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| 18e0 | 61 6c 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 66 6f 72 20 73 74 72 75 63 74 75 72 65 64 20 64 61 74 61 | al.Transport.for.structured.data |
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| 1920 | 20 49 6e 74 65 72 6e 61 74 69 6f 6e 61 6c 20 43 6f 6e 66 65 72 65 6e 63 65 20 6f 6e 20 4d 61 63 | .International.Conference.on.Mac |
| 1940 | 68 69 6e 65 20 4c 65 61 72 6e 69 6e 67 20 28 49 43 4d 4c 29 2e 20 32 30 31 39 2e 0a 0a 22 22 22 | hine.Learning.(ICML)..2019...""" |
| 1960 | 0a 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 54 69 74 6f 75 61 6e 20 56 61 79 65 72 20 3c 74 69 74 6f 75 | ..#.Author:.Titouan.Vayer.<titou |
| 1980 | 61 6e 2e 76 61 79 65 72 40 69 72 69 73 61 2e 66 72 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 | an.vayer@irisa.fr>.#.#.License:. |
| 19a0 | 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 0a 0a 23 25 25 20 6c 6f 61 64 20 6c 69 62 72 61 72 69 65 73 0a | MIT.License..#%%.load.libraries. |
| 19c0 | 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f | import.numpy.as.np.import.matplo |
| 19e0 | 74 6c 69 62 2e 70 79 70 6c 6f 74 20 61 73 20 70 6c 74 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 65 74 77 6f 72 | tlib.pyplot.as.plt.import.networ |
| 1a00 | 6b 78 20 61 73 20 6e 78 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 68 0a 66 72 6f 6d 20 73 63 69 70 79 2e | kx.as.nx.import.math.from.scipy. |
| 1a20 | 73 70 61 72 73 65 2e 63 73 67 72 61 70 68 20 69 6d 70 6f 72 74 20 73 68 6f 72 74 65 73 74 5f 70 | sparse.csgraph.import.shortest_p |
| 1a40 | 61 74 68 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 63 6f 6c 6f 72 73 20 61 73 20 | ath.import.matplotlib.colors.as. |
| 1a60 | 6d 63 6f 6c 0a 66 72 6f 6d 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 20 69 6d 70 6f 72 74 20 63 6d 0a 66 | mcol.from.matplotlib.import.cm.f |
| 1a80 | 72 6f 6d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 20 69 6d 70 6f 72 74 20 66 67 77 5f 62 61 72 79 63 65 6e | rom.ot.gromov.import.fgw_barycen |
| 1aa0 | 74 65 72 73 0a 23 25 25 20 47 72 61 70 68 20 66 75 6e 63 74 69 6f 6e 73 0a 0a 0a 64 65 66 20 66 | ters.#%%.Graph.functions...def.f |
| 1ac0 | 69 6e 64 5f 74 68 72 65 73 68 28 43 2c 20 69 6e 66 3d 30 2e 35 2c 20 73 75 70 3d 33 2c 20 73 74 | ind_thresh(C,.inf=0.5,.sup=3,.st |
| 1ae0 | 65 70 3d 31 30 29 3a 0a 20 20 20 20 22 22 22 20 54 72 69 63 6b 20 74 6f 20 66 69 6e 64 20 74 68 | ep=10):.....""".Trick.to.find.th |
| 1b00 | 65 20 61 64 65 71 75 61 74 65 20 74 68 72 65 73 68 6f 6c 64 73 20 66 72 6f 6d 20 77 68 65 72 65 | e.adequate.thresholds.from.where |
| 1b20 | 20 76 61 6c 75 65 20 6f 66 20 74 68 65 20 43 20 6d 61 74 72 69 78 20 61 72 65 20 63 6f 6e 73 69 | .value.of.the.C.matrix.are.consi |
| 1b40 | 64 65 72 65 64 20 63 6c 6f 73 65 20 65 6e 6f 75 67 68 20 74 6f 20 73 61 79 20 74 68 61 74 20 6e | dered.close.enough.to.say.that.n |
| 1b60 | 6f 64 65 73 20 61 72 65 20 63 6f 6e 6e 65 63 74 65 64 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 54 74 68 65 20 | odes.are.connected.........Tthe. |
| 1b80 | 74 68 72 65 73 68 6f 6c 64 20 69 73 20 66 6f 75 6e 64 20 62 79 20 61 20 6c 69 6e 65 73 65 61 72 | threshold.is.found.by.a.linesear |
| 1ba0 | 63 68 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 76 61 6c 75 65 73 20 22 69 6e 66 22 20 61 6e 64 20 22 73 75 70 | ch.between.values."inf".and."sup |
| 1bc0 | 22 20 77 69 74 68 20 22 73 74 65 70 22 20 74 68 72 65 73 68 6f 6c 64 73 20 74 65 73 74 65 64 2e | ".with."step".thresholds.tested. |
| 1be0 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 68 72 65 73 68 6f 6c 64 20 69 | .........The.optimal.threshold.i |
| 1c00 | 73 20 74 68 65 20 6f 6e 65 20 77 68 69 63 68 20 6d 69 6e 69 6d 69 7a 65 73 20 74 68 65 20 72 65 | s.the.one.which.minimizes.the.re |
| 1c20 | 63 6f 6e 73 74 72 75 63 74 69 6f 6e 20 65 72 72 6f 72 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 74 68 65 20 73 | construction.error.between.the.s |
| 1c40 | 68 6f 72 74 65 73 74 5f 70 61 74 68 20 6d 61 74 72 69 78 20 63 6f 6d 69 6e 67 20 66 72 6f 6d 20 | hortest_path.matrix.coming.from. |
| 1c60 | 74 68 65 20 74 68 72 65 73 68 6f 6c 64 65 64 20 61 64 6a 65 6e 63 79 20 6d 61 74 72 69 78 0a 20 | the.thresholded.adjency.matrix.. |
| 1c80 | 20 20 20 20 20 20 20 61 6e 64 20 74 68 65 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 6d 61 74 72 69 78 2e 0a | .......and.the.original.matrix.. |
| 1ca0 | 20 20 20 20 50 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 0a 20 20 20 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 20 20 | ....Parameters.....----------... |
| 1cc0 | 20 20 43 20 3a 20 6e 64 61 72 72 61 79 2c 20 73 68 61 70 65 20 28 6e 5f 6e 6f 64 65 73 2c 6e 5f | ..C.:.ndarray,.shape.(n_nodes,n_ |
| 1ce0 | 6e 6f 64 65 73 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 73 74 72 75 63 74 75 72 65 | nodes).............The.structure |
| 1d00 | 20 6d 61 74 72 69 78 20 74 6f 20 74 68 72 65 73 68 6f 6c 64 0a 20 20 20 20 69 6e 66 20 3a 20 66 | .matrix.to.threshold.....inf.:.f |
| 1d20 | 6c 6f 61 74 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 62 65 67 69 6e 6e 69 6e 67 20 6f 66 20 | loat...........The.beginning.of. |
| 1d40 | 74 68 65 20 6c 69 6e 65 73 65 61 72 63 68 0a 20 20 20 20 73 75 70 20 3a 20 66 6c 6f 61 74 0a 20 | the.linesearch.....sup.:.float.. |
| 1d60 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 65 6e 64 20 6f 66 20 74 68 65 20 6c 69 6e 65 73 65 61 72 | .........The.end.of.the.linesear |
| 1d80 | 63 68 0a 20 20 20 20 73 74 65 70 20 3a 20 69 6e 74 65 67 65 72 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ch.....step.:.integer........... |
| 1da0 | 20 20 4e 75 6d 62 65 72 20 6f 66 20 74 68 72 65 73 68 6f 6c 64 73 20 74 65 73 74 65 64 0a 20 20 | ..Number.of.thresholds.tested... |
| 1dc0 | 20 20 22 22 22 0a 20 20 20 20 64 69 73 74 20 3d 20 5b 5d 0a 20 20 20 20 73 65 61 72 63 68 20 3d | ..""".....dist.=.[].....search.= |
| 1de0 | 20 6e 70 2e 6c 69 6e 73 70 61 63 65 28 69 6e 66 2c 20 73 75 70 2c 20 73 74 65 70 29 0a 20 20 20 | .np.linspace(inf,.sup,.step).... |
| 1e00 | 20 66 6f 72 20 74 68 72 65 73 68 20 69 6e 20 73 65 61 72 63 68 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 43 | .for.thresh.in.search:.........C |
| 1e20 | 70 72 69 6d 65 20 3d 20 73 70 5f 74 6f 5f 61 64 6a 65 6e 63 79 28 43 2c 20 30 2c 20 74 68 72 65 | prime.=.sp_to_adjency(C,.0,.thre |
| 1e40 | 73 68 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 53 43 20 3d 20 73 68 6f 72 74 65 73 74 5f 70 61 74 68 28 43 | sh).........SC.=.shortest_path(C |
| 1e60 | 70 72 69 6d 65 2c 20 6d 65 74 68 6f 64 3d 27 44 27 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 53 43 5b 53 43 | prime,.method='D').........SC[SC |
| 1e80 | 20 3d 3d 20 66 6c 6f 61 74 28 27 69 6e 66 27 29 5d 20 3d 20 31 30 30 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 | .==.float('inf')].=.100......... |
| 1ea0 | 64 69 73 74 2e 61 70 70 65 6e 64 28 6e 70 2e 6c 69 6e 61 6c 67 2e 6e 6f 72 6d 28 53 43 20 2d 20 | dist.append(np.linalg.norm(SC.-. |
| 1ec0 | 43 29 29 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 73 65 61 72 63 68 5b 6e 70 2e 61 72 67 6d 69 6e 28 | C)).....return.search[np.argmin( |
| 1ee0 | 64 69 73 74 29 5d 2c 20 64 69 73 74 0a 0a 0a 64 65 66 20 73 70 5f 74 6f 5f 61 64 6a 65 6e 63 79 | dist)],.dist...def.sp_to_adjency |
| 1f00 | 28 43 2c 20 74 68 72 65 73 68 69 6e 66 3d 30 2e 32 2c 20 74 68 72 65 73 68 73 75 70 3d 31 2e 38 | (C,.threshinf=0.2,.threshsup=1.8 |
| 1f20 | 29 3a 0a 20 20 20 20 22 22 22 20 54 68 72 65 73 68 6f 6c 64 73 20 74 68 65 20 73 74 72 75 63 74 | ):.....""".Thresholds.the.struct |
| 1f40 | 75 72 65 20 6d 61 74 72 69 78 20 69 6e 20 6f 72 64 65 72 20 74 6f 20 63 6f 6d 70 75 74 65 20 61 | ure.matrix.in.order.to.compute.a |
| 1f60 | 6e 20 61 64 6a 65 6e 63 79 20 6d 61 74 72 69 78 2e 0a 20 20 20 20 41 6c 6c 20 76 61 6c 75 65 73 | n.adjency.matrix......All.values |
| 1f80 | 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 74 68 72 65 73 68 69 6e 66 20 61 6e 64 20 74 68 72 65 73 68 73 75 70 | .between.threshinf.and.threshsup |
| 1fa0 | 20 61 72 65 20 63 6f 6e 73 69 64 65 72 65 64 20 72 65 70 72 65 73 65 6e 74 69 6e 67 20 63 6f 6e | .are.considered.representing.con |
| 1fc0 | 6e 65 63 74 65 64 20 6e 6f 64 65 73 20 61 6e 64 20 73 65 74 20 74 6f 20 31 2e 20 45 6c 73 65 20 | nected.nodes.and.set.to.1..Else. |
| 1fe0 | 61 72 65 20 73 65 74 20 74 6f 20 30 0a 20 20 20 20 50 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 0a 20 20 20 20 | are.set.to.0.....Parameters..... |
| 2000 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 20 20 20 20 43 20 3a 20 6e 64 61 72 72 61 79 2c 20 73 68 61 70 | ----------.....C.:.ndarray,.shap |
| 2020 | 65 20 28 6e 5f 6e 6f 64 65 73 2c 6e 5f 6e 6f 64 65 73 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 | e.(n_nodes,n_nodes).........The. |
| 2040 | 73 74 72 75 63 74 75 72 65 20 6d 61 74 72 69 78 20 74 6f 20 74 68 72 65 73 68 6f 6c 64 0a 20 20 | structure.matrix.to.threshold... |
| 2060 | 20 20 74 68 72 65 73 68 69 6e 66 20 3a 20 66 6c 6f 61 74 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 | ..threshinf.:.float.........The. |
| 2080 | 6d 69 6e 69 6d 75 6d 20 76 61 6c 75 65 20 6f 66 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 20 66 72 6f 6d 20 77 | minimum.value.of.distance.from.w |
| 20a0 | 68 69 63 68 20 74 68 65 20 6e 65 77 20 76 61 6c 75 65 20 69 73 20 73 65 74 20 74 6f 20 31 0a 20 | hich.the.new.value.is.set.to.1.. |
| 20c0 | 20 20 20 74 68 72 65 73 68 73 75 70 20 3a 20 66 6c 6f 61 74 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 | ...threshsup.:.float.........The |
| 20e0 | 20 6d 61 78 69 6d 75 6d 20 76 61 6c 75 65 20 6f 66 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 20 66 72 6f 6d 20 | .maximum.value.of.distance.from. |
| 2100 | 77 68 69 63 68 20 74 68 65 20 6e 65 77 20 76 61 6c 75 65 20 69 73 20 73 65 74 20 74 6f 20 31 0a | which.the.new.value.is.set.to.1. |
| 2120 | 20 20 20 20 52 65 74 75 72 6e 73 0a 20 20 20 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 20 20 20 20 43 20 3a 20 | ....Returns.....-------.....C.:. |
| 2140 | 6e 64 61 72 72 61 79 2c 20 73 68 61 70 65 20 28 6e 5f 6e 6f 64 65 73 2c 6e 5f 6e 6f 64 65 73 29 | ndarray,.shape.(n_nodes,n_nodes) |
| 2160 | 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 54 68 65 20 74 68 72 65 73 68 6f 6c 64 20 6d 61 74 72 69 78 2e 20 45 | .........The.threshold.matrix..E |
| 2180 | 61 63 68 20 65 6c 65 6d 65 6e 74 20 69 73 20 69 6e 20 7b 30 2c 31 7d 0a 20 20 20 20 22 22 22 0a | ach.element.is.in.{0,1}.....""". |
| 21a0 | 20 20 20 20 48 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 5f 6c 69 6b 65 28 43 29 0a 20 20 20 20 6e 70 2e | ....H.=.np.zeros_like(C).....np. |
| 21c0 | 66 69 6c 6c 5f 64 69 61 67 6f 6e 61 6c 28 48 2c 20 6e 70 2e 64 69 61 67 6f 6e 61 6c 28 43 29 29 | fill_diagonal(H,.np.diagonal(C)) |
| 21e0 | 0a 20 20 20 20 43 20 3d 20 43 20 2d 20 48 0a 20 20 20 20 43 20 3d 20 6e 70 2e 6d 69 6e 69 6d 75 | .....C.=.C.-.H.....C.=.np.minimu |
| 2200 | 6d 28 6e 70 2e 6d 61 78 69 6d 75 6d 28 43 2c 20 74 68 72 65 73 68 69 6e 66 29 2c 20 74 68 72 65 | m(np.maximum(C,.threshinf),.thre |
| 2220 | 73 68 73 75 70 29 0a 20 20 20 20 43 5b 43 20 3d 3d 20 74 68 72 65 73 68 73 75 70 5d 20 3d 20 30 | shsup).....C[C.==.threshsup].=.0 |
| 2240 | 0a 20 20 20 20 43 5b 43 20 21 3d 20 30 5d 20 3d 20 31 0a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 43 | .....C[C.!=.0].=.1......return.C |
| 2260 | 0a 0a 0a 64 65 66 20 62 75 69 6c 64 5f 6e 6f 69 73 79 5f 63 69 72 63 75 6c 61 72 5f 67 72 61 70 | ...def.build_noisy_circular_grap |
| 2280 | 68 28 4e 3d 32 30 2c 20 6d 75 3d 30 2c 20 73 69 67 6d 61 3d 30 2e 33 2c 20 77 69 74 68 5f 6e 6f | h(N=20,.mu=0,.sigma=0.3,.with_no |
| 22a0 | 69 73 65 3d 46 61 6c 73 65 2c 20 73 74 72 75 63 74 75 72 65 5f 6e 6f 69 73 65 3d 46 61 6c 73 65 | ise=False,.structure_noise=False |
| 22c0 | 2c 20 70 3d 4e 6f 6e 65 29 3a 0a 20 20 20 20 22 22 22 20 43 72 65 61 74 65 20 61 20 6e 6f 69 73 | ,.p=None):.....""".Create.a.nois |
| 22e0 | 79 20 63 69 72 63 75 6c 61 72 20 67 72 61 70 68 0a 20 20 20 20 22 22 22 0a 20 20 20 20 67 20 3d | y.circular.graph.....""".....g.= |
| 2300 | 20 6e 78 2e 47 72 61 70 68 28 29 0a 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 6e 6f 64 65 73 5f 66 72 6f 6d | .nx.Graph().....g.add_nodes_from |
| 2320 | 28 6c 69 73 74 28 72 61 6e 67 65 28 4e 29 29 29 0a 20 20 20 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 | (list(range(N))).....for.i.in.ra |
| 2340 | 6e 67 65 28 4e 29 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 6f 69 73 65 20 3d 20 66 6c 6f 61 74 28 6e 70 | nge(N):.........noise.=.float(np |
| 2360 | 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 6e 6f 72 6d 61 6c 28 6d 75 2c 20 73 69 67 6d 61 2c 20 31 29 29 0a 20 20 | .random.normal(mu,.sigma,.1))... |
| 2380 | 20 20 20 20 20 20 69 66 20 77 69 74 68 5f 6e 6f 69 73 65 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ......if.with_noise:............ |
| 23a0 | 20 67 2e 61 64 64 5f 6e 6f 64 65 28 69 2c 20 61 74 74 72 5f 6e 61 6d 65 3d 6d 61 74 68 2e 73 69 | .g.add_node(i,.attr_name=math.si |
| 23c0 | 6e 28 28 32 20 2a 20 69 20 2a 20 6d 61 74 68 2e 70 69 20 2f 20 4e 29 29 20 2b 20 6e 6f 69 73 65 | n((2.*.i.*.math.pi./.N)).+.noise |
| 23e0 | 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 | ).........else:.............g.ad |
| 2400 | 64 5f 6e 6f 64 65 28 69 2c 20 61 74 74 72 5f 6e 61 6d 65 3d 6d 61 74 68 2e 73 69 6e 28 32 20 2a | d_node(i,.attr_name=math.sin(2.* |
| 2420 | 20 69 20 2a 20 6d 61 74 68 2e 70 69 20 2f 20 4e 29 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 | .i.*.math.pi./.N)).........g.add |
| 2440 | 5f 65 64 67 65 28 69 2c 20 69 20 2b 20 31 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 73 74 72 75 63 | _edge(i,.i.+.1).........if.struc |
| 2460 | 74 75 72 65 5f 6e 6f 69 73 65 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 72 61 6e 64 6f 6d 69 6e | ture_noise:.............randomin |
| 2480 | 74 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 30 2c 20 70 29 0a 20 20 20 20 | t.=.np.random.randint(0,.p)..... |
| 24a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 72 61 6e 64 6f 6d 69 6e 74 20 3d 3d 20 30 3a 0a 20 20 20 20 20 | ........if.randomint.==.0:...... |
| 24c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 69 20 3c 3d 20 4e 20 2d 20 33 3a 0a 20 20 20 20 20 20 | ...........if.i.<=.N.-.3:....... |
| 24e0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 65 64 67 65 28 69 2c 20 69 20 2b 20 | ..............g.add_edge(i,.i.+. |
| 2500 | 32 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 69 20 3d 3d 20 4e 20 2d 20 32 | 2).................if.i.==.N.-.2 |
| 2520 | 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 65 64 67 65 | :.....................g.add_edge |
| 2540 | 28 69 2c 20 30 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 69 66 20 69 20 3d 3d 20 4e | (i,.0).................if.i.==.N |
| 2560 | 20 2d 20 31 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f | .-.1:.....................g.add_ |
| 2580 | 65 64 67 65 28 69 2c 20 31 29 0a 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 65 64 67 65 28 4e 2c 20 30 29 0a | edge(i,.1).....g.add_edge(N,.0). |
| 25a0 | 20 20 20 20 6e 6f 69 73 65 20 3d 20 66 6c 6f 61 74 28 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 6e 6f 72 6d | ....noise.=.float(np.random.norm |
| 25c0 | 61 6c 28 6d 75 2c 20 73 69 67 6d 61 2c 20 31 29 29 0a 20 20 20 20 69 66 20 77 69 74 68 5f 6e 6f | al(mu,.sigma,.1)).....if.with_no |
| 25e0 | 69 73 65 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 67 2e 61 64 64 5f 6e 6f 64 65 28 4e 2c 20 61 74 74 72 5f | ise:.........g.add_node(N,.attr_ |
| 2600 | 6e 61 6d 65 3d 6d 61 74 68 2e 73 69 6e 28 28 32 20 2a 20 4e 20 2a 20 6d 61 74 68 2e 70 69 20 2f | name=math.sin((2.*.N.*.math.pi./ |
| 2620 | 20 4e 29 29 20 2b 20 6e 6f 69 73 65 29 0a 20 20 20 20 65 6c 73 65 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 | .N)).+.noise).....else:......... |
| 2640 | 67 2e 61 64 64 5f 6e 6f 64 65 28 4e 2c 20 61 74 74 72 5f 6e 61 6d 65 3d 6d 61 74 68 2e 73 69 6e | g.add_node(N,.attr_name=math.sin |
| 2660 | 28 32 20 2a 20 4e 20 2a 20 6d 61 74 68 2e 70 69 20 2f 20 4e 29 29 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 | (2.*.N.*.math.pi./.N)).....retur |
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| 26e0 | 78 29 0a 20 20 20 20 63 70 69 63 6b 20 3d 20 63 6d 2e 53 63 61 6c 61 72 4d 61 70 70 61 62 6c 65 | x).....cpick.=.cm.ScalarMappable |
| 2700 | 28 6e 6f 72 6d 3d 63 6e 6f 72 6d 2c 20 63 6d 61 70 3d 27 76 69 72 69 64 69 73 27 29 0a 20 20 20 | (norm=cnorm,.cmap='viridis').... |
| 2720 | 20 63 70 69 63 6b 2e 73 65 74 5f 61 72 72 61 79 28 5b 5d 29 0a 20 20 20 20 76 61 6c 5f 6d 61 70 | .cpick.set_array([]).....val_map |
| 2740 | 20 3d 20 7b 7d 0a 20 20 20 20 66 6f 72 20 6b 2c 20 76 20 69 6e 20 6e 78 2e 67 65 74 5f 6e 6f 64 | .=.{}.....for.k,.v.in.nx.get_nod |
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| 2780 | 65 27 29 2e 69 74 65 6d 73 28 29 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 76 61 6c 5f 6d 61 70 5b 6b 5d 20 | e').items():.........val_map[k]. |
| 27a0 | 3d 20 63 70 69 63 6b 2e 74 6f 5f 72 67 62 61 28 76 29 0a 20 20 20 20 63 6f 6c 6f 72 73 20 3d 20 | =.cpick.to_rgba(v).....colors.=. |
| 27c0 | 5b 5d 0a 20 20 20 20 66 6f 72 20 6e 6f 64 65 20 69 6e 20 6e 78 5f 67 72 61 70 68 2e 6e 6f 64 65 | [].....for.node.in.nx_graph.node |
| 27e0 | 73 28 29 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 63 6f 6c 6f 72 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 76 61 6c 5f 6d | s():.........colors.append(val_m |
| 2800 | 61 70 5b 6e 6f 64 65 5d 29 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 63 6f 6c 6f 72 73 0a 0a 23 23 23 | ap[node]).....return.colors..### |
| 2820 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 2840 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 2860 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d | ###########.#.Generate.data.#.-- |
| 2880 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 63 69 72 63 75 6c 61 72 20 64 61 74 61 73 65 | -----------..#%%.circular.datase |
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| 28c0 | 63 69 72 63 75 6c 61 72 20 67 72 61 70 68 73 2e 0a 23 20 4e 6f 69 73 65 20 69 73 20 61 64 64 65 | circular.graphs..#.Noise.is.adde |
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| 2960 | 0a 20 20 20 20 58 30 2e 61 70 70 65 6e 64 28 62 75 69 6c 64 5f 6e 6f 69 73 79 5f 63 69 72 63 75 | .....X0.append(build_noisy_circu |
| 2980 | 6c 61 72 5f 67 72 61 70 68 28 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 31 35 2c 20 | lar_graph(np.random.randint(15,. |
| 29a0 | 32 35 29 2c 20 77 69 74 68 5f 6e 6f 69 73 65 3d 54 72 75 65 2c 20 73 74 72 75 63 74 75 72 65 5f | 25),.with_noise=True,.structure_ |
| 29c0 | 6e 6f 69 73 65 3d 54 72 75 65 2c 20 70 3d 33 29 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | noise=True,.p=3))..############# |
| 29e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 2a00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 2a20 | 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 50 | #.#.Plot.data.#.---------..#%%.P |
| 2a40 | 6c 6f 74 20 67 72 61 70 68 73 0a 0a 70 6c 74 2e 66 69 67 75 72 65 28 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 | lot.graphs..plt.figure(figsize=( |
| 2a60 | 38 2c 20 31 30 29 29 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6c 65 6e 28 58 30 29 29 3a | 8,.10)).for.i.in.range(len(X0)): |
| 2a80 | 0a 20 20 20 20 70 6c 74 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 33 2c 20 33 2c 20 69 20 2b 20 31 29 0a 20 20 | .....plt.subplot(3,.3,.i.+.1)... |
| 2aa0 | 20 20 67 20 3d 20 58 30 5b 69 5d 0a 20 20 20 20 70 6f 73 20 3d 20 6e 78 2e 6b 61 6d 61 64 61 5f | ..g.=.X0[i].....pos.=.nx.kamada_ |
| 2ac0 | 6b 61 77 61 69 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 67 29 0a 20 20 20 20 6e 78 2e 64 72 61 77 28 67 2c 20 70 | kawai_layout(g).....nx.draw(g,.p |
| 2ae0 | 6f 73 3d 70 6f 73 2c 20 6e 6f 64 65 5f 63 6f 6c 6f 72 3d 67 72 61 70 68 5f 63 6f 6c 6f 72 73 28 | os=pos,.node_color=graph_colors( |
| 2b00 | 67 2c 20 76 6d 69 6e 3d 2d 31 2c 20 76 6d 61 78 3d 31 29 2c 20 77 69 74 68 5f 6c 61 62 65 6c 73 | g,.vmin=-1,.vmax=1),.with_labels |
| 2b20 | 3d 46 61 6c 73 65 2c 20 6e 6f 64 65 5f 73 69 7a 65 3d 31 30 30 29 0a 70 6c 74 2e 73 75 70 74 69 | =False,.node_size=100).plt.supti |
| 2b40 | 74 6c 65 28 27 44 61 74 61 73 65 74 20 6f 66 20 6e 6f 69 73 79 20 67 72 61 70 68 73 2e 20 43 6f | tle('Dataset.of.noisy.graphs..Co |
| 2b60 | 6c 6f 72 20 69 6e 64 69 63 61 74 65 73 20 74 68 65 20 6c 61 62 65 6c 27 2c 20 66 6f 6e 74 73 69 | lor.indicates.the.label',.fontsi |
| 2b80 | 7a 65 3d 32 30 29 0a 70 6c 74 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ze=20).plt.show()..############# |
| 2ba0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 2bc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 2be0 | 23 0a 23 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 0a 23 20 2d 2d 2d | #.#.Barycenter.computation.#.--- |
| 2c00 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 57 65 20 63 6f 6d 70 | -------------------..#%%.We.comp |
| 2c20 | 75 74 65 20 74 68 65 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 75 73 69 6e 67 20 46 47 57 2e 20 53 74 | ute.the.barycenter.using.FGW..St |
| 2c40 | 72 75 63 74 75 72 65 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 20 61 72 65 20 63 6f 6d 70 75 74 65 64 20 75 73 | ructure.matrices.are.computed.us |
| 2c60 | 69 6e 67 20 74 68 65 20 73 68 6f 72 74 65 73 74 5f 70 61 74 68 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 20 69 | ing.the.shortest_path.distance.i |
| 2c80 | 6e 20 74 68 65 20 67 72 61 70 68 0a 23 20 46 65 61 74 75 72 65 73 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 | n.the.graph.#.Features.distances |
| 2ca0 | 20 61 72 65 20 74 68 65 20 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 0a 43 73 20 | .are.the.euclidean.distances.Cs. |
| 2cc0 | 3d 20 5b 73 68 6f 72 74 65 73 74 5f 70 61 74 68 28 6e 78 2e 61 64 6a 61 63 65 6e 63 79 5f 6d 61 | =.[shortest_path(nx.adjacency_ma |
| 2ce0 | 74 72 69 78 28 78 29 29 20 66 6f 72 20 78 20 69 6e 20 58 30 5d 0a 70 73 20 3d 20 5b 6e 70 2e 6f | trix(x)).for.x.in.X0].ps.=.[np.o |
| 2d00 | 6e 65 73 28 6c 65 6e 28 78 2e 6e 6f 64 65 73 28 29 29 29 20 2f 20 6c 65 6e 28 78 2e 6e 6f 64 65 | nes(len(x.nodes()))./.len(x.node |
| 2d20 | 73 28 29 29 20 66 6f 72 20 78 20 69 6e 20 58 30 5d 0a 59 73 20 3d 20 5b 6e 70 2e 61 72 72 61 79 | s()).for.x.in.X0].Ys.=.[np.array |
| 2d40 | 28 5b 76 20 66 6f 72 20 28 6b 2c 20 76 29 20 69 6e 20 6e 78 2e 67 65 74 5f 6e 6f 64 65 5f 61 74 | ([v.for.(k,.v).in.nx.get_node_at |
| 2d60 | 74 72 69 62 75 74 65 73 28 78 2c 20 27 61 74 74 72 5f 6e 61 6d 65 27 29 2e 69 74 65 6d 73 28 29 | tributes(x,.'attr_name').items() |
| 2d80 | 5d 29 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 2d 31 2c 20 31 29 20 66 6f 72 20 78 20 69 6e 20 58 30 5d 0a 6c | ]).reshape(-1,.1).for.x.in.X0].l |
| 2da0 | 61 6d 62 64 61 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 6c 65 6e 28 59 | ambdas.=.np.array([np.ones(len(Y |
| 2dc0 | 73 29 29 20 2f 20 6c 65 6e 28 59 73 29 5d 29 2e 72 61 76 65 6c 28 29 0a 73 69 7a 65 62 61 72 79 | s))./.len(Ys)]).ravel().sizebary |
| 2de0 | 20 3d 20 31 35 20 20 23 20 77 65 20 63 68 6f 6f 73 65 20 61 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 | .=.15..#.we.choose.a.barycenter. |
| 2e00 | 77 69 74 68 20 31 35 20 6e 6f 64 65 73 0a 0a 41 2c 20 43 2c 20 6c 6f 67 20 3d 20 66 67 77 5f 62 | with.15.nodes..A,.C,.log.=.fgw_b |
| 2e20 | 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 73 69 7a 65 62 61 72 79 2c 20 59 73 2c 20 43 73 2c 20 70 73 2c | arycenters(sizebary,.Ys,.Cs,.ps, |
| 2e40 | 20 6c 61 6d 62 64 61 73 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 39 35 2c 20 6c 6f 67 3d 54 72 75 65 29 0a | .lambdas,.alpha=0.95,.log=True). |
| 2e60 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
| 2e80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 2ea0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 | ###############.#.Plot.Barycente |
| 2ec0 | 72 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 | r.#.-------------------------..# |
| 2ee0 | 25 25 20 43 72 65 61 74 65 20 74 68 65 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 0a 62 61 72 79 20 3d 20 | %%.Create.the.barycenter.bary.=. |
| 2f00 | 6e 78 2e 66 72 6f 6d 5f 6e 75 6d 70 79 5f 6d 61 74 72 69 78 28 73 70 5f 74 6f 5f 61 64 6a 65 6e | nx.from_numpy_matrix(sp_to_adjen |
| 2f20 | 63 79 28 43 2c 20 74 68 72 65 73 68 69 6e 66 3d 30 2c 20 74 68 72 65 73 68 73 75 70 3d 66 69 6e | cy(C,.threshinf=0,.threshsup=fin |
| 2f40 | 64 5f 74 68 72 65 73 68 28 43 2c 20 73 75 70 3d 31 30 30 2c 20 73 74 65 70 3d 31 30 30 29 5b 30 | d_thresh(C,.sup=100,.step=100)[0 |
| 2f60 | 5d 29 29 0a 66 6f 72 20 69 2c 20 76 20 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 41 2e 72 61 76 65 | ])).for.i,.v.in.enumerate(A.rave |
| 2f80 | 6c 28 29 29 3a 0a 20 20 20 20 62 61 72 79 2e 61 64 64 5f 6e 6f 64 65 28 69 2c 20 61 74 74 72 5f | l()):.....bary.add_node(i,.attr_ |
| 2fa0 | 6e 61 6d 65 3d 76 29 0a 0a 23 25 25 0a 70 6f 73 20 3d 20 6e 78 2e 6b 61 6d 61 64 61 5f 6b 61 77 | name=v)..#%%.pos.=.nx.kamada_kaw |
| 2fc0 | 61 69 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 62 61 72 79 29 0a 6e 78 2e 64 72 61 77 28 62 61 72 79 2c 20 70 6f | ai_layout(bary).nx.draw(bary,.po |
| 2fe0 | 73 3d 70 6f 73 2c 20 6e 6f 64 65 5f 63 6f 6c 6f 72 3d 67 72 61 70 68 5f 63 6f 6c 6f 72 73 28 62 | s=pos,.node_color=graph_colors(b |
| 3000 | 61 72 79 2c 20 76 6d 69 6e 3d 2d 31 2c 20 76 6d 61 78 3d 31 29 2c 20 77 69 74 68 5f 6c 61 62 65 | ary,.vmin=-1,.vmax=1),.with_labe |
| 3020 | 6c 73 3d 46 61 6c 73 65 29 0a 70 6c 74 2e 73 75 70 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 | ls=False).plt.suptitle('Barycent |
| 3040 | 65 72 27 2c 20 66 6f 6e 74 73 69 7a 65 3d 32 30 29 0a 70 6c 74 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 | er',.fontsize=20).plt.show().PK. |
| 3060 | 04 14 00 00 00 00 00 7c 68 3a 4f f2 7c 7e 9e 5c 0e 00 00 5c 0e 00 00 15 00 00 00 70 6c 6f 74 5f | .......|h:O.|~.\...\.......plot_ |
| 3080 | 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 31 44 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 | barycenter_1D.py#.-*-.coding:.ut |
| 30a0 | 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | f-8.-*-.""".==================== |
| 30c0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 31 44 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 62 61 72 79 63 65 | ==========.1D.Wasserstein.baryce |
| 30e0 | 6e 74 65 72 20 64 65 6d 6f 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | nter.demo.====================== |
| 3100 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6c 6c 75 73 74 72 61 74 | ========..This.example.illustrat |
| 3120 | 65 73 20 74 68 65 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 | es.the.computation.of.regularize |
| 3140 | 64 20 57 61 73 73 65 72 73 79 65 69 6e 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 0a 61 73 20 70 72 6f 70 | d.Wassersyein.Barycenter.as.prop |
| 3160 | 6f 73 65 64 20 69 6e 20 5b 33 5d 2e 0a 0a 0a 5b 33 5d 20 42 65 6e 61 6d 6f 75 2c 20 4a 2e 20 44 | osed.in.[3]....[3].Benamou,.J..D |
| 3180 | 2e 2c 20 43 61 72 6c 69 65 72 2c 20 47 2e 2c 20 43 75 74 75 72 69 2c 20 4d 2e 2c 20 4e 65 6e 6e | .,.Carlier,.G.,.Cuturi,.M.,.Nenn |
| 31a0 | 61 2c 20 4c 2e 2c 20 26 20 50 65 79 72 c3 a9 2c 20 47 2e 20 28 32 30 31 35 29 2e 0a 49 74 65 72 | a,.L.,.&.Peyr..,.G..(2015)..Iter |
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| 31e0 | 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 61 74 69 6f 6e 20 70 72 6f 62 6c 65 6d | gularized.transportation.problem |
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| 4280 | 73 2c 20 63 6f 76 5f 73 29 0a 78 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f | s,.cov_s).xt.=.ot.datasets.make_ |
| 42a0 | 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 75 5f 74 2c 20 63 6f 76 5f 74 29 | 2D_samples_gauss(n,.mu_t,.cov_t) |
| 42c0 | 0a 0a 61 2c 20 62 20 3d 20 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 28 6e 2c 29 29 20 2f 20 6e 2c 20 6e 70 2e 6f | ..a,.b.=.np.ones((n,))./.n,.np.o |
| 42e0 | 6e 65 73 28 28 6e 2c 29 29 20 2f 20 6e 20 20 23 20 75 6e 69 66 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 | nes((n,))./.n..#.uniform.distrib |
| 4300 | 75 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a | ution.on.samples..#.loss.matrix. |
| 4320 | 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 29 0a 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 | M.=.ot.dist(xs,.xt).M./=.M.max() |
| 4340 | 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ..############################## |
| 4360 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 4380 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d | ################.#.Plot.data.#.- |
| 43a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 0a 70 6c 2e 66 | --------..#%%.plot.samples..pl.f |
| 43c0 | 69 67 75 72 65 28 31 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c | igure(1).pl.plot(xs[:,.0],.xs[:, |
| 43e0 | 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | .1],.'+b',.label='Source.samples |
| 4400 | 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 | ').pl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.' |
| 4420 | 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e | xr',.label='Target.samples').pl. |
| 4440 | 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 | legend(loc=0).pl.title('Source.a |
| 4460 | 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 | nd.target.distributions')..pl.fi |
| 4480 | 67 75 72 65 28 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 | gure(2).pl.imshow(M,.interpolati |
| 44a0 | 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 | on='nearest').pl.title('Cost.mat |
| 44c0 | 72 69 78 20 4d 27 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | rix.M')..####################### |
| 44e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 4500 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 74 | #######################.#.Comput |
| 4520 | 65 20 45 4d 44 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 45 4d 44 0a 0a 47 30 | e.EMD.#.-----------..#%%.EMD..G0 |
| 4540 | 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 | .=.ot.emd(a,.b,.M)..pl.figure(3) |
| 4560 | 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 30 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 | .pl.imshow(G0,.interpolation='ne |
| 4580 | 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 30 27 29 | arest').pl.title('OT.matrix.G0') |
| 45a0 | 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 | ..pl.figure(4).ot.plot.plot2D_sa |
| 45c0 | 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 30 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c | mples_mat(xs,.xt,.G0,.c=[.5,..5, |
| 45e0 | 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c | .1]).pl.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1], |
| 4600 | 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 | .'+b',.label='Source.samples').p |
| 4620 | 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c | l.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr', |
| 4640 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 | .label='Target.samples').pl.lege |
| 4660 | 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 77 69 | nd(loc=0).pl.title('OT.matrix.wi |
| 4680 | 74 68 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | th.samples')...################# |
| 46a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 46c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 | #############################.#. |
| 46e0 | 43 6f 6d 70 75 74 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | Compute.Sinkhorn.#.------------- |
| 4700 | 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 0a 0a 23 20 72 65 67 20 74 65 72 6d 0a 6c 61 | ---..#%%.sinkhorn..#.reg.term.la |
| 4720 | 6d 62 64 20 3d 20 31 65 2d 33 0a 0a 47 73 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c 20 | mbd.=.1e-3..Gs.=.ot.sinkhorn(a,. |
| 4740 | 62 2c 20 4d 2c 20 6c 61 6d 62 64 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 29 0a 70 6c 2e 69 6d | b,.M,.lambd)..pl.figure(5).pl.im |
| 4760 | 73 68 6f 77 28 47 73 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 | show(Gs,.interpolation='nearest' |
| 4780 | 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 | ).pl.title('OT.matrix.sinkhorn') |
| 47a0 | 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 36 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 | ..pl.figure(6).ot.plot.plot2D_sa |
| 47c0 | 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 73 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 5b 2e 35 2c | mples_mat(xs,.xt,.Gs,.color=[.5, |
| 47e0 | 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c | ..5,.1]).pl.plot(xs[:,.0],.xs[:, |
| 4800 | 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | .1],.'+b',.label='Source.samples |
| 4820 | 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 | ').pl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.' |
| 4840 | 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e | xr',.label='Target.samples').pl. |
| 4860 | 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 | legend(loc=0).pl.title('OT.matri |
| 4880 | 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 77 69 74 68 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 | x.Sinkhorn.with.samples')..pl.sh |
| 48a0 | 6f 77 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ow()...######################### |
| 48c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 48e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 45 6d 70 72 69 72 69 63 | #####################.#.Empriric |
| 4900 | 61 6c 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a | al.Sinkhorn.#.----------------.. |
| 4920 | 23 25 25 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 0a 0a 23 20 72 65 67 20 74 65 72 6d 0a 6c 61 6d 62 64 20 3d | #%%.sinkhorn..#.reg.term.lambd.= |
| 4940 | 20 31 65 2d 33 0a 0a 47 65 73 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 65 6d 70 69 72 69 63 61 | .1e-3..Ges.=.ot.bregman.empirica |
| 4960 | 6c 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6c 61 6d 62 64 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 | l_sinkhorn(xs,.xt,.lambd)..pl.fi |
| 4980 | 67 75 72 65 28 37 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 65 73 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 | gure(7).pl.imshow(Ges,.interpola |
| 49a0 | 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 | tion='nearest').pl.title('OT.mat |
| 49c0 | 72 69 78 20 65 6d 70 69 72 69 63 61 6c 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 | rix.empirical.sinkhorn')..pl.fig |
| 49e0 | 75 72 65 28 38 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 | ure(8).ot.plot.plot2D_samples_ma |
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| 4a60 | 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 | lot(xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr',.la |
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| 4aa0 | 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 | loc=0).pl.title('OT.matrix.Sinkh |
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| 5080 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 0a 0a 65 70 73 69 | -------------...#.Sinkhorn..epsi |
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| 5b40 | 0a 0a 6e 5f 77 65 69 67 68 74 20 3d 20 31 31 0a 77 65 69 67 68 74 5f 6c 69 73 74 20 3d 20 6e 70 | ..n_weight.=.11.weight_list.=.np |
| 5b60 | 2e 6c 69 6e 73 70 61 63 65 28 30 2c 20 31 2c 20 6e 5f 77 65 69 67 68 74 29 0a 0a 0a 42 5f 6c 32 | .linspace(0,.1,.n_weight)...B_l2 |
| 5b80 | 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 6e 5f 77 65 69 67 68 74 29 29 0a 0a 42 5f 77 61 | .=.np.zeros((n,.n_weight))..B_wa |
| 5ba0 | 73 73 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 70 79 28 42 5f 6c 32 29 0a 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e | ss.=.np.copy(B_l2)..for.i.in.ran |
| 5bc0 | 67 65 28 30 2c 20 6e 5f 77 65 69 67 68 74 29 3a 0a 20 20 20 20 77 65 69 67 68 74 20 3d 20 77 65 | ge(0,.n_weight):.....weight.=.we |
| 5be0 | 69 67 68 74 5f 6c 69 73 74 5b 69 5d 0a 20 20 20 20 77 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 | ight_list[i].....weights.=.np.ar |
| 5c00 | 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 77 65 69 67 68 74 2c 20 77 65 69 67 68 74 5d 29 0a 20 20 20 20 42 5f | ray([1.-.weight,.weight]).....B_ |
| 5c20 | 6c 32 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 0a 20 20 20 20 42 5f | l2[:,.i].=.A.dot(weights).....B_ |
| 5c40 | 77 61 73 73 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 62 61 6c 61 6e 63 65 64 2e 62 61 72 79 63 | wass[:,.i].=.ot.unbalanced.baryc |
| 5c60 | 65 6e 74 65 72 5f 75 6e 62 61 6c 61 6e 63 65 64 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 61 6c 70 68 | enter_unbalanced(A,.M,.reg,.alph |
| 5c80 | 61 2c 20 77 65 69 67 68 74 73 3d 77 65 69 67 68 74 73 29 0a 0a 0a 23 20 70 6c 6f 74 20 69 6e 74 | a,.weights=weights)...#.plot.int |
| 5ca0 | 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 0a 0a 63 6d 61 70 20 3d | erpolation..pl.figure(3)..cmap.= |
| 5cc0 | 20 70 6c 2e 63 6d 2e 67 65 74 5f 63 6d 61 70 28 27 76 69 72 69 64 69 73 27 29 0a 76 65 72 74 73 | .pl.cm.get_cmap('viridis').verts |
| 5ce0 | 20 3d 20 5b 5d 0a 7a 73 20 3d 20 77 65 69 67 68 74 5f 6c 69 73 74 0a 66 6f 72 20 69 2c 20 7a 20 | .=.[].zs.=.weight_list.for.i,.z. |
| 5d00 | 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 7a 73 29 3a 0a 20 20 20 20 79 73 20 3d 20 42 5f 6c 32 5b | in.enumerate(zs):.....ys.=.B_l2[ |
| 5d20 | 3a 2c 20 69 5d 0a 20 20 20 20 76 65 72 74 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 6c 69 73 74 28 7a 69 70 28 | :,.i].....verts.append(list(zip( |
| 5d40 | 78 2c 20 79 73 29 29 29 0a 0a 61 78 20 3d 20 70 6c 2e 67 63 66 28 29 2e 67 63 61 28 70 72 6f 6a | x,.ys)))..ax.=.pl.gcf().gca(proj |
| 5d60 | 65 63 74 69 6f 6e 3d 27 33 64 27 29 0a 0a 70 6f 6c 79 20 3d 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 | ection='3d')..poly.=.PolyCollect |
| 5d80 | 69 6f 6e 28 76 65 72 74 73 2c 20 66 61 63 65 63 6f 6c 6f 72 73 3d 5b 63 6d 61 70 28 61 29 20 66 | ion(verts,.facecolors=[cmap(a).f |
| 5da0 | 6f 72 20 61 20 69 6e 20 77 65 69 67 68 74 5f 6c 69 73 74 5d 29 0a 70 6f 6c 79 2e 73 65 74 5f 61 | or.a.in.weight_list]).poly.set_a |
| 5dc0 | 6c 70 68 61 28 30 2e 37 29 0a 61 78 2e 61 64 64 5f 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 33 64 28 70 6f | lpha(0.7).ax.add_collection3d(po |
| 5de0 | 6c 79 2c 20 7a 73 3d 7a 73 2c 20 7a 64 69 72 3d 27 79 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 61 62 | ly,.zs=zs,.zdir='y').ax.set_xlab |
| 5e00 | 65 6c 28 27 78 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 6e 29 0a 61 78 2e 73 | el('x').ax.set_xlim3d(0,.n).ax.s |
| 5e20 | 65 74 5f 79 6c 61 62 65 6c 28 72 27 24 5c 61 6c 70 68 61 24 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c | et_ylabel(r'$\alpha$').ax.set_yl |
| 5e40 | 69 6d 33 64 28 30 2c 20 31 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 61 62 65 6c 28 27 27 29 0a 61 78 2e | im3d(0,.1).ax.set_zlabel('').ax. |
| 5e60 | 73 65 74 5f 7a 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 42 5f 6c 32 2e 6d 61 78 28 29 20 2a 20 31 2e 30 31 29 | set_zlim3d(0,.B_l2.max().*.1.01) |
| 5e80 | 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 | .pl.title('Barycenter.interpolat |
| 5ea0 | 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 6c 32 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a | ion.with.l2').pl.tight_layout(). |
| 5ec0 | 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 29 0a 63 6d 61 70 20 3d 20 70 6c 2e 63 6d 2e 67 65 74 5f 63 | .pl.figure(4).cmap.=.pl.cm.get_c |
| 5ee0 | 6d 61 70 28 27 76 69 72 69 64 69 73 27 29 0a 76 65 72 74 73 20 3d 20 5b 5d 0a 7a 73 20 3d 20 77 | map('viridis').verts.=.[].zs.=.w |
| 5f00 | 65 69 67 68 74 5f 6c 69 73 74 0a 66 6f 72 20 69 2c 20 7a 20 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 | eight_list.for.i,.z.in.enumerate |
| 5f20 | 28 7a 73 29 3a 0a 20 20 20 20 79 73 20 3d 20 42 5f 77 61 73 73 5b 3a 2c 20 69 5d 0a 20 20 20 20 | (zs):.....ys.=.B_wass[:,.i]..... |
| 5f40 | 76 65 72 74 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 6c 69 73 74 28 7a 69 70 28 78 2c 20 79 73 29 29 29 0a 0a | verts.append(list(zip(x,.ys))).. |
| 5f60 | 61 78 20 3d 20 70 6c 2e 67 63 66 28 29 2e 67 63 61 28 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 3d 27 33 64 | ax.=.pl.gcf().gca(projection='3d |
| 5f80 | 27 29 0a 0a 70 6f 6c 79 20 3d 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 28 76 65 72 74 73 2c | ')..poly.=.PolyCollection(verts, |
| 5fa0 | 20 66 61 63 65 63 6f 6c 6f 72 73 3d 5b 63 6d 61 70 28 61 29 20 66 6f 72 20 61 20 69 6e 20 77 65 | .facecolors=[cmap(a).for.a.in.we |
| 5fc0 | 69 67 68 74 5f 6c 69 73 74 5d 29 0a 70 6f 6c 79 2e 73 65 74 5f 61 6c 70 68 61 28 30 2e 37 29 0a | ight_list]).poly.set_alpha(0.7). |
| 5fe0 | 61 78 2e 61 64 64 5f 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 33 64 28 70 6f 6c 79 2c 20 7a 73 3d 7a 73 2c | ax.add_collection3d(poly,.zs=zs, |
| 6000 | 20 7a 64 69 72 3d 27 79 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 61 62 65 6c 28 27 78 27 29 0a 61 78 | .zdir='y').ax.set_xlabel('x').ax |
| 6020 | 2e 73 65 74 5f 78 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 6e 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 61 62 65 6c 28 | .set_xlim3d(0,.n).ax.set_ylabel( |
| 6040 | 72 27 24 5c 61 6c 70 68 61 24 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 31 29 | r'$\alpha$').ax.set_ylim3d(0,.1) |
| 6060 | 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 61 62 65 6c 28 27 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 69 6d 33 64 | .ax.set_zlabel('').ax.set_zlim3d |
| 6080 | 28 30 2c 20 42 5f 6c 32 2e 6d 61 78 28 29 20 2a 20 31 2e 30 31 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | (0,.B_l2.max().*.1.01).pl.title( |
| 60a0 | 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 57 | 'Barycenter.interpolation.with.W |
| 60c0 | 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a | asserstein').pl.tight_layout().. |
| 60e0 | 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 d2 72 94 50 43 c3 5c 58 99 17 00 00 | pl.show().PK.........r.PC.\X.... |
| 6100 | 99 17 00 00 21 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 6c 70 5f 76 73 5f 65 6e | ....!...plot_barycenter_lp_vs_en |
| 6120 | 74 72 6f 70 69 63 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d | tropic.py#.-*-.coding:.utf-8.-*- |
| 6140 | 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | .""".=========================== |
| 6160 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
| 6180 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 31 44 20 57 61 73 73 65 72 | ======================.1D.Wasser |
| 61a0 | 73 74 65 69 6e 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 61 72 69 73 6f 6e 20 62 65 74 77 | stein.barycenter.comparison.betw |
| 61c0 | 65 65 6e 20 65 78 61 63 74 20 4c 50 20 61 6e 64 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 | een.exact.LP.and.entropic.regula |
| 61e0 | 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | rization.======================= |
| 6200 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
| 6220 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 69 73 | ==========================..This |
| 6240 | 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6c 6c 75 73 74 72 61 74 65 73 20 74 68 65 20 63 6f 6d 70 75 74 61 | .example.illustrates.the.computa |
| 6260 | 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 | tion.of.regularized.Wasserstein. |
| 6280 | 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 0a 61 73 20 70 72 6f 70 6f 73 65 64 20 69 6e 20 5b 33 5d 20 61 6e | Barycenter.as.proposed.in.[3].an |
| 62a0 | 64 20 65 78 61 63 74 20 4c 50 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 20 75 73 69 6e 67 20 73 74 61 | d.exact.LP.barycenters.using.sta |
| 62c0 | 6e 64 61 72 64 20 4c 50 20 73 6f 6c 76 65 72 2e 0a 0a 49 74 20 72 65 70 72 6f 64 75 63 65 73 20 | ndard.LP.solver...It.reproduces. |
| 62e0 | 61 70 70 72 6f 78 69 6d 61 74 65 6c 79 20 46 69 67 75 72 65 20 33 2e 31 20 61 6e 64 20 33 2e 32 | approximately.Figure.3.1.and.3.2 |
| 6300 | 20 66 72 6f 6d 20 74 68 65 20 66 6f 6c 6c 6f 77 69 6e 67 20 70 61 70 65 72 3a 0a 43 75 74 75 72 | .from.the.following.paper:.Cutur |
| 6320 | 69 2c 20 4d 2e 2c 20 26 20 50 65 79 72 c3 a9 2c 20 47 2e 20 28 32 30 31 36 29 2e 20 41 20 73 6d | i,.M.,.&.Peyr..,.G..(2016)..A.sm |
| 6340 | 6f 6f 74 68 65 64 20 64 75 61 6c 20 61 70 70 72 6f 61 63 68 20 66 6f 72 20 76 61 72 69 61 74 69 | oothed.dual.approach.for.variati |
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| 6380 | 4a 6f 75 72 6e 61 6c 20 6f 6e 20 49 6d 61 67 69 6e 67 20 53 63 69 65 6e 63 65 73 2c 20 39 28 31 | Journal.on.Imaging.Sciences,.9(1 |
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| 7d60 | 62 5f 69 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | b_i)...######################### |
| 7d80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 7da0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 | #####################.#.Compute. |
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| 7f20 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
| 7f40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 7f60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d | ###############.#.Plot.data.#.-- |
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| 8440 | 6f 6e 76 65 72 67 65 6e 63 65 20 61 6e 64 20 61 70 70 6c 69 63 61 74 69 6f 6e 73 2e 0a 61 72 58 | onvergence.and.applications..arX |
| 8460 | 69 76 20 70 72 65 70 72 69 6e 74 20 61 72 58 69 76 3a 31 35 31 30 2e 30 36 35 36 37 2e 0a 0a 0a | iv.preprint.arXiv:1510.06567.... |
| 8480 | 0a 22 22 22 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 | ."""..import.numpy.as.np.import. |
| 84a0 | 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 | matplotlib.pylab.as.pl.import.ot |
| 84c0 | 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 2e 70 6c 6f 74 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .import.ot.plot..############### |
| 84e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 8500 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a | ###############################. |
| 8520 | 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a | #.Generate.data.#.-------------. |
| 8540 | 0a 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 0a 0a 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 62 | .#%%.parameters..n.=.100..#.nb.b |
| 8560 | 69 6e 73 0a 0a 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 0a 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e | ins..#.bin.positions.x.=.np.aran |
| 8580 | 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 0a 0a 23 20 47 61 75 73 73 | ge(n,.dtype=np.float64)..#.Gauss |
| 85a0 | 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 61 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 | ian.distributions.a.=.ot.dataset |
| 85c0 | 73 2e 6d 61 6b 65 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 | s.make_1D_gauss(n,.m=20,.s=5)..# |
| 85e0 | 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 0a 62 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 | .m=.mean,.s=.std.b.=.ot.datasets |
| 8600 | 2e 6d 61 6b 65 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 36 30 2c 20 73 3d 31 30 29 0a 0a 23 | .make_1D_gauss(n,.m=60,.s=10)..# |
| 8620 | 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 | .loss.matrix.M.=.ot.dist(x.resha |
| 8640 | 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 29 0a 4d | pe((n,.1)),.x.reshape((n,.1))).M |
| 8660 | 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ./=.M.max()..################### |
| 8680 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 86a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f | ###########################.#.So |
| 86c0 | 6c 76 65 20 45 4d 44 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 45 4d 44 0a 0a 47 30 | lve.EMD.#.---------..#%%.EMD..G0 |
| 86e0 | 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c | .=.ot.emd(a,.b,.M)..pl.figure(3, |
| 8700 | 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f | .figsize=(5,.5)).ot.plot.plot1D_ |
| 8720 | 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 30 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 30 27 29 0a 0a 23 | mat(a,.b,.G0,.'OT.matrix.G0')..# |
| 8740 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 8760 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 8780 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 46 | #############.#.Solve.EMD.with.F |
| 87a0 | 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 23 20 2d | robenius.norm.regularization.#.- |
| 87c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 87e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 46 72 | -----------..#%%.Example.with.Fr |
| 8800 | 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 0a 0a 64 65 | obenius.norm.regularization...de |
| 8820 | 66 20 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 30 2e 35 20 2a 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 | f.f(G):.....return.0.5.*.np.sum( |
| 8840 | 47 2a 2a 32 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 47 0a | G**2)...def.df(G):.....return.G. |
| 8860 | 0a 0a 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 31 0a 0a 47 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 63 67 28 | ..reg.=.1e-1..Gl2.=.ot.optim.cg( |
| 8880 | 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 | a,.b,.M,.reg,.f,.df,.verbose=Tru |
| 88a0 | 65 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f | e)..pl.figure(3).ot.plot.plot1D_ |
| 88c0 | 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 6c 32 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 46 72 6f 62 2e 20 | mat(a,.b,.Gl2,.'OT.matrix.Frob.. |
| 88e0 | 72 65 67 27 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | reg')..######################### |
| 8900 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 8920 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 45 4d | #####################.#.Solve.EM |
| 8940 | 44 20 77 69 74 68 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 23 | D.with.entropic.regularization.# |
| 8960 | 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .------------------------------- |
| 8980 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 65 6e 74 72 6f 70 | -------..#%%.Example.with.entrop |
| 89a0 | 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 0a 0a 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 0a 20 20 | ic.regularization...def.f(G):... |
| 89c0 | 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 20 2a 20 6e 70 2e 6c 6f 67 28 47 29 29 0a 0a | ..return.np.sum(G.*.np.log(G)).. |
| 89e0 | 0a 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 6c 6f 67 28 47 29 | .def.df(G):.....return.np.log(G) |
| 8a00 | 20 2b 20 31 2e 0a 0a 0a 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 0a 0a 47 65 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 | .+.1....reg.=.1e-3..Ge.=.ot.opti |
| 8a20 | 6d 2e 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 | m.cg(a,.b,.M,.reg,.f,.df,.verbos |
| 8a40 | 65 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 | e=True)..pl.figure(4,.figsize=(5 |
| 8a60 | 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 | ,.5)).ot.plot.plot1D_mat(a,.b,.G |
| 8a80 | 65 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 45 6e 74 72 6f 70 2e 20 72 65 67 27 29 0a 0a 23 23 23 | e,.'OT.matrix.Entrop..reg')..### |
| 8aa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 8ac0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 8ae0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 46 72 6f | ###########.#.Solve.EMD.with.Fro |
| 8b00 | 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 2b 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a | benius.norm.+.entropic.regulariz |
| 8b20 | 61 74 69 6f 6e 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ation.#.------------------------ |
| 8b40 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a | -------------------------------. |
| 8b60 | 0a 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d | .#%%.Example.with.Frobenius.norm |
| 8b80 | 20 2b 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 | .+.entropic.regularization.with. |
| 8ba0 | 67 63 67 0a 0a 0a 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 30 2e 35 20 2a | gcg...def.f(G):.....return.0.5.* |
| 8bc0 | 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 2a 2a 32 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 | .np.sum(G**2)...def.df(G):.....r |
| 8be0 | 65 74 75 72 6e 20 47 0a 0a 0a 72 65 67 31 20 3d 20 31 65 2d 33 0a 72 65 67 32 20 3d 20 31 65 2d | eturn.G...reg1.=.1e-3.reg2.=.1e- |
| 8c00 | 31 0a 0a 47 65 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 67 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 | 1..Gel2.=.ot.optim.gcg(a,.b,.M,. |
| 8c20 | 72 65 67 31 2c 20 72 65 67 32 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 | reg1,.reg2,.f,.df,.verbose=True) |
| 8c40 | 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f | ..pl.figure(5,.figsize=(5,.5)).o |
| 8c60 | 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 65 6c 32 2c 20 27 4f | t.plot.plot1D_mat(a,.b,.Gel2,.'O |
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| 9d60 | 6e 69 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 6e 62 20 3d 20 31 30 30 30 0a 69 64 78 31 20 3d 20 72 2e | ning.samples.nb.=.1000.idx1.=.r. |
| 9d80 | 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 31 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 | randint(X1.shape[0],.size=(nb,)) |
| 9da0 | 0a 69 64 78 32 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 32 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 | .idx2.=.r.randint(X2.shape[0],.s |
| 9dc0 | 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 0a 0a 58 73 20 3d 20 58 31 5b 69 64 78 31 2c 20 3a 5d 0a 58 74 20 | ize=(nb,))..Xs.=.X1[idx1,.:].Xt. |
| 9de0 | 3d 20 58 32 5b 69 64 78 32 2c 20 3a 5d 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | =.X2[idx2,.:]...################ |
| 9e00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 9e20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 | ##############################.# |
| 9e40 | 20 50 6c 6f 74 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 69 6d 61 67 65 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .Plot.original.image.#.--------- |
| 9e60 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 | ----------..pl.figure(1,.figsize |
| 9e80 | 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a | =(6.4,.3))..pl.subplot(1,.2,.1). |
| 9ea0 | 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e | pl.imshow(I1).pl.axis('off').pl. |
| 9ec0 | 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 | title('Image.1')..pl.subplot(1,. |
| 9ee0 | 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 | 2,.2).pl.imshow(I2).pl.axis('off |
| 9f00 | 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 | ').pl.title('Image.2')...####### |
| 9f20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 9f40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 9f60 | 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 63 61 74 74 65 72 20 70 6c 6f 74 20 6f 66 20 63 6f 6c 6f 72 73 | #######.#.Scatter.plot.of.colors |
| 9f80 | 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 | .#.----------------------..pl.fi |
| 9fa0 | 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 | gure(2,.figsize=(6.4,.3))..pl.su |
| 9fc0 | 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 | bplot(1,.2,.1).pl.scatter(Xs[:,. |
| 9fe0 | 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 73 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 | 0],.Xs[:,.2],.c=Xs).pl.axis([0,. |
| a000 | 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 0a 70 6c 2e 79 6c | 1,.0,.1]).pl.xlabel('Red').pl.yl |
| a020 | 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 | abel('Blue').pl.title('Image.1') |
| a040 | 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 | ..pl.subplot(1,.2,.2).pl.scatter |
| a060 | 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 | (Xt[:,.0],.Xt[:,.2],.c=Xt).pl.ax |
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| a0a0 | 29 0a 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d | ).pl.ylabel('Blue').pl.title('Im |
| a0c0 | 61 67 65 20 32 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 | age.2').pl.tight_layout()...#### |
| a0e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| a100 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| a120 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 68 65 20 64 69 66 | ##########.#.Instantiate.the.dif |
| a140 | 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 73 20 61 6e 64 20 | ferent.transport.algorithms.and. |
| a160 | 66 69 74 20 74 68 65 6d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | fit.them.#.--------------------- |
| a180 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| a1a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 | ------..#.EMDTransport.ot_emd.=. |
| a1c0 | 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 0a 6f 74 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 | ot.da.EMDTransport().ot_emd.fit( |
| a1e0 | 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f | Xs=Xs,.Xt=Xt)..#.SinkhornTranspo |
| a200 | 72 74 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 | rt.ot_sinkhorn.=.ot.da.SinkhornT |
| a220 | 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e | ransport(reg_e=1e-1).ot_sinkhorn |
| a240 | 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e | .fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)..#.prediction |
| a260 | 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 69 6d 61 67 65 73 20 28 75 73 69 6e 67 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 61 | .between.images.(using.out.of.sa |
| a280 | 6d 70 6c 65 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e 20 61 73 20 69 6e 20 5b 36 5d 29 0a 74 72 61 6e 73 | mple.prediction.as.in.[6]).trans |
| a2a0 | 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 | p_Xs_emd.=.ot_emd.transform(Xs=X |
| a2c0 | 31 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 69 6e 76 65 72 73 | 1).transp_Xt_emd.=.ot_emd.invers |
| a2e0 | 65 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 74 3d 58 32 29 0a 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 | e_transform(Xt=X2)..transp_Xs_si |
| a300 | 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 | nkhorn.=.ot_sinkhorn.transform(X |
| a320 | 73 3d 58 31 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 | s=X1).transp_Xt_sinkhorn.=.ot_si |
| a340 | 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 69 6e 76 65 72 73 65 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 74 3d 58 32 29 0a | nkhorn.inverse_transform(Xt=X2). |
| a360 | 0a 49 31 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 | .I1t.=.minmax(mat2im(transp_Xs_e |
| a380 | 6d 64 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 49 32 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 | md,.I1.shape)).I2t.=.minmax(mat2 |
| a3a0 | 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 65 6d 64 2c 20 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 49 31 | im(transp_Xt_emd,.I2.shape))..I1 |
| a3c0 | 74 65 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e | te.=.minmax(mat2im(transp_Xs_sin |
| a3e0 | 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 49 32 74 65 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 | khorn,.I1.shape)).I2te.=.minmax( |
| a400 | 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 32 2e 73 68 | mat2im(transp_Xt_sinkhorn,.I2.sh |
| a420 | 61 70 65 29 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ape))...######################## |
| a440 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| a460 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 6e 65 | ######################.#.Plot.ne |
| a480 | 77 20 69 6d 61 67 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 | w.images.#.---------------..pl.f |
| a4a0 | 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 | igure(3,.figsize=(8,.4))..pl.sub |
| a4c0 | 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 0a 70 6c 2e 61 | plot(2,.3,.1).pl.imshow(I1).pl.a |
| a4e0 | 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a 0a | xis('off').pl.title('Image.1').. |
| a500 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 | pl.subplot(2,.3,.2).pl.imshow(I1 |
| a520 | 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 | t).pl.axis('off').pl.title('Imag |
| a540 | 65 20 31 20 41 64 61 70 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 | e.1.Adapt')..pl.subplot(2,.3,.3) |
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| a580 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 0a | pl.title('Image.1.Adapt.(reg)'). |
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| a9e0 | 2e 70 6e 67 27 29 5b 3a 2c 20 3a 2c 20 32 5d 0a 0a 41 20 3d 20 5b 5d 0a 66 31 20 3d 20 66 31 20 | .png')[:,.:,.2]..A.=.[].f1.=.f1. |
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| aa80 | 41 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 41 29 0a 0a 6e 62 5f 69 6d 61 67 65 73 20 3d 20 35 0a 0a | A.=.np.array(A)..nb_images.=.5.. |
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| ab60 | 28 28 30 2c 20 30 2c 20 30 2c 20 31 29 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ((0,.0,.0,.1))...############### |
| ab80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| aba0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a | ###############################. |
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| ac00 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 23 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 | ---------------------.#..pl.figu |
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| acc0 | 20 66 6f 72 20 6a 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 62 5f 69 6d 61 67 65 73 29 3a 0a 20 20 20 20 | .for.j.in.range(nb_images):..... |
| ace0 | 20 20 20 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 6e 62 5f 69 6d 61 67 65 73 2c 20 6e 62 5f 69 6d 61 | ....pl.subplot(nb_images,.nb_ima |
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| ad40 | 20 31 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 74 79 20 3d 20 66 6c 6f 61 74 28 6a 29 20 2f 20 28 6e 62 5f | .1).........ty.=.float(j)./.(nb_ |
| ad60 | 69 6d 61 67 65 73 20 2d 20 31 29 0a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 23 20 77 65 69 67 68 74 73 20 61 | images.-.1)..........#.weights.a |
| ad80 | 72 65 20 63 6f 6e 73 74 72 75 63 74 65 64 20 62 79 20 62 69 6c 69 6e 65 61 72 20 69 6e 74 65 72 | re.constructed.by.bilinear.inter |
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| ade0 | 31 20 2d 20 74 78 29 20 2a 20 76 33 20 2b 20 74 78 20 2a 20 76 34 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 77 | 1.-.tx).*.v3.+.tx.*.v4.........w |
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| aee0 | 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 65 6c 69 66 20 69 20 3d 3d 20 | l.axis('off').........elif.i.==. |
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| af40 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 20 20 20 20 20 20 | ...........pl.axis('off')....... |
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| af80 | 6a 20 3d 3d 20 28 6e 62 5f 69 6d 61 67 65 73 20 2d 20 31 29 3a 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | j.==.(nb_images.-.1):........... |
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| afc0 | 20 20 20 20 20 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 65 6c 73 65 | .....pl.axis('off').........else |
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| be80 | 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 | ys,.Xt=Xt)..#.Sinkhorn.Transport |
| bea0 | 20 77 69 74 68 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e | .with.Group.lasso.regularization |
| bec0 | 20 6c 31 6c 32 0a 6f 74 5f 6c 31 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 | .l1l2.ot_l1l2.=.ot.da.SinkhornL1 |
| bee0 | 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 2c 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 32 | l2Transport(reg_e=1e-1,.reg_cl=2 |
| bf00 | 65 30 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | e0,.max_iter=20,................ |
| bf20 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 | .......................verbose=T |
| bf40 | 72 75 65 29 0a 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 | rue).ot_l1l2.fit(Xs=Xs,.ys=ys,.X |
| bf60 | 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 | t=Xt)..#.transport.source.sample |
| bf80 | 73 20 6f 6e 74 6f 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f | s.onto.target.samples.transp_Xs_ |
| bfa0 | 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 74 72 | emd.=.ot_emd.transform(Xs=Xs).tr |
| bfc0 | 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 | ansp_Xs_sinkhorn.=.ot_sinkhorn.t |
| bfe0 | 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d | ransform(Xs=Xs).transp_Xs_lpl1.= |
| c000 | 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 74 72 61 6e 73 70 | .ot_lpl1.transform(Xs=Xs).transp |
| c020 | 5f 58 73 5f 6c 31 6c 32 20 3d 20 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d | _Xs_l1l2.=.ot_l1l2.transform(Xs= |
| c040 | 58 73 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | Xs)...########################## |
| c060 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| c080 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 | ####################.#.Fig.1.:.p |
| c0a0 | 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 23 | lots.source.and.target.samples.# |
| c0c0 | 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .------------------------------- |
| c0e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 | --------..pl.figure(1,.figsize=( |
| c100 | 31 30 2c 20 35 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 | 10,.5)).pl.subplot(1,.2,.1).pl.s |
| c120 | 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c | catter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys, |
| c140 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c | .marker='+',.label='Source.sampl |
| c160 | 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 | es').pl.xticks([]).pl.yticks([]) |
| c180 | 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 | .pl.legend(loc=0).pl.title('Sour |
| c1a0 | 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 | ce..samples')..pl.subplot(1,.2,. |
| c1c0 | 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d | 2).pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1] |
| c1e0 | 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 | ,.c=yt,.marker='o',.label='Targe |
| c200 | 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 | t.samples').pl.xticks([]).pl.yti |
| c220 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | cks([]).pl.legend(loc=0).pl.titl |
| c240 | 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 | e('Target.samples').pl.tight_lay |
| c260 | 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | out()...######################## |
| c280 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| c2a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 32 20 3a | ######################.#.Fig.2.: |
| c2c0 | 20 70 6c 6f 74 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 61 6e 64 20 74 72 61 6e | .plot.optimal.couplings.and.tran |
| c2e0 | 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | sported.samples.#.-------------- |
| c300 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| c320 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 20 3d 20 7b 27 69 6e 74 65 72 70 6f 6c | --------..param_img.=.{'interpol |
| c340 | 61 74 69 6f 6e 27 3a 20 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 7d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c | ation':.'nearest'}..pl.figure(2, |
| c360 | 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 35 2c 20 38 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 | .figsize=(15,.8)).pl.subplot(2,. |
| c380 | 34 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f | 4,.1).pl.imshow(ot_emd.coupling_ |
| c3a0 | 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e | ,.**param_img).pl.xticks([]).pl. |
| c3c0 | 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 | yticks([]).pl.title('Optimal.cou |
| c3e0 | 70 6c 69 6e 67 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | pling\nEMDTransport')..pl.subplo |
| c400 | 74 28 32 2c 20 34 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e | t(2,.4,.2).pl.imshow(ot_sinkhorn |
| c420 | 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 | .coupling_,.**param_img).pl.xtic |
| c440 | 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f | ks([]).pl.yticks([]).pl.title('O |
| c460 | 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f | ptimal.coupling\nSinkhornTranspo |
| c480 | 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 | rt')..pl.subplot(2,.4,.3).pl.ims |
| c4a0 | 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 | how(ot_lpl1.coupling_,.**param_i |
| c4c0 | 6d 67 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a | mg).pl.xticks([]).pl.yticks([]). |
| c4e0 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b | pl.title('Optimal.coupling\nSink |
| c500 | 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | hornLpl1Transport')..pl.subplot( |
| c520 | 32 2c 20 34 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 63 6f 75 70 6c | 2,.4,.4).pl.imshow(ot_l1l2.coupl |
| c540 | 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 | ing_,.**param_img).pl.xticks([]) |
| c560 | 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c | .pl.yticks([]).pl.title('Optimal |
| c580 | 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 | .coupling\nSinkhornL1l2Transport |
| c5a0 | 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 35 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 | ')..pl.subplot(2,.4,.5).pl.scatt |
| c5c0 | 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 | er(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.mar |
| c5e0 | 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 | ker='o',............label='Targe |
| c600 | 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 | t.samples',.alpha=0.3).pl.scatte |
| c620 | 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 | r(transp_Xs_emd[:,.0],.transp_Xs |
| c640 | 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 | _emd[:,.1],.c=ys,............mar |
| c660 | 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c | ker='+',.label='Transp.samples', |
| c680 | 20 73 3d 33 30 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b | .s=30).pl.xticks([]).pl.yticks([ |
| c6a0 | 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | ]).pl.title('Transported.samples |
| c6c0 | 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 22 | \nEmdTransport').pl.legend(loc=" |
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| cf80 | 70 2e 61 70 70 65 6e 64 28 78 74 2c 20 28 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 28 6e 5f 6e | p.append(xt,.(np.random.rand(n_n |
| cfa0 | 6f 69 73 65 2c 20 32 29 20 2b 20 31 29 20 2a 20 2d 33 29 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c | oise,.2).+.1).*.-3).reshape((-1, |
| cfc0 | 20 32 29 29 0d 0a 0d 0a 4d 20 3d 20 73 70 2e 73 70 61 74 69 61 6c 2e 64 69 73 74 61 6e 63 65 2e | .2))....M.=.sp.spatial.distance. |
| cfe0 | 63 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 29 0d 0a 0d 0a 66 69 67 20 3d 20 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 | cdist(xs,.xt)....fig.=.pl.figure |
| d000 | 28 29 0d 0a 61 78 31 20 3d 20 66 69 67 2e 61 64 64 5f 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 33 31 29 0d 0a | ()..ax1.=.fig.add_subplot(131).. |
| d020 | 61 78 31 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 | ax1.plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+b |
| d040 | 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0d 0a 61 78 32 20 | ',.label='Source.samples')..ax2. |
| d060 | 3d 20 66 69 67 2e 61 64 64 5f 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 33 32 29 0d 0a 61 78 32 2e 73 63 61 74 | =.fig.add_subplot(132)..ax2.scat |
| d080 | 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 72 | ter(xt[:,.0],.xt[:,.1],.color='r |
| d0a0 | 27 29 0d 0a 61 78 33 20 3d 20 66 69 67 2e 61 64 64 5f 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 33 33 29 0d 0a | ')..ax3.=.fig.add_subplot(133).. |
| d0c0 | 61 78 33 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 29 0d 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0d 0a 0d 0a 23 23 23 23 | ax3.imshow(M)..pl.show()....#### |
| d0e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| d100 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| d120 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0d 0a 23 0d 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 70 61 72 74 69 61 6c 20 | #########..#..#.Compute.partial. |
| d140 | 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 70 6c 61 6e 73 20 61 6e 64 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 2c 0d | Wasserstein.plans.and.distance,. |
| d160 | 0a 23 20 62 79 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 69 6e 67 20 35 30 25 20 6f 66 20 74 68 65 20 6d 61 | .#.by.transporting.50%.of.the.ma |
| d180 | 73 73 0d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | ss..#.-------------------------- |
| d1a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 0d 0a 70 20 3d 20 6f 74 2e 75 | --------------------....p.=.ot.u |
| d1c0 | 6e 69 66 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 2b 20 6e 5f 6e 6f 69 73 65 29 0d 0a 71 20 3d 20 6f 74 | nif(n_samples.+.n_noise)..q.=.ot |
| d1e0 | 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 2b 20 6e 5f 6e 6f 69 73 65 29 0d 0a 0d 0a 77 30 | .unif(n_samples.+.n_noise)....w0 |
| d200 | 2c 20 6c 6f 67 30 20 3d 20 6f 74 2e 70 61 72 74 69 61 6c 2e 70 61 72 74 69 61 6c 5f 77 61 73 73 | ,.log0.=.ot.partial.partial_wass |
| d220 | 65 72 73 74 65 69 6e 28 70 2c 20 71 2c 20 4d 2c 20 6d 3d 30 2e 35 2c 20 6c 6f 67 3d 54 72 75 65 | erstein(p,.q,.M,.m=0.5,.log=True |
| d240 | 29 0d 0a 77 2c 20 6c 6f 67 20 3d 20 6f 74 2e 70 61 72 74 69 61 6c 2e 65 6e 74 72 6f 70 69 63 5f | )..w,.log.=.ot.partial.entropic_ |
| d260 | 70 61 72 74 69 61 6c 5f 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 28 70 2c 20 71 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 | partial_wasserstein(p,.q,.M,.reg |
| d280 | 3d 30 2e 31 2c 20 6d 3d 30 2e 35 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | =0.1,.m=0.5,.................... |
| d2a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c | ...............................l |
| d2c0 | 6f 67 3d 54 72 75 65 29 0d 0a 0d 0a 70 72 69 6e 74 28 27 50 61 72 74 69 61 6c 20 57 61 73 73 65 | og=True)....print('Partial.Wasse |
| d2e0 | 72 73 74 65 69 6e 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 20 28 6d 20 3d 20 30 2e 35 29 3a 20 27 20 2b 20 73 | rstein.distance.(m.=.0.5):.'.+.s |
| d300 | 74 72 28 6c 6f 67 30 5b 27 70 61 72 74 69 61 6c 5f 77 5f 64 69 73 74 27 5d 29 29 0d 0a 70 72 69 | tr(log0['partial_w_dist']))..pri |
| d320 | 6e 74 28 27 45 6e 74 72 6f 70 69 63 20 70 61 72 74 69 61 6c 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e | nt('Entropic.partial.Wasserstein |
| d340 | 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 20 28 6d 20 3d 20 30 2e 35 29 3a 20 27 20 2b 0d 0a 20 20 20 20 20 20 | .distance.(m.=.0.5):.'.+........ |
| d360 | 73 74 72 28 6c 6f 67 5b 27 70 61 72 74 69 61 6c 5f 77 5f 64 69 73 74 27 5d 29 29 0d 0a 0d 0a 70 | str(log['partial_w_dist']))....p |
| d380 | 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 28 31 30 2c 20 35 29 29 0d 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | l.figure(1,.(10,.5))..pl.subplot |
| d3a0 | 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0d 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 77 30 2c 20 63 6d 61 70 3d 27 6a | (1,.2,.1)..pl.imshow(w0,.cmap='j |
| d3c0 | 65 74 27 29 0d 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 61 72 74 69 61 6c 20 57 61 73 73 65 72 73 74 | et')..pl.title('Partial.Wasserst |
| d3e0 | 65 69 6e 27 29 0d 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0d 0a 70 6c 2e 69 | ein')..pl.subplot(1,.2,.2)..pl.i |
| d400 | 6d 73 68 6f 77 28 77 2c 20 63 6d 61 70 3d 27 6a 65 74 27 29 0d 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | mshow(w,.cmap='jet')..pl.title(' |
| d420 | 45 6e 74 72 6f 70 69 63 20 70 61 72 74 69 61 6c 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 0d 0a | Entropic.partial.Wasserstein').. |
| d440 | 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0d 0a 0d 0a 0d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | pl.show()......################# |
| d460 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| d480 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0d 0a 23 0d | ############################..#. |
| d4a0 | 0a 23 20 53 61 6d 70 6c 65 20 6f 6e 65 20 32 44 20 61 6e 64 20 33 44 20 47 61 75 73 73 69 61 6e | .#.Sample.one.2D.and.3D.Gaussian |
| d4c0 | 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 61 6e 64 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 6d 0d 0a 23 20 | .distributions.and.plot.them..#. |
| d4e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| d500 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 23 0d 0a 23 20 | -------------------------..#..#. |
| d520 | 54 68 65 20 47 72 6f 6d 6f 76 2d 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 20 | The.Gromov-Wasserstein.distance. |
| d540 | 61 6c 6c 6f 77 73 20 74 6f 20 63 6f 6d 70 75 74 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 20 77 69 74 68 | allows.to.compute.distances.with |
| d560 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 74 68 61 74 0d 0a 23 20 64 6f 20 6e 6f 74 20 62 65 6c 6f 6e 67 20 74 | .samples.that..#.do.not.belong.t |
| d580 | 6f 20 74 68 65 20 73 61 6d 65 20 6d 65 74 72 69 63 20 73 70 61 63 65 2e 20 46 6f 72 20 64 65 6d | o.the.same.metric.space..For.dem |
| d5a0 | 6f 6e 73 74 72 61 74 69 6f 6e 20 70 75 72 70 6f 73 65 2c 20 77 65 20 73 61 6d 70 6c 65 0d 0a 23 | onstration.purpose,.we.sample..# |
| d5c0 | 20 74 77 6f 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 69 6e 20 32 | .two.Gaussian.distributions.in.2 |
| d5e0 | 2d 20 61 6e 64 20 33 2d 64 69 6d 65 6e 73 69 6f 6e 61 6c 20 73 70 61 63 65 73 2e 0d 0a 0d 0a 6e | -.and.3-dimensional.spaces.....n |
| d600 | 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 32 30 20 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0d 0a 6e 5f 6e | _samples.=.20..#.nb.samples..n_n |
| d620 | 6f 69 73 65 20 3d 20 31 30 20 20 23 20 6e 62 20 6f 66 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 28 6e 6f 69 73 | oise.=.10..#.nb.of.samples.(nois |
| d640 | 65 29 0d 0a 0d 0a 70 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 2b 20 6e 5f | e)....p.=.ot.unif(n_samples.+.n_ |
| d660 | 6e 6f 69 73 65 29 0d 0a 71 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 2b 20 | noise)..q.=.ot.unif(n_samples.+. |
| d680 | 6e 5f 6e 6f 69 73 65 29 0d 0a 0d 0a 6d 75 5f 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 30 2c 20 | n_noise)....mu_s.=.np.array([0,. |
| d6a0 | 30 5d 29 0d 0a 63 6f 76 5f 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 5b 31 2c 20 30 5d 2c 20 5b | 0])..cov_s.=.np.array([[1,.0],.[ |
| d6c0 | 30 2c 20 31 5d 5d 29 0d 0a 0d 0a 6d 75 5f 74 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 30 2c 20 30 | 0,.1]])....mu_t.=.np.array([0,.0 |
| d6e0 | 2c 20 30 5d 29 0d 0a 63 6f 76 5f 74 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 5b 31 2c 20 30 2c 20 | ,.0])..cov_t.=.np.array([[1,.0,. |
| d700 | 30 5d 2c 20 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 5d 2c 20 5b 30 2c 20 30 2c 20 31 5d 5d 29 0d 0a 0d 0a 0d 0a | 0],.[0,.1,.0],.[0,.0,.1]])...... |
| d720 | 78 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 6d 61 6b 65 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 | xs.=.ot.datasets.make_2D_samples |
| d740 | 5f 67 61 75 73 73 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 6d 75 5f 73 2c 20 63 6f 76 5f 73 29 0d 0a | _gauss(n_samples,.mu_s,.cov_s).. |
| d760 | 78 73 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 6e 63 61 74 65 6e 61 74 65 28 28 78 73 2c 20 28 28 6e 70 2e 72 61 | xs.=.np.concatenate((xs,.((np.ra |
| d780 | 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 28 6e 5f 6e 6f 69 73 65 2c 20 32 29 20 2b 20 31 29 20 2a 20 34 29 29 | ndom.rand(n_noise,.2).+.1).*.4)) |
| d7a0 | 2c 20 61 78 69 73 3d 30 29 0d 0a 50 20 3d 20 73 70 2e 6c 69 6e 61 6c 67 2e 73 71 72 74 6d 28 63 | ,.axis=0)..P.=.sp.linalg.sqrtm(c |
| d7c0 | 6f 76 5f 74 29 0d 0a 78 74 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 5f 73 61 | ov_t)..xt.=.np.random.randn(n_sa |
| d7e0 | 6d 70 6c 65 73 2c 20 33 29 2e 64 6f 74 28 50 29 20 2b 20 6d 75 5f 74 0d 0a 78 74 20 3d 20 6e 70 | mples,.3).dot(P).+.mu_t..xt.=.np |
| d800 | 2e 63 6f 6e 63 61 74 65 6e 61 74 65 28 28 78 74 2c 20 28 28 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 | .concatenate((xt,.((np.random.ra |
| d820 | 6e 64 28 6e 5f 6e 6f 69 73 65 2c 20 33 29 20 2b 20 31 29 20 2a 20 31 30 29 29 2c 20 61 78 69 73 | nd(n_noise,.3).+.1).*.10)),.axis |
| d840 | 3d 30 29 0d 0a 0d 0a 66 69 67 20 3d 20 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 29 0d 0a 61 78 31 20 3d 20 | =0)....fig.=.pl.figure()..ax1.=. |
| d860 | 66 69 67 2e 61 64 64 5f 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 32 31 29 0d 0a 61 78 31 2e 70 6c 6f 74 28 78 | fig.add_subplot(121)..ax1.plot(x |
| d880 | 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | s[:,.0],.xs[:,.1],.'+b',.label=' |
| d8a0 | 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0d 0a 61 78 32 20 3d 20 66 69 67 2e 61 64 64 5f | Source.samples')..ax2.=.fig.add_ |
| d8c0 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 32 32 2c 20 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 3d 27 33 64 27 29 0d 0a 61 | subplot(122,.projection='3d')..a |
| d8e0 | 78 32 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 78 | x2.scatter(xt[:,.0],.xt[:,.1],.x |
| d900 | 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 72 27 29 0d 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0d 0a | t[:,.2],.color='r')..pl.show().. |
| d920 | 0d 0a 0d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ....############################ |
| d940 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| d960 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0d 0a 23 0d 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 | #################..#..#.Compute. |
| d980 | 70 61 72 74 69 61 6c 20 47 72 6f 6d 6f 76 2d 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 70 6c 61 6e 73 | partial.Gromov-Wasserstein.plans |
| d9a0 | 20 61 6e 64 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 2c 0d 0a 23 20 62 79 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 69 6e | .and.distance,..#.by.transportin |
| d9c0 | 67 20 31 30 30 25 20 61 6e 64 20 32 2f 33 20 6f 66 20 74 68 65 20 6d 61 73 73 0d 0a 23 20 2d 2d | g.100%.and.2/3.of.the.mass..#.-- |
| d9e0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| da00 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 0d 0a 43 31 20 3d 20 73 70 2e 73 | -------------------....C1.=.sp.s |
| da20 | 70 61 74 69 61 6c 2e 64 69 73 74 61 6e 63 65 2e 63 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 73 29 0d 0a 43 | patial.distance.cdist(xs,.xs)..C |
| da40 | 32 20 3d 20 73 70 2e 73 70 61 74 69 61 6c 2e 64 69 73 74 61 6e 63 65 2e 63 64 69 73 74 28 78 74 | 2.=.sp.spatial.distance.cdist(xt |
| da60 | 2c 20 78 74 29 0d 0a 0d 0a 70 72 69 6e 74 28 27 2d 2d 2d 2d 2d 6d 20 3d 20 31 27 29 0d 0a 6d 20 | ,.xt)....print('-----m.=.1')..m. |
| da80 | 3d 20 31 0d 0a 72 65 73 30 2c 20 6c 6f 67 30 20 3d 20 6f 74 2e 70 61 72 74 69 61 6c 2e 70 61 72 | =.1..res0,.log0.=.ot.partial.par |
| daa0 | 74 69 61 6c 5f 67 72 6f 6d 6f 76 5f 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 28 43 31 2c 20 43 32 2c 20 | tial_gromov_wasserstein(C1,.C2,. |
| dac0 | 70 2c 20 71 2c 20 6d 3d 6d 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | p,.q,.m=m,...................... |
| dae0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c | ...............................l |
| db00 | 6f 67 3d 54 72 75 65 29 0d 0a 72 65 73 2c 20 6c 6f 67 20 3d 20 6f 74 2e 70 61 72 74 69 61 6c 2e | og=True)..res,.log.=.ot.partial. |
| db20 | 65 6e 74 72 6f 70 69 63 5f 70 61 72 74 69 61 6c 5f 67 72 6f 6d 6f 76 5f 77 61 73 73 65 72 73 74 | entropic_partial_gromov_wasserst |
| db40 | 65 69 6e 28 43 31 2c 20 43 32 2c 20 70 2c 20 71 2c 20 31 30 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ein(C1,.C2,.p,.q,.10,........... |
| db60 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| db80 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 3d 6d 2c 20 6c 6f 67 3d 54 72 75 65 29 0d | .................m=m,.log=True). |
| dba0 | 0a 0d 0a 70 72 69 6e 74 28 27 50 61 72 74 69 61 6c 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 64 69 | ...print('Partial.Wasserstein.di |
| dbc0 | 73 74 61 6e 63 65 20 28 6d 20 3d 20 31 29 3a 20 27 20 2b 20 73 74 72 28 6c 6f 67 30 5b 27 70 61 | stance.(m.=.1):.'.+.str(log0['pa |
| dbe0 | 72 74 69 61 6c 5f 67 77 5f 64 69 73 74 27 5d 29 29 0d 0a 70 72 69 6e 74 28 27 45 6e 74 72 6f 70 | rtial_gw_dist']))..print('Entrop |
| dc00 | 69 63 20 70 61 72 74 69 61 6c 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 20 | ic.partial.Wasserstein.distance. |
| dc20 | 28 6d 20 3d 20 31 29 3a 20 27 20 2b 0d 0a 20 20 20 20 20 20 73 74 72 28 6c 6f 67 5b 27 70 61 72 | (m.=.1):.'.+........str(log['par |
| dc40 | 74 69 61 6c 5f 67 77 5f 64 69 73 74 27 5d 29 29 0d 0a 0d 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c | tial_gw_dist']))....pl.figure(1, |
| dc60 | 20 28 31 30 2c 20 35 29 29 0d 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 22 6d 61 73 73 20 74 6f 20 62 65 20 | .(10,.5))..pl.title("mass.to.be. |
| dc80 | 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 6d 20 3d 20 31 22 29 0d 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | transported.m.=.1")..pl.subplot( |
| dca0 | 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0d 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 72 65 73 30 2c 20 63 6d 61 70 3d 27 | 1,.2,.1)..pl.imshow(res0,.cmap=' |
| dcc0 | 6a 65 74 27 29 0d 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 61 72 74 69 61 6c 20 57 61 73 73 65 72 73 | jet')..pl.title('Partial.Wassers |
| dce0 | 74 65 69 6e 27 29 0d 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0d 0a 70 6c 2e | tein')..pl.subplot(1,.2,.2)..pl. |
| dd00 | 69 6d 73 68 6f 77 28 72 65 73 2c 20 63 6d 61 70 3d 27 6a 65 74 27 29 0d 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | imshow(res,.cmap='jet')..pl.titl |
| dd20 | 65 28 27 45 6e 74 72 6f 70 69 63 20 70 61 72 74 69 61 6c 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 | e('Entropic.partial.Wasserstein' |
| dd40 | 29 0d 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0d 0a 0d 0a 70 72 69 6e 74 28 27 2d 2d 2d 2d 2d 6d 20 3d 20 | )..pl.show()....print('-----m.=. |
| dd60 | 32 2f 33 27 29 0d 0a 6d 20 3d 20 32 20 2f 20 33 0d 0a 72 65 73 30 2c 20 6c 6f 67 30 20 3d 20 6f | 2/3')..m.=.2./.3..res0,.log0.=.o |
| dd80 | 74 2e 70 61 72 74 69 61 6c 2e 70 61 72 74 69 61 6c 5f 67 72 6f 6d 6f 76 5f 77 61 73 73 65 72 73 | t.partial.partial_gromov_wassers |
| dda0 | 74 65 69 6e 28 43 31 2c 20 43 32 2c 20 70 2c 20 71 2c 20 6d 3d 6d 2c 20 6c 6f 67 3d 54 72 75 65 | tein(C1,.C2,.p,.q,.m=m,.log=True |
| ddc0 | 29 0d 0a 72 65 73 2c 20 6c 6f 67 20 3d 20 6f 74 2e 70 61 72 74 69 61 6c 2e 65 6e 74 72 6f 70 69 | )..res,.log.=.ot.partial.entropi |
| dde0 | 63 5f 70 61 72 74 69 61 6c 5f 67 72 6f 6d 6f 76 5f 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 28 43 31 2c | c_partial_gromov_wasserstein(C1, |
| de00 | 20 43 32 2c 20 70 2c 20 71 2c 20 31 30 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | .C2,.p,.q,.10,.................. |
| de20 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| de40 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 3d 6d 2c 20 6c 6f 67 3d 54 72 75 65 29 0d 0a 0d 0a 70 72 69 6e | ..........m=m,.log=True)....prin |
| de60 | 74 28 27 50 61 72 74 69 61 6c 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 20 | t('Partial.Wasserstein.distance. |
| de80 | 28 6d 20 3d 20 32 2f 33 29 3a 20 27 20 2b 0d 0a 20 20 20 20 20 20 73 74 72 28 6c 6f 67 30 5b 27 | (m.=.2/3):.'.+........str(log0[' |
| dea0 | 70 61 72 74 69 61 6c 5f 67 77 5f 64 69 73 74 27 5d 29 29 0d 0a 70 72 69 6e 74 28 27 45 6e 74 72 | partial_gw_dist']))..print('Entr |
| dec0 | 6f 70 69 63 20 70 61 72 74 69 61 6c 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 64 69 73 74 61 6e 63 | opic.partial.Wasserstein.distanc |
| dee0 | 65 20 28 6d 20 3d 20 32 2f 33 29 3a 20 27 20 2b 0d 0a 20 20 20 20 20 20 73 74 72 28 6c 6f 67 5b | e.(m.=.2/3):.'.+........str(log[ |
| df00 | 27 70 61 72 74 69 61 6c 5f 67 77 5f 64 69 73 74 27 5d 29 29 0d 0a 0d 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 | 'partial_gw_dist']))....pl.figur |
| df20 | 65 28 31 2c 20 28 31 30 2c 20 35 29 29 0d 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 22 6d 61 73 73 20 74 6f | e(1,.(10,.5))..pl.title("mass.to |
| df40 | 20 62 65 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 6d 20 3d 20 32 2f 33 22 29 0d 0a 70 6c 2e 73 75 | .be.transported.m.=.2/3")..pl.su |
| df60 | 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0d 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 72 65 73 30 2c 20 | bplot(1,.2,.1)..pl.imshow(res0,. |
| df80 | 63 6d 61 70 3d 27 6a 65 74 27 29 0d 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 61 72 74 69 61 6c 20 57 | cmap='jet')..pl.title('Partial.W |
| dfa0 | 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 0d 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 | asserstein')..pl.subplot(1,.2,.2 |
| dfc0 | 29 0d 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 72 65 73 2c 20 63 6d 61 70 3d 27 6a 65 74 27 29 0d 0a 70 | )..pl.imshow(res,.cmap='jet')..p |
| dfe0 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 6e 74 72 6f 70 69 63 20 70 61 72 74 69 61 6c 20 57 61 73 73 65 72 | l.title('Entropic.partial.Wasser |
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| e860 | 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0a 69 6d 70 | import.numpy.as.np.import.ot.imp |
| e880 | 6f 72 74 20 6f 74 2e 70 6c 6f 74 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ort.ot.plot...################## |
| e8a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| e8c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 4f | ###########################.#.CO |
| e8e0 | 4d 50 55 54 45 20 54 52 41 4e 53 50 4f 52 54 41 54 49 4f 4e 20 4d 41 54 52 49 58 20 46 4f 52 20 | MPUTE.TRANSPORTATION.MATRIX.FOR. |
| e900 | 53 45 4d 49 2d 44 55 41 4c 20 50 52 4f 42 4c 45 4d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | SEMI-DUAL.PROBLEM.############## |
| e920 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| e940 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a | ###############################. |
| e960 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| e980 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| e9a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 44 49 53 43 52 45 54 45 20 43 41 53 45 3a 0a 23 | #############.#.DISCRETE.CASE:.# |
| e9c0 | 0a 23 20 53 61 6d 70 6c 65 20 74 77 6f 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 | .#.Sample.two.discrete.measures. |
| e9e0 | 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 63 61 73 65 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | for.the.discrete.case.#.-------- |
| ea00 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| ea20 | 2d 2d 2d 2d 2d 0a 23 0a 23 20 44 65 66 69 6e 65 20 32 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6d 65 61 73 | -----.#.#.Define.2.discrete.meas |
| ea40 | 75 72 65 73 20 61 20 61 6e 64 20 62 2c 20 74 68 65 20 70 6f 69 6e 74 73 20 77 68 65 72 65 20 61 | ures.a.and.b,.the.points.where.a |
| ea60 | 72 65 20 64 65 66 69 6e 65 64 20 74 68 65 20 73 6f 75 72 63 65 0a 23 20 61 6e 64 20 74 68 65 20 | re.defined.the.source.#.and.the. |
| ea80 | 74 61 72 67 65 74 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 61 6e 64 20 66 69 6e 61 6c 6c 79 20 74 68 65 20 | target.measures.and.finally.the. |
| eaa0 | 63 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 63 2e 0a 0a 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 20 3d 20 37 0a 6e 5f 74 | cost.matrix.c...n_source.=.7.n_t |
| eac0 | 61 72 67 65 74 20 3d 20 34 0a 72 65 67 20 3d 20 31 0a 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 20 3d 20 31 | arget.=.4.reg.=.1.numItermax.=.1 |
| eae0 | 30 30 30 0a 0a 61 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 29 | 000..a.=.ot.utils.unif(n_source) |
| eb00 | 0a 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 74 61 72 67 65 74 29 0a 0a 72 6e | .b.=.ot.utils.unif(n_target)..rn |
| eb20 | 67 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 52 61 6e 64 6f 6d 53 74 61 74 65 28 30 29 0a 58 5f 73 | g.=.np.random.RandomState(0).X_s |
| eb40 | 6f 75 72 63 65 20 3d 20 72 6e 67 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 2c 20 32 29 0a 59 | ource.=.rng.randn(n_source,.2).Y |
| eb60 | 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 72 6e 67 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 5f 74 61 72 67 65 74 2c 20 32 29 | _target.=.rng.randn(n_target,.2) |
| eb80 | 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 58 5f 73 6f 75 72 63 65 2c 20 59 5f 74 61 72 67 65 74 29 | .M.=.ot.dist(X_source,.Y_target) |
| eba0 | 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ..############################## |
| ebc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| ebe0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 0a 23 20 43 61 6c 6c 20 74 68 65 20 22 53 41 | ###############.#.#.Call.the."SA |
| ec00 | 47 22 20 6d 65 74 68 6f 64 20 74 6f 20 66 69 6e 64 20 74 68 65 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 61 | G".method.to.find.the.transporta |
| ec20 | 74 69 6f 6e 20 6d 61 74 72 69 78 20 69 6e 20 74 68 65 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 63 61 73 65 | tion.matrix.in.the.discrete.case |
| ec40 | 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .#.----------------------------- |
| ec60 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 23 0a 23 20 44 65 66 69 6e 65 20 74 68 65 20 | ----------------.#.#.Define.the. |
| ec80 | 6d 65 74 68 6f 64 20 22 53 41 47 22 2c 20 63 61 6c 6c 20 6f 74 2e 73 6f 6c 76 65 5f 73 65 6d 69 | method."SAG",.call.ot.solve_semi |
| eca0 | 5f 64 75 61 6c 5f 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 61 6e 64 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 0a 23 20 72 65 | _dual_entropic.and.plot.the.#.re |
| ecc0 | 73 75 6c 74 73 2e 0a 0a 6d 65 74 68 6f 64 20 3d 20 22 53 41 47 22 0a 73 61 67 5f 70 69 20 3d 20 | sults...method.=."SAG".sag_pi.=. |
| ece0 | 6f 74 2e 73 74 6f 63 68 61 73 74 69 63 2e 73 6f 6c 76 65 5f 73 65 6d 69 5f 64 75 61 6c 5f 65 6e | ot.stochastic.solve_semi_dual_en |
| ed00 | 74 72 6f 70 69 63 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 6d 65 74 68 6f 64 2c 0a 20 20 20 | tropic(a,.b,.M,.reg,.method,.... |
| ed20 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| ed40 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 29 0a 70 72 69 6e 74 28 73 | .............numItermax).print(s |
| ed60 | 61 67 5f 70 69 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ag_pi)..######################## |
| ed80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| eda0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 45 4d 49 43 4f 4e 54 | #####################.#.SEMICONT |
| edc0 | 49 4e 4f 55 53 20 43 41 53 45 3a 0a 23 0a 23 20 53 61 6d 70 6c 65 20 6f 6e 65 20 67 65 6e 65 72 | INOUS.CASE:.#.#.Sample.one.gener |
| ede0 | 61 6c 20 6d 65 61 73 75 72 65 20 61 2c 20 6f 6e 65 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6d 65 61 73 75 | al.measure.a,.one.discrete.measu |
| ee00 | 72 65 73 20 62 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 63 6f 6e 74 69 6e 6f 75 73 0a 23 20 63 61 | res.b.for.the.semicontinous.#.ca |
| ee20 | 73 65 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | se.#.--------------------------- |
| ee40 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 23 0a 23 20 44 65 66 69 6e 65 20 6f 6e | ------------------.#.#.Define.on |
| ee60 | 65 20 67 65 6e 65 72 61 6c 20 6d 65 61 73 75 72 65 20 61 2c 20 6f 6e 65 20 64 69 73 63 72 65 74 | e.general.measure.a,.one.discret |
| ee80 | 65 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 62 2c 20 74 68 65 20 70 6f 69 6e 74 73 20 77 68 65 72 65 0a 23 | e.measures.b,.the.points.where.# |
| eea0 | 20 61 72 65 20 64 65 66 69 6e 65 64 20 74 68 65 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 68 65 20 | .are.defined.the.source.and.the. |
| eec0 | 74 61 72 67 65 74 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 61 6e 64 20 66 69 6e 61 6c 6c 79 20 74 68 65 20 | target.measures.and.finally.the. |
| eee0 | 63 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 63 2e 0a 0a 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 20 3d 20 37 0a 6e 5f 74 | cost.matrix.c...n_source.=.7.n_t |
| ef00 | 61 72 67 65 74 20 3d 20 34 0a 72 65 67 20 3d 20 31 0a 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 78 20 3d 20 31 | arget.=.4.reg.=.1.numItermax.=.1 |
| ef20 | 30 30 30 0a 6c 6f 67 20 3d 20 54 72 75 65 0a 0a 61 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 75 6e 69 | 000.log.=.True..a.=.ot.utils.uni |
| ef40 | 66 28 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 29 0a 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f | f(n_source).b.=.ot.utils.unif(n_ |
| ef60 | 74 61 72 67 65 74 29 0a 0a 72 6e 67 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 52 61 6e 64 6f 6d 53 | target)..rng.=.np.random.RandomS |
| ef80 | 74 61 74 65 28 30 29 0a 58 5f 73 6f 75 72 63 65 20 3d 20 72 6e 67 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 5f 73 | tate(0).X_source.=.rng.randn(n_s |
| efa0 | 6f 75 72 63 65 2c 20 32 29 0a 59 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 72 6e 67 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e | ource,.2).Y_target.=.rng.randn(n |
| efc0 | 5f 74 61 72 67 65 74 2c 20 32 29 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 58 5f 73 6f 75 72 63 65 | _target,.2).M.=.ot.dist(X_source |
| efe0 | 2c 20 59 5f 74 61 72 67 65 74 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ,.Y_target)..################### |
| f000 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| f020 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 0a 23 20 43 | ##########################.#.#.C |
| f040 | 61 6c 6c 20 74 68 65 20 22 41 53 47 44 22 20 6d 65 74 68 6f 64 20 74 6f 20 66 69 6e 64 20 74 68 | all.the."ASGD".method.to.find.th |
| f060 | 65 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 61 74 69 6f 6e 20 6d 61 74 72 69 78 20 69 6e 20 74 68 65 20 73 | e.transportation.matrix.in.the.s |
| f080 | 65 6d 69 63 6f 6e 74 69 6e 6f 75 73 0a 23 20 63 61 73 65 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | emicontinous.#.case.#.---------- |
| f0a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| f0c0 | 2d 2d 2d 0a 23 0a 23 20 44 65 66 69 6e 65 20 74 68 65 20 6d 65 74 68 6f 64 20 22 41 53 47 44 22 | ---.#.#.Define.the.method."ASGD" |
| f0e0 | 2c 20 63 61 6c 6c 20 6f 74 2e 73 6f 6c 76 65 5f 73 65 6d 69 5f 64 75 61 6c 5f 65 6e 74 72 6f 70 | ,.call.ot.solve_semi_dual_entrop |
| f100 | 69 63 20 61 6e 64 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 0a 23 20 72 65 73 75 6c 74 73 2e 0a 0a 6d 65 74 68 | ic.and.plot.the.#.results...meth |
| f120 | 6f 64 20 3d 20 22 41 53 47 44 22 0a 61 73 67 64 5f 70 69 2c 20 6c 6f 67 5f 61 73 67 64 20 3d 20 | od.=."ASGD".asgd_pi,.log_asgd.=. |
| f140 | 6f 74 2e 73 74 6f 63 68 61 73 74 69 63 2e 73 6f 6c 76 65 5f 73 65 6d 69 5f 64 75 61 6c 5f 65 6e | ot.stochastic.solve_semi_dual_en |
| f160 | 74 72 6f 70 69 63 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 6d 65 74 68 6f 64 2c 0a 20 20 20 | tropic(a,.b,.M,.reg,.method,.... |
| f180 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| f1a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 75 6d 49 74 65 72 6d | ........................numIterm |
| f1c0 | 61 78 2c 20 6c 6f 67 3d 6c 6f 67 29 0a 70 72 69 6e 74 28 6c 6f 67 5f 61 73 67 64 5b 27 61 6c 70 | ax,.log=log).print(log_asgd['alp |
| f1e0 | 68 61 27 5d 2c 20 6c 6f 67 5f 61 73 67 64 5b 27 62 65 74 61 27 5d 29 0a 70 72 69 6e 74 28 61 73 | ha'],.log_asgd['beta']).print(as |
| f200 | 67 64 5f 70 69 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | gd_pi)..######################## |
| f220 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| f240 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 0a 23 20 43 6f 6d 70 61 72 | #####################.#.#.Compar |
| f260 | 65 20 74 68 65 20 72 65 73 75 6c 74 73 20 77 69 74 68 20 74 68 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 | e.the.results.with.the.Sinkhorn. |
| f280 | 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | algorithm.#.-------------------- |
| f2a0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 23 0a 23 20 43 61 | -------------------------.#.#.Ca |
| f2c0 | 6c 6c 20 74 68 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 20 66 72 6f 6d 20 50 | ll.the.Sinkhorn.algorithm.from.P |
| f2e0 | 4f 54 0a 0a 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 70 69 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c | OT..sinkhorn_pi.=.ot.sinkhorn(a, |
| f300 | 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 29 0a 70 72 69 6e 74 28 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 70 69 29 0a 0a | .b,.M,.reg).print(sinkhorn_pi).. |
| f320 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
| f340 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| f360 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 4c 4f 54 20 54 52 41 4e 53 50 4f 52 54 | ###############.#.PLOT.TRANSPORT |
| f380 | 41 54 49 4f 4e 20 4d 41 54 52 49 58 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ATION.MATRIX.################### |
| f3a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| f3c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 23 23 | ###########################..### |
| f3e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| f400 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| f420 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 53 41 47 20 72 65 73 75 6c 74 73 0a 23 | ###########.#.Plot.SAG.results.# |
| f440 | 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 | .----------------..pl.figure(4,. |
| f460 | 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d | figsize=(5,.5)).ot.plot.plot1D_m |
| f480 | 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 73 61 67 5f 70 69 2c 20 27 73 65 6d 69 2d 64 75 61 6c 20 3a 20 4f 54 | at(a,.b,.sag_pi,.'semi-dual.:.OT |
| f4a0 | 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 41 47 27 29 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 | .matrix.SAG').pl.show()...###### |
| f4c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| f4e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| f500 | 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 41 53 47 44 20 72 65 73 75 6c 74 73 0a 23 20 2d | ########.#.Plot.ASGD.results.#.- |
| f520 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 | ----------------..pl.figure(4,.f |
| f540 | 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 | igsize=(5,.5)).ot.plot.plot1D_ma |
| f560 | 74 28 61 2c 20 62 2c 20 61 73 67 64 5f 70 69 2c 20 27 73 65 6d 69 2d 64 75 61 6c 20 3a 20 4f 54 | t(a,.b,.asgd_pi,.'semi-dual.:.OT |
| f580 | 20 6d 61 74 72 69 78 20 41 53 47 44 27 29 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 | .matrix.ASGD').pl.show()...##### |
| f5a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| f5c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| f5e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 72 65 73 75 6c 74 | #########.#.Plot.Sinkhorn.result |
| f600 | 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 | s.#.---------------------..pl.fi |
| f620 | 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e | gure(4,.figsize=(5,.5)).ot.plot. |
| f640 | 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 70 69 2c 20 27 4f | plot1D_mat(a,.b,.sinkhorn_pi,.'O |
| f660 | 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 0a 0a | T.matrix.Sinkhorn').pl.show()... |
| f680 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| f6a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| f6c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 4f 4d 50 55 54 45 20 54 52 41 4e 53 50 4f 52 | #############.#.COMPUTE.TRANSPOR |
| f6e0 | 54 41 54 49 4f 4e 20 4d 41 54 52 49 58 20 46 4f 52 20 44 55 41 4c 20 50 52 4f 42 4c 45 4d 0a 23 | TATION.MATRIX.FOR.DUAL.PROBLEM.# |
| f700 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| f720 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| f740 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ############.################### |
| f760 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| f780 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 45 4d | ##########################.#.SEM |
| f7a0 | 49 43 4f 4e 54 49 4e 4f 55 53 20 43 41 53 45 3a 0a 23 0a 23 20 53 61 6d 70 6c 65 20 6f 6e 65 20 | ICONTINOUS.CASE:.#.#.Sample.one. |
| f7c0 | 67 65 6e 65 72 61 6c 20 6d 65 61 73 75 72 65 20 61 2c 20 6f 6e 65 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 | general.measure.a,.one.discrete. |
| f7e0 | 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 62 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 63 6f 6e 74 69 6e 6f 75 73 | measures.b.for.the.semicontinous |
| f800 | 0a 23 20 63 61 73 65 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .#.case.#.---------------------- |
| f820 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 23 0a 23 20 44 65 66 69 | -----------------------.#.#.Defi |
| f840 | 6e 65 20 6f 6e 65 20 67 65 6e 65 72 61 6c 20 6d 65 61 73 75 72 65 20 61 2c 20 6f 6e 65 20 64 69 | ne.one.general.measure.a,.one.di |
| f860 | 73 63 72 65 74 65 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 62 2c 20 74 68 65 20 70 6f 69 6e 74 73 20 77 68 | screte.measures.b,.the.points.wh |
| f880 | 65 72 65 0a 23 20 61 72 65 20 64 65 66 69 6e 65 64 20 74 68 65 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 | ere.#.are.defined.the.source.and |
| f8a0 | 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 6d 65 61 73 75 72 65 73 20 61 6e 64 20 66 69 6e 61 6c 6c 79 | .the.target.measures.and.finally |
| f8c0 | 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 63 2e 0a 0a 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 20 3d 20 | .the.cost.matrix.c...n_source.=. |
| f8e0 | 37 0a 6e 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 34 0a 72 65 67 20 3d 20 31 0a 6e 75 6d 49 74 65 72 6d 61 | 7.n_target.=.4.reg.=.1.numIterma |
| f900 | 78 20 3d 20 31 30 30 30 30 30 0a 6c 72 20 3d 20 30 2e 31 0a 62 61 74 63 68 5f 73 69 7a 65 20 3d | x.=.100000.lr.=.0.1.batch_size.= |
| f920 | 20 33 0a 6c 6f 67 20 3d 20 54 72 75 65 0a 0a 61 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 75 6e 69 66 | .3.log.=.True..a.=.ot.utils.unif |
| f940 | 28 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 29 0a 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 74 | (n_source).b.=.ot.utils.unif(n_t |
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| f980 | 61 74 65 28 30 29 0a 58 5f 73 6f 75 72 63 65 20 3d 20 72 6e 67 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 5f 73 6f | ate(0).X_source.=.rng.randn(n_so |
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| fc20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
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| fe20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
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| 104c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 0a 23 20 2d 2d | ###############.#.Plot.data.#.-- |
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| 116e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 11700 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 44 61 | ###########################.#.Da |
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| 11d40 | 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 70 20 3d 20 6e 70 2e 73 71 72 74 28 6f 74 2e 64 | .#.loss.matrix.Mp.=.np.sqrt(ot.d |
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| 153a0 | 6c 61 62 65 6c 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | label...######################## |
| 153c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 153e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 31 20 3a | ######################.#.Fig.1.: |
| 15400 | 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | .plots.source.and.target.samples |
| 15420 | 20 2b 20 6d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 0a 23 | .+.matrix.of.pairwise.distance.# |
| 15440 | 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .------------------------------- |
| 15460 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 15480 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 | ------..pl.figure(1,.figsize=(10 |
| 154a0 | 2c 20 31 30 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 | ,.10)).pl.subplot(2,.2,.1).pl.sc |
| 154c0 | 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 | atter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,. |
| 154e0 | 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 | marker='+',.label='Source.sample |
| 15500 | 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a | s').pl.xticks([]).pl.yticks([]). |
| 15520 | 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 | pl.legend(loc=0).pl.title('Sourc |
| 15540 | 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 | e..samples')..pl.subplot(2,.2,.2 |
| 15560 | 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c | ).pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1], |
| 15580 | 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 | .c=yt,.marker='o',.label='Target |
| 155a0 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 | .samples').pl.xticks([]).pl.ytic |
| 155c0 | 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | ks([]).pl.legend(loc=0).pl.title |
| 155e0 | 28 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 | ('Target.samples')..pl.subplot(2 |
| 15600 | 2c 20 32 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e | ,.2,.3).pl.imshow(ot_sinkhorn_un |
| 15620 | 2e 63 6f 73 74 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 | .cost_,.interpolation='nearest') |
| 15640 | 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e | .pl.xticks([]).pl.yticks([]).pl. |
| 15660 | 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 75 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 | title('Cost.matrix.-.unsupervise |
| 15680 | 64 20 44 41 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 69 | d.DA')..pl.subplot(2,.2,.4).pl.i |
| 156a0 | 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 63 6f 73 74 5f 2c 20 69 6e | mshow(ot_sinkhorn_semi.cost_,.in |
| 156c0 | 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 | terpolation='nearest').pl.xticks |
| 156e0 | 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 | ([]).pl.yticks([]).pl.title('Cos |
| 15700 | 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 2d 20 73 65 6d 69 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 0a 0a | t.matrix.-.semisupervised.DA').. |
| 15720 | 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 23 20 74 68 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c | pl.tight_layout()..#.the.optimal |
| 15740 | 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 69 6e 20 74 68 65 20 73 65 6d 69 2d 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 | .coupling.in.the.semi-supervised |
| 15760 | 20 44 41 20 63 61 73 65 20 77 69 6c 6c 20 65 78 68 69 62 69 74 20 22 20 73 68 61 70 65 0a 23 20 | .DA.case.will.exhibit.".shape.#. |
| 15780 | 73 69 6d 69 6c 61 72 22 20 74 6f 20 74 68 65 20 63 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 2c 20 28 62 6c | similar".to.the.cost.matrix,.(bl |
| 157a0 | 6f 63 6b 20 64 69 61 67 6f 6e 61 6c 20 6d 61 74 72 69 78 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ock.diagonal.matrix)...######### |
| 157c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 157e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 15800 | 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f | #####.#.Fig.2.:.plots.optimal.co |
| 15820 | 75 70 6c 69 6e 67 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 | uplings.for.the.different.method |
| 15840 | 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | s.#.---------------------------- |
| 15860 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 | -----------------------------..p |
| 15880 | 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 0a 0a 70 6c 2e | l.figure(2,.figsize=(8,.4))..pl. |
| 158a0 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 | subplot(1,.2,.1).pl.imshow(ot_si |
| 158c0 | 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 | nkhorn_un.coupling_,.interpolati |
| 158e0 | 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 | on='nearest').pl.xticks([]).pl.y |
| 15900 | 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 | ticks([]).pl.title('Optimal.coup |
| 15920 | 6c 69 6e 67 5c 6e 55 6e 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 | ling\nUnsupervised.DA')..pl.subp |
| 15940 | 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f | lot(1,.2,.2).pl.imshow(ot_sinkho |
| 15960 | 72 6e 5f 73 65 6d 69 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e | rn_semi.coupling_,.interpolation |
| 15980 | 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 | ='nearest').pl.xticks([]).pl.yti |
| 159a0 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 | cks([]).pl.title('Optimal.coupli |
| 159c0 | 6e 67 5c 6e 53 65 6d 69 2d 73 75 70 65 72 76 69 73 65 64 20 44 41 27 29 0a 0a 70 6c 2e 74 69 67 | ng\nSemi-supervised.DA')..pl.tig |
| 159e0 | 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ht_layout()...################## |
| 15a00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 15a20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 | ############################.#.F |
| 15a40 | 69 67 20 33 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a | ig.3.:.plot.transported.samples. |
| 15a60 | 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | #.------------------------------ |
| 15a80 | 2d 2d 0a 0a 23 20 64 69 73 70 6c 61 79 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 | --..#.display.transported.sample |
| 15aa0 | 73 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 0a 70 | s.pl.figure(4,.figsize=(8,.4)).p |
| 15ac0 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 | l.subplot(1,.2,.1).pl.scatter(Xt |
| 15ae0 | 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 | [:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker=' |
| 15b00 | 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d | o',............label='Target.sam |
| 15b20 | 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 | ples',.alpha=0.5).pl.scatter(tra |
| 15b40 | 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 | nsp_Xs_sinkhorn_un[:,.0],.transp |
| 15b60 | 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 75 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 | _Xs_sinkhorn_un[:,.1],.c=ys,.... |
| 15b80 | 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 | ........marker='+',.label='Trans |
| 15ba0 | 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e | p.samples',.s=30).pl.title('Tran |
| 15bc0 | 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a | sported.samples\nEmdTransport'). |
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| 16440 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 16460 | 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 | #######.#.Instantiate.the.differ |
| 16480 | 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 | ent.transport.algorithms.and.fit |
| 164a0 | 20 74 68 65 6d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | .them.#.------------------------ |
| 164c0 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 164e0 | 2d 2d 2d 0a 0a 23 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 6c 69 6e | ---..#.MappingTransport.with.lin |
| 16500 | 65 61 72 20 6b 65 72 6e 65 6c 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f | ear.kernel.ot_mapping_linear.=.o |
| 16520 | 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 0a 20 20 20 20 6b 65 72 6e 65 | t.da.MappingTransport(.....kerne |
| 16540 | 6c 3d 22 6c 69 6e 65 61 72 22 2c 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 38 2c 20 62 69 | l="linear",.mu=1e0,.eta=1e-8,.bi |
| 16560 | 61 73 3d 54 72 75 65 2c 0a 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 | as=True,.....max_iter=20,.verbos |
| 16580 | 65 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 66 69 74 28 58 | e=True)..ot_mapping_linear.fit(X |
| 165a0 | 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 | s=Xs,.Xt=Xt)..#.for.original.sou |
| 165c0 | 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 62 | rce.samples,.transform.applies.b |
| 165e0 | 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e | arycentric.mapping.transp_Xs_lin |
| 16600 | 65 61 72 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 | ear.=.ot_mapping_linear.transfor |
| 16620 | 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 0a 23 20 66 6f 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 | m(Xs=Xs)..#.for.out.of.source.sa |
| 16640 | 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 74 68 65 20 6c 69 6e | mples,.transform.applies.the.lin |
| 16660 | 65 61 72 20 6d 61 70 70 69 6e 67 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 | ear.mapping.transp_Xs_linear_new |
| 16680 | 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 | .=.ot_mapping_linear.transform(X |
| 166a0 | 73 3d 58 73 5f 6e 65 77 29 0a 0a 0a 23 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 | s=Xs_new)...#.MappingTransport.w |
| 166c0 | 69 74 68 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 6b 65 72 6e 65 6c 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 | ith.gaussian.kernel.ot_mapping_g |
| 166e0 | 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 | aussian.=.ot.da.MappingTransport |
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| 16720 | 35 2c 20 6d 75 3d 31 65 2d 31 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 20 73 69 67 6d 61 3d 31 2c 0a | 5,.mu=1e-1,.bias=True,.sigma=1,. |
| 16740 | 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 6f | ....max_iter=10,.verbose=True).o |
| 16760 | 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 | t_mapping_gaussian.fit(Xs=Xs,.Xt |
| 16780 | 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 | =Xt)..#.for.original.source.samp |
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| 167c0 | 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 | ic.mapping.transp_Xs_gaussian.=. |
| 167e0 | 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 | ot_mapping_gaussian.transform(Xs |
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| 16860 | 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d | .=.ot_mapping_gaussian.transform |
| 16880 | 28 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 77 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | (Xs=Xs_new)...################## |
| 168a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 168c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 | ############################.#.P |
| 168e0 | 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d | lot.transported.samples.#.------ |
| 16900 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 | ------------------..pl.figure(2) |
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| 16980 | 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 0a 70 6c 2e 73 | 'Target.samples',.alpha=.2).pl.s |
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| 169c0 | 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 | ransp_Xs_linear[:,.1],.c=ys,.mar |
| 169e0 | 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4d 61 70 70 65 | ker='+',............label='Mappe |
| 16a00 | 64 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 22 42 61 72 | d.source.samples').pl.title("Bar |
| 16a20 | 79 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 22 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 | y..mapping.(linear)").pl.legend( |
| 16a40 | 6c 6f 63 3d 30 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 | loc=0)..pl.subplot(2,.2,.2).pl.s |
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| 16ae0 | 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 0a 20 20 20 | .transp_Xs_linear_new[:,.1],.... |
| 16b00 | 20 20 20 20 20 20 20 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d | ........c=ys,.marker='+',.label= |
| 16b20 | 27 4c 65 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 22 45 73 74 | 'Learned.mapping').pl.title("Est |
| 16b40 | 69 6d 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 22 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | im..mapping.(linear)")..pl.subpl |
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| 174e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 17500 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 | ####################.#.Fig.1.:.p |
| 17520 | 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 2b | lots.source.and.target.samples.+ |
| 17540 | 20 6d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 0a 23 20 2d | .matrix.of.pairwise.distance.#.- |
| 17560 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 17580 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 175a0 | 2d 2d 2d 2d 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 | ----..pl.figure(1,.figsize=(10,. |
| 175c0 | 31 30 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 | 10)).pl.subplot(2,.2,.1).pl.scat |
| 175e0 | 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 | ter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.ma |
| 17600 | 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 | rker='+',.label='Source.samples' |
| 17620 | 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c | ).pl.xticks([]).pl.yticks([]).pl |
| 17640 | 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 | .legend(loc=0).pl.title('Source. |
| 17660 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 0a | .samples')..pl.subplot(2,.2,.2). |
| 17680 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 | pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c |
| 176a0 | 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 | =yt,.marker='o',.label='Target.s |
| 176c0 | 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 | amples').pl.xticks([]).pl.yticks |
| 176e0 | 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | ([]).pl.legend(loc=0).pl.title(' |
| 17700 | 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 | Target.samples')..pl.subplot(2,. |
| 17720 | 32 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e | 2,.3).pl.imshow(M,.interpolation |
| 17740 | 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 | ='nearest').pl.xticks([]).pl.yti |
| 17760 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 | cks([]).pl.title('Matrix.of.pair |
| 17780 | 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 | wise.distances').pl.tight_layout |
| 177a0 | 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ()...########################### |
| 177c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 177e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c | ###################.#.Fig.2.:.pl |
| 17800 | 6f 74 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 | ots.optimal.couplings.for.the.di |
| 17820 | 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | fferent.methods.#.-------------- |
| 17840 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d | -------------------------------- |
| 17860 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 | -----------.pl.figure(2,.figsize |
| 17880 | 3d 28 31 30 2c 20 36 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 70 | =(10,.6))..pl.subplot(2,.3,.1).p |
| 178a0 | 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 | l.imshow(ot_emd.coupling_,.inter |
| 178c0 | 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d | polation='nearest').pl.xticks([] |
| 178e0 | 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 | ).pl.yticks([]).pl.title('Optima |
| 17900 | 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 | l.coupling\nEMDTransport')..pl.s |
| 17920 | 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e | ubplot(2,.3,.2).pl.imshow(ot_sin |
| 17940 | 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 | khorn.coupling_,.interpolation=' |
| 17960 | 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b | nearest').pl.xticks([]).pl.ytick |
| 17980 | 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 | s([]).pl.title('Optimal.coupling |
| 179a0 | 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | \nSinkhornTransport')..pl.subplo |
| 179c0 | 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 | t(2,.3,.3).pl.imshow(ot_lpl1.cou |
| 179e0 | 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 | pling_,.interpolation='nearest') |
| 17a00 | 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e | .pl.xticks([]).pl.yticks([]).pl. |
| 17a20 | 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 | title('Optimal.coupling\nSinkhor |
| 17a40 | 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 | nLpl1Transport')..pl.subplot(2,. |
| 17a60 | 33 2c 20 34 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 | 3,.4).ot.plot.plot2D_samples_mat |
| 17a80 | 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 | (Xs,.Xt,.ot_emd.coupling_,.c=[.5 |
| 17aa0 | 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 | ,..5,.1]).pl.scatter(Xs[:,.0],.X |
| 17ac0 | 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c | s[:,.1],.c=ys,.marker='+',.label |
| 17ae0 | 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 | ='Source.samples').pl.scatter(Xt |
| 17b00 | 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 | [:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.marker=' |
| 17b20 | 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 | o',.label='Target.samples').pl.x |
| 17b40 | 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | ticks([]).pl.yticks([]).pl.title |
| 17b60 | 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 6e 45 4d | ('Main.coupling.coefficients\nEM |
| 17b80 | 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 | DTransport')..pl.subplot(2,.3,.5 |
| 17ba0 | 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c | ).ot.plot.plot2D_samples_mat(Xs, |
| 17bc0 | 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e | .Xt,.ot_sinkhorn.coupling_,.c=[. |
| 17be0 | 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 | 5,..5,.1]).pl.scatter(Xs[:,.0],. |
| 17c00 | 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 | Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+',.labe |
| 17c20 | 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 | l='Source.samples').pl.scatter(X |
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| 17c60 | 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e | 'o',.label='Target.samples').pl. |
| 17c80 | 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | xticks([]).pl.yticks([]).pl.titl |
| 17ca0 | 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 6e 53 | e('Main.coupling.coefficients\nS |
| 17cc0 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 | inkhornTransport')..pl.subplot(2 |
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| 17e60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 | ###########################.#.Fi |
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| 18da0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 6f 72 69 67 69 6e | ##################.#.Plot.origin |
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| 195c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0d | ###############################. |
| 195e0 | 0a 23 20 53 6d 61 63 6f 66 20 4d 44 53 0d 0a 23 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 23 0d 0a | .#.Smacof.MDS..#.----------..#.. |
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| 19660 | 62 65 20 67 69 76 65 6e 20 62 79 20 74 68 65 20 6f 75 74 70 75 74 20 6f 66 20 74 68 65 20 61 6c | be.given.by.the.output.of.the.al |
| 19680 | 67 6f 72 69 74 68 6d 0d 0a 0d 0a 0d 0a 64 65 66 20 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 2c 20 64 | gorithm......def.smacof_mds(C,.d |
| 196a0 | 69 6d 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 33 30 30 30 2c 20 65 70 73 3d 31 65 2d 39 29 3a 0d 0a 20 | im,.max_iter=3000,.eps=1e-9):... |
| 196c0 | 20 20 20 22 22 22 0d 0a 20 20 20 20 52 65 74 75 72 6e 73 20 61 6e 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 | ..."""......Returns.an.interpola |
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| 198c0 | 0a 20 20 20 20 52 65 74 75 72 6e 73 0d 0a 20 20 20 20 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 20 20 20 20 6e | .....Returns......-------......n |
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| 19960 | 6d 65 74 72 79 29 0d 0a 20 20 20 20 22 22 22 0d 0a 0d 0a 20 20 20 20 72 6e 67 20 3d 20 6e 70 2e | metry)......"""........rng.=.np. |
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| 199a0 | 20 20 6d 64 73 20 3d 20 6d 61 6e 69 66 6f 6c 64 2e 4d 44 53 28 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 64 | ..mds.=.manifold.MDS(..........d |
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| 19b40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 19b60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 19b80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0d 0a 23 20 44 61 74 61 20 70 72 65 70 61 72 61 74 69 6f 6e 0d 0a | ##########..#.Data.preparation.. |
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| 19e20 | 0a 20 20 20 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 38 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 | .....for.i.in.range(8):......... |
| 19e40 | 20 66 6f 72 20 6a 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 38 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | .for.j.in.range(8):............. |
| 19e60 | 20 69 66 20 73 68 61 70 65 73 5b 6e 62 5d 5b 69 2c 20 6a 5d 20 3c 20 30 2e 39 35 3a 0d 0a 20 20 | .if.shapes[nb][i,.j].<.0.95:.... |
| 19e80 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 78 73 5b 6e 62 5d 2e 61 70 70 65 6e 64 28 5b 6a 2c 20 | ..............xs[nb].append([j,. |
| 19ea0 | 38 20 2d 20 69 5d 29 0d 0a 0d 0a 78 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 6e 70 2e 61 72 72 | 8.-.i])....xs.=.np.array([np.arr |
| 19ec0 | 61 79 28 78 73 5b 30 5d 29 2c 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 31 5d 29 2c 0d 0a 20 20 20 | ay(xs[0]),.np.array(xs[1]),..... |
| 19ee0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 32 5d 29 2c 20 6e 70 2e | ............np.array(xs[2]),.np. |
| 19f00 | 61 72 72 61 79 28 78 73 5b 33 5d 29 5d 29 0d 0a 0d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | array(xs[3])])....############## |
| 19f20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 19f40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 19f60 | 0d 0a 23 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 0d 0a 23 20 2d 2d | ..#.Barycenter.computation..#.-- |
| 19f80 | 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 2d 0d 0a 0d 0a 0d 0a 6e 73 20 3d 20 5b | --------------------......ns.=.[ |
| 19fa0 | 6c 65 6e 28 78 73 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 0d 0a 6e | len(xs[s]).for.s.in.range(S)]..n |
| 19fc0 | 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 33 30 0d 0a 0d 0a 22 22 22 43 6f 6d 70 75 74 65 20 61 6c 6c 20 | _samples.=.30...."""Compute.all. |
| 19fe0 | 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 66 6f 75 72 20 | distances.matrices.for.the.four. |
| 1a000 | 73 68 61 70 65 73 22 22 22 0d 0a 43 73 20 3d 20 5b 73 70 2e 73 70 61 74 69 61 6c 2e 64 69 73 74 | shapes"""..Cs.=.[sp.spatial.dist |
| 1a020 | 61 6e 63 65 2e 63 64 69 73 74 28 78 73 5b 73 5d 2c 20 78 73 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 | ance.cdist(xs[s],.xs[s]).for.s.i |
| 1a040 | 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 0d 0a 43 73 20 3d 20 5b 63 73 20 2f 20 63 73 2e 6d 61 78 28 29 | n.range(S)]..Cs.=.[cs./.cs.max() |
| 1a060 | 20 66 6f 72 20 63 73 20 69 6e 20 43 73 5d 0d 0a 0d 0a 70 73 20 3d 20 5b 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 | .for.cs.in.Cs]....ps.=.[ot.unif( |
| 1a080 | 6e 73 5b 73 5d 29 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 53 29 5d 0d 0a 70 20 3d 20 6f | ns[s]).for.s.in.range(S)]..p.=.o |
| 1a0a0 | 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 29 0d 0a 0d 0a 0d 0a 6c 61 6d 62 64 61 73 74 20 | t.unif(n_samples)......lambdast. |
| 1a0c0 | 3d 20 5b 5b 66 6c 6f 61 74 28 69 29 20 2f 20 33 2c 20 66 6c 6f 61 74 28 33 20 2d 20 69 29 20 2f | =.[[float(i)./.3,.float(3.-.i)./ |
| 1a0e0 | 20 33 5d 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 5b 31 2c 20 32 5d 5d 0d 0a 0d 0a 43 74 30 31 20 3d 20 5b | .3].for.i.in.[1,.2]]....Ct01.=.[ |
| 1a100 | 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 | 0.for.i.in.range(2)]..for.i.in.r |
| 1a120 | 61 6e 67 65 28 32 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 43 74 30 31 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f | ange(2):......Ct01[i].=.ot.gromo |
| 1a140 | 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 | v.gromov_barycenters(n_samples,. |
| 1a160 | 5b 43 73 5b 30 5d 2c 20 43 73 5b 31 5d 5d 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | [Cs[0],.Cs[1]],................. |
| 1a180 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b | ............................[ps[ |
| 1a1a0 | 30 5d 2c 20 70 73 5b 31 5d 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | 0],.ps[1]....................... |
| 1a1c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d | .......................],.p,.lam |
| 1a1e0 | 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 20 23 20 35 65 2d 34 | bdast[i],.'square_loss',..#.5e-4 |
| 1a200 | 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ,............................... |
| 1a220 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d | ..............max_iter=100,.tol= |
| 1a240 | 31 65 2d 33 29 0d 0a 0d 0a 43 74 30 32 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 | 1e-3)....Ct02.=.[0.for.i.in.rang |
| 1a260 | 65 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 43 | e(2)]..for.i.in.range(2):......C |
| 1a280 | 74 30 32 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 | t02[i].=.ot.gromov.gromov_baryce |
| 1a2a0 | 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 5b 43 73 5b 30 5d 2c 20 43 73 5b 32 5d 5d 2c | nters(n_samples,.[Cs[0],.Cs[2]], |
| 1a2c0 | 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 1a2e0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b 30 5d 2c 20 70 73 5b 32 5d 0d 0a 20 20 20 20 | .............[ps[0],.ps[2]...... |
| 1a300 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 1a320 | 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 71 75 61 | ........],.p,.lambdast[i],.'squa |
| 1a340 | 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 20 23 20 35 65 2d 34 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | re_loss',..#.5e-4,.............. |
| 1a360 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d | ...............................m |
| 1a380 | 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 6f 6c 3d 31 65 2d 33 29 0d 0a 0d 0a 43 74 31 33 20 3d | ax_iter=100,.tol=1e-3)....Ct13.= |
| 1a3a0 | 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e | .[0.for.i.in.range(2)]..for.i.in |
| 1a3c0 | 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 0d 0a 20 20 20 20 43 74 31 33 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f | .range(2):......Ct13[i].=.ot.gro |
| 1a3e0 | 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 | mov.gromov_barycenters(n_samples |
| 1a400 | 2c 20 5b 43 73 5b 31 5d 2c 20 43 73 5b 33 5d 5d 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ,.[Cs[1],.Cs[3]],............... |
| 1a420 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 | ..............................[p |
| 1a440 | 73 5b 31 5d 2c 20 70 73 5b 33 5d 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | s[1],.ps[3]..................... |
| 1a460 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c | .........................],.p,.l |
| 1a480 | 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 71 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 20 23 20 35 65 | ambdast[i],.'square_loss',..#.5e |
| 1a4a0 | 2d 34 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | -4,............................. |
| 1a4c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 30 2c 20 74 6f | ................max_iter=100,.to |
| 1a4e0 | 6c 3d 31 65 2d 33 29 0d 0a 0d 0a 43 74 32 33 20 3d 20 5b 30 20 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 | l=1e-3)....Ct23.=.[0.for.i.in.ra |
| 1a500 | 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 3a 0d 0a 20 20 20 | nge(2)]..for.i.in.range(2):..... |
| 1a520 | 20 43 74 32 33 5b 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e 67 72 6f 6d 6f 76 2e 67 72 6f 6d 6f 76 5f 62 61 72 79 | .Ct23[i].=.ot.gromov.gromov_bary |
| 1a540 | 63 65 6e 74 65 72 73 28 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 5b 43 73 5b 32 5d 2c 20 43 73 5b 33 5d | centers(n_samples,.[Cs[2],.Cs[3] |
| 1a560 | 5d 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ],.............................. |
| 1a580 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5b 70 73 5b 32 5d 2c 20 70 73 5b 33 5d 0d 0a 20 20 | ...............[ps[2],.ps[3].... |
| 1a5a0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
| 1a5c0 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 5d 2c 20 70 2c 20 6c 61 6d 62 64 61 73 74 5b 69 5d 2c 20 27 73 71 | ..........],.p,.lambdast[i],.'sq |
| 1a5e0 | 75 61 72 65 5f 6c 6f 73 73 27 2c 20 20 23 20 35 65 2d 34 2c 0d 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | uare_loss',..#.5e-4,............ |
| 1a600 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | ................................ |
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| 1a640 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
| 1a660 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
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| 1a760 | 3d 20 5b 30 2c 20 30 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 30 31 20 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 | =.[0,.0]..npost01.=.[smacof_mds( |
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| 1a880 | 3d 20 5b 73 6d 61 63 6f 66 5f 6d 64 73 28 43 74 31 33 5b 73 5d 2c 20 32 29 20 66 6f 72 20 73 20 | =.[smacof_mds(Ct13[s],.2).for.s. |
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| 1a920 | 20 66 6f 72 20 73 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 32 29 5d 0d 0a 6e 70 6f 73 74 32 33 20 3d 20 5b | .for.s.in.range(2)]..npost23.=.[ |
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| 1aae0 | 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 33 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 | pl.ylim((-1,.1))..ax3.scatter(np |
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| 1ab80 | 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 5b 31 5d 5b 3a 2c | catter(npos[1][:,.0],.npos[1][:, |
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| 1ad00 | 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 37 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 | .ylim((-1,.1))..ax7.scatter(npos |
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| 1ad40 | 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 0d 0a 0d 0a 61 78 38 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 | color='b')....ax8.=.pl.subplot2g |
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| 1ad80 | 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 38 2e 73 63 61 | ,.1))..pl.ylim((-1,.1))..ax8.sca |
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| 1ae20 | 0d 0a 61 78 39 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 5b 32 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f | ..ax9.scatter(npos[2][:,.0],.npo |
| 1ae40 | 73 5b 32 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 72 27 29 0d 0a 0d 0a 61 78 31 30 20 3d | s[2][:,.1],.color='r')....ax10.= |
| 1ae60 | 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 33 2c 20 31 29 29 | .pl.subplot2grid((4,.4),.(3,.1)) |
| 1ae80 | 0d 0a 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c | ..pl.xlim((-1,.1))..pl.ylim((-1, |
| 1aea0 | 20 31 29 29 0d 0a 61 78 31 30 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 74 32 33 5b 31 5d 5b 3a 2c | .1))..ax10.scatter(npost23[1][:, |
| 1aec0 | 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 32 33 5b 31 5d 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 | .0],.npost23[1][:,.1],.color='b' |
| 1aee0 | 29 0d 0a 0d 0a 61 78 31 31 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 | )....ax11.=.pl.subplot2grid((4,. |
| 1af00 | 34 29 2c 20 28 33 2c 20 32 29 29 0d 0a 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 | 4),.(3,.2))..pl.xlim((-1,.1))..p |
| 1af20 | 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 31 31 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 | l.ylim((-1,.1))..ax11.scatter(np |
| 1af40 | 6f 73 74 32 33 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 74 32 33 5b 30 5d 5b 3a 2c 20 31 5d | ost23[0][:,.0],.npost23[0][:,.1] |
| 1af60 | 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 62 27 29 0d 0a 0d 0a 61 78 31 32 20 3d 20 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | ,.color='b')....ax12.=.pl.subplo |
| 1af80 | 74 32 67 72 69 64 28 28 34 2c 20 34 29 2c 20 28 33 2c 20 33 29 29 0d 0a 70 6c 2e 78 6c 69 6d 28 | t2grid((4,.4),.(3,.3))..pl.xlim( |
| 1afa0 | 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 70 6c 2e 79 6c 69 6d 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 0d 0a 61 78 31 32 | (-1,.1))..pl.ylim((-1,.1))..ax12 |
| 1afc0 | 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 6e 70 6f 73 5b 33 5d 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 6e 70 6f 73 5b 33 5d 5b | .scatter(npos[3][:,.0],.npos[3][ |
| 1afe0 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 27 72 27 29 0d 0a 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 7c | :,.1],.color='r')..PK..........| |
| 1b000 | 68 3a 4f a4 4f 47 3f 0c 0c 00 00 0c 0c 00 00 0b 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 00 00 00 | h:O.OG?......................... |
| 1b020 | 00 70 6c 6f 74 5f 57 44 41 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 7c 68 3a 4f c6 3b 52 da | .plot_WDA.pyPK..........|h:O.;R. |
| 1b040 | f3 0a 00 00 f3 0a 00 00 0e 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 35 0c 00 00 70 6c 6f 74 5f 67 | ......................5...plot_g |
| 1b060 | 72 6f 6d 6f 76 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 84 68 3a 4f ea 88 04 1c d5 18 00 00 | romov.pyPK...........h:O........ |
| 1b080 | d5 18 00 00 16 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 54 17 00 00 70 6c 6f 74 5f 62 61 72 79 63 | ..................T...plot_baryc |
| 1b0a0 | 65 6e 74 65 72 5f 66 67 77 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 7c 68 3a 4f f2 7c 7e 9e | enter_fgw.pyPK..........|h:O.|~. |
| 1b0c0 | 5c 0e 00 00 5c 0e 00 00 15 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 5d 30 00 00 70 6c 6f 74 5f 62 | \...\.................]0..plot_b |
| 1b0e0 | 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 31 44 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 7c 68 3a 4f a7 | arycenter_1D.pyPK..........|h:O. |
| 1b100 | 6b f0 c3 bf 0b 00 00 bf 0b 00 00 15 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 ec 3e 00 00 70 6c 6f | k.........................>..plo |
| 1b120 | 74 5f 4f 54 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 84 68 | t_OT_2D_samples.pyPK...........h |
| 1b140 | 3a 4f 0a ba a4 e6 91 06 00 00 91 06 00 00 0e 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 de 4a 00 00 | :O...........................J.. |
| 1b160 | 70 6c 6f 74 5f 55 4f 54 5f 31 44 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 03 78 94 50 e2 7d | plot_UOT_1D.pyPK...........x.P.} |
| 1b180 | 4e c5 18 0f 00 00 18 0f 00 00 19 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 9b 51 00 00 70 6c 6f 74 | N........................Q..plot |
| 1b1a0 | 5f 55 4f 54 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 31 44 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 | _UOT_barycenter_1D.pyPK......... |
| 1b1c0 | 00 d2 72 94 50 43 c3 5c 58 99 17 00 00 99 17 00 00 21 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 ea | ..r.PC.\X........!.............. |
| 1b1e0 | 60 00 00 70 6c 6f 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 6c 70 5f 76 73 5f 65 6e 74 72 6f 70 69 | `..plot_barycenter_lp_vs_entropi |
| 1b200 | 63 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 a5 72 94 50 b2 21 63 15 fc 07 00 00 fc 07 00 00 | c.pyPK...........r.P.!c......... |
| 1b220 | 1f 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 c2 78 00 00 70 6c 6f 74 5f 66 72 65 65 5f 73 75 70 70 | ...............x..plot_free_supp |
| 1b240 | 6f 72 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 7c 68 3a | ort_barycenter.pyPK..........|h: |
| 1b260 | 4f b8 cd f6 1b 7e 0b 00 00 7e 0b 00 00 13 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 fb 80 00 00 70 | O....~...~.....................p |
| 1b280 | 6c 6f 74 5f 6f 70 74 69 6d 5f 4f 54 72 65 67 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 83 68 | lot_optim_OTreg.pyPK...........h |
| 1b2a0 | 3a 4f 0e e0 72 82 97 0b 00 00 97 0b 00 00 1b 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 aa 8c 00 00 | :O..r........................... |
| 1b2c0 | 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 70 79 50 4b 01 02 14 | plot_otda_linear_mapping.pyPK... |
| 1b2e0 | 03 14 00 00 00 00 00 22 75 94 50 e7 4f 7f d3 f3 0d 00 00 f3 0d 00 00 19 00 00 00 00 00 00 00 00 | ......."u.P.O................... |
| 1b300 | 00 00 00 a4 81 7a 98 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e | .....z...plot_otda_color_images. |
| 1b320 | 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 83 68 3a 4f d1 a8 d7 2e a9 09 00 00 a9 09 00 00 20 00 | pyPK...........h:O.............. |
| 1b340 | 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 a4 a6 00 00 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6e 76 6f 6c 75 74 69 6f 6e | ................plot_convolution |
| 1b360 | 61 6c 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 83 68 3a 4f | al_barycenter.pyPK...........h:O |
| 1b380 | ff 09 e8 78 dd 08 00 00 dd 08 00 00 14 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 8b b0 00 00 70 6c | ...x..........................pl |
| 1b3a0 | 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 5f 73 6d 6f 6f 74 68 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 c2 72 | ot_OT_1D_smooth.pyPK...........r |
| 1b3c0 | 94 50 72 6d af 7b ed 10 00 00 ed 10 00 00 14 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 9a b9 00 00 | .Prm.{.......................... |
| 1b3e0 | 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6c 61 73 73 65 73 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 | plot_otda_classes.pyPK.......... |
| 1b400 | 49 78 94 50 0c 2b 5b b3 1e 15 00 00 1e 15 00 00 1f 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 b9 ca | Ix.P.+[......................... |
| 1b420 | 00 00 70 6c 6f 74 5f 70 61 72 74 69 61 6c 5f 77 61 73 73 5f 61 6e 64 5f 67 72 6f 6d 6f 76 2e 70 | ..plot_partial_wass_and_gromov.p |
| 1b440 | 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 7c 68 3a 4f 0b 5c 2a af a2 06 00 00 a2 06 00 00 0d 00 00 | yPK..........|h:O.\*............ |
| 1b460 | 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 14 e0 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 2e 70 79 50 4b 01 02 | ...............plot_OT_1D.pyPK.. |
| 1b480 | 14 03 14 00 00 00 00 00 84 68 3a 4f 6d 8a 53 18 e2 17 00 00 e2 17 00 00 12 00 00 00 00 00 00 00 | .........h:Om.S................. |
| 1b4a0 | 00 00 00 00 a4 81 e1 e6 00 00 70 6c 6f 74 5f 73 74 6f 63 68 61 73 74 69 63 2e 70 79 50 4b 01 02 | ..........plot_stochastic.pyPK.. |
| 1b4c0 | 14 03 14 00 00 00 00 00 84 68 3a 4f e5 5f 4e 9c 14 11 00 00 14 11 00 00 0b 00 00 00 00 00 00 00 | .........h:O._N................. |
| 1b4e0 | 00 00 00 00 b4 81 f3 fe 00 00 70 6c 6f 74 5f 66 67 77 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 | ..........plot_fgw.pyPK......... |
| 1b500 | 00 7c 68 3a 4f 6f 6c 58 5b 88 13 00 00 88 13 00 00 13 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 30 | .|h:OolX[......................0 |
| 1b520 | 10 01 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 4c 31 5f 76 73 5f 4c 32 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 | ...plot_OT_L1_vs_L2.pyPK........ |
| 1b540 | 00 00 a4 72 94 50 e9 d6 9c 70 1d 07 00 00 1d 07 00 00 16 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 | ...r.P...p...................... |
| 1b560 | e9 23 01 00 70 6c 6f 74 5f 73 63 72 65 65 6e 6b 68 6f 72 6e 5f 31 44 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 | .#..plot_screenkhorn_1D.pyPK.... |
| 1b580 | 14 00 00 00 00 00 7c 68 3a 4f 7a 2e b5 2b 65 09 00 00 65 09 00 00 13 00 00 00 00 00 00 00 00 00 | ......|h:Oz..+e...e............. |
| 1b5a0 | 00 00 b4 81 3a 2b 01 00 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6d 70 75 74 65 5f 65 6d 64 2e 70 79 50 4b 01 02 14 | ....:+..plot_compute_emd.pyPK... |
| 1b5c0 | 03 14 00 00 00 00 00 cf 72 94 50 09 53 8e 8d 14 16 00 00 14 16 00 00 12 00 00 00 00 00 00 00 00 | ........r.P.S................... |
| 1b5e0 | 00 00 00 b4 81 d0 34 01 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6a 63 70 6f 74 2e 70 79 50 4b 01 02 14 | ......4..plot_otda_jcpot.pyPK... |
| 1b600 | 03 14 00 00 00 00 00 83 68 3a 4f 71 12 0d cb 23 12 00 00 23 12 00 00 1c 00 00 00 00 00 00 00 00 | ........h:Oq...#...#............ |
| 1b620 | 00 00 00 b4 81 14 4b 01 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 73 65 6d 69 5f 73 75 70 65 72 76 69 73 | ......K..plot_otda_semi_supervis |
| 1b640 | 65 64 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 83 68 3a 4f cd ad d9 82 f4 0f 00 00 f4 0f 00 | ed.pyPK...........h:O........... |
| 1b660 | 00 14 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 71 5d 01 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 | ...............q]..plot_otda_map |
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