ofs | hex dump | ascii |
---|
0000 | 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 18 7f 21 4b 94 2f ca 38 47 0f 00 00 47 0f 00 00 15 00 00 00 70 6c | PK..........!K./.8G...G.......pl |
0020 | 6f 74 5f 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 5f 31 44 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a | ot_barycenter_1D.py#.-*-.coding: |
0040 | 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | .utf-8.-*-.""".================= |
0060 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 31 44 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 62 61 72 | =============.1D.Wasserstein.bar |
0080 | 79 63 65 6e 74 65 72 20 64 65 6d 6f 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ycenter.demo.=================== |
00a0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6c 6c 75 73 74 | ===========..This.example.illust |
00c0 | 72 61 74 65 73 20 74 68 65 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 72 65 67 75 6c 61 72 | rates.the.computation.of.regular |
00e0 | 69 7a 65 64 20 57 61 73 73 65 72 73 79 65 69 6e 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 0a 61 73 20 | ized.Wassersyein.Barycenter..as. |
0100 | 70 72 6f 70 6f 73 65 64 20 69 6e 20 5b 33 5d 2e 0a 0a 0a 5b 33 5d 20 42 65 6e 61 6d 6f 75 2c 20 | proposed.in.[3]....[3].Benamou,. |
0120 | 4a 2e 20 44 2e 2c 20 43 61 72 6c 69 65 72 2c 20 47 2e 2c 20 43 75 74 75 72 69 2c 20 4d 2e 2c 20 | J..D.,.Carlier,.G.,.Cuturi,.M.,. |
0140 | 4e 65 6e 6e 61 2c 20 4c 2e 2c 20 26 20 50 65 79 72 c3 a9 2c 20 47 2e 20 28 32 30 31 35 29 2e 20 | Nenna,.L.,.&.Peyr..,.G..(2015).. |
0160 | 0a 49 74 65 72 61 74 69 76 65 20 42 72 65 67 6d 61 6e 20 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 73 20 66 | .Iterative.Bregman.projections.f |
0180 | 6f 72 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 61 74 69 6f 6e 20 70 72 | or.regularized.transportation.pr |
01a0 | 6f 62 6c 65 6d 73 0a 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c 20 6f 6e 20 53 63 69 65 6e 74 69 66 69 | oblems.SIAM.Journal.on.Scientifi |
01c0 | 63 20 43 6f 6d 70 75 74 69 6e 67 2c 20 33 37 28 32 29 2c 20 41 31 31 31 31 2d 41 31 31 33 38 2e | c.Computing,.37(2),.A1111-A1138. |
01e0 | 0a 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 | .."""..#.Author:.Remi.Flamary.<r |
0200 | 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 | emi.flamary@unice.fr>.#.#.Licens |
0220 | 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 | e:.MIT.License..import.numpy.as. |
0240 | 6e 70 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c | np.import.matplotlib.pylab.as.pl |
0260 | 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0a 23 20 6e 65 63 65 73 73 61 72 79 20 66 6f 72 20 33 64 20 70 6c | .import.ot.#.necessary.for.3d.pl |
0280 | 6f 74 20 65 76 65 6e 20 69 66 20 6e 6f 74 20 75 73 65 64 0a 66 72 6f 6d 20 6d 70 6c 5f 74 6f 6f | ot.even.if.not.used.from.mpl_too |
02a0 | 6c 6b 69 74 73 2e 6d 70 6c 6f 74 33 64 20 69 6d 70 6f 72 74 20 41 78 65 73 33 44 20 20 23 20 6e | lkits.mplot3d.import.Axes3D..#.n |
02c0 | 6f 71 61 0a 66 72 6f 6d 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 73 20 | oqa.from.matplotlib.collections. |
02e0 | 69 6d 70 6f 72 74 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | import.PolyCollection..######### |
0300 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
0320 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
0340 | 23 23 23 23 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | #####.#.Generate.data.########## |
0360 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
0380 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
03a0 | 23 23 23 23 0a 0a 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 0a 0a 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 | ####..#%%.parameters..n.=.100..# |
03c0 | 20 6e 62 20 62 69 6e 73 0a 0a 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 0a 78 20 3d 20 6e 70 | .nb.bins..#.bin.positions.x.=.np |
03e0 | 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 0a 0a 23 20 | .arange(n,.dtype=np.float64)..#. |
0400 | 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 61 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 | Gaussian.distributions.a1.=.ot.d |
0420 | 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d | atasets.get_1D_gauss(n,.m=20,.s= |
0440 | 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 0a 61 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 | 5)..#.m=.mean,.s=.std.a2.=.ot.da |
0460 | 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 36 30 2c 20 73 3d 38 | tasets.get_1D_gauss(n,.m=60,.s=8 |
0480 | 29 0a 0a 23 20 63 72 65 61 74 69 6e 67 20 6d 61 74 72 69 78 20 41 20 63 6f 6e 74 61 69 6e 69 6e | )..#.creating.matrix.A.containin |
04a0 | 67 20 61 6c 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 41 20 3d 20 6e 70 2e 76 73 74 61 63 | g.all.distributions.A.=.np.vstac |
04c0 | 6b 28 28 61 31 2c 20 61 32 29 29 2e 54 0a 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 3d 20 | k((a1,.a2)).T.n_distributions.=. |
04e0 | 41 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 20 2b 20 6e 6f 72 6d | A.shape[1]..#.loss.matrix.+.norm |
0500 | 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 75 74 69 6c 73 2e 64 69 73 74 30 28 6e 29 0a | alization.M.=.ot.utils.dist0(n). |
0520 | 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | M./=.M.max()..################## |
0540 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
0560 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 | ############################.#.P |
0580 | 6c 6f 74 20 64 61 74 61 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | lot.data.####################### |
05a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
05c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f | #######################..#%%.plo |
05e0 | 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 | t.the.distributions..pl.figure(1 |
0600 | 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e | ,.figsize=(6.4,.3)).for.i.in.ran |
0620 | 67 65 28 6e 5f 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 | ge(n_distributions):.....pl.plot |
0640 | 28 78 2c 20 41 5b 3a 2c 20 69 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 | (x,.A[:,.i]).pl.title('Distribut |
0660 | 69 6f 6e 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 | ions').pl.tight_layout()..###### |
0680 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
06a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
06c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f | ########.#.Barycenter.computatio |
06e0 | 6e 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | n.############################## |
0700 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
0720 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 25 25 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 | ################..#%%.barycenter |
0740 | 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 0a 0a 61 6c 70 68 61 20 3d 20 30 2e 32 20 20 23 20 30 3c 3d | .computation..alpha.=.0.2..#.0<= |
0760 | 61 6c 70 68 61 3c 3d 31 0a 77 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d | alpha<=1.weights.=.np.array([1.- |
0780 | 20 61 6c 70 68 61 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 0a 0a 23 20 6c 32 62 61 72 79 0a 62 61 72 79 5f 6c | .alpha,.alpha])..#.l2bary.bary_l |
07a0 | 32 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 28 77 65 69 67 68 74 73 29 0a 0a 23 20 77 61 73 73 65 72 73 74 65 69 | 2.=.A.dot(weights)..#.wasserstei |
07c0 | 6e 0a 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 0a 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6f 74 2e 62 72 65 67 | n.reg.=.1e-3.bary_wass.=.ot.breg |
07e0 | 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 69 67 68 74 | man.barycenter(A,.M,.reg,.weight |
0800 | 73 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 | s)..pl.figure(2).pl.clf().pl.sub |
0820 | 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 6e 5f 64 | plot(2,.1,.1).for.i.in.range(n_d |
0840 | 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 29 3a 0a 20 20 20 20 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 41 5b | istributions):.....pl.plot(x,.A[ |
0860 | 3a 2c 20 69 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 44 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 | :,.i]).pl.title('Distributions') |
0880 | 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c | ..pl.subplot(2,.1,.2).pl.plot(x, |
08a0 | 20 62 61 72 79 5f 6c 32 2c 20 27 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 6c 32 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c | .bary_l2,.'r',.label='l2').pl.pl |
08c0 | 6f 74 28 78 2c 20 62 61 72 79 5f 77 61 73 73 2c 20 27 67 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 57 61 73 | ot(x,.bary_wass,.'g',.label='Was |
08e0 | 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | serstein').pl.legend().pl.title( |
0900 | 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 | 'Barycenters').pl.tight_layout() |
0920 | 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ..############################## |
0940 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
0960 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 42 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 69 | ################.#.Barycentric.i |
0980 | 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | nterpolation.################### |
09a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
09c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 25 25 | ###########################..#%% |
09e0 | 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 0a 0a 6e 5f 61 6c 70 | .barycenter.interpolation..n_alp |
0a00 | 68 61 20 3d 20 31 31 0a 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 20 3d 20 6e 70 2e 6c 69 6e 73 70 61 63 65 | ha.=.11.alpha_list.=.np.linspace |
0a20 | 28 30 2c 20 31 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 0a 0a 0a 42 5f 6c 32 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f | (0,.1,.n_alpha)...B_l2.=.np.zero |
0a40 | 73 28 28 6e 2c 20 6e 5f 61 6c 70 68 61 29 29 0a 0a 42 5f 77 61 73 73 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 70 | s((n,.n_alpha))..B_wass.=.np.cop |
0a60 | 79 28 42 5f 6c 32 29 0a 0a 66 6f 72 20 69 20 69 6e 20 72 61 6e 67 65 28 30 2c 20 6e 5f 61 6c 70 | y(B_l2)..for.i.in.range(0,.n_alp |
0a80 | 68 61 29 3a 0a 20 20 20 20 61 6c 70 68 61 20 3d 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5b 69 5d 0a 20 | ha):.....alpha.=.alpha_list[i].. |
0aa0 | 20 20 20 77 65 69 67 68 74 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 31 20 2d 20 61 6c 70 68 61 | ...weights.=.np.array([1.-.alpha |
0ac0 | 2c 20 61 6c 70 68 61 5d 29 0a 20 20 20 20 42 5f 6c 32 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 41 2e 64 6f 74 | ,.alpha]).....B_l2[:,.i].=.A.dot |
0ae0 | 28 77 65 69 67 68 74 73 29 0a 20 20 20 20 42 5f 77 61 73 73 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 6f 74 2e | (weights).....B_wass[:,.i].=.ot. |
0b00 | 62 72 65 67 6d 61 6e 2e 62 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 28 41 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 77 65 | bregman.barycenter(A,.M,.reg,.we |
0b20 | 69 67 68 74 73 29 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 0a 0a | ights)..#%%.plot.interpolation.. |
0b40 | 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 0a 0a 63 6d 61 70 20 3d 20 70 6c 2e 63 6d 2e 67 65 74 5f 63 | pl.figure(3)..cmap.=.pl.cm.get_c |
0b60 | 6d 61 70 28 27 76 69 72 69 64 69 73 27 29 0a 76 65 72 74 73 20 3d 20 5b 5d 0a 7a 73 20 3d 20 61 | map('viridis').verts.=.[].zs.=.a |
0b80 | 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 0a 66 6f 72 20 69 2c 20 7a 20 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 | lpha_list.for.i,.z.in.enumerate( |
0ba0 | 7a 73 29 3a 0a 20 20 20 20 79 73 20 3d 20 42 5f 6c 32 5b 3a 2c 20 69 5d 0a 20 20 20 20 76 65 72 | zs):.....ys.=.B_l2[:,.i].....ver |
0bc0 | 74 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 6c 69 73 74 28 7a 69 70 28 78 2c 20 79 73 29 29 29 0a 0a 61 78 20 | ts.append(list(zip(x,.ys)))..ax. |
0be0 | 3d 20 70 6c 2e 67 63 66 28 29 2e 67 63 61 28 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 3d 27 33 64 27 29 0a | =.pl.gcf().gca(projection='3d'). |
0c00 | 0a 70 6f 6c 79 20 3d 20 50 6f 6c 79 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 28 76 65 72 74 73 2c 20 66 61 | .poly.=.PolyCollection(verts,.fa |
0c20 | 63 65 63 6f 6c 6f 72 73 3d 5b 63 6d 61 70 28 61 29 20 66 6f 72 20 61 20 69 6e 20 61 6c 70 68 61 | cecolors=[cmap(a).for.a.in.alpha |
0c40 | 5f 6c 69 73 74 5d 29 0a 70 6f 6c 79 2e 73 65 74 5f 61 6c 70 68 61 28 30 2e 37 29 0a 61 78 2e 61 | _list]).poly.set_alpha(0.7).ax.a |
0c60 | 64 64 5f 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 33 64 28 70 6f 6c 79 2c 20 7a 73 3d 7a 73 2c 20 7a 64 69 | dd_collection3d(poly,.zs=zs,.zdi |
0c80 | 72 3d 27 79 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 61 62 65 6c 28 27 78 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 | r='y').ax.set_xlabel('x').ax.set |
0ca0 | 5f 78 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 6e 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 61 62 65 6c 28 27 24 5c 5c | _xlim3d(0,.n).ax.set_ylabel('$\\ |
0cc0 | 61 6c 70 68 61 24 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 31 29 0a 61 78 2e | alpha$').ax.set_ylim3d(0,.1).ax. |
0ce0 | 73 65 74 5f 7a 6c 61 62 65 6c 28 27 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 | set_zlabel('').ax.set_zlim3d(0,. |
0d00 | 42 5f 6c 32 2e 6d 61 78 28 29 20 2a 20 31 2e 30 31 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 | B_l2.max().*.1.01).pl.title('Bar |
0d20 | 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 6c 32 27 29 0a | ycenter.interpolation.with.l2'). |
0d40 | 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 29 0a | pl.tight_layout()..pl.figure(4). |
0d60 | 63 6d 61 70 20 3d 20 70 6c 2e 63 6d 2e 67 65 74 5f 63 6d 61 70 28 27 76 69 72 69 64 69 73 27 29 | cmap.=.pl.cm.get_cmap('viridis') |
0d80 | 0a 76 65 72 74 73 20 3d 20 5b 5d 0a 7a 73 20 3d 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 0a 66 6f 72 20 | .verts.=.[].zs.=.alpha_list.for. |
0da0 | 69 2c 20 7a 20 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 7a 73 29 3a 0a 20 20 20 20 79 73 20 3d 20 | i,.z.in.enumerate(zs):.....ys.=. |
0dc0 | 42 5f 77 61 73 73 5b 3a 2c 20 69 5d 0a 20 20 20 20 76 65 72 74 73 2e 61 70 70 65 6e 64 28 6c 69 | B_wass[:,.i].....verts.append(li |
0de0 | 73 74 28 7a 69 70 28 78 2c 20 79 73 29 29 29 0a 0a 61 78 20 3d 20 70 6c 2e 67 63 66 28 29 2e 67 | st(zip(x,.ys)))..ax.=.pl.gcf().g |
0e00 | 63 61 28 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 3d 27 33 64 27 29 0a 0a 70 6f 6c 79 20 3d 20 50 6f 6c 79 | ca(projection='3d')..poly.=.Poly |
0e20 | 43 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f 6e 28 76 65 72 74 73 2c 20 66 61 63 65 63 6f 6c 6f 72 73 3d 5b 63 6d | Collection(verts,.facecolors=[cm |
0e40 | 61 70 28 61 29 20 66 6f 72 20 61 20 69 6e 20 61 6c 70 68 61 5f 6c 69 73 74 5d 29 0a 70 6f 6c 79 | ap(a).for.a.in.alpha_list]).poly |
0e60 | 2e 73 65 74 5f 61 6c 70 68 61 28 30 2e 37 29 0a 61 78 2e 61 64 64 5f 63 6f 6c 6c 65 63 74 69 6f | .set_alpha(0.7).ax.add_collectio |
0e80 | 6e 33 64 28 70 6f 6c 79 2c 20 7a 73 3d 7a 73 2c 20 7a 64 69 72 3d 27 79 27 29 0a 61 78 2e 73 65 | n3d(poly,.zs=zs,.zdir='y').ax.se |
0ea0 | 74 5f 78 6c 61 62 65 6c 28 27 78 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 78 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 6e | t_xlabel('x').ax.set_xlim3d(0,.n |
0ec0 | 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 79 6c 61 62 65 6c 28 27 24 5c 5c 61 6c 70 68 61 24 27 29 0a 61 78 2e | ).ax.set_ylabel('$\\alpha$').ax. |
0ee0 | 73 65 74 5f 79 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 31 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 61 62 65 6c 28 27 | set_ylim3d(0,.1).ax.set_zlabel(' |
0f00 | 27 29 0a 61 78 2e 73 65 74 5f 7a 6c 69 6d 33 64 28 30 2c 20 42 5f 6c 32 2e 6d 61 78 28 29 20 2a | ').ax.set_zlim3d(0,.B_l2.max().* |
0f20 | 20 31 2e 30 31 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 42 61 72 79 63 65 6e 74 65 72 20 69 6e 74 65 | .1.01).pl.title('Barycenter.inte |
0f40 | 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 27 29 0a 70 6c 2e | rpolation.with.Wasserstein').pl. |
0f60 | 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 | tight_layout()..pl.show().PK.... |
0f80 | 00 00 00 00 18 7f 21 4b 0a 2e ad 80 b8 10 00 00 b8 10 00 00 14 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 | ......!K................plot_otd |
0fa0 | 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 | a_mapping.py#.-*-.coding:.utf-8. |
0fc0 | 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | -*-.""".======================== |
0fe0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 4f 54 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 65 | ===================.OT.mapping.e |
1000 | 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 0a | stimation.for.domain.adaptation. |
1020 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
1040 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 70 72 65 73 65 6e | ===========..This.example.presen |
1060 | 74 73 20 68 6f 77 20 74 6f 20 75 73 65 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 74 | ts.how.to.use.MappingTransport.t |
1080 | 6f 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 20 61 74 20 74 68 65 20 73 61 6d 65 0a 74 69 6d 65 20 62 6f 74 68 | o.estimate.at.the.same.time.both |
10a0 | 20 74 68 65 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6e 64 20 61 70 70 72 | .the.coupling.transport.and.appr |
10c0 | 6f 78 69 6d 61 74 65 20 74 68 65 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 6d 61 70 20 77 69 74 68 20 65 | oximate.the.transport.map.with.e |
10e0 | 69 74 68 65 72 0a 61 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6f 72 20 61 20 6b 65 72 6e 65 6c 69 7a 65 64 20 6d | ither.a.linear.or.a.kernelized.m |
1100 | 61 70 70 69 6e 67 20 61 73 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 64 20 69 6e 20 5b 38 5d 2e 0a 0a 5b 38 | apping.as.introduced.in.[8]...[8 |
1120 | 5d 20 4d 2e 20 50 65 72 72 6f 74 2c 20 4e 2e 20 43 6f 75 72 74 79 2c 20 52 2e 20 46 6c 61 6d 61 | ].M..Perrot,.N..Courty,.R..Flama |
1140 | 72 79 2c 20 41 2e 20 48 61 62 72 61 72 64 2c 0a 20 20 20 20 22 4d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 74 | ry,.A..Habrard,....."Mapping.est |
1160 | 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 | imation.for.discrete.optimal.tra |
1180 | 6e 73 70 6f 72 74 22 2c 0a 20 20 20 20 4e 65 75 72 61 6c 20 49 6e 66 6f 72 6d 61 74 69 6f 6e 20 | nsport",.....Neural.Information. |
11a0 | 50 72 6f 63 65 73 73 69 6e 67 20 53 79 73 74 65 6d 73 20 28 4e 49 50 53 29 2c 20 32 30 31 36 2e | Processing.Systems.(NIPS),.2016. |
11c0 | 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 | ."""..#.Authors:.Remi.Flamary.<r |
11e0 | 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | emi.flamary@unice.fr>.#......... |
1200 | 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e | .Stanislas.Chambon.<stan.chambon |
1220 | 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 | @gmail.com>.#.#.License:.MIT.Lic |
1240 | 65 6e 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 | ense..import.numpy.as.np.import. |
1260 | 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 | matplotlib.pylab.as.pl.import.ot |
1280 | 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ...############################# |
12a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
12c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 | #################.#.Generate.dat |
12e0 | 61 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | a.############################## |
1300 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
1320 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c | ################..n_source_sampl |
1340 | 65 73 20 3d 20 31 30 30 0a 6e 5f 74 61 72 67 65 74 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 31 30 30 0a | es.=.100.n_target_samples.=.100. |
1360 | 74 68 65 74 61 20 3d 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 20 2f 20 32 30 0a 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 | theta.=.2.*.np.pi./.20.noise_lev |
1380 | 65 6c 20 3d 20 30 2e 31 0a 0a 58 73 2c 20 79 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 | el.=.0.1..Xs,.ys.=.ot.datasets.g |
13a0 | 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 0a 20 20 20 20 27 67 61 75 73 73 72 6f 74 27 2c | et_data_classif(.....'gaussrot', |
13c0 | 20 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 6e 7a 3d 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 65 | .n_source_samples,.nz=noise_leve |
13e0 | 6c 29 0a 58 73 5f 6e 65 77 2c 20 5f 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 | l).Xs_new,._.=.ot.datasets.get_d |
1400 | 61 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 0a 20 20 20 20 27 67 61 75 73 73 72 6f 74 27 2c 20 6e 5f 73 | ata_classif(.....'gaussrot',.n_s |
1420 | 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 6e 7a 3d 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 76 65 6c 29 0a 58 | ource_samples,.nz=noise_level).X |
1440 | 74 2c 20 79 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 | t,.yt.=.ot.datasets.get_data_cla |
1460 | 73 73 69 66 28 0a 20 20 20 20 27 67 61 75 73 73 72 6f 74 27 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 5f 73 | ssif(.....'gaussrot',.n_target_s |
1480 | 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 68 65 74 61 3d 74 68 65 74 61 2c 20 6e 7a 3d 6e 6f 69 73 65 5f 6c 65 | amples,.theta=theta,.nz=noise_le |
14a0 | 76 65 6c 29 0a 0a 23 20 6f 6e 65 20 6f 66 20 74 68 65 20 74 61 72 67 65 74 20 6d 6f 64 65 20 63 | vel)..#.one.of.the.target.mode.c |
14c0 | 68 61 6e 67 65 73 20 69 74 73 20 76 61 72 69 61 6e 63 65 20 28 6e 6f 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6d | hanges.its.variance.(no.linear.m |
14e0 | 61 70 70 69 6e 67 29 0a 58 74 5b 79 74 20 3d 3d 20 32 5d 20 2a 3d 20 33 0a 58 74 20 3d 20 58 74 | apping).Xt[yt.==.2].*=.3.Xt.=.Xt |
1500 | 20 2b 20 34 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .+.4..########################## |
1520 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
1540 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 | ####################.#.Plot.data |
1560 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
1580 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
15a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 28 31 | ###############..pl.figure(1,.(1 |
15c0 | 30 2c 20 35 29 29 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c | 0,.5)).pl.clf().pl.scatter(Xs[:, |
15e0 | 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c | .0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+', |
1600 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 | .label='Source.samples').pl.scat |
1620 | 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 | ter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.ma |
1640 | 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 | rker='o',.label='Target.samples' |
1660 | 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 | ).pl.legend(loc=0).pl.title('Sou |
1680 | 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 0a | rce.and.target.distributions').. |
16a0 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
16c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
16e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 68 | ###############.#.Instantiate.th |
1700 | 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 73 | e.different.transport.algorithms |
1720 | 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .and.fit.them.################## |
1740 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
1760 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 20 | ############################..#. |
1780 | 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6b 65 72 | MappingTransport.with.linear.ker |
17a0 | 6e 65 6c 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 | nel.ot_mapping_linear.=.ot.da.Ma |
17c0 | 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 0a 20 20 20 20 6b 65 72 6e 65 6c 3d 22 6c 69 6e 65 | ppingTransport(.....kernel="line |
17e0 | 61 72 22 2c 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 38 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 | ar",.mu=1e0,.eta=1e-8,.bias=True |
1800 | 2c 0a 20 20 20 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 | ,.....max_iter=20,.verbose=True) |
1820 | 0a 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 | ..ot_mapping_linear.fit(Xs=Xs,.X |
1840 | 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d | t=Xt)..#.for.original.source.sam |
1860 | 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 | ples,.transform.applies.barycent |
1880 | 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f | ric.mapping.transp_Xs_linear.=.o |
18a0 | 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 | t_mapping_linear.transform(Xs=Xs |
18c0 | 29 0a 0a 23 20 66 6f 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 | )..#.for.out.of.source.samples,. |
18e0 | 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 74 68 65 20 6c 69 6e 65 61 72 20 6d 61 70 | transform.applies.the.linear.map |
1900 | 70 69 6e 67 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 5f 6d | ping.transp_Xs_linear_new.=.ot_m |
1920 | 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f 6e 65 | apping_linear.transform(Xs=Xs_ne |
1940 | 77 29 0a 0a 0a 23 20 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 67 61 75 | w)...#.MappingTransport.with.gau |
1960 | 73 73 69 61 6e 20 6b 65 72 6e 65 6c 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e | ssian.kernel.ot_mapping_gaussian |
1980 | 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 0a 20 20 20 20 6b | .=.ot.da.MappingTransport(.....k |
19a0 | 65 72 6e 65 6c 3d 22 67 61 75 73 73 69 61 6e 22 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 35 2c 20 6d 75 3d 31 | ernel="gaussian",.eta=1e-5,.mu=1 |
19c0 | 65 2d 31 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 20 73 69 67 6d 61 3d 31 2c 0a 20 20 20 20 6d 61 78 | e-1,.bias=True,.sigma=1,.....max |
19e0 | 5f 69 74 65 72 3d 31 30 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 | _iter=10,.verbose=True).ot_mappi |
1a00 | 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 | ng_gaussian.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)..# |
1a20 | 20 66 6f 72 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 | .for.original.source.samples,.tr |
1a40 | 61 6e 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 62 61 72 79 63 65 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 | ansform.applies.barycentric.mapp |
1a60 | 69 6e 67 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 | ing.transp_Xs_gaussian.=.ot_mapp |
1a80 | 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 0a 23 | ing_gaussian.transform(Xs=Xs)..# |
1aa0 | 20 66 6f 72 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2c 20 74 72 61 6e | .for.out.of.source.samples,.tran |
1ac0 | 73 66 6f 72 6d 20 61 70 70 6c 69 65 73 20 74 68 65 20 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 6d 61 70 70 69 | sform.applies.the.gaussian.mappi |
1ae0 | 6e 67 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5f 6e 65 77 20 3d 20 6f 74 5f 6d | ng.transp_Xs_gaussian_new.=.ot_m |
1b00 | 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 5f | apping_gaussian.transform(Xs=Xs_ |
1b20 | 6e 65 77 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | new)...######################### |
1b40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
1b60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 74 72 61 | #####################.#.Plot.tra |
1b80 | 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | nsported.samples.############### |
1ba0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
1bc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a | ###############################. |
1be0 | 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | .pl.figure(2).pl.clf().pl.subplo |
1c00 | 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 | t(2,.2,.1).pl.scatter(Xt[:,.0],. |
1c20 | 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 | Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',..... |
1c40 | 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 | .......label='Target.samples',.a |
1c60 | 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 | lpha=.2).pl.scatter(transp_Xs_li |
1c80 | 6e 65 61 72 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5b 3a 2c 20 | near[:,.0],.transp_Xs_linear[:,. |
1ca0 | 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | 1],.c=ys,.marker='+',........... |
1cc0 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4d 61 70 70 65 64 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a | .label='Mapped.source.samples'). |
1ce0 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 22 42 61 72 79 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 | pl.title("Bary..mapping.(linear) |
1d00 | 22 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 | ").pl.legend(loc=0)..pl.subplot( |
1d20 | 32 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 | 2,.2,.2).pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt |
1d40 | 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 | [:,.1],.c=yt,.marker='o',....... |
1d60 | 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 | .....label='Target.samples',.alp |
1d80 | 68 61 3d 2e 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 | ha=.2).pl.scatter(transp_Xs_line |
1da0 | 61 72 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 69 6e 65 61 72 5f 6e | ar_new[:,.0],.transp_Xs_linear_n |
1dc0 | 65 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 | ew[:,.1],............c=ys,.marke |
1de0 | 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 65 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 0a | r='+',.label='Learned.mapping'). |
1e00 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 22 45 73 74 69 6d 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6c 69 6e 65 61 72 | pl.title("Estim..mapping.(linear |
1e20 | 29 22 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 | )")..pl.subplot(2,.2,.3).pl.scat |
1e40 | 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 | ter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.ma |
1e60 | 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 | rker='o',............label='Targ |
1e80 | 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 2e 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 | et.samples',.alpha=.2).pl.scatte |
1ea0 | 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e | r(transp_Xs_gaussian[:,.0],.tran |
1ec0 | 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 | sp_Xs_gaussian[:,.1],.c=ys,..... |
1ee0 | 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 62 61 72 79 63 65 | .......marker='+',.label='baryce |
1f00 | 6e 74 72 69 63 20 6d 61 70 70 69 6e 67 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 22 42 61 72 79 2e 20 | ntric.mapping').pl.title("Bary.. |
1f20 | 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6b 65 72 6e 65 6c 29 22 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 | mapping.(kernel)")..pl.subplot(2 |
1f40 | 2c 20 32 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b | ,.2,.4).pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[ |
1f60 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 | :,.1],.c=yt,.marker='o',........ |
1f80 | 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 | ....label='Target.samples',.alph |
1fa0 | 61 3d 2e 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 | a=.2).pl.scatter(transp_Xs_gauss |
1fc0 | 69 61 6e 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 67 61 75 73 73 69 61 | ian_new[:,.0],.transp_Xs_gaussia |
1fe0 | 6e 5f 6e 65 77 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 | n_new[:,.1],.c=ys,............ma |
2000 | 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 4c 65 61 72 6e 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 | rker='+',.label='Learned.mapping |
2020 | 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 22 45 73 74 69 6d 2e 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 28 6b 65 72 | ').pl.title("Estim..mapping.(ker |
2040 | 6e 65 6c 29 22 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f | nel)").pl.tight_layout()..pl.sho |
2060 | 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 18 7f 21 4b b7 26 0b b3 8b 11 00 00 8b 11 00 00 14 00 | w().PK..........!K.&............ |
2080 | 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6c 61 73 73 65 73 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 | ..plot_otda_classes.py#.-*-.codi |
20a0 | 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ng:.utf-8.-*-.""".============== |
20c0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 | ==========.OT.for.domain.adaptat |
20e0 | 69 6f 6e 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 | ion.========================..Th |
2100 | 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 73 20 61 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 | is.example.introduces.a.domain.a |
2120 | 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 69 6e 20 61 20 32 44 20 73 65 74 74 69 6e 67 20 61 6e 64 20 74 68 | daptation.in.a.2D.setting.and.th |
2140 | 65 20 34 20 4f 54 44 41 0a 61 70 70 72 6f 61 63 68 65 73 20 63 75 72 72 65 6e 74 6c 79 20 73 75 | e.4.OTDA.approaches.currently.su |
2160 | 70 70 6f 72 74 65 64 20 69 6e 20 50 4f 54 2e 0a 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a | pported.in.POT..."""..#.Authors: |
2180 | 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 | .Remi.Flamary.<remi.flamary@unic |
21a0 | 65 2e 66 72 3e 0a 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 | e.fr>.#..........Stanislas.Chamb |
21c0 | 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 0a 23 0a 23 20 | on.<stan.chambon@gmail.com>.#.#. |
21e0 | 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 | License:.MIT.License..import.mat |
2200 | 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0a 0a 0a | plotlib.pylab.as.pl.import.ot... |
2220 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
2240 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
2260 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 67 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a 23 | ##############.#.generate.data.# |
2280 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
22a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
22c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 | #############..n_source_samples. |
22e0 | 3d 20 31 35 30 0a 6e 5f 74 61 72 67 65 74 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 20 3d 20 31 35 30 0a 0a 58 73 | =.150.n_target_samples.=.150..Xs |
2300 | 2c 20 79 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c 61 73 | ,.ys.=.ot.datasets.get_data_clas |
2320 | 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 27 2c 20 6e 5f 73 6f 75 72 63 65 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 29 0a | sif('3gauss',.n_source_samples). |
2340 | 58 74 2c 20 79 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 5f 63 6c | Xt,.yt.=.ot.datasets.get_data_cl |
2360 | 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 32 27 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 5f 73 61 6d 70 6c 65 | assif('3gauss2',.n_target_sample |
2380 | 73 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | s)...########################### |
23a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
23c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 | ###################.#.Instantiat |
23e0 | 65 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 | e.the.different.transport.algori |
2400 | 74 68 6d 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | thms.and.fit.them.############## |
2420 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
2440 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
2460 | 0a 0a 23 20 45 4d 44 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 | ..#.EMD.Transport.ot_emd.=.ot.da |
2480 | 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 0a 6f 74 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 | .EMDTransport().ot_emd.fit(Xs=Xs |
24a0 | 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f | ,.Xt=Xt)..#.Sinkhorn.Transport.o |
24c0 | 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 | t_sinkhorn.=.ot.da.SinkhornTrans |
24e0 | 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 | port(reg_e=1e-1).ot_sinkhorn.fit |
2500 | 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 | (Xs=Xs,.Xt=Xt)..#.Sinkhorn.Trans |
2520 | 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 | port.with.Group.lasso.regulariza |
2540 | 74 69 6f 6e 0a 6f 74 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c | tion.ot_lpl1.=.ot.da.SinkhornLpl |
2560 | 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 2c 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 31 65 | 1Transport(reg_e=1e-1,.reg_cl=1e |
2580 | 30 29 0a 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d | 0).ot_lpl1.fit(Xs=Xs,.ys=ys,.Xt= |
25a0 | 58 74 29 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 77 69 74 68 20 47 | Xt)..#.Sinkhorn.Transport.with.G |
25c0 | 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 6c 31 6c 32 0a 6f | roup.lasso.regularization.l1l2.o |
25e0 | 74 5f 6c 31 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 | t_l1l2.=.ot.da.SinkhornL1l2Trans |
2600 | 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 2c 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 32 65 30 2c 20 6d 61 78 | port(reg_e=1e-1,.reg_cl=2e0,.max |
2620 | 5f 69 74 65 72 3d 32 30 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 | _iter=20,....................... |
2640 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 6f 74 | ................verbose=True).ot |
2660 | 5f 6c 31 6c 32 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a | _l1l2.fit(Xs=Xs,.ys=ys,.Xt=Xt).. |
2680 | 23 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6f 6e 74 6f 20 | #.transport.source.samples.onto. |
26a0 | 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f | target.samples.transp_Xs_emd.=.o |
26c0 | 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 | t_emd.transform(Xs=Xs).transp_Xs |
26e0 | 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 | _sinkhorn.=.ot_sinkhorn.transfor |
2700 | 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f 6c 70 6c | m(Xs=Xs).transp_Xs_lpl1.=.ot_lpl |
2720 | 31 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 31 6c | 1.transform(Xs=Xs).transp_Xs_l1l |
2740 | 32 20 3d 20 6f 74 5f 6c 31 6c 32 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 0a 0a 23 | 2.=.ot_l1l2.transform(Xs=Xs)...# |
2760 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
2780 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
27a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f | #############.#.Fig.1.:.plots.so |
27c0 | 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 | urce.and.target.samples.######## |
27e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
2800 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
2820 | 23 23 23 23 23 23 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 | ######..pl.figure(1,.figsize=(10 |
2840 | 2c 20 35 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 | ,.5)).pl.subplot(1,.2,.1).pl.sca |
2860 | 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d | tter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.m |
2880 | 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | arker='+',.label='Source.samples |
28a0 | 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 | ').pl.xticks([]).pl.yticks([]).p |
28c0 | 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 | l.legend(loc=0).pl.title('Source |
28e0 | 20 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 | ..samples')..pl.subplot(1,.2,.2) |
2900 | 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | .pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],. |
2920 | 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 | c=yt,.marker='o',.label='Target. |
2940 | 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b | samples').pl.xticks([]).pl.ytick |
2960 | 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | s([]).pl.legend(loc=0).pl.title( |
2980 | 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 | 'Target.samples').pl.tight_layou |
29a0 | 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | t()...########################## |
29c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
29e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 | ####################.#.Fig.2.:.p |
2a00 | 6c 6f 74 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 61 6e 64 20 74 72 61 6e 73 70 | lot.optimal.couplings.and.transp |
2a20 | 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | orted.samples.################## |
2a40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
2a60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 70 61 | ############################..pa |
2a80 | 72 61 6d 5f 69 6d 67 20 3d 20 7b 27 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 27 3a 20 27 6e 65 61 | ram_img.=.{'interpolation':.'nea |
2aa0 | 72 65 73 74 27 2c 20 27 63 6d 61 70 27 3a 20 27 73 70 65 63 74 72 61 6c 27 7d 0a 0a 70 6c 2e 66 | rest',.'cmap':.'spectral'}..pl.f |
2ac0 | 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 35 2c 20 38 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 | igure(2,.figsize=(15,.8)).pl.sub |
2ae0 | 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 | plot(2,.4,.1).pl.imshow(ot_emd.c |
2b00 | 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 | oupling_,.**param_img).pl.xticks |
2b20 | 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 | ([]).pl.yticks([]).pl.title('Opt |
2b40 | 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 | imal.coupling\nEMDTransport')..p |
2b60 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f | l.subplot(2,.4,.2).pl.imshow(ot_ |
2b80 | 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 | sinkhorn.coupling_,.**param_img) |
2ba0 | 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e | .pl.xticks([]).pl.yticks([]).pl. |
2bc0 | 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 | title('Optimal.coupling\nSinkhor |
2be0 | 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 33 | nTransport')..pl.subplot(2,.4,.3 |
2c00 | 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a | ).pl.imshow(ot_lpl1.coupling_,.* |
2c20 | 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 | *param_img).pl.xticks([]).pl.yti |
2c40 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 | cks([]).pl.title('Optimal.coupli |
2c60 | 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e | ng\nSinkhornLpl1Transport')..pl. |
2c80 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 6c 31 | subplot(2,.4,.4).pl.imshow(ot_l1 |
2ca0 | 6c 32 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 2a 2a 70 61 72 61 6d 5f 69 6d 67 29 0a 70 6c 2e 78 74 | l2.coupling_,.**param_img).pl.xt |
2cc0 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | icks([]).pl.yticks([]).pl.title( |
2ce0 | 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 | 'Optimal.coupling\nSinkhornL1l2T |
2d00 | 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 35 29 0a | ransport')..pl.subplot(2,.4,.5). |
2d20 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 | pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c |
2d40 | 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 | =yt,.marker='o',............labe |
2d60 | 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 0a 70 | l='Target.samples',.alpha=0.3).p |
2d80 | 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 | l.scatter(transp_Xs_emd[:,.0],.t |
2da0 | 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 | ransp_Xs_emd[:,.1],.c=ys,....... |
2dc0 | 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 | .....marker='+',.label='Transp.s |
2de0 | 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e | amples',.s=30).pl.xticks([]).pl. |
2e00 | 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 | yticks([]).pl.title('Transported |
2e20 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 | .samples\nEmdTransport').pl.lege |
2e40 | 6e 64 28 6c 6f 63 3d 22 6c 6f 77 65 72 20 6c 65 66 74 22 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | nd(loc="lower.left")..pl.subplot |
2e60 | 28 32 2c 20 34 2c 20 36 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 | (2,.4,.6).pl.scatter(Xt[:,.0],.X |
2e80 | 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 | t[:,.1],.c=yt,.marker='o',...... |
2ea0 | 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c | ......label='Target.samples',.al |
2ec0 | 70 68 61 3d 30 2e 33 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 | pha=0.3).pl.scatter(transp_Xs_si |
2ee0 | 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e | nkhorn[:,.0],.transp_Xs_sinkhorn |
2f00 | 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d | [:,.1],.c=ys,............marker= |
2f20 | 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 | '+',.label='Transp.samples',.s=3 |
2f40 | 30 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 | 0).pl.xticks([]).pl.yticks([]).p |
2f60 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 53 69 | l.title('Transported.samples\nSi |
2f80 | 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | nkhornTransport')..pl.subplot(2, |
2fa0 | 20 34 2c 20 37 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a | .4,.7).pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[: |
2fc0 | 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 | ,.1],.c=yt,.marker='o',......... |
2fe0 | 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 | ...label='Target.samples',.alpha |
3000 | 3d 30 2e 33 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b | =0.3).pl.scatter(transp_Xs_lpl1[ |
3020 | 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 | :,.0],.transp_Xs_lpl1[:,.1],.c=y |
3040 | 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d | s,............marker='+',.label= |
3060 | 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b | 'Transp.samples',.s=30).pl.xtick |
3080 | 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 | s([]).pl.yticks([]).pl.title('Tr |
30a0 | 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 | ansported.samples\nSinkhornLpl1T |
30c0 | 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 34 2c 20 38 29 0a | ransport')..pl.subplot(2,.4,.8). |
30e0 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 | pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c |
3100 | 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 | =yt,.marker='o',............labe |
3120 | 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 33 29 0a 70 | l='Target.samples',.alpha=0.3).p |
3140 | 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 31 6c 32 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 | l.scatter(transp_Xs_l1l2[:,.0],. |
3160 | 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 31 6c 32 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 | transp_Xs_l1l2[:,.1],.c=ys,..... |
3180 | 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 | .......marker='+',.label='Transp |
31a0 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 | .samples',.s=30).pl.xticks([]).p |
31c0 | 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 | l.yticks([]).pl.title('Transport |
31e0 | 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 31 6c 32 54 72 61 6e 73 70 6f 72 | ed.samples\nSinkhornL1l2Transpor |
3200 | 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 | t').pl.tight_layout()..pl.show() |
3220 | 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 18 7f 21 4b 57 2f 82 87 43 0a 00 00 43 0a 00 00 15 00 00 00 70 | .PK..........!KW/..C...C.......p |
3240 | 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 | lot_OT_2D_samples.py#.-*-.coding |
3260 | 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | :.utf-8.-*-.""".================ |
3280 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
32a0 | 3d 3d 3d 3d 0a 32 44 20 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 62 65 74 77 65 65 | ====.2D.Optimal.transport.betwee |
32c0 | 6e 20 65 6d 70 69 72 69 63 61 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d | n.empirical.distributions.====== |
32e0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
3300 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 49 6c 6c 75 73 74 72 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 | ==============..Illustration.of. |
3320 | 32 44 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 64 69 73 | 2D.optimal.transport.between.dis |
3340 | 63 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 74 68 61 74 20 61 72 65 20 77 65 69 67 68 74 65 64 0a 73 75 6d | cributions.that.are.weighted.sum |
3360 | 20 6f 66 20 64 69 72 61 63 73 2e 20 54 68 65 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 69 73 20 70 6c 6f | .of.diracs..The.OT.matrix.is.plo |
3380 | 74 74 65 64 20 77 69 74 68 20 74 68 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 2e 0a 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 | tted.with.the.samples..."""..#.A |
33a0 | 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 | uthor:.Remi.Flamary.<remi.flamar |
33c0 | 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 | y@unice.fr>.#.#.License:.MIT.Lic |
33e0 | 65 6e 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 | ense..import.numpy.as.np.import. |
3400 | 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 | matplotlib.pylab.as.pl.import.ot |
3420 | 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ..############################## |
3440 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
3460 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 | ################.#.Generate.data |
3480 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
34a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
34c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 20 | ###############..#%%.parameters. |
34e0 | 61 6e 64 20 64 61 74 61 20 67 65 6e 65 72 61 74 69 6f 6e 0a 0a 6e 20 3d 20 35 30 20 20 23 20 6e | and.data.generation..n.=.50..#.n |
3500 | 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 0a 6d 75 5f 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 30 2c 20 30 | b.samples..mu_s.=.np.array([0,.0 |
3520 | 5d 29 0a 63 6f 76 5f 73 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 5b 31 2c 20 30 5d 2c 20 5b 30 2c | ]).cov_s.=.np.array([[1,.0],.[0, |
3540 | 20 31 5d 5d 29 0a 0a 6d 75 5f 74 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 34 2c 20 34 5d 29 0a 63 | .1]])..mu_t.=.np.array([4,.4]).c |
3560 | 6f 76 5f 74 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 72 61 79 28 5b 5b 31 2c 20 2d 2e 38 5d 2c 20 5b 2d 2e 38 2c | ov_t.=.np.array([[1,.-.8],.[-.8, |
3580 | 20 31 5d 5d 29 0a 0a 78 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 32 44 5f 73 | .1]])..xs.=.ot.datasets.get_2D_s |
35a0 | 61 6d 70 6c 65 73 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 75 5f 73 2c 20 63 6f 76 5f 73 29 0a 78 74 20 | amples_gauss(n,.mu_s,.cov_s).xt. |
35c0 | 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 67 61 75 | =.ot.datasets.get_2D_samples_gau |
35e0 | 73 73 28 6e 2c 20 6d 75 5f 74 2c 20 63 6f 76 5f 74 29 0a 0a 61 2c 20 62 20 3d 20 6e 70 2e 6f 6e | ss(n,.mu_t,.cov_t)..a,.b.=.np.on |
3600 | 65 73 28 28 6e 2c 29 29 20 2f 20 6e 2c 20 6e 70 2e 6f 6e 65 73 28 28 6e 2c 29 29 20 2f 20 6e 20 | es((n,))./.n,.np.ones((n,))./.n. |
3620 | 20 23 20 75 6e 69 66 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 61 6d 70 6c | .#.uniform.distribution.on.sampl |
3640 | 65 73 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 | es..#.loss.matrix.M.=.ot.dist(xs |
3660 | 2c 20 78 74 29 0a 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ,.xt).M./=.M.max()..############ |
3680 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
36a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
36c0 | 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ##.#.Plot.data.################# |
36e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
3700 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 | #############################..# |
3720 | 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 0a 70 6c | %%.plot.samples..pl.figure(1).pl |
3740 | 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 | .plot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+b',. |
3760 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 | label='Source.samples').pl.plot( |
3780 | 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d | xt[:,.0],.xt[:,.1],.'xr',.label= |
37a0 | 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d | 'Target.samples').pl.legend(loc= |
37c0 | 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 61 72 67 65 74 20 64 | 0).pl.title('Source.and.target.d |
37e0 | 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 0a 70 6c 2e | istributions')..pl.figure(2).pl. |
3800 | 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 | imshow(M,.interpolation='nearest |
3820 | 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 4d 27 29 0a 0a 23 23 | ').pl.title('Cost.matrix.M')..## |
3840 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
3860 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
3880 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 45 4d 44 0a 23 23 23 23 23 | ############.#.Compute.EMD.##### |
38a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
38c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
38e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 25 25 20 45 4d 44 0a 0a 47 30 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 | #########..#%%.EMD..G0.=.ot.emd( |
3900 | 61 2c 20 62 2c 20 4d 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 | a,.b,.M)..pl.figure(3).pl.imshow |
3920 | 28 47 30 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c | (G0,.interpolation='nearest').pl |
3940 | 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 30 27 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 | .title('OT.matrix.G0')..pl.figur |
3960 | 65 28 34 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 | e(4).ot.plot.plot2D_samples_mat( |
3980 | 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 30 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 70 6c | xs,.xt,.G0,.c=[.5,..5,.1]).pl.pl |
39a0 | 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 | ot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+b',.lab |
39c0 | 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b | el='Source.samples').pl.plot(xt[ |
39e0 | 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 | :,.0],.xt[:,.1],.'xr',.label='Ta |
3a00 | 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a | rget.samples').pl.legend(loc=0). |
3a20 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 77 69 74 68 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | pl.title('OT.matrix.with.samples |
3a40 | 27 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ')...########################### |
3a60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
3a80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 53 69 | ###################.#.Compute.Si |
3aa0 | 6e 6b 68 6f 72 6e 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | nkhorn.######################### |
3ac0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
3ae0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 25 25 20 73 69 6e 6b 68 | #####################..#%%.sinkh |
3b00 | 6f 72 6e 0a 0a 23 20 72 65 67 20 74 65 72 6d 0a 6c 61 6d 62 64 20 3d 20 31 65 2d 33 0a 0a 47 73 | orn..#.reg.term.lambd.=.1e-3..Gs |
3b20 | 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 6c 61 6d 62 64 29 0a 0a | .=.ot.sinkhorn(a,.b,.M,.lambd).. |
3b40 | 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 47 73 2c 20 69 6e 74 65 72 | pl.figure(5).pl.imshow(Gs,.inter |
3b60 | 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 | polation='nearest').pl.title('OT |
3b80 | 20 6d 61 74 72 69 78 20 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 36 29 | .matrix.sinkhorn')..pl.figure(6) |
3ba0 | 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 | .ot.plot.plot2D_samples_mat(xs,. |
3bc0 | 78 74 2c 20 47 73 2c 20 63 6f 6c 6f 72 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 70 6c | xt,.Gs,.color=[.5,..5,.1]).pl.pl |
3be0 | 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 | ot(xs[:,.0],.xs[:,.1],.'+b',.lab |
3c00 | 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b | el='Source.samples').pl.plot(xt[ |
3c20 | 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 | :,.0],.xt[:,.1],.'xr',.label='Ta |
3c40 | 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a | rget.samples').pl.legend(loc=0). |
3c60 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 77 69 74 | pl.title('OT.matrix.Sinkhorn.wit |
3c80 | 68 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 | h.samples')..pl.show().PK....... |
3ca0 | 00 18 7f 21 4b 7b 50 af 9f 3c 14 00 00 3c 14 00 00 13 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 4c 31 5f | ...!K{P..<...<.......plot_OT_L1_ |
3cc0 | 76 73 5f 4c 32 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a | vs_L2.py#.-*-.coding:.utf-8.-*-. |
3ce0 | 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | """.============================ |
3d00 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 32 44 20 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 | ==============.2D.Optimal.transp |
3d20 | 6f 72 74 20 66 6f 72 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6d 65 74 72 69 63 73 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ort.for.different.metrics.====== |
3d40 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
3d60 | 3d 3d 3d 3d 0a 0a 32 44 20 4f 54 20 6f 6e 20 65 6d 70 69 72 69 63 61 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 | ====..2D.OT.on.empirical.distrib |
3d80 | 75 74 69 6f 20 20 77 69 74 68 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 67 6f 75 6e 64 20 6d 65 74 72 69 | utio..with.different.gound.metri |
3da0 | 63 2e 0a 0a 53 74 6f 6c 65 20 74 68 65 20 66 69 67 75 72 65 20 69 64 65 61 20 66 72 6f 6d 20 46 | c...Stole.the.figure.idea.from.F |
3dc0 | 69 67 2e 20 31 20 61 6e 64 20 32 20 69 6e 0a 68 74 74 70 73 3a 2f 2f 61 72 78 69 76 2e 6f 72 67 | ig..1.and.2.in.https://arxiv.org |
3de0 | 2f 70 64 66 2f 31 37 30 36 2e 30 37 36 35 30 2e 70 64 66 0a 0a 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 | /pdf/1706.07650.pdf..."""..#.Aut |
3e00 | 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 | hor:.Remi.Flamary.<remi.flamary@ |
3e20 | 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e | unice.fr>.#.#.License:.MIT.Licen |
3e40 | 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 | se..import.numpy.as.np.import.ma |
3e60 | 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0a 0a | tplotlib.pylab.as.pl.import.ot.. |
3e80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
3ea0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
3ec0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 44 61 74 61 73 65 74 20 31 20 3a 20 75 6e 69 | ##############.#.Dataset.1.:.uni |
3ee0 | 66 6f 72 6d 20 73 61 6d 70 6c 69 6e 67 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | form.sampling.################## |
3f00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
3f20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 6e 20 | ############################..n. |
3f40 | 3d 20 32 30 20 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 78 73 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 | =.20..#.nb.samples.xs.=.np.zeros |
3f60 | 28 28 6e 2c 20 32 29 29 0a 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 | ((n,.2)).xs[:,.0].=.np.arange(n) |
3f80 | 20 2b 20 31 0a 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2b 20 | .+.1.xs[:,.1].=.(np.arange(n).+. |
3fa0 | 31 29 20 2a 20 2d 30 2e 30 30 31 20 20 23 20 74 6f 20 6d 61 6b 65 20 69 74 20 73 74 72 69 63 74 | 1).*.-0.001..#.to.make.it.strict |
3fc0 | 6c 79 20 63 6f 6e 76 65 78 2e 2e 2e 0a 0a 78 74 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 | ly.convex.....xt.=.np.zeros((n,. |
3fe0 | 32 29 29 0a 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2b 20 31 0a | 2)).xt[:,.1].=.np.arange(n).+.1. |
4000 | 0a 61 2c 20 62 20 3d 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 2c 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 20 20 | .a,.b.=.ot.unif(n),.ot.unif(n).. |
4020 | 23 20 75 6e 69 66 6f 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 61 6d 70 6c 65 | #.uniform.distribution.on.sample |
4040 | 73 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 | s..#.loss.matrix.M1.=.ot.dist(xs |
4060 | 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 4d 31 20 2f 3d 20 | ,.xt,.metric='euclidean').M1./=. |
4080 | 4d 31 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e | M1.max()..#.loss.matrix.M2.=.ot. |
40a0 | 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e | dist(xs,.xt,.metric='sqeuclidean |
40c0 | 27 29 0a 4d 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 | ').M2./=.M2.max()..#.loss.matrix |
40e0 | 0a 4d 70 20 3d 20 6e 70 2e 73 71 72 74 28 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 | .Mp.=.np.sqrt(ot.dist(xs,.xt,.me |
4100 | 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 29 0a 4d 70 20 2f 3d 20 4d 70 2e 6d 61 78 28 | tric='euclidean')).Mp./=.Mp.max( |
4120 | 29 0a 0a 23 20 44 61 74 61 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 | )..#.Data.pl.figure(1,.figsize=( |
4140 | 37 2c 20 33 29 29 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d | 7,.3)).pl.clf().pl.plot(xs[:,.0] |
4160 | 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 | ,.xs[:,.1],.'+b',.label='Source. |
4180 | 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a | samples').pl.plot(xt[:,.0],.xt[: |
41a0 | 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 | ,.1],.'xr',.label='Target.sample |
41c0 | 73 27 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 | s').pl.axis('equal').pl.title('S |
41e0 | 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 74 72 61 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 | ource.and.traget.distributions') |
4200 | 0a 0a 0a 23 20 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 | ...#.Cost.matrices.pl.figure(2,. |
4220 | 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 | figsize=(7,.3))..pl.subplot(1,.3 |
4240 | 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 31 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e | ,.1).pl.imshow(M1,.interpolation |
4260 | 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 | ='nearest').pl.title('Euclidean. |
4280 | 63 6f 73 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 | cost')..pl.subplot(1,.3,.2).pl.i |
42a0 | 6d 73 68 6f 77 28 4d 32 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 | mshow(M2,.interpolation='nearest |
42c0 | 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 | ').pl.title('Squared.Euclidean.c |
42e0 | 6f 73 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d | ost')..pl.subplot(1,.3,.3).pl.im |
4300 | 73 68 6f 77 28 4d 70 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 | show(Mp,.interpolation='nearest' |
4320 | 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 | ).pl.title('Sqrt.Euclidean.cost' |
4340 | 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ).pl.tight_layout()..########### |
4360 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
4380 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
43a0 | 23 23 23 0a 23 20 44 61 74 61 73 65 74 20 31 20 3a 20 50 6c 6f 74 20 4f 54 20 4d 61 74 72 69 63 | ###.#.Dataset.1.:.Plot.OT.Matric |
43c0 | 65 73 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | es.############################# |
43e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
4400 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 0a 0a 23 25 25 20 45 4d 44 0a 47 31 20 | #################....#%%.EMD.G1. |
4420 | 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 31 29 0a 47 32 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 | =.ot.emd(a,.b,.M1).G2.=.ot.emd(a |
4440 | 2c 20 62 2c 20 4d 32 29 0a 47 70 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 70 29 0a 0a | ,.b,.M2).Gp.=.ot.emd(a,.b,.Mp).. |
4460 | 23 20 4f 54 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 | #.OT.matrices.pl.figure(3,.figsi |
4480 | 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 0a | ze=(7,.3))..pl.subplot(1,.3,.1). |
44a0 | 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 | ot.plot.plot2D_samples_mat(xs,.x |
44c0 | 74 2c 20 47 31 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 | t,.G1,.c=[.5,..5,.1]).pl.plot(xs |
44e0 | 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 | [:,.0],.xs[:,.1],.'+b',.label='S |
4500 | 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d | ource.samples').pl.plot(xt[:,.0] |
4520 | 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 | ,.xt[:,.1],.'xr',.label='Target. |
4540 | 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 23 20 70 6c 2e | samples').pl.axis('equal').#.pl. |
4560 | 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 45 75 63 6c 69 | legend(loc=0).pl.title('OT.Eucli |
4580 | 64 65 61 6e 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 6f 74 2e 70 | dean')..pl.subplot(1,.3,.2).ot.p |
45a0 | 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 | lot.plot2D_samples_mat(xs,.xt,.G |
45c0 | 32 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 | 2,.c=[.5,..5,.1]).pl.plot(xs[:,. |
45e0 | 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 | 0],.xs[:,.1],.'+b',.label='Sourc |
4600 | 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 | e.samples').pl.plot(xt[:,.0],.xt |
4620 | 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 | [:,.1],.'xr',.label='Target.samp |
4640 | 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 | les').pl.axis('equal').#.pl.lege |
4660 | 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 75 61 72 65 64 20 45 | nd(loc=0).pl.title('OT.squared.E |
4680 | 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 0a | uclidean')..pl.subplot(1,.3,.3). |
46a0 | 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 | ot.plot.plot2D_samples_mat(xs,.x |
46c0 | 74 2c 20 47 70 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 | t,.Gp,.c=[.5,..5,.1]).pl.plot(xs |
46e0 | 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 | [:,.0],.xs[:,.1],.'+b',.label='S |
4700 | 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d | ource.samples').pl.plot(xt[:,.0] |
4720 | 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 | ,.xt[:,.1],.'xr',.label='Target. |
4740 | 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 23 20 70 6c 2e | samples').pl.axis('equal').#.pl. |
4760 | 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 72 74 20 | legend(loc=0).pl.title('OT.sqrt. |
4780 | 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 | Euclidean').pl.tight_layout()..p |
47a0 | 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | l.show()...##################### |
47c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
47e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 44 61 74 61 | #########################.#.Data |
4800 | 73 65 74 20 32 20 3a 20 50 61 72 74 69 61 6c 20 63 69 72 63 6c 65 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | set.2.:.Partial.circle.######### |
4820 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
4840 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
4860 | 23 23 23 23 23 0a 0a 6e 20 3d 20 35 30 20 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 78 74 6f 74 | #####..n.=.50..#.nb.samples.xtot |
4880 | 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 20 2b 20 31 2c 20 32 29 29 0a 78 74 6f 74 5b 3a 2c 20 | .=.np.zeros((n.+.1,.2)).xtot[:,. |
48a0 | 30 5d 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 73 28 0a 20 20 20 20 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 20 2b 20 | 0].=.np.cos(.....(np.arange(n.+. |
48c0 | 31 29 20 2b 20 31 2e 30 29 20 2a 20 30 2e 39 20 2f 20 28 6e 20 2b 20 32 29 20 2a 20 32 20 2a 20 | 1).+.1.0).*.0.9./.(n.+.2).*.2.*. |
48e0 | 6e 70 2e 70 69 29 0a 78 74 6f 74 5b 3a 2c 20 31 5d 20 3d 20 6e 70 2e 73 69 6e 28 0a 20 20 20 20 | np.pi).xtot[:,.1].=.np.sin(..... |
4900 | 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 20 2b 20 31 29 20 2b 20 31 2e 30 29 20 2a 20 30 2e 39 20 2f | (np.arange(n.+.1).+.1.0).*.0.9./ |
4920 | 20 28 6e 20 2b 20 32 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 29 0a 0a 78 73 20 3d 20 78 74 6f 74 | .(n.+.2).*.2.*.np.pi)..xs.=.xtot |
4940 | 5b 3a 6e 2c 20 3a 5d 0a 78 74 20 3d 20 78 74 6f 74 5b 31 3a 2c 20 3a 5d 0a 0a 61 2c 20 62 20 3d | [:n,.:].xt.=.xtot[1:,.:]..a,.b.= |
4960 | 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 2c 20 6f 74 2e 75 6e 69 66 28 6e 29 20 20 23 20 75 6e 69 66 6f | .ot.unif(n),.ot.unif(n)..#.unifo |
4980 | 72 6d 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 6f 6e 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 0a 23 20 6c 6f | rm.distribution.on.samples..#.lo |
49a0 | 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d | ss.matrix.M1.=.ot.dist(xs,.xt,.m |
49c0 | 65 74 72 69 63 3d 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 4d 31 20 2f 3d 20 4d 31 2e 6d 61 78 28 | etric='euclidean').M1./=.M1.max( |
49e0 | 29 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 | )..#.loss.matrix.M2.=.ot.dist(xs |
4a00 | 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 4d 32 20 2f | ,.xt,.metric='sqeuclidean').M2./ |
4a20 | 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 70 20 3d 20 6e | =.M2.max()..#.loss.matrix.Mp.=.n |
4a40 | 70 2e 73 71 72 74 28 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 65 | p.sqrt(ot.dist(xs,.xt,.metric='e |
4a60 | 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 29 0a 4d 70 20 2f 3d 20 4d 70 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 0a 23 20 44 | uclidean')).Mp./=.Mp.max()...#.D |
4a80 | 61 74 61 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 | ata.pl.figure(4,.figsize=(7,.3)) |
4aa0 | 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 5b 3a | .pl.clf().pl.plot(xs[:,.0],.xs[: |
4ac0 | 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 | ,.1],.'+b',.label='Source.sample |
4ae0 | 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | s').pl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1],. |
4b00 | 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c | 'xr',.label='Target.samples').pl |
4b20 | 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 | .axis('equal').pl.title('Source. |
4b40 | 61 6e 64 20 74 72 61 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 0a 0a 23 20 43 | and.traget.distributions')...#.C |
4b60 | 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 63 65 73 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 2c 20 66 69 67 73 69 7a | ost.matrices.pl.figure(5,.figsiz |
4b80 | 65 3d 28 37 2c 20 33 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 70 | e=(7,.3))..pl.subplot(1,.3,.1).p |
4ba0 | 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 31 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 | l.imshow(M1,.interpolation='near |
4bc0 | 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 | est').pl.title('Euclidean.cost') |
4be0 | 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 | ..pl.subplot(1,.3,.2).pl.imshow( |
4c00 | 4d 32 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e | M2,.interpolation='nearest').pl. |
4c20 | 74 69 74 6c 65 28 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 0a | title('Squared.Euclidean.cost'). |
4c40 | 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d | .pl.subplot(1,.3,.3).pl.imshow(M |
4c60 | 70 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 | p,.interpolation='nearest').pl.t |
4c80 | 69 74 6c 65 28 27 53 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 63 6f 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 | itle('Sqrt.Euclidean.cost').pl.t |
4ca0 | 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ight_layout()..################# |
4cc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
4ce0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 | #############################.#. |
4d00 | 44 61 74 61 73 65 74 20 32 20 3a 20 50 6c 6f 74 20 20 4f 54 20 4d 61 74 72 69 63 65 73 0a 23 23 | Dataset.2.:.Plot..OT.Matrices.## |
4d20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
4d40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
4d60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 0a 0a 23 25 25 20 45 4d 44 0a 47 31 20 3d 20 6f 74 2e | ############....#%%.EMD.G1.=.ot. |
4d80 | 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 31 29 0a 47 32 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 | emd(a,.b,.M1).G2.=.ot.emd(a,.b,. |
4da0 | 4d 32 29 0a 47 70 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 70 29 0a 0a 23 20 4f 54 20 | M2).Gp.=.ot.emd(a,.b,.Mp)..#.OT. |
4dc0 | 6d 61 74 72 69 63 65 73 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 36 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 37 | matrices.pl.figure(6,.figsize=(7 |
4de0 | 2c 20 33 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 6f 74 2e 70 6c | ,.3))..pl.subplot(1,.3,.1).ot.pl |
4e00 | 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 31 | ot.plot2D_samples_mat(xs,.xt,.G1 |
4e20 | 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 | ,.c=[.5,..5,.1]).pl.plot(xs[:,.0 |
4e40 | 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 | ],.xs[:,.1],.'+b',.label='Source |
4e60 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b | .samples').pl.plot(xt[:,.0],.xt[ |
4e80 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c | :,.1],.'xr',.label='Target.sampl |
4ea0 | 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e | es').pl.axis('equal').#.pl.legen |
4ec0 | 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 | d(loc=0).pl.title('OT.Euclidean' |
4ee0 | 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 | )..pl.subplot(1,.3,.2).ot.plot.p |
4f00 | 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 32 2c 20 63 3d | lot2D_samples_mat(xs,.xt,.G2,.c= |
4f20 | 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 | [.5,..5,.1]).pl.plot(xs[:,.0],.x |
4f40 | 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d | s[:,.1],.'+b',.label='Source.sam |
4f60 | 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 | ples').pl.plot(xt[:,.0],.xt[:,.1 |
4f80 | 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 | ],.'xr',.label='Target.samples') |
4fa0 | 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f | .pl.axis('equal').#.pl.legend(lo |
4fc0 | 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 | c=0).pl.title('OT.squared.Euclid |
4fe0 | 65 61 6e 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 6f 74 2e 70 6c | ean')..pl.subplot(1,.3,.3).ot.pl |
5000 | 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 78 73 2c 20 78 74 2c 20 47 70 | ot.plot2D_samples_mat(xs,.xt,.Gp |
5020 | 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 73 5b 3a 2c 20 30 | ,.c=[.5,..5,.1]).pl.plot(xs[:,.0 |
5040 | 5d 2c 20 78 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 2b 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 | ],.xs[:,.1],.'+b',.label='Source |
5060 | 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b | .samples').pl.plot(xt[:,.0],.xt[ |
5080 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 27 78 72 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c | :,.1],.'xr',.label='Target.sampl |
50a0 | 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 65 71 75 61 6c 27 29 0a 23 20 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e | es').pl.axis('equal').#.pl.legen |
50c0 | 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 54 20 73 71 72 74 20 45 75 63 6c 69 | d(loc=0).pl.title('OT.sqrt.Eucli |
50e0 | 64 65 61 6e 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f | dean').pl.tight_layout()..pl.sho |
5100 | 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 18 7f 21 4b 9d 2d e5 9a 46 11 00 00 46 11 00 00 22 00 | w().PK..........!K.-..F...F...". |
5120 | 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 63 6f 6c 6f 72 73 5f 69 6d 61 67 65 | ..plot_otda_mapping_colors_image |
5140 | 73 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a | s.py#.-*-.coding:.utf-8.-*-.""". |
5160 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
5180 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 4f 54 20 66 6f 72 20 69 6d 61 | =====================.OT.for.ima |
51a0 | 67 65 20 63 6f 6c 6f 72 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 6d 61 70 70 69 6e 67 | ge.color.adaptation.with.mapping |
51c0 | 20 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | .estimation..=================== |
51e0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ================================ |
5200 | 3d 3d 0a 0a 4f 54 20 66 6f 72 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 | ==..OT.for.domain.adaptation.wit |
5220 | 68 20 69 6d 61 67 65 20 63 6f 6c 6f 72 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 5b 36 5d 20 77 69 74 | h.image.color.adaptation.[6].wit |
5240 | 68 20 6d 61 70 70 69 6e 67 20 0a 65 73 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 5b 38 5d 2e 0a 0a 5b 36 5d 20 | h.mapping..estimation.[8]...[6]. |
5260 | 46 65 72 72 61 64 61 6e 73 2c 20 53 2e 2c 20 50 61 70 61 64 61 6b 69 73 2c 20 4e 2e 2c 20 50 65 | Ferradans,.S.,.Papadakis,.N.,.Pe |
5280 | 79 72 65 2c 20 47 2e 2c 20 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 4a 2e 20 46 2e 20 28 32 30 31 34 29 2e 20 | yre,.G.,.&.Aujol,.J..F..(2014).. |
52a0 | 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 0a 20 20 20 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c | Regularized.....discrete.optimal |
52c0 | 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 2e 20 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c 20 6f 6e 20 49 6d 61 67 | .transport..SIAM.Journal.on.Imag |
52e0 | 69 6e 67 20 53 63 69 65 6e 63 65 73 2c 20 37 28 33 29 2c 0a 20 20 20 20 31 38 35 33 2d 31 38 38 | ing.Sciences,.7(3),.....1853-188 |
5300 | 32 2e 0a 5b 38 5d 20 4d 2e 20 50 65 72 72 6f 74 2c 20 4e 2e 20 43 6f 75 72 74 79 2c 20 52 2e 20 | 2..[8].M..Perrot,.N..Courty,.R.. |
5320 | 46 6c 61 6d 61 72 79 2c 20 41 2e 20 48 61 62 72 61 72 64 2c 20 22 4d 61 70 70 69 6e 67 20 65 73 | Flamary,.A..Habrard,."Mapping.es |
5340 | 74 69 6d 61 74 69 6f 6e 20 66 6f 72 0a 20 20 20 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 | timation.for.....discrete.optima |
5360 | 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 22 2c 20 4e 65 75 72 61 6c 20 49 6e 66 6f 72 6d 61 74 69 6f 6e | l.transport",.Neural.Information |
5380 | 20 50 72 6f 63 65 73 73 69 6e 67 20 53 79 73 74 65 6d 73 20 28 4e 49 50 53 29 2c 0a 20 20 20 20 | .Processing.Systems.(NIPS),..... |
53a0 | 32 30 31 36 2e 0a 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d | 2016..."""..#.Authors:.Remi.Flam |
53c0 | 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 20 20 20 | ary.<remi.flamary@unice.fr>.#... |
53e0 | 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 | .......Stanislas.Chambon.<stan.c |
5400 | 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d | hambon@gmail.com>.#.#.License:.M |
5420 | 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0a 66 | IT.License..import.numpy.as.np.f |
5440 | 72 6f 6d 20 73 63 69 70 79 20 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 64 69 6d 61 67 65 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 | rom.scipy.import.ndimage.import. |
5460 | 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 | matplotlib.pylab.as.pl.import.ot |
5480 | 0a 0a 72 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 52 61 6e 64 6f 6d 53 74 61 74 65 28 34 32 29 0a | ..r.=.np.random.RandomState(42). |
54a0 | 0a 0a 64 65 66 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 29 3a 0a 20 20 20 20 22 22 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 | ..def.im2mat(I):....."""Converts |
54c0 | 20 61 6e 64 20 69 6d 61 67 65 20 74 6f 20 6d 61 74 72 69 78 20 28 6f 6e 65 20 70 69 78 65 6c 20 | .and.image.to.matrix.(one.pixel. |
54e0 | 70 65 72 20 6c 69 6e 65 29 22 22 22 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 49 2e 72 65 73 68 61 70 | per.line)""".....return.I.reshap |
5500 | 65 28 28 49 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 20 2a 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 20 49 2e 73 68 | e((I.shape[0].*.I.shape[1],.I.sh |
5520 | 61 70 65 5b 32 5d 29 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 6d 61 74 32 69 6d 28 58 2c 20 73 68 61 70 65 29 3a | ape[2]))...def.mat2im(X,.shape): |
5540 | 0a 20 20 20 20 22 22 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 62 61 63 6b 20 61 20 6d 61 74 72 69 78 20 74 | ....."""Converts.back.a.matrix.t |
5560 | 6f 20 61 6e 20 69 6d 61 67 65 22 22 22 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 58 2e 72 65 73 68 61 | o.an.image""".....return.X.resha |
5580 | 70 65 28 73 68 61 70 65 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 49 29 3a 0a 20 20 20 20 72 | pe(shape)...def.minmax(I):.....r |
55a0 | 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 63 6c 69 70 28 49 2c 20 30 2c 20 31 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 | eturn.np.clip(I,.0,.1)...####### |
55c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
55e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
5600 | 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 | #######.#.Generate.data.######## |
5620 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
5640 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
5660 | 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 20 4c 6f 61 64 69 6e 67 20 69 6d 61 67 65 73 0a 49 31 20 3d 20 6e 64 | ######..#.Loading.images.I1.=.nd |
5680 | 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 64 61 79 2e | image.imread('../data/ocean_day. |
56a0 | 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 0a 49 | jpg').astype(np.float64)./.256.I |
56c0 | 32 20 3d 20 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 | 2.=.ndimage.imread('../data/ocea |
56e0 | 6e 5f 73 75 6e 73 65 74 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 | n_sunset.jpg').astype(np.float64 |
5700 | 29 20 2f 20 32 35 36 0a 0a 0a 58 31 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 31 29 0a 58 32 20 3d 20 69 | )./.256...X1.=.im2mat(I1).X2.=.i |
5720 | 6d 32 6d 61 74 28 49 32 29 0a 0a 23 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 6e 62 | m2mat(I2)..#.training.samples.nb |
5740 | 20 3d 20 31 30 30 30 0a 69 64 78 31 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 31 2e 73 68 61 70 | .=.1000.idx1.=.r.randint(X1.shap |
5760 | 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 0a 69 64 78 32 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 | e[0],.size=(nb,)).idx2.=.r.randi |
5780 | 6e 74 28 58 32 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 0a 0a 58 73 20 | nt(X2.shape[0],.size=(nb,))..Xs. |
57a0 | 3d 20 58 31 5b 69 64 78 31 2c 20 3a 5d 0a 58 74 20 3d 20 58 32 5b 69 64 78 32 2c 20 3a 5d 0a 0a | =.X1[idx1,.:].Xt.=.X2[idx2,.:].. |
57c0 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
57e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
5800 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 44 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 | ###############.#.Domain.adaptat |
5820 | 69 6f 6e 20 66 6f 72 20 70 69 78 65 6c 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 20 74 72 61 6e 73 | ion.for.pixel.distribution.trans |
5840 | 66 65 72 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | fer.############################ |
5860 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
5880 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 20 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f | ##################..#.EMDTranspo |
58a0 | 72 74 0a 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 | rt.ot_emd.=.ot.da.EMDTransport() |
58c0 | 0a 6f 74 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 74 72 61 6e 73 70 | .ot_emd.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt).transp |
58e0 | 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 | _Xs_emd.=.ot_emd.transform(Xs=X1 |
5900 | 29 0a 49 6d 61 67 65 5f 65 6d 64 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e | ).Image_emd.=.minmax(mat2im(tran |
5920 | 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 | sp_Xs_emd,.I1.shape))..#.Sinkhor |
5940 | 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 | nTransport.ot_sinkhorn.=.ot.da.S |
5960 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 0a 6f 74 5f | inkhornTransport(reg_e=1e-1).ot_ |
5980 | 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 74 72 61 6e 73 | sinkhorn.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt).trans |
59a0 | 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d | p_Xs_sinkhorn.=.ot_emd.transform |
59c0 | 28 58 73 3d 58 31 29 0a 49 6d 61 67 65 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 | (Xs=X1).Image_sinkhorn.=.minmax( |
59e0 | 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 | mat2im(transp_Xs_sinkhorn,.I1.sh |
5a00 | 61 70 65 29 29 0a 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 | ape))..ot_mapping_linear.=.ot.da |
5a20 | 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 0a 20 20 20 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 65 | .MappingTransport(.....mu=1e0,.e |
5a40 | 74 61 3d 31 65 2d 38 2c 20 62 69 61 73 3d 54 72 75 65 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 32 30 2c | ta=1e-8,.bias=True,.max_iter=20, |
5a60 | 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 | .verbose=True).ot_mapping_linear |
5a80 | 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 58 31 74 6c 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 | .fit(Xs=Xs,.Xt=Xt)..X1tl.=.ot_ma |
5aa0 | 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 0a 49 6d | pping_linear.transform(Xs=X1).Im |
5ac0 | 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 | age_mapping_linear.=.minmax(mat2 |
5ae0 | 69 6d 28 58 31 74 6c 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f | im(X1tl,.I1.shape))..ot_mapping_ |
5b00 | 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 | gaussian.=.ot.da.MappingTranspor |
5b20 | 74 28 0a 20 20 20 20 6d 75 3d 31 65 30 2c 20 65 74 61 3d 31 65 2d 32 2c 20 73 69 67 6d 61 3d 31 | t(.....mu=1e0,.eta=1e-2,.sigma=1 |
5b40 | 2c 20 62 69 61 73 3d 46 61 6c 73 65 2c 20 6d 61 78 5f 69 74 65 72 3d 31 30 2c 20 76 65 72 62 6f | ,.bias=False,.max_iter=10,.verbo |
5b60 | 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 66 69 74 | se=True).ot_mapping_gaussian.fit |
5b80 | 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 58 31 74 6e 20 3d 20 6f 74 5f 6d 61 70 70 69 6e | (Xs=Xs,.Xt=Xt)..X1tn.=.ot_mappin |
5ba0 | 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 20 20 23 20 75 | g_gaussian.transform(Xs=X1)..#.u |
5bc0 | 73 65 20 74 68 65 20 65 73 74 69 6d 61 74 65 64 20 6d 61 70 70 69 6e 67 0a 49 6d 61 67 65 5f 6d | se.the.estimated.mapping.Image_m |
5be0 | 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 | apping_gaussian.=.minmax(mat2im( |
5c00 | 58 31 74 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | X1tn,.I1.shape))...############# |
5c20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
5c40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
5c60 | 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 6f 72 69 67 69 6e 61 6c 20 69 6d 61 67 65 73 0a 23 23 23 23 23 23 23 | #.#.Plot.original.images.####### |
5c80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
5ca0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
5cc0 | 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 | #######..pl.figure(1,.figsize=(6 |
5ce0 | 2e 34 2c 20 33 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 | .4,.3)).pl.subplot(1,.2,.1).pl.i |
5d00 | 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | mshow(I1).pl.axis('off').pl.titl |
5d20 | 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 | e('Image.1')..pl.subplot(1,.2,.2 |
5d40 | 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 | ).pl.imshow(I2).pl.axis('off').p |
5d60 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f | l.title('Image.2').pl.tight_layo |
5d80 | 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ut()...######################### |
5da0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
5dc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 70 69 78 | #####################.#.Plot.pix |
5de0 | 65 6c 20 76 61 6c 75 65 73 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | el.values.distribution.######### |
5e00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
5e20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
5e40 | 23 23 23 23 23 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 | #####..pl.figure(2,.figsize=(6.4 |
5e60 | 2c 20 35 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 | ,.5))..pl.subplot(1,.2,.1).pl.sc |
5e80 | 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 73 29 0a | atter(Xs[:,.0],.Xs[:,.2],.c=Xs). |
5ea0 | 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 | pl.axis([0,.1,.0,.1]).pl.xlabel( |
5ec0 | 27 52 65 64 27 29 0a 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | 'Red').pl.ylabel('Blue').pl.titl |
5ee0 | 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 | e('Image.1')..pl.subplot(1,.2,.2 |
5f00 | 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c | ).pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.2], |
5f20 | 20 63 3d 58 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e | .c=Xt).pl.axis([0,.1,.0,.1]).pl. |
5f40 | 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 0a 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a | xlabel('Red').pl.ylabel('Blue'). |
5f60 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 | pl.title('Image.2').pl.tight_lay |
5f80 | 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | out()...######################## |
5fa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
5fc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 74 72 | ######################.#.Plot.tr |
5fe0 | 61 6e 73 66 6f 72 6d 65 64 20 69 6d 61 67 65 73 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ansformed.images.############### |
6000 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6020 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a | ###############################. |
6040 | 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 35 29 29 0a 0a | .pl.figure(2,.figsize=(10,.5)).. |
6060 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 | pl.subplot(2,.3,.1).pl.imshow(I1 |
6080 | 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 2e 20 31 | ).pl.axis('off').pl.title('Im..1 |
60a0 | 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f | ')..pl.subplot(2,.3,.4).pl.imsho |
60c0 | 77 28 49 32 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 | w(I2).pl.axis('off').pl.title('I |
60e0 | 6d 2e 20 32 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 | m..2')..pl.subplot(2,.3,.2).pl.i |
6100 | 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 67 65 5f 65 6d 64 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a | mshow(Image_emd).pl.axis('off'). |
6120 | 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 6d 64 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 | pl.title('EmdTransport')..pl.sub |
6140 | 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 67 65 5f 73 69 | plot(2,.3,.5).pl.imshow(Image_si |
6160 | 6e 6b 68 6f 72 6e 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 | nkhorn).pl.axis('off').pl.title( |
6180 | 27 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 | 'SinkhornTransport')..pl.subplot |
61a0 | 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e | (2,.3,.3).pl.imshow(Image_mappin |
61c0 | 67 5f 6c 69 6e 65 61 72 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | g_linear).pl.axis('off').pl.titl |
61e0 | 65 28 27 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 28 6c 69 6e 65 61 72 29 27 29 0a 0a | e('MappingTransport.(linear)').. |
6200 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 6d | pl.subplot(2,.3,.6).pl.imshow(Im |
6220 | 61 67 65 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 67 61 75 73 73 69 61 6e 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f | age_mapping_gaussian).pl.axis('o |
6240 | 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 70 70 69 6e 67 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 | ff').pl.title('MappingTransport. |
6260 | 28 67 61 75 73 73 69 61 6e 29 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a | (gaussian)').pl.tight_layout().. |
6280 | 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 18 7f 21 4b 77 57 0d 45 09 0f 00 00 | pl.show().PK..........!KwW.E.... |
62a0 | 09 0f 00 00 19 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6f 6c 6f 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 70 | ........plot_otda_color_images.p |
62c0 | 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d | y#.-*-.coding:.utf-8.-*-.""".=== |
62e0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 4f 54 20 66 6f | ==========================.OT.fo |
6300 | 72 20 69 6d 61 67 65 20 63 6f 6c 6f 72 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | r.image.color.adaptation.======= |
6320 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 69 73 20 65 78 61 | ======================..This.exa |
6340 | 6d 70 6c 65 20 70 72 65 73 65 6e 74 73 20 61 20 77 61 79 20 6f 66 20 74 72 61 6e 73 66 65 72 72 | mple.presents.a.way.of.transferr |
6360 | 69 6e 67 20 63 6f 6c 6f 72 73 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 74 77 6f 20 69 6d 61 67 65 0a 77 69 74 | ing.colors.between.two.image.wit |
6380 | 68 20 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 73 20 69 6e 74 72 6f 64 75 63 65 | h.Optimal.Transport.as.introduce |
63a0 | 64 20 69 6e 20 5b 36 5d 0a 0a 5b 36 5d 20 46 65 72 72 61 64 61 6e 73 2c 20 53 2e 2c 20 50 61 70 | d.in.[6]..[6].Ferradans,.S.,.Pap |
63c0 | 61 64 61 6b 69 73 2c 20 4e 2e 2c 20 50 65 79 72 65 2c 20 47 2e 2c 20 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 | adakis,.N.,.Peyre,.G.,.&.Aujol,. |
63e0 | 4a 2e 20 46 2e 20 28 32 30 31 34 29 2e 0a 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 64 69 73 63 72 65 | J..F..(2014)..Regularized.discre |
6400 | 74 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 2e 0a 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e | te.optimal.transport..SIAM.Journ |
6420 | 61 6c 20 6f 6e 20 49 6d 61 67 69 6e 67 20 53 63 69 65 6e 63 65 73 2c 20 37 28 33 29 2c 20 31 38 | al.on.Imaging.Sciences,.7(3),.18 |
6440 | 35 33 2d 31 38 38 32 2e 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c | 53-1882.."""..#.Authors:.Remi.Fl |
6460 | 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 20 | amary.<remi.flamary@unice.fr>.#. |
6480 | 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e | .........Stanislas.Chambon.<stan |
64a0 | 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a | .chambon@gmail.com>.#.#.License: |
64c0 | 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 | .MIT.License..import.numpy.as.np |
64e0 | 0a 66 72 6f 6d 20 73 63 69 70 79 20 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 64 69 6d 61 67 65 0a 69 6d 70 6f 72 | .from.scipy.import.ndimage.impor |
6500 | 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 | t.matplotlib.pylab.as.pl.import. |
6520 | 6f 74 0a 0a 0a 72 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 52 61 6e 64 6f 6d 53 74 61 74 65 28 34 | ot...r.=.np.random.RandomState(4 |
6540 | 32 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 29 3a 0a 20 20 20 20 22 22 22 43 6f 6e 76 65 | 2)...def.im2mat(I):....."""Conve |
6560 | 72 74 73 20 61 6e 64 20 69 6d 61 67 65 20 74 6f 20 6d 61 74 72 69 78 20 28 6f 6e 65 20 70 69 78 | rts.and.image.to.matrix.(one.pix |
6580 | 65 6c 20 70 65 72 20 6c 69 6e 65 29 22 22 22 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 49 2e 72 65 73 | el.per.line)""".....return.I.res |
65a0 | 68 61 70 65 28 28 49 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 20 2a 20 49 2e 73 68 61 70 65 5b 31 5d 2c 20 49 | hape((I.shape[0].*.I.shape[1],.I |
65c0 | 2e 73 68 61 70 65 5b 32 5d 29 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 6d 61 74 32 69 6d 28 58 2c 20 73 68 61 70 | .shape[2]))...def.mat2im(X,.shap |
65e0 | 65 29 3a 0a 20 20 20 20 22 22 22 43 6f 6e 76 65 72 74 73 20 62 61 63 6b 20 61 20 6d 61 74 72 69 | e):....."""Converts.back.a.matri |
6600 | 78 20 74 6f 20 61 6e 20 69 6d 61 67 65 22 22 22 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 58 2e 72 65 | x.to.an.image""".....return.X.re |
6620 | 73 68 61 70 65 28 73 68 61 70 65 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 49 29 3a 0a 20 20 | shape(shape)...def.minmax(I):... |
6640 | 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 63 6c 69 70 28 49 2c 20 30 2c 20 31 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 | ..return.np.clip(I,.0,.1)...#### |
6660 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6680 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
66a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a 23 23 23 23 23 | ##########.#.Generate.data.##### |
66c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
66e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6700 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 20 4c 6f 61 64 69 6e 67 20 69 6d 61 67 65 73 0a 49 31 20 3d | #########..#.Loading.images.I1.= |
6720 | 20 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f 63 65 61 6e 5f 64 | .ndimage.imread('../data/ocean_d |
6740 | 61 79 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 | ay.jpg').astype(np.float64)./.25 |
6760 | 36 0a 49 32 20 3d 20 6e 64 69 6d 61 67 65 2e 69 6d 72 65 61 64 28 27 2e 2e 2f 64 61 74 61 2f 6f | 6.I2.=.ndimage.imread('../data/o |
6780 | 63 65 61 6e 5f 73 75 6e 73 65 74 2e 6a 70 67 27 29 2e 61 73 74 79 70 65 28 6e 70 2e 66 6c 6f 61 | cean_sunset.jpg').astype(np.floa |
67a0 | 74 36 34 29 20 2f 20 32 35 36 0a 0a 58 31 20 3d 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 31 29 0a 58 32 20 3d | t64)./.256..X1.=.im2mat(I1).X2.= |
67c0 | 20 69 6d 32 6d 61 74 28 49 32 29 0a 0a 23 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a | .im2mat(I2)..#.training.samples. |
67e0 | 6e 62 20 3d 20 31 30 30 30 0a 69 64 78 31 20 3d 20 72 2e 72 61 6e 64 69 6e 74 28 58 31 2e 73 68 | nb.=.1000.idx1.=.r.randint(X1.sh |
6800 | 61 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 0a 69 64 78 32 20 3d 20 72 2e 72 61 6e | ape[0],.size=(nb,)).idx2.=.r.ran |
6820 | 64 69 6e 74 28 58 32 2e 73 68 61 70 65 5b 30 5d 2c 20 73 69 7a 65 3d 28 6e 62 2c 29 29 0a 0a 58 | dint(X2.shape[0],.size=(nb,))..X |
6840 | 73 20 3d 20 58 31 5b 69 64 78 31 2c 20 3a 5d 0a 58 74 20 3d 20 58 32 5b 69 64 78 32 2c 20 3a 5d | s.=.X1[idx1,.:].Xt.=.X2[idx2,.:] |
6860 | 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ...############################# |
6880 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
68a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 6f 72 69 67 69 6e 61 | #################.#.Plot.origina |
68c0 | 6c 20 69 6d 61 67 65 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | l.image.######################## |
68e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6900 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 | ######################..pl.figur |
6920 | 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | e(1,.figsize=(6.4,.3))..pl.subpl |
6940 | 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 | ot(1,.2,.1).pl.imshow(I1).pl.axi |
6960 | 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 27 29 0a 0a 70 6c | s('off').pl.title('Image.1')..pl |
6980 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 29 0a | .subplot(1,.2,.2).pl.imshow(I2). |
69a0 | 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 | pl.axis('off').pl.title('Image.2 |
69c0 | 27 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ')...########################### |
69e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6a00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 63 61 74 74 65 72 20 70 6c | ###################.#.Scatter.pl |
6a20 | 6f 74 20 6f 66 20 63 6f 6c 6f 72 73 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ot.of.colors.################### |
6a40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6a60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 70 6c 2e | ###########################..pl. |
6a80 | 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 0a 0a 70 6c 2e | figure(2,.figsize=(6.4,.3))..pl. |
6aa0 | 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a | subplot(1,.2,.1).pl.scatter(Xs[: |
6ac0 | 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 73 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 5b 30 | ,.0],.Xs[:,.2],.c=Xs).pl.axis([0 |
6ae0 | 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 64 27 29 0a 70 6c 2e | ,.1,.0,.1]).pl.xlabel('Red').pl. |
6b00 | 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 | ylabel('Blue').pl.title('Image.1 |
6b20 | 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 | ')..pl.subplot(1,.2,.2).pl.scatt |
6b40 | 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 32 5d 2c 20 63 3d 58 74 29 0a 70 6c 2e | er(Xt[:,.0],.Xt[:,.2],.c=Xt).pl. |
6b60 | 61 78 69 73 28 5b 30 2c 20 31 2c 20 30 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 78 6c 61 62 65 6c 28 27 52 65 | axis([0,.1,.0,.1]).pl.xlabel('Re |
6b80 | 64 27 29 0a 70 6c 2e 79 6c 61 62 65 6c 28 27 42 6c 75 65 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | d').pl.ylabel('Blue').pl.title(' |
6ba0 | 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 | Image.2').pl.tight_layout()...## |
6bc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6be0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6c00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 74 68 65 20 64 | ############.#.Instantiate.the.d |
6c20 | 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 6d 73 20 61 6e | ifferent.transport.algorithms.an |
6c40 | 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | d.fit.them.##################### |
6c60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6c80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 20 45 4d 44 | #########################..#.EMD |
6ca0 | 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 4d 44 54 72 61 6e | Transport.ot_emd.=.ot.da.EMDTran |
6cc0 | 73 70 6f 72 74 28 29 0a 6f 74 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 | sport().ot_emd.fit(Xs=Xs,.Xt=Xt) |
6ce0 | 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 | ..#.SinkhornTransport.ot_sinkhor |
6d00 | 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f | n.=.ot.da.SinkhornTransport(reg_ |
6d20 | 65 3d 31 65 2d 31 29 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 58 | e=1e-1).ot_sinkhorn.fit(Xs=Xs,.X |
6d40 | 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 70 72 65 64 69 63 74 69 6f 6e 20 62 65 74 77 65 65 6e 20 69 6d 61 67 | t=Xt)..#.prediction.between.imag |
6d60 | 65 73 20 28 75 73 69 6e 67 20 6f 75 74 20 6f 66 20 73 61 6d 70 6c 65 20 70 72 65 64 69 63 74 69 | es.(using.out.of.sample.predicti |
6d80 | 6f 6e 20 61 73 20 69 6e 20 5b 36 5d 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 | on.as.in.[6]).transp_Xs_emd.=.ot |
6da0 | 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f | _emd.transform(Xs=X1).transp_Xt_ |
6dc0 | 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 69 6e 76 65 72 73 65 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 | emd.=.ot_emd.inverse_transform(X |
6de0 | 74 3d 58 32 29 0a 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 65 | t=X2)..transp_Xs_sinkhorn.=.ot_e |
6e00 | 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 31 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 73 69 | md.transform(Xs=X1).transp_Xt_si |
6e20 | 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 69 6e 76 65 72 73 65 5f 74 72 61 6e 73 66 6f 72 | nkhorn.=.ot_emd.inverse_transfor |
6e40 | 6d 28 58 74 3d 58 32 29 0a 0a 49 31 74 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 | m(Xt=X2)..I1t.=.minmax(mat2im(tr |
6e60 | 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 49 32 74 20 3d 20 6d 69 | ansp_Xs_emd,.I1.shape)).I2t.=.mi |
6e80 | 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 65 6d 64 2c 20 49 32 2e 73 68 | nmax(mat2im(transp_Xt_emd,.I2.sh |
6ea0 | 61 70 65 29 29 0a 0a 49 31 74 65 20 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e | ape))..I1te.=.minmax(mat2im(tran |
6ec0 | 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 49 31 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 49 32 74 65 20 | sp_Xs_sinkhorn,.I1.shape)).I2te. |
6ee0 | 3d 20 6d 69 6e 6d 61 78 28 6d 61 74 32 69 6d 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f | =.minmax(mat2im(transp_Xt_sinkho |
6f00 | 72 6e 2c 20 49 32 2e 73 68 61 70 65 29 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | rn,.I2.shape))...############### |
6f20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6f40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a | ###############################. |
6f60 | 23 20 50 6c 6f 74 20 6e 65 77 20 69 6d 61 67 65 73 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | #.Plot.new.images.############## |
6f80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6fa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
6fc0 | 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 38 2c 20 34 29 29 0a 0a | ..pl.figure(3,.figsize=(8,.4)).. |
6fe0 | 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 | pl.subplot(2,.3,.1).pl.imshow(I1 |
7000 | 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 | ).pl.axis('off').pl.title('Image |
7020 | 20 31 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 | .1')..pl.subplot(2,.3,.2).pl.ims |
7040 | 68 6f 77 28 49 31 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | how(I1t).pl.axis('off').pl.title |
7060 | 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c | ('Image.1.Adapt')..pl.subplot(2, |
7080 | 20 33 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 31 74 65 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 | .3,.3).pl.imshow(I1te).pl.axis(' |
70a0 | 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 31 20 41 64 61 70 74 20 28 72 | off').pl.title('Image.1.Adapt.(r |
70c0 | 65 67 29 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 0a 70 6c 2e 69 6d | eg)')..pl.subplot(2,.3,.4).pl.im |
70e0 | 73 68 6f 77 28 49 32 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 | show(I2).pl.axis('off').pl.title |
7100 | 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 | ('Image.2')..pl.subplot(2,.3,.5) |
7120 | 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 29 0a 70 6c 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 | .pl.imshow(I2t).pl.axis('off').p |
7140 | 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 64 61 70 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 | l.title('Image.2.Adapt')..pl.sub |
7160 | 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 49 32 74 65 29 0a 70 6c | plot(2,.3,.6).pl.imshow(I2te).pl |
7180 | 2e 61 78 69 73 28 27 6f 66 66 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 49 6d 61 67 65 20 32 20 41 | .axis('off').pl.title('Image.2.A |
71a0 | 64 61 70 74 20 28 72 65 67 29 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a | dapt.(reg)').pl.tight_layout().. |
71c0 | 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 18 7f 21 4b 77 9c 7b b1 13 0d 00 00 | pl.show().PK..........!Kw.{..... |
71e0 | 13 0d 00 00 0b 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 57 44 41 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e 67 3a | ........plot_WDA.py#.-*-.coding: |
7200 | 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | .utf-8.-*-.""".================= |
7220 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 44 69 73 | ================.Wasserstein.Dis |
7240 | 63 72 69 6d 69 6e 61 6e 74 20 41 6e 61 6c 79 73 69 73 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | criminant.Analysis.============= |
7260 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 | ====================..This.examp |
7280 | 6c 65 20 69 6c 6c 75 73 74 72 61 74 65 20 74 68 65 20 75 73 65 20 6f 66 20 57 44 41 20 61 73 20 | le.illustrate.the.use.of.WDA.as. |
72a0 | 70 72 6f 70 6f 73 65 64 20 69 6e 20 5b 31 31 5d 2e 0a 0a 0a 5b 31 31 5d 20 46 6c 61 6d 61 72 79 | proposed.in.[11]....[11].Flamary |
72c0 | 2c 20 52 2e 2c 20 43 75 74 75 72 69 2c 20 4d 2e 2c 20 43 6f 75 72 74 79 2c 20 4e 2e 2c 20 26 20 | ,.R.,.Cuturi,.M.,.Courty,.N.,.&. |
72e0 | 52 61 6b 6f 74 6f 6d 61 6d 6f 6e 6a 79 2c 20 41 2e 20 28 32 30 31 36 29 2e 20 0a 57 61 73 73 65 | Rakotomamonjy,.A..(2016)...Wasse |
7300 | 72 73 74 65 69 6e 20 44 69 73 63 72 69 6d 69 6e 61 6e 74 20 41 6e 61 6c 79 73 69 73 2e 0a 0a 22 | rstein.Discriminant.Analysis..." |
7320 | 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 | ""..#.Author:.Remi.Flamary.<remi |
7340 | 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 | .flamary@unice.fr>.#.#.License:. |
7360 | 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0a | MIT.License..import.numpy.as.np. |
7380 | 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 0a 66 | import.matplotlib.pylab.as.pl..f |
73a0 | 72 6f 6d 20 6f 74 2e 64 72 20 69 6d 70 6f 72 74 20 77 64 61 2c 20 66 64 61 0a 0a 0a 23 23 23 23 | rom.ot.dr.import.wda,.fda...#### |
73c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
73e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7400 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a 23 23 23 23 23 | ##########.#.Generate.data.##### |
7420 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7440 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7460 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 0a 0a 6e 20 3d 20 31 | #########..#%%.parameters..n.=.1 |
7480 | 30 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 69 6e 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e 64 20 | 000..#.nb.samples.in.source.and. |
74a0 | 74 61 72 67 65 74 20 64 61 74 61 73 65 74 73 0a 6e 7a 20 3d 20 30 2e 32 0a 0a 23 20 67 65 6e 65 | target.datasets.nz.=.0.2..#.gene |
74c0 | 72 61 74 65 20 63 69 72 63 6c 65 20 64 61 74 61 73 65 74 0a 74 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f | rate.circle.dataset.t.=.np.rando |
74e0 | 6d 2e 72 61 6e 64 28 6e 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 0a 79 73 20 3d 20 6e 70 2e 66 6c | m.rand(n).*.2.*.np.pi.ys.=.np.fl |
7500 | 6f 6f 72 28 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2a 20 31 2e 30 20 2f 20 6e 20 2a 20 33 29 | oor((np.arange(n).*.1.0./.n.*.3) |
7520 | 29 20 2b 20 31 0a 78 73 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 6e 63 61 74 65 6e 61 74 65 28 0a 20 20 20 20 28 | ).+.1.xs.=.np.concatenate(.....( |
7540 | 6e 70 2e 63 6f 73 28 74 29 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 2c 20 6e 70 2e 73 | np.cos(t).reshape((-1,.1)),.np.s |
7560 | 69 6e 28 74 29 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 29 2c 20 31 29 0a 78 73 20 3d | in(t).reshape((-1,.1))),.1).xs.= |
7580 | 20 78 73 20 2a 20 79 73 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 2d 31 2c 20 31 29 20 2b 20 6e 7a 20 2a 20 6e | .xs.*.ys.reshape(-1,.1).+.nz.*.n |
75a0 | 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c 20 32 29 0a 0a 74 20 3d 20 6e 70 2e 72 61 6e | p.random.randn(n,.2)..t.=.np.ran |
75c0 | 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 28 6e 29 20 2a 20 32 20 2a 20 6e 70 2e 70 69 0a 79 74 20 3d 20 6e 70 2e | dom.rand(n).*.2.*.np.pi.yt.=.np. |
75e0 | 66 6c 6f 6f 72 28 28 6e 70 2e 61 72 61 6e 67 65 28 6e 29 20 2a 20 31 2e 30 20 2f 20 6e 20 2a 20 | floor((np.arange(n).*.1.0./.n.*. |
7600 | 33 29 29 20 2b 20 31 0a 78 74 20 3d 20 6e 70 2e 63 6f 6e 63 61 74 65 6e 61 74 65 28 0a 20 20 20 | 3)).+.1.xt.=.np.concatenate(.... |
7620 | 20 28 6e 70 2e 63 6f 73 28 74 29 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 2c 20 6e 70 | .(np.cos(t).reshape((-1,.1)),.np |
7640 | 2e 73 69 6e 28 74 29 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 2d 31 2c 20 31 29 29 29 2c 20 31 29 0a 78 74 | .sin(t).reshape((-1,.1))),.1).xt |
7660 | 20 3d 20 78 74 20 2a 20 79 74 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 2d 31 2c 20 31 29 20 2b 20 6e 7a 20 2a | .=.xt.*.yt.reshape(-1,.1).+.nz.* |
7680 | 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c 20 32 29 0a 0a 6e 62 6e 6f 69 73 65 20 | .np.random.randn(n,.2)..nbnoise. |
76a0 | 3d 20 38 0a 0a 78 73 20 3d 20 6e 70 2e 68 73 74 61 63 6b 28 28 78 73 2c 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 | =.8..xs.=.np.hstack((xs,.np.rand |
76c0 | 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c 20 6e 62 6e 6f 69 73 65 29 29 29 0a 78 74 20 3d 20 6e 70 2e 68 | om.randn(n,.nbnoise))).xt.=.np.h |
76e0 | 73 74 61 63 6b 28 28 78 74 2c 20 6e 70 2e 72 61 6e 64 6f 6d 2e 72 61 6e 64 6e 28 6e 2c 20 6e 62 | stack((xt,.np.random.randn(n,.nb |
7700 | 6e 6f 69 73 65 29 29 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | noise)))..###################### |
7720 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7740 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 | ########################.#.Plot. |
7760 | 64 61 74 61 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | data.########################### |
7780 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
77a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 | ###################..#%%.plot.sa |
77c0 | 6d 70 6c 65 73 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c | mples.pl.figure(1,.figsize=(6.4, |
77e0 | 20 33 2e 35 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 | .3.5))..pl.subplot(1,.2,.1).pl.s |
7800 | 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c | catter(xt[:,.0],.xt[:,.1],.c=ys, |
7820 | 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c | .marker='+',.label='Source.sampl |
7840 | 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 | es').pl.legend(loc=0).pl.title(' |
7860 | 44 69 73 63 72 69 6d 69 6e 61 6e 74 20 64 69 6d 65 6e 73 69 6f 6e 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 | Discriminant.dimensions')..pl.su |
7880 | 62 70 6c 6f 74 28 31 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 5b 3a 2c 20 | bplot(1,.2,.2).pl.scatter(xt[:,. |
78a0 | 32 5d 2c 20 78 74 5b 3a 2c 20 33 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 | 2],.xt[:,.3],.c=ys,.marker='+',. |
78c0 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e | label='Source.samples').pl.legen |
78e0 | 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 74 68 65 72 20 64 69 6d 65 6e 73 69 | d(loc=0).pl.title('Other.dimensi |
7900 | 6f 6e 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 | ons').pl.tight_layout()..####### |
7920 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7940 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7960 | 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 46 69 73 68 65 72 20 44 69 73 63 72 69 6d | #######.#.Compute.Fisher.Discrim |
7980 | 69 6e 61 6e 74 20 41 6e 61 6c 79 73 69 73 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | inant.Analysis.################# |
79a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
79c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 | #############################..# |
79e0 | 25 25 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 46 44 41 0a 70 20 3d 20 32 0a 0a 50 66 64 61 2c 20 70 72 6f 6a | %%.Compute.FDA.p.=.2..Pfda,.proj |
7a00 | 66 64 61 20 3d 20 66 64 61 28 78 73 2c 20 79 73 2c 20 70 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | fda.=.fda(xs,.ys,.p)..########## |
7a20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7a40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7a60 | 23 23 23 23 0a 23 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 57 61 73 73 65 72 73 74 65 69 6e 20 44 69 73 63 72 | ####.#.Compute.Wasserstein.Discr |
7a80 | 69 6d 69 6e 61 6e 74 20 41 6e 61 6c 79 73 69 73 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | iminant.Analysis.############### |
7aa0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7ac0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a | ###############################. |
7ae0 | 0a 23 25 25 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 57 44 41 0a 70 20 3d 20 32 0a 72 65 67 20 3d 20 31 65 30 | .#%%.Compute.WDA.p.=.2.reg.=.1e0 |
7b00 | 0a 6b 20 3d 20 31 30 0a 6d 61 78 69 74 65 72 20 3d 20 31 30 30 0a 0a 50 77 64 61 2c 20 70 72 6f | .k.=.10.maxiter.=.100..Pwda,.pro |
7b20 | 6a 77 64 61 20 3d 20 77 64 61 28 78 73 2c 20 79 73 2c 20 70 2c 20 72 65 67 2c 20 6b 2c 20 6d 61 | jwda.=.wda(xs,.ys,.p,.reg,.k,.ma |
7b40 | 78 69 74 65 72 3d 6d 61 78 69 74 65 72 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | xiter=maxiter)...############### |
7b60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7b80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a | ###############################. |
7ba0 | 23 20 50 6c 6f 74 20 32 44 20 70 72 6f 6a 65 63 74 69 6f 6e 73 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | #.Plot.2D.projections.########## |
7bc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7be0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
7c00 | 23 23 23 23 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 0a 78 73 70 20 3d 20 70 72 | ####..#%%.plot.samples..xsp.=.pr |
7c20 | 6f 6a 66 64 61 28 78 73 29 0a 78 74 70 20 3d 20 70 72 6f 6a 66 64 61 28 78 74 29 0a 0a 78 73 70 | ojfda(xs).xtp.=.projfda(xt)..xsp |
7c40 | 77 20 3d 20 70 72 6f 6a 77 64 61 28 78 73 29 0a 78 74 70 77 20 3d 20 70 72 6f 6a 77 64 61 28 78 | w.=.projwda(xs).xtpw.=.projwda(x |
7c60 | 74 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 | t)..pl.figure(2)..pl.subplot(2,. |
7c80 | 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 70 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 70 5b | 2,.1).pl.scatter(xsp[:,.0],.xsp[ |
7ca0 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 | :,.1],.c=ys,.marker='+',.label=' |
7cc0 | 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f | Projected.samples').pl.legend(lo |
7ce0 | 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 74 72 61 69 6e 69 6e | c=0).pl.title('Projected.trainin |
7d00 | 67 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 46 44 41 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 | g.samples.FDA')..pl.subplot(2,.2 |
7d20 | 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 70 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 70 5b 3a | ,.2).pl.scatter(xtp[:,.0],.xtp[: |
7d40 | 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 50 | ,.1],.c=ys,.marker='+',.label='P |
7d60 | 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 | rojected.samples').pl.legend(loc |
7d80 | 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 74 65 73 74 20 73 61 6d | =0).pl.title('Projected.test.sam |
7da0 | 70 6c 65 73 20 46 44 41 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 0a | ples.FDA')..pl.subplot(2,.2,.3). |
7dc0 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 73 70 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 73 70 77 5b 3a 2c 20 31 | pl.scatter(xspw[:,.0],.xspw[:,.1 |
7de0 | 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 50 72 6f 6a | ],.c=ys,.marker='+',.label='Proj |
7e00 | 65 63 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 | ected.samples').pl.legend(loc=0) |
7e20 | 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 74 72 61 69 6e 69 6e 67 20 73 61 | .pl.title('Projected.training.sa |
7e40 | 6d 70 6c 65 73 20 57 44 41 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 34 29 | mples.WDA')..pl.subplot(2,.2,.4) |
7e60 | 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 78 74 70 77 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 78 74 70 77 5b 3a 2c 20 | .pl.scatter(xtpw[:,.0],.xtpw[:,. |
7e80 | 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 50 72 6f | 1],.c=ys,.marker='+',.label='Pro |
7ea0 | 6a 65 63 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 | jected.samples').pl.legend(loc=0 |
7ec0 | 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 50 72 6f 6a 65 63 74 65 64 20 74 65 73 74 20 73 61 6d 70 6c | ).pl.title('Projected.test.sampl |
7ee0 | 65 73 20 57 44 41 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 70 6c 2e 73 | es.WDA').pl.tight_layout()..pl.s |
7f00 | 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 18 7f 21 4b 65 61 f4 63 52 0c 00 00 52 0c 00 00 | how().PK..........!Kea.cR...R... |
7f20 | 13 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 70 74 69 6d 5f 4f 54 72 65 67 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 | ....plot_optim_OTreg.py#.-*-.cod |
7f40 | 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ing:.utf-8.-*-.""".============= |
7f60 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 | =====================.Regularize |
7f80 | 64 20 4f 54 20 77 69 74 68 20 67 65 6e 65 72 69 63 20 73 6f 6c 76 65 72 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | d.OT.with.generic.solver.======= |
7fa0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 49 6c 6c | ===========================..Ill |
7fc0 | 75 73 74 72 61 74 65 73 20 74 68 65 20 75 73 65 20 6f 66 20 74 68 65 20 67 65 6e 65 72 69 63 20 | ustrates.the.use.of.the.generic. |
7fe0 | 73 6f 6c 76 65 72 20 66 6f 72 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 4f 54 20 77 69 74 68 0a 75 | solver.for.regularized.OT.with.u |
8000 | 73 65 72 2d 64 65 73 69 67 6e 65 64 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 74 65 72 6d | ser-designed.regularization.term |
8020 | 2e 20 49 74 20 75 73 65 73 20 43 6f 6e 64 69 74 69 6f 6e 61 6c 20 67 72 61 64 69 65 6e 74 20 61 | ..It.uses.Conditional.gradient.a |
8040 | 73 20 69 6e 20 5b 36 5d 20 61 6e 64 20 0a 67 65 6e 65 72 61 6c 69 7a 65 64 20 43 6f 6e 64 69 74 | s.in.[6].and..generalized.Condit |
8060 | 69 6f 6e 61 6c 20 47 72 61 64 69 65 6e 74 20 61 73 20 70 72 6f 70 6f 73 65 64 20 69 6e 20 5b 35 | ional.Gradient.as.proposed.in.[5 |
8080 | 5d 5b 37 5d 2e 0a 0a 0a 5b 35 5d 20 4e 2e 20 43 6f 75 72 74 79 3b 20 52 2e 20 46 6c 61 6d 61 72 | ][7]....[5].N..Courty;.R..Flamar |
80a0 | 79 3b 20 44 2e 20 54 75 69 61 3b 20 41 2e 20 52 61 6b 6f 74 6f 6d 61 6d 6f 6e 6a 79 2c 20 4f 70 | y;.D..Tuia;.A..Rakotomamonjy,.Op |
80c0 | 74 69 6d 61 6c 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 66 6f 72 20 0a 44 6f 6d 61 69 6e 20 41 64 61 70 | timal.Transport.for..Domain.Adap |
80e0 | 74 61 74 69 6f 6e 2c 20 69 6e 20 49 45 45 45 20 54 72 61 6e 73 61 63 74 69 6f 6e 73 20 6f 6e 20 | tation,.in.IEEE.Transactions.on. |
8100 | 50 61 74 74 65 72 6e 20 41 6e 61 6c 79 73 69 73 20 61 6e 64 20 4d 61 63 68 69 6e 65 20 0a 49 6e | Pattern.Analysis.and.Machine..In |
8120 | 74 65 6c 6c 69 67 65 6e 63 65 20 2c 20 76 6f 6c 2e 50 50 2c 20 6e 6f 2e 39 39 2c 20 70 70 2e 31 | telligence.,.vol.PP,.no.99,.pp.1 |
8140 | 2d 31 2e 0a 0a 5b 36 5d 20 46 65 72 72 61 64 61 6e 73 2c 20 53 2e 2c 20 50 61 70 61 64 61 6b 69 | -1...[6].Ferradans,.S.,.Papadaki |
8160 | 73 2c 20 4e 2e 2c 20 50 65 79 72 c3 a9 2c 20 47 2e 2c 20 26 20 41 75 6a 6f 6c 2c 20 4a 2e 20 46 | s,.N.,.Peyr..,.G.,.&.Aujol,.J..F |
8180 | 2e 20 28 32 30 31 34 29 2e 20 0a 52 65 67 75 6c 61 72 69 7a 65 64 20 64 69 73 63 72 65 74 65 20 | ..(2014)...Regularized.discrete. |
81a0 | 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 2e 20 53 49 41 4d 20 4a 6f 75 72 6e 61 6c 20 | optimal.transport..SIAM.Journal. |
81c0 | 6f 6e 20 49 6d 61 67 69 6e 67 20 53 63 69 65 6e 63 65 73 2c 20 0a 37 28 33 29 2c 20 31 38 35 33 | on.Imaging.Sciences,..7(3),.1853 |
81e0 | 2d 31 38 38 32 2e 0a 0a 5b 37 5d 20 52 61 6b 6f 74 6f 6d 61 6d 6f 6e 6a 79 2c 20 41 2e 2c 20 46 | -1882...[7].Rakotomamonjy,.A.,.F |
8200 | 6c 61 6d 61 72 79 2c 20 52 2e 2c 20 26 20 43 6f 75 72 74 79 2c 20 4e 2e 20 28 32 30 31 35 29 2e | lamary,.R.,.&.Courty,.N..(2015). |
8220 | 20 47 65 6e 65 72 61 6c 69 7a 65 64 20 0a 63 6f 6e 64 69 74 69 6f 6e 61 6c 20 67 72 61 64 69 65 | .Generalized..conditional.gradie |
8240 | 6e 74 3a 20 61 6e 61 6c 79 73 69 73 20 6f 66 20 63 6f 6e 76 65 72 67 65 6e 63 65 20 61 6e 64 20 | nt:.analysis.of.convergence.and. |
8260 | 61 70 70 6c 69 63 61 74 69 6f 6e 73 2e 20 0a 61 72 58 69 76 20 70 72 65 70 72 69 6e 74 20 61 72 | applications...arXiv.preprint.ar |
8280 | 58 69 76 3a 31 35 31 30 2e 30 36 35 36 37 2e 0a 0a 0a 0a 22 22 22 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e | Xiv:1510.06567....."""..import.n |
82a0 | 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c | umpy.as.np.import.matplotlib.pyl |
82c0 | 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ab.as.pl.import.ot...########### |
82e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
8300 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
8320 | 23 23 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ###.#.Generate.data.############ |
8340 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
8360 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
8380 | 23 23 0a 0a 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 0a 0a 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e | ##..#%%.parameters..n.=.100..#.n |
83a0 | 62 20 62 69 6e 73 0a 0a 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 0a 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 | b.bins..#.bin.positions.x.=.np.a |
83c0 | 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 0a 0a 23 20 47 61 | range(n,.dtype=np.float64)..#.Ga |
83e0 | 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 61 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 | ussian.distributions.a.=.ot.data |
8400 | 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 | sets.get_1D_gauss(n,.m=20,.s=5). |
8420 | 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 0a 62 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 | .#.m=.mean,.s=.std.b.=.ot.datase |
8440 | 74 73 2e 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 36 30 2c 20 73 3d 31 30 29 0a 0a | ts.get_1D_gauss(n,.m=60,.s=10).. |
8460 | 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 | #.loss.matrix.M.=.ot.dist(x.resh |
8480 | 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 29 0a | ape((n,.1)),.x.reshape((n,.1))). |
84a0 | 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | M./=.M.max()..################## |
84c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
84e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 | ############################.#.S |
8500 | 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | olve.EMD.####################### |
8520 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
8540 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 25 25 20 45 4d 44 | #######################..#%%.EMD |
8560 | 0a 0a 47 30 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 | ..G0.=.ot.emd(a,.b,.M)..pl.figur |
8580 | 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f | e(3,.figsize=(5,.5)).ot.plot.plo |
85a0 | 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 30 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 30 27 | t1D_mat(a,.b,.G0,.'OT.matrix.G0' |
85c0 | 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | )..############################# |
85e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
8600 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 20 77 69 | #################.#.Solve.EMD.wi |
8620 | 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e | th.Frobenius.norm.regularization |
8640 | 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .############################### |
8660 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
8680 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 | ###############..#%%.Example.wit |
86a0 | 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a | h.Frobenius.norm.regularization. |
86c0 | 0a 0a 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 30 2e 35 20 2a 20 6e 70 2e | ..def.f(G):.....return.0.5.*.np. |
86e0 | 73 75 6d 28 47 2a 2a 32 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 | sum(G**2)...def.df(G):.....retur |
8700 | 6e 20 47 0a 0a 0a 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 31 0a 0a 47 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d | n.G...reg.=.1e-1..Gl2.=.ot.optim |
8720 | 2e 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 | .cg(a,.b,.M,.reg,.f,.df,.verbose |
8740 | 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f | =True)..pl.figure(3).ot.plot.plo |
8760 | 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 6c 32 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 46 72 | t1D_mat(a,.b,.Gl2,.'OT.matrix.Fr |
8780 | 6f 62 2e 20 72 65 67 27 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ob..reg')..##################### |
87a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
87c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 | #########################.#.Solv |
87e0 | 65 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 | e.EMD.with.entropic.regularizati |
8800 | 6f 6e 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | on.############################# |
8820 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
8840 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 | #################..#%%.Example.w |
8860 | 69 74 68 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 0a 0a 64 65 | ith.entropic.regularization...de |
8880 | 66 20 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 20 2a 20 6e 70 | f.f(G):.....return.np.sum(G.*.np |
88a0 | 2e 6c 6f 67 28 47 29 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e | .log(G))...def.df(G):.....return |
88c0 | 20 6e 70 2e 6c 6f 67 28 47 29 20 2b 20 31 2e 0a 0a 0a 72 65 67 20 3d 20 31 65 2d 33 0a 0a 47 65 | .np.log(G).+.1....reg.=.1e-3..Ge |
88e0 | 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 2c 20 66 2c 20 | .=.ot.optim.cg(a,.b,.M,.reg,.f,. |
8900 | 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 | df,.verbose=True)..pl.figure(4,. |
8920 | 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d | figsize=(5,.5)).ot.plot.plot1D_m |
8940 | 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 65 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 45 6e 74 72 6f 70 2e 20 | at(a,.b,.Ge,.'OT.matrix.Entrop.. |
8960 | 72 65 67 27 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | reg')..######################### |
8980 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
89a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 45 4d | #####################.#.Solve.EM |
89c0 | 44 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 2b 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 | D.with.Frobenius.norm.+.entropic |
89e0 | 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .regularization.################ |
8a00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
8a20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a | ##############################.. |
8a40 | 23 25 25 20 45 78 61 6d 70 6c 65 20 77 69 74 68 20 46 72 6f 62 65 6e 69 75 73 20 6e 6f 72 6d 20 | #%%.Example.with.Frobenius.norm. |
8a60 | 2b 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 6f 6e 20 77 69 74 68 20 67 | +.entropic.regularization.with.g |
8a80 | 63 67 0a 0a 0a 64 65 66 20 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 74 75 72 6e 20 30 2e 35 20 2a 20 | cg...def.f(G):.....return.0.5.*. |
8aa0 | 6e 70 2e 73 75 6d 28 47 2a 2a 32 29 0a 0a 0a 64 65 66 20 64 66 28 47 29 3a 0a 20 20 20 20 72 65 | np.sum(G**2)...def.df(G):.....re |
8ac0 | 74 75 72 6e 20 47 0a 0a 0a 72 65 67 31 20 3d 20 31 65 2d 33 0a 72 65 67 32 20 3d 20 31 65 2d 31 | turn.G...reg1.=.1e-3.reg2.=.1e-1 |
8ae0 | 0a 0a 47 65 6c 32 20 3d 20 6f 74 2e 6f 70 74 69 6d 2e 67 63 67 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 72 | ..Gel2.=.ot.optim.gcg(a,.b,.M,.r |
8b00 | 65 67 31 2c 20 72 65 67 32 2c 20 66 2c 20 64 66 2c 20 76 65 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a | eg1,.reg2,.f,.df,.verbose=True). |
8b20 | 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 35 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 | .pl.figure(5,.figsize=(5,.5)).ot |
8b40 | 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 65 6c 32 2c 20 27 4f 54 | .plot.plot1D_mat(a,.b,.Gel2,.'OT |
8b60 | 20 65 6e 74 72 6f 70 69 63 20 2b 20 6d 61 74 72 69 78 20 46 72 6f 62 2e 20 72 65 67 27 29 0a 70 | .entropic.+.matrix.Frob..reg').p |
8b80 | 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 18 7f 21 4b 9e d7 1b f5 32 0a 00 00 32 | l.show().PK..........!K....2...2 |
8ba0 | 0a 00 00 13 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6d 70 75 74 65 5f 65 6d 64 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 | .......plot_compute_emd.py#.-*-. |
8bc0 | 63 6f 64 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | coding:.utf-8.-*-.""".========== |
8be0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 50 6c 6f 74 20 6d 75 6c 74 69 70 6c 65 20 45 4d 44 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d | =======.Plot.multiple.EMD.====== |
8c00 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 53 68 6f 77 73 20 68 6f 77 20 74 6f 20 63 6f 6d 70 75 74 | ===========..Shows.how.to.comput |
8c20 | 65 20 6d 75 6c 74 69 70 6c 65 20 45 4d 44 20 61 6e 64 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 77 69 74 68 | e.multiple.EMD.and.Sinkhorn.with |
8c40 | 20 74 77 6f 20 64 69 66 66 65 72 6e 74 20 0a 67 72 6f 75 6e 64 20 6d 65 74 72 69 63 73 20 61 6e | .two.differnt..ground.metrics.an |
8c60 | 64 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 69 72 20 76 61 6c 75 65 73 20 66 6f 72 20 64 69 66 66 65 65 6e 74 | d.plot.their.values.for.diffeent |
8c80 | 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 2e 0a 0a 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a | .distributions...."""..#.Author: |
8ca0 | 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 | .Remi.Flamary.<remi.flamary@unic |
8cc0 | 65 2e 66 72 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 0a 0a | e.fr>.#.#.License:.MIT.License.. |
8ce0 | 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f | import.numpy.as.np.import.matplo |
8d00 | 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6f 74 0a 66 72 6f 6d 20 | tlib.pylab.as.pl.import.ot.from. |
8d20 | 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 20 69 6d 70 6f 72 74 20 67 65 74 5f 31 44 5f 67 61 75 73 73 20 | ot.datasets.import.get_1D_gauss. |
8d40 | 61 73 20 67 61 75 73 73 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | as.gauss...##################### |
8d60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
8d80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 47 65 6e 65 | #########################.#.Gene |
8da0 | 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | rate.data.###################### |
8dc0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
8de0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 25 25 20 70 61 | ########################..#%%.pa |
8e00 | 72 61 6d 65 74 65 72 73 0a 0a 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e 62 20 62 69 6e 73 0a 6e 5f 74 | rameters..n.=.100..#.nb.bins.n_t |
8e20 | 61 72 67 65 74 20 3d 20 35 30 20 20 23 20 6e 62 20 74 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 | arget.=.50..#.nb.target.distribu |
8e40 | 74 69 6f 6e 73 0a 0a 0a 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 0a 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 | tions...#.bin.positions.x.=.np.a |
8e60 | 72 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 0a 0a 6c 73 74 5f | range(n,.dtype=np.float64)..lst_ |
8e80 | 6d 20 3d 20 6e 70 2e 6c 69 6e 73 70 61 63 65 28 32 30 2c 20 39 30 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 74 | m.=.np.linspace(20,.90,.n_target |
8ea0 | 29 0a 0a 23 20 47 61 75 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 61 20 3d 20 | )..#.Gaussian.distributions.a.=. |
8ec0 | 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 | gauss(n,.m=20,.s=5)..#.m=.mean,. |
8ee0 | 73 3d 20 73 74 64 0a 0a 42 20 3d 20 6e 70 2e 7a 65 72 6f 73 28 28 6e 2c 20 6e 5f 74 61 72 67 65 | s=.std..B.=.np.zeros((n,.n_targe |
8f00 | 74 29 29 0a 0a 66 6f 72 20 69 2c 20 6d 20 69 6e 20 65 6e 75 6d 65 72 61 74 65 28 6c 73 74 5f 6d | t))..for.i,.m.in.enumerate(lst_m |
8f20 | 29 3a 0a 20 20 20 20 42 5b 3a 2c 20 69 5d 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 6d 2c 20 73 | ):.....B[:,.i].=.gauss(n,.m=m,.s |
8f40 | 3d 35 29 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 20 61 6e 64 20 6e 6f 72 6d 61 6c 69 7a 61 | =5)..#.loss.matrix.and.normaliza |
8f60 | 74 69 6f 6e 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 | tion.M.=.ot.dist(x.reshape((n,.1 |
8f80 | 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 27 65 75 63 6c 69 64 65 61 | )),.x.reshape((n,.1)),.'euclidea |
8fa0 | 6e 27 29 0a 4d 20 2f 3d 20 4d 2e 6d 61 78 28 29 0a 4d 32 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e | n').M./=.M.max().M2.=.ot.dist(x. |
8fc0 | 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 | reshape((n,.1)),.x.reshape((n,.1 |
8fe0 | 29 29 2c 20 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 0a 4d 32 20 2f 3d 20 4d 32 2e 6d 61 78 28 | )),.'sqeuclidean').M2./=.M2.max( |
9000 | 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | )..############################# |
9020 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9040 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 64 61 74 61 0a 23 23 | #################.#.Plot.data.## |
9060 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9080 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
90a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 | ############..#%%.plot.the.distr |
90c0 | 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | ibutions..pl.figure(1).pl.subplo |
90e0 | 74 28 32 2c 20 31 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 61 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 | t(2,.1,.1).pl.plot(x,.a,.'b',.la |
9100 | 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 | bel='Source.distribution').pl.ti |
9120 | 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 0a 70 6c 2e 73 75 | tle('Source.distribution').pl.su |
9140 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 31 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 42 2c 20 6c 61 62 | bplot(2,.1,.2).pl.plot(x,.B,.lab |
9160 | 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 | el='Target.distributions').pl.ti |
9180 | 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 | tle('Target.distributions').pl.t |
91a0 | 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ight_layout()...################ |
91c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
91e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 | ##############################.# |
9200 | 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 45 4d 44 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 6c | .Compute.EMD.for.the.different.l |
9220 | 6f 73 73 65 73 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | osses.########################## |
9240 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9260 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 25 25 20 43 6f 6d 70 75 74 | ####################..#%%.Comput |
9280 | 65 20 61 6e 64 20 70 6c 6f 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 61 6e 64 20 6c 6f 73 | e.and.plot.distributions.and.los |
92a0 | 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 0a 64 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 32 28 61 2c 20 42 2c 20 | s.matrix..d_emd.=.ot.emd2(a,.B,. |
92c0 | 4d 29 20 20 23 20 64 69 72 65 63 74 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 45 4d 44 0a | M)..#.direct.computation.of.EMD. |
92e0 | 64 5f 65 6d 64 32 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 32 29 20 20 23 20 64 69 | d_emd2.=.ot.emd2(a,.B,.M2)..#.di |
9300 | 72 65 63 74 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 45 4d 44 20 77 69 74 68 20 6c 6f 73 | rect.computation.of.EMD.with.los |
9320 | 73 20 4d 32 0a 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 6d | s.M2...pl.figure(2).pl.plot(d_em |
9340 | 64 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f | d,.label='Euclidean.EMD').pl.plo |
9360 | 74 28 64 5f 65 6d 64 32 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 | t(d_emd2,.label='Squared.Euclide |
9380 | 61 6e 20 45 4d 44 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 45 4d 44 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 | an.EMD').pl.title('EMD.distances |
93a0 | 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ').pl.legend()..################ |
93c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
93e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 | ##############################.# |
9400 | 20 43 6f 6d 70 75 74 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 | .Compute.Sinkhorn.for.the.differ |
9420 | 65 6e 74 20 6c 6f 73 73 65 73 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ent.losses.##################### |
9440 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9460 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 25 25 0a 72 | #########################..#%%.r |
9480 | 65 67 20 3d 20 31 65 2d 32 0a 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f | eg.=.1e-2.d_sinkhorn.=.ot.sinkho |
94a0 | 72 6e 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 2c 20 72 65 67 29 0a 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 20 3d 20 | rn2(a,.B,.M,.reg).d_sinkhorn2.=. |
94c0 | 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 28 61 2c 20 42 2c 20 4d 32 2c 20 72 65 67 29 0a 0a 70 6c 2e | ot.sinkhorn2(a,.B,.M2,.reg)..pl. |
94e0 | 66 69 67 75 72 65 28 32 29 0a 70 6c 2e 63 6c 66 28 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 65 6d 64 | figure(2).pl.clf().pl.plot(d_emd |
9500 | 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 45 4d 44 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 | ,.label='Euclidean.EMD').pl.plot |
9520 | 28 64 5f 65 6d 64 32 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 71 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 | (d_emd2,.label='Squared.Euclidea |
9540 | 6e 20 45 4d 44 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2c 20 27 2b 27 2c | n.EMD').pl.plot(d_sinkhorn,.'+', |
9560 | 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 0a 70 6c 2e | .label='Euclidean.Sinkhorn').pl. |
9580 | 70 6c 6f 74 28 64 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 32 2c 20 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 71 | plot(d_sinkhorn2,.'+',.label='Sq |
95a0 | 75 61 72 65 64 20 45 75 63 6c 69 64 65 61 6e 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 | uared.Euclidean.Sinkhorn').pl.ti |
95c0 | 74 6c 65 28 27 45 4d 44 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 29 | tle('EMD.distances').pl.legend() |
95e0 | 0a 0a 70 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 17 7f 21 4b 17 18 1f 68 11 07 | ..pl.show().PK..........!K...h.. |
9600 | 00 00 11 07 00 00 0d 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 | ..........plot_OT_1D.py#.-*-.cod |
9620 | 69 6e 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | ing:.utf-8.-*-.""".============= |
9640 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 31 44 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 3d 3d 3d | =======.1D.optimal.transport.=== |
9660 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 | =================..This.example. |
9680 | 69 6c 6c 75 73 74 72 61 74 65 73 20 74 68 65 20 63 6f 6d 70 75 74 61 74 69 6f 6e 20 6f 66 20 45 | illustrates.the.computation.of.E |
96a0 | 4d 44 20 61 6e 64 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 70 6c 61 6e 73 20 | MD.and.Sinkhorn.transport.plans. |
96c0 | 0a 61 6e 64 20 74 68 65 69 72 20 76 69 73 75 61 6c 69 7a 61 74 69 6f 6e 2e 0a 0a 22 22 22 0a 0a | .and.their.visualization...""".. |
96e0 | 23 20 41 75 74 68 6f 72 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 | #.Author:.Remi.Flamary.<remi.fla |
9700 | 6d 61 72 79 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 | mary@unice.fr>.#.#.License:.MIT. |
9720 | 4c 69 63 65 6e 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 6e 75 6d 70 79 20 61 73 20 6e 70 0a 69 6d 70 6f | License..import.numpy.as.np.impo |
9740 | 72 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 | rt.matplotlib.pylab.as.pl.import |
9760 | 20 6f 74 0a 66 72 6f 6d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 20 69 6d 70 6f 72 74 20 67 65 74 5f | .ot.from.ot.datasets.import.get_ |
9780 | 31 44 5f 67 61 75 73 73 20 61 73 20 67 61 75 73 73 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | 1D_gauss.as.gauss..############# |
97a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
97c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
97e0 | 23 0a 23 20 47 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 61 74 61 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | #.#.Generate.data.############## |
9800 | 23 0a 0a 23 25 25 20 70 61 72 61 6d 65 74 65 72 73 0a 0a 6e 20 3d 20 31 30 30 20 20 23 20 6e 62 | #..#%%.parameters..n.=.100..#.nb |
9820 | 20 62 69 6e 73 0a 0a 23 20 62 69 6e 20 70 6f 73 69 74 69 6f 6e 73 0a 78 20 3d 20 6e 70 2e 61 72 | .bins..#.bin.positions.x.=.np.ar |
9840 | 61 6e 67 65 28 6e 2c 20 64 74 79 70 65 3d 6e 70 2e 66 6c 6f 61 74 36 34 29 0a 0a 23 20 47 61 75 | ange(n,.dtype=np.float64)..#.Gau |
9860 | 73 73 69 61 6e 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 61 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c | ssian.distributions.a.=.gauss(n, |
9880 | 20 6d 3d 32 30 2c 20 73 3d 35 29 20 20 23 20 6d 3d 20 6d 65 61 6e 2c 20 73 3d 20 73 74 64 0a 62 | .m=20,.s=5)..#.m=.mean,.s=.std.b |
98a0 | 20 3d 20 67 61 75 73 73 28 6e 2c 20 6d 3d 36 30 2c 20 73 3d 31 30 29 0a 0a 23 20 6c 6f 73 73 20 | .=.gauss(n,.m=60,.s=10)..#.loss. |
98c0 | 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 73 74 28 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c | matrix.M.=.ot.dist(x.reshape((n, |
98e0 | 20 31 29 29 2c 20 78 2e 72 65 73 68 61 70 65 28 28 6e 2c 20 31 29 29 29 0a 4d 20 2f 3d 20 4d 2e | .1)),.x.reshape((n,.1))).M./=.M. |
9900 | 6d 61 78 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | max()...######################## |
9920 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9940 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 50 6c 6f 74 20 64 69 | ######################.#.Plot.di |
9960 | 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 20 61 6e 64 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 23 23 23 23 | stributions.and.loss.matrix.#### |
9980 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
99a0 | 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 74 68 65 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 0a 70 6c | ..#%%.plot.the.distributions..pl |
99c0 | 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 36 2e 34 2c 20 33 29 29 0a 70 6c 2e | .figure(1,.figsize=(6.4,.3)).pl. |
99e0 | 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 61 2c 20 27 62 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 64 69 | plot(x,.a,.'b',.label='Source.di |
9a00 | 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 0a 70 6c 2e 70 6c 6f 74 28 78 2c 20 62 2c 20 27 72 27 2c 20 | stribution').pl.plot(x,.b,.'r',. |
9a20 | 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 27 29 0a 70 6c 2e | label='Target.distribution').pl. |
9a40 | 6c 65 67 65 6e 64 28 29 0a 0a 23 25 25 20 70 6c 6f 74 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 | legend()..#%%.plot.distributions |
9a60 | 20 61 6e 64 20 6c 6f 73 73 20 6d 61 74 72 69 78 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 32 2c 20 66 | .and.loss.matrix..pl.figure(2,.f |
9a80 | 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 | igsize=(5,.5)).ot.plot.plot1D_ma |
9aa0 | 74 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 27 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 20 4d 27 29 0a 0a 23 23 23 | t(a,.b,.M,.'Cost.matrix.M')..### |
9ac0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9ae0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9b00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 45 4d 44 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 | ###########.#.Solve.EMD.######## |
9b20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9b40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9b60 | 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 25 25 20 45 4d 44 0a 0a 47 30 20 3d 20 6f 74 2e 65 6d 64 28 61 2c 20 | ######..#%%.EMD..G0.=.ot.emd(a,. |
9b80 | 62 2c 20 4d 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 33 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 35 2c 20 | b,.M)..pl.figure(3,.figsize=(5,. |
9ba0 | 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 62 2c 20 47 30 2c | 5)).ot.plot.plot1D_mat(a,.b,.G0, |
9bc0 | 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 47 30 27 29 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .'OT.matrix.G0')..############## |
9be0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9c00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9c20 | 0a 23 20 53 6f 6c 76 65 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .#.Solve.Sinkhorn.############## |
9c40 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9c60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
9c80 | 0a 0a 23 25 25 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 0a 0a 6c 61 6d 62 64 20 3d 20 31 65 2d 33 0a 47 73 20 | ..#%%.Sinkhorn..lambd.=.1e-3.Gs. |
9ca0 | 3d 20 6f 74 2e 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 28 61 2c 20 62 2c 20 4d 2c 20 6c 61 6d 62 64 2c 20 76 65 | =.ot.sinkhorn(a,.b,.M,.lambd,.ve |
9cc0 | 72 62 6f 73 65 3d 54 72 75 65 29 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a | rbose=True)..pl.figure(4,.figsiz |
9ce0 | 65 3d 28 35 2c 20 35 29 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 31 44 5f 6d 61 74 28 61 2c 20 | e=(5,.5)).ot.plot.plot1D_mat(a,. |
9d00 | 62 2c 20 47 73 2c 20 27 4f 54 20 6d 61 74 72 69 78 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 27 29 0a 0a 70 6c | b,.Gs,.'OT.matrix.Sinkhorn')..pl |
9d20 | 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 03 04 14 00 00 00 00 00 18 7f 21 4b d0 88 31 48 54 15 00 00 54 15 | .show().PK..........!K..1HT...T. |
9d40 | 00 00 0f 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 64 32 2e 70 79 23 20 2d 2a 2d 20 63 6f 64 69 6e | ......plot_otda_d2.py#.-*-.codin |
9d60 | 67 3a 20 75 74 66 2d 38 20 2d 2a 2d 0a 22 22 22 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | g:.utf-8.-*-.""".=============== |
9d80 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 4f 54 20 66 6f 72 20 65 6d 70 69 72 69 63 61 6c | ===============.OT.for.empirical |
9da0 | 20 64 69 73 74 72 69 62 75 74 69 6f 6e 73 0a 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d | .distributions.================= |
9dc0 | 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 3d 0a 0a 54 68 69 73 20 65 78 61 6d 70 6c 65 20 69 6e 74 72 | =============..This.example.intr |
9de0 | 6f 64 75 63 65 73 20 61 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 69 6e 20 61 20 | oduces.a.domain.adaptation.in.a. |
9e00 | 32 44 20 73 65 74 74 69 6e 67 2e 20 49 74 20 65 78 70 6c 69 63 69 74 73 0a 74 68 65 20 70 72 6f | 2D.setting..It.explicits.the.pro |
9e20 | 62 6c 65 6d 20 6f 66 20 64 6f 6d 61 69 6e 20 61 64 61 70 74 61 74 69 6f 6e 20 61 6e 64 20 69 6e | blem.of.domain.adaptation.and.in |
9e40 | 74 72 6f 64 75 63 65 73 20 73 6f 6d 65 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a | troduces.some.optimal.transport. |
9e60 | 61 70 70 72 6f 61 63 68 65 73 20 74 6f 20 73 6f 6c 76 65 20 69 74 2e 0a 0a 51 75 61 6e 74 69 74 | approaches.to.solve.it...Quantit |
9e80 | 69 65 73 20 73 75 63 68 20 61 73 20 6f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 2c 20 67 | ies.such.as.optimal.couplings,.g |
9ea0 | 72 65 61 74 65 72 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 20 61 6e 64 | reater.coupling.coefficients.and |
9ec0 | 0a 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 61 72 65 20 72 65 70 72 65 73 65 | .transported.samples.are.represe |
9ee0 | 6e 74 65 64 20 69 6e 20 6f 72 64 65 72 20 74 6f 20 67 69 76 65 20 61 20 76 69 73 75 61 6c 20 75 | nted.in.order.to.give.a.visual.u |
9f00 | 6e 64 65 72 73 74 61 6e 64 69 6e 67 0a 6f 66 20 77 68 61 74 20 74 68 65 20 74 72 61 6e 73 70 6f | nderstanding.of.what.the.transpo |
9f20 | 72 74 20 6d 65 74 68 6f 64 73 20 61 72 65 20 64 6f 69 6e 67 2e 0a 22 22 22 0a 0a 23 20 41 75 74 | rt.methods.are.doing.."""..#.Aut |
9f40 | 68 6f 72 73 3a 20 52 65 6d 69 20 46 6c 61 6d 61 72 79 20 3c 72 65 6d 69 2e 66 6c 61 6d 61 72 79 | hors:.Remi.Flamary.<remi.flamary |
9f60 | 40 75 6e 69 63 65 2e 66 72 3e 0a 23 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 53 74 61 6e 69 73 6c 61 73 20 | @unice.fr>.#..........Stanislas. |
9f80 | 43 68 61 6d 62 6f 6e 20 3c 73 74 61 6e 2e 63 68 61 6d 62 6f 6e 40 67 6d 61 69 6c 2e 63 6f 6d 3e | Chambon.<stan.chambon@gmail.com> |
9fa0 | 0a 23 0a 23 20 4c 69 63 65 6e 73 65 3a 20 4d 49 54 20 4c 69 63 65 6e 73 65 0a 0a 69 6d 70 6f 72 | .#.#.License:.MIT.License..impor |
9fc0 | 74 20 6d 61 74 70 6c 6f 74 6c 69 62 2e 70 79 6c 61 62 20 61 73 20 70 6c 0a 69 6d 70 6f 72 74 20 | t.matplotlib.pylab.as.pl.import. |
9fe0 | 6f 74 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ot...########################### |
a000 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
a020 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 67 65 6e 65 72 61 74 65 20 64 | ###################.#.generate.d |
a040 | 61 74 61 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ata.############################ |
a060 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
a080 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 73 6f | ##################..n_samples_so |
a0a0 | 75 72 63 65 20 3d 20 31 35 30 0a 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 74 61 72 67 65 74 20 3d 20 31 35 | urce.=.150.n_samples_target.=.15 |
a0c0 | 30 0a 0a 58 73 2c 20 79 73 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 74 61 | 0..Xs,.ys.=.ot.datasets.get_data |
a0e0 | 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 27 2c 20 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 73 6f 75 | _classif('3gauss',.n_samples_sou |
a100 | 72 63 65 29 0a 58 74 2c 20 79 74 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 74 61 73 65 74 73 2e 67 65 74 5f 64 61 | rce).Xt,.yt.=.ot.datasets.get_da |
a120 | 74 61 5f 63 6c 61 73 73 69 66 28 27 33 67 61 75 73 73 32 27 2c 20 6e 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f | ta_classif('3gauss2',.n_samples_ |
a140 | 74 61 72 67 65 74 29 0a 0a 23 20 43 6f 73 74 20 6d 61 74 72 69 78 0a 4d 20 3d 20 6f 74 2e 64 69 | target)..#.Cost.matrix.M.=.ot.di |
a160 | 73 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6d 65 74 72 69 63 3d 27 73 71 65 75 63 6c 69 64 65 61 6e 27 29 | st(Xs,.Xt,.metric='sqeuclidean') |
a180 | 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ...############################# |
a1a0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
a1c0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 49 6e 73 74 61 6e 74 69 61 74 65 20 | #################.#.Instantiate. |
a1e0 | 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 61 6c 67 6f 72 69 74 68 | the.different.transport.algorith |
a200 | 6d 73 20 61 6e 64 20 66 69 74 20 74 68 65 6d 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ms.and.fit.them.################ |
a220 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
a240 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a | ##############################.. |
a260 | 23 20 45 4d 44 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f 65 6d 64 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 45 | #.EMD.Transport.ot_emd.=.ot.da.E |
a280 | 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 29 0a 6f 74 5f 65 6d 64 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 | MDTransport().ot_emd.fit(Xs=Xs,. |
a2a0 | 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 0a 6f 74 5f | Xt=Xt)..#.Sinkhorn.Transport.ot_ |
a2c0 | 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f | sinkhorn.=.ot.da.SinkhornTranspo |
a2e0 | 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 29 0a 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 66 69 74 28 58 | rt(reg_e=1e-1).ot_sinkhorn.fit(X |
a300 | 73 3d 58 73 2c 20 58 74 3d 58 74 29 0a 0a 23 20 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 54 72 61 6e 73 70 6f | s=Xs,.Xt=Xt)..#.Sinkhorn.Transpo |
a320 | 72 74 20 77 69 74 68 20 47 72 6f 75 70 20 6c 61 73 73 6f 20 72 65 67 75 6c 61 72 69 7a 61 74 69 | rt.with.Group.lasso.regularizati |
a340 | 6f 6e 0a 6f 74 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 2e 64 61 2e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 | on.ot_lpl1.=.ot.da.SinkhornLpl1T |
a360 | 72 61 6e 73 70 6f 72 74 28 72 65 67 5f 65 3d 31 65 2d 31 2c 20 72 65 67 5f 63 6c 3d 31 65 30 29 | ransport(reg_e=1e-1,.reg_cl=1e0) |
a380 | 0a 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 66 69 74 28 58 73 3d 58 73 2c 20 79 73 3d 79 73 2c 20 58 74 3d 58 74 | .ot_lpl1.fit(Xs=Xs,.ys=ys,.Xt=Xt |
a3a0 | 29 0a 0a 23 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 20 73 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 6f 6e | )..#.transport.source.samples.on |
a3c0 | 74 6f 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 20 | to.target.samples.transp_Xs_emd. |
a3e0 | 3d 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 74 72 61 6e 73 70 | =.ot_emd.transform(Xs=Xs).transp |
a400 | 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 20 3d 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 74 72 61 6e 73 | _Xs_sinkhorn.=.ot_sinkhorn.trans |
a420 | 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 20 3d 20 6f 74 5f | form(Xs=Xs).transp_Xs_lpl1.=.ot_ |
a440 | 6c 70 6c 31 2e 74 72 61 6e 73 66 6f 72 6d 28 58 73 3d 58 73 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 | lpl1.transform(Xs=Xs)...######## |
a460 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
a480 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
a4a0 | 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 31 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 73 6f 75 72 63 65 20 61 6e | ######.#.Fig.1.:.plots.source.an |
a4c0 | 64 20 74 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 20 2b 20 6d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 | d.target.samples.+.matrix.of.pai |
a4e0 | 72 77 69 73 65 20 64 69 73 74 61 6e 63 65 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | rwise.distance.################# |
a500 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
a520 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 70 | #############################..p |
a540 | 6c 2e 66 69 67 75 72 65 28 31 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 31 30 29 29 0a 70 6c | l.figure(1,.figsize=(10,.10)).pl |
a560 | 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 73 5b | .subplot(2,.2,.1).pl.scatter(Xs[ |
a580 | 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b | :,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.marker='+ |
a5a0 | 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 | ',.label='Source.samples').pl.xt |
a5c0 | 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 | icks([]).pl.yticks([]).pl.legend |
a5e0 | 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 53 6f 75 72 63 65 20 20 73 61 6d 70 6c 65 | (loc=0).pl.title('Source..sample |
a600 | 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 | s')..pl.subplot(2,.2,.2).pl.scat |
a620 | 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 | ter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c=yt,.ma |
a640 | 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 | rker='o',.label='Target.samples' |
a660 | 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c | ).pl.xticks([]).pl.yticks([]).pl |
a680 | 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 61 72 67 65 74 20 | .legend(loc=0).pl.title('Target. |
a6a0 | 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 32 2c 20 33 29 0a 70 | samples')..pl.subplot(2,.2,.3).p |
a6c0 | 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 4d 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 | l.imshow(M,.interpolation='neare |
a6e0 | 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 | st').pl.xticks([]).pl.yticks([]) |
a700 | 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 74 72 69 78 20 6f 66 20 70 61 69 72 77 69 73 65 20 64 69 | .pl.title('Matrix.of.pairwise.di |
a720 | 73 74 61 6e 63 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 | stances').pl.tight_layout()...## |
a740 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
a760 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
a780 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 32 20 3a 20 70 6c 6f 74 73 20 6f 70 74 | ############.#.Fig.2.:.plots.opt |
a7a0 | 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 73 20 66 6f 72 20 74 68 65 20 64 69 66 66 65 72 65 6e 74 | imal.couplings.for.the.different |
a7c0 | 20 6d 65 74 68 6f 64 73 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | .methods.####################### |
a7e0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
a800 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 70 6c 2e 66 69 67 75 | #######################..pl.figu |
a820 | 72 65 28 32 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 36 29 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | re(2,.figsize=(10,.6))..pl.subpl |
a840 | 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 | ot(2,.3,.1).pl.imshow(ot_emd.cou |
a860 | 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 | pling_,.interpolation='nearest') |
a880 | 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e | .pl.xticks([]).pl.yticks([]).pl. |
a8a0 | 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e | title('Optimal.coupling\nEMDTran |
a8c0 | 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e | sport')..pl.subplot(2,.3,.2).pl. |
a8e0 | 69 6d 73 68 6f 77 28 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e | imshow(ot_sinkhorn.coupling_,.in |
a900 | 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 | terpolation='nearest').pl.xticks |
a920 | 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 | ([]).pl.yticks([]).pl.title('Opt |
a940 | 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 | imal.coupling\nSinkhornTransport |
a960 | 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 69 6d 73 68 6f | ')..pl.subplot(2,.3,.3).pl.imsho |
a980 | 77 28 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 69 6e 74 65 72 70 6f 6c 61 74 69 | w(ot_lpl1.coupling_,.interpolati |
a9a0 | 6f 6e 3d 27 6e 65 61 72 65 73 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 | on='nearest').pl.xticks([]).pl.y |
a9c0 | 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4f 70 74 69 6d 61 6c 20 63 6f 75 70 | ticks([]).pl.title('Optimal.coup |
a9e0 | 6c 69 6e 67 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 | ling\nSinkhornLpl1Transport')..p |
aa00 | 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 34 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 | l.subplot(2,.3,.4).ot.plot.plot2 |
aa20 | 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 65 6d 64 2e 63 6f 75 | D_samples_mat(Xs,.Xt,.ot_emd.cou |
aa40 | 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 | pling_,.c=[.5,..5,.1]).pl.scatte |
aa60 | 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 6b | r(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.mark |
aa80 | 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a | er='+',.label='Source.samples'). |
aaa0 | 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 | pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],.c |
aac0 | 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 | =yt,.marker='o',.label='Target.s |
aae0 | 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 | amples').pl.xticks([]).pl.yticks |
ab00 | 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f 65 | ([]).pl.title('Main.coupling.coe |
ab20 | 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 6e 45 4d 44 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 | fficients\nEMDTransport')..pl.su |
ab40 | 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 35 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f 74 32 44 5f 73 61 | bplot(2,.3,.5).ot.plot.plot2D_sa |
ab60 | 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 6e 2e 63 6f | mples_mat(Xs,.Xt,.ot_sinkhorn.co |
ab80 | 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 | upling_,.c=[.5,..5,.1]).pl.scatt |
aba0 | 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d 61 72 | er(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.mar |
abc0 | 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 | ker='+',.label='Source.samples') |
abe0 | 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | .pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1],. |
ac00 | 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 | c=yt,.marker='o',.label='Target. |
ac20 | 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b | samples').pl.xticks([]).pl.ytick |
ac40 | 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 63 6f | s([]).pl.title('Main.coupling.co |
ac60 | 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a | efficients\nSinkhornTransport'). |
ac80 | 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 32 2c 20 33 2c 20 36 29 0a 6f 74 2e 70 6c 6f 74 2e 70 6c 6f | .pl.subplot(2,.3,.6).ot.plot.plo |
aca0 | 74 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 5f 6d 61 74 28 58 73 2c 20 58 74 2c 20 6f 74 5f 6c 70 6c 31 2e | t2D_samples_mat(Xs,.Xt,.ot_lpl1. |
acc0 | 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 5f 2c 20 63 3d 5b 2e 35 2c 20 2e 35 2c 20 31 5d 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 | coupling_,.c=[.5,..5,.1]).pl.sca |
ace0 | 74 74 65 72 28 58 73 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 73 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 20 6d | tter(Xs[:,.0],.Xs[:,.1],.c=ys,.m |
ad00 | 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 53 6f 75 72 63 65 20 73 61 6d 70 6c 65 73 | arker='+',.label='Source.samples |
ad20 | 27 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d | ').pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[:,.1] |
ad40 | 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 | ,.c=yt,.marker='o',.label='Targe |
ad60 | 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 | t.samples').pl.xticks([]).pl.yti |
ad80 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 4d 61 69 6e 20 63 6f 75 70 6c 69 6e 67 20 | cks([]).pl.title('Main.coupling. |
ada0 | 63 6f 65 66 66 69 63 69 65 6e 74 73 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 | coefficients\nSinkhornLpl1Transp |
adc0 | 6f 72 74 27 29 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 0a 0a 23 23 23 23 23 23 | ort').pl.tight_layout()...###### |
ade0 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
ae00 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
ae20 | 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 23 20 46 69 67 20 33 20 3a 20 70 6c 6f 74 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 | ########.#.Fig.3.:.plot.transpor |
ae40 | 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ted.samples.#################### |
ae60 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 | ################################ |
ae80 | 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 23 0a 0a 23 20 64 69 | ##########################..#.di |
aea0 | 73 70 6c 61 79 20 74 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 0a 70 6c 2e 66 69 67 | splay.transported.samples.pl.fig |
aec0 | 75 72 65 28 34 2c 20 66 69 67 73 69 7a 65 3d 28 31 30 2c 20 34 29 29 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c | ure(4,.figsize=(10,.4)).pl.subpl |
aee0 | 6f 74 28 31 2c 20 33 2c 20 31 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c | ot(1,.3,.1).pl.scatter(Xt[:,.0], |
af00 | 20 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 | .Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',.... |
af20 | 20 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 | ........label='Target.samples',. |
af40 | 61 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f | alpha=0.5).pl.scatter(transp_Xs_ |
af60 | 65 6d 64 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 65 6d 64 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 | emd[:,.0],.transp_Xs_emd[:,.1],. |
af80 | 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 | c=ys,............marker='+',.lab |
afa0 | 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 | el='Transp.samples',.s=30).pl.ti |
afc0 | 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 45 6d 64 54 72 61 | tle('Transported.samples\nEmdTra |
afe0 | 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 70 6c 2e 6c 65 67 65 6e 64 28 6c 6f 63 3d 30 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 | nsport').pl.legend(loc=0).pl.xti |
b000 | 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f | cks([]).pl.yticks([])..pl.subplo |
b020 | 74 28 31 2c 20 33 2c 20 32 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 | t(1,.3,.2).pl.scatter(Xt[:,.0],. |
b040 | 58 74 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 | Xt[:,.1],.c=yt,.marker='o',..... |
b060 | 20 20 20 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 | .......label='Target.samples',.a |
b080 | 6c 70 68 61 3d 30 2e 35 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 | lpha=0.5).pl.scatter(transp_Xs_s |
b0a0 | 69 6e 6b 68 6f 72 6e 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 73 69 6e 6b 68 6f 72 | inkhorn[:,.0],.transp_Xs_sinkhor |
b0c0 | 6e 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 | n[:,.1],.c=ys,............marker |
b0e0 | 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d | ='+',.label='Transp.samples',.s= |
b100 | 33 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 | 30).pl.title('Transported.sample |
b120 | 73 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 | s\nSinkhornTransport').pl.xticks |
b140 | 28 5b 5d 29 0a 70 6c 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 0a 70 6c 2e 73 75 62 70 6c 6f 74 28 31 | ([]).pl.yticks([])..pl.subplot(1 |
b160 | 2c 20 33 2c 20 33 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 58 74 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 58 74 5b | ,.3,.3).pl.scatter(Xt[:,.0],.Xt[ |
b180 | 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d 79 74 2c 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 6f 27 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 | :,.1],.c=yt,.marker='o',........ |
b1a0 | 20 20 20 20 6c 61 62 65 6c 3d 27 54 61 72 67 65 74 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 61 6c 70 68 | ....label='Target.samples',.alph |
b1c0 | 61 3d 30 2e 35 29 0a 70 6c 2e 73 63 61 74 74 65 72 28 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 | a=0.5).pl.scatter(transp_Xs_lpl1 |
b1e0 | 5b 3a 2c 20 30 5d 2c 20 74 72 61 6e 73 70 5f 58 73 5f 6c 70 6c 31 5b 3a 2c 20 31 5d 2c 20 63 3d | [:,.0],.transp_Xs_lpl1[:,.1],.c= |
b200 | 79 73 2c 0a 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 20 6d 61 72 6b 65 72 3d 27 2b 27 2c 20 6c 61 62 65 6c | ys,............marker='+',.label |
b220 | 3d 27 54 72 61 6e 73 70 20 73 61 6d 70 6c 65 73 27 2c 20 73 3d 33 30 29 0a 70 6c 2e 74 69 74 6c | ='Transp.samples',.s=30).pl.titl |
b240 | 65 28 27 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 65 64 20 73 61 6d 70 6c 65 73 5c 6e 53 69 6e 6b 68 6f 72 6e | e('Transported.samples\nSinkhorn |
b260 | 4c 70 6c 31 54 72 61 6e 73 70 6f 72 74 27 29 0a 70 6c 2e 78 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 70 6c | Lpl1Transport').pl.xticks([]).pl |
b280 | 2e 79 74 69 63 6b 73 28 5b 5d 29 0a 0a 70 6c 2e 74 69 67 68 74 5f 6c 61 79 6f 75 74 28 29 0a 70 | .yticks([])..pl.tight_layout().p |
b2a0 | 6c 2e 73 68 6f 77 28 29 0a 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 18 7f 21 4b 94 2f ca 38 47 0f 00 | l.show().PK............!K./.8G.. |
b2c0 | 00 47 0f 00 00 15 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 00 00 00 00 70 6c 6f 74 5f 62 61 72 79 | .G.....................plot_bary |
b2e0 | 63 65 6e 74 65 72 5f 31 44 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 18 7f 21 4b 0a 2e ad 80 | center_1D.pyPK............!K.... |
b300 | b8 10 00 00 b8 10 00 00 14 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 7a 0f 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f | ......................z...plot_o |
b320 | 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 18 7f 21 4b b7 26 | tda_mapping.pyPK............!K.& |
b340 | 0b b3 8b 11 00 00 8b 11 00 00 14 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 64 20 00 00 70 6c 6f 74 | ........................d...plot |
b360 | 5f 6f 74 64 61 5f 63 6c 61 73 73 65 73 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 18 7f 21 4b | _otda_classes.pyPK............!K |
b380 | 57 2f 82 87 43 0a 00 00 43 0a 00 00 15 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 21 32 00 00 70 6c | W/..C...C.................!2..pl |
b3a0 | 6f 74 5f 4f 54 5f 32 44 5f 73 61 6d 70 6c 65 73 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 18 | ot_OT_2D_samples.pyPK........... |
b3c0 | 7f 21 4b 7b 50 af 9f 3c 14 00 00 3c 14 00 00 13 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 97 3c 00 | .!K{P..<...<..................<. |
b3e0 | 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 4c 31 5f 76 73 5f 4c 32 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 | .plot_OT_L1_vs_L2.pyPK.......... |
b400 | 18 7f 21 4b 9d 2d e5 9a 46 11 00 00 46 11 00 00 22 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 04 51 | ..!K.-..F...F..."..............Q |
b420 | 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 6d 61 70 70 69 6e 67 5f 63 6f 6c 6f 72 73 5f 69 6d 61 67 65 | ..plot_otda_mapping_colors_image |
b440 | 73 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 18 7f 21 4b 77 57 0d 45 09 0f 00 00 09 0f 00 00 | s.pyPK............!KwW.E........ |
b460 | 19 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 8a 62 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 63 6f 6c 6f | ...............b..plot_otda_colo |
b480 | 72 5f 69 6d 61 67 65 73 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 18 7f 21 4b 77 9c 7b b1 13 | r_images.pyPK............!Kw.{.. |
b4a0 | 0d 00 00 13 0d 00 00 0b 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 ca 71 00 00 70 6c 6f 74 5f 57 44 | ......................q..plot_WD |
b4c0 | 41 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 18 7f 21 4b 65 61 f4 63 52 0c 00 00 52 0c 00 00 | A.pyPK............!Kea.cR...R... |
b4e0 | 13 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 06 7f 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 70 74 69 6d 5f 4f 54 72 | ..................plot_optim_OTr |
b500 | 65 67 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 18 7f 21 4b 9e d7 1b f5 32 0a 00 00 32 0a 00 | eg.pyPK............!K....2...2.. |
b520 | 00 13 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 89 8b 00 00 70 6c 6f 74 5f 63 6f 6d 70 75 74 65 5f | ...................plot_compute_ |
b540 | 65 6d 64 2e 70 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 17 7f 21 4b 17 18 1f 68 11 07 00 00 11 07 | emd.pyPK............!K...h...... |
b560 | 00 00 0d 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 ec 95 00 00 70 6c 6f 74 5f 4f 54 5f 31 44 2e 70 | ....................plot_OT_1D.p |
b580 | 79 50 4b 01 02 14 03 14 00 00 00 00 00 18 7f 21 4b d0 88 31 48 54 15 00 00 54 15 00 00 0f 00 00 | yPK............!K..1HT...T...... |
b5a0 | 00 00 00 00 00 00 00 00 00 b4 81 28 9d 00 00 70 6c 6f 74 5f 6f 74 64 61 5f 64 32 2e 70 79 50 4b | ...........(...plot_otda_d2.pyPK |
b5c0 | 05 06 00 00 00 00 0c 00 0c 00 15 03 00 00 a9 b2 00 00 00 00 | .................... |