 | 0a 0a 23 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c | ..#.for.original.source.samples, |
| c360 | 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d | .transform.applies.barycentric.m |
| c380 | 61 70 70 69 6e 67 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 | apping.transp_Xs_linear.=.ot_map |
| c3a0 | 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 0a 23 20 | ping_linear.transform(Xs=Xs)..#. |
| c3c0 | 66 6f 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 | for.out.of.source.samples,.trans |
| c3e0 | 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 74 68 65 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 0a | form.applies.the.linear.mapping. |
| c400 | 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e | transp_Xs_linear_new.=.ot_mappin |
| c420 | 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 77 29 0a 0a 0a | g_linear.transform(Xs=Xs_new)... |
| c440 | 23 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 67 61 75 73 73 69 61 6e | #.MappingTransport.with.gaussian |
| c460 | 20 6b 65 72 6e 65 6c 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 | .kernel.ot_mapping_gaussian.=.ot |
| c480 | 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 0a 20 20 20 20 6b 65 72 6e 65 6c | .da.MappingTransport(.....kernel |
| c4a0 | 3d 22 67 61 75 73 73 69 61 6e 22 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 35 2c 20 6d 75 3d 31 65 2d 31 2c 20 | ="gaussian",.eta=1e-5,.mu=1e-1,. |
| c4c0 | 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 20 73 69 67 6d 61 3d 31 2c 0a 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 | bias=True,.sigma=1,.....max_iter |
| c4e0 | 3d 31 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 | =10,.verbose=True).ot_mapping_ga |
| c500 | 75 73 73 69 61 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 66 6f 72 20 | ussian.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)..#.for. |
| c520 | 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f | original.source.samples,.transfo |
| c540 | 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 0a 74 | rm.applies.barycentric.mapping.t |
| c560 | 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 | ransp_Xs_gaussian.=.ot_mapping_g |
| c580 | 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 0a 23 20 66 6f 72 20 | aussian.transform(Xs=Xs)..#.for. |
| c5a0 | 6f 75 74 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d | out.of.source.samples,.transform |
| c5c0 | 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 74 68 65 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 0a 74 72 | .applies.the.gaussian.mapping.tr |
| c5e0 | 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e | ansp_Xs_gaussian_new.=.ot_mappin |
| c600 | 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 77 29 0a | g_gaussian.transform(Xs=Xs_new). |
| c620 | 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ..############################## |
| c640 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| c660 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 | ################.#.Plot.transpor |
| c680 | 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ted.samples.#.------------------ |
| c6a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 70 6c | ------..pl.figure(2).pl.clf().pl |
| c6c0 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b | .subplot(2,.2,.1).pl.scatter(Xt[ |
| c6e0 | 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f | :,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o |
| c700 | 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 | ',............label='Target.samp |
| c720 | 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 | les',.alpha=.2).pl.scatter(trans |
| c740 | 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e | p_Xs_linear[:,.0],.transp_Xs_lin |
| c760 | 65 61 72 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 0a 20 20 20 | ear[:,.1],.c=ys,.marker='+',.... |
| c780 | 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4d 61 70 70 65 64 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d | ........label='Mapped.source.sam |
| c7a0 | 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 22 42 61 72 79 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 | ples').pl.title("Bary..mapping.( |
| c7c0 | 6c 69 6e 65 61 72 29 22 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 0a 70 6c 2e 73 | linear)").pl.legend(loc=0)..pl.s |
| c7e0 | 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c | ubplot(2,.2,.2).pl.scatter(Xt[:, |
| c800 | 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c | .0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o', |
| c820 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 | ............label='Target.sample |
| c840 | 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f | s',.alpha=.2).pl.scatter(transp_ |
| c860 | 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c | Xs_linear_new[:,.0],.transp_Xs_l |
| c880 | 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 63 3d 79 73 | inear_new[:,.1],............c=ys |
| c8a0 | 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 65 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 | ,.marker='+',.label='Learned.map |
| c8c0 | 70 69 6e 67 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 22 45 73 74 69 6d 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 | ping').pl.title("Estim..mapping. |
| c8e0 | 28 6c 69 6e 65 61 72 29 22 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 0a | (linear)")..pl.subplot(2,.2,.3). |
| c900 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 | pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c |
| c920 | 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 | =yt,.marker='o',............labe |
| c940 | 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 0a 70 6c | l='Target.samples',.alpha=.2).pl |
| c960 | 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5b 3a 2c 20 30 | .scatter(transp_Xs_gaussian[:,.0 |
| c980 | 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 | ],.transp_Xs_gaussian[:,.1],.c=y |
| c9a0 | 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d | s,............marker='+',.label= |
| c9c0 | 27 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | 'barycentric.mapping').pl.title( |
| c9e0 | 22 42 61 72 79 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6b 65 72 6e 65 6c 29 22 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 | "Bary..mapping.(kernel)")..pl.su |
| ca00 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 | bplot(2,.2,.4).pl.scatter(Xt[:,. |
| ca20 | 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a | 0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',. |
| ca40 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | ...........label='Target.samples |
| ca60 | 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 | ',.alpha=.2).pl.scatter(transp_X |
| ca80 | 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f | s_gaussian_new[:,.0],.transp_Xs_ |
| caa0 | 67 61 75 73 73 69 61 6e 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 | gaussian_new[:,.1],.c=ys,....... |
| cac0 | 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 65 61 72 6e 65 64 20 | .....marker='+',.label='Learned. |
| cae0 | 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 22 45 73 74 69 6d 2e 20 6d 61 70 70 69 | mapping').pl.title("Estim..mappi |
| cb00 | 6e 67 20 28 6b 65 72 6e 65 6c 29 22 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a | ng.(kernel)").pl.tight_layout(). |
| cb20 | 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b c9 85 61 a8 64 09 00 | .pl.show().PK.........o/K..a.d.. |
| cb40 | 00 64 09 00 00 21 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6d 70 | .d...!...auto_examples/plot_comp |
| cb60 | 75 74 65 5f 65 6d 64 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a | ute_emd.py#.-*-.coding:.utf-8.-* |
| cb80 | 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 50 6c 6f 74 20 6d 75 6c | -.""".=================.Plot.mul |
| cba0 | 74 69 70 6c 65 20 45 4d 44 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 53 68 6f | tiple.EMD.=================..Sho |
| cbc0 | 77 73 20 68 6f 77 20 74 6f 20 63 6f 6d 70 75 74 65 20 6d 75 6c 74 69 70 6c 65 20 45 4d 44 20 61 | ws.how.to.compute.multiple.EMD.a |
| cbe0 | 6e 64 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 77 69 74 68 20 74 77 6f 20 64 69 66 66 65 72 6e 74 0a 67 72 | nd.Sinkhorn.with.two.differnt.gr |
| cc00 | 6f 75 6e 64 20 6d 65 74 72 69 63 73 20 61 6e 64 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 69 72 20 76 61 6c 75 | ound.metrics.and.plot.their.valu |
| cc20 | 65 73 20 66 6f 72 20 64 69 66 66 65 65 6e 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 2e 0a 0a | es.for.diffeent.distributions... |
| cc40 | 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 | ."""..#.Author:.Remi.Flamary.<re |
| cc60 | 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 | mi.flamary@unice.fr>.#.#.License |
| cc80 | 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e | :.MIT.License..import.numpy.as.n |
| cca0 | 70 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a | p.import.matplotlib.pylab.as.pl. |
| ccc0 | 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0a 66 72 6f 6d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 20 69 6d 70 6f 72 | import.ot.from.ot.datasets.impor |
| cce0 | 74 20 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 20 61 73 20 67 61 75 73 73 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 | t.get_1D_gauss.as.gauss...###### |
| cd00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| cd20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| cd40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d | ########.#.Generate.data.#.----- |
| cd60 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 0a 0a 6e 20 3d 20 31 30 | --------..#%%.parameters..n.=.10 |
| cd80 | 30 20 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e 73 0a 6e 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 35 30 20 20 23 20 6e 62 | 0..#.nb.bins.n_target.=.50..#.nb |
| cda0 | 20 74 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 0a 0a 23 20 62 69 6e 20 70 6f | .target.distributions...#.bin.po |
| cdc0 | 73 69 74 69 6f 6e 73 0a 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e | sitions.x.=.np.arange(n,.dtype=n |
| cde0 | 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 0a 0a 6c 73 74 5f 6d 20 3d 20 6e 70 2e 6c 69 6e 73 70 61 63 65 28 | p.float64)..lst_m.=.np.linspace( |
| ce00 | 32 30 2c 20 39 30 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 29 0a 0a 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 | 20,.90,.n_target)..#.Gaussian.di |
| ce20 | 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 61 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 | stributions.a.=.gauss(n,.m=20,.s |
| ce40 | 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 0a 0a 42 20 3d 20 6e 70 2e 7a | =5)..#.m=.mean,.s=.std..B.=.np.z |
| ce60 | 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 29 29 0a 0a 66 6f 72 20 69 2c 20 6d 20 69 6e | eros((n,.n_target))..for.i,.m.in |
| ce80 | 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 6c 73 74 5f 6d 29 3a 0a 20 20 20 20 42 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d | .enumerate(lst_m):.....B[:,.i].= |
| cea0 | 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 6d 2c 20 73 3d 35 29 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 | .gauss(n,.m=m,.s=5)..#.loss.matr |
| cec0 | 69 78 20 61 6e 64 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 | ix.and.normalization.M.=.ot.dist |
| cee0 | 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e | (x.reshape((n,.1)),.x.reshape((n |
| cf00 | 2c 20 31 29 29 2c 20 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 | ,.1)),.'euclidean').M./=.M.max() |
| cf20 | 0a 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c | .M2.=.ot.dist(x.reshape((n,.1)), |
| cf40 | 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e | .x.reshape((n,.1)),.'sqeuclidean |
| cf60 | 27 29 0a 4d 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ').M2./=.M2.max()..############# |
| cf80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| cfa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| cfc0 | 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 70 | #.#.Plot.data.#.---------..#%%.p |
| cfe0 | 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 | lot.the.distributions..pl.figure |
| d000 | 28 31 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 | (1).pl.subplot(2,.1,.1).pl.plot( |
| d020 | 78 2c 20 61 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 73 74 72 69 62 | x,.a,.'b',.label='Source.distrib |
| d040 | 75 74 69 6f 6e 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 73 74 72 69 62 | ution').pl.title('Source.distrib |
| d060 | 75 74 69 6f 6e 27 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 70 | ution').pl.subplot(2,.1,.2).pl.p |
| d080 | 6c 6f 74 28 78 2c 20 42 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 | lot(x,.B,.label='Target.distribu |
| d0a0 | 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 | tions').pl.title('Target.distrib |
| d0c0 | 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 | utions').pl.tight_layout()...### |
| d0e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| d100 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| d120 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 45 4d 44 20 66 6f 72 20 74 68 | ###########.#.Compute.EMD.for.th |
| d140 | 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6c 6f 73 73 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | e.different.losses.#.----------- |
| d160 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 43 | -------------------------..#%%.C |
| d180 | 6f 6d 70 75 74 65 20 61 6e 64 20 70 6c 6f 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 61 6e | ompute.and.plot.distributions.an |
| d1a0 | 64 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 0a 64 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 32 28 61 | d.loss.matrix..d_emd.=.ot.emd2(a |
| d1c0 | 2c 20 42 2c 20 4d 29 20 20 23 20 64 69 72 65 63 74 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 | ,.B,.M)..#.direct.computation.of |
| d1e0 | 20 45 4d 44 0a 64 5f 65 6d 64 32 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 32 29 20 | .EMD.d_emd2.=.ot.emd2(a,.B,.M2). |
| d200 | 20 23 20 64 69 72 65 63 74 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 45 4d 44 20 77 69 74 | .#.direct.computation.of.EMD.wit |
| d220 | 68 20 6c 6f 73 73 20 4d 32 0a 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 | h.loss.M2...pl.figure(2).pl.plot |
| d240 | 28 64 5f 65 6d 64 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 27 29 0a 70 | (d_emd,.label='Euclidean.EMD').p |
| d260 | 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 6d 64 32 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 | l.plot(d_emd2,.label='Squared.Eu |
| d280 | 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 4d 44 20 64 69 73 74 | clidean.EMD').pl.title('EMD.dist |
| d2a0 | 61 6e 63 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ances').pl.legend()..########### |
| d2c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| d2e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| d300 | 23 23 23 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 | ###.#.Compute.Sinkhorn.for.the.d |
| d320 | 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6c 6f 73 73 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ifferent.losses.#.-------------- |
| d340 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 | ---------------------------..#%% |
| d360 | 0a 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 32 0a 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b | .reg.=.1e-2.d_sinkhorn.=.ot.sink |
| d380 | 68 6f 72 6e 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 29 0a 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 20 | horn2(a,.B,.M,.reg).d_sinkhorn2. |
| d3a0 | 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 32 2c 20 72 65 67 29 0a 0a 70 | =.ot.sinkhorn2(a,.B,.M2,.reg)..p |
| d3c0 | 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 | l.figure(2).pl.clf().pl.plot(d_e |
| d3e0 | 6d 64 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c | md,.label='Euclidean.EMD').pl.pl |
| d400 | 6f 74 28 64 5f 65 6d 64 32 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 | ot(d_emd2,.label='Squared.Euclid |
| d420 | 65 61 6e 20 45 4d 44 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 27 2b | ean.EMD').pl.plot(d_sinkhorn,.'+ |
| d440 | 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 0a 70 | ',.label='Euclidean.Sinkhorn').p |
| d460 | 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 2c 20 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | l.plot(d_sinkhorn2,.'+',.label=' |
| d480 | 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 0a 70 6c 2e | Squared.Euclidean.Sinkhorn').pl. |
| d4a0 | 74 69 74 6c 65 28 27 45 4d 44 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 | title('EMD.distances').pl.legend |
| d4c0 | 28 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b 99 da 74 4f | ()..pl.show().PK.........o/K..tO |
| d4e0 | 0d 0e 00 00 0d 0e 00 00 27 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f | ........'...auto_examples/plot_o |
| d500 | 74 64 61 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a | tda_color_images.py#.-*-.coding: |
| d520 | 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | .utf-8.-*-.""".================= |
| d540 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 4f 54 20 66 6f 72 20 69 6d 61 67 65 20 63 6f 6c 6f 72 20 | ============.OT.for.image.color. |
| d560 | 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | adaptation.===================== |
| d580 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 70 72 65 73 65 6e 74 73 20 | ========..This.example.presents. |
| d5a0 | 61 20 77 61 79 20 6f 66 20 74 72 61 6e 73 66 65 72 72 69 6e 67 20 63 6f 6c 6f 72 73 20 62 65 74 | a.way.of.transferring.colors.bet |
| d5c0 | 77 65 65 6e 20 74 77 6f 20 69 6d 61 67 65 0a 77 69 74 68 20 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 54 72 61 6e | ween.two.image.with.Optimal.Tran |
| d5e0 | 73 70 6f 72 74 20 61 73 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 64 20 69 6e 20 5b 36 5d 0a 0a 5b 36 5d 20 | sport.as.introduced.in.[6]..[6]. |
| d600 | 46 65 72 72 61 64 61 6e 73 2c 20 53 2e 2c 20 50 61 70 61 64 61 6b 69 73 2c 20 4e 2e 2c 20 50 65 | Ferradans,.S.,.Papadakis,.N.,.Pe |
| d620 | 79 72 65 2c 20 47 2e 2c 20 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 4a 2e 20 46 2e 20 28 32 30 31 34 29 2e 0a | yre,.G.,.&.Aujol,.J..F..(2014).. |
| d640 | 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 | Regularized.discrete.optimal.tra |
| d660 | 6e 73 70 6f 72 74 2e 0a 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c 20 6f 6e 20 49 6d 61 67 69 6e 67 20 | nsport..SIAM.Journal.on.Imaging. |
| d680 | 53 63 69 65 6e 63 65 73 2c 20 37 28 33 29 2c 20 31 38 35 33 2d 31 38 38 32 2e 0a 22 22 22 0a 0a | Sciences,.7(3),.1853-1882..""".. |
| d6a0 | 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c | #.Authors:.Remi.Flamary.<remi.fl |
| d6c0 | 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 | amary@unice.fr>.#..........Stani |
| d6e0 | 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c | slas.Chambon.<stan.chambon@gmail |
| d700 | 2e 63 6f 6d 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 0a 0a | .com>.#.#.License:.MIT.License.. |
| d720 | 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0a 66 72 6f 6d 20 73 63 69 70 79 20 69 6d | import.numpy.as.np.from.scipy.im |
| d740 | 70 6f 72 74 20 6e 64 69 6d 61 67 65 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 | port.ndimage.import.matplotlib.p |
| d760 | 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0a 0a 0a 72 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 | ylab.as.pl.import.ot...r.=.np.ra |
| d780 | 6e 64 6f 6d 2e 52 61 6e 64 6f 6d 53 74 61 74 65 28 34 32 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 69 6d 32 6d 61 | ndom.RandomState(42)...def.im2ma |
| d7a0 | 74 28 49 29 3a 0a 20 20 20 20 22 22 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 61 6e 64 20 69 6d 61 67 65 20 | t(I):....."""Converts.and.image. |
| d7c0 | 74 6f 20 6d 61 74 72 69 78 20 28 6f 6e 65 20 70 69 78 65 6c 20 70 65 72 20 6c 69 6e 65 29 22 22 | to.matrix.(one.pixel.per.line)"" |
| d7e0 | 22 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 49 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 49 2e 73 68 61 70 65 5b | ".....return.I.reshape((I.shape[ |
| d800 | 30 5d 20 2a 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 32 5d 29 29 0a 0a 0a | 0].*.I.shape[1],.I.shape[2]))... |
| d820 | 64 65 66 20 6d 61 74 32 69 6d 28 58 2c 20 73 68 61 70 65 29 3a 0a 20 20 20 20 22 22 22 43 6f 6e | def.mat2im(X,.shape):....."""Con |
| d840 | 76 65 72 74 73 20 62 61 63 6b 20 61 20 6d 61 74 72 69 78 20 74 6f 20 61 6e 20 69 6d 61 67 65 22 | verts.back.a.matrix.to.an.image" |
| d860 | 22 22 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 58 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 73 68 61 70 65 29 0a 0a | "".....return.X.reshape(shape).. |
| d880 | 0a 64 65 66 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 49 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 63 6c | .def.minmax(I):.....return.np.cl |
| d8a0 | 69 70 28 49 2c 20 30 2c 20 31 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ip(I,.0,.1)...################## |
| d8c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| d8e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 47 | ############################.#.G |
| d900 | 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 | enerate.data.#.-------------..#. |
| d920 | 4c 6f 61 64 69 6e 67 20 69 6d 61 67 65 73 0a 49 31 20 3d 20 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 | Loading.images.I1.=.ndimage.imre |
| d940 | 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 64 61 79 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 | ad('../data/ocean_day.jpg').asty |
| d960 | 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 0a 49 32 20 3d 20 6e 64 69 6d 61 67 | pe(np.float64)./.256.I2.=.ndimag |
| d980 | 65 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 73 75 6e 73 65 74 2e 6a | e.imread('../data/ocean_sunset.j |
| d9a0 | 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 0a 0a 58 | pg').astype(np.float64)./.256..X |
| d9c0 | 31 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 31 29 0a 58 32 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 32 29 0a 0a | 1.=.im2mat(I1).X2.=.im2mat(I2).. |
| d9e0 | 23 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 6e 62 20 3d 20 31 30 30 30 0a 69 64 78 | #.training.samples.nb.=.1000.idx |
| da00 | 31 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 31 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d | 1.=.r.randint(X1.shape[0],.size= |
| da20 | 28 6e 62 2c 29 29 0a 69 64 78 32 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 32 2e 73 68 61 70 65 | (nb,)).idx2.=.r.randint(X2.shape |
| da40 | 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 0a 0a 58 73 20 3d 20 58 31 5b 69 64 78 31 2c 20 | [0],.size=(nb,))..Xs.=.X1[idx1,. |
| da60 | 3a 5d 0a 58 74 20 3d 20 58 32 5b 69 64 78 32 2c 20 3a 5d 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | :].Xt.=.X2[idx2,.:]...########## |
| da80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| daa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| dac0 | 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 69 6d 61 67 65 0a 23 20 2d 2d 2d | ####.#.Plot.original.image.#.--- |
| dae0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 | ----------------..pl.figure(1,.f |
| db00 | 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 | igsize=(6.4,.3))..pl.subplot(1,. |
| db20 | 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 | 2,.1).pl.imshow(I1).pl.axis('off |
| db40 | 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | ').pl.title('Image.1')..pl.subpl |
| db60 | 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 | ot(1,.2,.2).pl.imshow(I2).pl.axi |
| db80 | 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 0a 0a 23 | s('off').pl.title('Image.2')...# |
| dba0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| dbc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| dbe0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 63 61 74 74 65 72 20 70 6c 6f 74 20 6f 66 20 | #############.#.Scatter.plot.of. |
| dc00 | 63 6f 6c 6f 72 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a | colors.#.----------------------. |
| dc20 | 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 0a | .pl.figure(2,.figsize=(6.4,.3)). |
| dc40 | 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 | .pl.subplot(1,.2,.1).pl.scatter( |
| dc60 | 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 73 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 | Xs[:,.0],.Xs[:,.2],.c=Xs).pl.axi |
| dc80 | 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 | s([0,.1,.0,.1]).pl.xlabel('Red') |
| dca0 | 0a 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 | .pl.ylabel('Blue').pl.title('Ima |
| dcc0 | 67 65 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 | ge.1')..pl.subplot(1,.2,.2).pl.s |
| dce0 | 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 74 29 | catter(Xt[:,.0],.Xt[:,.2],.c=Xt) |
| dd00 | 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c | .pl.axis([0,.1,.0,.1]).pl.xlabel |
| dd20 | 28 27 52 65 64 27 29 0a 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 | ('Red').pl.ylabel('Blue').pl.tit |
| dd40 | 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a | le('Image.2').pl.tight_layout(). |
| dd60 | 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ..############################## |
| dd80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| dda0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 | ################.#.Instantiate.t |
| ddc0 | 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d | he.different.transport.algorithm |
| dde0 | 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | s.and.fit.them.#.--------------- |
| de00 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| de20 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f | ------------..#.EMDTransport.ot_ |
| de40 | 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 0a 6f 74 5f 65 6d | emd.=.ot.da.EMDTransport().ot_em |
| de60 | 64 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 | d.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)..#.SinkhornT |
| de80 | 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e | ransport.ot_sinkhorn.=.ot.da.Sin |
| dea0 | 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 0a 6f 74 5f 73 69 | khornTransport(reg_e=1e-1).ot_si |
| dec0 | 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 70 72 65 64 | nkhorn.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)..#.pred |
| dee0 | 69 63 74 69 6f 6e 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 69 6d 61 67 65 73 20 28 75 73 69 6e 67 20 6f 75 74 | iction.between.images.(using.out |
| df00 | 20 6f 66 20 73 61 6d 70 6c 65 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e 20 61 73 20 69 6e 20 5b 36 5d 29 | .of.sample.prediction.as.in.[6]) |
| df20 | 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 | .transp_Xs_emd.=.ot_emd.transfor |
| df40 | 6d 28 58 73 3d 58 31 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e | m(Xs=X1).transp_Xt_emd.=.ot_emd. |
| df60 | 69 6e 76 65 72 73 65 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 74 3d 58 32 29 0a 0a 74 72 61 6e 73 70 | inverse_transform(Xt=X2)..transp |
| df80 | 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 | _Xs_sinkhorn.=.ot_emd.transform( |
| dfa0 | 58 73 3d 58 31 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 65 | Xs=X1).transp_Xt_sinkhorn.=.ot_e |
| dfc0 | 6d 64 2e 69 6e 76 65 72 73 65 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 74 3d 58 32 29 0a 0a 49 31 74 | md.inverse_transform(Xt=X2)..I1t |
| dfe0 | 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 2c 20 | .=.minmax(mat2im(transp_Xs_emd,. |
| e000 | 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 49 32 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 | I1.shape)).I2t.=.minmax(mat2im(t |
| e020 | 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 65 6d 64 2c 20 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 49 31 74 65 20 3d | ransp_Xt_emd,.I2.shape))..I1te.= |
| e040 | 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 | .minmax(mat2im(transp_Xs_sinkhor |
| e060 | 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 49 32 74 65 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 | n,.I1.shape)).I2te.=.minmax(mat2 |
| e080 | 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 | im(transp_Xt_sinkhorn,.I2.shape) |
| e0a0 | 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | )...############################ |
| e0c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| e0e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 6e 65 77 20 69 6d | ##################.#.Plot.new.im |
| e100 | 61 67 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 | ages.#.---------------..pl.figur |
| e120 | 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | e(3,.figsize=(8,.4))..pl.subplot |
| e140 | 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 | (2,.3,.1).pl.imshow(I1).pl.axis( |
| e160 | 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 | 'off').pl.title('Image.1')..pl.s |
| e180 | 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 29 0a 70 | ubplot(2,.3,.2).pl.imshow(I1t).p |
| e1a0 | 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 | l.axis('off').pl.title('Image.1. |
| e1c0 | 41 64 61 70 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e | Adapt')..pl.subplot(2,.3,.3).pl. |
| e1e0 | 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 65 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 | imshow(I1te).pl.axis('off').pl.t |
| e200 | 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 0a 0a 70 6c 2e | itle('Image.1.Adapt.(reg)')..pl. |
| e220 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 0a 70 | subplot(2,.3,.4).pl.imshow(I2).p |
| e240 | 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 | l.axis('off').pl.title('Image.2' |
| e260 | 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 | )..pl.subplot(2,.3,.5).pl.imshow |
| e280 | 28 49 32 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 | (I2t).pl.axis('off').pl.title('I |
| e2a0 | 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c | mage.2.Adapt')..pl.subplot(2,.3, |
| e2c0 | 20 36 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 65 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 | .6).pl.imshow(I2te).pl.axis('off |
| e2e0 | 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 | ').pl.title('Image.2.Adapt.(reg) |
| e300 | 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a | ').pl.tight_layout()..pl.show(). |
| e320 | 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b fc f7 6b 6f da 09 00 00 da 09 00 00 1c 00 00 00 | PK...........o/K..ko............ |
| e340 | 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 00 00 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 | ..............auto_examples/plot |
| e360 | 5f 67 72 6f 6d 6f 76 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b a4 4f 47 3f 0c 0c | _gromov.pyPK...........o/K.OG?.. |
| e380 | 00 00 0c 0c 00 00 19 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 14 0a 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 | ........................auto_exa |
| e3a0 | 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 57 44 41 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f | mples/plot_WDA.pyPK...........o/ |
| e3c0 | 4b 8b 89 17 b5 91 1c 00 00 91 1c 00 00 27 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 57 16 00 00 61 | K............'.............W...a |
| e3e0 | 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 6e | uto_examples/plot_gromov_barycen |
| e400 | 74 65 72 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b 7e 83 d4 f9 6e 0b 00 00 6e 0b | ter.pyPK...........o/K~...n...n. |
| e420 | 00 00 21 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 2d 33 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 | ..!.............-3..auto_example |
| e440 | 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 70 74 69 6d 5f 4f 54 72 65 67 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 | s/plot_optim_OTreg.pyPK......... |
| e460 | 00 09 6f 2f 4b 3b 5a 71 cf fc 14 00 00 fc 14 00 00 1d 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 da | ..o/K;Zq........................ |
| e480 | 3e 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 64 32 2e 70 79 | >..auto_examples/plot_otda_d2.py |
| e4a0 | 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b 0a ea dc a4 21 12 00 00 21 12 00 00 2a 00 00 00 | PK...........o/K....!...!...*... |
| e4c0 | 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 11 54 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 | ...........T..auto_examples/plot |
| e4e0 | 5f 6f 74 64 61 5f 73 65 6d 69 5f 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 | _otda_semi_supervised.pyPK...... |
| e500 | 00 00 00 00 09 6f 2f 4b ad 47 e9 fa 92 06 00 00 92 06 00 00 1b 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 | .....o/K.G...................... |
| e520 | b4 81 7a 66 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 2e 70 | ..zf..auto_examples/plot_OT_1D.p |
| e540 | 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b 0c f2 34 0e 5a 0e 00 00 5a 0e 00 00 23 00 00 | yPK...........o/K..4.Z...Z...#.. |
| e560 | 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 45 6d 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f | ...........Em..auto_examples/plo |
| e580 | 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 31 44 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 09 6f | t_barycenter_1D.pyPK...........o |
| e5a0 | 2f 4b 60 f3 2a fb 00 11 00 00 00 11 00 00 22 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 e0 7b 00 00 | /K`.*........."..............{.. |
| e5c0 | 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6c 61 73 73 65 73 2e | auto_examples/plot_otda_classes. |
| e5e0 | 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b 1a d1 23 82 4f 10 00 00 4f 10 00 00 30 00 | pyPK...........o/K..#.O...O...0. |
| e600 | 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 20 8d 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c | ................auto_examples/pl |
| e620 | 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 63 6f 6c 6f 72 73 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 70 79 | ot_otda_mapping_colors_images.py |
| e640 | 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b 37 2c 8d 0c 79 13 00 00 79 13 00 00 21 00 00 00 | PK...........o/K7,..y...y...!... |
| e660 | 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 bd 9d 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 | ..............auto_examples/plot |
| e680 | 5f 4f 54 5f 4c 31 5f 76 73 5f 4c 32 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b 8c | _OT_L1_vs_L2.pyPK...........o/K. |
| e6a0 | 4d bd 60 44 09 00 00 44 09 00 00 23 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 75 b1 00 00 61 75 74 | M.`D...D...#.............u...aut |
| e6c0 | 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2e 70 79 | o_examples/plot_OT_2D_samples.py |
| e6e0 | 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b 6f e7 38 bd f1 0f 00 00 f1 0f 00 00 22 00 00 00 | PK...........o/Ko.8........."... |
| e700 | 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 fa ba 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 | ..............auto_examples/plot |
| e720 | 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b | _otda_mapping.pyPK...........o/K |
| e740 | c9 85 61 a8 64 09 00 00 64 09 00 00 21 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 2b cb 00 00 61 75 | ..a.d...d...!.............+...au |
| e760 | 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6d 70 75 74 65 5f 65 6d 64 2e 70 79 50 | to_examples/plot_compute_emd.pyP |
| e780 | 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 09 6f 2f 4b 99 da 74 4f 0d 0e 00 00 0d 0e 00 00 27 00 00 00 00 | K...........o/K..tO........'.... |
| e7a0 | 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 ce d4 00 00 61 75 74 6f 5f 65 78 61 6d 70 6c 65 73 2f 70 6c 6f 74 5f | .............auto_examples/plot_ |
| e7c0 | 6f 74 64 61 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 70 79 50 4b 05 06 00 00 00 00 0f 00 0f 00 | otda_color_images.pyPK.......... |
| e7e0 | b4 04 00 00 20 e3 00 00 00 00 | .......... |
 |
index : debian-python-pot | |
| Debian package for POT. | gspr@nonempty.org |
| summaryrefslogtreecommitdiff |
blob: aa06bb641b83ae9a56a82d983ca9b9b95677edd1 (plain)